AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880044884.01


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MsG0880044884.01.T02 AT3G21250 22.826 276 197 4 1229 1503 573 833 6.42e-13 74.7
MsG0880044884.01.T02 AT3G13100 41.801 1244 708 8 267 1502 1 1236 0.0 983
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MsG0880044884.01.T02 AT3G21250 22.826 276 197 4 1229 1503 151 411 1.31e-12 73.6
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MsG0880044884.01.T02 AT4G28630 30.000 220 139 3 667 872 460 678 6.02e-20 96.7
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MsG0880044884.01.T02 AT1G27940 31.489 235 144 4 667 887 396 627 8.26e-26 116
MsG0880044884.01.T02 AT1G27940 28.431 306 199 6 562 853 929 1228 5.82e-22 104
MsG0880044884.01.T02 AT5G58270 35.319 235 150 2 1261 1494 477 710 2.01e-37 152
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MsG0880044884.01.T02 AT3G28860 26.439 556 351 17 982 1503 84 615 1.22e-36 152
MsG0880044884.01.T02 AT3G28860 31.602 231 156 2 1260 1488 1007 1237 3.52e-29 127
MsG0880044884.01.T02 AT3G28860 26.477 491 317 13 642 1096 365 847 1.81e-28 125
MsG0880044884.01.T02 AT3G28860 30.342 234 146 4 634 853 1004 1234 1.49e-22 106
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MsG0880044884.01.T02 AT4G18050 28.938 273 174 6 634 889 349 618 1.98e-22 105
MsG0880044884.01.T02 AT4G18050 27.778 252 163 5 634 869 987 1235 2.51e-20 99.0
MsG0880044884.01.T02 AT4G18050 24.593 553 370 14 970 1496 70 601 5.67e-36 149
MsG0880044884.01.T02 AT4G18050 33.750 240 155 3 1260 1495 1000 1239 2.58e-33 141
MsG0880044884.01.T02 AT4G18050 28.938 273 174 6 634 889 359 628 1.93e-22 105
MsG0880044884.01.T02 AT4G18050 27.778 252 163 5 634 869 997 1245 2.30e-20 99.0
MsG0880044884.01.T02 AT4G01820 26.592 534 327 16 1006 1496 73 584 3.03e-35 147
MsG0880044884.01.T02 AT4G01820 23.333 510 328 11 634 1103 342 828 5.00e-24 110
MsG0880044884.01.T02 AT1G02530 26.240 484 321 12 1022 1486 127 593 1.49e-34 144
MsG0880044884.01.T02 AT1G02530 23.977 513 340 12 638 1103 362 871 3.92e-23 107
MsG0880044884.01.T02 AT1G27940 31.250 256 171 3 1242 1495 139 391 1.77e-34 144
MsG0880044884.01.T02 AT1G27940 31.939 263 165 5 1237 1491 764 1020 1.72e-30 131
MsG0880044884.01.T02 AT1G27940 31.224 237 146 4 665 887 180 413 5.65e-26 117
MsG0880044884.01.T02 AT1G27940 28.431 306 199 6 562 853 715 1014 4.11e-22 104
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MsG0880044884.01.T02 AT2G47000 24.031 516 325 12 634 1096 378 879 1.88e-26 118
MsG0880044884.01.T02 AT2G47000 26.680 491 314 13 1022 1488 143 611 2.14e-34 144
MsG0880044884.01.T02 AT2G47000 24.031 516 325 12 634 1096 378 879 1.88e-26 118
MsG0880044884.01.T02 AT2G47000 34.894 235 143 3 1260 1488 381 611 2.30e-34 144
MsG0880044884.01.T02 AT2G47000 24.031 516 325 12 634 1096 378 879 1.35e-26 119
MsG0880044884.01.T02 AT1G70610 24.809 524 349 13 1001 1500 14 516 7.96e-34 138
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MsG0880044884.01.T02 AT1G70610 23.899 477 299 19 423 857 233 687 2.38e-16 85.1
MsG0880044884.01.T02 AT5G03910 35.094 265 152 4 1230 1484 366 620 2.21e-32 135
MsG0880044884.01.T02 AT5G03910 25.641 312 195 9 582 873 336 630 2.31e-18 91.7
MsG0880044884.01.T02 AT4G01830 32.258 248 161 4 1261 1502 983 1229 5.87e-31 133
MsG0880044884.01.T02 AT4G01830 25.926 486 320 12 1022 1486 112 578 9.78e-31 132
MsG0880044884.01.T02 AT4G01830 24.008 479 289 12 422 854 129 578 1.19e-21 103
MsG0880044884.01.T02 AT4G01830 28.854 253 154 8 634 866 979 1225 1.07e-19 96.7
MsG0880044884.01.T02 AT4G01830 32.258 248 161 4 1261 1502 749 995 6.23e-31 133
MsG0880044884.01.T02 AT4G01830 34.052 232 145 3 1260 1486 116 344 1.45e-29 128
MsG0880044884.01.T02 AT4G01830 30.396 227 143 3 642 854 119 344 2.44e-21 102
MsG0880044884.01.T02 AT4G01830 28.854 253 154 8 634 866 745 991 1.25e-19 96.3
MsG0880044884.01.T02 AT2G36910 29.752 242 164 4 1260 1496 1021 1261 4.53e-30 130
MsG0880044884.01.T02 AT2G36910 30.705 241 161 4 1261 1496 366 605 5.05e-29 127
MsG0880044884.01.T02 AT2G36910 30.980 255 155 5 642 876 368 621 4.41e-25 114
MsG0880044884.01.T02 AT2G36910 30.837 227 142 3 642 854 1024 1249 1.60e-20 99.4
MsG0880044884.01.T02 AT2G39480 24.413 639 413 20 874 1473 764 1371 2.88e-29 128
MsG0880044884.01.T02 AT2G39480 23.904 502 327 13 1022 1496 173 646 1.55e-24 112
MsG0880044884.01.T02 AT2G39480 25.694 288 189 5 642 912 412 691 4.29e-19 94.7
MsG0880044884.01.T02 AT2G39480 27.820 266 168 6 624 867 1142 1405 1.38e-18 93.2
MsG0880044884.01.T02 AT2G39480 24.413 639 413 20 874 1473 584 1191 4.50e-29 127
MsG0880044884.01.T02 AT2G39480 28.870 239 167 2 1260 1496 229 466 4.64e-24 110
MsG0880044884.01.T02 AT2G39480 25.694 288 189 5 642 912 232 511 6.59e-19 94.4
MsG0880044884.01.T02 AT2G39480 27.820 266 168 6 624 867 962 1225 1.95e-18 92.8
MsG0880044884.01.T02 AT3G55320 23.988 667 431 22 874 1498 765 1397 4.19e-28 124
MsG0880044884.01.T02 AT3G55320 24.194 496 333 13 1022 1496 175 648 7.61e-26 117
MsG0880044884.01.T02 AT3G55320 24.625 333 216 5 548 866 1086 1397 2.57e-20 99.0
MsG0880044884.01.T02 AT3G55320 25.726 241 165 3 642 869 414 653 6.35e-17 87.8
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MsG0880044884.01.T02 AT4G25450 33.182 220 144 1 1279 1495 487 706 8.94e-26 115
MsG0880044884.01.T02 AT4G25450 26.552 290 188 7 590 863 426 706 1.42e-17 89.4
MsG0880044884.01.T02 AT1G67940 35.981 214 119 5 1279 1484 44 247 4.87e-23 100
MsG0880044884.01.T02 AT5G39040 22.727 374 268 7 995 1358 130 492 6.87e-19 92.8
MsG0880044884.01.T02 AT2G13610 23.894 339 230 10 631 944 31 366 2.13e-12 72.4
MsG0880044884.01.T02 AT2G39350 26.549 226 145 7 668 873 118 342 4.62e-11 68.2
MsG0880044884.01.T02 AT4G39850 27.632 228 142 7 1263 1480 448 662 4.74e-11 68.6
