AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580027118.01

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MsG0580027118.01.T01 AT3G53700 29.223 592 394 7 240 827 69 639 1.28e-81 278
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MsG0580027118.01.T01 AT1G63230 31.746 252 168 1 36 287 1 248 3.69e-41 154
MsG0580027118.01.T01 AT1G63230 28.869 336 207 4 246 576 1 309 3.60e-38 145
MsG0580027118.01.T01 AT1G63230 27.675 271 192 2 13 281 44 312 1.99e-35 137
MsG0580027118.01.T01 AT1G63230 25.740 338 223 6 113 446 8 321 1.45e-34 135
MsG0580027118.01.T01 AT1G63230 31.651 218 144 3 4 218 105 320 2.33e-32 129
MsG0580027118.01.T01 AT1G63230 27.160 243 177 0 5 247 71 313 2.60e-31 125
MsG0580027118.01.T01 AT1G63230 32.768 177 119 0 1 177 137 313 1.26e-29 120
MsG0580027118.01.T01 AT2G01740 27.339 545 354 6 322 830 2 540 7.02e-69 238
MsG0580027118.01.T01 AT2G01740 26.834 559 347 5 33 588 44 543 3.35e-62 220
MsG0580027118.01.T01 AT2G01740 24.954 549 346 8 1 544 47 534 8.42e-48 179
MsG0580027118.01.T01 AT2G01740 22.976 531 368 9 168 688 39 538 5.00e-42 162
MsG0580027118.01.T01 AT2G01740 28.115 313 195 1 5 287 228 540 2.76e-40 157
MsG0580027118.01.T01 AT2G01740 22.340 564 382 9 95 623 1 543 4.30e-31 129
MsG0580027118.01.T01 AT5G01110 24.430 614 409 3 77 688 190 750 7.28e-69 243
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MsG0580027118.01.T01 AT5G61400 27.536 414 290 3 373 779 230 640 6.28e-50 187
MsG0580027118.01.T01 AT5G61400 23.211 629 444 9 92 717 50 642 1.68e-45 174
MsG0580027118.01.T01 AT5G61400 21.828 536 366 2 15 550 169 651 1.04e-41 163
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MsG0580027118.01.T01 AT2G41720 21.702 470 367 1 340 808 44 513 6.54e-40 157
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MsG0580027118.01.T01 AT1G79080 26.477 457 332 3 374 827 68 523 8.20e-49 182
MsG0580027118.01.T01 AT1G79080 26.214 515 349 8 113 619 69 560 4.13e-38 151
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MsG0580027118.01.T01 AT5G38730 22.687 454 298 4 13 466 136 536 5.15e-28 120
MsG0580027118.01.T01 AT5G38730 24.653 288 216 1 1 288 264 550 2.69e-25 112
MsG0580027118.01.T01 AT5G38730 28.205 156 112 0 1 156 403 558 1.86e-14 77.8
MsG0580027118.01.T01 AT5G16420 32.857 280 187 1 549 828 187 465 2.07e-45 172
MsG0580027118.01.T01 AT5G16420 28.418 373 256 4 461 828 134 500 1.94e-43 166
MsG0580027118.01.T01 AT5G16420 27.358 318 229 2 364 681 178 493 1.79e-38 151
MsG0580027118.01.T01 AT5G16420 29.861 288 201 1 6 293 187 473 2.08e-37 148
MsG0580027118.01.T01 AT5G16420 26.710 307 223 2 339 645 188 492 4.08e-32 132
MsG0580027118.01.T01 AT5G16420 27.523 327 219 4 145 471 186 494 1.25e-30 127
MsG0580027118.01.T01 AT5G16420 23.077 312 233 4 517 823 82 391 2.56e-28 120
MsG0580027118.01.T01 AT5G16420 31.188 202 138 1 6 207 292 492 8.10e-24 107
MsG0580027118.01.T01 AT5G16420 25.446 224 165 1 75 296 186 409 3.43e-23 105
MsG0580027118.01.T01 AT5G16420 30.769 143 99 0 688 830 186 328 1.02e-18 90.9
MsG0580027118.01.T01 AT5G16420 32.857 280 187 1 549 828 187 465 2.07e-45 172
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MsG0580027118.01.T01 AT4G30825 20.464 733 538 14 111 830 170 870 3.66e-32 135
MsG0580027118.01.T01 AT4G30825 20.530 604 421 13 1 584 340 904 5.86e-19 92.8
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MsG0580027118.01.T01 AT1G32415 21.886 594 371 17 277 824 49 595 7.69e-25 111
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MsG0580027118.01.T01 AT1G71060 28.374 289 191 4 13 295 200 478 5.30e-28 119
MsG0580027118.01.T01 AT1G71060 21.392 388 292 6 407 790 123 501 4.18e-27 116
MsG0580027118.01.T01 AT1G71060 21.935 310 238 2 521 830 131 436 1.84e-26 114
MsG0580027118.01.T01 AT1G71060 21.429 280 215 3 4 281 122 398 2.92e-20 95.9
MsG0580027118.01.T01 AT1G71060 20.566 389 283 7 73 456 121 488 2.26e-17 86.7
MsG0580027118.01.T01 AT1G77360 23.760 383 288 3 433 815 84 462 7.54e-37 145
MsG0580027118.01.T01 AT1G77360 26.801 347 251 3 483 829 98 441 1.50e-34 139
MsG0580027118.01.T01 AT1G77360 26.277 274 200 2 552 825 97 368 1.18e-32 133
MsG0580027118.01.T01 AT1G77360 23.936 376 262 6 45 418 98 451 1.59e-29 124
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MsG0580027118.01.T01 AT3G04130 24.561 228 170 2 60 286 170 396 6.22e-19 91.7
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MsG0580027118.01.T01 AT1G16830 19.737 228 176 2 606 830 126 349 7.49e-11 66.2
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MsG0580027118.01.T01 AT1G71210 21.860 645 425 12 191 822 188 766 1.03e-26 117
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MsG0580027118.01.T01 AT1G71210 20.866 508 371 8 10 509 249 733 1.55e-19 94.7
MsG0580027118.01.T01 AT1G71210 21.993 291 216 5 1 285 383 668 1.17e-13 75.5
MsG0580027118.01.T01 AT1G71210 21.065 413 286 10 12 414 464 846 1.17e-13 75.5
MsG0580027118.01.T01 AT1G71210 21.975 314 233 5 523 830 187 494 2.38e-12 71.2
MsG0580027118.01.T01 AT1G71210 25.339 221 158 5 10 228 603 818 4.34e-11 67.4
MsG0580027118.01.T01 AT1G74750 24.793 363 267 4 382 743 296 653 3.13e-32 135
MsG0580027118.01.T01 AT1G74750 26.909 275 201 0 555 829 361 635 8.92e-30 127
MsG0580027118.01.T01 AT1G74750 26.780 295 216 0 520 814 361 655 1.91e-26 116
MsG0580027118.01.T01 AT1G74750 24.727 275 207 0 12 286 361 635 7.27e-25 111
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MsG0580027118.01.T01 AT2G38420 24.206 252 189 1 31 280 165 416 3.10e-17 85.9
MsG0580027118.01.T01 AT2G38420 28.877 187 119 3 67 246 273 452 2.26e-16 83.2
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MsG0580027118.01.T01 AT5G27270 19.372 733 514 13 15 704 192 890 4.01e-24 109
MsG0580027118.01.T01 AT5G27270 20.339 413 327 2 404 816 180 590 2.68e-20 97.1
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MsG0580027118.01.T01 AT1G63320 30.469 128 78 2 170 287 1 127 5.16e-12 65.9
MsG0580027118.01.T01 AT1G63320 27.559 127 83 1 713 830 1 127 6.01e-11 62.8
MsG0580027118.01.T01 AT3G62890 21.961 510 333 10 330 825 12 470 1.86e-27 118
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MsG0580027118.01.T01 AT1G08070 25.000 256 180 4 9 264 133 376 2.97e-15 80.5
MsG0580027118.01.T01 AT1G08070 23.827 277 197 5 9 281 230 496 8.41e-14 75.9
MsG0580027118.01.T01 AT1G08070 19.065 556 405 12 9 558 98 614 1.06e-13 75.5
MsG0580027118.01.T01 AT1G08070 19.057 509 332 10 169 672 87 520 2.18e-13 74.7
MsG0580027118.01.T01 AT3G17370 29.949 197 123 4 521 716 17 199 2.65e-27 110
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MsG0580027118.01.T01 AT1G11630 25.837 209 155 0 514 722 178 386 3.62e-18 88.2
MsG0580027118.01.T01 AT1G11630 26.108 203 150 0 479 681 178 380 6.06e-18 87.4
MsG0580027118.01.T01 AT1G11630 23.451 226 172 1 606 830 129 354 3.40e-17 85.1
MsG0580027118.01.T01 AT1G11630 23.715 253 192 1 536 787 129 381 1.34e-16 83.6
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MsG0580027118.01.T01 AT4G33990 21.326 558 365 14 1 525 137 653 1.84e-15 81.3
MsG0580027118.01.T01 AT4G33990 21.465 396 258 9 471 828 58 438 1.24e-14 78.6
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MsG0580027118.01.T01 AT3G29290 20.896 469 338 10 382 824 25 486 1.18e-17 87.8
MsG0580027118.01.T01 AT3G29290 24.000 275 208 1 8 281 212 486 1.58e-15 80.9
MsG0580027118.01.T01 AT3G29290 22.259 301 229 3 533 829 122 421 6.71e-14 75.9
MsG0580027118.01.T01 AT3G29290 21.538 455 324 12 12 459 109 537 8.94e-13 72.4
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MsG0580027118.01.T01 AT1G05750 23.577 369 218 10 483 807 36 384 7.77e-22 100
MsG0580027118.01.T01 AT1G05750 21.538 455 323 13 316 761 12 441 8.92e-20 94.0
MsG0580027118.01.T01 AT1G05750 23.704 270 190 7 15 281 113 369 1.12e-12 71.6
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MsG0580027118.01.T01 AT3G60040 30.899 178 98 2 533 695 445 612 1.11e-16 85.1
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MsG0580027118.01.T01 AT3G60040 33.043 115 75 1 107 219 495 609 2.19e-14 77.8
MsG0580027118.01.T01 AT3G60040 32.479 117 79 0 607 723 489 605 2.74e-14 77.4
MsG0580027118.01.T01 AT3G60040 36.190 105 67 0 514 618 501 605 6.50e-14 76.3
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MsG0580027118.01.T01 AT3G60040 29.060 117 83 0 64 180 489 605 1.97e-11 68.2
