AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680033773.01

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MsG0680033773.01.T01 AT1G05670 28.205 390 280 0 59 448 338 727 2.71e-60 213
MsG0680033773.01.T01 AT1G05670 23.288 219 167 1 333 550 191 409 1.07e-13 74.7
MsG0680033773.01.T01 AT1G05670 29.621 449 316 0 102 550 241 689 8.50e-74 249
MsG0680033773.01.T01 AT1G05670 28.412 447 320 0 98 544 272 718 8.28e-73 247
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MsG0680033773.01.T01 AT3G09060 26.132 486 357 2 53 537 200 684 1.52e-60 213
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MsG0680033773.01.T01 AT5G16420 25.490 306 227 1 69 374 188 492 2.11e-29 122
MsG0680033773.01.T01 AT5G16420 25.926 270 194 3 286 550 121 389 2.73e-23 103
MsG0680033773.01.T01 AT5G16420 27.273 231 167 1 323 552 126 356 3.43e-20 94.4
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MsG0680033773.01.T01 AT5G65820 26.364 220 159 2 323 541 189 406 1.32e-19 93.2
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MsG0680033773.01.T01 AT2G37230 22.833 473 317 5 77 540 158 591 5.20e-33 134
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MsG0680033773.01.T01 AT2G35030 22.727 506 304 17 30 475 10 488 9.47e-24 105
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MsG0680033773.01.T01 AT3G15200 24.051 237 176 2 314 550 140 372 1.98e-14 76.6
MsG0680033773.01.T01 AT3G15200 21.935 310 168 8 50 288 191 497 2.67e-13 72.8
MsG0680033773.01.T01 AT2G38420 24.949 489 284 11 34 515 37 449 1.64e-30 124
MsG0680033773.01.T01 AT2G38420 24.024 333 247 5 215 542 75 406 6.56e-22 99.4
MsG0680033773.01.T01 AT1G73710 22.678 463 318 6 109 534 307 766 1.66e-30 127
MsG0680033773.01.T01 AT1G73710 19.798 495 356 6 60 516 328 819 1.50e-23 105
MsG0680033773.01.T01 AT1G73710 20.779 539 370 5 70 552 143 680 1.49e-22 102
MsG0680033773.01.T01 AT1G73710 22.955 440 320 7 104 534 476 905 1.69e-19 93.2
MsG0680033773.01.T01 AT1G73710 19.185 417 325 4 72 483 515 924 2.59e-16 83.2
MsG0680033773.01.T01 AT1G73710 22.667 375 268 9 50 416 563 923 2.09e-12 70.5
MsG0680033773.01.T01 AT3G62540 23.398 359 273 2 172 530 190 546 1.70e-30 126
MsG0680033773.01.T01 AT3G62540 21.270 315 239 4 114 424 267 576 2.28e-19 92.0
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MsG0680033773.01.T01 AT3G18110 20.222 361 282 2 60 417 810 1167 5.11e-20 95.1
MsG0680033773.01.T01 AT3G18110 16.667 390 325 0 69 458 784 1173 9.05e-17 84.7
MsG0680033773.01.T01 AT3G18110 19.213 432 340 4 127 550 590 1020 3.51e-16 82.8
MsG0680033773.01.T01 AT3G18110 20.041 489 349 7 70 520 436 920 6.56e-16 82.0
MsG0680033773.01.T01 AT1G32415 24.158 505 276 18 106 536 107 578 1.09e-27 118
