AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035223.01

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MsG0680035223.01.T01 AT1G09820 31.227 269 180 2 22 286 200 467 9.72e-45 160
MsG0680035223.01.T01 AT1G09820 25.347 288 204 4 9 287 148 433 6.13e-29 116
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MsG0680035223.01.T01 AT5G41170 32.740 281 189 0 6 286 3 283 1.40e-52 177
MsG0680035223.01.T01 AT5G41170 32.558 258 174 0 8 265 40 297 3.13e-47 163
MsG0680035223.01.T01 AT5G41170 31.301 246 166 1 6 248 108 353 2.10e-46 161
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MsG0680035223.01.T01 AT5G64320 28.527 319 196 1 1 287 208 526 1.30e-42 155
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MsG0680035223.01.T01 AT5G64320 34.146 205 135 0 1 205 520 724 1.31e-36 138
MsG0680035223.01.T01 AT5G64320 24.464 233 164 5 61 286 91 318 5.14e-12 66.6
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MsG0680035223.01.T01 AT3G04760 26.502 283 208 0 4 286 187 469 7.53e-41 149
MsG0680035223.01.T01 AT3G04760 29.339 242 171 0 1 242 324 565 1.62e-38 143
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MsG0680035223.01.T01 AT1G77340 30.882 272 187 1 16 287 126 396 1.62e-42 150
MsG0680035223.01.T01 AT1G77340 31.502 273 178 5 15 287 98 361 4.30e-36 133
MsG0680035223.01.T01 AT1G64100 30.851 282 191 1 5 286 291 568 3.02e-48 171
MsG0680035223.01.T01 AT1G64100 32.517 286 189 1 1 286 357 638 4.23e-48 171
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MsG0680035223.01.T01 AT1G03560 30.180 222 155 0 44 265 186 407 4.39e-36 136
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MsG0680035223.01.T01 AT3G49730 27.451 204 146 2 85 287 172 374 3.93e-23 99.4
MsG0680035223.01.T01 AT3G09060 30.314 287 198 2 1 286 175 460 6.82e-45 161
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MsG0680035223.01.T01 AT3G09060 30.466 279 192 2 8 285 112 389 9.65e-40 147
MsG0680035223.01.T01 AT3G09060 27.622 286 206 1 2 286 350 635 1.03e-38 144
MsG0680035223.01.T01 AT3G09060 31.250 224 153 1 40 262 109 332 1.95e-38 143
MsG0680035223.01.T01 AT3G09060 29.528 254 179 0 12 265 396 649 8.66e-33 127
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MsG0680035223.01.T01 AT2G16880 32.308 260 175 1 5 263 305 564 2.89e-39 146
MsG0680035223.01.T01 AT2G16880 28.720 289 204 2 1 287 195 483 1.77e-38 144
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MsG0680035223.01.T01 AT1G30290 31.621 253 171 2 12 262 244 496 7.70e-44 159
MsG0680035223.01.T01 AT1G30290 30.403 273 189 1 13 284 421 693 1.24e-39 147
MsG0680035223.01.T01 AT1G30290 26.829 287 208 2 1 285 303 589 3.97e-36 137
MsG0680035223.01.T01 AT1G30290 28.929 280 195 2 7 285 521 797 5.01e-33 128
