AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035251.01

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MsG0680035251.01.T01 AT4G19440 29.136 405 266 4 18 402 392 795 3.66e-55 195
MsG0680035251.01.T01 AT4G19440 31.707 328 224 0 11 338 490 817 1.50e-54 193
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MsG0680035251.01.T01 AT4G19440 25.393 445 278 3 11 401 280 724 2.46e-49 179
MsG0680035251.01.T01 AT4G19440 27.346 373 254 2 6 377 449 805 8.05e-45 166
MsG0680035251.01.T01 AT4G19440 31.818 264 180 0 11 274 560 823 1.48e-41 156
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MsG0680035251.01.T01 AT5G04810 23.562 365 259 3 39 401 309 655 2.02e-35 139
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MsG0680035251.01.T01 AT1G02060 29.949 197 123 2 206 401 130 312 4.54e-22 99.0
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MsG0680035251.01.T01 AT2G26790 27.855 359 226 4 45 396 187 519 3.99e-38 146
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MsG0680035251.01.T01 AT4G26680 27.700 213 154 0 11 223 280 492 9.85e-25 106
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MsG0680035251.01.T01 AT4G26680 30.000 160 112 0 11 170 350 509 5.99e-17 83.2
MsG0680035251.01.T01 AT4G26680 30.038 263 184 0 13 275 247 509 1.45e-41 154
MsG0680035251.01.T01 AT4G26680 27.632 304 213 1 54 350 176 479 1.73e-40 150
MsG0680035251.01.T01 AT4G26680 27.640 322 233 0 34 355 198 519 8.23e-39 146
MsG0680035251.01.T01 AT4G26680 26.984 315 209 2 106 401 167 479 8.06e-35 135
MsG0680035251.01.T01 AT4G26680 27.562 283 203 1 17 299 216 496 8.95e-33 129
MsG0680035251.01.T01 AT4G26680 27.700 213 154 0 11 223 280 492 9.85e-25 106
MsG0680035251.01.T01 AT4G26680 23.438 256 180 1 147 402 171 410 1.36e-22 100
MsG0680035251.01.T01 AT4G26680 30.000 160 112 0 11 170 350 509 5.99e-17 83.2
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MsG0680035251.01.T01 AT1G18900 29.841 315 215 4 23 334 347 658 2.50e-41 156
MsG0680035251.01.T01 AT1G18900 28.295 258 167 3 145 401 365 605 3.86e-30 123
MsG0680035251.01.T01 AT1G18900 24.484 339 250 4 20 355 415 750 4.11e-24 105
MsG0680035251.01.T01 AT1G18900 29.841 315 215 4 23 334 347 658 2.50e-41 156
MsG0680035251.01.T01 AT1G18900 28.295 258 167 3 145 401 365 605 3.86e-30 123
MsG0680035251.01.T01 AT1G18900 24.484 339 250 4 20 355 415 750 4.11e-24 105
MsG0680035251.01.T01 AT1G18900 29.841 315 215 4 23 334 347 658 2.50e-41 156
MsG0680035251.01.T01 AT1G18900 28.295 258 167 3 145 401 365 605 3.86e-30 123
MsG0680035251.01.T01 AT1G18900 24.484 339 250 4 20 355 415 750 4.11e-24 105
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MsG0680035251.01.T01 AT3G59040 26.804 291 188 5 106 393 171 439 2.14e-28 117
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MsG0680035251.01.T01 AT1G13800 24.884 430 265 8 18 401 410 827 8.75e-40 151
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MsG0680035251.01.T01 AT3G59040 26.804 291 188 5 106 393 178 446 1.92e-28 117
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MsG0680035251.01.T01 AT2G35130 24.719 267 181 3 139 401 150 400 1.27e-21 97.4
MsG0680035251.01.T01 AT2G35130 21.141 298 195 2 13 310 313 570 1.34e-16 82.0
