AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035252.01

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MsG0680035252.01.T01 AT1G05670 29.070 430 304 1 8 436 275 704 1.81e-65 225
MsG0680035252.01.T01 AT1G05670 28.982 383 271 1 2 383 339 721 1.57e-59 209
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MsG0680035252.01.T01 AT1G13630 31.818 242 164 1 260 500 236 477 6.45e-33 133
MsG0680035252.01.T01 AT1G13630 25.060 415 252 5 20 398 416 807 2.91e-32 131
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MsG0680035252.01.T01 AT5G28460 22.531 324 214 2 12 298 439 762 1.05e-19 93.2
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MsG0680035252.01.T01 AT5G14770 29.221 462 294 5 68 499 79 537 2.30e-54 197
MsG0680035252.01.T01 AT5G14770 29.828 466 315 5 31 493 112 568 1.83e-53 194
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MsG0680035252.01.T01 AT5G08310 25.591 254 181 4 251 499 99 349 2.67e-14 76.3
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MsG0680035252.01.T01 AT5G25630 24.263 441 298 7 1 408 67 504 3.01e-40 153
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MsG0680035252.01.T01 AT5G25630 24.615 260 168 4 46 277 257 516 8.95e-18 86.7
MsG0680035252.01.T01 AT5G25630 24.638 207 153 1 293 496 45 251 2.60e-16 82.4
MsG0680035252.01.T01 AT1G74850 27.204 397 287 2 81 475 138 534 5.72e-42 160
MsG0680035252.01.T01 AT1G74850 25.796 314 228 4 186 496 139 450 2.02e-32 132
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MsG0680035252.01.T01 AT3G59040 23.645 406 299 4 20 417 106 508 6.50e-35 138
MsG0680035252.01.T01 AT3G59040 20.382 314 244 2 189 499 140 450 9.54e-23 102
MsG0680035252.01.T01 AT5G11310 26.087 391 272 6 114 490 130 517 1.05e-37 146
MsG0680035252.01.T01 AT5G11310 22.877 424 238 10 41 412 123 509 8.94e-28 117
MsG0680035252.01.T01 AT5G11310 23.032 343 245 6 150 475 127 467 1.93e-26 113
MsG0680035252.01.T01 AT5G11310 20.710 338 221 6 145 471 92 393 2.09e-17 85.5
MsG0680035252.01.T01 AT5G11310 22.420 281 217 1 6 285 242 522 4.99e-17 84.3
MsG0680035252.01.T01 AT1G73710 26.482 506 347 14 9 500 298 792 1.29e-37 147
MsG0680035252.01.T01 AT1G73710 22.330 515 377 6 7 499 138 651 4.38e-26 113
MsG0680035252.01.T01 AT1G73710 23.820 466 341 7 1 459 327 785 1.20e-24 108
MsG0680035252.01.T01 AT1G73710 21.235 405 310 6 15 415 516 915 7.94e-22 100
MsG0680035252.01.T01 AT4G01400 26.144 306 225 1 191 495 122 427 1.66e-37 144
MsG0680035252.01.T01 AT4G01400 28.904 301 212 2 2 300 142 442 8.36e-32 127
MsG0680035252.01.T01 AT4G01400 26.866 268 194 2 158 423 158 425 1.54e-29 121
MsG0680035252.01.T01 AT4G01400 24.924 329 245 2 71 397 106 434 1.02e-28 119
MsG0680035252.01.T01 AT4G01400 27.106 273 198 1 228 499 89 361 6.89e-25 107
MsG0680035252.01.T01 AT5G46680 26.304 441 310 8 40 474 6 437 4.42e-37 142
MsG0680035252.01.T01 AT5G46680 28.409 352 246 5 145 491 2 352 5.72e-37 142
MsG0680035252.01.T01 AT5G46680 29.537 281 194 3 221 498 9 288 1.40e-33 132
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MsG0680035252.01.T01 AT2G35030 26.708 322 183 9 207 498 27 325 3.75e-28 118
MsG0680035252.01.T01 AT2G35030 22.414 406 284 12 15 416 110 488 1.71e-24 107
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MsG0680035252.01.T01 AT5G50280 23.184 358 272 3 82 436 306 663 4.06e-33 134
MsG0680035252.01.T01 AT5G50280 25.568 352 253 5 154 499 273 621 5.67e-31 127
MsG0680035252.01.T01 AT5G50280 24.722 360 268 3 122 478 276 635 4.79e-30 124
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MsG0680035252.01.T01 AT1G73400 25.573 262 189 4 11 267 230 490 1.08e-19 92.8
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MsG0680035252.01.T01 AT5G14820 28.629 248 175 2 251 498 187 432 2.03e-26 113
MsG0680035252.01.T01 AT5G14820 22.727 330 249 3 17 343 231 557 2.74e-22 100
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MsG0680035252.01.T01 AT1G05600 22.115 416 285 6 1 409 103 486 1.30e-26 113
