AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035267.01

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MsG0680035267.01.T01 AT1G63150 29.318 440 311 0 94 533 53 492 7.14e-65 223
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MsG0680035267.01.T01 AT1G64583 29.954 434 304 0 108 541 55 488 5.10e-63 215
MsG0680035267.01.T01 AT1G64583 33.945 327 216 0 212 538 54 380 5.65e-57 199
MsG0680035267.01.T01 AT1G64583 30.000 190 133 0 351 540 53 242 3.14e-20 94.4
MsG0680035267.01.T01 AT1G64583 27.083 192 131 3 357 540 17 207 3.03e-12 69.3
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MsG0680035267.01.T01 AT1G62720 31.429 420 285 1 122 541 67 483 1.17e-69 232
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MsG0680035267.01.T01 AT5G64320 28.706 425 297 3 119 541 106 526 9.21e-54 194
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MsG0680035267.01.T01 AT4G26800 30.259 347 239 1 192 535 83 429 3.10e-46 169
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MsG0680035267.01.T01 AT1G08610 27.990 418 299 2 123 539 103 519 2.11e-47 174
MsG0680035267.01.T01 AT1G08610 27.528 356 258 0 186 541 96 451 1.35e-45 169
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MsG0680035267.01.T01 AT3G16010 26.536 407 263 2 87 457 231 637 2.08e-40 155
MsG0680035267.01.T01 AT3G16010 24.398 332 248 2 49 379 300 629 1.13e-33 135
MsG0680035267.01.T01 AT3G16010 28.986 138 93 3 34 169 495 629 9.50e-11 65.1
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MsG0680035267.01.T01 AT5G42310 23.256 516 352 4 44 519 188 699 4.52e-45 169
MsG0680035267.01.T01 AT5G42310 23.022 417 279 3 127 541 170 546 2.14e-32 132
MsG0680035267.01.T01 AT5G42310 23.077 299 195 3 55 318 410 708 2.26e-20 95.5
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MsG0680035267.01.T01 AT4G26680 25.146 342 256 0 57 398 171 512 2.26e-41 156
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MsG0680035267.01.T01 AT4G26680 26.871 294 197 4 266 541 117 410 4.39e-27 115
MsG0680035267.01.T01 AT4G26680 24.364 275 207 1 34 308 219 492 1.05e-22 102
MsG0680035267.01.T01 AT4G26680 22.010 209 162 1 48 255 301 509 5.56e-12 68.6
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MsG0680035267.01.T01 AT3G60050 27.344 256 182 1 86 337 216 471 1.53e-28 119
MsG0680035267.01.T01 AT3G60050 24.055 291 221 0 214 504 169 459 9.09e-28 116
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MsG0680035267.01.T01 AT3G60050 27.344 256 182 1 86 337 216 471 1.53e-28 119
MsG0680035267.01.T01 AT3G60050 24.055 291 221 0 214 504 169 459 9.09e-28 116
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MsG0680035267.01.T01 AT3G62540 25.240 313 226 4 231 540 197 504 1.31e-27 117
MsG0680035267.01.T01 AT3G62540 20.235 425 324 6 76 492 182 599 2.06e-25 110
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MsG0680035267.01.T01 AT3G15200 28.571 287 199 3 84 368 208 490 1.10e-31 129
MsG0680035267.01.T01 AT3G15200 23.565 331 246 4 142 469 160 486 3.20e-25 109
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MsG0680035267.01.T01 AT5G43820 23.981 417 313 4 116 532 111 523 3.08e-31 127
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MsG0680035267.01.T01 AT4G02750 22.986 422 271 13 66 473 27 408 4.47e-29 122
MsG0680035267.01.T01 AT4G02750 21.560 436 308 9 34 468 173 575 2.53e-19 92.4
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MsG0680035267.01.T01 AT4G39620 25.417 240 165 4 309 535 101 339 2.45e-14 75.9
MsG0680035267.01.T01 AT4G39620 24.870 193 135 4 352 536 115 305 1.19e-11 67.8
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MsG0680035267.01.T01 AT1G14470 26.389 216 137 6 84 288 326 530 4.87e-11 65.9
