AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035058.01

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MsG0680035058.01.T01 AT1G63150 29.091 330 233 1 265 593 81 410 2.03e-45 170
MsG0680035058.01.T01 AT1G63150 33.197 244 162 1 353 595 64 307 5.25e-42 160
MsG0680035058.01.T01 AT1G63150 30.159 189 132 0 408 596 50 238 3.78e-24 107
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MsG0680035058.01.T01 AT1G64583 34.203 345 223 2 235 578 122 463 8.86e-59 204
MsG0680035058.01.T01 AT1G64583 34.630 257 167 1 340 595 84 340 4.77e-48 175
MsG0680035058.01.T01 AT1G64583 29.775 356 245 2 242 596 25 376 5.44e-48 175
MsG0680035058.01.T01 AT1G64583 25.479 365 210 7 1 363 153 457 4.72e-27 115
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MsG0680035058.01.T01 AT1G74580 26.106 226 163 2 374 596 42 266 3.61e-20 95.5
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MsG0680035058.01.T01 AT1G74580 28.209 592 384 7 15 596 92 652 2.38e-71 244
MsG0680035058.01.T01 AT1G74580 23.970 534 374 7 2 512 184 708 7.71e-42 161
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MsG0680035058.01.T01 AT1G74580 21.270 677 403 12 37 591 79 747 2.06e-37 148
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MsG0680035058.01.T01 AT5G12100 27.925 265 190 1 333 596 140 404 8.35e-35 140
MsG0680035058.01.T01 AT5G12100 27.586 290 209 1 308 596 150 439 1.07e-32 134
MsG0680035058.01.T01 AT5G12100 30.000 280 189 4 261 538 523 797 6.01e-30 125
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MsG0680035058.01.T01 AT2G17140 22.500 280 182 1 258 502 515 794 1.53e-17 87.0
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MsG0680035058.01.T01 AT2G17140 28.235 340 239 2 262 596 142 481 7.64e-44 168
MsG0680035058.01.T01 AT2G17140 29.341 334 230 4 268 595 112 445 3.12e-36 145
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MsG0680035058.01.T01 AT1G13630 27.570 214 139 4 388 596 12 214 6.25e-18 88.2
MsG0680035058.01.T01 AT1G13630 22.572 381 264 7 2 372 273 632 2.83e-15 79.7
MsG0680035058.01.T01 AT1G13630 28.378 148 68 3 2 111 132 279 1.06e-11 68.2
MsG0680035058.01.T01 AT1G13630 30.088 113 77 1 2 112 97 209 3.33e-11 66.6
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MsG0680035058.01.T01 AT1G09820 33.226 310 190 6 297 596 183 485 8.28e-51 185
MsG0680035058.01.T01 AT1G09820 29.379 354 243 5 248 596 169 520 5.33e-50 183
MsG0680035058.01.T01 AT1G09820 28.701 331 230 4 262 587 253 582 3.11e-46 172
MsG0680035058.01.T01 AT1G09820 32.281 285 192 1 242 525 306 590 2.06e-44 167
MsG0680035058.01.T01 AT1G09820 28.896 308 216 3 251 556 280 586 2.90e-40 155
MsG0680035058.01.T01 AT1G09820 23.833 407 277 12 21 420 210 590 1.79e-28 120
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MsG0680035058.01.T01 AT2G06000 28.615 325 228 4 225 547 200 522 3.22e-37 145
MsG0680035058.01.T01 AT2G06000 26.222 225 162 3 374 596 105 327 2.95e-20 95.1
MsG0680035058.01.T01 AT2G06000 24.650 357 212 10 3 324 175 509 2.05e-19 92.4
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MsG0680035058.01.T01 AT1G20300 24.806 258 192 2 340 596 154 410 9.24e-29 120
MsG0680035058.01.T01 AT1G20300 20.682 440 284 7 2 437 154 532 7.24e-24 106
MsG0680035058.01.T01 AT1G20300 28.070 114 80 1 1 112 257 370 4.67e-11 65.9
MsG0680035058.01.T01 AT1G20300 28.333 120 85 1 477 596 152 270 8.38e-11 65.1
MsG0680035058.01.T01 AT2G35130 25.779 353 250 4 248 593 171 518 2.65e-37 146
MsG0680035058.01.T01 AT2G35130 24.706 340 254 2 258 595 146 485 3.35e-32 131
MsG0680035058.01.T01 AT2G35130 24.906 265 197 2 334 596 152 416 8.31e-26 112
MsG0680035058.01.T01 AT2G35130 23.383 201 118 2 431 595 145 345 2.83e-15 79.7
MsG0680035058.01.T01 AT2G35130 19.203 276 222 1 264 538 293 568 1.19e-14 77.4
MsG0680035058.01.T01 AT1G52640 26.444 329 232 4 251 573 157 481 2.68e-37 145
MsG0680035058.01.T01 AT1G52640 24.916 297 222 1 298 593 134 430 1.44e-30 126
MsG0680035058.01.T01 AT1G52640 28.777 139 99 0 458 596 155 293 1.45e-15 80.1
MsG0680035058.01.T01 AT1G52640 30.909 110 74 1 2 109 246 355 8.24e-14 74.7
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MsG0680035058.01.T01 AT5G40400 32.727 110 72 1 2 109 310 419 7.54e-13 72.0
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MsG0680035058.01.T01 AT5G25630 22.432 370 255 7 253 591 101 469 4.62e-29 122
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MsG0680035058.01.T01 AT5G18390 23.158 285 181 4 251 533 201 449 1.47e-15 79.7
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MsG0680035058.01.T01 AT4G01570 27.016 248 174 2 353 593 264 511 1.72e-27 118
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MsG0680035058.01.T01 AT4G01570 20.823 389 276 8 235 595 295 679 2.24e-12 70.5
MsG0680035058.01.T01 AT4G01570 33.333 120 78 1 2 119 292 411 4.48e-11 66.6
MsG0680035058.01.T01 AT1G77405 25.602 332 193 7 283 595 107 403 3.08e-27 115
MsG0680035058.01.T01 AT1G77405 27.203 261 172 5 308 553 171 428 3.10e-19 91.3
MsG0680035058.01.T01 AT1G77405 32.520 123 68 3 2 109 203 325 3.32e-13 72.4
MsG0680035058.01.T01 AT1G77405 23.762 202 139 3 264 450 197 398 1.00e-12 70.9
MsG0680035058.01.T01 AT1G80550 26.481 287 198 5 266 545 150 430 3.52e-27 115
MsG0680035058.01.T01 AT1G80550 25.410 244 166 4 357 588 97 336 6.21e-21 96.3
MsG0680035058.01.T01 AT1G80550 23.148 324 239 6 278 595 56 375 2.09e-20 94.7
MsG0680035058.01.T01 AT1G80550 22.727 220 164 3 257 474 214 429 4.03e-15 78.6
MsG0680035058.01.T01 AT1G80550 33.945 109 70 1 2 108 227 335 1.89e-11 67.0
MsG0680035058.01.T01 AT3G22670 24.922 321 221 6 273 588 153 458 4.04e-27 116
MsG0680035058.01.T01 AT3G22670 25.597 293 212 5 308 595 209 500 3.64e-26 113
MsG0680035058.01.T01 AT3G22670 29.130 230 150 6 374 595 168 392 1.43e-25 111
MsG0680035058.01.T01 AT3G22670 26.974 304 217 3 234 533 241 543 1.04e-22 102
MsG0680035058.01.T01 AT3G22670 23.907 343 245 7 246 578 217 553 2.13e-20 95.5
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MsG0680035058.01.T01 AT3G13160 22.388 201 155 1 264 463 174 374 4.61e-14 74.7
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MsG0680035058.01.T01 AT3G04750 23.973 292 200 10 304 583 302 583 5.57e-15 79.0
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MsG0680035058.01.T01 AT4G02750 20.958 334 233 8 252 585 111 413 1.68e-19 93.2
MsG0680035058.01.T01 AT2G40720 25.000 296 212 4 303 595 440 728 4.21e-20 95.5
MsG0680035058.01.T01 AT5G15280 23.757 362 241 7 266 595 255 613 5.39e-20 95.1
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MsG0680035058.01.T01 AT3G29230 23.423 333 226 10 264 583 213 529 2.70e-18 89.0
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MsG0680035058.01.T01 AT5G39680 21.160 293 221 4 305 595 205 489 1.22e-12 71.2
MsG0680035058.01.T01 AT5G61370 24.627 268 188 6 340 596 141 405 7.46e-17 84.0
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MsG0680035058.01.T01 AT5G02830 20.718 362 253 8 242 595 308 643 2.55e-15 80.1
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MsG0680035058.01.T01 AT5G02830 21.053 418 261 14 21 424 322 684 2.47e-11 67.4
MsG0680035058.01.T01 AT4G37170 18.862 334 254 7 266 595 150 470 2.88e-15 79.7
MsG0680035058.01.T01 AT4G37170 21.311 305 225 6 264 565 215 507 4.38e-14 75.9
MsG0680035058.01.T01 AT4G15720 22.581 310 229 5 264 568 92 395 3.22e-15 79.3