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MsG0680035251.01.T01 AT5G08310 24.919 309 172 8 142 402 175 471 8.47e-18 86.3
MsG0680035251.01.T01 AT5G08310 26.404 178 131 0 9 186 619 796 1.18e-12 70.1
MsG0680035251.01.T01 AT5G08310 27.013 385 257 4 18 400 422 784 1.17e-38 148
MsG0680035251.01.T01 AT5G08310 25.472 424 276 5 15 401 225 645 1.78e-36 142
MsG0680035251.01.T01 AT5G08310 25.081 307 230 0 11 317 481 787 3.22e-29 120
MsG0680035251.01.T01 AT5G08310 28.625 269 192 0 23 291 528 796 2.26e-26 112
MsG0680035251.01.T01 AT5G08310 23.022 417 246 7 41 401 143 540 3.47e-23 102
MsG0680035251.01.T01 AT5G08310 30.097 206 144 0 4 209 579 784 4.29e-22 99.4
MsG0680035251.01.T01 AT5G08310 24.919 309 172 8 142 402 175 471 8.47e-18 86.3
MsG0680035251.01.T01 AT5G08310 26.404 178 131 0 9 186 619 796 1.18e-12 70.1
MsG0680035251.01.T01 AT1G07740 27.095 358 245 2 23 380 65 406 1.65e-38 144
MsG0680035251.01.T01 AT1G07740 29.856 278 195 0 18 295 165 442 1.28e-36 139
MsG0680035251.01.T01 AT1G07740 28.492 179 128 0 13 191 265 443 1.59e-17 84.7
MsG0680035251.01.T01 AT1G07740 23.810 231 154 3 192 400 56 286 7.47e-12 67.0
MsG0680035251.01.T01 AT5G40400 28.804 368 245 3 31 397 229 580 1.87e-38 147
MsG0680035251.01.T01 AT5G40400 26.346 353 244 2 26 377 329 666 4.75e-37 143
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MsG0680035251.01.T01 AT5G40400 27.953 254 165 3 126 377 217 454 7.30e-28 116
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MsG0680035251.01.T01 AT2G18940 23.052 308 231 2 34 338 486 790 3.82e-27 114
MsG0680035251.01.T01 AT2G18940 25.131 191 126 2 213 402 209 383 1.89e-15 79.0
MsG0680035251.01.T01 AT5G50280 25.490 357 248 3 42 396 276 616 3.53e-34 135
MsG0680035251.01.T01 AT5G50280 22.507 351 249 4 28 374 333 664 1.85e-30 124
MsG0680035251.01.T01 AT5G50280 24.768 323 240 2 4 325 346 666 1.12e-28 119
MsG0680035251.01.T01 AT5G50280 27.225 191 122 3 212 401 271 445 7.15e-15 77.0
MsG0680035251.01.T01 AT3G17370 31.604 212 132 3 96 307 1 199 4.42e-34 126
MsG0680035251.01.T01 AT3G17370 28.856 201 130 2 37 237 12 199 2.95e-24 100
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MsG0680035251.01.T01 AT3G17370 28.302 212 120 3 201 393 1 199 2.75e-23 97.4
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MsG0680035251.01.T01 AT3G04130 26.364 330 233 5 18 341 169 494 2.68e-29 119
MsG0680035251.01.T01 AT3G04130 23.121 346 248 7 18 348 88 430 4.74e-24 104
MsG0680035251.01.T01 AT3G04130 25.000 240 177 3 11 247 231 470 1.05e-16 82.4
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MsG0680035251.01.T01 AT5G43820 22.814 263 203 0 9 271 260 522 1.10e-19 91.3
MsG0680035251.01.T01 AT5G43820 22.909 275 194 4 129 402 135 392 4.32e-19 89.7
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MsG0680035251.01.T01 AT5G15010 27.446 368 207 11 73 401 160 506 7.78e-29 118
MsG0680035251.01.T01 AT5G15010 27.046 281 195 6 42 318 235 509 2.44e-27 114
MsG0680035251.01.T01 AT5G15010 27.778 216 152 3 34 248 297 509 1.19e-21 97.4
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MsG0680035251.01.T01 AT1G80550 26.374 273 195 3 13 282 160 429 1.97e-28 116