MsG0680035267.01.T01 AT4G39620 27.000 300 212 3 158 451 132 430 1.61e-30 125
MsG0680035267.01.T01 AT4G39620 25.926 324 227 5 227 541 131 450 2.08e-25 110
MsG0680035267.01.T01 AT4G39620 22.256 328 228 8 57 368 136 452 3.59e-15 79.0
MsG0680035267.01.T01 AT4G39620 25.417 240 165 4 309 535 101 339 4.68e-14 75.5
MsG0680035267.01.T01 AT4G39620 24.870 193 135 4 352 536 115 305 1.93e-11 67.0
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MsG0680035267.01.T01 AT1G71210 23.282 524 359 9 55 539 218 737 4.93e-28 119
MsG0680035267.01.T01 AT1G71210 21.869 535 376 8 36 533 268 797 3.33e-25 110
MsG0680035267.01.T01 AT1G71210 22.414 406 303 6 128 527 186 585 1.67e-21 99.4
MsG0680035267.01.T01 AT1G71210 24.176 273 205 2 268 539 186 457 9.71e-17 84.3
MsG0680035267.01.T01 AT1G71210 24.444 315 224 5 234 541 187 494 1.61e-15 80.5
MsG0680035267.01.T01 AT5G15010 31.061 264 176 4 263 524 265 524 4.56e-30 124
MsG0680035267.01.T01 AT5G15010 26.050 357 243 9 194 540 161 506 1.48e-28 120
MsG0680035267.01.T01 AT5G15010 27.303 304 208 6 67 368 217 509 6.99e-24 105
MsG0680035267.01.T01 AT5G15010 24.171 211 156 3 54 263 302 509 5.01e-17 84.7
MsG0680035267.01.T01 AT1G03540 21.651 545 364 13 31 536 39 559 7.76e-30 124
MsG0680035267.01.T01 AT5G18390 23.864 352 266 2 120 469 107 458 1.33e-29 122
MsG0680035267.01.T01 AT5G18390 27.852 298 198 7 243 531 160 449 2.18e-27 115
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MsG0680035267.01.T01 AT1G53600 21.176 510 291 16 86 518 141 616 6.04e-21 97.4
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MsG0680035267.01.T01 AT1G02420 27.875 287 165 5 257 540 170 417 8.77e-24 105
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MsG0680035267.01.T01 AT5G46580 25.397 252 187 1 290 540 212 463 1.30e-23 105
MsG0680035267.01.T01 AT5G46580 22.013 318 245 2 193 508 185 501 2.34e-21 98.6
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MsG0680035267.01.T01 AT3G53170 23.885 381 279 6 61 434 65 441 7.37e-22 99.0
MsG0680035267.01.T01 AT3G53170 24.453 274 202 5 271 540 65 337 3.16e-16 81.6
MsG0680035267.01.T01 AT3G53170 20.939 277 218 1 34 309 145 421 4.32e-16 81.3
MsG0680035267.01.T01 AT2G27800 27.490 251 170 4 197 435 175 425 1.35e-26 112
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MsG0680035267.01.T01 AT2G02750 22.135 384 278 9 86 463 228 596 1.17e-16 83.6
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MsG0680035267.01.T01 AT1G20230 18.471 314 248 2 227 540 79 384 1.43e-15 80.5
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MsG0680035267.01.T01 AT1G10270 24.000 275 202 4 271 538 152 426 6.20e-18 88.2
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MsG0680035267.01.T01 AT4G19191 22.505 511 332 14 32 501 101 588 5.72e-20 94.0
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MsG0680035267.01.T01 AT5G39350 20.041 489 369 10 58 540 49 521 1.39e-18 89.7
MsG0680035267.01.T01 AT5G39350 20.823 389 275 10 86 461 281 649 3.24e-18 88.6
MsG0680035267.01.T01 AT2G22410 23.748 539 319 14 13 518 20 499 1.79e-23 105
MsG0680035267.01.T01 AT2G22410 22.105 380 280 5 88 466 221 585 2.89e-21 98.2
MsG0680035267.01.T01 AT2G40720 22.541 488 357 8 57 540 341 811 1.94e-23 105
MsG0680035267.01.T01 AT2G40720 20.069 583 387 16 9 541 21 574 6.60e-15 78.6
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MsG0680035267.01.T01 AT2G42920 22.005 409 298 8 90 494 90 481 7.79e-22 99.8
MsG0680035267.01.T01 AT2G42920 22.143 280 200 5 265 540 90 355 9.09e-17 84.0
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MsG0680035267.01.T01 AT5G56310 23.261 417 265 10 58 469 51 417 3.03e-21 97.8
MsG0680035267.01.T01 AT5G56310 21.801 422 283 7 80 500 38 413 1.43e-19 92.4