MsG0680035058.01.T01 AT4G15720 22.568 257 185 6 343 595 70 316 1.86e-11 67.4
MsG0680035058.01.T01 AT4G35130 22.993 274 198 5 257 528 186 448 3.33e-15 79.7
MsG0680035058.01.T01 AT4G35130 19.826 575 364 15 2 567 133 619 9.20e-15 78.2
MsG0680035058.01.T01 AT5G40405 23.077 351 240 10 256 595 60 391 3.40e-15 79.3
MsG0680035058.01.T01 AT5G40405 23.077 351 240 10 256 595 60 391 3.40e-15 79.3
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 22.449 294 215 7 304 588 178 467 3.71e-15 79.0
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 23.607 305 221 5 261 561 243 539 2.54e-14 76.3
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 20.962 291 224 3 299 584 104 393 3.90e-14 75.9
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 20.576 243 186 3 248 488 300 537 4.58e-12 69.3
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 21.549 297 220 7 302 593 249 537 8.51e-12 68.6
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 22.449 294 215 7 304 588 178 467 3.71e-15 79.0
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 23.607 305 221 5 261 561 243 539 2.54e-14 76.3
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 20.962 291 224 3 299 584 104 393 3.90e-14 75.9
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 20.576 243 186 3 248 488 300 537 4.58e-12 69.3
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 21.549 297 220 7 302 593 249 537 8.51e-12 68.6
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 22.449 294 215 7 304 588 178 467 3.71e-15 79.0
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 23.607 305 221 5 261 561 243 539 2.54e-14 76.3
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 20.962 291 224 3 299 584 104 393 3.90e-14 75.9
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 20.576 243 186 3 248 488 300 537 4.58e-12 69.3
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 21.549 297 220 7 302 593 249 537 8.51e-12 68.6
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 22.449 294 215 7 304 588 178 467 3.71e-15 79.0
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 23.607 305 221 5 261 561 243 539 2.54e-14 76.3
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 20.962 291 224 3 299 584 104 393 3.90e-14 75.9
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 20.576 243 186 3 248 488 300 537 4.58e-12 69.3
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 21.549 297 220 7 302 593 249 537 8.51e-12 68.6
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 22.449 294 215 7 304 588 178 467 3.71e-15 79.0
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 23.607 305 221 5 261 561 243 539 2.54e-14 76.3
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 20.962 291 224 3 299 584 104 393 3.90e-14 75.9
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 20.576 243 186 3 248 488 300 537 4.58e-12 69.3
MsG0680035058.01.T01 AT3G29290 21.549 297 220 7 302 593 249 537 8.51e-12 68.6
MsG0680035058.01.T01 AT5G44230 22.823 333 238 9 246 572 128 447 4.01e-15 79.3
MsG0680035058.01.T01 AT5G44230 22.188 320 224 9 283 595 62 363 1.97e-12 70.5
MsG0680035058.01.T01 AT5G44230 24.199 281 193 9 266 536 245 515 7.57e-12 68.9
MsG0680035058.01.T01 AT2G42920 21.365 337 244 9 243 572 99 421 5.66e-15 78.6
MsG0680035058.01.T01 AT2G42920 21.365 337 244 9 243 572 99 421 5.66e-15 78.6
MsG0680035058.01.T01 AT1G22830 25.305 328 216 12 251 565 269 580 6.12e-15 78.6
MsG0680035058.01.T01 AT1G22830 25.305 328 216 12 251 565 269 580 6.12e-15 78.6
MsG0680035058.01.T01 AT2G13600 22.397 317 220 6 253 555 91 395 6.58e-15 78.6
MsG0680035058.01.T01 AT2G13600 19.355 372 243 9 254 588 42 393 4.63e-13 72.8
MsG0680035058.01.T01 AT2G13600 20.170 352 229 9 251 595 237 543 5.91e-13 72.4
MsG0680035058.01.T01 AT2G27610 23.301 309 223 5 250 556 111 407 7.29e-15 78.6
MsG0680035058.01.T01 AT2G27610 21.138 369 259 10 231 588 57 404 9.07e-13 72.0
MsG0680035058.01.T01 AT2G27610 21.622 296 207 9 288 577 316 592 1.28e-12 71.6
MsG0680035058.01.T01 AT2G27610 18.838 637 417 22 4 596 133 713 2.19e-12 70.9
MsG0680035058.01.T01 AT3G16610 25.926 243 163 5 333 572 345 573 7.75e-15 78.2
MsG0680035058.01.T01 AT3G16610 22.945 292 209 6 268 555 309 588 9.25e-14 74.7
MsG0680035058.01.T01 AT3G49170 20.833 336 244 11 251 580 356 675 8.13e-15 78.6
MsG0680035058.01.T01 AT3G49170 20.375 373 249 9 261 595 263 625 1.95e-13 73.9
MsG0680035058.01.T01 AT3G49170 19.888 357 254 11 251 595 218 554 6.70e-13 72.4
MsG0680035058.01.T01 AT3G49170 22.111 398 258 13 238 595 103 488 1.56e-12 71.2
MsG0680035058.01.T01 AT3G49740 19.492 354 260 10 252 596 339 676 1.32e-14 77.8
MsG0680035058.01.T01 AT1G77010 21.302 338 240 6 263 595 183 499 1.42e-14 77.4
MsG0680035058.01.T01 AT1G77010 20.996 281 206 5 260 537 346 613 4.18e-12 69.7
MsG0680035058.01.T01 AT3G56030 23.558 208 155 2 374 577 127 334 1.54e-14 75.9
MsG0680035058.01.T01 AT1G74600 22.192 365 228 11 264 588 112 460 1.73e-14 77.4
MsG0680035058.01.T01 AT3G49710 22.018 327 227 9 237 555 48 354 1.90e-14 77.0
MsG0680035058.01.T01 AT2G02750 18.609 532 364 14 5 502 37 533 2.08e-14 77.0
MsG0680035058.01.T01 AT2G02750 19.325 326 254 5 249 572 215 533 6.07e-14 75.5
MsG0680035058.01.T01 AT2G02750 22.189 338 241 9 263 595 27 347 1.90e-11 67.4
MsG0680035058.01.T01 AT5G43790 23.418 316 219 9 290 595 29 331 2.55e-14 75.9
MsG0680035058.01.T01 AT5G43790 21.519 316 225 9 250 555 92 394 1.43e-12 70.5
MsG0680035058.01.T01 AT1G10330 20.915 306 224 5 238 537 57 350 2.57e-14 76.3
MsG0680035058.01.T01 AT3G02010 26.423 246 156 7 326 560 33 264 2.66e-14 76.6
MsG0680035058.01.T01 AT5G50390 21.083 351 228 7 258 571 149 487 3.10e-14 76.6
MsG0680035058.01.T01 AT5G13270 20.213 376 251 8 257 595 139 502 3.29e-14 76.3
MsG0680035058.01.T01 AT5G13270 21.752 331 235 7 268 590 251 565 3.44e-13 73.2
MsG0680035058.01.T01 AT5G13270 19.521 292 223 5 265 555 116 396 9.32e-13 71.6
MsG0680035058.01.T01 AT3G05340 20.652 368 268 4 245 595 148 508 3.36e-14 76.3
MsG0680035058.01.T01 AT5G36300 25.481 208 139 4 298 490 111 317 3.61e-14 74.3
MsG0680035058.01.T01 AT5G36300 20.984 305 220 7 272 559 16 316 8.21e-14 73.6
MsG0680035058.01.T01 AT5G36300 22.344 273 192 5 339 595 13 281 8.28e-14 73.6
MsG0680035058.01.T01 AT5G36300 23.134 268 175 7 220 456 51 318 8.52e-12 67.4
MsG0680035058.01.T01 AT4G16470 22.569 288 212 5 309 595 83 360 3.62e-14 75.9
MsG0680035058.01.T01 AT4G18520 21.212 330 249 3 266 595 217 535 3.75e-14 75.9
MsG0680035058.01.T01 AT4G18520 21.767 317 236 4 250 566 302 606 7.65e-14 75.1
MsG0680035058.01.T01 AT4G18520 21.370 365 231 9 264 588 246 594 1.75e-11 67.4
MsG0680035058.01.T01 AT4G08210 27.014 211 139 5 333 541 36 233 3.96e-14 76.3
MsG0680035058.01.T01 AT4G08210 20.364 604 436 15 11 595 17 594 1.21e-12 71.2
MsG0680035058.01.T01 AT1G03510 24.138 319 219 10 245 560 66 364 5.87e-14 74.7

Find 112 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 499 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ACTTATAGTGCTTTAATTAA+TGG 0.144636 6:-98306556 MsG0680035058.01.T01:CDS
TGTTACTTATAACTCTTTAA+TGG 0.169542 6:-98306353 MsG0680035058.01.T01:CDS
AGTTACAGTATCTTGATTAA+TGG 0.210240 6:-98306244 MsG0680035058.01.T01:CDS
TCAGAGCCTCTTCACGATTA+TGG 0.211387 6:-98309579 MsG0680035058.01.T01:CDS
