AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580027119.01

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MsG0580027119.01.T01 AT3G22470 25.775 516 302 11 38 542 135 580 4.42e-38 151
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MsG0580027119.01.T01 AT3G53700 30.990 384 255 4 325 706 157 532 5.93e-53 197
MsG0580027119.01.T01 AT3G53700 24.046 524 329 13 38 542 219 692 9.40e-38 151
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MsG0580027119.01.T01 AT3G53700 24.883 426 245 12 31 453 388 741 8.47e-24 107
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MsG0580027119.01.T01 AT1G63230 29.167 312 216 2 322 632 10 317 1.34e-40 152
MsG0580027119.01.T01 AT1G63230 28.276 290 197 2 418 707 1 279 1.22e-33 132
MsG0580027119.01.T01 AT1G63230 28.682 258 173 2 455 712 3 249 7.59e-31 124
MsG0580027119.01.T01 AT1G63230 24.359 390 221 10 38 426 5 321 8.72e-24 103
MsG0580027119.01.T01 AT1G63230 21.127 355 233 6 169 523 5 312 7.85e-21 94.7
MsG0580027119.01.T01 AT1G63230 28.495 186 122 2 523 708 1 175 9.12e-17 82.8
MsG0580027119.01.T01 AT1G63230 25.095 263 125 7 20 219 43 296 3.55e-13 72.0
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MsG0580027119.01.T01 AT4G11690 30.396 227 108 5 23 219 290 496 6.98e-23 103
MsG0580027119.01.T01 AT4G11690 28.704 216 118 5 18 223 206 395 1.60e-20 96.7
MsG0580027119.01.T01 AT4G11690 22.066 426 261 11 44 468 172 527 2.29e-20 96.3
MsG0580027119.01.T01 AT4G11690 23.333 270 181 4 454 710 86 342 8.23e-16 82.0
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MsG0580027119.01.T01 AT2G02150 26.190 210 124 5 33 222 287 485 1.91e-15 81.3
MsG0580027119.01.T01 AT2G02150 25.000 448 305 3 313 729 288 735 7.29e-48 182
MsG0580027119.01.T01 AT2G02150 27.438 441 304 4 260 698 170 596 2.92e-45 174
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MsG0580027119.01.T01 AT5G57250 21.946 442 265 7 380 746 14 450 3.31e-19 93.6
MsG0580027119.01.T01 AT1G63630 32.567 261 169 1 445 705 9 262 9.58e-44 159
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MsG0580027119.01.T01 AT2G41720 18.356 365 262 3 316 644 251 615 8.73e-15 79.0
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MsG0580027119.01.T01 AT4G01400 30.052 193 105 5 28 219 177 340 9.78e-17 84.3
MsG0580027119.01.T01 AT4G01400 28.718 195 108 4 41 230 223 391 2.44e-16 83.2
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MsG0580027119.01.T01 AT1G20300 25.882 255 177 3 454 708 147 389 2.46e-19 92.8
MsG0580027119.01.T01 AT1G20300 18.962 443 262 12 10 423 158 532 6.02e-16 82.4
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MsG0580027119.01.T01 AT5G25630 19.792 576 355 16 7 564 40 526 4.45e-21 99.0
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MsG0580027119.01.T01 AT2G19280 25.161 310 230 2 311 619 362 670 1.16e-30 129
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MsG0580027119.01.T01 AT5G40400 25.824 182 109 3 38 219 231 386 4.59e-14 76.6
MsG0580027119.01.T01 AT5G40400 26.601 203 119 6 37 219 265 457 1.88e-13 74.7
MsG0580027119.01.T01 AT5G40400 25.140 358 260 2 353 709 303 653 4.73e-32 133
MsG0580027119.01.T01 AT5G40400 25.060 415 264 6 356 732 236 641 2.21e-30 128
MsG0580027119.01.T01 AT5G40400 24.251 367 240 5 316 644 300 666 4.49e-25 111
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MsG0580027119.01.T01 AT5G40400 25.824 182 109 3 38 219 302 457 4.22e-14 76.6
MsG0580027119.01.T01 AT5G40400 26.601 203 119 6 37 219 336 528 1.51e-13 75.1
MsG0580027119.01.T01 AT1G53330 28.269 283 167 2 354 635 149 396 4.74e-32 131
MsG0580027119.01.T01 AT1G53330 26.190 294 196 4 437 723 134 413 1.18e-28 120
MsG0580027119.01.T01 AT1G53330 24.194 310 232 3 325 632 155 463 1.31e-25 111
MsG0580027119.01.T01 AT1G53330 26.241 282 198 3 426 705 151 424 2.02e-22 102
MsG0580027119.01.T01 AT1G53330 27.624 181 104 4 41 220 185 339 5.90e-11 66.2
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MsG0580027119.01.T01 AT1G05600 26.766 269 155 7 356 583 225 492 9.86e-19 90.9
MsG0580027119.01.T01 AT1G05600 20.902 488 307 14 85 543 49 486 1.56e-17 87.0
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MsG0580027119.01.T01 AT4G34830 22.738 431 315 4 285 704 386 809 1.57e-23 107
MsG0580027119.01.T01 AT4G34830 23.843 281 210 2 325 602 540 819 2.08e-20 97.4
MsG0580027119.01.T01 AT4G34830 25.651 269 190 4 445 711 485 745 3.52e-18 90.5
MsG0580027119.01.T01 AT2G35130 20.856 374 254 4 341 714 270 601 1.71e-23 106
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MsG0580027119.01.T01 AT2G33680 21.799 289 209 5 361 644 128 404 3.24e-11 67.8
MsG0580027119.01.T01 AT3G25060 21.453 289 214 4 356 644 150 425 3.47e-11 67.4
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MsG0580027119.01.T01 AT3G08820 19.582 383 260 7 356 707 145 510 6.62e-11 66.6
MsG0580027119.01.T01 AT1G15510 19.767 430 289 6 311 705 251 659 4.94e-11 67.0
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MsG0580027119.01.T01 AT2G01510 19.572 327 247 6 322 644 74 388 5.13e-11 66.6
MsG0580027119.01.T01 AT1G34160 22.896 297 204 9 392 688 66 337 5.66e-11 66.2
MsG0580027119.01.T01 AT4G21170 19.412 340 266 6 315 647 246 584 6.60e-11 66.2
MsG0580027119.01.T01 AT1G80150 29.710 138 87 2 461 593 176 308 6.65e-11 65.1

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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GTATTAATTGTTACAGTATT+AGG 0.185874 5:+53979429 None:intergenic
ACTTACAATACTTTAATATA+TGG 0.216075 5:-53972641 MsG0580027119.01.T01:CDS
ATTGATGGATTATGTAAAAT+AGG 0.220362 5:-53979285 MsG0580027119.01.T01:CDS
TTTACATGCATCTCTTTAAT+TGG 0.236410 5:-53968781 MsG0580027119.01.T01:CDS