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MsG0680033773.01.T01 AT1G32415 24.696 247 161 7 295 541 55 276 1.26e-17 87.0
MsG0680033773.01.T01 AT3G12770 24.277 346 247 6 95 437 172 505 1.21e-27 118
MsG0680033773.01.T01 AT3G12770 19.560 455 312 10 68 484 80 518 2.01e-20 95.9
MsG0680033773.01.T01 AT3G12770 20.721 444 288 10 98 536 49 433 5.90e-19 91.3
MsG0680033773.01.T01 AT1G71060 23.936 376 241 4 215 552 131 499 1.21e-27 117
MsG0680033773.01.T01 AT1G71060 22.424 330 249 2 157 486 177 499 5.90e-26 112
MsG0680033773.01.T01 AT1G71060 22.460 374 286 2 75 448 131 500 9.10e-26 111
MsG0680033773.01.T01 AT1G71060 19.799 298 236 1 53 350 178 472 1.52e-16 83.2
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MsG0680033773.01.T01 AT1G18900 22.368 380 293 2 172 550 359 737 2.62e-27 117
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MsG0680033773.01.T01 AT1G05750 24.485 388 244 6 108 492 37 378 2.74e-23 103
MsG0680033773.01.T01 AT1G05750 22.742 299 210 6 244 536 33 316 4.55e-13 72.0
MsG0680033773.01.T01 AT5G08305 23.869 398 284 8 126 520 92 473 3.06e-23 103
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MsG0680033773.01.T01 AT5G08305 22.424 330 241 7 68 395 170 486 1.66e-15 79.7
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MsG0680033773.01.T01 AT1G69350 21.687 415 253 9 45 396 276 681 3.67e-15 79.3
MsG0680033773.01.T01 AT4G16835 23.155 393 273 11 68 458 120 485 6.52e-23 103
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MsG0680033773.01.T01 AT3G09040 22.794 272 198 7 126 395 716 977 1.03e-11 68.6
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MsG0680033773.01.T01 AT1G31430 23.790 248 184 2 106 352 243 486 7.60e-14 74.7
MsG0680033773.01.T01 AT1G31430 19.348 491 338 9 69 520 8 479 6.66e-13 71.6
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MsG0680033773.01.T01 AT2G33680 22.378 429 307 11 53 474 200 609 5.32e-16 82.0
MsG0680033773.01.T01 AT2G33680 19.604 505 303 11 111 536 53 533 2.33e-15 79.7

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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CAATTGCCTTGTCAACTTGA+TGG 0.353343 6:-73244898 None:intergenic
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GACAAGTGTATTTAAGGTAA+TGG 0.372152 6:-73244018 None:intergenic
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TGCTAAAAGTATAAACATTT+GGG 0.383385 6:-73244430 None:intergenic
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TGTTTGTCAATACCATTTGA+TGG 0.389666 6:-73244403 None:intergenic
ATTTGGTTTGTTCCATCAAA+TGG 0.391410 6:+73244391 MsG0680033773.01.T01:CDS
ATGTATAGCACAATTATTGA+TGG 0.393181 6:+73244233 MsG0680033773.01.T01:CDS
TCTCACCGATTGGAATTTAA+CGG 0.394378 6:+73243876 MsG0680033773.01.T01:CDS