MsG0680035223.01.T01 AT1G30290 27.969 261 186 2 27 285 224 484 1.80e-32 126
MsG0680035223.01.T01 AT1G30290 26.778 239 175 0 8 246 452 690 2.04e-32 126
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MsG0680035223.01.T01 AT5G61990 27.660 282 203 1 1 282 513 793 2.97e-42 155
MsG0680035223.01.T01 AT5G61990 30.851 282 193 1 5 286 344 623 5.09e-41 151
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MsG0680035223.01.T01 AT3G54980 22.581 279 215 1 9 286 162 440 1.68e-16 80.1
MsG0680035223.01.T01 AT3G54980 26.437 174 124 2 1 172 680 851 9.16e-16 77.8
MsG0680035223.01.T01 AT4G01400 27.915 283 203 1 1 282 145 427 2.33e-41 149
MsG0680035223.01.T01 AT4G01400 30.366 191 133 0 96 286 171 361 2.61e-25 105
MsG0680035223.01.T01 AT4G01400 27.014 211 151 2 76 285 117 325 1.99e-21 94.0
MsG0680035223.01.T01 AT3G16010 33.074 257 171 1 7 262 300 556 3.51e-41 150
MsG0680035223.01.T01 AT3G16010 28.679 265 184 3 1 262 364 626 4.77e-33 128
MsG0680035223.01.T01 AT3G16010 25.796 314 197 2 8 285 231 544 5.73e-29 116
MsG0680035223.01.T01 AT3G16010 32.919 161 106 1 5 165 476 634 1.83e-24 103
MsG0680035223.01.T01 AT3G16010 28.821 229 160 2 40 267 159 385 6.90e-22 95.9
MsG0680035223.01.T01 AT5G18475 28.521 284 201 2 6 287 192 475 4.59e-41 149
MsG0680035223.01.T01 AT5G18475 30.453 243 169 0 4 246 262 504 1.91e-40 147
MsG0680035223.01.T01 AT5G18475 28.571 259 184 1 8 265 230 488 2.05e-38 141
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MsG0680035223.01.T01 AT3G62470 22.650 234 143 2 8 238 366 564 8.08e-17 80.9
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MsG0680035223.01.T01 AT1G52640 24.254 268 203 0 1 268 164 431 4.12e-28 113
MsG0680035223.01.T01 AT1G52640 25.123 203 152 0 83 285 141 343 2.78e-17 82.0
MsG0680035223.01.T01 AT2G19280 26.882 279 201 1 9 287 270 545 3.50e-38 142
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MsG0680035223.01.T01 AT5G24830 27.391 230 167 0 1 230 326 555 3.65e-31 122
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MsG0680035223.01.T01 AT2G41720 24.101 278 209 1 6 281 279 556 1.71e-28 115
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MsG0680035223.01.T01 AT2G41720 24.615 260 190 4 28 284 161 417 1.35e-23 100
MsG0680035223.01.T01 AT2G41720 25.431 232 138 1 4 200 419 650 4.29e-20 90.5
MsG0680035223.01.T01 AT2G41720 24.453 274 196 3 12 280 532 799 2.02e-16 79.7
MsG0680035223.01.T01 AT1G20300 24.367 316 202 3 8 287 219 533 1.14e-32 126
MsG0680035223.01.T01 AT1G20300 30.114 176 122 1 83 258 154 328 9.66e-23 98.2
MsG0680035223.01.T01 AT1G20300 25.281 178 128 2 108 285 148 320 3.59e-12 67.0
MsG0680035223.01.T01 AT1G18900 29.482 251 177 0 36 286 390 640 1.95e-32 126
MsG0680035223.01.T01 AT1G18900 26.906 223 163 0 40 262 359 581 1.67e-28 115
