AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280008091.01

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MsG0280008091.01.T01 AT1G63330 26.000 250 185 0 43 292 277 526 3.38e-28 115
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MsG0280008091.01.T01 AT1G63330 31.868 273 185 1 59 330 188 460 1.04e-45 163
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MsG0280008091.01.T01 AT3G16710 31.081 296 202 2 36 330 169 463 6.50e-48 168
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MsG0280008091.01.T01 AT5G59900 25.591 254 189 0 57 310 263 516 5.75e-25 106
MsG0280008091.01.T01 AT5G59900 25.962 312 206 6 34 322 79 388 1.14e-22 99.4
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MsG0280008091.01.T01 AT1G06580 31.915 235 160 0 86 320 3 237 6.22e-42 150
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MsG0280008091.01.T01 AT1G06580 31.915 235 160 0 86 320 3 237 6.22e-42 150
MsG0280008091.01.T01 AT1G06580 30.038 263 184 0 59 321 11 273 1.08e-37 139
MsG0280008091.01.T01 AT1G06580 36.816 201 127 0 121 321 3 203 2.31e-34 130
MsG0280008091.01.T01 AT1G06580 26.394 269 198 0 54 322 41 309 3.42e-33 127
MsG0280008091.01.T01 AT4G01400 32.082 293 197 2 40 331 139 430 1.15e-44 159
MsG0280008091.01.T01 AT3G53700 30.855 269 185 1 54 321 222 490 1.22e-44 162
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MsG0280008091.01.T01 AT5G65560 27.559 254 184 0 59 312 186 439 2.61e-34 133
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MsG0280008091.01.T01 AT5G65560 27.626 257 184 1 38 292 479 735 1.21e-26 111
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MsG0280008091.01.T01 AT5G65560 29.021 286 199 3 36 320 304 586 1.43e-39 149
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MsG0280008091.01.T01 AT5G65560 27.626 257 184 1 38 292 479 735 1.21e-26 111
MsG0280008091.01.T01 AT5G65560 22.909 275 211 1 34 308 441 714 1.57e-25 107
MsG0280008091.01.T01 AT5G65560 23.729 295 201 5 37 310 619 910 4.88e-17 82.8
MsG0280008091.01.T01 AT5G65560 22.951 122 94 0 199 320 186 307 3.41e-14 73.9
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MsG0280008091.01.T01 AT5G38730 27.875 287 203 3 36 321 149 432 1.69e-32 127
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MsG0280008091.01.T01 AT1G77360 23.500 200 148 3 128 326 134 329 9.44e-17 81.3
MsG0280008091.01.T01 AT1G77360 22.656 256 190 3 54 309 234 481 5.70e-13 69.7
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MsG0280008091.01.T01 AT3G14580 26.609 233 169 1 61 293 139 369 1.74e-21 94.7
MsG0280008091.01.T01 AT3G14580 20.909 220 174 0 54 273 165 384 5.16e-17 81.6
MsG0280008091.01.T01 AT3G14580 35.000 120 78 0 202 321 208 327 1.56e-15 77.4
MsG0280008091.01.T01 AT1G77360 23.810 273 205 3 59 330 171 441 2.62e-24 103
MsG0280008091.01.T01 AT1G77360 22.436 312 204 5 31 307 179 487 2.57e-23 100
