AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680034468.01

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MsG0680034468.01.T01 AT4G31850 25.725 517 346 3 30 510 69 583 9.05e-55 202
MsG0680034468.01.T01 AT4G31850 27.022 507 362 6 6 507 571 1074 1.58e-53 198
MsG0680034468.01.T01 AT4G31850 26.539 471 305 5 6 436 641 1110 1.14e-47 181
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MsG0680034468.01.T01 AT4G31850 25.792 221 163 1 5 224 888 1108 3.48e-21 99.4
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MsG0680034468.01.T01 AT1G19290 23.899 636 339 6 5 495 222 857 6.34e-59 213
MsG0680034468.01.T01 AT1G19290 27.556 450 287 4 60 507 206 618 1.01e-52 195
MsG0680034468.01.T01 AT1G13040 26.220 492 352 5 15 500 16 502 1.43e-58 205
MsG0680034468.01.T01 AT1G13040 27.039 466 337 3 9 472 45 509 3.36e-50 182
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MsG0680034468.01.T01 AT2G32630 25.954 393 291 0 108 500 219 611 9.97e-48 177
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MsG0680034468.01.T01 AT5G24830 27.354 446 285 1 14 420 127 572 4.48e-50 183
MsG0680034468.01.T01 AT5G24830 26.859 417 301 1 82 494 125 541 8.38e-47 174
MsG0680034468.01.T01 AT5G24830 29.096 354 247 3 4 353 187 540 3.70e-43 164
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MsG0680034468.01.T01 AT2G37230 23.984 246 184 2 266 510 127 370 2.43e-17 86.7
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MsG0680034468.01.T01 AT1G74850 21.010 495 385 4 10 501 107 598 3.61e-36 145
MsG0680034468.01.T01 AT1G74850 21.241 532 368 7 8 495 176 700 1.95e-33 137
MsG0680034468.01.T01 AT1G74850 21.963 428 323 5 6 423 315 741 2.97e-22 102
MsG0680034468.01.T01 AT1G73710 24.738 477 353 6 22 495 283 756 3.73e-38 152
MsG0680034468.01.T01 AT1G73710 24.319 514 365 7 6 497 143 654 4.52e-34 139
MsG0680034468.01.T01 AT1G73710 22.961 466 322 6 22 451 354 818 6.73e-30 126
MsG0680034468.01.T01 AT1G73710 21.026 390 290 5 40 421 582 961 1.03e-16 84.7
MsG0680034468.01.T01 AT1G73710 19.431 422 332 4 1 419 508 924 2.17e-14 77.4
MsG0680034468.01.T01 AT1G16830 23.800 479 353 4 38 513 105 574 8.72e-38 149
MsG0680034468.01.T01 AT1G16830 24.650 357 252 3 6 355 210 556 3.43e-27 117
MsG0680034468.01.T01 AT1G16830 24.823 282 178 2 5 252 279 560 1.37e-21 99.8
MsG0680034468.01.T01 AT4G01570 23.419 427 301 5 70 472 84 508 9.74e-38 150
MsG0680034468.01.T01 AT4G01570 22.761 536 345 7 30 497 235 769 2.04e-34 140
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MsG0680034468.01.T01 AT4G01400 27.727 220 158 1 30 249 213 431 8.29e-23 102
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MsG0680034468.01.T01 AT5G06400 23.885 314 201 3 27 338 732 1009 2.67e-15 80.5
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MsG0680034468.01.T01 AT3G14580 24.545 220 164 1 281 498 88 307 5.16e-17 84.0
MsG0680034468.01.T01 AT3G14580 25.000 156 117 0 39 194 198 353 1.53e-13 73.6
MsG0680034468.01.T01 AT3G14580 21.622 185 143 1 14 198 208 390 2.93e-12 69.3
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MsG0680034468.01.T01 AT1G61870 25.287 261 193 2 179 438 147 406 8.61e-23 101
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MsG0680034468.01.T01 AT5G37570 23.556 450 257 13 40 454 71 468 7.49e-24 106
MsG0680034468.01.T01 AT5G37570 21.296 432 301 13 4 424 70 473 8.32e-21 97.1
MsG0680034468.01.T01 AT5G37570 21.088 294 180 5 180 472 71 313 2.63e-14 76.6
MsG0680034468.01.T01 AT3G06430 22.656 384 284 6 80 455 90 468 7.98e-24 105
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MsG0680034468.01.T01 AT1G80880 25.234 321 223 7 198 515 170 476 1.16e-23 105
MsG0680034468.01.T01 AT1G80880 23.592 284 211 3 71 353 217 495 7.92e-23 103
MsG0680034468.01.T01 AT1G80880 25.234 321 223 7 198 515 170 476 1.16e-23 105
MsG0680034468.01.T01 AT1G80880 23.592 284 211 3 71 353 217 495 7.92e-23 103
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MsG0680034468.01.T01 AT5G27270 21.165 515 308 8 6 423 361 874 3.13e-21 99.0
MsG0680034468.01.T01 AT5G27270 19.841 504 370 6 14 487 264 763 1.15e-17 87.8
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MsG0680034468.01.T01 AT5G46580 22.424 330 249 4 144 470 217 542 2.45e-22 102
MsG0680034468.01.T01 AT5G46580 22.909 275 209 2 39 311 217 490 2.79e-20 95.9
MsG0680034468.01.T01 AT5G46580 22.302 278 215 1 11 287 224 501 1.70e-18 90.1
MsG0680034468.01.T01 AT5G46580 26.064 188 138 1 311 497 173 360 1.63e-13 74.3
MsG0680034468.01.T01 AT5G46580 21.930 228 177 1 266 492 163 390 1.28e-11 68.2
MsG0680034468.01.T01 AT3G49240 20.647 402 267 8 139 492 156 553 4.37e-23 104
MsG0680034468.01.T01 AT3G49240 23.292 322 237 4 39 351 197 517 1.65e-22 102
MsG0680034468.01.T01 AT3G49240 21.448 359 270 5 145 492 127 484 1.67e-19 93.2
MsG0680034468.01.T01 AT4G39530 20.000 560 368 11 4 498 210 754 7.62e-23 104
MsG0680034468.01.T01 AT4G39530 20.426 470 353 7 37 501 140 593 5.72e-17 85.5
MsG0680034468.01.T01 AT3G53360 24.802 379 258 11 49 420 311 669 8.50e-23 103
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MsG0680034468.01.T01 AT3G53360 18.565 474 362 10 4 472 129 583 1.26e-12 71.6
MsG0680034468.01.T01 AT3G53360 24.802 379 258 11 49 420 311 669 8.50e-23 103
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MsG0680034468.01.T01 AT1G74600 21.771 542 335 10 42 513 83 605 3.80e-21 99.0
MsG0680034468.01.T01 AT1G74600 18.587 538 387 11 4 509 312 830 3.38e-14 76.6
MsG0680034468.01.T01 AT2G01390 20.777 515 359 9 4 488 51 546 3.82e-21 98.2
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MsG0680034468.01.T01 AT4G38150 22.289 166 126 1 166 331 117 279 8.20e-11 63.9
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MsG0680034468.01.T01 AT3G08820 20.402 348 256 8 4 346 173 504 1.43e-11 68.2