MsG0880044884.01.T02 AT4G39850 27.700 213 132 6 1278 1480 462 662 4.97e-11 68.6
MsG0880044884.01.T02 AT4G39850 27.700 213 132 6 1278 1480 462 662 4.97e-11 68.6
MsG0880044884.01.T02 AT4G39850 27.700 213 132 6 1278 1480 462 662 5.14e-11 68.6

Find 18 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 491 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATCTCTAATAACAAGAAATT+TGG 0.135394 8:+50892995 None:intergenic
GCACATAAGTGTAAAATTTC+AGG 0.174631 8:-50891037 MsG0880044884.01.T01:three_prime_UTR
TCTTGATTTCTGCATCATTC+TGG 0.229072 8:-50892947 MsG0880044884.01.T01:intron
TATTCAACGATAAATAAATA+AGG 0.276885 8:+50892729 None:intergenic
TAATTCAGCAATATCTTTAC+TGG 0.282672 8:+50892531 None:intergenic
CTAGAAGCAGAGTATATAAT+TGG 0.299266 8:-50892916 MsG0880044884.01.T01:intron
GTTATTAGAGATATAAAGTT+TGG 0.314250 8:-50892984 MsG0880044884.01.T01:intron
GGTAAAGAAAATTAGAAGTA+TGG 0.325200 8:-50892829 MsG0880044884.01.T01:intron
AGGAAACAAATAAGTTTGTA+TGG 0.338784 8:+50892470 None:intergenic
TAAAATGAGTTGAATTTGCT+TGG 0.375273 8:+50892883 None:intergenic
CACATAAGTGTAAAATTTCA+GGG 0.423327 8:-50891036 None:intergenic
TATCATTAAATACTATAAAC+CGG 0.448321 8:+50892430 None:intergenic
CAACTTAATCATAGTTATGA+TGG 0.476555 8:-50893023 MsG0880044884.01.T01:intron
GGAAACAAATAAGTTTGTAT+GGG 0.522394 8:+50892471 None:intergenic
CATAAGTGTAAAATTTCAGG+GGG 0.612027 8:-50891034 None:intergenic
GGTCTTTCAAGCAAACGTGA+TGG 0.633239 8:+50893087 None:intergenic
GATATTGCTGAATTAAGCTG+CGG 0.658771 8:-50892523 MsG0880044884.01.T01:intron
ACATAAGTGTAAAATTTCAG+GGG 0.679769 8:-50891035 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAAAAAATTGAAAAAATTC+TGG - Chr8:50898578-50898597 MsG0880044884.01.T01:CDS 10.0%
!! TAAAAAAGATTAAAAAATTC+TGG - Chr8:50898830-50898849 MsG0880044884.01.T01:CDS 10.0%
!! TAATAAAAATGAAAAAAATC+TGG - Chr8:50898696-50898715 MsG0880044884.01.T01:CDS 10.0%
!! TGAAAAATTAAAAAAAATTC+TGG + Chr8:50899606-50899625 None:intergenic 10.0%
!! TTTACTCAAAATAAATATAA+TGG + Chr8:50898352-50898371 None:intergenic 10.0%
!!! ATATATACTAATCAAAATTT+TGG - Chr8:50899266-50899285 MsG0880044884.01.T01:CDS 10.0%
!!! TAATTACTTAAATTTTTTCA+TGG + Chr8:50897278-50897297 None:intergenic 10.0%
!!! TATATTTATTTTGAGTAAAT+AGG - Chr8:50898353-50898372 MsG0880044884.01.T01:CDS 10.0%
!!! TTACTAATGTATTTTTATAA+GGG + Chr8:50895669-50895688 None:intergenic 10.0%
!!! TTATTATATTATTTTGTTAG+TGG - Chr8:50896958-50896977 MsG0880044884.01.T01:intron 10.0%
!!! TTTAAATTTTAATGAAATTC+TGG - Chr8:50898916-50898935 MsG0880044884.01.T01:CDS 10.0%
!!! TTTCTAAAAAAATTAAAATC+TGG - Chr8:50898873-50898892 MsG0880044884.01.T01:CDS 10.0%
!! AAAAAATGTTGAAAATAAAG+AGG - Chr8:50897830-50897849 MsG0880044884.01.T01:CDS 15.0%
!! ATTCTTGAAAATAAAAATTC+TGG - Chr8:50898957-50898976 MsG0880044884.01.T01:CDS 15.0%
!! CTGAAAAAATTTAAAAAAAC+TGG - Chr8:50898744-50898763 MsG0880044884.01.T01:CDS 15.0%
!! GAAAAATAATGAAAAAATTC+TGG + Chr8:50898820-50898801 None:intergenic 15.0%
!! TAATAGAAAGTTTAATAAAG+TGG - Chr8:50897355-50897374 MsG0880044884.01.T01:intron 15.0%
!! TATCATTAAATACTATAAAC+CGG + Chr8:50898253-50898272 None:intergenic 15.0%
!! TATTCAACGATAAATAAATA+AGG + Chr8:50897954-50897973 None:intergenic 15.0%
!!! AAAAAAAAGATGACTAATTT+TGG + Chr8:50897886-50897905 None:intergenic 15.0%
!!! AAAAAAAGATGACTAATTTT+GGG + Chr8:50897885-50897904 None:intergenic 15.0%
!!! AATAATGCAATTTGTTTTTT+TGG + Chr8:50894113-50894132 None:intergenic 15.0%
!!! ACATTTAAGTTTTTAGTTAT+TGG + Chr8:50896724-50896743 None:intergenic 15.0%
!!! ATACTTTTTTGGTTATAAAA+TGG - Chr8:50896236-50896255 MsG0880044884.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATTTTCATTAGTATTTTTTC+CGG - Chr8:50899155-50899174 MsG0880044884.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATTTTTGTGTATTTATAAAC+CGG - Chr8:50899097-50899116 MsG0880044884.01.T01:CDS 15.0%
!!! CAGAAAATTTTATAAACAAT+TGG - Chr8:50892109-50892128 MsG0880044884.01.T01:intron 15.0%
!!! GTTACTAATGTATTTTTATA+AGG + Chr8:50895670-50895689 None:intergenic 15.0%
!!! TAACAAAATTTTGAATTTGA+TGG + Chr8:50897383-50897402 None:intergenic 15.0%
!!! TAGTATTTCTCAAAATTTTA+CGG - Chr8:50899072-50899091 MsG0880044884.01.T01:CDS 15.0%
!!! TAGTCATCTTTTTTTTTTTA+GGG - Chr8:50897890-50897909 MsG0880044884.01.T01:CDS 15.0%
!!! TATATATTTTCTTTCTAACA+TGG - Chr8:50891138-50891157 MsG0880044884.01.T01:three_prime_UTR 15.0%
!!! TTAGTCATCTTTTTTTTTTT+AGG - Chr8:50897889-50897908 MsG0880044884.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTTTTAATTTTTCAAGTTCA+GGG - Chr8:50899612-50899631 MsG0880044884.01.T01:five_prime_UTR 15.0%
!!! TTTTTAATTTTTCAAGTTCA+GGG + Chr8:50899631-50899612 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTTTAATTTTTCAAGTTC+AGG - Chr8:50899611-50899630 MsG0880044884.01.T01:five_prime_UTR 15.0%
!!! TTTTTTAATTTTTCAAGTTC+AGG + Chr8:50899630-50899611 None:intergenic 15.0%
!! AACTGACAATTCATTTATAA+TGG + Chr8:50893795-50893814 None:intergenic 20.0%
!! AAGATTAGACAGTTTAATAT+GGG - Chr8:50896129-50896148 MsG0880044884.01.T01:CDS 20.0%
!! AATACTGTTTGTATACATTA+AGG + Chr8:50894534-50894553 None:intergenic 20.0%
!! AATAGATTCTTAGTGATAAA+GGG + Chr8:50891711-50891730 None:intergenic 20.0%
!! ACAAAAAAGAACAAAGATAA+TGG + Chr8:50891859-50891878 None:intergenic 20.0%
!! ACATATTGGTAAGATAAATT+GGG + Chr8:50894023-50894042 None:intergenic 20.0%
!! ATAAATACACAAAAAGTTTC+CGG + Chr8:50899202-50899221 None:intergenic 20.0%
!! ATCAAAGAAAACATATTGTT+TGG - Chr8:50893481-50893500 MsG0880044884.01.T01:intron 20.0%
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!! ATGATTAACTCAATAAAGTT+CGG + Chr8:50896693-50896712 None:intergenic 20.0%
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!!! CTAATTTTACTTACTACTTA+TGG - Chr8:50895606-50895625 MsG0880044884.01.T01:CDS 20.0%
!!! GCACATATTTAATACTTTTT+TGG - Chr8:50896225-50896244 MsG0880044884.01.T01:CDS 20.0%
