AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035229.01

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MsG0680035229.01.T01 AT1G62720 31.579 399 268 2 458 856 90 483 1.31e-62 219
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MsG0680035229.01.T01 AT3G53700 27.389 314 210 5 412 716 443 747 2.32e-27 119
MsG0680035229.01.T01 AT3G53700 27.184 206 146 3 652 854 121 325 1.22e-16 85.1
MsG0680035229.01.T01 AT1G64580 29.962 524 340 5 347 849 6 523 5.12e-79 265
MsG0680035229.01.T01 AT5G41170 34.300 414 264 2 414 819 82 495 5.38e-79 265
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MsG0680035229.01.T01 AT2G15630 27.778 162 114 1 697 855 130 291 7.02e-12 69.7
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MsG0680035229.01.T01 AT2G35130 19.697 264 212 0 413 676 330 593 5.93e-14 76.3
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MsG0680035229.01.T01 AT5G08490 21.158 449 302 12 422 833 312 745 2.75e-18 90.5
MsG0680035229.01.T01 AT4G18520 20.763 472 284 13 421 855 165 583 2.91e-18 90.1
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MsG0680035229.01.T01 AT3G02330 18.598 328 251 4 506 833 80 391 6.05e-11 67.0
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MsG0680035229.01.T01 AT1G05750 22.802 364 225 8 510 833 37 384 5.58e-18 88.6
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Find 151 sgRNAs with CRISPR-Local

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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AATGTTTCCCTTGTTCTATT+TGG 0.195503 6:-100834258 MsG0680035229.01.T01:CDS
ATTTATAATGTGATGGTTAA+TGG 0.198257 6:-100828603 MsG0680035229.01.T01:CDS
ATTGGTTGATGGTTTATTTA+AGG 0.201150 6:-100829222 MsG0680035229.01.T01:CDS
ATCAACGGTCTTTGTCTTAA+TGG 0.209740 6:-100829638 MsG0680035229.01.T01:CDS
TTTGATGGATGGGTATTTCT+TGG 0.227507 6:-100829117 MsG0680035229.01.T01:CDS
TTTACATAACCCGTTGATTA+AGG 0.232866 6:+100829538 None:intergenic
TATTCAACACTCTTTCTCTA+AGG 0.247946 6:-100829067 MsG0680035229.01.T01:CDS
CCAAAGGTGGTCCTTATAAT+AGG 0.266161 6:-100834410 MsG0680035229.01.T01:CDS
ATAGCGAGATCGGGAAATTC+TGG 0.277309 6:+100834446 None:intergenic
CTTGTTCTATTTGGAGTTGT+TGG 0.286663 6:-100834249 MsG0680035229.01.T01:CDS
CATCTTAACCATGTTAGTTA+TGG 0.291268 6:-100829563 MsG0680035229.01.T01:CDS
CATTTCTTTGAAGAGATTTA+CGG 0.291616 6:+100828971 None:intergenic
GTTTCGTAGGTGACAGCATT+AGG 0.307626 6:+100828510 None:intergenic
ATCTTAACCATGTTAGTTAT+GGG 0.317906 6:-100829562 MsG0680035229.01.T01:CDS
ATTGATGGACTTTGCAAATC+AGG 0.317950 6:-100828903 MsG0680035229.01.T01:CDS
AGTAATGTACAACACTATTA+TGG 0.319394 6:-100829447 MsG0680035229.01.T01:CDS
CTCTTATTCATGCTTTGTTC+GGG 0.324485 6:-100828488 MsG0680035229.01.T01:CDS
CAGGGAGAATCTCTGATGTT+TGG 0.325927 6:-100828884 MsG0680035229.01.T01:CDS
TCATACAATTCTCTTATTGA+TGG 0.330506 6:-100828918 MsG0680035229.01.T01:CDS
TTTATAATGTGATGGTTAAT+GGG 0.330837 6:-100828602 MsG0680035229.01.T01:CDS
GCAACCTTATACGTCGCATT+TGG 0.332750 6:-100833869 MsG0680035229.01.T01:CDS
GTAGTTAACGTTACAGTATC+AGG 0.337331 6:+100829665 None:intergenic
CCATCCAAATGCGACGTATA+AGG 0.337352 6:+100833865 None:intergenic
CGCATTTGGATGGACTGAAT+TGG 0.338297 6:-100833855 MsG0680035229.01.T01:CDS
TGCCTTCAACTTCAACTTCA+AGG 0.342590 6:-100834503 MsG0680035229.01.T01:CDS
TGTTACTTATACTTCTTTGA+TGG 0.343831 6:-100829132 MsG0680035229.01.T01:CDS
TTGCATAAAGCATCTAATAA+AGG 0.343933 6:+100828804 None:intergenic
CTATTTGGAGTTGTTGGTTC+AGG 0.346705 6:-100834243 MsG0680035229.01.T01:CDS
ACTTACACTATACTTGTTGA+TGG 0.348796 6:-100828708 MsG0680035229.01.T01:CDS
CATGATAATGTTATAGCAAA+TGG 0.350744 6:-100829590 MsG0680035229.01.T01:CDS
TTTGTCTTAATGGTCATGTT+AGG 0.351570 6:-100829628 MsG0680035229.01.T01:CDS
TATACAAATCTTCTGATTAA+GGG 0.353551 6:-100828645 MsG0680035229.01.T01:CDS
ATGAGAAACTTGATGACAAA+TGG 0.362150 6:-100833918 MsG0680035229.01.T01:CDS
GAATTGTATGATATGGTATC+TGG 0.363202 6:+100828930 None:intergenic
AATAAGAGAATTGTATGATA+TGG 0.368165 6:+100828923 None:intergenic
AGAAACTAAAGCTGCCTTGC+AGG 0.371058 6:-100829510 MsG0680035229.01.T01:CDS
CTCTGAGAAAACCTATTATA+AGG 0.371133 6:+100834399 None:intergenic
ACTCTTATTCATGCTTTGTT+CGG 0.373706 6:-100828489 MsG0680035229.01.T01:CDS
TTTCGTAGGTGACAGCATTA+GGG 0.376526 6:+100828511 None:intergenic
TATAGTGTAAGTGTACATAT+TGG 0.378010 6:+100828719 None:intergenic
ATTGTCATTACTGTCGAAAA+TGG 0.378138 6:-100828550 MsG0680035229.01.T01:CDS
AGGGAGAATCTCTGATGTTT+GGG 0.383335 6:-100828883 MsG0680035229.01.T01:CDS
ACACTTTGAGGGTGTGTTGC+CGG 0.386983 6:+100834072 None:intergenic
GAAGATTTGTATAAACTTCT+CGG 0.389471 6:+100828655 None:intergenic
AAGGAAAAGTTGAAGGGAAT+TGG 0.390236 6:-100833951 MsG0680035229.01.T01:CDS
AGACTGAGCGGAGTGATTTA+GGG 0.391676 6:-100833990 MsG0680035229.01.T01:CDS
ATCTACAGTGTCATGATTAA+CGG 0.395544 6:-100829023 MsG0680035229.01.T01:CDS
TGCCAAGAGGGGCAAAAGAT+TGG 0.400180 6:-100834296 MsG0680035229.01.T01:CDS
AAGAGTGTTGAATACATGTT+TGG 0.401898 6:+100829076 None:intergenic
GTTAATGGGCTTTGTAAAGA+AGG 0.414212 6:-100828588 MsG0680035229.01.T01:CDS