TATCAATTGTTTCTGTCAAT+TGG 0.225223 6:-98306961 MsG0680035058.01.T01:CDS
AGTTATGGAACCTTGATTAA+TGG 0.229426 6:-98306766 MsG0680035058.01.T01:CDS
TGTTGTCAGGTTTCTGTTAT+CGG 0.250463 6:-98309550 MsG0680035058.01.T01:CDS
AATTACTTACAGTTCTATAT+TGG 0.258088 6:-98306038 MsG0680035058.01.T01:CDS
GAACTGTAAGTAATTATATT+TGG 0.266489 6:+98306046 None:intergenic
AGATGTGTACTTTAATATAT+TGG 0.267300 6:-98306461 MsG0680035058.01.T01:CDS
CATTACTTACAATTCTATAT+TGG 0.272429 6:-98313022 MsG0680035058.01.T01:CDS
ACATACACTATTCTAATTGA+TGG 0.275990 6:-98305929 MsG0680035058.01.T01:CDS
CCGACGAGTTGATGGAAAAT+TGG 0.280558 6:-98306701 MsG0680035058.01.T01:CDS
CCTTGTTAAAGAATTGAATA+AGG 0.299795 6:-98306320 MsG0680035058.01.T01:CDS
ATTTACACAAACCATCAATA+AGG 0.302156 6:+98306128 None:intergenic
TTTGTTTAATAAAATGATAT+TGG 0.312248 6:-98306497 MsG0680035058.01.T01:CDS
AAACTTGTTAATGAAGCTTT+TGG 0.314250 6:-98313601 MsG0680035058.01.T01:CDS
CAATTGAACCATGTTAGTTA+TGG 0.327438 6:-98306781 MsG0680035058.01.T01:CDS
GTTATGGAACCTTGATTAAT+GGG 0.330102 6:-98306765 MsG0680035058.01.T01:CDS
ATCAATTGTTTCTGTCAATT+GGG 0.332068 6:-98306960 MsG0680035058.01.T01:CDS
AGTCGATGAGATGCATGATA+TGG 0.334852 6:-98306077 MsG0680035058.01.T01:CDS
TATTGATGGTTTGTGTAAAT+CGG 0.336073 6:-98306125 MsG0680035058.01.T01:CDS
ACTTACAGTGCTTTAATTAG+TGG 0.348481 6:-98313532 MsG0680035058.01.T01:CDS
GTAGTCAATGTTATGATATC+TGG 0.361978 6:+98306883 None:intergenic
CATGAAAGTGTAATGCTTGA+TGG 0.362848 6:+98306827 None:intergenic
ATACTGTAACTGTGAATATC+AGG 0.365382 6:+98306256 None:intergenic
GCACTATAAGTGACAACATT+AGG 0.366433 6:+98306568 None:intergenic
CAGAGCCTCTTCACGATTAT+GGG 0.367420 6:-98309578 MsG0680035058.01.T01:CDS
GCCTGACAATTTGTTTAAGT+GGG 0.367572 6:-98309670 MsG0680035058.01.T01:CDS
AATATATTAAAGTACACATC+TGG 0.373466 6:+98306463 None:intergenic
TTTGCACATGCTATCAATAA+TGG 0.376377 6:+98313627 None:intergenic
TTAAGAGTCCCACATCGTTT+AGG 0.380060 6:-98309698 MsG0680035058.01.T01:CDS
ATTGATGGTTTGTGTAAATC+GGG 0.390070 6:-98306124 MsG0680035058.01.T01:CDS
ATTATCAAAATTGAAAGATC+GGG 0.390344 6:-98305972 MsG0680035058.01.T01:CDS
GAATTGCTCCGACGAGTTGA+TGG 0.391402 6:-98306709 MsG0680035058.01.T01:CDS
ACTTACAGTTCCCTTATTGA+TGG 0.398325 6:-98306139 MsG0680035058.01.T01:CDS
AGCATTACACTTTCATGATA+AGG 0.407570 6:-98306821 MsG0680035058.01.T01:CDS
GAACTTGTTGCAGCTGCTGC+TGG 0.418761 6:-98311042 MsG0680035058.01.T01:CDS
GAATTGTAAGTAATGATATC+AGG 0.421727 6:+98313030 None:intergenic
GTTGTCAGGTTTCTGTTATC+GGG 0.428686 6:-98309549 MsG0680035058.01.T01:CDS
AGAGGCTCTGATACCATCTT+AGG 0.429094 6:+98309591 None:intergenic
GGCCTGACAATTTGTTTAAG+TGG 0.429366 6:-98309671 MsG0680035058.01.T01:CDS
TATTATCAAAATTGAAAGAT+CGG 0.433734 6:-98305973 MsG0680035058.01.T01:CDS
ATTATGGGCCACCTGTTGTC+AGG 0.444761 6:-98309563 MsG0680035058.01.T01:CDS
ATAGTGTATGTGTAAATATT+CGG 0.448504 6:+98305941 None:intergenic
CATGATAAGGTGGTAGCGCT+TGG 0.454251 6:-98306808 MsG0680035058.01.T01:CDS
TTTACTCAACCCATTAATCA+AGG 0.454297 6:+98306756 None:intergenic
CCTAACACAACCCACAAAAC+CGG 0.455277 6:+98309627 None:intergenic
ATTAATGGGTTGAGTAAAGT+TGG 0.456087 6:-98306751 MsG0680035058.01.T01:CDS
TTTACACAAACCATCAATAA+GGG 0.457291 6:+98306129 None:intergenic
GCAGTGTACATTACCACATT+AGG 0.458244 6:+98306673 None:intergenic
TATATTCAACACTATGGCTC+AGG 0.460509 6:-98306290 MsG0680035058.01.T01:CDS
CCCCACTTAAACAAATTGTC+AGG 0.463325 6:+98309669 None:intergenic
CAACTCGTCGGAGCAATTCA+AGG 0.465670 6:+98306713 None:intergenic
ACATACACAACACTTGTTGA+TGG 0.466054 6:-98312913 MsG0680035058.01.T01:CDS
CATTTCTTCAAAGAGATACA+TGG 0.466598 6:+98306192 None:intergenic
GGTAAATTGAAAGATGCAAT+TGG 0.470627 6:-98313496 MsG0680035058.01.T01:intron
GAGTTATAAGTAACAACGTC+AGG 0.475954 6:+98306361 None:intergenic
CCCAACCACGATTCCTAAGA+TGG 0.477912 6:-98309604 MsG0680035058.01.T01:CDS
AACATTGACTACACTCATCA+AGG 0.482909 6:-98306872 MsG0680035058.01.T01:CDS
TAAGAGTATATTCAACACTA+TGG 0.484675 6:-98306296 MsG0680035058.01.T01:CDS
GTTGTGTATGTACACATATC+TGG 0.491834 6:+98312925 None:intergenic
ACTTATAACTCTTTAATGGA+TGG 0.499169 6:-98306349 MsG0680035058.01.T01:CDS
GTCGATGAGATGCATGATAT+GGG 0.499577 6:-98306076 MsG0680035058.01.T01:CDS
CCATCTTAGGAATCGTGGTT+GGG 0.501630 6:+98309604 None:intergenic
GAACTGTAAGTTACCACATT+GGG 0.507843 6:+98306151 None:intergenic
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GTCGATGAGATGCATGATAG+AGG 0.517828 6:-98313060 MsG0680035058.01.T01:CDS
CTGTAAGTAATTATATTTGG+TGG 0.520658 6:+98306049 None:intergenic
GATAACAGAAACCTGACAAC+AGG 0.521145 6:+98309552 None:intergenic
CCTTATTCAATTCTTTAACA+AGG 0.521617 6:+98306320 None:intergenic
ATCAAGGGTCACTGTCTCAA+AGG 0.528498 6:-98306856 MsG0680035058.01.T01:CDS
ACCATCTTAGGAATCGTGGT+TGG 0.529892 6:+98309603 None:intergenic
CAATTGCCTTGTCAACCTGA+TGG 0.536217 6:+98312983 None:intergenic
CGATTGCCTTGTCAAGATGA+TGG 0.544340 6:+98305999 None:intergenic
ACCCACAAAACCGGCTTGTG+AGG 0.546283 6:+98309636 None:intergenic
GCAATCCTCACCTCACAAGC+CGG 0.556045 6:-98309646 MsG0680035058.01.T01:CDS
TTTGTAAAGGTGGAGACTAG+AGG 0.558667 6:-98305904 None:intergenic
CAACACTTGTTGATGGTCAA+AGG 0.564027 6:-98312906 MsG0680035058.01.T01:CDS
CCTGACAATTTGTTTAAGTG+GGG 0.578309 6:-98309669 MsG0680035058.01.T01:CDS
CTGACAATTTGTTTAAGTGG+GGG 0.582003 6:-98309668 MsG0680035058.01.T01:CDS
GAAGCGTGAACATAAATGAC+GGG 0.593029 6:+98309523 None:intergenic
ATGTGTAATCTTGAGCGTGA+GGG 0.593763 6:-98309498 MsG0680035058.01.T01:CDS
TCAAGGTTCCATAACTAACA+TGG 0.604055 6:+98306773 None:intergenic
AACTCGTCGGAGCAATTCAA+GGG 0.605482 6:+98306714 None:intergenic
ATTACACTTTCATGATAAGG+TGG 0.606323 6:-98306818 MsG0680035058.01.T01:CDS
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TTGATGGTTTGTGTAAATCG+GGG 0.611570 6:-98306123 MsG0680035058.01.T01:CDS
AACAGAAACCTGACAACAGG+TGG 0.614452 6:+98309555 None:intergenic
ATATATTAAAGTACACATCT+GGG 0.615939 6:+98306464 None:intergenic
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GGAACTGTAAGTTACCACAT+TGG 0.616626 6:+98306150 None:intergenic
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TAAGTCAATGTCATCCATGT+TGG 0.620996 6:+98311080 None:intergenic
TGAAGCGTGAACATAAATGA+CGG 0.621745 6:+98309522 None:intergenic
TGATACCATCTTAGGAATCG+TGG 0.624493 6:+98309599 None:intergenic
CAAAAGCCATCATCTTGACA+AGG 0.625265 6:-98306005 MsG0680035058.01.T01:CDS
TACAGATACACCAACCAACA+TGG 0.628799 6:-98311094 MsG0680035058.01.T01:intron
CAAAACCGGCTTGTGAGGTG+AGG 0.628959 6:+98309641 None:intergenic
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GCGTGAACATAAATGACGGG+TGG 0.678302 6:+98309526 None:intergenic
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TGTGTAATCTTGAGCGTGAG+GGG 0.696798 6:-98309497 MsG0680035058.01.T01:CDS
TTGTAAGTAATGATATCAGG+TGG 0.699754 6:+98313033 None:intergenic
GTGTAATCTTGAGCGTGAGG+GGG 0.711194 6:-98309496 MsG0680035058.01.T01:intron
TTAGCTATGATGATGAAACA+AGG 0.779554 6:-98306391 MsG0680035058.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! ATTAAATTTTTTAAATATTA+TGG + Chr6:98311544-98311563 None:intergenic 0.0%
!! ATTTGTAACATAAAATAAAA+AGG + Chr6:98308178-98308197 None:intergenic 10.0%
!! TAAACTATTAATTATATGAA+TGG - Chr6:98307934-98307953 MsG0680035058.01.T01:intron 10.0%
!! TTTGTTTAATAAAATGATAT+TGG - Chr6:98313047-98313066 MsG0680035058.01.T01:CDS 10.0%
