AlfalfaGEDB | MsG0380012011.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380012011.01

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MsG0380012011.01.T01	AT2G35130	18.655	461	315	9	49	488	146	567	3.13e-13	73.6
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MsG0380012011.01.T01	AT3G53170	23.292	322	223	11	240	543	159	474	7.99e-11	65.5
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MsG0380012011.01.T01	AT2G26790	24.383	324	205	9	210	527	233	522	3.97e-12	70.5
MsG0380012011.01.T01	AT3G22670	21.723	267	189	8	299	549	170	432	4.21e-12	69.7
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Find 139 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 172 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence	on_target_score	Position	Region
TTGACTGCCTGTGCTGATTT+AGG	0.201513	3:-9482411	MsG0380012011.01.T01:CDS
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ACCTGACTGCTTTACTTTAG+TGG	0.290371	3:-9482136	MsG0380012011.01.T01:CDS
GATATTAAGGATTTGAGAAT+TGG	0.295659	3:-9482699	MsG0380012011.01.T01:CDS
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TCTGTTCTTGTGGTGATTAT+TGG	0.323447	3:-9481036	MsG0380012011.01.T01:CDS
TCTTGGACTAGTTTGGTTGC+AGG	0.324527	3:-9482834	MsG0380012011.01.T01:CDS
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CTCCATGTCTGTTCTCACCT+TGG	0.329137	3:+9481459	None:intergenic
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ATATTAGGTTATGCTCAAAA+TGG	0.344883	3:-9482213	MsG0380012011.01.T01:CDS
AGATTCTTCCTTATATGTAT+TGG	0.352733	3:+9481166	None:intergenic
ACATGATGCCCACCCTCATT+TGG	0.359954	3:+9481529	None:intergenic
GGAGATTGATGATGCGTATA+AGG	0.361067	3:-9482889	MsG0380012011.01.T01:CDS
AGAATTGGAAAGTCTATTCA+TGG	0.362082	3:-9482684	MsG0380012011.01.T01:CDS
GAAAAGATTTGAACTTGAAA+AGG	0.375575	3:-9483003	MsG0380012011.01.T01:CDS
GAGATTGTCAGAGAAGGATT+TGG	0.380174	3:-9482859	MsG0380012011.01.T01:CDS
CTCCACGTCATGAATAGAAT+TGG	0.381928	3:+9481273	None:intergenic
CGGATGGCCAAGTGGATTCA+TGG	0.388464	3:-9482078	MsG0380012011.01.T01:CDS
ATGGACAGGTGATAGTTAAT+GGG	0.393776	3:-9482968	MsG0380012011.01.T01:CDS
TTGCTGATTTATCGGTTAAC+CGG	0.394916	3:-9482098	MsG0380012011.01.T01:CDS
TTTGGTGTCTTGGACTAGTT+TGG	0.414136	3:-9482841	MsG0380012011.01.T01:CDS
AAGCTTCCTTGCAGTTTGAA+TGG	0.416542	3:+9481978	None:intergenic
ATGGTAATCCCTGGTTTGAT+AGG	0.417219	3:+9481637	None:intergenic
CAGAGAAGGATTTGGTGTCT+TGG	0.423030	3:-9482851	MsG0380012011.01.T01:CDS
AGGAAGAATCTAAGAGTTTG+TGG	0.426976	3:-9481154	MsG0380012011.01.T01:CDS
GGATATGGCACACATGGCCT+TGG	0.428742	3:-9481904	MsG0380012011.01.T01:CDS
TTATGGCTTGGAGCCTTCAA+TGG	0.432636	3:-9481737	MsG0380012011.01.T01:CDS
TGATTTAGGTGATCTTGAAC+GGG	0.434278	3:-9482397	MsG0380012011.01.T01:CDS
AAAAGATTTGAACTTGAAAA+GGG	0.434783	3:-9483002	MsG0380012011.01.T01:CDS
ACATGGAATGCAATGATAGA+TGG	0.438552	3:-9481925	MsG0380012011.01.T01:CDS
AAAGATGGATTCTGTTACGT+TGG	0.441954	3:-9482745	MsG0380012011.01.T01:CDS
CACAAGTGAAATGTACTTAG+TGG	0.442533	3:+9481117	None:intergenic
GGATGCAAAATGATGGTGTT+AGG	0.445433	3:-9483067	MsG0380012011.01.T01:CDS
AGATTCCATTCTTAAAATGA+TGG	0.447096	3:+9481056	None:intergenic
CAATAGCAAGCCTCTCACTA+TGG	0.448336	3:+9481221	None:intergenic
AAACAAATCCAAAGCTCTCT+CGG	0.448481	3:+9482791	None:intergenic
GGATTCATGGACTTGCAATA+AGG	0.448987	3:-9482065	MsG0380012011.01.T01:CDS
CATGAATCCACTTGGCCATC+CGG	0.450393	3:+9482079	None:intergenic
