AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780038115.01


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MsG0780038115.01.T01 AT2G15490 33.418 395 223 11 92 466 106 480 8.69e-54 188
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MsG0780038115.01.T01 AT2G30140 30.591 474 281 14 6 466 13 451 6.46e-53 185
MsG0780038115.01.T01 AT2G15490 33.418 395 220 12 92 466 106 477 1.53e-52 184
MsG0780038115.01.T01 AT1G07240 29.278 485 288 16 3 455 2 463 2.00e-52 184
MsG0780038115.01.T01 AT4G15260 33.148 359 208 11 117 458 2 345 5.13e-52 180
MsG0780038115.01.T01 AT2G29710 29.938 481 286 18 3 459 2 455 5.74e-51 180
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MsG0780038115.01.T01 AT2G31750 29.461 482 284 15 6 466 8 454 1.53e-49 176
MsG0780038115.01.T01 AT2G15480 32.737 391 228 11 92 466 109 480 1.56e-49 176
MsG0780038115.01.T01 AT1G22380 28.689 488 281 17 6 456 13 470 1.67e-49 176
MsG0780038115.01.T01 AT5G14860 28.834 489 281 15 17 468 19 477 1.86e-49 176
MsG0780038115.01.T01 AT2G31790 29.814 483 291 13 2 466 4 456 2.16e-49 175
MsG0780038115.01.T01 AT1G22340 28.457 499 289 18 2 462 9 477 2.21e-49 176
MsG0780038115.01.T01 AT1G05680 29.814 483 291 12 1 466 1 452 4.18e-49 174
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MsG0780038115.01.T01 AT2G15480 32.918 401 224 12 92 466 109 490 2.53e-48 173
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MsG0780038115.01.T01 AT2G36780 36.242 298 160 7 183 462 199 484 9.10e-47 169
MsG0780038115.01.T01 AT2G30150 29.424 486 278 15 6 469 13 455 1.01e-46 168
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MsG0780038115.01.T01 AT2G16890 30.682 440 255 15 4 418 5 419 5.98e-46 165
MsG0780038115.01.T01 AT4G34138 36.823 277 137 8 207 466 223 478 7.91e-46 166
MsG0780038115.01.T01 AT2G30150 29.436 479 273 14 13 469 4 439 1.13e-45 165
MsG0780038115.01.T01 AT1G78270 28.131 487 283 15 6 455 13 469 1.22e-45 166
MsG0780038115.01.T01 AT4G34131 31.551 374 216 12 111 466 128 479 1.50e-45 166
MsG0780038115.01.T01 AT1G22360 28.189 486 282 16 1 455 5 454 1.80e-45 165
MsG0780038115.01.T01 AT2G36770 36.458 288 156 8 192 462 207 484 4.40e-45 164
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MsG0780038115.01.T01 AT1G22370 30.785 484 269 17 6 455 13 464 9.44e-45 163
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MsG0780038115.01.T01 AT1G51210 29.978 457 254 16 6 440 20 432 7.15e-44 160
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MsG0780038115.01.T01 AT5G12890 29.482 502 291 18 2 465 4 480 1.30e-43 160
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MsG0780038115.01.T01 AT1G73880 27.309 498 290 18 5 470 13 470 1.38e-42 157
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MsG0780038115.01.T01 AT3G46680 28.602 465 291 18 1 455 4 437 3.38e-42 155
MsG0780038115.01.T01 AT1G24100 27.291 491 303 14 1 468 1 460 3.46e-42 156
MsG0780038115.01.T01 AT2G36970 27.697 343 223 7 108 442 122 447 3.56e-42 156
