AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380014599.01

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MsG0380014599.01.T01 AT1G64583 26.423 246 181 0 6 251 242 487 7.71e-30 122
MsG0380014599.01.T01 AT1G64583 25.628 199 147 1 263 460 44 242 4.27e-16 80.9
MsG0380014599.01.T01 AT5G41170 36.235 425 263 2 9 425 71 495 2.76e-79 255
MsG0380014599.01.T01 AT5G41170 33.505 388 255 1 5 389 102 489 2.80e-72 236
MsG0380014599.01.T01 AT5G41170 28.037 428 295 3 8 422 25 452 7.05e-60 204
MsG0380014599.01.T01 AT5G41170 30.707 368 254 1 94 460 16 383 1.82e-53 187
MsG0380014599.01.T01 AT5G41170 29.484 407 283 4 45 449 2 406 3.09e-49 176
MsG0380014599.01.T01 AT1G63230 40.308 325 187 2 36 357 1 321 1.85e-78 247
MsG0380014599.01.T01 AT1G63230 33.333 309 202 1 141 449 1 305 4.26e-55 186
MsG0380014599.01.T01 AT1G63230 31.962 316 211 1 71 386 1 312 7.89e-52 178
MsG0380014599.01.T01 AT1G63230 29.904 311 214 1 114 424 9 315 1.13e-50 175
MsG0380014599.01.T01 AT1G63230 30.496 282 192 1 176 457 1 278 3.34e-46 163
MsG0380014599.01.T01 AT1G63230 27.675 271 188 3 16 282 47 313 4.98e-37 138
MsG0380014599.01.T01 AT1G63230 27.016 248 181 0 1 248 67 314 8.85e-29 116
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MsG0380014599.01.T01 AT1G13630 30.469 384 265 2 79 460 228 611 9.54e-52 187
MsG0380014599.01.T01 AT1G13630 28.485 330 228 2 129 457 180 502 1.99e-41 157
MsG0380014599.01.T01 AT1G13630 26.667 195 135 3 267 460 178 365 7.56e-15 77.8
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MsG0380014599.01.T01 AT3G60050 27.119 177 129 0 1 177 280 456 1.32e-14 76.3
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MsG0380014599.01.T01 AT5G25630 23.058 412 286 5 1 382 106 516 1.80e-32 130
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MsG0380014599.01.T01 AT5G62370 21.964 387 249 6 85 452 48 400 4.07e-16 81.6
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MsG0380014599.01.T01 AT3G59040 21.767 317 242 2 1 314 200 513 6.13e-20 93.2
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MsG0380014599.01.T01 AT1G05600 22.340 376 249 5 40 406 145 486 4.80e-19 90.1
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MsG0380014599.01.T01 AT1G05600 21.700 447 324 6 20 440 39 485 7.66e-28 116
MsG0380014599.01.T01 AT1G05600 20.769 390 297 7 83 461 84 472 1.76e-20 94.4
MsG0380014599.01.T01 AT1G05600 22.340 376 249 5 40 406 145 486 4.80e-19 90.1
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MsG0380014599.01.T01 AT1G05600 22.340 376 249 5 40 406 145 486 4.80e-19 90.1