TGGTTATCCCGAGAGAGCTT+TGG	0.450627	3:-9482799	MsG0380012011.01.T01:CDS
TCCTTAATATCCGCCACAGC+TGG	0.460903	3:+9482711	None:intergenic
AGGCTCTTGGAGATAAGATC+AGG	0.461676	3:-9481318	MsG0380012011.01.T01:CDS
ACGGTACACCAATACATATA+AGG	0.462407	3:-9481174	MsG0380012011.01.T01:CDS
GTCGATCTCCTTGGTCGTGC+CGG	0.464451	3:-9481697	MsG0380012011.01.T01:CDS
TAAGCAAAATCATACACAAC+TGG	0.465171	3:+9483044	None:intergenic
TCGTGGAATACGATGATTGA+TGG	0.469730	3:-9482531	MsG0380012011.01.T01:CDS
CTTCAAATTATCAAAGATTG+AGG	0.475606	3:+9482266	None:intergenic
AATGCAATGATAGATGGATA+TGG	0.478014	3:-9481919	MsG0380012011.01.T01:CDS
AGTGCTGTGGTCGATCTCCT+TGG	0.478103	3:-9481706	MsG0380012011.01.T01:CDS
GTGTGAAAGGATTGCGAGGT+TGG	0.480603	3:-9482586	MsG0380012011.01.T01:CDS
CTTTACCATGCCATGCTCAA+AGG	0.484550	3:-9483137	MsG0380012011.01.T01:CDS
TATCATAGGATGCAAAATGA+TGG	0.485634	3:-9483074	MsG0380012011.01.T01:CDS
GAGATTTGTTCATAAATTAG+TGG	0.487439	3:-9482373	MsG0380012011.01.T01:CDS
GCACTATAGTGATCCATTGA+AGG	0.490301	3:+9481724	None:intergenic
AACAAATCCAAAGCTCTCTC+GGG	0.494908	3:+9482792	None:intergenic
TTTACCATGCCATGCTCAAA+GGG	0.496140	3:-9483136	MsG0380012011.01.T01:CDS
AAGTACATTTCACTTGTGAC+AGG	0.496753	3:-9481112	MsG0380012011.01.T01:CDS
GCTTATTTGTTGCAGTTGTG+TGG	0.497043	3:-9483026	MsG0380012011.01.T01:CDS
TCACTCGGGTTTCGTGGAAG+AGG	0.501197	3:-9481791	MsG0380012011.01.T01:CDS
CAAGAGATGCCTATCAAACC+AGG	0.505391	3:-9481646	MsG0380012011.01.T01:CDS
GGAGATAAGATCAGGGATGC+TGG	0.508230	3:-9481310	MsG0380012011.01.T01:CDS
CCGGAAAGTTACATGGTGCT+TGG	0.508775	3:-9481678	MsG0380012011.01.T01:CDS
GCCACTAAAGTAAAGCAGTC+AGG	0.510500	3:+9482135	None:intergenic
TATCTCGGCTTGTAGTCACT+CGG	0.510521	3:-9481806	MsG0380012011.01.T01:CDS
GTAACAAGTGTGTTGTTTCG+TGG	0.516519	3:-9482548	MsG0380012011.01.T01:CDS
TTGTAGTCACTCGGGTTTCG+TGG	0.521319	3:-9481797	MsG0380012011.01.T01:CDS
GGGTAGAGAGATTCATGGAC+AGG	0.526144	3:-9482982	MsG0380012011.01.T01:CDS
CTGATTTAGGTGATCTTGAA+CGG	0.527972	3:-9482398	MsG0380012011.01.T01:CDS
CCATTTCTTTCAAAGCATGA+AGG	0.527989	3:-9481764	MsG0380012011.01.T01:CDS
TGATTTATCGGTTAACCGGA+TGG	0.529299	3:-9482094	MsG0380012011.01.T01:CDS
CTTATTTGTTGCAGTTGTGT+GGG	0.531360	3:-9483025	MsG0380012011.01.T01:CDS
TCATGAATAGAATTGGTGTC+AGG	0.532626	3:+9481280	None:intergenic
GCACCTAAAATGGTAATCCC+TGG	0.535791	3:+9481628	None:intergenic
GCAGGAAGCTGGCTTAAAGA+TGG	0.537552	3:-9482760	MsG0380012011.01.T01:CDS
ATCTCGGCTTGTAGTCACTC+GGG	0.538194	3:-9481805	MsG0380012011.01.T01:CDS
TCTCTTACAATTCGAATACA+TGG	0.542176	3:+9482302	None:intergenic
TGTATATGTACTTTGAATGC+GGG	0.542178	3:-9482608	MsG0380012011.01.T01:CDS
GTTGCAGGATATGCGCAGAA+TGG	0.543080	3:-9482819	MsG0380012011.01.T01:CDS
GAAAAGGGTAGAGAGATTCA+TGG	0.548385	3:-9482987	MsG0380012011.01.T01:CDS
TTGTATATGTACTTTGAATG+CGG	0.549406	3:-9482609	MsG0380012011.01.T01:CDS
AATTCAACAAAACTGCAGCC+TGG	0.549958	3:+9481415	None:intergenic
CACTCGGGTTTCGTGGAAGA+GGG	0.550367	3:-9481790	MsG0380012011.01.T01:CDS
TGCAAGTCCATGAATCCACT+TGG	0.562383	3:+9482071	None:intergenic
AAGGGTATCCACAAAACTCC+AGG	0.564335	3:-9481433	MsG0380012011.01.T01:CDS
ATTTGAGTTAGATCCAAATG+AGG	0.567729	3:-9481542	MsG0380012011.01.T01:CDS
GGTCGTGCCGGAAAGTTACA+TGG	0.573537	3:-9481685	MsG0380012011.01.T01:CDS
ACTTTGAATGCGGGTGTGAA+AGG	0.579258	3:-9482599	MsG0380012011.01.T01:CDS
CATGAAGGAAGATTATGGCT+TGG	0.581075	3:-9481749	MsG0380012011.01.T01:CDS
CATACCCTTTGAGCATGGCA+TGG	0.586442	3:+9483132	None:intergenic
