AlfalfaGEDB | MsG0180005265.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180005265.01

KEGG: -
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PFAM: PF12854 PF13041

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Trembl:

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Protein Kinases:

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Co-expression Network

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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CRISPR-GE

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!!!	ATATTAAAAGTATTAACATT+AGG	+	Chr1:89360667-89360686	None:intergenic	10.0%
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!!	ACTAGTAACATAATTATTCA+TGG	-	Chr1:89361722-89361741	MsG0180005265.01.T01:intron	20.0%
!!	ACTTATAATACTTTGATAGA+TGG	-	Chr1:89361095-89361114	MsG0180005265.01.T01:CDS	20.0%
!!	ATATACGTATATCAAGTTAA+TGG	-	Chr1:89362276-89362295	MsG0180005265.01.T01:intron	20.0%
!!	ATATTACATGTGAAAATATC+TGG	+	Chr1:89361818-89361837	None:intergenic	20.0%
!!	CTTATAATACTTTGATAGAT+GGG	-	Chr1:89361096-89361115	MsG0180005265.01.T01:CDS	20.0%
!!!	ACTTATAATATTTTGGTTCA+TGG	-	Chr1:89360885-89360904	MsG0180005265.01.T01:CDS	20.0%
!!!	CTTATAATATTTTGGTTCAT+GGG	-	Chr1:89360886-89360905	MsG0180005265.01.T01:CDS	20.0%
!	ACTTATAACACGATGATTAA+TGG	-	Chr1:89361303-89361322	MsG0180005265.01.T01:CDS	25.0%
!	ACTTATAACACTATAATCAG+GGG	-	Chr1:89361617-89361636	MsG0180005265.01.T01:intron	25.0%
!	AGAGGATATTATTATGTTGT+AGG	+	Chr1:89361936-89361955	None:intergenic	25.0%
!	AGTGTTATAAGTGATAATAG+TGG	+	Chr1:89361609-89361628	None:intergenic	25.0%
!	CACATAATATAATGGTTAAG+TGG	-	Chr1:89361200-89361219	MsG0180005265.01.T01:CDS	25.0%
!	CACTTATAACACTATAATCA+GGG	-	Chr1:89361616-89361635	MsG0180005265.01.T01:intron	25.0%
!	GTATTACAAGTAAGCAAATT+CGG	+	Chr1:89360554-89360573	None:intergenic	25.0%
!	GTATTATAAGTAACAACATC+CGG	+	Chr1:89361086-89361105	None:intergenic	25.0%
!	GTGTTATAAGTAAAACAATC+CGG	+	Chr1:89361294-89361313	None:intergenic	25.0%
!	TATGTTACTAGTAGATTCAT+CGG	+	Chr1:89361714-89361733	None:intergenic	25.0%
!	TCACTTATAACACTATAATC+AGG	-	Chr1:89361615-89361634	MsG0180005265.01.T01:intron	25.0%
!	TGTATGGACTTATAATACTA+TGG	-	Chr1:89360983-89361002	MsG0180005265.01.T01:CDS	25.0%
!!!	TATAAGATGATGGATGAAAT+GGG	-	Chr1:89361356-89361375	MsG0180005265.01.T01:CDS	25.0%
!!!	TTATAAGATGATGGATGAAA+TGG	-	Chr1:89361355-89361374	MsG0180005265.01.T01:CDS	25.0%