!!! GTTTTTATGACATAATGAAT+TGG - Chr8:50893766-50893785 MsG0880044884.01.T01:intron 20.0%
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!!! TTTTAATTTTTCAAGTTCAG+GGG - Chr8:50899613-50899632 MsG0880044884.01.T01:five_prime_UTR 20.0%
!!! TTTTAATTTTTCAAGTTCAG+GGG + Chr8:50899632-50899613 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTCATTAGTATTTTTTCC+GGG - Chr8:50899156-50899175 MsG0880044884.01.T01:CDS 20.0%
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! AATAGATGACATATTCTCAT+TGG - Chr8:50891825-50891844 MsG0880044884.01.T01:intron 25.0%
! AATTACTTCGGTTTACAAAA+AGG - Chr8:50892422-50892441 MsG0880044884.01.T01:intron 25.0%
! ACAGTTAACAGAAAAATTGA+CGG + Chr8:50898483-50898502 None:intergenic 25.0%
! ACATAAGTGTAAAATTTCAG+GGG + Chr8:50899664-50899645 None:intergenic 25.0%
! ACGTTGCAAAATATTATTCA+TGG - Chr8:50897048-50897067 MsG0880044884.01.T01:CDS 25.0%
! AGATGAATCTATAGGTAAAA+GGG + Chr8:50891269-50891288 None:intergenic 25.0%
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! AGGAAACAAATAAGTTTGTA+TGG + Chr8:50898213-50898232 None:intergenic 25.0%
! AGTACAAAGTTTACAAACAT+TGG + Chr8:50895000-50895019 None:intergenic 25.0%
! ATACATAAAAATCCTAAGCT+CGG + Chr8:50899119-50899138 None:intergenic 25.0%
! ATACATTAGTAACAACAATG+AGG - Chr8:50895677-50895696 MsG0880044884.01.T01:CDS 25.0%
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! ATGTCGAAATTTCAAAATTC+TGG + Chr8:50899312-50899331 None:intergenic 25.0%
! ATTAACGTTATGCAATTTCA+GGG + Chr8:50898447-50898466 None:intergenic 25.0%
! ATTACTTCGGTTTACAAAAA+GGG - Chr8:50892423-50892442 MsG0880044884.01.T01:intron 25.0%
! ATTTGTGATTCTGTGAATAT+TGG - Chr8:50893370-50893389 MsG0880044884.01.T01:intron 25.0%
! CAACTTAATCATAGTTATGA+TGG - Chr8:50897657-50897676 MsG0880044884.01.T01:CDS 25.0%
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! CAATAGATTCTTAGTGATAA+AGG + Chr8:50891712-50891731 None:intergenic 25.0%
! CACATAAGTGTAAAATTTCA+GGG + Chr8:50899663-50899644 None:intergenic 25.0%
! CAGAATCACAAATCATTAAA+AGG + Chr8:50893363-50893382 None:intergenic 25.0%
! CATAGAGTTAAACAATTTAC+AGG - Chr8:50896062-50896081 MsG0880044884.01.T01:CDS 25.0%
! CGAAAATAAAAACGAAATTC+TGG - Chr8:50899010-50899029 MsG0880044884.01.T01:CDS 25.0%
! CTATACATGTCACTATTAAA+AGG + Chr8:50897498-50897517 None:intergenic 25.0%
! CTGTAAATTGTTTAACTCTA+TGG + Chr8:50896064-50896083 None:intergenic 25.0%
! CTTTATCACTAAGAATCTAT+TGG - Chr8:50891710-50891729 MsG0880044884.01.T01:intron 25.0%
! GGAAACAAATAAGTTTGTAT+GGG + Chr8:50898212-50898231 None:intergenic 25.0%
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! GGTATATATTATAGTCACAA+TGG - Chr8:50896083-50896102 MsG0880044884.01.T01:CDS 25.0%
! GGTATTAACATTTCTAATGT+TGG - Chr8:50896434-50896453 MsG0880044884.01.T01:CDS 25.0%
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! TAATTCAGCAATATCTTTAC+TGG + Chr8:50898152-50898171 None:intergenic 25.0%
! TATAGGAAAAGAAGATGAAA+GGG + Chr8:50895529-50895548 None:intergenic 25.0%
! TATATTATCTTGCAACTTCT+AGG - Chr8:50895225-50895244 MsG0880044884.01.T01:CDS 25.0%
! TCTAAACAATATTTGAACTC+GGG + Chr8:50896638-50896657 None:intergenic 25.0%
! TGGCAAAAAGATCATAAAAA+GGG + Chr8:50895480-50895499 None:intergenic 25.0%
! TTATAGGAAAAGAAGATGAA+AGG + Chr8:50895530-50895549 None:intergenic 25.0%
! TTCATTATGTCATAAAAACC+AGG + Chr8:50893765-50893784 None:intergenic 25.0%
! TTGGCAAAAAGATCATAAAA+AGG + Chr8:50895481-50895500 None:intergenic 25.0%
! TTTCCAAAAACACCTAAATA+AGG + Chr8:50892175-50892194 None:intergenic 25.0%
!! ACTCTTGTTATGAATTGTTT+AGG - Chr8:50894939-50894958 MsG0880044884.01.T01:intron 25.0%
!! AGGTTTCTTGTTTACATATT+TGG - Chr8:50894744-50894763 MsG0880044884.01.T01:CDS 25.0%
!! CAACATTCCTTTTAATGTTT+CGG - Chr8:50894884-50894903 MsG0880044884.01.T01:intron 25.0%
!! CAGAAAAACTCAAACATTTT+AGG + Chr8:50893975-50893994 None:intergenic 25.0%
!! GGTTTCTTGTTTACATATTT+GGG - Chr8:50894745-50894764 MsG0880044884.01.T01:CDS 25.0%
!! TAAAATGAGTTGAATTTGCT+TGG + Chr8:50897800-50897819 None:intergenic 25.0%
!! TGTATTCTGAAGAAGAAATT+TGG - Chr8:50896549-50896568 MsG0880044884.01.T01:intron 25.0%
!! TTGAGTTTTTCTGTAAATGA+TGG - Chr8:50893982-50894001 MsG0880044884.01.T01:intron 25.0%
!! TTTTTACAGGAATGTATCAT+GGG - Chr8:50893852-50893871 MsG0880044884.01.T01:intron 25.0%
!! TTTTTGTCATATCCATTAGA+GGG - Chr8:50891872-50891891 MsG0880044884.01.T01:intron 25.0%
!!! AAGAGTTGGTAATTAAGAAA+GGG - Chr8:50893207-50893226 MsG0880044884.01.T01:intron 25.0%
!!! AGTCTATTTTTCCTTATTCT+CGG + Chr8:50899228-50899247 None:intergenic 25.0%
!!! ATGTAGTAAGTCTTATTCAA+AGG - Chr8:50894059-50894078 MsG0880044884.01.T01:intron 25.0%
!!! ATTATTTTGTTAGTGGTTGA+TGG - Chr8:50896965-50896984 MsG0880044884.01.T01:CDS 25.0%
!!! TACTATTTTGCTGTTAACTT+TGG - Chr8:50892855-50892874 MsG0880044884.01.T01:intron 25.0%
!!! TCACTTTAAATCCATTTTTG+TGG + Chr8:50897419-50897438 None:intergenic 25.0%
!!! TCTATTAGTATTTTGAATCG+GGG - Chr8:50894190-50894209 MsG0880044884.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTAATTTTTCAAGTTCAGG+GGG - Chr8:50899614-50899633 MsG0880044884.01.T01:five_prime_UTR 25.0%
!!! TTTAATTTTTCAAGTTCAGG+GGG + Chr8:50899633-50899614 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTTTGTCATATCCATTAG+AGG - Chr8:50891871-50891890 MsG0880044884.01.T01:intron 25.0%
AAAAATGAAGAACCAGCATA+AGG + Chr8:50891976-50891995 None:intergenic 30.0%
AAAAGATGGGAAATTCTCAT+GGG - Chr8:50893151-50893170 MsG0880044884.01.T01:intron 30.0%
AAACCAATAACCTTTCTTCA+TGG - Chr8:50891587-50891606 MsG0880044884.01.T01:intron 30.0%
AAAGATAGTACTACTAGTGA+AGG - Chr8:50892291-50892310 MsG0880044884.01.T01:intron 30.0%
AAATGTCAGTGAGGAAAAAT+TGG - Chr8:50891789-50891808 MsG0880044884.01.T01:intron 30.0%
AAGAATATCATACCCTATAC+CGG + Chr8:50895119-50895138 None:intergenic 30.0%