MsG0780038115.01.T01 AT3G53160 37.591 274 141 9 207 462 217 478 4.62e-42 156
MsG0780038115.01.T01 AT4G34135 32.530 332 192 8 111 427 129 443 4.85e-42 156
MsG0780038115.01.T01 AT2G43840 28.310 491 273 15 6 467 7 447 5.67e-42 155
MsG0780038115.01.T01 AT3G11340 27.655 452 290 16 17 462 20 440 6.70e-42 155
MsG0780038115.01.T01 AT2G36750 36.765 272 146 6 207 462 218 479 1.24e-41 155
MsG0780038115.01.T01 AT5G05880 30.303 363 225 12 106 462 104 444 5.25e-41 152
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MsG0780038115.01.T01 AT3G55700 33.115 305 182 10 163 466 167 450 1.01e-40 152
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MsG0780038115.01.T01 AT2G28080 29.261 352 222 9 111 455 129 460 2.85e-40 151
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MsG0780038115.01.T01 AT3G46700 34.733 262 153 6 207 467 201 445 5.65e-40 149
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MsG0780038115.01.T01 AT5G38010 29.810 369 222 12 109 466 111 453 2.66e-35 137
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MsG0780038115.01.T01 AT5G38040 27.682 466 284 18 17 466 21 449 1.45e-34 135
MsG0780038115.01.T01 AT4G15490 29.570 372 213 15 105 455 111 454 2.71e-34 134
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MsG0780038115.01.T01 AT1G05560 35.178 253 147 9 208 455 250 490 1.11e-33 133
MsG0780038115.01.T01 AT3G55710 31.561 301 178 10 174 466 174 454 2.16e-33 132
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MsG0780038115.01.T01 AT2G23250 27.729 339 210 11 138 466 122 435 4.34e-32 127
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MsG0780038115.01.T01 AT3G22250 32.227 211 114 7 237 436 247 439 1.62e-26 112
MsG0780038115.01.T01 AT2G22590 31.604 212 127 4 236 441 247 446 1.68e-26 112
MsG0780038115.01.T01 AT1G64910 31.890 254 155 6 192 442 180 418 3.88e-26 110
MsG0780038115.01.T01 AT4G27570 30.579 242 151 5 206 445 201 427 7.50e-25 107
MsG0780038115.01.T01 AT4G27560 29.583 240 152 5 206 443 201 425 9.66e-23 100
MsG0780038115.01.T01 AT5G53990 33.514 185 111 3 260 442 244 418 4.03e-22 99.0
MsG0780038115.01.T01 AT5G54010 32.292 192 118 3 254 443 244 425 9.60e-22 97.8
MsG0780038115.01.T01 AT1G50580 24.342 456 296 13 1 443 1 420 3.64e-20 93.2
MsG0780038115.01.T01 AT1G64920 31.500 200 117 5 254 445 238 425 6.07e-20 92.4
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MsG0780038115.01.T01 AT2G22930 29.167 192 124 3 254 443 238 419 2.43e-19 90.5
MsG0780038115.01.T01 AT3G29630 32.275 189 111 5 260 443 246 422 3.37e-19 90.1
MsG0780038115.01.T01 AT4G09500 29.775 178 113 2 267 442 226 393 4.60e-18 86.7
MsG0780038115.01.T01 AT4G09500 29.775 178 113 2 267 442 251 418 5.45e-18 86.7
MsG0780038115.01.T01 AT5G54060 31.183 186 115 4 259 441 267 442 4.16e-16 80.9
MsG0780038115.01.T01 AT4G34135 29.902 204 129 6 111 305 129 327 1.56e-12 68.9

