AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680033671.01

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MsG0680033671.01.T01 AT1G62680 32.424 330 223 0 213 542 62 391 6.40e-55 194
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MsG0680033671.01.T01 AT1G06580 34.527 391 255 1 125 514 2 392 9.46e-72 235
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MsG0680033671.01.T01 AT4G19890 28.132 423 303 1 97 518 183 605 1.95e-53 193
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MsG0680033671.01.T01 AT4G19890 24.752 303 225 1 76 378 373 672 1.56e-25 111
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MsG0680033671.01.T01 AT3G04760 28.935 432 306 1 115 546 108 538 2.25e-62 216
MsG0680033671.01.T01 AT3G04760 28.193 415 295 1 62 473 156 570 4.95e-61 212
MsG0680033671.01.T01 AT3G04760 27.665 394 282 2 154 547 79 469 1.69e-51 186
MsG0680033671.01.T01 AT3G04760 31.126 302 207 1 247 548 100 400 1.33e-43 164
MsG0680033671.01.T01 AT3G04760 25.153 326 241 1 45 367 244 569 1.04e-32 132
MsG0680033671.01.T01 AT1G31840 27.664 535 330 5 63 547 251 778 8.12e-63 221
MsG0680033671.01.T01 AT1G31840 28.803 493 338 3 45 528 302 790 3.71e-61 216
MsG0680033671.01.T01 AT1G31840 30.152 461 315 2 93 547 249 708 4.48e-58 207
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MsG0680033671.01.T01 AT2G31400 26.420 352 256 3 198 547 230 580 4.35e-36 144
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MsG0680033671.01.T01 AT1G77360 23.641 368 277 3 63 428 133 498 1.55e-27 116
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MsG0680033671.01.T01 AT3G59040 21.802 344 225 4 46 383 191 496 9.39e-20 93.2
MsG0680033671.01.T01 AT3G59040 19.118 272 220 0 25 296 243 514 1.77e-13 73.6
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MsG0680033671.01.T01 AT3G17370 31.500 200 124 2 340 539 13 199 7.65e-23 97.4
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MsG0680033671.01.T01 AT3G17370 28.505 214 138 4 95 308 13 211 1.75e-20 90.5
MsG0680033671.01.T01 AT3G17370 26.866 201 132 5 130 329 13 199 1.31e-14 73.6
MsG0680033671.01.T01 AT3G17370 26.590 173 114 2 375 547 13 172 1.25e-12 67.8
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MsG0680033671.01.T01 AT1G68930 22.222 360 262 6 190 548 61 403 2.65e-14 76.6
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MsG0680033671.01.T01 AT3G23330 18.408 402 313 6 112 511 188 576 2.87e-18 89.0
MsG0680033671.01.T01 AT3G23330 20.144 417 312 7 96 507 70 470 7.16e-18 87.8
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MsG0680033671.01.T01 AT2G22410 22.444 401 292 5 121 518 108 492 2.67e-21 98.6
MsG0680033671.01.T01 AT2G22410 22.026 454 295 11 95 507 117 552 5.30e-18 88.2
MsG0680033671.01.T01 AT2G22410 23.881 335 231 9 195 518 70 391 6.66e-15 78.2
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MsG0680033671.01.T01 AT5G66520 22.286 350 251 5 93 437 77 410 6.82e-18 87.4
MsG0680033671.01.T01 AT5G66520 23.313 326 228 5 200 515 79 392 5.62e-15 78.6
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MsG0680033671.01.T01 AT2G40240 21.256 207 163 0 273 479 109 315 1.88e-14 75.5
