AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035268.01

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MsG0680035268.01.T01 AT1G13630 29.864 442 301 4 110 550 45 478 1.27e-53 193
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MsG0680035268.01.T01 AT4G19890 29.490 451 316 2 101 550 150 599 2.22e-69 236
MsG0680035268.01.T01 AT4G19890 27.955 533 368 7 23 550 179 700 1.16e-60 213
MsG0680035268.01.T01 AT4G19890 26.327 471 343 3 69 538 153 620 1.35e-60 213
MsG0680035268.01.T01 AT4G19890 27.493 371 267 2 182 551 161 530 1.60e-44 168
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MsG0680035268.01.T01 AT5G24830 27.682 289 209 0 43 331 280 568 1.28e-34 138
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MsG0680035268.01.T01 AT1G79080 30.128 156 108 1 394 549 87 241 3.77e-18 88.2
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MsG0680035268.01.T01 AT4G01400 28.631 241 170 2 311 550 122 361 4.08e-26 112
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MsG0680035268.01.T01 AT2G36240 27.759 299 215 1 171 469 196 493 1.36e-35 140
MsG0680035268.01.T01 AT2G36240 24.731 279 202 2 43 317 208 482 6.82e-26 111
MsG0680035268.01.T01 AT2G36240 30.147 136 91 2 416 549 160 293 1.98e-15 79.3
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MsG0680035268.01.T01 AT1G74850 25.059 423 311 3 126 545 134 553 3.08e-40 156
MsG0680035268.01.T01 AT1G74850 23.834 386 290 3 167 550 140 523 5.71e-38 149
MsG0680035268.01.T01 AT1G74850 19.419 551 394 7 44 551 157 700 5.68e-35 140
MsG0680035268.01.T01 AT1G74850 22.955 379 254 6 171 547 108 450 7.27e-35 140
MsG0680035268.01.T01 AT1G74850 20.492 488 345 5 61 507 245 730 2.53e-27 117
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MsG0680035268.01.T01 AT2G37230 24.395 496 353 8 69 550 191 678 1.17e-34 139
MsG0680035268.01.T01 AT2G37230 26.076 395 277 6 168 550 114 505 5.81e-31 128
MsG0680035268.01.T01 AT2G37230 21.591 528 361 8 51 549 243 746 1.99e-27 117
MsG0680035268.01.T01 AT2G37230 21.516 488 354 10 44 514 271 746 2.43e-22 102
MsG0680035268.01.T01 AT2G18940 21.910 534 345 6 66 528 213 745 3.59e-40 156
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MsG0680035268.01.T01 AT3G59040 20.628 223 173 1 15 237 270 488 3.26e-12 69.7
MsG0680035268.01.T01 AT1G73400 28.421 285 199 3 233 514 229 511 1.87e-35 140
MsG0680035268.01.T01 AT1G73400 28.521 284 198 3 270 550 231 512 2.50e-32 131
MsG0680035268.01.T01 AT1G73400 24.024 333 245 4 76 404 214 542 1.17e-26 114
MsG0680035268.01.T01 AT1G73400 23.656 279 206 3 55 330 226 500 1.95e-23 104
MsG0680035268.01.T01 AT1G73400 22.368 304 226 3 123 420 224 523 1.97e-23 104
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MsG0680035268.01.T01 AT4G30825 26.749 243 167 4 151 388 647 883 2.23e-19 92.8
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MsG0680035268.01.T01 AT5G14820 22.192 365 282 2 66 430 197 559 9.87e-30 124
MsG0680035268.01.T01 AT5G14820 25.703 249 182 3 301 549 187 432 1.86e-21 98.6
MsG0680035268.01.T01 AT5G14820 19.048 252 204 0 60 311 294 545 5.83e-19 90.9
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MsG0680035268.01.T01 AT5G11310 25.153 326 235 4 139 458 218 540 2.43e-28 119
MsG0680035268.01.T01 AT5G11310 22.388 469 337 9 84 534 87 546 2.52e-28 119
MsG0680035268.01.T01 AT5G11310 22.064 281 219 0 55 335 242 522 1.01e-20 96.3