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MsG0580027118.01.T01 AT3G53170 27.148 291 193 8 373 649 175 460 1.79e-16 83.6
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MsG0580027118.01.T01 AT3G50420 22.391 527 344 13 305 788 160 664 1.71e-21 100
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MsG0580027118.01.T01 AT3G60040 37.607 117 73 0 712 828 709 825 1.53e-19 94.7
MsG0580027118.01.T01 AT3G60040 30.899 178 98 2 533 695 665 832 1.52e-16 85.1
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MsG0580027118.01.T01 AT2G03880 21.713 502 326 14 331 824 85 527 1.72e-14 77.8
MsG0580027118.01.T01 AT2G03880 25.820 244 162 6 45 285 127 354 5.20e-14 76.3
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MsG0580027118.01.T01 AT5G44230 24.390 328 226 8 504 824 99 411 4.19e-18 89.7
MsG0580027118.01.T01 AT5G44230 21.785 381 246 10 378 754 115 447 1.69e-14 78.2
MsG0580027118.01.T01 AT5G44230 22.857 315 189 11 374 683 212 477 5.44e-13 73.2
MsG0580027118.01.T01 AT5G48910 21.600 375 242 8 478 807 85 452 4.43e-18 89.4
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MsG0580027118.01.T01 AT4G20770 19.259 675 479 19 180 820 36 678 6.62e-18 89.4
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MsG0580027118.01.T01 AT1G30610 22.118 425 292 8 434 828 456 871 6.70e-18 89.4
MsG0580027118.01.T01 AT1G30610 27.136 199 128 3 83 265 510 707 2.27e-14 78.2
MsG0580027118.01.T01 AT1G30610 23.183 289 201 4 9 285 592 871 9.14e-13 72.8
MsG0580027118.01.T01 AT1G30610 20.751 506 322 16 312 777 424 890 9.00e-11 66.2
MsG0580027118.01.T01 AT4G30700 20.903 421 279 11 409 827 182 550 7.62e-18 89.0
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MsG0580027118.01.T01 AT5G08305 20.859 326 247 4 504 828 59 374 2.69e-15 80.1
MsG0580027118.01.T01 AT5G08305 20.170 352 257 7 340 684 71 405 7.27e-14 75.9
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MsG0580027118.01.T01 AT1G12615 28.369 141 99 1 583 721 5 145 8.50e-13 67.4
MsG0580027118.01.T01 AT1G12615 28.571 147 103 1 509 653 1 147 1.01e-11 64.3
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MsG0580027118.01.T01 AT1G12615 28.082 146 100 3 121 263 16 159 3.00e-11 63.2
MsG0580027118.01.T01 AT1G12615 22.400 125 95 1 75 197 5 129 7.33e-11 62.0
MsG0580027118.01.T01 AT3G23330 20.760 342 229 7 517 825 97 429 2.09e-17 87.0
MsG0580027118.01.T01 AT3G23330 19.728 441 292 10 325 758 82 467 1.86e-15 80.9
MsG0580027118.01.T01 AT3G23330 21.875 256 192 2 9 264 97 344 5.58e-12 69.7
MsG0580027118.01.T01 AT3G23330 21.098 346 223 9 517 825 206 538 2.16e-17 87.4
MsG0580027118.01.T01 AT3G23330 19.728 441 292 10 325 758 191 576 3.70e-15 80.1
MsG0580027118.01.T01 AT3G23330 21.875 256 192 2 9 264 206 453 3.62e-12 70.5

Find 164 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 516 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TGTTACTTATACTTCTTTAA+TGG 0.179283 5:-53956750 MsG0580027118.01.T01:CDS
ATTGATGGACTTTGCCAATT+AGG 0.181096 5:-53956521 MsG0580027118.01.T01:CDS
ACCCCACCCATATTTGAATT+TGG 0.196131 5:-53957499 MsG0580027118.01.T01:CDS
GATCTTACCAAATTCAAATA+TGG 0.209628 5:+53957492 None:intergenic
AGGGAAAATATCTGATGTTT+TGG 0.232147 5:-53956501 MsG0580027118.01.T01:CDS
TTTAGTGGATGGGTGTTTCT+TGG 0.238314 5:-53964335 MsG0580027118.01.T01:CDS
GTCTTCCATTTCTGACAATA+AGG 0.240398 5:+53956163 None:intergenic
ATCAAAGGTCTATGTCTTAA+TGG 0.243510 5:-53957259 MsG0580027118.01.T01:CDS
ACTTACAGTACTTTAATATA+TGG 0.244085 5:-53956956 MsG0580027118.01.T01:CDS
GTTTGAAAAGTTACAGCATT+AGG 0.265416 5:+53956128 None:intergenic
TTGATGGACTTTGCCAATTA+GGG 0.269728 5:-53956520 MsG0580027118.01.T01:CDS
TTTAATGGATGGTTATTTCT+TGG 0.278834 5:-53956735 MsG0580027118.01.T01:CDS
TATTAAAAGTACAAACATTC+AGG 0.289472 5:+53964464 None:intergenic
ATGTATAATGTGATGGTTAA+TGG 0.289694 5:-53956221 MsG0580027118.01.T01:CDS
AAAGATTTATCGGGATCTTA+TGG 0.293596 5:-53963870 MsG0580027118.01.T01:CDS
ATTGATGGGTTATGTAAAAT+AGG 0.293892 5:-53957154 MsG0580027118.01.T01:CDS
GTATTCATTGTTATGGTATC+AGG 0.294450 5:+53957286 None:intergenic
GAGTTGTATGTTACAGTATT+AGG 0.299817 5:+53956548 None:intergenic
CGGGGAAAATATCTGATGTT+TGG 0.304108 5:-53964102 MsG0580027118.01.T01:CDS
CATTACTTATACTTCTTTAG+TGG 0.306751 5:-53964350 MsG0580027118.01.T01:CDS
CACCTTGACCAGGTTAGTTA+TGG 0.307472 5:-53957184 MsG0580027118.01.T01:CDS
CGGATTATGCAAGCATAAAA+TGG 0.320364 5:-53956621 MsG0580027118.01.T01:CDS
TTTGAAAAGTTACAGCATTA+GGG 0.323750 5:+53956129 None:intergenic
CGGATTATGTAAGAATAAAA+TGG 0.324520 5:-53964221 MsG0580027118.01.T01:CDS
AGGGTTATAATTTAGATGTT+AGG 0.325102 5:-53956244 MsG0580027118.01.T01:CDS
ATTGTGTATGTGAACATATT+TGG 0.328770 5:+53963938 None:intergenic
ATGTTAAAAGTACGAACATT+TGG 0.335812 5:+53956863 None:intergenic
ATGAAACGAATTGGGAGTTA+TGG 0.339699 5:+53957624 None:intergenic
ACATACACAATACTTGTTGA+TGG 0.342765 5:-53956326 MsG0580027118.01.T01:CDS
ACATACACAATACTTGTTGA+TGG 0.342765 5:-53963926 MsG0580027118.01.T01:CDS
GGATGCACAAAATTTATATC+AGG 0.344001 5:-53956279 MsG0580027118.01.T01:CDS
GAACTGTATGCTACAATATC+AGG 0.350034 5:+53964148 None:intergenic
GATAAGTGTATTCATTGTTA+TGG 0.350125 5:+53957279 None:intergenic
TTATCGGGATCTTATGGTTA+AGG 0.352336 5:-53963864 MsG0580027118.01.T01:CDS
AGCTATAGTGTTATGATTAA+CGG 0.354517 5:-53964241 MsG0580027118.01.T01:CDS
AAAACCTAACTTAAGAATCT+TGG 0.358085 5:+53957312 None:intergenic
AGCTACAGTGTTATGATTAA+CGG 0.360398 5:-53956641 MsG0580027118.01.T01:CDS
GCATACAGTTCGCTTATTGA+TGG 0.367648 5:-53964136 MsG0580027118.01.T01:CDS
TTGGCCAAGATTCTTAAGTT+AGG 0.368021 5:-53957316 MsG0580027118.01.T01:CDS
TCGACGATGATGAAACGAAT+TGG 0.373406 5:+53957615 None:intergenic
TGTTAAAAGTACGAACATTT+GGG 0.373790 5:+53956864 None:intergenic
AGGAAATAGCAGTGTGGAAA+TGG 0.375603 5:+53957446 None:intergenic
AGGGATATCATTTAAATGCT+TGG 0.377925 5:-53963844 MsG0580027118.01.T01:CDS
ACCTTGACCAGGTTAGTTAT+GGG 0.381805 5:-53957183 MsG0580027118.01.T01:CDS
ATTAATTGTTACTCCCATCT+TGG 0.388551 5:-53957364 MsG0580027118.01.T01:CDS
ATTGATGGACTTTGCAAATC+GGG 0.390070 5:-53964121 MsG0580027118.01.T01:CDS
AGGATGCACAAAAGATTTAT+CGG 0.392792 5:-53963880 MsG0580027118.01.T01:CDS
GGGGAAAATATCTGATGTTT+GGG 0.394640 5:-53964101 MsG0580027118.01.T01:CDS
ACATACAACTCACTTATTGA+TGG 0.395902 5:-53956536 MsG0580027118.01.T01:CDS
GAAGTATAAGTAATGACAAT+AGG 0.405772 5:+53964358 None:intergenic
TATCGGGATCTTATGGTTAA+GGG 0.409513 5:-53963863 MsG0580027118.01.T01:CDS
AGTTATGGGACCTTGATTGA+TGG 0.409827 5:-53957169 MsG0580027118.01.T01:CDS
ATGTCTTAATGGCAAGGTTA+AGG 0.412687 5:-53957248 MsG0580027118.01.T01:CDS
AACATCATCATGAAAGTAAA+GGG 0.419733 5:+53957222 None:intergenic
GTACTGTAAGTGATAACATT+AGG 0.420496 5:+53956968 None:intergenic
TGAAACGAATTGGGAGTTAT+GGG 0.421927 5:+53957625 None:intergenic
TGCATAATGTCATGATTAAC+GGG 0.428148 5:-53963820 MsG0580027118.01.T01:CDS
AATGTCCTTATTGTCAGAAA+TGG 0.429894 5:-53956168 MsG0580027118.01.T01:CDS
CATGATGATGTTAGAGCTAA+GGG 0.431140 5:-53957211 MsG0580027118.01.T01:CDS
TGTATAATGTGATGGTTAAT+GGG 0.436936 5:-53956220 MsG0580027118.01.T01:CDS
ATATCAGGATCTTCTGATGA+AGG 0.438234 5:-53956264 MsG0580027118.01.T01:CDS
CACATATGTATTCAACACTA+TGG 0.438364 5:-53964293 MsG0580027118.01.T01:CDS
CAATTCTTTGAAGAGATTGA+CGG 0.438947 5:+53964189 None:intergenic
TATTGATGGACTTTGCAAAT+CGG 0.440470 5:-53964122 MsG0580027118.01.T01:CDS
ACATATTTGGTTCAATTCCC+TGG 0.440936 5:+53963951 None:intergenic
ATCTTACCAAATTCAAATAT+GGG 0.443522 5:+53957493 None:intergenic
GTTCTTACAAAGATTGATGA+TGG 0.443914 5:-53957109 MsG0580027118.01.T01:CDS
CACACATGTATTCAACACTA+TGG 0.445628 5:-53956693 MsG0580027118.01.T01:CDS
GAGTTCCATTTGTTTAGAAA+AGG 0.450377 5:+53957426 None:intergenic
GTTTCGTAAGTTACAACATC+AGG 0.451834 5:+53963728 None:intergenic
ACTTATACTTCTTTAGTGGA+TGG 0.452787 5:-53964346 MsG0580027118.01.T01:CDS
ATGCATAATGTCATGATTAA+CGG 0.453140 5:-53963821 MsG0580027118.01.T01:CDS
TAACATCATCATGAAAGTAA+AGG 0.455799 5:+53957221 None:intergenic
ATTCAACACTATGGCTCAAA+GGG 0.460054 5:-53956684 MsG0580027118.01.T01:CDS
ATTGTTCGTACTGTCTGAAA+TGG 0.460208 5:-53963768 MsG0580027118.01.T01:CDS
TGCATTGTTCACAAACCATC+AGG 0.462450 5:-53956411 MsG0580027118.01.T01:CDS
ATTGGTCGATGGTTTATGTA+AGG 0.464387 5:-53956840 MsG0580027118.01.T01:CDS
TTTACATAACCCATCAATCA+AGG 0.466405 5:+53957159 None:intergenic
CATATCATTTAACATATCAA+TGG 0.469559 5:+53956904 None:intergenic