CTGAGCTTTAGCGAGCGATT+CGG 0.424071 6:+100831873 None:intergenic
CTTATACTTCTTTGATGGAT+GGG 0.429900 6:-100829127 MsG0680035229.01.T01:CDS
GATCGGGAAATTCTGGAGTT+AGG 0.430128 6:+100834453 None:intergenic
AAACTAGAATCACGTGTGTT+CGG 0.433419 6:+100834169 None:intergenic
ACACTGTAGATATGAACATT+AGG 0.433611 6:+100829035 None:intergenic
GCATTTGGATGGACTGAATT+GGG 0.433979 6:-100833854 MsG0680035229.01.T01:CDS
ACCCTCAAAGTGTGAGAGTT+GGG 0.436760 6:-100834062 MsG0680035229.01.T01:CDS
ACGTGTGTTCGGTTTGTGTA+AGG 0.437622 6:+100834180 None:intergenic
CGAAATTAAAATAGCGAGAT+CGG 0.438044 6:+100834436 None:intergenic
GAGAATGAAGGAAAAGTTGA+AGG 0.438255 6:-100833958 MsG0680035229.01.T01:CDS
TGAATTGCTCTTTCAAGCTC+AGG 0.442207 6:-100831908 MsG0680035229.01.T01:CDS
ATCCCAACTCTCACACTTTG+AGG 0.443157 6:+100834060 None:intergenic
GTAGTAAAAGTACGAACATC+CGG 0.443682 6:+100829245 None:intergenic
CAAGGCAGCTTTAGTTTCTC+CGG 0.446402 6:+100829514 None:intergenic
CCTATTATAAGGACCACCTT+TGG 0.446812 6:+100834410 None:intergenic
CTTGATGAGATGCATGATAT+AGG 0.448050 6:-100828855 MsG0680035229.01.T01:CDS
TTTGGCGACCTTTCGGAGAA+AGG 0.449893 6:-100833306 MsG0680035229.01.T01:intron
TTCAGAATTCACTCATGGCT+TGG 0.450144 6:-100834569 None:intergenic
ACATATTGGGCTGAATTCCT+TGG 0.450615 6:+100828733 None:intergenic
ACTTATACTTCTTTGATGGA+TGG 0.452238 6:-100829128 MsG0680035229.01.T01:CDS
GAAGTATAAGTAACAACATC+AGG 0.453409 6:+100829140 None:intergenic
ATAGTGTAAGTGTACATATT+GGG 0.454212 6:+100828720 None:intergenic
ACTAAAATGTTCAAGCAAAC+CGG 0.458500 6:+100833762 None:intergenic
AAACTGCTCAGCACTGTGTC+TGG 0.465687 6:+100833396 None:intergenic
GTTATGGGACCTTAATCAAC+GGG 0.468594 6:-100829547 MsG0680035229.01.T01:CDS
GCTCGCTAAAGCTCAGGTAA+TGG 0.469980 6:-100831866 MsG0680035229.01.T01:CDS
TGATGACAAATGGGTTAAGA+AGG 0.473472 6:-100833908 MsG0680035229.01.T01:CDS
GTTGATGGTTTATTTAAGGA+AGG 0.476383 6:-100829218 MsG0680035229.01.T01:CDS
AAGATTTGTATAAACTTCTC+GGG 0.481547 6:+100828656 None:intergenic
CCTTATACGTCGCATTTGGA+TGG 0.481840 6:-100833865 MsG0680035229.01.T01:CDS
GAGCGGAGTGATTTAGGGTA+TGG 0.481841 6:-100833985 MsG0680035229.01.T01:CDS
ATCAACGGGTTATGTAAATC+CGG 0.482535 6:-100829533 MsG0680035229.01.T01:CDS
AAACAAAAGGCATCAACAAA+AGG 0.483071 6:+100833811 None:intergenic
GAAATTAAAATAGCGAGATC+GGG 0.493255 6:+100834437 None:intergenic
GCTTCAGCTTTAGATATATG+AGG 0.496330 6:+100831985 None:intergenic
GTCTCCAAGCTTCTTCTCCA+TGG 0.500499 6:+100834140 None:intergenic
ACTTACAGTACTTTAATACA+TGG 0.502109 6:-100829338 MsG0680035229.01.T01:CDS
TGTTAGAATTTATAATGTGA+TGG 0.502841 6:-100828610 MsG0680035229.01.T01:CDS
TTGATGGACTTTGCAAATCA+GGG 0.505171 6:-100828902 MsG0680035229.01.T01:CDS
TCCCAACTCTCACACTTTGA+GGG 0.505571 6:+100834061 None:intergenic
TGAGAAACTTGATGACAAAT+GGG 0.508994 6:-100833917 MsG0680035229.01.T01:CDS
AGCCTTGAAGTTGAAGTTGA+AGG 0.510117 6:+100834501 None:intergenic
TGATCCTCGTGTGGCTCCTA+CGG 0.513329 6:-100832070 MsG0680035229.01.T01:CDS
CGAATCGCTCGCTAAAGCTC+AGG 0.514358 6:-100831872 MsG0680035229.01.T01:CDS
GTACTGTAAGTGATCACATC+AGG 0.518991 6:+100829350 None:intergenic
TAGTAAAAGTACGAACATCC+GGG 0.521742 6:+100829246 None:intergenic
TTTAATTTCGCTACCAAAGG+TGG 0.527691 6:-100834423 MsG0680035229.01.T01:CDS
CTTCTATTAGTCGCATCAGC+AGG 0.528066 6:-100832096 MsG0680035229.01.T01:CDS
ATTCAACACTCTTTCTCTAA+GGG 0.529726 6:-100829066 MsG0680035229.01.T01:CDS
AATGCCATGGAGAAGAAGCT+TGG 0.530715 6:-100834144 MsG0680035229.01.T01:CDS
GGGTATGGTTCAGAGAATGA+AGG 0.538268 6:-100833970 MsG0680035229.01.T01:CDS
TGAAGGGAATTGGCAGATGG+AGG 0.541512 6:-100833941 MsG0680035229.01.T01:CDS
CTTCCCACCAGGTAAACAAA+AGG 0.543528 6:+100833798 None:intergenic
GTGTTGTACATTACTACGTC+AGG 0.552733 6:+100829455 None:intergenic
GGGAAGATAGTTGTATTCAC+CGG 0.553263 6:-100833781 MsG0680035229.01.T01:CDS
TTGTAAGTGATCACATCGGC+AGG 0.559427 6:+100828828 None:intergenic
ATGGCCAAGATTCTCAAGCT+AGG 0.561146 6:-100829695 MsG0680035229.01.T01:intron
CTGCGTGTTTGAAAAGATGA+AGG 0.567504 6:-100834118 MsG0680035229.01.T01:CDS
CAACAACTCCAAATAGAACA+AGG 0.568302 6:+100834250 None:intergenic
AGAATGAAGGAAAAGTTGAA+GGG 0.571867 6:-100833957 MsG0680035229.01.T01:CDS
CACCCTCAAAGTGTGAGAGT+TGG 0.577769 6:-100834063 MsG0680035229.01.T01:CDS
GATTCTAGTTTCGAATGCCA+TGG 0.579969 6:-100834157 MsG0680035229.01.T01:CDS
TCTCAGAGAATAGGAACAAG+TGG 0.583572 6:-100834384 MsG0680035229.01.T01:CDS
AGTTATGGGACCTTAATCAA+CGG 0.584891 6:-100829548 MsG0680035229.01.T01:CDS
TAATTGCATTGTCAATCTGA+TGG 0.587109 6:+100828778 None:intergenic
TGGTTTATTTAAGGAAGGAG+AGG 0.587240 6:-100829213 MsG0680035229.01.T01:CDS
AGTTGAAGGGAATTGGCAGA+TGG 0.592584 6:-100833944 MsG0680035229.01.T01:CDS
AATCATTACCTTTCTCCGAA+AGG 0.593435 6:+100833298 None:intergenic
ATGAATTTCTCTAAGACCGT+AGG 0.593712 6:+100832054 None:intergenic
GATGACAAATGGGTTAAGAA+GGG 0.606043 6:-100833907 MsG0680035229.01.T01:CDS
CTTGGTTAAAGAAGTCGACA+AGG 0.609490 6:-100829099 MsG0680035229.01.T01:CDS
CTTCGTGAAATGATTGCTAG+AGG 0.611526 6:-100828435 MsG0680035229.01.T01:CDS
GGTCAAATGAAAGAAGCAGT+TGG 0.614044 6:-100829302 MsG0680035229.01.T01:CDS