MsG0680035268.01.T01 AT2G17670 28.826 281 194 4 43 317 64 344 6.56e-33 129
MsG0680035268.01.T01 AT2G17670 27.113 284 200 5 221 498 67 349 5.65e-32 126
MsG0680035268.01.T01 AT2G17670 25.194 258 187 4 297 549 74 330 1.27e-25 108
MsG0680035268.01.T01 AT2G17670 27.586 232 165 2 164 392 118 349 1.81e-25 108
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MsG0680035268.01.T01 AT5G14080 21.596 426 327 5 128 550 77 498 4.62e-21 97.4
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MsG0680035268.01.T01 AT5G14080 23.077 234 139 4 101 296 331 561 1.25e-11 67.8
MsG0680035268.01.T01 AT5G15010 23.955 359 254 7 63 412 161 509 5.13e-29 121
MsG0680035268.01.T01 AT5G15010 27.747 364 217 9 206 530 164 520 5.53e-29 121
MsG0680035268.01.T01 AT5G15010 25.143 350 221 8 238 550 161 506 8.58e-22 99.8
MsG0680035268.01.T01 AT5G55740 21.978 455 337 6 97 548 238 677 5.25e-29 122
MsG0680035268.01.T01 AT5G55740 20.284 493 372 7 63 547 340 819 3.61e-25 110
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MsG0680035268.01.T01 AT1G53600 21.039 385 218 7 94 478 306 604 2.97e-18 89.0
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MsG0680035268.01.T01 AT5G37570 24.308 325 221 7 232 551 68 372 2.86e-20 94.7
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MsG0680035268.01.T01 AT5G27270 20.703 512 363 8 66 543 261 763 1.02e-16 84.3
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MsG0680035268.01.T01 AT5G40405 23.821 403 254 11 80 478 53 406 3.62e-22 100
MsG0680035268.01.T01 AT5G40405 22.476 307 223 5 224 528 57 350 6.57e-14 75.1
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MsG0680035268.01.T01 AT2G21090 21.867 375 250 6 200 545 79 439 2.52e-18 89.0
MsG0680035268.01.T01 AT2G21090 24.597 248 164 6 306 550 80 307 2.92e-14 76.3
MsG0680035268.01.T01 AT3G13770 23.474 426 258 13 131 510 16 419 4.02e-22 100
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MsG0680035268.01.T01 AT5G27270 19.734 451 350 7 81 530 451 890 1.12e-17 87.4
MsG0680035268.01.T01 AT5G27270 20.194 515 383 10 45 550 310 805 1.42e-17 87.0
MsG0680035268.01.T01 AT5G27270 20.784 510 365 8 66 543 261 763 3.40e-17 85.9
MsG0680035268.01.T01 AT5G27270 23.926 326 230 5 67 385 572 886 1.79e-16 83.6
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MsG0680035268.01.T01 AT2G18520 24.400 250 181 6 306 550 28 274 9.18e-16 80.1
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MsG0680035268.01.T01 AT4G33990 20.846 331 242 6 63 387 306 622 1.17e-14 77.8
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MsG0680035268.01.T01 AT3G13880 18.931 449 286 9 91 469 176 616 2.32e-16 83.2
MsG0680035268.01.T01 AT3G13880 19.959 491 325 14 105 550 89 556 7.88e-15 78.2
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MsG0680035268.01.T01 AT3G48250 23.923 209 123 2 378 550 263 471 1.64e-12 70.5
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MsG0680035268.01.T01 AT1G69350 20.656 518 325 9 43 528 151 614 1.01e-18 90.5
MsG0680035268.01.T01 AT1G69350 20.281 498 339 12 86 546 256 732 3.15e-16 82.8
MsG0680035268.01.T01 AT1G69350 20.243 494 335 12 96 550 63 536 4.22e-13 72.8
MsG0680035268.01.T01 AT2G45350 22.360 322 202 7 241 528 153 460 1.51e-18 89.7
MsG0680035268.01.T01 AT2G45350 20.889 450 301 12 64 478 87 516 5.78e-15 78.6
MsG0680035268.01.T01 AT2G45350 23.179 302 216 7 53 351 273 561 1.52e-11 67.4
