AlfalfaGEDB | MsG0580026450.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580026450.01

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MsG0580026450.01.T01	AT5G16420	23.626	364	252	10	3	353	144	494	1.17e-11	67.8
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MsG0580026450.01.T01	AT5G12100	22.727	440	305	16	10	429	102	526	6.84e-11	65.9
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MsG0580026450.01.T01	AT5G55840	20.721	333	245	8	75	394	425	751	7.37e-11	65.9
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MsG0580026450.01.T01	AT4G19890	27.152	151	101	4	231	374	187	335	8.14e-11	65.5
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MsG0580026450.01.T01	AT2G35130	21.290	310	191	7	46	311	284	584	9.37e-11	65.1

Find 100 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 119 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

CRISPR-Local
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GTTGTTCTTGTATGGATTAT+TGG	0.296716	5:-37617459	MsG0580026450.01.T01:CDS
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GGGTATTTACCTGACTATTC+AGG	0.318234	5:-37617718	MsG0580026450.01.T01:CDS
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ATTACAGCATCTGGTTTAAT+CGG	0.332305	5:+37618072	None:intergenic
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GAATGTGGTTTGTGATGTTT+TGG	0.351362	5:-37618478	MsG0580026450.01.T01:CDS
TGTTCCATGTGAAGGAATTT+GGG	0.357490	5:+37619003	None:intergenic
AGTTAGAGATAGGATTAGAT+TGG	0.371833	5:+37619072	None:intergenic
ATCTTTACTTTGTGGATGAT+TGG	0.372661	5:+37617786	None:intergenic
GGTTTAGGTTCGCTTTCGTT+AGG	0.372897	5:-37618540	MsG0580026450.01.T01:CDS
CTCCTCCAAATTACAGCATC+TGG	0.373784	5:+37618063	None:intergenic
TTATATATATCTTTACTTTG+TGG	0.378373	5:+37617778	None:intergenic
CAGGGGAAACTAGAATCTAT+AGG	0.383591	5:-37617739	MsG0580026450.01.T01:CDS
TTTCTCTACCTTCACCATTC+GGG	0.384424	5:+37618296	None:intergenic
ACAAGTGATTAATGTGTTTG+AGG	0.390669	5:+37619099	None:intergenic
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CTTATCGAGATGTGAGTTCA+TGG	0.404087	5:-37618380	MsG0580026450.01.T01:CDS
GCACAAGCTTTAAGAACAAA+AGG	0.406560	5:+37618867	None:intergenic
GAACCAAGTCTGGTGCATTA+TGG	0.409559	5:-37618162	MsG0580026450.01.T01:CDS
GTTCGCTTTCGTTAGGGATG+TGG	0.415489	5:-37618533	MsG0580026450.01.T01:CDS
CGATTTCATCACTTTAAAGA+TGG	0.416133	5:-37617484	MsG0580026450.01.T01:CDS
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CCAACAAAAGTGATAGAATT+CGG	0.434999	5:+37618267	None:intergenic