MsG0680035252.01.T01 AT1G05600 21.083 351 199 6 222 494 45 395 3.85e-13 72.0
MsG0680035252.01.T01 AT1G05600 24.350 423 302 8 70 478 67 485 1.13e-31 128
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MsG0680035252.01.T01 AT1G74750 24.257 404 277 7 114 496 321 716 1.56e-26 114
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MsG0680035252.01.T01 AT1G74750 26.974 304 214 5 114 413 354 653 1.11e-30 127
MsG0680035252.01.T01 AT1G74750 27.622 286 207 0 190 475 361 646 1.41e-30 126
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MsG0680035252.01.T01 AT1G63320 29.444 180 117 2 249 419 7 185 2.48e-20 89.4
MsG0680035252.01.T01 AT1G63320 33.121 157 95 3 120 266 17 173 2.00e-17 80.9
MsG0680035252.01.T01 AT1G63320 26.590 173 117 2 139 301 1 173 4.98e-16 77.0
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MsG0680035252.01.T01 AT4G02750 23.762 404 245 10 50 417 189 565 2.44e-26 113
MsG0680035252.01.T01 AT4G02750 22.843 394 234 12 108 459 4 369 2.57e-21 98.2
MsG0680035252.01.T01 AT4G02750 20.192 312 217 8 188 499 64 343 5.31e-17 84.7
MsG0680035252.01.T01 AT4G02750 24.561 171 113 4 291 461 62 216 8.65e-13 71.2
MsG0680035252.01.T01 AT3G13160 26.054 261 186 2 241 500 95 349 9.34e-27 112
MsG0680035252.01.T01 AT3G13160 23.282 262 199 1 123 382 110 371 1.32e-21 97.1
MsG0680035252.01.T01 AT3G13160 23.047 256 195 2 169 422 121 376 6.28e-20 92.0
MsG0680035252.01.T01 AT3G13160 20.455 264 209 1 229 491 112 375 7.64e-18 85.9
MsG0680035252.01.T01 AT3G13160 22.000 250 193 2 1 248 128 377 2.29e-16 81.3
MsG0680035252.01.T01 AT3G62890 25.762 361 226 12 64 407 44 379 9.48e-27 114
MsG0680035252.01.T01 AT4G16390 24.528 318 238 2 154 469 175 492 1.54e-26 114
MsG0680035252.01.T01 AT4G16390 23.599 339 221 5 1 301 161 499 4.49e-21 97.4
MsG0680035252.01.T01 AT4G16390 24.510 204 154 0 296 499 178 381 2.60e-12 69.7
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MsG0680035252.01.T01 AT1G53600 22.912 419 278 9 81 471 141 542 1.26e-25 111
MsG0680035252.01.T01 AT1G53600 21.689 438 277 13 20 417 183 594 2.99e-22 100
MsG0680035252.01.T01 AT1G53600 26.740 273 188 4 118 389 340 601 8.33e-21 96.7
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MsG0680035252.01.T01 AT1G68930 22.762 391 277 8 34 417 155 527 6.11e-22 100
MsG0680035252.01.T01 AT1G68930 22.563 359 261 5 143 500 61 403 3.02e-19 91.7
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MsG0680035252.01.T01 AT2G13600 21.450 331 210 7 194 491 61 374 2.07e-13 73.2
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MsG0680035252.01.T01 AT3G14580 21.769 294 227 2 151 441 92 385 7.33e-21 95.1
MsG0680035252.01.T01 AT3G14580 24.715 263 190 3 122 382 141 397 2.36e-19 90.5
MsG0680035252.01.T01 AT3G14580 25.397 189 140 1 12 199 165 353 3.92e-16 80.9
MsG0680035252.01.T01 AT1G80150 29.515 227 144 5 154 370 177 397 3.78e-24 104
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MsG0680035252.01.T01 AT1G80150 25.490 204 152 0 219 422 173 376 1.61e-15 79.0
MsG0680035252.01.T01 AT1G80150 23.790 248 167 4 17 252 144 381 5.53e-13 71.2
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MsG0680035252.01.T01 AT3G29290 22.899 476 303 13 17 478 110 535 9.14e-24 105
MsG0680035252.01.T01 AT3G29290 20.339 413 285 3 126 499 114 521 7.61e-18 87.0
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MsG0680035252.01.T01 AT5G15280 22.348 264 199 3 240 500 200 460 5.96e-13 72.0
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MsG0680035252.01.T01 AT4G14820 21.818 440 303 11 55 483 152 561 1.27e-19 92.8
MsG0680035252.01.T01 AT3G29230 23.645 406 256 8 74 477 72 425 7.44e-23 102
MsG0680035252.01.T01 AT3G29230 22.306 399 255 9 28 389 130 510 1.94e-20 95.1
MsG0680035252.01.T01 AT1G56690 22.654 437 241 12 98 470 31 434 8.08e-23 102
MsG0680035252.01.T01 AT1G56690 20.335 418 305 9 81 497 107 497 1.18e-18 89.7
MsG0680035252.01.T01 AT1G56690 24.513 359 219 10 69 425 219 527 2.11e-16 82.8