MsG0380014599.01.T01 AT3G59040 24.665 373 271 5 15 382 151 518 3.93e-33 132
MsG0380014599.01.T01 AT3G59040 22.857 420 304 6 43 452 109 518 5.13e-32 129
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MsG0380014599.01.T01 AT5G52850 20.578 277 197 4 168 437 72 332 1.13e-11 67.8
MsG0380014599.01.T01 AT5G52850 21.531 209 156 2 190 398 28 228 7.34e-11 65.1
MsG0380014599.01.T01 AT1G77405 33.333 237 140 5 179 398 157 392 3.37e-30 122
MsG0380014599.01.T01 AT1G77405 27.843 255 163 5 228 461 132 386 7.05e-21 95.5
MsG0380014599.01.T01 AT1G77405 25.833 240 161 4 7 229 159 398 9.57e-18 85.9
MsG0380014599.01.T01 AT1G16830 25.278 360 265 2 102 460 199 555 3.45e-30 124
MsG0380014599.01.T01 AT1G16830 26.254 339 236 5 119 452 147 476 4.57e-27 114
MsG0380014599.01.T01 AT1G16830 21.829 339 262 1 70 408 202 537 7.37e-26 111
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MsG0380014599.01.T01 AT4G13650 20.561 428 297 6 9 404 454 870 8.15e-20 93.2
MsG0380014599.01.T01 AT4G13650 20.645 465 308 12 35 458 74 518 2.02e-16 82.8
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MsG0380014599.01.T01 AT3G24000 22.871 411 276 13 26 421 40 424 1.53e-14 76.6
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MsG0380014599.01.T01 AT1G10910 23.114 411 289 8 11 410 130 524 6.55e-22 99.4
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MsG0380014599.01.T01 AT3G09040 20.163 367 238 10 9 369 619 936 4.25e-12 68.9
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MsG0380014599.01.T01 AT4G18750 20.432 509 327 9 13 454 163 660 4.39e-16 81.6
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MsG0380014599.01.T01 AT1G25360 23.789 227 164 4 9 234 381 599 4.47e-13 72.0
MsG0380014599.01.T01 AT1G25360 22.006 309 225 5 154 458 18 314 8.26e-13 71.2
MsG0380014599.01.T01 AT4G21065 23.834 386 277 9 9 390 84 456 6.02e-22 99.4
MsG0380014599.01.T01 AT4G21065 22.280 386 281 10 78 458 83 454 2.89e-20 94.0
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MsG0380014599.01.T01 AT1G56570 22.595 447 257 11 9 451 75 436 4.56e-19 90.5
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MsG0380014599.01.T01 AT2G27800 24.766 214 143 4 258 456 210 420 2.94e-13 72.0
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MsG0380014599.01.T01 AT3G16610 23.977 342 243 6 43 382 308 634 4.22e-16 81.3
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MsG0380014599.01.T01 AT3G06430 30.270 185 127 2 272 454 141 325 7.80e-17 83.2