AATGTGTTTGCAGAATATGT+TGG - Chr8:50895856-50895875 MsG0880044884.01.T01:CDS 30.0%
ACAAAATGGTTTCAGTTGAA+AGG - Chr8:50895953-50895972 MsG0880044884.01.T01:CDS 30.0%
AGTGTAAGTTATAGCCAAAA+GGG + Chr8:50891542-50891561 None:intergenic 30.0%
ATAACAATGGTGCAAATGAA+TGG - Chr8:50895405-50895424 MsG0880044884.01.T01:CDS 30.0%
ATAAGTGTAAAATTTCAGGG+GGG + Chr8:50898525-50898544 None:intergenic 30.0%
ATTCATTTGCACCATTGTTA+TGG + Chr8:50895406-50895425 None:intergenic 30.0%
ATTGATGTTTCGTTAACTAC+AGG + Chr8:50898419-50898438 None:intergenic 30.0%
CAAAAAGATCATAAAAAGGG+TGG + Chr8:50895477-50895496 None:intergenic 30.0%
CATAAGTGTAAAATTTCAGG+GGG + Chr8:50899665-50899646 None:intergenic 30.0%
CATTATGCAAGAAATCAACT+TGG + Chr8:50893914-50893933 None:intergenic 30.0%
CCTGACTTAATAAAAGAACT+TGG + Chr8:50895500-50895519 None:intergenic 30.0%
CCTGTAAAAAGATAGAGAAT+CGG + Chr8:50893842-50893861 None:intergenic 30.0%
CTAAATAAGGCTACTATAAC+TGG + Chr8:50892162-50892181 None:intergenic 30.0%
CTAGAAGCAGAGTATATAAT+TGG - Chr8:50897764-50897783 MsG0880044884.01.T01:CDS 30.0%
CTATTTGTTTCCATGAAGAA+AGG + Chr8:50891600-50891619 None:intergenic 30.0%
GATTAACGTTATGCAATTTC+AGG + Chr8:50898448-50898467 None:intergenic 30.0%
GCACATAAGTGTAAAATTTC+AGG - Chr8:50899643-50899662 MsG0880044884.01.T01:five_prime_UTR 30.0%
GCACATAAGTGTAAAATTTC+AGG + Chr8:50899662-50899643 None:intergenic 30.0%
GTAAGAACAGTTACAACTAA+TGG + Chr8:50892897-50892916 None:intergenic 30.0%
GTAGTATCAAAGAATGACAT+TGG + Chr8:50894826-50894845 None:intergenic 30.0%
GTTATAAAATGGTTGTGATC+AGG - Chr8:50896247-50896266 MsG0880044884.01.T01:CDS 30.0%
GTTCTTATGTATAGCTATGT+TGG - Chr8:50892591-50892610 MsG0880044884.01.T01:intron 30.0%
TAAAAGATGGGAAATTCTCA+TGG - Chr8:50893150-50893169 MsG0880044884.01.T01:intron 30.0%
TACTCACTTCATGTATAAAG+TGG - Chr8:50897998-50898017 MsG0880044884.01.T01:CDS 30.0%
TATTCTGCTTTCTTAAGCTA+CGG + Chr8:50895331-50895350 None:intergenic 30.0%
TCATGTGATGAGAATTGTTA+AGG + Chr8:50891183-50891202 None:intergenic 30.0%
TGAAAAGGATCTTGAAATGA+TGG - Chr8:50893555-50893574 MsG0880044884.01.T01:CDS 30.0%
TGTAATTACATATGTCAGGT+TGG - Chr8:50897300-50897319 MsG0880044884.01.T01:intron 30.0%
TGTATTTATAAACCGAGCTT+AGG - Chr8:50899104-50899123 MsG0880044884.01.T01:CDS 30.0%
TGTGATTAAGTTTCAAGCTT+GGG - Chr8:50892764-50892783 MsG0880044884.01.T01:intron 30.0%
TTAACAGAAAAATTGACGGA+GGG + Chr8:50898479-50898498 None:intergenic 30.0%
TTAGTATATATGTCGAGCTT+AGG + Chr8:50899257-50899276 None:intergenic 30.0%
TTGATGTTTCGTTAACTACA+GGG + Chr8:50898418-50898437 None:intergenic 30.0%
TTGCAATGTTGAGAACAAAA+TGG - Chr8:50895939-50895958 MsG0880044884.01.T01:CDS 30.0%
TTGTCAGGAAAATATTGACA+AGG - Chr8:50895355-50895374 MsG0880044884.01.T01:CDS 30.0%
TTTCCATGAAGAAAGGTTAT+TGG + Chr8:50891593-50891612 None:intergenic 30.0%
TTTGACAAACCTTGCAATTT+CGG + Chr8:50898390-50898409 None:intergenic 30.0%
! AAAGCAGAATACATTTTGTC+AGG - Chr8:50895340-50895359 MsG0880044884.01.T01:CDS 30.0%
! AACTTTTCTTGGATTTCCTT+TGG - Chr8:50892929-50892948 MsG0880044884.01.T01:intron 30.0%
! AGAATGGATTTCCATAACAA+TGG - Chr8:50895392-50895411 MsG0880044884.01.T01:CDS 30.0%
! AGGCTTTGTGTTATGTATAT+TGG - Chr8:50892228-50892247 MsG0880044884.01.T01:intron 30.0%
! CATTTTTGTCCAAAACAGTT+TGG - Chr8:50891989-50892008 MsG0880044884.01.T01:intron 30.0%
! CCAAGTTCTTTTATTAAGTC+AGG - Chr8:50895497-50895516 MsG0880044884.01.T01:intron 30.0%
! CTCAAGCAACAATATCTTTT+GGG - Chr8:50893039-50893058 MsG0880044884.01.T01:CDS 30.0%
! CTTTTTACAGGAATGTATCA+TGG - Chr8:50893851-50893870 MsG0880044884.01.T01:intron 30.0%
! GGTTTTCGTTTAGACTATAA+TGG - Chr8:50895431-50895450 MsG0880044884.01.T01:CDS 30.0%
! GTGTCTTTAATCTGAAATGT+CGG - Chr8:50897322-50897341 MsG0880044884.01.T01:intron 30.0%
! TCATTTCAAGATCCTTTTCA+AGG + Chr8:50893555-50893574 None:intergenic 30.0%
! TCTCAAGCAACAATATCTTT+TGG - Chr8:50893038-50893057 MsG0880044884.01.T01:CDS 30.0%
! TGTGGTACATTTGATGTTTT+TGG - Chr8:50897544-50897563 MsG0880044884.01.T01:CDS 30.0%
! TTCTGAAGAAGAAATTTGGA+AGG - Chr8:50896553-50896572 MsG0880044884.01.T01:intron 30.0%
! TTTTGACACTTACTTTGTTC+TGG - Chr8:50895196-50895215 MsG0880044884.01.T01:CDS 30.0%
!! AAATACTCCTCTAGTTCTTA+AGG - Chr8:50896283-50896302 MsG0880044884.01.T01:CDS 30.0%
!! AAGGAACATCTTCTAGTTTA+AGG + Chr8:50892056-50892075 None:intergenic 30.0%
!! AATACTCCTCTAGTTCTTAA+GGG - Chr8:50896284-50896303 MsG0880044884.01.T01:CDS 30.0%
!! AGAGTTGGTAATTAAGAAAG+GGG - Chr8:50893208-50893227 MsG0880044884.01.T01:intron 30.0%
!! AGGAACATCTTCTAGTTTAA+GGG + Chr8:50892055-50892074 None:intergenic 30.0%
!! CACTGATTCAAGTGTTATTT+AGG - Chr8:50896375-50896394 MsG0880044884.01.T01:CDS 30.0%
!! CAGTTATAGTAGCCTTATTT+AGG - Chr8:50892160-50892179 MsG0880044884.01.T01:intron 30.0%
!! GAAGAGTTGGTAATTAAGAA+AGG - Chr8:50893206-50893225 MsG0880044884.01.T01:intron 30.0%
!! GCATAATGTTGACTCTATAA+TGG - Chr8:50893926-50893945 MsG0880044884.01.T01:intron 30.0%
!! TTTTCTGCTCTAAATTCAAG+AGG + Chr8:50892084-50892103 None:intergenic 30.0%
!!! AACAAATAGAAGCACCTTTT+CGG - Chr8:50891611-50891630 MsG0880044884.01.T01:intron 30.0%
!!! AATTTTTGCAGCATTGGTTA+AGG - Chr8:50897619-50897638 MsG0880044884.01.T01:CDS 30.0%
!!! ACACAAACACATGTTGTTTT+TGG - Chr8:50898105-50898124 MsG0880044884.01.T01:CDS 30.0%
!!! GTTTTGTTGATTTCACATCA+AGG - Chr8:50892268-50892287 MsG0880044884.01.T01:intron 30.0%
!!! TAGCCTTATTTAGGTGTTTT+TGG - Chr8:50892169-50892188 MsG0880044884.01.T01:intron 30.0%
AAAATGGTTGTGATCAGGTT+AGG - Chr8:50896252-50896271 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
AACATTGCAACTCATAGTCA+TGG + Chr8:50895929-50895948 None:intergenic 35.0%
AACCATTGAAGTATGAGTTG+TGG + Chr8:50891301-50891320 None:intergenic 35.0%
AAGAAAAGTTGCAGTTGCAA+AGG + Chr8:50892919-50892938 None:intergenic 35.0%
AAGAACAAAGCTAAGATTCC+TGG - Chr8:50893744-50893763 MsG0880044884.01.T01:intron 35.0%