TTGATTGATGAGATTAATGA+AGG	0.436609	5:-37617688	MsG0580026450.01.T01:CDS
CTCTGCACCGTGTAACAATC+AGG	0.437015	5:+37618582	None:intergenic
GTTTAGGTTCGCTTTCGTTA+GGG	0.437585	5:-37618539	MsG0580026450.01.T01:CDS
TTCTTGTGGCTGTTTGGAAA+CGG	0.453412	5:-37618739	MsG0580026450.01.T01:CDS
GAATCAAATGGGAGTGTTTG+TGG	0.454315	5:-37617970	MsG0580026450.01.T01:CDS
TTCGCTTTCGTTAGGGATGT+GGG	0.460396	5:-37618532	MsG0580026450.01.T01:CDS
AGGGGAAACTAGAATCTATA+GGG	0.462750	5:-37617738	MsG0580026450.01.T01:CDS
ATTGATTCTTATGCGAAGGT+TGG	0.470025	5:-37618657	MsG0580026450.01.T01:CDS
ATTCATTTCTACTCTTCTTG+TGG	0.472458	5:-37618753	MsG0580026450.01.T01:CDS
AAACCACATTCAGAGCCTCT+TGG	0.476127	5:+37618103	None:intergenic
GTTGGTGTTGGTTGTTGCAA+TGG	0.484684	5:+37619127	None:intergenic
GCAAGTAGGTGGAATGATGT+AGG	0.485354	5:-37617910	MsG0580026450.01.T01:CDS
GAGGTGGCATAGTGAGAGAT+TGG	0.486917	5:-37617650	MsG0580026450.01.T01:CDS
TTTGAGTGTGGATTTGTTTG+AGG	0.489720	5:+37619045	None:intergenic
AATGGTGCACCTGAATAGTC+AGG	0.491157	5:+37617709	None:intergenic
AGAAAGCTAATGAATGATAA+GGG	0.492124	5:-37617880	MsG0580026450.01.T01:CDS
GATTTCATCACTTTAAAGAT+GGG	0.500710	5:-37617483	MsG0580026450.01.T01:CDS
CATCCATAATGCACCAGACT+TGG	0.501789	5:+37618159	None:intergenic
GTTGATATGTATTGTAAATG+TGG	0.501983	5:-37618441	MsG0580026450.01.T01:CDS
GTTGATCTTTACGCTAGAGC+TGG	0.505697	5:-37618132	MsG0580026450.01.T01:CDS
TTTGAGGTTAGTGTTGGTGT+TGG	0.512098	5:+37619115	None:intergenic
TGGGAAAGCTAAGGCAGCAT+TGG	0.515418	5:-37618328	MsG0580026450.01.T01:CDS
GTACAATGTTGAACCAAGTC+TGG	0.518018	5:-37618172	MsG0580026450.01.T01:CDS
TCATTAATCTCATCAATCAA+TGG	0.521255	5:+37617691	None:intergenic
AACCAGATGCTGTAATTTGG+AGG	0.525315	5:-37618065	MsG0580026450.01.T01:CDS
TATTCTTCTTTACAAAGCAA+TGG	0.525569	5:-37618934	MsG0580026450.01.T01:CDS
CACAAGCTTTAAGAACAAAA+GGG	0.533348	5:+37618868	None:intergenic
AATGTGTTTGAGGTTAGTGT+TGG	0.533935	5:+37619109	None:intergenic
CAGAGTGTTATTAGGGCTTG+TGG	0.534128	5:-37618564	MsG0580026450.01.T01:CDS
AGTGTGTAGTGACTGTCATA+AGG	0.538497	5:-37617563	MsG0580026450.01.T01:CDS
AAGTTTATGAACGAAATTCA+GGG	0.542680	5:-37617757	MsG0580026450.01.T01:CDS
AAAGGAGGAATGTGGTTTCG+TGG	0.547028	5:-37618689	MsG0580026450.01.T01:CDS
CAAGTAGGTGGAATGATGTA+GGG	0.557399	5:-37617909	MsG0580026450.01.T01:CDS
TTGTGGATGATTGGTGTCTC+CGG	0.558346	5:+37617795	None:intergenic
TGCCGTGCATGGGAAAGCTA+AGG	0.560228	5:-37618337	MsG0580026450.01.T01:CDS