TCTTGGTTAAAGAAGTGAGC+AGG 0.469859 5:-53956718 MsG0580027118.01.T01:CDS
CTTATACTTCTTTAGTGGAT+GGG 0.473945 5:-53964345 MsG0580027118.01.T01:CDS
GTTGATGGTTTATACAAGGA+AGG 0.476383 5:-53964436 MsG0580027118.01.T01:CDS
CGACGATGATGAAACGAATT+GGG 0.476586 5:+53957616 None:intergenic
ATTGTGTATGTGAACATATC+TGG 0.477584 5:+53956338 None:intergenic
AATTCAAATATGGGTGGGGT+AGG 0.481226 5:+53957502 None:intergenic
GTTAATGGGCTTTGTAAAGA+GGG 0.481662 5:-53956206 MsG0580027118.01.T01:CDS
TCATGATGATGTTAGAGCTA+AGG 0.483020 5:-53957212 MsG0580027118.01.T01:CDS
GGAAACAGCGTCGTCAACAT+TGG 0.484914 5:+53957555 None:intergenic
GAAACAGCGTCGTCAACATT+GGG 0.485070 5:+53957556 None:intergenic
GTTATGGGACCTTGATTGAT+GGG 0.487183 5:-53957168 MsG0580027118.01.T01:CDS
GGATGCACAAAAGATTTATC+GGG 0.488000 5:-53963879 MsG0580027118.01.T01:CDS
TGTTGCTTTCAAACAAAGCA+TGG 0.493371 5:+53956099 None:intergenic
AAAATTGAGGTGACCAAGAT+GGG 0.495650 5:+53957351 None:intergenic
CAAAATTGAGGTGACCAAGA+TGG 0.496380 5:+53957350 None:intergenic
ACATATCTGGTTCAATTCCC+TGG 0.498343 5:+53956351 None:intergenic
ACTTATACTTCTTTAATGGA+TGG 0.500814 5:-53956746 MsG0580027118.01.T01:CDS
ACACTGTAGCTATGAACATC+AGG 0.506602 5:+53956653 None:intergenic
GGTTAATGGGCTTTGTAAAG+AGG 0.509478 5:-53956207 MsG0580027118.01.T01:CDS
CACTATGGTTCGAAGGGGAG+TGG 0.510786 5:-53964278 MsG0580027118.01.T01:CDS
ACCAAATTCAAATATGGGTG+GGG 0.518332 5:+53957498 None:intergenic
GATTAACGGGCTTTGTAAAG+AGG 0.518600 5:-53963807 MsG0580027118.01.T01:CDS
ATGAAGGATGCGATTGAAAG+AGG 0.520105 5:+53957534 None:intergenic
TGAAAGCAACAAGAATGATA+AGG 0.524398 5:-53956087 MsG0580027118.01.T01:CDS
CGAAAACGACAAGAATGATA+AGG 0.526016 5:-53963687 MsG0580027118.01.T01:CDS
CGTTCTTCTTCAGGTTAACA+AGG 0.532555 5:-53957666 MsG0580027118.01.T01:intron
TACCAAATTCAAATATGGGT+GGG 0.534078 5:+53957497 None:intergenic
ATTCAAATATGGGTGGGGTA+GGG 0.537035 5:+53957503 None:intergenic
TATCAGGATCTTCTGATGAA+GGG 0.539134 5:-53956263 MsG0580027118.01.T01:CDS
ATTAAAAGTACAAACATTCA+GGG 0.540349 5:+53964465 None:intergenic
GTGTTGTACATGACGACATC+AGG 0.542217 5:+53957073 None:intergenic
TGAAACAACAGCTGCCATGC+AGG 0.543423 5:-53957131 MsG0580027118.01.T01:CDS
CTTGGTTAAAGAAGTGAACA+AGG 0.544300 5:-53964317 MsG0580027118.01.T01:CDS
ATTAACGGGCTTTGTAAAGA+GGG 0.546855 5:-53963806 MsG0580027118.01.T01:CDS
AAAGATTGATGATGGGCTGT+TGG 0.547381 5:-53957101 MsG0580027118.01.T01:CDS
ATTGAAGAAGATCAAAGACC+AGG 0.548396 5:-53963969 MsG0580027118.01.T01:CDS
GTCGATGGTTTATGTAAGGT+AGG 0.548857 5:-53956836 MsG0580027118.01.T01:CDS
TATTCAACACTATGGTTCGA+AGG 0.552511 5:-53964285 MsG0580027118.01.T01:CDS
GGAGTAACAATTAATCAAGA+TGG 0.558131 5:+53957372 None:intergenic
TATTCAACACTATGGCTCAA+AGG 0.560718 5:-53956685 MsG0580027118.01.T01:CDS
GGGTAGGGTTGTTCATATGA+AGG 0.568277 5:+53957518 None:intergenic
CATAGTGTTGAATACATATG+TGG 0.569642 5:+53964294 None:intergenic
TTGATGGACTTTGCAAATCG+GGG 0.576229 5:-53964120 MsG0580027118.01.T01:CDS
CTTGGTTAAAGAAGTGAGCA+GGG 0.577184 5:-53956717 MsG0580027118.01.T01:CDS
AGGTCTATGTCTTAATGGCA+AGG 0.579393 5:-53957254 MsG0580027118.01.T01:CDS
ATTGACGAAGATCAAAGACC+AGG 0.579700 5:-53956369 MsG0580027118.01.T01:CDS
TTCTTACAAAGATTGATGAT+GGG 0.581654 5:-53957108 MsG0580027118.01.T01:CDS
CATTTCACGTAGAAGTTCCA+CGG 0.581831 5:+53956064 None:intergenic
CAATTGCCTTGTCAACCTGA+TGG 0.582934 5:+53956396 None:intergenic
CAACAAGAATGATAAGGCCG+TGG 0.583421 5:-53956081 MsG0580027118.01.T01:CDS
ATTGGTTGATGGTTTATACA+AGG 0.584510 5:-53964440 MsG0580027118.01.T01:CDS
CTTCGTGAAATGCTTTCTAG+AGG 0.585617 5:-53963653 MsG0580027118.01.T01:CDS
TTGGGAATGAACGAAGGCAA+TGG 0.586061 5:+53957574 None:intergenic
CACAAACCATCAGGTTGACA+AGG 0.586429 5:-53956402 MsG0580027118.01.T01:CDS
ATAGATGAGATGCATGATAG+AGG 0.587032 5:-53956473 MsG0580027118.01.T01:CDS
ATAGATGAGATGCATGATAG+AGG 0.587032 5:-53964073 MsG0580027118.01.T01:CDS
TAAGGGATTTCACCTTGACC+AGG 0.588776 5:-53957194 MsG0580027118.01.T01:CDS
TTGAAAAGTTACAGCATTAG+GGG 0.589014 5:+53956130 None:intergenic
ATTCAACACTATGGTTCGAA+GGG 0.589211 5:-53964284 MsG0580027118.01.T01:CDS
TTAGCTGTTATGATAAAACT+AGG 0.589388 5:-53964388 MsG0580027118.01.T01:CDS
TCAAGGTCCCATAACTAACC+TGG 0.595363 5:+53957176 None:intergenic
TGGTTTATGTAAGGTAGGAG+AGG 0.597337 5:-53956831 MsG0580027118.01.T01:CDS
ACAATGAATACACTTATCAA+AGG 0.603240 5:-53957274 MsG0580027118.01.T01:CDS
AATTATGAATAGTTTATGCA+AGG 0.605408 5:-53957050 MsG0580027118.01.T01:CDS
TGGTTTATACAAGGAAGGAG+AGG 0.605855 5:-53964431 MsG0580027118.01.T01:CDS
TCCCATAACTAACCTGGTCA+AGG 0.606203 5:+53957182 None:intergenic
TTACCAAATTCAAATATGGG+TGG 0.606850 5:+53957496 None:intergenic
ATTATGTAAGAATAAAATGG+TGG 0.609528 5:-53964218 MsG0580027118.01.T01:CDS
TTGTCAGAAATGGAAGACAA+TGG 0.613579 5:-53956158 MsG0580027118.01.T01:CDS
TTGAAGAAGATCAAAGACCA+GGG 0.621177 5:-53963968 MsG0580027118.01.T01:CDS
TGTTATGATAAAACTAGGTG+TGG 0.639504 5:-53964383 MsG0580027118.01.T01:CDS
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AATCTTTGTAAGAACCTGCA+TGG 0.642036 5:+53957117 None:intergenic
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CAATTGCCATGTCAACCTGA+TGG 0.645529 5:+53963996 None:intergenic
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TCAACATTGGGAATGAACGA+AGG 0.690281 5:+53957568 None:intergenic
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TAGAAAAGGAAATAGCAGTG+TGG 0.715195 5:+53957440 None:intergenic
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TTGGCTGTTATGATAAGACA+AGG 0.777483 5:-53956788 MsG0580027118.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
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!! AATAAAAATGAAATAAAAGT+AGG + Chr5:53958153-53958172 None:intergenic 10.0%
!! ATAATGAAAAATAAAATGTA+TGG - Chr5:53961934-53961953 MsG0580027118.01.T01:intron 10.0%
!! CCAAAAAAATAAAAAATTAA+TGG + Chr5:53962550-53962569 None:intergenic 10.0%
!! TATATAATGATAAAGATTAA+AGG + Chr5:53959326-53959345 None:intergenic 10.0%
!!! CCATTAATTTTTTATTTTTT+TGG - Chr5:53962547-53962566 MsG0580027118.01.T01:intron 10.0%
!!! TATCTTTCATTTTTTTTTAT+AGG + Chr5:53961397-53961416 None:intergenic 10.0%
!!! TTTATTTGTATTTTTTTCTT+TGG - Chr5:53959269-53959288 MsG0580027118.01.T01:intron 10.0%
!!! TTTCTTTTACAATATTTTTT+TGG - Chr5:53961108-53961127 MsG0580027118.01.T01:intron 10.0%
!! AAAATAAAAAGAGGTAAAAA+AGG - Chr5:53962784-53962803 MsG0580027118.01.T01:intron 15.0%
!! ATATTAGACAAAATAAAAAG+AGG - Chr5:53962775-53962794 MsG0580027118.01.T01:intron 15.0%
!! CAAGAATAAATTAGATAATT+CGG + Chr5:53960311-53960330 None:intergenic 15.0%
!! TTCAATCAATAATATAAACT+AGG - Chr5:53960605-53960624 MsG0580027118.01.T01:intron 15.0%
!!! AAGTAAGCTAATTTTTTTTT+AGG - Chr5:53958483-53958502 MsG0580027118.01.T01:intron 15.0%
!! AAGACTTTAATTGAACAAAA+AGG - Chr5:53960133-53960152 MsG0580027118.01.T01:intron 20.0%
!! AATCTGTTATTATGTTCTAA+AGG - Chr5:53958832-53958851 MsG0580027118.01.T01:intron 20.0%
!! AATTATGAATAGTTTATGCA+AGG - Chr5:53963477-53963496 MsG0580027118.01.T01:intron 20.0%
!! ACTTACAGTACTTTAATATA+TGG - Chr5:53963571-53963590 MsG0580027118.01.T01:intron 20.0%
!! AGAATTGCATTTAAAAAACA+TGG - Chr5:53956354-53956373 MsG0580027118.01.T01:CDS 20.0%
!! AGGTAAATTATTTAAGTAGT+TGG - Chr5:53957457-53957476 MsG0580027118.01.T01:CDS 20.0%
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!! ATCTTACCAAATTCAAATAT+GGG + Chr5:53963037-53963056 None:intergenic 20.0%
!! ATGTATAATGTGATGATTAA+TGG - Chr5:53957928-53957947 MsG0580027118.01.T01:intron 20.0%
!! ATTATGTAAGAATAAAATGG+TGG - Chr5:53956309-53956328 MsG0580027118.01.T01:CDS 20.0%
!! CATAGAATATATACTGTAAT+AGG - Chr5:53959024-53959043 MsG0580027118.01.T01:intron 20.0%
!! CATATCATTTAACATATCAA+TGG + Chr5:53963626-53963645 None:intergenic 20.0%
!! GGTAAATTATTTAAGTAGTT+GGG - Chr5:53957458-53957477 MsG0580027118.01.T01:CDS 20.0%
!! GTAAAGTGATTAAGATTAAT+TGG - Chr5:53960197-53960216 MsG0580027118.01.T01:intron 20.0%
!! GTAAATTATTTAAGTAGTTG+GGG - Chr5:53957459-53957478 MsG0580027118.01.T01:CDS 20.0%
!! TAAACCGTAAATCAATTTAA+AGG - Chr5:53960526-53960545 MsG0580027118.01.T01:intron 20.0%
!! TAAAGATTAAAGGAAATACA+AGG + Chr5:53959316-53959335 None:intergenic 20.0%
!! TAATTTCTTACTATGTCTTT+CGG + Chr5:53957693-53957712 None:intergenic 20.0%
!! TAGTGCAATAATGAAAATAA+CGG - Chr5:53960171-53960190 MsG0580027118.01.T01:intron 20.0%
