AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035248.01

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MsG0680035248.01.T01 AT1G74580 25.000 300 183 6 52 349 488 747 2.34e-19 92.4
MsG0680035248.01.T01 AT5G65560 30.498 482 334 1 59 540 218 698 6.62e-79 266
MsG0680035248.01.T01 AT5G65560 31.984 494 324 3 37 521 154 644 1.03e-77 263
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MsG0680035248.01.T01 AT3G07290 23.986 567 366 7 23 530 299 859 6.85e-46 173
MsG0680035248.01.T01 AT3G07290 24.390 451 244 14 48 403 427 875 1.47e-23 105
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MsG0680035248.01.T01 AT1G13630 27.103 321 226 2 227 546 159 472 5.40e-32 131
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MsG0680035248.01.T01 AT1G52620 26.255 518 296 8 89 521 236 752 8.77e-54 195
MsG0680035248.01.T01 AT1G52620 26.680 491 342 5 41 515 328 816 2.81e-50 185
MsG0680035248.01.T01 AT1G52620 27.221 349 219 2 232 545 168 516 9.01e-38 149
MsG0680035248.01.T01 AT1G52620 23.246 228 174 1 320 546 150 377 7.81e-20 94.0
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MsG0680035248.01.T01 AT1G13040 26.078 487 356 4 39 523 25 509 8.76e-51 182
MsG0680035248.01.T01 AT1G13040 25.229 436 317 4 60 490 80 511 4.76e-49 177
MsG0680035248.01.T01 AT1G13040 27.907 387 270 4 164 545 9 391 2.30e-37 145
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MsG0680035248.01.T01 AT5G24830 27.553 421 293 3 133 545 125 541 9.97e-44 164
MsG0680035248.01.T01 AT5G24830 28.571 343 206 1 237 540 124 466 7.63e-41 156
MsG0680035248.01.T01 AT5G24830 26.933 375 266 3 34 404 170 540 3.36e-37 145
MsG0680035248.01.T01 AT5G24830 27.241 290 210 1 38 327 280 568 6.45e-31 127
MsG0680035248.01.T01 AT1G79540 26.667 450 313 4 99 537 132 575 6.98e-54 195
MsG0680035248.01.T01 AT1G79540 26.316 513 363 9 39 543 143 648 3.91e-51 187
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MsG0680035248.01.T01 AT5G16420 23.396 265 162 5 65 294 267 525 2.42e-12 69.7
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MsG0680035248.01.T01 AT5G40400 22.652 362 243 3 60 384 308 669 2.84e-26 114
MsG0680035248.01.T01 AT5G40400 27.168 173 126 0 373 545 236 408 1.03e-13 74.3
MsG0680035248.01.T01 AT2G36240 27.439 328 231 4 201 524 159 483 2.59e-40 153
MsG0680035248.01.T01 AT2G36240 29.195 298 211 0 167 464 196 493 1.41e-37 145
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MsG0680035248.01.T01 AT2G36240 26.101 318 233 2 231 546 153 470 6.42e-32 129
MsG0680035248.01.T01 AT2G36240 25.670 261 159 1 62 287 231 491 2.56e-21 97.8
MsG0680035248.01.T01 AT2G35130 23.571 420 320 1 122 540 148 567 7.98e-40 153
MsG0680035248.01.T01 AT2G35130 26.855 283 206 1 264 545 150 432 6.60e-29 121
MsG0680035248.01.T01 AT2G35130 19.200 375 267 3 62 435 228 567 5.40e-19 90.9
MsG0680035248.01.T01 AT5G25630 23.789 475 288 8 100 540 51 485 8.21e-40 153
MsG0680035248.01.T01 AT5G25630 23.973 438 302 6 91 498 77 513 1.20e-33 135
MsG0680035248.01.T01 AT5G25630 25.485 361 242 6 90 441 184 526 3.58e-32 131
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MsG0680035248.01.T01 AT1G05600 22.759 435 314 9 41 455 54 486 9.00e-29 120
MsG0680035248.01.T01 AT1G05600 24.495 396 289 7 34 420 92 486 1.91e-27 116