TTCAACACTCTTTCTCTAAG+GGG 0.615898 6:-100829065 MsG0680035229.01.T01:CDS
AGCATGAATAAGAGTTTCGT+AGG 0.617565 6:+100828497 None:intergenic
AGCAGTTTACACATAATCAG+TGG 0.621012 6:-100833381 MsG0680035229.01.T01:CDS
TATATCTAAAGCTGAAGCCG+AGG 0.624435 6:-100831980 MsG0680035229.01.T01:CDS
AATCTTTCTAAGAACCTGCA+AGG 0.624944 6:+100829496 None:intergenic
TTCGTAGGTGACAGCATTAG+GGG 0.624975 6:+100828512 None:intergenic
CTGTCGAAAATGGAAGACAA+TGG 0.625680 6:-100828540 MsG0680035229.01.T01:CDS
CAAATGGGTTAAGAAGGGTA+AGG 0.625766 6:-100833902 MsG0680035229.01.T01:CDS
TTAAGGTCCCATAACTAACA+TGG 0.628535 6:+100829555 None:intergenic
TGTTATGATAAAACAAGGTG+TGG 0.633140 6:-100829165 MsG0680035229.01.T01:CDS
CGGGAGCGATATGAATGATG+AGG 0.645071 6:-100828469 MsG0680035229.01.T01:CDS
AACAACTCCAAATAGAACAA+GGG 0.652012 6:+100834251 None:intergenic
AATACAACTATCTTCCCACC+AGG 0.658440 6:+100833787 None:intergenic
AGCAGGCTATGATCCTCGTG+TGG 0.661195 6:-100832079 MsG0680035229.01.T01:CDS
GATGAAGAAAACATTGAACA+AGG 0.665144 6:-100834013 MsG0680035229.01.T01:CDS
ACGTTAACTACACTTATCAA+CGG 0.667790 6:-100829653 MsG0680035229.01.T01:CDS
TTAAAGAAGATCAAGAACCA+AGG 0.670451 6:-100828750 MsG0680035229.01.T01:CDS
GAGCGATATGAATGATGAGG+CGG 0.684411 6:-100828466 MsG0680035229.01.T01:CDS
TGTATTGCATGAGCATGCTG+AGG 0.727095 6:-100831944 MsG0680035229.01.T01:CDS
AGTAAAAGTACGAACATCCG+GGG 0.729128 6:+100829247 None:intergenic
AGGATTGTAAGTGATCACAT+CGG 0.734586 6:+100828824 None:intergenic
CATTGAACAAGGAGACTGAG+CGG 0.761321 6:-100834002 MsG0680035229.01.T01:CDS
TTAGCTGTTATGATAAAACA+AGG 0.770648 6:-100829170 MsG0680035229.01.T01:CDS
AAGACCGTAGGAGCCACACG+AGG 0.773543 6:+100832066 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TTAATAATTCATTGATATAT+AGG - Chr6:100829751-100829770 MsG0680035229.01.T01:intron 10.0%
!!! ATAGAAAATTGTATAATTTT+AGG - Chr6:100830738-100830757 MsG0680035229.01.T01:intron 10.0%
!!! ATATATAATTGTTTTTATGA+GGG + Chr6:100832147-100832166 None:intergenic 10.0%
!!! ATTCATATTTTTAATGAATT+TGG - Chr6:100832950-100832969 MsG0680035229.01.T01:intron 10.0%
!!! TGAATATAAATTTTACATAT+TGG + Chr6:100832984-100833003 None:intergenic 10.0%
!!! TTCATATTTTTAATGAATTT+GGG - Chr6:100832951-100832970 MsG0680035229.01.T01:intron 10.0%
!!! TTGAAATTAATAACAATTTT+AGG - Chr6:100828621-100828640 MsG0680035229.01.T01:CDS 10.0%
!! TATAAATTGTTATGAAACTA+AGG - Chr6:100831671-100831690 MsG0680035229.01.T01:intron 15.0%
!! TTCATTAAAAATATGAATTG+TGG + Chr6:100832948-100832967 None:intergenic 15.0%
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!!! CACTAGATTTTTTTTTCCAT+TGG + Chr6:100832000-100832019 None:intergenic 25.0%
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!!! TTTTGAGATATCTTCCTATT+GGG - Chr6:100832278-100832297 MsG0680035229.01.T01:intron 25.0%
AAATCTAACACTTTACTGCT+TGG - Chr6:100829538-100829557 MsG0680035229.01.T01:CDS 30.0%
AAATTATGCAACACAAGTGA+TGG + Chr6:100831496-100831515 None:intergenic 30.0%
AACAACTCCAAATAGAACAA+GGG + Chr6:100828732-100828751 None:intergenic 30.0%
AATATATTTCGGACGGAATT+TGG + Chr6:100832576-100832595 None:intergenic 30.0%
AATGTTTCCCTTGTTCTATT+TGG - Chr6:100828722-100828741 MsG0680035229.01.T01:CDS 30.0%
AATTTCCTACGAATTTCAGA+CGG - Chr6:100832783-100832802 MsG0680035229.01.T01:intron 30.0%
ACAATGATTGTATGGTATCT+AGG - Chr6:100831203-100831222 MsG0680035229.01.T01:intron 30.0%
ACACTGTAGATATGAACATT+AGG + Chr6:100833948-100833967 None:intergenic 30.0%
ACGTTAACTACACTTATCAA+CGG - Chr6:100833327-100833346 MsG0680035229.01.T01:CDS 30.0%
ACTAAAATGTTCAAGCAAAC+CGG + Chr6:100829221-100829240 None:intergenic 30.0%
ACTTATACTTCTTTGATGGA+TGG - Chr6:100833852-100833871 MsG0680035229.01.T01:CDS 30.0%
AGAATGAAGGAAAAGTTGAA+GGG - Chr6:100829023-100829042 MsG0680035229.01.T01:CDS 30.0%
ATATATTTCGGACGGAATTT+GGG + Chr6:100832575-100832594 None:intergenic 30.0%
ATCTACAGTGTCATGATTAA+CGG - Chr6:100833957-100833976 MsG0680035229.01.T01:CDS 30.0%
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CAACCCTTGATTTAAAGAAA+GGG + Chr6:100830035-100830054 None:intergenic 30.0%
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CATCTTAACCATGTTAGTTA+TGG - Chr6:100833417-100833436 MsG0680035229.01.T01:intron 30.0%
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CTTACTATAGAAAAACCCAA+TGG - Chr6:100831981-100832000 MsG0680035229.01.T01:CDS 30.0%
GAAAAAGAAGCTGATTACAT+TGG - Chr6:100830860-100830879 MsG0680035229.01.T01:intron 30.0%
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TAAATTGAACTAAACCGAAC+TGG - Chr6:100830438-100830457 MsG0680035229.01.T01:intron 30.0%
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TACTCAAAAGCTTTACTTGA+TGG - Chr6:100832202-100832221 MsG0680035229.01.T01:intron 30.0%
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TCTCATCAAATGGAAATCAA+AGG - Chr6:100833180-100833199 MsG0680035229.01.T01:intron 30.0%
TGGATATCCATATAGCAATT+GGG + Chr6:100831902-100831921 None:intergenic 30.0%
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TGTTATGATAAAACAAGGTG+TGG - Chr6:100833815-100833834 MsG0680035229.01.T01:CDS 30.0%