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MsG0680035251.01.T01 AT3G15200 24.579 297 186 7 126 400 102 382 6.14e-15 77.0
MsG0680035251.01.T01 AT1G55890 26.996 263 191 1 78 339 113 375 1.55e-29 118
MsG0680035251.01.T01 AT1G55890 27.103 214 155 1 60 272 165 378 7.13e-26 108
MsG0680035251.01.T01 AT1G55890 22.707 229 151 4 192 400 93 315 1.66e-15 78.2
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MsG0680035251.01.T01 AT3G53170 23.729 354 227 10 79 401 46 387 3.02e-15 77.8
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MsG0680035251.01.T01 AT3G14330 25.952 289 198 5 60 347 261 534 2.08e-21 97.1
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MsG0680035251.01.T01 AT1G05750 23.871 310 182 7 74 343 36 331 6.91e-19 89.0
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MsG0680035251.01.T01 AT4G18750 20.739 352 255 4 38 373 260 603 2.48e-16 81.6
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MsG0680035251.01.T01 AT3G05240 23.546 361 209 14 72 373 70 422 8.27e-14 73.6
MsG0680035251.01.T01 AT1G28690 22.150 307 216 6 43 338 135 429 2.00e-19 90.5
MsG0680035251.01.T01 AT1G28690 22.414 290 192 7 107 373 98 377 1.14e-13 72.8
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MsG0680035251.01.T01 AT1G50270 24.793 242 172 5 7 246 308 541 4.13e-15 77.4
MsG0680035251.01.T01 AT4G04370 22.714 339 220 7 42 349 14 341 3.11e-17 84.3
MsG0680035251.01.T01 AT4G04370 21.221 344 250 7 9 346 316 644 3.43e-13 71.6
MsG0680035251.01.T01 AT4G04370 21.718 419 273 8 26 397 166 576 3.78e-13 71.6
MsG0680035251.01.T01 AT4G04370 23.293 249 168 4 140 373 8 248 2.36e-12 69.3
MsG0680035251.01.T01 AT4G39530 21.975 314 234 3 40 350 215 520 3.32e-17 84.3
MsG0680035251.01.T01 AT4G39530 22.327 318 191 7 78 354 389 691 1.42e-16 82.4
MsG0680035251.01.T01 AT4G39530 20.202 396 259 5 27 373 272 659 2.10e-16 82.0
MsG0680035251.01.T01 AT4G39530 19.688 320 219 5 63 348 405 720 2.14e-13 72.4
MsG0680035251.01.T01 AT4G36680 22.337 291 220 4 76 363 104 391 3.86e-17 83.2
MsG0680035251.01.T01 AT4G36680 21.111 270 205 4 20 285 118 383 2.64e-15 77.4
MsG0680035251.01.T01 AT1G74600 19.872 312 241 4 38 348 515 818 4.29e-17 84.0
MsG0680035251.01.T01 AT1G74600 20.181 441 262 10 20 379 131 562 1.26e-13 73.2
MsG0680035251.01.T01 AT1G74600 22.222 306 202 5 71 345 112 412 1.22e-12 70.1
MsG0680035251.01.T01 AT1G77010 21.359 412 284 8 1 396 190 577 4.92e-17 83.6
MsG0680035251.01.T01 AT1G77010 22.989 261 188 5 41 297 381 632 9.73e-15 76.6
MsG0680035251.01.T01 AT1G77010 22.742 299 213 6 73 370 352 633 1.31e-13 73.2
MsG0680035251.01.T01 AT2G40240 23.671 207 154 2 146 350 109 313 5.05e-17 82.0
MsG0680035251.01.T01 AT2G40240 22.764 246 179 2 35 280 79 313 3.53e-13 70.9
MsG0680035251.01.T01 AT4G15720 23.676 321 200 9 86 377 76 380 6.14e-17 83.2
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MsG0680035251.01.T01 AT1G30610 21.945 401 236 8 45 400 475 843 7.05e-17 83.6
MsG0680035251.01.T01 AT1G30610 20.909 330 207 9 33 349 555 843 6.00e-12 68.2
MsG0680035251.01.T01 AT1G30610 24.257 202 120 5 217 402 510 694 2.55e-11 66.2
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MsG0680035251.01.T01 AT5G03560 25.595 168 119 3 197 362 183 346 1.14e-14 75.1