MsG0680034468.01.T01 AT3G50420 20.388 515 336 9 4 453 159 664 7.22e-20 94.7
MsG0680034468.01.T01 AT3G21470 22.249 409 297 6 81 489 14 401 7.96e-20 93.6
MsG0680034468.01.T01 AT3G21470 19.870 463 342 11 42 500 80 517 4.51e-13 72.4
MsG0680034468.01.T01 AT3G21470 20.486 288 216 5 4 290 204 479 5.19e-13 72.4
MsG0680034468.01.T01 AT3G60040 37.607 117 73 0 377 493 489 605 8.38e-20 94.0
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MsG0680034468.01.T01 AT5G08490 22.247 454 316 13 8 450 263 690 7.17e-19 91.3
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MsG0680034468.01.T01 AT3G49170 20.782 486 336 16 40 507 128 582 5.08e-15 79.3
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MsG0680034468.01.T01 AT3G03580 20.534 487 330 10 27 472 13 483 2.60e-15 80.1
MsG0680034468.01.T01 AT3G03580 21.759 432 258 10 36 400 300 718 1.29e-13 74.7
MsG0680034468.01.T01 AT3G03580 18.692 428 312 9 74 490 303 705 2.66e-11 67.4
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MsG0680034468.01.T01 AT5G40405 20.859 489 319 10 25 503 53 483 1.74e-18 89.7
MsG0680034468.01.T01 AT4G19191 20.306 458 330 11 27 472 102 536 1.83e-18 90.1
MsG0680034468.01.T01 AT4G19191 21.634 453 305 11 73 489 47 485 4.55e-17 85.5
MsG0680034468.01.T01 AT2G44880 20.862 441 299 9 13 419 54 478 1.85e-18 89.7
MsG0680034468.01.T01 AT1G77010 20.850 494 341 12 4 480 120 580 1.94e-18 90.1
MsG0680034468.01.T01 AT2G44880 20.862 441 299 9 13 419 52 476 1.99e-18 89.7
MsG0680034468.01.T01 AT2G44880 20.862 441 299 9 13 419 52 476 1.99e-18 89.7
MsG0680034468.01.T01 AT2G44880 20.862 441 299 9 13 419 50 474 2.05e-18 89.7
MsG0680034468.01.T01 AT2G44880 20.862 441 299 9 13 419 51 475 2.06e-18 89.7
MsG0680034468.01.T01 AT5G19020 20.240 499 320 10 4 437 134 619 2.32e-18 89.7
MsG0680034468.01.T01 AT5G19020 20.330 364 269 7 147 510 106 448 1.24e-15 80.9
MsG0680034468.01.T01 AT5G19020 18.070 487 303 13 77 484 106 575 1.45e-11 68.2
MsG0680034468.01.T01 AT2G44880 20.862 441 299 9 13 419 11 435 2.44e-18 89.4
MsG0680034468.01.T01 AT2G22070 19.923 517 349 12 21 498 124 614 2.59e-18 89.7
MsG0680034468.01.T01 AT2G22070 22.663 353 223 8 151 469 83 419 6.46e-18 88.6
MsG0680034468.01.T01 AT2G22070 19.114 429 298 7 30 457 266 646 8.35e-15 78.6
MsG0680034468.01.T01 AT4G18520 23.218 435 271 9 49 477 123 500 2.97e-18 89.4
MsG0680034468.01.T01 AT4G18520 20.643 373 283 4 40 412 246 605 2.25e-17 86.3
MsG0680034468.01.T01 AT4G18520 19.436 319 241 4 17 331 289 595 5.53e-13 72.4
MsG0680034468.01.T01 AT1G34160 22.529 435 295 13 13 422 21 438 3.34e-18 89.0
MsG0680034468.01.T01 AT3G14730 21.300 446 297 9 47 489 100 494 3.37e-18 89.0
MsG0680034468.01.T01 AT5G08510 23.607 305 221 4 186 489 50 343 4.87e-18 88.2
MsG0680034468.01.T01 AT5G08510 22.857 315 227 6 101 413 105 405 3.70e-14 75.9
MsG0680034468.01.T01 AT5G61800 25.000 284 199 4 208 489 105 376 6.09e-18 87.8
MsG0680034468.01.T01 AT5G61800 21.034 290 216 4 170 458 139 416 5.59e-17 84.7
MsG0680034468.01.T01 AT5G61800 18.971 311 239 6 3 310 178 478 6.70e-12 68.6
MsG0680034468.01.T01 AT2G27610 18.124 469 303 6 77 479 57 510 6.16e-18 88.6
MsG0680034468.01.T01 AT2G27610 19.268 410 302 11 110 510 318 707 1.19e-13 74.7
MsG0680034468.01.T01 AT2G27610 19.519 374 278 8 15 381 298 655 9.04e-13 72.0
MsG0680034468.01.T01 AT5G48910 19.798 495 343 14 4 485 86 539 6.18e-18 88.2
MsG0680034468.01.T01 AT4G20770 20.263 533 366 12 4 493 99 615 6.84e-18 88.2
MsG0680034468.01.T01 AT4G20770 19.010 384 290 7 40 417 312 680 2.97e-13 73.6
MsG0680034468.01.T01 AT4G20770 21.714 350 241 10 171 507 59 388 5.08e-12 69.7
MsG0680034468.01.T01 AT4G20770 20.327 428 271 14 90 472 23 425 1.82e-11 67.8
MsG0680034468.01.T01 AT3G49710 21.396 444 303 8 6 414 72 504 1.01e-17 87.8
MsG0680034468.01.T01 AT3G49710 22.149 456 309 13 49 489 49 473 5.56e-17 85.5
MsG0680034468.01.T01 AT3G49710 23.101 316 229 8 27 338 224 529 4.33e-14 76.3
MsG0680034468.01.T01 AT2G17210 22.254 346 222 7 146 457 281 613 1.20e-17 87.4
MsG0680034468.01.T01 AT2G17210 19.713 487 308 14 56 490 121 576 4.50e-15 79.3
MsG0680034468.01.T01 AT2G17210 21.543 311 222 7 42 346 313 607 7.07e-14 75.5
MsG0680034468.01.T01 AT3G11460 21.018 452 304 12 2 417 47 481 1.48e-17 87.0
MsG0680034468.01.T01 AT3G11460 20.455 484 355 11 15 490 25 486 7.70e-14 75.1
MsG0680034468.01.T01 AT5G13270 20.596 403 295 8 6 402 182 565 1.49e-17 87.4
MsG0680034468.01.T01 AT5G13270 18.615 462 353 9 15 472 55 497 4.93e-16 82.4
MsG0680034468.01.T01 AT1G34160 23.410 346 244 9 78 422 66 391 1.60e-17 86.7
MsG0680034468.01.T01 AT5G08305 21.965 346 257 5 112 454 70 405 1.69e-17 86.7
MsG0680034468.01.T01 AT5G08305 22.697 304 223 5 171 472 60 353 1.58e-16 83.6
MsG0680034468.01.T01 AT5G08305 20.264 454 312 8 6 458 71 475 2.23e-16 82.8
MsG0680034468.01.T01 AT5G08305 20.833 408 304 7 36 442 36 425 6.08e-16 81.6
MsG0680034468.01.T01 AT1G13410 23.741 278 163 6 228 472 38 299 1.75e-17 86.3
MsG0680034468.01.T01 AT1G13410 22.969 357 221 8 145 463 87 427 5.42e-15 78.2
MsG0680034468.01.T01 AT2G33760 20.344 349 266 5 146 491 70 409 1.96e-17 86.7
MsG0680034468.01.T01 AT1G09190 22.154 325 238 6 171 492 54 366 2.16e-17 85.9
MsG0680034468.01.T01 AT5G44230 24.085 328 227 8 169 489 2 314 2.22e-17 86.3
MsG0680034468.01.T01 AT3G51320 21.845 412 300 9 69 473 109 505 2.68e-17 85.9
MsG0680034468.01.T01 AT4G38010 19.087 482 333 10 16 492 7 436 3.14e-17 85.9
MsG0680034468.01.T01 AT4G38010 18.814 489 339 10 9 458 72 541 4.37e-14 75.9
MsG0680034468.01.T01 AT4G38010 20.440 318 237 6 4 317 168 473 1.17e-11 68.2
MsG0680034468.01.T01 AT2G36980 20.440 455 329 11 77 524 25 453 3.27e-17 85.9
MsG0680034468.01.T01 AT2G36980 18.648 429 321 11 4 423 156 565 1.45e-14 77.4