ATCAAAGGTCTATGTCTTAA+TGG 0.244181 5:-53972941 MsG0580027119.01.T01:CDS
TGTTACTTATAATTCTTTAA+TGG 0.244852 5:-53972435 MsG0580027119.01.T01:CDS
TGTCTTAATGGTAATGTTAA+TGG 0.246938 5:-53979390 MsG0580027119.01.T01:CDS
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ATCAAAGGTCTCTGTCTTAA+TGG 0.257062 5:-53979402 MsG0580027119.01.T01:CDS
ATTTACTTTCTTCACCTTCT+AGG 0.258603 5:+53980279 None:intergenic
GTTTGAAAAGTTACAGCATT+AGG 0.265416 5:+53977609 None:intergenic
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ATTGACGGATTATGTAAAAT+AGG 0.276999 5:-53972836 MsG0580027119.01.T01:CDS
CTCGTGTATTTGACCTTGTA+TGG 0.283582 5:-53968155 MsG0580027119.01.T01:CDS
ACGAATTGGAAAACACAAAT+TGG 0.288692 5:+53973294 None:intergenic
ACACTATAGCTTTGAACATT+AGG 0.292716 5:+53972338 None:intergenic
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GTAGTCAAGGTTATAGTATC+AGG 0.306818 5:+53972968 None:intergenic
CGGATTATCTAAGAATAAAA+TGG 0.307704 5:-53972306 MsG0580027119.01.T01:intron
TTTAATGGATGGGTGTTTCT+TGG 0.313985 5:-53972420 MsG0580027119.01.T01:CDS
GAAGCCATTGATATGCTAAA+TGG 0.318158 5:-53972593 MsG0580027119.01.T01:CDS
AGTAATGTACAACACTATTA+TGG 0.319394 5:-53972750 MsG0580027119.01.T01:CDS
AATTCAAAGATGGGCTGAAT+AGG 0.323243 5:+53973184 None:intergenic
TATTAATTGTTACAGTATTA+GGG 0.323302 5:+53979430 None:intergenic
TTTGAAAAGTTACAGCATTA+GGG 0.323750 5:+53977610 None:intergenic
ACAGCTGCCCTGCAGGTTCT+TGG 0.325437 5:-53972806 MsG0580027119.01.T01:CDS
TTGCTGACATGGGATGGTTT+TGG 0.334031 5:-53974058 MsG0580027119.01.T01:CDS
AAAATTGTTGAGTTGCCATA+TGG 0.344007 5:-53980341 MsG0580027119.01.T01:CDS
AGCTATAGTGTTATGATTAA+CGG 0.354517 5:-53972326 MsG0580027119.01.T01:CDS
CACATATGTATTTAATACTA+TGG 0.357267 5:-53972378 MsG0580027119.01.T01:CDS
TGTGTTAAAAGTCGAACATT+TGG 0.358310 5:+53978998 None:intergenic
GTGCTGTACATTACTACATT+AGG 0.366542 5:+53979207 None:intergenic
TATGTCTTAATGGTAAGGTT+AGG 0.368842 5:-53972931 MsG0580027119.01.T01:CDS
ATACATGATTGATTCTTGTT+TGG 0.371485 5:-53980375 MsG0580027119.01.T01:CDS
GTTTCGTAAGTTACAACATC+AGG 0.377795 5:+53971822 None:intergenic
GTGTTAAAAGTCGAACATTT+GGG 0.378005 5:+53978999 None:intergenic
AGTTATGCCATCTTAATTGA+TGG 0.379024 5:-53979300 MsG0580027119.01.T01:CDS
GTAATGTTAATGGTAAGGTT+AGG 0.383003 5:-53979380 MsG0580027119.01.T01:CDS
ATTCAAAGATGGGCTGAATA+GGG 0.394317 5:+53973185 None:intergenic
TACATACACATACTTGTTGA+TGG 0.396018 5:-53972017 MsG0580027119.01.T01:CDS
ATGCTTTGTTTGAAAGCAAC+TGG 0.396397 5:-53977578 MsG0580027119.01.T01:intron
TGTTGATGGACTATGCAAAA+TGG 0.402078 5:-53972003 MsG0580027119.01.T01:CDS
GAAATAGCATCATCAACATT+AGG 0.403259 5:+53973238 None:intergenic
GTGTTAAAAGTACGAACATT+TGG 0.405364 5:+53972548 None:intergenic
GTCTTCCATTTCTGACAGTA+AGG 0.410836 5:+53977644 None:intergenic
TTTACTTTCTTCACCTTCTA+GGG 0.419890 5:+53980280 None:intergenic
TGGTTCGAGTGCACTTGTTA+TGG 0.420702 5:-53968829 MsG0580027119.01.T01:CDS
CATGACAATGTCATAGCAAA+GGG 0.423491 5:-53972893 MsG0580027119.01.T01:CDS
AATTAGGTTTACTACAAATC+CGG 0.432428 5:-53968341 MsG0580027119.01.T01:intron
ACTTATAATTCTTTAATGGA+TGG 0.436882 5:-53972431 MsG0580027119.01.T01:CDS
CATGACGATGTTAGAGCTAA+GGG 0.437591 5:-53979342 MsG0580027119.01.T01:CDS
ACATAATCCGTCAATTAAGA+TGG 0.437886 5:+53972844 None:intergenic
AAAGCTAAAGGTTGTATTGA+AGG 0.441116 5:-53968863 MsG0580027119.01.T01:CDS
ACATAATCCATCAATTAAGA+TGG 0.443570 5:+53979293 None:intergenic
TAAGGGGTTTCACCTTGATC+AGG 0.445188 5:-53979325 MsG0580027119.01.T01:CDS
TGAACATGTAATCGACGAAT+TGG 0.447817 5:+53973280 None:intergenic
AGTTATGCCATCTTAATTGA+CGG 0.449236 5:-53972851 MsG0580027119.01.T01:CDS
ATGTATAATGTGATGGTTGA+TGG 0.452369 5:-53977702 MsG0580027119.01.T01:CDS
CTTATAATTCTTTAATGGAT+GGG 0.454719 5:-53972430 MsG0580027119.01.T01:CDS
AAAACCTAGCTTGAGAATCT+TGG 0.454720 5:+53972994 None:intergenic
TATTATGGATAGTTTATGTA+AGG 0.459971 5:-53972735 MsG0580027119.01.T01:CDS
ATTGGTCGATGGTTTATGTA+AGG 0.462950 5:-53972525 MsG0580027119.01.T01:CDS
AATGTCCTTACTGTCAGAAA+TGG 0.465806 5:-53977649 MsG0580027119.01.T01:CDS
CAATCTTTCCAAGAACCTGC+AGG 0.466545 5:+53972798 None:intergenic
ACATATCCGGCTGAATTCCT+TGG 0.472345 5:+53972041 None:intergenic
CATGCCATTTAGCATATCAA+TGG 0.473690 5:+53972589 None:intergenic
TAATGGTAATGTTAATGGTA+AGG 0.474667 5:-53979385 MsG0580027119.01.T01:CDS
TACTATGCTCAGTTACAGCT+TGG 0.479037 5:+53968885 None:intergenic
TGAAAGAACAGCTGCCCTGC+AGG 0.482953 5:-53972813 MsG0580027119.01.T01:CDS
GGATTCAAATGCATCCCATA+TGG 0.486997 5:+53980326 None:intergenic
ATCAATCATGTATTGAAGCA+TGG 0.488597 5:+53980385 None:intergenic
TATGTGTATGTATACATATC+CGG 0.490939 5:+53972028 None:intergenic
ATGAATGATGCGATTGAAAG+AGG 0.494407 5:+53973216 None:intergenic
ATGTCTTAATGGTAAGGTTA+GGG 0.494857 5:-53972930 MsG0580027119.01.T01:CDS
TAATGTTAATGGTAAGGTTA+GGG 0.498029 5:-53979379 MsG0580027119.01.T01:CDS
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TCATGACGATGTTAGAGCTA+AGG 0.502819 5:-53979343 MsG0580027119.01.T01:CDS
GTCGATGGTTTATGTAAGGA+AGG 0.511591 5:-53972521 MsG0580027119.01.T01:CDS
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TGGCATAACTAAACTGATCA+AGG 0.512307 5:+53972864 None:intergenic
TACTTGTGCAGCCTTAAAGA+TGG 0.513300 5:+53980304 None:intergenic
AGGTCTATGTCTTAATGGTA+AGG 0.514774 5:-53972936 MsG0580027119.01.T01:CDS
ATTGCGTTAGTTACAATCTG+TGG 0.521163 5:-53976745 MsG0580027119.01.T01:CDS
TATATATGGATTTCGTATGG+TGG 0.521929 5:-53979077 MsG0580027119.01.T01:CDS
ATGTACGAATGCCTGCCAAC+TGG 0.524080 5:-53976769 MsG0580027119.01.T01:CDS
CAAAATTGAGGTGACCCAAA+TGG 0.524179 5:+53973032 None:intergenic
CGAAAACGACAAGAATGATA+AGG 0.526016 5:-53971781 MsG0580027119.01.T01:CDS
AGTTGCTTTCAAACAAAGCA+TGG 0.528733 5:+53977580 None:intergenic