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MsG0680033671.01.T01 AT4G18840 23.320 253 183 5 44 294 221 464 3.85e-15 78.6
MsG0680033671.01.T01 AT4G18840 22.222 243 168 7 287 525 52 277 2.34e-12 70.1
MsG0680033671.01.T01 AT4G18840 22.727 440 295 12 120 544 60 469 2.02e-16 82.8
MsG0680033671.01.T01 AT4G18840 23.320 253 183 5 44 294 221 464 3.85e-15 78.6
MsG0680033671.01.T01 AT4G18840 22.222 243 168 7 287 525 52 277 2.34e-12 70.1
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MsG0680033671.01.T01 AT4G18840 22.222 243 168 7 287 525 52 277 2.34e-12 70.1
MsG0680033671.01.T01 AT3G13770 23.824 319 218 9 94 402 116 419 2.12e-16 82.8
MsG0680033671.01.T01 AT3G13770 21.513 423 271 15 128 507 15 419 4.32e-16 82.0
MsG0680033671.01.T01 AT3G03580 21.564 422 315 5 68 489 11 416 2.15e-16 83.2
MsG0680033671.01.T01 AT3G03580 22.683 410 291 9 139 543 12 400 1.27e-14 77.8
MsG0680033671.01.T01 AT3G03580 20.978 491 291 12 94 543 271 705 1.20e-13 74.3
MsG0680033671.01.T01 AT4G13650 18.398 462 320 7 122 545 314 756 2.28e-16 83.2
MsG0680033671.01.T01 AT4G13650 24.699 332 220 10 155 476 73 384 1.94e-15 80.5
MsG0680033671.01.T01 AT4G13650 22.535 355 240 8 37 378 463 795 1.70e-12 70.9
MsG0680033671.01.T01 AT2G03380 21.652 351 249 7 128 472 104 434 2.30e-16 82.8
MsG0680033671.01.T01 AT2G03380 19.048 378 288 8 95 468 307 670 1.42e-13 73.9
MsG0680033671.01.T01 AT2G03380 21.714 350 253 8 130 473 307 641 6.20e-13 72.0
MsG0680033671.01.T01 AT4G30700 23.499 383 265 12 70 445 258 619 2.38e-16 83.2
MsG0680033671.01.T01 AT4G30700 20.104 383 286 6 128 507 182 547 1.63e-12 70.9
MsG0680033671.01.T01 AT3G05240 22.840 486 295 16 81 542 52 481 2.94e-16 82.4
MsG0680033671.01.T01 AT3G05240 23.607 305 213 10 44 340 225 517 2.39e-15 79.3
MsG0680033671.01.T01 AT3G05240 21.226 424 304 11 46 455 89 496 7.62e-13 71.6
MsG0680033671.01.T01 AT5G04780 20.513 351 264 6 89 437 89 426 3.10e-16 82.4
MsG0680033671.01.T01 AT5G04780 20.580 379 245 9 144 517 74 401 4.05e-11 66.2
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MsG0680033671.01.T01 AT5G13230 22.590 332 239 7 93 420 310 627 6.25e-15 78.6
MsG0680033671.01.T01 AT1G15510 20.137 437 309 5 68 474 235 661 3.76e-16 82.4
MsG0680033671.01.T01 AT1G15510 21.795 390 255 8 138 525 66 407 8.68e-16 81.3
MsG0680033671.01.T01 AT1G15510 19.450 545 351 9 68 542 133 659 2.84e-15 79.7
MsG0680033671.01.T01 AT1G15510 21.158 449 316 14 95 531 331 753 6.00e-15 78.6
MsG0680033671.01.T01 AT4G39952 23.077 234 172 3 91 324 493 718 4.25e-16 82.0
MsG0680033671.01.T01 AT4G39952 19.913 462 323 6 81 542 281 695 1.15e-11 68.2
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MsG0680033671.01.T01 AT3G46610 22.744 277 201 3 187 453 367 640 6.31e-16 81.6
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MsG0680033671.01.T01 AT3G22690 22.275 422 288 10 115 515 321 723 8.33e-15 78.2
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MsG0680033671.01.T01 AT3G22690 23.868 243 176 3 235 476 98 332 1.60e-11 67.8
MsG0680033671.01.T01 AT3G60040 34.746 118 77 0 184 301 488 605 6.21e-16 81.3
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MsG0680033671.01.T01 AT3G60040 34.545 110 71 1 298 406 716 825 2.57e-11 67.0