!!! TTTTTATTTTATGTTACAAA+TGG - Chr6:98308177-98308196 MsG0680035058.01.T01:intron 10.0%
!! AAAAGAGTGAATTTAAATAT+TGG - Chr6:98311667-98311686 MsG0680035058.01.T01:intron 15.0%
!! GAAAAAAAGAAAAAATAGAA+AGG - Chr6:98309398-98309417 MsG0680035058.01.T01:intron 15.0%
!! TAATAGTATATTAATTTCGA+GGG + Chr6:98309653-98309672 None:intergenic 15.0%
!! TATTATCAAAATTGAAAGAT+CGG - Chr6:98313571-98313590 MsG0680035058.01.T01:CDS 15.0%
!! TTAATAGTATATTAATTTCG+AGG + Chr6:98309654-98309673 None:intergenic 15.0%
!! TTATAAACAATATATAGTCA+AGG + Chr6:98311502-98311521 None:intergenic 15.0%
!!! ATAAAATGATATTTTAGGAA+AGG - Chr6:98312022-98312041 MsG0680035058.01.T01:intron 15.0%
!!! ATAATTTTCTTGAGAATATA+AGG - Chr6:98311927-98311946 MsG0680035058.01.T01:intron 15.0%
!!! ATTTTGTAAGATTAAAATGA+TGG - Chr6:98313323-98313342 MsG0680035058.01.T01:intron 15.0%
!!! CATTGATAAAATGATATTTT+AGG - Chr6:98312017-98312036 MsG0680035058.01.T01:intron 15.0%
!!! TAAAATGATATTTTAGGAAA+GGG - Chr6:98312023-98312042 MsG0680035058.01.T01:intron 15.0%
!!! TTATATTGTTATAACTTGTA+AGG - Chr6:98310396-98310415 MsG0680035058.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTTGAATTATACTTTGAAA+TGG - Chr6:98312936-98312955 MsG0680035058.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTTTTTAATGAATAGTAGTT+TGG + Chr6:98309731-98309750 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTTTATAATACATACTAG+CGG + Chr6:98311646-98311665 None:intergenic 15.0%
!! AAAGAAAAAATAGAAAGGTA+AGG - Chr6:98309403-98309422 MsG0680035058.01.T01:intron 20.0%
!! AATATATTAAAGTACACATC+TGG + Chr6:98313084-98313103 None:intergenic 20.0%
!! AATTACTTACAGTTCTATAT+TGG - Chr6:98313506-98313525 MsG0680035058.01.T01:CDS 20.0%
!! ACTTATAGTGCTTTAATTAA+TGG - Chr6:98312988-98313007 MsG0680035058.01.T01:CDS 20.0%
!! AGATGTGTACTTTAATATAT+TGG - Chr6:98313083-98313102 MsG0680035058.01.T01:intron 20.0%
!! AGGTTTACAAAATATAATCT+CGG - Chr6:98311903-98311922 MsG0680035058.01.T01:intron 20.0%
!! ATAGTGTATGTGTAAATATT+CGG + Chr6:98313606-98313625 None:intergenic 20.0%
!! ATATATTAAAGTACACATCT+GGG + Chr6:98313083-98313102 None:intergenic 20.0%
!! ATTATCAAAATTGAAAGATC+GGG - Chr6:98313572-98313591 MsG0680035058.01.T01:CDS 20.0%
!! CATTACTTACAATTCTATAT+TGG - Chr6:98306522-98306541 MsG0680035058.01.T01:CDS 20.0%
!! CTATTCATTAAAAAATCATG+TGG - Chr6:98309736-98309755 MsG0680035058.01.T01:intron 20.0%
!! GAACTGTAAGTAATTATATT+TGG + Chr6:98313501-98313520 None:intergenic 20.0%
!! GATGATTATTTCATAAGTAA+CGG + Chr6:98306820-98306839 None:intergenic 20.0%
!! GTGAAGAATTTAATATCTAA+TGG - Chr6:98310534-98310553 MsG0680035058.01.T01:intron 20.0%
!! TAAATGTATAAATGACATCT+TGG + Chr6:98311331-98311350 None:intergenic 20.0%
!! TAAGCTAAAATGATTAACTA+AGG - Chr6:98307691-98307710 MsG0680035058.01.T01:intron 20.0%
!! TACAATTAACTATATTGCAA+AGG - Chr6:98308213-98308232 MsG0680035058.01.T01:intron 20.0%
!! TAGTTAATTGTACAAAAGTA+CGG + Chr6:98308205-98308224 None:intergenic 20.0%
!! TATATTTAACATAGAGAAGA+GGG - Chr6:98311842-98311861 MsG0680035058.01.T01:intron 20.0%
!! TTAAACAAATTTGTGTTATC+CGG - Chr6:98310742-98310761 MsG0680035058.01.T01:intron 20.0%
!! TTAAATCATAGAATTTGTGT+GGG + Chr6:98309377-98309396 None:intergenic 20.0%
!! TTTAAATCATAGAATTTGTG+TGG + Chr6:98309378-98309397 None:intergenic 20.0%
!!! AAAATGATATTTTAGGAAAG+GGG - Chr6:98312024-98312043 MsG0680035058.01.T01:intron 20.0%
!!! AATGATTTGTTTTTTGCTTT+TGG - Chr6:98310997-98311016 MsG0680035058.01.T01:intron 20.0%
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!!! GCATAAATTTTTCCTTTTAA+GGG - Chr6:98311810-98311829 MsG0680035058.01.T01:intron 20.0%
!!! TGAAAAGGATGAATTTTTTT+GGG + Chr6:98312310-98312329 None:intergenic 20.0%
!!! TGTTACTTATAACTCTTTAA+TGG - Chr6:98306211-98306230 MsG0680035058.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGTTTTCTAATTCATGTAAT+TGG + Chr6:98310841-98310860 None:intergenic 20.0%
!!! TTGAAAAGGATGAATTTTTT+TGG + Chr6:98312311-98312330 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTACCTTAATTTTTATGC+AGG - Chr6:98311434-98311453 MsG0680035058.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTGGTTTATATTCTGAAA+TGG - Chr6:98305960-98305979 MsG0680035058.01.T01:CDS 20.0%
! AAATTTCTTAGTAGGAAAAC+AGG - Chr6:98307463-98307482 MsG0680035058.01.T01:intron 25.0%
! AAGCAACTAATAGATCAAAA+TGG + Chr6:98308607-98308626 None:intergenic 25.0%
! AATAGTTTCAGTCTTACATT+AGG + Chr6:98306911-98306930 None:intergenic 25.0%
! AATTAAAGATATACACATCC+GGG + Chr6:98306106-98306125 None:intergenic 25.0%
! AATTTCTTAGTAGGAAAACA+GGG - Chr6:98307464-98307483 MsG0680035058.01.T01:intron 25.0%
! ACATACACTATTCTAATTGA+TGG - Chr6:98313615-98313634 MsG0680035058.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTATAACTCTTTAATGGA+TGG - Chr6:98306215-98306234 MsG0680035058.01.T01:CDS 25.0%
! AGCAACTAATAGATCAAAAT+GGG + Chr6:98308606-98308625 None:intergenic 25.0%
! AGTTACAGTATCTTGATTAA+TGG - Chr6:98313300-98313319 MsG0680035058.01.T01:intron 25.0%
! ATAATCAAAATCTCATATCG+GGG - Chr6:98311780-98311799 MsG0680035058.01.T01:intron 25.0%
! ATATATACCGTATGATTCAA+GGG - Chr6:98306680-98306699 MsG0680035058.01.T01:CDS 25.0%
! ATCATTATTACTATTGGAGA+TGG - Chr6:98310595-98310614 MsG0680035058.01.T01:intron 25.0%
! ATTCATGAAAGAAAAAAACG+TGG + Chr6:98311720-98311739 None:intergenic 25.0%
! ATTTACACAAACCATCAATA+AGG + Chr6:98313419-98313438 None:intergenic 25.0%
! CAACTTTCATAATTGATTGA+TGG + Chr6:98307088-98307107 None:intergenic 25.0%
! CAATTAAAGATATACACATC+CGG + Chr6:98306107-98306126 None:intergenic 25.0%
! CAGTTTATATCCATTTATCT+TGG - Chr6:98308822-98308841 MsG0680035058.01.T01:intron 25.0%
! CATAATCAAAATCTCATATC+GGG - Chr6:98311779-98311798 MsG0680035058.01.T01:intron 25.0%
! CCTTATTCAATTCTTTAACA+AGG + Chr6:98313227-98313246 None:intergenic 25.0%
! CCTTGTTAAAGAATTGAATA+AGG - Chr6:98313224-98313243 MsG0680035058.01.T01:intron 25.0%
! CTGTAAGTAATTATATTTGG+TGG + Chr6:98313498-98313517 None:intergenic 25.0%
! CTTCTACTTATTCTAATCTT+AGG - Chr6:98307578-98307597 MsG0680035058.01.T01:intron 25.0%
! GAATTGTAAGTAATGATATC+AGG + Chr6:98306517-98306536 None:intergenic 25.0%
! GATATAATATGAATATCCCT+AGG + Chr6:98311043-98311062 None:intergenic 25.0%
! GCATAATCAAAATCTCATAT+CGG - Chr6:98311778-98311797 MsG0680035058.01.T01:intron 25.0%
! GCTTAAAATTGAAGAATTTG+AGG - Chr6:98307903-98307922 MsG0680035058.01.T01:intron 25.0%
! GTAAACTGATTGAAGATATT+AGG - Chr6:98309791-98309810 MsG0680035058.01.T01:intron 25.0%
! GTATATTTAACATAGAGAAG+AGG - Chr6:98311841-98311860 MsG0680035058.01.T01:intron 25.0%
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! GTTATATAGACTAAATTCGA+TGG - Chr6:98307206-98307225 MsG0680035058.01.T01:intron 25.0%
! TAAAATGATTAACTAAGGTC+TGG - Chr6:98307696-98307715 MsG0680035058.01.T01:intron 25.0%
! TAGAATAACTAGTGATGAAT+AGG + Chr6:98308632-98308651 None:intergenic 25.0%
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AAATCTTAGAAATCGTGGTT+GGG + Chr6:98310292-98310311 None:intergenic 30.0%
AACCTCTTGTGTAAAAAACA+GGG + Chr6:98309562-98309581 None:intergenic 30.0%
AAGTGTAATTCAAAGCAGAA+AGG + Chr6:98307147-98307166 None:intergenic 30.0%
AATGATGAGTTCAGTTACAT+AGG + Chr6:98308281-98308300 None:intergenic 30.0%
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ACTCTTAACTTAGAAAATCG+TGG + Chr6:98310180-98310199 None:intergenic 30.0%