ACCTTTGATAAGTGTAGTCA+AGG 0.529791 5:+53972955 None:intergenic
TTGGCCAAGATTCTCAAGCT+AGG 0.532129 5:-53972998 MsG0580027119.01.T01:CDS
GTTGATGGGCTTTGTAAAGA+GGG 0.534622 5:-53977687 MsG0580027119.01.T01:CDS
CACAGTCAGCAGCTGCCACA+TGG 0.535282 5:+53974035 None:intergenic
ATATATGGATTTCGTATGGT+GGG 0.537000 5:-53979076 MsG0580027119.01.T01:CDS
CTTGGTTAAAGAAGTGAACA+AGG 0.544300 5:-53972402 MsG0580027119.01.T01:CDS
TGAAACAAGATCTGCCATGC+AGG 0.548439 5:-53979262 MsG0580027119.01.T01:CDS
ATGTTGAAAGTAAATAAGTC+AGG 0.549100 5:+53973073 None:intergenic
CTATGCAAAATGGAAGACTA+AGG 0.549553 5:-53971993 MsG0580027119.01.T01:CDS
AAGCTAAAGGTTGTATTGAA+GGG 0.551406 5:-53968862 MsG0580027119.01.T01:CDS
TCAATCATGTATTGAAGCAT+GGG 0.552698 5:+53980386 None:intergenic
GTGTTGTACATTACTACGTC+AGG 0.552733 5:+53972758 None:intergenic
TGGCATAACTAACCTGATCA+AGG 0.553302 5:+53979313 None:intergenic
TCGTGTATTTGACCTTGTAT+GGG 0.553665 5:-53968154 MsG0580027119.01.T01:CDS
AAATTGTTGAGTTGCCATAT+GGG 0.554731 5:-53980340 MsG0580027119.01.T01:CDS
ACTTGTGCAGCCTTAAAGAT+GGG 0.555351 5:+53980305 None:intergenic
TATTGAAGGGTATCGTGTGT+TGG 0.557006 5:-53968849 MsG0580027119.01.T01:CDS
TTGCGTTAGTTACAATCTGT+GGG 0.558054 5:-53976744 MsG0580027119.01.T01:intron
CTTCTCAAGAGAATTTCTCC+TGG 0.562238 5:-53972671 MsG0580027119.01.T01:CDS
CTTCTCAAGAGAATTTCTCC+TGG 0.562238 5:-53979121 MsG0580027119.01.T01:intron
GGTTGATGGGCTTTGTAAAG+AGG 0.565501 5:-53977688 MsG0580027119.01.T01:CDS
ACTGAGCATAGTAAAGCTAA+AGG 0.566188 5:-53968875 MsG0580027119.01.T01:CDS
CATAGTATTAAATACATATG+TGG 0.567576 5:+53972379 None:intergenic
AAAAGTGAAACCAAAAGAGC+CGG 0.575488 5:+53968271 None:intergenic
TGTATAATGTGATGGTTGAT+GGG 0.575642 5:-53977701 MsG0580027119.01.T01:CDS
TTAGGAATGAATGAAGGAAG+AGG 0.575745 5:+53973256 None:intergenic
CTAACGCAATACCAGTTGGC+AGG 0.575749 5:+53976758 None:intergenic
CTATATTATTCAGATTAACA+AGG 0.576524 5:-53973333 MsG0580027119.01.T01:intron
TCATGACAATGTCATAGCAA+AGG 0.579031 5:-53972894 MsG0580027119.01.T01:CDS
CATGTCATTTAACATATCGA+TGG 0.579269 5:+53979039 None:intergenic
TCAACATTAGGAATGAATGA+AGG 0.586623 5:+53973250 None:intergenic
TTTCGTAAGTTACAACATCA+GGG 0.587168 5:+53971823 None:intergenic
TTGAAAAGTTACAGCATTAG+GGG 0.589014 5:+53977611 None:intergenic
GACATTGTCATGAAAGTGAA+GGG 0.589318 5:+53972904 None:intergenic
ACCTTGTATGGGATACTACA+CGG 0.590165 5:-53968143 MsG0580027119.01.T01:CDS
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ACCTTGACTACACTTATCAA+AGG 0.595993 5:-53972956 MsG0580027119.01.T01:CDS
TAGTCAAGGTTATAGTATCA+GGG 0.602493 5:+53972969 None:intergenic
CTTCGTGAAATGATTGCTAG+AGG 0.606300 5:-53971747 MsG0580027119.01.T01:intron
TCCGTGTAGTATCCCATACA+AGG 0.609119 5:+53968142 None:intergenic
TGACATTGTCATGAAAGTGA+AGG 0.611616 5:+53972903 None:intergenic
TACTATGGCTCAAAGAGGAG+TGG 0.611621 5:-53972363 MsG0580027119.01.T01:CDS
TAACATCGTCATGAAAGTGA+AGG 0.614056 5:+53979352 None:intergenic
TGGTTTATGTAAGGAAGGAG+AGG 0.614463 5:-53972516 MsG0580027119.01.T01:CDS
GTAATGATTCAACTTAGCAA+GGG 0.614723 5:+53973144 None:intergenic
AATCTTTCCAAGAACCTGCA+GGG 0.616936 5:+53972799 None:intergenic
GAATTATAAGTAACAACACT+AGG 0.619481 5:+53972443 None:intergenic
TGTTCAAATGTATAATGTGA+TGG 0.619639 5:-53977709 MsG0580027119.01.T01:CDS
TGTTATGATAAAACAAGATG+TGG 0.621828 5:-53972468 MsG0580027119.01.T01:CDS
AACATCGTCATGAAAGTGAA+GGG 0.624454 5:+53979353 None:intergenic
AATCTTTCTAAGAACCTGCA+TGG 0.629515 5:+53979248 None:intergenic
TTTAATACTATGGCTCAAAG+AGG 0.631408 5:-53972368 MsG0580027119.01.T01:CDS
TTCGTAAGTTACAACATCAG+GGG 0.646940 5:+53971824 None:intergenic
CTGTCAGAAATGGAAGACAA+TGG 0.647181 5:-53977639 MsG0580027119.01.T01:CDS
GAAGACTAAGGATGCACAAG+CGG 0.648678 5:-53971981 MsG0580027119.01.T01:intron
ATGACGATGTTAGAGCTAAG+GGG 0.655423 5:-53979341 MsG0580027119.01.T01:CDS
GTAACTAACGCAATACCAGT+TGG 0.657896 5:+53976754 None:intergenic
GTATTGTAAGTGATAACACC+AGG 0.683845 5:+53972653 None:intergenic
GTATTGTAAGTGATAACACC+AGG 0.683845 5:+53979103 None:intergenic
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AAACGACAAGAATGATAAGG+CGG 0.706448 5:-53971778 MsG0580027119.01.T01:CDS
CATACAAGGTCAAATACACG+AGG 0.711326 5:+53968156 None:intergenic
AAATGACATAGACTGCCATG+TGG 0.742043 5:+53974003 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
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! TTGATAGAAATAAAGGGAAT+GGG + Chr5:53977491-53977510 None:intergenic 25.0%
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AGTTATGCCATCTTAATTGA+TGG - Chr5:53969208-53969227 MsG0580027119.01.T01:intron 30.0%
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TTTCTTGCGTCTTATAGAAA+AGG - Chr5:53977524-53977543 MsG0580027119.01.T01:intron 30.0%
! AAAATTGTTGAGTTGCCATA+TGG - Chr5:53968167-53968186 MsG0580027119.01.T01:CDS 30.0%
! AAATTGTTGAGTTGCCATAT+GGG - Chr5:53968168-53968187 MsG0580027119.01.T01:intron 30.0%
! AACTCTTATTTGTGCTAGTT+TGG - Chr5:53970250-53970269 MsG0580027119.01.T01:intron 30.0%
! AAGAAACAAAAGTGCAGAAA+CGG + Chr5:53972277-53972296 None:intergenic 30.0%
! AATTCAAAGATGGGTTTAGT+AGG + Chr5:53968865-53968884 None:intergenic 30.0%
! ACATGTTATATGATTGGTTG+GGG - Chr5:53972909-53972928 MsG0580027119.01.T01:CDS 30.0%
! ATCTGCTTCATCAATTTTCA+AGG - Chr5:53977031-53977050 MsG0580027119.01.T01:intron 30.0%
! ATTCAAAGATGGGTTTAGTA+GGG + Chr5:53968864-53968883 None:intergenic 30.0%
! ATTTCAGAGTATCCTAATAG+TGG - Chr5:53978718-53978737 MsG0580027119.01.T01:intron 30.0%
! CAAAACCTTTTCTTCCATTT+TGG + Chr5:53970206-53970225 None:intergenic 30.0%
! CATGTCATTTAACATATCGA+TGG + Chr5:53969472-53969491 None:intergenic 30.0%
! GATCACATTATACTTGTTGA+TGG - Chr5:53970701-53970720 MsG0580027119.01.T01:intron 30.0%