	AATTATTCATGGCTATTGCT+GGG	-	Chr1:89361733-89361752	MsG0180005265.01.T01:intron	30.0%
	ACATGTAATATTCTTCTTCG+AGG	-	Chr1:89361827-89361846	MsG0180005265.01.T01:CDS	30.0%
	ACGTATATCAAGTTAATGGA+TGG	-	Chr1:89362280-89362299	MsG0180005265.01.T01:intron	30.0%
	ACTTATAATACTATGGTGAG+GGG	-	Chr1:89360990-89361009	MsG0180005265.01.T01:CDS	30.0%
	ATGTTACTAGTAGATTCATC+GGG	+	Chr1:89361713-89361732	None:intergenic	30.0%
	ATTAATCAAATGGGGGAATA+TGG	-	Chr1:89360739-89360758	MsG0180005265.01.T01:CDS	30.0%
	ATTCCAGTTCCATAACAAAA+TGG	-	Chr1:89361775-89361794	MsG0180005265.01.T01:CDS	30.0%
	CAATAGCATTATAGGTATAC+CGG	+	Chr1:89362033-89362052	None:intergenic	30.0%
	CTTATAACACTATAATCAGG+GGG	-	Chr1:89361618-89361637	MsG0180005265.01.T01:intron	30.0%
	CTTCGGTTGATTAATCAAAT+GGG	-	Chr1:89360730-89360749	MsG0180005265.01.T01:CDS	30.0%
	GACTTATAATACTATGGTGA+GGG	-	Chr1:89360989-89361008	MsG0180005265.01.T01:CDS	30.0%
	GATTAATGGTTATTGTAAGC+TGG	-	Chr1:89361317-89361336	MsG0180005265.01.T01:CDS	30.0%
	GTATTATAAGTCCATACATC+CGG	+	Chr1:89360981-89361000	None:intergenic	30.0%
	GTCTAACACTATTTAACACA+TGG	-	Chr1:89361879-89361898	MsG0180005265.01.T01:CDS	30.0%
	TAATTATTCATGGCTATTGC+TGG	-	Chr1:89361732-89361751	MsG0180005265.01.T01:intron	30.0%
	TGCAATGAAATTGTTTCAAC+AGG	-	Chr1:89362225-89362244	MsG0180005265.01.T01:intron	30.0%
	TGGTGTGACACATAATATAA+TGG	-	Chr1:89361192-89361211	MsG0180005265.01.T01:CDS	30.0%
	TTAACACATGGATCTCTAAA+GGG	-	Chr1:89361891-89361910	MsG0180005265.01.T01:CDS	30.0%
	TTCGGTTGATTAATCAAATG+GGG	-	Chr1:89360731-89360750	MsG0180005265.01.T01:CDS	30.0%
	TTGACAAAACAAAGAATGAG+AGG	+	Chr1:89360606-89360625	None:intergenic	30.0%
	TTGCTTCAAATGAAGAATAG+TGG	-	Chr1:89360843-89360862	MsG0180005265.01.T01:CDS	30.0%
	TTTAACACATGGATCTCTAA+AGG	-	Chr1:89361890-89361909	MsG0180005265.01.T01:CDS	30.0%
!	AATAAGTAGTTTGTGTACTC+AGG	-	Chr1:89362189-89362208	MsG0180005265.01.T01:intron	30.0%
!	ATAAGTAGTTTGTGTACTCA+GGG	-	Chr1:89362190-89362209	MsG0180005265.01.T01:intron	30.0%
!	ATATCCTCTTTTTGCAAAGA+AGG	-	Chr1:89361947-89361966	MsG0180005265.01.T01:CDS	30.0%
!	TGTGAAAATATCTGGTTTCA+AGG	+	Chr1:89361810-89361829	None:intergenic	30.0%
!	TTTTCCTTCTTTGCAAAAAG+AGG	+	Chr1:89361954-89361973	None:intergenic	30.0%
!	TTTTGACCTTATGACTGAAA+TGG	-	Chr1:89361985-89362004	MsG0180005265.01.T01:CDS	30.0%
!!	ATTAAACGAGCTTTTAGAGA+AGG	-	Chr1:89361679-89361698	MsG0180005265.01.T01:intron	30.0%