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AGTTATGGAACCTTGATTAA+TGG - Chr6:98312778-98312797 MsG0680035058.01.T01:intron 30.0%
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ATAGACTAAATTCGATGGAA+GGG - Chr6:98307211-98307230 MsG0680035058.01.T01:intron 30.0%
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ATTACACTTTCATGATAAGG+TGG - Chr6:98312726-98312745 MsG0680035058.01.T01:intron 30.0%
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CATTTCTTCAAAGAGATACA+TGG + Chr6:98313355-98313374 None:intergenic 30.0%
CCAAATAATGATGCTAGTTA+TGG + Chr6:98310654-98310673 None:intergenic 30.0%
CCACTTATAAACAAATTGTC+AGG + Chr6:98310107-98310126 None:intergenic 30.0%
CCATAACTAGCATCATTATT+TGG - Chr6:98310651-98310670 MsG0680035058.01.T01:intron 30.0%
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CTTTCACATTAAATGACACA+TGG + Chr6:98308028-98308047 None:intergenic 30.0%
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GGACTATACAAATTATCATC+CGG + Chr6:98310764-98310783 None:intergenic 30.0%
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TATAGACTAAATTCGATGGA+AGG - Chr6:98307210-98307229 MsG0680035058.01.T01:intron 30.0%
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TTTGCACATGCTATCAATAA+TGG + Chr6:98305920-98305939 None:intergenic 30.0%
! AACAACAATGTGGTAATGTT+TGG + Chr6:98312501-98312520 None:intergenic 30.0%
! AGAAATTTACCCTTGTTTCA+AGG - Chr6:98308546-98308565 MsG0680035058.01.T01:intron 30.0%
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! ATTGATGGTTTGTGTAAATC+GGG - Chr6:98306437-98306456 MsG0680035058.01.T01:CDS 30.0%
! CATTGATGGTTTGTGTAAAT+CGG - Chr6:98306436-98306455 MsG0680035058.01.T01:CDS 30.0%
! CCTGACAATTTGTTTATAAG+TGG - Chr6:98310104-98310123 MsG0680035058.01.T01:intron 30.0%
! GAAATTTACCCTTGTTTCAA+GGG - Chr6:98308547-98308566 MsG0680035058.01.T01:intron 30.0%
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! GGCTATCAAATCATTTGTTA+AGG + Chr6:98307240-98307259 None:intergenic 30.0%
! GGTAAAGATTACATTTTCTC+TGG + Chr6:98308084-98308103 None:intergenic 30.0%
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! GTTCAAATAACCTTCTTTTG+TGG + Chr6:98310444-98310463 None:intergenic 30.0%
! TCAGTCTTTTCTGATTAAGA+AGG - Chr6:98309194-98309213 MsG0680035058.01.T01:intron 30.0%
! TCTTCAACAAAATGTTTCTG+AGG - Chr6:98312255-98312274 MsG0680035058.01.T01:intron 30.0%
! TTAGCTATGATGATGAAACA+AGG - Chr6:98306173-98306192 MsG0680035058.01.T01:CDS 30.0%
! TTCTTCATCTGCTAAGTTTT+AGG + Chr6:98312174-98312193 None:intergenic 30.0%
!! ACGGGTTTTGTAAGATTAAA+AGG - Chr6:98306337-98306356 MsG0680035058.01.T01:CDS 30.0%
!! AGGAAGCATGATTCTATTTT+CGG - Chr6:98307777-98307796 MsG0680035058.01.T01:intron 30.0%
!! ATTAATGGGTTGAGTAAAGT+TGG - Chr6:98312793-98312812 MsG0680035058.01.T01:intron 30.0%
!! ATTGGTTGATGCATTTTGTA+AGG - Chr6:98306123-98306142 MsG0680035058.01.T01:CDS 30.0%
!! CCTTATTGACTTCTTTAACT+AGG + Chr6:98306245-98306264 None:intergenic 30.0%
!! TACATTTTCTCTGGAAGAAA+CGG + Chr6:98308075-98308094 None:intergenic 30.0%
!! TGGAATGCTTTTTATCAACT+AGG - Chr6:98308369-98308388 MsG0680035058.01.T01:intron 30.0%
!! TTCGGCATAATTGTTGATTT+CGG - Chr6:98307795-98307814 MsG0680035058.01.T01:intron 30.0%
!!! ATTGATGGATTTTGTAAAGG+TGG - Chr6:98313630-98313649 MsG0680035058.01.T01:CDS 30.0%
!!! GTTAAAGCTCTTTTTGAGAT+CGG + Chr6:98308786-98308805 None:intergenic 30.0%
!!! TGACTGGTTTTACTTTAGTA+GGG - Chr6:98309274-98309293 MsG0680035058.01.T01:intron 30.0%
!!! TGTTTTTTGCTTTTGGTTTG+GGG - Chr6:98311004-98311023 MsG0680035058.01.T01:intron 30.0%
!!! TTGACTGGTTTTACTTTAGT+AGG - Chr6:98309273-98309292 MsG0680035058.01.T01:intron 30.0%
AAGGTTATGTCACAGAATTG+CGG - Chr6:98308850-98308869 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
AATACAATACACCAAATGGC+GGG + Chr6:98309526-98309545 None:intergenic 35.0%
AATCAAGATTGATCTTTGGC+TGG + Chr6:98308745-98308764 None:intergenic 35.0%
AATCTTACCGAATTTGAAGG+TGG + Chr6:98312460-98312479 None:intergenic 35.0%
ACAATGCTGAAAAGATCGAA+GGG + Chr6:98308676-98308695 None:intergenic 35.0%
ACATGACAACAACTTTACCA+GGG - Chr6:98309481-98309500 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
ACCAACAGATTTCATCGAAT+GGG + Chr6:98311164-98311183 None:intergenic 35.0%
ACTGTAAGTGAAAACATCAG+AGG + Chr6:98306001-98306020 None:intergenic 35.0%
ACTTACAATTCCCTCATTGA+TGG - Chr6:98306422-98306441 MsG0680035058.01.T01:CDS 35.0%
ACTTACAGTTCCCTTATTGA+TGG - Chr6:98313405-98313424 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
AGAAAGAGCTCAAAGATCAT+TGG + Chr6:98308581-98308600 None:intergenic 35.0%
AGAGCTGAATGTCTTTCAAA+TGG - Chr6:98311295-98311314 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
AGCTCTCAATACTTCTTTCA+AGG + Chr6:98307365-98307384 None:intergenic 35.0%
ATACATTTCCCTCCCTTAAA+AGG + Chr6:98311825-98311844 None:intergenic 35.0%
ATATTCAACACTATGGCTCA+GGG - Chr6:98313255-98313274 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
ATCACAGAGAGAAATCGAAA+TGG + Chr6:98307042-98307061 None:intergenic 35.0%
ATCTTACCGAATTTGAAGGT+GGG + Chr6:98312459-98312478 None:intergenic 35.0%
ATGATTCATCAAACAAGCCA+TGG + Chr6:98306714-98306733 None:intergenic 35.0%
ATGGAAAATTTCACACATGG+TGG - Chr6:98310553-98310572 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
ATGTAACTCTTTGTCTCTAG+TGG - Chr6:98310947-98310966 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
ATGTTATCTTGTACCTTTCG+TGG - Chr6:98308411-98308430 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
ATTAATTTCGAGGGTAACCT+TGG + Chr6:98309644-98309663 None:intergenic 35.0%
ATTCAACACTATGTCTCGTA+GGG - Chr6:98306275-98306294 MsG0680035058.01.T01:CDS 35.0%
ATTGGAGTTGCTGTCAAAAA+TGG - Chr6:98306770-98306789 MsG0680035058.01.T01:CDS 35.0%
ATTTGAAAGACATTCAGCTC+TGG + Chr6:98311296-98311315 None:intergenic 35.0%
CAAAAGAGTTGTTCAATCAC+AGG - Chr6:98309093-98309112 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
CAACCTCTTGTGTAAAAAAC+AGG + Chr6:98309563-98309582 None:intergenic 35.0%
CAATACAATACACCAAATGG+CGG + Chr6:98309527-98309546 None:intergenic 35.0%
CAATTTAGACGCCATAAGAT+AGG + Chr6:98307513-98307532 None:intergenic 35.0%
CTAGTGACCAAACAATTTCA+AGG + Chr6:98307722-98307741 None:intergenic 35.0%
CTCAAAGATCATTGGACAAT+TGG + Chr6:98308573-98308592 None:intergenic 35.0%
CTTGAAATTGTTTGGTCACT+AGG - Chr6:98307720-98307739 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
CTTGTGTAAAAAACAGGGTA+AGG + Chr6:98309557-98309576 None:intergenic 35.0%
GAACTGTAAGTTACCACATT+GGG + Chr6:98313396-98313415 None:intergenic 35.0%
GAAGAATTTGTGCGAAATTC+TGG + Chr6:98308905-98308924 None:intergenic 35.0%
GAAGATCATGTAATTGTCCA+CGG + Chr6:98311079-98311098 None:intergenic 35.0%
GAATTGTAAGTTACCACATC+AGG + Chr6:98306413-98306432 None:intergenic 35.0%
GAGTTATAAGTAACAACGTC+AGG + Chr6:98313186-98313205 None:intergenic 35.0%
GCAATTCTTAGAAACAACTG+AGG + Chr6:98310819-98310838 None:intergenic 35.0%
GCACTATAAGTGACAACATT+AGG + Chr6:98312979-98312998 None:intergenic 35.0%
GCGAAATCAAGATTGATCTT+TGG + Chr6:98308749-98308768 None:intergenic 35.0%
GCTACAGTATCATGATTAAC+GGG - Chr6:98306319-98306338 MsG0680035058.01.T01:CDS 35.0%
GGAAGTTGAAATTGAACGTT+AGG + Chr6:98309338-98309357 None:intergenic 35.0%
GTAAAGTTGTTGTCATGTGA+TGG + Chr6:98309479-98309498 None:intergenic 35.0%
GTAATGTTTGGATTTGACGA+GGG + Chr6:98312489-98312508 None:intergenic 35.0%