TCAAAATGGATACGTTAATG+AGG	0.587529	3:-9482199	MsG0380012011.01.T01:CDS
TAGATTTGGATTTGAGTCGA+AGG	0.590243	3:-9482652	MsG0380012011.01.T01:CDS
GAGTTAGATCCAAATGAGGG+TGG	0.599674	3:-9481538	MsG0380012011.01.T01:CDS
AATGTGGGACAAAGTGGCCA+AGG	0.599912	3:-9481476	MsG0380012011.01.T01:CDS
AAGATCACCTAAATCAGCAC+AGG	0.599971	3:+9482404	None:intergenic
TGCATCAATGTGGGACAAAG+TGG	0.600898	3:-9481482	MsG0380012011.01.T01:CDS
TTTGTCCCACATTGATGCAG+AGG	0.601956	3:+9481486	None:intergenic
CACCAATTCTATTCATGACG+TGG	0.602807	3:-9481275	MsG0380012011.01.T01:CDS
ATTTAGGTGATCTTGAACGG+GGG	0.605310	3:-9482395	MsG0380012011.01.T01:CDS
AGTTAGATCCAAATGAGGGT+GGG	0.608857	3:-9481537	MsG0380012011.01.T01:CDS
AGAAGAAAACAAACGTGACG+TGG	0.610802	3:-9482245	MsG0380012011.01.T01:CDS
GAAGTTCACACATTCTACTC+AGG	0.611214	3:-9481385	MsG0380012011.01.T01:CDS
GGCTCTTGGAGATAAGATCA+GGG	0.614327	3:-9481317	MsG0380012011.01.T01:CDS
AAGAATGGAATCTGTTCTTG+TGG	0.616666	3:-9481046	MsG0380012011.01.T01:CDS
TCATGCTTTGAAAGAAATGG+AGG	0.617570	3:+9481767	None:intergenic
GTGGAGCCATTCAAACTGCA+AGG	0.621786	3:-9481984	MsG0380012011.01.T01:CDS
GCCATAATTGCAACTCGTGT+AGG	0.622301	3:+9482438	None:intergenic
ATAAACATGTTCTTCAAACA+TGG	0.622598	3:-9483215	None:intergenic
TTTGAGTTAGATCCAAATGA+GGG	0.623540	3:-9481541	MsG0380012011.01.T01:CDS
GGCCAAGGTGAGAACAGACA+TGG	0.628700	3:-9481461	MsG0380012011.01.T01:CDS
CGGTTAACCGGATGGCCAAG+TGG	0.629537	3:-9482086	MsG0380012011.01.T01:CDS
GTAACTTTCCGGCACGACCA+AGG	0.630782	3:+9481689	None:intergenic
CATTTCACTTGTGACAGGGA+GGG	0.632830	3:-9481107	MsG0380012011.01.T01:CDS
ATAGATGGATATGGCACACA+TGG	0.637111	3:-9481910	MsG0380012011.01.T01:CDS
TTATAGTACGTGATTTACGT+AGG	0.638112	3:-9481081	MsG0380012011.01.T01:CDS
GTTGACATGTATGCAAAATG+TGG	0.639681	3:-9482003	MsG0380012011.01.T01:CDS
TGACGTGGAGGAAAATGTGA+AGG	0.640270	3:-9481260	MsG0380012011.01.T01:CDS
TTATATGTATTGGTGTACCG+TGG	0.642153	3:+9481176	None:intergenic
TACACGAGTTGCAATTATGG+CGG	0.642282	3:-9482436	MsG0380012011.01.T01:CDS
AGTACATTTCACTTGTGACA+GGG	0.644110	3:-9481111	MsG0380012011.01.T01:CDS
TGCTCAGTAGCCATAGTGAG+AGG	0.650272	3:-9481231	MsG0380012011.01.T01:CDS
AAGAACGGCATGTGATAACA+TGG	0.656936	3:-9481942	MsG0380012011.01.T01:CDS
AATGGATCACTATAGTGCTG+TGG	0.659703	3:-9481719	MsG0380012011.01.T01:CDS
ACATTTCACTTGTGACAGGG+AGG	0.669327	3:-9481108	MsG0380012011.01.T01:CDS
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CAATTCTATTCATGACGTGG+AGG	0.678272	3:-9481272	MsG0380012011.01.T01:CDS
AAGAGATGCCTATCAAACCA+GGG	0.683886	3:-9481645	MsG0380012011.01.T01:CDS
GTATGCCTCTGCATCAATGT+GGG	0.688519	3:-9481491	MsG0380012011.01.T01:CDS
TGTATGCCTCTGCATCAATG+TGG	0.688703	3:-9481492	MsG0380012011.01.T01:CDS
GCGGGTGTGAAAGGATTGCG+AGG	0.700457	3:-9482590	MsG0380012011.01.T01:CDS
AAATGTACTTAGTGGCATCG+TGG	0.702828	3:+9481125	None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content
!!!	TATAATTTGTTTTCTATGAT+TGG	-	Chr3:9481303-9481322	MsG0380012011.01.T01:CDS	15.0%
!!	AAAAGATTTGAACTTGAAAA+GGG	-	Chr3:9481240-9481259	MsG0380012011.01.T01:CDS	20.0%
!!	AATTCATAAAAATGTCGAAT+TGG	-	Chr3:9482655-9482674	MsG0380012011.01.T01:CDS	20.0%
!!	ATTCATAAAAATGTCGAATT+GGG	-	Chr3:9482656-9482675	MsG0380012011.01.T01:CDS	20.0%
!	AGATTCCATTCTTAAAATGA+TGG	+	Chr3:9483189-9483208	None:intergenic	25.0%
!	AGATTCTTCCTTATATGTAT+TGG	+	Chr3:9483079-9483098	None:intergenic	25.0%
!	ATATTAGGTTATGCTCAAAA+TGG	-	Chr3:9482029-9482048	MsG0380012011.01.T01:CDS	25.0%