Find 83 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 108 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GGAAAAGATTGGTGGGATTT+AGG 0.191027 7:+40552943 MsG0780038115.01.T01:CDS
ACACATCCTGGTAACTTTAT+AGG 0.232228 7:-40552041 None:intergenic
GTGGGACCCATTACACAAAT+AGG 0.239147 7:+40552254 MsG0780038115.01.T01:CDS
TTGGAAAGAACCAAAGAAAA+AGG 0.272917 7:+40552536 MsG0780038115.01.T01:CDS
CTTGACCCTATTTGTGTAAT+GGG 0.274064 7:-40552260 None:intergenic
ATGCAAGTGACATGAAAATT+TGG 0.279288 7:-40551642 None:intergenic
ATGATTTGTGACTAATCTTT+TGG 0.279385 7:-40551619 None:intergenic
GTGTAACTGTTAATTGAATT+AGG 0.291228 7:-40551794 None:intergenic
CAAATGAATGAACTAGCTTT+TGG 0.303669 7:+40552395 MsG0780038115.01.T01:CDS
GTTAATTGAATTAGGATTCC+TGG 0.304486 7:-40551786 None:intergenic
GAAACCTCTTCATCAAGTTT+TGG 0.313198 7:-40551993 None:intergenic
TTCACACTTGGCTACTCAAT+TGG 0.329298 7:+40552922 MsG0780038115.01.T01:CDS
AGACAAAGAATTGAACTCTT+TGG 0.331941 7:-40551919 None:intergenic
GGTAAGTCTTGTTTGTTGAT+TGG 0.374729 7:-40551750 None:intergenic
GCTACTCAATTGGAAAAGAT+TGG 0.383288 7:+40552932 MsG0780038115.01.T01:CDS
AAAACTAAGTTTATGTTTGG+TGG 0.393290 7:-40551720 None:intergenic
TGAGTGGTCAAAGATTCATT+TGG 0.413025 7:+40552426 MsG0780038115.01.T01:CDS
ATGGTCTTAAAGTGGCTTTA+AGG 0.413506 7:+40552732 MsG0780038115.01.T01:CDS
AACAGCATTCATTGCTTGTT+CGG 0.413693 7:-40552699 None:intergenic
GAGTGGTCAAAGATTCATTT+GGG 0.415417 7:+40552427 MsG0780038115.01.T01:CDS
ACTTGCATCATTCCCTCACT+TGG 0.426590 7:+40551657 MsG0780038115.01.T01:CDS
ACTTGACCCTATTTGTGTAA+TGG 0.427102 7:-40552261 None:intergenic
AACAATGGCCAAGCTACTAT+TGG 0.445439 7:-40552674 None:intergenic
ATGTATCTTCAACGTGCTAA+AGG 0.465770 7:+40552125 MsG0780038115.01.T01:CDS
ATCAAGTGCTATAAAAGCAT+TGG 0.465790 7:+40552196 MsG0780038115.01.T01:CDS
ATGAACATGAATGTTTGAAA+TGG 0.468686 7:+40552303 MsG0780038115.01.T01:CDS
TTAATTGAATTAGGATTCCT+GGG 0.470926 7:-40551785 None:intergenic
TGGGACCCATTACACAAATA+GGG 0.471912 7:+40552255 MsG0780038115.01.T01:CDS
CCACTGATTGGTACACATCC+TGG 0.474167 7:-40552053 None:intergenic
TTGTGGTTGGAATTCAACTT+TGG 0.474884 7:+40552631 MsG0780038115.01.T01:CDS
TGTTTGGTGGAATTGTTTCA+AGG 0.480591 7:-40551707 None:intergenic
TCAGCAATTATAGCAACTAA+AGG 0.482289 7:-40551867 None:intergenic
CTAAAGCAAAATTCAGTTGG+TGG 0.483507 7:+40552596 MsG0780038115.01.T01:CDS
TTGAGAGCTTCATGAATTGA+TGG 0.484255 7:-40551825 None:intergenic
AATTGCTGATAAATTTGCAT+TGG 0.486451 7:+40551881 MsG0780038115.01.T01:CDS
TGCTTTAGTATTTCAACTTG+AGG 0.497268 7:-40552581 None:intergenic
TTTAAGAGAATCTGCTGCTA+TGG 0.506143 7:+40552862 MsG0780038115.01.T01:CDS
AAGCTGAACAAGGGAAGTAA+AGG 0.507190 7:-40551944 None:intergenic
ATAGCTGTTATTTCAAGCCC+TGG 0.511106 7:+40551564 MsG0780038115.01.T01:CDS
GGGGCTATGTGGCTGAAACC+AGG 0.513712 7:-40551582 None:intergenic
ACAGTAACAAAAGATAGATC+AGG 0.513854 7:+40552089 MsG0780038115.01.T01:CDS
TGTGTGATGGAAGGGGAAGA+AGG 0.517535 7:+40552812 MsG0780038115.01.T01:CDS