MsG0680035223.01.T01 AT1G18900 24.809 262 197 0 1 262 390 651 7.25e-26 107
MsG0680035223.01.T01 AT1G18900 24.638 207 156 0 75 281 359 565 5.59e-19 87.4
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MsG0680035223.01.T01 AT3G13150 28.151 238 168 2 51 287 130 365 5.01e-29 116
MsG0680035223.01.T01 AT3G13150 26.291 213 153 2 6 216 189 399 5.92e-25 104
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MsG0680035223.01.T01 AT3G02650 30.244 205 132 5 10 210 372 569 2.96e-22 96.7
MsG0680035223.01.T01 AT3G02650 29.412 153 107 1 1 152 398 550 3.08e-15 76.3
MsG0680035223.01.T01 AT1G63320 34.615 156 93 1 135 281 1 156 1.70e-25 100
MsG0680035223.01.T01 AT1G63320 32.164 171 107 1 100 261 1 171 2.02e-23 95.1
MsG0680035223.01.T01 AT1G63320 28.261 184 119 2 67 237 3 186 2.11e-23 94.7
MsG0680035223.01.T01 AT1G63320 31.056 161 102 1 9 160 15 175 4.66e-22 91.3
MsG0680035223.01.T01 AT1G63320 27.778 180 120 2 32 202 3 181 1.05e-19 85.1
MsG0680035223.01.T01 AT1G63320 27.857 140 91 2 1 131 42 180 1.25e-14 71.2
MsG0680035223.01.T01 AT3G17370 30.636 173 107 3 1 173 40 199 2.61e-25 100
MsG0680035223.01.T01 AT3G17370 28.922 204 132 2 67 270 1 191 2.45e-24 98.2
MsG0680035223.01.T01 AT3G17370 25.472 212 145 2 32 243 1 199 1.88e-23 95.5
MsG0680035223.01.T01 AT3G17370 25.405 185 125 2 102 286 1 172 2.48e-16 76.3
MsG0680035223.01.T01 AT1G09410 28.750 240 147 6 9 248 78 293 3.79e-25 105
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MsG0680035223.01.T01 AT1G09410 22.826 276 163 8 16 258 178 436 8.20e-16 77.8
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MsG0680035223.01.T01 AT5G27270 22.131 244 188 2 4 246 563 805 1.45e-16 80.1
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MsG0680035223.01.T01 AT5G27270 20.938 320 203 4 1 278 79 390 1.36e-13 71.2
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MsG0680035223.01.T01 AT5G03560 28.571 133 94 1 156 287 203 335 2.63e-13 69.7
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MsG0680035223.01.T01 AT4G30825 20.775 284 187 3 15 262 319 600 5.69e-16 78.6
MsG0680035223.01.T01 AT4G30825 26.012 173 128 0 9 181 732 904 1.90e-14 73.9
MsG0680035223.01.T01 AT4G30825 20.000 305 208 4 1 270 235 538 6.19e-13 69.3
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MsG0680035223.01.T01 AT1G71210 23.387 248 186 3 10 257 603 846 2.18e-16 79.7
MsG0680035223.01.T01 AT1G71210 23.045 243 186 1 12 253 253 495 3.17e-16 79.3
MsG0680035223.01.T01 AT1G71210 20.448 357 210 4 1 285 383 737 1.16e-15 77.4
MsG0680035223.01.T01 AT1G71210 24.783 230 173 0 3 232 350 579 5.20e-15 75.5
MsG0680035223.01.T01 AT1G71210 22.364 313 196 6 16 287 188 494 2.81e-12 67.4
MsG0680035223.01.T01 AT1G71210 22.711 273 174 4 49 285 186 457 2.25e-11 64.7