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TTAGGACTACAATGATTGTA+TGG - Chr6:100831195-100831214 MsG0680035229.01.T01:intron 30.0%
TTTCTGCAAAAAAGTAGTCA+AGG - Chr6:100831314-100831333 MsG0680035229.01.T01:intron 30.0%
TTTGTCTTAATGGTCATGTT+AGG - Chr6:100833352-100833371 MsG0680035229.01.T01:CDS 30.0%
TTTGTTAGACAGGTTAGAAT+AGG - Chr6:100829779-100829798 MsG0680035229.01.T01:intron 30.0%
! AATACATGGTTTTTGCATTG+TGG - Chr6:100833656-100833675 MsG0680035229.01.T01:intron 30.0%
! AATAGGTTTTCTCAGAGAAT+AGG - Chr6:100828587-100828606 MsG0680035229.01.T01:CDS 30.0%
! ACTAAACTTCAAACGGATTT+CGG - Chr6:100832646-100832665 MsG0680035229.01.T01:intron 30.0%
! ACTCTTATTCATGCTTTGTT+CGG - Chr6:100834491-100834510 MsG0680035229.01.T01:CDS 30.0%
! ACTTACACTATACTTGTTGA+TGG - Chr6:100834272-100834291 MsG0680035229.01.T01:CDS 30.0%
! AGAACAAGGGAAACATTTTT+AGG + Chr6:100828719-100828738 None:intergenic 30.0%
! AGTTCAATTTTTCTGAACTG+TGG + Chr6:100830198-100830217 None:intergenic 30.0%
! ATACATGGTTTTTGCATTGT+GGG - Chr6:100833657-100833676 MsG0680035229.01.T01:intron 30.0%
! ATAGGTAATGTTTGTTAGAC+AGG - Chr6:100829769-100829788 MsG0680035229.01.T01:intron 30.0%
! ATGAGAAACTTGATGACAAA+TGG - Chr6:100829062-100829081 MsG0680035229.01.T01:CDS 30.0%
! ATGCAATATTGATTGTGGAA+AGG - Chr6:100830770-100830789 MsG0680035229.01.T01:intron 30.0%
! ATTTTCCAACAATTTTCGGA+CGG - Chr6:100832851-100832870 MsG0680035229.01.T01:intron 30.0%
! CATTGGGTTTTTCTATAGTA+AGG + Chr6:100831983-100832002 None:intergenic 30.0%
! CTCTGAGAAAACCTATTATA+AGG + Chr6:100828584-100828603 None:intergenic 30.0%
! CTTATACTTCTTTGATGGAT+GGG - Chr6:100833853-100833872 MsG0680035229.01.T01:CDS 30.0%
! CTTTAAAAATGAGTTGTTGC+CGG - Chr6:100828889-100828908 MsG0680035229.01.T01:CDS 30.0%
! GGTCATACTATTAGCTTATT+GGG + Chr6:100831873-100831892 None:intergenic 30.0%
! GTGAAAAATTGGTTTAGGTA+TGG - Chr6:100831347-100831366 MsG0680035229.01.T01:intron 30.0%
! TGAGAAACTTGATGACAAAT+GGG - Chr6:100829063-100829082 MsG0680035229.01.T01:CDS 30.0%
! TGTTCGTACTTTTACTACAT+TGG - Chr6:100833740-100833759 MsG0680035229.01.T01:CDS 30.0%
! TTAGGATGCAATATTGATTG+TGG - Chr6:100830765-100830784 MsG0680035229.01.T01:intron 30.0%
! TTTACATAACCCGTTGATTA+AGG + Chr6:100833445-100833464 None:intergenic 30.0%
!! AAACAAAAGGCATCAACAAA+AGG + Chr6:100829172-100829191 None:intergenic 30.0%
!! AAGAGTGTTGAATACATGTT+TGG + Chr6:100833907-100833926 None:intergenic 30.0%
!! ACTTTTACTACATTGGTTGA+TGG - Chr6:100833747-100833766 MsG0680035229.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTATTCTAGAGGTACTACT+AGG + Chr6:100830141-100830160 None:intergenic 30.0%
!! CCTCTAGAATAATTATCGTT+CGG - Chr6:100830148-100830167 MsG0680035229.01.T01:intron 30.0%
!! GTCATTTTCGGACAAAATTT+CGG - Chr6:100832427-100832446 MsG0680035229.01.T01:intron 30.0%
!! GTTGATGGACTATGTAAAAA+TGG - Chr6:100834287-100834306 MsG0680035229.01.T01:CDS 30.0%
!! GTTGATGGTTTATTTAAGGA+AGG - Chr6:100833762-100833781 MsG0680035229.01.T01:CDS 30.0%
!! TACAGCTTTATATTTTGCCT+CGG + Chr6:100831020-100831039 None:intergenic 30.0%
!!! CTTTTGAGATATCTTCCTAT+TGG - Chr6:100832277-100832296 MsG0680035229.01.T01:intron 30.0%
AAAACCTAGCTTGAGAATCT+TGG + Chr6:100833292-100833311 None:intergenic 35.0%
AAACTAGAATCACGTGTGTT+CGG + Chr6:100828814-100828833 None:intergenic 35.0%
AAGGAAAAGTTGAAGGGAAT+TGG - Chr6:100829029-100829048 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
AATCATTACCTTTCTCCGAA+AGG + Chr6:100829685-100829704 None:intergenic 35.0%
AATTTCCTACGAATTTCGGA+CGG - Chr6:100832716-100832735 MsG0680035229.01.T01:intron 35.0%
AATTTCCTACGGATTTCAGA+CGG - Chr6:100832750-100832769 MsG0680035229.01.T01:intron 35.0%
AGAATGTAAGAGCTTGACTA+GGG - Chr6:100831158-100831177 MsG0680035229.01.T01:intron 35.0%
AGCAGTTTACACATAATCAG+TGG - Chr6:100829599-100829618 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
AGCATGAATAAGAGTTTCGT+AGG + Chr6:100834486-100834505 None:intergenic 35.0%
AGGAGAAAGAAAGTAAAGAG+AGG - Chr6:100831730-100831749 MsG0680035229.01.T01:intron 35.0%
AGGATTGTAAGTGATCACAT+CGG + Chr6:100834159-100834178 None:intergenic 35.0%
AGTTATGGGACCTTAATCAA+CGG - Chr6:100833432-100833451 MsG0680035229.01.T01:intron 35.0%
ATCAACGGTCTTTGTCTTAA+TGG - Chr6:100833342-100833361 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
ATTCGCTCTTTATGTCTGTT+TGG - Chr6:100829288-100829307 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
CAACAACTCCAAATAGAACA+AGG + Chr6:100828733-100828752 None:intergenic 35.0%
CACCGTGTGTTTACAAAATA+TGG - Chr6:100828769-100828788 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
CCAATAACCCAATTGCTATA+TGG - Chr6:100831892-100831911 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
CCATATAGCAATTGGGTTAT+TGG + Chr6:100831895-100831914 None:intergenic 35.0%
CCGAACGATAATTATTCTAG+AGG + Chr6:100830151-100830170 None:intergenic 35.0%
CGTCCGAAATATATTTCAGA+CGG - Chr6:100832581-100832600 MsG0680035229.01.T01:intron 35.0%
CTCTTGTGATGTGTACAATT+AGG - Chr6:100831766-100831785 MsG0680035229.01.T01:intron 35.0%