MsG0680035248.01.T01 AT1G05600 25.479 365 263 5 165 520 117 481 3.15e-36 141
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MsG0680035248.01.T01 AT3G60050 28.308 325 221 3 131 447 151 471 1.13e-34 137
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MsG0680035248.01.T01 AT3G60050 25.962 208 150 2 59 264 254 459 3.44e-13 72.4
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MsG0680035248.01.T01 AT3G18110 23.529 527 350 10 62 544 300 817 1.12e-32 134
MsG0680035248.01.T01 AT3G18110 23.839 323 246 0 201 523 754 1076 6.72e-30 125
MsG0680035248.01.T01 AT3G18110 19.388 392 312 3 62 451 755 1144 9.52e-24 106
MsG0680035248.01.T01 AT3G18110 19.712 416 327 4 133 545 582 993 4.08e-18 89.0
MsG0680035248.01.T01 AT3G18110 22.261 283 216 3 266 545 188 469 1.20e-17 87.4
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MsG0680035248.01.T01 AT4G01030 22.483 298 222 4 93 389 290 579 7.32e-18 87.8
MsG0680035248.01.T01 AT1G18900 26.844 339 245 2 123 461 325 660 4.94e-32 132
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MsG0680035248.01.T01 AT1G18900 27.336 289 210 0 233 521 363 651 3.21e-26 114
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MsG0680035248.01.T01 AT4G39620 20.625 320 245 3 92 404 131 448 8.66e-15 77.4
MsG0680035248.01.T01 AT4G39620 23.750 240 169 4 314 540 101 339 6.61e-13 71.6
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MsG0680035248.01.T01 AT3G59040 21.751 377 289 2 160 533 135 508 2.12e-25 110
MsG0680035248.01.T01 AT3G59040 22.807 342 254 4 165 501 182 518 6.40e-28 118
MsG0680035248.01.T01 AT3G59040 24.919 309 226 2 240 545 152 457 8.05e-28 118
MsG0680035248.01.T01 AT3G59040 21.921 406 282 4 61 466 148 518 1.17e-27 117
MsG0680035248.01.T01 AT3G59040 21.751 377 289 2 160 533 142 515 1.81e-25 110
MsG0680035248.01.T01 AT5G18390 23.796 353 263 4 197 545 109 459 7.45e-28 117
MsG0680035248.01.T01 AT5G18390 25.000 288 211 3 119 404 138 422 4.14e-22 99.8
MsG0680035248.01.T01 AT5G18390 23.345 287 217 2 65 349 152 437 1.04e-20 95.5
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MsG0680035248.01.T01 AT5G48730 26.812 276 196 4 267 538 148 421 2.49e-20 94.7
MsG0680035248.01.T01 AT5G48730 21.856 334 224 3 122 418 143 476 1.54e-19 92.4
MsG0680035248.01.T01 AT3G17370 27.451 204 135 2 260 463 5 195 2.15e-25 104
MsG0680035248.01.T01 AT3G17370 28.000 200 131 4 233 432 13 199 2.47e-23 98.6
MsG0680035248.01.T01 AT3G17370 28.643 199 125 3 341 537 16 199 7.82e-23 97.4
MsG0680035248.01.T01 AT3G17370 26.786 224 148 3 291 511 1 211 1.63e-22 96.3
MsG0680035248.01.T01 AT3G17370 28.643 199 125 3 162 358 12 195 1.98e-22 96.3
MsG0680035248.01.T01 AT3G17370 28.205 195 127 3 98 292 18 199 5.91e-20 89.0
MsG0680035248.01.T01 AT3G17370 28.261 184 119 2 362 545 2 172 2.02e-18 84.7
MsG0680035248.01.T01 AT3G17370 26.020 196 132 3 128 323 13 195 1.52e-14 73.2
MsG0680035248.01.T01 AT5G27270 25.071 351 258 4 120 467 624 972 1.15e-24 109
MsG0680035248.01.T01 AT5G27270 20.631 412 326 1 121 532 180 590 2.22e-20 95.9
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MsG0680035248.01.T01 AT5G47360 28.472 144 99 2 407 546 163 306 2.54e-11 66.6
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MsG0680035248.01.T01 AT3G29230 20.824 461 305 10 64 521 56 459 1.90e-19 92.4