TCAACTTGAGGTGCCCATGA+TGG 0.519687 7:-40552569 None:intergenic
AATACAAACTATTTCACACT+TGG 0.521278 7:+40552910 MsG0780038115.01.T01:CDS
TGAAGATCAATACCACTGAT+TGG 0.525322 7:-40552065 None:intergenic
CTCAATTGGAAAAGATTGGT+GGG 0.525949 7:+40552936 MsG0780038115.01.T01:CDS
ATACTAAAGCAAAATTCAGT+TGG 0.529329 7:+40552593 MsG0780038115.01.T01:CDS
AGCTTCATGAATTGATGGTA+GGG 0.535357 7:-40551820 None:intergenic
TTTGGAGAATTCTACTATTG+GGG 0.537773 7:-40551601 None:intergenic
GAGCTTCATGAATTGATGGT+AGG 0.538695 7:-40551821 None:intergenic
TTGGCCAAAACTTGATGAAG+AGG 0.539482 7:+40551989 MsG0780038115.01.T01:CDS
AAGTCTTGTTTGTTGATTGG+TGG 0.544881 7:-40551747 None:intergenic
GGGCTATGTGGCTGAAACCA+GGG 0.550402 7:-40551581 None:intergenic
AGATGATGACATTGTGGTAA+AGG 0.553765 7:+40552766 MsG0780038115.01.T01:CDS
CAAGAACCTATAAAGTTACC+AGG 0.568874 7:+40552035 MsG0780038115.01.T01:CDS
TCAAGTAACAATGATGTTGT+TGG 0.571362 7:+40552278 MsG0780038115.01.T01:CDS
GCATTGGAACAACATGGTGA+TGG 0.576398 7:+40552212 MsG0780038115.01.T01:CDS
GTTATGTGATGGTCTTAAAG+TGG 0.579133 7:+40552724 MsG0780038115.01.T01:CDS
ACTCAATTGGAAAAGATTGG+TGG 0.583668 7:+40552935 MsG0780038115.01.T01:CDS
ATGATTAAGTGTGTGATGGA+AGG 0.584625 7:+40552803 MsG0780038115.01.T01:CDS
TGATTAAGTGTGTGATGGAA+GGG 0.587144 7:+40552804 MsG0780038115.01.T01:CDS
ATTGCTTGTTCGGCAAACAA+TGG 0.588625 7:-40552689 None:intergenic
AACTTTGGAAAGTATACAAG+AGG 0.590085 7:+40552646 MsG0780038115.01.T01:CDS
GAAAGTACAAAAGCTGAACA+AGG 0.590176 7:-40551954 None:intergenic
GATTAAGTGTGTGATGGAAG+GGG 0.592863 7:+40552805 MsG0780038115.01.T01:CDS
ATTCTACTATTGGGGCTATG+TGG 0.593266 7:-40551593 None:intergenic
ATTTGGTAATGAACCAAGTG+AGG 0.598683 7:-40551670 None:intergenic
ATTTGTGTAATGGGTCCCAC+AGG 0.598751 7:-40552251 None:intergenic
ATGGCATTGAAAGTCAAAGA+TGG 0.602420 7:+40552881 MsG0780038115.01.T01:CDS
ATTTGAAGATGATGACATTG+TGG 0.606566 7:+40552760 MsG0780038115.01.T01:CDS
AACAAACAAGACTTACCTCA+AGG 0.611556 7:+40551756 MsG0780038115.01.T01:CDS
ACTTTGGAAAGTATACAAGA+GGG 0.613255 7:+40552647 MsG0780038115.01.T01:CDS
TTTGGTAATGAACCAAGTGA+GGG 0.624797 7:-40551669 None:intergenic
AAAGATGATTAAGTGTGTGA+TGG 0.637223 7:+40552799 MsG0780038115.01.T01:CDS
ATTCCTGGGTATACTCCTTG+AGG 0.640775 7:-40551771 None:intergenic
CCAGGATGTGTACCAATCAG+TGG 0.645988 7:+40552053 MsG0780038115.01.T01:CDS
TTTGGAAAGTATACAAGAGG+GGG 0.657847 7:+40552649 MsG0780038115.01.T01:CDS
GCAGCACTAACTGAATCACT+TGG 0.660110 7:-40552461 None:intergenic
AATGCTGTTATGTTATGTGA+TGG 0.661412 7:+40552713 MsG0780038115.01.T01:CDS
CTTTGGAAAGTATACAAGAG+GGG 0.668198 7:+40552648 MsG0780038115.01.T01:CDS
AAAGTACAAAAGCTGAACAA+GGG 0.678258 7:-40551953 None:intergenic
TTACCTCAAGGAGTATACCC+AGG 0.698158 7:+40551768 MsG0780038115.01.T01:CDS
ATAAAAGCATTGGAACAACA+TGG 0.711109 7:+40552206 MsG0780038115.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TACTTTCTTTTTATTTACAT+TGG + Chr7:40551970-40551989 MsG0780038115.01.T01:CDS 15.0%