MsG0680035251.01.T01 AT5G03560 24.118 170 109 3 234 402 185 335 1.73e-13 71.6
MsG0680035251.01.T01 AT5G03560 26.923 156 108 3 130 283 186 337 3.50e-12 67.8
MsG0680035251.01.T01 AT5G03560 29.870 154 103 3 26 178 188 337 7.47e-17 81.6
MsG0680035251.01.T01 AT5G03560 27.152 151 104 3 64 213 192 337 2.78e-16 80.1
MsG0680035251.01.T01 AT5G03560 25.595 168 119 3 197 362 183 346 1.14e-14 75.1
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MsG0680035251.01.T01 AT5G03560 29.870 154 103 3 26 178 188 337 7.47e-17 81.6
MsG0680035251.01.T01 AT5G03560 27.152 151 104 3 64 213 192 337 2.78e-16 80.1
MsG0680035251.01.T01 AT5G03560 25.595 168 119 3 197 362 183 346 1.14e-14 75.1
MsG0680035251.01.T01 AT5G03560 24.118 170 109 3 234 402 185 335 1.73e-13 71.6
MsG0680035251.01.T01 AT5G03560 26.923 156 108 3 130 283 186 337 3.50e-12 67.8
MsG0680035251.01.T01 AT3G25970 22.961 331 241 5 18 345 80 399 9.91e-17 82.8
MsG0680035251.01.T01 AT3G25970 20.519 385 247 11 3 346 239 605 9.52e-13 70.5
MsG0680035251.01.T01 AT1G09220 24.601 313 197 12 92 397 176 456 1.01e-16 82.4
MsG0680035251.01.T01 AT1G09220 22.000 350 193 10 38 350 188 494 2.07e-11 65.9
MsG0680035251.01.T01 AT2G29760 21.515 330 245 5 11 338 204 521 1.03e-16 82.8
MsG0680035251.01.T01 AT2G29760 20.984 305 217 4 108 396 196 492 7.23e-15 77.0
MsG0680035251.01.T01 AT2G29760 23.077 260 190 4 107 365 93 343 1.14e-14 76.3
MsG0680035251.01.T01 AT2G29760 20.690 290 216 6 44 331 268 545 9.65e-14 73.6
MsG0680035251.01.T01 AT2G29760 22.053 263 191 6 38 298 297 547 2.08e-12 69.3
MsG0680035251.01.T01 AT3G53360 20.424 377 278 5 38 399 335 704 1.11e-16 82.8
MsG0680035251.01.T01 AT3G53360 22.397 317 189 11 44 318 69 370 1.18e-13 73.2
MsG0680035251.01.T01 AT3G53360 20.922 282 214 3 11 291 140 413 1.84e-12 69.7
MsG0680035251.01.T01 AT3G53360 20.680 353 255 7 38 373 233 577 3.07e-11 65.9
MsG0680035251.01.T01 AT3G53360 20.424 377 278 5 38 399 335 704 1.11e-16 82.8
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MsG0680035251.01.T01 AT4G30700 22.408 299 216 7 40 334 351 637 1.14e-16 82.8
MsG0680035251.01.T01 AT4G30700 21.705 387 249 12 38 395 286 647 2.60e-14 75.5
MsG0680035251.01.T01 AT3G02010 24.859 354 212 11 63 401 33 347 1.21e-16 82.4
MsG0680035251.01.T01 AT2G01390 21.713 327 237 5 24 350 107 414 1.24e-16 82.4
MsG0680035251.01.T01 AT2G01390 26.339 224 146 2 173 396 116 320 6.54e-15 77.0
MsG0680035251.01.T01 AT2G01390 22.963 405 261 11 33 395 151 546 4.66e-14 74.3

Find 62 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 78 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TGTTACTTATAACTCTTTAA+TGG 0.184388 6:-101091033 MsG0680035251.01.T01:CDS
CTTAACAAGGGAACCTAAAA+TGG 0.256676 6:+101091562 None:intergenic
TTTGTTTAATAAAATGATTT+TGG 0.267107 6:-101091180 MsG0680035251.01.T01:CDS
AGTTACAATATCTTGATTAA+TGG 0.267963 6:-101090924 MsG0680035251.01.T01:CDS
AGTTACGGTACCTTGATTAA+TGG 0.271946 6:-101091449 MsG0680035251.01.T01:CDS
AATTACTTACAATTCTATAT+TGG 0.289788 6:-101090718 MsG0680035251.01.T01:CDS
GTTACAATATCTTGATTAAT+GGG 0.317647 6:-101090923 MsG0680035251.01.T01:CDS
CATTTCTTCAAAGAGATTCA+TGG 0.328931 6:+101090872 None:intergenic
GTTACGGTACCTTGATTAAT+GGG 0.356009 6:-101091448 MsG0680035251.01.T01:CDS