MsG0280008091.01.T01 AT1G77360 23.500 200 148 3 128 326 170 365 7.86e-17 81.6
MsG0280008091.01.T01 AT1G77360 22.656 256 190 3 54 309 270 517 5.86e-13 70.1
MsG0280008091.01.T01 AT3G18110 26.126 222 163 1 54 274 295 516 5.91e-24 103
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MsG0280008091.01.T01 AT3G18110 22.140 271 209 2 23 292 300 569 1.09e-16 81.6
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MsG0280008091.01.T01 AT1G19720 21.250 240 185 1 90 329 145 380 4.41e-14 73.6
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MsG0280008091.01.T01 AT1G11630 25.373 201 150 0 121 321 177 377 2.43e-13 70.9
MsG0280008091.01.T01 AT5G39980 24.068 295 218 2 29 320 128 419 4.11e-21 94.7
MsG0280008091.01.T01 AT5G39980 24.901 253 184 2 72 321 241 490 1.59e-18 87.0
MsG0280008091.01.T01 AT5G39980 19.679 249 196 1 47 295 356 600 6.97e-12 67.0
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MsG0280008091.01.T01 AT1G80550 23.320 253 189 4 59 307 84 335 7.62e-16 78.6
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MsG0280008091.01.T01 AT3G59040 21.708 281 211 4 37 312 198 474 8.65e-21 93.6
MsG0280008091.01.T01 AT3G59040 21.453 289 220 3 46 330 171 456 1.55e-18 87.0
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MsG0280008091.01.T01 AT3G04130 21.723 267 189 6 62 320 130 384 4.69e-17 82.4
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MsG0280008091.01.T01 AT3G46610 22.984 248 184 1 68 308 393 640 5.52e-17 82.4
MsG0280008091.01.T01 AT3G46610 19.318 264 206 1 54 310 344 607 9.72e-16 78.6
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MsG0280008091.01.T01 AT3G29290 24.167 240 176 3 62 300 290 524 6.60e-17 82.0
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MsG0280008091.01.T01 AT3G29290 23.881 268 195 3 44 308 100 361 5.69e-14 73.2
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MsG0280008091.01.T01 AT2G35130 21.739 276 170 5 88 322 152 422 4.59e-16 79.3
MsG0280008091.01.T01 AT2G35130 19.713 279 215 4 37 311 243 516 7.61e-15 75.9
MsG0280008091.01.T01 AT2G35130 19.355 248 200 0 47 294 322 569 4.73e-12 67.4
MsG0280008091.01.T01 AT1G77405 23.438 256 145 4 92 298 168 421 1.36e-16 80.9
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MsG0280008091.01.T01 AT1G77405 27.545 167 108 2 167 320 171 337 7.74e-12 66.2
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MsG0280008091.01.T01 AT4G38150 32.639 144 92 3 188 330 127 266 1.40e-16 79.3
MsG0280008091.01.T01 AT4G38150 27.778 144 104 0 166 309 136 279 1.42e-15 76.6
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MsG0280008091.01.T01 AT4G38150 32.639 144 92 3 188 330 127 266 1.40e-16 79.3
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MsG0280008091.01.T01 AT4G38150 24.667 150 107 2 110 256 118 264 3.50e-11 63.5
MsG0280008091.01.T01 AT5G47360 23.431 239 177 3 83 316 158 395 1.61e-16 80.5