Find 126 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 325 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TCTGAATTACGGTCATTTAT+TGG 0.157954 6:+88052702 MsG0680034468.01.T01:CDS
ATTGATGGACTTTGCCAATT+AGG 0.181096 6:+88049281 MsG0680034468.01.T01:CDS
ACCCCACCCATATTTGAATT+TGG 0.196131 6:+88048306 MsG0680034468.01.T01:CDS
GATCTTACCAAATTCAAATA+TGG 0.209628 6:-88048313 None:intergenic
TTTGATGGATGGTTATTTCT+TGG 0.211830 6:+88049067 MsG0680034468.01.T01:CDS
AGGGAAAATATCTGATGTTT+TGG 0.232147 6:+88049301 MsG0680034468.01.T01:CDS
GTCTTCCATTTCTGACAATA+AGG 0.240398 6:-88049639 None:intergenic
ACTTACAGTACTTTAATATA+TGG 0.244085 6:+88048846 MsG0680034468.01.T01:CDS
ATCAAAGGTCTGTGTCTTAA+TGG 0.244731 6:+88048546 MsG0680034468.01.T01:CDS
ATATCAGGATCTTCTGATTA+AGG 0.251962 6:+88049538 MsG0680034468.01.T01:CDS
GTTTGAAAAGTTACAGCATT+AGG 0.265416 6:-88049674 None:intergenic
TTGATGGACTTTGCCAATTA+GGG 0.269728 6:+88049282 MsG0680034468.01.T01:CDS
TTTGCAAGATTTGGTCCTAT+TGG 0.276614 6:+88053145 MsG0680034468.01.T01:CDS
GAGTTGTATGTTACGGTATT+AGG 0.279458 6:-88049254 None:intergenic
CTGAATTACGGTCATTTATT+GGG 0.279469 6:+88052703 MsG0680034468.01.T01:CDS
ATGTATAATGTGATGGTTAA+TGG 0.289694 6:+88049581 MsG0680034468.01.T01:CDS
TGTTGTGATGCCGGCTCTTT+TGG 0.292870 6:+88051378 MsG0680034468.01.T01:CDS
TTTACTATATTTGCAAGATT+TGG 0.293765 6:+88053136 MsG0680034468.01.T01:CDS
ATTGATGGGTTATGTAAAAT+AGG 0.293892 6:+88048651 MsG0680034468.01.T01:CDS
CACCTTGACCAGGTTAGTTA+TGG 0.307472 6:+88048621 MsG0680034468.01.T01:CDS
TTGATGAAAATGGAAGTTTC+AGG 0.314193 6:+88053058 MsG0680034468.01.T01:CDS
AGGGCTATAATTTAGATGTT+AGG 0.318044 6:+88049558 MsG0680034468.01.T01:CDS
GTAGTCATTGTTATGGTATC+AGG 0.320292 6:-88048519 None:intergenic
CGGATTATGCAAGCATAAAA+TGG 0.320364 6:+88049181 MsG0680034468.01.T01:CDS
TTTGAAAAGTTACAGCATTA+GGG 0.323750 6:-88049673 None:intergenic
ATTTGGTCCTATTGGACATT+TGG 0.324481 6:+88053153 MsG0680034468.01.T01:CDS
ATGTTAAAAGTACGAACATT+TGG 0.335812 6:-88048939 None:intergenic
AATCTTTGTAAGAACCTTCA+TGG 0.336899 6:-88048688 None:intergenic
ACATACACAATACTTGTTGA+TGG 0.342765 6:+88049476 MsG0680034468.01.T01:CDS
TGTTACTTATACTTCTTTGA+TGG 0.343831 6:+88049052 MsG0680034468.01.T01:CDS
GATAAGTGTAGTCATTGTTA+TGG 0.354648 6:-88048526 None:intergenic
AAAACCTAACTTAAGAATCT+TGG 0.358085 6:-88048493 None:intergenic
AGCTACAGTGTTATGATTAA+CGG 0.360398 6:+88049161 MsG0680034468.01.T01:CDS
TTGGCCAAGATTCTTAAGTT+AGG 0.368021 6:+88048489 MsG0680034468.01.T01:CDS
GAAGTATAAGTAACAACATT+AGG 0.368065 6:-88049044 None:intergenic
GGATGCACAAAATGTATATC+AGG 0.369601 6:+88049523 MsG0680034468.01.T01:CDS
TGTTAAAAGTACGAACATTT+GGG 0.373790 6:-88048938 None:intergenic
ATGAAATAGCAGTGTGGAAA+TGG 0.375603 6:-88048359 None:intergenic
ACCTTGACCAGGTTAGTTAT+GGG 0.381805 6:+88048622 MsG0680034468.01.T01:CDS
ATTAATTGTTACTCCCATCT+TGG 0.388195 6:+88048441 MsG0680034468.01.T01:CDS
TCAGGCTTACTTCTGAATTA+CGG 0.395105 6:+88052691 MsG0680034468.01.T01:intron
ACATACAACTCACTTATTGA+TGG 0.395902 6:+88049266 MsG0680034468.01.T01:CDS
TACAAAGATTGATAAGTTGT+TGG 0.398274 6:+88048701 MsG0680034468.01.T01:CDS
CATGATGATGTTAGAGCAAA+GGG 0.401138 6:+88048594 MsG0680034468.01.T01:CDS
CCCTTCGGTTGTTGTGATGC+CGG 0.408483 6:+88051369 MsG0680034468.01.T01:CDS
AGTTATGGGACCTTGATTGA+TGG 0.409827 6:+88048636 MsG0680034468.01.T01:CDS
GTGTCTTAATGGCAAGGTTA+AGG 0.410248 6:+88048557 MsG0680034468.01.T01:CDS
TGTATTTAGGTTCAACCCTT+CGG 0.415167 6:+88051354 MsG0680034468.01.T01:intron
AACATCATCATGAAAGTAAA+GGG 0.419733 6:-88048583 None:intergenic
GTACTGTAAGTGATAACATT+AGG 0.420496 6:-88048834 None:intergenic
AATGTCCTTATTGTCAGAAA+TGG 0.429894 6:+88049634 MsG0680034468.01.T01:CDS
TGTATAATGTGATGGTTAAT+GGG 0.436936 6:+88049582 MsG0680034468.01.T01:CDS
ATCTTACCAAATTCAAATAT+GGG 0.443522 6:-88048312 None:intergenic
AGACATTGAGACAGTCCAAT+AGG 0.444672 6:-88052913 None:intergenic
AGACAGTCCAAATGTCCAAT+AGG 0.449082 6:-88053160 None:intergenic
CACACATGTATTCAACACTA+TGG 0.452282 6:+88049109 MsG0680034468.01.T01:CDS
TATCAGGATCTTCTGATTAA+GGG 0.452325 6:+88049539 MsG0680034468.01.T01:CDS
GGAGTAACAATTAATTAAGA+TGG 0.453223 6:-88048433 None:intergenic
TAACATCATCATGAAAGTAA+AGG 0.455799 6:-88048584 None:intergenic
ATTGGTCGATGGTTTATGTA+AGG 0.455919 6:+88048962 MsG0680034468.01.T01:CDS
ATTCAACACTATGGCTCAAA+GGG 0.460054 6:+88049118 MsG0680034468.01.T01:CDS
TTTACATAACCCATCAATCA+AGG 0.466405 6:-88048646 None:intergenic
CATATCATTTAACATATCAA+TGG 0.469559 6:-88048898 None:intergenic
TGGACGTGATTGCAATAAGA+TGG 0.475349 6:+88053104 MsG0680034468.01.T01:CDS
ATTGTGTATGTGAACATATC+TGG 0.477584 6:-88049464 None:intergenic
AATTCAAATATGGGTGGGGT+AGG 0.481226 6:-88048303 None:intergenic
ATGCTAAAATGCCATGGAAG+TGG 0.483845 6:-88052868 None:intergenic
TATTGAATTGTTATTACAAG+TGG 0.485219 6:+88052825 MsG0680034468.01.T01:CDS
GTTATGGGACCTTGATTGAT+GGG 0.487183 6:+88048637 MsG0680034468.01.T01:CDS
TGTTGCTTTCAAACAAAGCA+TGG 0.493371 6:-88049703 None:intergenic
ACTTATACTTCTTTGATGGA+TGG 0.493378 6:+88049056 MsG0680034468.01.T01:CDS
AAAATTGAGGTGACCAAGAT+GGG 0.495650 6:-88048454 None:intergenic
CAAAATTGAGGTGACCAAGA+TGG 0.496380 6:-88048455 None:intergenic
ACATATCTGGTTCAATTCCC+TGG 0.498343 6:-88049451 None:intergenic
AATAAGTGAGTTGTATGTTA+CGG 0.498778 6:-88049261 None:intergenic
TTAATTGAGGGAATAGGGTA+GGG 0.502784 6:-88052735 None:intergenic
CATGTAATGCCTAAGTGTTA+TGG 0.502981 6:+88053183 MsG0680034468.01.T01:CDS
ACACTGTAGCTATGAACATC+AGG 0.506602 6:-88049149 None:intergenic
TTCATGCTTTCATTTGACCT+TGG 0.509358 6:+88053084 MsG0680034468.01.T01:CDS
GTCGATGGTTTATGTAAGGA+AGG 0.511591 6:+88048966 MsG0680034468.01.T01:CDS
GGTTAATGGGCTTTGTAAAG+AGG 0.516161 6:+88049595 MsG0680034468.01.T01:CDS
ACCAAATTCAAATATGGGTG+GGG 0.518332 6:-88048307 None:intergenic