ACTTACAGTGCTTTAATTAG+TGG 0.361903 6:-101091239 MsG0680035251.01.T01:CDS
AGGCTTGTTTGATGAATCAT+TGG 0.363423 6:-101090526 MsG0680035251.01.T01:CDS
TATTAAAAGTATACACATTC+GGG 0.364236 6:+101091147 None:intergenic
CCTAGTTTCAGTGTTACAAT+AGG 0.371496 6:+101090370 None:intergenic
ATTTCATAAGTAACGGCGTT+TGG 0.372565 6:+101090468 None:intergenic
ATGTATAGTACGATTATTGA+TGG 0.383279 6:-101091344 MsG0680035251.01.T01:CDS
TGTTGATGGTTTGTGTAAAT+CGG 0.384895 6:-101090805 MsG0680035251.01.T01:CDS
GTACTATACATTACCACATT+AGG 0.386526 6:+101091356 None:intergenic
ACTTACAGTTCCCTTGTTGA+TGG 0.387522 6:-101090819 MsG0680035251.01.T01:CDS
GCACTGTAAGTGACAACATT+AGG 0.399897 6:+101091251 None:intergenic
CATTATTCACTTCTTTAACT+AGG 0.406106 6:+101091000 None:intergenic
ATAGTGTATGTACACATATC+TGG 0.409542 6:+101090621 None:intergenic
ATATTAAAAGTATACACATT+CGG 0.412962 6:+101091146 None:intergenic
ACATACACTATACTTGTTGA+TGG 0.424059 6:-101090609 MsG0680035251.01.T01:CDS
GAATTGTAAGTAATTATATC+AGG 0.424389 6:+101090726 None:intergenic
TTATAAAGATGAAAATGATA+AGG 0.426704 6:-101090427 MsG0680035251.01.T01:CDS
ATTAATGGGTTATGTAAAGT+TGG 0.432159 6:-101091434 MsG0680035251.01.T01:CDS
CAATTGTTGAAACGAGTTGA+TGG 0.437616 6:-101091392 MsG0680035251.01.T01:CDS
GTTGATGGTTTGTGTAAATC+GGG 0.444751 6:-101090804 MsG0680035251.01.T01:CDS
GAGTTATAAGTAACAACATC+AGG 0.464642 6:+101091041 None:intergenic
TATATTCAAGACAATGGCTC+AGG 0.465765 6:-101090970 MsG0680035251.01.T01:CDS
TTTACATAACCCATTAATCA+AGG 0.485797 6:+101091439 None:intergenic
ATTATTGATGGTTTGTGCAA+AGG 0.486994 6:-101091332 MsG0680035251.01.T01:CDS
CATTTAGACCAAGTTAGTTA+CGG 0.490319 6:-101091464 MsG0680035251.01.T01:CDS
AATTGTTGAAACGAGTTGAT+GGG 0.491988 6:-101091391 MsG0680035251.01.T01:CDS
TCAAGGTACCGTAACTAACT+TGG 0.492403 6:+101091456 None:intergenic
ACTTATAACTCTTTAATGGA+TGG 0.499169 6:-101091029 MsG0680035251.01.T01:CDS
GGCTTGTTTGATGAATCATT+GGG 0.503811 6:-101090525 MsG0680035251.01.T01:CDS
GAACTGTAAGTTACCACGTC+AGG 0.518443 6:+101090831 None:intergenic
TTAACGAAGTTGAAAGGCGA+AGG 0.542182 6:-101090651 MsG0680035251.01.T01:CDS
GATGATTATTTCATAAGTAA+CGG 0.550559 6:+101090461 None:intergenic
TCATTCTTAACGAAGTTGAA+AGG 0.557473 6:-101090657 MsG0680035251.01.T01:CDS
GAAATTTGTTCAACCTAATG+TGG 0.557950 6:-101091369 MsG0680035251.01.T01:CDS
ATTCAAGACAATGGCTCAGG+GGG 0.567332 6:-101090967 MsG0680035251.01.T01:CDS
ATTGCACTTTCATGACAAGC+TGG 0.569134 6:-101091501 MsG0680035251.01.T01:CDS
TCATGACAAGCTGGTAACGC+AGG 0.573200 6:-101091492 MsG0680035251.01.T01:CDS
CATGACAAGCTGGTAACGCA+GGG 0.573993 6:-101091491 MsG0680035251.01.T01:CDS
GTATTGTAAGATTAAAATGA+TGG 0.579713 6:-101090901 MsG0680035251.01.T01:CDS
CAGAAACATTATTCCTGACG+TGG 0.581192 6:-101090844 MsG0680035251.01.T01:CDS
TAAAGATGAAAATGATAAGG+CGG 0.594875 6:-101090424 MsG0680035251.01.T01:CDS
ATATTCAAGACAATGGCTCA+GGG 0.599769 6:-101090969 MsG0680035251.01.T01:CDS
TGAAAGTATATTCAAGACAA+TGG 0.615683 6:-101090976 MsG0680035251.01.T01:CDS
AGAGACCTAAAATCTTAACA+AGG 0.637538 6:+101091549 None:intergenic
CTTCGTGAAATGATTACGAG+AGG 0.649907 6:-101090393 MsG0680035251.01.T01:CDS
ATTTACACAAACCATCAACA+AGG 0.667394 6:+101090808 None:intergenic
TTGTAAGTAATTATATCAGG+TGG 0.667901 6:+101090729 None:intergenic