MsG0680035252.01.T01 AT4G37170 21.584 505 360 12 7 497 3 485 8.13e-23 102
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MsG0680035252.01.T01 AT2G36980 23.765 425 302 8 50 471 36 441 6.01e-21 96.7
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MsG0680035252.01.T01 AT1G17630 21.951 369 269 6 106 468 180 535 2.50e-14 76.3
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MsG0680035252.01.T01 AT1G74630 21.149 435 319 10 46 477 82 495 2.93e-17 85.5
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MsG0680035252.01.T01 AT5G40405 20.942 382 281 9 31 407 53 418 1.27e-15 80.1
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MsG0680035252.01.T01 AT2G42920 21.976 496 291 13 16 461 40 489 8.63e-20 92.8
MsG0680035252.01.T01 AT2G42920 23.676 321 221 8 184 499 54 355 9.06e-18 86.7
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MsG0680035252.01.T01 AT3G22150 23.134 402 282 9 28 424 338 717 2.22e-19 92.0
MsG0680035252.01.T01 AT3G22150 21.767 464 314 10 50 477 180 630 8.89e-17 84.0
MsG0680035252.01.T01 AT4G14050 26.038 265 183 6 155 417 88 341 2.35e-19 91.7
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MsG0680035252.01.T01 AT3G25210 27.742 155 112 0 29 183 203 357 1.73e-14 75.5
MsG0680035252.01.T01 AT3G25210 31.008 129 89 0 350 478 210 338 3.84e-13 71.2
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MsG0680035252.01.T01 AT2G37310 23.204 362 258 7 141 497 150 496 4.33e-19 90.9
MsG0680035252.01.T01 AT2G20540 21.448 359 266 6 69 425 93 437 4.13e-19 90.9
MsG0680035252.01.T01 AT2G20540 21.053 342 244 7 139 467 58 386 1.59e-14 76.6
MsG0680035252.01.T01 AT4G38150 31.847 157 104 1 277 433 118 271 4.32e-19 88.2
MsG0680035252.01.T01 AT4G38150 28.221 163 114 1 209 371 120 279 8.44e-19 87.4
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MsG0680035252.01.T01 AT4G35130 20.619 388 225 8 161 480 71 443 3.47e-18 88.6
MsG0680035252.01.T01 AT4G35130 20.045 444 299 8 90 496 101 525 1.41e-15 80.1
MsG0680035252.01.T01 AT4G35130 19.794 389 260 9 6 389 253 594 1.04e-12 71.2
MsG0680035252.01.T01 AT3G01580 24.911 281 193 7 192 468 100 366 3.67e-18 88.2
MsG0680035252.01.T01 AT1G28690 24.516 310 209 8 170 471 85 377 4.12e-18 87.4
MsG0680035252.01.T01 AT1G28690 22.000 350 245 7 81 418 97 430 1.41e-17 85.9
MsG0680035252.01.T01 AT1G28690 25.210 238 163 6 189 424 176 400 1.84e-15 79.3
MsG0680035252.01.T01 AT2G02980 19.617 418 255 7 109 490 49 421 6.21e-18 87.4
MsG0680035252.01.T01 AT2G02980 23.145 337 239 10 46 377 91 412 7.58e-17 84.0
MsG0680035252.01.T01 AT2G02980 19.250 400 274 9 55 452 66 418 6.25e-12 68.6
MsG0680035252.01.T01 AT3G23330 18.766 389 300 7 10 395 94 469 8.68e-18 87.0
MsG0680035252.01.T01 AT3G23330 21.264 348 221 8 188 496 98 431 1.11e-17 86.7
MsG0680035252.01.T01 AT3G23330 19.250 400 311 6 65 463 79 467 7.53e-16 80.9
MsG0680035252.01.T01 AT3G23330 21.094 256 194 2 222 477 97 344 2.48e-15 79.3
MsG0680035252.01.T01 AT3G57430 22.477 436 287 10 20 417 68 490 9.85e-18 87.0
MsG0680035252.01.T01 AT2G36980 26.490 302 202 7 173 471 5 289 1.01e-17 86.3
MsG0680035252.01.T01 AT2G36980 20.554 433 289 15 90 499 23 423 1.25e-11 67.0
MsG0680035252.01.T01 AT2G18520 22.911 371 267 8 135 492 4 368 1.01e-17 85.9
MsG0680035252.01.T01 AT2G18520 24.333 300 180 9 123 417 106 363 2.37e-15 78.6
MsG0680035252.01.T01 AT2G18520 22.490 249 186 4 256 499 28 274 4.37e-15 77.8
MsG0680035252.01.T01 AT2G18520 23.311 296 212 7 1 286 117 407 1.47e-13 72.8
MsG0680035252.01.T01 AT1G30610 23.765 324 209 7 207 498 526 843 1.13e-17 87.0
MsG0680035252.01.T01 AT1G30610 24.260 338 205 8 142 466 582 881 1.55e-17 86.7
MsG0680035252.01.T01 AT1G30610 22.821 390 262 7 106 466 530 909 1.39e-17 86.7
MsG0680035252.01.T01 AT1G30610 22.159 352 208 9 207 498 526 871 1.50e-13 73.9
MsG0680035252.01.T01 AT5G61370 25.418 299 196 6 190 475 175 459 1.42e-17 85.9
MsG0680035252.01.T01 AT5G61370 22.184 293 221 1 210 495 125 417 4.32e-16 81.3
