AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035053.01

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MsG0680035053.01.T01 AT1G09900 28.040 403 276 4 37 431 188 584 3.70e-60 207
MsG0680035053.01.T01 AT1G09900 27.473 364 257 2 40 397 223 585 1.99e-49 178
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MsG0680035053.01.T01 AT1G13630 24.740 384 270 3 36 401 420 802 6.89e-30 124
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MsG0680035053.01.T01 AT5G38730 25.234 428 257 8 3 372 136 558 4.98e-31 126
MsG0680035053.01.T01 AT5G38730 25.581 301 193 3 173 473 145 414 4.29e-26 112
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MsG0680035053.01.T01 AT3G61520 25.373 402 251 11 85 472 146 512 5.01e-29 121
MsG0680035053.01.T01 AT3G61520 25.697 323 211 3 54 376 439 732 6.28e-26 112
MsG0680035053.01.T01 AT3G61520 23.358 274 204 1 34 301 489 762 4.67e-20 94.0
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MsG0680035053.01.T01 AT5G28370 24.242 429 297 8 53 462 294 713 4.05e-38 148
MsG0680035053.01.T01 AT5G28370 25.064 391 256 4 89 471 220 581 1.38e-37 146
MsG0680035053.01.T01 AT5G28370 25.495 404 248 11 85 472 146 512 1.72e-28 119
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MsG0680035053.01.T01 AT1G77360 24.581 358 256 7 122 471 130 481 1.71e-28 118
MsG0680035053.01.T01 AT1G77360 26.908 249 174 3 231 473 133 379 9.75e-26 110
MsG0680035053.01.T01 AT1G77360 25.076 327 235 5 36 356 183 505 1.28e-25 110
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MsG0680035053.01.T01 AT5G55740 22.462 325 201 6 195 476 235 551 8.11e-18 87.0
MsG0680035053.01.T01 AT5G55740 20.110 363 267 7 59 410 444 794 7.90e-14 74.7
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MsG0680035053.01.T01 AT1G55890 24.783 230 167 2 162 385 145 374 3.86e-19 89.7
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MsG0680035053.01.T01 AT1G55890 21.923 260 196 2 203 455 115 374 1.22e-16 82.0
MsG0680035053.01.T01 AT1G55890 22.541 244 187 2 38 280 126 368 1.31e-13 72.8
MsG0680035053.01.T01 AT5G48730 25.397 315 220 5 166 470 157 466 8.36e-22 98.6
MsG0680035053.01.T01 AT5G48730 22.449 343 253 4 119 451 143 482 4.01e-18 87.4
MsG0680035053.01.T01 AT5G48730 24.315 292 192 3 179 469 132 395 9.68e-18 86.3
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MsG0680035053.01.T01 AT5G27270 22.794 408 291 9 34 431 481 874 1.92e-15 79.7
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MsG0680035053.01.T01 AT5G39350 19.957 461 315 8 52 470 76 524 1.54e-15 79.7
MsG0680035053.01.T01 AT4G14050 23.410 346 213 8 123 462 102 401 1.56e-15 79.7
MsG0680035053.01.T01 AT1G06140 23.013 239 178 3 193 428 273 508 1.58e-15 79.3
MsG0680035053.01.T01 AT1G06140 20.320 438 301 12 55 471 3 413 8.26e-12 67.8
MsG0680035053.01.T01 AT5G02830 20.147 407 292 10 85 465 296 695 1.67e-15 79.7
MsG0680035053.01.T01 AT3G21470 23.473 311 192 6 193 470 77 374 1.87e-15 79.3
MsG0680035053.01.T01 AT5G06540 23.529 340 240 8 89 421 80 406 2.01e-15 79.3