GAGACCTAAAATCTTAACAA+GGG 0.668204 6:+101091550 None:intergenic
GTCAATGAGATGCATGACAG+AGG 0.676438 6:-101090756 MsG0680035251.01.T01:CDS
TTGATGGTTTGTGTAAATCG+GGG 0.692297 6:-101090803 MsG0680035251.01.T01:CDS
TTTACACAAACCATCAACAA+GGG 0.699882 6:+101090809 None:intergenic
TATTCAAGACAATGGCTCAG+GGG 0.702603 6:-101090968 MsG0680035251.01.T01:CDS
TTCAAGACAATGGCTCAGGG+GGG 0.724237 6:-101090966 MsG0680035251.01.T01:CDS
TTAGCTATGATGATGAAACA+AGG 0.779554 6:-101091071 MsG0680035251.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TTTGTTTAATAAAATGATTT+TGG - Chr6:101090772-101090791 MsG0680035251.01.T01:CDS 10.0%
!! AATTACTTACAATTCTATAT+TGG - Chr6:101091234-101091253 MsG0680035251.01.T01:CDS 15.0%
!! TTATAAAGATGAAAATGATA+AGG - Chr6:101091525-101091544 MsG0680035251.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATATTAAAAGTATACACATT+CGG + Chr6:101090809-101090828 None:intergenic 15.0%
!!! TGTGTATACTTTTAATATAT+TGG - Chr6:101090811-101090830 MsG0680035251.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTTTGATTTATATTCTGAAA+TGG - Chr6:101090661-101090680 MsG0680035251.01.T01:CDS 15.0%
!! AGTTACAATATCTTGATTAA+TGG - Chr6:101091028-101091047 MsG0680035251.01.T01:CDS 20.0%
!! GAATTGTAAGTAATTATATC+AGG + Chr6:101091229-101091248 None:intergenic 20.0%
!! GATGATTATTTCATAAGTAA+CGG + Chr6:101091494-101091513 None:intergenic 20.0%
!! GTATTGTAAGATTAAAATGA+TGG - Chr6:101091051-101091070 MsG0680035251.01.T01:CDS 20.0%
!! GTTACAATATCTTGATTAAT+GGG - Chr6:101091029-101091048 MsG0680035251.01.T01:CDS 20.0%
!!! ACTTTTAATATATTGGTTGA+TGG - Chr6:101090818-101090837 MsG0680035251.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATTAAAAGTATACACATTC+GGG + Chr6:101090808-101090827 None:intergenic 20.0%
!!! TGTTACTTATAACTCTTTAA+TGG - Chr6:101090919-101090938 MsG0680035251.01.T01:CDS 20.0%
! ACTTATAACTCTTTAATGGA+TGG - Chr6:101090923-101090942 MsG0680035251.01.T01:CDS 25.0%
! ATGTATAGTACGATTATTGA+TGG - Chr6:101090608-101090627 MsG0680035251.01.T01:CDS 25.0%
! CATTATTCACTTCTTTAACT+AGG + Chr6:101090955-101090974 None:intergenic 25.0%
! TAAAGATGAAAATGATAAGG+CGG - Chr6:101091528-101091547 MsG0680035251.01.T01:CDS 25.0%
! TTGTAAGTAATTATATCAGG+TGG + Chr6:101091226-101091245 None:intergenic 25.0%
! TTTACATAACCCATTAATCA+AGG + Chr6:101090516-101090535 None:intergenic 25.0%
!! TGAAAGTATATTCAAGACAA+TGG - Chr6:101090976-101090995 MsG0680035251.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTAATGGGTTATGTAAAGT+TGG - Chr6:101090518-101090537 MsG0680035251.01.T01:CDS 25.0%
!!! GATAGTTTTTGAAGATCTTT+TGG - Chr6:101091399-101091418 MsG0680035251.01.T01:CDS 25.0%
ACTTACAGTGCTTTAATTAG+TGG - Chr6:101090713-101090732 MsG0680035251.01.T01:CDS 30.0%
AGAGACCTAAAATCTTAACA+AGG + Chr6:101090406-101090425 None:intergenic 30.0%
ATAGTGTATGTACACATATC+TGG + Chr6:101091334-101091353 None:intergenic 30.0%
ATTTACACAAACCATCAACA+AGG + Chr6:101091147-101091166 None:intergenic 30.0%
CAAAAATCATCAGATTGACA+AGG - Chr6:101091267-101091286 MsG0680035251.01.T01:CDS 30.0%
CATTTAGACCAAGTTAGTTA+CGG - Chr6:101090488-101090507 MsG0680035251.01.T01:CDS 30.0%
CATTTCTTCAAAGAGATTCA+TGG + Chr6:101091083-101091102 None:intergenic 30.0%