!	CTTCAAATTATCAAAGATTG+AGG	+	Chr3:9481979-9481998	None:intergenic	25.0%
!	GAAAAGATTTGAACTTGAAA+AGG	-	Chr3:9481239-9481258	MsG0380012011.01.T01:CDS	25.0%
!	GACAAAAATGTTGTATCATT+TGG	+	Chr3:9482413-9482432	None:intergenic	25.0%
!	GATATTAAGGATTTGAGAAT+TGG	-	Chr3:9481543-9481562	MsG0380012011.01.T01:CDS	25.0%
!	TTGTATATGTACTTTGAATG+CGG	-	Chr3:9481633-9481652	MsG0380012011.01.T01:CDS	25.0%
!!	AACATTTTTGTCTGTTATCT+CGG	-	Chr3:9482421-9482440	MsG0380012011.01.T01:CDS	25.0%
!!	ATGGATTTTTATATGAAGTG+TGG	-	Chr3:9481330-9481349	MsG0380012011.01.T01:CDS	25.0%
!!	GAGATTTGTTCATAAATTAG+TGG	-	Chr3:9481869-9481888	MsG0380012011.01.T01:CDS	25.0%
!!	TGGATTTTTATATGAAGTGT+GGG	-	Chr3:9481331-9481350	MsG0380012011.01.T01:CDS	25.0%
!!!	ATGCTTTGTGTTTTTATCAT+AGG	-	Chr3:9481154-9481173	MsG0380012011.01.T01:CDS	25.0%
	AATGCAATGATAGATGGATA+TGG	-	Chr3:9482323-9482342	MsG0380012011.01.T01:CDS	30.0%
	AGAATTGGAAAGTCTATTCA+TGG	-	Chr3:9481558-9481577	MsG0380012011.01.T01:CDS	30.0%
	TAAGCAAAATCATACACAAC+TGG	+	Chr3:9481201-9481220	None:intergenic	30.0%
	TATCATAGGATGCAAAATGA+TGG	-	Chr3:9481168-9481187	MsG0380012011.01.T01:CDS	30.0%
	TCAAAATGGATACGTTAATG+AGG	-	Chr3:9482043-9482062	MsG0380012011.01.T01:CDS	30.0%
	TCTCTTACAATTCGAATACA+TGG	+	Chr3:9481943-9481962	None:intergenic	30.0%
	TGTATATGTACTTTGAATGC+GGG	-	Chr3:9481634-9481653	MsG0380012011.01.T01:CDS	30.0%
	TTATAGTACGTGATTTACGT+AGG	-	Chr3:9483161-9483180	MsG0380012011.01.T01:CDS	30.0%
!	ACTTGCAATAAGGACTTTTA+TGG	-	Chr3:9482187-9482206	MsG0380012011.01.T01:CDS	30.0%
!	ATTGATGGTTATGCACAAAT+AGG	-	Chr3:9481726-9481745	MsG0380012011.01.T01:CDS	30.0%
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!!	AGGTTCCATCATTTTAAGAA+TGG	-	Chr3:9483181-9483200	MsG0380012011.01.T01:CDS	30.0%
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!!!	GAGCTTTGGATTTGTTTTAT+CGG	-	Chr3:9481457-9481476	MsG0380012011.01.T01:CDS	30.0%
!!!	GTTTTCTATGATTGGTGTTA+TGG	-	Chr3:9481311-9481330	MsG0380012011.01.T01:CDS	30.0%
!!!	TGCTACTTTTTTGAAGATGT+TGG	-	Chr3:9481767-9481786	MsG0380012011.01.T01:CDS	30.0%
	AAACAAATCCAAAGCTCTCT+CGG	+	Chr3:9481454-9481473	None:intergenic	35.0%
	AAGAATGGAATCTGTTCTTG+TGG	-	Chr3:9483196-9483215	MsG0380012011.01.T01:CDS	35.0%
	AAGTACATTTCACTTGTGAC+AGG	-	Chr3:9483130-9483149	MsG0380012011.01.T01:CDS	35.0%
	ACATGGAATGCAATGATAGA+TGG	-	Chr3:9482317-9482336	MsG0380012011.01.T01:CDS	35.0%
	ACGGTACACCAATACATATA+AGG	-	Chr3:9483068-9483087	MsG0380012011.01.T01:CDS	35.0%
	AGAACAGACATGGAGAAAAA+GGG	-	Chr3:9482791-9482810	MsG0380012011.01.T01:CDS	35.0%
	AGGAAGAATCTAAGAGTTTG+TGG	-	Chr3:9483088-9483107	MsG0380012011.01.T01:CDS	35.0%
	AGTACATTTCACTTGTGACA+GGG	-	Chr3:9483131-9483150	MsG0380012011.01.T01:CDS	35.0%
	ATGGACAGGTGATAGTTAAT+GGG	-	Chr3:9481274-9481293	MsG0380012011.01.T01:CDS	35.0%
	CAAAGCATGAAGGAAGATTA+TGG	-	Chr3:9482488-9482507	MsG0380012011.01.T01:CDS	35.0%
	CACAAGTGAAATGTACTTAG+TGG	+	Chr3:9483128-9483147	None:intergenic	35.0%
	CATGGTTATGCTCTTAGATT+TGG	-	Chr3:9481576-9481595	MsG0380012011.01.T01:CDS	35.0%
	CCATTTCTTTCAAAGCATGA+AGG	-	Chr3:9482478-9482497	MsG0380012011.01.T01:CDS	35.0%
	CTGATTTAGGTGATCTTGAA+CGG	-	Chr3:9481844-9481863	MsG0380012011.01.T01:CDS	35.0%
	GTTGACATGTATGCAAAATG+TGG	-	Chr3:9482239-9482258	MsG0380012011.01.T01:CDS	35.0%
	TAGATTTGGATTTGAGTCGA+AGG	-	Chr3:9481590-9481609	MsG0380012011.01.T01:CDS	35.0%
	TCTGTTCTTGTGGTGATTAT+TGG	-	Chr3:9483206-9483225	MsG0380012011.01.T01:CDS	35.0%