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MsG0380014599.01.T01 AT3G06430 29.851 134 90 3 318 447 79 212 8.23e-11 64.3
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MsG0380014599.01.T01 AT3G13770 21.429 462 291 12 9 452 117 524 9.93e-18 86.3
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Find 74 sgRNAs with CRISPR-Local

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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GAGTTATAAGCAACAATGTT+AGG 0.299933 3:+56990277 None:intergenic
ATTTGCACAAACCATCAATA+AGG 0.301850 3:+56990044 None:intergenic
AGTTGAACCAAGTTAGTTAC+AGG 0.305503 3:-56990699 MsG0380014599.01.T01:CDS
TTTGTTACATAAAATGATAT+TGG 0.311345 3:-56990416 MsG0380014599.01.T01:CDS
TTTGAGAATGTTGGAAAATA+CGG 0.314031 3:+56990837 None:intergenic
TGTGTATACCTTTAGTATAT+TGG 0.316079 3:-56990377 MsG0380014599.01.T01:CDS
GAGACGAATTGATGGGAAAT+TGG 0.338867 3:-56990620 MsG0380014599.01.T01:CDS
AATATTCTTATCAATGGATT+AGG 0.340377 3:-56989839 MsG0380014599.01.T01:CDS
AATTCGTCTCAGCAATTCTA+AGG 0.366874 3:+56990633 None:intergenic
ATTTGTGGTTTATGCAATAT+GGG 0.368324 3:-56990460 MsG0380014599.01.T01:CDS
GAAGTGTAAGTAATTATATT+AGG 0.377440 3:+56989962 None:intergenic
ATTTCAAAAGTTGTAGCATC+TGG 0.382425 3:+56989647 None:intergenic
AGTTACAGTATCATGATTAG+TGG 0.398946 3:-56990160 MsG0380014599.01.T01:CDS
ACTTATAATACTTTAATTTG+TGG 0.402138 3:-56990475 MsG0380014599.01.T01:CDS
AGCATTGCACTTTCATGATA+AGG 0.402201 3:-56990740 MsG0380014599.01.T01:CDS
TATTGATGGTTTGTGCAAAT+CGG 0.404135 3:-56990041 MsG0380014599.01.T01:CDS
GAATTGTACGTCACCACATC+AGG 0.415648 3:+56990067 None:intergenic
CATAGTGTTGAATATACTTT+CGG 0.415898 3:+56990213 None:intergenic
TGTAAGAAGGACTTGTTTGA+TGG 0.429390 3:-56989713 MsG0380014599.01.T01:CDS
GGTCAATTAAAAGATGCAAT+TGG 0.434249 3:-56990439 MsG0380014599.01.T01:CDS
ATTGATGGTTTGTGCAAATC+GGG 0.451401 3:-56990040 MsG0380014599.01.T01:CDS
GAATTGCTGAGACGAATTGA+TGG 0.451671 3:-56990628 MsG0380014599.01.T01:CDS
CATGATAAGGTGGTAGCGCT+TGG 0.454251 3:-56990727 MsG0380014599.01.T01:CDS
CGAAAGTATATTCAACACTA+TGG 0.454349 3:-56990212 MsG0380014599.01.T01:CDS
TTTAATGGATGGATATTGTC+TGG 0.455193 3:-56990254 MsG0380014599.01.T01:CDS
ACGTACAATTCCCTTATTGA+TGG 0.455548 3:-56990055 MsG0380014599.01.T01:CDS
TACATATAATACTATGATCA+AGG 0.456639 3:-56989741 MsG0380014599.01.T01:CDS
GTTACAGGACCTTGATCAAC+GGG 0.459465 3:-56990684 MsG0380014599.01.T01:CDS
GGACTTGTTTGATGGGGCAT+TGG 0.468911 3:-56989705 MsG0380014599.01.T01:CDS
TTTGCACAAACCATCAATAA+GGG 0.470734 3:+56990045 None:intergenic
ACATACAATATTCTTATCAA+TGG 0.472866 3:-56989845 MsG0380014599.01.T01:CDS