MsG0680035267.01.T01 AT5G56310 21.835 316 234 5 226 538 75 380 8.82e-13 71.2
MsG0680035267.01.T01 AT4G38150 31.410 156 104 1 320 475 120 272 3.22e-21 94.7
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MsG0680035267.01.T01 AT4G37170 21.646 328 240 5 192 518 118 429 1.90e-16 83.2
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MsG0680035267.01.T01 AT1G50270 21.239 452 305 8 88 538 35 436 6.45e-17 84.3
MsG0680035267.01.T01 AT3G51320 24.119 369 266 6 115 482 109 464 3.84e-20 94.4
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MsG0680035267.01.T01 AT1G74630 21.345 342 253 5 178 518 69 395 9.32e-18 87.0
MsG0680035267.01.T01 AT3G46790 22.453 481 317 14 76 535 3 448 4.95e-20 94.4
MsG0680035267.01.T01 AT1G74630 20.000 425 295 8 73 465 54 465 4.99e-20 94.4
MsG0680035267.01.T01 AT1G74630 21.345 342 253 5 178 518 54 380 1.14e-17 87.0
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MsG0680035267.01.T01 AT3G22150 21.235 405 295 9 89 487 353 739 4.87e-17 85.1
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MsG0680035267.01.T01 AT3G47840 20.082 488 358 11 48 526 65 529 1.62e-13 73.9
MsG0680035267.01.T01 AT3G47840 18.356 523 375 14 32 535 85 574 4.45e-12 69.3
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MsG0680035267.01.T01 AT3G20730 24.818 274 160 6 72 307 198 463 1.78e-12 70.5
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MsG0680035267.01.T01 AT2G33680 18.182 429 325 9 121 540 245 656 5.36e-12 69.3
MsG0680035267.01.T01 AT2G36730 22.280 386 269 11 60 439 47 407 2.57e-18 88.6
MsG0680035267.01.T01 AT2G36730 22.024 336 213 8 231 529 80 403 1.66e-14 76.6
MsG0680035267.01.T01 AT2G33680 22.444 450 312 12 34 471 200 624 2.61e-18 89.0
MsG0680035267.01.T01 AT2G33680 18.182 429 325 9 121 540 181 592 6.64e-12 68.9
MsG0680035267.01.T01 AT2G33680 22.444 450 312 12 34 471 200 624 2.61e-18 89.0
MsG0680035267.01.T01 AT2G33680 18.182 429 325 9 121 540 181 592 6.64e-12 68.9
MsG0680035267.01.T01 AT2G33680 22.444 450 312 12 34 471 200 624 2.61e-18 89.0
MsG0680035267.01.T01 AT2G33680 18.182 429 325 9 121 540 181 592 6.64e-12 68.9
MsG0680035267.01.T01 AT3G57430 21.308 535 355 15 12 535 18 497 2.70e-18 89.4
MsG0680035267.01.T01 AT3G57430 20.374 481 300 15 78 500 225 680 6.50e-12 68.9
MsG0680035267.01.T01 AT2G33680 22.444 450 312 12 34 471 255 679 2.90e-18 89.0
MsG0680035267.01.T01 AT2G33680 18.182 429 325 9 121 540 236 647 5.66e-12 68.9
MsG0680035267.01.T01 AT1G68980 21.798 445 305 10 85 522 183 591 3.16e-18 88.6
MsG0680035267.01.T01 AT1G68980 20.000 410 277 9 162 521 147 555 6.38e-14 75.1
MsG0680035267.01.T01 AT4G20770 20.455 484 334 15 78 539 161 615 3.28e-18 89.0
MsG0680035267.01.T01 AT4G20770 18.701 385 300 5 86 468 312 685 7.05e-14 75.1
MsG0680035267.01.T01 AT4G20770 19.588 388 243 9 183 521 61 428 4.34e-12 69.3

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTATCAGGAACTTCTATTTA+AGG 0.181264 6:+101253399 MsG0680035267.01.T01:CDS
ATCAAAGGTCTTTGTCTAAA+TGG 0.198050 6:+101252407 MsG0680035267.01.T01:CDS
TTTGCACAATCCATCTAATA+AGG 0.227493 6:-101253242 None:intergenic
ATTTGCAAAGTCCATCAATT+AGG 0.227651 6:-101253138 None:intergenic
TTCTTTCATTTGACCCAAAA+TGG 0.235550 6:-101252735 None:intergenic
ACCATCAATCAAAATATTAA+AGG 0.254488 6:-101252813 None:intergenic
TATTCAACGCTCTTTCTCTA+AGG 0.256934 6:+101252978 MsG0680035267.01.T01:CDS
TTTGATGGATGGGTATTTCT+TGG 0.275770 6:+101252928 MsG0680035267.01.T01:CDS
CATTTCTTTGAAGAGATTTA+CGG 0.291616 6:-101253074 None:intergenic
ACTTACAATTCCTTATTAGA+TGG 0.297543 6:+101253232 MsG0680035267.01.T01:CDS
ATGTATACTGTGATGATTAA+TGG 0.307597 6:+101253442 MsG0680035267.01.T01:CDS
ATTGATGGACTTTGCAAATC+AGG 0.317950 6:+101253142 MsG0680035267.01.T01:CDS