!! TATTACAAATAGAGTACAAT+AGG - Chr5:53957810-53957829 MsG0580027118.01.T01:intron 20.0%
!! TATTTATAAGGAGCTAAAAT+CGG - Chr5:53960856-53960875 MsG0580027118.01.T01:intron 20.0%
!! TCAAACTAAAATCAAAGTTA+CGG + Chr5:53958645-53958664 None:intergenic 20.0%
!! TTCAAGTAGTAAAGTTAAAA+CGG - Chr5:53960059-53960078 MsG0580027118.01.T01:intron 20.0%
!!! AAACTTTCATTTTTCTTGTT+TGG + Chr5:53962034-53962053 None:intergenic 20.0%
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!!! AAATTTGCCTTAAGTTATTT+TGG - Chr5:53962610-53962629 MsG0580027118.01.T01:intron 20.0%
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!!! AATATATGGATTTTGTATTG+TGG - Chr5:53963585-53963604 MsG0580027118.01.T01:intron 20.0%
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!!! ACACCTCTTTTATATTTATA+AGG - Chr5:53960844-53960863 MsG0580027118.01.T01:intron 20.0%
!!! ATATATGGATTTTGTATTGT+GGG - Chr5:53963586-53963605 MsG0580027118.01.T01:intron 20.0%
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!!! ATTAAAAGTACAAACATTCA+GGG + Chr5:53956065-53956084 None:intergenic 20.0%
!!! CATTTTCTTAGTTTTCTTTA+TGG - Chr5:53959649-53959668 MsG0580027118.01.T01:intron 20.0%
!!! CTTTTAGTTCTTTTTGATAT+TGG + Chr5:53962455-53962474 None:intergenic 20.0%
!!! GTCTTTATTTCTAATTACTT+TGG + Chr5:53957671-53957690 None:intergenic 20.0%
!!! TATTAAAAGTACAAACATTC+AGG + Chr5:53956066-53956085 None:intergenic 20.0%
!!! TATTTCCTTTTCTAAACAAA+TGG - Chr5:53963096-53963115 MsG0580027118.01.T01:intron 20.0%
!!! TATTTTCATATAGCAACAAA+GGG - Chr5:53958706-53958725 MsG0580027118.01.T01:intron 20.0%
!!! TGAAAACATATTACGATTTT+TGG + Chr5:53960821-53960840 None:intergenic 20.0%
!!! TGTTACTTATACTTCTTTAA+TGG - Chr5:53963777-53963796 MsG0580027118.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGTTTGTACTTTTAATACAT+TGG - Chr5:53956069-53956088 MsG0580027118.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTATTTTCATATAGCAACAA+AGG - Chr5:53958705-53958724 MsG0580027118.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTCTTACTTTACACTATTT+TGG + Chr5:53958399-53958418 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTAACTTTACTACTTGAA+CGG + Chr5:53960059-53960078 None:intergenic 20.0%
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! AAAACCTAACTTAAGAATCT+TGG + Chr5:53963218-53963237 None:intergenic 25.0%
! AAAGATGGCAAAAACAATTA+TGG + Chr5:53960005-53960024 None:intergenic 25.0%
! AAATTGCAATTAACAAGAAC+TGG + Chr5:53959882-53959901 None:intergenic 25.0%
! AACATCATCATGAAAGTAAA+GGG + Chr5:53963308-53963327 None:intergenic 25.0%
! AATACACCATCAATAAAAGA+TGG + Chr5:53960020-53960039 None:intergenic 25.0%
! AATTCTCTTAATGATTCCAA+GGG - Chr5:53960424-53960443 MsG0580027118.01.T01:intron 25.0%
! ACAATGAATACACTTATCAA+AGG - Chr5:53963253-53963272 MsG0580027118.01.T01:intron 25.0%
! ACAGTATATATTCTATGAAG+TGG + Chr5:53959021-53959040 None:intergenic 25.0%
! ACATAGAAAAAGCAAAATTG+AGG + Chr5:53963192-53963211 None:intergenic 25.0%
! ACTCAGATTAGTGTAAAATT+AGG - Chr5:53957437-53957456 MsG0580027118.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTATACTTCTTTAATGGA+TGG - Chr5:53963781-53963800 MsG0580027118.01.T01:CDS 25.0%
! AGAAATGCAGTTAAAAAACA+TGG - Chr5:53963954-53963973 MsG0580027118.01.T01:CDS 25.0%
! AGAGTACAATAGGAATAAAA+GGG - Chr5:53957820-53957839 MsG0580027118.01.T01:intron 25.0%
! AGCACAATATTATGATTGAT+TGG + Chr5:53958942-53958961 None:intergenic 25.0%
! AGCTATAGTGTTATGATTAA+CGG - Chr5:53956286-53956305 MsG0580027118.01.T01:CDS 25.0%
! AGGGTTATAATTTAGATGTT+AGG - Chr5:53964283-53964302 MsG0580027118.01.T01:CDS 25.0%
! AGGTCCAAATATTAAGTTTA+AGG + Chr5:53958902-53958921 None:intergenic 25.0%
! AGTCAACATAGATATTCAAA+CGG + Chr5:53959383-53959402 None:intergenic 25.0%
! ATAATATTGTGCTCTTGAAT+GGG - Chr5:53958949-53958968 MsG0580027118.01.T01:intron 25.0%
! ATAATGGTACATAAAACTGA+TGG + Chr5:53959692-53959711 None:intergenic 25.0%
! ATGCATAATGTCATGATTAA+CGG - Chr5:53956706-53956725 MsG0580027118.01.T01:CDS 25.0%
! ATGGTTAAAGTAAAAATGTC+AGG + Chr5:53963139-53963158 None:intergenic 25.0%
! ATGTATAATGTGATGGTTAA+TGG - Chr5:53964306-53964325 MsG0580027118.01.T01:CDS 25.0%
! ATGTGTACCAAAATAACTTA+AGG + Chr5:53962620-53962639 None:intergenic 25.0%
! ATTGAATATCCAAAAGAATG+AGG + Chr5:53959960-53959979 None:intergenic 25.0%
! ATTGTGTATGTGAACATATT+TGG + Chr5:53956592-53956611 None:intergenic 25.0%
! CAAGTAACTTAAATTGTAAC+TGG + Chr5:53958112-53958131 None:intergenic 25.0%
! CATTACTTATACTTCTTTAG+TGG - Chr5:53956177-53956196 MsG0580027118.01.T01:CDS 25.0%
! CGGATTATGTAAGAATAAAA+TGG - Chr5:53956306-53956325 MsG0580027118.01.T01:CDS 25.0%
! CTTAGTGAATTTGAAGATTA+GGG - Chr5:53960382-53960401 MsG0580027118.01.T01:intron 25.0%
! GAACCCTTAAACTTAATATT+TGG - Chr5:53958895-53958914 MsG0580027118.01.T01:intron 25.0%
! GAAGTATAAGTAATGACAAT+AGG + Chr5:53956172-53956191 None:intergenic 25.0%
! GACATAGTAAGAAATTAAGA+AGG - Chr5:53957696-53957715 MsG0580027118.01.T01:intron 25.0%
! GATAAGTGTATTCATTGTTA+TGG + Chr5:53963251-53963270 None:intergenic 25.0%
! GATCTTACCAAATTCAAATA+TGG + Chr5:53963038-53963057 None:intergenic 25.0%
! GCTCCTTATAAATATAAAAG+AGG + Chr5:53960850-53960869 None:intergenic 25.0%
! GGTCCAAATATTAAGTTTAA+GGG + Chr5:53958901-53958920 None:intergenic 25.0%
! TAACAAAGATTCTTACATAG+TGG + Chr5:53961801-53961820 None:intergenic 25.0%
! TAACATCATCATGAAAGTAA+AGG + Chr5:53963309-53963328 None:intergenic 25.0%
! TAGAGTACAATAGGAATAAA+AGG - Chr5:53957819-53957838 MsG0580027118.01.T01:intron 25.0%
! TAGTCTATGACACATAAAAA+GGG - Chr5:53956972-53956991 MsG0580027118.01.T01:CDS 25.0%
! TATCTATTCCTAGATTACAA+AGG - Chr5:53960451-53960470 MsG0580027118.01.T01:intron 25.0%
! TATCTCAACAATTACGAAAA+GGG + Chr5:53958554-53958573 None:intergenic 25.0%
! TGTATAATGTGATGGTTAAT+GGG - Chr5:53964307-53964326 MsG0580027118.01.T01:CDS 25.0%
! TGTATAGAAAGATTGTTAGA+GGG + Chr5:53961844-53961863 None:intergenic 25.0%
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! TTAGTCTATGACACATAAAA+AGG - Chr5:53956971-53956990 MsG0580027118.01.T01:CDS 25.0%
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! TTCAAATTCACTAAGGAATT+AGG + Chr5:53960377-53960396 None:intergenic 25.0%
! TTGTATAGAAAGATTGTTAG+AGG + Chr5:53961845-53961864 None:intergenic 25.0%
! TTTGAAAAGTTACAGCATTA+GGG + Chr5:53964401-53964420 None:intergenic 25.0%
!! ATGTTAAAAGTACGAACATT+TGG + Chr5:53963667-53963686 None:intergenic 25.0%
!! ATTTTCATATAGCAACAAAG+GGG - Chr5:53958707-53958726 MsG0580027118.01.T01:intron 25.0%
!! TAGGGTTCTTAATATTTTTC+TGG - Chr5:53961634-53961653 MsG0580027118.01.T01:intron 25.0%
!! TGTTAAAAGTACGAACATTT+GGG + Chr5:53963666-53963685 None:intergenic 25.0%
!! TGTTCGTACTTTTAACATAT+TGG - Chr5:53963669-53963688 MsG0580027118.01.T01:CDS 25.0%
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!! TTTTTGCCATCTTTTATTGA+TGG - Chr5:53960011-53960030 MsG0580027118.01.T01:intron 25.0%
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!!! AATTGTTCTAAAAATAGTGG+GGG + Chr5:53961881-53961900 None:intergenic 25.0%
!!! ACTAAGTTATTAGCTTTTCA+TGG + Chr5:53960256-53960275 None:intergenic 25.0%
!!! ACTTTTAATACATTGGTTGA+TGG - Chr5:53956076-53956095 MsG0580027118.01.T01:CDS 25.0%
!!! AGATTTTGAAAACTGGAAAT+CGG + Chr5:53960975-53960994 None:intergenic 25.0%
!!! AGGCATTTTTATGTCATTTT+GGG + Chr5:53961050-53961069 None:intergenic 25.0%
!!! ATTGATGGGTTATGTAAAAT+AGG - Chr5:53963373-53963392 MsG0580027118.01.T01:intron 25.0%
!!! CAATTGTTCTAAAAATAGTG+GGG + Chr5:53961882-53961901 None:intergenic 25.0%
!!! CAATTTTGCTTTTTCTATGT+TGG - Chr5:53963192-53963211 MsG0580027118.01.T01:intron 25.0%
!!! CTTAATGCTTTTTATTGTGT+CGG + Chr5:53960555-53960574 None:intergenic 25.0%
!!! GCAATTGTTCTAAAAATAGT+GGG + Chr5:53961883-53961902 None:intergenic 25.0%
!!! GTTTAAAGTTTTTGTCACTA+AGG + Chr5:53960342-53960361 None:intergenic 25.0%
!!! TAGGCATTTTTATGTCATTT+TGG + Chr5:53961051-53961070 None:intergenic 25.0%
!!! TATTTTGATGCAGTTATGTT+GGG - Chr5:53958675-53958694 MsG0580027118.01.T01:intron 25.0%
!!! TCTGTTATTATGTTCTAAAG+GGG - Chr5:53958834-53958853 MsG0580027118.01.T01:intron 25.0%
!!! TTACGGTTTATTTTGTGATA+CGG + Chr5:53960516-53960535 None:intergenic 25.0%