MsG0680035268.01.T01 AT2G02980 22.078 385 273 8 165 541 56 421 1.57e-18 89.7
MsG0680035268.01.T01 AT2G02980 22.281 377 267 6 46 404 25 393 3.64e-17 85.1
MsG0680035268.01.T01 AT2G02980 21.114 341 245 6 218 548 34 360 7.30e-16 81.3
MsG0680035268.01.T01 AT3G25060 21.121 464 303 11 93 551 146 551 1.65e-18 89.4
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MsG0680035268.01.T01 AT3G25210 26.368 201 139 2 254 445 160 360 7.79e-16 80.1
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MsG0680035268.01.T01 AT3G25210 26.946 167 121 1 364 530 209 374 5.19e-14 74.3
MsG0680035268.01.T01 AT3G01580 20.194 515 335 13 63 510 25 530 2.53e-18 89.0
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MsG0680035268.01.T01 AT4G38010 20.971 453 298 10 99 545 72 470 3.19e-18 88.6
MsG0680035268.01.T01 AT4G38010 20.802 524 318 14 32 479 39 541 9.99e-18 87.0
MsG0680035268.01.T01 AT4G38010 17.936 407 272 9 186 550 17 403 3.07e-13 72.8
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MsG0680035268.01.T01 AT1G05750 23.596 356 237 8 203 545 36 369 5.72e-18 87.4
MsG0680035268.01.T01 AT1G05750 23.273 275 195 5 69 342 115 374 3.88e-12 69.3
MsG0680035268.01.T01 AT5G13230 20.352 511 347 12 39 546 192 645 7.17e-18 87.8
MsG0680035268.01.T01 AT5G13230 19.694 457 340 8 94 546 144 577 5.42e-16 82.0
MsG0680035268.01.T01 AT5G13230 21.709 433 281 10 128 551 242 625 8.01e-15 78.2
MsG0680035268.01.T01 AT2G03380 22.075 453 299 11 135 550 244 679 1.06e-17 87.0
MsG0680035268.01.T01 AT2G03380 20.043 469 328 13 95 548 104 540 7.56e-14 75.1
MsG0680035268.01.T01 AT5G48910 20.418 431 270 7 52 478 79 440 1.11e-17 87.0
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MsG0680035268.01.T01 AT3G20730 22.247 445 285 12 143 546 22 446 1.11e-17 86.7
MsG0680035268.01.T01 AT3G20730 20.366 437 287 12 95 522 177 561 2.92e-11 66.6
MsG0680035268.01.T01 AT3G20730 19.506 405 267 10 119 473 84 479 3.32e-11 66.2
MsG0680035268.01.T01 AT5G36300 24.194 310 218 6 241 536 14 320 1.11e-17 84.7
MsG0680035268.01.T01 AT5G36300 20.789 279 205 3 276 541 14 289 1.43e-17 84.7
MsG0680035268.01.T01 AT5G36300 20.645 310 229 4 171 466 14 320 6.10e-15 76.6

Find 86 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 105 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CATTTCTTTGAAGAGATTTA+TGG 0.157040 6:-101260134 None:intergenic
ATCAAAGGTCTTTGTCTTAA+TGG 0.161636 6:+101259467 MsG0680035268.01.T01:CDS
TATCGGGATCTTACGATTAA+AGG 0.194099 6:+101260463 MsG0680035268.01.T01:CDS
TGTATATACCTTTAATATAT+TGG 0.222235 6:+101259865 MsG0680035268.01.T01:CDS
TTTGATGGATGGGTATTTCT+TGG 0.227507 6:+101259988 MsG0680035268.01.T01:CDS
ATTTGCAAAGTCCATCAATT+AGG 0.227651 6:-101260198 None:intergenic
AGCTACAATATCATGATTAA+TGG 0.237820 6:+101260082 MsG0680035268.01.T01:CDS
TATTTAGCACTCTTTCTCTA+AGG 0.285954 6:+101260038 MsG0680035268.01.T01:CDS
ACTTACAATTCTTTATTAGA+TGG 0.297529 6:+101260292 MsG0680035268.01.T01:CDS
TGAAACAAAAGCTGCTTTGC+AGG 0.306362 6:+101259595 MsG0680035268.01.T01:CDS
ATGTATACTGTGATGATTAA+TGG 0.307597 6:+101260505 MsG0680035268.01.T01:CDS
GTATTGAACGTTACAGTATC+AGG 0.312267 6:-101259440 None:intergenic
ATTGATGGACTTTGCAAATC+AGG 0.317950 6:+101260202 MsG0680035268.01.T01:CDS
AGTAATGTACAACACTATTA+TGG 0.319394 6:+101259658 MsG0680035268.01.T01:CDS