! GTGTTAAAAGTACGAACATT+TGG + Chr5:53975963-53975982 None:intergenic 30.0%
! TACATACACATACTTGTTGA+TGG - Chr5:53976491-53976510 MsG0580027119.01.T01:intron 30.0%
! TCATACACAATACTTGTTGA+TGG - Chr5:53970034-53970053 MsG0580027119.01.T01:intron 30.0%
! TGTTCGTACTTTTAACACAT+TGG - Chr5:53975965-53975984 MsG0580027119.01.T01:intron 30.0%
! TTTTTCCCTGAGTATACAAT+GGG - Chr5:53973403-53973422 MsG0580027119.01.T01:intron 30.0%
!! ACACTATAGCTTTGAACATT+AGG + Chr5:53976173-53976192 None:intergenic 30.0%
!! AGGAATTTTCAGGATTTTGA+AGG - Chr5:53974756-53974775 MsG0580027119.01.T01:intron 30.0%
!! AGTTGATGAAAAGGAAGTTT+CGG - Chr5:53973446-53973465 MsG0580027119.01.T01:intron 30.0%
!! CATCTCTTTAATTGGTGTTT+TGG - Chr5:53979735-53979754 MsG0580027119.01.T01:intron 30.0%
!! CTGAGAATTTTAATCTTGGA+AGG - Chr5:53978782-53978801 MsG0580027119.01.T01:intron 30.0%
!! GATTAATTGTTTCTGCCATT+TGG - Chr5:53975461-53975480 MsG0580027119.01.T01:intron 30.0%
!! TATTGATGGACTTTGCAAAT+CGG - Chr5:53976297-53976316 MsG0580027119.01.T01:intron 30.0%
!! TCGGTTTTTGTTGTATTTCT+TGG - Chr5:53972463-53972482 MsG0580027119.01.T01:CDS 30.0%
!! TTATTGATGGACTTTGCAAT+CGG - Chr5:53969844-53969863 MsG0580027119.01.T01:intron 30.0%
!! TTGGTTCTAACAAAGCAATT+AGG + Chr5:53980286-53980305 None:intergenic 30.0%
!! TTTCAAAACCTTTTTCGCAT+GGG + Chr5:53973024-53973043 None:intergenic 30.0%
!! TTTTCAAAACCTTTTTCGCA+TGG + Chr5:53973025-53973044 None:intergenic 30.0%
!!! CAATTTTGCTTTTTCTATGC+TGG - Chr5:53969030-53969049 MsG0580027119.01.T01:intron 30.0%
!!! CTTTTTTGAAGGAATGTGTT+AGG + Chr5:53978042-53978061 None:intergenic 30.0%
!!! TAGCTAGTTTTGGAGTATTT+TGG - Chr5:53977805-53977824 MsG0580027119.01.T01:intron 30.0%
!!! TGGAGTATTTTGGTTCATTT+TGG - Chr5:53977815-53977834 MsG0580027119.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTTTTCCCTGAGTATACAA+TGG - Chr5:53973402-53973421 MsG0580027119.01.T01:intron 30.0%
AAAACCTAGCTTGAGAATCT+TGG + Chr5:53975517-53975536 None:intergenic 35.0%
AAAAGGGCTGAGAATTGAAT+TGG + Chr5:53979473-53979492 None:intergenic 35.0%
AAAAGTGAAACCAAAAGAGC+CGG + Chr5:53972517-53972536 None:intergenic 35.0%
AAACGACAAGAATGATAAGG+CGG - Chr5:53976730-53976749 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
AAAGGGCTGAGAATTGAATT+GGG + Chr5:53979472-53979491 None:intergenic 35.0%
AACAATAGAGTCCATCAGTT+AGG + Chr5:53979547-53979566 None:intergenic 35.0%
AACATCGTCATGAAAGTGAA+GGG + Chr5:53969158-53969177 None:intergenic 35.0%
AACTTAGTGTATGTCTTGGA+CGG - Chr5:53978822-53978841 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
AAGCTTCTTGTATCCAAAGT+AGG - Chr5:53978750-53978769 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
AAGGGTGATGTCAACAATAA+TGG + Chr5:53971455-53971474 None:intergenic 35.0%
AAGGTTTCACATAGTGTCTA+AGG + Chr5:53978862-53978881 None:intergenic 35.0%
AAGTAAATTGGACTGTGCAA+TGG - Chr5:53971013-53971032 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
AATGTCCTTACTGTCAGAAA+TGG - Chr5:53970859-53970878 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
ACATACACTAAGTTTGTCTG+AGG + Chr5:53978816-53978835 None:intergenic 35.0%
ACCTTGACTACACTTATCAA+AGG - Chr5:53975552-53975571 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
ACCTTTGATAAGTGTAGTCA+AGG + Chr5:53975556-53975575 None:intergenic 35.0%
ACTGAGCATAGTAAAGCTAA+AGG - Chr5:53979633-53979652 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
ACTGTTCTCACTTTCATCAA+GGG - Chr5:53977458-53977477 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
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AGATTCACAACCAAAACCTT+AGG - Chr5:53968263-53968282 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
AGCTACACTGTCATGATTAA+TGG - Chr5:53969728-53969747 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
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AGGTCTATGTCTTAATGGTA+AGG - Chr5:53975572-53975591 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
AGGTTTCACATAGTGTCTAA+GGG + Chr5:53978861-53978880 None:intergenic 35.0%
AGTAAACCTTAACAATGCCA+TGG + Chr5:53973170-53973189 None:intergenic 35.0%
AGTAACAAAAAGAGGGTTGT+TGG + Chr5:53977559-53977578 None:intergenic 35.0%
ATACCTAGCCAGTTGTAAAA+GGG - Chr5:53978374-53978393 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
ATAGCACCAAATCATGAAAC+AGG + Chr5:53971543-53971562 None:intergenic 35.0%
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ATCCAGGTATGATCGAATAA+CGG + Chr5:53973137-53973156 None:intergenic 35.0%
ATCGGGAAAATATCGATGTT+TGG - Chr5:53969862-53969881 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
ATCTGCTACTCAAAAAGACA+AGG + Chr5:53978881-53978900 None:intergenic 35.0%
ATCTGTGGGTAATCATATAC+TGG - Chr5:53971778-53971797 MsG0580027119.01.T01:CDS 35.0%
ATGAAGCAATTTGTGGATAG+AGG - Chr5:53977653-53977672 MsG0580027119.01.T01:CDS 35.0%
ATGAAGGATGCTATTGAATG+AGG + Chr5:53968833-53968852 None:intergenic 35.0%
ATGAATGATGCGATTGAAAG+AGG + Chr5:53975295-53975314 None:intergenic 35.0%
ATGACAATGTCATAGCAAAG+GGG - Chr5:53975616-53975635 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
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ATTGGTCGATGGTTTATGTA+AGG - Chr5:53975983-53976002 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
CAAAACACGTCCAAATTACA+GGG + Chr5:53974345-53974364 None:intergenic 35.0%
CAAAATACGCCCAAATTACA+GGG - Chr5:53974946-53974965 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
CAGATTTACAAAACGCTAAC+AGG + Chr5:53970589-53970608 None:intergenic 35.0%
CATACAAGGTCAAATACACA+AGG + Chr5:53972725-53972744 None:intergenic 35.0%
CATGACAATGTCATAGCAAA+GGG - Chr5:53975615-53975634 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
