AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene50031


Find 89 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 442 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE



Chromosome Type Strat End Strand Name
chr2.3 gene 3589434 3595890 3589434 ID=MS.gene50031
chr2.3 mRNA 3589434 3595890 3589434 ID=MS.gene50031.t1;Parent=MS.gene50031
chr2.3 exon 3595692 3595890 3595692 ID=MS.gene50031.t1.exon1;Parent=MS.gene50031.t1
chr2.3 CDS 3595692 3595890 3595692 ID=cds.MS.gene50031.t1;Parent=MS.gene50031.t1
chr2.3 exon 3593883 3593975 3593883 ID=MS.gene50031.t1.exon2;Parent=MS.gene50031.t1
chr2.3 CDS 3593883 3593975 3593883 ID=cds.MS.gene50031.t1;Parent=MS.gene50031.t1
chr2.3 exon 3593666 3593719 3593666 ID=MS.gene50031.t1.exon3;Parent=MS.gene50031.t1
chr2.3 CDS 3593666 3593719 3593666 ID=cds.MS.gene50031.t1;Parent=MS.gene50031.t1
chr2.3 exon 3593013 3593162 3593013 ID=MS.gene50031.t1.exon4;Parent=MS.gene50031.t1
chr2.3 CDS 3593013 3593162 3593013 ID=cds.MS.gene50031.t1;Parent=MS.gene50031.t1
chr2.3 exon 3592725 3592833 3592725 ID=MS.gene50031.t1.exon5;Parent=MS.gene50031.t1
chr2.3 CDS 3592725 3592833 3592725 ID=cds.MS.gene50031.t1;Parent=MS.gene50031.t1
chr2.3 exon 3592507 3592624 3592507 ID=MS.gene50031.t1.exon6;Parent=MS.gene50031.t1
chr2.3 CDS 3592507 3592624 3592507 ID=cds.MS.gene50031.t1;Parent=MS.gene50031.t1
chr2.3 exon 3591336 3591483 3591336 ID=MS.gene50031.t1.exon7;Parent=MS.gene50031.t1
chr2.3 CDS 3591336 3591483 3591336 ID=cds.MS.gene50031.t1;Parent=MS.gene50031.t1
chr2.3 exon 3590603 3590851 3590603 ID=MS.gene50031.t1.exon8;Parent=MS.gene50031.t1
chr2.3 CDS 3590603 3590851 3590603 ID=cds.MS.gene50031.t1;Parent=MS.gene50031.t1
chr2.3 exon 3590373 3590501 3590373 ID=MS.gene50031.t1.exon9;Parent=MS.gene50031.t1
chr2.3 CDS 3590373 3590501 3590373 ID=cds.MS.gene50031.t1;Parent=MS.gene50031.t1
chr2.3 exon 3590200 3590300 3590200 ID=MS.gene50031.t1.exon10;Parent=MS.gene50031.t1
chr2.3 CDS 3590200 3590300 3590200 ID=cds.MS.gene50031.t1;Parent=MS.gene50031.t1
chr2.3 exon 3589956 3590030 3589956 ID=MS.gene50031.t1.exon11;Parent=MS.gene50031.t1
chr2.3 CDS 3589956 3590030 3589956 ID=cds.MS.gene50031.t1;Parent=MS.gene50031.t1
chr2.3 exon 3589434 3589493 3589434 ID=MS.gene50031.t1.exon12;Parent=MS.gene50031.t1
chr2.3 CDS 3589434 3589493 3589434 ID=cds.MS.gene50031.t1;Parent=MS.gene50031.t1
Gene Sequence