CATCTTAACGAAGTTAGTTA+TGG 0.321004 6:+101259542 MsG0680035268.01.T01:CDS
CAGGGAGAATATCTGATGTT+TGG 0.333147 6:+101260221 MsG0680035268.01.T01:CDS
ATAGTGTATGTACACATATT+TGG 0.339433 6:-101260388 None:intergenic
ACCGTCAACCAATATATTAA+AGG 0.341741 6:-101259873 None:intergenic
CTGCTTTGCAGGTTCTTAGA+AGG 0.343147 6:+101259606 MsG0680035268.01.T01:CDS
TGTTACTTATACTTCTTTGA+TGG 0.343831 6:+101259973 MsG0680035268.01.T01:CDS
TTTGTCTTAATGGTCATGTT+AGG 0.351570 6:+101259477 MsG0680035268.01.T01:CDS
TTTGCAAAGTCCATCAATTA+GGG 0.370444 6:-101260197 None:intergenic
ATCTTAACGAAGTTAGTTAT+GGG 0.372780 6:+101259543 MsG0680035268.01.T01:CDS
AGGGAGAATATCTGATGTTT+GGG 0.377940 6:+101260222 MsG0680035268.01.T01:CDS
TCGACAATGAAGAATCGAAT+TGG 0.381329 6:-101259120 None:intergenic
TTGGGTAAGATTCTCAAGAT+AGG 0.385372 6:+101259410 MsG0680035268.01.T01:CDS
GCATACAATTCCCTAATTGA+TGG 0.405695 6:+101260187 MsG0680035268.01.T01:CDS
AGAAGTCAACAAGGCCAAAC+AGG 0.405744 6:+101260015 MsG0680035268.01.T01:CDS
TAACTTTGTCATAGTGAGTT+TGG 0.407286 6:-101259072 None:intergenic
AATCTTGTTAAATTCGAAGA+TGG 0.410749 6:-101259234 None:intergenic
AGGATGCGCAAGAAGTTTAT+CGG 0.413416 6:+101260446 MsG0680035268.01.T01:CDS
TGGGTTATGTAAGAATAAAA+TGG 0.416056 6:+101260102 MsG0680035268.01.T01:CDS
CATGATAATGTTATAGCAAA+GGG 0.417201 6:+101259515 MsG0680035268.01.T01:CDS
CAAAGTTATCATCATTGTTA+AGG 0.418755 6:+101259087 MsG0680035268.01.T01:CDS
GAATTGTATGCTACAGTGTC+AGG 0.423389 6:-101260175 None:intergenic
ACATACACTATACTTGTTGA+TGG 0.424059 6:+101260400 MsG0680035268.01.T01:CDS
GCTACAATATCATGATTAAT+GGG 0.426948 6:+101260083 MsG0680035268.01.T01:CDS
GTTTCGTAAGTTACTGCATC+AGG 0.427932 6:-101260598 None:intergenic
CTTATACTTCTTTGATGGAT+GGG 0.429900 6:+101259978 MsG0680035268.01.T01:CDS
ATATTGTAGCTACGAACATT+AGG 0.430291 6:-101260070 None:intergenic
ACCTTTAATATATTGGTTGA+CGG 0.432117 6:+101259872 MsG0680035268.01.T01:CDS
ATATTAAAGGTATATACATC+TGG 0.435741 6:-101259860 None:intergenic
AAGAGTGCTAAATACCTGTT+TGG 0.437934 6:-101260029 None:intergenic
ATTGGTTGACGGTTTATGTA+AGG 0.444066 6:+101259883 MsG0680035268.01.T01:CDS
TGTATACTGTGATGATTAAT+GGG 0.445925 6:+101260506 MsG0680035268.01.T01:CDS
GTTATGGGATCTTGATCAAC+GGG 0.450956 6:+101259558 MsG0680035268.01.T01:CDS
ACTTATACTTCTTTGATGGA+TGG 0.452238 6:+101259977 MsG0680035268.01.T01:CDS
GAAGTATAAGTAACAACATC+AGG 0.453409 6:-101259965 None:intergenic
GTGGTGTAGGGTTGATGTTA+AGG 0.471948 6:-101259211 None:intergenic
CGACAATGAAGAATCGAATT+GGG 0.473510 6:-101259119 None:intergenic
ACTTACAGTTCTTTAATACA+TGG 0.475931 6:+101259767 MsG0680035268.01.T01:CDS
AATTCGAAGATGGGTGGTGT+AGG 0.478880 6:-101259224 None:intergenic
AAGGCTATCATTTAGATGCT+AGG 0.479231 6:+101260482 MsG0680035268.01.T01:CDS
ATTTAGCACTCTTTCTCTAA+GGG 0.482735 6:+101260039 MsG0680035268.01.T01:CDS
ATCAACATTATCAATGAATG+AGG 0.493054 6:-101259162 None:intergenic
ATTCGAAGATGGGTGGTGTA+GGG 0.494646 6:-101259223 None:intergenic
GAACTGTAAGTGATCACATC+AGG 0.499149 6:-101259755 None:intergenic
CGTAATTGATTTGATTGAGA+TGG 0.500729 6:-101259376 None:intergenic
ATCAACGGGTTATGTAAATC+CGG 0.502302 6:+101259572 MsG0680035268.01.T01:CDS
GAGAAAATGAAATAGCTTTG+TGG 0.502597 6:-101259286 None:intergenic
ATCTTGTTAAATTCGAAGAT+GGG 0.504467 6:-101259233 None:intergenic
TGAAAGCGACAGAAATGATA+AGG 0.511513 6:+101260639 MsG0680035268.01.T01:CDS
CTTCGTGAAATGATTGCAAG+AGG 0.517768 6:+101260673 MsG0680035268.01.T01:CDS