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MsG0680035248.01.T01 AT3G50420 19.944 356 233 6 233 545 264 610 4.76e-12 69.3
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MsG0680035248.01.T01 AT1G68930 19.926 542 332 13 55 523 11 523 3.86e-20 94.7
MsG0680035248.01.T01 AT1G20230 21.346 431 326 6 84 513 207 625 4.00e-20 94.7
MsG0680035248.01.T01 AT1G20230 20.988 486 350 10 64 540 55 515 2.32e-18 89.4
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MsG0680035248.01.T01 AT4G22760 21.318 258 190 4 55 310 259 505 1.55e-12 70.5
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MsG0680035248.01.T01 AT4G21300 19.775 445 304 7 63 470 278 706 5.43e-16 82.0
MsG0680035248.01.T01 AT3G13880 20.000 485 325 14 104 545 92 556 6.80e-19 90.9
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MsG0680035248.01.T01 AT1G05750 20.892 426 314 10 51 470 28 436 3.67e-17 84.7
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MsG0680035248.01.T01 AT4G35130 17.560 336 237 8 79 383 283 609 3.36e-11 66.6
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MsG0680035248.01.T01 AT3G22150 20.569 457 307 10 94 545 353 758 2.48e-17 86.3
MsG0680035248.01.T01 AT4G21065 21.579 380 282 7 167 543 88 454 2.59e-17 85.9
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MsG0680035248.01.T01 AT4G18840 22.866 328 236 5 197 523 103 414 3.48e-17 85.1
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MsG0680035248.01.T01 AT1G06143 22.254 346 251 5 196 541 88 415 3.55e-17 85.1
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MsG0680035248.01.T01 AT2G17210 21.670 503 317 15 86 541 104 576 3.55e-17 85.5
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Find 91 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 110 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
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ACTTACAATACTCTAATATA+TGG 0.334281 6:+101040302 MsG0680035248.01.T01:CDS
TGGATTATGTAAGAATAAAA+TGG 0.334341 6:+101040637 MsG0680035248.01.T01:CDS
ATAGTGTATGTATACATATT+TGG 0.334710 6:-101040920 None:intergenic
ATGTTTAAAGTAACAATGTT+AGG 0.336743 6:-101039870 None:intergenic
GTATTAAAAGTACGAACATT+TGG 0.344960 6:-101040395 None:intergenic
ACCTTGATCAAGTTAGTTAT+GGG 0.351399 6:+101040078 MsG0680035248.01.T01:CDS
ATGCTATACATTACCACATT+AGG 0.351542 6:-101040185 None:intergenic
CTCCGTGAAATGATTGTTAG+AGG 0.354846 6:+101041205 MsG0680035248.01.T01:CDS
TTCGGCAAAATTCTCAAGTT+AGG 0.355929 6:+101039945 MsG0680035248.01.T01:CDS
ACATACAATTCACTTATTGA+TGG 0.356398 6:+101040722 MsG0680035248.01.T01:CDS
TTTAACGGATGGGTATTTCT+TGG 0.360071 6:+101040523 MsG0680035248.01.T01:CDS
GAATTGTATGTTACAGTATC+AGG 0.366109 6:-101040710 None:intergenic
AGATTGAAGGGTTATTGATT+AGG 0.367497 6:+101040162 MsG0680035248.01.T01:CDS
TGTTACTTATACTTCTTTAA+CGG 0.368005 6:+101040508 MsG0680035248.01.T01:CDS
GAAGTATAAGTAACAACATT+AGG 0.368065 6:-101040500 None:intergenic
ATGAATTGGAAGAAACAAAT+TGG 0.369118 6:-101039649 None:intergenic
TGAAATGATTCAACTTAGTA+AGG 0.375026 6:-101039800 None:intergenic
ACAAAGCACAAATAAGAGTT+TGG 0.383295 6:-101041147 None:intergenic
CATGATCATGTTATAGCAAA+GGG 0.385771 6:+101040050 MsG0680035248.01.T01:CDS
AAGAGTGTTGAATACATGTT+TGG 0.401898 6:-101040564 None:intergenic