CATTATGCTTACTGCCAAAA+TGG - Chr5:53970189-53970208 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
CCAAGAAATCCAACAAAAAC+CGG + Chr5:53980189-53980208 None:intergenic 35.0%
CCATTAGATCCCTGTAATTT+GGG + Chr5:53974958-53974977 None:intergenic 35.0%
CGAAAACGACAAGAATGATA+AGG - Chr5:53976727-53976746 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
CTACAGGAAGGAAAATATTC+TGG + Chr5:53972151-53972170 None:intergenic 35.0%
CTAGCAATCAAATAGAATGG+TGG + Chr5:53971507-53971526 None:intergenic 35.0%
CTATGCAAAATGGAAGACTA+AGG - Chr5:53976515-53976534 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
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GCAAACTTCAGTTAACTTCT+TGG + Chr5:53972582-53972601 None:intergenic 35.0%
GCATTGAATTTGAAGAGACT+TGG + Chr5:53977761-53977780 None:intergenic 35.0%
GCATTTGAATCCCATCTTTA+AGG - Chr5:53968193-53968212 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
GCTCTAGCAATCAAATAGAA+TGG + Chr5:53971510-53971529 None:intergenic 35.0%
GGATGTATGAATGAATCCAT+GGG - Chr5:53973091-53973110 MsG0580027119.01.T01:CDS 35.0%
GGGAAGAATATCTGATGTTT+GGG - Chr5:53976318-53976337 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
GGTAATGATTCAACTTAGCA+AGG + Chr5:53975368-53975387 None:intergenic 35.0%
GTAGTCAAGGTTATAGTATC+AGG + Chr5:53975543-53975562 None:intergenic 35.0%
GTATTGTAAGTGATAACACC+AGG + Chr5:53969408-53969427 None:intergenic 35.0%
GTGCTGTACATTACTACATT+AGG + Chr5:53969304-53969323 None:intergenic 35.0%
GTTTCGTAAGTTACAACATC+AGG + Chr5:53976689-53976708 None:intergenic 35.0%
TAACATCGTCATGAAAGTGA+AGG + Chr5:53969159-53969178 None:intergenic 35.0%
TAACTTGAATTCATCTCACC+TGG + Chr5:53976804-53976823 None:intergenic 35.0%
TACATGTGCATAAATGGGAA+TGG + Chr5:53972367-53972386 None:intergenic 35.0%
TACTGCCAAAATGGAAGAAA+AGG - Chr5:53970198-53970217 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
TAGGCATGCTATCTCAATAA+CGG + Chr5:53978932-53978951 None:intergenic 35.0%
TAGTAGGGTTGTTCATATGA+AGG + Chr5:53968849-53968868 None:intergenic 35.0%
TCATGACAATGTCATAGCAA+AGG - Chr5:53975614-53975633 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
TCCATTAGATCCCTGTAATT+TGG + Chr5:53974959-53974978 None:intergenic 35.0%
TCGGGAAAATATCGATGTTT+GGG - Chr5:53969863-53969882 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
TCGTGTATTTGACCTTGTAT+GGG - Chr5:53980354-53980373 MsG0580027119.01.T01:CDS 35.0%
TCTTTACTTCACTGTGATCT+TGG + Chr5:53979108-53979127 None:intergenic 35.0%
TGAACATGTAATCGACGAAT+TGG + Chr5:53975231-53975250 None:intergenic 35.0%
TGAACGTGTAAACAACGAAT+TGG + Chr5:53968769-53968788 None:intergenic 35.0%
TGACATTGTCATGAAAGTGA+AGG + Chr5:53975608-53975627 None:intergenic 35.0%
TGAGAAAAAGAAATGGCAGT+TGG + Chr5:53975390-53975409 None:intergenic 35.0%
TGCATTGTTCAAAAACCATC+AGG - Chr5:53969952-53969971 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
TGGATGTATGAATGAATCCA+TGG - Chr5:53973090-53973109 MsG0580027119.01.T01:CDS 35.0%
TGGCATAACTAAACTGATCA+AGG + Chr5:53975647-53975666 None:intergenic 35.0%
TGTGCAAAATGGAAGACTTA+AGG - Chr5:53970059-53970078 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
TGTGCTGAAACAGATATATG+CGG + Chr5:53980070-53980089 None:intergenic 35.0%
TTAAAAAGAGACAGGTATCC+AGG + Chr5:53973527-53973546 None:intergenic 35.0%
TTACACGCATAACAATGAAG+CGG - Chr5:53970424-53970443 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
TTAGGAATGAATGAAGGAAG+AGG + Chr5:53975255-53975274 None:intergenic 35.0%
TTCGTAAGTTACAACATCAG+GGG + Chr5:53976687-53976706 None:intergenic 35.0%
TTGAATCTAGAAACTGCAGA+GGG + Chr5:53978987-53979006 None:intergenic 35.0%
TTGCATTATGACGAAGATCA+AGG - Chr5:53969987-53970006 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
TTGCGTTAGTTACAATCTGT+GGG - Chr5:53971764-53971783 MsG0580027119.01.T01:CDS 35.0%
TTGGATATCAACATCTCAGT+GGG - Chr5:53972850-53972869 MsG0580027119.01.T01:CDS 35.0%
TTTCGTAAGTAACAGCTTCA+GGG + Chr5:53970232-53970251 None:intergenic 35.0%
TTTGAATCTAGAAACTGCAG+AGG + Chr5:53978988-53979007 None:intergenic 35.0%
TTTGCAAGATTCAGTCCTAT+TGG - Chr5:53973308-53973327 MsG0580027119.01.T01:CDS 35.0%
TTTGCAGGGTAAATTCTTGA+GGG - Chr5:53972534-53972553 MsG0580027119.01.T01:CDS 35.0%
TTTGGATATCAACATCTCAG+TGG - Chr5:53972849-53972868 MsG0580027119.01.T01:CDS 35.0%
TTTGGTTGTGAATCTCATGA+AGG + Chr5:53968258-53968277 None:intergenic 35.0%
! AAAGTTTCCCCTTTTACAAC+TGG + Chr5:53978385-53978404 None:intergenic 35.0%
! AATCTTTCTAAGAACCTGCA+TGG + Chr5:53969263-53969282 None:intergenic 35.0%
! ACATTTAGAAGGATCCCTTT+TGG - Chr5:53971988-53972007 MsG0580027119.01.T01:CDS 35.0%
! ACTACAAATCCGGTTTTTGT+TGG - Chr5:53980177-53980196 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
! ACTTTTAACACAGTGGTTGA+TGG - Chr5:53969521-53969540 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
! ACTTTTAACACATTGGTCGA+TGG - Chr5:53975972-53975991 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
! AGTTGCTTTCAAACAAAGCA+TGG + Chr5:53970931-53970950 None:intergenic 35.0%
! ATAGGGAGCATATGATCTTA+TGG - Chr5:53979786-53979805 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
! ATCATTAGGTTTTTCGTTGG+AGG - Chr5:53979382-53979401 MsG0580027119.01.T01:CDS 35.0%
! ATGTTCGACTTTTAACACAG+TGG - Chr5:53969514-53969533 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
! CATATTCATGCCATTTCTCT+TGG + Chr5:53973055-53973074 None:intergenic 35.0%
! CATGCCATTTAGCATATCAA+TGG + Chr5:53975922-53975941 None:intergenic 35.0%
! CCAAAGACCTTTTAGACTAA+TGG - Chr5:53974234-53974253 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
! CCATTAGTCTAAAAGGTCTT+TGG + Chr5:53974237-53974256 None:intergenic 35.0%
! CGAAAGATTTTGCGCAAAAA+CGG + Chr5:53975103-53975122 None:intergenic 35.0%