AACTTTGACTACACTCATCA+AGG 0.478671 3:-56990791 MsG0380014599.01.T01:CDS
GCTTATAACTCTTTAATGGA+TGG 0.480776 3:-56990265 MsG0380014599.01.T01:CDS
TTCAACACTATGGCTCAAAT+CGG 0.482003 3:-56990202 MsG0380014599.01.T01:CDS
TACTAAAGGTATACACAGTT+GGG 0.483410 3:+56990383 None:intergenic
GATGAGTGTAGTCAAAGTTA+TGG 0.491040 3:+56990795 None:intergenic
TTTACATAACCCGTTGATCA+AGG 0.495600 3:+56990675 None:intergenic
GTTTGATGGGGCATTGGCCA+TGG 0.497461 3:-56989699 MsG0380014599.01.T01:CDS
ATCAATGGATTAGGCAAAAG+TGG 0.497552 3:-56989830 MsG0380014599.01.T01:CDS
TCAAGGTCCTGTAACTAACT+TGG 0.501872 3:+56990692 None:intergenic
CTTCGTGAAATGATTGTAAG+AGG 0.504224 3:-56989575 MsG0380014599.01.T01:CDS
TGATAAAGGTGAATATGATA+AGG 0.506689 3:-56989606 MsG0380014599.01.T01:CDS
ATACTAAAGGTATACACAGT+TGG 0.509890 3:+56990382 None:intergenic
GTAGTCAAAGTTATGGCATC+CGG 0.512644 3:+56990802 None:intergenic
CACCTTTATCAAACAAAGAA+CGG 0.514595 3:+56989618 None:intergenic
ATCAAGGGTCTTTGTCTCAA+AGG 0.514973 3:-56990775 MsG0380014599.01.T01:CDS
TGCATCAACCAATATACTAA+AGG 0.515251 3:+56990369 None:intergenic
ATCAACGGGTTATGTAAAGT+TGG 0.530634 3:-56990670 MsG0380014599.01.T01:CDS
ATGTACAACACGATTATTGA+TGG 0.535941 3:-56990580 MsG0380014599.01.T01:CDS
AATTGCTGAGACGAATTGAT+GGG 0.540302 3:-56990627 MsG0380014599.01.T01:CDS
AGGCAAAAGTGGAAGACTAA+AGG 0.540692 3:-56989819 MsG0380014599.01.T01:CDS
GTAAGAAGGACTTGTTTGAT+GGG 0.547470 3:-56989712 MsG0380014599.01.T01:CDS
ATCGGTGAGATGCATGATAG+AGG 0.561117 3:-56989992 MsG0380014599.01.T01:CDS
CATCGACAAATGGAATTCAA+CGG 0.581508 3:-56990937 None:intergenic
ACTTTGACTACACTCATCAA+GGG 0.590369 3:-56990790 MsG0380014599.01.T01:CDS
GTATTATAAGTGACAACAGT+AGG 0.597321 3:+56990487 None:intergenic
AGCATCTGGAATGCAACCAC+TGG 0.597602 3:+56989661 None:intergenic
GTGTAAGTAATTATATTAGG+TGG 0.600456 3:+56989965 None:intergenic
AGTTACAGGACCTTGATCAA+CGG 0.605801 3:-56990685 MsG0380014599.01.T01:CDS
TGGATATTGTCTGGTAAATG+AGG 0.607504 3:-56990245 MsG0380014599.01.T01:CDS
TAAGAAGGACTTGTTTGATG+GGG 0.608358 3:-56989711 MsG0380014599.01.T01:CDS
ACATATAATACTATGATCAA+GGG 0.610407 3:-56989740 MsG0380014599.01.T01:CDS
ATATTGTATGTGCACACACT+TGG 0.615846 3:+56989857 None:intergenic
TCTGGTAAATGAGGTGAACA+AGG 0.619727 3:-56990236 MsG0380014599.01.T01:CDS
ATTGCACTTTCATGATAAGG+TGG 0.624070 3:-56990737 MsG0380014599.01.T01:CDS
GAAATTGGTTCAACTTGATG+TGG 0.644132 3:-56990605 MsG0380014599.01.T01:CDS