!!	GTGTTAAGAGTAAAAGTATC+TGG	+	Chr1:89361398-89361417	None:intergenic	30.0%
!!	TTAAACGAGCTTTTAGAGAA+GGG	-	Chr1:89361680-89361699	MsG0180005265.01.T01:intron	30.0%
!!!	ATTCTTTGTTTTGTCAAGAG+AGG	-	Chr1:89360609-89360628	MsG0180005265.01.T01:CDS	30.0%
	AACGTATGGAACTCTAATCA+TGG	-	Chr1:89361511-89361530	MsG0180005265.01.T01:CDS	35.0%
	AAGTCAGTTGAGTCAAGTTA+GGG	-	Chr1:89360815-89360834	MsG0180005265.01.T01:CDS	35.0%
	ACCTATAATGCTATTGTGAC+TGG	-	Chr1:89362037-89362056	MsG0180005265.01.T01:CDS	35.0%
	ACGTATGGAACTCTAATCAT+GGG	-	Chr1:89361512-89361531	MsG0180005265.01.T01:CDS	35.0%
	ATTCTTGATGAGGTAACGTA+TGG	-	Chr1:89361497-89361516	MsG0180005265.01.T01:CDS	35.0%
	CCTATAATGCTATTGTGACT+GGG	-	Chr1:89362038-89362057	MsG0180005265.01.T01:CDS	35.0%
	CGTTGAAATTTGCAGAGAAA+GGG	-	Chr1:89362101-89362120	MsG0180005265.01.T01:intron	35.0%
	GCTTCGGTTGATTAATCAAA+TGG	-	Chr1:89360729-89360748	MsG0180005265.01.T01:CDS	35.0%
	GGACTTATAATACTATGGTG+AGG	-	Chr1:89360988-89361007	MsG0180005265.01.T01:CDS	35.0%
	GTTATTGTAAGCTGGAAAGA+TGG	-	Chr1:89361325-89361344	MsG0180005265.01.T01:CDS	35.0%
	TCGGTTGATTAATCAAATGG+GGG	-	Chr1:89360732-89360751	MsG0180005265.01.T01:CDS	35.0%
	TGAAATGGAGGGGAAAAATT+TGG	-	Chr1:89362000-89362019	MsG0180005265.01.T01:CDS	35.0%
	TGTTACTAGTAGATTCATCG+GGG	+	Chr1:89361712-89361731	None:intergenic	35.0%
	TTGCAAAGAAGGAAAACTTG+AGG	-	Chr1:89361958-89361977	MsG0180005265.01.T01:CDS	35.0%
	TTTCAAGATGCTGTTAAGCT+TGG	-	Chr1:89360634-89360653	MsG0180005265.01.T01:CDS	35.0%
!	AATGGTTAAGTGGTTCTGTA+AGG	-	Chr1:89361210-89361229	MsG0180005265.01.T01:CDS	35.0%
!	AGTGCTCTACCATTTTGTTA+TGG	+	Chr1:89361787-89361806	None:intergenic	35.0%
!	ATGGGTATTGTAAGCTGAAA+TGG	-	Chr1:89360904-89360923	MsG0180005265.01.T01:CDS	35.0%
!!	AGGTTATTGAGTTGATGACT+AGG	-	Chr1:89360943-89360962	MsG0180005265.01.T01:CDS	35.0%
!!	ATAGTGGTCTTGTTCCTAAT+AGG	-	Chr1:89360859-89360878	MsG0180005265.01.T01:CDS	35.0%
!!	CTACCATTTTGTTATGGAAC+TGG	+	Chr1:89361781-89361800	None:intergenic	35.0%
!!	TAAGTTGATGGAGGAAATGA+AGG	-	Chr1:89361150-89361169	MsG0180005265.01.T01:CDS	35.0%
!!	TAATGGATGGACTTTTGAAG+AGG	-	Chr1:89362293-89362312	MsG0180005265.01.T01:CDS	35.0%
	ACCTTATGACTGAAATGGAG+GGG	-	Chr1:89361990-89362009	MsG0180005265.01.T01:CDS	40.0%
	ATATCACTTGTACCAAGCTC+CGG	+	Chr1:89362154-89362173	None:intergenic	40.0%
	ATGGATGAAATGGGAAGGAA+AGG	-	Chr1:89361365-89361384	MsG0180005265.01.T01:CDS	40.0%
	CAAGCACATAATGTGCAGTA+AGG	+	Chr1:89361420-89361439	None:intergenic	40.0%