GGATGCGCAAGAAGTTTATC+GGG 0.517867 6:+101260447 MsG0680035268.01.T01:CDS
TTGTAAGTGATTATGTTAGC+TGG 0.525627 6:-101260277 None:intergenic
TTGATGGACTTTGCAAATCA+GGG 0.534189 6:+101260203 MsG0680035268.01.T01:CDS
GTTGACGGTTTATGTAAGGA+AGG 0.537391 6:+101259887 MsG0680035268.01.T01:CDS
TCATGATAATGTTATAGCAA+AGG 0.537525 6:+101259514 MsG0680035268.01.T01:CDS
ATTAATGGGCTTTGTAAACA+AGG 0.551480 6:+101260520 MsG0680035268.01.T01:CDS
GTGTTGTACATTACTACGTC+AGG 0.552733 6:-101259650 None:intergenic
GTTAAGGATGCTATTGAATG+AGG 0.580511 6:-101259195 None:intergenic
GGTCAATTCAAAGAAGCACT+TGG 0.586847 6:+101259803 MsG0680035268.01.T01:CDS
AGTTATGGGATCTTGATCAA+CGG 0.590390 6:+101259557 MsG0680035268.01.T01:CDS
TCTCAACAAATGGAACTCAA+AGG 0.590742 6:+101259305 MsG0680035268.01.T01:CDS
CGGTTTATGTAAGGAAGGAG+AGG 0.594112 6:+101259892 MsG0680035268.01.T01:CDS
CTTGGTTAAAGAAGTCAACA+AGG 0.595976 6:+101260006 MsG0680035268.01.T01:CDS
ACGTTCAATACAATTATCAA+AGG 0.606806 6:+101259452 MsG0680035268.01.T01:CDS
TTTAGCACTCTTTCTCTAAG+GGG 0.608938 6:+101260040 MsG0680035268.01.T01:CDS
CAATTGCCCTGTCAACCTGA+TGG 0.620505 6:-101260327 None:intergenic
TCAACATTATCAATGAATGA+GGG 0.623935 6:-101259161 None:intergenic
TTAATGGGCTTTGTAAACAA+GGG 0.625421 6:+101260521 MsG0680035268.01.T01:CDS
TTGTTAAATTCGAAGATGGG+TGG 0.635779 6:-101259230 None:intergenic
TGTTATGATAAAACAACGTG+TGG 0.655037 6:+101259940 MsG0680035268.01.T01:CDS
GTTATGTAAGAATAAAATGG+TGG 0.659806 6:+101260105 MsG0680035268.01.T01:CDS
ATAGATGAGATGCATGACAG+AGG 0.693029 6:+101260250 MsG0680035268.01.T01:CDS
AAGCGACAGAAATGATAAGG+CGG 0.727047 6:+101260642 MsG0680035268.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TGTATATACCTTTAATATAT+TGG + Chr6:101259865-101259884 MsG0680035268.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATGTTTAAAGTAAAAATGTT+AGG - Chr6:101259338-101259357 None:intergenic 15.0%
!! ACTTACAATTCTTTATTAGA+TGG + Chr6:101260292-101260311 MsG0680035268.01.T01:CDS 20.0%
!!! AATTACGCTTTTTCTATATT+GGG + Chr6:101259392-101259411 MsG0680035268.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATATTAAAGGTATATACATC+TGG - Chr6:101259863-101259882 None:intergenic 20.0%
!!! TATTTCATTTTCTCAACAAA+TGG + Chr6:101259295-101259314 MsG0680035268.01.T01:CDS 20.0%
! AATCTTGTTAAATTCGAAGA+TGG - Chr6:101259237-101259256 None:intergenic 25.0%
! ACGTTCAATACAATTATCAA+AGG + Chr6:101259452-101259471 MsG0680035268.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTACAGTTCTTTAATACA+TGG + Chr6:101259767-101259786 MsG0680035268.01.T01:CDS 25.0%
! AGAAATGCATTCCAAAAATA+TGG + Chr6:101260150-101260169 MsG0680035268.01.T01:CDS 25.0%
! AGCTACAATATCATGATTAA+TGG + Chr6:101260082-101260101 MsG0680035268.01.T01:CDS 25.0%
! AGTAATGTACAACACTATTA+TGG + Chr6:101259658-101259677 MsG0680035268.01.T01:CDS 25.0%
! ATAGTGTATGTACACATATT+TGG - Chr6:101260391-101260410 None:intergenic 25.0%
! ATCAACATTATCAATGAATG+AGG - Chr6:101259165-101259184 None:intergenic 25.0%
! ATCTTAACGAAGTTAGTTAT+GGG + Chr6:101259543-101259562 MsG0680035268.01.T01:CDS 25.0%
! ATCTTGTTAAATTCGAAGAT+GGG - Chr6:101259236-101259255 None:intergenic 25.0%
! ATGTATACTGTGATGATTAA+TGG + Chr6:101260505-101260524 MsG0680035268.01.T01:CDS 25.0%
! CAAAGTTATCATCATTGTTA+AGG + Chr6:101259087-101259106 MsG0680035268.01.T01:CDS 25.0%
! GCTACAATATCATGATTAAT+GGG + Chr6:101260083-101260102 MsG0680035268.01.T01:CDS 25.0%