MsG0680033671.01.T01 AT3G60040 34.746 118 77 0 184 301 707 824 7.15e-16 81.6
MsG0680033671.01.T01 AT3G60040 35.043 117 76 0 430 546 708 824 1.07e-14 77.8
MsG0680033671.01.T01 AT3G60040 34.545 110 71 1 298 406 715 824 2.59e-11 67.0
MsG0680033671.01.T01 AT2G40720 21.716 373 277 6 68 437 412 772 7.59e-16 81.6
MsG0680033671.01.T01 AT2G40720 21.143 350 259 8 94 439 131 467 7.28e-13 72.0
MsG0680033671.01.T01 AT2G40720 21.445 429 292 12 62 472 64 465 4.23e-12 69.7
MsG0680033671.01.T01 AT3G14330 20.573 384 292 5 92 474 163 534 7.94e-16 81.3
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MsG0680033671.01.T01 AT5G48910 23.373 338 234 7 220 544 78 403 4.88e-14 75.5
MsG0680033671.01.T01 AT2G20540 25.632 277 184 8 43 314 129 388 1.31e-15 80.1
MsG0680033671.01.T01 AT2G20540 22.154 325 237 7 154 475 66 377 4.84e-11 65.9
MsG0680033671.01.T01 AT3G02010 21.557 501 331 15 60 518 75 555 1.39e-15 80.5
MsG0680033671.01.T01 AT3G02010 19.127 481 334 7 100 544 188 649 3.40e-12 69.7
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MsG0680033671.01.T01 AT1G09410 21.992 241 161 7 60 297 75 291 1.32e-12 70.9
MsG0680033671.01.T01 AT1G09410 20.856 374 272 11 94 464 201 553 8.80e-11 65.1

Find 89 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 108 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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ATCAATGGCTTGTGTAAAAT+TGG 0.167300 6:-70795421 MsG0680033671.01.T01:CDS
CAATTGGATCAAGTTACTTA+TGG 0.198342 6:-70795451 MsG0680033671.01.T01:CDS
AGCTATAATGTCATGATTAA+TGG 0.206747 6:-70794911 MsG0680033671.01.T01:CDS
ACTTTCAATTCTCTAATCTA+TGG 0.237445 6:-70795226 MsG0680033671.01.T01:CDS
ATGTTAAAAGTATAAATATC+TGG 0.252758 6:+70795133 None:intergenic
GTAGAGCTTCCTTCACCTTA+TGG 0.253867 6:+70795506 None:intergenic
TGTTACGTACAATTCATTAA+TGG 0.258084 6:-70795020 MsG0680033671.01.T01:CDS
ACATTATAGCTTTGAATATC+AGG 0.262263 6:+70794923 None:intergenic
AAGGCTACAATTTAACAGTT+TGG 0.326804 6:-70794514 MsG0680033671.01.T01:CDS
AATTGGATCAAGTTACTTAT+GGG 0.333907 6:-70795450 MsG0680033671.01.T01:CDS
GAGACGAATTGAAAGCAAAT+TGG 0.350101 6:-70795371 MsG0680033671.01.T01:CDS
GCTAAACATTATTTCTCAAA+TGG 0.352658 6:-70794954 MsG0680033671.01.T01:CDS
CACGACCATGTGCTTGCACT+TGG 0.369532 6:-70795478 MsG0680033671.01.T01:CDS
ACTTACAATTCTCTCATTGA+TGG 0.378731 6:-70794806 MsG0680033671.01.T01:CDS
GATCAATGGTCTTTGTTTAG+AGG 0.379325 6:-70794477 MsG0680033671.01.T01:CDS
AATAATGTTTAGCACATGTT+TGG 0.381545 6:+70794964 None:intergenic
CAAAGGAATTATTCCTGATC+AGG 0.382087 6:-70794831 MsG0680033671.01.T01:CDS
ACAACATCAACAACAGTATT+GGG 0.396612 6:+70795826 None:intergenic
GGGCGATTGAAAGAAGCTTT+TGG 0.398176 6:-70795190 MsG0680033671.01.T01:CDS
AATCTTATTAAATTGAATGA+TGG 0.405933 6:+70795750 None:intergenic
ATTTCACAAGTTACAGCATC+AGG 0.406200 6:+70794398 None:intergenic
AGGTTTGTGTTTAAACCATA+AGG 0.409102 6:-70795521 MsG0680033671.01.T01:CDS
ATGTATAGCACAATCATTGA+TGG 0.411767 6:-70795331 MsG0680033671.01.T01:CDS
AACAACATCAACAACAGTAT+TGG 0.417304 6:+70795825 None:intergenic
AACCTGAAGCATGATGAAAA+TGG 0.419522 6:+70795931 None:intergenic