MsG0680035252.01.T01 AT1G34160 22.626 358 230 9 62 417 50 362 1.48e-17 86.3
MsG0680035252.01.T01 AT1G34160 22.715 383 270 10 46 416 65 433 2.80e-16 82.0
MsG0680035252.01.T01 AT1G31920 19.938 321 209 5 170 453 82 391 1.50e-17 86.3
MsG0680035252.01.T01 AT3G09040 19.630 433 327 6 39 468 140 554 1.66e-17 86.7
MsG0680035252.01.T01 AT3G09040 21.975 405 266 6 128 490 79 475 1.28e-16 83.6
MsG0680035252.01.T01 AT3G09040 20.085 468 317 10 47 475 315 764 5.73e-16 81.6
MsG0680035252.01.T01 AT3G09040 19.958 471 292 13 75 475 479 934 4.53e-15 79.0
MsG0680035252.01.T01 AT3G09040 21.081 370 235 9 55 417 595 914 1.61e-12 70.9
MsG0680035252.01.T01 AT3G09040 19.630 433 327 6 39 468 140 554 1.66e-17 86.7
MsG0680035252.01.T01 AT3G09040 21.975 405 266 6 128 490 79 475 1.28e-16 83.6
MsG0680035252.01.T01 AT3G09040 20.085 468 317 10 47 475 315 764 5.73e-16 81.6
MsG0680035252.01.T01 AT3G09040 19.958 471 292 13 75 475 479 934 4.53e-15 79.0
MsG0680035252.01.T01 AT3G09040 21.081 370 235 9 55 417 595 914 1.61e-12 70.9
MsG0680035252.01.T01 AT3G09040 19.630 433 327 6 39 468 115 529 1.78e-17 86.3
MsG0680035252.01.T01 AT3G09040 21.975 405 266 6 128 490 54 450 1.27e-16 83.6
MsG0680035252.01.T01 AT3G09040 20.085 468 317 10 47 475 290 739 5.39e-16 81.6
MsG0680035252.01.T01 AT3G09040 19.958 471 292 13 75 475 454 909 4.26e-15 79.0
MsG0680035252.01.T01 AT3G09040 21.081 370 235 9 55 417 570 889 1.53e-12 70.9
MsG0680035252.01.T01 AT3G09040 19.630 433 327 6 39 468 115 529 1.78e-17 86.3
MsG0680035252.01.T01 AT3G09040 21.975 405 266 6 128 490 54 450 1.27e-16 83.6
MsG0680035252.01.T01 AT3G09040 20.085 468 317 10 47 475 290 739 5.39e-16 81.6
MsG0680035252.01.T01 AT3G09040 19.958 471 292 13 75 475 454 909 4.26e-15 79.0
MsG0680035252.01.T01 AT3G09040 21.081 370 235 9 55 417 570 889 1.53e-12 70.9
MsG0680035252.01.T01 AT2G27610 21.007 457 273 11 89 475 63 501 1.97e-17 86.3
MsG0680035252.01.T01 AT2G27610 20.261 459 310 9 50 471 160 599 3.25e-17 85.5
MsG0680035252.01.T01 AT2G27610 21.670 503 290 13 1 424 181 658 3.12e-16 82.4
MsG0680035252.01.T01 AT2G27610 23.137 255 186 3 210 462 43 289 1.01e-11 68.2

Find 102 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 120 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTCTCATCAAATGGAATTTA+AGG 0.045048 6:-101098953 MsG0680035252.01.T01:CDS
TGTTACTTATAACTCTTTAA+TGG 0.169542 6:-101098287 MsG0680035252.01.T01:CDS
CATTAATTCTTTCTGTCAAT+TGG 0.204719 6:-101098896 MsG0680035252.01.T01:CDS
ATTGGCAAAGATTCTCAAAA+AGG 0.221966 6:-101098848 MsG0680035252.01.T01:CDS
ACTCCACCCGCTATCGAATT+TGG 0.257121 6:-101099030 MsG0680035252.01.T01:CDS
GAAGTCAATGTTATGGTATT+TGG 0.261123 6:+101098817 None:intergenic
AGCTACAATATCATGATTAA+TGG 0.266795 6:-101098178 MsG0680035252.01.T01:CDS
AGTTATGGAACCTTGATTAA+TGG 0.268280 6:-101098700 MsG0680035252.01.T01:CDS
CCGACGAGTTGATGGAAAAT+TGG 0.280558 6:-101098635 MsG0680035252.01.T01:CDS
GATTACTTACAATTCTATAT+TGG 0.289788 6:-101097972 MsG0680035252.01.T01:CDS
AGTATATTGGTTGATGGATT+TGG 0.291299 6:-101098382 MsG0680035252.01.T01:CDS
TGTGTATACATTTAGTATAT+TGG 0.299955 6:-101098395 MsG0680035252.01.T01:CDS
TTTGTTTAATAAAATGATAT+TGG 0.312248 6:-101098434 MsG0680035252.01.T01:CDS
GTTATGGAACCTTGATTAAT+GGG 0.330102 6:-101098699 MsG0680035252.01.T01:CDS
TCTCATCAAATGGAATTTAA+GGG 0.351301 6:-101098952 MsG0680035252.01.T01:CDS
CATGAAAGTGCAATGCTTGA+TGG 0.354156 6:+101098761 None:intergenic
AACAACAGTGTGGTAATGTT+TGG 0.358144 6:+101098981 None:intergenic
GATTGCGATGGGATTTCATT+TGG 0.358312 6:-101098731 MsG0680035252.01.T01:CDS
ACATTTAGTATATTGGTTGA+TGG 0.361835 6:-101098388 MsG0680035252.01.T01:CDS
CATTTGGACCAAGTTAGTTA+TGG 0.362825 6:-101098715 MsG0680035252.01.T01:CDS
TACTAAATGTATACACATTC+GGG 0.367591 6:+101098401 None:intergenic
GAATTGTAAGTAATCATATT+AGG 0.370721 6:+101097980 None:intergenic
TAAATTCCATTTGATGAGAA+AGG 0.375398 6:+101098956 None:intergenic
GCCAATACATAAACAGCAAA+AGG 0.376239 6:+101098865 None:intergenic
TGTTTCCCTTTCTCATCAAA+TGG 0.378647 6:-101098962 MsG0680035252.01.T01:CDS
