AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680034467.01

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MsG0680034467.01.T01 AT5G59900 23.328 583 384 7 60 606 336 891 2.84e-47 181
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MsG0680034467.01.T01 AT3G16710 26.781 351 257 0 428 778 114 464 2.11e-46 173
MsG0680034467.01.T01 AT3G16710 26.801 347 254 0 430 776 81 427 2.91e-43 164
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MsG0680034467.01.T01 AT3G16710 28.000 200 143 1 577 776 54 252 5.96e-19 91.7
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MsG0680034467.01.T01 AT4G26800 25.523 239 175 1 281 516 104 342 1.67e-18 88.6
MsG0680034467.01.T01 AT4G26800 29.371 143 101 0 632 774 3 145 4.63e-13 72.0
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MsG0680034467.01.T01 AT5G02860 23.929 560 349 10 292 777 208 764 1.38e-51 194
MsG0680034467.01.T01 AT5G02860 28.029 421 299 4 361 779 172 590 2.31e-51 193
MsG0680034467.01.T01 AT5G02860 21.759 648 470 8 62 703 179 795 1.54e-45 176
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MsG0680034467.01.T01 AT3G18020 26.526 475 293 9 346 770 74 542 1.45e-34 141
MsG0680034467.01.T01 AT3G18020 23.762 404 227 7 450 774 73 474 1.52e-23 106
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MsG0680034467.01.T01 AT2G17670 27.027 296 207 2 463 753 155 446 8.77e-34 135
MsG0680034467.01.T01 AT2G17670 26.100 341 245 4 436 770 89 428 1.50e-32 132
MsG0680034467.01.T01 AT2G17670 24.260 169 118 1 22 190 206 364 1.60e-11 67.8
MsG0680034467.01.T01 AT5G04810 24.027 437 332 0 295 731 417 853 6.57e-46 177
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MsG0680034467.01.T01 AT5G40400 22.977 383 255 8 57 431 237 587 3.69e-20 95.9
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MsG0680034467.01.T01 AT1G20300 25.329 304 226 1 470 773 154 456 8.46e-33 134
MsG0680034467.01.T01 AT1G20300 27.004 237 172 1 540 776 154 389 2.85e-29 123
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MsG0680034467.01.T01 AT2G35130 23.193 332 220 3 450 778 136 435 1.11e-19 94.4
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MsG0680034467.01.T01 AT3G18110 24.156 385 277 5 400 777 228 604 1.89e-30 129
MsG0680034467.01.T01 AT3G18110 21.182 812 512 22 35 778 312 1063 8.13e-30 127
MsG0680034467.01.T01 AT3G18110 22.414 406 314 1 366 770 685 1090 1.19e-27 120
MsG0680034467.01.T01 AT3G18110 19.487 390 314 0 295 684 755 1144 1.55e-27 120
MsG0680034467.01.T01 AT3G18110 19.562 731 509 16 59 779 228 889 3.28e-20 97.1
MsG0680034467.01.T01 AT4G01400 31.801 261 176 2 273 532 136 395 4.02e-37 145
MsG0680034467.01.T01 AT4G01400 25.000 304 225 2 463 765 117 418 1.27e-31 129
MsG0680034467.01.T01 AT4G01400 28.889 225 160 0 553 777 171 395 5.91e-31 127
MsG0680034467.01.T01 AT4G01400 27.915 283 200 2 339 621 167 445 2.32e-30 125
MsG0680034467.01.T01 AT4G01400 25.600 250 186 0 411 660 169 418 3.42e-29 122
MsG0680034467.01.T01 AT4G01400 23.209 349 228 4 382 725 100 413 8.29e-26 112
MsG0680034467.01.T01 AT4G01400 28.431 204 145 1 575 777 122 325 2.08e-19 92.4
MsG0680034467.01.T01 AT4G01400 29.032 155 108 2 37 190 136 289 1.42e-13 74.3
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MsG0680034467.01.T01 AT1G74850 22.628 411 317 1 359 768 138 548 3.08e-35 144
MsG0680034467.01.T01 AT1G74850 22.782 417 283 6 400 778 108 523 1.13e-34 142
MsG0680034467.01.T01 AT1G74850 19.697 528 385 4 290 779 174 700 1.23e-30 129
MsG0680034467.01.T01 AT1G74850 18.367 686 488 8 68 707 82 741 8.25e-25 111
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MsG0680034467.01.T01 AT5G15280 19.583 480 349 5 324 769 320 796 1.09e-15 82.4
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MsG0680034467.01.T01 AT5G15280 19.682 503 332 9 110 557 723 1208 8.16e-13 72.8
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MsG0680034467.01.T01 AT1G52640 25.763 295 218 1 485 778 156 450 1.59e-29 124
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MsG0680034467.01.T01 AT1G52640 29.596 223 151 3 554 773 155 374 3.10e-24 108
MsG0680034467.01.T01 AT2G03880 25.476 420 259 9 372 756 36 436 2.93e-30 127
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MsG0680034467.01.T01 AT1G62260 21.594 389 230 12 436 777 44 404 6.36e-17 85.5
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MsG0680034467.01.T01 AT1G10910 25.000 220 162 3 559 777 120 337 1.92e-14 77.8
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MsG0680034467.01.T01 AT1G10910 24.834 302 224 3 471 771 102 401 1.06e-19 94.4
MsG0680034467.01.T01 AT1G10910 21.368 351 274 2 271 620 146 495 1.24e-16 84.7