MsG0680035053.01.T01 AT5G36300 24.601 313 193 8 164 464 14 295 2.03e-15 77.8
MsG0680035053.01.T01 AT5G36300 22.925 253 178 5 235 470 14 266 1.56e-13 72.0
MsG0680035053.01.T01 AT5G40405 22.312 372 264 9 76 437 56 412 2.15e-15 79.3
MsG0680035053.01.T01 AT5G40405 22.312 372 264 9 76 437 56 412 2.15e-15 79.3
MsG0680035053.01.T01 AT4G21170 20.428 421 303 9 41 443 175 581 2.17e-15 79.3
MsG0680035053.01.T01 AT2G20540 22.316 354 246 9 89 430 71 407 2.64e-15 78.6
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MsG0680035053.01.T01 AT3G58590 23.167 341 238 7 90 423 381 704 7.88e-15 77.8
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MsG0680035053.01.T01 AT5G03560 30.894 123 78 3 246 361 211 333 1.65e-11 66.2
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MsG0680035053.01.T01 AT4G22760 22.831 438 307 12 41 471 54 467 5.27e-13 71.6
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MsG0680035053.01.T01 AT4G33990 23.175 315 190 9 75 347 332 636 1.52e-12 70.5
MsG0680035053.01.T01 AT4G33990 27.925 265 149 10 196 459 184 407 7.31e-11 65.1
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MsG0680035053.01.T01 AT2G40240 27.206 136 99 0 333 468 109 244 3.87e-11 65.1
MsG0680035053.01.T01 AT3G18970 23.037 382 223 13 60 425 130 456 1.42e-14 76.3
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MsG0680035053.01.T01 AT4G33990 23.175 315 190 9 75 347 325 629 1.51e-12 70.5
MsG0680035053.01.T01 AT4G33990 27.925 265 149 10 196 459 177 400 8.23e-11 65.1
MsG0680035053.01.T01 AT1G28690 20.690 406 275 15 86 471 64 442 1.66e-14 76.3
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MsG0680035053.01.T01 AT3G13880 22.475 396 237 16 101 445 92 468 8.12e-11 65.1
MsG0680035053.01.T01 AT3G13880 22.826 276 187 7 208 469 93 356 8.71e-11 64.7
MsG0680035053.01.T01 AT1G06143 22.857 315 192 6 194 471 88 388 1.81e-14 76.3
MsG0680035053.01.T01 AT1G06143 22.170 424 255 13 40 413 69 467 2.15e-12 69.7
MsG0680035053.01.T01 AT3G46790 25.145 346 229 10 97 427 118 448 2.02e-14 76.3
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MsG0680035053.01.T01 AT1G11290 19.685 508 310 14 34 462 113 601 3.16e-14 75.9
MsG0680035053.01.T01 AT1G11290 21.782 303 216 6 176 469 45 335 1.45e-11 67.4
MsG0680035053.01.T01 AT1G16480 20.785 433 319 11 34 459 191 606 3.20e-14 75.9
MsG0680035053.01.T01 AT1G16480 20.785 433 319 11 34 459 208 623 3.30e-14 75.9
MsG0680035053.01.T01 AT4G18840 21.189 387 253 10 76 423 90 463 3.66e-14 75.1
MsG0680035053.01.T01 AT4G18840 21.189 387 253 10 76 423 90 463 3.66e-14 75.1
MsG0680035053.01.T01 AT4G18840 21.189 387 253 10 76 423 90 463 3.66e-14 75.1
MsG0680035053.01.T01 AT1G09190 20.306 458 254 12 45 434 56 470 5.31e-14 74.3
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MsG0680035053.01.T01 AT1G31430 20.087 458 307 9 48 462 1 442 8.39e-14 74.3
MsG0680035053.01.T01 AT1G31430 23.529 289 197 5 191 470 5 278 6.97e-13 71.2
MsG0680035053.01.T01 AT5G44230 22.905 358 252 10 90 437 16 359 9.93e-14 73.9