MsG0680035223.01.T01 AT1G32415 24.229 227 151 5 22 248 54 259 7.59e-19 87.0
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MsG0680035223.01.T01 AT1G11900 24.074 162 122 1 102 262 164 325 2.71e-11 63.9
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MsG0680035223.01.T01 AT5G56310 19.497 318 207 6 1 282 142 446 8.30e-14 71.6
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MsG0680035223.01.T01 AT5G16860 22.835 254 187 3 5 257 122 367 6.15e-15 75.5
MsG0680035223.01.T01 AT5G16860 24.727 275 183 6 4 264 324 588 4.55e-14 72.8
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MsG0680035223.01.T01 AT1G06143 22.364 313 198 5 1 282 117 415 2.63e-17 82.4
MsG0680035223.01.T01 AT1G06143 26.522 230 147 5 37 262 83 294 5.67e-16 78.2
MsG0680035223.01.T01 AT1G06143 23.673 245 149 6 36 247 212 451 6.13e-15 75.1
MsG0680035223.01.T01 AT5G52850 22.568 257 191 2 6 262 388 636 3.10e-17 82.4
MsG0680035223.01.T01 AT5G52850 23.457 243 177 3 9 250 289 523 2.82e-14 73.6
MsG0680035223.01.T01 AT5G52850 22.605 261 179 4 9 262 88 332 2.37e-13 70.5
MsG0680035223.01.T01 AT5G52850 21.401 257 182 7 7 257 187 429 4.03e-12 67.0
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MsG0680035223.01.T01 AT5G39680 21.076 223 166 4 9 229 302 516 2.78e-11 64.3
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MsG0680035223.01.T01 AT5G08510 22.814 263 191 4 3 264 75 326 1.69e-15 76.6
MsG0680035223.01.T01 AT5G08510 24.519 208 152 3 9 214 178 382 2.80e-14 73.2
MsG0680035223.01.T01 AT1G74630 23.963 217 154 3 42 258 184 389 1.73e-15 77.0
MsG0680035223.01.T01 AT1G74630 19.380 258 187 4 7 254 184 430 3.56e-12 67.0
MsG0680035223.01.T01 AT5G19020 20.962 291 182 6 9 267 172 446 1.77e-15 77.0
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MsG0680035223.01.T01 AT5G19020 21.311 244 185 4 5 246 366 604 6.99e-11 63.2
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MsG0680035223.01.T01 AT3G22150 23.188 276 199 6 9 281 383 648 4.05e-13 70.1
MsG0680035223.01.T01 AT3G22150 20.816 245 152 5 12 254 488 692 2.25e-11 64.7
MsG0680035223.01.T01 AT3G22150 27.556 225 152 5 1 221 512 729 1.98e-15 77.0
MsG0680035223.01.T01 AT3G22150 23.188 276 199 6 9 281 383 648 4.05e-13 70.1
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MsG0680035223.01.T01 AT3G53360 22.222 252 179 5 9 255 132 371 4.78e-13 69.7
MsG0680035223.01.T01 AT1G34160 22.613 199 147 2 9 207 127 318 6.49e-14 72.0
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MsG0680035223.01.T01 AT5G40405 22.330 206 155 2 12 216 207 408 7.02e-14 72.0
MsG0680035223.01.T01 AT5G40405 20.909 220 168 3 29 246 188 403 9.77e-13 68.6
MsG0680035223.01.T01 AT3G24000 21.352 281 213 2 1 281 152 424 7.47e-14 72.0
MsG0680035223.01.T01 AT3G24000 20.400 250 191 3 1 250 253 494 2.26e-13 70.5