	TGATTTAGGTGATCTTGAAC+GGG	-	Chr3:9481845-9481864	MsG0380012011.01.T01:CDS	35.0%
!	AAACCAGGGATTACCATTTT+AGG	-	Chr3:9482611-9482630	MsG0380012011.01.T01:CDS	35.0%
!	AAAGATGGATTCTGTTACGT+TGG	-	Chr3:9481497-9481516	MsG0380012011.01.T01:CDS	35.0%
!	CTTATTTGTTGCAGTTGTGT+GGG	-	Chr3:9481217-9481236	MsG0380012011.01.T01:CDS	35.0%
!	GATCAATAGCTTCTTTTCCA+AGG	+	Chr3:9482358-9482377	None:intergenic	35.0%
!	GGACTTTTAAACACAAACCA+CGG	-	Chr3:9483049-9483068	MsG0380012011.01.T01:CDS	35.0%
!	TCATGAATAGAATTGGTGTC+AGG	+	Chr3:9482965-9482984	None:intergenic	35.0%
!	TTATATGTATTGGTGTACCG+TGG	+	Chr3:9483069-9483088	None:intergenic	35.0%
!	TTTTCGACATGATGCAAGAA+CGG	-	Chr3:9482285-9482304	MsG0380012011.01.T01:CDS	35.0%
!!	CCTTCATGCTTTGAAAGAAA+TGG	+	Chr3:9482481-9482500	None:intergenic	35.0%
!!	TACTGCTCTTGCTGATTTAT+CGG	-	Chr3:9482136-9482155	MsG0380012011.01.T01:CDS	35.0%
!!	TCATGCTTTGAAAGAAATGG+AGG	+	Chr3:9482478-9482497	None:intergenic	35.0%
!!	TTGCTGATTTATCGGTTAAC+CGG	-	Chr3:9482144-9482163	MsG0380012011.01.T01:CDS	35.0%
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	AAATGTACTTAGTGGCATCG+TGG	+	Chr3:9483120-9483139	None:intergenic	40.0%
	AACAAATCCAAAGCTCTCTC+GGG	+	Chr3:9481453-9481472	None:intergenic	40.0%
	AAGAACGGCATGTGATAACA+TGG	-	Chr3:9482300-9482319	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
	AAGAGATGCCTATCAAACCA+GGG	-	Chr3:9482597-9482616	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
	AAGATCACCTAAATCAGCAC+AGG	+	Chr3:9481841-9481860	None:intergenic	40.0%
	AAGCTTCCTTGCAGTTTGAA+TGG	+	Chr3:9482267-9482286	None:intergenic	40.0%
	AATGGATCACTATAGTGCTG+TGG	-	Chr3:9482523-9482542	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
	AATTCAACAAAACTGCAGCC+TGG	+	Chr3:9482830-9482849	None:intergenic	40.0%
	ACCTACACGAGTTGCAATTA+TGG	-	Chr3:9481803-9481822	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
	ACCTAGCATTGCACCTAAAA+TGG	+	Chr3:9482627-9482646	None:intergenic	40.0%
	ACCTGACTGCTTTACTTTAG+TGG	-	Chr3:9482106-9482125	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
	ACGTGGAATGCGATGATATT+AGG	-	Chr3:9482014-9482033	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
	AGAAGAAAACAAACGTGACG+TGG	-	Chr3:9481997-9482016	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
	AGTTAGATCCAAATGAGGGT+GGG	-	Chr3:9482705-9482724	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
	ATAGATGGATATGGCACACA+TGG	-	Chr3:9482332-9482351	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
	ATTTAGGTGATCTTGAACGG+GGG	-	Chr3:9481847-9481866	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
	CAATTCTATTCATGACGTGG+AGG	-	Chr3:9482970-9482989	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
	CACCAATTCTATTCATGACG+TGG	-	Chr3:9482967-9482986	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
	CATGAAGGAAGATTATGGCT+TGG	-	Chr3:9482493-9482512	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
	CATGGACAGGTGATAGTTAA+TGG	-	Chr3:9481273-9481292	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
	CTCCACGTCATGAATAGAAT+TGG	+	Chr3:9482972-9482991	None:intergenic	40.0%
	GAAAAGGGTAGAGAGATTCA+TGG	-	Chr3:9481255-9481274	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
	GAAGTTCACACATTCTACTC+AGG	-	Chr3:9482857-9482876	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
	GAGAACAGACATGGAGAAAA+AGG	-	Chr3:9482790-9482809	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