MsG0680034467.01.T01 AT1G10910 25.000 220 162 3 559 777 120 337 2.20e-14 77.4
MsG0680034467.01.T01 AT1G10910 24.569 232 170 4 550 779 76 304 5.32e-12 69.7
MsG0680034467.01.T01 AT3G02650 26.045 311 228 2 295 603 234 544 1.31e-26 115
MsG0680034467.01.T01 AT3G02650 26.198 313 225 4 365 673 234 544 1.89e-23 105
MsG0680034467.01.T01 AT3G02650 25.344 363 242 8 434 778 193 544 6.65e-23 104
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MsG0680034467.01.T01 AT3G60040 35.897 117 75 0 661 777 708 824 1.19e-17 88.2
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MsG0680034467.01.T01 AT3G21470 23.183 289 196 9 265 547 184 452 4.59e-13 72.8
MsG0680034467.01.T01 AT3G21470 18.701 385 292 6 322 706 76 439 6.56e-13 72.4
MsG0680034467.01.T01 AT2G36980 19.093 419 320 6 361 778 34 434 9.50e-17 85.1
MsG0680034467.01.T01 AT2G36980 20.998 481 325 15 288 731 31 493 2.19e-16 84.0
MsG0680034467.01.T01 AT1G43980 22.272 449 295 12 360 769 78 511 9.57e-17 85.1
MsG0680034467.01.T01 AT4G21170 21.382 463 295 14 276 722 175 584 1.02e-16 84.7
MsG0680034467.01.T01 AT1G60770 22.727 374 281 4 366 737 27 394 1.03e-16 84.3
MsG0680034467.01.T01 AT5G15300 21.760 409 291 12 288 689 73 459 1.10e-16 84.7
MsG0680034467.01.T01 AT5G15300 21.560 436 284 14 341 756 60 457 9.60e-16 81.6
MsG0680034467.01.T01 AT5G15300 21.739 368 258 10 415 773 60 406 1.92e-12 71.2
MsG0680034467.01.T01 AT3G46790 23.014 365 249 13 267 620 123 466 1.12e-16 84.7
MsG0680034467.01.T01 AT3G46790 19.481 385 264 7 322 703 107 448 2.71e-14 77.4
MsG0680034467.01.T01 AT3G46790 20.424 377 278 6 403 773 52 412 5.19e-14 76.3
MsG0680034467.01.T01 AT3G46790 20.283 424 303 8 363 773 47 448 1.51e-13 74.7
MsG0680034467.01.T01 AT5G19020 23.662 355 223 7 435 757 110 448 1.24e-16 84.7
MsG0680034467.01.T01 AT5G19020 18.802 484 347 9 288 738 134 604 1.34e-16 84.7
MsG0680034467.01.T01 AT5G19020 20.628 446 291 11 352 756 128 551 1.18e-14 78.6
MsG0680034467.01.T01 AT5G19020 19.313 611 398 18 117 721 98 619 7.40e-14 75.9
MsG0680034467.01.T01 AT5G19020 22.628 274 185 7 511 778 49 301 2.06e-11 68.2

Find 141 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 210 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ACTTACAATACTTTAATATA+TGG 0.216075 6:+88036097 MsG0680034467.01.T01:CDS
GGGGAAAATATCTGATGTTT+TGG 0.221921 6:+88036552 MsG0680034467.01.T01:CDS
ATGTATAATGCGATGGTTAA+TGG 0.227816 6:+88036832 MsG0680034467.01.T01:CDS
TATTGATGGACTTTGCAAAT+TGG 0.236788 6:+88036531 MsG0680034467.01.T01:CDS
TTTGATGGATGGGTGTTTCT+TGG 0.243568 6:+88036318 MsG0680034467.01.T01:CDS
ATCAAAGGTCTATGTCTTAA+TGG 0.244181 6:+88035797 MsG0680034467.01.T01:CDS
AGCTACAGTGTCATGATAAA+TGG 0.255971 6:+88036412 MsG0680034467.01.T01:CDS
ATCAAAGGTCTCTGTCTTAA+TGG 0.257062 6:+88033627 MsG0680034467.01.T01:CDS
CCTTATCATTCTTATCATTT+CGG 0.271896 6:-88036966 None:intergenic
ATTCAAAGATGGGTTGTTTA+GGG 0.293260 6:-88033383 None:intergenic
ATTCAAAGATGGGTTGTTTA+GGG 0.293260 6:-88035553 None:intergenic
AATTCAAAGATGGGTTGTTT+AGG 0.296343 6:-88033384 None:intergenic
AATTCAAAGATGGGTTGTTT+AGG 0.296343 6:-88035554 None:intergenic
AGTAATGTTCAACACAATTA+TGG 0.314717 6:+88035988 MsG0680034467.01.T01:CDS
GAAGCCATTGATATGCTAAA+TGG 0.318158 6:+88036145 MsG0680034467.01.T01:CDS
ATCCAGTGACAAACAGATTC+CGG 0.320970 6:+88035307 MsG0680034467.01.T01:CDS
AGGGTTATAATTTAGATGTT+AGG 0.325102 6:+88036809 MsG0680034467.01.T01:CDS
ACAGAAACAATTAATCAAAA+TGG 0.326164 6:-88033514 None:intergenic
ACAGAAACAATTAATCAAAA+TGG 0.326164 6:-88035684 None:intergenic
GTGTTAAAAGTATGAACATT+TGG 0.326342 6:-88036190 None:intergenic
AGTTATGCCATCTTAATTGA+TGG 0.329746 6:+88033717 MsG0680034467.01.T01:CDS
AGTTATGCCATCTTAATTGA+TGG 0.329746 6:+88035887 MsG0680034467.01.T01:CDS
GTGTTGAACATTACTACATT+AGG 0.331451 6:-88035980 None:intergenic
ATTGATGGACTTTGCAAATT+GGG 0.333995 6:+88036532 MsG0680034467.01.T01:CDS
ACATACACAATACTTGTTGA+TGG 0.335842 6:+88036727 MsG0680034467.01.T01:CDS
ATTGATGGATTATGTAAATC+TGG 0.335960 6:+88033732 MsG0680034467.01.T01:CDS
ATTGATGGATTATGTAAATC+TGG 0.335960 6:+88035902 MsG0680034467.01.T01:CDS
TAATGTCGTCATCGTTCTTA+AGG 0.339591 6:+88033229 None:intergenic
TAATGTCGTCATCGTTCTTA+AGG 0.339591 6:+88035399 MsG0680034467.01.T01:CDS
TGTTACTTATACTTCTTTGA+TGG 0.343831 6:+88036303 MsG0680034467.01.T01:CDS
TGGATTATGTAAGAATAAAA+TGG 0.343946 6:+88036432 MsG0680034467.01.T01:CDS
GTATTGATTGTTACAGTATC+AGG 0.353202 6:-88033600 None:intergenic
GTATTGATTGTTACAGTATC+AGG 0.353202 6:-88035770 None:intergenic
CAATTGCCTTGTCAACTTGA+TGG 0.353343 6:-88036657 None:intergenic
CGTCATCGTTCTTAAGGTTA+AGG 0.357186 6:+88033235 MsG0680034467.01.T01:CDS
CGTCATCGTTCTTAAGGTTA+AGG 0.357186 6:+88035405 MsG0680034467.01.T01:CDS