!!! TTATTTTGATGCAGTTATGT+TGG - Chr5:53958674-53958693 MsG0580027118.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTAATGGATGGTTATTTCT+TGG - Chr5:53963792-53963811 MsG0580027118.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTTGGGAAAATTACACTA+GGG - Chr5:53962563-53962582 MsG0580027118.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTTTGGGAAAATTACACT+AGG - Chr5:53962562-53962581 MsG0580027118.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTTTTTTAGGACAACTGA+AGG - Chr5:53958494-53958513 MsG0580027118.01.T01:intron 25.0%
AAAATTAATGGTGTGTCACA+TGG + Chr5:53962538-53962557 None:intergenic 30.0%
AAAGATTTATCGGGATCTTA+TGG - Chr5:53956657-53956676 MsG0580027118.01.T01:CDS 30.0%
AATACTTTCACTTCAGTCTT+TGG + Chr5:53961354-53961373 None:intergenic 30.0%
AATGTCCTTATTGTCAGAAA+TGG - Chr5:53964359-53964378 MsG0580027118.01.T01:CDS 30.0%
ACATACAACTCACTTATTGA+TGG - Chr5:53963991-53964010 MsG0580027118.01.T01:CDS 30.0%
ACCGTAAATCAATTTAAAGG+CGG - Chr5:53960529-53960548 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
ACTTATACTTCTTTAGTGGA+TGG - Chr5:53956181-53956200 MsG0580027118.01.T01:CDS 30.0%
AGCTACAGTGTTATGATTAA+CGG - Chr5:53963886-53963905 MsG0580027118.01.T01:CDS 30.0%
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AGTAAACACTCAATGTCTAT+TGG + Chr5:53959117-53959136 None:intergenic 30.0%
ATCAAAGGTCTATGTCTTAA+TGG - Chr5:53963268-53963287 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
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ATGGAGTTACAAGCTAAAAA+AGG + Chr5:53961009-53961028 None:intergenic 30.0%
ATTAATTGGAGAAAGATGCT+AGG - Chr5:53960211-53960230 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
ATTAATTGTTACTCCCATCT+TGG - Chr5:53963163-53963182 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
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ATTATGCTTACTGCCAAAAA+TGG - Chr5:53957966-53957985 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
ATTGTGTATGTGAACATATC+TGG + Chr5:53964192-53964211 None:intergenic 30.0%
CACATATGTATTCAACACTA+TGG - Chr5:53956234-53956253 MsG0580027118.01.T01:CDS 30.0%
CATAACAAACATGTTCATCT+AGG - Chr5:53960629-53960648 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
CATAATATTGTGCTCTTGAA+TGG - Chr5:53958948-53958967 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
CCTAAAGCATAACAATAATG+AGG + Chr5:53958592-53958611 None:intergenic 30.0%
CCTAATCTTCAAATTCACTA+AGG + Chr5:53960384-53960403 None:intergenic 30.0%
CCTCATTATTGTTATGCTTT+AGG - Chr5:53958589-53958608 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
CCTTAGTGAATTTGAAGATT+AGG - Chr5:53960381-53960400 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
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GAAGTTATACCTAATACATC+AGG + Chr5:53959923-53959942 None:intergenic 30.0%
GAATTCTCTTAATGATTCCA+AGG - Chr5:53960423-53960442 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
GACCAATAGCTTAAAACTTA+TGG + Chr5:53961457-53961476 None:intergenic 30.0%
GAGTTCCATTTGTTTAGAAA+AGG + Chr5:53963104-53963123 None:intergenic 30.0%
GAGTTGTATGTTACAGTATT+AGG + Chr5:53963982-53964001 None:intergenic 30.0%
GGAGTAACAATTAATCAAGA+TGG + Chr5:53963158-53963177 None:intergenic 30.0%
GGATGCACAAAATTTATATC+AGG - Chr5:53964248-53964267 MsG0580027118.01.T01:CDS 30.0%
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GTACTGTAAGTGATAACATT+AGG + Chr5:53963562-53963581 None:intergenic 30.0%
GTAGTTCAATTCAAGAGATT+TGG + Chr5:53962817-53962836 None:intergenic 30.0%
GTATTCATTGTTATGGTATC+AGG + Chr5:53963244-53963263 None:intergenic 30.0%
GTTCTTACAAAGATTGATGA+TGG - Chr5:53963418-53963437 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
GTTTGAAAAGTTACAGCATT+AGG + Chr5:53964402-53964421 None:intergenic 30.0%
TAAGTTTAAGGGTTCTGTTA+TGG + Chr5:53958890-53958909 None:intergenic 30.0%
TACCAAATTCAAATATGGGT+GGG + Chr5:53963033-53963052 None:intergenic 30.0%
TATTAATGTCAGATGTGAGT+AGG - Chr5:53958221-53958240 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
TGAAAGCAACAAGAATGATA+AGG - Chr5:53964440-53964459 MsG0580027118.01.T01:CDS 30.0%
TGCATAATGTCATGATTAAC+GGG - Chr5:53956707-53956726 MsG0580027118.01.T01:CDS 30.0%
TGGCTTGATTCTTATAAGTT+AGG + Chr5:53958922-53958941 None:intergenic 30.0%
TGGTAAAGAAAAGAACTAAC+AGG - Chr5:53957599-53957618 MsG0580027118.01.T01:CDS 30.0%
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TTAATTGGAGAAAGATGCTA+GGG - Chr5:53960212-53960231 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
TTACCAAATTCAAATATGGG+TGG + Chr5:53963034-53963053 None:intergenic 30.0%
TTGAAAAGTTACAGCATTAG+GGG + Chr5:53964400-53964419 None:intergenic 30.0%
TTGGACACAAGAAATTATAG+TGG - Chr5:53961717-53961736 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
TTTACATAACCCATCAATCA+AGG + Chr5:53963371-53963390 None:intergenic 30.0%
! AAATTCACATATGCTGACTA+AGG + Chr5:53957856-53957875 None:intergenic 30.0%
! AATTATCCTCCTCATTCTTT+TGG - Chr5:53959948-53959967 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
! AATTGGACTACACATTGTTT+TGG - Chr5:53956995-53957014 MsG0580027118.01.T01:CDS 30.0%
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! ACTGTGTTTGTATGTGTTTT+AGG + Chr5:53958778-53958797 None:intergenic 30.0%
! ACTTCAATCAAGAGTACATT+CGG + Chr5:53958979-53958998 None:intergenic 30.0%
! ACTTTTAACATATTGGTCGA+TGG - Chr5:53963676-53963695 MsG0580027118.01.T01:CDS 30.0%
! AGGAATTAGGTCTTTAGTTT+AGG + Chr5:53960364-53960383 None:intergenic 30.0%
! AGGGAAAATATCTGATGTTT+TGG - Chr5:53964026-53964045 MsG0580027118.01.T01:CDS 30.0%
! ATGGAAGAACACTCTTTTAT+TGG + Chr5:53959504-53959523 None:intergenic 30.0%
! CAACCATTTTCTTCCATTTT+TGG + Chr5:53957982-53958001 None:intergenic 30.0%
! CAAGGAGTACATTAAACTAA+TGG + Chr5:53959083-53959102 None:intergenic 30.0%
! CAATTCTTTGAAGAGATTGA+CGG + Chr5:53956341-53956360 None:intergenic 30.0%
! CATAGTGTTGAATACATATG+TGG + Chr5:53956236-53956255 None:intergenic 30.0%
! CATCAGATATTTTCCCTAAT+TGG + Chr5:53964023-53964042 None:intergenic 30.0%
! CTTATACTTCTTTAGTGGAT+GGG - Chr5:53956182-53956201 MsG0580027118.01.T01:CDS 30.0%
! GTTTTTGTCACTAAGGAATT+AGG + Chr5:53960335-53960354 None:intergenic 30.0%
! TCTGAAATCCAAATTCTGTT+TGG - Chr5:53961208-53961227 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
! TGAGCATTGTACATTTAGAA+AGG - Chr5:53958527-53958546 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
! TTTTTATTCAGAATCCTGTG+TGG - Chr5:53961490-53961509 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
!! ATAAAAGAGTGTTCTTCCAT+TGG - Chr5:53959504-53959523 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
!! ATTGGTTGATGGTTTATACA+AGG - Chr5:53956087-53956106 MsG0580027118.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTTTTCTGGAAACTTAGTG+TGG - Chr5:53961647-53961666 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
!! GGCAATTGTTCTAAAAATAG+TGG + Chr5:53961884-53961903 None:intergenic 30.0%
!! TACGATTTTTGGAGATCAAA+AGG + Chr5:53960810-53960829 None:intergenic 30.0%
!! TATTGATGGACTTTGCAAAT+CGG - Chr5:53956405-53956424 MsG0580027118.01.T01:CDS 30.0%
!! TCATCGTTTTTGTTAACAGA+TGG + Chr5:53962686-53962705 None:intergenic 30.0%
!! TCATTGAAGGAGTTTTAACA+AGG + Chr5:53960745-53960764 None:intergenic 30.0%
!! TGAGAAGCATCAATTGTATA+CGG + Chr5:53957379-53957398 None:intergenic 30.0%
!! TGTTAGTTCTTTTCTTTACC+AGG + Chr5:53957600-53957619 None:intergenic 30.0%
!! TTTTGGGAAAATTACACTAG+GGG - Chr5:53962564-53962583 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
!!! AAGTTTTAAGCTATTGGTCA+TGG - Chr5:53961458-53961477 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
!!! ACTCTTTTATTGGTTCTAAG+AGG + Chr5:53959494-53959513 None:intergenic 30.0%
!!! AGCCATAAGTTTTAAGCTAT+TGG - Chr5:53961452-53961471 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
!!! AGGATTATTTTTGTGAGTCT+AGG - Chr5:53961615-53961634 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
!!! CTTTTTTACTAGATAGTCAG+TGG - Chr5:53959151-53959170 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
!!! GGATTATTTTTGTGAGTCTA+GGG - Chr5:53961616-53961635 MsG0580027118.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTATTTTGTGATACGGAAG+TGG + Chr5:53960510-53960529 None:intergenic 30.0%
AAAATTGAGGTGACCAAGAT+GGG + Chr5:53963179-53963198 None:intergenic 35.0%
AAACGACAAGAATGATAAGG+CGG - Chr5:53956843-53956862 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
AAGATCAATACCAAAGTGCA+TGG - Chr5:53962428-53962447 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
AATCTTTGTAAGAACCTGCA+TGG + Chr5:53963413-53963432 None:intergenic 35.0%