MsG0680035223.01.T01 AT4G14050 21.967 305 188 11 14 282 144 434 8.37e-14 72.0
MsG0680035223.01.T01 AT4G20770 21.895 306 188 10 1 264 129 425 9.25e-14 71.6
MsG0680035223.01.T01 AT4G20770 24.194 248 169 6 8 249 517 751 1.18e-12 68.6
MsG0680035223.01.T01 AT4G20770 21.324 272 167 6 29 264 268 528 2.51e-12 67.4
MsG0680035223.01.T01 AT3G25970 21.533 274 206 4 12 284 68 333 9.36e-14 71.6
MsG0680035223.01.T01 AT3G25970 23.297 279 165 6 9 249 135 402 2.68e-13 70.5
MsG0680035223.01.T01 AT3G25970 22.439 205 150 3 30 232 223 420 9.36e-11 62.8
MsG0680035223.01.T01 AT4G21065 23.529 204 148 2 6 209 117 312 9.95e-14 71.6
MsG0680035223.01.T01 AT4G21065 25.641 195 139 3 12 204 189 379 3.44e-12 67.0
MsG0680035223.01.T01 AT3G16610 24.460 278 194 4 9 281 270 536 9.99e-14 71.6
MsG0680035223.01.T01 AT4G33990 21.912 251 179 6 16 262 383 620 1.16e-13 71.6
MsG0680035223.01.T01 AT4G16470 23.103 290 203 7 1 281 200 478 1.36e-13 71.2
MsG0680035223.01.T01 AT4G33990 21.912 251 179 6 16 262 390 627 1.43e-13 71.2
MsG0680035223.01.T01 AT3G50420 21.481 270 175 4 8 245 400 664 1.49e-13 71.2
MsG0680035223.01.T01 AT3G14330 23.137 255 183 6 4 255 331 575 1.76e-13 70.9
MsG0680035223.01.T01 AT3G14330 20.648 247 188 2 1 247 227 465 1.85e-12 67.8
MsG0680035223.01.T01 AT3G14330 23.684 266 175 8 19 268 210 463 3.98e-11 63.9
MsG0680035223.01.T01 AT1G13410 21.324 272 165 7 20 258 38 293 1.79e-13 70.5
MsG0680035223.01.T01 AT1G13410 20.661 242 143 5 9 213 89 318 1.35e-11 65.1
MsG0680035223.01.T01 AT1G64310 24.747 198 144 2 8 204 271 464 1.97e-13 70.5
MsG0680035223.01.T01 AT5G27110 21.708 281 201 8 12 284 377 646 2.10e-13 70.9
MsG0680035223.01.T01 AT5G27110 19.692 325 186 6 30 287 24 340 2.44e-12 67.4
MsG0680035223.01.T01 AT5G36300 21.961 255 184 4 31 273 2 253 2.57e-13 68.9
MsG0680035223.01.T01 AT1G17630 25.301 249 168 6 40 281 188 425 2.72e-13 70.5
MsG0680035223.01.T01 AT1G17630 25.301 249 168 6 40 281 188 425 2.72e-13 70.5
MsG0680035223.01.T01 AT1G07590 21.429 308 191 5 1 263 227 528 3.40e-13 70.1

Find 44 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 59 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TGTTACTTATAACTCTTTAA+TGG 0.184388 6:+100770113 MsG0680035223.01.T01:CDS
AGCTACGATATCATGATTAA+TGG 0.283392 6:+100770222 MsG0680035223.01.T01:CDS
CCTAGTTAAAGAAGTGAATA+AGG 0.324245 6:+100770146 MsG0680035223.01.T01:CDS
GAGTTATAAGTAACAACATT+AGG 0.326764 6:-100770105 None:intergenic
TATTCAACACTATGTCTCAT+AGG 0.340065 6:+100770178 MsG0680035223.01.T01:CDS
ACCTTTAGTATAGTGGTTGA+TGG 0.355351 6:+100770012 MsG0680035223.01.T01:CDS
GAATTGTAGGTAATTATATC+AGG 0.359750 6:-100770420 None:intergenic
ATCGATGGATTGTGCAAATC+TGG 0.367864 6:+100770342 MsG0680035223.01.T01:CDS
ATACTAAAGGTATACACATT+TGG 0.375611 6:-100770000 None:intergenic