CTGTAGTTTCTAAACCAAAC+TGG - Chr6:100830273-100830292 MsG0680035229.01.T01:intron 35.0%
CTGTGTATCCTAAAAATGTG+TGG - Chr6:100828654-100828673 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
CTTGATGAGATGCATGATAT+AGG - Chr6:100834125-100834144 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
GAATAATTATCGTTCGGTTC+AGG - Chr6:100830154-100830173 MsG0680035229.01.T01:intron 35.0%
GAGAATGAAGGAAAAGTTGA+AGG - Chr6:100829022-100829041 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
GCAACCCTTGATTTAAAGAA+AGG + Chr6:100830036-100830055 None:intergenic 35.0%
GTAATTAAGCCCACATTTCT+TGG - Chr6:100830710-100830729 MsG0680035229.01.T01:intron 35.0%
GTAGTTAACGTTACAGTATC+AGG + Chr6:100833318-100833337 None:intergenic 35.0%
GTGGATATCCATATAGCAAT+TGG + Chr6:100831903-100831922 None:intergenic 35.0%
TAAATCCGTCCGAAAATTGT+TGG + Chr6:100832859-100832878 None:intergenic 35.0%
TGAACTATACGAAACCAGTT+CGG + Chr6:100830455-100830474 None:intergenic 35.0%
TGCTAATTTGGAGAAGAGTA+TGG + Chr6:100832256-100832275 None:intergenic 35.0%
TGGTTTATTTAAGGAAGGAG+AGG - Chr6:100833767-100833786 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
TTAAGGTCCCATAACTAACA+TGG + Chr6:100833428-100833447 None:intergenic 35.0%
TTCAACACTCTTTCTCTAAG+GGG - Chr6:100833915-100833934 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
TTTATTGACGACATTCAGGA+TGG - Chr6:100830838-100830857 MsG0680035229.01.T01:intron 35.0%
! AATCTTTCTAAGAACCTGCA+AGG + Chr6:100833487-100833506 None:intergenic 35.0%
! AATTTCCTACGGTTTTCAGA+CGG - Chr6:100832817-100832836 MsG0680035229.01.T01:intron 35.0%
! ACAAAATTTCGGACGGTTTT+GGG - Chr6:100832438-100832457 MsG0680035229.01.T01:intron 35.0%
! ATGTGTTTTCGGACGAAATT+CGG - Chr6:100832500-100832519 MsG0680035229.01.T01:intron 35.0%
! ATTTTCCTACGGTTTTCAGA+CGG - Chr6:100832683-100832702 MsG0680035229.01.T01:intron 35.0%
! CACTTTACTGCTTGGTAATT+AGG - Chr6:100829546-100829565 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
! CGTCTGAAATATATTTCGGA+CGG + Chr6:100832583-100832602 None:intergenic 35.0%
! CTCTTATTCATGCTTTGTTC+GGG - Chr6:100834492-100834511 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
! CTTGTTCTATTTGGAGTTGT+TGG - Chr6:100828731-100828750 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
! GCAAGGTGAAAAATTGGTTT+AGG - Chr6:100831342-100831361 MsG0680035229.01.T01:intron 35.0%
! GCAGAGATAGCAACTTTTAT+CGG - Chr6:100829247-100829266 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
! GGGTCATACTATTAGCTTAT+TGG + Chr6:100831874-100831893 None:intergenic 35.0%
! GTAGTAAAAGTACGAACATC+CGG + Chr6:100833738-100833757 None:intergenic 35.0%
! GTTCATTAGTTGGTACTCAA+AGG - Chr6:100833148-100833167 MsG0680035229.01.T01:intron 35.0%
! TAGTAAAAGTACGAACATCC+GGG + Chr6:100833737-100833756 None:intergenic 35.0%
! TATTGATTGTGGAAAGGTGA+AGG - Chr6:100830776-100830795 MsG0680035229.01.T01:intron 35.0%
! TCCTGGTAAGGTTTTTAATG+AGG + Chr6:100832063-100832082 None:intergenic 35.0%
! TGGTAAGGTTTTTAATGAGG+CGG + Chr6:100832060-100832079 None:intergenic 35.0%
! TTACTGCTTGGTAATTAGGT+TGG - Chr6:100829550-100829569 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
! TTGCTAGAGGTCTTTTGTAA+AGG - Chr6:100834558-100834577 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
! TTTAATTTCGCTACCAAAGG+TGG - Chr6:100828557-100828576 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
! TTTGATGGATGGGTATTTCT+TGG - Chr6:100833863-100833882 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTCGGACAAAATTTCGGA+CGG - Chr6:100832431-100832450 MsG0680035229.01.T01:intron 35.0%
!! ATCAACGGGTTATGTAAATC+CGG - Chr6:100833447-100833466 MsG0680035229.01.T01:intron 35.0%
!! ATGAATTTCTCTAAGACCGT+AGG + Chr6:100830929-100830948 None:intergenic 35.0%
!! ATTGATGGACTTTGCAAATC+AGG - Chr6:100834077-100834096 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
!! GACTGTCATCACTTTTCTTT+TGG - Chr6:100829656-100829675 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
!! GATGACAAATGGGTTAAGAA+GGG - Chr6:100829073-100829092 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
!! GCTTCAGCTTTAGATATATG+AGG + Chr6:100830998-100831017 None:intergenic 35.0%
!! GTTAATGGGCTTTGTAAAGA+AGG - Chr6:100834392-100834411 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
!! TCTCTATAAAAGTTGGTTCG+AGG + Chr6:100830238-100830257 None:intergenic 35.0%
!! TGATGACAAATGGGTTAAGA+AGG - Chr6:100829072-100829091 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
!! TTGATGGACTTTGCAAATCA+GGG - Chr6:100834078-100834097 MsG0680035229.01.T01:CDS 35.0%
AAAGTAGAGAGAAGCAGAGA+AGG - Chr6:100831710-100831729 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
AAATTCCGTCTGAAAACCGT+AGG + Chr6:100832691-100832710 None:intergenic 40.0%
AACTAGTGAAACGTATGAGC+TGG - Chr6:100830582-100830601 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
AATACAACTATCTTCCCACC+AGG + Chr6:100829196-100829215 None:intergenic 40.0%
ACATATTGGGCTGAATTCCT+TGG + Chr6:100834250-100834269 None:intergenic 40.0%
ACCATTATGGACGATTCAAC+AGG - Chr6:100831427-100831446 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