TGAAAGCAACAAGAATGATA+AGG 0.524398 6:+88049715 MsG0680034468.01.T01:CDS
TTTAATTGAGGGAATAGGGT+AGG 0.529985 6:-88052736 None:intergenic
TACCAAATTCAAATATGGGT+GGG 0.534078 6:-88048308 None:intergenic
GTTAATGGGCTTTGTAAAGA+GGG 0.535797 6:+88049596 MsG0680034468.01.T01:CDS
ATTCAAATATGGGTGGGGTA+GGG 0.537035 6:-88048302 None:intergenic
TCATGATGATGTTAGAGCAA+AGG 0.537716 6:+88048593 MsG0680034468.01.T01:CDS
GTGTTGTACATGACGACATC+AGG 0.542217 6:-88048729 None:intergenic
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TAATTGAGGGAATAGGGTAG+GGG 0.561849 6:-88052734 None:intergenic
GGAAGAAATTCCCACTTCCA+TGG 0.562980 6:+88052857 MsG0680034468.01.T01:CDS
TATTACAAGTGGAGTACAGT+AGG 0.570645 6:+88052836 MsG0680034468.01.T01:CDS
TCACATATGCTAAAATGCCA+TGG 0.576660 6:-88052874 None:intergenic
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CATTTCACGTAGAAGTTCCA+CGG 0.581831 6:-88049738 None:intergenic
CAATTGCCTTGTCAACCTGA+TGG 0.582934 6:-88049406 None:intergenic
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TCTTATTGCAATCACGTCCA+AGG 0.586974 6:-88053101 None:intergenic
ATAGATGAGATGCATGATAG+AGG 0.587032 6:+88049329 MsG0680034468.01.T01:CDS
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TCAAGGTCCCATAACTAACC+TGG 0.595363 6:-88048629 None:intergenic
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TCCCATAACTAACCTGGTCA+AGG 0.606203 6:-88048623 None:intergenic
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GCCGGCATCACAACAACCGA+AGG 0.614185 6:-88051370 None:intergenic
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TAGAAAATGAAATAGCAGTG+TGG 0.676343 6:-88048365 None:intergenic
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CATAGTGTTGAATACATGTG+TGG 0.746722 6:-88049108 None:intergenic
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CRISPR-GE

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!! GTTATAAATGAATTATTACA+AGG - Chr6:88052479-88052498 None:intergenic 15.0%
!!! ATGATTATTTTCATACAATT+TGG + Chr6:88050059-88050078 MsG0680034468.01.T01:intron 15.0%
!!! TATTTCATTTTCTAAACAAA+TGG + Chr6:88048374-88048393 MsG0680034468.01.T01:CDS 15.0%
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!! ACTTACAGTACTTTAATATA+TGG + Chr6:88048846-88048865 MsG0680034468.01.T01:CDS 20.0%
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!!! TTTTTATATCAACATCAACT+GGG + Chr6:88050092-88050111 MsG0680034468.01.T01:intron 20.0%
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! AAAAGCTACCAAACATAATT+CGG - Chr6:88052125-88052144 None:intergenic 25.0%
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! AATTCTCTACAGATGTATTA+GGG + Chr6:88052598-88052617 MsG0680034468.01.T01:intron 25.0%
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! ATAATTCTGTGGATAATCAT+AGG + Chr6:88050540-88050559 MsG0680034468.01.T01:intron 25.0%
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! CTGTTACACAAAAAGTAAAT+TGG + Chr6:88049873-88049892 MsG0680034468.01.T01:intron 25.0%
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! GATCTTACCAAATTCAAATA+TGG - Chr6:88048316-88048335 None:intergenic 25.0%
! GGAGTAACAATTAATTAAGA+TGG - Chr6:88048436-88048455 None:intergenic 25.0%
! TAACATCATCATGAAAGTAA+AGG - Chr6:88048587-88048606 None:intergenic 25.0%
! TAATTAACACCATAACACTT+AGG - Chr6:88053195-88053214 None:intergenic 25.0%
! TACAAAGATTGATAAGTTGT+TGG + Chr6:88048701-88048720 MsG0680034468.01.T01:CDS 25.0%
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! TTGGATGATAGTTATTCAAT+TGG - Chr6:88052176-88052195 None:intergenic 25.0%
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!! TGTTCGTACTTTTAACATAT+TGG + Chr6:88048944-88048963 MsG0680034468.01.T01:CDS 25.0%
!! TTCCATTTTCATCAACTTTT+TGG - Chr6:88053053-88053072 None:intergenic 25.0%
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!! TTTTATATCAACATCAACTG+GGG + Chr6:88050093-88050112 MsG0680034468.01.T01:intron 25.0%
!!! ACATTTTTAATTGAGGGAAT+AGG - Chr6:88052744-88052763 None:intergenic 25.0%
!!! ATTGATGGGTTATGTAAAAT+AGG + Chr6:88048651-88048670 MsG0680034468.01.T01:CDS 25.0%
!!! CAATTTACTTTTCATGTAGT+TGG + Chr6:88050888-88050907 MsG0680034468.01.T01:intron 25.0%
!!! CAATTTTGCTTTTTCTATGT+TGG + Chr6:88048470-88048489 MsG0680034468.01.T01:CDS 25.0%
!!! CATTTTTAATTGAGGGAATA+GGG - Chr6:88052743-88052762 None:intergenic 25.0%
!!! GATTCTGTGTTTTATTAATG+TGG + Chr6:88051609-88051628 MsG0680034468.01.T01:intron 25.0%
!!! TACCAAAAAGTTGATGAAAA+TGG + Chr6:88053048-88053067 MsG0680034468.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTGTTTCTGAATTTAATGGT+CGG + Chr6:88052258-88052277 MsG0680034468.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTTTTGCTGAGTATACAA+TGG + Chr6:88053012-88053031 MsG0680034468.01.T01:intron 25.0%
AACTTCAGTTAACTTCTTCT+TGG - Chr6:88051456-88051475 None:intergenic 30.0%
AAGTAAGATAGGATACCATA+GGG + Chr6:88050733-88050752 MsG0680034468.01.T01:intron 30.0%
AATCTTTGTAAGAACCTTCA+TGG - Chr6:88048691-88048710 None:intergenic 30.0%
AATGTCCTTATTGTCAGAAA+TGG + Chr6:88049634-88049653 MsG0680034468.01.T01:CDS 30.0%
ACAATGACTACACTTATCAA+AGG + Chr6:88048531-88048550 MsG0680034468.01.T01:CDS 30.0%
ACATACAACTCACTTATTGA+TGG + Chr6:88049266-88049285 MsG0680034468.01.T01:CDS 30.0%
ACTTATACTTCTTTGATGGA+TGG + Chr6:88049056-88049075 MsG0680034468.01.T01:CDS 30.0%
ACTTTACAATTGGCAAGAAA+TGG - Chr6:88050288-88050307 None:intergenic 30.0%
AGCTACAGTGTTATGATTAA+CGG + Chr6:88049161-88049180 MsG0680034468.01.T01:CDS 30.0%
AGGGCTATAATTTAGATGTT+AGG + Chr6:88049558-88049577 MsG0680034468.01.T01:CDS 30.0%
ATAAGGAAAGAAAGATTGGA+AGG - Chr6:88049844-88049863 None:intergenic 30.0%
ATATCAGGATCTTCTGATTA+AGG + Chr6:88049538-88049557 MsG0680034468.01.T01:CDS 30.0%
ATATGCTTGGTTTCAAGATT+CGG + Chr6:88050446-88050465 MsG0680034468.01.T01:intron 30.0%