TGCCTTAGCTTTCCCATGCA+CGG	0.563965	5:+37618335	None:intergenic
ATTCAAAAGCCCAAAAGCTA+TGG	0.564026	5:+37617627	None:intergenic
GTATTGTAAATGTGGATCGT+TGG	0.574055	5:-37618433	MsG0580026450.01.T01:CDS
ATCGTTGGAAATTGCTACGC+AGG	0.576188	5:-37618418	MsG0580026450.01.T01:CDS
TATGAGAATGTTCCATGTGA+AGG	0.577690	5:+37618995	None:intergenic
TTGTGCGAAGTATTTGAGTG+TGG	0.585260	5:+37619033	None:intergenic
AAGTGTATGCTTCAGCAAGT+AGG	0.591394	5:-37617924	MsG0580026450.01.T01:CDS
TTGATAAAATGTGCGAAAGG+AGG	0.595059	5:-37618704	MsG0580026450.01.T01:CDS
ACACCCCAAATTCCTTCACA+TGG	0.601288	5:-37619007	MsG0580026450.01.T01:CDS
CATCCAAGAGGCTCTGAATG+TGG	0.608991	5:-37618106	MsG0580026450.01.T01:CDS
CATAGTGGAATGGTTAACGA+AGG	0.613489	5:-37618225	MsG0580026450.01.T01:CDS
TTGAGTGCATGTAATCATAG+TGG	0.618435	5:-37618240	MsG0580026450.01.T01:CDS
TGTATGCTTCAGCAAGTAGG+TGG	0.619377	5:-37617921	MsG0580026450.01.T01:CDS
TGATTGATGAGATTAATGAA+GGG	0.634738	5:-37617687	MsG0580026450.01.T01:CDS
AAGGGAAACAGAATACTATG+AGG	0.635946	5:-37617669	MsG0580026450.01.T01:CDS
ATCTCTATTAAACTACAACC+AGG	0.637462	5:+37617844	None:intergenic
TGTTTGATAAAATGTGCGAA+AGG	0.642033	5:-37618707	MsG0580026450.01.T01:CDS
AATGTGCGAAAGGAGGAATG+TGG	0.642461	5:-37618697	MsG0580026450.01.T01:CDS
ATAGTGGAATGGTTAACGAA+GGG	0.647074	5:-37618224	MsG0580026450.01.T01:CDS
AGTTTATGAACGAAATTCAG+GGG	0.650570	5:-37617756	MsG0580026450.01.T01:CDS
AAGGGTGTGAGTAAAGAGCC+TGG	0.656105	5:-37617862	MsG0580026450.01.T01:CDS
GGAAACAGAATACTATGAGG+TGG	0.657354	5:-37617666	MsG0580026450.01.T01:CDS
TGCATGTAATCATAGTGGAA+TGG	0.663537	5:-37618235	MsG0580026450.01.T01:CDS
AATGATTGATTCTTATGCGA+AGG	0.670107	5:-37618661	MsG0580026450.01.T01:CDS
GTTCCATGTGAAGGAATTTG+GGG	0.670572	5:+37619004	None:intergenic
AGTGTTATTAGGGCTTGTGG+CGG	0.675398	5:-37618561	MsG0580026450.01.T01:CDS
AATATCTAGAATTTACAATG+TGG	0.690392	5:-37617530	MsG0580026450.01.T01:CDS
TAGAGCTGGACACATCCAAG+AGG	0.721825	5:-37618118	MsG0580026450.01.T01:CDS
ATATGAACCTGATTGTTACA+CGG	0.727096	5:-37618589	MsG0580026450.01.T01:CDS
TCAAATGGGAGTGTTTGTGG+TGG	0.734327	5:-37617967	MsG0580026450.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content
!!	TTATATATATCTTTACTTTG+TGG	+	Chr5:37618818-37618837	None:intergenic	15.0%
!!	AGATTCTTAAATACTCTTAT+TGG	+	Chr5:37619007-37619026	None:intergenic	20.0%
!!	TGTAGTTTAATAGAGATAAA+TGG	-	Chr5:37618755-37618774	MsG0580026450.01.T01:CDS	20.0%
!!!	AATATCTAGAATTTACAATG+TGG	-	Chr5:37619063-37619082	MsG0580026450.01.T01:CDS	20.0%