ACCAAATTCAAATATGGGTG+GGG + Chr5:53963032-53963051 None:intergenic 35.0%
ACCAGGAAGAAGAGTTATAT+GGG + Chr5:53957583-53957602 None:intergenic 35.0%
AGAAAGAAGGTCAGGAATTA+TGG + Chr5:53957412-53957431 None:intergenic 35.0%
AGATGTACAAAACGCTTACA+GGG + Chr5:53958323-53958342 None:intergenic 35.0%
AGGGCTATAATTTAGGTGTT+AGG - Chr5:53957905-53957924 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
AGTCACAAGATTACTACTTG+AGG - Chr5:53959567-53959586 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
ATAGATGAGATGCATGATAG+AGG - Chr5:53956454-53956473 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
ATATCACGATCTTCTGATGA+AGG - Chr5:53957885-53957904 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
ATATCAGGATCTTCTGATGA+AGG - Chr5:53964263-53964282 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
ATCTGAGTCTCAAAGAAAGA+AGG + Chr5:53957425-53957444 None:intergenic 35.0%
ATGAAACGAATTGGGAGTTA+TGG + Chr5:53962906-53962925 None:intergenic 35.0%
ATGTCTTAATGGCAAGGTTA+AGG - Chr5:53963279-53963298 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
ATTAGCGAAATGATTGCTAG+AGG - Chr5:53958052-53958071 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
ATTCAACACTATGGCTCAAA+GGG - Chr5:53963843-53963862 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
ATTCAACACTATGGTTCGAA+GGG - Chr5:53956243-53956262 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
ATTGAAGAAGATCAAAGACC+AGG - Chr5:53956558-53956577 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
ATTGGTCGATGGTTTATGTA+AGG - Chr5:53963687-53963706 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
ATTGTTCGTACTGTCTGAAA+TGG - Chr5:53956759-53956778 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
CAATCAATCAAACAGAAGGA+TGG + Chr5:53957523-53957542 None:intergenic 35.0%
CACACATGTATTCAACACTA+TGG - Chr5:53963834-53963853 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
CACTTTGTGTGAGTTTATGA+TGG + Chr5:53961155-53961174 None:intergenic 35.0%
CATCATAAACTCACACAAAG+TGG - Chr5:53961153-53961172 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
CCTAAAACTGCAGCAAAAAT+CGG - Chr5:53960926-53960945 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
CCTTATCATTCTGATCGTTT+CGG + Chr5:53958021-53958040 None:intergenic 35.0%
CGAAAACGACAAGAATGATA+AGG - Chr5:53956840-53956859 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
CGGATTATGCAAGCATAAAA+TGG - Chr5:53963906-53963925 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
CTGATGAAGGGCTATAATTT+AGG - Chr5:53957898-53957917 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
CTGCCAAAAATGGAAGAAAA+TGG - Chr5:53957976-53957995 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
CTTGGTTAAAGAAGTGAACA+AGG - Chr5:53956210-53956229 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
GAACTGTATGCTACAATATC+AGG + Chr5:53956382-53956401 None:intergenic 35.0%
GAATATCCAAAAGAATGAGG+AGG + Chr5:53959957-53959976 None:intergenic 35.0%
GAGTGTAAGGTAGAGAAAAT+TGG - Chr5:53961698-53961717 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
GATGGCAAAAACAATTATGG+AGG + Chr5:53960002-53960021 None:intergenic 35.0%
GCAAATTGGAACATCATTGA+AGG + Chr5:53960758-53960777 None:intergenic 35.0%
GGATGCACAAAAGATTTATC+GGG - Chr5:53956648-53956667 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
GGGGAAAATATCTGATGTTT+GGG - Chr5:53956426-53956445 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
GTAAAGTTTCTCGTCATTGT+TGG + Chr5:53961908-53961927 None:intergenic 35.0%
GTCTTCCATTTCTGACAATA+AGG + Chr5:53964367-53964386 None:intergenic 35.0%
GTGCAAAAATGGAAGACTTA+AGG - Chr5:53964227-53964246 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
GTGGAATTGAAAGGTTGTAT+TGG - Chr5:53961509-53961528 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
GTTTCGTAAGTTACAACATC+AGG + Chr5:53956802-53956821 None:intergenic 35.0%
TAACTAAACCCTCCTTTGTT+GGG + Chr5:53960665-53960684 None:intergenic 35.0%
TAAGCTAAAAGAGAAACCGT+TGG + Chr5:53959464-53959483 None:intergenic 35.0%
TACCAGGAAGAAGAGTTATA+TGG + Chr5:53957584-53957603 None:intergenic 35.0%
TACCCTTACGTTAGTTAGAA+GGG + Chr5:53961746-53961765 None:intergenic 35.0%
TACTTGTGCCAAACAGAATT+TGG + Chr5:53961219-53961238 None:intergenic 35.0%
TAGAAAAGGAAATAGCAGTG+TGG + Chr5:53963090-53963109 None:intergenic 35.0%
TAGGAATAGATACAAACCCT+TGG + Chr5:53960443-53960462 None:intergenic 35.0%
TAGTATATTACCTGCACGTT+CGG + Chr5:53958459-53958478 None:intergenic 35.0%
TATCACGATCTTCTGATGAA+GGG - Chr5:53957886-53957905 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
TATCAGGATCTTCTGATGAA+GGG - Chr5:53964264-53964283 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
TATCGGGATCTTATGGTTAA+GGG - Chr5:53956664-53956683 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
TATTCAACACTATGGCTCAA+AGG - Chr5:53963842-53963861 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
TATTCAACACTATGGTTCGA+AGG - Chr5:53956242-53956261 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
TCTATTGTAAGCGTGAATCA+AGG - Chr5:53958075-53958094 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
TGAAACGAATTGGGAGTTAT+GGG + Chr5:53962905-53962924 None:intergenic 35.0%
TGCATTGTTCAAAAACCATC+AGG - Chr5:53956516-53956535 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
TTATCGGGATCTTATGGTTA+AGG - Chr5:53956663-53956682 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
TTCCCTTCTAACTAACGTAA+GGG - Chr5:53961741-53961760 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
TTGAAGAAGATCAAAGACCA+GGG - Chr5:53956559-53956578 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
TTGGCCAAGATTCTTAAGTT+AGG - Chr5:53963211-53963230 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
TTGGCTGTTATGATAAGACA+AGG - Chr5:53963739-53963758 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
TTGTCAGAAATGGAAGACAA+TGG - Chr5:53964369-53964388 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
TTTACTAGATAGTCAGTGGT+AGG - Chr5:53959155-53959174 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
TTTCCCTTCTAACTAACGTA+AGG - Chr5:53961740-53961759 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
TTTGGAAACATAGCAAGAGA+AGG + Chr5:53957653-53957672 None:intergenic 35.0%
! AACAAAGGGGTTTAGTTTCA+TGG - Chr5:53958720-53958739 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
! ACATATTTGGTTCAATTCCC+TGG + Chr5:53956579-53956598 None:intergenic 35.0%
! ACTAATTTGCAACACTATGC+TGG + Chr5:53959550-53959569 None:intergenic 35.0%
! ATAGGAACCTTGCTTCTTTT+AGG - Chr5:53959042-53959061 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
! ATGATCTTTACAGCTAGCTT+AGG + Chr5:53957196-53957215 None:intergenic 35.0%
! CAAAAAGAACTAAAAGCGCA+TGG - Chr5:53962459-53962478 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
! CATAGTGTTGAATACATGTG+TGG + Chr5:53963836-53963855 None:intergenic 35.0%
! CATGATGATGTTAGAGCTAA+GGG - Chr5:53963316-53963335 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
! GCCGCCTTTAAATTGATTTA+CGG + Chr5:53960533-53960552 None:intergenic 35.0%
! GCGGAAAAATAAAGAGTGTA+AGG - Chr5:53961685-53961704 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
! GTTACTTTGAGTGAATTGCA+TGG - Chr5:53961419-53961438 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
! GTTCATTCTGCGTTTCATTT+TGG - Chr5:53959217-53959236 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
! TACATAGTGGAATTCCTTCA+CGG + Chr5:53961788-53961807 None:intergenic 35.0%
! TCATGATGATGTTAGAGCTA+AGG - Chr5:53963315-53963334 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
! TGATCTTTACAGCTAGCTTA+GGG + Chr5:53957195-53957214 None:intergenic 35.0%
!! AGAAGCATCAATTGTATACG+GGG + Chr5:53957377-53957396 None:intergenic 35.0%
!! ATTAACGGGCTTTGTAAAGA+GGG - Chr5:53956721-53956740 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTGATGGACTTTGCAAATC+GGG - Chr5:53956406-53956425 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTGATGGACTTTGCCAATT+AGG - Chr5:53964006-53964025 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
!! CTGTCATCCTAGTTTTTCTT+AGG + Chr5:53961070-53961089 None:intergenic 35.0%
!! GAGAAGCATCAATTGTATAC+GGG + Chr5:53957378-53957397 None:intergenic 35.0%
!! GTTAATGGGCTTTGTAAAGA+GGG - Chr5:53964321-53964340 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTGATGGACTATGCAAAAA+TGG - Chr5:53956616-53956635 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTGATGGTTTATACAAGGA+AGG - Chr5:53956091-53956110 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