GAATTGTAAGTTACCTGATC+AGG 0.421044 6:+70794818 None:intergenic
ATTGGTTGATGTTCTATGTA+AGG 0.424769 6:-70795110 MsG0680033671.01.T01:CDS
GTTGATCAGATGCATGATAA+TGG 0.425038 6:-70794743 MsG0680033671.01.T01:CDS
ATCAATGGTCTTTGTTTAGA+GGG 0.433637 6:-70794476 MsG0680033671.01.T01:CDS
GCTTGCACTTGGATTTCAAT+TGG 0.437750 6:-70795467 MsG0680033671.01.T01:CDS
CTTCGTACACTTCATTAACT+AGG 0.439567 6:+70794987 None:intergenic
TCAATGGCTTGTGTAAAATT+GGG 0.447283 6:-70795420 MsG0680033671.01.T01:CDS
CTAAACATTATTTCTCAAAT+GGG 0.447615 6:-70794953 MsG0680033671.01.T01:CDS
GGGAAATAACAGTGGGGTAA+TGG 0.455888 6:+70795704 None:intergenic
CATTTCATTAAAGAGATTCA+AGG 0.457403 6:+70794859 None:intergenic
CAAGGAGAATCCCCTGTGCT+TGG 0.457824 6:-70794772 MsG0680033671.01.T01:CDS
GAAGGGAATAATAAGAAAAG+TGG 0.460216 6:+70795888 None:intergenic
ATTCGCCAAAATTCTCAAGA+TGG 0.460545 6:-70795584 MsG0680033671.01.T01:CDS
TTTACACAAGCCATTGATCA+AGG 0.471807 6:+70795426 None:intergenic
TGTTAAAAGTATAAATATCT+GGG 0.473191 6:+70795134 None:intergenic
AAGGAGAATCCCCTGTGCTT+GGG 0.476290 6:-70794771 MsG0680033671.01.T01:CDS
ACTTATGGGACCTTGATCAA+TGG 0.481530 6:-70795436 MsG0680033671.01.T01:CDS
AGTAGTCAAGGTAATGGTAT+CGG 0.487119 6:+70795552 None:intergenic
CATTTCAGAATATAACTCAT+AGG 0.490638 6:+70795279 None:intergenic
ATGCAAACAAGGAAGGCTTA+AGG 0.493158 6:-70794570 MsG0680033671.01.T01:CDS
GTTGATGTTCTATGTAAGGA+AGG 0.498210 6:-70795106 MsG0680033671.01.T01:CDS
CAATTGCTTTGTCAACATGA+TGG 0.500715 6:+70794666 None:intergenic
TTCGCCAAAATTCTCAAGAT+GGG 0.507803 6:-70795583 MsG0680033671.01.T01:CDS
ATCAACAAACTCCCAAGCAC+AGG 0.508285 6:+70794760 None:intergenic
GTAGTCAAGGTAATGGTATC+GGG 0.512071 6:+70795553 None:intergenic
GCGAATATAGAAAAGGCAAA+AGG 0.513075 6:+70795601 None:intergenic
ACATATACTATTATGATCAA+TGG 0.514301 6:-70794491 MsG0680033671.01.T01:CDS
GATTAGAGTAGTCAAGGTAA+TGG 0.515937 6:+70795546 None:intergenic
ACCTTGACTACTCTAATCAA+AGG 0.526645 6:-70795541 MsG0680033671.01.T01:CDS
TTTAATGAAATGTGTTGCAA+AGG 0.531764 6:-70794848 MsG0680033671.01.T01:CDS
TTAGAAAGGGAAATAACAGT+GGG 0.532390 6:+70795697 None:intergenic
TTGAAAATGATAAGAACGAA+AGG 0.536756 6:-70794358 MsG0680033671.01.T01:CDS
AAGGGAATAATAAGAAAAGT+GGG 0.540802 6:+70795889 None:intergenic
TTATTAAATTGAATGATGGA+TGG 0.545126 6:+70795754 None:intergenic
ACGTACAATTCATTAATGGA+TGG 0.546305 6:-70795016 MsG0680033671.01.T01:CDS
ACCTTTGATTAGAGTAGTCA+AGG 0.546930 6:+70795540 None:intergenic
CATTATTTCTCAAATGGGAG+CGG 0.546987 6:-70794948 MsG0680033671.01.T01:CDS
GAATTGAAAGTGACAGCAGT+AGG 0.549387 6:+70795238 None:intergenic
TGAAAATGATAAGAACGAAA+GGG 0.555864 6:-70794357 MsG0680033671.01.T01:CDS
TTTAGAAAGGGAAATAACAG+TGG 0.561645 6:+70795696 None:intergenic
TTGTAAGTGAATATGTCGGC+TGG 0.565855 6:+70794716 None:intergenic
ACATATCTAGTTGAATGCCT+TGG 0.576546 6:+70794621 None:intergenic
ACATACAATATACTTATCGA+TGG 0.577283 6:-70794596 MsG0680033671.01.T01:CDS
TTGATGGTTTGTGCAAAGCA+AGG 0.582723 6:-70794790 MsG0680033671.01.T01:CDS
AATTGAATGATGGATGGAGT+AGG 0.582857 6:+70795760 None:intergenic
GTGTTTAAACCATAAGGTGA+AGG 0.585501 6:-70795515 MsG0680033671.01.T01:CDS