CACTATGGCTCAAATCGGAG+TGG 0.647792 3:-56990197 MsG0380014599.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TTTGTTACATAAAATGATAT+TGG - Chr3:56990077-56990096 MsG0380014599.01.T01:CDS 15.0%
!!! ACTTATAATACTTTAATTTG+TGG - Chr3:56990018-56990037 MsG0380014599.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTTTGATTTATATTCTGAAA+TGG - Chr3:56989966-56989985 MsG0380014599.01.T01:CDS 15.0%
!! AATTACTTACACTTCTTTAT+TGG - Chr3:56990539-56990558 MsG0380014599.01.T01:CDS 20.0%
!! ACATACAATATTCTTATCAA+TGG - Chr3:56990648-56990667 MsG0380014599.01.T01:CDS 20.0%
!! ACATATAATACTATGATCAA+GGG - Chr3:56990753-56990772 MsG0380014599.01.T01:CDS 20.0%
!! GAAGTGTAAGTAATTATATT+AGG + Chr3:56990534-56990553 None:intergenic 20.0%
!! TACATATAATACTATGATCA+AGG - Chr3:56990752-56990771 MsG0380014599.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAAAGTTTTTGAAGATGTTT+TGG - Chr3:56990704-56990723 MsG0380014599.01.T01:CDS 20.0%
!!! AATATTCTTATCAATGGATT+AGG - Chr3:56990654-56990673 MsG0380014599.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATCAATTGTTTTTCTCAATT+GGG - Chr3:56989613-56989632 MsG0380014599.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTTTGTAAGATTAAAATGG+TGG - Chr3:56990356-56990375 MsG0380014599.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGGATTTTGTAAGATTAAAA+TGG - Chr3:56990353-56990372 MsG0380014599.01.T01:CDS 20.0%
! AATTTGTGGTTTATGCAATA+TGG - Chr3:56990032-56990051 MsG0380014599.01.T01:CDS 25.0%
! ATTTGTGGTTTATGCAATAT+GGG - Chr3:56990033-56990052 MsG0380014599.01.T01:CDS 25.0%
! GTGTAAGTAATTATATTAGG+TGG + Chr3:56990531-56990550 None:intergenic 25.0%
! TGATAAAGGTGAATATGATA+AGG - Chr3:56990887-56990906 MsG0380014599.01.T01:CDS 25.0%
! TGTGTATACCTTTAGTATAT+TGG - Chr3:56990116-56990135 MsG0380014599.01.T01:CDS 25.0%
! TTTGAGAATGTTGGAAAATA+CGG + Chr3:56989659-56989678 None:intergenic 25.0%
!! ATTTTCCAACATTCTCAAAA+AGG - Chr3:56989660-56989679 MsG0380014599.01.T01:CDS 25.0%
!! CATAGTGTTGAATATACTTT+CGG + Chr3:56990283-56990302 None:intergenic 25.0%
!! TGTTGCTTATAACTCTTTAA+TGG - Chr3:56990224-56990243 MsG0380014599.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTTCCAACATTCTCAAAAA+GGG - Chr3:56989661-56989680 MsG0380014599.01.T01:CDS 25.0%
!!! GATCAATTGTTTTTCTCAAT+TGG - Chr3:56989612-56989631 MsG0380014599.01.T01:CDS 25.0%
!!! TCATATGCTTTGAAACTTAT+CGG - Chr3:56990483-56990502 MsG0380014599.01.T01:CDS 25.0%
AGTTACAGTATCATGATTAG+TGG - Chr3:56990333-56990352 MsG0380014599.01.T01:CDS 30.0%
ATGTACAACACGATTATTGA+TGG - Chr3:56989913-56989932 MsG0380014599.01.T01:CDS 30.0%
ATTTCAAAAGTTGTAGCATC+TGG + Chr3:56990849-56990868 None:intergenic 30.0%