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MsG0280008091.01.T01 AT5G27270 22.511 231 177 2 97 326 505 734 5.29e-16 79.3
MsG0280008091.01.T01 AT5G27270 22.078 231 177 2 90 320 396 623 2.89e-11 65.1
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MsG0280008091.01.T01 AT5G03560 28.188 149 102 3 148 295 188 332 1.33e-14 74.3
MsG0280008091.01.T01 AT5G03560 27.941 136 97 1 61 195 202 337 7.14e-13 69.3
MsG0280008091.01.T01 AT5G03560 25.325 154 111 2 113 265 187 337 9.97e-12 65.9
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MsG0280008091.01.T01 AT3G60040 35.043 117 76 0 179 295 488 604 8.59e-15 75.5
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MsG0280008091.01.T01 AT3G09040 21.849 238 178 2 81 318 140 369 2.21e-12 68.6
MsG0280008091.01.T01 AT3G09040 21.317 319 233 8 4 314 606 914 3.31e-14 73.9
MsG0280008091.01.T01 AT3G09040 21.849 238 178 2 81 318 115 344 2.66e-12 68.2
MsG0280008091.01.T01 AT3G09040 21.317 319 233 8 4 314 606 914 3.31e-14 73.9
MsG0280008091.01.T01 AT3G09040 21.849 238 178 2 81 318 115 344 2.66e-12 68.2
MsG0280008091.01.T01 AT5G15010 27.500 200 132 4 119 312 259 451 3.35e-14 73.9
MsG0280008091.01.T01 AT5G15010 28.507 221 143 9 120 330 188 403 2.02e-13 71.2
MsG0280008091.01.T01 AT5G15010 20.705 227 176 2 73 298 284 507 1.95e-12 68.6
MsG0280008091.01.T01 AT5G15010 22.381 210 159 3 57 265 303 509 1.60e-11 65.5
MsG0280008091.01.T01 AT1G06143 22.744 277 195 6 36 310 206 465 3.90e-14 73.6
MsG0280008091.01.T01 AT5G66520 22.407 241 178 3 81 320 69 301 4.26e-14 73.6
MsG0280008091.01.T01 AT5G66520 23.431 239 171 3 73 311 97 323 6.02e-14 73.2
MsG0280008091.01.T01 AT3G23020 23.746 299 217 3 37 329 168 461 4.91e-14 73.6
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MsG0280008091.01.T01 AT3G04750 27.273 242 155 7 88 321 297 525 5.89e-14 73.2
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MsG0280008091.01.T01 AT3G22150 23.364 214 155 4 76 285 469 677 6.32e-12 67.0
MsG0280008091.01.T01 AT1G74600 21.481 270 201 5 56 322 581 842 6.32e-12 67.0
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MsG0280008091.01.T01 AT1G68930 20.308 325 196 9 41 322 22 326 1.10e-11 66.2
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MsG0280008091.01.T01 AT3G20730 24.364 275 181 8 31 295 191 448 9.55e-12 66.2
MsG0280008091.01.T01 AT3G06430 22.179 257 197 3 61 314 93 349 1.02e-11 66.2
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MsG0280008091.01.T01 AT1G05750 19.697 264 167 4 33 295 153 372 1.06e-11 66.2
MsG0280008091.01.T01 AT2G22070 21.839 261 181 6 67 320 223 467 1.13e-11 66.2
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MsG0280008091.01.T01 AT3G25060 21.401 257 162 4 86 311 146 393 1.19e-11 65.9
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MsG0280008091.01.T01 AT2G44880 21.739 230 164 5 88 316 80 294 1.50e-11 65.9
MsG0280008091.01.T01 AT2G44880 21.739 230 164 5 88 316 78 292 1.52e-11 65.9