AATGAACATGGACAAGTACA+GGG - Chr8:50893510-50893529 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
AATGTTCAAGATCTCAGGAA+AGG - Chr8:50893298-50893317 MsG0880044884.01.T01:intron 35.0%
ACAAAACTCTGAATCAACAG+TGG + Chr8:50892255-50892274 None:intergenic 35.0%
ACAAAGAATCAAGAGCAGAA+AGG + Chr8:50891363-50891382 None:intergenic 35.0%
ACATCTCAAAGCTTCTTCAT+TGG - Chr8:50894775-50894794 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
ACATGGAGATAGGAAAAGAA+AGG + Chr8:50891326-50891345 None:intergenic 35.0%
ACCAATGCTGCAAAAATTGA+AGG + Chr8:50897617-50897636 None:intergenic 35.0%
AGAAGAAGAAGAAGAAGACA+TGG + Chr8:50891221-50891240 None:intergenic 35.0%
ATTGAAGGTGGAGAAAAAGT+TGG - Chr8:50896320-50896339 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
CAAAGACAACTTCTATGCTT+AGG - Chr8:50897010-50897029 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
CAGTGTAAGTTATAGCCAAA+AGG + Chr8:50891543-50891562 None:intergenic 35.0%
CATGTTGACACCAACTTTAA+AGG - Chr8:50894225-50894244 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
CCATCGAAAGAAAAAGAAAG+CGG - Chr8:50894415-50894434 MsG0880044884.01.T01:intron 35.0%
CCTCACTGACATTTACAATT+CGG + Chr8:50891783-50891802 None:intergenic 35.0%
CTAAATTCAAGAGGAAGTGA+AGG + Chr8:50892075-50892094 None:intergenic 35.0%
CTACTACATCGTAGAAAAAC+CGG - Chr8:50898231-50898250 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
CTGAAAGTTGTTACTACTCT+TGG + Chr8:50892679-50892698 None:intergenic 35.0%
CTTCTTCTTCTTCTTCTTCA+TGG - Chr8:50891224-50891243 MsG0880044884.01.T01:intron 35.0%
GAATCTTTCTCTTTCAGAAG+TGG + Chr8:50891472-50891491 None:intergenic 35.0%
GATATTGCTGAATTAAGCTG+CGG - Chr8:50898157-50898176 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
GATTGTCATAACACCAGAAA+TGG + Chr8:50895309-50895328 None:intergenic 35.0%
GCATGAACCGAAACATTAAA+AGG + Chr8:50894894-50894913 None:intergenic 35.0%
GCTATAACTTACACTGTTCT+AGG - Chr8:50891547-50891566 MsG0880044884.01.T01:intron 35.0%
GCTGGGAAAATAATCATTGA+TGG - Chr8:50896413-50896432 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
GTAGAGGAAGATGAATCTAT+AGG + Chr8:50891277-50891296 None:intergenic 35.0%
GTGTGATTAAGTTTCAAGCT+TGG - Chr8:50892763-50892782 MsG0880044884.01.T01:intron 35.0%
GTTAACAGAAAAATTGACGG+AGG + Chr8:50898480-50898499 None:intergenic 35.0%
GTTGGTATGTCTTTATCCTA+TGG - Chr8:50895874-50895893 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
TAACAGAAAAATTGACGGAG+GGG + Chr8:50898478-50898497 None:intergenic 35.0%
TAGCTGTGGAGATAAAAGAT+GGG - Chr8:50893138-50893157 MsG0880044884.01.T01:intron 35.0%
TATGATGAACTTCTCAAAGC+AGG - Chr8:50894283-50894302 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
TATGTCTTTATCCTATGGTC+TGG - Chr8:50895879-50895898 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
TCATGAATCCTCAATGAAGA+TGG - Chr8:50894333-50894352 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
TCGTTCGAGCATAATTACTT+CGG - Chr8:50892410-50892429 MsG0880044884.01.T01:intron 35.0%
TCTGAAAAGTGATGAATCAC+TGG + Chr8:50895284-50895303 None:intergenic 35.0%
TCTTCAGAATACAATCCAAG+AGG + Chr8:50896542-50896561 None:intergenic 35.0%
TCTTGATTTCTGCATCATTC+TGG - Chr8:50897733-50897752 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
TGATGTTTCGTTAACTACAG+GGG + Chr8:50898417-50898436 None:intergenic 35.0%
TGCATAGTTGTTATGGTAAG+AGG - Chr8:50894724-50894743 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
TGTAGTTGCGACATATACAT+CGG - Chr8:50891927-50891946 MsG0880044884.01.T01:intron 35.0%
TGTATATGTCGCAACTACAT+CGG + Chr8:50891926-50891945 None:intergenic 35.0%
TGTGATTGAGGAGTTATTGT+TGG + Chr8:50891446-50891465 None:intergenic 35.0%
TGTTGCATGCATAGTTGTTA+TGG - Chr8:50894717-50894736 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
TTCAGGGAAGTCTTCATTAT+TGG - Chr8:50893259-50893278 MsG0880044884.01.T01:intron 35.0%
TTCTTACTGTTCCTTGAAAG+AGG + Chr8:50896508-50896527 None:intergenic 35.0%
TTCTTTGATACTACTCCTTC+TGG - Chr8:50894832-50894851 MsG0880044884.01.T01:intron 35.0%
TTGACAAACCTTGCAATTTC+GGG + Chr8:50898389-50898408 None:intergenic 35.0%
TTGTGATCAGGTTAGGTATA+GGG - Chr8:50896259-50896278 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
! AAGCAACAATATCTTTTGGG+AGG - Chr8:50893042-50893061 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
! ACCTTCAATTTTTGCAGCAT+TGG - Chr8:50897613-50897632 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
! ATGATTATTTTCCCAGCTGA+AGG + Chr8:50896410-50896429 None:intergenic 35.0%
! CATCCAAAACCAAACTGTTT+TGG + Chr8:50892001-50892020 None:intergenic 35.0%
! CCGATTCTCTATCTTTTTAC+AGG - Chr8:50893839-50893858 MsG0880044884.01.T01:intron 35.0%
! CGCTTTCTTTTTCTTTCGAT+GGG + Chr8:50894417-50894436 None:intergenic 35.0%
! GAGCTTTTGTGATTGAATCA+AGG + Chr8:50895262-50895281 None:intergenic 35.0%
! GATCTTGAAATGATGGAAGA+TGG - Chr8:50893562-50893581 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
! GTTTGGTTTACCAATGAACA+TGG - Chr8:50893498-50893517 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
! TTTGCAACTGCAACTTTTCT+TGG - Chr8:50892918-50892937 MsG0880044884.01.T01:intron 35.0%
!! AACAATATCTTTTGGGAGGT+TGG - Chr8:50893046-50893065 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
!! AACTTTTTCTCCACCTTCAA+TGG + Chr8:50896321-50896340 None:intergenic 35.0%
!! AGAGTACTGTCGTTACATAT+TGG + Chr8:50894037-50894056 None:intergenic 35.0%
!! AGGTATCGACTGATATACTT+TGG - Chr8:50894959-50894978 MsG0880044884.01.T01:intron 35.0%
!! ATGTTGGTCTTCATGATTTG+AGG - Chr8:50896450-50896469 MsG0880044884.01.T01:intron 35.0%
!! ATTTCACAGAAGCATTTGGA+TGG - Chr8:50894551-50894570 MsG0880044884.01.T01:intron 35.0%
!! CAACTGATTTTGCTGCAAAA+AGG + Chr8:50892335-50892354 None:intergenic 35.0%
!! CAGTATTTCACAGAAGCATT+TGG - Chr8:50894547-50894566 MsG0880044884.01.T01:intron 35.0%