CTGTCAAAAATGGAAGAAAA+TGG - Chr6:101091454-101091473 MsG0680035251.01.T01:CDS 30.0%
GAGACCTAAAATCTTAACAA+GGG + Chr6:101090405-101090424 None:intergenic 30.0%
GAGTTATAAGTAACAACATC+AGG + Chr6:101090914-101090933 None:intergenic 30.0%
GTACTATACATTACCACATT+AGG + Chr6:101090599-101090618 None:intergenic 30.0%
TCATTCTTAACGAAGTTGAA+AGG - Chr6:101091295-101091314 MsG0680035251.01.T01:CDS 30.0%
TTTACACAAACCATCAACAA+GGG + Chr6:101091146-101091165 None:intergenic 30.0%
! ACATACACTATACTTGTTGA+TGG - Chr6:101091343-101091362 MsG0680035251.01.T01:CDS 30.0%
! ATTATTGATGGTTTGTGCAA+AGG - Chr6:101090620-101090639 MsG0680035251.01.T01:CDS 30.0%
! GAAATTTGTTCAACCTAATG+TGG - Chr6:101090583-101090602 MsG0680035251.01.T01:CDS 30.0%
! TTAGCTATGATGATGAAACA+AGG - Chr6:101090881-101090900 MsG0680035251.01.T01:CDS 30.0%
! TTTGAAGATCTTTTGGTCAA+AGG - Chr6:101091406-101091425 MsG0680035251.01.T01:CDS 30.0%
!! AATTGTTGAAACGAGTTGAT+GGG - Chr6:101090561-101090580 MsG0680035251.01.T01:CDS 30.0%
!! TGTTGATGGTTTGTGTAAAT+CGG - Chr6:101091147-101091166 MsG0680035251.01.T01:CDS 30.0%
!!! ATTGGTTGATGGTTTTTGTA+AGG - Chr6:101090829-101090848 MsG0680035251.01.T01:CDS 30.0%
AGTTACGGTACCTTGATTAA+TGG - Chr6:101090503-101090522 MsG0680035251.01.T01:CDS 35.0%
ATATTCAAGACAATGGCTCA+GGG - Chr6:101090983-101091002 MsG0680035251.01.T01:CDS 35.0%
ATTTCATAAGTAACGGCGTT+TGG + Chr6:101091487-101091506 None:intergenic 35.0%
CTTAACAAGGGAACCTAAAA+TGG + Chr6:101090393-101090412 None:intergenic 35.0%
GTTACGGTACCTTGATTAAT+GGG - Chr6:101090504-101090523 MsG0680035251.01.T01:CDS 35.0%
TATATTCAAGACAATGGCTC+AGG - Chr6:101090982-101091001 MsG0680035251.01.T01:CDS 35.0%
TTGCAAAAATGGAAGACTAG+AGG - Chr6:101091369-101091388 MsG0680035251.01.T01:CDS 35.0%
! AGGCTTGTTTGATGAATCAT+TGG - Chr6:101091426-101091445 MsG0680035251.01.T01:CDS 35.0%
! ATGGTTTTTGTAAGGAAGGA+AGG - Chr6:101090837-101090856 MsG0680035251.01.T01:CDS 35.0%
! ATTAGTGGCTTTTGCATTGT+TGG - Chr6:101090728-101090747 MsG0680035251.01.T01:CDS 35.0%
! CAATTGTTGAAACGAGTTGA+TGG - Chr6:101090560-101090579 MsG0680035251.01.T01:CDS 35.0%
! GGCTTGTTTGATGAATCATT+GGG - Chr6:101091427-101091446 MsG0680035251.01.T01:CDS 35.0%
! GGTTCCCTTGTTAAGATTTT+AGG - Chr6:101090398-101090417 MsG0680035251.01.T01:CDS 35.0%
! TGGTTTTTGTAAGGAAGGAA+GGG - Chr6:101090838-101090857 MsG0680035251.01.T01:CDS 35.0%
! TTGATGGTTTGTGTAAATCG+GGG - Chr6:101091149-101091168 MsG0680035251.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTGGGTTTGCTGTCAAAAA+TGG - Chr6:101091444-101091463 MsG0680035251.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTTTAGGTCTCTGTCTCAA+AGG - Chr6:101090413-101090432 MsG0680035251.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTGATGGACTTTGCAAAAA+TGG - Chr6:101091358-101091377 MsG0680035251.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTGATGGTTTGTGTAAATC+GGG - Chr6:101091148-101091167 MsG0680035251.01.T01:CDS 35.0%
!!! GTTGATGGTTTTTGTAAGGA+AGG - Chr6:101090833-101090852 MsG0680035251.01.T01:CDS 35.0%
ACTTACAGTTCCCTTGTTGA+TGG - Chr6:101091133-101091152 MsG0680035251.01.T01:CDS 40.0%
ATTGCACTTTCATGACAAGC+TGG - Chr6:101090451-101090470 MsG0680035251.01.T01:CDS 40.0%
CAGAAACATTATTCCTGACG+TGG - Chr6:101091108-101091127 MsG0680035251.01.T01:CDS 40.0%