!	AAGTTTATGAACGAAATTCA+GGG	-	Chr5:37618836-37618855	MsG0580026450.01.T01:CDS	25.0%
!	AGAAAGCTAATGAATGATAA+GGG	-	Chr5:37618713-37618732	MsG0580026450.01.T01:CDS	25.0%
!	GTTGATATGTATTGTAAATG+TGG	-	Chr5:37618152-37618171	MsG0580026450.01.T01:CDS	25.0%
!	TAAGTTTATGAACGAAATTC+AGG	-	Chr5:37618835-37618854	MsG0580026450.01.T01:CDS	25.0%
!	TAGAAAGCTAATGAATGATA+AGG	-	Chr5:37618712-37618731	MsG0580026450.01.T01:CDS	25.0%
!	TATTCTTCTTTACAAAGCAA+TGG	-	Chr5:37617659-37617678	MsG0580026450.01.T01:CDS	25.0%
!	TCATTAATCTCATCAATCAA+TGG	+	Chr5:37618905-37618924	None:intergenic	25.0%
!	TGATTGATGAGATTAATGAA+GGG	-	Chr5:37618906-37618925	MsG0580026450.01.T01:CDS	25.0%
!	TTGATTGATGAGATTAATGA+AGG	-	Chr5:37618905-37618924	MsG0580026450.01.T01:CDS	25.0%
!!	AAGCAAGTTTTTGAATCAAA+TGG	-	Chr5:37618611-37618630	MsG0580026450.01.T01:CDS	25.0%
!!	AGCAAGTTTTTGAATCAAAT+GGG	-	Chr5:37618612-37618631	MsG0580026450.01.T01:CDS	25.0%
!!	GATTTCATCACTTTAAAGAT+GGG	-	Chr5:37619110-37619129	MsG0580026450.01.T01:CDS	25.0%
!!!	GTATTTTGAAATGATGACTA+AGG	-	Chr5:37618397-37618416	MsG0580026450.01.T01:CDS	25.0%
!!!	TGTTTTGGTTAATACTTGTT+TGG	-	Chr5:37618130-37618149	MsG0580026450.01.T01:CDS	25.0%
	ACAAGTGATTAATGTGTTTG+AGG	+	Chr5:37617497-37617516	None:intergenic	30.0%
	AGTTAGAGATAGGATTAGAT+TGG	+	Chr5:37617524-37617543	None:intergenic	30.0%
	AGTTTATGAACGAAATTCAG+GGG	-	Chr5:37618837-37618856	MsG0580026450.01.T01:CDS	30.0%
	ATATGAACCTGATTGTTACA+CGG	-	Chr5:37618004-37618023	MsG0580026450.01.T01:CDS	30.0%
	ATCTCTATTAAACTACAACC+AGG	+	Chr5:37618752-37618771	None:intergenic	30.0%
	ATCTTTACTTTGTGGATGAT+TGG	+	Chr5:37618810-37618829	None:intergenic	30.0%
	ATTCATTTCTACTCTTCTTG+TGG	-	Chr5:37617840-37617859	MsG0580026450.01.T01:CDS	30.0%
	CCAACAAAAGTGATAGAATT+CGG	+	Chr5:37618329-37618348	None:intergenic	30.0%
	TCATGGAATTCGATTATCTT+AGG	-	Chr5:37618230-37618249	MsG0580026450.01.T01:CDS	30.0%
	TGTTTGATAAAATGTGCGAA+AGG	-	Chr5:37617886-37617905	MsG0580026450.01.T01:CDS	30.0%
	TTAAACCAGATGCTGTAATT+TGG	-	Chr5:37618525-37618544	MsG0580026450.01.T01:CDS	30.0%
!	AATGATTGATTCTTATGCGA+AGG	-	Chr5:37617932-37617951	MsG0580026450.01.T01:CDS	30.0%
!	ATTACAGCATCTGGTTTAAT+CGG	+	Chr5:37618524-37618543	None:intergenic	30.0%
!	CGATTTCATCACTTTAAAGA+TGG	-	Chr5:37619109-37619128	MsG0580026450.01.T01:CDS	30.0%
!	GTTGTTCTTGTATGGATTAT+TGG	-	Chr5:37619134-37619153	MsG0580026450.01.T01:CDS	30.0%
!	TATGTTTTGTGAGATGATGA+AGG	-	Chr5:37617980-37617999	MsG0580026450.01.T01:CDS	30.0%