CGGATTATGTAAGAATAAAA+TGG 0.324520 6:+101253042 MsG0680035267.01.T01:CDS
CAGGGAGAATATCTGATGTT+TGG 0.333147 6:+101253161 MsG0680035267.01.T01:CDS
ACTTACACTACTCTAATATA+TGG 0.334281 6:+101252707 MsG0680035267.01.T01:CDS
ATAGTGTATGTATATATATT+TGG 0.334710 6:-101253325 None:intergenic
ATGAAGAAGAAGAAACGAAT+TGG 0.339829 6:-101252051 None:intergenic
TGTTACTTATACTTCTTTGA+TGG 0.343831 6:+101252913 MsG0680035267.01.T01:CDS
GTATTGAATGTTACAGTATC+AGG 0.344237 6:-101252380 None:intergenic
CATCTGGATCAGGTCAGTTA+TGG 0.347217 6:+101252482 MsG0680035267.01.T01:CDS
AGCTACAGTGTCATGATTAA+CGG 0.358103 6:+101253022 MsG0680035267.01.T01:CDS
TATCAGGAACTTCTATTTAA+GGG 0.365792 6:+101253400 MsG0680035267.01.T01:CDS
TTTGCAAAGTCCATCAATTA+GGG 0.370444 6:-101253137 None:intergenic
AAAACCTAGCTTGAGAATCT+TGG 0.373120 6:-101252354 None:intergenic
AGGGAGAATATCTGATGTTT+GGG 0.377940 6:+101253162 MsG0680035267.01.T01:CDS
ATCTGGATCAGGTCAGTTAT+GGG 0.384032 6:+101252483 MsG0680035267.01.T01:CDS
GGATGCACAAAGGGTCTATC+AGG 0.387077 6:+101253384 MsG0680035267.01.T01:CDS
GTTGGGTAGGATTCTTCATA+TGG 0.396331 6:-101252151 None:intergenic
ACATACACTATACTTGTTGA+TGG 0.402875 6:+101253337 MsG0680035267.01.T01:CDS
GCATACAATTCCCTAATTGA+TGG 0.405695 6:+101253127 MsG0680035267.01.T01:CDS
ATTAATGGGCTTTGTAAAGA+AGG 0.409709 6:+101253457 MsG0680035267.01.T01:CDS
GTTATGGGACATTAATTAAC+GGG 0.413038 6:+101252498 MsG0680035267.01.T01:CDS
ACACTGTAGCTAAGAACATT+AGG 0.423005 6:-101253010 None:intergenic
GAATTGTATGCTACAGTGTC+AGG 0.423389 6:-101253115 None:intergenic
TTTGATTGATGGTTTATGTA+AGG 0.428388 6:+101252823 MsG0680035267.01.T01:CDS
TATAGCAAAGGGATTTCATC+TGG 0.429651 6:+101252466 MsG0680035267.01.T01:CDS
CTTATACTTCTTTGATGGAT+GGG 0.429900 6:+101252918 MsG0680035267.01.T01:CDS
GTTTCGTAAGTTACAGCATC+AGG 0.431829 6:-101253535 None:intergenic
TGACAAAGTTATCATTGTTA+AGG 0.431918 6:+101252018 MsG0680035267.01.T01:CDS
AAGAGCGTTGAATACATGTT+TGG 0.439925 6:-101252969 None:intergenic
TATGATGATGTTATAGCAAA+GGG 0.441973 6:+101252455 MsG0680035267.01.T01:CDS
TAGAAAGATTGAAGGGTTGT+TGG 0.442366 6:+101252562 MsG0680035267.01.T01:CDS
GGTCAAATGAAAGAAGCAAT+TGG 0.443944 6:+101252743 MsG0680035267.01.T01:CDS
TGTATACTGTGATGATTAAT+GGG 0.443987 6:+101253443 MsG0680035267.01.T01:CDS
ACCCAACCTATCTTCGAATT+CGG 0.450490 6:+101252167 MsG0680035267.01.T01:CDS
ACTTATACTTCTTTGATGGA+TGG 0.452238 6:+101252917 MsG0680035267.01.T01:CDS
GAAGTATAAGTAACAACATC+AGG 0.453409 6:-101252905 None:intergenic
ATTGATGGTTTATGTAAGGA+AGG 0.470136 6:+101252827 MsG0680035267.01.T01:CDS
TACCGAATTCGAAGATAGGT+TGG 0.472514 6:-101252169 None:intergenic
TAGGGCAGCTTGTGTTTCTC+CGG 0.472914 6:-101252531 None:intergenic
AGTTATGGGACATTAATTAA+CGG 0.475682 6:+101252497 MsG0680035267.01.T01:CDS
ATTAACGGGTTATGTAAATC+CGG 0.477190 6:+101252512 MsG0680035267.01.T01:CDS
CAGTTGCTTAGAAAGATTGA+AGG 0.482000 6:+101252554 MsG0680035267.01.T01:CDS
TGAAGAAGAAGAAACGAATT+GGG 0.487594 6:-101252050 None:intergenic
GTAGTGTAAGTGACGACATC+AGG 0.491513 6:-101252695 None:intergenic
AAAGGGATTTCATCTGGATC+AGG 0.503967 6:+101252472 MsG0680035267.01.T01:CDS
GTGTTGTACATGACAACATC+AGG 0.506752 6:-101252590 None:intergenic
ATTCAACGCTCTTTCTCTAA+GGG 0.506775 6:+101252979 MsG0680035267.01.T01:CDS
CAATCTTTCTAAGCAACTGT+AGG 0.509119 6:-101252550 None:intergenic
TTGTAAGTGATTATGTTAGC+TGG 0.512788 6:-101253217 None:intergenic
TTAATGGGCTTTGTAAAGAA+GGG 0.514597 6:+101253458 MsG0680035267.01.T01:CDS
ATATTAAAGGTGTAAACATC+CGG 0.516846 6:-101252800 None:intergenic
ACCGAATTCGAAGATAGGTT+GGG 0.517500 6:-101252168 None:intergenic
AAGATCTAAGGATGCACAAA+GGG 0.520164 6:+101253375 MsG0680035267.01.T01:CDS
TTGATGGACTTTGCAAATCA+GGG 0.534189 6:+101253143 MsG0680035267.01.T01:CDS