! GTTATGTAAGAATAAAATGG+TGG + Chr6:101260105-101260124 MsG0680035268.01.T01:CDS 25.0%
! TCAACATTATCAATGAATGA+GGG - Chr6:101259164-101259183 None:intergenic 25.0%
! TGGGTTATGTAAGAATAAAA+TGG + Chr6:101260102-101260121 MsG0680035268.01.T01:CDS 25.0%
! TGTATACTGTGATGATTAAT+GGG + Chr6:101260506-101260525 MsG0680035268.01.T01:CDS 25.0%
!! AATACATGGATTTTGTATTG+TGG + Chr6:101259781-101259800 MsG0680035268.01.T01:CDS 25.0%
!! ACCTTTAATATATTGGTTGA+CGG + Chr6:101259872-101259891 MsG0680035268.01.T01:CDS 25.0%
!! ATACATGGATTTTGTATTGT+GGG + Chr6:101259782-101259801 MsG0680035268.01.T01:CDS 25.0%
!! CATGATAATGTTATAGCAAA+GGG + Chr6:101259515-101259534 MsG0680035268.01.T01:CDS 25.0%
!! CATTTCTTTGAAGAGATTTA+TGG - Chr6:101260137-101260156 None:intergenic 25.0%
!! TCATGATAATGTTATAGCAA+AGG + Chr6:101259514-101259533 MsG0680035268.01.T01:CDS 25.0%
!! TGTTACTTATACTTCTTTGA+TGG + Chr6:101259973-101259992 MsG0680035268.01.T01:CDS 25.0%
!!! CAATTACGCTTTTTCTATAT+TGG + Chr6:101259391-101259410 MsG0680035268.01.T01:CDS 25.0%
ACCGTCAACCAATATATTAA+AGG - Chr6:101259876-101259895 None:intergenic 30.0%
ACTTATACTTCTTTGATGGA+TGG + Chr6:101259977-101259996 MsG0680035268.01.T01:CDS 30.0%
ATATTGTAGCTACGAACATT+AGG - Chr6:101260073-101260092 None:intergenic 30.0%
ATCAAAGGTCTTTGTCTTAA+TGG + Chr6:101259467-101259486 MsG0680035268.01.T01:CDS 30.0%
ATTGTCCTTACTCTCAAAAA+TGG + Chr6:101260558-101260577 MsG0680035268.01.T01:CDS 30.0%
ATTTAGCACTCTTTCTCTAA+GGG + Chr6:101260039-101260058 MsG0680035268.01.T01:CDS 30.0%
ATTTGCAAAGTCCATCAATT+AGG - Chr6:101260201-101260220 None:intergenic 30.0%
CATCTTAACGAAGTTAGTTA+TGG + Chr6:101259542-101259561 MsG0680035268.01.T01:CDS 30.0%
GAAAAAAGCTAGAAACATGT+TGG + Chr6:101259916-101259935 MsG0680035268.01.T01:CDS 30.0%
GAAGTATAAGTAACAACATC+AGG - Chr6:101259968-101259987 None:intergenic 30.0%
TAACTTTGTCATAGTGAGTT+TGG - Chr6:101259075-101259094 None:intergenic 30.0%
TATTTAGCACTCTTTCTCTA+AGG + Chr6:101260038-101260057 MsG0680035268.01.T01:CDS 30.0%
TGTTATGATAAAACAACGTG+TGG + Chr6:101259940-101259959 MsG0680035268.01.T01:CDS 30.0%
TTGAAAAAGATGAAAGACGA+AGG + Chr6:101260358-101260377 MsG0680035268.01.T01:CDS 30.0%
TTGTAAGTGATTATGTTAGC+TGG - Chr6:101260280-101260299 None:intergenic 30.0%
TTTGCAAAGTCCATCAATTA+GGG - Chr6:101260200-101260219 None:intergenic 30.0%
TTTGTCTTAATGGTCATGTT+AGG + Chr6:101259477-101259496 MsG0680035268.01.T01:CDS 30.0%
! ACATACACTATACTTGTTGA+TGG + Chr6:101260400-101260419 MsG0680035268.01.T01:CDS 30.0%
! CTTATACTTCTTTGATGGAT+GGG + Chr6:101259978-101259997 MsG0680035268.01.T01:CDS 30.0%
! GAGAAAATGAAATAGCTTTG+TGG - Chr6:101259289-101259308 None:intergenic 30.0%
!! ATTAATGGGCTTTGTAAACA+AGG + Chr6:101260520-101260539 MsG0680035268.01.T01:CDS 30.0%
!! CGTAATTGATTTGATTGAGA+TGG - Chr6:101259379-101259398 None:intergenic 30.0%
!! TTAATGGGCTTTGTAAACAA+GGG + Chr6:101260521-101260540 MsG0680035268.01.T01:CDS 30.0%
AAGGCTATCATTTAGATGCT+AGG + Chr6:101260482-101260501 MsG0680035268.01.T01:CDS 35.0%
AGGGAGAATATCTGATGTTT+GGG + Chr6:101260222-101260241 MsG0680035268.01.T01:CDS 35.0%
AGTTATGGGATCTTGATCAA+CGG + Chr6:101259557-101259576 MsG0680035268.01.T01:CDS 35.0%
ATTGGTTGACGGTTTATGTA+AGG + Chr6:101259883-101259902 MsG0680035268.01.T01:CDS 35.0%
CGACAATGAAGAATCGAATT+GGG - Chr6:101259122-101259141 None:intergenic 35.0%