!!	ATTGGATTATTTTACCCGAA+TGG	-	Chr5:37618283-37618302	MsG0580026450.01.T01:CDS	30.0%
!!	CACAAGCTTTAAGAACAAAA+GGG	+	Chr5:37617728-37617747	None:intergenic	30.0%
!!	TACTTGTTTTCGTTATTCGA+AGG	-	Chr5:37617750-37617769	MsG0580026450.01.T01:CDS	30.0%
!!!	ATGCTCATGTTTTGAAACTT+GGG	-	Chr5:37617784-37617803	MsG0580026450.01.T01:CDS	30.0%
	AAAGGGTAAGTGTGTTTATC+AGG	+	Chr5:37617711-37617730	None:intergenic	35.0%
	AAGGGAAACAGAATACTATG+AGG	-	Chr5:37618924-37618943	MsG0580026450.01.T01:CDS	35.0%
	AGGGGAAACTAGAATCTATA+GGG	-	Chr5:37618855-37618874	MsG0580026450.01.T01:CDS	35.0%
	ATGTTCCATGTGAAGGAATT+TGG	+	Chr5:37617594-37617613	None:intergenic	35.0%
	ATTCAAAAGCCCAAAAGCTA+TGG	+	Chr5:37618969-37618988	None:intergenic	35.0%
	GTATTGTAAATGTGGATCGT+TGG	-	Chr5:37618160-37618179	MsG0580026450.01.T01:CDS	35.0%
	TATGAGAATGTTCCATGTGA+AGG	+	Chr5:37617601-37617620	None:intergenic	35.0%
	TGTTCCATGTGAAGGAATTT+GGG	+	Chr5:37617593-37617612	None:intergenic	35.0%
	TTCGTTATTCGAAGGAAAAC+AGG	-	Chr5:37617758-37617777	MsG0580026450.01.T01:CDS	35.0%
	TTGAGTGCATGTAATCATAG+TGG	-	Chr5:37618353-37618372	MsG0580026450.01.T01:CDS	35.0%
	TTGATAAAATGTGCGAAAGG+AGG	-	Chr5:37617889-37617908	MsG0580026450.01.T01:CDS	35.0%
!	AATGTGTTTGAGGTTAGTGT+TGG	+	Chr5:37617487-37617506	None:intergenic	35.0%
!	ATAGTGGAATGGTTAACGAA+GGG	-	Chr5:37618369-37618388	MsG0580026450.01.T01:CDS	35.0%
!	ATTGATTCTTATGCGAAGGT+TGG	-	Chr5:37617936-37617955	MsG0580026450.01.T01:CDS	35.0%
!	GAAAAAGTGCGATAAGAATG+TGG	-	Chr5:37618100-37618119	MsG0580026450.01.T01:CDS	35.0%
!	GGGCTTTTGAATTCAAAATC+AGG	-	Chr5:37618977-37618996	MsG0580026450.01.T01:CDS	35.0%
!	TGCATGTAATCATAGTGGAA+TGG	-	Chr5:37618358-37618377	MsG0580026450.01.T01:CDS	35.0%
!	TTTGAGTGTGGATTTGTTTG+AGG	+	Chr5:37617551-37617570	None:intergenic	35.0%
!	TTTTCTCTACCTTCACCATT+CGG	+	Chr5:37618301-37618320	None:intergenic	35.0%
!!	CCGAATTCTATCACTTTTGT+TGG	-	Chr5:37618326-37618345	MsG0580026450.01.T01:CDS	35.0%
!!	GAATGTGGTTTGTGATGTTT+TGG	-	Chr5:37618115-37618134	MsG0580026450.01.T01:CDS	35.0%
!!	GCACAAGCTTTAAGAACAAA+AGG	+	Chr5:37617729-37617748	None:intergenic	35.0%
!!	TTATTTTACCCGAATGGTGA+AGG	-	Chr5:37618289-37618308	MsG0580026450.01.T01:CDS	35.0%
!!!	CATGCTCATGTTTTGAAACT+TGG	-	Chr5:37617783-37617802	MsG0580026450.01.T01:CDS	35.0%
	AACCAGATGCTGTAATTTGG+AGG	-	Chr5:37618528-37618547	MsG0580026450.01.T01:CDS	40.0%
	AAGTGTATGCTTCAGCAAGT+AGG	-	Chr5:37618669-37618688	MsG0580026450.01.T01:CDS	40.0%