ATAGATGAGATGCATGATAG+AGG 0.545633 6:+101253190 MsG0680035267.01.T01:CDS
TCTCATCAAATGGAAATCAA+AGG 0.546058 6:+101252245 MsG0680035267.01.T01:CDS
CTATGATGATGTTATAGCAA+AGG 0.548250 6:+101252454 MsG0680035267.01.T01:CDS
ATGGCCAAGATTCTCAAGCT+AGG 0.561146 6:+101252350 MsG0680035267.01.T01:CDS
CTTCGTGAAATGATTTCTAG+AGG 0.569836 6:+101253610 MsG0680035267.01.T01:CDS
TTTGTTAAATCAAATGACGC+TGG 0.570627 6:+101252766 MsG0680035267.01.T01:CDS
TCGTTTCTTCTTCTTCATCG+TGG 0.571852 6:+101252056 MsG0680035267.01.T01:CDS
AAAGATAAGCTTGTTAGTGA+TGG 0.572458 6:+101252632 MsG0680035267.01.T01:CDS
AATCTTTCTAAGCAACTGTA+GGG 0.575448 6:-101252549 None:intergenic
AGTTGCTTAGAAAGATTGAA+GGG 0.580882 6:+101252555 MsG0680035267.01.T01:CDS
TTATCAATGAACGAAGGAAG+AGG 0.581121 6:-101252092 None:intergenic
TGGTTTATGTAAGGAAGGAG+AGG 0.581729 6:+101252832 MsG0680035267.01.T01:CDS
TATACATTCTAATATTTAGA+CGG 0.583735 6:-101253426 None:intergenic
GGAAATGATTCAACTTAACA+AGG 0.586195 6:-101252205 None:intergenic
CAAGCTTATCTTTACAGAGA+CGG 0.593126 6:-101252622 None:intergenic
ATTATGTAAGAATAAAATGG+TGG 0.609528 6:+101253045 MsG0680035267.01.T01:CDS
AGGTCTTTGTCTAAATGGCG+AGG 0.615679 6:+101252412 MsG0680035267.01.T01:CDS
TTGGCTGTTATGATAAATCA+AGG 0.615831 6:+101252875 MsG0680035267.01.T01:CDS
CAATTGCCCTGTCAACCTGA+TGG 0.620505 6:-101253267 None:intergenic
ACATTCAATACACTTATCAA+AGG 0.623563 6:+101252392 MsG0680035267.01.T01:CDS
TTCAACGCTCTTTCTCTAAG+GGG 0.628368 6:+101252980 MsG0680035267.01.T01:CDS
CTTGGTAAAAGAAGTCAACA+AGG 0.632436 6:+101252946 MsG0680035267.01.T01:CDS
GACGCTGGAAAACATCACTC+CGG 0.636709 6:+101252781 MsG0680035267.01.T01:CDS
AATTCGAAGATAGGTTGGGT+AGG 0.641062 6:-101252164 None:intergenic
GTTGTACTTACTCTCAACAA+TGG 0.642153 6:+101253495 MsG0680035267.01.T01:CDS
ACATTCTAATATTTAGACGG+TGG 0.644729 6:-101253423 None:intergenic
GAAGATCTAAGGATGCACAA+AGG 0.655399 6:+101253374 MsG0680035267.01.T01:CDS
CTCTCAACAATGGAAGACAA+CGG 0.661400 6:+101253505 MsG0680035267.01.T01:CDS
GAAATGATTCAACTTAACAA+GGG 0.668762 6:-101252204 None:intergenic
TGTTATGATAAATCAAGGAG+TGG 0.686812 6:+101252880 MsG0680035267.01.T01:CDS
TCAACATTATCAATGAACGA+AGG 0.687067 6:-101252098 None:intergenic
GAGAAAATGAAATAGCTGTG+TGG 0.710337 6:-101252226 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATAGTGTATGTATATATATT+TGG - Chr6:101253328-101253347 None:intergenic 15.0%
!! TATACATTCTAATATTTAGA+CGG - Chr6:101253429-101253448 None:intergenic 15.0%
!! ACCATCAATCAAAATATTAA+AGG - Chr6:101252816-101252835 None:intergenic 20.0%
!! ATGTTGAAAGTAAAAATATC+AGG - Chr6:101252278-101252297 None:intergenic 20.0%
!! ATTATGTAAGAATAAAATGG+TGG + Chr6:101253045-101253064 MsG0680035267.01.T01:CDS 20.0%
!!! AATATATGGTTTTTCCATTT+TGG + Chr6:101252721-101252740 MsG0680035267.01.T01:CDS 20.0%
!!! ACCTTTAATATTTTGATTGA+TGG + Chr6:101252812-101252831 MsG0680035267.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATATATGGTTTTTCCATTTT+GGG + Chr6:101252722-101252741 MsG0680035267.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATTTCATTTTCTCATCAAA+TGG + Chr6:101252235-101252254 MsG0680035267.01.T01:CDS 20.0%
! ACATTCAATACACTTATCAA+AGG + Chr6:101252392-101252411 MsG0680035267.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTACAATTCCTTATTAGA+TGG + Chr6:101253232-101253251 MsG0680035267.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTACACTACTCTAATATA+TGG + Chr6:101252707-101252726 MsG0680035267.01.T01:CDS 25.0%
! AGAAATGCATTCCAAAAATA+TGG + Chr6:101253090-101253109 MsG0680035267.01.T01:CDS 25.0%
! AGTTATGGGACATTAATTAA+CGG + Chr6:101252497-101252516 MsG0680035267.01.T01:CDS 25.0%
! ATGTATACTGTGATGATTAA+TGG + Chr6:101253442-101253461 MsG0680035267.01.T01:CDS 25.0%
! CAAAAACAACAAGAATGATA+AGG + Chr6:101253576-101253595 MsG0680035267.01.T01:CDS 25.0%