	GAGATTGTCAGAGAAGGATT+TGG	-	Chr3:9481383-9481402	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
	GATTTAGGTGATCTTGAACG+GGG	-	Chr3:9481846-9481865	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
	GCACTATAGTGATCCATTGA+AGG	+	Chr3:9482521-9482540	None:intergenic	40.0%
	GGATTCATGGACTTGCAATA+AGG	-	Chr3:9482177-9482196	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
	TACACGAGTTGCAATTATGG+CGG	-	Chr3:9481806-9481825	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
	TCGTGGAATACGATGATTGA+TGG	-	Chr3:9481711-9481730	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
	TTTACCATGCCATGCTCAAA+GGG	-	Chr3:9481106-9481125	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
!	ATGGTAATCCCTGGTTTGAT+AGG	+	Chr3:9482608-9482627	None:intergenic	40.0%
!	GAAAATCTACGCTTTTCTCG+AGG	-	Chr3:9482904-9482923	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
!	GCTTATTTGTTGCAGTTGTG+TGG	-	Chr3:9481216-9481235	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
!	GGATGCAAAATGATGGTGTT+AGG	-	Chr3:9481175-9481194	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
!	TGATTTATCGGTTAACCGGA+TGG	-	Chr3:9482148-9482167	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
!	TTTTGCATACCCTTTGAGCA+TGG	+	Chr3:9481118-9481137	None:intergenic	40.0%
!!	ACCATTTTAGGTGCAATGCT+AGG	-	Chr3:9482623-9482642	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
!!	GGAGATTGATGATGCGTATA+AGG	-	Chr3:9481353-9481372	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
!!	GTAACAAGTGTGTTGTTTCG+TGG	-	Chr3:9481694-9481713	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
!!	TTTGGTGTCTTGGACTAGTT+TGG	-	Chr3:9481401-9481420	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
!!!	ATTGCGAGGTTGGTTTTTGA+GGG	-	Chr3:9481666-9481685	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
!!!	GGATTTGTTTTATCGGATGC+AGG	-	Chr3:9481464-9481483	MsG0380012011.01.T01:CDS	40.0%
	ACATTTCACTTGTGACAGGG+AGG	-	Chr3:9483134-9483153	MsG0380012011.01.T01:CDS	45.0%
	ACTTTGAATGCGGGTGTGAA+AGG	-	Chr3:9481643-9481662	MsG0380012011.01.T01:CDS	45.0%
	AGGCTCTTGGAGATAAGATC+AGG	-	Chr3:9482924-9482943	MsG0380012011.01.T01:CDS	45.0%
	CAAGAGATGCCTATCAAACC+AGG	-	Chr3:9482596-9482615	MsG0380012011.01.T01:CDS	45.0%
	CAATAGCAAGCCTCTCACTA+TGG	+	Chr3:9483024-9483043	None:intergenic	45.0%
	CATTTCACTTGTGACAGGGA+GGG	-	Chr3:9483135-9483154	MsG0380012011.01.T01:CDS	45.0%
	CCAAGCACCATGTAACTTTC+CGG	+	Chr3:9482567-9482586	None:intergenic	45.0%
	CTTTACCATGCCATGCTCAA+AGG	-	Chr3:9481105-9481124	MsG0380012011.01.T01:CDS	45.0%
	GAGTTAGATCCAAATGAGGG+TGG	-	Chr3:9482704-9482723	MsG0380012011.01.T01:CDS	45.0%
	GCACCTAAAATGGTAATCCC+TGG	+	Chr3:9482617-9482636	None:intergenic	45.0%
	GCCACTAAAGTAAAGCAGTC+AGG	+	Chr3:9482110-9482129	None:intergenic	45.0%
	GCCATAATTGCAACTCGTGT+AGG	+	Chr3:9481807-9481826	None:intergenic	45.0%
	GGCTCTTGGAGATAAGATCA+GGG	-	Chr3:9482925-9482944	MsG0380012011.01.T01:CDS	45.0%
	GTATGCCTCTGCATCAATGT+GGG	-	Chr3:9482751-9482770	MsG0380012011.01.T01:CDS	45.0%
	TGACGTGGAGGAAAATGTGA+AGG	-	Chr3:9482982-9483001	MsG0380012011.01.T01:CDS	45.0%
	TGCAAGTCCATGAATCCACT+TGG	+	Chr3:9482174-9482193	None:intergenic	45.0%
	TGCATCAATGTGGGACAAAG+TGG	-	Chr3:9482760-9482779	MsG0380012011.01.T01:CDS	45.0%
	TGTATGCCTCTGCATCAATG+TGG	-	Chr3:9482750-9482769	MsG0380012011.01.T01:CDS	45.0%
	TTTGTCCCACATTGATGCAG+AGG	+	Chr3:9482759-9482778	None:intergenic	45.0%
!	TATCTCGGCTTGTAGTCACT+CGG	-	Chr3:9482436-9482455	MsG0380012011.01.T01:CDS	45.0%