!! AGAAAAACTAAGTTTATGTT+TGG - Chr7:40551726-40551745 None:intergenic 20.0%
! AAAACTAAGTTTATGTTTGG+TGG - Chr7:40551723-40551742 None:intergenic 25.0%
! AATACAAACTATTTCACACT+TGG + Chr7:40552910-40552929 MsG0780038115.01.T01:CDS 25.0%
! AATTGCTGATAAATTTGCAT+TGG + Chr7:40551881-40551900 MsG0780038115.01.T01:CDS 25.0%
! ATACTAAAGCAAAATTCAGT+TGG + Chr7:40552593-40552612 MsG0780038115.01.T01:CDS 25.0%
! ATGAACATGAATGTTTGAAA+TGG + Chr7:40552303-40552322 MsG0780038115.01.T01:CDS 25.0%
! GTGTAACTGTTAATTGAATT+AGG - Chr7:40551797-40551816 None:intergenic 25.0%
! TTAATTGAATTAGGATTCCT+GGG - Chr7:40551788-40551807 None:intergenic 25.0%
!! CAAAATCAAACCTTTTTCTT+TGG - Chr7:40552549-40552568 None:intergenic 25.0%
!! TCTGTTTTGTATGTTTCTTT+TGG + Chr7:40552347-40552366 MsG0780038115.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAAAATCAGTTTTTTTCCTG+TGG + Chr7:40552235-40552254 MsG0780038115.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAAATCAGTTTTTTTCCTGT+GGG + Chr7:40552236-40552255 MsG0780038115.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAAGGTATGTATTTTGTTGA+TGG + Chr7:40552143-40552162 MsG0780038115.01.T01:CDS 25.0%
!!! AGGTATGATTTTGATGAATT+TGG - Chr7:40551690-40551709 None:intergenic 25.0%
!!! ATGATTTGTGACTAATCTTT+TGG - Chr7:40551622-40551641 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTGGAGAATTCTACTATT+GGG - Chr7:40551605-40551624 None:intergenic 25.0%
AAAGATGATTAAGTGTGTGA+TGG + Chr7:40552799-40552818 MsG0780038115.01.T01:CDS 30.0%
AAAGTACAAAAGCTGAACAA+GGG - Chr7:40551956-40551975 None:intergenic 30.0%
AATGCTGTTATGTTATGTGA+TGG + Chr7:40552713-40552732 MsG0780038115.01.T01:CDS 30.0%
ACAGTAACAAAAGATAGATC+AGG + Chr7:40552089-40552108 MsG0780038115.01.T01:CDS 30.0%
AGACAAAGAATTGAACTCTT+TGG - Chr7:40551922-40551941 None:intergenic 30.0%
ATGCAAGTGACATGAAAATT+TGG - Chr7:40551645-40551664 None:intergenic 30.0%
ATTTGAAGATGATGACATTG+TGG + Chr7:40552760-40552779 MsG0780038115.01.T01:CDS 30.0%
GTTAATTGAATTAGGATTCC+TGG - Chr7:40551789-40551808 None:intergenic 30.0%
TCAAGTAACAATGATGTTGT+TGG + Chr7:40552278-40552297 MsG0780038115.01.T01:CDS 30.0%
TCAGCAATTATAGCAACTAA+AGG - Chr7:40551870-40551889 None:intergenic 30.0%
TGCTTTAGTATTTCAACTTG+AGG - Chr7:40552584-40552603 None:intergenic 30.0%
TTGGAAAGAACCAAAGAAAA+AGG + Chr7:40552536-40552555 MsG0780038115.01.T01:CDS 30.0%
TTTGGAGAATTCTACTATTG+GGG - Chr7:40551604-40551623 None:intergenic 30.0%
! AACTTTGGAAAGTATACAAG+AGG + Chr7:40552646-40552665 MsG0780038115.01.T01:CDS 30.0%
! ACATACAAAACAGAGTTTTG+TGG - Chr7:40552341-40552360 None:intergenic 30.0%
! ACTTTGGAAAGTATACAAGA+GGG + Chr7:40552647-40552666 MsG0780038115.01.T01:CDS 30.0%
! ATCAAGTGCTATAAAAGCAT+TGG + Chr7:40552196-40552215 MsG0780038115.01.T01:CDS 30.0%
! ATTTTTACCTACAGGGTTTT+TGG + Chr7:40552517-40552536 MsG0780038115.01.T01:CDS 30.0%
! CACTGAAATTTTTACCTACA+GGG + Chr7:40552510-40552529 MsG0780038115.01.T01:CDS 30.0%
