AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680033779.01

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MsG0680033779.01.T01 AT5G65820 28.269 283 189 5 152 431 147 418 8.48e-26 113
MsG0680033779.01.T01 AT5G65820 22.442 303 226 5 8 305 285 583 9.37e-16 81.6
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MsG0680033779.01.T01 AT1G63320 27.737 137 90 1 137 264 1 137 2.93e-14 72.4
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MsG0680033779.01.T01 AT4G34830 24.125 257 193 1 38 292 563 819 6.80e-19 92.0
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MsG0680033779.01.T01 AT5G27270 18.663 359 283 3 74 432 180 529 2.31e-12 70.9
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MsG0680033779.01.T01 AT2G03380 20.551 399 288 10 46 439 307 681 4.68e-12 69.7
MsG0680033779.01.T01 AT5G44230 23.507 268 187 8 44 305 113 368 4.13e-12 69.7
MsG0680033779.01.T01 AT3G53360 22.376 362 232 9 86 414 35 380 4.18e-12 70.1
MsG0680033779.01.T01 AT3G53360 22.376 362 232 9 86 414 35 380 4.18e-12 70.1
MsG0680033779.01.T01 AT5G16860 22.759 435 271 11 28 414 69 486 4.73e-12 70.1
MsG0680033779.01.T01 AT5G16860 21.450 331 222 9 118 431 296 605 2.82e-11 67.4
MsG0680033779.01.T01 AT5G44230 23.507 268 187 8 44 305 210 465 5.20e-12 69.7
MsG0680033779.01.T01 AT5G56310 21.471 340 222 8 141 448 136 462 5.24e-12 69.3
MsG0680033779.01.T01 AT3G03580 20.358 447 294 9 3 414 64 483 5.57e-12 69.7
MsG0680033779.01.T01 AT3G09040 22.739 387 271 10 42 427 155 514 5.68e-12 69.7
MsG0680033779.01.T01 AT3G09040 22.739 387 271 10 42 427 155 514 5.68e-12 69.7
MsG0680033779.01.T01 AT3G15130 19.385 423 259 10 44 432 67 441 6.12e-12 69.3
MsG0680033779.01.T01 AT3G09040 22.680 388 272 10 41 427 179 539 6.19e-12 69.7
MsG0680033779.01.T01 AT3G09040 22.680 388 272 10 41 427 179 539 6.19e-12 69.7
MsG0680033779.01.T01 AT3G22150 22.291 323 218 8 39 347 339 642 7.38e-12 69.3
MsG0680033779.01.T01 AT3G22150 22.291 323 218 8 39 347 339 642 7.38e-12 69.3
MsG0680033779.01.T01 AT2G36980 21.281 484 298 11 10 432 4 465 9.17e-12 68.9
MsG0680033779.01.T01 AT2G36980 21.556 450 278 10 44 432 21 456 9.39e-12 68.6
MsG0680033779.01.T01 AT1G25360 20.819 562 345 18 136 655 29 532 1.12e-11 68.6
MsG0680033779.01.T01 AT5G09950 21.970 264 194 5 43 304 548 801 1.12e-11 68.9
MsG0680033779.01.T01 AT5G09950 21.970 264 194 5 43 304 548 801 1.12e-11 68.9
MsG0680033779.01.T01 AT5G36300 21.795 312 214 7 120 414 14 312 1.15e-11 67.0
MsG0680033779.01.T01 AT5G09950 21.970 264 194 5 43 304 542 795 1.16e-11 68.9
MsG0680033779.01.T01 AT3G20730 21.945 401 280 9 40 432 71 446 1.21e-11 68.2
MsG0680033779.01.T01 AT4G13650 19.834 721 450 20 6 674 147 791 1.30e-11 68.6