ATTAGGTTCCCTTGTTAAGC+TGG 0.400963 6:+73243827 MsG0680033773.01.T01:CDS
TTGCTAAATTCTACAATGGA+TGG 0.411147 6:-73243801 None:intergenic
GGTCAATTGAAAGAAGCATT+TGG 0.418578 6:+73244374 MsG0680033773.01.T01:CDS
CAATTGAATGAAGTTACTTA+CGG 0.420038 6:+73244113 MsG0680033773.01.T01:CDS
AATAGTGCTTAAAACGTGTT+TGG 0.420903 6:-73244600 None:intergenic
AATTGAATGAAGTTACTTAC+GGG 0.426215 6:+73244114 MsG0680033773.01.T01:CDS
ATCAACAACATGAACATGAT+TGG 0.428641 6:-73243733 None:intergenic
TCCATCCATTAATGAATTGT+AGG 0.430371 6:-73244549 None:intergenic
GTATTTAAGGTAATGGAATC+AGG 0.444055 6:-73244011 None:intergenic
TAATCACAGTATTATAGCTC+AGG 0.445117 6:-73244649 None:intergenic
TATTTCCCTTTCTCACCGAT+TGG 0.445851 6:+73243866 MsG0680033773.01.T01:CDS
TCAATGGCTTGTGTAAAATT+GGG 0.447283 6:+73244144 MsG0680033773.01.T01:CDS
TTTCGCCAAAATTCTCAAGA+TGG 0.447359 6:+73243980 MsG0680033773.01.T01:CDS
TAAATTCCAATCGGTGAGAA+AGG 0.463581 6:-73243872 None:intergenic
TTTACATAAAGCATGTAAGA+AGG 0.467261 6:-73244873 None:intergenic
TTTACACAAGCCATTGATCA+AGG 0.471807 6:-73244138 None:intergenic
CAGGGAAAATTTCTCATGCA+TGG 0.477292 6:+73244792 MsG0680033773.01.T01:CDS
TTCGCCAAAATTCTCAAGAT+GGG 0.478786 6:+73243981 MsG0680033773.01.T01:CDS
TTAAGCACTATTGCTCGAAT+GGG 0.478839 6:+73244611 MsG0680033773.01.T01:CDS
CAAAGGAATCGATCCTGATA+AGG 0.479181 6:+73244733 MsG0680033773.01.T01:CDS
TGCTAAATTCTACAATGGAT+GGG 0.482277 6:-73243800 None:intergenic
ATTAATGGCCTTTGTTTGGA+GGG 0.483631 6:+73245088 MsG0680033773.01.T01:CDS
ACAATTGATCAACATATTCA+AGG 0.485003 6:-73243919 None:intergenic
GATTAATGGCCTTTGTTTGG+AGG 0.489494 6:+73245087 MsG0680033773.01.T01:CDS
TTTAAGCACTATTGCTCGAA+TGG 0.499266 6:+73244610 MsG0680033773.01.T01:CDS
AATTGGAATTGGAATTGGAA+TGG 0.500962 6:-73243710 None:intergenic
AAGGCTATAATGTAACGGTC+TGG 0.504666 6:+73245050 MsG0680033773.01.T01:CDS
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CAAATGTTGAGAAAGATTGA+TGG 0.506629 6:+73244185 MsG0680033773.01.T01:CDS
CACTATTGCTCGAATGGGAG+TGG 0.509512 6:+73244616 MsG0680033773.01.T01:CDS
AGGTTTGTGTCTTAATGGTA+AGG 0.510246 6:+73244043 MsG0680033773.01.T01:CDS
TTTGATGAAATGCGGTTCAA+AGG 0.515033 6:+73244716 MsG0680033773.01.T01:CDS
ATGGATGGACTGTGCAAAGA+AGG 0.517167 6:+73244983 MsG0680033773.01.T01:CDS
ACTTACGGGACCTTGATCAA+TGG 0.521124 6:+73244128 MsG0680033773.01.T01:CDS
ATCAATTGTTACTGTCACCT+TGG 0.524528 6:+73243933 MsG0680033773.01.T01:CDS
TGATCAAGCTATGAACCTGC+TGG 0.532133 6:+73245117 MsG0680033773.01.T01:CDS
GAATATTTAGTTGAATGCAT+TGG 0.537153 6:-73244943 None:intergenic
GCTAAATTCTACAATGGATG+GGG 0.538648 6:-73243799 None:intergenic
AATCTTTCTCAACATTTGCA+AGG 0.550191 6:-73244180 None:intergenic
ACCTTAAATACACTTGTCAA+AGG 0.550200 6:+73244023 MsG0680033773.01.T01:CDS