TGTTTGGATGTATAATGTTA+TGG 0.402093 6:+101041030 MsG0680035248.01.T01:CDS
ACATACACTATACTTGTTGA+TGG 0.402875 6:+101040932 MsG0680035248.01.T01:CDS
GGAAAGAATCTCTGATGTTT+GGG 0.403551 6:+101040757 MsG0680035248.01.T01:CDS
GATCTTGTTAAATTCAAAGA+TGG 0.406759 6:-101039769 None:intergenic
GTTATGGGACATTAATTAAC+GGG 0.413038 6:+101040093 MsG0680035248.01.T01:CDS
ACATTGTAGCTATGAACATT+AGG 0.421320 6:-101040605 None:intergenic
GTTAAATTCAAAGATGGGTT+GGG 0.427044 6:-101039763 None:intergenic
TTCTTTCATTTGACCCAGAA+TGG 0.427711 6:-101040330 None:intergenic
ATTGGTTGATGGTTTATGTA+AGG 0.428388 6:+101040418 MsG0680035248.01.T01:CDS
TGAACGTGTAATCGATGAAT+TGG 0.434353 6:-101039663 None:intergenic
TTTGTCTTAATGGCGAGGTT+AGG 0.436862 6:+101040012 MsG0680035248.01.T01:CDS
TGTTAAATTCAAAGATGGGT+TGG 0.447202 6:-101039764 None:intergenic
TAGGGCAGCTCTTGTTTCTC+CGG 0.452496 6:-101040126 None:intergenic
TATTGATGGACTTTGCAAAT+CGG 0.464775 6:+101040736 MsG0680035248.01.T01:CDS
ATTCAAAGATGGGTTGGGTA+GGG 0.469355 6:-101039758 None:intergenic
GTTGATGGTTTATGTAAGGA+AGG 0.470136 6:+101040422 MsG0680035248.01.T01:CDS
ACTTATACTTCTTTAACGGA+TGG 0.476194 6:+101040512 MsG0680035248.01.T01:CDS
ATTAACGGGTTATGTAAATC+CGG 0.477190 6:+101040107 MsG0680035248.01.T01:CDS
CATTTCAGAATATAAATCAT+AGG 0.479424 6:-101040249 None:intergenic
CGAAAATGACAAGAATGATA+AGG 0.485086 6:+101041171 MsG0680035248.01.T01:CDS
CTTATACTTCTTTAACGGAT+GGG 0.485215 6:+101040513 MsG0680035248.01.T01:CDS
CAGTTACTTAGAAAGATTGA+AGG 0.486406 6:+101040149 MsG0680035248.01.T01:CDS
ACATATTTGGCTGAATCCCT+TGG 0.486444 6:-101040907 None:intergenic
CGAAATTGATTTGATTGAGA+TGG 0.486891 6:-101039911 None:intergenic
GTATTGTAAGTGACGACATC+AGG 0.491513 6:-101040290 None:intergenic
AGTTATGGGACATTAATTAA+CGG 0.498667 6:+101040092 MsG0680035248.01.T01:CDS
GACCTCTAACAATCATTTCA+CGG 0.500317 6:-101041207 None:intergenic
CAATCTTTCTAAGTAACTGT+AGG 0.500783 6:-101040145 None:intergenic
ATCTTGTTAAATTCAAAGAT+GGG 0.501445 6:-101039768 None:intergenic
AATTCAAAGATGGGTTGGGT+AGG 0.512129 6:-101039759 None:intergenic
ATTCAACACTCTTTCTCTAA+GGG 0.520958 6:+101040574 MsG0680035248.01.T01:CDS
GGTTAACGCGCTTTGTAAAG+AGG 0.522430 6:+101041051 MsG0680035248.01.T01:CDS
TCATGATCATGTTATAGCAA+AGG 0.530954 6:+101040049 MsG0680035248.01.T01:CDS
TCCCATAACTAACTTGATCA+AGG 0.532928 6:-101040079 None:intergenic
GTTAACGCGCTTTGTAAAGA+GGG 0.538871 6:+101041052 MsG0680035248.01.T01:CDS
TGGAAGAAACAAATTGGCAG+TGG 0.548205 6:-101039643 None:intergenic
TTGTCAATGAACGAAGGAAG+AGG 0.554716 6:-101039687 None:intergenic
CATATGAAGAATGTGATTGA+AGG 0.556099 6:-101039730 None:intergenic
AATCTTTCTAAGTAACTGTA+GGG 0.559770 6:-101040144 None:intergenic
AGAAACAAATTGGCAGTGGA+AGG 0.561327 6:-101039639 None:intergenic
CAATCGCCTTGTCAACCTGA+TGG 0.562201 6:-101040862 None:intergenic
GAAATGATTCAACTTAGTAA+GGG 0.564185 6:-101039799 None:intergenic
ATAGATGAGATGCACAATAG+AGG 0.580207 6:+101040785 MsG0680035248.01.T01:CDS
TGTTATGATAAAACAAGGTG+TGG 0.583140 6:+101040475 MsG0680035248.01.T01:CDS
GTTATTGATTAGGCCTAATG+TGG 0.585904 6:+101040172 MsG0680035248.01.T01:CDS
AGTTACTTAGAAAGATTGAA+GGG 0.591120 6:+101040150 MsG0680035248.01.T01:CDS
CTTGGTTAAAGAAGTCAACA+AGG 0.595976 6:+101040541 MsG0680035248.01.T01:CDS
TAAATAAGATGAAAGACCAA+GGG 0.597920 6:+101040891 MsG0680035248.01.T01:CDS