GAAGTATAAGTAACAACATT+AGG 0.368065 6:-88036295 None:intergenic
TATGTCTTAATGGTAAGGTT+AGG 0.368842 6:+88035807 MsG0680034467.01.T01:CDS
GGATGCACAAAATGTATATC+AGG 0.369601 6:+88036774 MsG0680034467.01.T01:CDS
TCTGTCTTAATGGTAAGGTT+AGG 0.374912 6:+88033637 MsG0680034467.01.T01:CDS
AAGATTGAAGAGAAATTTGT+TGG 0.382914 6:+88033786 MsG0680034467.01.T01:CDS
AAGATTGAAGAGAAATTTGT+TGG 0.382914 6:+88035956 MsG0680034467.01.T01:CDS
TGAACTGTATGCTACAATAT+CGG 0.390759 6:-88036506 None:intergenic
TAACATCGTCATGAAAGTTA+AGG 0.393350 6:-88033665 None:intergenic
TAACATCGTCATGAAAGTTA+AGG 0.393350 6:-88035835 None:intergenic
CTTATACTTCTTTGATGGAT+GGG 0.394712 6:+88036308 MsG0680034467.01.T01:CDS
GCATACAGTTCACTTATTGA+TGG 0.399421 6:+88036517 MsG0680034467.01.T01:CDS
TGTATAATGCGATGGTTAAT+GGG 0.402173 6:+88036833 MsG0680034467.01.T01:CDS
GATCTTGTTAAATTCAAAGA+TGG 0.406759 6:-88033394 None:intergenic
GATCTTGTTAAATTCAAAGA+TGG 0.406759 6:-88035564 None:intergenic
GTTTCATAAGTAACAGCATC+AGG 0.418168 6:-88036925 None:intergenic
AAAACCTAGCTTGAAAATCT+TGG 0.418224 6:-88033574 None:intergenic
AAAACCTAGCTTGAAAATCT+TGG 0.418224 6:-88035744 None:intergenic
TGAGAAAATGAAATAGCAGT+TGG 0.424801 6:-88033447 None:intergenic
TGAGAAAATGAAATAGCAGT+TGG 0.424801 6:-88035617 None:intergenic
CACATATCTATTCAACACTA+TGG 0.425089 6:+88036360 MsG0680034467.01.T01:CDS
ACTTATACTTCTTTGATGGA+TGG 0.426181 6:+88036307 MsG0680034467.01.T01:CDS
TCCAGTGACAAACAGATTCC+GGG 0.426520 6:+88035308 MsG0680034467.01.T01:CDS
ATTGTGTATGTAAACATATC+TGG 0.436643 6:-88036715 None:intergenic
CATGACGATGTTAGAGCTAA+GGG 0.437591 6:+88033675 MsG0680034467.01.T01:CDS
CATGACGATGTTAGAGCTAA+GGG 0.437591 6:+88035845 MsG0680034467.01.T01:CDS
TGTTAAAAGTATGAACATTT+GGG 0.443598 6:-88036189 None:intergenic
GAGAAAATGAAATAGCAGTT+GGG 0.444434 6:-88033446 None:intergenic
GAGAAAATGAAATAGCAGTT+GGG 0.444434 6:-88035616 None:intergenic
ATTGGTTGATGGTTTATGTA+AGG 0.445290 6:+88036213 MsG0680034467.01.T01:CDS
GTTTAGGGTTGTTCATATGA+AGG 0.448606 6:-88033368 None:intergenic
GTTTAGGGTTGTTCATATGA+AGG 0.448606 6:-88035538 None:intergenic
AACATCGTCATGAAAGTTAA+GGG 0.455041 6:-88033664 None:intergenic
AACATCGTCATGAAAGTTAA+GGG 0.455041 6:-88035834 None:intergenic
CAATTCTTTGAAGAGATTGA+CGG 0.458182 6:-88036464 None:intergenic
ACACTGTAGCTTTGAACATC+AGG 0.460827 6:-88036400 None:intergenic
CTGTCTTAATGGTAAGGTTA+GGG 0.463478 6:+88033638 MsG0680034467.01.T01:CDS
GTTGATGGTTTATGTAAGGA+AGG 0.470136 6:+88036217 MsG0680034467.01.T01:CDS
CATGCCATTTAGCATATCAA+TGG 0.471251 6:-88036149 None:intergenic
TGAACGTGTAAACAACGAAT+TGG 0.471521 6:-88033288 None:intergenic
TGAACGTGTAAACAACGAAT+TGG 0.471521 6:-88035458 None:intergenic
ACATAATCCATCAATTAAGA+TGG 0.472588 6:-88033724 None:intergenic
ACATAATCCATCAATTAAGA+TGG 0.472588 6:-88035894 None:intergenic
ATGTTGGGATTCTTCAACGA+AGG 0.482255 6:+88035274 MsG0680034467.01.T01:CDS
CAATCTTTCTAAGAACCTGC+AGG 0.482666 6:-88033770 None:intergenic
CAATCTTTCTAAGAACCTGC+AGG 0.482666 6:-88035940 None:intergenic
ATTAATTGTTTCTGTCACCT+TGG 0.490105 6:+88035692 MsG0680034467.01.T01:CDS
AGAAACAAGAGCTGCCCTGC+AGG 0.490890 6:+88033755 MsG0680034467.01.T01:CDS
AGAAACAAGAGCTGCCCTGC+AGG 0.490890 6:+88035925 MsG0680034467.01.T01:CDS
ATGTCTTAATGGTAAGGTTA+GGG 0.492418 6:+88035808 MsG0680034467.01.T01:CDS
CCGAAATGATAAGAATGATA+AGG 0.494596 6:+88036966 MsG0680034467.01.T01:CDS
GAACTGTATGCTACAATATC+GGG 0.495045 6:-88036505 None:intergenic
ACATATCTGGTTCAATTCCC+TGG 0.498979 6:-88036702 None:intergenic
ACTGACGAAGATCAAAGGCC+AGG 0.501328 6:+88036684 MsG0680034467.01.T01:CDS
ATCTTGTTAAATTCAAAGAT+GGG 0.501445 6:-88033393 None:intergenic
ATCTTGTTAAATTCAAAGAT+GGG 0.501445 6:-88035563 None:intergenic
TCATGACGATGTTAGAGCTA+AGG 0.502819 6:+88033674 MsG0680034467.01.T01:CDS
TCATGACGATGTTAGAGCTA+AGG 0.502819 6:+88035844 MsG0680034467.01.T01:CDS
GCCCGGAATCTGTTTGTCAC+TGG 0.503376 6:-88035309 None:intergenic
TGTCTTCAGCTCTAAAACAA+TGG 0.506366 6:-88035331 None:intergenic
CACTATGGTTCGAAGGGGAG+TGG 0.510786 6:+88036375 MsG0680034467.01.T01:CDS
TGGCATAACTAAACTGATCA+AGG 0.512307 6:-88033704 None:intergenic
TGGCATAACTAAACTGATCA+AGG 0.512307 6:-88035874 None:intergenic
AGGTCTATGTCTTAATGGTA+AGG 0.514774 6:+88035802 MsG0680034467.01.T01:CDS
AGGTCTCTGTCTTAATGGTA+AGG 0.516664 6:+88033632 MsG0680034467.01.T01:CDS
GGTTAATGGGCTTTGTAAAG+AGG 0.518644 6:+88036846 MsG0680034467.01.T01:CDS
ATATCAGGATCTTCTGATGA+AGG 0.518922 6:+88036789 MsG0680034467.01.T01:CDS
TTGATGGACTTTGCAAATTG+GGG 0.522174 6:+88036533 MsG0680034467.01.T01:CDS
AGAACTATAAGTAATTATGT+TGG 0.536281 6:-88036611 None:intergenic
TTGTCAATGAACGAAGGAAG+AGG 0.538668 6:-88033312 None:intergenic