!! GGAACATCTTCTAGTTTAAG+GGG + Chr8:50892054-50892073 None:intergenic 35.0%
!! GGTATCGACTGATATACTTT+GGG - Chr8:50894960-50894979 MsG0880044884.01.T01:intron 35.0%
!! TCATTATTGGCTTCTGTGTT+GGG - Chr8:50893272-50893291 MsG0880044884.01.T01:intron 35.0%
!! TCTTAGTGATAAAGGGTGTT+TGG + Chr8:50891704-50891723 None:intergenic 35.0%
!! TGAGTAGAGCTTTGAATATG+TGG + Chr8:50897984-50898003 None:intergenic 35.0%
!! TGTCCAAAACAGTTTGGTTT+TGG - Chr8:50891995-50892014 MsG0880044884.01.T01:intron 35.0%
!! TTACACTGTTCTAGGAATCT+TGG - Chr8:50891555-50891574 MsG0880044884.01.T01:intron 35.0%
!! TTACTGTTTTCCTCTGGTTT+TGG + Chr8:50892135-50892154 None:intergenic 35.0%
!! TTCATTATTGGCTTCTGTGT+TGG - Chr8:50893271-50893290 MsG0880044884.01.T01:intron 35.0%
!!! AAGATGACTAATTTTGGGAC+TGG + Chr8:50897880-50897899 None:intergenic 35.0%
!!! ATTTTGTTAGTGGTTGATGG+TGG - Chr8:50896968-50896987 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
!!! CATTTTTGGCTGGTGATTAT+TGG - Chr8:50894620-50894639 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
!!! GTACATTTGATGTTTTTGGC+AGG - Chr8:50897548-50897567 MsG0880044884.01.T01:CDS 35.0%
AAAACAGTGCCAGAATCCAA+AGG + Chr8:50892948-50892967 None:intergenic 40.0%
AAAAGGGTGGTTACCAACAA+GGG + Chr8:50891526-50891545 None:intergenic 40.0%
AAACAATTGGCCAAAACCAG+AGG - Chr8:50892122-50892141 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
AACAGAAAAATTGACGGAGG+GGG + Chr8:50898477-50898496 None:intergenic 40.0%
AACGTTATGCAATTTCAGGG+AGG + Chr8:50898444-50898463 None:intergenic 40.0%
AACTTCCACTCGCAGAAAAT+CGG - Chr8:50892378-50892397 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
AAGTATGAGTTGTGGTGTAG+AGG + Chr8:50891293-50891312 None:intergenic 40.0%
AATGGTGCAAATGAATGGCT+TGG - Chr8:50895410-50895429 MsG0880044884.01.T01:CDS 40.0%
ACAAGTACAGGGAAGCTTTA+AGG - Chr8:50893521-50893540 MsG0880044884.01.T01:CDS 40.0%
ACTGCTTGAAACAACCGAAA+AGG + Chr8:50891628-50891647 None:intergenic 40.0%
AGAACCAACATTGATCCTCT+TGG - Chr8:50896524-50896543 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
AGAATGACATTGGTGCATGA+AGG + Chr8:50894816-50894835 None:intergenic 40.0%
AGATACTTCAAGAGCCTTTG+AGG - Chr8:50892988-50893007 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
AGCAAAGCTCATTGAAGATG+AGG - Chr8:50894486-50894505 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
AGGACAGATAGTGAATCACA+TGG - Chr8:50892485-50892504 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
ATATCCATTAGAGGGTCATC+AGG - Chr8:50891880-50891899 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
ATCGACTGATATACTTTGGG+TGG - Chr8:50894963-50894982 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
ATGTTTCGTTAACTACAGGG+GGG + Chr8:50898415-50898434 None:intergenic 40.0%
ATTGTTCAGGTCAGAGTTTG+TGG - Chr8:50893412-50893431 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
CAATCCAAGAGGATCAATGT+TGG + Chr8:50896531-50896550 None:intergenic 40.0%
CAATGAACATGGACAAGTAC+AGG - Chr8:50893509-50893528 MsG0880044884.01.T01:CDS 40.0%
CACCACAACTCATACTTCAA+TGG - Chr8:50891296-50891315 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
CATTGCTCACAGAATACCTA+CGG - Chr8:50897159-50897178 MsG0880044884.01.T01:CDS 40.0%
CCGAATTGTAAATGTCAGTG+AGG - Chr8:50891780-50891799 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
CTGACTATAGAGTCACTCTT+TGG - Chr8:50891491-50891510 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
CTGTACTTGTCCATGTTCAT+TGG + Chr8:50893511-50893530 None:intergenic 40.0%
CTTGGATTTCCTTTGGATTC+TGG - Chr8:50892936-50892955 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
GAAGATGAGGAAAGAGAAAC+TGG - Chr8:50894499-50894518 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
GATGTTTCGTTAACTACAGG+GGG + Chr8:50898416-50898435 None:intergenic 40.0%
GCAATGGCATCAACCATATA+GGG + Chr8:50892554-50892573 None:intergenic 40.0%
GCGCAATCCAATAGAGAAAT+AGG + Chr8:50894158-50894177 None:intergenic 40.0%
GGAAATTTGAGTCCTTATGC+TGG - Chr8:50891961-50891980 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
GGAGAAATGTTCAAGATCTC+AGG - Chr8:50893293-50893312 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
GGTGAATGCAAGTCTAAGAA+TGG - Chr8:50895376-50895395 MsG0880044884.01.T01:CDS 40.0%
GTAAGTTATAGCCAAAAGGG+TGG + Chr8:50891539-50891558 None:intergenic 40.0%
GTAGCTGTGGAGATAAAAGA+TGG - Chr8:50893137-50893156 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
GTTCATGACGAGTAAGGAAA+TGG - Chr8:50893073-50893092 MsG0880044884.01.T01:CDS 40.0%
GTTGTGATCAGGTTAGGTAT+AGG - Chr8:50896258-50896277 MsG0880044884.01.T01:CDS 40.0%
TATCCATTAGAGGGTCATCA+GGG - Chr8:50891881-50891900 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
TCACAGAATACCTACGGTTA+TGG - Chr8:50897165-50897184 MsG0880044884.01.T01:CDS 40.0%
TCGGTTCATGCTTTAGTGTT+TGG - Chr8:50894903-50894922 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
TGACAAACCTTGCAATTTCG+GGG + Chr8:50898388-50898407 None:intergenic 40.0%
TGCAATGGCATCAACCATAT+AGG + Chr8:50892555-50892574 None:intergenic 40.0%
TGGAAACACATAGCTTTCAC+TGG - Chr8:50892189-50892208 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
TGTCGTATGCCAGAATTCTT+GGG - Chr8:50895053-50895072 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
TTGGTTCAAACTACCCTTGT+TGG - Chr8:50891510-50891529 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
TTGTCGTATGCCAGAATTCT+TGG - Chr8:50895052-50895071 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
! ACTTTAAAGGTGATGCGTGA+AGG - Chr8:50894238-50894257 MsG0880044884.01.T01:CDS 40.0%
! ATAGGTAAAAGGGTGCATGA+AGG + Chr8:50891259-50891278 None:intergenic 40.0%
! ATTTTCCAAGGAGCTTCTGA+TGG + Chr8:50896000-50896019 None:intergenic 40.0%
! CAAGTACAGGGAAGCTTTAA+GGG - Chr8:50893522-50893541 MsG0880044884.01.T01:CDS 40.0%
! CACTTTTCAGAGACCATTTC+TGG - Chr8:50895293-50895312 MsG0880044884.01.T01:CDS 40.0%