	AGATGGGAGTTGTTCTTGTA+TGG	-	Chr5:37619126-37619145	MsG0580026450.01.T01:CDS	40.0%
	AGTGTGTAGTGACTGTCATA+AGG	-	Chr5:37619030-37619049	MsG0580026450.01.T01:CDS	40.0%
	CAAGTAGGTGGAATGATGTA+GGG	-	Chr5:37618684-37618703	MsG0580026450.01.T01:CDS	40.0%
	CAGGGGAAACTAGAATCTAT+AGG	-	Chr5:37618854-37618873	MsG0580026450.01.T01:CDS	40.0%
	CTTATCGAGATGTGAGTTCA+TGG	-	Chr5:37618213-37618232	MsG0580026450.01.T01:CDS	40.0%
	GGAAACAGAATACTATGAGG+TGG	-	Chr5:37618927-37618946	MsG0580026450.01.T01:CDS	40.0%
	GGGTATTTACCTGACTATTC+AGG	-	Chr5:37618875-37618894	MsG0580026450.01.T01:CDS	40.0%
	GTACAATGTTGAACCAAGTC+TGG	-	Chr5:37618421-37618440	MsG0580026450.01.T01:CDS	40.0%
	GTTCCATGTGAAGGAATTTG+GGG	+	Chr5:37617592-37617611	None:intergenic	40.0%
	TTCTTGTGGCTGTTTGGAAA+CGG	-	Chr5:37617854-37617873	MsG0580026450.01.T01:CDS	40.0%
	TTGAGGTGAGAGTTAGAGAT+AGG	+	Chr5:37617534-37617553	None:intergenic	40.0%
	TTTCTCTACCTTCACCATTC+GGG	+	Chr5:37618300-37618319	None:intergenic	40.0%
!	ATTGCTACGCAGGTTTTTGA+AGG	-	Chr5:37618185-37618204	MsG0580026450.01.T01:CDS	40.0%
!	CATAGTGGAATGGTTAACGA+AGG	-	Chr5:37618368-37618387	MsG0580026450.01.T01:CDS	40.0%
!	GTTTAGGTTCGCTTTCGTTA+GGG	-	Chr5:37618054-37618073	MsG0580026450.01.T01:CDS	40.0%
!	TTGTGCGAAGTATTTGAGTG+TGG	+	Chr5:37617563-37617582	None:intergenic	40.0%
!!	AGAGATTGGCCATAGCTTTT+GGG	-	Chr5:37618957-37618976	MsG0580026450.01.T01:CDS	40.0%
!!	GAATCAAATGGGAGTGTTTG+TGG	-	Chr5:37618623-37618642	MsG0580026450.01.T01:CDS	40.0%
!!	TTTGAGGTTAGTGTTGGTGT+TGG	+	Chr5:37617481-37617500	None:intergenic	40.0%
!!!	GCTGCTCATGAATTTTTTGC+CGG	-	Chr5:37618779-37618798	MsG0580026450.01.T01:CDS	40.0%
	AAACCACATTCAGAGCCTCT+TGG	+	Chr5:37618493-37618512	None:intergenic	45.0%
	AAAGGAGGAATGTGGTTTCG+TGG	-	Chr5:37617904-37617923	MsG0580026450.01.T01:CDS	45.0%
	AATGGTGCACCTGAATAGTC+AGG	+	Chr5:37618887-37618906	None:intergenic	45.0%
	AATGTGCGAAAGGAGGAATG+TGG	-	Chr5:37617896-37617915	MsG0580026450.01.T01:CDS	45.0%
	ACACCCCAAATTCCTTCACA+TGG	-	Chr5:37617586-37617605	MsG0580026450.01.T01:CDS	45.0%
	ATCGTTGGAAATTGCTACGC+AGG	-	Chr5:37618175-37618194	MsG0580026450.01.T01:CDS	45.0%
	CATCCATAATGCACCAGACT+TGG	+	Chr5:37618437-37618456	None:intergenic	45.0%
	CTACTCTTCTTGTGGCTGTT+TGG	-	Chr5:37617848-37617867	MsG0580026450.01.T01:CDS	45.0%
	CTCCTCCAAATTACAGCATC+TGG	+	Chr5:37618533-37618552	None:intergenic	45.0%
	GAACCAAGTCTGGTGCATTA+TGG	-	Chr5:37618431-37618450	MsG0580026450.01.T01:CDS	45.0%