	CAAGCATGAACAAGCAGATA+GGG	-	Chr1:89361541-89361560	MsG0180005265.01.T01:intron	40.0%
	CAATGTAATGGTGAAGATGG+TGG	-	Chr1:89361254-89361273	MsG0180005265.01.T01:CDS	40.0%
	CCCAGTCACAATAGCATTAT+AGG	+	Chr1:89362041-89362060	None:intergenic	40.0%
	CGTATGGAACTCTAATCATG+GGG	-	Chr1:89361513-89361532	MsG0180005265.01.T01:CDS	40.0%
	CTCTTCTTAATGCTCTTGTC+AGG	-	Chr1:89360573-89360592	MsG0180005265.01.T01:CDS	40.0%
	CTTACTGCACATTATGTGCT+TGG	-	Chr1:89361418-89361437	MsG0180005265.01.T01:CDS	40.0%
	GAAAACTCAAGACATCTCTC+CGG	-	Chr1:89362132-89362151	MsG0180005265.01.T01:intron	40.0%
	GAAGTCAGTTGAGTCAAGTT+AGG	-	Chr1:89360814-89360833	MsG0180005265.01.T01:CDS	40.0%
	GACCTTATGACTGAAATGGA+GGG	-	Chr1:89361989-89362008	MsG0180005265.01.T01:CDS	40.0%
	GAGCAATGTAATGGTGAAGA+TGG	-	Chr1:89361251-89361270	MsG0180005265.01.T01:CDS	40.0%
	GCGAGGTTATATTCTTGATG+AGG	-	Chr1:89361487-89361506	MsG0180005265.01.T01:CDS	40.0%
	GCGTTGAAATTTGCAGAGAA+AGG	-	Chr1:89362100-89362119	MsG0180005265.01.T01:intron	40.0%
	GGTTAGGTTTAGAGATGAGA+TGG	-	Chr1:89361043-89361062	MsG0180005265.01.T01:CDS	40.0%
	TCAAGCATGAACAAGCAGAT+AGG	-	Chr1:89361540-89361559	MsG0180005265.01.T01:intron	40.0%
	TGACCTTATGACTGAAATGG+AGG	-	Chr1:89361988-89362007	MsG0180005265.01.T01:CDS	40.0%
	TGAGATGGAGAGATTGAAAC+TGG	-	Chr1:89361058-89361077	MsG0180005265.01.T01:CDS	40.0%
	TGATGAGGGTAAGATTGATG+AGG	-	Chr1:89361019-89361038	MsG0180005265.01.T01:CDS	40.0%
	TTGATGAGCGAGCAATGTAA+TGG	-	Chr1:89361242-89361261	MsG0180005265.01.T01:CDS	40.0%
	TTGTAGGTAACTGTGTCCAT+GGG	+	Chr1:89361920-89361939	None:intergenic	40.0%
!	GTTAAGTGGTTCTGTAAGGA+AGG	-	Chr1:89361214-89361233	MsG0180005265.01.T01:CDS	40.0%
!!	AGATGATGGATGAAATGGGA+AGG	-	Chr1:89361360-89361379	MsG0180005265.01.T01:CDS	40.0%
!!	ATAATGTCGAAGAAGCGCTT+CGG	-	Chr1:89360713-89360732	MsG0180005265.01.T01:CDS	40.0%
!!	ATTGAGTTGATGACTAGGAG+TGG	-	Chr1:89360948-89360967	MsG0180005265.01.T01:CDS	40.0%
!!	TAGATGGGTGTTTTGAGCAT+CGG	-	Chr1:89361111-89361130	MsG0180005265.01.T01:CDS	40.0%
	AACTGAGGAAGCAGAGAAAC+TGG	-	Chr1:89362078-89362097	MsG0180005265.01.T01:intron	45.0%
	ATGGTTGAAAGAAGCTGCTG+AGG	-	Chr1:89360923-89360942	MsG0180005265.01.T01:CDS	45.0%
	ATTCATGGCTATTGCTGGGA+GGG	-	Chr1:89361737-89361756	MsG0180005265.01.T01:intron	45.0%
	ATTTGCAGAGAAAGGGCAAC+AGG	-	Chr1:89362108-89362127	MsG0180005265.01.T01:intron	45.0%
	GCAAATTCGGTCGAAAACGA+AGG	+	Chr1:89360541-89360560	None:intergenic	45.0%