! CAGCGCTGAATATATCATCA+AGG + Chr8:50893690-50893709 None:intergenic 40.0%
! CCGCTTTCTTTTTCTTTCGA+TGG + Chr8:50894418-50894437 None:intergenic 40.0%
! CGGTTTTTCTACGATGTAGT+AGG + Chr8:50898233-50898252 None:intergenic 40.0%
! CTCAAAGCAGGTCTAGATTT+TGG - Chr8:50894295-50894314 MsG0880044884.01.T01:CDS 40.0%
! CTTTAAAGGTGATGCGTGAA+GGG - Chr8:50894239-50894258 MsG0880044884.01.T01:CDS 40.0%
! GAAATGATGGAAGATGGTGA+CGG - Chr8:50893568-50893587 MsG0880044884.01.T01:CDS 40.0%
! GACTTGTCAGCAATTTTCCA+AGG + Chr8:50896012-50896031 None:intergenic 40.0%
! TCCTCGTAATTCCACTGTTT+TGG - Chr8:50895085-50895104 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
! TGTTTCTGCCATCTTCATTG+AGG + Chr8:50894344-50894363 None:intergenic 40.0%
! TTGAACTCGGGTTCTAACAT+TGG + Chr8:50896626-50896645 None:intergenic 40.0%
! TTTTCCAAGGAGCTTCTGAT+GGG + Chr8:50895999-50896018 None:intergenic 40.0%
!! AAGGTTTTGGTCATAGATGC+AGG - Chr8:50897196-50897215 MsG0880044884.01.T01:CDS 40.0%
!! ATCATACGCTCTAGAGAGTT+GGG - Chr8:50898032-50898051 MsG0880044884.01.T01:CDS 40.0%
!! CAAGCTTGGGAAGAGTATTT+CGG - Chr8:50892777-50892796 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
!! CATGATTTGAGGTCACGTTT+TGG - Chr8:50896461-50896480 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
!! TATGGACTGTGACAAGGTTT+TGG - Chr8:50897183-50897202 MsG0880044884.01.T01:CDS 40.0%
!! TCACGCATCACCTTTAAAGT+TGG + Chr8:50894238-50894257 None:intergenic 40.0%
!! TCTAGATTTTGGTGCACTTC+TGG - Chr8:50894306-50894325 MsG0880044884.01.T01:CDS 40.0%
!! TGGTTGATGGTGGAGATAAT+TGG - Chr8:50896978-50896997 MsG0880044884.01.T01:CDS 40.0%
!! TTGTAGGAACTGTTGGTTCA+GGG - Chr8:50893243-50893262 MsG0880044884.01.T01:intron 40.0%
!!! CAGAAGTGGTTTTGTGATTG+AGG + Chr8:50891458-50891477 None:intergenic 40.0%
!!! GTTTTTGGCAGGTTTTGCAA+AGG - Chr8:50897559-50897578 MsG0880044884.01.T01:CDS 40.0%
!!! TGCTGCAGTTTTTTCAGACT+TGG + Chr8:50894470-50894489 None:intergenic 40.0%
AATCCCTGATGACCCTCTAA+TGG + Chr8:50891887-50891906 None:intergenic 45.0%
AATGCCACAGCTACTTGCAA+TGG + Chr8:50892570-50892589 None:intergenic 45.0%
ACAAACCTTGCAATTTCGGG+GGG + Chr8:50898386-50898405 None:intergenic 45.0%
ACTAGCTAGAGCTGTGTATC+AGG - Chr8:50893648-50893667 MsG0880044884.01.T01:CDS 45.0%
ACTGTTCCTTGAAAGAGGAC+AGG + Chr8:50896503-50896522 None:intergenic 45.0%
AGACAGTCTCCCAAGAATTC+TGG + Chr8:50895065-50895084 None:intergenic 45.0%
AGTTCTTCGAGACAAGCTCA+TGG - Chr8:50892459-50892478 MsG0880044884.01.T01:intron 45.0%
ATTGCAAGTAGCTGTGGCAT+TGG - Chr8:50892569-50892588 MsG0880044884.01.T01:intron 45.0%
CAAAAGGGTGGTTACCAACA+AGG + Chr8:50891527-50891546 None:intergenic 45.0%
CAACGAGAGGAGAATTGTGA+TGG - Chr8:50893110-50893129 MsG0880044884.01.T01:CDS 45.0%
CACAAAGCCTAATCACTGCA+AGG + Chr8:50892218-50892237 None:intergenic 45.0%
CAGCCACCACTTCTTTCAAT+TGG + Chr8:50896779-50896798 None:intergenic 45.0%
CGACTCAAAATTCTGCCAGA+AGG + Chr8:50894850-50894869 None:intergenic 45.0%
CGGTTTACAAAAAGGGTCTG+AGG - Chr8:50892430-50892449 MsG0880044884.01.T01:intron 45.0%
GAAATCGTGATAAGAGCCTG+AGG + Chr8:50893020-50893039 None:intergenic 45.0%
GAAATGTTAACGAGTGCTCC+TGG + Chr8:50895647-50895666 None:intergenic 45.0%
GACAAACCTTGCAATTTCGG+GGG + Chr8:50898387-50898406 None:intergenic 45.0%
GCAGAAAGGAGAAGTCTTTG+AGG + Chr8:50891349-50891368 None:intergenic 45.0%
GCCAAAACAGTGGAATTACG+AGG + Chr8:50895089-50895108 None:intergenic 45.0%
GGACTCAAATTTCCTTCAGC+CGG + Chr8:50891955-50891974 None:intergenic 45.0%
GGAGAAAAAGTTGGCGTTGT+TGG - Chr8:50896329-50896348 MsG0880044884.01.T01:CDS 45.0%
GGAGTCACTCTTACCATTGA+AGG - Chr8:50896305-50896324 MsG0880044884.01.T01:CDS 45.0%
GGATGAGTTCATGACGAGTA+AGG - Chr8:50893067-50893086 MsG0880044884.01.T01:CDS 45.0%
GGTCAGAGTTTGTGGAATGA+CGG - Chr8:50893420-50893439 MsG0880044884.01.T01:intron 45.0%
GGTCTTTCAAGCAAACGTGA+TGG + Chr8:50897596-50897615 None:intergenic 45.0%
GGTGGAGATAATTGGAGTGT+GGG - Chr8:50896986-50897005 MsG0880044884.01.T01:CDS 45.0%
GTCACTCTTACCATTGAAGG+TGG - Chr8:50896308-50896327 MsG0880044884.01.T01:CDS 45.0%
GTGACTCCCTTAAGAACTAG+AGG + Chr8:50896293-50896312 None:intergenic 45.0%
GTGAGCTGCAAAAGCTAAGA+GGG + Chr8:50891395-50891414 None:intergenic 45.0%
GTGCCAATTGAAAGAAGTGG+TGG - Chr8:50896773-50896792 MsG0880044884.01.T01:CDS 45.0%
TAAAAAGGGTGGCAGTGCAA+AGG + Chr8:50895466-50895485 None:intergenic 45.0%
TCAGTACTTGCAGCATTGCT+TGG - Chr8:50892618-50892637 MsG0880044884.01.T01:intron 45.0%
TGATGCAGCTTCACCCTATA+TGG - Chr8:50892538-50892557 MsG0880044884.01.T01:intron 45.0%
TGCAAAGCCTGAGAAACTTG+AGG - Chr8:50896797-50896816 MsG0880044884.01.T01:CDS 45.0%
TGCTCCTGGAACACTCTTTA+AGG + Chr8:50895633-50895652 None:intergenic 45.0%
TGGTGGAGATAATTGGAGTG+TGG - Chr8:50896985-50897004 MsG0880044884.01.T01:CDS 45.0%
TGTGAGCTGCAAAAGCTAAG+AGG + Chr8:50891396-50891415 None:intergenic 45.0%
TTGGCTCAACAACCGGTATA+GGG - Chr8:50895104-50895123 MsG0880044884.01.T01:intron 45.0%
TTGTCACAGTCCATAACCGT+AGG + Chr8:50897178-50897197 None:intergenic 45.0%
TTTCCCAATCCATCCATGCT+CGG + Chr8:50892829-50892848 None:intergenic 45.0%
! AATCCGAGCATGGATGGATT+GGG - Chr8:50892823-50892842 MsG0880044884.01.T01:intron 45.0%
! AGGAGAAGTCTTTGAGGACA+TGG + Chr8:50891343-50891362 None:intergenic 45.0%
! CTAGTTGCACACGTTGTTTC+TGG + Chr8:50893633-50893652 None:intergenic 45.0%
! GAGGTGCCAATTGAAAGAAG+TGG - Chr8:50896770-50896789 MsG0880044884.01.T01:CDS 45.0%
! GGATGCTTACTGTTTTCCTC+TGG + Chr8:50892141-50892160 None:intergenic 45.0%
! GTCTTTGAGGACATGGAGAT+AGG + Chr8:50891336-50891355 None:intergenic 45.0%
! TACGGTTATGGACTGTGACA+AGG - Chr8:50897177-50897196 MsG0880044884.01.T01:CDS 45.0%
! TTGTGATGGTGATGTAGCTG+TGG - Chr8:50893124-50893143 MsG0880044884.01.T01:intron 45.0%
! TTTGGCTCAACAACCGGTAT+AGG - Chr8:50895103-50895122 MsG0880044884.01.T01:intron 45.0%