>MS.gene50031

ATGTCTTCTCCGGCAACACAATTCCTCTGCCCTTGGCCTTGCTTGGTCGCATCATCTACACCAAACTCTGTCTCAACTCGCAGTTTTGTGCAGGCCACCGTTGCATCACAATCAAAGGTTTCCAAGATGTTTGCTCAAACCTTGTTGTTTAACTCGTGCAATATTCCTGCATCGCAGCTACCTAAACCTTGTTTCAAAGGTGAGCAAATCTCAATCAAAGGATAACTAGCTAAGGAAAATTTGTTTCTGTTTTCATCTTGGAAATGTTATTTTTTTTCCTTAATTAGTTTATGGTAATCTTGGAAATTGATTTTATACTTGCATATGCGTCGAATTAGTTATTCCTTCGAATTTCCGACCTGTTTGATGTTGTATTTACAGTTGGAAATTGGCTGCAAAACGAGCAGAATTAGTCTTAGAATTTTTTTGTAGTCAACTTAGATATACATTTATATAATCAAAATAGTTTACAAATTAATTATTGGGTTGAAATTTTTTTAGTGTTGATAAAATCACGATCATTTTCAACAAACAAAATATAATAATCACTATCATCTAAGTTAGTTTCAACATAAATATTAGATTTAAATGCAATTTATCCCTTGAAACAAACGCACCCTTAAGGATTGGTCGAGAGGAAGGAAGAATCAAGTAAACATCTTTTCCTTCATTGCGAGGTCACTAGCTTGATATGGCAAAAGGTAATAAATTGGATGGAATTTTCTTTTATCACTCCTCCTAATTTGTTGATTCATTGGGATTGTTGGGGTATGGAGGGAAGGAATAAGAAAGCTCTTAAGGGATTATGGCTTATTTGGCAAGTAAGAAATAACAAAATTTTCAAGGATGAGGTTTGTGGAATTGAGGAAATTGTGGAGAAGATCAAAGTGCTCTCATGGAGATGGAGTCTAACTAGACTTAAGATTCCTACTTGTATGTTCTACGAATGGTGTTGGAACCCGAATGATTGCCTTCGCCGTTAGGAAGGGCCATCGGTTTTGTTATAGGTATGGAGGTGGATGCTGTCAAGCTGGTCTGCAGTGCAGACTGCTGTTTTTTGCTTCTGCTGTGTTTGTTTTTCTGGGCTCCTGGGTGCTGGTAGCATCTGTTTCCTGTAGTGCTGGCTGCTGTTTTTTACGCCCATTTGTTTTTTGGCAGTTTTTTTCTAGGTGTGTGCTGGGTATTTTGTAAAGCCCACTTAGTTTTTGGCAGCTGGTGTGTGTTTGCTGTTTTTTTTAGTTATGTGGGGGGGTGCACTGCCTTTGTAAGTCGTCCGCTCTATCGTTTTTCTTGTATTTTTAGCAAGTCTTGCGCTTCTTGTGCAGTCGTTGCATTAATAATATTGGCTGGTTCAAAAAAAAAAAAAAAACACTCTTATTAGGTTTTTGGTGAAGCCCCGTATTAACACTCTTTATCTAAAGCCTTGGAGGCTTGGTGCACATTGGGCTCGTTTGTTTGGGATTTAAGCATGTTTGTTTTGCTGTGTCTGCATATTGAGCTCCTTATTATTTTAACGGTGTTCATATTAAATTAAAAAAGATTTTAACAAAAAAATATTTTTAACCTTTAAATGGAGATATATGATTCCATTAAGATATTTAACCTTTAAATGGAGATATTTGATTCCTTTAAGATATGTTTCTAAAATAAAAATATATGATTTGGATTTAGCCTAATTAAATTATAAATAAGAGACTAGACATTGTTTATGGGAAGGAGAACAAGAGAAAGTAAACATTTGCGAAATCGGTATGTTATTTTTTATAATATTTTTTTTCTTCTTTCATTGAGGCGTTGATAATTTATCTTTGTGTATATGTATATGCTCCTTTCTCTCTCTTGTTGGTTTCCATAACTATTATGTTTTTCATAAGGGAGTAATATTTATATGCGTGGTGCCTCAATTTCGTAACAGTTTTCAAAGAAAGAGAGAGACTATTGACACTGCAGTGTAGATTCTCAATAGATGATGCGAAATATGATGATGATGGTCGCATAAATCGAACAGGTTTGTGTCTTGTGTGACCAAATACACCAAGTCAATTAAAAATTTTGTTTTTATTTTTATTTTCACATGTTATAATGTTGTTATTTTAACATTGATAAAAAATTGAATGAGCATGAAGGAACGTTGTTAATTGTGGGTGCACACATAGTGATGGTTGTAATAGGATCTGGAGTGTTGTCATTGGCATTGGCTATTGCTCATTCACGCTGGATTAAAGGTAATTAATTACCTACGAAGTTCAAATTTTAATGTATATGCCCAATAGGAAGTACTCTCATGTTCCATAAAATACCTTAATCGTCAAGTTTTTTTCCTCACAAACCTTTCCATAAGTACTTGAGAGTAGAGAAATTTTATGCATGTTGGTTTTTTGATGTTTGCATACTTCACTATAAATTATCACTCTTGCATCATTATATAGTAGCTACAATTGTGGTTGGTTTGCTAGTTGTTGCTCCATTAGGCATGGTATAAGCTTATCAAACAAGACCTAAAACCAATTAATCTTAGGATGATTGATCCTAATTCATTTGAGATTTTTGAAACAAGTCAAGTGGAATCATTATCAGTAATGCATTAGGAAATAGTGGATGCTATGTACTTTTTAGTTTACTTGTAGTATAAACCATCTACGCATTCCGCGAACAAATAAAGAAAATATATGTTGTGTGAATTGCTTATTTTATTTTTTATTTTTTTGAATGACAAATATGAAATTAGATAAGAAAGGGAAGAAACATACAAGGAGTACAAGTACAAGAAGTATCGAGGTCCAAGACCATCACAAAACAAAAATAAAACAACCAAAAGCAAAGACAAAAAGCAACATGGAAAAGACAACAAGCCAAGAACAGCCCAACTCCAGCACTTGTATGTATCTCTTATTATTTTCAGCTGCTTGCAACCTTGTTTGGATTTTTTCTTGTGATTTTCAATTACTGCCTTGATTGGCATCCAAAAACTATGCCCCATTTAGAAGATTGTTGCGTATATATGCATTTGATTTCACATGACATGAAAATATTTTGGTTTTTTTATTTCGCTAATAGATGTCGAGCCACGATATTCGGGATCAAGAATAGAAGGAGATACTATTACTTTGGATTTCGTAAAGAAAATGATGAATGATTTCAAGGAACAGAAGTGCTTGGATAGAGGGTATTGAAGTAATAAGATTTTTTTTTTTTGTGAAACCGTTTGTACTTTTATTGAAGTGTTGTTGAAATGTATTTGCATTTGTCCTGGTTCATTGTTTTAGGTATGCATCCAAGATTTTGTTGCAAACAAAAAAGGTTTTGAAAGCTTTGCCTTCTCTTGTTGACATAACTGTTCCTAATGGAAAACATGTTACTGTTTGTGGCGATGTGCATGGTCAGGTAATTGGTATATGACAATTGCTCCCTTGGTTTATTATTTGCGAAAACAATTGTTGCTAGTAACTTCAAGGTGGTTCTTTGTTACGTAGATATTTGGAGGATAGGGTTGTTCTCACACCATCATTGATTTTTTCTTATATAACTTTTATTGACTCAATCTTTTTCAAATTTGAATTTAAATTTTATTTACACTTTGATCACAGGAAACTTCAAAACTAAATACCTATTATCTTGCTATTCTATAACAAACTTTAAACTAACAATATAATAAAAGATTTAAATAGACGAGCGTGTGTCTCTCTTTCTGTTATGTTCATAAAGTAAATTTCTTTGACCATTTATGTGGAGGGATTGGGGAGCTATTTTTTTAGGGGAGGGAGCTATATTTTTTGTTGATGAGCTTGTTAGTTAATATTTTATATGGGGCTATCTAATATGGGTCAGATCTGTCGCTGTGAGCTTAGCTTACTTGGTAAGGGATAATGCATAATTTATGCAGGGGCCGGGGTTCGAACCCTGACACCCCACATATTCACCTTTAAGGTAAATTTCTCTAGCCGCTAGGCTACTTGACTAAAAAAAAAAAGGGTCAGATCTAAAGGTAGATCATTTTTTTGGTCAAGTATCCTAGTGTTGCTGGAACTCATACATTTTAAATGCGGTGAAGTCGAGTGTCCGGAATTCGAACTCCGGCCCGGCCCCTGCATATATTATACATTCTTCCTTTCAACTGAGCTAGACTCACGAAGACAAGGTGAATCCTTCTATTCCTGACAAATTTTAATAAAATATTATATGCATACGCTATTTTTTATCATTATAAAATTTATTTTTACTAAAAATGGTAAAGGTCCATATTTATACATTTTCTGAGAGGACATTTAGATTATTTTTGCCTCATGTGTACGGAGGATTTAACTTCCTTGTTGAATTTATTTCCATTTATTCTGATTATACATGTTTGGCTAACTTTATTTAACTACCAACCCTTTCAATTTTATTTTTCATGACTCCTGCATGCAGTTCTATGATCTTTTGAATATTTTTGAGCTCAATGGGCTTCCTTCAGAAGAAAATCCATATCTATTTAATGGTGACTTTGTAGATAGAGGATCATTTTCAGTGGAAGTCGCATTCACTTTGTTTGCATTTAAGTGCATGTCTCCATCTGGTAAACCCTAGCTCTTTCTTTATTAGCCTGTTAGGTTTTCTTTTTACCAAAGAATGTGTTGTGCAAGTGTGAGATGAGTTAGAAGTCCCGTATTAATTATTTGGAAAAAAGGACATTGAGCAACATATAAATGAGAGGATCTATAAACTATATGACTTACGGTTTTACGTAAAAATGTGCTGTAACTCACTTGTGTAATTGCTTTTGGGCAATGCGGATAATTCTCTAAATTAACTCCCCTCGTGACCAAACAACCTCTTCTTAGGTTTCATTATATTATTTTTGATATATTATGGATTATTTAATTTATCATCTCCTATCACCTGATTAGATGCTTAATTTATTAACTTATTTTTCAATTGAATTGTATAATCAATAATGCTTATTTTGTGTGGTTGGATTTTCGTAAATATTATACTCCTCTTTTCACTTCACTTAGTTAGCTGGGATGTTGTAACTTGTTTTGCTTCTATATTATTTTCAGCCATGTATATAGCTAGAGGAAATCATGAGAGCAAGAGCATGAACAAGATATTTGGTTTTGAGGGTGAGGTGCGCTCAAAGTTGAATGACAAATTTGTCAAAATGTTTGCGGAAGTATTCAACTGTTTACCTTTGGCTCATGTGATAAACAAGAAAGTTTTCGTCGTCCATGGAGGCCTTTTTAGTGTTGATGGGGTCAAACTCTCTCAAATCCGATCAATTAATCGGTTTTGTGAGCCTCCTGATGAAGGTAAGACACATAATTTTTTTTTTTTTCTTGCTATTCATCATAATCCTTAATACTTCTTTGTATTGTTGTTTTGTTTATGTATCTATGTTTGGTATGTGTAGGGTTGATGCATGACTTGCTATGGAGTGATCCACAATCTCTCCCTGGAAGAGGACCAAGCAAGCGTGGCGATGGGTGCTTTTGTTTTGGTGAGGATGTTACAAAAAGGTTCTTGAAGGATAATAATTTAGGTATGTTTTCCATTGGTTTGATACTTAATTTCTTATTTCACTGGTGACTTGATATGAATTATCATTTTACAGATTTAGTTGTGAGATCTCATAAATCAAAGCACAAGGGTTATGAGATTCAACATGACGGTAAACTGATAACTGTATTTTCTGCTCCAAATTACTGTGATCAGGTAACCATGTCTCTTTTGTTACAACCTTCTTTCTTGAATAATTTTACGGCATGTGCAGGAAAATTATTGAGTTGTGACCGTGCCACACGCTTATGATATTAATGTATGTAAGTAATCACTTATACTCCCATGAAGTATACATATCCTGATTTTCCATTGTTTTATGCAGAAGGGTAACAAAGGTGCCTTTATTCGATTTGAAGCACCTGATTTGAAACCTAACATTATTACATTTGAAGCAGTGGTTAGTATCTTTCATAATTTGAAGTCTGTCATCTTATATTATCTTTCATAATTTGAAATCTGTCATGTTATATTATGTATAGTCATTATAATAAAAAATGAAAAAGGAAAAGAATCAGTGTTGTTAAATATGGGCTATTGAAACACCATATGGCGGATTGTGGTGGCAGATTCTTTCACTAGTGTAGTGTCATATTGCCAATTTGTGAATGATGGTGGCGCCAAAGCGTTTTATGGTGGATATGGTGGCTTAGAATGTCGAATTCTTGGCTTCTGGCCCTCGTCTGCCACTGCAATTGATAACACTGAAAATAATTAACAAAAGTATATAACTCTTCATTTCATGTTACAATCATTCTGTTGCACTGTGATTAAATTATACATATCTTCATTCAATTTGTGAGGTTATGTCTGGTGTTGACATACTTTCTTCTTGGATTGGTTCACTTTATTGAATTTGCAGCCACACCCTGATGTTAAGCCAATGGCTTATGCAAACAACTTCAACCGATTGTTCTCATAA

Protein sequence

>MS.gene50031.t1

MSSPATQFLCPWPCLVASSTPNSVSTRSFVQATVASQSKVSKMFAQTLLFNSCNIPASQLPKPCFKVFKERERLLTLQCRFSIDDAKYDDDGRINRTGSGVLSLALAIAHSRWIKDKKGKKHTRSTSTRSIEVQDHHKTKIKQPKAKTKSNMEKTTSQEQPNSSTYVEPRYSGSRIEGDTITLDFVKKMMNDFKEQKCLDRGYASKILLQTKKVLKALPSLVDITVPNGKHVTVCGDVHGQFYDLLNIFELNGLPSEENPYLFNGDFVDRGSFSVEVAFTLFAFKCMSPSAMYIARGNHESKSMNKIFGFEGEVRSKLNDKFVKMFAEVFNCLPLAHVINKKVFVVHGGLFSVDGVKLSQIRSINRFCEPPDEGLMHDLLWSDPQSLPGRGPSKRGDGCFCFGEDVTKRFLKDNNLDLVVRSHKSKHKGYEIQHDGKLITVFSAPNYCDQKGNKGAFIRFEAPDLKPNIITFEAVPHPDVKPMAYANNFNRLFS