ATGAAGAGAAATCATGAAGA+TGG - Chr6:88050204-88050223 None:intergenic 30.0%
ATTAATTGTTACTCCCATCT+TGG + Chr6:88048441-88048460 MsG0680034468.01.T01:CDS 30.0%
ATTATGCAAGCATAAAATGG+TGG + Chr6:88049184-88049203 MsG0680034468.01.T01:CDS 30.0%
ATTGTGTATGTGAACATATC+TGG - Chr6:88049467-88049486 None:intergenic 30.0%
ATTTGCCTGTCAATTATACA+AGG + Chr6:88052415-88052434 MsG0680034468.01.T01:intron 30.0%
ATTTGGATATCAACATCTAG+TGG + Chr6:88051645-88051664 MsG0680034468.01.T01:intron 30.0%
CTGAATTACGGTCATTTATT+GGG + Chr6:88052703-88052722 MsG0680034468.01.T01:CDS 30.0%
GATAAGTGTAGTCATTGTTA+TGG - Chr6:88048529-88048548 None:intergenic 30.0%
GTACTGTAAGTGATAACATT+AGG - Chr6:88048837-88048856 None:intergenic 30.0%
GTTTAGTTACATGGTATTTG+AGG + Chr6:88050925-88050944 MsG0680034468.01.T01:intron 30.0%
GTTTGAAAAGTTACAGCATT+AGG - Chr6:88049677-88049696 None:intergenic 30.0%
TAACTATCATCCAAGAGAAA+TGG + Chr6:88052182-88052201 MsG0680034468.01.T01:intron 30.0%
TAACTCAAACAATTGCCAAA+AGG - Chr6:88050779-88050798 None:intergenic 30.0%
TAAGTAAGATAGGATACCAT+AGG + Chr6:88050732-88050751 MsG0680034468.01.T01:intron 30.0%
TACCAAATTCAAATATGGGT+GGG - Chr6:88048311-88048330 None:intergenic 30.0%
TAGAAAATGAAATAGCAGTG+TGG - Chr6:88048368-88048387 None:intergenic 30.0%
TAGAGCAGAATAGAAAAATC+TGG - Chr6:88051799-88051818 None:intergenic 30.0%
TATAGTTTCTTGAGATTCTC+GGG + Chr6:88050120-88050139 MsG0680034468.01.T01:intron 30.0%
TATCAGGATCTTCTGATTAA+GGG + Chr6:88049539-88049558 MsG0680034468.01.T01:CDS 30.0%
TCACTAGTAAACCTTAAACA+AGG - Chr6:88052321-88052340 None:intergenic 30.0%
TCTACTGTAAGAGTAAAACA+AGG + Chr6:88049772-88049791 MsG0680034468.01.T01:intron 30.0%
TCTGAATTACGGTCATTTAT+TGG + Chr6:88052702-88052721 MsG0680034468.01.T01:CDS 30.0%
TGAAAGAGAAATCATGAAGA+TGG - Chr6:88051774-88051793 None:intergenic 30.0%
TGAAAGCAACAAGAATGATA+AGG + Chr6:88049715-88049734 MsG0680034468.01.T01:CDS 30.0%
TGGCAATCATTATAACAGTT+AGG + Chr6:88052144-88052163 MsG0680034468.01.T01:intron 30.0%
TGTTAGGATGTATAATGTGA+TGG + Chr6:88049574-88049593 MsG0680034468.01.T01:CDS 30.0%
TGTTATGATAAAACAAGGTG+TGG + Chr6:88049019-88049038 MsG0680034468.01.T01:CDS 30.0%
TTAAATTCAGAAACAACCCA+TGG - Chr6:88052254-88052273 None:intergenic 30.0%
TTACCAAATTCAAATATGGG+TGG - Chr6:88048312-88048331 None:intergenic 30.0%
TTCTGTCATCTAAGTAACTT+GGG + Chr6:88050850-88050869 MsG0680034468.01.T01:intron 30.0%
TTGAAAAGTTACAGCATTAG+GGG - Chr6:88049675-88049694 None:intergenic 30.0%
TTGATGAAAATGGAAGTTTC+AGG + Chr6:88053058-88053077 MsG0680034468.01.T01:CDS 30.0%
TTGGATCTAACAAAGCAATT+AGG - Chr6:88051437-88051456 None:intergenic 30.0%
TTGTAGTCCTCTATAATTGT+TGG + Chr6:88051940-88051959 MsG0680034468.01.T01:intron 30.0%
TTTACATAACCCATCAATCA+AGG - Chr6:88048649-88048668 None:intergenic 30.0%
TTTATATCAACATCAACTGG+GGG + Chr6:88050094-88050113 MsG0680034468.01.T01:intron 30.0%
TTTCTGTCATCTAAGTAACT+TGG + Chr6:88050849-88050868 MsG0680034468.01.T01:intron 30.0%
TTTGCCTGTCAATTATACAA+GGG + Chr6:88052416-88052435 MsG0680034468.01.T01:intron 30.0%
TTTGGATATCAACATCTAGT+GGG + Chr6:88051646-88051665 MsG0680034468.01.T01:intron 30.0%
! AACTTAATCCAACTTTTTGC+AGG - Chr6:88050146-88050165 None:intergenic 30.0%
! AAGAAACAAAAGTGCAGAAA+TGG - Chr6:88051256-88051275 None:intergenic 30.0%
! AAGGCTCAAATTGTATTTTC+AGG + Chr6:88052673-88052692 MsG0680034468.01.T01:intron 30.0%
! AATTCAGCAAGTTTTGCAAT+TGG - Chr6:88051871-88051890 None:intergenic 30.0%
! ACATACACAATACTTGTTGA+TGG + Chr6:88049476-88049495 MsG0680034468.01.T01:CDS 30.0%
! ACTTTTAACATATTGGTCGA+TGG + Chr6:88048951-88048970 MsG0680034468.01.T01:CDS 30.0%
! AGGGAAAATATCTGATGTTT+TGG + Chr6:88049301-88049320 MsG0680034468.01.T01:CDS 30.0%
! CATATTTATGCCATTTCTCT+TGG - Chr6:88052195-88052214 None:intergenic 30.0%
! CATCAGATATTTTCCCTAAT+TGG - Chr6:88049298-88049317 None:intergenic 30.0%
! CGCAAAAAGTTTGTTTAACT+TGG + Chr6:88051715-88051734 MsG0680034468.01.T01:intron 30.0%
! CTTACTTATCTTTAGGTTTC+TGG - Chr6:88050720-88050739 None:intergenic 30.0%
! TAGAGCATCAATTATATGCT+TGG + Chr6:88050433-88050452 MsG0680034468.01.T01:intron 30.0%
! TAGAGGAAGGAAAAATTTTC+TGG - Chr6:88051129-88051148 None:intergenic 30.0%
! TATTCAGAGCATCAATACAA+GGG - Chr6:88051972-88051991 None:intergenic 30.0%
! TTATTCAGAGCATCAATACA+AGG - Chr6:88051973-88051992 None:intergenic 30.0%
!! GAATTATGTTTGGTAGCTTT+TGG + Chr6:88052124-88052143 MsG0680034468.01.T01:intron 30.0%
!! TGGGTTGTTTCTGAATTTAA+TGG + Chr6:88052254-88052273 MsG0680034468.01.T01:intron 30.0%
!! TTATATTCTAAGGTGGACAT+TGG - Chr6:88049978-88049997 None:intergenic 30.0%
!! TTTGATGGATGGTTATTTCT+TGG + Chr6:88049067-88049086 MsG0680034468.01.T01:CDS 30.0%
AAAAGTGAAACCAAAAGAGC+CGG - Chr6:88051391-88051410 None:intergenic 35.0%
AAAATTGAGGTGACCAAGAT+GGG - Chr6:88048457-88048476 None:intergenic 35.0%
AAGGGTTGAACCTAAATACA+TGG - Chr6:88051354-88051373 None:intergenic 35.0%
AAGTAAATTGGACTGTGCAA+TGG + Chr6:88049885-88049904 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
AAGTCAATTATGTGGGAGTT+CGG + Chr6:88052003-88052022 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
ACCAAATTCAAATATGGGTG+GGG - Chr6:88048310-88048329 None:intergenic 35.0%
ACTAGTTGCTTGAGATTCTT+AGG + Chr6:88051675-88051694 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
AGGGTTGAACCTAAATACAT+GGG - Chr6:88051353-88051372 None:intergenic 35.0%
ATAGATGAGATGCATGATAG+AGG + Chr6:88049329-88049348 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
ATAGGGATTGTACGTTTAGA+AGG + Chr6:88050750-88050769 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
ATATGATCACAGTTGCTGAT+TGG + Chr6:88052210-88052229 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
ATCAAAGGTCTGTGTCTTAA+TGG + Chr6:88048546-88048565 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