!	TTATGGCTTGGAGCCTTCAA+TGG	-	Chr3:9482505-9482524	MsG0380012011.01.T01:CDS	45.0%
!	TTTTATCGGATGCAGGAAGC+TGG	-	Chr3:9481471-9481490	MsG0380012011.01.T01:CDS	45.0%
!!	AAGGGTATCCACAAAACTCC+AGG	-	Chr3:9482809-9482828	MsG0380012011.01.T01:CDS	45.0%
!!	CAGAGAAGGATTTGGTGTCT+TGG	-	Chr3:9481391-9481410	MsG0380012011.01.T01:CDS	45.0%
!!	GAGAGGCTTGCTATTGCATT+TGG	-	Chr3:9483028-9483047	MsG0380012011.01.T01:CDS	45.0%
!!	TCTTGGACTAGTTTGGTTGC+AGG	-	Chr3:9481408-9481427	MsG0380012011.01.T01:CDS	45.0%
!!	TTGACTGCCTGTGCTGATTT+AGG	-	Chr3:9481831-9481850	MsG0380012011.01.T01:CDS	45.0%
!!!	GATTGCGAGGTTGGTTTTTG+AGG	-	Chr3:9481665-9481684	MsG0380012011.01.T01:CDS	45.0%
!!!	TTGCGAGGTTGGTTTTTGAG+GGG	-	Chr3:9481667-9481686	MsG0380012011.01.T01:CDS	45.0%
	AATGTGGGACAAAGTGGCCA+AGG	-	Chr3:9482766-9482785	MsG0380012011.01.T01:CDS	50.0%
	ACATGATGCCCACCCTCATT+TGG	+	Chr3:9482716-9482735	None:intergenic	50.0%
	CATACCCTTTGAGCATGGCA+TGG	+	Chr3:9481113-9481132	None:intergenic	50.0%
	CATGAATCCACTTGGCCATC+CGG	+	Chr3:9482166-9482185	None:intergenic	50.0%
	CCGGAAAGTTACATGGTGCT+TGG	-	Chr3:9482564-9482583	MsG0380012011.01.T01:CDS	50.0%
	CTCCATGTCTGTTCTCACCT+TGG	+	Chr3:9482786-9482805	None:intergenic	50.0%
	GGAGATAAGATCAGGGATGC+TGG	-	Chr3:9482932-9482951	MsG0380012011.01.T01:CDS	50.0%
	GGGTAGAGAGATTCATGGAC+AGG	-	Chr3:9481260-9481279	MsG0380012011.01.T01:CDS	50.0%
	GTGGAGCCATTCAAACTGCA+AGG	-	Chr3:9482258-9482277	MsG0380012011.01.T01:CDS	50.0%
	GTGTGAAAGGATTGCGAGGT+TGG	-	Chr3:9481656-9481675	MsG0380012011.01.T01:CDS	50.0%
	GTTGCAGGATATGCGCAGAA+TGG	-	Chr3:9481423-9481442	MsG0380012011.01.T01:CDS	50.0%
	TCCTTAATATCCGCCACAGC+TGG	+	Chr3:9481534-9481553	None:intergenic	50.0%
	TGCTCAGTAGCCATAGTGAG+AGG	-	Chr3:9483011-9483030	MsG0380012011.01.T01:CDS	50.0%
	TGGTTATCCCGAGAGAGCTT+TGG	-	Chr3:9481443-9481462	MsG0380012011.01.T01:CDS	50.0%
	TTGTAGTCACTCGGGTTTCG+TGG	-	Chr3:9482445-9482464	MsG0380012011.01.T01:CDS	50.0%
!	AACTGCAGCCTGGAGTTTTG+TGG	+	Chr3:9482820-9482839	None:intergenic	50.0%
!	ATCTCGGCTTGTAGTCACTC+GGG	-	Chr3:9482437-9482456	MsG0380012011.01.T01:CDS	50.0%
!	GCAGGAAGCTGGCTTAAAGA+TGG	-	Chr3:9481482-9481501	MsG0380012011.01.T01:CDS	50.0%
!	GCGTAGATTTTCTTCGCTCG+AGG	+	Chr3:9482896-9482915	None:intergenic	50.0%
!	GGTTAGTGTTTTGCCAGCTG+TGG	-	Chr3:9481518-9481537	MsG0380012011.01.T01:CDS	50.0%
!	TACGCTTTTCTCGAGGCTCT+TGG	-	Chr3:9482911-9482930	MsG0380012011.01.T01:CDS	50.0%
!	TAGTGTTTTGCCAGCTGTGG+CGG	-	Chr3:9481521-9481540	MsG0380012011.01.T01:CDS	50.0%
	AGTGCTGTGGTCGATCTCCT+TGG	-	Chr3:9482536-9482555	MsG0380012011.01.T01:CDS	55.0%
	CACTCGGGTTTCGTGGAAGA+GGG	-	Chr3:9482452-9482471	MsG0380012011.01.T01:CDS	55.0%
	GGATATGGCACACATGGCCT+TGG	-	Chr3:9482338-9482357	MsG0380012011.01.T01:CDS	55.0%
	GGCCAAGGTGAGAACAGACA+TGG	-	Chr3:9482781-9482800	MsG0380012011.01.T01:CDS	55.0%
	GGTCGTGCCGGAAAGTTACA+TGG	-	Chr3:9482557-9482576	MsG0380012011.01.T01:CDS	55.0%
	GTAACTTTCCGGCACGACCA+AGG	+	Chr3:9482556-9482575	None:intergenic	55.0%
	TCACTCGGGTTTCGTGGAAG+AGG	-	Chr3:9482451-9482470	MsG0380012011.01.T01:CDS	55.0%
!	CGGATGGCCAAGTGGATTCA+TGG	-	Chr3:9482164-9482183	MsG0380012011.01.T01:CDS	55.0%
!!	GCCAGCTGTGGCGGATATTA+AGG	-	Chr3:9481530-9481549	MsG0380012011.01.T01:CDS	55.0%
	CGGTTAACCGGATGGCCAAG+TGG	-	Chr3:9482156-9482175	MsG0380012011.01.T01:CDS	60.0%
	GCGGGTGTGAAAGGATTGCG+AGG	-	Chr3:9481652-9481671	MsG0380012011.01.T01:CDS	60.0%