GTCAAGAAAATTAAAGACCA+AGG 0.588775 6:-70794638 MsG0680033671.01.T01:CDS
ATGGACTATGCAAACAAGGA+AGG 0.597610 6:-70794577 MsG0680033671.01.T01:CDS
TCAACAAACTCCCAAGCACA+GGG 0.607234 6:+70794761 None:intergenic
GAAATCCAAGTGCAAGCACA+TGG 0.610248 6:+70795473 None:intergenic
CGAATTGTAAGTGAATATGT+CGG 0.612481 6:+70794712 None:intergenic
TCAATGGTCTTTGTTTAGAG+GGG 0.618181 6:-70794475 MsG0680033671.01.T01:CDS
CAATGGCTTGTGTAAAATTG+GGG 0.623224 6:-70795419 MsG0680033671.01.T01:CDS
ATGGTTCAACTTAACAAGTG+AGG 0.629175 6:+70795723 None:intergenic
GGGGTTGCTTGATGAAGCTG+AGG 0.633171 6:-70794456 MsG0680033671.01.T01:CDS
ATCGATGGACTATGCAAACA+AGG 0.634978 6:-70794581 MsG0680033671.01.T01:CDS
CTGCGTGAAATGATTGCTAG+AGG 0.647097 6:-70794323 MsG0680033671.01.T01:CDS
CTCTAGCAATCATTTCACGC+AGG 0.657088 6:+70794324 None:intergenic
ATAGCTGTGATGATGAAAGA+AGG 0.665340 6:-70795058 MsG0680033671.01.T01:CDS
TGTGATGATGAAAGAAGGCA+TGG 0.672580 6:-70795053 MsG0680033671.01.T01:CDS
TGCTATACATTACTGCATCG+AGG 0.677335 6:+70795344 None:intergenic
TAGAAAGGGAAATAACAGTG+GGG 0.688693 6:+70795698 None:intergenic
CAACAAACTCCCAAGCACAG+GGG 0.763932 6:+70794762 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TATTTATACTTTTAACATAT+TGG - Chr6:70795122-70795141 MsG0680033671.01.T01:CDS 10.0%
!! AATCTTATTAAATTGAATGA+TGG + Chr6:70794503-70794522 None:intergenic 15.0%
!!! AATTTCCAATTTTTTAGAAA+GGG + Chr6:70794569-70794588 None:intergenic 15.0%
!!! ATGTTAAAAGTATAAATATC+TGG + Chr6:70795120-70795139 None:intergenic 15.0%
!!! TAATTTCCAATTTTTTAGAA+AGG + Chr6:70794570-70794589 None:intergenic 15.0%
!!! TGTTAAAAGTATAAATATCT+GGG + Chr6:70795119-70795138 None:intergenic 15.0%
!!! TTTCTAAAAAATTGGAAATT+AGG - Chr6:70794569-70794588 MsG0680033671.01.T01:CDS 15.0%
!! ACATATACTATTATGATCAA+TGG - Chr6:70795759-70795778 MsG0680033671.01.T01:CDS 20.0%
!!! CTAAACATTATTTCTCAAAT+GGG - Chr6:70795297-70795316 MsG0680033671.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATTTCCCTTTCTAAAAAAT+TGG - Chr6:70794561-70794580 MsG0680033671.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTATTAAATTGAATGATGGA+TGG + Chr6:70794499-70794518 None:intergenic 20.0%
! AAGGGAATAATAAGAAAAGT+GGG + Chr6:70794364-70794383 None:intergenic 25.0%
! AATAATGTTTAGCACATGTT+TGG + Chr6:70795289-70795308 None:intergenic 25.0%
! AATTGGATCAAGTTACTTAT+GGG - Chr6:70794800-70794819 MsG0680033671.01.T01:CDS 25.0%
! ACATACAATATACTTATCGA+TGG - Chr6:70795654-70795673 MsG0680033671.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTTCAATTCTCTAATCTA+TGG - Chr6:70795024-70795043 MsG0680033671.01.T01:CDS 25.0%
! AGCTATAATGTCATGATTAA+TGG - Chr6:70795339-70795358 MsG0680033671.01.T01:CDS 25.0%
! CATTTCAGAATATAACTCAT+AGG + Chr6:70794974-70794993 None:intergenic 25.0%
! CATTTCATTAAAGAGATTCA+AGG + Chr6:70795394-70795413 None:intergenic 25.0%
! TGAAAATGATAAGAACGAAA+GGG - Chr6:70795893-70795912 MsG0680033671.01.T01:CDS 25.0%
! TGTTACGTACAATTCATTAA+TGG - Chr6:70795230-70795249 MsG0680033671.01.T01:CDS 25.0%
! TTGAAAATGATAAGAACGAA+AGG - Chr6:70795892-70795911 MsG0680033671.01.T01:CDS 25.0%
! TTTAATGAAATGTGTTGCAA+AGG - Chr6:70795402-70795421 MsG0680033671.01.T01:CDS 25.0%