! CGGATTATGTAAGAATAAAA+TGG + Chr6:101253042-101253061 MsG0680035267.01.T01:CDS 25.0%
! GAAATGATTCAACTTAACAA+GGG - Chr6:101252207-101252226 None:intergenic 25.0%
! TATCAGGAACTTCTATTTAA+GGG + Chr6:101253400-101253419 MsG0680035267.01.T01:CDS 25.0%
! TGACAAAGTTATCATTGTTA+AGG + Chr6:101252018-101252037 MsG0680035267.01.T01:CDS 25.0%
! TGTATACTGTGATGATTAAT+GGG + Chr6:101253443-101253462 MsG0680035267.01.T01:CDS 25.0%
! TTGAAAAAGATGAAAGATGA+AGG + Chr6:101253295-101253314 MsG0680035267.01.T01:CDS 25.0%
!! ATATTAAAGGTGTAAACATC+CGG - Chr6:101252803-101252822 None:intergenic 25.0%
!! CATTTCTTTGAAGAGATTTA+CGG - Chr6:101253077-101253096 None:intergenic 25.0%
!! TATGATGATGTTATAGCAAA+GGG + Chr6:101252455-101252474 MsG0680035267.01.T01:CDS 25.0%
!! TGTTACTTATACTTCTTTGA+TGG + Chr6:101252913-101252932 MsG0680035267.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTGATTGATGGTTTATGTA+AGG + Chr6:101252823-101252842 MsG0680035267.01.T01:CDS 25.0%
AATCTTTCTAAGCAACTGTA+GGG - Chr6:101252552-101252571 None:intergenic 30.0%
ACATTCTAATATTTAGACGG+TGG - Chr6:101253426-101253445 None:intergenic 30.0%
ACTTATACTTCTTTGATGGA+TGG + Chr6:101252917-101252936 MsG0680035267.01.T01:CDS 30.0%
AGTTGCTTAGAAAGATTGAA+GGG + Chr6:101252555-101252574 MsG0680035267.01.T01:CDS 30.0%
ATCAAAGGTCTTTGTCTAAA+TGG + Chr6:101252407-101252426 MsG0680035267.01.T01:CDS 30.0%
ATGAAGAAGAAGAAACGAAT+TGG - Chr6:101252054-101252073 None:intergenic 30.0%
ATGCAAAAATGGAAGATCTA+AGG + Chr6:101253363-101253382 MsG0680035267.01.T01:CDS 30.0%
ATTTGCAAAGTCCATCAATT+AGG - Chr6:101253141-101253160 None:intergenic 30.0%
CTATCAGGAACTTCTATTTA+AGG + Chr6:101253399-101253418 MsG0680035267.01.T01:CDS 30.0%
GAAAAAAGCTAGAAATGTGT+TGG + Chr6:101252856-101252875 MsG0680035267.01.T01:CDS 30.0%
GAAGTATAAGTAACAACATC+AGG - Chr6:101252908-101252927 None:intergenic 30.0%
GGAAATGATTCAACTTAACA+AGG - Chr6:101252208-101252227 None:intergenic 30.0%
GTATTGAATGTTACAGTATC+AGG - Chr6:101252383-101252402 None:intergenic 30.0%
GTTATGGGACATTAATTAAC+GGG + Chr6:101252498-101252517 MsG0680035267.01.T01:CDS 30.0%
TCAACATTATCAATGAACGA+AGG - Chr6:101252101-101252120 None:intergenic 30.0%
TCTCATCAAATGGAAATCAA+AGG + Chr6:101252245-101252264 MsG0680035267.01.T01:CDS 30.0%
TGAAGAAGAAGAAACGAATT+GGG - Chr6:101252053-101252072 None:intergenic 30.0%
TGTTATGATAAATCAAGGAG+TGG + Chr6:101252880-101252899 MsG0680035267.01.T01:CDS 30.0%
TTCTTTCATTTGACCCAAAA+TGG - Chr6:101252738-101252757 None:intergenic 30.0%
TTGGCTGTTATGATAAATCA+AGG + Chr6:101252875-101252894 MsG0680035267.01.T01:CDS 30.0%
TTGTAAGTGATTATGTTAGC+TGG - Chr6:101253220-101253239 None:intergenic 30.0%
TTTGCAAAGTCCATCAATTA+GGG - Chr6:101253140-101253159 None:intergenic 30.0%
TTTGCACAATCCATCTAATA+AGG - Chr6:101253245-101253264 None:intergenic 30.0%
TTTGTTAAATCAAATGACGC+TGG + Chr6:101252766-101252785 MsG0680035267.01.T01:CDS 30.0%
! ACATACACTATACTTGTTGA+TGG + Chr6:101253337-101253356 MsG0680035267.01.T01:CDS 30.0%
! ATTGATGGTTTATGTAAGGA+AGG + Chr6:101252827-101252846 MsG0680035267.01.T01:CDS 30.0%
! ATTTTACCGAATTCGAAGAT+AGG - Chr6:101252176-101252195 None:intergenic 30.0%
! CTATGATGATGTTATAGCAA+AGG + Chr6:101252454-101252473 MsG0680035267.01.T01:CDS 30.0%
! CTTATACTTCTTTGATGGAT+GGG + Chr6:101252918-101252937 MsG0680035267.01.T01:CDS 30.0%
!! AAAGATAAGCTTGTTAGTGA+TGG + Chr6:101252632-101252651 MsG0680035267.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTAACGGGTTATGTAAATC+CGG + Chr6:101252512-101252531 MsG0680035267.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTAATGGGCTTTGTAAAGA+AGG + Chr6:101253457-101253476 MsG0680035267.01.T01:CDS 30.0%
!! TTAATGGGCTTTGTAAAGAA+GGG + Chr6:101253458-101253477 MsG0680035267.01.T01:CDS 30.0%