CTTCGTGAAATGATTACGAG+AGG - Chr6:101091559-101091578 MsG0680035251.01.T01:CDS 40.0%
GCACTGTAAGTGACAACATT+AGG + Chr6:101090704-101090723 None:intergenic 40.0%
TATTCAAGACAATGGCTCAG+GGG - Chr6:101090984-101091003 MsG0680035251.01.T01:CDS 40.0%
TTAACGAAGTTGAAAGGCGA+AGG - Chr6:101091301-101091320 MsG0680035251.01.T01:CDS 40.0%
!! TCAAGGTACCGTAACTAACT+TGG + Chr6:101090499-101090518 None:intergenic 40.0%
ATTCAAGACAATGGCTCAGG+GGG - Chr6:101090985-101091004 MsG0680035251.01.T01:CDS 45.0%
GAACTGTAAGTTACCACGTC+AGG + Chr6:101091124-101091143 None:intergenic 45.0%
GTCAATGAGATGCATGACAG+AGG - Chr6:101091196-101091215 MsG0680035251.01.T01:CDS 45.0%
TTCAAGACAATGGCTCAGGG+GGG - Chr6:101090986-101091005 MsG0680035251.01.T01:CDS 50.0%
! CATGACAAGCTGGTAACGCA+GGG - Chr6:101090461-101090480 MsG0680035251.01.T01:CDS 50.0%
! TCATGACAAGCTGGTAACGC+AGG - Chr6:101090460-101090479 MsG0680035251.01.T01:CDS 50.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 101090383 101091591 101090383 ID=MsG0680035251.01;Name=MsG0680035251.01
Chr6 mRNA 101090383 101091591 101090383 ID=MsG0680035251.01.T01;Parent=MsG0680035251.01;Name=MsG0680035251.01.T01;_AED=0.33;_eAED=0.33;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|402
Chr6 exon 101090383 101091591 101090383 ID=MsG0680035251.01.T01:exon:10567;Parent=MsG0680035251.01.T01
Chr6 CDS 101090383 101091591 101090383 ID=MsG0680035251.01.T01:cds;Parent=MsG0680035251.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680035251.01.T01

ATGACAACCATTTTAGGTTCCCTTGTTAAGATTTTAGGTCTCTGTCTCAAAGGTCAAATTCATCGAGCATTGCACTTTCATGACAAGCTGGTAACGCAGGGATTTCATTTAGACCAAGTTAGTTACGGTACCTTGATTAATGGGTTATGTAAAGTTGGACAAACAAGAGCTGCTTTACAATTGTTGAAACGAGTTGATGGGAAATTTGTTCAACCTAATGTGGTAATGTATAGTACGATTATTGATGGTTTGTGCAAAGGTAAACTTCTTAATGATGCTTTTGATTTATATTCTGAAATGGTTTCTAAGAGAATTTCTCCTAATGTTGTCACTTACAGTGCTTTAATTAGTGGCTTTTGCATTGTTGGTAAAATAAAATATGCAATTGATTTGTTTAATAAAATGATTTTGGAAAACATCAACCCGAATGTGTATACTTTTAATATATTGGTTGATGGTTTTTGTAAGGAAGGAAGGGTGAAAGAAGCTAAAAATGTGTTAGCTATGATGATGAAACAAGGCATTAAACCTGATGTTGTTACTTATAACTCTTTAATGGATGGATATTGCCTAGTTAAAGAAGTGAATAATGCTGAAAGTATATTCAAGACAATGGCTCAGGGGGGAGTGAATCATGATATTCAGAGTTACAATATCTTGATTAATGGGTATTGTAAGATTAAAATGATGGATGAAGCCATGAATCTCTTTGAAGAAATGCATTGCAGAAACATTATTCCTGACGTGGTAACTTACAGTTCCCTTGTTGATGGTTTGTGTAAATCGGGGAAAATCTCTTATGCTTTGAAGCTAGTCAATGAGATGCATGACAGAGGTGTACCACCTGATATAATTACTTACAATTCTATATTGGATGCTTTATGCAAAAATCATCAGATTGACAAGGCAATTTCATTCTTAACGAAGTTGAAAGGCGAAGGAATTCAGCCAGATATGTGTACATACACTATACTTGTTGATGGACTTTGCAAAAATGGAAGACTAGAGGATGCACAGATAGTTTTTGAAGATCTTTTGGTCAAAGGCTTGTTTGATGAATCATTGGGTTTGCTGTCAAAAATGGAAGAAAATGGTTGCATTCCAAACGCCGTTACTTATGAAATAATCATCTGTTCTCTTTTTTATAAAGATGAAAATGATAAGGCGGAGAAACTTCTTCGTGAAATGATTACGAGAGGCCTATTGTAA
Protein sequence

>MsG0680035251.01.T01

MTTILGSLVKILGLCLKGQIHRALHFHDKLVTQGFHLDQVSYGTLINGLCKVGQTRAALQLLKRVDGKFVQPNVVMYSTIIDGLCKGKLLNDAFDLYSEMVSKRISPNVVTYSALISGFCIVGKIKYAIDLFNKMILENINPNVYTFNILVDGFCKEGRVKEAKNVLAMMMKQGIKPDVVTYNSLMDGYCLVKEVNNAESIFKTMAQGGVNHDIQSYNILINGYCKIKMMDEAMNLFEEMHCRNIIPDVVTYSSLVDGLCKSGKISYALKLVNEMHDRGVPPDIITYNSILDALCKNHQIDKAISFLTKLKGEGIQPDMCTYTILVDGLCKNGRLEDAQIVFEDLLVKGLFDESLGLLSKMEENGCIPNAVTYEIIICSLFYKDENDKAEKLLREMITRGLL*