ACCTACAATTCATTAATGGA+TGG 0.551321 6:+73244548 MsG0680033773.01.T01:CDS
AAATTCCAATCGGTGAGAAA+GGG 0.552004 6:-73243871 None:intergenic
TAGTTCCGTTAAATTCCAAT+CGG 0.554261 6:-73243881 None:intergenic
GGTAATGCTCCAGCTTAACA+AGG 0.557718 6:-73243836 None:intergenic
TGAGAAAGGGAAATAACAGT+TGG 0.562002 6:-73243858 None:intergenic
TTGATGGTTTGTGCAAATCA+GGG 0.562612 6:+73244774 MsG0680033773.01.T01:CDS
CTTGATCAGATGCATGATAG+AGG 0.566685 6:+73244821 MsG0680033773.01.T01:CDS
AGGGAAAATTTCTCATGCAT+GGG 0.569634 6:+73244793 MsG0680033773.01.T01:CDS
TGAGTCTCTTTGATGAAATG+CGG 0.570782 6:+73244708 MsG0680033773.01.T01:CDS
GTTGATGCTCTATGTAAGGA+AGG 0.575458 6:+73244458 MsG0680033773.01.T01:CDS
ACATACAATATACTTATGGA+TGG 0.579320 6:+73244968 MsG0680033773.01.T01:CDS
GATCAAAGGCTATAATGTAA+CGG 0.580345 6:+73245045 MsG0680033773.01.T01:CDS
AAATGTTGAGAAAGATTGAT+GGG 0.583920 6:+73244186 MsG0680033773.01.T01:CDS
GAGAAAGGGAAATAACAGTT+GGG 0.588148 6:-73243857 None:intergenic
AATTCTACAATGGATGGGGT+AGG 0.597764 6:-73243795 None:intergenic
TTGTAAGTGAATGCATCTGC+AGG 0.608426 6:-73244848 None:intergenic
GAAATCCAAGTGCAAGCACA+TGG 0.610248 6:-73244091 None:intergenic
AATCACAGTATTATAGCTCA+GGG 0.612193 6:-73244648 None:intergenic
CAAACAATCCCTCCAAACAA+AGG 0.612764 6:-73245096 None:intergenic
CATTTCATCAAAGAGACTCA+AGG 0.619790 6:-73244705 None:intergenic
CAATGGCTTGTGTAAAATTG+GGG 0.623224 6:+73244145 MsG0680033773.01.T01:CDS
TAAAAGTATAAACATTTGGG+AGG 0.652180 6:-73244427 None:intergenic
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ATAGCTGTGATGATGAGAGA+AGG 0.712175 6:+73244506 MsG0680033773.01.T01:CDS
GTAATGCTCCAGCTTAACAA+GGG 0.714199 6:-73243835 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ACATATAATATTATGATTAA+TGG + Chr6:73245073-73245092 MsG0680033773.01.T01:CDS 10.0%
!! GTAGAATTTAGCAAAATATT+AGG + Chr6:73243810-73243829 MsG0680033773.01.T01:CDS 20.0%
!! TAAAAATGATGAGAATGATA+GGG + Chr6:73245207-73245226 MsG0680033773.01.T01:CDS 20.0%
!! TTAAAAATGATGAGAATGAT+AGG + Chr6:73245206-73245225 MsG0680033773.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATGCTAAAAGTATAAACATT+TGG - Chr6:73244434-73244453 None:intergenic 20.0%
!!! TATTTTGCTAAATTCTACAA+TGG - Chr6:73243808-73243827 None:intergenic 20.0%
!!! TGCTAAAAGTATAAACATTT+GGG - Chr6:73244433-73244452 None:intergenic 20.0%
!!! TGGATTTTGTAAGAATAAAA+TGG + Chr6:73244673-73244692 MsG0680033773.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGTTTATACTTTTAGCATAT+TGG + Chr6:73244436-73244455 MsG0680033773.01.T01:CDS 20.0%
! AAATGTTGAGAAAGATTGAT+GGG + Chr6:73244186-73244205 MsG0680033773.01.T01:CDS 25.0%
! AATTGAATGAAGTTACTTAC+GGG + Chr6:73244114-73244133 MsG0680033773.01.T01:CDS 25.0%
! ACAATTGATCAACATATTCA+AGG - Chr6:73243922-73243941 None:intergenic 25.0%
