AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene29489


Find 230 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 406 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE



Chromosome Type Strat End Strand Name
chr5.3 gene 64624877 64630644 64624877 ID=MS.gene29489
chr5.3 mRNA 64624877 64630644 64624877 ID=MS.gene29489.t1;Parent=MS.gene29489
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chr5.3 CDS 64630408 64630644 64630408 ID=cds.MS.gene29489.t1;Parent=MS.gene29489.t1
Gene Sequence

>MS.gene29489

ATGGCTCACTGCTCTATCAAGGATACCGGTATAGCGGAATCCCAGTTGAGTTGGTGGTATCTCGTATCATCTTACGAAGAACTCAAAACAGGGAAACAAAAGGTAAAAACCTCGGCCGAGAGTTTCAGTTGTCCGTACTGCCCCGAGAGGAAACAGGATTATAAGTTAAATGAACTCCTTAATCACGCCACTGGGATTGGTAGGAGTAGTTCAGAGAAGAGAAGTGCTAAAGAGAAGGGTAGTCATTTGGCTTTGGTAAAATATTTGGAGCAAGATCTTAACAGTAAGGATGGTGCATCGAGACCTATAGATCAAGGTGATCTGTTGTTAGTCTTATATTCCGTTTTAGTCGTCGTTTTAAGGTTAATTACATTACACATACCAATAAAACTGATTAATATTGTTACTTTTGATTAAATTATTTGCCTGGTAAATCAGCAGGACAACGATCTTTGCTAACACTAATTTTTGTCTTTCAGTTACGAACACAATAAGTCCAGGACAAACAGTAATGTCTCACTGTTCTATCAAGGATACCGATATAAGTTGGTGGTATGTAGATACAGCTTATGAAGAGCTCAAAAATGGAACTCGGAATGTGAAAACCTCAGACGGGACTTTCATATGCCCGTACTGCCCTAATAGAAAACAGGATTATTTGTACAGGGAACTCCTAGAACATGCTTTTATGGTTGGTCGGAGTAGTTCAGATAAGAGAAGTGCAAGAGAAAGAGCTAATCATCTTGCTTTGTTGAAATATTTGGAAAAGGATATTACGAGTATGCCTGGACCGTCAAAGCCTGTTGATAAAGGTGATCCTGATCCTGCTGTTTGCGATATACCACGGAAATTTTTTCGTTCTAGTTAATATATTTTTCTGGGTAATTGAATAGGCTGAAACTATCCATTTCACAGTGATATTATTTTTTATACTATATATAAAAGAGATATCGGGATTTGGTGTAGTCTTTACTCTGTCAATTTGACCCTTAATTTAAACTTTTTATTTTTACTATTTTATCATTCTAATATATTTTTGTTATATTAATAATCAACTAAATTTTGTAACTTCAATTATTTTTATAAAAAAGCAGAAAGACAGACACATTAACGCCTGTTTGCACGCTAGTAATAGAATACTGATTCTGTAAAGCAGCATAGTAAAAATCAGTGCTAAAACTAACTTTTGTCTTTCAGGTACAAAATTGATAAGTCAAGGACAAACTGTCACGGCTCCATGCTCTAACAAGGATACTGGTTCAAGTGATCCTCGAATAAGTTGGTTGTATGTAGATAAATTTTATCAAGAACTCAAGAATGGAAGTCTCAAAGTGAGAATCTCAGATGAGGCTTTCACTTGTCCATACTGCCCGAAAATGAAAAAACCGGACTATGTGTACAGGGAAATCCTTGAACACGCTTCTGGGGTCGGTCAGAGTAGTTCGCAAAAGAGAGGTATCAGAGAGAAGGCAACTCATCTGGCTTTAATGAAATATTTGAAACAGGATATTATATATGTGCCTGCTCCATCAAAACCTGTGATTGAAGGTGATTCTTCTGGTAAGTAAGCAATTGTTCAAAACTTCAGTTCAATTTTTCCTAGTTACTGAATATACCGACTTTGACCAATTCAATTAACAATGATATTTGGTCGAAGTAACGTGCAAGGAGATATATTTTATCAAAGCTTAACAGTCGGTACTAAAACAATATTTTGTTTTTCAGGAGCCATGATACAAAGCCGAGAAGAAAATGCGACGACTCGCTGCTCCGACAAAGATTCTGATAAAAGTGCATCTCAAATAAATTTAGGGCAATTAAAAAGAACATATGAACAGCTCAAAAAGGGGATTCAAAACGTGAGAACCTCAGATAAGACTTTCACTTGCCCATACTGCCCTAATAATAAAAGGATAAAACGGGATTACGTGTACAGGGAAATCCTTGAACATGCTTCCGGGGTGGGTTGGAGTATCTCACAAACTAGAACTGACATTGAAAAGGCGGATCATCTGGCTTTGGTTAAATATTTGAAAAAGGATCTTATAAATGTCGGTGGTCCTTCAGAACCAACGAAGAAAGGTGATATCTCGCTCTTAATGAAACATTTATGAAAAAAATCTTTGTTTAACCTTTCTTTCCAATTACCTAACTCCCTCTAATCTTTTTTAAATGCCGCTTCTGTTGATAAATTGTGTTCCTACTTACATGTCATTTTCCTAGTTCAATGCAATATTAACTACTGTTTTGTCAATGACACCCTTAACTATTTGGCGCTGAGTGAGAAATAAGTGGAATGGGATAATAAATTTTAAGGGTATTATAGGTAAAAAAAACTAACAATTTCATCAAAAGTTAATAACTTTAAAATGACAAATAAAGAAACAAAGGGAATGATATGCAGACATTGGCCAACTCACAATGATATTTAATGGAATGGAAGTAATCTATGAAGCACTTAACAAGAATCATTACTAACTCCTTATTTTGTTTTGCAGGCACCATAATGTTGAACCGAGGAGTAACTGTAACAGGTCACCTCTCTGAGAAGGATGCTAATAATAGTGCATCTCAAATAAATGCGTTGTTTGTAAATAAATCCTATGCAGAACTCAAGAAGGGAATTCACAAGGTCAAAACATCAGAAGATACTTTCTCATGTCCGTATTGCCCTAAGAGAAAATGCAATTATAGGTACAGCGAACTCCTTAATCATGCTTTAGGGGTAGGTCAAAGTGACGCACAAAGGAGAAGTGTATTGGAGAAGGCCAACCATCTAGCTTTAGTGAAATATTTGGAAAAGGATCTTATGACTATGAATGTGGAACGTCCGTTAAAGCCTGCAAATAAATATTTGGAAAACAATCTTATGAATGTGGAACAAAATCGAACAAAACCAGTGAATGAAAACATTCTTGTCAATTCTGAAAGGCAGTTTGTATGGCCATGGACTGGGATTGTGGTAAATATTCCCACTAGCCAAACCGAAGATGGACGATGTATTGGTGAAAGTGGTTCCAAGCTAAGGGATGAATATCGAATAAGGGGTTTTAATCCACGTAGAGTCCGAACGCTTTGGAATTCATGGGGTCACACCGGAGCTGCAGTCGTGGAATTCAATAAAAGTTGGCTAGGGTTATATAATGCATTGGCATTTGAAAGGGCGTATGAATTAGATTGTCACGGGAAAAAGGACTGGCTTTCTTGTAGTGAACAAAAATCCGGTCTTTATGCGTGGGTTGCCCGAGCTGATGACTACAAAGTGAACAACATAATCGGGGAACAACTACAAAAGATGGATGTTAAAACAATACCTGAAATCATGGAGCAAGATGCTAGAAGGTTCAATAGACTCGTGCAGAGTATGCATAACATTCTTCAAGTAAAGAACAACAAGATAAAAGAAATGGAAGTAGTATGCAATGAAATTACACTTCGCATGGACATTGTGATGGGCGAAATAGATAGACTTGCTCAATCTCACAGTCAAGGTATCTATATTATAGAAGCTGCGTTAATTTTTCTCTAATTTTGATCATTACTTGCCAATCGTTTCTAAATGTTGTTTATAGACATTCTGCTAGACTTTTGAAACACATTTGCAACAATTTACTGTTTTAAATGACGTTGAACTATTCAAATGATATTGTTTTATGTCATCATTGCTTGTATTTCAGAGATGAAGAAAATACAGTCAAGTGCAAATCAACACTTTCAGAGTGTTTTGAATGGTCATGAAAGGCTTAAGTTGCAACTGGAATCTCAGAAAAGAGAACTTGAGTTGCGAAGAATTGAACTGGAAAAACGTGAGGCACGTAATGAAAGTGAAAGGAAAAAGTTGGATGAAGAGATTAACAAGGTGCATTGCTTTTCTAATTTTGTTTCATCTTTTTTATCGTTCTGTGACTCACATTCCTGTGAAATGAAGATCAAAGTGAAAATATTGTTTAAGGGTGATTAATTAAGATAGTTTTAATTTTATCTGTTTAGATTTTCCATTTTTTTTCCTCTTTTTTTCTTTCCCTTTTTTCTCCAAACAAGGATCTTGCCGAGGAATCTATAAACCAAAAGTTTGGCATTATTTATTTTTTGCGTCTTTGAAATTCTTCAATAATAATGATACGGTTAAGAATCTTGTCAAATGTTTCATTTAGGTCCATGCTTATGTTTTTTGCTTTTTCTAGACTGCAACGAAAAATCACTTTCTTCAAATGGCTGCTTTGGAGCAACAAAAAGCTGGTGAAAATGTTTTGAAACTTGCTGCAGATCAAAAGGTCCGTATAATTTGTTTTAATGCTTTTTTAATATCCAAAGGTGTTAATGTCAGGATTAGTTCTGTTTATGGTTCGGTTCAGGAAGGAAAACCTAATCTCATTCGGTAAAACTGACCCGAACCATATTCGGTAAACTTGAACCAAACCGTTGAGGGTTTGTCCCGGACCCAATTGGTATACACTGAACTGGTGCACCAAATATATATGCCAGTTCAGTGGTTCTGAACCAAAACTACCTTTTCGGTGTGGTTCGGTTTAACGGTTTGATTCGGTTTTTGGTTTTATTAACAGTCTTAGTCAGCAAAGTGGCAAGCTGATAATGGTACTTGACTATCTATTTATCCAGCGGCAAAAAGAACAACTCCATGCCAAAATCATCCAGCTTGAAAAACAACTAAATGTGAAACAAAAACTGGAATTGGAGATTCAGCAACTAAGAGGAAAACTAAACGTCATGAAGCACATGGAAGATGATGGAGAACATGATGTTCTGGATATGATGGATGCCTTACATATAGATTTAAGAGAGAAGGAACAGTCACTTCGAGACATGGATGCATTGAACCAAACTCTGATCATTAAAGAGCGTAAGAGCAATGATGAACTGCAGGAAGCTCGAAAGGAATTGATTACTGTAATTTTTTTAATTTTTCTAATGATTTGTGTTTTGAAAGTTCTTTCCTCGCATCTTTTAAACTCTTGGATTTTTATCTATCACAGACCATT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Protein sequence