	GCATTATAGGTATACCGGTC+AGG	+	Chr1:89362028-89362047	None:intergenic	45.0%
	GGCAGAGGCTTATAAGATGA+TGG	-	Chr1:89361346-89361365	MsG0180005265.01.T01:CDS	45.0%
	GTAAGATTGATGAGGCGGTT+AGG	-	Chr1:89361027-89361046	MsG0180005265.01.T01:CDS	45.0%
	GTTGTAGGTAACTGTGTCCA+TGG	+	Chr1:89361921-89361940	None:intergenic	45.0%
	TACCAAAGCTGGTAGAACTG+AGG	-	Chr1:89362063-89362082	MsG0180005265.01.T01:intron	45.0%
	TATTCATGGCTATTGCTGGG+AGG	-	Chr1:89361736-89361755	MsG0180005265.01.T01:intron	45.0%
	TCCCCTCCATTTCAGTCATA+AGG	+	Chr1:89361994-89362013	None:intergenic	45.0%
	TGAGGGTAAGATTGATGAGG+CGG	-	Chr1:89361022-89361041	MsG0180005265.01.T01:CDS	45.0%
	TTCCTCAGTTCTACCAGCTT+TGG	+	Chr1:89362068-89362087	None:intergenic	45.0%
	TTTCAACAGGCAGAGCAGAA+AGG	-	Chr1:89362238-89362257	MsG0180005265.01.T01:intron	45.0%
!	GAGGCGGAAAAGCATATCAA+AGG	-	Chr1:89362312-89362331	MsG0180005265.01.T01:CDS	45.0%
!	GGAAAAATTTGGAGCCTGAC+CGG	-	Chr1:89362011-89362030	MsG0180005265.01.T01:CDS	45.0%
!	GGAGAGATTGAAACTGGTTC+CGG	-	Chr1:89361064-89361083	MsG0180005265.01.T01:CDS	45.0%
!	GTGAGGGGTTTTTGTGATGA+GGG	-	Chr1:89361005-89361024	MsG0180005265.01.T01:CDS	45.0%
!	GTGTACTCAGGGAAAGTACA+AGG	-	Chr1:89362201-89362220	MsG0180005265.01.T01:intron	45.0%
!!	AGATAGGGCGTTGAAGCTTT+GGG	-	Chr1:89361556-89361575	MsG0180005265.01.T01:intron	45.0%
!!	AGATGGGTGTTTTGAGCATC+GGG	-	Chr1:89361112-89361131	MsG0180005265.01.T01:CDS	45.0%
!!	ATGGTGAAGATGGTGGAAAG+TGG	-	Chr1:89361261-89361280	MsG0180005265.01.T01:CDS	45.0%
!!	CGAGCTTTTAGAGAAGGGTT+TGG	-	Chr1:89361685-89361704	MsG0180005265.01.T01:intron	45.0%
!!	TGATGCGGCGTTTAAGTTGA+TGG	-	Chr1:89361138-89361157	MsG0180005265.01.T01:CDS	45.0%
!!	TGGATGGACTTTTGAAGAGG+CGG	-	Chr1:89362296-89362315	MsG0180005265.01.T01:CDS	45.0%
!!	TGGTGAAGATGGTGGAAAGT+GGG	-	Chr1:89361262-89361281	MsG0180005265.01.T01:CDS	45.0%
	AATGAAGGCGAGGGGAGTTA+AGG	-	Chr1:89361165-89361184	MsG0180005265.01.T01:CDS	50.0%
	AGAGAGGGAATGCTGGAGAA+AGG	-	Chr1:89361857-89361876	MsG0180005265.01.T01:CDS	50.0%
	ATGGAGGAAATGAAGGCGAG+GGG	-	Chr1:89361157-89361176	MsG0180005265.01.T01:CDS	50.0%
	CTTCGAGGTCTTTGCAGAGA+GGG	-	Chr1:89361842-89361861	MsG0180005265.01.T01:CDS	50.0%
	GACTAGGAGTGGTATGTTGC+CGG	-	Chr1:89360959-89360978	MsG0180005265.01.T01:CDS	50.0%
	GATGGAGGAAATGAAGGCGA+GGG	-	Chr1:89361156-89361175	MsG0180005265.01.T01:CDS	50.0%
	GTAAGCTGGAAAGATGGCAG+AGG	-	Chr1:89361331-89361350	MsG0180005265.01.T01:CDS	50.0%