ATTAATTCTTTCTGTCAATT+GGG 0.381365 6:-101098895 MsG0680035252.01.T01:CDS
ATACTAAATGTATACACATT+CGG 0.388933 6:+101098400 None:intergenic
ATCGATGGTTTGTGTAAGTC+GGG 0.389719 6:-101098058 MsG0680035252.01.T01:CDS
GAATTGCTCCGACGAGTTGA+TGG 0.391402 6:-101098643 MsG0680035252.01.T01:CDS
GAATTGTAAGTTACCACATT+AGG 0.392884 6:+101098085 None:intergenic
CATCTCTTTCAAAGAGAGAA+AGG 0.393692 6:+101097636 None:intergenic
TTTGCACATACCATCAATAA+TGG 0.398089 6:+101098585 None:intergenic
AGCATTGCACTTTCATGATA+AGG 0.402201 6:-101098755 MsG0680035252.01.T01:CDS
ATATATACCGTTATGATTCA+AGG 0.434755 6:-101097758 MsG0680035252.01.T01:CDS
ATTAATGGGTTGTGTAAAGT+TGG 0.452436 6:-101098685 MsG0680035252.01.T01:CDS
TGAAAGAGATGAAAATGAAA+TGG 0.454680 6:-101097624 MsG0680035252.01.T01:CDS
TTTACACAACCCATTAATCA+AGG 0.456779 6:+101098690 None:intergenic
ACTTACACCGCTTTAATTAG+TGG 0.463045 6:-101098493 MsG0680035252.01.T01:CDS
GTTGATGGATTTGGTAAGGA+AGG 0.465144 6:-101098373 MsG0680035252.01.T01:CDS
CAACTCGTCGGAGCAATTCA+AGG 0.465670 6:+101098647 None:intergenic
CTTACACAAACCATCGATAA+GGG 0.474123 6:+101098063 None:intergenic
CGGGTGGAGTGGGATTCTTA+TGG 0.479056 6:+101099043 None:intergenic
GAGTTATAAGTAACAACGTC+CGG 0.479404 6:+101098295 None:intergenic
AAATTCCATTTGATGAGAAA+GGG 0.479963 6:+101098957 None:intergenic
TATATACCGTTATGATTCAA+GGG 0.480321 6:-101097757 MsG0680035252.01.T01:CDS
ATGGATTTGGTAAGGAAGGA+AGG 0.480625 6:-101098369 MsG0680035252.01.T01:CDS
ATGTACAATACCATTATTGA+TGG 0.481901 6:-101098595 MsG0680035252.01.T01:CDS
ATGTTGCAATTGACAAAGCC+TGG 0.482654 6:+101098922 None:intergenic
TCAAGGTTCCATAACTAACT+TGG 0.483114 6:+101098707 None:intergenic
TGGCTTGTTTGATGAAGCAT+TGG 0.484016 6:-101097723 MsG0680035252.01.T01:CDS
GATGAGTGAAGTCAATGTTA+TGG 0.484431 6:+101098810 None:intergenic
CTTACACCGCTTTAATTAGT+GGG 0.488309 6:-101098492 MsG0680035252.01.T01:CDS
CATGATAAGGTGATTGCGAT+GGG 0.491058 6:-101098742 MsG0680035252.01.T01:CDS
GTTGTGTGTGTACACATATC+TGG 0.493829 6:+101097875 None:intergenic
ACTTACACAAACCATCGATA+AGG 0.495898 6:+101098062 None:intergenic
ACTTATAACTCTTTAATGGA+TGG 0.499169 6:-101098283 MsG0680035252.01.T01:CDS
ATCTTACCAAATTCGATAGC+GGG 0.504208 6:+101099024 None:intergenic
TATCGATGGTTTGTGTAAGT+CGG 0.507302 6:-101098059 MsG0680035252.01.T01:CDS
GACGAAACAAGGCATTAAAC+CGG 0.512359 6:-101098314 MsG0680035252.01.T01:CDS
TTTGAAGATCTTCTGGTCAA+AGG 0.512445 6:-101097800 MsG0680035252.01.T01:CDS
ATTGGTTGATGGATTTGGTA+AGG 0.512512 6:-101098377 MsG0680035252.01.T01:CDS
GTCGATGAGATGCAAGATAG+AGG 0.517828 6:-101098010 MsG0680035252.01.T01:CDS
GGGGAGTAACTACTAATGTT+CGG 0.519889 6:-101098201 MsG0680035252.01.T01:CDS
GAATTTAAGGGAATTAAGCC+AGG 0.520530 6:-101098940 MsG0680035252.01.T01:CDS
ATCAAAGGTCACTGTCTCAA+AGG 0.526202 6:-101098790 MsG0680035252.01.T01:CDS
ATTCAACACTATGTCTCGTA+GGG 0.529272 6:-101098221 MsG0680035252.01.T01:CDS
TAAAAGAATTATTCCTAATG+TGG 0.536912 6:-101098098 MsG0680035252.01.T01:CDS
CCAATACATAAACAGCAAAA+GGG 0.538349 6:+101098866 None:intergenic
ATGGAAGACTAGAGGATGCA+TGG 0.539193 6:-101097829 MsG0680035252.01.T01:CDS
TCATGATAAGGTGATTGCGA+TGG 0.539726 6:-101098743 MsG0680035252.01.T01:CDS
ACAAAACCCTTGAATCATAA+CGG 0.551384 6:+101097751 None:intergenic
ATTGACAGAAAGAATTAATG+AGG 0.552354 6:+101098899 None:intergenic
GCGGTGTAAGTGACAACAGT+TGG 0.558651 6:+101098505 None:intergenic
ACTTACAATTCCCTTATCGA+TGG 0.561737 6:-101098073 MsG0680035252.01.T01:CDS
TACACACACAACACTTGTTG+AGG 0.569057 6:-101097864 MsG0680035252.01.T01:CDS
AATTCGATAGCGGGTGGAGT+GGG 0.571603 6:+101099033 None:intergenic
ATTATTGATGGTATGTGCAA+AGG 0.572696 6:-101098583 MsG0680035252.01.T01:CDS
GAATTGCCTTGTCAACCTGA+TGG 0.574284 6:+101097933 None:intergenic
TGGATTTGGTAAGGAAGGAA+GGG 0.574940 6:-101098368 MsG0680035252.01.T01:CDS
TATTCAACACTATGTCTCGT+AGG 0.576365 6:-101098222 MsG0680035252.01.T01:CDS
TCTAGTAAGTGAAGTGAACA+AGG 0.577861 6:-101098254 MsG0680035252.01.T01:CDS