CAATGGCTGCACCCCAAATG+TGG 0.598763 6:+101041117 MsG0680035248.01.T01:CDS
TTAAATAAGATGAAAGACCA+AGG 0.602830 6:+101040890 MsG0680035248.01.T01:CDS
ACATTCAATACAATTATCAA+AGG 0.606806 6:+101039987 MsG0680035248.01.T01:CDS
AAGACTTAAGGATGCACAAG+AGG 0.607266 6:+101040970 MsG0680035248.01.T01:CDS
AGGTCTTTGTCTTAATGGCG+AGG 0.613066 6:+101040007 MsG0680035248.01.T01:CDS
GGTCAAATGAAAGAAGCAGT+TGG 0.614044 6:+101040338 MsG0680035248.01.T01:CDS
TTCAACACTCTTTCTCTAAG+GGG 0.620649 6:+101040575 MsG0680035248.01.T01:CDS
ATTAAAAGTACGAACATTTG+GGG 0.634236 6:-101040393 None:intergenic
TTGGTAAGTTACCACATTTG+GGG 0.659363 6:-101041128 None:intergenic
ATGATCATGTTATAGCAAAG+GGG 0.671177 6:+101040051 MsG0680035248.01.T01:CDS
TCAACATTGTCAATGAACGA+AGG 0.676691 6:-101039693 None:intergenic
TTACCTGTTATGATAAAACA+AGG 0.757865 6:+101040470 MsG0680035248.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ACATTCAATACAATTATCAA+AGG + Chr6:101039987-101040006 MsG0680035248.01.T01:CDS 20.0%
!! ACTTACAATACTCTAATATA+TGG + Chr6:101040302-101040321 MsG0680035248.01.T01:CDS 20.0%
!! AGAAATGCATTTAAAAAACA+TGG + Chr6:101040685-101040704 MsG0680035248.01.T01:CDS 20.0%
!! ATAGTGTATGTATACATATT+TGG - Chr6:101040923-101040942 None:intergenic 20.0%
!! ATCTTGTTAAATTCAAAGAT+GGG - Chr6:101039771-101039790 None:intergenic 20.0%
!! CATTTCAGAATATAAATCAT+AGG - Chr6:101040252-101040271 None:intergenic 20.0%
!! TGGATTATGTAAGAATAAAA+TGG + Chr6:101040637-101040656 MsG0680035248.01.T01:CDS 20.0%
!!! AATTTCGCATTTTCTATATT+CGG + Chr6:101039927-101039946 MsG0680035248.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATGTTTAAAGTAACAATGTT+AGG - Chr6:101039873-101039892 None:intergenic 20.0%
!!! TATCAAGATCTTTTGATTAA+GGG + Chr6:101040995-101041014 MsG0680035248.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATTAAAAGTACGAACATTT+GGG - Chr6:101040397-101040416 None:intergenic 20.0%
!!! TATTTCTTTTTCGAAACAAA+TGG + Chr6:101039830-101039849 MsG0680035248.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGTTACTTATACTTCTTTAA+CGG + Chr6:101040508-101040527 MsG0680035248.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTATCAAGATCTTTTGATTA+AGG + Chr6:101040994-101041013 MsG0680035248.01.T01:CDS 20.0%
! AACATGATCATGAAAGTAAA+TGG - Chr6:101040042-101040061 None:intergenic 25.0%
! AATCTTTCTAAGTAACTGTA+GGG - Chr6:101040147-101040166 None:intergenic 25.0%
! AATTCTCAAGTTAGGTTATA+AGG + Chr6:101039953-101039972 MsG0680035248.01.T01:CDS 25.0%
! ACATACAATTCACTTATTGA+TGG + Chr6:101040722-101040741 MsG0680035248.01.T01:CDS 25.0%
! AGTTACTTAGAAAGATTGAA+GGG + Chr6:101040150-101040169 MsG0680035248.01.T01:CDS 25.0%
! AGTTATGGGACATTAATTAA+CGG + Chr6:101040092-101040111 MsG0680035248.01.T01:CDS 25.0%
! ATGAATTGGAAGAAACAAAT+TGG - Chr6:101039652-101039671 None:intergenic 25.0%
! GAAATGATTCAACTTAGTAA+GGG - Chr6:101039802-101039821 None:intergenic 25.0%
! GAAGTATAAGTAACAACATT+AGG - Chr6:101040503-101040522 None:intergenic 25.0%
! GATCTTGTTAAATTCAAAGA+TGG - Chr6:101039772-101039791 None:intergenic 25.0%
! TAAATAAGATGAAAGACCAA+GGG + Chr6:101040891-101040910 MsG0680035248.01.T01:CDS 25.0%
! TGAAATGATTCAACTTAGTA+AGG - Chr6:101039803-101039822 None:intergenic 25.0%
! TGTTTGGATGTATAATGTTA+TGG + Chr6:101041030-101041049 MsG0680035248.01.T01:CDS 25.0%