! CTTTGATGGATGGTTATTTC+TGG - Chr5:53969635-53969654 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
! GAACCAGTGTTGTTGAATAT+CGG - Chr5:53978510-53978529 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
! GAACTAATCCAACTTTTTGC+AGG + Chr5:53971290-53971309 None:intergenic 35.0%
! GACATCATTAGGTTTTTCGT+TGG - Chr5:53979379-53979398 MsG0580027119.01.T01:CDS 35.0%
! GTGAAGTTATCCTAAGGTTT+TGG + Chr5:53968276-53968295 None:intergenic 35.0%
! GTTGATGAAAAGGAAGTTTC+GGG - Chr5:53973447-53973466 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
! TACTGTTTCTTCAAAGACGA+CGG + Chr5:53975051-53975070 None:intergenic 35.0%
! TAGGGAGCATATGATCTTAT+GGG - Chr5:53979787-53979806 MsG0580027119.01.T01:intron 35.0%
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! CCGGTTTTTGTTGGATTTCT+TGG - Chr5:53980186-53980205 MsG0580027119.01.T01:intron 40.0%
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! CTTTGAAGAAACAGTAGCTC+CGG - Chr5:53975055-53975074 MsG0580027119.01.T01:intron 40.0%
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! GAGGGTGTATCACACAAAAA+GGG + Chr5:53977427-53977446 None:intergenic 40.0%
! GTCAATGGGCTTTGTAAAGA+GGG - Chr5:53976608-53976627 MsG0580027119.01.T01:intron 40.0%
! GTCTACATTGTTGATGAAGG+AGG + Chr5:53968800-53968819 None:intergenic 40.0%
! GTGTTATTGTTTCCTTCCGT+TGG - Chr5:53973698-53973717 MsG0580027119.01.T01:intron 40.0%
! TACATTTTCCCGGTCGAAAA+GGG - Chr5:53977905-53977924 MsG0580027119.01.T01:intron 40.0%
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!! ACTTACCTGCTTTTCTGTCA+AGG - Chr5:53977583-53977602 MsG0580027119.01.T01:CDS 40.0%
!! ACTTCTAGAGTATGCTCTAC+AGG + Chr5:53972167-53972186 None:intergenic 40.0%
!! ATGTTTCTGAGATGACAGTG+AGG + Chr5:53971867-53971886 None:intergenic 40.0%
!! CAAAAACCATCAGGTTGACA+AGG - Chr5:53969961-53969980 MsG0580027119.01.T01:intron 40.0%
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!! CATTTTGGTCCTGCATCTTT+AGG - Chr5:53977830-53977849 MsG0580027119.01.T01:intron 40.0%
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!! TTTTGGGTAATCCATGCTCT+AGG - Chr5:53979752-53979771 MsG0580027119.01.T01:intron 40.0%
!! TTTTGTCTAGGACCATTGAG+AGG - Chr5:53971916-53971935 MsG0580027119.01.T01:intron 40.0%
!!! ACTTTTTTGCTGACATGGGA+TGG - Chr5:53974444-53974463 MsG0580027119.01.T01:intron 40.0%
!!! CTGGCCAAGATTTTCAAGTT+AGG - Chr5:53969049-53969068 MsG0580027119.01.T01:intron 40.0%
!!! TTTTCTGGTTGTTGTGATGC+CGG - Chr5:53972495-53972514 MsG0580027119.01.T01:CDS 40.0%
!!! TTTTCTGGTTGTTGTGATGC+TGG - Chr5:53972495-53972514 MsG0580027119.01.T01:CDS 40.0%
AAGACTTAAGGATGCGCAAG+CGG - Chr5:53970739-53970758 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
AATGTCTGCTGAGAGCCATT+TGG + Chr5:53977214-53977233 None:intergenic 45.0%
ACATATCCGGCTGAATTCCT+TGG + Chr5:53976470-53976489 None:intergenic 45.0%
ACTCCAACATATGAAGAGCG+TGG + Chr5:53978318-53978337 None:intergenic 45.0%
ATGACGAAGATCAAGGACCA+GGG - Chr5:53969994-53970013 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
ATGTTTCTCGGCACGTTAAC+AGG + Chr5:53971838-53971857 None:intergenic 45.0%
ATTGTTTCCTTCCGTTGGTG+CGG - Chr5:53973703-53973722 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
ATTTCGCGAAGAAGCTTCAC+TGG + Chr5:53970301-53970320 None:intergenic 45.0%
CAATCTTTCCAAGAACCTGC+AGG + Chr5:53975713-53975732 None:intergenic 45.0%
CAATTGCCATGTCAACCTGA+TGG + Chr5:53969970-53969989 None:intergenic 45.0%
CACAAGACTTGCCTAAGTGT+TGG + Chr5:53979288-53979307 None:intergenic 45.0%
CAGAAACATCCAACTCATGC+TGG - Chr5:53971878-53971897 MsG0580027119.01.T01:CDS 45.0%
CCCATGTCAGCAAAAAAGTG+GGG + Chr5:53974443-53974462 None:intergenic 45.0%
CCGATCTCAACTATGAAGGT+TGG + Chr5:53979047-53979066 None:intergenic 45.0%
CGACCGGGAAAATGTAAAAG+TGG + Chr5:53977901-53977920 None:intergenic 45.0%
CTAGAGTATGCTCTACAGGA+AGG + Chr5:53972163-53972182 None:intergenic 45.0%
CTCTCCGATCTCAACTATGA+AGG + Chr5:53979051-53979070 None:intergenic 45.0%
CTGAATTTGCAGTGTAGTGC+CGG + Chr5:53975077-53975096 None:intergenic 45.0%
CTGGCAGGAAATGAATAAGG+AGG + Chr5:53977386-53977405 None:intergenic 45.0%
GAAGACTAAGGATGCACAAG+CGG - Chr5:53976527-53976546 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
GAAGATCAAGGATGTTGAGC+TGG + Chr5:53977405-53977424 None:intergenic 45.0%
GAAGCAGATTCGCAGCAAAT+TGG + Chr5:53977020-53977039 None:intergenic 45.0%
GAGCTGGCAGGAAATGAATA+AGG + Chr5:53977389-53977408 None:intergenic 45.0%
GAGGAGTCAATTCCAGTTGT+TGG - Chr5:53979401-53979420 MsG0580027119.01.T01:CDS 45.0%
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GATCCACGCTCTTCATATGT+TGG - Chr5:53978312-53978331 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
GATCCAGATGTTCCTGATGA+TGG + Chr5:53968325-53968344 None:intergenic 45.0%
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GCGGTTCTTTCCATATAACC+TGG - Chr5:53973506-53973525 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
GCGTCATCGTCTTAAGGTTA+AGG - Chr5:53968713-53968732 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
GGATATCAACATCTCAGTGG+GGG - Chr5:53972852-53972871 MsG0580027119.01.T01:CDS 45.0%
GTATACAATGGGAGGCAAGT+AGG - Chr5:53973414-53973433 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
GTCACTACTAGCTAGCCAAA+TGG - Chr5:53977244-53977263 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
GTCCCACTATTTAGCTGAGT+TGG + Chr5:53974855-53974874 None:intergenic 45.0%
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TAAGGGGTTTCACCTTGATC+AGG - Chr5:53969183-53969202 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
TAATTATGTGGCATGCCACG+TGG - Chr5:53974792-53974811 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