	GTGGTATGTTGCCGGATGTA+TGG	-	Chr1:89360967-89360986	MsG0180005265.01.T01:CDS	50.0%
	TCTTCGAGGTCTTTGCAGAG+AGG	-	Chr1:89361841-89361860	MsG0180005265.01.T01:CDS	50.0%
	TCTTTGCAGAGAGGGAATGC+TGG	-	Chr1:89361850-89361869	MsG0180005265.01.T01:CDS	50.0%
	TGATGGAGGAAATGAAGGCG+AGG	-	Chr1:89361155-89361174	MsG0180005265.01.T01:CDS	50.0%
	TGCTTACGCCTTGACTGTGA+AGG	-	Chr1:89361457-89361476	MsG0180005265.01.T01:CDS	50.0%
	TGGGAGGAGATGAAGGAGAA+GGG	-	Chr1:89361575-89361594	MsG0180005265.01.T01:intron	50.0%
	TTGGGAGGAGATGAAGGAGA+AGG	-	Chr1:89361574-89361593	MsG0180005265.01.T01:intron	50.0%
!	CTTCCTAGCCTTCACAGTCA+AGG	+	Chr1:89361468-89361487	None:intergenic	50.0%
!	GATCTCTAAAGGGAAGCCCA+TGG	-	Chr1:89361901-89361920	MsG0180005265.01.T01:CDS	50.0%
!	GGTGAGGGGTTTTTGTGATG+AGG	-	Chr1:89361004-89361023	MsG0180005265.01.T01:CDS	50.0%
!!	CAGATAGGGCGTTGAAGCTT+TGG	-	Chr1:89361555-89361574	MsG0180005265.01.T01:intron	50.0%
!!	GAAGCTTTGGGAGGAGATGA+AGG	-	Chr1:89361568-89361587	MsG0180005265.01.T01:intron	50.0%
!!	GATGGGTGTTTTGAGCATCG+GGG	-	Chr1:89361113-89361132	MsG0180005265.01.T01:CDS	50.0%
!!	GGTGGAAAGTGGGTTTTCTC+CGG	-	Chr1:89361272-89361291	MsG0180005265.01.T01:CDS	50.0%
!!	TGCGGCGTTTAAGTTGATGG+AGG	-	Chr1:89361141-89361160	MsG0180005265.01.T01:CDS	50.0%
	ACGCCTTGACTGTGAAGGCT+AGG	-	Chr1:89361462-89361481	MsG0180005265.01.T01:CDS	55.0%
	ACTGTGAAGGCTAGGAAGCG+AGG	-	Chr1:89361470-89361489	MsG0180005265.01.T01:CDS	55.0%
	ATCAGGGGGTTGTGTCTGTC+TGG	-	Chr1:89361632-89361651	MsG0180005265.01.T01:intron	55.0%
	CAAGACATCTCTCCGGAGCT+TGG	-	Chr1:89362139-89362158	MsG0180005265.01.T01:intron	55.0%
	GCGAGGGGAGTTAAGGAGAA+TGG	-	Chr1:89361172-89361191	MsG0180005265.01.T01:CDS	55.0%
	GTGACTGGGCTTACCAAAGC+TGG	-	Chr1:89362052-89362071	MsG0180005265.01.T01:intron	55.0%
	TCAGGGGGTTGTGTCTGTCT+GGG	-	Chr1:89361633-89361652	MsG0180005265.01.T01:intron	55.0%
!!	TAGGGCGTTGAAGCTTTGGG+AGG	-	Chr1:89361559-89361578	MsG0180005265.01.T01:intron	55.0%
!!	TTGAGCATCGGGGTGTGATG+CGG	-	Chr1:89361123-89361142	MsG0180005265.01.T01:CDS	55.0%
	TGGCTATTGCTGGGAGGGAG+CGG	-	Chr1:89361742-89361761	MsG0180005265.01.T01:CDS	60.0%

Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
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Gene Sequence

>MsG0180005265.01.T01

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Protein sequence

>MsG0180005265.01.T01

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