TTGTCAATGAACGAAGGAAG+AGG 0.538668 6:-88035482 None:intergenic
CTTGGTTAAAGAAGTGAACA+AGG 0.544300 6:+88036336 MsG0680034467.01.T01:CDS
ATGCTACAATATCGGGAGCC+AGG 0.544528 6:-88036498 None:intergenic
TATTCAACACTATGGTTCGA+AGG 0.550028 6:+88036368 MsG0680034467.01.T01:CDS
GTATTGTAAGTGATAACATC+AGG 0.551977 6:-88036085 None:intergenic
GTTAATGGGCTTTGTAAAGA+GGG 0.565139 6:+88036847 MsG0680034467.01.T01:CDS
ATTCAACACTATGGTTCGAA+GGG 0.570716 6:+88036369 MsG0680034467.01.T01:CDS
CATAGTGTTGAATAGATATG+TGG 0.578632 6:-88036359 None:intergenic
TCAGCTCTAAAACAATGGCC+CGG 0.580697 6:-88035326 None:intergenic
TGGTTTATGTAAGGAAGGAG+AGG 0.581729 6:+88036222 MsG0680034467.01.T01:CDS
ATTAATTGTTTCTGTCACGT+TGG 0.581852 6:+88033522 MsG0680034467.01.T01:CDS
GCATAGAAAACGCAAAATTG+AGG 0.583109 6:-88033548 None:intergenic
CTGACGAAGATCAAAGGCCA+GGG 0.593656 6:+88036685 MsG0680034467.01.T01:CDS
ACAATCAATACACTTATCAA+AGG 0.594280 6:+88033612 MsG0680034467.01.T01:CDS
ACAATCAATACACTTATCAA+AGG 0.594280 6:+88035782 MsG0680034467.01.T01:CDS
TGTTAGGATGTATAATGCGA+TGG 0.595552 6:+88036825 MsG0680034467.01.T01:CDS
AATTATGGATAGTTTGTGCA+AGG 0.599862 6:+88036003 MsG0680034467.01.T01:CDS
GCATTACTGACGAAGATCAA+AGG 0.600450 6:+88036679 MsG0680034467.01.T01:CDS
TTTCATAAGTAACAGCATCA+GGG 0.602128 6:-88036924 None:intergenic
TATCAGGATCTTCTGATGAA+GGG 0.605858 6:+88036790 MsG0680034467.01.T01:CDS
AGTATTGATAAAACAAGGTG+TGG 0.610510 6:+88036270 MsG0680034467.01.T01:CDS
TGTCAATGAACGAAGGAAGA+GGG 0.617141 6:-88033311 None:intergenic
TGTCAATGAACGAAGGAAGA+GGG 0.617141 6:-88035481 None:intergenic
AAGCAAAATTGAGGTGACCA+AGG 0.623087 6:-88035709 None:intergenic
TTCATAAGTAACAGCATCAG+GGG 0.627166 6:-88036923 None:intergenic
AATCTTTCTAAGAACCTGCA+GGG 0.653137 6:-88033769 None:intergenic
AATCTTTCTAAGAACCTGCA+GGG 0.653137 6:-88035939 None:intergenic
ATGACGATGTTAGAGCTAAG+GGG 0.655423 6:+88033676 MsG0680034467.01.T01:CDS
ATGACGATGTTAGAGCTAAG+GGG 0.655423 6:+88035846 MsG0680034467.01.T01:CDS
CTTCGCGTAATGATTGCTAG+AGG 0.657757 6:+88037000 MsG0680034467.01.T01:CDS
ATTATGTAAGAATAAAATGG+TGG 0.659806 6:+88036435 MsG0680034467.01.T01:CDS
TCAACATTGTCAATGAACGA+AGG 0.676691 6:-88033318 None:intergenic
TCAACATTGTCAATGAACGA+AGG 0.676691 6:-88035488 None:intergenic
TTCAACACTATGGTTCGAAG+GGG 0.684440 6:+88036370 MsG0680034467.01.T01:CDS
TTAGCAGTATTGATAAAACA+AGG 0.700832 6:+88036265 MsG0680034467.01.T01:CDS
ATAGATGAGATGCATGACAG+AGG 0.712373 6:+88036580 MsG0680034467.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TTTCTCAAATATTTTAAAAT+GGG - Chr6:88033906-88033925 None:intergenic 10.0%
!! AATAAAAAAAGACTTATGTT+GGG + Chr6:88035259-88035278 MsG0680034467.01.T01:intron 15.0%
!! ACTTACAATACTTTAATATA+TGG + Chr6:88036097-88036116 MsG0680034467.01.T01:CDS 15.0%
!! CATGTAATATTAATGAATTT+CGG - Chr6:88035193-88035212 None:intergenic 15.0%
!! TAATAAAAAAAGACTTATGT+TGG + Chr6:88035258-88035277 MsG0680034467.01.T01:intron 15.0%
!!! AACAAAATGTTATTTTGAAA+AGG + Chr6:88033982-88034001 MsG0680034467.01.T01:intron 15.0%
!!! ACAAAATGTTATTTTGAAAA+GGG + Chr6:88033983-88034002 MsG0680034467.01.T01:intron 15.0%
!!! GTTTCTCAAATATTTTAAAA+TGG - Chr6:88033907-88033926 None:intergenic 15.0%
!!! TATTTCATTTTCTCAAAAAA+TGG + Chr6:88033455-88033474 MsG0680034467.01.T01:CDS 15.0%
!! AATATATGTTACAACATCAA+AGG - Chr6:88034735-88034754 None:intergenic 20.0%
!! ACAGAAACAATTAATCAAAA+TGG - Chr6:88033517-88033536 None:intergenic 20.0%
!! AGAACTATAAGTAATTATGT+TGG - Chr6:88036614-88036633 None:intergenic 20.0%
!! ATCTTGTTAAATTCAAAGAT+GGG - Chr6:88033396-88033415 None:intergenic 20.0%
!! ATTATGTAAGAATAAAATGG+TGG + Chr6:88036435-88036454 MsG0680034467.01.T01:CDS 20.0%
!! CGAAATTCATTAATATTACA+TGG + Chr6:88035191-88035210 MsG0680034467.01.T01:intron 20.0%
!! GGAATTTCTTCTAAATTTAT+AGG + Chr6:88034399-88034418 MsG0680034467.01.T01:intron 20.0%
!! TAAATTAGAATGATCTCAAA+AGG + Chr6:88034221-88034240 MsG0680034467.01.T01:intron 20.0%
!! TGGATTATGTAAGAATAAAA+TGG + Chr6:88036432-88036451 MsG0680034467.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAAATCTCTTTTTGAAATGA+GGG - Chr6:88034197-88034216 None:intergenic 20.0%
!!! AATATATGGATTTTGTATTG+TGG + Chr6:88036111-88036130 MsG0680034467.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATATATGGATTTTGTATTGT+GGG + Chr6:88036112-88036131 MsG0680034467.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTTTAGATTCTTTCACATT+TGG - Chr6:88035123-88035142 None:intergenic 20.0%
!!! TGTTAAAAGTATGAACATTT+GGG - Chr6:88036192-88036211 None:intergenic 20.0%
!!! TTACAAATTTTTGCTAATTG+AGG - Chr6:88033937-88033956 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTGAGATCATTCTAATTT+AGG - Chr6:88034222-88034241 None:intergenic 20.0%