ATTTGCACAAACCATCAATA+AGG + Chr3:56990452-56990471 None:intergenic 30.0%
CAAAAACTATCATGTTGACA+AGG - Chr3:56990572-56990591 MsG0380014599.01.T01:CDS 30.0%
CACCTTTATCAAACAAAGAA+CGG + Chr3:56990878-56990897 None:intergenic 30.0%
CATTTCTTCAAAGAGTTTCA+TGG + Chr3:56990388-56990407 None:intergenic 30.0%
GAGTTATAAGCAACAATGTT+AGG + Chr3:56990219-56990238 None:intergenic 30.0%
GCTTATAACTCTTTAATGGA+TGG - Chr3:56990228-56990247 MsG0380014599.01.T01:CDS 30.0%
GGTCAATTAAAAGATGCAAT+TGG - Chr3:56990054-56990073 MsG0380014599.01.T01:CDS 30.0%
GTATTATAAGTGACAACAGT+AGG + Chr3:56990009-56990028 None:intergenic 30.0%
TGCATCAACCAATATACTAA+AGG + Chr3:56990127-56990146 None:intergenic 30.0%
TTTGCACAAACCATCAATAA+GGG + Chr3:56990451-56990470 None:intergenic 30.0%
! ATACTAAAGGTATACACAGT+TGG + Chr3:56990114-56990133 None:intergenic 30.0%
! ATCCGTTCTTTGTTTGATAA+AGG - Chr3:56990873-56990892 MsG0380014599.01.T01:CDS 30.0%
! CGAAAGTATATTCAACACTA+TGG - Chr3:56990281-56990300 MsG0380014599.01.T01:CDS 30.0%
! TACTAAAGGTATACACAGTT+GGG + Chr3:56990113-56990132 None:intergenic 30.0%
! TATTGATGGTTTGTGCAAAT+CGG - Chr3:56990452-56990471 MsG0380014599.01.T01:CDS 30.0%
! TTTAATGGATGGATATTGTC+TGG - Chr3:56990239-56990258 MsG0380014599.01.T01:CDS 30.0%
!! ATAACCCTTTTTGAGAATGT+TGG + Chr3:56989668-56989687 None:intergenic 30.0%
!! ATTGGTTGATGCATTTTGTA+AGG - Chr3:56990134-56990153 MsG0380014599.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTGAAGATGTTTTGGTCAA+AGG - Chr3:56990711-56990730 MsG0380014599.01.T01:CDS 30.0%
AACTTTGACTACACTCATCA+AGG - Chr3:56989702-56989721 MsG0380014599.01.T01:CDS 35.0%
AATTCGTCTCAGCAATTCTA+AGG + Chr3:56989863-56989882 None:intergenic 35.0%
AATTGCTGAGACGAATTGAT+GGG - Chr3:56989866-56989885 MsG0380014599.01.T01:CDS 35.0%
ACGTACAATTCCCTTATTGA+TGG - Chr3:56990438-56990457 MsG0380014599.01.T01:CDS 35.0%
ACTTTGACTACACTCATCAA+GGG - Chr3:56989703-56989722 MsG0380014599.01.T01:CDS 35.0%
AGCATTGCACTTTCATGATA+AGG - Chr3:56989753-56989772 MsG0380014599.01.T01:CDS 35.0%
AGTTGAACCAAGTTAGTTAC+AGG - Chr3:56989794-56989813 MsG0380014599.01.T01:CDS 35.0%
ATATTGTATGTGCACACACT+TGG + Chr3:56990639-56990658 None:intergenic 35.0%
ATTGCACTTTCATGATAAGG+TGG - Chr3:56989756-56989775 MsG0380014599.01.T01:CDS 35.0%
CTTCGTGAAATGATTGTAAG+AGG - Chr3:56990918-56990937 MsG0380014599.01.T01:CDS 35.0%
GATGAGTGTAGTCAAAGTTA+TGG + Chr3:56989701-56989720 None:intergenic 35.0%
GTTTCAAAAATGAAAGCCAG+TGG - Chr3:56990816-56990835 MsG0380014599.01.T01:CDS 35.0%