MsG0280008091.01.T01 AT1G59720 22.436 312 223 8 16 320 40 339 1.56e-11 65.9
MsG0280008091.01.T01 AT4G18840 21.782 202 152 3 90 289 267 464 1.58e-11 65.5
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MsG0280008091.01.T01 AT4G18840 21.782 202 152 3 90 289 267 464 1.58e-11 65.5
MsG0280008091.01.T01 AT2G44880 21.739 230 164 5 88 316 82 296 1.64e-11 65.5
MsG0280008091.01.T01 AT2G44880 21.739 230 164 5 88 316 39 253 1.66e-11 65.5
MsG0280008091.01.T01 AT3G24000 23.457 243 160 4 88 321 92 317 1.86e-11 65.5
MsG0280008091.01.T01 AT2G18520 20.678 295 218 8 2 288 14 300 1.91e-11 65.1
MsG0280008091.01.T01 AT3G23330 23.810 273 191 6 53 320 67 327 1.94e-11 65.5
MsG0280008091.01.T01 AT2G46050 25.909 220 143 6 97 311 183 387 2.05e-11 65.5
MsG0280008091.01.T01 AT5G60960 21.831 284 197 7 56 320 171 448 2.46e-11 65.1
MsG0280008091.01.T01 AT1G43980 20.000 235 177 5 56 288 282 507 3.22e-11 64.7
MsG0280008091.01.T01 AT1G80880 23.837 172 129 2 105 275 238 408 3.55e-11 64.7
MsG0280008091.01.T01 AT1G80880 23.837 172 129 2 105 275 238 408 3.55e-11 64.7
MsG0280008091.01.T01 AT1G80880 23.837 172 129 2 105 275 238 408 3.55e-11 64.7
MsG0280008091.01.T01 AT5G10690 23.171 246 151 8 92 310 78 312 3.97e-11 64.3
MsG0280008091.01.T01 AT5G10690 23.171 246 151 8 92 310 78 312 3.97e-11 64.3
MsG0280008091.01.T01 AT3G51320 23.832 214 155 3 108 321 100 305 4.99e-11 63.9
MsG0280008091.01.T01 AT3G13880 20.385 260 165 5 77 298 302 557 5.19e-11 64.3
MsG0280008091.01.T01 AT1G08070 22.749 211 155 2 110 320 14 216 5.81e-11 63.9
MsG0280008091.01.T01 AT1G11900 26.950 141 102 1 141 280 192 332 5.99e-11 63.5
MsG0280008091.01.T01 AT3G08820 23.661 224 161 4 89 311 74 288 6.11e-11 63.9
MsG0280008091.01.T01 AT1G71490 21.978 273 195 7 42 311 201 458 7.92e-11 63.5
MsG0280008091.01.T01 AT3G13770 21.569 255 164 5 88 310 115 365 8.13e-11 63.5
MsG0280008091.01.T01 AT4G18520 23.913 276 190 7 2 270 228 490 8.44e-11 63.5
MsG0280008091.01.T01 AT2G13600 19.932 296 219 5 31 325 66 344 9.15e-11 63.5
MsG0280008091.01.T01 AT4G21065 22.271 229 168 5 88 314 51 271 9.60e-11 63.2

Find 59 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 78 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATCAAGGGTCTTTGTCTTAA+AGG 0.197932 2:-25392138 MsG0280008091.01.T01:CDS
TGTTACTTATAATTCTTTAA+TGG 0.211640 2:-25391632 MsG0280008091.01.T01:CDS
GTGGGGTGGGATTGTTCTTA+TGG 0.287446 2:+25392394 None:intergenic
GAGACGCGTAGATGGAAAAT+TGG 0.335506 2:-25391983 MsG0280008091.01.T01:CDS
ACCCCACCCGCCATTGAATT+CGG 0.339702 2:-25392378 MsG0280008091.01.T01:CDS
TACTAAAAGTATACACATTT+GGG 0.343642 2:+25391746 None:intergenic
AAAATTTGATATGACCCAAT+TGG 0.348210 2:+25392229 None:intergenic
ATAGTAAAAGTTACAGCATC+AGG 0.356635 2:+25392165 None:intergenic
ATACTAAAAGTATACACATT+TGG 0.360305 2:+25391745 None:intergenic
ACTTATAGTTCTTTAATTAG+TGG 0.363417 2:-25391838 MsG0280008091.01.T01:CDS