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MsG0680035053.01.T01 AT3G23330 18.442 385 296 7 88 466 204 576 5.77e-13 71.6
MsG0680035053.01.T01 AT3G23330 24.490 294 193 7 192 471 65 343 1.77e-11 67.0
MsG0680035053.01.T01 AT3G50420 19.038 499 309 11 46 461 153 639 7.89e-13 71.2
MsG0680035053.01.T01 AT1G77010 20.302 463 303 14 46 469 114 549 8.64e-13 71.2
MsG0680035053.01.T01 AT3G14730 20.566 389 271 9 97 470 102 467 8.75e-13 71.2
MsG0680035053.01.T01 AT3G22150 22.622 389 256 11 74 437 326 694 9.62e-13 71.2
MsG0680035053.01.T01 AT3G22150 20.699 372 280 8 62 427 355 717 6.52e-12 68.6
MsG0680035053.01.T01 AT3G22150 22.622 389 256 11 74 437 326 694 9.62e-13 71.2
MsG0680035053.01.T01 AT3G22150 20.699 372 280 8 62 427 355 717 6.52e-12 68.6
MsG0680035053.01.T01 AT4G37380 25.993 277 184 7 193 463 91 352 9.84e-13 70.9
MsG0680035053.01.T01 AT2G29760 20.205 391 273 11 36 413 181 545 1.04e-12 70.9
MsG0680035053.01.T01 AT2G29760 19.951 406 265 11 107 471 80 466 1.01e-11 67.8
MsG0680035053.01.T01 AT2G29760 20.153 392 288 9 89 472 129 503 8.80e-11 64.7

Find 82 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 104 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATCAAAGGTCTTTGTCTTAA+TGG 0.161636 6:+98242426 MsG0680035053.01.T01:CDS
GATCACCTACAATTCTTTAT+TGG 0.174556 6:+98243228 MsG0680035053.01.T01:CDS
AAAGATTGAAGGGTTATTAT+TGG 0.223540 6:+98242584 MsG0680035053.01.T01:CDS
TCATTTCAGAATATAGTAAA+AGG 0.231570 6:-98242677 None:intergenic
AGCTACAGTGTCATGATTAA+TGG 0.241933 6:+98243022 MsG0680035053.01.T01:CDS
GTATTGAATGTTACAGTATT+AGG 0.246475 6:-98242399 None:intergenic
GAATTGTATGTTACAGTATT+AGG 0.282383 6:-98243115 None:intergenic
TATTCAACACTCATTCTCTA+AGG 0.287460 6:+98242978 MsG0680035053.01.T01:CDS
TTTGTCTTAATGGTCATATT+AGG 0.293586 6:+98242436 MsG0680035053.01.T01:CDS
ATGCTTAATGTAACAATGTT+AGG 0.294368 6:-98242294 None:intergenic
CGGGAAGAATCTCTGATGTT+TGG 0.303707 6:+98243161 MsG0680035053.01.T01:CDS
AGGGCTATCGTTTAGATGTT+TGG 0.313089 6:+98243419 MsG0680035053.01.T01:CDS
CATCTTAACGAAGTTAGTTA+TGG 0.321004 6:+98242501 MsG0680035053.01.T01:CDS
GTTTGGTAAGTTACCGCATC+TGG 0.322591 6:-98243535 None:intergenic
TGGATTATGTAAGAATAAAA+TGG 0.343946 6:+98243042 MsG0680035053.01.T01:CDS
CATGATAATGTTATAGCAAA+TGG 0.350744 6:+98242474 MsG0680035053.01.T01:CDS
ACATACAATTCACTTATTGA+TGG 0.356398 6:+98243127 MsG0680035053.01.T01:CDS
ACTTATAGTACTCTAATATA+TGG 0.368102 6:+98242729 MsG0680035053.01.T01:CDS
ATCTTAACGAAGTTAGTTAT+GGG 0.372780 6:+98242502 MsG0680035053.01.T01:CDS
GAATTCCTTTGAGTTCCATT+TGG 0.383051 6:-98242269 None:intergenic
ACATACACTATACTTGTTGA+TGG 0.402875 6:+98243337 MsG0680035053.01.T01:CDS
ATAGTGTATGTATACATATC+TGG 0.404819 6:-98243325 None:intergenic
GGGAAGAATCTCTGATGTTT+GGG 0.405517 6:+98243162 MsG0680035053.01.T01:CDS
CAGGGCAGTTGTTGTTTCTC+CGG 0.408979 6:-98242550 None:intergenic
ACACCACCCATCTTCGAATT+CGG 0.415544 6:+98242186 MsG0680035053.01.T01:CDS
GTACTATAAGTGACAACATT+AGG 0.416316 6:-98242717 None:intergenic