! ACATACAATATACTTATGGA+TGG + Chr6:73244968-73244987 MsG0680033773.01.T01:CDS 25.0%
! AGCTATAATACTGTGATTAA+TGG + Chr6:73244653-73244672 MsG0680033773.01.T01:CDS 25.0%
! ATGTATAGCACAATTATTGA+TGG + Chr6:73244233-73244252 MsG0680033773.01.T01:CDS 25.0%
! CAATTGAATGAAGTTACTTA+CGG + Chr6:73244113-73244132 MsG0680033773.01.T01:CDS 25.0%
! CCTAGTTAATGAAGTTAATA+AGG + Chr6:73244577-73244596 MsG0680033773.01.T01:CDS 25.0%
! CCTTATTAACTTCATTAACT+AGG - Chr6:73244580-73244599 None:intergenic 25.0%
! GAATATTTAGTTGAATGCAT+TGG - Chr6:73244946-73244965 None:intergenic 25.0%
! TCAGACATACAATATACTTA+TGG + Chr6:73244964-73244983 MsG0680033773.01.T01:CDS 25.0%
! TGTTACCTACAATTCATTAA+TGG + Chr6:73244544-73244563 MsG0680033773.01.T01:CDS 25.0%
! TTTACATAAAGCATGTAAGA+AGG - Chr6:73244876-73244895 None:intergenic 25.0%
!! TAAAAGTATAAACATTTGGG+AGG - Chr6:73244430-73244449 None:intergenic 25.0%
!!! AATTTTGGCGAAAATAGAAA+AGG - Chr6:73243973-73243992 None:intergenic 25.0%
!!! AGTAGTAAAGTGTTCTTTTT+AGG - Chr6:73243677-73243696 None:intergenic 25.0%
!!! TAAAGTGTTCTTTTTAGGAA+AGG - Chr6:73243672-73243691 None:intergenic 25.0%
AACATGAACATGATTGGAAT+TGG - Chr6:73243730-73243749 None:intergenic 30.0%
AACATGATTGGAATTGGAAT+TGG - Chr6:73243724-73243743 None:intergenic 30.0%
AATAGTGCTTAAAACGTGTT+TGG - Chr6:73244603-73244622 None:intergenic 30.0%
AATCACAGTATTATAGCTCA+GGG - Chr6:73244651-73244670 None:intergenic 30.0%
AATCTTTCTCAACATTTGCA+AGG - Chr6:73244183-73244202 None:intergenic 30.0%
AATTGGAATTGGAATTGGAA+TGG - Chr6:73243713-73243732 None:intergenic 30.0%
ACCTACAATTCATTAATGGA+TGG + Chr6:73244548-73244567 MsG0680033773.01.T01:CDS 30.0%
ACCTTAAATACACTTGTCAA+AGG + Chr6:73244023-73244042 MsG0680033773.01.T01:CDS 30.0%
ACCTTTGACAAGTGTATTTA+AGG - Chr6:73244027-73244046 None:intergenic 30.0%
ACTTACAATTCTCTCATTGA+TGG + Chr6:73244758-73244777 MsG0680033773.01.T01:CDS 30.0%
ATCAACAACATGAACATGAT+TGG - Chr6:73243736-73243755 None:intergenic 30.0%
ATTGGAATTGGAATTGGAAT+TGG - Chr6:73243712-73243731 None:intergenic 30.0%
CAAATGTTGAGAAAGATTGA+TGG + Chr6:73244185-73244204 MsG0680033773.01.T01:CDS 30.0%
GAATTGTAAGTTACCTTATC+AGG - Chr6:73244749-73244768 None:intergenic 30.0%
GATCAAAGGCTATAATGTAA+CGG + Chr6:73245045-73245064 MsG0680033773.01.T01:CDS 30.0%
GTTTCATACGTTACAACATT+AGG - Chr6:73245169-73245188 None:intergenic 30.0%
TAATCACAGTATTATAGCTC+AGG - Chr6:73244652-73244671 None:intergenic 30.0%
TAGTTCCGTTAAATTCCAAT+CGG - Chr6:73243884-73243903 None:intergenic 30.0%
TATGATTAATGGCCTTTGTT+TGG + Chr6:73245084-73245103 MsG0680033773.01.T01:CDS 30.0%
TCCATCCATTAATGAATTGT+AGG - Chr6:73244552-73244571 None:intergenic 30.0%
TGCTAAATTCTACAATGGAT+GGG - Chr6:73243803-73243822 None:intergenic 30.0%