! TTAAATAAGATGAAAGACCA+AGG + Chr6:101040890-101040909 MsG0680035248.01.T01:CDS 25.0%
! TTACCTGTTATGATAAAACA+AGG + Chr6:101040470-101040489 MsG0680035248.01.T01:CDS 25.0%
!! AATATATGGTTTTTCCATTC+TGG + Chr6:101040316-101040335 MsG0680035248.01.T01:CDS 25.0%
!! ATATATGGTTTTTCCATTCT+GGG + Chr6:101040317-101040336 MsG0680035248.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTAAAAGTACGAACATTTG+GGG - Chr6:101040396-101040415 None:intergenic 25.0%
!! GTATTAAAAGTACGAACATT+TGG - Chr6:101040398-101040417 None:intergenic 25.0%
!! TGTTCGTACTTTTAATACAT+TGG + Chr6:101040400-101040419 MsG0680035248.01.T01:CDS 25.0%
!!! ACTTTTAATACATTGGTTGA+TGG + Chr6:101040407-101040426 MsG0680035248.01.T01:CDS 25.0%
ACAAAGCACAAATAAGAGTT+TGG - Chr6:101041150-101041169 None:intergenic 30.0%
ACATTGTAGCTATGAACATT+AGG - Chr6:101040608-101040627 None:intergenic 30.0%
ACCTTGATCAAGTTAGTTAT+GGG + Chr6:101040078-101040097 MsG0680035248.01.T01:CDS 30.0%
ACTTATACTTCTTTAACGGA+TGG + Chr6:101040512-101040531 MsG0680035248.01.T01:CDS 30.0%
AGCTACAATGTCATGATTAA+TGG + Chr6:101040617-101040636 MsG0680035248.01.T01:CDS 30.0%
ATCAAAGGTCTTTGTCTTAA+TGG + Chr6:101040002-101040021 MsG0680035248.01.T01:CDS 30.0%
ATGATCATGTTATAGCAAAG+GGG + Chr6:101040051-101040070 MsG0680035248.01.T01:CDS 30.0%
ATGCAAAAATGGAAGACTTA+AGG + Chr6:101040958-101040977 MsG0680035248.01.T01:CDS 30.0%
ATGCTATACATTACCACATT+AGG - Chr6:101040188-101040207 None:intergenic 30.0%
ATTCAACACTCTTTCTCTAA+GGG + Chr6:101040574-101040593 MsG0680035248.01.T01:CDS 30.0%
ATTGTCCTTACTCTCAAAAA+TGG + Chr6:101041090-101041109 MsG0680035248.01.T01:CDS 30.0%
CAATCTTTCTAAGTAACTGT+AGG - Chr6:101040148-101040167 None:intergenic 30.0%
CAGTTACTTAGAAAGATTGA+AGG + Chr6:101040149-101040168 MsG0680035248.01.T01:CDS 30.0%
CATATGAAGAATGTGATTGA+AGG - Chr6:101039733-101039752 None:intergenic 30.0%
CATGATCATGTTATAGCAAA+GGG + Chr6:101040050-101040069 MsG0680035248.01.T01:CDS 30.0%
CGAAAATGACAAGAATGATA+AGG + Chr6:101041171-101041190 MsG0680035248.01.T01:CDS 30.0%
GAATTGTATGTTACAGTATC+AGG - Chr6:101040713-101040732 None:intergenic 30.0%
GTTATGGGACATTAATTAAC+GGG + Chr6:101040093-101040112 MsG0680035248.01.T01:CDS 30.0%
TATTCAACACTCTTTCTCTA+AGG + Chr6:101040573-101040592 MsG0680035248.01.T01:CDS 30.0%
TCATGATCATGTTATAGCAA+AGG + Chr6:101040049-101040068 MsG0680035248.01.T01:CDS 30.0%
TGTTAAATTCAAAGATGGGT+TGG - Chr6:101039767-101039786 None:intergenic 30.0%
TGTTATGATAAAACAAGGTG+TGG + Chr6:101040475-101040494 MsG0680035248.01.T01:CDS 30.0%
TTTGGTAAGTTACCACATTT+GGG - Chr6:101041132-101041151 None:intergenic 30.0%
! ACATACACTATACTTGTTGA+TGG + Chr6:101040932-101040951 MsG0680035248.01.T01:CDS 30.0%
! AGATTGAAGGGTTATTGATT+AGG + Chr6:101040162-101040181 MsG0680035248.01.T01:CDS 30.0%
! CTTATACTTCTTTAACGGAT+GGG + Chr6:101040513-101040532 MsG0680035248.01.T01:CDS 30.0%
! GTTAAATTCAAAGATGGGTT+GGG - Chr6:101039766-101039785 None:intergenic 30.0%
!! AAGAGTGTTGAATACATGTT+TGG - Chr6:101040567-101040586 None:intergenic 30.0%
!! ATTAACGGGTTATGTAAATC+CGG + Chr6:101040107-101040126 MsG0680035248.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTGGTTGATGGTTTATGTA+AGG + Chr6:101040418-101040437 MsG0680035248.01.T01:CDS 30.0%