ACACACACAACACTTGTTGA+GGG 0.586517 6:-101097863 MsG0680035252.01.T01:CDS
ATGCTTCATCAAACAAGCCA+TGG 0.598430 6:+101097726 None:intergenic
AACTCGTCGGAGCAATTCAA+GGG 0.605482 6:+101098648 None:intergenic
GATGGAAAATTGGTTCAGCC+TGG 0.614206 6:-101098625 MsG0680035252.01.T01:CDS
TCTTTCATCTTCGTTAACAA+CGG 0.616177 6:+101097911 None:intergenic
AAATTCGATAGCGGGTGGAG+TGG 0.620193 6:+101099032 None:intergenic
TTAGCTATGATGACGAAACA+AGG 0.625326 6:-101098325 MsG0680035252.01.T01:CDS
ACATTGACTTCACTCATCAA+AGG 0.634796 6:-101098805 MsG0680035252.01.T01:CDS
AATCTTACCAAATTCGATAG+CGG 0.639290 6:+101099023 None:intergenic
GCAAAACCCACTAATTAAAG+CGG 0.641769 6:+101098486 None:intergenic
TTACCAAATTCGATAGCGGG+TGG 0.645752 6:+101099027 None:intergenic
CTTCGTGAAATGATAGTGAG+AGG 0.646045 6:-101097590 MsG0680035252.01.T01:CDS
TCGATGGTTTGTGTAAGTCG+GGG 0.646920 6:-101098057 MsG0680035252.01.T01:CDS
GGTAATGTTTGGATTTGACA+AGG 0.657021 6:+101098992 None:intergenic
TTGTAAGTAATCATATTAGG+TGG 0.674084 6:+101097983 None:intergenic
GTAATGTTTGGATTTGACAA+GGG 0.676865 6:+101098993 None:intergenic
GTATTGTACATTACCACACC+AGG 0.689334 6:+101098607 None:intergenic
TTAACGAAGATGAAAGACGA+AGG 0.693314 6:-101097905 MsG0680035252.01.T01:CDS
TTCAACACTATGTCTCGTAG+GGG 0.705124 6:-101098220 MsG0680035252.01.T01:CDS
AAAATTGGTTCAGCCTGGTG+TGG 0.706338 6:-101098620 MsG0680035252.01.T01:CDS
GAGAAAGGGAAACAACAGTG+TGG 0.747142 6:+101098971 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TTTGTTTAATAAAATGATAT+TGG - Chr6:101098206-101098225 MsG0680035252.01.T01:CDS 10.0%
!! ATACTAAATGTATACACATT+CGG + Chr6:101098243-101098262 None:intergenic 20.0%
!! ATTAATTCTTTCTGTCAATT+GGG - Chr6:101097745-101097764 MsG0680035252.01.T01:CDS 20.0%
!! GAATTGTAAGTAATCATATT+AGG + Chr6:101098663-101098682 None:intergenic 20.0%
!! GATTACTTACAATTCTATAT+TGG - Chr6:101098668-101098687 MsG0680035252.01.T01:CDS 20.0%
!! TAAAAGAATTATTCCTAATG+TGG - Chr6:101098542-101098561 MsG0680035252.01.T01:CDS 20.0%
!! TGTGTATACATTTAGTATAT+TGG - Chr6:101098245-101098264 MsG0680035252.01.T01:CDS 20.0%
!! TTGTTAAAAATGGAAAACAA+TGG - Chr6:101098945-101098964 MsG0680035252.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTTTGTAAGGTTAAATTGT+TGG - Chr6:101098485-101098504 MsG0680035252.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGTTACTTATAACTCTTTAA+TGG - Chr6:101098353-101098372 MsG0680035252.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTGTAAGGTTAAATTGTT+GGG - Chr6:101098486-101098505 MsG0680035252.01.T01:CDS 20.0%
! AAATTCCATTTGATGAGAAA+GGG + Chr6:101097686-101097705 None:intergenic 25.0%
! ACTTATAACTCTTTAATGGA+TGG - Chr6:101098357-101098376 MsG0680035252.01.T01:CDS 25.0%
! AGCTACAATATCATGATTAA+TGG - Chr6:101098462-101098481 MsG0680035252.01.T01:CDS 25.0%
! ATATATACCGTTATGATTCA+AGG - Chr6:101098882-101098901 MsG0680035252.01.T01:CDS 25.0%
! ATGTACAATACCATTATTGA+TGG - Chr6:101098045-101098064 MsG0680035252.01.T01:CDS 25.0%
! ATTGACAGAAAGAATTAATG+AGG + Chr6:101097744-101097763 None:intergenic 25.0%
! CATTAATTCTTTCTGTCAAT+TGG - Chr6:101097744-101097763 MsG0680035252.01.T01:CDS 25.0%
! TAAATTCCATTTGATGAGAA+AGG + Chr6:101097687-101097706 None:intergenic 25.0%
! TACTAAATGTATACACATTC+GGG + Chr6:101098242-101098261 None:intergenic 25.0%
! TATATACCGTTATGATTCAA+GGG - Chr6:101098883-101098902 MsG0680035252.01.T01:CDS 25.0%
! TCTCATCAAATGGAATTTAA+GGG - Chr6:101097688-101097707 MsG0680035252.01.T01:CDS 25.0%
! TGAAAGAGATGAAAATGAAA+TGG - Chr6:101099016-101099035 MsG0680035252.01.T01:CDS 25.0%
! TTCTCATCAAATGGAATTTA+AGG - Chr6:101097687-101097706 MsG0680035252.01.T01:CDS 25.0%
! TTGTAAGTAATCATATTAGG+TGG + Chr6:101098660-101098679 None:intergenic 25.0%
!! ACATTTAGTATATTGGTTGA+TGG - Chr6:101098252-101098271 MsG0680035252.01.T01:CDS 25.0%
!! ATCGAATTTGGTAAGATTTT+AGG - Chr6:101097622-101097641 MsG0680035252.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTGGCTTTGTTGTTAAAAA+TGG - Chr6:101098935-101098954 MsG0680035252.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTTCATAAGTTTTAGCATC+TGG + Chr6:101098978-101098997 None:intergenic 25.0%