TACGGTGCAGTCAACTCTTA+AGG - Chr5:53970659-53970678 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
TACTATGGCTCAAAGAGGAG+TGG - Chr5:53976145-53976164 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
TAGAGTCCATCAGTTAGGCT+TGG + Chr5:53979542-53979561 None:intergenic 45.0%
TAGCAAACATGGCAGTGTTG+TGG - Chr5:53977707-53977726 MsG0580027119.01.T01:CDS 45.0%
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TATGACGAAGATCAAGGACC+AGG - Chr5:53969993-53970012 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
TCACCATAAAAGAGGCTTGC+CGG + Chr5:53973849-53973868 None:intergenic 45.0%
TCAGTATCACCTCCCTACTT+TGG + Chr5:53978766-53978785 None:intergenic 45.0%
TCCAGTGACAAACAGATTCC+AGG - Chr5:53968621-53968640 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
TCCGTGTAGTATCCCATACA+AGG + Chr5:53980369-53980388 None:intergenic 45.0%
TCTGCTACTGTTGCGTTATG+TGG - Chr5:53980035-53980054 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
TCTGGAGAAATCCCTCTCAA+TGG + Chr5:53971931-53971950 None:intergenic 45.0%
TGAAACAAGATCTGCCATGC+AGG - Chr5:53969246-53969265 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
TGATTGCCTTGTCAACCTGA+TGG + Chr5:53976425-53976444 None:intergenic 45.0%
TGCCTCCCATTGTATACTCA+GGG + Chr5:53973411-53973430 None:intergenic 45.0%
TGGCCGATATTCAACAACAC+TGG + Chr5:53978516-53978535 None:intergenic 45.0%
TGTTTCTCGGCACGTTAACA+GGG + Chr5:53971837-53971856 None:intergenic 45.0%
TTCAATGCTCTGTGTCTACC+AGG - Chr5:53977773-53977792 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
TTCCCTGAGTATACAATGGG+AGG - Chr5:53973406-53973425 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
TTGCCTCCCATTGTATACTC+AGG + Chr5:53973412-53973431 None:intergenic 45.0%
TTGGCCAAGATTCTCAAGCT+AGG - Chr5:53975510-53975529 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
TTGTTGAATATCGGCCATGG+AGG - Chr5:53978519-53978538 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
! ACATATGAAGAGCGTGGATC+TGG + Chr5:53978312-53978331 None:intergenic 45.0%
! ACTGTGCAACTTTTGCCACA+TGG - Chr5:53974490-53974509 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
! ATCAGTGGCGGAATTTCAAC+AGG - Chr5:53978555-53978574 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
! CCATGGTGTTGAATCAATCC+AGG + Chr5:53973153-53973172 None:intergenic 45.0%
! CCTGGATTGATTCAACACCA+TGG - Chr5:53973150-53973169 MsG0580027119.01.T01:CDS 45.0%
! GACTCGGTAGAACAACAAAG+AGG + Chr5:53972781-53972800 None:intergenic 45.0%
! GGAAAATATTCTGGAGGAGG+AGG + Chr5:53972142-53972161 None:intergenic 45.0%
! GGAGGGTGTATCACACAAAA+AGG + Chr5:53977428-53977447 None:intergenic 45.0%
! GGTCAATGGGCTTTGTAAAG+AGG - Chr5:53976607-53976626 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
! GTGTTGTTGAATATCGGCCA+TGG - Chr5:53978516-53978535 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
! TCACTACTAGCCTAGCCAAA+TGG - Chr5:53977196-53977215 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
! TCAGTGGCGGAATTTCAACA+GGG - Chr5:53978556-53978575 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
! TGGTTCGAGTGCACTTGTTA+TGG - Chr5:53979679-53979698 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
! TGTTGATGAAGGAGGGAAGA+GGG + Chr5:53968792-53968811 None:intergenic 45.0%
! TTCAACAGGGTGCCATAGAA+AGG - Chr5:53978569-53978588 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
! TTCCCCTTTTACAACTGGCT+AGG + Chr5:53978380-53978399 None:intergenic 45.0%
! TTGCTGACATGGGATGGTTT+TGG - Chr5:53974450-53974469 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
! TTGTTGATGAAGGAGGGAAG+AGG + Chr5:53968793-53968812 None:intergenic 45.0%
!! AAAAGGTGTCAACCAGGAGA+TGG + Chr5:53971482-53971501 None:intergenic 45.0%
!! GCAGCACCTTTAGCTAGTTT+TGG - Chr5:53977795-53977814 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
!! GGTTGATGGGCTTTGTAAAG+AGG - Chr5:53970820-53970839 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
!! TAGCTGAGTTGGCATGGTTT+TGG + Chr5:53974844-53974863 None:intergenic 45.0%
!! TCAGCTCTAAAACAATGGCC+TGG + Chr5:53968642-53968661 None:intergenic 45.0%
!!! ACCCCACTTTTTTGCTGACA+TGG - Chr5:53974439-53974458 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
!!! CCCCACTTTTTTGCTGACAT+GGG - Chr5:53974440-53974459 MsG0580027119.01.T01:intron 45.0%
!!! CTGAAGTTTGCTGGCTCTTT+TGG - Chr5:53972591-53972610 MsG0580027119.01.T01:CDS 45.0%
!!! TGTTGTGATGCTGGCTCTTT+TGG - Chr5:53972504-53972523 MsG0580027119.01.T01:CDS 45.0%
!!! AGTTTTAAAAATAAAAATAA+AGG + Chr5:53979896-53979915 None:intergenic 5.0%
!!! ATTTTTTTTTTGTTTTAAAA+AGG + Chr5:53974884-53974903 None:intergenic 5.0%
!!! CATATTTTTTAATTTTAAAA+AGG - Chr5:53974736-53974755 MsG0580027119.01.T01:intron 5.0%
!!! TTTTTTAAAACAATTTTTTT+AGG + Chr5:53974990-53975009 None:intergenic 5.0%
AAGGAGGGACTGTTAGAGTG+AGG + Chr5:53977370-53977389 None:intergenic 50.0%
ATCAAGGATGTTGAGCTGGC+AGG + Chr5:53977401-53977420 None:intergenic 50.0%
ATGCCAACTCCTCCATCATC+AGG - Chr5:53968310-53968329 MsG0580027119.01.T01:CDS 50.0%
ATGTACGAATGCCTGCCAAC+TGG - Chr5:53971739-53971758 MsG0580027119.01.T01:intron 50.0%
CAAACTGGCCCATGCGAAAA+AGG - Chr5:53973013-53973032 MsG0580027119.01.T01:CDS 50.0%
CATGGCAGTGTTGTGGATCT+AGG - Chr5:53977714-53977733 MsG0580027119.01.T01:CDS 50.0%
CCTCCATCATCAGGAACATC+TGG - Chr5:53968319-53968338 MsG0580027119.01.T01:CDS 50.0%
CTAACGCAATACCAGTTGGC+AGG + Chr5:53971753-53971772 None:intergenic 50.0%
CTAGCTAGTAGTGACTGCTC+GGG + Chr5:53977239-53977258 None:intergenic 50.0%
GAGGAGTTGGCATGTTGAAG+TGG + Chr5:53968303-53968322 None:intergenic 50.0%
GCCTGGAATCTGTTTGTCAC+TGG + Chr5:53968625-53968644 None:intergenic 50.0%
GCTAGCTAGTAGTGACTGCT+CGG + Chr5:53977240-53977259 None:intergenic 50.0%
GCTGCACAAGTATCCCTAGA+AGG - Chr5:53968215-53968234 MsG0580027119.01.T01:intron 50.0%