!! CGAAATTGATTTGATTGAGA+TGG - Chr6:101039914-101039933 None:intergenic 30.0%
!! TATTGATGGACTTTGCAAAT+CGG + Chr6:101040736-101040755 MsG0680035248.01.T01:CDS 30.0%
!!! ACACCTTGTTTTATCATAAC+AGG - Chr6:101040476-101040495 None:intergenic 30.0%
!!! CGTCATCATTTTTAAGGTTA+AGG + Chr6:101039601-101039620 MsG0680035248.01.T01:CDS 30.0%
ATAGATGAGATGCACAATAG+AGG + Chr6:101040785-101040804 MsG0680035248.01.T01:CDS 35.0%
CACCTTGATCAAGTTAGTTA+TGG + Chr6:101040077-101040096 MsG0680035248.01.T01:CDS 35.0%
CTCTCAAAAATGGTAGACAA+TGG + Chr6:101041100-101041119 MsG0680035248.01.T01:CDS 35.0%
CTTGGTTAAAGAAGTCAACA+AGG + Chr6:101040541-101040560 MsG0680035248.01.T01:CDS 35.0%
GACCTCTAACAATCATTTCA+CGG - Chr6:101041210-101041229 None:intergenic 35.0%
GGAAAGAATCTCTGATGTTT+GGG + Chr6:101040757-101040776 MsG0680035248.01.T01:CDS 35.0%
GTTTGGTAAGTTACCACATT+TGG - Chr6:101041133-101041152 None:intergenic 35.0%
TCAACATTGTCAATGAACGA+AGG - Chr6:101039696-101039715 None:intergenic 35.0%
TCCCATAACTAACTTGATCA+AGG - Chr6:101040082-101040101 None:intergenic 35.0%
TGAACGTGTAATCGATGAAT+TGG - Chr6:101039666-101039685 None:intergenic 35.0%
TTCAACACTCTTTCTCTAAG+GGG + Chr6:101040575-101040594 MsG0680035248.01.T01:CDS 35.0%
TTCGGCAAAATTCTCAAGTT+AGG + Chr6:101039945-101039964 MsG0680035248.01.T01:CDS 35.0%
TTCTTTCATTTGACCCAGAA+TGG - Chr6:101040333-101040352 None:intergenic 35.0%
TTGGTAAGTTACCACATTTG+GGG - Chr6:101041131-101041150 None:intergenic 35.0%
! GTTATTGATTAGGCCTAATG+TGG + Chr6:101040172-101040191 MsG0680035248.01.T01:CDS 35.0%
! TTTAACGGATGGGTATTTCT+TGG + Chr6:101040523-101040542 MsG0680035248.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTTGGGGTGATGTTTTTCA+AGG - Chr6:101040381-101040400 None:intergenic 35.0%
!! GTCTACCATTTTTGAGAGTA+AGG - Chr6:101041098-101041117 None:intergenic 35.0%
!! GTTGATGGACTATGCAAAAA+TGG + Chr6:101040947-101040966 MsG0680035248.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTGATGGTTTATGTAAGGA+AGG + Chr6:101040422-101040441 MsG0680035248.01.T01:CDS 35.0%
AAGACTTAAGGATGCACAAG+AGG + Chr6:101040970-101040989 MsG0680035248.01.T01:CDS 40.0%
ACATATTTGGCTGAATCCCT+TGG - Chr6:101040910-101040929 None:intergenic 40.0%
AGAAACAAATTGGCAGTGGA+AGG - Chr6:101039642-101039661 None:intergenic 40.0%
AGGGCTATCGTTTAGATGTT+TGG + Chr6:101041014-101041033 MsG0680035248.01.T01:CDS 40.0%
CGGAAAGAATCTCTGATGTT+TGG + Chr6:101040756-101040775 MsG0680035248.01.T01:CDS 40.0%
CTCCGTGAAATGATTGTTAG+AGG + Chr6:101041205-101041224 MsG0680035248.01.T01:CDS 40.0%
GGTCAAATGAAAGAAGCAGT+TGG + Chr6:101040338-101040357 MsG0680035248.01.T01:CDS 40.0%
GTATTGTAAGTGACGACATC+AGG - Chr6:101040293-101040312 None:intergenic 40.0%
GTTAACGCGCTTTGTAAAGA+GGG + Chr6:101041052-101041071 MsG0680035248.01.T01:CDS 40.0%
TGCTTTGTGCAAAAACCATC+AGG + Chr6:101040847-101040866 MsG0680035248.01.T01:CDS 40.0%
TGGAAGAAACAAATTGGCAG+TGG - Chr6:101039646-101039665 None:intergenic 40.0%
TTGTCAATGAACGAAGGAAG+AGG - Chr6:101039690-101039709 None:intergenic 40.0%
TTTGTCTTAATGGCGAGGTT+AGG + Chr6:101040012-101040031 MsG0680035248.01.T01:CDS 40.0%
!! AATTCAAAGATGGGTTGGGT+AGG - Chr6:101039762-101039781 None:intergenic 40.0%
!! ATTCAAAGATGGGTTGGGTA+GGG - Chr6:101039761-101039780 None:intergenic 40.0%
!! CAAAAACCATCAGGTTGACA+AGG + Chr6:101040856-101040875 MsG0680035248.01.T01:CDS 40.0%