TGGAAGAATATCATATGCTT+TGG 0.398309 6:+100770362 MsG0680035223.01.T01:CDS
CCTTATTCACTTCTTTAACT+AGG 0.406106 6:-100770146 None:intergenic
ATGGTGTATGTGTTCATATT+TGG 0.411150 6:-100770525 None:intergenic
AATTACCTACAATTCTATAC+TGG 0.411471 6:+100770428 MsG0680035223.01.T01:CDS
AGCATCCAGTATAGAATTGT+AGG 0.423783 6:-100770433 None:intergenic
GTGCCAAAGTGGAAAATTAG+AGG 0.451133 6:+100770563 MsG0680035223.01.T01:CDS
CATTTCTTTGAAAAGTCTCA+TGG 0.452570 6:-100770274 None:intergenic
TGTGTATACCTTTAGTATAG+TGG 0.461787 6:+100770005 MsG0680035223.01.T01:CDS
GAACTATAAGTTATCACATC+AGG 0.472956 6:-100770315 None:intergenic
ATTTGCACAATCCATCGATA+AGG 0.477674 6:-100770338 None:intergenic
ATTCAACACTATGTCTCATA+GGG 0.483777 6:+100770179 MsG0680035223.01.T01:CDS
TTTGCACAATCCATCGATAA+GGG 0.489223 6:-100770337 None:intergenic
ACTTATAACTCTTTAATGGA+TGG 0.499169 6:+100770117 MsG0680035223.01.T01:CDS
CACATACACCATTCTTGTCA+TGG 0.511132 6:+100770536 MsG0680035223.01.T01:CDS
TCCATCAACCACTATACTAA+AGG 0.511461 6:-100770013 None:intergenic
ACTTATAGTTCCCTTATCGA+TGG 0.517748 6:+100770327 MsG0680035223.01.T01:CDS
GGGGAGTGACTGCTAATGTT+CGG 0.523675 6:+100770199 MsG0680035223.01.T01:CDS
AGCCCTTGTCACAAAACCCT+TGG 0.529690 6:-100770659 None:intergenic
GCATATACCGTTATGATCCA+AGG 0.531285 6:+100770642 MsG0680035223.01.T01:CDS
GCACAATCCCATGACAAGAA+TGG 0.542095 6:-100770544 None:intergenic
ACATACACCATTCTTGTCAT+GGG 0.548621 6:+100770537 MsG0680035223.01.T01:CDS
CATATACCGTTATGATCCAA+GGG 0.555286 6:+100770643 MsG0680035223.01.T01:CDS
CGGTATATGCATAGACATCA+AGG 0.559308 6:-100770629 None:intergenic
GGGCTTGTTTGATGAAGCGT+TGG 0.566160 6:+100770677 MsG0680035223.01.T01:CDS
TCATATTTGGTCGAATACCC+TGG 0.577552 6:-100770512 None:intergenic
GTCGATGAGATGCATGATCG+AGG 0.581002 6:+100770390 MsG0680035223.01.T01:CDS
ACAAAACCCTTGGATCATAA+CGG 0.583900 6:-100770649 None:intergenic
AAGGAAGGAAAGATGAAAGA+CGG 0.598338 6:+100770042 MsG0680035223.01.T01:CDS
TCGATGAGATGCATGATCGA+GGG 0.624353 6:+100770391 MsG0680035223.01.T01:CDS
ATTAACAAAACTGAAAGACC+AGG 0.644016 6:+100770494 MsG0680035223.01.T01:CDS
GTCATGGGATTGTGCCAAAG+TGG 0.648609 6:+100770552 MsG0680035223.01.T01:CDS
CTTCGTGAAATGATCATGCG+AGG 0.655702 6:+100770810 MsG0680035223.01.T01:CDS
TTCAACACTATGTCTCATAG+GGG 0.690155 6:+100770180 MsG0680035223.01.T01:CDS
TTAACAAAACTGAAAGACCA+GGG 0.712925 6:+100770495 MsG0680035223.01.T01:CDS
TTTGCTATAATGATGAAACA+AGG 0.749631 6:+100770075 MsG0680035223.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! AAAAGTTTTTGAAGATCTTT+TGG + Chr6:100770593-100770612 MsG0680035223.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTTTGTAAGATTAAAATGG+TGG + Chr6:100770245-100770264 MsG0680035223.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGGATTTTGTAAGATTAAAA+TGG + Chr6:100770242-100770261 MsG0680035223.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGTTACTTATAACTCTTTAA+TGG + Chr6:100770113-100770132 MsG0680035223.01.T01:CDS 20.0%