ACACTGTAGCTATGAACATT+AGG 0.420566 6:-98243010 None:intergenic
TGAACGTGTAATCGACGAAT+TGG 0.427233 6:-98242090 None:intergenic
AGCATCCAATAAAGAATTGT+AGG 0.427933 6:-98243233 None:intergenic
ATCAATGGGTTATGTAAATC+CGG 0.442501 6:+98242531 MsG0680035053.01.T01:CDS
GTTATGGGATCTTGATCAAT+GGG 0.443214 6:+98242517 MsG0680035053.01.T01:CDS
TATTGATGGACTTCGCAAAT+CGG 0.452082 6:+98243141 MsG0680035053.01.T01:CDS
GTGGTATAAGTAAGAACATT+CGG 0.453656 6:-98242822 None:intergenic
GAAACAGCGTCGTCGACGTT+GGG 0.456199 6:-98242132 None:intergenic
CAATCTTTCTAAGCAACTGC+AGG 0.461978 6:-98242569 None:intergenic
AGTTATGGGATCTTGATCAA+TGG 0.465218 6:+98242516 MsG0680035053.01.T01:CDS
ATTGATGGACTTCGCAAATC+GGG 0.467367 6:+98243142 MsG0680035053.01.T01:CDS
AATCTTACCGAATTCGAAGA+TGG 0.475792 6:-98242193 None:intergenic
TATTTCATTCTCTCACCAAA+TGG 0.479461 6:+98242254 MsG0680035053.01.T01:CDS
CAGTTGCTTAGAAAGATTGA+AGG 0.480260 6:+98242573 MsG0680035053.01.T01:CDS
ATGAGTGTTGAATACATGTT+TGG 0.489221 6:-98242969 None:intergenic
TTTGGTAAGTTACCGCATCT+GGG 0.502247 6:-98243534 None:intergenic
GCAGTGTACATTATCACATC+AGG 0.512084 6:-98242612 None:intergenic
AATTCGAAGATGGGTGGTGT+AGG 0.515823 6:-98242183 None:intergenic
GGTTAATGCGCTTTGTAAAG+AGG 0.517508 6:+98243456 MsG0680035053.01.T01:CDS
TGCTTTGTGCAAAATCCATC+AGG 0.519913 6:+98243252 MsG0680035053.01.T01:CDS
TTGGGTAAGATTCTTAAGCT+AGG 0.523318 6:+98242369 MsG0680035053.01.T01:CDS
CAAAATTGAGTTGATTCAAG+TGG 0.524984 6:-98242335 None:intergenic
CATTCTATTTGTTAAAGTTG+AGG 0.525626 6:+98242034 MsG0680035053.01.T01:CDS
GTTAATGCGCTTTGTAAAGA+GGG 0.536783 6:+98243457 MsG0680035053.01.T01:CDS
CAATTGCCTTGTCAACCTGA+TGG 0.542661 6:-98243267 None:intergenic
ATTCAACACTCATTCTCTAA+GGG 0.545874 6:+98242979 MsG0680035053.01.T01:CDS
TGTTCTTACTTATACCACAT+TGG 0.558637 6:+98242827 MsG0680035053.01.T01:CDS
CATTTCAGAATATAGTAAAA+GGG 0.558966 6:-98242676 None:intergenic
ATTCGAAGATGGGTGGTGTA+GGG 0.561706 6:-98242182 None:intergenic
GATGCACAAGAGATTTATCA+AGG 0.566164 6:+98243385 MsG0680035053.01.T01:CDS
TTGGGAATGAATGAAGGAAG+AGG 0.570555 6:-98242114 None:intergenic
ACTTATACCACATTGGTCGA+TGG 0.573840 6:+98242834 MsG0680035053.01.T01:CDS
TCGACGTTGGGAATGAATGA+AGG 0.576557 6:-98242120 None:intergenic
GAAATGATTCATCTTAACAA+GGG 0.576828 6:-98242223 None:intergenic
CAAAATCCATCAGGTTGACA+AGG 0.577378 6:+98243261 MsG0680035053.01.T01:CDS
AGGTGATCACATCAGCAGAT+TGG 0.581164 6:-98243213 None:intergenic
ATCTTACCGAATTCGAAGAT+GGG 0.585697 6:-98242192 None:intergenic
AATCATTGATAGTTTGTGCA+AGG 0.586213 6:+98242635 MsG0680035053.01.T01:CDS
GGAAACAGCGTCGTCGACGT+TGG 0.594907 6:-98242133 None:intergenic
TGAAATGATTCATCTTAACA+AGG 0.596483 6:-98242224 None:intergenic
GTTGAGAATGCGATTGAATG+AGG 0.597664 6:-98242154 None:intergenic
AGTTGCTTAGAAAGATTGAA+GGG 0.598832 6:+98242574 MsG0680035053.01.T01:CDS
ACATTCAATACAATTATCAA+AGG 0.606806 6:+98242411 MsG0680035053.01.T01:CDS
TGTTTGGATGTATAATGTGA+TGG 0.607421 6:+98243435 MsG0680035053.01.T01:CDS