	GTCGATCTCCTTGGTCGTGC+CGG	-	Chr3:9482545-9482564	MsG0380012011.01.T01:CDS	60.0%

Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
Chr3	gene	9481033	9483231	9481033	ID=MsG0380012011.01;Name=MsG0380012011.01
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Chr3	exon	9481033	9483231	9481033	ID=MsG0380012011.01.T01:exon:2867;Parent=MsG0380012011.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0380012011.01.T01

ATGTTCTTCAAACATGGCAGCATCAATGAAGCATCTCTTGTCTTTGACACTGTTGAACATAAACAAGATGTTCTTTACCATGCCATGCTCAAAGGGTATGCAAAAAACTCATCTTTATGTGATGCTTTGTGTTTTTATCATAGGATGCAAAATGATGGTGTTAGGCCAGTTGTGTATGATTTTGCTTATTTGTTGCAGTTGTGTGGGAAAAGATTTGAACTTGAAAAGGGTAGAGAGATTCATGGACAGGTGATAGTTAATGGGTTTGAGTATAATTTGTTTTCTATGATTGGTGTTATGGATTTTTATATGAAGTGTGGGGAGATTGATGATGCGTATAAGGTTTTTGAGAGATTGTCAGAGAAGGATTTGGTGTCTTGGACTAGTTTGGTTGCAGGATATGCGCAGAATGGTTATCCCGAGAGAGCTTTGGATTTGTTTTATCGGATGCAGGAAGCTGGCTTAAAGATGGATTCTGTTACGTTGGTTAGTGTTTTGCCAGCTGTGGCGGATATTAAGGATTTGAGAATTGGAAAGTCTATTCATGGTTATGCTCTTAGATTTGGATTTGAGTCGAAGGTTAGTTTTACAAATGCGCTTTTGTATATGTACTTTGAATGCGGGTGTGAAAGGATTGCGAGGTTGGTTTTTGAGGGGATGAGTAACAAGTGTGTTGTTTCGTGGAATACGATGATTGATGGTTATGCACAAATAGGAAAATCTGAAGAAGCGTTTGCTACTTTTTTGAAGATGTTGGATGAAGGAGTTGAACCTACACGAGTTGCAATTATGGCGGCTTTGACTGCCTGTGCTGATTTAGGTGATCTTGAACGGGGGAGATTTGTTCATAAATTAGTGGATCGACTGAAACTTGATTTTGAAGTGTCTGTTATGAACTCTTTACTATCCATGTATTCGAATTGTAAGAGAGTTGACGTCGCAGCCTCAATCTTTGATAATTTGAAGAAGAAAACAAACGTGACGTGGAATGCGATGATATTAGGTTATGCTCAAAATGGATACGTTAATGAGGCTTTAAATCTGTTTTGTGTGATGCAATCTCAAGAAGTTAAACCTGACTGCTTTACTTTAGTGGCTGTAATTACTGCTCTTGCTGATTTATCGGTTAACCGGATGGCCAAGTGGATTCATGGACTTGCAATAAGGACTTTTATGGACAATGATGTCTATGTTGCTACTGCTCTTGTTGACATGTATGCAAAATGTGGAGCCATTCAAACTGCAAGGAAGCTTTTCGACATGATGCAAGAACGGCATGTGATAACATGGAATGCAATGATAGATGGATATGGCACACATGGCCTTGGAAAAGAAGCTATTGATCTCTTTGACGATATGCAGAAAGAAGCTGTTATGCCAAATGATACAACATTTTTGTCTGTTATCTCGGCTTGTAGTCACTCGGGTTTCGTGGAAGAGGGCCTCCATTTCTTTCAAAGCATGAAGGAAGATTATGGCTTGGAGCCTTCAATGGATCACTATAGTGCTGTGGTCGATCTCCTTGGTCGTGCCGGAAAGTTACATGGTGCTTGGAATTTAATTCAAGAGATGCCTATCAAACCAGGGATTACCATTTTAGGTGCAATGCTAGGTGCTTGCAAAATTCATAAAAATGTCGAATTGGGCGAAAAAGCTGCAGACAAACTATTTGAGTTAGATCCAAATGAGGGTGGGCATCATGTTCTGCTAGCAAACATGTATGCCTCTGCATCAATGTGGGACAAAGTGGCCAAGGTGAGAACAGACATGGAGAAAAAGGGTATCCACAAAACTCCAGGCTGCAGTTTTGTTGAATTGAGAAATGAAGTTCACACATTCTACTCAGGAAGTACGAATCATCCTCGAGCGAAGAAAATCTACGCTTTTCTCGAGGCTCTTGGAGATAAGATCAGGGATGCTGGTTACATACCTGACACCAATTCTATTCATGACGTGGAGGAAAATGTGAAGGAGCAATTGCTCAGTAGCCATAGTGAGAGGCTTGCTATTGCATTTGGACTTTTAAACACAAACCACGGTACACCAATACATATAAGGAAGAATCTAAGAGTTTGTGGAGACTGCCACGATGCCACTAAGTACATTTCACTTGTGACAGGGAGGGAAATTATAGTACGTGATTTACGTAGGTTCCATCATTTTAAGAATGGAATCTGTTCTTGTGGTGATTATTGGTGA

Protein sequence

>MsG0380012011.01.T01

MFFKHGSINEASLVFDTVEHKQDVLYHAMLKGYAKNSSLCDALCFYHRMQNDGVRPVVYDFAYLLQLCGKRFELEKGREIHGQVIVNGFEYNLFSMIGVMDFYMKCGEIDDAYKVFERLSEKDLVSWTSLVAGYAQNGYPERALDLFYRMQEAGLKMDSVTLVSVLPAVADIKDLRIGKSIHGYALRFGFESKVSFTNALLYMYFECGCERIARLVFEGMSNKCVVSWNTMIDGYAQIGKSEEAFATFLKMLDEGVEPTRVAIMAALTACADLGDLERGRFVHKLVDRLKLDFEVSVMNSLLSMYSNCKRVDVAASIFDNLKKKTNVTWNAMILGYAQNGYVNEALNLFCVMQSQEVKPDCFTLVAVITALADLSVNRMAKWIHGLAIRTFMDNDVYVATALVDMYAKCGAIQTARKLFDMMQERHVITWNAMIDGYGTHGLGKEAIDLFDDMQKEAVMPNDTTFLSVISACSHSGFVEEGLHFFQSMKEDYGLEPSMDHYSAVVDLLGRAGKLHGAWNLIQEMPIKPGITILGAMLGACKIHKNVELGEKAADKLFELDPNEGGHHVLLANMYASASMWDKVAKVRTDMEKKGIHKTPGCSFVELRNEVHTFYSGSTNHPRAKKIYAFLEALGDKIRDAGYIPDTNSIHDVEENVKEQLLSSHSERLAIAFGLLNTNHGTPIHIRKNLRVCGDCHDATKYISLVTGREIIVRDLRRFHHFKNGICSCGDYW*