CTTGGTTAAAGAAGTCAACA+AGG + Chr6:101260006-101260025 MsG0680035268.01.T01:CDS 35.0%
GCATACAATTCCCTAATTGA+TGG + Chr6:101260187-101260206 MsG0680035268.01.T01:CDS 35.0%
GTATTGAACGTTACAGTATC+AGG - Chr6:101259443-101259462 None:intergenic 35.0%
GTTAAGGATGCTATTGAATG+AGG - Chr6:101259198-101259217 None:intergenic 35.0%
TATCGGGATCTTACGATTAA+AGG + Chr6:101260463-101260482 MsG0680035268.01.T01:CDS 35.0%
TCGACAATGAAGAATCGAAT+TGG - Chr6:101259123-101259142 None:intergenic 35.0%
TCTCAACAAATGGAACTCAA+AGG + Chr6:101259305-101259324 MsG0680035268.01.T01:CDS 35.0%
TGAAAGCGACAGAAATGATA+AGG + Chr6:101260639-101260658 MsG0680035268.01.T01:CDS 35.0%
TTGGGTAAGATTCTCAAGAT+AGG + Chr6:101259410-101259429 MsG0680035268.01.T01:CDS 35.0%
TTGTTAAATTCGAAGATGGG+TGG - Chr6:101259233-101259252 None:intergenic 35.0%
TTTAGCACTCTTTCTCTAAG+GGG + Chr6:101260040-101260059 MsG0680035268.01.T01:CDS 35.0%
! AGTGTCAGGAACCATATTTT+TGG - Chr6:101260164-101260183 None:intergenic 35.0%
! TTTGATGGATGGGTATTTCT+TGG + Chr6:101259988-101260007 MsG0680035268.01.T01:CDS 35.0%
!! AAGAGTGCTAAATACCTGTT+TGG - Chr6:101260032-101260051 None:intergenic 35.0%
!! ATCAACGGGTTATGTAAATC+CGG + Chr6:101259572-101259591 MsG0680035268.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTGATGGACTTTGCAAATC+AGG + Chr6:101260202-101260221 MsG0680035268.01.T01:CDS 35.0%
!! GTCTTCCATTTTTGAGAGTA+AGG - Chr6:101260566-101260585 None:intergenic 35.0%
!! GTTGATGGACTATGCAAAAA+CGG + Chr6:101260415-101260434 MsG0680035268.01.T01:CDS 35.0%
!! TTGATGGACTTTGCAAATCA+GGG + Chr6:101260203-101260222 MsG0680035268.01.T01:CDS 35.0%
AAGCGACAGAAATGATAAGG+CGG + Chr6:101260642-101260661 MsG0680035268.01.T01:CDS 40.0%
AGGATGCGCAAGAAGTTTAT+CGG + Chr6:101260446-101260465 MsG0680035268.01.T01:CDS 40.0%
ATAGATGAGATGCATGACAG+AGG + Chr6:101260250-101260269 MsG0680035268.01.T01:CDS 40.0%
ATGCAAAAACGGAAGACTTG+AGG + Chr6:101260426-101260445 MsG0680035268.01.T01:CDS 40.0%
CAGGGAGAATATCTGATGTT+TGG + Chr6:101260221-101260240 MsG0680035268.01.T01:CDS 40.0%
CTCTCAAAAATGGAAGACAG+CGG + Chr6:101260568-101260587 MsG0680035268.01.T01:CDS 40.0%
CTTCGTGAAATGATTGCAAG+AGG + Chr6:101260673-101260692 MsG0680035268.01.T01:CDS 40.0%
GAACTGTAAGTGATCACATC+AGG - Chr6:101259758-101259777 None:intergenic 40.0%
GAATTGTATGCTACAGTGTC+AGG - Chr6:101260178-101260197 None:intergenic 40.0%
GTGTTGTACATTACTACGTC+AGG - Chr6:101259653-101259672 None:intergenic 40.0%
GTTATGGGATCTTGATCAAC+GGG + Chr6:101259558-101259577 MsG0680035268.01.T01:CDS 40.0%
GTTGACGGTTTATGTAAGGA+AGG + Chr6:101259887-101259906 MsG0680035268.01.T01:CDS 40.0%
GTTTCGTAAGTTACTGCATC+AGG - Chr6:101260601-101260620 None:intergenic 40.0%
TGGATTGTGCAAAAACCATC+AGG + Chr6:101260312-101260331 MsG0680035268.01.T01:CDS 40.0%
! TGAAACAAAAGCTGCTTTGC+AGG + Chr6:101259595-101259614 MsG0680035268.01.T01:CDS 40.0%
!! CAAAAACCATCAGGTTGACA+GGG + Chr6:101260321-101260340 MsG0680035268.01.T01:CDS 40.0%
!! CAAAGCAGCTTTTGTTTCAC+CGG - Chr6:101259594-101259613 None:intergenic 40.0%
!! GGTCAATTCAAAGAAGCACT+TGG + Chr6:101259803-101259822 MsG0680035268.01.T01:CDS 40.0%
AATTCGAAGATGGGTGGTGT+AGG - Chr6:101259227-101259246 None:intergenic 45.0%
AGAAGTCAACAAGGCCAAAC+AGG + Chr6:101260015-101260034 MsG0680035268.01.T01:CDS 45.0%
ATTCGAAGATGGGTGGTGTA+GGG - Chr6:101259226-101259245 None:intergenic 45.0%