GTTGTGTATGTACACATATC+TGG + Chr6:98306622-98306641 None:intergenic 35.0%
GTTTGACGATAGTTGTCATA+GGG + Chr6:98311138-98311157 None:intergenic 35.0%
TAAGTCAATGTCATCCATGT+TGG + Chr6:98308467-98308486 None:intergenic 35.0%
TACAATGCTGAAAAGATCGA+AGG + Chr6:98308677-98308696 None:intergenic 35.0%
TACCAACAGATTTCATCGAA+TGG + Chr6:98311165-98311184 None:intergenic 35.0%
TATATTCAACACTATGGCTC+AGG - Chr6:98313254-98313273 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
TATTCAACACTATGTCTCGT+AGG - Chr6:98306274-98306293 MsG0680035058.01.T01:CDS 35.0%
TCAAGGTTCCATAACTAACA+TGG + Chr6:98312774-98312793 None:intergenic 35.0%
TCTAGAAATTGCATGCTTGT+AGG - Chr6:98307757-98307776 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
TGAAGCGTGAACATAAATGA+CGG + Chr6:98310025-98310044 None:intergenic 35.0%
TGCTTTATGCAAAAACCATC+AGG - Chr6:98306546-98306565 MsG0680035058.01.T01:CDS 35.0%
TGTGAAAGCAAACAAGCTTA+TGG - Chr6:98308040-98308059 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
TGTTGTCAGGTTTCTGTTAT+CGG - Chr6:98309994-98310013 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
TGTTTCCCTTTCTCAACAAA+TGG - Chr6:98312517-98312536 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
TTAACGAAGATGAAAGACGA+AGG - Chr6:98306589-98306608 MsG0680035058.01.T01:CDS 35.0%
TTATAGGACACTTACTACAG+AGG - Chr6:98309000-98309019 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
TTCTCAAACAATTCAACTGG+AGG + Chr6:98308150-98308169 None:intergenic 35.0%
TTGCAAAACACAAACAGCTA+TGG + Chr6:98309228-98309247 None:intergenic 35.0%
TTTGACGATAGTTGTCATAG+GGG + Chr6:98311137-98311156 None:intergenic 35.0%
TTTGGGAAGAAAAAGAGAAC+AGG + Chr6:98312293-98312312 None:intergenic 35.0%
! AAAATTGGTTCAGCCTAATG+TGG - Chr6:98312858-98312877 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
! AACATTGACTACACTCATCA+AGG - Chr6:98312672-98312691 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
! AACTTCGTTTTATGCATGAC+TGG - Chr6:98308343-98308362 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
! ACATACACAACACTTGTTGA+TGG - Chr6:98306631-98306650 MsG0680035058.01.T01:CDS 35.0%
! ACATTGACTACACTCATCAA+GGG - Chr6:98312673-98312692 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
! ATGATTTGATAGCCAGCATA+TGG - Chr6:98307246-98307265 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
! ATGCATTTTGTAAGGAAGGA+AGG - Chr6:98306131-98306150 MsG0680035058.01.T01:CDS 35.0%
! ATTAGTGGCTTTTGCATTGT+TGG - Chr6:98306027-98306046 MsG0680035058.01.T01:CDS 35.0%
! CAAATAACCTTCTTTTGTGG+CGG + Chr6:98310441-98310460 None:intergenic 35.0%
! CATGAAAGTGTAATGCTTGA+TGG + Chr6:98312720-98312739 None:intergenic 35.0%
! CATTGGTTGAAGTTGAAGAA+GGG + Chr6:98312380-98312399 None:intergenic 35.0%
! CCTGACAATTTGTTTAAGTG+GGG - Chr6:98309875-98309894 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
! CGATCTTTTCAGCATTGTAT+AGG - Chr6:98308678-98308697 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
! CTGACAATTTGTTTAAGTGG+GGG - Chr6:98309876-98309895 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
! GCCTGACAATTTGTTTAAGT+GGG - Chr6:98309874-98309893 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
! GTTGATGCATTTTGTAAGGA+AGG - Chr6:98306127-98306146 MsG0680035058.01.T01:CDS 35.0%
! GTTTTATGCATGACTGGAAT+TGG - Chr6:98308349-98308368 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
! TCATTGGTTGAAGTTGAAGA+AGG + Chr6:98312381-98312400 None:intergenic 35.0%
! TGATTTGATAGCCAGCATAT+GGG - Chr6:98307247-98307266 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
! TGCATTTTGTAAGGAAGGAA+GGG - Chr6:98306132-98306151 MsG0680035058.01.T01:CDS 35.0%
! TTCAAGTTTGGTCTGGATAT+GGG - Chr6:98308110-98308129 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
! TTGATGGTTTGTGTAAATCG+GGG - Chr6:98306438-98306457 MsG0680035058.01.T01:CDS 35.0%
! TTTACACAAGAGGTTGTTTC+CGG - Chr6:98309567-98309586 MsG0680035058.01.T01:CDS 35.0%
! TTTGTGGTCTCTCTTTTTGT+CGG + Chr6:98312136-98312155 None:intergenic 35.0%
!! ACATTTTCTCTGGAAGAAAC+GGG + Chr6:98308074-98308093 None:intergenic 35.0%
!! AGAAGTATTGAGAGCTAGAA+AGG - Chr6:98307369-98307388 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
!! AGTTTCTTTTTCACTAGCAG+AGG + Chr6:98306963-98306982 None:intergenic 35.0%
!! ATTGGATTGTTTTGTAGCCA+TGG - Chr6:98306732-98306751 MsG0680035058.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTGATGAGTTTTGCAAAGA+AGG - Chr6:98313105-98313124 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
!! TCGGTGTTAACTTTGATTCT+TGG - Chr6:98307814-98307833 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
!! TGGCTTGTTTGATGAATCAT+TGG - Chr6:98306714-98306733 MsG0680035058.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTAGGGAGTGATTGTTTC+AGG - Chr6:98311883-98311902 MsG0680035058.01.T01:intron 35.0%
!!! TACCCTGTTTTTTACACAAG+AGG - Chr6:98309557-98309576 MsG0680035058.01.T01:CDS 35.0%
AAATGACATCTTGGAATGCC+TGG + Chr6:98311322-98311341 None:intergenic 40.0%
AACAGCATCATCGACATCAT+TGG + Chr6:98312397-98312416 None:intergenic 40.0%
AATCACGGGAAACAACATTG+CGG + Chr6:98312109-98312128 None:intergenic 40.0%
ACAATTGGCCCTTGAAACAA+GGG + Chr6:98308558-98308577 None:intergenic 40.0%
ACCACGAAGAAAAGATTGAC+TGG - Chr6:98309258-98309277 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
ACCCATTCGATGAAATCTGT+TGG - Chr6:98311160-98311179 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
ACCTTCCCAACCAAGATAAA+TGG + Chr6:98308835-98308854 None:intergenic 40.0%
AGAAGGGAGAAGGAAAATGA+AGG + Chr6:98312364-98312383 None:intergenic 40.0%
AGCCACCAGATAGTAAGTAA+AGG + Chr6:98310913-98310932 None:intergenic 40.0%
AGCCTTTACTTACTATCTGG+TGG - Chr6:98310908-98310927 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
AGGTTATGTCACAGAATTGC+GGG - Chr6:98308851-98308870 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
AGTCGATGAGATGCATGATA+TGG - Chr6:98306483-98306502 MsG0680035058.01.T01:CDS 40.0%
ATAGTTGTCATAGGGGTTGA+AGG + Chr6:98311130-98311149 None:intergenic 40.0%
ATCAAAATCTCATATCGGGG+AGG - Chr6:98311783-98311802 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
ATGACACATGGGTATGCTTT+AGG + Chr6:98308016-98308035 None:intergenic 40.0%
ATGTGTAATCTTGAGCGTGA+GGG - Chr6:98310046-98310065 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
ATGTTGCAACTGACAAAGTC+AGG + Chr6:98312560-98312579 None:intergenic 40.0%
ATTTGTGCGAAATTCTGGTC+TGG + Chr6:98308900-98308919 None:intergenic 40.0%
CAAAAGCCATCATCTTGACA+AGG - Chr6:98313539-98313558 MsG0680035058.01.T01:CDS 40.0%
CACATGACAACAACTTTACC+AGG - Chr6:98309480-98309499 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
CATCCAAATCTCCAGATAAG+AGG + Chr6:98307116-98307135 None:intergenic 40.0%
CCCCACTTAAACAAATTGTC+AGG + Chr6:98309878-98309897 None:intergenic 40.0%
CCTTCACCTATGACAACAAA+AGG + Chr6:98309766-98309785 None:intergenic 40.0%
CGTTTGACGATAGTTGTCAT+AGG + Chr6:98311139-98311158 None:intergenic 40.0%
CTAACACAAACCCACAAAAC+CGG + Chr6:98310268-98310287 None:intergenic 40.0%
CTAAGTTAAGAGTCCCACAT+CGG - Chr6:98310187-98310206 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
CTTCGTGAAATGATTACGAG+AGG - Chr6:98306885-98306904 MsG0680035058.01.T01:CDS 40.0%
CTTTAGTAGGGAGAAACTTG+TGG - Chr6:98309286-98309305 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
GAAGCGTGAACATAAATGAC+GGG + Chr6:98310024-98310043 None:intergenic 40.0%