TAAACTCCATTTGTTGAGAA+AGG 0.368582 2:+25392304 None:intergenic
CAGTTGGATCAAGTTAGTTA+TGG 0.370473 2:-25392063 MsG0280008091.01.T01:CDS
GAATTCAATGGCGGGTGGGG+TGG 0.395497 2:+25392380 None:intergenic
CAATTGTTGAGACGCGTAGA+TGG 0.396666 2:-25391991 MsG0280008091.01.T01:CDS
TTTGTTTAATAGAATGATAT+CGG 0.396723 2:-25391779 MsG0280008091.01.T01:CDS
TCTCAACAAATGGAGTTTAA+CGG 0.403007 2:-25392300 MsG0280008091.01.T01:CDS
GCCGAATTCAATGGCGGGTG+GGG 0.404015 2:+25392377 None:intergenic
AGCATTGTACTTTCACGATA+AGG 0.417563 2:-25392103 MsG0280008091.01.T01:CDS
TCTTTCCCTTTCTCAACAAA+TGG 0.425775 2:-25392310 MsG0280008091.01.T01:CDS
TTTGAGAATCTTGGCGAATA+CGG 0.432295 2:+25392200 None:intergenic
AATTCAATGGCGGGTGGGGT+GGG 0.433581 2:+25392381 None:intergenic
GTTATGGAACGTTGATCAAT+GGG 0.437173 2:-25392047 MsG0280008091.01.T01:CDS
AAATTTGATATGACCCAATT+GGG 0.440330 2:+25392230 None:intergenic
AGTTATGGAACGTTGATCAA+TGG 0.440948 2:-25392048 MsG0280008091.01.T01:CDS
AGATTGCAAGTGACAAAGTC+TGG 0.441905 2:+25392270 None:intergenic
GTGCTATACATTACCACATT+AGG 0.444088 2:+25391955 None:intergenic
TTTGGGAATGATAGCAGAAA+AGG 0.449944 2:+25392494 None:intergenic
AAACTCCATTTGTTGAGAAA+GGG 0.454255 2:+25392305 None:intergenic
GAACTATAAGTGACAACATC+AGG 0.454793 2:+25391850 None:intergenic
ATTCAACGCTATGGCTCAAA+GGG 0.459216 2:-25391567 MsG0280008091.01.T01:CDS
ATTCGCCAAGATTCTCAAAA+GGG 0.474786 2:-25392196 MsG0280008091.01.T01:CDS
ATGTATAGCACGATTATTGA+TGG 0.476246 2:-25391943 MsG0280008091.01.T01:CDS
ACTTATAATTCTTTAATGGA+TGG 0.482948 2:-25391628 MsG0280008091.01.T01:CDS
GAGAAAGGGAAAGAGCGGTT+TGG 0.483208 2:+25392319 None:intergenic
TAAAATCTTGCCGAATTCAA+TGG 0.486990 2:+25392368 None:intergenic
TCACGATAAGGTTGTAGCGC+AGG 0.496438 2:-25392091 MsG0280008091.01.T01:CDS
TATTCGCCAAGATTCTCAAA+AGG 0.497884 2:-25392197 MsG0280008091.01.T01:CDS
CAAGCGGTGGAACAGTGAAA+TGG 0.498798 2:+25392419 None:intergenic
GATTATTGATGGTATGTGTA+AGG 0.498875 2:-25391932 MsG0280008091.01.T01:CDS
CAGTGAAATGGAATCATCAA+TGG 0.498942 2:+25392431 None:intergenic
CACGATAAGGTTGTAGCGCA+GGG 0.500887 2:-25392090 MsG0280008091.01.T01:CDS
CGAAAGTTTATTCAACGCTA+TGG 0.504463 2:-25391576 MsG0280008091.01.T01:CDS
TGCCGAATTCAATGGCGGGT+GGG 0.510607 2:+25392376 None:intergenic
ATCAATGGGTTATGTAGAGT+TGG 0.514837 2:-25392033 MsG0280008091.01.T01:CDS
TGTAGCGCAGGGGTTTCAGT+TGG 0.527018 2:-25392079 MsG0280008091.01.T01:CDS
TATTCAACGCTATGGCTCAA+AGG 0.541807 2:-25391568 MsG0280008091.01.T01:CDS
TACGCGTCTCAACAATTGTA+CGG 0.560543 2:+25391996 None:intergenic
CTTAGTTAAACAAGTGAACA+AGG 0.575889 2:-25391599 MsG0280008091.01.T01:CDS
ATCTTGCCGAATTCAATGGC+GGG 0.582098 2:+25392372 None:intergenic
TGTTCTTATGGAGCAAGCGG+TGG 0.586451 2:+25392406 None:intergenic
TTGCCGAATTCAATGGCGGG+TGG 0.593749 2:+25392375 None:intergenic
TTGTTGAGAAAGGGAAAGAG+CGG 0.621542 2:+25392314 None:intergenic
TAGTAAAAGTTACAGCATCA+GGG 0.626106 2:+25392166 None:intergenic