!! TGTTGCTTTCAAACAAAGCA+TGG + Chr5:53964431-53964450 None:intergenic 35.0%
!! TGTTTTTACCTCCATTAAGC+CGG - Chr5:53959434-53959453 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
!! TTGATGGACTTTGCCAATTA+GGG - Chr5:53964007-53964026 MsG0580027118.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTCTTTGGTCCTTGCTATT+TGG - Chr5:53959283-53959302 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
!!! TTTTTAGGACAACTGAAGGT+AGG - Chr5:53958498-53958517 MsG0580027118.01.T01:intron 35.0%
AAAACTGCAGCAAAAATCGG+TGG - Chr5:53960929-53960948 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
AAACACATAGGAGAGCGATT+TGG + Chr5:53960782-53960801 None:intergenic 40.0%
AAAGATTGTTAGAGGGCCTT+CGG + Chr5:53961837-53961856 None:intergenic 40.0%
AACTAAACCCTCCTTTGTTG+GGG + Chr5:53960664-53960683 None:intergenic 40.0%
AAGTTTCTCGTCATTGTTGG+TGG + Chr5:53961905-53961924 None:intergenic 40.0%
AATTCAAATATGGGTGGGGT+AGG + Chr5:53963028-53963047 None:intergenic 40.0%
ACAACCTTTCAATTCCACAC+AGG + Chr5:53961507-53961526 None:intergenic 40.0%
ACACTGTAGCTATGAACATC+AGG + Chr5:53963877-53963896 None:intergenic 40.0%
ACCCCACCCATATTTGAATT+TGG - Chr5:53963028-53963047 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
ACTTTGAGTCACATAGAGAG+TGG - Chr5:53958806-53958825 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
AGAATCCATGCCTTGTCTTA+AGG - Chr5:53957735-53957754 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
AGATAGTCAGTGGTAGGAAT+TGG - Chr5:53959161-53959180 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
AGCAAATGAGAAGGGTTCTT+AGG - Chr5:53961595-53961614 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
AGGAAATAGCAGTGTGGAAA+TGG + Chr5:53963084-53963103 None:intergenic 40.0%
AGGACTCATTCCAAATAGCA+AGG + Chr5:53959296-53959315 None:intergenic 40.0%
AGGTCTATGTCTTAATGGCA+AGG - Chr5:53963273-53963292 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
AGTCTCAAAGAAAGAAGGTC+AGG + Chr5:53957420-53957439 None:intergenic 40.0%
AGTTATGGGACCTTGATTGA+TGG - Chr5:53963358-53963377 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
ATGAAGGATGCGATTGAAAG+AGG + Chr5:53962996-53963015 None:intergenic 40.0%
ATTCAAATATGGGTGGGGTA+GGG + Chr5:53963027-53963046 None:intergenic 40.0%
ATTCCTAGATTACAAAGGCG+AGG - Chr5:53960456-53960475 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
ATTGACGAAGATCAAAGACC+AGG - Chr5:53964158-53964177 MsG0580027118.01.T01:CDS 40.0%
CAAAAGGCCTAGAAACACAT+AGG + Chr5:53960794-53960813 None:intergenic 40.0%
CAAAATTGAGGTGACCAAGA+TGG + Chr5:53963180-53963199 None:intergenic 40.0%
CAAACTAAGGCCTTAAGACA+AGG + Chr5:53957748-53957767 None:intergenic 40.0%
CAAATGTAAAGTTCGCTCAG+TGG - Chr5:53957316-53957335 MsG0580027118.01.T01:CDS 40.0%
CAGATGTACAAAACGCTTAC+AGG + Chr5:53958324-53958343 None:intergenic 40.0%
CATAAACTCACACAAAGTGG+AGG - Chr5:53961156-53961175 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
CATTATGCAATGCAGCCAAT+GGG - Chr5:53959706-53959725 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
CATTTCACGTAGAAGTTCCA+CGG + Chr5:53964466-53964485 None:intergenic 40.0%
CCAGGAAGAAGAGTTATATG+GGG + Chr5:53957582-53957601 None:intergenic 40.0%
CCATCAGCTACGGAAAAAAT+CGG + Chr5:53960906-53960925 None:intergenic 40.0%
CCATGTACCTAAAAGAAGCA+AGG + Chr5:53959052-53959071 None:intergenic 40.0%
CCGAAACGATCAGAATGATA+AGG - Chr5:53958018-53958037 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
CCTACCATAATACTCAATCC+AGG + Chr5:53961294-53961313 None:intergenic 40.0%
CCTGGATTGAGTATTATGGT+AGG - Chr5:53961291-53961310 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
CGACGATGATGAAACGAATT+GGG + Chr5:53962914-53962933 None:intergenic 40.0%
CGCACAATCAATCAAACAGA+AGG + Chr5:53957527-53957546 None:intergenic 40.0%
CGGGGAAAATATCTGATGTT+TGG - Chr5:53956425-53956444 MsG0580027118.01.T01:CDS 40.0%
CTACGTGAAATGATTGCTAG+AGG - Chr5:53964474-53964493 MsG0580027118.01.T01:CDS 40.0%
CTATTGGGACAGAATCTACA+AGG + Chr5:53959101-53959120 None:intergenic 40.0%
CTTCGTGAAATGCTTTCTAG+AGG - Chr5:53956874-53956893 MsG0580027118.01.T01:CDS 40.0%
CTTGGTTAAAGAAGTGAGCA+GGG - Chr5:53963810-53963829 MsG0580027118.01.T01:CDS 40.0%
CTTTCACTTCAGTCTTTGGT+AGG + Chr5:53961350-53961369 None:intergenic 40.0%
GAAAGAGAGATCGTGAAGAT+AGG + Chr5:53959796-53959815 None:intergenic 40.0%
GAACGCACACTATCAAACTA+AGG + Chr5:53957761-53957780 None:intergenic 40.0%
GAATCCTGTGTGGAATTGAA+AGG - Chr5:53961500-53961519 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
GCATACAGTTCGCTTATTGA+TGG - Chr5:53956391-53956410 MsG0580027118.01.T01:CDS 40.0%
GTAACTAAACCCTCCTTTGT+TGG + Chr5:53960666-53960685 None:intergenic 40.0%
GTACCCTTACGTTAGTTAGA+AGG + Chr5:53961747-53961766 None:intergenic 40.0%
GTCACTGTCAAAGAAACCAA+TGG + Chr5:53959523-53959542 None:intergenic 40.0%
GTCGATGGTTTATGTAAGGT+AGG - Chr5:53963691-53963710 MsG0580027118.01.T01:CDS 40.0%
GTGGAAGATATGAACGAATG+CGG - Chr5:53961666-53961685 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
GTTATGGGACCTTGATTGAT+GGG - Chr5:53963359-53963378 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
GTTTCATGGGTCTTTAGCAT+TGG - Chr5:53959599-53959618 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
TATTCATCCCCAACAAAGGA+GGG - Chr5:53960654-53960673 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
TCAACATTGGGAATGAACGA+AGG + Chr5:53962962-53962981 None:intergenic 40.0%
TCACAATGTCGTTCTTCTTC+AGG - Chr5:53962852-53962871 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
TCCATCTTCAGTGTTATGTG+TGG + Chr5:53958177-53958196 None:intergenic 40.0%
TCGACGATGATGAAACGAAT+TGG + Chr5:53962915-53962934 None:intergenic 40.0%
TCTTGGTTAAAGAAGTGAGC+AGG - Chr5:53963809-53963828 MsG0580027118.01.T01:CDS 40.0%
TGAGACGAAGCAAATGAGAA+GGG - Chr5:53961587-53961606 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
TGATATTGGTCCATGCACTT+TGG + Chr5:53962441-53962460 None:intergenic 40.0%
TGCACCTGGATTGAGTATTA+TGG - Chr5:53961287-53961306 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
TGCATTGTTCACAAACCATC+AGG - Chr5:53964116-53964135 MsG0580027118.01.T01:CDS 40.0%
TGCTGAGTTCCTGATGTATT+AGG - Chr5:53959911-53959930 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
TGGTTTATACAAGGAAGGAG+AGG - Chr5:53956096-53956115 MsG0580027118.01.T01:CDS 40.0%
TGGTTTATGTAAGGTAGGAG+AGG - Chr5:53963696-53963715 MsG0580027118.01.T01:CDS 40.0%
TTCAACACTATGGCTCAAAG+GGG - Chr5:53963844-53963863 MsG0580027118.01.T01:CDS 40.0%
TTCAACACTATGGTTCGAAG+GGG - Chr5:53956244-53956263 MsG0580027118.01.T01:CDS 40.0%
TTGACGAAGATCAAAGACCA+GGG - Chr5:53964159-53964178 MsG0580027118.01.T01:CDS 40.0%
TTGAGACGAAGCAAATGAGA+AGG - Chr5:53961586-53961605 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
! ACATAGTGGAATTCCTTCAC+GGG + Chr5:53961787-53961806 None:intergenic 40.0%
! ACATATCTGGTTCAATTCCC+TGG + Chr5:53964179-53964198 None:intergenic 40.0%
! ACCTTGACCAGGTTAGTTAT+GGG - Chr5:53963344-53963363 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
! CCGATTTTTGCTGCAGTTTT+AGG + Chr5:53960929-53960948 None:intergenic 40.0%
! CGTTCTTCTTCAGGTTAACA+AGG - Chr5:53962861-53962880 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
! CTGTCTGAAATGGAAGACAA+CGG - Chr5:53956769-53956788 MsG0580027118.01.T01:CDS 40.0%
! GAGGCATTAGCTAGTTTCAT+GGG - Chr5:53959586-53959605 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
! TGAGGCATTAGCTAGTTTCA+TGG - Chr5:53959585-53959604 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
! TTTAGTGGATGGGTGTTTCT+TGG - Chr5:53956192-53956211 MsG0580027118.01.T01:CDS 40.0%
!! AAAGATTGATGATGGGCTGT+TGG - Chr5:53963426-53963445 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
!! CAAAAACCATCAGGTTGACA+TGG - Chr5:53956525-53956544 MsG0580027118.01.T01:CDS 40.0%
!! CCTTGCTTCTTTTAGGTACA+TGG - Chr5:53959049-53959068 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
!! GATTAACGGGCTTTGTAAAG+AGG - Chr5:53956720-53956739 MsG0580027118.01.T01:CDS 40.0%
!! GGTTAATGGGCTTTGTAAAG+AGG - Chr5:53964320-53964339 MsG0580027118.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTGATGGACTGTGCAAAAA+TGG - Chr5:53964216-53964235 MsG0580027118.01.T01:CDS 40.0%
!! TTGATGGACTTTGCAAATCG+GGG - Chr5:53956407-53956426 MsG0580027118.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTTTGGTAGACAGACGAGA+TGG - Chr5:53961124-53961143 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