TCTCACCAAATGGAACTCAA+AGG 0.612193 6:+98242264 MsG0680035053.01.T01:CDS
TTGGTAAGTTACCGCATCTG+GGG 0.623361 6:-98243533 None:intergenic
CAATGGCTGCACCCCAGATG+CGG 0.623451 6:+98243522 MsG0680035053.01.T01:CDS
CTTGGTAAAAGAAGTCAACA+AGG 0.632436 6:+98242946 MsG0680035053.01.T01:intron
ATAGATGAGATGCATCATAG+AGG 0.636538 6:+98243190 MsG0680035053.01.T01:CDS
AATCTTTCTAAGCAACTGCA+GGG 0.653137 6:-98242568 None:intergenic
ATTATGTAAGAATAAAATGG+TGG 0.659806 6:+98243045 MsG0680035053.01.T01:CDS
TTCAACACTCATTCTCTAAG+GGG 0.664514 6:+98242980 MsG0680035053.01.T01:CDS
TTACCGAATTCGAAGATGGG+TGG 0.681713 6:-98242189 None:intergenic
TTAACAAAGATGAAAGACGA+AGG 0.688717 6:+98243295 MsG0680035053.01.T01:CDS
ACATAAACCATCGACCAATG+TGG 0.690463 6:-98242841 None:intergenic
TTGGTGAGAGAATGAAATAG+CGG 0.694764 6:-98242250 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! AATTTTGCATTTTCTATATT+GGG + Chr6:98242351-98242370 MsG0680035053.01.T01:CDS 15.0%
!! ACATTCAATACAATTATCAA+AGG + Chr6:98242411-98242430 MsG0680035053.01.T01:CDS 20.0%
!! ACTTATAGTACTCTAATATA+TGG + Chr6:98242729-98242748 MsG0680035053.01.T01:CDS 20.0%
!! ATTATGTAAGAATAAAATGG+TGG + Chr6:98243045-98243064 MsG0680035053.01.T01:CDS 20.0%
!! CATTTCAGAATATAGTAAAA+GGG - Chr6:98242679-98242698 None:intergenic 20.0%
!! TCATTTCAGAATATAGTAAA+AGG - Chr6:98242680-98242699 None:intergenic 20.0%
!! TGGATTATGTAAGAATAAAA+TGG + Chr6:98243042-98243061 MsG0680035053.01.T01:CDS 20.0%
!!! CAATTTTGCATTTTCTATAT+TGG + Chr6:98242350-98242369 MsG0680035053.01.T01:CDS 20.0%
! AAAGATTGAAGGGTTATTAT+TGG + Chr6:98242584-98242603 MsG0680035053.01.T01:CDS 25.0%
! ACATACAATTCACTTATTGA+TGG + Chr6:98243127-98243146 MsG0680035053.01.T01:CDS 25.0%
! ATAGTGTATGTATACATATC+TGG - Chr6:98243328-98243347 None:intergenic 25.0%
! ATCTTAACGAAGTTAGTTAT+GGG + Chr6:98242502-98242521 MsG0680035053.01.T01:CDS 25.0%
! ATGCTTAATGTAACAATGTT+AGG - Chr6:98242297-98242316 None:intergenic 25.0%
! GAAATGATTCATCTTAACAA+GGG - Chr6:98242226-98242245 None:intergenic 25.0%
! GAAGTATAAGTAACAACATT+AGG - Chr6:98242908-98242927 None:intergenic 25.0%
! GAATTGTATGTTACAGTATT+AGG - Chr6:98243118-98243137 None:intergenic 25.0%
! GTATTGAATGTTACAGTATT+AGG - Chr6:98242402-98242421 None:intergenic 25.0%
! TGAAATGATTCATCTTAACA+AGG - Chr6:98242227-98242246 None:intergenic 25.0%
! TTTGTCTTAATGGTCATATT+AGG + Chr6:98242436-98242455 MsG0680035053.01.T01:CDS 25.0%
!! AATATATGGTCTTTTCATTG+TGG + Chr6:98242743-98242762 MsG0680035053.01.T01:CDS 25.0%
!! ATATATGGTCTTTTCATTGT+GGG + Chr6:98242744-98242763 MsG0680035053.01.T01:CDS 25.0%
!! CATGATAATGTTATAGCAAA+TGG + Chr6:98242474-98242493 MsG0680035053.01.T01:CDS 25.0%
!! CATTCTATTTGTTAAAGTTG+AGG + Chr6:98242034-98242053 MsG0680035053.01.T01:CDS 25.0%
!! TGTTACTTATACTTCTTTGA+TGG + Chr6:98242913-98242932 MsG0680035053.01.T01:intron 25.0%
!!! TATCAAGGTCTTTTGATTAA+GGG + Chr6:98243400-98243419 MsG0680035053.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTATCAAGGTCTTTTGATTA+AGG + Chr6:98243399-98243418 MsG0680035053.01.T01:CDS 25.0%