!! ATCTATGGATTTTGTATTGT+TGG - Chr6:70795039-70795058 MsG0680033671.01.T01:CDS 25.0%
!! GCTAAACATTATTTCTCAAA+TGG - Chr6:70795296-70795315 MsG0680033671.01.T01:CDS 25.0%
!! TCTATGGATTTTGTATTGTT+GGG - Chr6:70795040-70795059 MsG0680033671.01.T01:CDS 25.0%
!!! AATTTTGGCGAATATAGAAA+AGG + Chr6:70794659-70794678 None:intergenic 25.0%
!!! ACATTATAGCTTTGAATATC+AGG + Chr6:70795330-70795349 None:intergenic 25.0%
!!! TGTTTTTCAATACCATTTGA+TGG + Chr6:70795092-70795111 None:intergenic 25.0%
!!! TTTCAGGATCTTTTGATTAA+AGG - Chr6:70795717-70795736 MsG0680033671.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTGTGTTGTTGTTAAGAA+GGG + Chr6:70794382-70794401 None:intergenic 25.0%
AACAACATCAACAACAGTAT+TGG + Chr6:70794428-70794447 None:intergenic 30.0%
AAGGCTACAATTTAACAGTT+TGG - Chr6:70795736-70795755 MsG0680033671.01.T01:CDS 30.0%
ACAACATCAACAACAGTATT+GGG + Chr6:70794427-70794446 None:intergenic 30.0%
ACGTACAATTCATTAATGGA+TGG - Chr6:70795234-70795253 MsG0680033671.01.T01:CDS 30.0%
ACTTACAATTCTCTCATTGA+TGG - Chr6:70795444-70795463 MsG0680033671.01.T01:CDS 30.0%
AGGTTTGTGTTTAAACCATA+AGG - Chr6:70794729-70794748 MsG0680033671.01.T01:CDS 30.0%
ATGTATAGCACAATCATTGA+TGG - Chr6:70794919-70794938 MsG0680033671.01.T01:CDS 30.0%
CAATTGGATCAAGTTACTTA+TGG - Chr6:70794799-70794818 MsG0680033671.01.T01:CDS 30.0%
CGAATTGTAAGTGAATATGT+CGG + Chr6:70795541-70795560 None:intergenic 30.0%
CTATCAAAAATGGAAGACAA+TGG - Chr6:70795822-70795841 MsG0680033671.01.T01:CDS 30.0%
GAAGGGAATAATAAGAAAAG+TGG + Chr6:70794365-70794384 None:intergenic 30.0%
GTCAAGAAAATTAAAGACCA+AGG - Chr6:70795612-70795631 MsG0680033671.01.T01:CDS 30.0%
TTAGAAAGGGAAATAACAGT+GGG + Chr6:70794556-70794575 None:intergenic 30.0%
TTTAGAAAGGGAAATAACAG+TGG + Chr6:70794557-70794576 None:intergenic 30.0%
! ATAACCCATCTTGAGAATTT+TGG + Chr6:70794674-70794693 None:intergenic 30.0%
! ATCAATGGCTTGTGTAAAAT+TGG - Chr6:70794829-70794848 MsG0680033671.01.T01:CDS 30.0%
! ATCAATGGTCTTTGTTTAGA+GGG - Chr6:70795774-70795793 MsG0680033671.01.T01:CDS 30.0%
! ATTGGTTGATGTTCTATGTA+AGG - Chr6:70795140-70795159 MsG0680033671.01.T01:CDS 30.0%
! TCAATGGCTTGTGTAAAATT+GGG - Chr6:70794830-70794849 MsG0680033671.01.T01:CDS 30.0%
!! GTTTTGTGTTGTTGTTAAGA+AGG + Chr6:70794383-70794402 None:intergenic 30.0%
!!! TTTTGGTTTGTTCCATCAAA+TGG - Chr6:70795077-70795096 MsG0680033671.01.T01:CDS 30.0%
AACCTGAAGCATGATGAAAA+TGG + Chr6:70794322-70794341 None:intergenic 35.0%
ACATATCTAGTTGAATGCCT+TGG + Chr6:70795632-70795651 None:intergenic 35.0%
ACCTTGACTACTCTAATCAA+AGG - Chr6:70794709-70794728 MsG0680033671.01.T01:CDS 35.0%
ACCTTTGATTAGAGTAGTCA+AGG + Chr6:70794713-70794732 None:intergenic 35.0%
ATGGTTCAACTTAACAAGTG+AGG + Chr6:70794530-70794549 None:intergenic 35.0%
ATTCGCCAAAATTCTCAAGA+TGG - Chr6:70794666-70794685 MsG0680033671.01.T01:CDS 35.0%
ATTTCACAAGTTACAGCATC+AGG + Chr6:70795855-70795874 None:intergenic 35.0%
CAAAGGAATTATTCCTGATC+AGG - Chr6:70795419-70795438 MsG0680033671.01.T01:CDS 35.0%
CAATTGCTTTGTCAACATGA+TGG + Chr6:70795587-70795606 None:intergenic 35.0%
CTTCGTACACTTCATTAACT+AGG + Chr6:70795266-70795285 None:intergenic 35.0%
GAATTGTAAGTTACCTGATC+AGG + Chr6:70795435-70795454 None:intergenic 35.0%