! AAATCTGATCATCTTAAATC+AGG + Chr6:88034279-88034298 MsG0680034467.01.T01:intron 25.0%
! AAGAATCAATCATGTATTGA+AGG - Chr6:88034817-88034836 None:intergenic 25.0%
! AAGATTGAAGAGAAATTTGT+TGG + Chr6:88033786-88033805 MsG0680034467.01.T01:CDS 25.0%
! ACAATCAATACACTTATCAA+AGG + Chr6:88033612-88033631 MsG0680034467.01.T01:CDS 25.0%
! ACATAATCCATCAATTAAGA+TGG - Chr6:88033727-88033746 None:intergenic 25.0%
! AGAATTGCATATAAAAAACC+TGG + Chr6:88036480-88036499 MsG0680034467.01.T01:CDS 25.0%
! AGATTTATGGAATCATGAAT+AGG - Chr6:88034650-88034669 None:intergenic 25.0%
! AGGGTTATAATTTAGATGTT+AGG + Chr6:88036809-88036828 MsG0680034467.01.T01:CDS 25.0%
! AGTAATGTTCAACACAATTA+TGG + Chr6:88033818-88033837 MsG0680034467.01.T01:intron 25.0%
! ATGGCTAAAGTAAAAATATC+AGG - Chr6:88033498-88033517 None:intergenic 25.0%
! ATTGTGTATGTAAACATATC+TGG - Chr6:88036718-88036737 None:intergenic 25.0%
! CCTTATCATTCTTATCATTT+CGG - Chr6:88036969-88036988 None:intergenic 25.0%
! GAAGTATAAGTAACAACATT+AGG - Chr6:88036298-88036317 None:intergenic 25.0%
! GATCTTGTTAAATTCAAAGA+TGG - Chr6:88033397-88033416 None:intergenic 25.0%
!! ATACATGATTGATTCTTGTT+TGG + Chr6:88034820-88034839 MsG0680034467.01.T01:intron 25.0%
!! GTGTTAAAAGTATGAACATT+TGG - Chr6:88036193-88036212 None:intergenic 25.0%
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!! TGTGCAAATAAATGAAGTTT+TGG - Chr6:88034561-88034580 None:intergenic 25.0%
!! TGTTACTTATACTTCTTTGA+TGG + Chr6:88036303-88036322 MsG0680034467.01.T01:CDS 25.0%
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!!! ATTGATGGATTATGTAAATC+TGG + Chr6:88033732-88033751 MsG0680034467.01.T01:CDS 25.0%
!!! CAAAATCTCTTTTTGAAATG+AGG - Chr6:88034198-88034217 None:intergenic 25.0%
!!! GGGAAGTAATATTTTGAAAA+AGG + Chr6:88034003-88034022 MsG0680034467.01.T01:intron 25.0%
!!! TTAGCAGTATTGATAAAACA+AGG + Chr6:88036265-88036284 MsG0680034467.01.T01:CDS 25.0%
AAAACCTAGCTTGAAAATCT+TGG - Chr6:88033577-88033596 None:intergenic 30.0%
AAATCCTCCATAACTTGATT+AGG + Chr6:88034684-88034703 MsG0680034467.01.T01:intron 30.0%
AACATCGTCATGAAAGTTAA+GGG - Chr6:88033667-88033686 None:intergenic 30.0%
ACTTATACTTCTTTGATGGA+TGG + Chr6:88036307-88036326 MsG0680034467.01.T01:CDS 30.0%
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ATAGGTTATGGTTCATGTTT+AGG - Chr6:88034611-88034630 None:intergenic 30.0%
ATCAAAGGTCTATGTCTTAA+TGG + Chr6:88035797-88035816 MsG0680034467.01.T01:CDS 30.0%
ATGTATAATGCGATGGTTAA+TGG + Chr6:88036832-88036851 MsG0680034467.01.T01:CDS 30.0%
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ATTGAAGGATTATGAAACAG+AGG - Chr6:88034802-88034821 None:intergenic 30.0%
ATTTACTTTCTTCACCTTCT+AGG - Chr6:88034919-88034938 None:intergenic 30.0%
CACATATCTATTCAACACTA+TGG + Chr6:88036360-88036379 MsG0680034467.01.T01:CDS 30.0%
CCGAAATGATAAGAATGATA+AGG + Chr6:88036966-88036985 MsG0680034467.01.T01:CDS 30.0%
GAGAAAATGAAATAGCAGTT+GGG - Chr6:88033449-88033468 None:intergenic 30.0%
GCATAGAAAAAGCAAAATTG+AGG - Chr6:88035721-88035740 None:intergenic 30.0%
GCATATCACATATACATGTT+CGG + Chr6:88035076-88035095 MsG0680034467.01.T01:intron 30.0%
GTATTGTAAGTGATAACATC+AGG - Chr6:88036088-88036107 None:intergenic 30.0%
GTGTTGAACATTACTACATT+AGG - Chr6:88033813-88033832 None:intergenic 30.0%
TAACATCGTCATGAAAGTTA+AGG - Chr6:88033668-88033687 None:intergenic 30.0%
TATGGAATCATGAATAGGTT+TGG - Chr6:88034645-88034664 None:intergenic 30.0%
TATGTCTTAATGGTAAGGTT+AGG + Chr6:88035807-88035826 MsG0680034467.01.T01:CDS 30.0%
TCATAAAGTTCAGAATGACA+AGG + Chr6:88035050-88035069 MsG0680034467.01.T01:intron 30.0%
TCTCAAAAAATGGAACTCAA+AGG + Chr6:88033465-88033484 MsG0680034467.01.T01:CDS 30.0%
TGAACTGTATGCTACAATAT+CGG - Chr6:88036509-88036528 None:intergenic 30.0%
TGAGAAAATGAAATAGCAGT+TGG - Chr6:88033450-88033469 None:intergenic 30.0%
TGTATAATGCGATGGTTAAT+GGG + Chr6:88036833-88036852 MsG0680034467.01.T01:CDS 30.0%
TTTACTTTCTTCACCTTCTA+GGG - Chr6:88034918-88034937 None:intergenic 30.0%
TTTCATAAGTAACAGCATCA+GGG - Chr6:88036927-88036946 None:intergenic 30.0%
TTTGGTACTCGTATTACTTT+GGG - Chr6:88034357-88034376 None:intergenic 30.0%
! AAAATTGTTGAGTTGCCATA+TGG + Chr6:88034854-88034873 MsG0680034467.01.T01:intron 30.0%
! AAATTGTTGAGTTGCCATAT+GGG + Chr6:88034855-88034874 MsG0680034467.01.T01:intron 30.0%
! AATTATGGATAGTTTGTGCA+AGG + Chr6:88036003-88036022 MsG0680034467.01.T01:CDS 30.0%
! ACATACACAATACTTGTTGA+TGG + Chr6:88036727-88036746 MsG0680034467.01.T01:CDS 30.0%
! ATCAAGTTATGGAGGATTTT+AGG - Chr6:88034683-88034702 None:intergenic 30.0%
! CAACCATTTTCTTCCATTTT+TGG - Chr6:88036901-88036920 None:intergenic 30.0%