GAATGTCTTTCAAATGGACC+AGG - Chr6:98311301-98311320 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
GAGAAAGGGAAACAACAATG+TGG + Chr6:98312511-98312530 None:intergenic 40.0%
GAGGAGCAGGTTTAAGAATT+AGG + Chr6:98309176-98309195 None:intergenic 40.0%
GATAACAGAAACCTGACAAC+AGG + Chr6:98309995-98310014 None:intergenic 40.0%
GATGTCTTGATCTCAGTTTG+TGG + Chr6:98312152-98312171 None:intergenic 40.0%
GCAGTGTACATTACCACATT+AGG + Chr6:98312874-98312893 None:intergenic 40.0%
GGAACTGTAAGTTACCACAT+TGG + Chr6:98313397-98313416 None:intergenic 40.0%
GGTAATGTTTGGATTTGACG+AGG + Chr6:98312490-98312509 None:intergenic 40.0%
GTAATTGTCCACGGTATAGT+TGG + Chr6:98311070-98311089 None:intergenic 40.0%
GTCGATGAGATGCATGATAT+GGG - Chr6:98313468-98313487 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
GTTGTCAGGTTTCTGTTATC+GGG - Chr6:98309995-98310014 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
TACAGATACACCAACCAACA+TGG - Chr6:98308450-98308469 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
TATGCAGCAAACAGATTCTG+CGG + Chr6:98307414-98307433 None:intergenic 40.0%
TCAATGTCATCCATGTTGGT+TGG + Chr6:98308463-98308482 None:intergenic 40.0%
TCCATTTATCTTGGTTGGGA+AGG - Chr6:98308831-98308850 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
TGATACCATCTTAGGAATCG+TGG + Chr6:98309948-98309967 None:intergenic 40.0%
TTAAGAGTCCCACATCGTTT+AGG - Chr6:98309846-98309865 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
TTCAACACTATGTCTCGTAG+GGG - Chr6:98306276-98306295 MsG0680035058.01.T01:CDS 40.0%
TTGAAGTTGAAGAAGGGAGA+AGG + Chr6:98312374-98312393 None:intergenic 40.0%
TTGTGAGGAATCCTATCTTG+AGG - Chr6:98309123-98309142 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
TTTGTGCGAAATTCTGGTCT+GGG + Chr6:98308899-98308918 None:intergenic 40.0%
! ACCAGTCAATCTTTTCTTCG+TGG + Chr6:98309262-98309281 None:intergenic 40.0%
! AGTCAATCTTTTCTTCGTGG+TGG + Chr6:98309259-98309278 None:intergenic 40.0%
! CCAATTTTCCATCAACTCGT+CGG + Chr6:98312846-98312865 None:intergenic 40.0%
! CTTCAAGTTTGGTCTGGATA+TGG - Chr6:98308109-98308128 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
! CTTCTATGATTGTCTAGAGC+AGG - Chr6:98311095-98311114 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
! CTTTTTGTCGGATGGAATCA+CGG + Chr6:98312124-98312143 None:intergenic 40.0%
! GGCCTGACAATTTGTTTAAG+TGG - Chr6:98309873-98309892 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
! GGGTATGGAGAATTTTCCTA+GGG - Chr6:98311024-98311043 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
! TATGATTGTCTAGAGCAGGA+CGG - Chr6:98311099-98311118 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
! TTACACAAGAGGTTGTTTCC+GGG - Chr6:98309568-98309587 MsG0680035058.01.T01:CDS 40.0%
! TTTACCTGCGTCTTCAAGTT+TGG - Chr6:98308098-98308117 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
! TTTTTGTCGGATGGAATCAC+GGG + Chr6:98312123-98312142 None:intergenic 40.0%
!! ATTCAAGGGTTTTGTAGCCA+TGG - Chr6:98306694-98306713 MsG0680035058.01.T01:CDS 40.0%
!! CAAAAACCATCAGGTTGACA+AGG - Chr6:98306555-98306574 MsG0680035058.01.T01:CDS 40.0%
!! CAACACTTGTTGATGGTCAA+AGG - Chr6:98306638-98306657 MsG0680035058.01.T01:CDS 40.0%
!! CCTTTTGTTGTCATAGGTGA+AGG - Chr6:98309763-98309782 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
!! GGACATCCTTTTGTTGTCAT+AGG - Chr6:98309757-98309776 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
!!! TTTGCTTTTGGTTTGGGGTA+TGG - Chr6:98311009-98311028 MsG0680035058.01.T01:intron 40.0%
AACAGAAACCTGACAACAGG+TGG + Chr6:98309992-98310011 None:intergenic 45.0%
AACTCGTCGGAGCAATTCAA+GGG + Chr6:98312833-98312852 None:intergenic 45.0%
AAGTTGTGCAGCCTCTTATC+TGG - Chr6:98307102-98307121 MsG0680035058.01.T01:intron 45.0%
AATTCTGGTCTGGGTCATCA+AGG + Chr6:98308890-98308909 None:intergenic 45.0%
AATTTGAAGGTGGGTGGAGT+GGG + Chr6:98312450-98312469 None:intergenic 45.0%
ACAACAACTTTACCAGGGTC+CGG - Chr6:98309486-98309505 MsG0680035058.01.T01:intron 45.0%
ACCATCTTAGGAATCGTGGT+TGG + Chr6:98309944-98309963 None:intergenic 45.0%
ACGGAGCAAGTGATTGAACA+TGG + Chr6:98312421-98312440 None:intergenic 45.0%
ACGTGGATATGGTCTCTGTA+AGG + Chr6:98311703-98311722 None:intergenic 45.0%
ACTCCACCCACCTTCAAATT+CGG - Chr6:98312450-98312469 MsG0680035058.01.T01:intron 45.0%
AGCATGCAAAGTTCGCAACA+TGG - Chr6:98309453-98309472 MsG0680035058.01.T01:intron 45.0%
AGTCCTTCTTACCCATATGC+TGG + Chr6:98307261-98307280 None:intergenic 45.0%
ATCAAGGGTCACTGTCTCAA+AGG - Chr6:98312688-98312707 MsG0680035058.01.T01:intron 45.0%
ATCACAGGCAACACTTTGTG+AGG - Chr6:98309108-98309127 MsG0680035058.01.T01:intron 45.0%
ATCAGAAAAGACTGAGGAGC+AGG + Chr6:98309189-98309208 None:intergenic 45.0%
ATGCAGCAAACAGATTCTGC+GGG + Chr6:98307413-98307432 None:intergenic 45.0%
CAATTGCCTTGTCAACCTGA+TGG + Chr6:98306564-98306583 None:intergenic 45.0%
CACAGAATTGCGGGTGTTAA+GGG - Chr6:98308860-98308879 MsG0680035058.01.T01:intron 45.0%
CAGAGCCTCTTCACGATTAT+GGG - Chr6:98309966-98309985 MsG0680035058.01.T01:intron 45.0%
CAGCCTCTTATCTGGAGATT+TGG - Chr6:98307110-98307129 MsG0680035058.01.T01:intron 45.0%
CCATCTTAGGAATCGTGGTT+GGG + Chr6:98309943-98309962 None:intergenic 45.0%
CCTAACACAACCCACAAAAC+CGG + Chr6:98309920-98309939 None:intergenic 45.0%
CGATTGCCTTGTCAAGATGA+TGG + Chr6:98313548-98313567 None:intergenic 45.0%
CTAACACAACCCCACAAAAC+CGG + Chr6:98310151-98310170 None:intergenic 45.0%
CTGAAAAGATCGAAGGGAGA+GGG + Chr6:98308670-98308689 None:intergenic 45.0%
GACAATTGGCCCTTGAAACA+AGG + Chr6:98308559-98308578 None:intergenic 45.0%
GATGTGTAATCTTGAGCGTG+AGG - Chr6:98310045-98310064 MsG0680035058.01.T01:intron 45.0%
GATTGATCTTTGGCTGGAAG+TGG + Chr6:98308739-98308758 None:intergenic 45.0%
GCATATGGGTAAGAAGGACT+TGG - Chr6:98307261-98307280 MsG0680035058.01.T01:intron 45.0%
GTCGATGAGATGCATGATAG+AGG - Chr6:98306484-98306503 MsG0680035058.01.T01:CDS 45.0%
GTGGGTACTTCAGTTCATGA+AGG + Chr6:98309359-98309378 None:intergenic 45.0%
GTGTGTTAAGAGTCCCACAT+CGG - Chr6:98310070-98310089 MsG0680035058.01.T01:intron 45.0%
TAGACGCCATAAGATAGGCT+CGG + Chr6:98307508-98307527 None:intergenic 45.0%
TAGCCAGCATATGGGTAAGA+AGG - Chr6:98307255-98307274 MsG0680035058.01.T01:intron 45.0%
TATCGAGTCCAACTATACCG+TGG - Chr6:98311059-98311078 MsG0680035058.01.T01:CDS 45.0%
TCACAGAATTGCGGGTGTTA+AGG - Chr6:98308859-98308878 MsG0680035058.01.T01:intron 45.0%
TCAGAGCCTCTTCACGATTA+TGG - Chr6:98309965-98309984 MsG0680035058.01.T01:intron 45.0%
TCTGGTGGCTAAACAAGTTC+AGG - Chr6:98310923-98310942 MsG0680035058.01.T01:intron 45.0%
TGACATCGCAAACATCAACC+CGG - Chr6:98306085-98306104 MsG0680035058.01.T01:CDS 45.0%
TGTGTAATCTTGAGCGTGAG+GGG - Chr6:98310047-98310066 MsG0680035058.01.T01:intron 45.0%
TTACCGAATTTGAAGGTGGG+TGG + Chr6:98312456-98312475 None:intergenic 45.0%
! AGAGGCTCTGATACCATCTT+AGG + Chr6:98309956-98309975 None:intergenic 45.0%
! CTGGTATCGAACCCTTGAAA+AGG + Chr6:98309037-98309056 None:intergenic 45.0%
! GACATTCAGCTCTGGTACAA+CGG + Chr6:98311288-98311307 None:intergenic 45.0%
! GGGGTATGGAGAATTTTCCT+AGG - Chr6:98311023-98311042 MsG0680035058.01.T01:intron 45.0%
! GTTGTTGTCATGTGATGGGA+AGG + Chr6:98309608-98309627 None:intergenic 45.0%
! TGGTCTCTCTTTTTGTCGGA+TGG + Chr6:98312132-98312151 None:intergenic 45.0%
! TTAAGAGTCCCACATCGGTT+AGG - Chr6:98310075-98310094 MsG0680035058.01.T01:intron 45.0%