!! ATAAAAGCATTGGAACAACA+TGG + Chr7:40552206-40552225 MsG0780038115.01.T01:CDS 30.0%
!! CTTTTGGAGAATTCTACTAT+TGG - Chr7:40551606-40551625 None:intergenic 30.0%
!! TTGTATGTTTCTTTTGGAAG+TGG + Chr7:40552353-40552372 MsG0780038115.01.T01:CDS 30.0%
!!! CAAATGAATGAACTAGCTTT+TGG + Chr7:40552395-40552414 MsG0780038115.01.T01:CDS 30.0%
!!! GATTTTTAAGTCATTGTGGT+TGG + Chr7:40552618-40552637 MsG0780038115.01.T01:CDS 30.0%
AACAAACAAGACTTACCTCA+AGG + Chr7:40551756-40551775 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
AACAGCATTCATTGCTTGTT+CGG - Chr7:40552702-40552721 None:intergenic 35.0%
ACACATCCTGGTAACTTTAT+AGG - Chr7:40552044-40552063 None:intergenic 35.0%
ACTCAATTGGAAAAGATTGG+TGG + Chr7:40552935-40552954 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
ACTTGACCCTATTTGTGTAA+TGG - Chr7:40552264-40552283 None:intergenic 35.0%
AGATGATGACATTGTGGTAA+AGG + Chr7:40552766-40552785 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
ATGTATCTTCAACGTGCTAA+AGG + Chr7:40552125-40552144 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
CAAGAACCTATAAAGTTACC+AGG + Chr7:40552035-40552054 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
CCTGTAGGTAAAAATTTCAG+TGG - Chr7:40552512-40552531 None:intergenic 35.0%
CTAAAGCAAAATTCAGTTGG+TGG + Chr7:40552596-40552615 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
CTCAATTGGAAAAGATTGGT+GGG + Chr7:40552936-40552955 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
CTTGACCCTATTTGTGTAAT+GGG - Chr7:40552263-40552282 None:intergenic 35.0%
GAGTGGTCAAAGATTCATTT+GGG + Chr7:40552427-40552446 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
GCTACTCAATTGGAAAAGAT+TGG + Chr7:40552932-40552951 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
TGAAGATCAATACCACTGAT+TGG - Chr7:40552068-40552087 None:intergenic 35.0%
TGAGTGGTCAAAGATTCATT+TGG + Chr7:40552426-40552445 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
TTGAGAGCTTCATGAATTGA+TGG - Chr7:40551828-40551847 None:intergenic 35.0%
TTGTGGTTGGAATTCAACTT+TGG + Chr7:40552631-40552650 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
TTTAAGAGAATCTGCTGCTA+TGG + Chr7:40552862-40552881 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
! AGCTTCATGAATTGATGGTA+GGG - Chr7:40551823-40551842 None:intergenic 35.0%
! ATGATTAAGTGTGTGATGGA+AGG + Chr7:40552803-40552822 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
! ATGGCATTGAAAGTCAAAGA+TGG + Chr7:40552881-40552900 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
! ATGGTCTTAAAGTGGCTTTA+AGG + Chr7:40552732-40552751 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
! CCACTGAAATTTTTACCTAC+AGG + Chr7:40552509-40552528 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
! CTTTGGAAAGTATACAAGAG+GGG + Chr7:40552648-40552667 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
! GAAACCTCTTCATCAAGTTT+TGG - Chr7:40551996-40552015 None:intergenic 35.0%
! GAAAGTACAAAAGCTGAACA+AGG - Chr7:40551957-40551976 None:intergenic 35.0%