ATGAAATAGCAGTGTGGAAA+TGG - Chr6:88048362-88048381 None:intergenic 35.0%
ATTCAACACTATGGCTCAAA+GGG + Chr6:88049118-88049137 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
ATTGGTCGATGGTTTATGTA+AGG + Chr6:88048962-88048981 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
ATTTGGTCCTATTGGACATT+TGG + Chr6:88053153-88053172 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
CACACATGTATTCAACACTA+TGG + Chr6:88049109-88049128 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
CATGTAATGCCTAAGTGTTA+TGG + Chr6:88053183-88053202 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
CCATTTATGCCCATGTATTT+AGG + Chr6:88051341-88051360 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
CCTAAATACATGGGCATAAA+TGG - Chr6:88051344-88051363 None:intergenic 35.0%
CGGATTATGCAAGCATAAAA+TGG + Chr6:88049181-88049200 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
CTAGCAATCAAATAGAATGG+TGG - Chr6:88050416-88050435 None:intergenic 35.0%
GAGTTGTATGTTACGGTATT+AGG - Chr6:88049257-88049276 None:intergenic 35.0%
GCTCTAGCAATCAAATAGAA+TGG - Chr6:88050419-88050438 None:intergenic 35.0%
GGATGCACAAAATGTATATC+AGG + Chr6:88049523-88049542 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
GGATGTATGAATGAATCCAT+GGG + Chr6:88052235-88052254 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
GTAGTCATTGTTATGGTATC+AGG - Chr6:88048522-88048541 None:intergenic 35.0%
GTCTTCCATTTCTGACAATA+AGG - Chr6:88049642-88049661 None:intergenic 35.0%
GTGCAAAAATGGAAGACTTA+AGG + Chr6:88049502-88049521 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
TACGATATCTTCAGGATCAA+AGG + Chr6:88050985-88051004 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
TATACAATGGTGAAGCAAGT+AGG + Chr6:88053025-88053044 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
TATTACAAGTGGAGTACAGT+AGG + Chr6:88052836-88052855 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
TATTCAACACTATGGCTCAA+AGG + Chr6:88049117-88049136 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
TCACATATGCTAAAATGCCA+TGG - Chr6:88052877-88052896 None:intergenic 35.0%
TCAGGCTTACTTCTGAATTA+CGG + Chr6:88052691-88052710 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
TCGCGTTAGTTATAATTCTG+TGG + Chr6:88050529-88050548 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
TCTCTTCTTATGACTGACAA+AGG - Chr6:88052574-88052593 None:intergenic 35.0%
TCTGTGGATAATCATAGGAT+TGG + Chr6:88050545-88050564 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
TGCATTGTTCAAAAACCATC+AGG + Chr6:88049391-88049410 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
TGGATGTATGAATGAATCCA+TGG + Chr6:88052234-88052253 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
TGTTCAGATGTTCTTGATTC+TGG + Chr6:88051839-88051858 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
TTAATTGAGGGAATAGGGTA+GGG - Chr6:88052738-88052757 None:intergenic 35.0%
TTATCTCCTACGATATCTTC+AGG + Chr6:88050977-88050996 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
TTCATGCTTTCATTTGACCT+TGG + Chr6:88053084-88053103 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
TTCTAAACGTACAATCCCTA+TGG - Chr6:88050751-88050770 None:intergenic 35.0%
TTGGATATCAACATCTAGTG+GGG + Chr6:88051647-88051666 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
TTGGCCAAGATTCTTAAGTT+AGG + Chr6:88048489-88048508 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
TTGTCAGAAATGGAAGACAA+TGG + Chr6:88049644-88049663 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
TTGTCAGTCATAAGAAGAGA+AGG + Chr6:88052574-88052593 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
TTTAATTGAGGGAATAGGGT+AGG - Chr6:88052739-88052758 None:intergenic 35.0%
TTTGATCCTGAAGATATCGT+AGG - Chr6:88050986-88051005 None:intergenic 35.0%
TTTGCTGGGTAAATTCTTGA+GGG + Chr6:88051408-88051427 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
! ACGTTTAGAAGGATTCCTTT+TGG + Chr6:88050761-88050780 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
! AGCAAATGGGTTTAGTTACA+TGG + Chr6:88050916-88050935 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
! AGGAAGGAAAAATTTTCTGG+AGG - Chr6:88051126-88051145 None:intergenic 35.0%
! ATTCAGAGCATCAATACAAG+GGG - Chr6:88051971-88051990 None:intergenic 35.0%
! CAGGATCAAAGGTTTCTTTT+TGG + Chr6:88050996-88051015 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
! CATAGTGTTGAATACATGTG+TGG - Chr6:88049111-88049130 None:intergenic 35.0%
! CATGATGATGTTAGAGCAAA+GGG + Chr6:88048594-88048613 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
! CTTGTGTATTGACCTTGTAT+GGG + Chr6:88051510-88051529 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
! TCATGATGATGTTAGAGCAA+AGG + Chr6:88048593-88048612 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
! TGTATTTAGGTTCAACCCTT+CGG + Chr6:88051354-88051373 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
! TTTGCAAGATTTGGTCCTAT+TGG + Chr6:88053145-88053164 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTGCTGGGTAAATTCTTG+AGG + Chr6:88051407-88051426 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
!! AAAAGGTGTCAAACAGGATA+TGG - Chr6:88050391-88050410 None:intergenic 35.0%
!! AAATCAAAGCACTGATGACT+CGG - Chr6:88051589-88051608 None:intergenic 35.0%
!! AAGGAAAAATTTTCTGGAGG+AGG - Chr6:88051123-88051142 None:intergenic 35.0%
!! ATTGATGGACTTTGCCAATT+AGG + Chr6:88049281-88049300 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
!! CAAATAGAATGGTGGACAAA+AGG - Chr6:88050408-88050427 None:intergenic 35.0%
!! GGTCATGTTTTTCAAACTTG+AGG + Chr6:88051017-88051036 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
!! GTTAATGGGCTTTGTAAAGA+GGG + Chr6:88049596-88049615 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
!! TGTTGCTTTCAAACAAAGCA+TGG - Chr6:88049706-88049725 None:intergenic 35.0%