TGTTTGTCAATACCATTTGA+TGG - Chr6:73244406-73244425 None:intergenic 30.0%
TTGCTAAATTCTACAATGGA+TGG - Chr6:73243804-73243823 None:intergenic 30.0%
! ACTTTTAGTGCTCTTATCTA+CGG + Chr6:73244338-73244357 MsG0680033773.01.T01:CDS 30.0%
! ATAACCCATCTTGAGAATTT+TGG - Chr6:73243988-73244007 None:intergenic 30.0%
! ATCAATGGCTTGTGTAAAAT+TGG + Chr6:73244143-73244162 MsG0680033773.01.T01:CDS 30.0%
! GACAAGTGTATTTAAGGTAA+TGG - Chr6:73244021-73244040 None:intergenic 30.0%
! TCAATGGCTTGTGTAAAATT+GGG + Chr6:73244144-73244163 MsG0680033773.01.T01:CDS 30.0%
! TTTCAGGATCTTTTGATCAA+AGG + Chr6:73245031-73245050 MsG0680033773.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTTGGTTTGTTCCATCAAA+TGG + Chr6:73244391-73244410 MsG0680033773.01.T01:CDS 30.0%
!! GTATTTAAGGTAATGGAATC+AGG - Chr6:73244014-73244033 None:intergenic 30.0%
!! TAAAAACCATCAAGTTGACA+AGG + Chr6:73244892-73244911 MsG0680033773.01.T01:CDS 30.0%
AAATTCCAATCGGTGAGAAA+GGG - Chr6:73243874-73243893 None:intergenic 35.0%
AGGGAAAATTTCTCATGCAT+GGG + Chr6:73244793-73244812 MsG0680033773.01.T01:CDS 35.0%
AGGTTTGTGTCTTAATGGTA+AGG + Chr6:73244043-73244062 MsG0680033773.01.T01:CDS 35.0%
ATCAATTGTTACTGTCACCT+TGG + Chr6:73243933-73243952 MsG0680033773.01.T01:CDS 35.0%
CATTTCATCAAAGAGACTCA+AGG - Chr6:73244708-73244727 None:intergenic 35.0%
GAAATTGGTCAACATCAATG+TGG + Chr6:73244208-73244227 MsG0680033773.01.T01:CDS 35.0%
GAGAAAGATTGATGGGAAAT+TGG + Chr6:73244193-73244212 MsG0680033773.01.T01:CDS 35.0%
GAGAAAGGGAAATAACAGTT+GGG - Chr6:73243860-73243879 None:intergenic 35.0%
GCACTAAAAGTGACAACATT+TGG - Chr6:73244329-73244348 None:intergenic 35.0%
GCTAAATTCTACAATGGATG+GGG - Chr6:73243802-73243821 None:intergenic 35.0%
GTCAAAGGTTTGTGTCTTAA+TGG + Chr6:73244038-73244057 MsG0680033773.01.T01:CDS 35.0%
TAAATTCCAATCGGTGAGAA+AGG - Chr6:73243875-73243894 None:intergenic 35.0%
TATGAACCTGCTGGAAAAAA+TGG + Chr6:73245126-73245145 MsG0680033773.01.T01:CDS 35.0%
TGAGAAAGGGAAATAACAGT+TGG - Chr6:73243861-73243880 None:intergenic 35.0%
TGAGTCTCTTTGATGAAATG+CGG + Chr6:73244708-73244727 MsG0680033773.01.T01:CDS 35.0%
TTAAGCACTATTGCTCGAAT+GGG + Chr6:73244611-73244630 MsG0680033773.01.T01:CDS 35.0%
TTCGCCAAAATTCTCAAGAT+GGG + Chr6:73243981-73244000 MsG0680033773.01.T01:CDS 35.0%
TTTAAGCACTATTGCTCGAA+TGG + Chr6:73244610-73244629 MsG0680033773.01.T01:CDS 35.0%
TTTACACAAGCCATTGATCA+AGG - Chr6:73244141-73244160 None:intergenic 35.0%
TTTCGCCAAAATTCTCAAGA+TGG + Chr6:73243980-73243999 MsG0680033773.01.T01:CDS 35.0%
TTTGATGAAATGCGGTTCAA+AGG + Chr6:73244716-73244735 MsG0680033773.01.T01:CDS 35.0%
! ATCTACGGATTTTGCATTGT+TGG + Chr6:73244353-73244372 MsG0680033773.01.T01:CDS 35.0%
! ATTAATGGCCTTTGTTTGGA+GGG + Chr6:73245088-73245107 MsG0680033773.01.T01:CDS 35.0%