!!! CATGATTAATGGATTTTGTA+AGG - Chr6:101098473-101098492 MsG0680035252.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGCTTTTGATTTATATTCTG+AGG - Chr6:101098095-101098114 MsG0680035252.01.T01:CDS 25.0%
AATCTTACCAAATTCGATAG+CGG + Chr6:101097620-101097639 None:intergenic 30.0%
ACAAAACCCTTGAATCATAA+CGG + Chr6:101098892-101098911 None:intergenic 30.0%
AGTTATGGAACCTTGATTAA+TGG - Chr6:101097940-101097959 MsG0680035252.01.T01:CDS 30.0%
ATTGGCAAAGATTCTCAAAA+AGG - Chr6:101097792-101097811 MsG0680035252.01.T01:CDS 30.0%
CCAATACATAAACAGCAAAA+GGG + Chr6:101097777-101097796 None:intergenic 30.0%
GAAGTCAATGTTATGGTATT+TGG + Chr6:101097826-101097845 None:intergenic 30.0%
GAATTGTAAGTTACCACATT+AGG + Chr6:101098558-101098577 None:intergenic 30.0%
GTAATGTTTGGATTTGACAA+GGG + Chr6:101097650-101097669 None:intergenic 30.0%
GTTATGGAACCTTGATTAAT+GGG - Chr6:101097941-101097960 MsG0680035252.01.T01:CDS 30.0%
TCTTTCATCTTCGTTAACAA+CGG + Chr6:101098732-101098751 None:intergenic 30.0%
TTGGCAAAGATTCTCAAAAA+GGG - Chr6:101097793-101097812 MsG0680035252.01.T01:CDS 30.0%
TTTACACAACCCATTAATCA+AGG + Chr6:101097953-101097972 None:intergenic 30.0%
TTTGCACATACCATCAATAA+TGG + Chr6:101098058-101098077 None:intergenic 30.0%
! ATTATTGATGGTATGTGCAA+AGG - Chr6:101098057-101098076 MsG0680035252.01.T01:CDS 30.0%
!! AGTATATTGGTTGATGGATT+TGG - Chr6:101098258-101098277 MsG0680035252.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTAATGGGTTGTGTAAAGT+TGG - Chr6:101097955-101097974 MsG0680035252.01.T01:CDS 30.0%
!! GATAGTTTTTGAAGATCTTC+TGG - Chr6:101098833-101098852 MsG0680035252.01.T01:CDS 30.0%
ACTTACAATTCCCTTATCGA+TGG - Chr6:101098567-101098586 MsG0680035252.01.T01:CDS 35.0%
ACTTACACAAACCATCGATA+AGG + Chr6:101098581-101098600 None:intergenic 35.0%
ACTTACACCGCTTTAATTAG+TGG - Chr6:101098147-101098166 MsG0680035252.01.T01:CDS 35.0%
AGCATTGCACTTTCATGATA+AGG - Chr6:101097885-101097904 MsG0680035252.01.T01:CDS 35.0%
ATCTTACCAAATTCGATAGC+GGG + Chr6:101097619-101097638 None:intergenic 35.0%
ATGCAAAAATGGAAGACTAG+AGG - Chr6:101098803-101098822 MsG0680035252.01.T01:CDS 35.0%
ATTCAACACTATGTCTCGTA+GGG - Chr6:101098419-101098438 MsG0680035252.01.T01:CDS 35.0%
CATCTCTTTCAAAGAGAGAA+AGG + Chr6:101099007-101099026 None:intergenic 35.0%
CATTTGGACCAAGTTAGTTA+TGG - Chr6:101097925-101097944 MsG0680035252.01.T01:CDS 35.0%
CTTACACAAACCATCGATAA+GGG + Chr6:101098580-101098599 None:intergenic 35.0%
CTTACACCGCTTTAATTAGT+GGG - Chr6:101098148-101098167 MsG0680035252.01.T01:CDS 35.0%
GAATTTAAGGGAATTAAGCC+AGG - Chr6:101097700-101097719 MsG0680035252.01.T01:CDS 35.0%
GAGTTATAAGTAACAACGTC+CGG + Chr6:101098348-101098367 None:intergenic 35.0%
GATGAGTGAAGTCAATGTTA+TGG + Chr6:101097833-101097852 None:intergenic 35.0%
GCAAAACCCACTAATTAAAG+CGG + Chr6:101098157-101098176 None:intergenic 35.0%
GCCAATACATAAACAGCAAA+AGG + Chr6:101097778-101097797 None:intergenic 35.0%
GGTAATGTTTGGATTTGACA+AGG + Chr6:101097651-101097670 None:intergenic 35.0%
TATTCAACACTATGTCTCGT+AGG - Chr6:101098418-101098437 MsG0680035252.01.T01:CDS 35.0%
TCAAGGTTCCATAACTAACT+TGG + Chr6:101097936-101097955 None:intergenic 35.0%
TCTAGTAAGTGAAGTGAACA+AGG - Chr6:101098386-101098405 MsG0680035252.01.T01:CDS 35.0%
TGCTTTATGCAAAAACCATC+AGG - Chr6:101098692-101098711 MsG0680035252.01.T01:CDS 35.0%
TGTTTCCCTTTCTCATCAAA+TGG - Chr6:101097678-101097697 MsG0680035252.01.T01:CDS 35.0%
TTAACGAAGATGAAAGACGA+AGG - Chr6:101098735-101098754 MsG0680035252.01.T01:CDS 35.0%
TTTGAAGATCTTCTGGTCAA+AGG - Chr6:101098840-101098859 MsG0680035252.01.T01:CDS 35.0%
! AACAACAGTGTGGTAATGTT+TGG + Chr6:101097662-101097681 None:intergenic 35.0%
! TATCGATGGTTTGTGTAAGT+CGG - Chr6:101098581-101098600 MsG0680035252.01.T01:CDS 35.0%
! TTAGCTATGATGACGAAACA+AGG - Chr6:101098315-101098334 MsG0680035252.01.T01:CDS 35.0%