	GCAAGTAGGTGGAATGATGT+AGG	-	Chr5:37618683-37618702	MsG0580026450.01.T01:CDS	45.0%
	GTTGATCTTTACGCTAGAGC+TGG	-	Chr5:37618461-37618480	MsG0580026450.01.T01:CDS	45.0%
	TGTATGCTTCAGCAAGTAGG+TGG	-	Chr5:37618672-37618691	MsG0580026450.01.T01:CDS	45.0%
	TTCGCTTTCGTTAGGGATGT+GGG	-	Chr5:37618061-37618080	MsG0580026450.01.T01:CDS	45.0%
!	ACACGGTGCAGAGTGTTATT+AGG	-	Chr5:37618021-37618040	MsG0580026450.01.T01:CDS	45.0%
!	AGTGTTATTAGGGCTTGTGG+CGG	-	Chr5:37618032-37618051	MsG0580026450.01.T01:CDS	45.0%
!	ATCTTAGGTTTTGCCGTGCA+TGG	-	Chr5:37618245-37618264	MsG0580026450.01.T01:CDS	45.0%
!	CACGGTGCAGAGTGTTATTA+GGG	-	Chr5:37618022-37618041	MsG0580026450.01.T01:CDS	45.0%
!	CAGAGTGTTATTAGGGCTTG+TGG	-	Chr5:37618029-37618048	MsG0580026450.01.T01:CDS	45.0%
!	GGTTTAGGTTCGCTTTCGTT+AGG	-	Chr5:37618053-37618072	MsG0580026450.01.T01:CDS	45.0%
!	TCTTAGGTTTTGCCGTGCAT+GGG	-	Chr5:37618246-37618265	MsG0580026450.01.T01:CDS	45.0%
!	TTGTGGATGATTGGTGTCTC+CGG	+	Chr5:37618801-37618820	None:intergenic	45.0%
!!	GAGAGATTGGCCATAGCTTT+TGG	-	Chr5:37618956-37618975	MsG0580026450.01.T01:CDS	45.0%
!!	GTTGGTGTTGGTTGTTGCAA+TGG	+	Chr5:37617469-37617488	None:intergenic	45.0%
!!	TCAAATGGGAGTGTTTGTGG+TGG	-	Chr5:37618626-37618645	MsG0580026450.01.T01:CDS	45.0%
	ATTAGGGCTTGTGGCGGTTT+AGG	-	Chr5:37618038-37618057	MsG0580026450.01.T01:CDS	50.0%
	CTCTGCACCGTGTAACAATC+AGG	+	Chr5:37618014-37618033	None:intergenic	50.0%
	GAGGTGGCATAGTGAGAGAT+TGG	-	Chr5:37618943-37618962	MsG0580026450.01.T01:CDS	50.0%
	GTTCGCTTTCGTTAGGGATG+TGG	-	Chr5:37618060-37618079	MsG0580026450.01.T01:CDS	50.0%
	TAGAGCTGGACACATCCAAG+AGG	-	Chr5:37618475-37618494	MsG0580026450.01.T01:CDS	50.0%
	TGGGAAAGCTAAGGCAGCAT+TGG	-	Chr5:37618265-37618284	MsG0580026450.01.T01:CDS	50.0%
!	AAGGGTGTGAGTAAAGAGCC+TGG	-	Chr5:37618731-37618750	MsG0580026450.01.T01:CDS	50.0%
!	TGCCTTAGCTTTCCCATGCA+CGG	+	Chr5:37618261-37618280	None:intergenic	50.0%
!!	CATCCAAGAGGCTCTGAATG+TGG	-	Chr5:37618487-37618506	MsG0580026450.01.T01:CDS	50.0%
	TGCCGTGCATGGGAAAGCTA+AGG	-	Chr5:37618256-37618275	MsG0580026450.01.T01:CDS	55.0%

Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
Chr5	gene	37617456	37619159	37617456	ID=MsG0580026450.01;Name=MsG0580026450.01
Chr5	mRNA	37617456	37619159	37617456	ID=MsG0580026450.01.T01;Parent=MsG0580026450.01;Name=MsG0580026450.01.T01;_AED=0.42;_eAED=0.42;_QI=0\|-1\|0\|1\|-1\|1\|1\|0\|567
Chr5	exon	37617456	37619159	37617456	ID=MsG0580026450.01.T01:exon:5833;Parent=MsG0580026450.01.T01