! AATTACCTACAATTCTATAC+TGG + Chr6:100770428-100770447 MsG0680035223.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTATAACTCTTTAATGGA+TGG + Chr6:100770117-100770136 MsG0680035223.01.T01:CDS 25.0%
! CGAAAAAGATGAAAATGATA+TGG + Chr6:100770776-100770795 MsG0680035223.01.T01:CDS 25.0%
! GAATTGTAGGTAATTATATC+AGG - Chr6:100770423-100770442 None:intergenic 25.0%
! GAGTTATAAGTAACAACATT+AGG - Chr6:100770108-100770127 None:intergenic 25.0%
!! ATACTAAAGGTATACACATT+TGG - Chr6:100770003-100770022 None:intergenic 25.0%
!! TTTGCTATAATGATGAAACA+AGG + Chr6:100770075-100770094 MsG0680035223.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTTCATAAGTTTTAGCATC+TGG - Chr6:100770738-100770757 None:intergenic 25.0%
AGCTACGATATCATGATTAA+TGG + Chr6:100770222-100770241 MsG0680035223.01.T01:CDS 30.0%
ATGGTGTATGTGTTCATATT+TGG - Chr6:100770528-100770547 None:intergenic 30.0%
ATTAACAAAACTGAAAGACC+AGG + Chr6:100770494-100770513 MsG0680035223.01.T01:CDS 30.0%
ATTCAACACTATGTCTCATA+GGG + Chr6:100770179-100770198 MsG0680035223.01.T01:CDS 30.0%
CCTAGTTAAAGAAGTGAATA+AGG + Chr6:100770146-100770165 MsG0680035223.01.T01:CDS 30.0%
CCTTATTCACTTCTTTAACT+AGG - Chr6:100770149-100770168 None:intergenic 30.0%
GAACTATAAGTTATCACATC+AGG - Chr6:100770318-100770337 None:intergenic 30.0%
TATTCAACACTATGTCTCAT+AGG + Chr6:100770178-100770197 MsG0680035223.01.T01:CDS 30.0%
TGGAAGAATATCATATGCTT+TGG + Chr6:100770362-100770381 MsG0680035223.01.T01:CDS 30.0%
TGTGTATACCTTTAGTATAG+TGG + Chr6:100770005-100770024 MsG0680035223.01.T01:CDS 30.0%
TTAACAAAACTGAAAGACCA+GGG + Chr6:100770495-100770514 MsG0680035223.01.T01:CDS 30.0%
! CATTTCTTTGAAAAGTCTCA+TGG - Chr6:100770277-100770296 None:intergenic 30.0%
! TTTGAAGATCTTTTGGTCAA+AGG + Chr6:100770600-100770619 MsG0680035223.01.T01:CDS 30.0%
AAGGAAGGAAAGATGAAAGA+CGG + Chr6:100770042-100770061 MsG0680035223.01.T01:CDS 35.0%
ACAAAACCCTTGGATCATAA+CGG - Chr6:100770652-100770671 None:intergenic 35.0%
ACATACACCATTCTTGTCAT+GGG + Chr6:100770537-100770556 MsG0680035223.01.T01:CDS 35.0%
ACCTTTAGTATAGTGGTTGA+TGG + Chr6:100770012-100770031 MsG0680035223.01.T01:CDS 35.0%
ACTTATAGTTCCCTTATCGA+TGG + Chr6:100770327-100770346 MsG0680035223.01.T01:CDS 35.0%
AGCATCCAGTATAGAATTGT+AGG - Chr6:100770436-100770455 None:intergenic 35.0%
ATTTGCACAATCCATCGATA+AGG - Chr6:100770341-100770360 None:intergenic 35.0%
CATATACCGTTATGATCCAA+GGG + Chr6:100770643-100770662 MsG0680035223.01.T01:CDS 35.0%
CTGTCAAAAATGGAAGAGAA+TGG + Chr6:100770705-100770724 MsG0680035223.01.T01:CDS 35.0%
TCCATCAACCACTATACTAA+AGG - Chr6:100770016-100770035 None:intergenic 35.0%