!!! TGTTGTTTTTGAACAAAGCA+TGG - Chr6:101253567-101253586 None:intergenic 30.0%
AAAACCTAGCTTGAGAATCT+TGG - Chr6:101252357-101252376 None:intergenic 35.0%
AAGATCTAAGGATGCACAAA+GGG + Chr6:101253375-101253394 MsG0680035267.01.T01:CDS 35.0%
ACACTGTAGCTAAGAACATT+AGG - Chr6:101253013-101253032 None:intergenic 35.0%
AGCTACAGTGTCATGATTAA+CGG + Chr6:101253022-101253041 MsG0680035267.01.T01:CDS 35.0%
AGGGAGAATATCTGATGTTT+GGG + Chr6:101253162-101253181 MsG0680035267.01.T01:CDS 35.0%
ATAGATGAGATGCATGATAG+AGG + Chr6:101253190-101253209 MsG0680035267.01.T01:CDS 35.0%
ATTCAACGCTCTTTCTCTAA+GGG + Chr6:101252979-101252998 MsG0680035267.01.T01:CDS 35.0%
CAAGCTTATCTTTACAGAGA+CGG - Chr6:101252625-101252644 None:intergenic 35.0%
CAATCTTTCTAAGCAACTGT+AGG - Chr6:101252553-101252572 None:intergenic 35.0%
CAGTTGCTTAGAAAGATTGA+AGG + Chr6:101252554-101252573 MsG0680035267.01.T01:CDS 35.0%
CTTGGTAAAAGAAGTCAACA+AGG + Chr6:101252946-101252965 MsG0680035267.01.T01:CDS 35.0%
GAGAAAATGAAATAGCTGTG+TGG - Chr6:101252229-101252248 None:intergenic 35.0%
GCATACAATTCCCTAATTGA+TGG + Chr6:101253127-101253146 MsG0680035267.01.T01:CDS 35.0%
GGTCAAATGAAAGAAGCAAT+TGG + Chr6:101252743-101252762 MsG0680035267.01.T01:CDS 35.0%
GTTGTACTTACTCTCAACAA+TGG + Chr6:101253495-101253514 MsG0680035267.01.T01:CDS 35.0%
TAGAAAGATTGAAGGGTTGT+TGG + Chr6:101252562-101252581 MsG0680035267.01.T01:CDS 35.0%
TATAGCAAAGGGATTTCATC+TGG + Chr6:101252466-101252485 MsG0680035267.01.T01:CDS 35.0%
TATTCAACGCTCTTTCTCTA+AGG + Chr6:101252978-101252997 MsG0680035267.01.T01:CDS 35.0%
TTATCAATGAACGAAGGAAG+AGG - Chr6:101252095-101252114 None:intergenic 35.0%
! AGTGTCAGGAACCATATTTT+TGG - Chr6:101253104-101253123 None:intergenic 35.0%
! CAATTTCGCGTTTTCTGTAA+TGG + Chr6:101252331-101252350 MsG0680035267.01.T01:CDS 35.0%
! CTTCGTGAAATGATTTCTAG+AGG + Chr6:101253610-101253629 MsG0680035267.01.T01:CDS 35.0%
! TTTGATGGATGGGTATTTCT+TGG + Chr6:101252928-101252947 MsG0680035267.01.T01:CDS 35.0%
!! AAGAGCGTTGAATACATGTT+TGG - Chr6:101252972-101252991 None:intergenic 35.0%
!! ATTGATGGACTTTGCAAATC+AGG + Chr6:101253142-101253161 MsG0680035267.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTGATGGACTATGCAAAAA+TGG + Chr6:101253352-101253371 MsG0680035267.01.T01:CDS 35.0%
!! TTGATGGACTTTGCAAATCA+GGG + Chr6:101253143-101253162 MsG0680035267.01.T01:CDS 35.0%
AAAGGGATTTCATCTGGATC+AGG + Chr6:101252472-101252491 MsG0680035267.01.T01:CDS 40.0%
ACCCAACCTATCTTCGAATT+CGG + Chr6:101252167-101252186 MsG0680035267.01.T01:CDS 40.0%
ACCGAATTCGAAGATAGGTT+GGG - Chr6:101252171-101252190 None:intergenic 40.0%
ATCTGGATCAGGTCAGTTAT+GGG + Chr6:101252483-101252502 MsG0680035267.01.T01:CDS 40.0%
CAGGGAGAATATCTGATGTT+TGG + Chr6:101253161-101253180 MsG0680035267.01.T01:CDS 40.0%
CTCTCAACAATGGAAGACAA+CGG + Chr6:101253505-101253524 MsG0680035267.01.T01:CDS 40.0%
GAAGATCTAAGGATGCACAA+AGG + Chr6:101253374-101253393 MsG0680035267.01.T01:CDS 40.0%
GAATTGTATGCTACAGTGTC+AGG - Chr6:101253118-101253137 None:intergenic 40.0%
GTGTTGTACATGACAACATC+AGG - Chr6:101252593-101252612 None:intergenic 40.0%
GTTGGGTAGGATTCTTCATA+TGG - Chr6:101252154-101252173 None:intergenic 40.0%
GTTTCGTAAGTTACAGCATC+AGG - Chr6:101253538-101253557 None:intergenic 40.0%
TACCGAATTCGAAGATAGGT+TGG - Chr6:101252172-101252191 None:intergenic 40.0%
TCGTTTCTTCTTCTTCATCG+TGG + Chr6:101252056-101252075 MsG0680035267.01.T01:CDS 40.0%
TGGATTGTGCAAAAACCATC+AGG + Chr6:101253252-101253271 MsG0680035267.01.T01:CDS 40.0%
TGGTTTATGTAAGGAAGGAG+AGG + Chr6:101252832-101252851 MsG0680035267.01.T01:CDS 40.0%
TTCAACGCTCTTTCTCTAAG+GGG + Chr6:101252980-101252999 MsG0680035267.01.T01:CDS 40.0%