! CAATTCTTTGAAGAGATTGA+CGG - Chr6:88036467-88036486 None:intergenic 30.0%
! CATAGTGTTGAATAGATATG+TGG - Chr6:88036362-88036381 None:intergenic 30.0%
! CTTAACAGACTTTAGAAAGT+TGG - Chr6:88034035-88034054 None:intergenic 30.0%
! CTTATACTTCTTTGATGGAT+GGG + Chr6:88036308-88036327 MsG0680034467.01.T01:CDS 30.0%
! TCAAGTTATGGAGGATTTTA+GGG - Chr6:88034682-88034701 None:intergenic 30.0%
! TCACAAATTGGTAAAGCTTT+TGG - Chr6:88034375-88034394 None:intergenic 30.0%
! TTTTGGTACTCGTATTACTT+TGG - Chr6:88034358-88034377 None:intergenic 30.0%
!! AATTCAAAGATGGGTTGTTT+AGG - Chr6:88033387-88033406 None:intergenic 30.0%
!! ACTTTTAACACATTGGTTGA+TGG + Chr6:88036202-88036221 MsG0680034467.01.T01:CDS 30.0%
!! AGTATTGATAAAACAAGGTG+TGG + Chr6:88036270-88036289 MsG0680034467.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTAATTGTTTCTGTCACCT+TGG + Chr6:88035692-88035711 MsG0680034467.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTAATTGTTTCTGTCACGT+TGG + Chr6:88033522-88033541 MsG0680034467.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTCAAAGATGGGTTGTTTA+GGG - Chr6:88033386-88033405 None:intergenic 30.0%
!! ATTGATGGACTTTGCAAATT+GGG + Chr6:88036532-88036551 MsG0680034467.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTGGTTGATGGTTTATGTA+AGG + Chr6:88036213-88036232 MsG0680034467.01.T01:CDS 30.0%
!! GTATTGATTGTTACAGTATC+AGG - Chr6:88033603-88033622 None:intergenic 30.0%
!! TATTGATGGACTTTGCAAAT+TGG + Chr6:88036531-88036550 MsG0680034467.01.T01:CDS 30.0%
!! TTCTCACTTTTGTTTGTGAT+AGG - Chr6:88034089-88034108 None:intergenic 30.0%
!! TTTAGAGTTAACATCGCTTT+TGG - Chr6:88035218-88035237 None:intergenic 30.0%
!!! CAATTTTGCTTTTTCTATGC+TGG + Chr6:88035721-88035740 MsG0680034467.01.T01:CDS 30.0%
AAGTGTGCCTAATCAAGTTA+TGG - Chr6:88034694-88034713 None:intergenic 35.0%
AGAATGATCTCAAAAGGTTG+AGG + Chr6:88034227-88034246 MsG0680034467.01.T01:intron 35.0%
AGATTCACAACCAAAACCTT+AGG + Chr6:88034950-88034969 MsG0680034467.01.T01:intron 35.0%
AGCTACAGTGTCATGATAAA+TGG + Chr6:88036412-88036431 MsG0680034467.01.T01:CDS 35.0%
AGGGACATCTTGAAGATTTA+TGG - Chr6:88034663-88034682 None:intergenic 35.0%
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ATATCAGGATCTTCTGATGA+AGG + Chr6:88036789-88036808 MsG0680034467.01.T01:CDS 35.0%
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CTGCAAAAATGGAAGACTTA+AGG + Chr6:88036753-88036772 MsG0680034467.01.T01:CDS 35.0%
CTGCCAAAAATGGAAGAAAA+TGG + Chr6:88036895-88036914 MsG0680034467.01.T01:CDS 35.0%
CTGTCTTAATGGTAAGGTTA+GGG + Chr6:88033638-88033657 MsG0680034467.01.T01:CDS 35.0%
CTTGGTTAAAGAAGTGAACA+AGG + Chr6:88036336-88036355 MsG0680034467.01.T01:CDS 35.0%
GAAATTCCTGCATCACAAAT+TGG - Chr6:88034387-88034406 None:intergenic 35.0%
GAACTGTATGCTACAATATC+GGG - Chr6:88036508-88036527 None:intergenic 35.0%
GAAGCCATTGATATGCTAAA+TGG + Chr6:88036145-88036164 MsG0680034467.01.T01:CDS 35.0%
GATCATCTTAAATCAGGATG+TGG + Chr6:88034285-88034304 MsG0680034467.01.T01:intron 35.0%
GCATACAGTTCACTTATTGA+TGG + Chr6:88036517-88036536 MsG0680034467.01.T01:CDS 35.0%
GCATAGAAAACGCAAAATTG+AGG - Chr6:88033551-88033570 None:intergenic 35.0%
GGATGCACAAAATGTATATC+AGG + Chr6:88036774-88036793 MsG0680034467.01.T01:CDS 35.0%
GTTAAGACCTTTCAAAAAGC+TGG + Chr6:88034049-88034068 MsG0680034467.01.T01:intron 35.0%
GTTTCATAAGTAACAGCATC+AGG - Chr6:88036928-88036947 None:intergenic 35.0%
TAATGTCGTCATCGTTCTTA+AGG + Chr6:88035399-88035418 MsG0680034467.01.T01:CDS 35.0%
TATCAGGATCTTCTGATGAA+GGG + Chr6:88036790-88036809 MsG0680034467.01.T01:CDS 35.0%
TATTCAACACTATGGTTCGA+AGG + Chr6:88036368-88036387 MsG0680034467.01.T01:CDS 35.0%
TCAACATTGTCAATGAACGA+AGG - Chr6:88033321-88033340 None:intergenic 35.0%
TCTGTCTTAATGGTAAGGTT+AGG + Chr6:88033637-88033656 MsG0680034467.01.T01:CDS 35.0%
TGAACGTGTAAACAACGAAT+TGG - Chr6:88033291-88033310 None:intergenic 35.0%
TGGCATAACTAAACTGATCA+AGG - Chr6:88033707-88033726 None:intergenic 35.0%
TGTTAGGATGTATAATGCGA+TGG + Chr6:88036825-88036844 MsG0680034467.01.T01:CDS 35.0%
TTCATAAGTAACAGCATCAG+GGG - Chr6:88036926-88036945 None:intergenic 35.0%
TTTGGTTGTGAATCTCATGA+AGG - Chr6:88034945-88034964 None:intergenic 35.0%
! AATCTTTCTAAGAACCTGCA+GGG - Chr6:88033772-88033791 None:intergenic 35.0%
! ACCTTTCAAAAAGCTGGTTT+AGG + Chr6:88034055-88034074 MsG0680034467.01.T01:intron 35.0%
! CAATTTTGCGTTTTCTATGC+TGG + Chr6:88033551-88033570 MsG0680034467.01.T01:CDS 35.0%
! CATGCCATTTAGCATATCAA+TGG - Chr6:88036152-88036171 None:intergenic 35.0%
! GCATTTGACTTCCATCTTTA+AGG + Chr6:88034880-88034899 MsG0680034467.01.T01:intron 35.0%
! GGGGAAAATATCTGATGTTT+TGG + Chr6:88036552-88036571 MsG0680034467.01.T01:CDS 35.0%