AGCCATGGAGGATCAAAAAA+TGG + Chr6:100831379-100831398 None:intergenic 40.0%
AGCCTTGAAGTTGAAGTTGA+AGG + Chr6:100828482-100828501 None:intergenic 40.0%
AGGGAGAATCTCTGATGTTT+GGG - Chr6:100834097-100834116 MsG0680035229.01.T01:CDS 40.0%
ATATCCTCGATTGACATCCA+AGG + Chr6:100831948-100831967 None:intergenic 40.0%
ATATTCATAACACTCCCCCT+TGG - Chr6:100831928-100831947 MsG0680035229.01.T01:CDS 40.0%
ATGTTTGCTCCCCAAATCAT+TGG + Chr6:100831843-100831862 None:intergenic 40.0%
CAAACACAGTTGTGGGATAT+TGG - Chr6:100832623-100832642 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
CCAAAGGTGGTCCTTATAAT+AGG - Chr6:100828570-100828589 MsG0680035229.01.T01:CDS 40.0%
CCATGGAGGATCAAAAAATG+GGG + Chr6:100831377-100831396 None:intergenic 40.0%
CCTATTATAAGGACCACCTT+TGG + Chr6:100828573-100828592 None:intergenic 40.0%
CGAAAATACAATTTGCGACG+CGG + Chr6:100832551-100832570 None:intergenic 40.0%
CGGCCCTTTCTTTAAATCAA+GGG - Chr6:100830029-100830048 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
CTAGTTCATAACAATGCTGC+AGG + Chr6:100830568-100830587 None:intergenic 40.0%
CTGCGTGTTTGAAAAGATGA+AGG - Chr6:100828862-100828881 MsG0680035229.01.T01:CDS 40.0%
CTGTCGAAAATGGAAGACAA+TGG - Chr6:100834440-100834459 MsG0680035229.01.T01:CDS 40.0%
CTTCGTGAAATGATTGCTAG+AGG - Chr6:100834545-100834564 MsG0680035229.01.T01:CDS 40.0%
CTTGGTTAAAGAAGTCGACA+AGG - Chr6:100833881-100833900 MsG0680035229.01.T01:CDS 40.0%
GAACAAGCACCAATGATTTG+GGG - Chr6:100831831-100831850 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
GAATGTAAGAGCTTGACTAG+GGG - Chr6:100831159-100831178 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
GAATTTACGGAAACTTCCCA+CGG - Chr6:100832464-100832483 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
GACATTGAAAAACATCACCC+CGG - Chr6:100833716-100833735 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
GAGAATGTAAGAGCTTGACT+AGG - Chr6:100831157-100831176 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
GCAAGTGCAAGGTGAAAAAT+TGG - Chr6:100831336-100831355 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
GCCATGGAGGATCAAAAAAT+GGG + Chr6:100831378-100831397 None:intergenic 40.0%
GCCTCATTAAAAACCTTACC+AGG - Chr6:100832059-100832078 MsG0680035229.01.T01:CDS 40.0%
GGAACAAGCACCAATGATTT+GGG - Chr6:100831830-100831849 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
GGGAAGATAGTTGTATTCAC+CGG - Chr6:100829199-100829218 MsG0680035229.01.T01:CDS 40.0%
GGTCAAATGAAAGAAGCAGT+TGG - Chr6:100833678-100833697 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
GGTTCTTTCAACAACCCAAT+AGG + Chr6:100832295-100832314 None:intergenic 40.0%
GTACTGTAAGTGATCACATC+AGG + Chr6:100833633-100833652 None:intergenic 40.0%
GTGTTGTACATTACTACGTC+AGG + Chr6:100833528-100833547 None:intergenic 40.0%
GTTATGGGACCTTAATCAAC+GGG - Chr6:100833433-100833452 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
GTTGAATCGTCCATAATGGT+TGG + Chr6:100831427-100831446 None:intergenic 40.0%
TAAATCCGTCTGAAAACCGT+AGG + Chr6:100832825-100832844 None:intergenic 40.0%
TAAGTGAAGGCCAACCATTA+TGG - Chr6:100831414-100831433 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
TATCCTCGATTGACATCCAA+GGG + Chr6:100831947-100831966 None:intergenic 40.0%
TCTCAGAGAATAGGAACAAG+TGG - Chr6:100828596-100828615 MsG0680035229.01.T01:CDS 40.0%
TCTGAACTGTGGTAACAGTT+CGG + Chr6:100830187-100830206 None:intergenic 40.0%
TGAATTGCTCTTTCAAGCTC+AGG - Chr6:100831072-100831091 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
TGCAGTTCAGTTCAGCAATT+TGG + Chr6:100830407-100830426 None:intergenic 40.0%
TGCCTTCAACTTCAACTTCA+AGG - Chr6:100828477-100828496 MsG0680035229.01.T01:CDS 40.0%
TGGGATAAAACCATGGTCAA+GGG - Chr6:100832091-100832110 MsG0680035229.01.T01:CDS 40.0%
TGTGGGCTTAATTACACAAG+TGG + Chr6:100830705-100830724 None:intergenic 40.0%
TTGGCTCAATTAGTGTTACC+AGG - Chr6:100829870-100829889 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
TTTCGCACAAACACAGTTGT+GGG - Chr6:100832616-100832635 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
TTTCGTAGGTGACAGCATTA+GGG + Chr6:100834472-100834491 None:intergenic 40.0%
! ACTGAATTGGGAGATTTTGG+TGG - Chr6:100829138-100829157 MsG0680035229.01.T01:CDS 40.0%
! AGGGGTTGAAGGTTTTCTTT+AGG - Chr6:100831177-100831196 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
! AGTAAAAGTACGAACATCCG+GGG + Chr6:100833736-100833755 None:intergenic 40.0%
! CAATTCCGTCTGAAATTCGT+AGG + Chr6:100832791-100832810 None:intergenic 40.0%
! CTTTTCTTTTGGCGACCTTT+CGG - Chr6:100829667-100829686 MsG0680035229.01.T01:CDS 40.0%
! GACAAAATTTCGGACGGTTT+TGG - Chr6:100832437-100832456 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
! GACACAAACAAAGCTTTGTC+TGG - Chr6:100831282-100831301 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
! TATATCTAAAGCTGAAGCCG+AGG - Chr6:100831000-100831019 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
! TGGACTGAATTGGGAGATTT+TGG - Chr6:100829135-100829154 MsG0680035229.01.T01:CDS 40.0%
! TGTGGCATTTTATGCCAAGA+GGG - Chr6:100828672-100828691 MsG0680035229.01.T01:CDS 40.0%