!! CCGACGAGTTGATGGAAAAT+TGG - Chr6:98312843-98312862 MsG0680035058.01.T01:intron 45.0%
!! CGGTTTTGTGGGTTTGTGTT+AGG - Chr6:98310266-98310285 MsG0680035058.01.T01:intron 45.0%
!! CTCGTAACACGCTCTAGAAA+GGG + Chr6:98311227-98311246 None:intergenic 45.0%
!! GGTCTGGCCTTGAAATTGTT+TGG - Chr6:98307712-98307731 MsG0680035058.01.T01:intron 45.0%
!! TCTTTTTCACTAGCAGAGGC+AGG + Chr6:98306959-98306978 None:intergenic 45.0%
!!! ATCTAATTTTATTTTTTAAA+AGG - Chr6:98312058-98312077 MsG0680035058.01.T01:intron 5.0%
AGATCGAAGGGAGAGGGAAA+AGG + Chr6:98308664-98308683 None:intergenic 50.0%
AGGCCAACTCCTAAACGATG+TGG + Chr6:98309858-98309877 None:intergenic 50.0%
ATTATGGGCCACCTGTTGTC+AGG - Chr6:98309981-98310000 MsG0680035058.01.T01:intron 50.0%
CAACAACTTTACCAGGGTCC+GGG - Chr6:98309487-98309506 MsG0680035058.01.T01:intron 50.0%
CAACTCGTCGGAGCAATTCA+AGG + Chr6:98312834-98312853 None:intergenic 50.0%
CAACTTTACCAGTTGCGCCA+AGG - Chr6:98309624-98309643 MsG0680035058.01.T01:CDS 50.0%
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CCCAACCACGATTCCTAAGA+TGG - Chr6:98309940-98309959 MsG0680035058.01.T01:intron 50.0%
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GACTTGCCGAGCCTATCTTA+TGG - Chr6:98307499-98307518 MsG0680035058.01.T01:intron 50.0%
GCTGAAAAGATCGAAGGGAG+AGG + Chr6:98308671-98308690 None:intergenic 50.0%
GGCCAACTCCTAAACGATGT+GGG + Chr6:98309857-98309876 None:intergenic 50.0%
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! AACCTTCTTTTGTGGCGGCT+GGG + Chr6:98310436-98310455 None:intergenic 50.0%
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! ATTCAGCTCTGGTACAACGG+AGG + Chr6:98311285-98311304 None:intergenic 50.0%
! CATGATAAGGTGGTAGCGCT+TGG - Chr6:98312736-98312755 MsG0680035058.01.T01:intron 50.0%
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! GCGTGAACATAAATGACGGG+TGG + Chr6:98310021-98310040 None:intergenic 50.0%
! GTCATGTGATGGGAAGGTCA+CGG + Chr6:98309602-98309621 None:intergenic 50.0%
! TAACCTTCTTTTGTGGCGGC+TGG + Chr6:98310437-98310456 None:intergenic 50.0%
! TCATGTGATGGGAAGGTCAC+GGG + Chr6:98309601-98309620 None:intergenic 50.0%
!! ACCTCACAAGCCGGTTTTGT+GGG - Chr6:98309907-98309926 MsG0680035058.01.T01:intron 50.0%
!! CCGGTTTTGTGGGTTGTGTT+AGG - Chr6:98309917-98309936 MsG0680035058.01.T01:intron 50.0%
!! CCTCGTAACACGCTCTAGAA+AGG + Chr6:98311228-98311247 None:intergenic 50.0%
!! CCTTTCTAGAGCGTGTTACG+AGG - Chr6:98311225-98311244 MsG0680035058.01.T01:intron 50.0%
!! CGGTTTTGTGGGGTTGTGTT+AGG - Chr6:98310149-98310168 MsG0680035058.01.T01:intron 50.0%
AACTTTACCAGGGTCCGGGA+AGG - Chr6:98309491-98309510 MsG0680035058.01.T01:intron 55.0%
ACTTTACCAGGGTCCGGGAA+GGG - Chr6:98309492-98309511 MsG0680035058.01.T01:intron 55.0%
AGGCCAACTCCTAACCGATG+TGG + Chr6:98310087-98310106 None:intergenic 55.0%
GCAATCCTCACCTCACAAGC+CGG - Chr6:98309898-98309917 MsG0680035058.01.T01:intron 55.0%
GCTGGAAGTGGAACATGTGC+AGG + Chr6:98308727-98308746 None:intergenic 55.0%
GGCCAACTCCTAACCGATGT+GGG + Chr6:98310086-98310105 None:intergenic 55.0%
GGTGGCCCATAATCGTGAAG+AGG + Chr6:98309974-98309993 None:intergenic 55.0%
TGGGTGGAGTGGGATTCTGA+CGG + Chr6:98312440-98312459 None:intergenic 55.0%
! ACCTTCTTTTGTGGCGGCTG+GGG + Chr6:98310435-98310454 None:intergenic 55.0%
! GTCCCACATCGGTTAGGAGT+TGG - Chr6:98310081-98310100 MsG0680035058.01.T01:intron 55.0%
!! ACCCACAAAACCGGCTTGTG+AGG + Chr6:98309911-98309930 None:intergenic 55.0%
!! CAAAACCGGCTTGTGAGGTG+AGG + Chr6:98309906-98309925 None:intergenic 55.0%
!! CACCTCACAAGCCGGTTTTG+TGG - Chr6:98309906-98309925 MsG0680035058.01.T01:intron 55.0%
!! CCTCACAAGCCGGTTTTGTG+GGG - Chr6:98309908-98309927 MsG0680035058.01.T01:intron 55.0%
!! GAACTTGTTGCAGCTGCTGC+TGG - Chr6:98308502-98308521 MsG0680035058.01.T01:intron 55.0%
CTTTACCAGGGTCCGGGAAG+GGG - Chr6:98309493-98309512 MsG0680035058.01.T01:intron 60.0%
GAGGGTAACCTTGGCGCAAC+TGG + Chr6:98309635-98309654 None:intergenic 60.0%
TCCCCAGCCGCCACAAAAGA+AGG - Chr6:98310431-98310450 MsG0680035058.01.T01:intron 60.0%
!! CCCCACAAAACCGGCTTGTG+AGG + Chr6:98310142-98310161 None:intergenic 60.0%
GGGGAAGGAGTCCCGCCATT+TGG - Chr6:98309512-98309531 MsG0680035058.01.T01:CDS 65.0%
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GCGGGACTCCTTCCCCTTCC+CGG + Chr6:98309508-98309527 None:intergenic 70.0%
TCCTTCCCCTTCCCGGACCC+TGG + Chr6:98309501-98309520 None:intergenic 70.0%
TGGCGGCTGGGGAGTGACGT+AGG + Chr6:98310424-98310443 None:intergenic 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 98305907 98313659 98305907 ID=MsG0680035058.01;Name=MsG0680035058.01
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Chr6 exon 98313497 98313659 98313497 ID=MsG0680035058.01.T01:exon:13987;Parent=MsG0680035058.01.T01
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Chr6 exon 98305907 98306995 98305907 ID=MsG0680035058.01.T01:exon:13983;Parent=MsG0680035058.01.T01
Chr6 CDS 98313497 98313659 98313497 ID=MsG0680035058.01.T01:cds;Parent=MsG0680035058.01.T01
Chr6 CDS 98312878 98313081 98312878 ID=MsG0680035058.01.T01:cds;Parent=MsG0680035058.01.T01
Chr6 CDS 98311034 98311111 98311034 ID=MsG0680035058.01.T01:cds;Parent=MsG0680035058.01.T01
Chr6 CDS 98309497 98309753 98309497 ID=MsG0680035058.01.T01:cds;Parent=MsG0680035058.01.T01
Chr6 CDS 98305907 98306995 98305907 ID=MsG0680035058.01.T01:cds;Parent=MsG0680035058.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680035058.01.T01

ATGTACAACACCATTATTGATAGCATGTGCAAAGTTAAACTTGTTAATGAAGCTTTTGGTTTATATTCTGAAATGGTTTCTAAGAGAATTTCCTCTGATGTTTTCACTTACAGTGCTTTAATTAGTGGCTTTTGCATTGTTGGTAAATTGAAAGATGCAATTGTCGATGAGATGCATGATAGAGGTGTACCACCTGATATCATTACTTACAATTCTATATTGGATGCTTTATGCAAAAACCATCAGGTTGACAAGGCAATTGCGTTGTTAACGAAGATGAAAGACGAAGGAATTCAGCCAGATATGTGTACATACACAACACTTGTTGATGGTCAAAGGCTACATTCTAGATGTCAATATATATACCATACACCAACCAACATGGATGACATTGACTTACAATTCGATGAGATTGAACTTGTTGCAGCTGCTGCTGGATACTATTGTGTAAGTGTAACTTCAAATGTTAAATTTATTGTTAAGAGTCCCACATCGTTTAGGAGTTGGCCTGACAATTTGTTTAAGTGGGGGCAATCCTCACCTCACAAGCCGGTTTTGTGGGTTGTGTTAGGCCCAACCACGATTCCTAAGATGGTATCAGAGCCTCTTCACGATTATGGGCCACCTGTTGTCAGGTTTCTGTTATCGGGCCACCCGTCATTTATGTTCACGCTTCAGATGTGTAATCTTGAGCGTGAGGGGTTGCAACATCTTTATCAATTGTTTCTGTCAATTGGGTCTTATCCCTTTGCTTTTTCTGTATTGACAAAGATTCTCAAAAACGGTTACGAGCCAGATATCATAACATTGACTACACTCATCAAGGGTCACTGTCTCAAAGGTCAGATCCATCAAGCATTACACTTTCATGATAAGGTGGTAGCGCTTGGATTTCAATTGAACCATGTTAGTTATGGAACCTTGATTAATGGGTTGAGTAAAGTTGGTGAAACAAGAGCAGCCCTTGAATTGCTCCGACGAGTTGATGGAAAATTGGTTCAGCCTAATGTGGTAATGTACACTGCGATTATTGATAGTATGTGTAAAGATAAACATGTTAATGATGCTTTTGAATTATACTTTGAAATGGTTGCAAAGAGAATTTCTCCTAATGTTGTCACTTATAGTGCTTTAATTAATGGTTTTTGCATTGTTGGTAGAATTAAAGATGCAATTGATTTGTTTAATAAAATGATATTGGAAAACATCAACCCAGATGTGTACTTTAATATATTGGTTGATGAGTTTTGCAAAGAAGGAAAGATGAAAGAAGCTAAAAATGTGTTAGCTATGATGATGAAACAAGGCATTAAACCTGACGTTGTTACTTATAACTCTTTAATGGATGGATATTGCCTTGTTAAAGAATTGAATAAGGCTAAGAGTATATTCAACACTATGGCTCAGGGAGCAGTGAATCCTGATATTCACAGTTACAGTATCTTGATTAATGGATTTTGTAAGATTAAAATGATGGATGAAGCCATGTATCTCTTTGAAGAAATGCATTGCAAAAACATTATTCCCAATGTGGTAACTTACAGTTCCCTTATTGATGGTTTGTGTAAATCGGGGAAAATCTCTTATGCTTTAAAGCTAGTCGATGAGATGCATGATATGGGTCAACCACCAAATATAATTACTTACAGTTCTATATTGGATGCTCTATGCAAAAGCCATCATCTTGACAAGGCAATCGCATTATTATCAAAATTGAAAGATCGGGGTATTCTACCGAATATTTACACATACACTATTCTAATTGATGGATTTTGTAAAGGTGGAGACTAG
Protein sequence

>MsG0680035058.01.T01

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