!! TTACTTTTCATGTAGTTGGG+TGG + Chr6:88050892-88050911 MsG0680034468.01.T01:intron 35.0%
!! TTGATGGACTTTGCCAATTA+GGG + Chr6:88049282-88049301 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
!!! CTTTTGGTTTCACTTTTGCT+GGG + Chr6:88051394-88051413 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
!!! TCTTTTGGTTTCACTTTTGC+TGG + Chr6:88051393-88051412 MsG0680034468.01.T01:CDS 35.0%
AATTCAAATATGGGTGGGGT+AGG - Chr6:88048306-88048325 None:intergenic 40.0%
ACACTGTAGCTATGAACATC+AGG - Chr6:88049152-88049171 None:intergenic 40.0%
ACCCCACCCATATTTGAATT+TGG + Chr6:88048306-88048325 MsG0680034468.01.T01:CDS 40.0%
ACCTTGTATGGGATACTACA+TGG + Chr6:88051521-88051540 MsG0680034468.01.T01:intron 40.0%
AGACAGTCCAAATGTCCAAT+AGG - Chr6:88053163-88053182 None:intergenic 40.0%
AGACATTGAGACAGTCCAAT+AGG - Chr6:88052916-88052935 None:intergenic 40.0%
AGGGGTGATGTCAACAATAA+TGG - Chr6:88050362-88050381 None:intergenic 40.0%
AGTTATGGGACCTTGATTGA+TGG + Chr6:88048636-88048655 MsG0680034468.01.T01:CDS 40.0%
ATAACTAACGCGATACCAGT+AGG - Chr6:88050522-88050541 None:intergenic 40.0%
ATGCTAAAATGCCATGGAAG+TGG - Chr6:88052871-88052890 None:intergenic 40.0%
ATTCAAATATGGGTGGGGTA+GGG - Chr6:88048305-88048324 None:intergenic 40.0%
ATTGACGAAGATCAAAGACC+AGG + Chr6:88049433-88049452 MsG0680034468.01.T01:CDS 40.0%
ATTTCTCAGCACGTTAACAG+GGG - Chr6:88050605-88050624 None:intergenic 40.0%
CAAAATTGAGGTGACCAAGA+TGG - Chr6:88048458-88048477 None:intergenic 40.0%
CATTTCACGTAGAAGTTCCA+CGG - Chr6:88049741-88049760 None:intergenic 40.0%
CCATACAAGGTCAATACACA+AGG - Chr6:88051512-88051531 None:intergenic 40.0%
CTACGTGAAATGATTGCTAG+AGG + Chr6:88049749-88049768 MsG0680034468.01.T01:CDS 40.0%
CTGGATTTGATTCAACACCA+TGG + Chr6:88052295-88052314 MsG0680034468.01.T01:intron 40.0%
GATTTCTCAGCACGTTAACA+GGG - Chr6:88050606-88050625 None:intergenic 40.0%
GGACGTGATTGCAATAAGAT+GGG + Chr6:88053105-88053124 MsG0680034468.01.T01:CDS 40.0%
GGTCAGACCAACAATTATAG+AGG - Chr6:88051950-88051969 None:intergenic 40.0%
GGTGATGTCAACAATAATGG+AGG - Chr6:88050359-88050378 None:intergenic 40.0%
GTAAACCTTAAACAAGGCCA+TGG - Chr6:88052315-88052334 None:intergenic 40.0%
GTCGATGGTTTATGTAAGGA+AGG + Chr6:88048966-88048985 MsG0680034468.01.T01:CDS 40.0%
GTGGTTCTTCTCATACGATT+TGG + Chr6:88051628-88051647 MsG0680034468.01.T01:intron 40.0%
GTGTCTTAATGGCAAGGTTA+AGG + Chr6:88048557-88048576 MsG0680034468.01.T01:CDS 40.0%
GTTATGGGACCTTGATTGAT+GGG + Chr6:88048637-88048656 MsG0680034468.01.T01:CDS 40.0%
TAATTGAGGGAATAGGGTAG+GGG - Chr6:88052737-88052756 None:intergenic 40.0%
TCCATGTAGTATCCCATACA+AGG - Chr6:88051525-88051544 None:intergenic 40.0%
TCTGCTCTATTGGAATCACA+CGG + Chr6:88051810-88051829 MsG0680034468.01.T01:intron 40.0%
TCTGTTATTGTCGCGTTATG+TGG + Chr6:88051283-88051302 MsG0680034468.01.T01:intron 40.0%
TCTTATTGCAATCACGTCCA+AGG - Chr6:88053104-88053123 None:intergenic 40.0%
TGATTTCTCAGCACGTTAAC+AGG - Chr6:88050607-88050626 None:intergenic 40.0%
TGCTAAAATGCCATGGAAGT+GGG - Chr6:88052870-88052889 None:intergenic 40.0%
TGGACGTGATTGCAATAAGA+TGG + Chr6:88053104-88053123 MsG0680034468.01.T01:CDS 40.0%
TGGATATCAACATCTAGTGG+GGG + Chr6:88051648-88051667 MsG0680034468.01.T01:intron 40.0%
TGGTCCCTTGTATAATTGAC+AGG - Chr6:88052423-88052442 None:intergenic 40.0%
TGGTTTATGTAAGGAAGGAG+AGG + Chr6:88048971-88048990 MsG0680034468.01.T01:CDS 40.0%
TTCAACACTATGGCTCAAAG+GGG + Chr6:88049119-88049138 MsG0680034468.01.T01:CDS 40.0%
TTGACGAAGATCAAAGACCA+GGG + Chr6:88049434-88049453 MsG0680034468.01.T01:CDS 40.0%
TTTGCGGATCTATGTTAGTC+TGG - Chr6:88051701-88051720 None:intergenic 40.0%
! AAACAGGATATGGCTTGGAA+GGG - Chr6:88050381-88050400 None:intergenic 40.0%
! ACATATCTGGTTCAATTCCC+TGG - Chr6:88049454-88049473 None:intergenic 40.0%
! ACCTTGACCAGGTTAGTTAT+GGG + Chr6:88048622-88048641 MsG0680034468.01.T01:CDS 40.0%
! CATGGTGTTGAATCAAATCC+AGG - Chr6:88052297-88052316 None:intergenic 40.0%
! CCTTGTGTATTGACCTTGTA+TGG + Chr6:88051509-88051528 MsG0680034468.01.T01:intron 40.0%
! TGACTCGGCATAACAAACAA+AGG - Chr6:88051574-88051593 None:intergenic 40.0%
! TTTGTCTAGGACCATTGAGA+GGG + Chr6:88050688-88050707 MsG0680034468.01.T01:intron 40.0%
!! AAATTTTCTGGAGGAGGAAG+AGG - Chr6:88051117-88051136 None:intergenic 40.0%
!! ACTTCTAGAGTAGACTCTAG+AGG - Chr6:88051146-88051165 None:intergenic 40.0%
!! ATGTTTCTGAGATGACAGTG+AGG - Chr6:88050638-88050657 None:intergenic 40.0%
!! CAAAAACCATCAGGTTGACA+AGG + Chr6:88049400-88049419 MsG0680034468.01.T01:CDS 40.0%
!! GGTTAATGGGCTTTGTAAAG+AGG + Chr6:88049595-88049614 MsG0680034468.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTGATGGACTGTGCAAAAA+TGG + Chr6:88049491-88049510 MsG0680034468.01.T01:CDS 40.0%
!! TGTTTCTGAGATGACAGTGA+GGG - Chr6:88050637-88050656 None:intergenic 40.0%
!! TTTTGTCTAGGACCATTGAG+AGG + Chr6:88050687-88050706 MsG0680034468.01.T01:intron 40.0%
AAAGGGATTTCACCTTGACC+AGG + Chr6:88048611-88048630 MsG0680034468.01.T01:CDS 45.0%
AGGCTAAATGACGTCTTCCA+TGG - Chr6:88052554-88052573 None:intergenic 45.0%
AGGTCTGTGTCTTAATGGCA+AGG + Chr6:88048551-88048570 MsG0680034468.01.T01:CDS 45.0%
CAACAAGAATGATAAGGCCG+TGG + Chr6:88049721-88049740 MsG0680034468.01.T01:CDS 45.0%
CAATTGCCTTGTCAACCTGA+TGG - Chr6:88049409-88049428 None:intergenic 45.0%
CAGAAACATCCAAGTCATGC+TGG + Chr6:88050649-88050668 MsG0680034468.01.T01:intron 45.0%
CAGGTTCAGCTCTCTTAAAC+CGG - Chr6:88052525-88052544 None:intergenic 45.0%
CTCGGCATAACAAACAAAGG+AGG - Chr6:88051571-88051590 None:intergenic 45.0%
GGAAGAAATTCCCACTTCCA+TGG + Chr6:88052857-88052876 MsG0680034468.01.T01:CDS 45.0%
GTGTCAAACAGGATATGGCT+TGG - Chr6:88050386-88050405 None:intergenic 45.0%
GTGTTGTACATGACGACATC+AGG - Chr6:88048732-88048751 None:intergenic 45.0%
TCAAGGTCCCATAACTAACC+TGG - Chr6:88048632-88048651 None:intergenic 45.0%