! GTTATGTGATGGTCTTAAAG+TGG + Chr7:40552724-40552743 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
! TGATTAAGTGTGTGATGGAA+GGG + Chr7:40552804-40552823 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
! TGTTTGGTGGAATTGTTTCA+AGG - Chr7:40551710-40551729 None:intergenic 35.0%
! TTTGGAAAGTATACAAGAGG+GGG + Chr7:40552649-40552668 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
!! AAGGTTTGATTTTGCCATCA+TGG + Chr7:40552555-40552574 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
!! AAGTCTTGTTTGTTGATTGG+TGG - Chr7:40551750-40551769 None:intergenic 35.0%
!! ACAAAACAGAGTTTTGTGGT+TGG - Chr7:40552337-40552356 None:intergenic 35.0%
!! AGGTTTGATTTTGCCATCAT+GGG + Chr7:40552556-40552575 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTTGGTAATGAACCAAGTG+AGG - Chr7:40551673-40551692 None:intergenic 35.0%
!! GGTAAGTCTTGTTTGTTGAT+TGG - Chr7:40551753-40551772 None:intergenic 35.0%
!! TATGTTTCTTTTGGAAGTGG+TGG + Chr7:40552356-40552375 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTGGTAATGAACCAAGTGA+GGG - Chr7:40551672-40551691 None:intergenic 35.0%
!!! GAATGAACTAGCTTTTGGTT+TGG + Chr7:40552400-40552419 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
!!! GGTGGATTTTTAAGTCATTG+TGG + Chr7:40552614-40552633 MsG0780038115.01.T01:CDS 35.0%
AACAATGGCCAAGCTACTAT+TGG - Chr7:40552677-40552696 None:intergenic 40.0%
AAGCTGAACAAGGGAAGTAA+AGG - Chr7:40551947-40551966 None:intergenic 40.0%
ATTCTACTATTGGGGCTATG+TGG - Chr7:40551596-40551615 None:intergenic 40.0%
ATTGCTTGTTCGGCAAACAA+TGG - Chr7:40552692-40552711 None:intergenic 40.0%
GTTCTTTCCAAAAACCCTGT+AGG - Chr7:40552527-40552546 None:intergenic 40.0%
TGGGACCCATTACACAAATA+GGG + Chr7:40552255-40552274 MsG0780038115.01.T01:CDS 40.0%
TTCACACTTGGCTACTCAAT+TGG + Chr7:40552922-40552941 MsG0780038115.01.T01:CDS 40.0%
TTGGCCAAAACTTGATGAAG+AGG + Chr7:40551989-40552008 MsG0780038115.01.T01:CDS 40.0%
! GAGCTTCATGAATTGATGGT+AGG - Chr7:40551824-40551843 None:intergenic 40.0%
! GATTAAGTGTGTGATGGAAG+GGG + Chr7:40552805-40552824 MsG0780038115.01.T01:CDS 40.0%
!! ATAGCTGTTATTTCAAGCCC+TGG + Chr7:40551564-40551583 MsG0780038115.01.T01:CDS 40.0%
!!! GCTTTTGGTTTGGAATTGAG+TGG + Chr7:40552410-40552429 MsG0780038115.01.T01:CDS 40.0%
ACTTGCATCATTCCCTCACT+TGG + Chr7:40551657-40551676 MsG0780038115.01.T01:CDS 45.0%
ATTCCTGGGTATACTCCTTG+AGG - Chr7:40551774-40551793 None:intergenic 45.0%
GCAGCACTAACTGAATCACT+TGG - Chr7:40552464-40552483 None:intergenic 45.0%
GCATTGGAACAACATGGTGA+TGG + Chr7:40552212-40552231 MsG0780038115.01.T01:CDS 45.0%
GTGGGACCCATTACACAAAT+AGG + Chr7:40552254-40552273 MsG0780038115.01.T01:CDS 45.0%
! TTACCTCAAGGAGTATACCC+AGG + Chr7:40551768-40551787 MsG0780038115.01.T01:CDS 45.0%
!! ATTTGTGTAATGGGTCCCAC+AGG - Chr7:40552254-40552273 None:intergenic 45.0%
CCAGGATGTGTACCAATCAG+TGG + Chr7:40552053-40552072 MsG0780038115.01.T01:CDS 50.0%
! CCACTGATTGGTACACATCC+TGG - Chr7:40552056-40552075 None:intergenic 50.0%