! GTTTAGGGTTGTTCATATGA+AGG - Chr6:88033371-88033390 None:intergenic 35.0%
! TCCTAAACCAGCTTTTTGAA+AGG - Chr6:88034059-88034078 None:intergenic 35.0%
!! CAAAAACCATCAAGTTGACA+AGG + Chr6:88036651-88036670 MsG0680034467.01.T01:CDS 35.0%
!! GAATAGGTTTGGTGTATTCT+AGG - Chr6:88034634-88034653 None:intergenic 35.0%
!! GGAGTGCTACAATTTTTGAA+TGG - Chr6:88033885-88033904 None:intergenic 35.0%
!! GTGTATTCTAGGATAGGTTA+TGG - Chr6:88034623-88034642 None:intergenic 35.0%
!! GTTAATGGGCTTTGTAAAGA+GGG + Chr6:88036847-88036866 MsG0680034467.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTGAGTTGCTCTAGAATAA+TGG + Chr6:88034505-88034524 MsG0680034467.01.T01:intron 35.0%
!! GTTGATGGTTTATGTAAGGA+AGG + Chr6:88036217-88036236 MsG0680034467.01.T01:CDS 35.0%
!! TGTCTTCAGCTCTAAAACAA+TGG - Chr6:88035334-88035353 None:intergenic 35.0%
!! TTGATGGACTTTGCAAATTG+GGG + Chr6:88036533-88036552 MsG0680034467.01.T01:CDS 35.0%
!!! ACAGAGGTTGAGTTTTGTTT+TGG - Chr6:88034786-88034805 None:intergenic 35.0%
!!! GTTTTGTTTTGGTCATGAGA+TGG - Chr6:88034775-88034794 None:intergenic 35.0%
AAGAGAAACACTAACCTCCA+AGG + Chr6:88034330-88034349 MsG0680034467.01.T01:intron 40.0%
AAGCAAAATTGAGGTGACCA+AGG - Chr6:88035712-88035731 None:intergenic 40.0%
ACATCAAAGGTTCCACATCT+AGG - Chr6:88034722-88034741 None:intergenic 40.0%
AGGTCTCTGTCTTAATGGTA+AGG + Chr6:88033632-88033651 MsG0680034467.01.T01:CDS 40.0%
ATAGATGAGATGCATGACAG+AGG + Chr6:88036580-88036599 MsG0680034467.01.T01:CDS 40.0%
ATCCAGTGACAAACAGATTC+CGG + Chr6:88035307-88035326 MsG0680034467.01.T01:CDS 40.0%
ATGACGATGTTAGAGCTAAG+GGG + Chr6:88033676-88033695 MsG0680034467.01.T01:CDS 40.0%
ATGTTGGGATTCTTCAACGA+AGG + Chr6:88035274-88035293 MsG0680034467.01.T01:CDS 40.0%
CAACTCAACATCATCTTGAG+AGG - Chr6:88034494-88034513 None:intergenic 40.0%
CAATTGCCTTGTCAACTTGA+TGG - Chr6:88036660-88036679 None:intergenic 40.0%
CATCAAAGGTTCCACATCTA+GGG - Chr6:88034721-88034740 None:intergenic 40.0%
CATGACGATGTTAGAGCTAA+GGG + Chr6:88033675-88033694 MsG0680034467.01.T01:CDS 40.0%
CGTCATCGTTCTTAAGGTTA+AGG + Chr6:88033235-88033254 MsG0680034467.01.T01:CDS 40.0%
GAAGTCAAATGCATCCCATA+TGG - Chr6:88034872-88034891 None:intergenic 40.0%
GACAGATGATAGCTTCTTAG+AGG - Chr6:88034584-88034603 None:intergenic 40.0%
GCATTACTGACGAAGATCAA+AGG + Chr6:88036679-88036698 MsG0680034467.01.T01:CDS 40.0%
GCTTTACCAATTTGTGATGC+AGG + Chr6:88034378-88034397 MsG0680034467.01.T01:intron 40.0%
TACTTGTGCAGCCTTAAAGA+TGG - Chr6:88034894-88034913 None:intergenic 40.0%
TCATGACGATGTTAGAGCTA+AGG + Chr6:88033674-88033693 MsG0680034467.01.T01:CDS 40.0%
TGGTTTATGTAAGGAAGGAG+AGG + Chr6:88036222-88036241 MsG0680034467.01.T01:CDS 40.0%
TGTCAATGAACGAAGGAAGA+GGG - Chr6:88033314-88033333 None:intergenic 40.0%
TGTGCCTAATCAAGTTATGG+AGG - Chr6:88034691-88034710 None:intergenic 40.0%
TTCAACACTATGGTTCGAAG+GGG + Chr6:88036370-88036389 MsG0680034467.01.T01:CDS 40.0%
TTGTCAATGAACGAAGGAAG+AGG - Chr6:88033315-88033334 None:intergenic 40.0%
! ACATATCTGGTTCAATTCCC+TGG - Chr6:88036705-88036724 None:intergenic 40.0%
! CAATCTTTCTAAGAACCTGC+AGG - Chr6:88033773-88033792 None:intergenic 40.0%
! GTGAAGTTGTCCTAAGGTTT+TGG - Chr6:88034963-88034982 None:intergenic 40.0%
! TTTGATGGATGGGTGTTTCT+TGG + Chr6:88036318-88036337 MsG0680034467.01.T01:CDS 40.0%
!! ACACTGTAGCTTTGAACATC+AGG - Chr6:88036403-88036422 None:intergenic 40.0%
!! GGTTAATGGGCTTTGTAAAG+AGG + Chr6:88036846-88036865 MsG0680034467.01.T01:CDS 40.0%
!! GGTTTGGTGTATTCTAGGAT+AGG - Chr6:88034629-88034648 None:intergenic 40.0%
!! GTTGATGGACTCTGCAAAAA+TGG + Chr6:88036742-88036761 MsG0680034467.01.T01:CDS 40.0%
CACACTTTACTCCCTAGATG+TGG + Chr6:88034707-88034726 MsG0680034467.01.T01:intron 45.0%
CTCGTATTACTTTGGGTCCT+TGG - Chr6:88034350-88034369 None:intergenic 45.0%
CTTCGCGTAATGATTGCTAG+AGG + Chr6:88037000-88037019 MsG0680034467.01.T01:CDS 45.0%
GATCCAGATGTTCCTGATGA+TGG - Chr6:88035012-88035031 None:intergenic 45.0%
GGTGATGTGAAGTTGTCCTA+AGG - Chr6:88034969-88034988 None:intergenic 45.0%
GTATTACTTTGGGTCCTTGG+AGG - Chr6:88034347-88034366 None:intergenic 45.0%
TCCAGTGACAAACAGATTCC+GGG + Chr6:88035308-88035327 MsG0680034467.01.T01:CDS 45.0%
!! CTGGCCAAGATTTTCAAGCT+AGG + Chr6:88033570-88033589 MsG0680034467.01.T01:CDS 45.0%
!! TCAGCTCTAAAACAATGGCC+CGG - Chr6:88035329-88035348 None:intergenic 45.0%
!!! TTTTATAAAAAAAAACATAT+AGG - Chr6:88034158-88034177 None:intergenic 5.0%
ACTGACGAAGATCAAAGGCC+AGG + Chr6:88036684-88036703 MsG0680034467.01.T01:CDS 50.0%
ATGCCAACTCCTCCATCATC+AGG + Chr6:88034997-88035016 MsG0680034467.01.T01:intron 50.0%
ATGCTACAATATCGGGAGCC+AGG - Chr6:88036501-88036520 None:intergenic 50.0%
CCTCCATCATCAGGAACATC+TGG + Chr6:88035006-88035025 MsG0680034467.01.T01:intron 50.0%