TGGATATTGTCTGGTAAATG+AGG - Chr3:56990248-56990267 MsG0380014599.01.T01:CDS 35.0%
TTCAACACTATGGCTCAAAT+CGG - Chr3:56990291-56990310 MsG0380014599.01.T01:CDS 35.0%
TTTACATAACCCGTTGATCA+AGG + Chr3:56989821-56989840 None:intergenic 35.0%
! ATTGATGGTTTGTGCAAATC+GGG - Chr3:56990453-56990472 MsG0380014599.01.T01:CDS 35.0%
! CAAACACATTTTTCCTGATG+TGG - Chr3:56990413-56990432 MsG0380014599.01.T01:CDS 35.0%
! CATGAAAGTGCAATGCTTTA+TGG + Chr3:56989750-56989769 None:intergenic 35.0%
! GAAATTGGTTCAACTTGATG+TGG - Chr3:56989888-56989907 MsG0380014599.01.T01:CDS 35.0%
! GATCAAGGGATTTTGTAAGA+AGG - Chr3:56990767-56990786 MsG0380014599.01.T01:CDS 35.0%
! GTAAGAAGGACTTGTTTGAT+GGG - Chr3:56990781-56990800 MsG0380014599.01.T01:CDS 35.0%
! GTTGATGCATTTTGTAAGGA+AGG - Chr3:56990138-56990157 MsG0380014599.01.T01:CDS 35.0%
! TAAGAAGGACTTGTTTGATG+GGG - Chr3:56990782-56990801 MsG0380014599.01.T01:CDS 35.0%
! TGTAAGAAGGACTTGTTTGA+TGG - Chr3:56990780-56990799 MsG0380014599.01.T01:CDS 35.0%
!! ATCAACGGGTTATGTAAAGT+TGG - Chr3:56989823-56989842 MsG0380014599.01.T01:CDS 35.0%
!! ATCAATGGATTAGGCAAAAG+TGG - Chr3:56990663-56990682 MsG0380014599.01.T01:CDS 35.0%
!!! GGCTTTCATTTTTGAAACCA+TGG + Chr3:56990814-56990833 None:intergenic 35.0%
AGGCAAAAGTGGAAGACTAA+AGG - Chr3:56990674-56990693 MsG0380014599.01.T01:CDS 40.0%
AGTTACAGGACCTTGATCAA+CGG - Chr3:56989808-56989827 MsG0380014599.01.T01:CDS 40.0%
ATCAAGGGTCTTTGTCTCAA+AGG - Chr3:56989718-56989737 MsG0380014599.01.T01:CDS 40.0%
GAATTGCTGAGACGAATTGA+TGG - Chr3:56989865-56989884 MsG0380014599.01.T01:CDS 40.0%
GAGACGAATTGATGGGAAAT+TGG - Chr3:56989873-56989892 MsG0380014599.01.T01:CDS 40.0%
GTAGTCAAAGTTATGGCATC+CGG + Chr3:56989694-56989713 None:intergenic 40.0%
TCAAGGTCCTGTAACTAACT+TGG + Chr3:56989804-56989823 None:intergenic 40.0%
TCTCAAAAAGGGTTATGAGC+CGG - Chr3:56989672-56989691 MsG0380014599.01.T01:CDS 40.0%
TCTGGTAAATGAGGTGAACA+AGG - Chr3:56990257-56990276 MsG0380014599.01.T01:CDS 40.0%
ATCGGTGAGATGCATGATAG+AGG - Chr3:56990501-56990520 MsG0380014599.01.T01:CDS 45.0%
GAATTGTACGTCACCACATC+AGG + Chr3:56990429-56990448 None:intergenic 45.0%
GTTACAGGACCTTGATCAAC+GGG - Chr3:56989809-56989828 MsG0380014599.01.T01:CDS 45.0%
CACTATGGCTCAAATCGGAG+TGG - Chr3:56990296-56990315 MsG0380014599.01.T01:CDS 50.0%
! AGCATCTGGAATGCAACCAC+TGG + Chr3:56990835-56990854 None:intergenic 50.0%
! CATGATAAGGTGGTAGCGCT+TGG - Chr3:56989766-56989785 MsG0380014599.01.T01:CDS 50.0%
! GGACTTGTTTGATGGGGCAT+TGG - Chr3:56990788-56990807 MsG0380014599.01.T01:CDS 50.0%