AACAAAGCACAAATAGAGTT+TGG - Chr6:98243555-98243574 None:intergenic 30.0%
ACTTATACTTCTTTGATGGA+TGG + Chr6:98242917-98242936 MsG0680035053.01.T01:intron 30.0%
AGCATCCAATAAAGAATTGT+AGG - Chr6:98243236-98243255 None:intergenic 30.0%
AGTTGCTTAGAAAGATTGAA+GGG + Chr6:98242574-98242593 MsG0680035053.01.T01:CDS 30.0%
ATCAAAGGTCTTTGTCTTAA+TGG + Chr6:98242426-98242445 MsG0680035053.01.T01:CDS 30.0%
ATTCAACACTCATTCTCTAA+GGG + Chr6:98242979-98242998 MsG0680035053.01.T01:CDS 30.0%
CATCTTAACGAAGTTAGTTA+TGG + Chr6:98242501-98242520 MsG0680035053.01.T01:CDS 30.0%
GATCACCTACAATTCTTTAT+TGG + Chr6:98243228-98243247 MsG0680035053.01.T01:CDS 30.0%
GTACTATAAGTGACAACATT+AGG - Chr6:98242720-98242739 None:intergenic 30.0%
GTGGTATAAGTAAGAACATT+CGG - Chr6:98242825-98242844 None:intergenic 30.0%
TATTCAACACTCATTCTCTA+AGG + Chr6:98242978-98242997 MsG0680035053.01.T01:CDS 30.0%
TATTTCATTCTCTCACCAAA+TGG + Chr6:98242254-98242273 MsG0680035053.01.T01:CDS 30.0%
TGTTCTTACTTATACCACAT+TGG + Chr6:98242827-98242846 MsG0680035053.01.T01:CDS 30.0%
TGTTTGGATGTATAATGTGA+TGG + Chr6:98243435-98243454 MsG0680035053.01.T01:CDS 30.0%
TTAACAAAGATGAAAGACGA+AGG + Chr6:98243295-98243314 MsG0680035053.01.T01:CDS 30.0%
TTGTCAAAAATGGAAGACAA+TGG + Chr6:98243505-98243524 MsG0680035053.01.T01:CDS 30.0%
! AAAAAGCATAAAACAAGGTG+TGG + Chr6:98242880-98242899 MsG0680035053.01.T01:intron 30.0%
! AATCATTGATAGTTTGTGCA+AGG + Chr6:98242635-98242654 MsG0680035053.01.T01:CDS 30.0%
! ACATACACTATACTTGTTGA+TGG + Chr6:98243337-98243356 MsG0680035053.01.T01:CDS 30.0%
! ATTGTCCTTGTTGTCAAAAA+TGG + Chr6:98243495-98243514 MsG0680035053.01.T01:CDS 30.0%
! CTTATACTTCTTTGATGGAT+GGG + Chr6:98242918-98242937 MsG0680035053.01.T01:intron 30.0%
! GGTGAAAAAAGCATAAAACA+AGG + Chr6:98242875-98242894 MsG0680035053.01.T01:intron 30.0%
!! ATCAATGGGTTATGTAAATC+CGG + Chr6:98242531-98242550 MsG0680035053.01.T01:CDS 30.0%
!! ATGAGTGTTGAATACATGTT+TGG - Chr6:98242972-98242991 None:intergenic 30.0%
!! CAAAATTGAGTTGATTCAAG+TGG - Chr6:98242338-98242357 None:intergenic 30.0%
AATCTTACCGAATTCGAAGA+TGG - Chr6:98242196-98242215 None:intergenic 35.0%
AATCTTTCTAAGCAACTGCA+GGG - Chr6:98242571-98242590 None:intergenic 35.0%
ACACTGTAGCTATGAACATT+AGG - Chr6:98243013-98243032 None:intergenic 35.0%
AGCTACAGTGTCATGATTAA+TGG + Chr6:98243022-98243041 MsG0680035053.01.T01:CDS 35.0%
AGTTATGGGATCTTGATCAA+TGG + Chr6:98242516-98242535 MsG0680035053.01.T01:CDS 35.0%
ATAGATGAGATGCATCATAG+AGG + Chr6:98243190-98243209 MsG0680035053.01.T01:CDS 35.0%
ATCTTACCGAATTCGAAGAT+GGG - Chr6:98242195-98242214 None:intergenic 35.0%
ATGCAAAAATGGAAGACTTG+AGG + Chr6:98243363-98243382 MsG0680035053.01.T01:CDS 35.0%
CAGTTGCTTAGAAAGATTGA+AGG + Chr6:98242573-98242592 MsG0680035053.01.T01:CDS 35.0%
CTTCGTGAAATGATTGTTAG+AGG + Chr6:98243609-98243628 MsG0680035053.01.T01:intron 35.0%
CTTGGTAAAAGAAGTCAACA+AGG + Chr6:98242946-98242965 MsG0680035053.01.T01:intron 35.0%
GATGCACAAGAGATTTATCA+AGG + Chr6:98243385-98243404 MsG0680035053.01.T01:CDS 35.0%