! TTCGGACGGAAATGTGTTTT+CGG - Chr6:100832489-100832508 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
! TTTTCGCACAAACACAGTTG+TGG - Chr6:100832615-100832634 MsG0680035229.01.T01:intron 40.0%
!! ATGCCTTTTGTTTACCTGGT+GGG - Chr6:100829179-100829198 MsG0680035229.01.T01:CDS 40.0%
!! CAAATGGGTTAAGAAGGGTA+AGG - Chr6:100829078-100829097 MsG0680035229.01.T01:CDS 40.0%
!! CTATTTGGAGTTGTTGGTTC+AGG - Chr6:100828737-100828756 MsG0680035229.01.T01:CDS 40.0%
!! CTTGCGAGTCAACTTGTTTT+GGG + Chr6:100829917-100829936 None:intergenic 40.0%
!! GATTCTAGTTTCGAATGCCA+TGG - Chr6:100828823-100828842 MsG0680035229.01.T01:CDS 40.0%
!! GCATTTGGATGGACTGAATT+GGG - Chr6:100829126-100829145 MsG0680035229.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTGATGCCTTTTGTTTACC+TGG - Chr6:100829175-100829194 MsG0680035229.01.T01:CDS 40.0%
AACCCAGTGGGATAAAACCA+TGG - Chr6:100832084-100832103 MsG0680035229.01.T01:CDS 45.0%
AAGTAGTCAAGGCAAGTGCA+AGG - Chr6:100831325-100831344 MsG0680035229.01.T01:intron 45.0%
AATGCCATGGAGAAGAAGCT+TGG - Chr6:100828836-100828855 MsG0680035229.01.T01:CDS 45.0%
ACCCTCAAAGTGTGAGAGTT+GGG - Chr6:100828918-100828937 MsG0680035229.01.T01:CDS 45.0%
AGAAACTAAAGCTGCCTTGC+AGG - Chr6:100833470-100833489 MsG0680035229.01.T01:intron 45.0%
AGACTGAGCGGAGTGATTTA+GGG - Chr6:100828990-100829009 MsG0680035229.01.T01:CDS 45.0%
AGTTGAAGGGAATTGGCAGA+TGG - Chr6:100829036-100829055 MsG0680035229.01.T01:CDS 45.0%
ATAACCACGACTGAAAAGCG+TGG + Chr6:100832901-100832920 None:intergenic 45.0%
ATAGCGAGATCGGGAAATTC+TGG + Chr6:100828537-100828556 None:intergenic 45.0%
ATCCCAACTCTCACACTTTG+AGG + Chr6:100828923-100828942 None:intergenic 45.0%
ATCCTCGATTGACATCCAAG+GGG + Chr6:100831946-100831965 None:intergenic 45.0%
ATGGCCAAGATTCTCAAGCT+AGG - Chr6:100833285-100833304 MsG0680035229.01.T01:intron 45.0%
CAATTCCGTCCGAAATTCGT+AGG + Chr6:100832724-100832743 None:intergenic 45.0%
CAGGGAGAATCTCTGATGTT+TGG - Chr6:100834096-100834115 MsG0680035229.01.T01:CDS 45.0%
CATTGAACAAGGAGACTGAG+CGG - Chr6:100828978-100828997 MsG0680035229.01.T01:CDS 45.0%
CCATCCAAATGCGACGTATA+AGG + Chr6:100829118-100829137 None:intergenic 45.0%
CCTTATACGTCGCATTTGGA+TGG - Chr6:100829115-100829134 MsG0680035229.01.T01:CDS 45.0%
CTTCCCACCAGGTAAACAAA+AGG + Chr6:100829185-100829204 None:intergenic 45.0%
CTTCTATTAGTCGCATCAGC+AGG - Chr6:100830884-100830903 MsG0680035229.01.T01:intron 45.0%
GAGATGGAGCTTCTAAGTGA+AGG - Chr6:100831401-100831420 MsG0680035229.01.T01:intron 45.0%
GAGCGATATGAATGATGAGG+CGG - Chr6:100834514-100834533 MsG0680035229.01.T01:CDS 45.0%
GATTGTGGAAAGGTGAAGGA+CGG - Chr6:100830780-100830799 MsG0680035229.01.T01:intron 45.0%
GCAACCTTATACGTCGCATT+TGG - Chr6:100829111-100829130 MsG0680035229.01.T01:CDS 45.0%
GCCTGTTGAATCGTCCATAA+TGG + Chr6:100831431-100831450 None:intergenic 45.0%
GCGGCCCTTTCTTTAAATCA+AGG - Chr6:100830028-100830047 MsG0680035229.01.T01:intron 45.0%
GGACGAAATTCGGACAGATA+GGG - Chr6:100832510-100832529 MsG0680035229.01.T01:intron 45.0%
GGAGGCCAAAATCGTAAACT+CGG + Chr6:100829896-100829915 None:intergenic 45.0%
GGGAACAAGCACCAATGATT+TGG - Chr6:100831829-100831848 MsG0680035229.01.T01:intron 45.0%
GGGTATGGTTCAGAGAATGA+AGG - Chr6:100829010-100829029 MsG0680035229.01.T01:CDS 45.0%
GGTTCGAGGCAATTCGATAT+GGG + Chr6:100830224-100830243 None:intergenic 45.0%
GTGGGATAAAACCATGGTCA+AGG - Chr6:100832090-100832109 MsG0680035229.01.T01:CDS 45.0%
GTTTCGTAGGTGACAGCATT+AGG + Chr6:100834473-100834492 None:intergenic 45.0%
TCCCAACTCTCACACTTTGA+GGG + Chr6:100828922-100828941 None:intergenic 45.0%
TGGTTCGAGGCAATTCGATA+TGG + Chr6:100830225-100830244 None:intergenic 45.0%
TGTATTGCATGAGCATGCTG+AGG - Chr6:100831036-100831055 MsG0680035229.01.T01:intron 45.0%
TTCGTAGGTGACAGCATTAG+GGG + Chr6:100834471-100834490 None:intergenic 45.0%
TTGTAAGTGATCACATCGGC+AGG + Chr6:100834155-100834174 None:intergenic 45.0%
! AACCAATCTTTTGCCCCTCT+TGG + Chr6:100828689-100828708 None:intergenic 45.0%
! AATTTGCGACGCGGCTTTTT+CGG + Chr6:100832542-100832561 None:intergenic 45.0%
! ACGTGTGTTCGGTTTGTGTA+AGG + Chr6:100828803-100828822 None:intergenic 45.0%
! AGCAACTTTTATCGGACGTG+AGG - Chr6:100829255-100829274 MsG0680035229.01.T01:CDS 45.0%
! CAAGGCAGCTTTAGTTTCTC+CGG + Chr6:100833469-100833488 None:intergenic 45.0%
! CAATTCCGTCTGAAATCCGT+AGG + Chr6:100832758-100832777 None:intergenic 45.0%
! CACTCTTTTTCCCTTGACCA+TGG + Chr6:100832104-100832123 None:intergenic 45.0%
! GGTGAAGGACGGTAATTTGT+TGG - Chr6:100830791-100830810 MsG0680035229.01.T01:intron 45.0%
! GTGGCATTTTATGCCAAGAG+GGG - Chr6:100828673-100828692 MsG0680035229.01.T01:CDS 45.0%
! GTGTGGCATTTTATGCCAAG+AGG - Chr6:100828671-100828690 MsG0680035229.01.T01:CDS 45.0%
! TTTATCCCACTGGGTTTTCC+TGG + Chr6:100832080-100832099 None:intergenic 45.0%
! TTTTCCACGCTTTTCAGTCG+TGG - Chr6:100832894-100832913 MsG0680035229.01.T01:intron 45.0%
!! CGCATTTGGATGGACTGAAT+TGG - Chr6:100829125-100829144 MsG0680035229.01.T01:CDS 45.0%
!! GATCGGGAAATTCTGGAGTT+AGG + Chr6:100828530-100828549 None:intergenic 45.0%
!! GATGCCTTTTGTTTACCTGG+TGG - Chr6:100829178-100829197 MsG0680035229.01.T01:CDS 45.0%