!!! AAAAATCGGCCACCGATTTT+TGG + Chr5:53960892-53960911 None:intergenic 40.0%
!!! GATTTTGCTATTCCAGTGTC+TGG - Chr5:53959822-53959841 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
!!! TGTCGTTTTCGAACAAAGCA+TGG + Chr5:53956831-53956850 None:intergenic 40.0%
!!! TTGCTTTTTAGTGTTCCACG+TGG - Chr5:53962497-53962516 MsG0580027118.01.T01:intron 40.0%
!!! TTGTTTTGACATCGTGTAGC+TGG - Chr5:53957090-53957109 MsG0580027118.01.T01:CDS 40.0%
AAAAGCCGTCAAACAGGATC+TGG + Chr5:53957498-53957517 None:intergenic 45.0%
AATTGTATACGGGGAGGATG+TGG + Chr5:53957368-53957387 None:intergenic 45.0%
ACAGACTGTGCAGGAATATG+TGG + Chr5:53958291-53958310 None:intergenic 45.0%
AGCATCAATTGTATACGGGG+AGG + Chr5:53957374-53957393 None:intergenic 45.0%
ATCGTTTCGGAACAGCATCA+GGG + Chr5:53958008-53958027 None:intergenic 45.0%
ATGGACAAAAGCCGTCAAAC+AGG + Chr5:53957504-53957523 None:intergenic 45.0%
CAACAAGAATGATAAGGCCG+TGG - Chr5:53964446-53964465 MsG0580027118.01.T01:CDS 45.0%
CAATTGCCATGTCAACCTGA+TGG + Chr5:53956534-53956553 None:intergenic 45.0%
CAATTGCCTTGTCAACCTGA+TGG + Chr5:53964134-53964153 None:intergenic 45.0%
CAGATAACCAATCCTCCAAG+AGG - Chr5:53961534-53961553 MsG0580027118.01.T01:intron 45.0%
CCATTATGCAATGCAGCCAA+TGG - Chr5:53959705-53959724 MsG0580027118.01.T01:intron 45.0%
CCCCATATAACTCTTCTTCC+TGG - Chr5:53957579-53957598 MsG0580027118.01.T01:CDS 45.0%
CTATTCATCCCCAACAAAGG+AGG - Chr5:53960653-53960672 MsG0580027118.01.T01:intron 45.0%
CTGATACTAACAGACTGTGC+AGG + Chr5:53958300-53958319 None:intergenic 45.0%
GAAACAGCGTCGTCAACATT+GGG + Chr5:53962974-53962993 None:intergenic 45.0%
GATCCTCGCCTTTGTAATCT+AGG + Chr5:53960462-53960481 None:intergenic 45.0%
GCCACACATAACACTGAAGA+TGG - Chr5:53958173-53958192 MsG0580027118.01.T01:intron 45.0%
GGGTAGGGTTGTTCATATGA+AGG + Chr5:53963012-53963031 None:intergenic 45.0%
GGTCTATTCATCCCCAACAA+AGG - Chr5:53960650-53960669 MsG0580027118.01.T01:intron 45.0%
GTGTTGTACATGACGACATC+AGG + Chr5:53963457-53963476 None:intergenic 45.0%
TAAGGCCTTAAGACAAGGCA+TGG + Chr5:53957743-53957762 None:intergenic 45.0%
TAAGGGATTTCACCTTGACC+AGG - Chr5:53963333-53963352 MsG0580027118.01.T01:intron 45.0%
TCAAGGTCCCATAACTAACC+TGG + Chr5:53963354-53963373 None:intergenic 45.0%
TCCCATAACTAACCTGGTCA+AGG + Chr5:53963348-53963367 None:intergenic 45.0%
TCGCTCTCCTATGTGTTTCT+AGG - Chr5:53960784-53960803 MsG0580027118.01.T01:intron 45.0%
TGCAGATCAAAGCAACCCAT+TGG + Chr5:53959724-53959743 None:intergenic 45.0%
TGGATTTCAGACGTCATGAC+CGG + Chr5:53961199-53961218 None:intergenic 45.0%
TTGGGAATGAACGAAGGCAA+TGG + Chr5:53962956-53962975 None:intergenic 45.0%
TTGTTGCAATCTCCAGACAC+TGG + Chr5:53959837-53959856 None:intergenic 45.0%
! CACCTTGACCAGGTTAGTTA+TGG - Chr5:53963343-53963362 MsG0580027118.01.T01:intron 45.0%
! CAGGTGCAAAGCATCATTTG+GGG + Chr5:53961275-53961294 None:intergenic 45.0%
! CATAGTGGAATTCCTTCACG+GGG + Chr5:53961786-53961805 None:intergenic 45.0%
! CCAGGTGCAAAGCATCATTT+GGG + Chr5:53961276-53961295 None:intergenic 45.0%
! CCATTGGCTGCATTGCATAA+TGG + Chr5:53959708-53959727 None:intergenic 45.0%
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! TCCAGGTGCAAAGCATCATT+TGG + Chr5:53961277-53961296 None:intergenic 45.0%
!! AAATAGTGGGGGTGCTATCT+TGG + Chr5:53961870-53961889 None:intergenic 45.0%
!! CACAAACCATCAGGTTGACA+AGG - Chr5:53964125-53964144 MsG0580027118.01.T01:CDS 45.0%
!! CGGCCACCGATTTGTAAAAT+CGG + Chr5:53960955-53960974 None:intergenic 45.0%
!! CGGTGGCCGATTTTACAAAT+CGG - Chr5:53960946-53960965 MsG0580027118.01.T01:intron 45.0%
!! TGGCCGATTTTACAAATCGG+TGG - Chr5:53960949-53960968 MsG0580027118.01.T01:intron 45.0%
!!! CAGTTTTAGGCCATCAGCTA+CGG + Chr5:53960916-53960935 None:intergenic 45.0%
!!! CCGATTTTTTCCGTAGCTGA+TGG - Chr5:53960903-53960922 MsG0580027118.01.T01:intron 45.0%
!!! CATTAATTTTTTATTTTTTT+GGG - Chr5:53962548-53962567 MsG0580027118.01.T01:intron 5.0%
ACCAATCCTCCAAGAGGAAG+AGG - Chr5:53961540-53961559 MsG0580027118.01.T01:intron 50.0%
ACTTCCTTCCCTCTTCCTCT+TGG + Chr5:53961552-53961571 None:intergenic 50.0%
ATTCCTTCACGGGGTGAGAA+AGG + Chr5:53961777-53961796 None:intergenic 50.0%
CCAATCCTCCAAGAGGAAGA+GGG - Chr5:53961541-53961560 MsG0580027118.01.T01:intron 50.0%
CCCAAATGATGCTTTGCACC+TGG - Chr5:53961273-53961292 MsG0580027118.01.T01:intron 50.0%
GATCGTTTCGGAACAGCATC+AGG + Chr5:53958009-53958028 None:intergenic 50.0%
GATTTCAGACGTCATGACCG+GGG + Chr5:53961197-53961216 None:intergenic 50.0%
GCAAGCCAGATCCTGTTTGA+CGG - Chr5:53957490-53957509 MsG0580027118.01.T01:CDS 50.0%
GGAAACAGCGTCGTCAACAT+TGG + Chr5:53962975-53962994 None:intergenic 50.0%
GGATTTCAGACGTCATGACC+GGG + Chr5:53961198-53961217 None:intergenic 50.0%
GTGCAGGAATATGTGGAGAC+TGG + Chr5:53958284-53958303 None:intergenic 50.0%
TCGTTTCGGAACAGCATCAG+GGG + Chr5:53958007-53958026 None:intergenic 50.0%
TGAAACAACAGCTGCCATGC+AGG - Chr5:53963396-53963415 MsG0580027118.01.T01:intron 50.0%
TTACAAGCAACCCTGACCGA+AGG - Chr5:53961818-53961837 MsG0580027118.01.T01:intron 50.0%
! AAGAGAAACCGTTGGTGCTC+CGG + Chr5:53959456-53959475 None:intergenic 50.0%
! CTCACACAAAGTGGAGGTAC+CGG - Chr5:53961162-53961181 MsG0580027118.01.T01:intron 50.0%
! TTTTAGTGTTCCACGTGGCG+TGG - Chr5:53962502-53962521 MsG0580027118.01.T01:intron 50.0%
!! TCACACAAAGTGGAGGTACC+GGG - Chr5:53961163-53961182 MsG0580027118.01.T01:intron 50.0%
ACCAATCATTCCACGCCACG+TGG + Chr5:53962515-53962534 None:intergenic 55.0%
ACTCCTTTCTCACCCCGTGA+AGG - Chr5:53961771-53961790 MsG0580027118.01.T01:intron 55.0%
CACCGTGCTCCAAAAATCGG+TGG - Chr5:53960880-53960899 MsG0580027118.01.T01:intron 55.0%
CACTATGGTTCGAAGGGGAG+TGG - Chr5:53956249-53956268 MsG0580027118.01.T01:CDS 55.0%
CCCTCTTCCTCTTGGAGGAT+TGG + Chr5:53961544-53961563 None:intergenic 55.0%
CGATCCTCGAGTTCGACACT+CGG + Chr5:53960090-53960109 None:intergenic 55.0%
GGCCACCGTGCTCCAAAAAT+CGG - Chr5:53960877-53960896 MsG0580027118.01.T01:intron 55.0%
TCCACGTGGCGTGGAATGAT+TGG - Chr5:53962511-53962530 MsG0580027118.01.T01:intron 55.0%
TCCTCCAAGAGGAAGAGGGA+AGG - Chr5:53961545-53961564 MsG0580027118.01.T01:intron 55.0%
TCCTTCCCTCTTCCTCTTGG+AGG + Chr5:53961549-53961568 None:intergenic 55.0%
TGTTAGAGGGCCTTCGGTCA+GGG + Chr5:53961831-53961850 None:intergenic 55.0%
TTCACGGGGTGAGAAAGGAG+TGG + Chr5:53961772-53961791 None:intergenic 55.0%
TTGTTAGAGGGCCTTCGGTC+AGG + Chr5:53961832-53961851 None:intergenic 55.0%
! CCATTAAGCCGGAGCACCAA+CGG - Chr5:53959445-53959464 MsG0580027118.01.T01:intron 55.0%
! TTGGTGCTCCGGCTTAATGG+AGG + Chr5:53959445-53959464 None:intergenic 55.0%
!! AAGACCGAGTGTCGAACTCG+AGG - Chr5:53960083-53960102 MsG0580027118.01.T01:intron 55.0%
!! ACACAAAGTGGAGGTACCGG+GGG - Chr5:53961165-53961184 MsG0580027118.01.T01:intron 55.0%
!! CACACAAAGTGGAGGTACCG+GGG - Chr5:53961164-53961183 MsG0580027118.01.T01:intron 55.0%
!!! CACCGATTTTTGGAGCACGG+TGG + Chr5:53960882-53960901 None:intergenic 55.0%
!!! GGCCACCGATTTTTGGAGCA+CGG + Chr5:53960885-53960904 None:intergenic 55.0%
CAGGGAGTTGGAAGCAGAGC+TGG + Chr5:53958428-53958447 None:intergenic 60.0%
GCACGTTCGGTACGCTGTCA+GGG + Chr5:53958446-53958465 None:intergenic 60.0%
TCGGTACGCTGTCAGGGAGT+TGG + Chr5:53958440-53958459 None:intergenic 60.0%
TGACAGCGTACCGAACGTGC+AGG - Chr5:53958446-53958465 MsG0580027118.01.T01:intron 60.0%
TGCACGTTCGGTACGCTGTC+AGG + Chr5:53958447-53958466 None:intergenic 60.0%
! CCGTTGGTGCTCCGGCTTAA+TGG + Chr5:53959448-53959467 None:intergenic 60.0%
ATGACCGGGGTTCGAACCCC+CGG + Chr5:53961184-53961203 None:intergenic 65.0%
! GGTACCGGGGGTTCGAACCC+CGG - Chr5:53961177-53961196 MsG0580027118.01.T01:intron 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 53956043 53964506 53956043 ID=MsG0580027118.01;Name=MsG0580027118.01
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Chr5 exon 53963647 53964506 53963647 ID=MsG0580027118.01.T01:exon:40680;Parent=MsG0580027118.01.T01
Chr5 exon 53956043 53957675 53956043 ID=MsG0580027118.01.T01:exon:40681;Parent=MsG0580027118.01.T01
Chr5 CDS 53963647 53964506 53963647 ID=MsG0580027118.01.T01:cds;Parent=MsG0580027118.01.T01
Chr5 CDS 53956043 53957675 53956043 ID=MsG0580027118.01.T01:cds;Parent=MsG0580027118.01.T01
Gene Sequence

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Protein sequence

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