! ATTGATGGTTTGTGCAAATC+AGG + Chr6:73244773-73244792 MsG0680033773.01.T01:CDS 35.0%
! ATTGGTTGATGCTCTATGTA+AGG + Chr6:73244454-73244473 MsG0680033773.01.T01:CDS 35.0%
! CAATGGCTTGTGTAAAATTG+GGG + Chr6:73244145-73244164 MsG0680033773.01.T01:CDS 35.0%
! GAATGCACAAGTGATTTTTC+AGG + Chr6:73245015-73245034 MsG0680033773.01.T01:CDS 35.0%
! TCTCACCGATTGGAATTTAA+CGG + Chr6:73243876-73243895 MsG0680033773.01.T01:CDS 35.0%
! TTGATGGTTTGTGCAAATCA+GGG + Chr6:73244774-73244793 MsG0680033773.01.T01:CDS 35.0%
!! GGTCAATTGAAAGAAGCATT+TGG + Chr6:73244374-73244393 MsG0680033773.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTTCTTCCATTTTTTCCAGC+AGG - Chr6:73245135-73245154 None:intergenic 35.0%
AAGGCTATAATGTAACGGTC+TGG + Chr6:73245050-73245069 MsG0680033773.01.T01:CDS 40.0%
AATTCTACAATGGATGGGGT+AGG - Chr6:73243798-73243817 None:intergenic 40.0%
AGGCAAATCTCATTTGACCA+AGG - Chr6:73243953-73243972 None:intergenic 40.0%
ATTAGGTTCCCTTGTTAAGC+TGG + Chr6:73243827-73243846 MsG0680033773.01.T01:CDS 40.0%
CAAACAATCCCTCCAAACAA+AGG - Chr6:73245099-73245118 None:intergenic 40.0%
CAAAGGAATCGATCCTGATA+AGG + Chr6:73244733-73244752 MsG0680033773.01.T01:CDS 40.0%
CAATTGCCTTGTCAACTTGA+TGG - Chr6:73244901-73244920 None:intergenic 40.0%
CAGGGAAAATTTCTCATGCA+TGG + Chr6:73244792-73244811 MsG0680033773.01.T01:CDS 40.0%
CTTGATCAGATGCATGATAG+AGG + Chr6:73244821-73244840 MsG0680033773.01.T01:CDS 40.0%
GTAATGCTCCAGCTTAACAA+GGG - Chr6:73243838-73243857 None:intergenic 40.0%
GTTGATGCTCTATGTAAGGA+AGG + Chr6:73244458-73244477 MsG0680033773.01.T01:CDS 40.0%
TATTTCCCTTTCTCACCGAT+TGG + Chr6:73243866-73243885 MsG0680033773.01.T01:CDS 40.0%
TTGTAAGTGAATGCATCTGC+AGG - Chr6:73244851-73244870 None:intergenic 40.0%
! ATAGCTGTGATGATGAGAGA+AGG + Chr6:73244506-73244525 MsG0680033773.01.T01:CDS 40.0%
! CTCTGTTTTCATCATGCTTC+AGG + Chr6:73243601-73243620 MsG0680033773.01.T01:CDS 40.0%
! GATTAATGGCCTTTGTTTGG+AGG + Chr6:73245087-73245106 MsG0680033773.01.T01:CDS 40.0%
! GTATTATAGCTCAGGGCATT+AGG - Chr6:73244644-73244663 None:intergenic 40.0%
ACTTACGGGACCTTGATCAA+TGG + Chr6:73244128-73244147 MsG0680033773.01.T01:CDS 45.0%
GAAATCCAAGTGCAAGCACA+TGG - Chr6:73244094-73244113 None:intergenic 45.0%
GGTAATGCTCCAGCTTAACA+AGG - Chr6:73243839-73243858 None:intergenic 45.0%
TGATCAAGCTATGAACCTGC+TGG + Chr6:73245117-73245136 MsG0680033773.01.T01:CDS 45.0%
!! ATGGATGGACTGTGCAAAGA+AGG + Chr6:73244983-73245002 MsG0680033773.01.T01:CDS 45.0%
CACTATTGCTCGAATGGGAG+TGG + Chr6:73244616-73244635 MsG0680033773.01.T01:CDS 50.0%
CACGACCATGTGCTTGCACT+TGG + Chr6:73244086-73244105 MsG0680033773.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 73243594 73245252 73243594 ID=MsG0680033773.01;Name=MsG0680033773.01