Chr5	CDS	37617456	37619159	37617456	ID=MsG0580026450.01.T01:cds;Parent=MsG0580026450.01.T01

Gene Sequence

>MsG0580026450.01.T01

ATGGCTTTGTCCATTGCAACAACCAACACCAACACTAACCTCAAACACATTAATCACTTGTTAAACCAATCTAATCCTATCTCTAACTCTCACCTCAAACAAATCCACACTCAAATACTTCGCACAATTCACACCCCAAATTCCTTCACATGGAACATTCTCATACGATCATACGCTAAATCAACACTTCACAAACACAAAGCTATTCTTCTTTACAAAGCAATGGTAAATGAACAAGAAAATGAACTCTTTCCTGATAAACACACTTACCCTTTTGTTCTTAAAGCTTGTGCTTACTTGTTTTCGTTATTCGAAGGAAAACAGGTTCATGCTCATGTTTTGAAACTTGGGTTTGAGTTAGATACTTATATTTGTAACAGTTTGATTCATTTCTACTCTTCTTGTGGCTGTTTGGAAACGGCGCGTAAAGTGTTTGATAAAATGTGCGAAAGGAGGAATGTGGTTTCGTGGAATGTAATGATTGATTCTTATGCGAAGGTTGGAGAGTATGATACTGTTTTGATTATGTTTTGTGAGATGATGAAGGTATATGAACCTGATTGTTACACGGTGCAGAGTGTTATTAGGGCTTGTGGCGGTTTAGGTTCGCTTTCGTTAGGGATGTGGGTTCATGCTTTTGTTTTGAAAAAGTGCGATAAGAATGTGGTTTGTGATGTTTTGGTTAATACTTGTTTGGTTGATATGTATTGTAAATGTGGATCGTTGGAAATTGCTACGCAGGTTTTTGAAGGAATGTCTTATCGAGATGTGAGTTCATGGAATTCGATTATCTTAGGTTTTGCCGTGCATGGGAAAGCTAAGGCAGCATTGGATTATTTTACCCGAATGGTGAAGGTAGAGAAAATTGTGCCGAATTCTATCACTTTTGTTGGTGTGTTGAGTGCATGTAATCATAGTGGAATGGTTAACGAAGGGTTGATGTATTTTGAAATGATGACTAAGGAGTACAATGTTGAACCAAGTCTGGTGCATTATGGATGTGTTGTTGATCTTTACGCTAGAGCTGGACACATCCAAGAGGCTCTGAATGTGGTTTCAGAAATGCCGATTAAACCAGATGCTGTAATTTGGAGGAGTCTTTTAGATGCTTGTTATAAGCAACATGCAAGTATCGAGCTAAGTGAAGAAATAACAAAGCAAGTTTTTGAATCAAATGGGAGTGTTTGTGGTGGTGCTTATGTTCTTTTGTCGAAAGTGTATGCTTCAGCAAGTAGGTGGAATGATGTAGGGTTGCTTAGAAAGCTAATGAATGATAAGGGTGTGAGTAAAGAGCCTGGTTGTAGTTTAATAGAGATAAATGGTGCTGCTCATGAATTTTTTGCCGGAGACACCAATCATCCACAAAGTAAAGATATATATAAGTTTATGAACGAAATTCAGGGGAAACTAGAATCTATAGGGTATTTACCTGACTATTCAGGTGCACCATTGATTGATGAGATTAATGAAGGGAAACAGAATACTATGAGGTGGCATAGTGAGAGATTGGCCATAGCTTTTGGGCTTTTGAATTCAAAATCAGGCATGCCAATAAGAGTATTTAAGAATCTTAGAGTGTGTAGTGACTGTCATAAGGTTACTAAATTAATATCTAGAATTTACAATGTGGAGATAATTGTAAGAGATCGTGTTCGATTTCATCACTTTAAAGATGGGAGTTGTTCTTGTATGGATTATTGGTGA

Protein sequence

>MsG0580026450.01.T01

MALSIATTNTNTNLKHINHLLNQSNPISNSHLKQIHTQILRTIHTPNSFTWNILIRSYAKSTLHKHKAILLYKAMVNEQENELFPDKHTYPFVLKACAYLFSLFEGKQVHAHVLKLGFELDTYICNSLIHFYSSCGCLETARKVFDKMCERRNVVSWNVMIDSYAKVGEYDTVLIMFCEMMKVYEPDCYTVQSVIRACGGLGSLSLGMWVHAFVLKKCDKNVVCDVLVNTCLVDMYCKCGSLEIATQVFEGMSYRDVSSWNSIILGFAVHGKAKAALDYFTRMVKVEKIVPNSITFVGVLSACNHSGMVNEGLMYFEMMTKEYNVEPSLVHYGCVVDLYARAGHIQEALNVVSEMPIKPDAVIWRSLLDACYKQHASIELSEEITKQVFESNGSVCGGAYVLLSKVYASASRWNDVGLLRKLMNDKGVSKEPGCSLIEINGAAHEFFAGDTNHPQSKDIYKFMNEIQGKLESIGYLPDYSGAPLIDEINEGKQNTMRWHSERLAIAFGLLNSKSGMPIRVFKNLRVCSDCHKVTKLISRIYNVEIIVRDRVRFHHFKDGSCSCMDYW*