AAAATTGGTTCAGCCTAATG+TGG 0.629118 2:-25391968 MsG0280008091.01.T01:CDS
GATTGTTCTTATGGAGCAAG+CGG 0.633285 2:+25392403 None:intergenic
TTCGCCAAGATTCTCAAAAG+GGG 0.639277 2:-25392195 MsG0280008091.01.T01:CDS
AATCTTGCCGAATTCAATGG+CGG 0.647866 2:+25392371 None:intergenic
ACGATAAGGTTGTAGCGCAG+GGG 0.650306 2:-25392089 MsG0280008091.01.T01:CDS
TTCAACGCTATGGCTCAAAG+GGG 0.713222 2:-25391566 MsG0280008091.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TTTGTTTAATAGAATGATAT+CGG - Chr2:25392316-25392335 MsG0280008091.01.T01:CDS 15.0%
!!! AAAAGATTGATTGAAATTTT+TGG + Chr2:25391622-25391641 None:intergenic 15.0%
!!! AAAGATTGATTGAAATTTTT+GGG + Chr2:25391621-25391640 None:intergenic 15.0%
!!! TGTTACTTATAATTCTTTAA+TGG - Chr2:25392463-25392482 MsG0280008091.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTTTGATTTATATTGTGAAA+TGG - Chr2:25392205-25392224 MsG0280008091.01.T01:CDS 15.0%
!! ACTTATAATTCTTTAATGGA+TGG - Chr2:25392467-25392486 MsG0280008091.01.T01:CDS 20.0%
!! ACTTATAGTTCTTTAATTAG+TGG - Chr2:25392257-25392276 MsG0280008091.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATACTAAAAGTATACACATT+TGG + Chr2:25392353-25392372 None:intergenic 20.0%
!!! TACTAAAAGTATACACATTT+GGG + Chr2:25392352-25392371 None:intergenic 20.0%
!!! TGTGTATACTTTTAGTATAT+TGG - Chr2:25392355-25392374 MsG0280008091.01.T01:CDS 20.0%
! AAAATTTGATATGACCCAAT+TGG + Chr2:25391869-25391888 None:intergenic 25.0%
! AAATTTGATATGACCCAATT+GGG + Chr2:25391868-25391887 None:intergenic 25.0%
!! AACTTTTACTATACTCATCA+AGG - Chr2:25391941-25391960 MsG0280008091.01.T01:CDS 25.0%
!! ACTTTTACTATACTCATCAA+GGG - Chr2:25391942-25391961 MsG0280008091.01.T01:CDS 25.0%
!!! ACTTTTAGTATATTGGTTGA+TGG - Chr2:25392362-25392381 MsG0280008091.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATGAATTGTTTTTCCCAATT+GGG - Chr2:25391852-25391871 MsG0280008091.01.T01:CDS 25.0%
ATAGTAAAAGTTACAGCATC+AGG + Chr2:25391933-25391952 None:intergenic 30.0%
ATGTATAGCACGATTATTGA+TGG - Chr2:25392152-25392171 MsG0280008091.01.T01:CDS 30.0%
CTTAGTTAAACAAGTGAACA+AGG - Chr2:25392496-25392515 MsG0280008091.01.T01:CDS 30.0%
TAAAATCTTGCCGAATTCAA+TGG + Chr2:25391730-25391749 None:intergenic 30.0%
TAGTAAAAGTTACAGCATCA+GGG + Chr2:25391932-25391951 None:intergenic 30.0%
TCTCAACAAATGGAGTTTAA+CGG - Chr2:25391795-25391814 MsG0280008091.01.T01:CDS 30.0%
! AAACTCCATTTGTTGAGAAA+GGG + Chr2:25391793-25391812 None:intergenic 30.0%
! ATTGAATTCGGCAAGATTTT+AGG - Chr2:25391729-25391748 MsG0280008091.01.T01:CDS 30.0%
! GATTATTGATGGTATGTGTA+AGG - Chr2:25392163-25392182 MsG0280008091.01.T01:CDS 30.0%
! TAAACTCCATTTGTTGAGAA+AGG + Chr2:25391794-25391813 None:intergenic 30.0%
! TCTTTAATTAGTGGCTTTTG+TGG - Chr2:25392266-25392285 MsG0280008091.01.T01:CDS 30.0%
!! GATGAATTGTTTTTCCCAAT+TGG - Chr2:25391851-25391870 MsG0280008091.01.T01:CDS 30.0%
!!! GTATTGTTTTGCTTTGAGAA+GGG + Chr2:25391757-25391776 None:intergenic 30.0%