! TCAACTTGAGGTGCCCATGA+TGG - Chr7:40552572-40552591 None:intergenic 50.0%
! TGTGTGATGGAAGGGGAAGA+AGG + Chr7:40552812-40552831 MsG0780038115.01.T01:CDS 50.0%
GGGCTATGTGGCTGAAACCA+GGG - Chr7:40551584-40551603 None:intergenic 55.0%
!! AGGGGGTGCCAATAGTAGCT+TGG + Chr7:40552666-40552685 MsG0780038115.01.T01:CDS 55.0%
GGGGCTATGTGGCTGAAACC+AGG - Chr7:40551585-40551604 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 40551546 40552964 40551546 ID=MsG0780038115.01;Name=MsG0780038115.01
Chr7 mRNA 40551546 40552964 40551546 ID=MsG0780038115.01.T01;Parent=MsG0780038115.01;Name=MsG0780038115.01.T01;_AED=0.46;_eAED=0.46;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|472
Chr7 exon 40551546 40552964 40551546 ID=MsG0780038115.01.T01:exon:12767;Parent=MsG0780038115.01.T01
Chr7 CDS 40551546 40552964 40551546 ID=MsG0780038115.01.T01:cds;Parent=MsG0780038115.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780038115.01.T01

ATGGCAAAAACAACTCACATAGCTGTTATTTCAAGCCCTGGTTTCAGCCACATAGCCCCAATAGTAGAATTCTCCAAAAGATTAGTCACAAATCATCCAAATTTTCATGTCACTTGCATCATTCCCTCACTTGGTTCATTACCAAATTCATCAAAATCATACCTTGAAACAATTCCACCAAACATAAACTTAGTTTTTCTTCCACCAATCAACAAACAAGACTTACCTCAAGGAGTATACCCAGGAATCCTAATTCAATTAACAGTTACACGCTCCCTACCATCAATTCATGAAGCTCTCAAATCAATAACTTCAAAAGCACCTTTAGTTGCTATAATTGCTGATAAATTTGCATTGGAAGCACTAGATTTTGCCAAAGAGTTCAATTCTTTGTCTTACCTTTACTTCCCTTGTTCAGCTTTTGTACTTTCTTTTTATTTACATTGGCCAAAACTTGATGAAGAGGTTTCATGTAAATACAAAGAATTACAAGAACCTATAAAGTTACCAGGATGTGTACCAATCAGTGGTATTGATCTTCATACAGTAACAAAAGATAGATCAGGTCAAGCTTACAAAATGTATCTTCAACGTGCTAAAGGTATGTATTTTGTTGATGGAATCTTGTTTAACAGTTTCTTTGCATTAGAATCAAGTGCTATAAAAGCATTGGAACAACATGGTGATGGAAAAATCAGTTTTTTTCCTGTGGGACCCATTACACAAATAGGGTCAAGTAACAATGATGTTGTTGGTGATGAACATGAATGTTTGAAATGGTTGAAAAACCAACCACAAAACTCTGTTTTGTATGTTTCTTTTGGAAGTGGTGGAACACTTTCTCAAAGACAAATGAATGAACTAGCTTTTGGTTTGGAATTGAGTGGTCAAAGATTCATTTGGGTTGTGAGACAACCAAGTGATTCAGTTAGTGCTGCTTATCTTGAAGATGCAAATGAAGATCCACTGAAATTTTTACCTACAGGGTTTTTGGAAAGAACCAAAGAAAAAGGTTTGATTTTGCCATCATGGGCACCTCAAGTTGAAATACTAAAGCAAAATTCAGTTGGTGGATTTTTAAGTCATTGTGGTTGGAATTCAACTTTGGAAAGTATACAAGAGGGGGTGCCAATAGTAGCTTGGCCATTGTTTGCCGAACAAGCAATGAATGCTGTTATGTTATGTGATGGTCTTAAAGTGGCTTTAAGGTTGAAATTTGAAGATGATGACATTGTGGTAAAGGAGAAAATTGCAAAGATGATTAAGTGTGTGATGGAAGGGGAAGAAGGTAAAGCAATGCGTGATAGAATGAAGAGTTTAAGAGAATCTGCTGCTATGGCATTGAAAGTCAAAGATGGTTCTTCAATACAAACTATTTCACACTTGGCTACTCAATTGGAAAAGATTGGTGGGATTTAG

Protein sequence

>MsG0780038115.01.T01

MAKTTHIAVISSPGFSHIAPIVEFSKRLVTNHPNFHVTCIIPSLGSLPNSSKSYLETIPPNINLVFLPPINKQDLPQGVYPGILIQLTVTRSLPSIHEALKSITSKAPLVAIIADKFALEALDFAKEFNSLSYLYFPCSAFVLSFYLHWPKLDEEVSCKYKELQEPIKLPGCVPISGIDLHTVTKDRSGQAYKMYLQRAKGMYFVDGILFNSFFALESSAIKALEQHGDGKISFFPVGPITQIGSSNNDVVGDEHECLKWLKNQPQNSVLYVSFGSGGTLSQRQMNELAFGLELSGQRFIWVVRQPSDSVSAAYLEDANEDPLKFLPTGFLERTKEKGLILPSWAPQVEILKQNSVGGFLSHCGWNSTLESIQEGVPIVAWPLFAEQAMNAVMLCDGLKVALRLKFEDDDIVVKEKIAKMIKCVMEGEEGKAMRDRMKSLRESAAMALKVKDGSSIQTISHLATQLEKIGGI*