CTGACGAAGATCAAAGGCCA+GGG + Chr6:88036685-88036704 MsG0680034467.01.T01:CDS 50.0%
GAGGAGTTGGCATGTTGAAG+TGG - Chr6:88034990-88035009 None:intergenic 50.0%
GCTGCACAAGTATCCCTAGA+AGG + Chr6:88034902-88034921 MsG0680034467.01.T01:intron 50.0%
!! CCAGATGTTCCTGATGATGG+AGG - Chr6:88035009-88035028 None:intergenic 50.0%
!! GTTCCTGATGATGGAGGAGT+TGG - Chr6:88035003-88035022 None:intergenic 50.0%
AGAAACAAGAGCTGCCCTGC+AGG + Chr6:88033755-88033774 MsG0680034467.01.T01:CDS 55.0%
CACTATGGTTCGAAGGGGAG+TGG + Chr6:88036375-88036394 MsG0680034467.01.T01:CDS 55.0%
GCCCGGAATCTGTTTGTCAC+TGG - Chr6:88035312-88035331 None:intergenic 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 88033231 88037032 88033231 ID=MsG0680034467.01;Name=MsG0680034467.01
Chr6 mRNA 88033231 88037032 88033231 ID=MsG0680034467.01.T01;Parent=MsG0680034467.01;Name=MsG0680034467.01.T01;_AED=0.13;_eAED=0.13;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|779
Chr6 exon 88033231 88033807 88033231 ID=MsG0680034467.01.T01:exon:18352;Parent=MsG0680034467.01.T01
Chr6 exon 88035270 88037032 88035270 ID=MsG0680034467.01.T01:exon:18353;Parent=MsG0680034467.01.T01
Chr6 CDS 88033231 88033807 88033231 ID=MsG0680034467.01.T01:cds;Parent=MsG0680034467.01.T01
Chr6 CDS 88035270 88037032 88035270 ID=MsG0680034467.01.T01:cds;Parent=MsG0680034467.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680034467.01.T01

ATGTCGTCATCGTTCTTAAGGTTAAGGTACGCAACTCTCTCTTTTCGTTCTACACAGCCAATTCGTTGTTTACACGTTCACCCTCTTCCTTCGTTCATTGACAATGTTGATGACGCTGTTTCTTCATTCAATCGCATCCTTCATATGAACAACCCTAAACAACCCATCTTTGAATTTAACAAGATCTTATCTTCTCTTGTTAAGTTGAATCATTACCCAACTGCTATTTCATTTTCTCAAAAAATGGAACTCAAAGGAATTCAACTTGATATTTTTACTTTAGCCATTTTGATTAATTGTTTCTGTCACGTTGGTCACCTCAATTTTGCGTTTTCTATGCTGGCCAAGATTTTCAAGCTAGGTTTTCAGCCTGATACTGTAACAATCAATACACTTATCAAAGGTCTCTGTCTTAATGGTAAGGTTAGGGATGCCCTTAACTTTCATGACGATGTTAGAGCTAAGGGGTTTCACCTTGATCAGTTTAGTTATGCCATCTTAATTGATGGATTATGTAAATCTGGAGAAACAAGAGCTGCCCTGCAGGTTCTTAGAAAGATTGAAGAGAAATTTGTTGACTTATGTTGGGATTCTTCAACGAAGGATCAATTCTTATCCAGTGACAAACAGATTCCGGGCCATTGTTTTAGAGCTGAAGACAAAATCTCATTCAATCATTCATTCATTCATTCTCTCACAAAATCAATAATGTCGTCATCGTTCTTAAGGTTAAGGTACGCAACTCTCTCTTTTCGTTCTACACAGCCAATTCGTTGTTTACACGTTCACCCTCTTCCTTCGTTCATTGACAATGTTGATGACGCTGTTTCTTCATTCAATCGCATCCTTCATATGAACAACCCTAAACAACCCATCTTTGAATTTAACAAGATCTTATCTTCTCTTGTTAAGTTGAATCATTACCCAACTGCTATTTCATTTTCTCAAAAAATGGAACTCAAAGGAATTCAACCTGATATTTTTACTTTAGCCATTTTGATTAATTGTTTCTGTCACCTTGGTCACCTCAATTTTGCTTTTTCTATGCTGGCCAAGATTTTCAAGCTAGGTTTTCAGCCTGATACTGTAACAATCAATACACTTATCAAAGGTCTATGTCTTAATGGTAAGGTTAGGGATGCCCTTAACTTTCATGACGATGTTAGAGCTAAGGGGTTTCACCTTGATCAGTTTAGTTATGCCATCTTAATTGATGGATTATGTAAATCTGGAGAAACAAGAGCTGCCCTGCAGGTTCTTAGAAAGATTGAAGAGAAATTTGTTGGTCCTAATGTAGTAATGTTCAACACAATTATGGATAGTTTGTGCAAGGATAAACTTGTAATTGATGCTTGTGATTTATATTCTCAAATGCTTCTCAAGAGAATTTCTCCTGATGTTATCACTTACAATACTTTAATATATGGATTTTGTATTGTGGGTCAATTCAAAGAAGCCATTGATATGCTAAATGGCATGCTCATGAAAAACATCAGCCCAAATGTTCATACTTTTAACACATTGGTTGATGGTTTATGTAAGGAAGGAGAGGTGAAAAAAGCTAGAAATGTGTTAGCAGTATTGATAAAACAAGGTGTGGAACCTAATGTTGTTACTTATACTTCTTTGATGGATGGGTGTTTCTTGGTTAAAGAAGTGAACAAGGCCACATATCTATTCAACACTATGGTTCGAAGGGGAGTGGCTCCTGATGTTCAAAGCTACAGTGTCATGATAAATGGATTATGTAAGAATAAAATGGTGGATGAAGCCGTCAATCTCTTCAAAGAATTGCATATAAAAAACCTGGCTCCCGATATTGTAGCATACAGTTCACTTATTGATGGACTTTGCAAATTGGGGAAAATATCTGATGTTTTGGAACTTATAGATGAGATGCATGACAGAGGTCAACAAGCCAACATAATTACTTATAGTTCTTTATTAGATGCGTTGTTCAAAAACCATCAAGTTGACAAGGCAATTGCATTACTGACGAAGATCAAAGGCCAGGGAATTGAACCAGATATGTTTACATACACAATACTTGTTGATGGACTCTGCAAAAATGGAAGACTTAAGGATGCACAAAATGTATATCAGGATCTTCTGATGAAGGGTTATAATTTAGATGTTAGGATGTATAATGCGATGGTTAATGGGCTTTGTAAAGAGGGTCTGTTAGATGAAGCATTGTGCTTACTGCCAAAAATGGAAGAAAATGGTTGCACCCCTGATGCTGTTACTTATGAAACTCTTATTCATGCTATGTTCCGAAATGATAAGAATGATAAGGCGATGAAACTTCTTCGCGTAATGATTGCTAGAGGTCTACTATGA
Protein sequence

>MsG0680034467.01.T01

MSSSFLRLRYATLSFRSTQPIRCLHVHPLPSFIDNVDDAVSSFNRILHMNNPKQPIFEFNKILSSLVKLNHYPTAISFSQKMELKGIQLDIFTLAILINCFCHVGHLNFAFSMLAKIFKLGFQPDTVTINTLIKGLCLNGKVRDALNFHDDVRAKGFHLDQFSYAILIDGLCKSGETRAALQVLRKIEEKFVDLCWDSSTKDQFLSSDKQIPGHCFRAEDKISFNHSFIHSLTKSIMSSSFLRLRYATLSFRSTQPIRCLHVHPLPSFIDNVDDAVSSFNRILHMNNPKQPIFEFNKILSSLVKLNHYPTAISFSQKMELKGIQPDIFTLAILINCFCHLGHLNFAFSMLAKIFKLGFQPDTVTINTLIKGLCLNGKVRDALNFHDDVRAKGFHLDQFSYAILIDGLCKSGETRAALQVLRKIEEKFVGPNVVMFNTIMDSLCKDKLVIDACDLYSQMLLKRISPDVITYNTLIYGFCIVGQFKEAIDMLNGMLMKNISPNVHTFNTLVDGLCKEGEVKKARNVLAVLIKQGVEPNVVTYTSLMDGCFLVKEVNKATYLFNTMVRRGVAPDVQSYSVMINGLCKNKMVDEAVNLFKELHIKNLAPDIVAYSSLIDGLCKLGKISDVLELIDEMHDRGQQANIITYSSLLDALFKNHQVDKAIALLTKIKGQGIEPDMFTYTILVDGLCKNGRLKDAQNVYQDLLMKGYNLDVRMYNAMVNGLCKEGLLDEALCLLPKMEENGCTPDAVTYETLIHAMFRNDKNDKAMKLLRVMIARGLL*