!! AACTCTATGGTGCCATGACT+AGG + Chr8:50896051-50896070 None:intergenic 45.0%
!! ACAGAAGCATTTGGATGGTG+GGG - Chr8:50894556-50894575 MsG0880044884.01.T01:intron 45.0%
!! AGATTTTGGTGCACTTCTGG+AGG - Chr8:50894309-50894328 MsG0880044884.01.T01:CDS 45.0%
!! CACAGAAGCATTTGGATGGT+GGG - Chr8:50894555-50894574 MsG0880044884.01.T01:intron 45.0%
!! GATCATACGCTCTAGAGAGT+TGG - Chr8:50898031-50898050 MsG0880044884.01.T01:CDS 45.0%
!! GGCTTGGGTTTCGTCATTTT+TGG - Chr8:50894606-50894625 MsG0880044884.01.T01:intron 45.0%
!! GGGAGCTCTGAAAGATAAGA+CGG - Chr8:50893872-50893891 MsG0880044884.01.T01:intron 45.0%
!! GTTGTAGGAACTGTTGGTTC+AGG - Chr8:50893242-50893261 MsG0880044884.01.T01:intron 45.0%
!! TCACAGAAGCATTTGGATGG+TGG - Chr8:50894554-50894573 MsG0880044884.01.T01:intron 45.0%
!! TCATACGCTCTAGAGAGTTG+GGG - Chr8:50898033-50898052 MsG0880044884.01.T01:CDS 45.0%
!! TGCGACATATACATCGGTTC+CGG - Chr8:50891933-50891952 MsG0880044884.01.T01:intron 45.0%
!! TGGTCCTTAAAGAGTGTTCC+AGG - Chr8:50895626-50895645 MsG0880044884.01.T01:CDS 45.0%
!!! CACTGTTTTGGCTCAACAAC+CGG - Chr8:50895097-50895116 MsG0880044884.01.T01:intron 45.0%
!!! CTTGTTGGTAACCACCCTTT+TGG - Chr8:50891525-50891544 MsG0880044884.01.T01:intron 45.0%
!!! TGGGTTTCGTCATTTTTGGC+TGG - Chr8:50894610-50894629 MsG0880044884.01.T01:intron 45.0%
!! AAAAAAAAATAAAAAAATTC+TGG + Chr8:50899574-50899593 None:intergenic 5.0%
!! AAAAAAAAATTAAAAAATTC+TGG - Chr8:50898610-50898629 MsG0880044884.01.T01:CDS 5.0%
!! AAAAAAATATTAAAAAATTC+TGG - Chr8:50898660-50898679 MsG0880044884.01.T01:CDS 5.0%
!! AAAAAAATATTAAAAAATTC+TGG + Chr8:50898679-50898660 None:intergenic 5.0%
!! AATAATAAAAATGAAAAAAA+CGG + Chr8:50899488-50899507 None:intergenic 5.0%
AAGCCGCGATTTGAGGATGA+AGG - Chr8:50892713-50892732 MsG0880044884.01.T01:intron 50.0%
AATACCGCGCTCTCCAATCT+CGG + Chr8:50893596-50893615 None:intergenic 50.0%
ACTCGTGCTAGCAATGTCAG+TGG - Chr8:50894585-50894604 MsG0880044884.01.T01:intron 50.0%
AGCGCTGTTGATGCTCAAAC+AGG - Chr8:50893703-50893722 MsG0880044884.01.T01:CDS 50.0%
AGGAGCTTCTGATGGGAGAA+TGG + Chr8:50895992-50896011 None:intergenic 50.0%
ATTTCCCCCCCGAAATTGCA+AGG - Chr8:50898378-50898397 MsG0880044884.01.T01:CDS 50.0%
CAAACCTTGCAATTTCGGGG+GGG + Chr8:50898385-50898404 None:intergenic 50.0%
CAAGAGCCTGTCCTCTTTCA+AGG - Chr8:50896494-50896513 MsG0880044884.01.T01:intron 50.0%
CAGTTTCGTGAATCCGAGCA+TGG - Chr8:50892813-50892832 MsG0880044884.01.T01:intron 50.0%
CCTGAAGCCTCAAGTTTCTC+AGG + Chr8:50896807-50896826 None:intergenic 50.0%
CCTGAGAAACTTGAGGCTTC+AGG - Chr8:50896804-50896823 MsG0880044884.01.T01:CDS 50.0%
CGGTTGTTGAGCCAAAACAG+TGG + Chr8:50895099-50895118 None:intergenic 50.0%
CGTATGTGGCACAAACGTCA+TGG - Chr8:50893443-50893462 MsG0880044884.01.T01:intron 50.0%
CTGGCTTCCTTGCAGTGATT+AGG - Chr8:50892208-50892227 MsG0880044884.01.T01:intron 50.0%
GAATCCGAGCATGGATGGAT+TGG - Chr8:50892822-50892841 MsG0880044884.01.T01:intron 50.0%
GATGCCATTGCAAGTAGCTG+TGG - Chr8:50892563-50892582 MsG0880044884.01.T01:intron 50.0%
GCCTGAGGAAAAGTCCTCAA+AGG + Chr8:50893005-50893024 None:intergenic 50.0%
GCTAGCAATGTCAGTGGCTT+GGG - Chr8:50894591-50894610 MsG0880044884.01.T01:intron 50.0%
GCTGCTGTTGTAGGAACTGT+TGG - Chr8:50893236-50893255 MsG0880044884.01.T01:intron 50.0%
GGTTGATTGAGCCTTCAGCT+GGG - Chr8:50896396-50896415 MsG0880044884.01.T01:CDS 50.0%
GTTGTTGGTCGTACAGGAAG+TGG - Chr8:50896344-50896363 MsG0880044884.01.T01:CDS 50.0%
TCGAGACAAGCTCATGGAAC+AGG - Chr8:50892465-50892484 MsG0880044884.01.T01:intron 50.0%
TCGCCTTCATCCTCAAATCG+CGG + Chr8:50892719-50892738 None:intergenic 50.0%
TGAAAGAGGACAGGCTCTTG+TGG + Chr8:50896494-50896513 None:intergenic 50.0%
TGAGAATGCAGTGCAACGAG+AGG - Chr8:50893097-50893116 MsG0880044884.01.T01:CDS 50.0%
TGATGACAAGCCGCGATTTG+AGG - Chr8:50892706-50892725 MsG0880044884.01.T01:intron 50.0%
TGCTAGCAATGTCAGTGGCT+TGG - Chr8:50894590-50894609 MsG0880044884.01.T01:intron 50.0%
TGTTGCTGCAGAGTCTTGAG+AGG - Chr8:50896751-50896770 MsG0880044884.01.T01:intron 50.0%
TTCGTGAATCCGAGCATGGA+TGG - Chr8:50892817-50892836 MsG0880044884.01.T01:intron 50.0%
TTCTCCCATCAGAAGCTCCT+TGG - Chr8:50895992-50896011 MsG0880044884.01.T01:CDS 50.0%
TTGTGGAATGACGGCGTATG+TGG - Chr8:50893429-50893448 MsG0880044884.01.T01:intron 50.0%
! AAGGGTGTGCTGCCTTGAAA+AGG - Chr8:50893540-50893559 MsG0880044884.01.T01:CDS 50.0%
! AGGTTGATTGAGCCTTCAGC+TGG - Chr8:50896395-50896414 MsG0880044884.01.T01:CDS 50.0%
! GGGGAAGGGTCTAAAGTTGA+AGG - Chr8:50898052-50898071 MsG0880044884.01.T01:CDS 50.0%
!! CGCTCTGAGAGTTGAAGAGT+TGG - Chr8:50893193-50893212 MsG0880044884.01.T01:intron 50.0%
!! GCCTTTGAGGACTTTTCCTC+AGG - Chr8:50893001-50893020 MsG0880044884.01.T01:intron 50.0%
!! TATACATCGGTTCCGGCTGA+AGG - Chr8:50891940-50891959 MsG0880044884.01.T01:intron 50.0%
!!! GCATACCGATTTTCTGCGAG+TGG + Chr8:50892386-50892405 None:intergenic 50.0%
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GAGCGCGGTATTAACCTCAG+TGG - Chr8:50893604-50893623 MsG0880044884.01.T01:CDS 55.0%
GGGGATCATGCTGCTGTTGT+AGG - Chr8:50893227-50893246 MsG0880044884.01.T01:intron 55.0%
GTTGGCGTTGTTGGTCGTAC+AGG - Chr8:50896338-50896357 MsG0880044884.01.T01:CDS 55.0%
!! ACGCTCTAGAGAGTTGGGGA+AGG - Chr8:50898037-50898056 MsG0880044884.01.T01:CDS 55.0%
!! CGCTCTAGAGAGTTGGGGAA+GGG - Chr8:50898038-50898057 MsG0880044884.01.T01:CDS 55.0%
!! GATGGTGACGGAACCGAGAT+TGG - Chr8:50893580-50893599 MsG0880044884.01.T01:CDS 55.0%
!! GTTGTTTCTGGCCTCCACTG+AGG + Chr8:50893621-50893640 None:intergenic 55.0%
!! TCCTATGGTCTGGCTCTGAG+TGG - Chr8:50895889-50895908 MsG0880044884.01.T01:CDS 55.0%
GGAACCGAGATTGGAGAGCG+CGG - Chr8:50893589-50893608 MsG0880044884.01.T01:CDS 60.0%
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Protein sequence

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>MsG0880044884.01.T02

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