AGCATTGTACTTTCACGATA+AGG - Chr2:25391992-25392011 MsG0280008091.01.T01:CDS 35.0%
AGTTATGGAACGTTGATCAA+TGG - Chr2:25392047-25392066 MsG0280008091.01.T01:CDS 35.0%
ATCAAGGGTCTTTGTCTTAA+AGG - Chr2:25391957-25391976 MsG0280008091.01.T01:CDS 35.0%
ATTCGCCAAGATTCTCAAAA+GGG - Chr2:25391899-25391918 MsG0280008091.01.T01:CDS 35.0%
CAGTGAAATGGAATCATCAA+TGG + Chr2:25391667-25391686 None:intergenic 35.0%
CAGTTGGATCAAGTTAGTTA+TGG - Chr2:25392032-25392051 MsG0280008091.01.T01:CDS 35.0%
CGAAAGTTTATTCAACGCTA+TGG - Chr2:25392519-25392538 MsG0280008091.01.T01:CDS 35.0%
GAACTATAAGTGACAACATC+AGG + Chr2:25392248-25392267 None:intergenic 35.0%
GTGCTATACATTACCACATT+AGG + Chr2:25392143-25392162 None:intergenic 35.0%
GTTATGGAACGTTGATCAAT+GGG - Chr2:25392048-25392067 MsG0280008091.01.T01:CDS 35.0%
TATTCGCCAAGATTCTCAAA+AGG - Chr2:25391898-25391917 MsG0280008091.01.T01:CDS 35.0%
TCTTTCCCTTTCTCAACAAA+TGG - Chr2:25391785-25391804 MsG0280008091.01.T01:CDS 35.0%
TTTGAGAATCTTGGCGAATA+CGG + Chr2:25391898-25391917 None:intergenic 35.0%
TTTGGGAATGATAGCAGAAA+AGG + Chr2:25391604-25391623 None:intergenic 35.0%
! AAAATTGGTTCAGCCTAATG+TGG - Chr2:25392127-25392146 MsG0280008091.01.T01:CDS 35.0%
!! ATAACCCCTTTTGAGAATCT+TGG + Chr2:25391907-25391926 None:intergenic 35.0%
!! ATCAATGGGTTATGTAGAGT+TGG - Chr2:25392062-25392081 MsG0280008091.01.T01:CDS 35.0%
!!! ATTGGTTGATGGTTTTTGCA+AGG - Chr2:25392373-25392392 MsG0280008091.01.T01:CDS 35.0%
!!! GGTATTGTTTTGCTTTGAGA+AGG + Chr2:25391758-25391777 None:intergenic 35.0%
AATCTTGCCGAATTCAATGG+CGG + Chr2:25391727-25391746 None:intergenic 40.0%
AGATTGCAAGTGACAAAGTC+TGG + Chr2:25391828-25391847 None:intergenic 40.0%
ATTCAACGCTATGGCTCAAA+GGG - Chr2:25392528-25392547 MsG0280008091.01.T01:CDS 40.0%
GATTGTTCTTATGGAGCAAG+CGG + Chr2:25391695-25391714 None:intergenic 40.0%
TACGCGTCTCAACAATTGTA+CGG + Chr2:25392102-25392121 None:intergenic 40.0%
TATTCAACGCTATGGCTCAA+AGG - Chr2:25392527-25392546 MsG0280008091.01.T01:CDS 40.0%
TTCGCCAAGATTCTCAAAAG+GGG - Chr2:25391900-25391919 MsG0280008091.01.T01:CDS 40.0%
TTGTTGAGAAAGGGAAAGAG+CGG + Chr2:25391784-25391803 None:intergenic 40.0%
!!! GTTGATGGTTTTTGCAAGGA+GGG - Chr2:25392377-25392396 MsG0280008091.01.T01:CDS 40.0%
ATCTTGCCGAATTCAATGGC+GGG + Chr2:25391726-25391745 None:intergenic 45.0%
CAATTGTTGAGACGCGTAGA+TGG - Chr2:25392104-25392123 MsG0280008091.01.T01:CDS 45.0%
GAGACGCGTAGATGGAAAAT+TGG - Chr2:25392112-25392131 MsG0280008091.01.T01:CDS 45.0%
TTCAACGCTATGGCTCAAAG+GGG - Chr2:25392529-25392548 MsG0280008091.01.T01:CDS 45.0%
! ATTAGTGGCTTTTGTGGCGT+TGG - Chr2:25392272-25392291 MsG0280008091.01.T01:CDS 45.0%
! TGGTTTTTGCAAGGAGGGAA+AGG - Chr2:25392382-25392401 MsG0280008091.01.T01:CDS 45.0%
!!! GGTTGATGGTTTTTGCAAGG+AGG - Chr2:25392376-25392395 MsG0280008091.01.T01:CDS 45.0%
ACGATAAGGTTGTAGCGCAG+GGG - Chr2:25392006-25392025 MsG0280008091.01.T01:CDS 50.0%