GGATGCACAAGCGGTTTATC+AGG - Chr5:53976536-53976555 MsG0580027119.01.T01:intron 50.0%
GGATGCCTCAAGTGCATTTC+TGG - Chr5:53973355-53973374 MsG0580027119.01.T01:intron 50.0%
GGTTGCCTTGACAGAAAAGC+AGG + Chr5:53977591-53977610 None:intergenic 50.0%
GTACTCTGCTGAGAGCCATT+TGG + Chr5:53977262-53977281 None:intergenic 50.0%
GTGATACACCCTCCACACTT+CGG - Chr5:53977434-53977453 MsG0580027119.01.T01:intron 50.0%
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GTTTCTCGGCACGTTAACAG+GGG + Chr5:53971836-53971855 None:intergenic 50.0%
TAGTGTCTAAGGGCCCATAC+AGG + Chr5:53978851-53978870 None:intergenic 50.0%
TCCAGTTGTTGGAGTCTCCA+TGG - Chr5:53979412-53979431 MsG0580027119.01.T01:CDS 50.0%
TCCATGGAGACTCCAACAAC+TGG + Chr5:53979416-53979435 None:intergenic 50.0%
TCTTGGACGGTGTCCTGTAT+GGG - Chr5:53978835-53978854 MsG0580027119.01.T01:intron 50.0%
TGATACACCCTCCACACTTC+GGG - Chr5:53977435-53977454 MsG0580027119.01.T01:intron 50.0%
TGGCACTTGAGGCACATACA+TGG + Chr5:53973269-53973288 None:intergenic 50.0%
TTCCCGGTCGAAAAGGGTAA+GGG - Chr5:53977911-53977930 MsG0580027119.01.T01:intron 50.0%
TTTCCCGGTCGAAAAGGGTA+AGG - Chr5:53977910-53977929 MsG0580027119.01.T01:intron 50.0%
! AACAGGGTGCCATAGAAAGG+AGG - Chr5:53978572-53978591 MsG0580027119.01.T01:intron 50.0%
! ACTGTGCAACTTTTGCCACG+TGG + Chr5:53974810-53974829 None:intergenic 50.0%
! CATCCGGCAAGCCTCTTTTA+TGG - Chr5:53973843-53973862 MsG0580027119.01.T01:intron 50.0%
! TAGGTGCAAGGAAGTGCAGT+TGG - Chr5:53977733-53977752 MsG0580027119.01.T01:intron 50.0%
! TCTTGGCTACGCGTGTTTTC+TGG - Chr5:53980203-53980222 MsG0580027119.01.T01:intron 50.0%
! TGGTGTATGCAAGCTTGCTC+CGG + Chr5:53977881-53977900 None:intergenic 50.0%
! TGTCCCTTACCCTTTTCGAC+CGG + Chr5:53977917-53977936 None:intergenic 50.0%
!! AACTAGCTAAAGGTGCTGCC+TGG + Chr5:53977794-53977813 None:intergenic 50.0%
!! CCAGATGTTCCTGATGATGG+AGG + Chr5:53968322-53968341 None:intergenic 50.0%
!! GGTTGCGTTTCTGGTAGCAT+TGG - Chr5:53973610-53973629 MsG0580027119.01.T01:intron 50.0%
!! GTGGACAAAAGGTGTCAACC+AGG + Chr5:53971488-53971507 None:intergenic 50.0%
!! GTTCCTGATGATGGAGGAGT+TGG + Chr5:53968316-53968335 None:intergenic 50.0%
!!! ATGGGATGGTTTTGGCCATG+TGG - Chr5:53974458-53974477 MsG0580027119.01.T01:intron 50.0%
!!! TGTTGTGATGCCGGCTCTTT+TGG - Chr5:53980227-53980246 MsG0580027119.01.T01:intron 50.0%
AAACAGTCCGCACCAACGGA+AGG + Chr5:53973713-53973732 None:intergenic 55.0%
AGAACAGTCCCGAAGTGTGG+AGG + Chr5:53977446-53977465 None:intergenic 55.0%
AGGTCAAGTCAGTAGGCACG+AGG + Chr5:53971270-53971289 None:intergenic 55.0%
ATAGAAAGGAGGTGGCGTGG+CGG - Chr5:53978583-53978602 MsG0580027119.01.T01:intron 55.0%
CAACCAGGAGATGGCTGGAA+GGG + Chr5:53971473-53971492 None:intergenic 55.0%
CTGCTGAGAGCCATTTGGCT+AGG + Chr5:53977209-53977228 None:intergenic 55.0%
GAACAGTCCCGAAGTGTGGA+GGG + Chr5:53977445-53977464 None:intergenic 55.0%
GGATGCGCAAGCGGTTTATC+AGG - Chr5:53970748-53970767 MsG0580027119.01.T01:intron 55.0%
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TGAAAGAACAGCTGCCCTGC+AGG - Chr5:53975695-53975714 MsG0580027119.01.T01:intron 55.0%
! AGGGTGCCATAGAAAGGAGG+TGG - Chr5:53978575-53978594 MsG0580027119.01.T01:intron 55.0%
! GTCCCTTACCCTTTTCGACC+GGG + Chr5:53977916-53977935 None:intergenic 55.0%
! TCTTGGCTGCGCGTGTTTTC+TGG - Chr5:53972480-53972499 MsG0580027119.01.T01:CDS 55.0%
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CACAGTCAGCAGCTGCCACA+TGG + Chr5:53974476-53974495 None:intergenic 60.0%
CTCCGCCATGAGCTAGCATC+CGG - Chr5:53973827-53973846 MsG0580027119.01.T01:intron 60.0%
GCCACGCCACCTCCTTTCTA+TGG + Chr5:53978584-53978603 None:intergenic 60.0%
GCCATAGAAAGGAGGTGGCG+TGG - Chr5:53978580-53978599 MsG0580027119.01.T01:intron 60.0%
GCTTGCCGGATGCTAGCTCA+TGG + Chr5:53973835-53973854 None:intergenic 60.0%
GGTGTCAACCAGGAGATGGC+TGG + Chr5:53971478-53971497 None:intergenic 60.0%
TCACCCTTCCAGCCATCTCC+TGG - Chr5:53971467-53971486 MsG0580027119.01.T01:intron 60.0%
TCCGCCACTGATATCCGCCA+TGG + Chr5:53978547-53978566 None:intergenic 60.0%
TGCCGGATGCTAGCTCATGG+CGG + Chr5:53973832-53973851 None:intergenic 60.0%
!! GCCATGGCGGATATCAGTGG+CGG - Chr5:53978543-53978562 MsG0580027119.01.T01:intron 60.0%
!! GTGGCGGATTGTTGCAACGC+TGG - Chr5:53978599-53978618 MsG0580027119.01.T01:intron 60.0%
CGGATGCTAGCTCATGGCGG+AGG + Chr5:53973829-53973848 None:intergenic 65.0%
TATCCGCCATGGCGCCTCCA+TGG + Chr5:53978536-53978555 None:intergenic 65.0%
!! GGCGCCATGGCGGATATCAG+TGG - Chr5:53978540-53978559 MsG0580027119.01.T01:intron 65.0%
!! TATCGGCCATGGAGGCGCCA+TGG - Chr5:53978527-53978546 MsG0580027119.01.T01:intron 65.0%
!! CGGCCATGGAGGCGCCATGG+CGG - Chr5:53978530-53978549 MsG0580027119.01.T01:intron 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
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Protein sequence

>MsG0580027119.01.T01

MLQYMIDSCLDVKQKIVELPYGMHLNPIFKAAQVSLEGFHPNTVTINTLIKGLCLNGNVNGKVRDALHFHDDVRAKGFHLDQVSYAILIDGLCKIGETRSAMQVLRKIEENFVRPNVRISPGVITYNTFIYGFRMVGQFKEAIDMLNDMLMKNISPNVRLLTQWLMVYGYHLDVQMYNVMVDGLCKEGLFDDAMSLLSEMEDNGCTPNAVTFQTLIHALFESNCTINEYVRMPANWYCVSYNLWVSDPTFLLTWDGFGHVAAADCATFATWQLTRYTNLSSNLCFPIRRLHVQPLPSFIPNVDDAISSFNRIIHMRNPIQPIFEFNKILSSLAKLNHYPTAISFSQQMELKQIQPDLFTFNILINCFCHLGHLNFAFSVLAKILKLGFHPDTITLTTLIKGLCLNGKVREALHFHDNVIAKGFHLDQFSYAILIDGLCKIGERTAALQVLGKIEEKSVRPDVVMYNTIMDSLCKDKLVIDACDLYSQMLLKRISPGVITYNTLIYGFCIVGQFKEAIDMLNGMLVKNISPNVRTFNTLVDGLCKEGEVKQARNVLAVMIKQDVEPSVVTYNSLMDGCFLVKEVNKATYVFNTMAQRGVAPNVQSYSVMINGLSKNKMVDKAITLLTKIKNQGIQPDMYTYTYLLMDYAKWKTKDAQAGLFDEALSLLSKMEDNGCTPDVVTYETLILALFENDKNDKAAKLLREMIARVLLSELFQAVTEHSKAKGCIEGYRVLVRVHLLWNYVLCFTSFYMHLFNWCFGFTTNPVFVGFLGYACFLVVVMPALLVSLLQVNYPRVFDLVWDTTRILKIT*