AGGTCTTTGTCTTAATGGCG+AGG + Chr6:101040007-101040026 MsG0680035248.01.T01:CDS 45.0%
GGTTAACGCGCTTTGTAAAG+AGG + Chr6:101041051-101041070 MsG0680035248.01.T01:CDS 45.0%
CAATCGCCTTGTCAACCTGA+TGG - Chr6:101040865-101040884 None:intergenic 50.0%
! TAGGGCAGCTCTTGTTTCTC+CGG - Chr6:101040129-101040148 None:intergenic 50.0%
CAATGGCTGCACCCCAAATG+TGG + Chr6:101041117-101041136 MsG0680035248.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 101039597 101041237 101039597 ID=MsG0680035248.01;Name=MsG0680035248.01
Chr6 mRNA 101039597 101041237 101039597 ID=MsG0680035248.01.T01;Parent=MsG0680035248.01;Name=MsG0680035248.01.T01;_AED=0.43;_eAED=0.43;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|546
Chr6 exon 101039597 101041237 101039597 ID=MsG0680035248.01.T01:exon:10522;Parent=MsG0680035248.01.T01
Chr6 CDS 101039597 101041237 101039597 ID=MsG0680035248.01.T01:cds;Parent=MsG0680035248.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680035248.01.T01

ATGACGTCATCATTTTTAAGGTTAAGGTATGCTCTCTCTGTTCCTTCCACTGCCAATTTGTTTCTTCCAATTCATCGATTACACGTTCAGCCTCTTCCTTCGTTCATTGACAATGTTGATGATGCTGTTTCATCCTTCAATCACATTCTTCATATGAACAACCCTACCCAACCCATCTTTGAATTTAACAAGATCTTATCTTCCCTTACTAAGTTGAATCATTTCAACACTGCTATTTCTTTTTCGAAACAAATGGAACTTAAATGTATTCAACCTAACATTGTTACTTTAAACATCTTGATTAATTCTTTCTGCCATCTCAATCAAATCAATTTCGCATTTTCTATATTCGGCAAAATTCTCAAGTTAGGTTATAAGGCTGATACTGTAACATTCAATACAATTATCAAAGGTCTTTGTCTTAATGGCGAGGTTAGGAAAGCCATTTACTTTCATGATCATGTTATAGCAAAGGGGTTTCACCTTGATCAAGTTAGTTATGGGACATTAATTAACGGGTTATGTAAATCCGGAGAAACAAGAGCTGCCCTACAGTTACTTAGAAAGATTGAAGGGTTATTGATTAGGCCTAATGTGGTAATGTATAGCATAATCATAGATAGTCTATGCAAAGATAAGCTCGTAATTGACGCCTATGATTTATATTCTGAAATGATTTTTAAGAAAATTTGTCCTGATGTCGTCACTTACAATACTCTAATATATGGTTTTTCCATTCTGGGTCAAATGAAAGAAGCAGTTGGTTTGTTAAATCAAATGACCTTGAAAAACATCACCCCAAATGTTCGTACTTTTAATACATTGGTTGATGGTTTATGTAAGGAAGGAGAGATGAAAAAAGCTACAAGTGTGTTACCTGTTATGATAAAACAAGGTGTGGAACCTAATGTTGTTACTTATACTTCTTTAACGGATGGGTATTTCTTGGTTAAAGAAGTCAACAAGGCCAAACATGTATTCAACACTCTTTCTCTAAGGGGAGTGACTCCTAATGTTCATAGCTACAATGTCATGATTAATGGATTATGTAAGAATAAAATGGTAGATGAAGCTACGAATCATTTCAAAGAAATGCATTTAAAAAACATGGCTCCTGATACTGTAACATACAATTCACTTATTGATGGACTTTGCAAATCGGAAAGAATCTCTGATGTTTGGGATCTTATAGATGAGATGCACAATAGAGGTCAATCAGCTAATGTGATCACTTACAGTTCTTTATTGAATGCTTTGTGCAAAAACCATCAGGTTGACAAGGCGATTGCATTATTAAATAAGATGAAAGACCAAGGGATTCAGCCAAATATGTATACATACACTATACTTGTTGATGGACTATGCAAAAATGGAAGACTTAAGGATGCACAAGAGGTTTATCAAGATCTTTTGATTAAGGGCTATCGTTTAGATGTTTGGATGTATAATGTTATGGTTAACGCGCTTTGTAAAGAGGGTTTGTTCGATGAAGCATTGTCCTTACTCTCAAAAATGGTAGACAATGGCTGCACCCCAAATGTGGTAACTTACCAAACTCTTATTTGTGCTTTGTTCGAAAATGACAAGAATGATAAGGCGTTGATACTTCTCCGTGAAATGATTGTTAGAGGTCTATTGTAA
Protein sequence

>MsG0680035248.01.T01

MTSSFLRLRYALSVPSTANLFLPIHRLHVQPLPSFIDNVDDAVSSFNHILHMNNPTQPIFEFNKILSSLTKLNHFNTAISFSKQMELKCIQPNIVTLNILINSFCHLNQINFAFSIFGKILKLGYKADTVTFNTIIKGLCLNGEVRKAIYFHDHVIAKGFHLDQVSYGTLINGLCKSGETRAALQLLRKIEGLLIRPNVVMYSIIIDSLCKDKLVIDAYDLYSEMIFKKICPDVVTYNTLIYGFSILGQMKEAVGLLNQMTLKNITPNVRTFNTLVDGLCKEGEMKKATSVLPVMIKQGVEPNVVTYTSLTDGYFLVKEVNKAKHVFNTLSLRGVTPNVHSYNVMINGLCKNKMVDEATNHFKEMHLKNMAPDTVTYNSLIDGLCKSERISDVWDLIDEMHNRGQSANVITYSSLLNALCKNHQVDKAIALLNKMKDQGIQPNMYTYTILVDGLCKNGRLKDAQEVYQDLLIKGYRLDVWMYNVMVNALCKEGLFDEALSLLSKMVDNGCTPNVVTYQTLICALFENDKNDKALILLREMIVRGLL*