!! ACATTGACTTCACTCATCAA+AGG - Chr6:101097835-101097854 MsG0680035252.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTGGTTGATGGATTTGGTA+AGG - Chr6:101098263-101098282 MsG0680035252.01.T01:CDS 35.0%
!!! ATTAGTGGGTTTTGCATTGT+TGG - Chr6:101098162-101098181 MsG0680035252.01.T01:CDS 35.0%
!!! CCCTTTTGCTGTTTATGTAT+TGG - Chr6:101097774-101097793 MsG0680035252.01.T01:CDS 35.0%
ATCAAAGGTCACTGTCTCAA+AGG - Chr6:101097850-101097869 MsG0680035252.01.T01:CDS 40.0%
ATGCTTCATCAAACAAGCCA+TGG + Chr6:101098917-101098936 None:intergenic 40.0%
ATGTTGCAATTGACAAAGCC+TGG + Chr6:101097721-101097740 None:intergenic 40.0%
CATGATAAGGTGATTGCGAT+GGG - Chr6:101097898-101097917 MsG0680035252.01.T01:CDS 40.0%
GATTGCGATGGGATTTCATT+TGG - Chr6:101097909-101097928 MsG0680035252.01.T01:CDS 40.0%
GGGGAGTAACTACTAATGTT+CGG - Chr6:101098439-101098458 MsG0680035252.01.T01:CDS 40.0%
GTATTGTACATTACCACACC+AGG + Chr6:101098036-101098055 None:intergenic 40.0%
GTTGAGGGACTATGCAAAAA+TGG - Chr6:101098792-101098811 MsG0680035252.01.T01:CDS 40.0%
GTTGTGTGTGTACACATATC+TGG + Chr6:101098768-101098787 None:intergenic 40.0%
TCATGATAAGGTGATTGCGA+TGG - Chr6:101097897-101097916 MsG0680035252.01.T01:CDS 40.0%
TTCAACACTATGTCTCGTAG+GGG - Chr6:101098420-101098439 MsG0680035252.01.T01:CDS 40.0%
! ACACACACAACACTTGTTGA+GGG - Chr6:101098777-101098796 MsG0680035252.01.T01:CDS 40.0%
! ATCGATGGTTTGTGTAAGTC+GGG - Chr6:101098582-101098601 MsG0680035252.01.T01:CDS 40.0%
! ATGGATTTGGTAAGGAAGGA+AGG - Chr6:101098271-101098290 MsG0680035252.01.T01:CDS 40.0%
! CATGAAAGTGCAATGCTTGA+TGG + Chr6:101097882-101097901 None:intergenic 40.0%
! CCAATTTTCCATCAACTCGT+CGG + Chr6:101098008-101098027 None:intergenic 40.0%
! CTTCGTGAAATGATAGTGAG+AGG - Chr6:101099050-101099069 MsG0680035252.01.T01:CDS 40.0%
! GACGAAACAAGGCATTAAAC+CGG - Chr6:101098326-101098345 MsG0680035252.01.T01:CDS 40.0%
! TACACACACAACACTTGTTG+AGG - Chr6:101098776-101098795 MsG0680035252.01.T01:CDS 40.0%
! TGGATTTGGTAAGGAAGGAA+GGG - Chr6:101098272-101098291 MsG0680035252.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTCAAGGGTTTTGTAGCCA+TGG - Chr6:101098897-101098916 MsG0680035252.01.T01:CDS 40.0%
!! CAAAAACCATCAGGTTGACA+AGG - Chr6:101098701-101098720 MsG0680035252.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTGATGGATTTGGTAAGGA+AGG - Chr6:101098267-101098286 MsG0680035252.01.T01:CDS 40.0%
!! TGGCTTGTTTGATGAAGCAT+TGG - Chr6:101098917-101098936 MsG0680035252.01.T01:CDS 40.0%
AACTCGTCGGAGCAATTCAA+GGG + Chr6:101097995-101098014 None:intergenic 45.0%
ATGGAAGACTAGAGGATGCA+TGG - Chr6:101098811-101098830 MsG0680035252.01.T01:CDS 45.0%
GAATTGCCTTGTCAACCTGA+TGG + Chr6:101098710-101098729 None:intergenic 45.0%
GAGAAAGGGAAACAACAGTG+TGG + Chr6:101097672-101097691 None:intergenic 45.0%
GTCGATGAGATGCAAGATAG+AGG - Chr6:101098630-101098649 MsG0680035252.01.T01:CDS 45.0%
! AAAATTGGTTCAGCCTGGTG+TGG - Chr6:101098020-101098039 MsG0680035252.01.T01:CDS 45.0%
! GATGGAAAATTGGTTCAGCC+TGG - Chr6:101098015-101098034 MsG0680035252.01.T01:CDS 45.0%
! TCGATGGTTTGTGTAAGTCG+GGG - Chr6:101098583-101098602 MsG0680035252.01.T01:CDS 45.0%
!! CCGACGAGTTGATGGAAAAT+TGG - Chr6:101098005-101098024 MsG0680035252.01.T01:CDS 45.0%
!! TTACCAAATTCGATAGCGGG+TGG + Chr6:101097616-101097635 None:intergenic 45.0%
ACTCCACCCGCTATCGAATT+TGG - Chr6:101097610-101097629 MsG0680035252.01.T01:CDS 50.0%
CAACTCGTCGGAGCAATTCA+AGG + Chr6:101097996-101098015 None:intergenic 50.0%
GCGGTGTAAGTGACAACAGT+TGG + Chr6:101098138-101098157 None:intergenic 50.0%
! GAATTGCTCCGACGAGTTGA+TGG - Chr6:101097997-101098016 MsG0680035252.01.T01:CDS 50.0%
!! AAATTCGATAGCGGGTGGAG+TGG + Chr6:101097611-101097630 None:intergenic 50.0%
!! AATTCGATAGCGGGTGGAGT+GGG + Chr6:101097610-101097629 None:intergenic 50.0%
CGGGTGGAGTGGGATTCTTA+TGG + Chr6:101097600-101097619 None:intergenic 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 101097580 101099082 101097580 ID=MsG0680035252.01;Name=MsG0680035252.01
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