GAGACGAATTGAAAGCAAAT+TGG - Chr6:70794879-70794898 MsG0680033671.01.T01:CDS 35.0%
GATTAGAGTAGTCAAGGTAA+TGG + Chr6:70794707-70794726 None:intergenic 35.0%
GCGAATATAGAAAAGGCAAA+AGG + Chr6:70794652-70794671 None:intergenic 35.0%
GTGTTTAAACCATAAGGTGA+AGG - Chr6:70794735-70794754 MsG0680033671.01.T01:CDS 35.0%
GTTGATCAGATGCATGATAA+TGG - Chr6:70795507-70795526 MsG0680033671.01.T01:CDS 35.0%
GTTGATGTTCTATGTAAGGA+AGG - Chr6:70795144-70795163 MsG0680033671.01.T01:CDS 35.0%
TAGAAAGGGAAATAACAGTG+GGG + Chr6:70794555-70794574 None:intergenic 35.0%
TTCGCCAAAATTCTCAAGAT+GGG - Chr6:70794667-70794686 MsG0680033671.01.T01:CDS 35.0%
TTTACACAAGCCATTGATCA+AGG + Chr6:70794827-70794846 None:intergenic 35.0%
! AGTAGTCAAGGTAATGGTAT+CGG + Chr6:70794701-70794720 None:intergenic 35.0%
! ATAGCTGTGATGATGAAAGA+AGG - Chr6:70795192-70795211 MsG0680033671.01.T01:CDS 35.0%
! CAATGGCTTGTGTAAAATTG+GGG - Chr6:70794831-70794850 MsG0680033671.01.T01:CDS 35.0%
! CATTATTTCTCAAATGGGAG+CGG - Chr6:70795302-70795321 MsG0680033671.01.T01:CDS 35.0%
! GATCAATGGTCTTTGTTTAG+AGG - Chr6:70795773-70795792 MsG0680033671.01.T01:CDS 35.0%
! TCAATGGTCTTTGTTTAGAG+GGG - Chr6:70795775-70795794 MsG0680033671.01.T01:CDS 35.0%
!! AATTGAATGATGGATGGAGT+AGG + Chr6:70794493-70794512 None:intergenic 35.0%
!! GTCTTCCATTTTTGATAGCA+GGG + Chr6:70795820-70795839 None:intergenic 35.0%
!! TGTCTTCCATTTTTGATAGC+AGG + Chr6:70795821-70795840 None:intergenic 35.0%
ACTTATGGGACCTTGATCAA+TGG - Chr6:70794814-70794833 MsG0680033671.01.T01:CDS 40.0%
ATGCAAACAAGGAAGGCTTA+AGG - Chr6:70795680-70795699 MsG0680033671.01.T01:CDS 40.0%
GAATTGAAAGTGACAGCAGT+AGG + Chr6:70795015-70795034 None:intergenic 40.0%
GCTTGCACTTGGATTTCAAT+TGG - Chr6:70794783-70794802 MsG0680033671.01.T01:CDS 40.0%
TGCTATACATTACTGCATCG+AGG + Chr6:70794909-70794928 None:intergenic 40.0%
TTGTAAGTGAATATGTCGGC+TGG + Chr6:70795537-70795556 None:intergenic 40.0%
! ATGGACTATGCAAACAAGGA+AGG - Chr6:70795673-70795692 MsG0680033671.01.T01:CDS 40.0%
! GGATGCACAAGTGATTTTTC+AGG - Chr6:70795701-70795720 MsG0680033671.01.T01:CDS 40.0%
! GTAGTCAAGGTAATGGTATC+GGG + Chr6:70794700-70794719 None:intergenic 40.0%
! TGTGATGATGAAAGAAGGCA+TGG - Chr6:70795197-70795216 MsG0680033671.01.T01:CDS 40.0%
! TTGATGGTTTGTGCAAAGCA+AGG - Chr6:70795460-70795479 MsG0680033671.01.T01:CDS 40.0%
!! ATCGATGGACTATGCAAACA+AGG - Chr6:70795669-70795688 MsG0680033671.01.T01:CDS 40.0%
!!! TGCCATTTTCATCATGCTTC+AGG - Chr6:70794317-70794336 MsG0680033671.01.T01:CDS 40.0%
ATCAACAAACTCCCAAGCAC+AGG + Chr6:70795493-70795512 None:intergenic 45.0%
CTCTAGCAATCATTTCACGC+AGG + Chr6:70795929-70795948 None:intergenic 45.0%
CTGCGTGAAATGATTGCTAG+AGG - Chr6:70795927-70795946 MsG0680033671.01.T01:CDS 45.0%
GAAATCCAAGTGCAAGCACA+TGG + Chr6:70794780-70794799 None:intergenic 45.0%
GGGAAATAACAGTGGGGTAA+TGG + Chr6:70794549-70794568 None:intergenic 45.0%
GTAGAGCTTCCTTCACCTTA+TGG + Chr6:70794747-70794766 None:intergenic 45.0%
TCAACAAACTCCCAAGCACA+GGG + Chr6:70795492-70795511 None:intergenic 45.0%
TGAGGCCCTGCTATCAAAAA+TGG - Chr6:70795812-70795831 MsG0680033671.01.T01:CDS 45.0%