! AATTCGAAGATAGGTTGGGT+AGG - Chr6:101252167-101252186 None:intergenic 40.0%
!! CAAAAACCATCAGGTTGACA+GGG + Chr6:101253261-101253280 MsG0680035267.01.T01:CDS 40.0%
AGGTCTTTGTCTAAATGGCG+AGG + Chr6:101252412-101252431 MsG0680035267.01.T01:CDS 45.0%
ATGGCCAAGATTCTCAAGCT+AGG + Chr6:101252350-101252369 MsG0680035267.01.T01:CDS 45.0%
CATCTGGATCAGGTCAGTTA+TGG + Chr6:101252482-101252501 MsG0680035267.01.T01:CDS 45.0%
GTAGTGTAAGTGACGACATC+AGG - Chr6:101252698-101252717 None:intergenic 45.0%
!! GCAAAAACCATCAGGTTGAC+AGG + Chr6:101253260-101253279 MsG0680035267.01.T01:CDS 45.0%
CAATTGCCCTGTCAACCTGA+TGG - Chr6:101253270-101253289 None:intergenic 50.0%
GACGCTGGAAAACATCACTC+CGG + Chr6:101252781-101252800 MsG0680035267.01.T01:CDS 50.0%
GGATGCACAAAGGGTCTATC+AGG + Chr6:101253384-101253403 MsG0680035267.01.T01:CDS 50.0%
TAGGGCAGCTTGTGTTTCTC+CGG - Chr6:101252534-101252553 None:intergenic 50.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 101252017 101253642 101252017 ID=MsG0680035267.01;Name=MsG0680035267.01
Chr6 mRNA 101252017 101253642 101252017 ID=MsG0680035267.01.T01;Parent=MsG0680035267.01;Name=MsG0680035267.01.T01;_AED=0.45;_eAED=0.46;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|541
Chr6 exon 101252017 101253642 101252017 ID=MsG0680035267.01.T01:exon:20704;Parent=MsG0680035267.01.T01
Chr6 CDS 101252017 101253642 101252017 ID=MsG0680035267.01.T01:cds;Parent=MsG0680035267.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680035267.01.T01

ATGACAAAGTTATCATTGTTAAGGTACGCAACTCCCAATTCGTTTCTTCTTCTTCATCGTGGATTACACATTCAACCTCTTCCTTCGTTCATTGATAATGTTGATGATGCTGTTTCTTCGTTCAATCGCATTCTCCATATGAAGAATCCTACCCAACCTATCTTCGAATTCGGTAAAATTTTATCTTCCCTTGTTAAGTTGAATCATTTCCACACAGCTATTTCATTTTCTCATCAAATGGAAATCAAAGGAATTCAACCTGATATTTTTACTTTCAACATTTTGATTAATTGTTTCTCTCGTCTAAATCAACTCAATTTCGCGTTTTCTGTAATGGCCAAGATTCTCAAGCTAGGTTTTCAACCTGATACTGTAACATTCAATACACTTATCAAAGGTCTTTGTCTAAATGGCGAGGTTAAGAAAGCATTTCACTTCTATGATGATGTTATAGCAAAGGGATTTCATCTGGATCAGGTCAGTTATGGGACATTAATTAACGGGTTATGTAAATCCGGAGAAACACAAGCTGCCCTACAGTTGCTTAGAAAGATTGAAGGGTTGTTGGTCAAGCCTGATGTTGTCATGTACAACACAATCATTGACCGTCTCTGTAAAGATAAGCTTGTTAGTGATGGCTATGATTTATATTCTGAAATGATTGTTAAGAAAATTTGTCCTGATGTCGTCACTTACACTACTCTAATATATGGTTTTTCCATTTTGGGTCAAATGAAAGAAGCAATTGGTTTGTTAAATCAAATGACGCTGGAAAACATCACTCCGGATGTTTACACCTTTAATATTTTGATTGATGGTTTATGTAAGGAAGGAGAGGTGAAAAAAGCTAGAAATGTGTTGGCTGTTATGATAAATCAAGGAGTGGAACCTGATGTTGTTACTTATACTTCTTTGATGGATGGGTATTTCTTGGTAAAAGAAGTCAACAAGGCCAAACATGTATTCAACGCTCTTTCTCTAAGGGGAGTGACTCCTAATGTTCTTAGCTACAGTGTCATGATTAACGGATTATGTAAGAATAAAATGGTGGATGAAGCCGTAAATCTCTTCAAAGAAATGCATTCCAAAAATATGGTTCCTGACACTGTAGCATACAATTCCCTAATTGATGGACTTTGCAAATCAGGGAGAATATCTGATGTTTGGGATTTTATAGATGAGATGCATGATAGAGGTCAACCAGCTAACATAATCACTTACAATTCCTTATTAGATGGATTGTGCAAAAACCATCAGGTTGACAGGGCAATTGCATTATTGAAAAAGATGAAAGATGAAGGAATTCAGCCAAATATATATACATACACTATACTTGTTGATGGACTATGCAAAAATGGAAGATCTAAGGATGCACAAAGGGTCTATCAGGAACTTCTATTTAAGGGCCACCGTCTAAATATTAGAATGTATACTGTGATGATTAATGGGCTTTGTAAAGAAGGGTTTTTTGATGAAGCGTTGTACTTACTCTCAACAATGGAAGACAACGGTTGCATGCCTGATGCTGTAACTTACGAAACTCTTATCCATGCTTTGTTCAAAAACAACAAGAATGATAAGGCTGTGAAGCTTCTTCGTGAAATGATTTCTAGAGGTCTACTCTAA
Protein sequence

>MsG0680035267.01.T01

MTKLSLLRYATPNSFLLLHRGLHIQPLPSFIDNVDDAVSSFNRILHMKNPTQPIFEFGKILSSLVKLNHFHTAISFSHQMEIKGIQPDIFTFNILINCFSRLNQLNFAFSVMAKILKLGFQPDTVTFNTLIKGLCLNGEVKKAFHFYDDVIAKGFHLDQVSYGTLINGLCKSGETQAALQLLRKIEGLLVKPDVVMYNTIIDRLCKDKLVSDGYDLYSEMIVKKICPDVVTYTTLIYGFSILGQMKEAIGLLNQMTLENITPDVYTFNILIDGLCKEGEVKKARNVLAVMINQGVEPDVVTYTSLMDGYFLVKEVNKAKHVFNALSLRGVTPNVLSYSVMINGLCKNKMVDEAVNLFKEMHSKNMVPDTVAYNSLIDGLCKSGRISDVWDFIDEMHDRGQPANIITYNSLLDGLCKNHQVDRAIALLKKMKDEGIQPNIYTYTILVDGLCKNGRSKDAQRVYQELLFKGHRLNIRMYTVMINGLCKEGFFDEALYLLSTMEDNGCMPDAVTYETLIHALFKNNKNDKAVKLLREMISRGLL*