!! GTTTGATGGGGCATTGGCCA+TGG - Chr3:56990794-56990813 MsG0380014599.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 56989565 56990950 56989565 ID=MsG0380014599.01;Name=MsG0380014599.01
Chr3 mRNA 56989565 56990950 56989565 ID=MsG0380014599.01.T01;Parent=MsG0380014599.01;Name=MsG0380014599.01.T01;_AED=0.13;_eAED=0.13;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|461
Chr3 exon 56989565 56990950 56989565 ID=MsG0380014599.01.T01:exon:10628;Parent=MsG0380014599.01.T01
Chr3 CDS 56989565 56990950 56989565 ID=MsG0380014599.01.T01:cds;Parent=MsG0380014599.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380014599.01.T01

ATGGAATTCAACGGAATCGCGTCAAACATAGTCACTTTGAGCATCTTGATCAATTGTTTTTCTCAATTGGGTCATAACTCTCTTTCATTTTCCGTATTTTCCAACATTCTCAAAAAGGGTTATGAGCCGGATGCCATAACTTTGACTACACTCATCAAGGGTCTTTGTCTCAAAGGTAACATCCATAAAGCATTGCACTTTCATGATAAGGTGGTAGCGCTTGGATTTCAGTTGAACCAAGTTAGTTACAGGACCTTGATCAACGGGTTATGTAAAGTTGGACAAACAAAAGCTGCCTTAGAATTGCTGAGACGAATTGATGGGAAATTGGTTCAACTTGATGTGGTGATGTACAACACGATTATTGATGGTGTGTGCAAAGATAAACTTGTTAATGATGCTTTTGATTTATATTCTGAAATGGTTGCTAAGAGAATTTGTCCTACTGTTGTCACTTATAATACTTTAATTTGTGGTTTATGCAATATGGGTCAATTAAAAGATGCAATTGGTTTGTTACATAAAATGATATTGGAAAATATCAACCCAACTGTGTATACCTTTAGTATATTGGTTGATGCATTTTGTAAGGAAGGAAAAGTGAAAGAAGCTATAAATGTGTTTGTTGTGATGATGAAAAAAGATGTAAAACCTAACATTGTTGCTTATAACTCTTTAATGGATGGATATTGTCTGGTAAATGAGGTGAACAAGGCCGAAAGTATATTCAACACTATGGCTCAAATCGGAGTGGCTCTTGACGTTCATAGTTACAGTATCATGATTAGTGGATTTTGTAAGATTAAAATGGTGGATGAAGCCATGAAACTCTTTGAAGAAATGCATTGCAAACACATTTTTCCTGATGTGGTGACGTACAATTCCCTTATTGATGGTTTGTGCAAATCGGGAAGAATCTCATATGCTTTGAAACTTATCGGTGAGATGCATGATAGAGGTCAACCACCTAATATAATTACTTACACTTCTTTATTGGATGCTTTATGCAAAAACTATCATGTTGACAAGGCAATTGAATTGTTAACAAAACTTGAAGATCACAATATACAACCAAGTGTGTGCACATACAATATTCTTATCAATGGATTAGGCAAAAGTGGAAGACTAAAGGATGCGCAAAAAGTTTTTGAAGATGTTTTGGTCAAAGGCTACAATATTGATGTGTATACATATAATACTATGATCAAGGGATTTTGTAAGAAGGACTTGTTTGATGGGGCATTGGCCATGGTTTCAAAAATGAAAGCCAGTGGTTGCATTCCAGATGCTACAACTTTTGAAATAATTATCCGTTCTTTGTTTGATAAAGGTGAATATGATAAGGCAAAGAAACTTCGTGAAATGATTGTAAGAGGTCTACTATAA
Protein sequence

>MsG0380014599.01.T01

MEFNGIASNIVTLSILINCFSQLGHNSLSFSVFSNILKKGYEPDAITLTTLIKGLCLKGNIHKALHFHDKVVALGFQLNQVSYRTLINGLCKVGQTKAALELLRRIDGKLVQLDVVMYNTIIDGVCKDKLVNDAFDLYSEMVAKRICPTVVTYNTLICGLCNMGQLKDAIGLLHKMILENINPTVYTFSILVDAFCKEGKVKEAINVFVVMMKKDVKPNIVAYNSLMDGYCLVNEVNKAESIFNTMAQIGVALDVHSYSIMISGFCKIKMVDEAMKLFEEMHCKHIFPDVVTYNSLIDGLCKSGRISYALKLIGEMHDRGQPPNIITYTSLLDALCKNYHVDKAIELLTKLEDHNIQPSVCTYNILINGLGKSGRLKDAQKVFEDVLVKGYNIDVYTYNTMIKGFCKKDLFDGALAMVSKMKASGCIPDATTFEIIIRSLFDKGEYDKAKKLREMIVRGLL*