>MS.gene29489.t1

MAHCSIKDTGIAESQLSWWYLVSSYEELKTGKQKVKTSAESFSCPYCPERKQDYKLNELLNHATGIGRSSSEKRSAKEKGSHLALVKYLEQDLNSKDGASRPIDQVTNTISPGQTVMSHCSIKDTDISWWYVDTAYEELKNGTRNVKTSDGTFICPYCPNRKQDYLYRELLEHAFMVGRSSSDKRSARERANHLALLKYLEKDITSMPGPSKPVDKGTKLISQGQTVTAPCSNKDTGSSDPRISWLYVDKFYQELKNGSLKVRISDEAFTCPYCPKMKKPDYVYREILEHASGVGQSSSQKRGIREKATHLALMKYLKQDIIYVPAPSKPVIEGDSSGAMIQSREENATTRCSDKDSDKSASQINLGQLKRTYEQLKKGIQNVRTSDKTFTCPYCPNNKRIKRDYVYREILEHASGVGWSISQTRTDIEKADHLALVKYLKKDLINVGGPSEPTKKGTIMLNRGVTVTGHLSEKDANNSASQINALFVNKSYAELKKGIHKVKTSEDTFSCPYCPKRKCNYRYSELLNHALGVGQSDAQRRSVLEKANHLALVKYLEKDLMTMNVERPLKPANKYLENNLMNVEQNRTKPVNENILVNSERQFVWPWTGIVVNIPTSQTEDGRCIGESGSKLRDEYRIRGFNPRRVRTLWNSWGHTGAAVVEFNKSWLGLYNALAFERAYELDCHGKKDWLSCSEQKSGLYAWVARADDYKVNNIIGEQLQKMDVKTIPEIMEQDARRFNRLVQSMHNILQVKNNKIKEMEVVCNEITLRMDIVMGEIDRLAQSHSQEMKKIQSSANQHFQSVLNGHERLKLQLESQKRELELRRIELEKREARNESERKKLDEEINKTATKNHFLQMAALEQQKAGENVLKLAADQKRQKEQLHAKIIQLEKQLNVKQKLELEIQQLRGKLNVMKHMEDDGEHDVLDMMDALHIDLREKEQSLRDMDALNQTLIIKERKSNDELQEARKELITTIKEMPSCADIRVKRMGELDFRPFLEAMKKKYNEDVAEDRASELCSLWEEYLKDPDWHPFKISTIQEKHQEAIDDEDEKLNELRNEMGEEVYKAVVAALKEINEYNPSGRYITSELWNYAEGKRATLQEGVRVLLKQWKLHRQKRGMI