TTCAACACTATGTCTCATAG+GGG + Chr6:100770180-100770199 MsG0680035223.01.T01:CDS 35.0%
TTTGCACAATCCATCGATAA+GGG - Chr6:100770340-100770359 None:intergenic 35.0%
! CATCCTCTAATTTTCCACTT+TGG - Chr6:100770569-100770588 None:intergenic 35.0%
!!! AGTGGTTGATGGATTTTGTA+AGG + Chr6:100770023-100770042 MsG0680035223.01.T01:CDS 35.0%
!!! CATCTTTTTCGAACAGAGAA+AGG - Chr6:100770767-100770786 None:intergenic 35.0%
!!! GTTGATGGATTTTGTAAGGA+AGG + Chr6:100770027-100770046 MsG0680035223.01.T01:CDS 35.0%
CACATACACCATTCTTGTCA+TGG + Chr6:100770536-100770555 MsG0680035223.01.T01:CDS 40.0%
CGGTATATGCATAGACATCA+AGG - Chr6:100770632-100770651 None:intergenic 40.0%
GCATATACCGTTATGATCCA+AGG + Chr6:100770642-100770661 MsG0680035223.01.T01:CDS 40.0%
GTGCCAAAGTGGAAAATTAG+AGG + Chr6:100770563-100770582 MsG0680035223.01.T01:CDS 40.0%
TCATATTTGGTCGAATACCC+TGG - Chr6:100770515-100770534 None:intergenic 40.0%
!! ATCCAAGGGTTTTGTGACAA+GGG + Chr6:100770657-100770676 MsG0680035223.01.T01:CDS 40.0%
!! ATCGATGGATTGTGCAAATC+TGG + Chr6:100770342-100770361 MsG0680035223.01.T01:CDS 40.0%
!! CTCTTCCATTTTTGACAGCA+AGG - Chr6:100770703-100770722 None:intergenic 40.0%
CTTCGTGAAATGATCATGCG+AGG + Chr6:100770810-100770829 MsG0680035223.01.T01:CDS 45.0%
GCACAATCCCATGACAAGAA+TGG - Chr6:100770547-100770566 None:intergenic 45.0%
TCGATGAGATGCATGATCGA+GGG + Chr6:100770391-100770410 MsG0680035223.01.T01:CDS 45.0%
!! GATCCAAGGGTTTTGTGACA+AGG + Chr6:100770656-100770675 MsG0680035223.01.T01:CDS 45.0%
!! GTTGGCCTTGCTGTCAAAAA+TGG + Chr6:100770695-100770714 MsG0680035223.01.T01:CDS 45.0%
AGCCCTTGTCACAAAACCCT+TGG - Chr6:100770662-100770681 None:intergenic 50.0%
GGGGAGTGACTGCTAATGTT+CGG + Chr6:100770199-100770218 MsG0680035223.01.T01:CDS 50.0%
GTCATGGGATTGTGCCAAAG+TGG + Chr6:100770552-100770571 MsG0680035223.01.T01:CDS 50.0%
GTCGATGAGATGCATGATCG+AGG + Chr6:100770390-100770409 MsG0680035223.01.T01:CDS 50.0%
! GGGCTTGTTTGATGAAGCGT+TGG + Chr6:100770677-100770696 MsG0680035223.01.T01:CDS 50.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 100769979 100770842 100769979 ID=MsG0680035223.01;Name=MsG0680035223.01
Chr6 mRNA 100769979 100770842 100769979 ID=MsG0680035223.01.T01;Parent=MsG0680035223.01;Name=MsG0680035223.01.T01;_AED=0.43;_eAED=0.43;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|287
Chr6 exon 100769979 100770842 100769979 ID=MsG0680035223.01.T01:exon:7886;Parent=MsG0680035223.01.T01
Chr6 CDS 100769979 100770842 100769979 ID=MsG0680035223.01.T01:cds;Parent=MsG0680035223.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680035223.01.T01

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Protein sequence

>MsG0680035223.01.T01

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