TCACATAAGCCAGCATGACT+TGG - Chr6:88050661-88050680 None:intergenic 45.0%
TCCCATAACTAACCTGGTCA+AGG - Chr6:88048626-88048645 None:intergenic 45.0%
TCTGGAGAAATCCCTCTCAA+TGG - Chr6:88050702-88050721 None:intergenic 45.0%
TGAAACAACAGCTGCCATGA+AGG + Chr6:88048674-88048693 MsG0680034468.01.T01:CDS 45.0%
TTTCTCAGCACGTTAACAGG+GGG - Chr6:88050604-88050623 None:intergenic 45.0%
! AACAGGATATGGCTTGGAAG+GGG - Chr6:88050380-88050399 None:intergenic 45.0%
! ATGCTGTGTACAGCTAGCTT+CGG - Chr6:88051747-88051766 None:intergenic 45.0%
! CAAACAGGATATGGCTTGGA+AGG - Chr6:88050382-88050401 None:intergenic 45.0%
! CACCTTGACCAGGTTAGTTA+TGG + Chr6:88048621-88048640 MsG0680034468.01.T01:CDS 45.0%
! CTAGAGTAGACTCTAGAGGA+AGG - Chr6:88051142-88051161 None:intergenic 45.0%
! GATCACAGTTGCTGATTGGA+TGG + Chr6:88052214-88052233 MsG0680034468.01.T01:intron 45.0%
!! CAACACCATGGCCTTGTTTA+AGG + Chr6:88052307-88052326 MsG0680034468.01.T01:intron 45.0%
!! GTGGACAAAAGGTGTCAAAC+AGG - Chr6:88050397-88050416 None:intergenic 45.0%
!!! TGTTTTTTTTTTTTTTTTTA+AGG + Chr6:88052797-88052816 MsG0680034468.01.T01:intron 5.0%
ACGTCTTCCATGGCAAGAAC+AGG - Chr6:88052544-88052563 None:intergenic 50.0%
AGCTGAACCTGTTCTTGCCA+TGG + Chr6:88052534-88052553 MsG0680034468.01.T01:intron 50.0%
GTAGTTGGGTGGCAGCAAAT+GGG + Chr6:88050903-88050922 MsG0680034468.01.T01:intron 50.0%
GTTCAGCTCTCTTAAACCGG+AGG - Chr6:88052522-88052541 None:intergenic 50.0%
TGTAGTTGGGTGGCAGCAAA+TGG + Chr6:88050902-88050921 MsG0680034468.01.T01:intron 50.0%
TTCACGTAGGTTGCTACCTC+CGG + Chr6:88052503-88052522 MsG0680034468.01.T01:intron 50.0%
TTCTCGGGCCTGCAAAAAGT+TGG + Chr6:88050135-88050154 MsG0680034468.01.T01:intron 50.0%
! TGCTGTGTACAGCTAGCTTC+GGG - Chr6:88051746-88051765 None:intergenic 50.0%
!!! TGTTGTGATGCCGGCTCTTT+TGG + Chr6:88051378-88051397 MsG0680034468.01.T01:CDS 50.0%
ACGTACGAATGCCTGCCTAC+TGG + Chr6:88050504-88050523 MsG0680034468.01.T01:intron 55.0%
CCCTTCGGTTGTTGTGATGC+CGG + Chr6:88051369-88051388 MsG0680034468.01.T01:CDS 55.0%
CCGGCATCACAACAACCGAA+GGG - Chr6:88051372-88051391 None:intergenic 55.0%
CTAACGCGATACCAGTAGGC+AGG - Chr6:88050518-88050537 None:intergenic 55.0%
TCAGCACGTTAACAGGGGGT+TGG - Chr6:88050600-88050619 None:intergenic 55.0%
GCCGGCATCACAACAACCGA+AGG - Chr6:88051373-88051392 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 88048294 88053215 88048294 ID=MsG0680034468.01;Name=MsG0680034468.01
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Chr6 exon 88052695 88052761 88052695 ID=MsG0680034468.01.T01:exon:18356;Parent=MsG0680034468.01.T01
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Chr6 exon 88053047 88053215 88053047 ID=MsG0680034468.01.T01:exon:18358;Parent=MsG0680034468.01.T01
Chr6 CDS 88048294 88049777 88048294 ID=MsG0680034468.01.T01:cds;Parent=MsG0680034468.01.T01
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Chr6 CDS 88052819 88052923 88052819 ID=MsG0680034468.01.T01:cds;Parent=MsG0680034468.01.T01
Chr6 CDS 88053047 88053215 88053047 ID=MsG0680034468.01.T01:cds;Parent=MsG0680034468.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680034468.01.T01

ATGAACAACCCTACCCCACCCATATTTGAATTTGGTAAGATCTTATCTTCTCTTGTTAAGTTGAACCATTTCCACACTGCTATTTCATTTTCTAAACAAATGGAACTCAAACAAATTCAACCTGACATTTTTACTTTAACCATCTTAATTAATTGTTACTCCCATCTTGGTCACCTCAATTTTGCTTTTTCTATGTTGGCCAAGATTCTTAAGTTAGGTTTTCAACCTGATACCATAACAATGACTACACTTATCAAAGGTCTGTGTCTTAATGGCAAGGTTAAGGAAGCCCTTTACTTTCATGATGATGTTAGAGCAAAGGGATTTCACCTTGACCAGGTTAGTTATGGGACCTTGATTGATGGGTTATGTAAAATAGGTGAAACAACAGCTGCCATGAAGGTTCTTACAAAGATTGATAAGTTGTTGGTTCAACCTGATGTCGTCATGTACAACACAATTATGAATAGTTTATGCAAGGATAAACTTGTAATTGATGCTTGTGATTTATATTCTCAAATGCTTCTCAAGAGAATTTCTCCTAATGTTATCACTTACAGTACTTTAATATATGGATTTTGTATTGTGGGTCAATTCAAACAAGCCATTGATATGTTAAATGATATGCTCGTGAAAAACATCAGCCCAAATGTTCGTACTTTTAACATATTGGTCGATGGTTTATGTAAGGAAGGAGAGGTGAAAAAAGCTAGAAATGTGTTAGCTGTTATGATAAAACAAGGTGTGGAACCTAATGTTGTTACTTATACTTCTTTGATGGATGGTTATTTCTTGGTTAAAGAAGTGAGCAGAGCCACACATGTATTCAACACTATGGCTCAAAGGGGAGTGACTCCTGATGTTCATAGCTACAGTGTTATGATTAACGGATTATGCAAGCATAAAATGGTGGATGAAGCTGTCAATATCTTCAAAGAAATGCAGTTAAAAAACATGGCTCCTAATACCGTAACATACAACTCACTTATTGATGGACTTTGCCAATTAGGGAAAATATCTGATGTTTTGGAACTTATAGATGAGATGCATGATAGAGGTCAACAAGCTAACATAATTACTTACAGTTCTTTACTAGATGCATTGTTCAAAAACCATCAGGTTGACAAGGCAATTGCATTATTGACGAAGATCAAAGACCAGGGAATTGAACCAGATATGTTCACATACACAATACTTGTTGATGGACTGTGCAAAAATGGAAGACTTAAGGATGCACAAAATGTATATCAGGATCTTCTGATTAAGGGCTATAATTTAGATGTTAGGATGTATAATGTGATGGTTAATGGGCTTTGTAAAGAGGGCTTGTTTGATGATGCAATGTCCTTATTGTCAGAAATGGAAGACAATGGTTGCACCCCTAATGCTGTAACTTTTCAAACTCTTATCCATGCTTTGTTTGAAAGCAACAAGAATGATAAGGCCGTGGAACTTCTACGTGAAATGATTGCTAGAGGTCTACTGTTCAACCCTTCGGTTGTTGTGATGCCGGCTCTTTTGGTTTCACTTTTGCTGGGCTTACTTCTGAATTACGGTCATTTATTGGGAGAACTAACCCCTACCCTATTCCCTCAATTAAAAATGTTTGATATTGAATTGTTATTACAAGTGGAGTACAGTAGGAAGAAATTCCCACTTCCATGGCATTTTAGCATATGTGAATTTACAAGATTTTGTCCTATTGGACTGTACCAAAAAGTTGATGAAAATGGAAGTTTCAGGTCATTCATGCTTTCATTTGACCTTGGACGTGATTGCAATAAGATGGGTCAAACTCTTTACTATATTTGCAAGATTTGGTCCTATTGGACATTTGGACTGTCTCATGTAATGCCTAAGTGTTATGGTGTTAATTAG
Protein sequence

>MsG0680034468.01.T01

MNNPTPPIFEFGKILSSLVKLNHFHTAISFSKQMELKQIQPDIFTLTILINCYSHLGHLNFAFSMLAKILKLGFQPDTITMTTLIKGLCLNGKVKEALYFHDDVRAKGFHLDQVSYGTLIDGLCKIGETTAAMKVLTKIDKLLVQPDVVMYNTIMNSLCKDKLVIDACDLYSQMLLKRISPNVITYSTLIYGFCIVGQFKQAIDMLNDMLVKNISPNVRTFNILVDGLCKEGEVKKARNVLAVMIKQGVEPNVVTYTSLMDGYFLVKEVSRATHVFNTMAQRGVTPDVHSYSVMINGLCKHKMVDEAVNIFKEMQLKNMAPNTVTYNSLIDGLCQLGKISDVLELIDEMHDRGQQANIITYSSLLDALFKNHQVDKAIALLTKIKDQGIEPDMFTYTILVDGLCKNGRLKDAQNVYQDLLIKGYNLDVRMYNVMVNGLCKEGLFDDAMSLLSEMEDNGCTPNAVTFQTLIHALFESNKNDKAVELLREMIARGLLFNPSVVVMPALLVSLLLGLLLNYGHLLGELTPTLFPQLKMFDIELLLQVEYSRKKFPLPWHFSICEFTRFCPIGLYQKVDENGSFRSFMLSFDLGRDCNKMGQTLYYICKIWSYWTFGLSHVMPKCYGVN*