!! GCTTGCGAGTCAACTTGTTT+TGG + Chr6:100829918-100829937 None:intergenic 45.0%
!!! AATTTCGGACGGTTTTGGGA+CGG - Chr6:100832442-100832461 MsG0680035229.01.T01:intron 45.0%
!!! CCCCATTTTTTGATCCTCCA+TGG - Chr6:100831374-100831393 MsG0680035229.01.T01:intron 45.0%
!!! CGGTTTTGGGACGGAATTTA+CGG - Chr6:100832451-100832470 MsG0680035229.01.T01:intron 45.0%
!!! GACCATGGTTTTATCCCACT+GGG + Chr6:100832089-100832108 None:intergenic 45.0%
!!! GCGAGTCTTTTGAGTTTGTG+CGG + Chr6:100829952-100829971 None:intergenic 45.0%
!!! TGACCATGGTTTTATCCCAC+TGG + Chr6:100832090-100832109 None:intergenic 45.0%
AAACTGCTCAGCACTGTGTC+TGG + Chr6:100829587-100829606 None:intergenic 50.0%
AACTTCCCACGGAATTCGGA+CGG - Chr6:100832475-100832494 MsG0680035229.01.T01:intron 50.0%
ACATTTCCGTCCGAATTCCG+TGG + Chr6:100832484-100832503 None:intergenic 50.0%
ACCTTACCAGGAAAACCCAG+TGG - Chr6:100832071-100832090 MsG0680035229.01.T01:CDS 50.0%
AGAGCTTGACTAGGGGTTGA+AGG - Chr6:100831166-100831185 MsG0680035229.01.T01:intron 50.0%
AGGTTCTGTAACAATGCCGC+TGG + Chr6:100830548-100830567 None:intergenic 50.0%
CACCCTCAAAGTGTGAGAGT+TGG - Chr6:100828917-100828936 MsG0680035229.01.T01:CDS 50.0%
CATTTCCGTCCGAATTCCGT+GGG + Chr6:100832483-100832502 None:intergenic 50.0%
CCAAAATCGTAAACTCGGCC+TGG + Chr6:100829891-100829910 None:intergenic 50.0%
CCTTACCAGGAAAACCCAGT+GGG - Chr6:100832072-100832091 MsG0680035229.01.T01:CDS 50.0%
CGGAAACTTCCCACGGAATT+CGG - Chr6:100832471-100832490 MsG0680035229.01.T01:intron 50.0%
CGGACGAAATTCGGACAGAT+AGG - Chr6:100832509-100832528 MsG0680035229.01.T01:intron 50.0%
CGGGAGCGATATGAATGATG+AGG - Chr6:100834511-100834530 MsG0680035229.01.T01:CDS 50.0%
GAAGCTCCATCTCAAAGCCA+TGG + Chr6:100831394-100831413 None:intergenic 50.0%
GAGACTGAGCGGAGTGATTT+AGG - Chr6:100828989-100829008 MsG0680035229.01.T01:CDS 50.0%
GCTCGCTAAAGCTCAGGTAA+TGG - Chr6:100831114-100831133 MsG0680035229.01.T01:intron 50.0%
GTCTCCAAGCTTCTTCTCCA+TGG + Chr6:100828843-100828862 None:intergenic 50.0%
GTGATACGCCCAATCCTCAT+CGG - Chr6:100830516-100830535 MsG0680035229.01.T01:intron 50.0%
TCCTCGATTGACATCCAAGG+GGG + Chr6:100831945-100831964 None:intergenic 50.0%
TGAAGGGAATTGGCAGATGG+AGG - Chr6:100829039-100829058 MsG0680035229.01.T01:CDS 50.0%
TGATACGCCCAATCCTCATC+GGG - Chr6:100830517-100830536 MsG0680035229.01.T01:intron 50.0%
TGCCAAGAGGGGCAAAAGAT+TGG - Chr6:100828684-100828703 MsG0680035229.01.T01:CDS 50.0%
TTTGGCGACCTTTCGGAGAA+AGG - Chr6:100829674-100829693 MsG0680035229.01.T01:CDS 50.0%
! ACACTTTGAGGGTGTGTTGC+CGG + Chr6:100828911-100828930 None:intergenic 50.0%
! CCAGGCCGAGTTTACGATTT+TGG - Chr6:100829888-100829907 MsG0680035229.01.T01:intron 50.0%
! CTGAGCTTTAGCGAGCGATT+CGG + Chr6:100831110-100831129 None:intergenic 50.0%
! CTGTAACAATGCCGCTGGTT+TGG + Chr6:100830543-100830562 None:intergenic 50.0%
! GAGCGGAGTGATTTAGGGTA+TGG - Chr6:100828995-100829014 MsG0680035229.01.T01:CDS 50.0%
!! GATCCTCCATGGCTTTGAGA+TGG - Chr6:100831385-100831404 MsG0680035229.01.T01:intron 50.0%
!!! GCGAGTCAACTTGTTTTGGG+AGG + Chr6:100829914-100829933 None:intergenic 50.0%
AGCAGGCTATGATCCTCGTG+TGG - Chr6:100830901-100830920 MsG0680035229.01.T01:intron 55.0%
CGAATCGCTCGCTAAAGCTC+AGG - Chr6:100831108-100831127 MsG0680035229.01.T01:intron 55.0%
GCTCCATCTCAAAGCCATGG+AGG + Chr6:100831391-100831410 None:intergenic 55.0%
GGTTTGGCCCGATGAGGATT+GGG + Chr6:100830527-100830546 None:intergenic 55.0%
TCCCCCTTGGATGTCAATCG+AGG - Chr6:100831941-100831960 MsG0680035229.01.T01:CDS 55.0%
TGATCCTCGTGTGGCTCCTA+CGG - Chr6:100830910-100830929 MsG0680035229.01.T01:intron 55.0%
! CCCACTGGGTTTTCCTGGTA+AGG + Chr6:100832075-100832094 None:intergenic 55.0%
! TGGTTTGGCCCGATGAGGAT+TGG + Chr6:100830528-100830547 None:intergenic 55.0%
AAGACCGTAGGAGCCACACG+AGG + Chr6:100830917-100830936 None:intergenic 60.0%
TCCTCATCGGGCCAAACCAG+CGG - Chr6:100830529-100830548 MsG0680035229.01.T01:intron 60.0%
!! GCCGCTGGTTTGGCCCGATG+AGG + Chr6:100830533-100830552 None:intergenic 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 100828425 100834577 100828425 ID=MsG0680035229.01;Name=MsG0680035229.01
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Chr6 exon 100833726 100834577 100833726 ID=MsG0680035229.01.T01:exon:20667;Parent=MsG0680035229.01.T01
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Chr6 exon 100831840 100832146 100831840 ID=MsG0680035229.01.T01:exon:20665;Parent=MsG0680035229.01.T01
Chr6 exon 100828425 100829708 100828425 ID=MsG0680035229.01.T01:exon:20664;Parent=MsG0680035229.01.T01
Chr6 CDS 100833726 100834577 100833726 ID=MsG0680035229.01.T01:cds;Parent=MsG0680035229.01.T01
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Chr6 CDS 100831840 100832146 100831840 ID=MsG0680035229.01.T01:cds;Parent=MsG0680035229.01.T01
Chr6 CDS 100828425 100829708 100828425 ID=MsG0680035229.01.T01:cds;Parent=MsG0680035229.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680035229.01.T01

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Protein sequence

>MsG0680035229.01.T01

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