GTCGATGGTTTATGTAAAGA+AGG + Chr6:98242849-98242868 MsG0680035053.01.T01:intron 35.0%
GTTAATGCGCTTTGTAAAGA+GGG + Chr6:98243457-98243476 MsG0680035053.01.T01:CDS 35.0%
GTTATGGGATCTTGATCAAT+GGG + Chr6:98242517-98242536 MsG0680035053.01.T01:CDS 35.0%
TGGTTTATGTAAAGAAGGAG+AGG + Chr6:98242854-98242873 MsG0680035053.01.T01:intron 35.0%
TTCAACACTCATTCTCTAAG+GGG + Chr6:98242980-98242999 MsG0680035053.01.T01:CDS 35.0%
TTGGGTAAGATTCTTAAGCT+AGG + Chr6:98242369-98242388 MsG0680035053.01.T01:CDS 35.0%
TTGGTGAGAGAATGAAATAG+CGG - Chr6:98242253-98242272 None:intergenic 35.0%
! GAATTCCTTTGAGTTCCATT+TGG - Chr6:98242272-98242291 None:intergenic 35.0%
! TTTGATGGATGGGTATTTCT+TGG + Chr6:98242928-98242947 MsG0680035053.01.T01:intron 35.0%
!! GTCTTCCATTTTTGACAACA+AGG - Chr6:98243503-98243522 None:intergenic 35.0%
!! GTTGATGGACTATGCAAAAA+TGG + Chr6:98243352-98243371 MsG0680035053.01.T01:CDS 35.0%
!! TATTGATGGACTTCGCAAAT+CGG + Chr6:98243141-98243160 MsG0680035053.01.T01:CDS 35.0%
ACATAAACCATCGACCAATG+TGG - Chr6:98242844-98242863 None:intergenic 40.0%
ACTTATACCACATTGGTCGA+TGG + Chr6:98242834-98242853 MsG0680035053.01.T01:CDS 40.0%
AGGGCTATCGTTTAGATGTT+TGG + Chr6:98243419-98243438 MsG0680035053.01.T01:CDS 40.0%
CAATCTTTCTAAGCAACTGC+AGG - Chr6:98242572-98242591 None:intergenic 40.0%
GCAGTGTACATTATCACATC+AGG - Chr6:98242615-98242634 None:intergenic 40.0%
GGGAAGAATCTCTGATGTTT+GGG + Chr6:98243162-98243181 MsG0680035053.01.T01:CDS 40.0%
GGTTAATGCGCTTTGTAAAG+AGG + Chr6:98243456-98243475 MsG0680035053.01.T01:CDS 40.0%
GTTGAGAATGCGATTGAATG+AGG - Chr6:98242157-98242176 None:intergenic 40.0%
TCTCACCAAATGGAACTCAA+AGG + Chr6:98242264-98242283 MsG0680035053.01.T01:CDS 40.0%
TGAACGTGTAATCGACGAAT+TGG - Chr6:98242093-98242112 None:intergenic 40.0%
TGCTTTGTGCAAAATCCATC+AGG + Chr6:98243252-98243271 MsG0680035053.01.T01:CDS 40.0%
TTGGGAATGAATGAAGGAAG+AGG - Chr6:98242117-98242136 None:intergenic 40.0%
TTTGGTAAGTTACCGCATCT+GGG - Chr6:98243537-98243556 None:intergenic 40.0%
!! ATTGATGGACTTCGCAAATC+GGG + Chr6:98243142-98243161 MsG0680035053.01.T01:CDS 40.0%
!! CAAAATCCATCAGGTTGACA+AGG + Chr6:98243261-98243280 MsG0680035053.01.T01:CDS 40.0%
AATTCGAAGATGGGTGGTGT+AGG - Chr6:98242186-98242205 None:intergenic 45.0%
ACACCACCCATCTTCGAATT+CGG + Chr6:98242186-98242205 MsG0680035053.01.T01:CDS 45.0%
AGGTGATCACATCAGCAGAT+TGG - Chr6:98243216-98243235 None:intergenic 45.0%
ATTCGAAGATGGGTGGTGTA+GGG - Chr6:98242185-98242204 None:intergenic 45.0%
CAATTGCCTTGTCAACCTGA+TGG - Chr6:98243270-98243289 None:intergenic 45.0%
CGGGAAGAATCTCTGATGTT+TGG + Chr6:98243161-98243180 MsG0680035053.01.T01:CDS 45.0%
GTTTGGTAAGTTACCGCATC+TGG - Chr6:98243538-98243557 None:intergenic 45.0%
TCGACGTTGGGAATGAATGA+AGG - Chr6:98242123-98242142 None:intergenic 45.0%
TTACCGAATTCGAAGATGGG+TGG - Chr6:98242192-98242211 None:intergenic 45.0%
TTGGTAAGTTACCGCATCTG+GGG - Chr6:98243536-98243555 None:intergenic 45.0%
!! CAGGGCAGTTGTTGTTTCTC+CGG - Chr6:98242553-98242572 None:intergenic 50.0%