! GGGCGATTGAAAGAAGCTTT+TGG - Chr6:70795060-70795079 MsG0680033671.01.T01:CDS 45.0%
AAGGAGAATCCCCTGTGCTT+GGG - Chr6:70795479-70795498 MsG0680033671.01.T01:CDS 50.0%
CAACAAACTCCCAAGCACAG+GGG + Chr6:70795491-70795510 None:intergenic 50.0%
CAAGGAGAATCCCCTGTGCT+TGG - Chr6:70795478-70795497 MsG0680033671.01.T01:CDS 55.0%
CACGACCATGTGCTTGCACT+TGG - Chr6:70794772-70794791 MsG0680033671.01.T01:CDS 55.0%
GGGGTTGCTTGATGAAGCTG+AGG - Chr6:70795794-70795813 MsG0680033671.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 70794313 70795959 70794313 ID=MsG0680033671.01;Name=MsG0680033671.01
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Chr6 exon 70794313 70795959 70794313 ID=MsG0680033671.01.T01:exon:10716;Parent=MsG0680033671.01.T01
Chr6 CDS 70794313 70795959 70794313 ID=MsG0680033671.01.T01:cds;Parent=MsG0680033671.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680033671.01.T01

ATGTTGCCATTTTCATCATGCTTCAGGTTTCGCTTTTCTTCTTCTAAACCCACTTTTCTTATTATTCCCTTCTTAACAACAACACAAAACTATTATCACTCTAGATTTGTTCCCAATACTGTTGTTGATGTTGTTGATAATGCTATTTCTTCATTCAATCATATGCTTAGTATGAATCCTACTCCATCCATCATTCAATTTAATAAGATTTTAACCTCACTTGTTAAGTTGAACCATTACCCCACTGTTATTTCCCTTTCTAAAAAATTGGAAATTAGGCAAGATATTGTTACTTTGAACATCTTGATTAATTGCTACTGTCATGTTCGTCAAATGCCTTTTGCCTTTTCTATATTCGCCAAAATTCTCAAGATGGGTTATCAGCCCGATACCATTACCTTGACTACTCTAATCAAAGGTTTGTGTTTAAACCATAAGGTGAAGGAAGCTCTACACTTTCACGACCATGTGCTTGCACTTGGATTTCAATTGGATCAAGTTACTTATGGGACCTTGATCAATGGCTTGTGTAAAATTGGGGAAACAAAAGCTGCATTACAGTTGTTGAGACGAATTGAAAGCAAATTGGTCAACCTCGATGCAGTAATGTATAGCACAATCATTGATGGTTTTTGTAAAGATAAGCTTGTAAATGATGCCTATGAGTTATATTCTGAAATGATTACAAAGAGAATTTCTCCTACTGCTGTCACTTTCAATTCTCTAATCTATGGATTTTGTATTGTTGGGCGATTGAAAGAAGCTTTTGGTTTGTTCCATCAAATGGTATTGAAAAACATCAACCCAGATATTTATACTTTTAACATATTGGTTGATGTTCTATGTAAGGAAGGAAAGATCAAAGAAGCTAAAAATGTGATAGCTGTGATGATGAAAGAAGGCATGGAACATGATGTTGTTACGTACAATTCATTAATGGATGGTTATTGCCTAGTTAATGAAGTGTACGAAGCCAAACATGTGCTAAACATTATTTCTCAAATGGGAGCGGCTCCTGATATTCAAAGCTATAATGTCATGATTAATGGATTGTGTAAGATTAAAATGATCGATGAAGCCTTGAATCTCTTTAATGAAATGTGTTGCAAAGGAATTATTCCTGATCAGGTAACTTACAATTCTCTCATTGATGGTTTGTGCAAAGCAAGGAGAATCCCCTGTGCTTGGGAGTTTGTTGATCAGATGCATGATAATGGTATACCAGCCGACATATTCACTTACAATTCGTTAATAGATGCTTTATGCAAAAACCATCATGTTGACAAAGCAATTGTATTAGTCAAGAAAATTAAAGACCAAGGCATTCAACTAGATATGTACACATACAATATACTTATCGATGGACTATGCAAACAAGGAAGGCTTAAGGATGCACAAGTGATTTTTCAGGATCTTTTGATTAAAGGCTACAATTTAACAGTTTGGACATATACTATTATGATCAATGGTCTTTGTTTAGAGGGGTTGCTTGATGAAGCTGAGGCCCTGCTATCAAAAATGGAAGACAATGGATGCGTTCCTGATGCTGTAACTTGTGAAATAATTATTCGTGCTCTCTTTGAAAATGATAAGAACGAAAGGGCAGAGAAACTCCTGCGTGAAATGATTGCTAGAGGTCTACTATAA
Protein sequence

>MsG0680033671.01.T01

MLPFSSCFRFRFSSSKPTFLIIPFLTTTQNYYHSRFVPNTVVDVVDNAISSFNHMLSMNPTPSIIQFNKILTSLVKLNHYPTVISLSKKLEIRQDIVTLNILINCYCHVRQMPFAFSIFAKILKMGYQPDTITLTTLIKGLCLNHKVKEALHFHDHVLALGFQLDQVTYGTLINGLCKIGETKAALQLLRRIESKLVNLDAVMYSTIIDGFCKDKLVNDAYELYSEMITKRISPTAVTFNSLIYGFCIVGRLKEAFGLFHQMVLKNINPDIYTFNILVDVLCKEGKIKEAKNVIAVMMKEGMEHDVVTYNSLMDGYCLVNEVYEAKHVLNIISQMGAAPDIQSYNVMINGLCKIKMIDEALNLFNEMCCKGIIPDQVTYNSLIDGLCKARRIPCAWEFVDQMHDNGIPADIFTYNSLIDALCKNHHVDKAIVLVKKIKDQGIQLDMYTYNILIDGLCKQGRLKDAQVIFQDLLIKGYNLTVWTYTIMINGLCLEGLLDEAEALLSKMEDNGCVPDAVTCEIIIRALFENDKNERAEKLLREMIARGLL*