Chr6 mRNA 73243594 73245252 73243594 ID=MsG0680033773.01.T01;Parent=MsG0680033773.01;Name=MsG0680033773.01.T01;_AED=0.46;_eAED=0.46;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|552
Chr6 exon 73243594 73245252 73243594 ID=MsG0680033773.01.T01:exon:3808;Parent=MsG0680033773.01.T01
Chr6 CDS 73243594 73245252 73243594 ID=MsG0680033773.01.T01:cds;Parent=MsG0680033773.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680033773.01.T01

ATGTCTTCTCTGTTTTCATCATGCTTCAGGTTTTGTAATTCTTCTTCTTCTTCTATTAATTGCAATTTTCTTATTCCTTTCCTAAAAAGAACACTTTACTACTCTCACTCTAGATTCCATTCCAATTCCAATTCCAATTCCAATCATGTTCATGTTGTTGATAATGTTATTTTGTCATTCAATCACATGATTCGTATGAATCCTACCCCATCCATTGTAGAATTTAGCAAAATATTAGGTTCCCTTGTTAAGCTGGAGCATTACCCAACTGTTATTTCCCTTTCTCACCGATTGGAATTTAACGGAACTATGCTAGATATTGTTTCCTTGAATATGTTGATCAATTGTTACTGTCACCTTGGTCAAATGAGATTTGCCTTTTCTATTTTCGCCAAAATTCTCAAGATGGGTTATCAGCCTGATTCCATTACCTTAAATACACTTGTCAAAGGTTTGTGTCTTAATGGTAAGGTAAAAGAAGCTCTACACTTTCACGACCATGTGCTTGCACTTGGATTTCAATTGAATGAAGTTACTTACGGGACCTTGATCAATGGCTTGTGTAAAATTGGGGAAACAAGAGCTGCCTTGCAAATGTTGAGAAAGATTGATGGGAAATTGGTCAACATCAATGTGGTAATGTATAGCACAATTATTGATGGTTTGTGTAAAGATAAACTTGTAAATGATGCATATGAGTTATATTCTGAAATGATTACAAAGAGAATTTCTCCAAATGTTGTCACTTTTAGTGCTCTTATCTACGGATTTTGCATTGTTGGTCAATTGAAAGAAGCATTTGGTTTGTTCCATCAAATGGTATTGACAAACATCCTCCCAAATGTTTATACTTTTAGCATATTGGTTGATGCTCTATGTAAGGAAGGAAATGTGAAAGAAGCTAAAAGTGTGATAGCTGTGATGATGAGAGAAGGTGTGATGACAAATGTTGTTACCTACAATTCATTAATGGATGGATATTGCCTAGTTAATGAAGTTAATAAGGCCAAACACGTTTTAAGCACTATTGCTCGAATGGGAGTGGCACCTAATGCCCTGAGCTATAATACTGTGATTAATGGATTTTGTAAGAATAAAATGGTCAATGAAGCCTTGAGTCTCTTTGATGAAATGCGGTTCAAAGGAATCGATCCTGATAAGGTAACTTACAATTCTCTCATTGATGGTTTGTGCAAATCAGGGAAAATTTCTCATGCATGGGAGCTTCTTGATCAGATGCATGATAGAGGTCAACCTGCAGATGCATTCACTTACAATTCCTTCTTACATGCTTTATGTAAAAACCATCAAGTTGACAAGGCAATTGCATTTGTCAAGAAAATTAAAGACCAATGCATTCAACTAAATATTCAGACATACAATATACTTATGGATGGACTGTGCAAAGAAGGAAGACTTGAGAATGCACAAGTGATTTTTCAGGATCTTTTGATCAAAGGCTATAATGTAACGGTCTGGACATATAATATTATGATTAATGGCCTTTGTTTGGAGGGATTGTTTGATCAAGCTATGAACCTGCTGGAAAAAATGGAAGAAAATAGTTGCATTCCTAATGTTGTAACGTATGAAACTATTATTCGCGCTCTTTTTAAAAATGATGAGAATGATAGGGCAGAGAAACTTTACGTGAAATGA
Protein sequence

>MsG0680033773.01.T01

MSSLFSSCFRFCNSSSSSINCNFLIPFLKRTLYYSHSRFHSNSNSNSNHVHVVDNVILSFNHMIRMNPTPSIVEFSKILGSLVKLEHYPTVISLSHRLEFNGTMLDIVSLNMLINCYCHLGQMRFAFSIFAKILKMGYQPDSITLNTLVKGLCLNGKVKEALHFHDHVLALGFQLNEVTYGTLINGLCKIGETRAALQMLRKIDGKLVNINVVMYSTIIDGLCKDKLVNDAYELYSEMITKRISPNVVTFSALIYGFCIVGQLKEAFGLFHQMVLTNILPNVYTFSILVDALCKEGNVKEAKSVIAVMMREGVMTNVVTYNSLMDGYCLVNEVNKAKHVLSTIARMGVAPNALSYNTVINGFCKNKMVNEALSLFDEMRFKGIDPDKVTYNSLIDGLCKSGKISHAWELLDQMHDRGQPADAFTYNSFLHALCKNHQVDKAIAFVKKIKDQCIQLNIQTYNILMDGLCKEGRLENAQVIFQDLLIKGYNVTVWTYNIMINGLCLEGLFDQAMNLLEKMEENSCIPNVVTYETIIRALFKNDENDRAEKLYVK*