GAAACAGCGTCGTCGACGTT+GGG - Chr6:98242135-98242154 None:intergenic 55.0%
CAATGGCTGCACCCCAGATG+CGG + Chr6:98243522-98243541 MsG0680035053.01.T01:CDS 60.0%
GGAAACAGCGTCGTCGACGT+TGG - Chr6:98242136-98242155 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 98242030 98243646 98242030 ID=MsG0680035053.01;Name=MsG0680035053.01
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Chr6 exon 98242030 98242855 98242030 ID=MsG0680035053.01.T01:exon:13967;Parent=MsG0680035053.01.T01
Chr6 exon 98242957 98243543 98242957 ID=MsG0680035053.01.T01:exon:13968;Parent=MsG0680035053.01.T01
Chr6 exon 98243629 98243646 98243629 ID=MsG0680035053.01.T01:exon:13969;Parent=MsG0680035053.01.T01
Chr6 CDS 98242030 98242855 98242030 ID=MsG0680035053.01.T01:cds;Parent=MsG0680035053.01.T01
Chr6 CDS 98242957 98243543 98242957 ID=MsG0680035053.01.T01:cds;Parent=MsG0680035053.01.T01
Chr6 CDS 98243629 98243646 98243629 ID=MsG0680035053.01.T01:cds;Parent=MsG0680035053.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680035053.01.T01

ATGTCATTCTATTTGTTAAAGTTGAGGTACGCATCTCTATCTCTTAACAATTTGTTTCTTCCAATTCGTCGATTACACGTTCAACCTCTTCCTTCATTCATTCCCAACGTCGACGACGCTGTTTCCTCATTCAATCGCATTCTCAACATGAACCCTACACCACCCATCTTCGAATTCGGTAAGATTTTATCATCCCTTGTTAAGATGAATCATTTCAATACCGCTATTTCATTCTCTCACCAAATGGAACTCAAAGGAATTCAACCTAACATTGTTACATTAAGCATCTTGATTAATTCTTTTTGCCACTTGAATCAACTCAATTTTGCATTTTCTATATTGGGTAAGATTCTTAAGCTAGGTTATGAGCCTAATACTGTAACATTCAATACAATTATCAAAGGTCTTTGTCTTAATGGTCATATTAGGAAAGCACTACACTTTCATGATAATGTTATAGCAAATGGATTTCATCTTAACGAAGTTAGTTATGGGATCTTGATCAATGGGTTATGTAAATCCGGAGAAACAACAACTGCCCTGCAGTTGCTTAGAAAGATTGAAGGGTTATTATTGGTTAGACCTGATGTGATAATGTACACTGCAATCATTGATAGTTTGTGCAAGGATAAACTTGTCAATGACGCCCTTTTACTATATTCTGAAATGACTGTCAAGAAAATTTATCCTAATGTTGTCACTTATAGTACTCTAATATATGGTCTTTTCATTGTGGGTAAAATGAACGAAGCAGTTGATTTGTTAAATGAAATGTCGTTGAAAAATATCAGTCCGAATGTTCTTACTTATACCACATTGGTCGATGAAGTCAACAAGGCCAAACATGTATTCAACACTCATTCTCTAAGGGGAGTGACTCCTAATGTTCATAGCTACAGTGTCATGATTAATGGATTATGTAAGAATAAAATGGTGGATGAAGCTGTGAATCTTTTCAAAGAAATGCATTTAAAAAACATGACTCCTAATACTGTAACATACAATTCACTTATTGATGGACTTCGCAAATCGGGAAGAATCTCTGATGTTTGGGATCTTATAGATGAGATGCATCATAGAGGCCAATCTGCTGATGTGATCACCTACAATTCTTTATTGGATGCTTTGTGCAAAATCCATCAGGTTGACAAGGCAATTGCGTTGTTAACAAAGATGAAAGACGAAGGAATTCAGCCAGATATGTATACATACACTATACTTGTTGATGGACTATGCAAAAATGGAAGACTTGAGGATGCACAAGAGATTTATCAAGGTCTTTTGATTAAGGGCTATCGTTTAGATGTTTGGATGTATAATGTGATGGTTAATGCGCTTTGTAAAGAGGGCTTGTTTGATGAAGCATTGTCCTTGTTGTCAAAAATGGAAGACAATGGCTGCACCCCAGATGCGAGGTCTACTGTAATCTAG
Protein sequence

>MsG0680035053.01.T01

MSFYLLKLRYASLSLNNLFLPIRRLHVQPLPSFIPNVDDAVSSFNRILNMNPTPPIFEFGKILSSLVKMNHFNTAISFSHQMELKGIQPNIVTLSILINSFCHLNQLNFAFSILGKILKLGYEPNTVTFNTIIKGLCLNGHIRKALHFHDNVIANGFHLNEVSYGILINGLCKSGETTTALQLLRKIEGLLLVRPDVIMYTAIIDSLCKDKLVNDALLLYSEMTVKKIYPNVVTYSTLIYGLFIVGKMNEAVDLLNEMSLKNISPNVLTYTTLVDEVNKAKHVFNTHSLRGVTPNVHSYSVMINGLCKNKMVDEAVNLFKEMHLKNMTPNTVTYNSLIDGLRKSGRISDVWDLIDEMHHRGQSADVITYNSLLDALCKIHQVDKAIALLTKMKDEGIQPDMYTYTILVDGLCKNGRLEDAQEIYQGLLIKGYRLDVWMYNVMVNALCKEGLFDEALSLLSKMEDNGCTPDARSTVI*