CGGTTTATGTAAGGAAGGAG+AGG + Chr6:101259892-101259911 MsG0680035268.01.T01:CDS 45.0%
CTGCTTTGCAGGTTCTTAGA+AGG + Chr6:101259606-101259625 MsG0680035268.01.T01:CDS 45.0%
GGATGCGCAAGAAGTTTATC+GGG + Chr6:101260447-101260466 MsG0680035268.01.T01:CDS 45.0%
!! GCAAAAACCATCAGGTTGAC+AGG + Chr6:101260320-101260339 MsG0680035268.01.T01:CDS 45.0%
!! GTGGTGTAGGGTTGATGTTA+AGG - Chr6:101259214-101259233 None:intergenic 45.0%
CAATTGCCCTGTCAACCTGA+TGG - Chr6:101260330-101260349 None:intergenic 50.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 101259050 101260705 101259050 ID=MsG0680035268.01;Name=MsG0680035268.01
Chr6 mRNA 101259050 101260705 101259050 ID=MsG0680035268.01.T01;Parent=MsG0680035268.01;Name=MsG0680035268.01.T01;_AED=0.45;_eAED=0.45;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|551
Chr6 exon 101259050 101260705 101259050 ID=MsG0680035268.01.T01:exon:20705;Parent=MsG0680035268.01.T01
Chr6 CDS 101259050 101260705 101259050 ID=MsG0680035268.01.T01:cds;Parent=MsG0680035268.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680035268.01.T01

ATGGCATTCACAATCATTGCAACCAAACTCACTATGACAAAGTTATCATCATTGTTAAGGTACGCAACTCCCAATTCGATTCTTCATTGTCGATTACACATTCAGTCACTTCCCTCATTCATTGATAATGTTGATGATGCTGTTTCCTCATTCAATAGCATCCTTAACATCAACCCTACACCACCCATCTTCGAATTTAACAAGATTTTATCTTCTCTTGCTAAGTTGAATCATTTCCACAAAGCTATTTCATTTTCTCAACAAATGGAACTCAAAGGAATTCAACCTAACATTTTTACTTTAAACATCTTGATTAATTCTTTCTGCCATCTCAATCAAATCAATTACGCTTTTTCTATATTGGGTAAGATTCTCAAGATAGGTTTTCAACCTGATACTGTAACGTTCAATACAATTATCAAAGGTCTTTGTCTTAATGGTCATGTTAGGAAAGCTCTACACTTTCATGATAATGTTATAGCAAAGGGATTTCATCTTAACGAAGTTAGTTATGGGATCTTGATCAACGGGTTATGTAAATCCGGTGAAACAAAAGCTGCTTTGCAGGTTCTTAGAAGGATTGAAGAGAAATGTGTTAGACCTGACGTAGTAATGTACAACACTATTATGGATAGTTTATGCAAGAATAAATTAGTAATTGATGCGTGTGATTTATATTCTGAAATGCTTGTCAGAAGAATTTCTCCTGATGTGATCACTTACAGTTCTTTAATACATGGATTTTGTATTGTGGGTCAATTCAAAGAAGCACTTGGTTTTTTCAATCAAATGTTATTAAAAAACATAAAACCAGATGTATATACCTTTAATATATTGGTTGACGGTTTATGTAAGGAAGGAGAGGTGAAAAAAGCTAGAAACATGTTGGCTGTTATGATAAAACAACGTGTGGAACCTGATGTTGTTACTTATACTTCTTTGATGGATGGGTATTTCTTGGTTAAAGAAGTCAACAAGGCCAAACAGGTATTTAGCACTCTTTCTCTAAGGGGAGTGACTCCTAATGTTCGTAGCTACAATATCATGATTAATGGGTTATGTAAGAATAAAATGGTGGATGAAGCCATAAATCTCTTCAAAGAAATGCATTCCAAAAATATGGTTCCTGACACTGTAGCATACAATTCCCTAATTGATGGACTTTGCAAATCAGGGAGAATATCTGATGTTTGGGATTTTATAGATGAGATGCATGACAGAGGTCAACCAGCTAACATAATCACTTACAATTCTTTATTAGATGGATTGTGCAAAAACCATCAGGTTGACAGGGCAATTGCATTATTATTGAAAAAGATGAAAGACGAAGGAGTTCAGCCAAATATGTGTACATACACTATACTTGTTGATGGACTATGCAAAAACGGAAGACTTGAGGATGCGCAAGAAGTTTATCGGGATCTTACGATTAAAGGCTATCATTTAGATGCTAGGATGTATACTGTGATGATTAATGGGCTTTGTAAACAAGGGTTTTTTGATGAAGCATTGTCCTTACTCTCAAAAATGGAAGACAGCGGTTGCACTCCTGATGCAGTAACTTACGAAACTCTTATTCATGCTTTGTTTGAAAGCGACAGAAATGATAAGGCGGTGAAACTTCTTCGTGAAATGATTGCAAGAGGTTTACTCTAA
Protein sequence

>MsG0680035268.01.T01

MAFTIIATKLTMTKLSSLLRYATPNSILHCRLHIQSLPSFIDNVDDAVSSFNSILNINPTPPIFEFNKILSSLAKLNHFHKAISFSQQMELKGIQPNIFTLNILINSFCHLNQINYAFSILGKILKIGFQPDTVTFNTIIKGLCLNGHVRKALHFHDNVIAKGFHLNEVSYGILINGLCKSGETKAALQVLRRIEEKCVRPDVVMYNTIMDSLCKNKLVIDACDLYSEMLVRRISPDVITYSSLIHGFCIVGQFKEALGFFNQMLLKNIKPDVYTFNILVDGLCKEGEVKKARNMLAVMIKQRVEPDVVTYTSLMDGYFLVKEVNKAKQVFSTLSLRGVTPNVRSYNIMINGLCKNKMVDEAINLFKEMHSKNMVPDTVAYNSLIDGLCKSGRISDVWDFIDEMHDRGQPANIITYNSLLDGLCKNHQVDRAIALLLKKMKDEGVQPNMCTYTILVDGLCKNGRLEDAQEVYRDLTIKGYHLDARMYTVMINGLCKQGFFDEALSLLSKMEDSGCTPDAVTYETLIHALFESDRNDKAVKLLREMIARGLL*