CAAGCGGTGGAACAGTGAAA+TGG + Chr2:25391679-25391698 None:intergenic 50.0%
CACGATAAGGTTGTAGCGCA+GGG - Chr2:25392005-25392024 MsG0280008091.01.T01:CDS 50.0%
GAGAAAGGGAAAGAGCGGTT+TGG + Chr2:25391779-25391798 None:intergenic 50.0%
GTGGGGTGGGATTGTTCTTA+TGG + Chr2:25391704-25391723 None:intergenic 50.0%
TCACGATAAGGTTGTAGCGC+AGG - Chr2:25392004-25392023 MsG0280008091.01.T01:CDS 50.0%
TGTTCTTATGGAGCAAGCGG+TGG + Chr2:25391692-25391711 None:intergenic 50.0%
ACCCCACCCGCCATTGAATT+CGG - Chr2:25391717-25391736 MsG0280008091.01.T01:CDS 55.0%
TGTAGCGCAGGGGTTTCAGT+TGG - Chr2:25392016-25392035 MsG0280008091.01.T01:CDS 55.0%
! TTGCCGAATTCAATGGCGGG+TGG + Chr2:25391723-25391742 None:intergenic 55.0%
!! AATTCAATGGCGGGTGGGGT+GGG + Chr2:25391717-25391736 None:intergenic 55.0%
!! TGCCGAATTCAATGGCGGGT+GGG + Chr2:25391722-25391741 None:intergenic 55.0%
!! GAATTCAATGGCGGGTGGGG+TGG + Chr2:25391718-25391737 None:intergenic 60.0%
!! GCCGAATTCAATGGCGGGTG+GGG + Chr2:25391721-25391740 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 25391561 25392556 25391561 ID=MsG0280008091.01;Name=MsG0280008091.01
Chr2 mRNA 25391561 25392556 25391561 ID=MsG0280008091.01.T01;Parent=MsG0280008091.01;Name=MsG0280008091.01.T01;_AED=0.44;_eAED=0.44;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|331
Chr2 exon 25391561 25392556 25391561 ID=MsG0280008091.01.T01:exon:3303;Parent=MsG0280008091.01.T01
Chr2 CDS 25391561 25392556 25391561 ID=MsG0280008091.01.T01:cds;Parent=MsG0280008091.01.T01
Gene Sequence

>MsG0280008091.01.T01

ATGTTTTCTTCTTCTTCAAAGTTAACGAGCTATGTTGCTGCCTTTTCTGCTATCATTCCCAAAAATTTCAATCAATCTTTTTATCTCTGCTCTTCAACTTCAACCATTGATGATTCCATTTCACTGTTCCACCGCTTGCTCCATAAGAACAATCCCACCCCACCCGCCATTGAATTCGGCAAGATTTTAGGTTCCCTTCTCAAAGCAAAACAATACCAAACCGCTCTTTCCCTTTCTCAACAAATGGAGTTTAACGGAATCAAACCAGACTTTGTCACTTGCAATCTCTTGATGAATTGTTTTTCCCAATTGGGTCATATCAAATTTTCATTTTCCGTATTCGCCAAGATTCTCAAAAGGGGTTATCACCCTGATGCTGTAACTTTTACTATACTCATCAAGGGTCTTTGTCTTAAAGGCGAGATTCATAAAGCATTGTACTTTCACGATAAGGTTGTAGCGCAGGGGTTTCAGTTGGATCAAGTTAGTTATGGAACGTTGATCAATGGGTTATGTAGAGTTGGCGAAACAAAAGCAGCCGTACAATTGTTGAGACGCGTAGATGGAAAATTGGTTCAGCCTAATGTGGTAATGTATAGCACGATTATTGATGGTATGTGTAAGGATAAACTTGTTAACGATGCTTTTGATTTATATTGTGAAATGGTTGCTAAGAGAATTTCTCCTGATGTTGTCACTTATAGTTCTTTAATTAGTGGCTTTTGTGGCGTTGGTAAATTGAAAGATGCTGTTGATTTGTTTAATAGAATGATATCGGAAAACATTAACCCAAATGTGTATACTTTTAGTATATTGGTTGATGGTTTTTGCAAGGAGGGAAAGGTGAAAGAAACTAAAAATGTGTTAGCTGTGATGATGAAAAAAGACGTAAAACTTGATGTTGTTACTTATAATTCTTTAATGGATGGATATTGCTTAGTTAAACAAGTGAACAAGGCGAAAGTTTATTCAACGCTATGGCTCAAAGGGGAGTAA
Protein sequence

>MsG0280008091.01.T01

MFSSSSKLTSYVAAFSAIIPKNFNQSFYLCSSTSTIDDSISLFHRLLHKNNPTPPAIEFGKILGSLLKAKQYQTALSLSQQMEFNGIKPDFVTCNLLMNCFSQLGHIKFSFSVFAKILKRGYHPDAVTFTILIKGLCLKGEIHKALYFHDKVVAQGFQLDQVSYGTLINGLCRVGETKAAVQLLRRVDGKLVQPNVVMYSTIIDGMCKDKLVNDAFDLYCEMVAKRISPDVVTYSSLISGFCGVGKLKDAVDLFNRMISENINPNVYTFSILVDGFCKEGKVKETKNVLAVMMKKDVKLDVVTYNSLMDGYCLVKQVNKAKVYSTLWLKGE*