MsG0680033779.01.T01 AT4G13650 22.977 309 187 8 144 414 103 398 2.19e-11 67.8
MsG0680033779.01.T01 AT3G26782 21.303 399 283 10 46 434 40 417 1.59e-11 68.2
MsG0680033779.01.T01 AT1G13410 23.307 502 285 22 98 547 12 465 1.63e-11 67.4
MsG0680033779.01.T01 AT1G78320 34.783 115 57 2 431 541 57 157 2.24e-11 63.9
MsG0680033779.01.T01 AT1G69350 24.462 372 248 12 32 396 220 565 2.58e-11 67.4

Find 142 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 472 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CACTTGGATCATGTTACTTA+TGG 0.166982 6:+73360231 MsG0680033779.01.T01:CDS
ATCAAAGGTTTGTGTCTTAA+TGG 0.169149 6:+73360156 MsG0680033779.01.T01:CDS
ATCAATGGCTTGTGTAAAAT+AGG 0.185934 6:+73360261 MsG0680033779.01.T01:CDS
ACCTTTGATAAGAGTATTAA+AGG 0.210560 6:-73360142 None:intergenic
AATGCTGTTTCTTCATTCTA+TGG 0.212282 6:+73359865 MsG0680033779.01.T01:CDS
ACGTATACTATTATGATTAA+TGG 0.214658 6:+73353678 MsG0680033779.01.T01:CDS
AGCTATAGTATCATGATTAA+TGG 0.223616 6:+73353364 MsG0680033779.01.T01:CDS
AACCCTTAATCAAAAGATTC+TGG 0.224765 6:-73353638 None:intergenic
GATCAATGGCTTGTGTAAAA+TGG 0.230266 6:+73352853 MsG0680033779.01.T01:CDS
ACTTTCAATTCTCTAATCTA+TGG 0.237445 6:+73353049 MsG0680033779.01.T01:CDS
GTGCTATACATTACTATATC+AGG 0.241016 6:-73352932 None:intergenic
TTTGAGAATCTTAGCAAATA+TGG 0.243195 6:-73352687 None:intergenic
TGTTACCTACAATTCATTAA+TGG 0.245388 6:+73353255 MsG0680033779.01.T01:CDS
TGGATTCTGTAAGATTAAAA+TGG 0.249286 6:+73353384 MsG0680033779.01.T01:CDS
GTGATGTTGGAGGGAGGATA+TGG 0.264890 6:+73354625 MsG0680033779.01.T01:CDS
AAGACAAATTGAAGGGAAAT+TGG 0.272036 6:+73352904 MsG0680033779.01.T01:CDS
TGAGATTGAATTGGCAAATA+AGG 0.280477 6:+73354662 MsG0680033779.01.T01:CDS
CTTGGAGACAAGCCTTATTT+TGG 0.284960 6:+73354720 MsG0680033779.01.T01:CDS
TTTGCTAAGATTCTCAAATT+AGG 0.289983 6:+73352692 MsG0680033779.01.T01:CDS
TTTACACAAGCCATTGATTA+AGG 0.298154 6:-73360256 None:intergenic
GTTTCATAAGTTACGGCATT+AGG 0.304928 6:-73353771 None:intergenic
GAAAGCTCAAGCCATGTTTC+GGG 0.311268 6:+73354578 MsG0680033779.01.T01:CDS
AGAGGCCTTGTTATCTAAAA+TGG 0.314043 6:+73353731 MsG0680033779.01.T01:CDS
CCTAGTTAATGAAGTGTATA+AGG 0.319105 6:+73353288 MsG0680033779.01.T01:CDS
ACTTGGATCATGTTACTTAT+GGG 0.324086 6:+73360232 MsG0680033779.01.T01:CDS
TCAATGGCTTGTGTAAAATA+GGG 0.325073 6:+73360262 MsG0680033779.01.T01:CDS
GTGAAATAACAGTGAGATAA+TGG 0.325406 6:-73352562 None:intergenic
CATTAATTGTCACTCTCACT+TGG 0.360689 6:+73352643 MsG0680033779.01.T01:CDS
AGAAAGCTCAAGCCATGTTT+CGG 0.366597 6:+73354577 MsG0680033779.01.T01:CDS
CACGACCATGTGCTTGCACT+TGG 0.369532 6:+73360204 MsG0680033779.01.T01:CDS
AATTTGTCTTAACACTTGTA+AGG 0.376126 6:-73352891 None:intergenic
TGAGAAAGATTGATGGAAAT+TGG 0.377331 6:+73360310 MsG0680033779.01.T01:CDS
ACTTACAATTCTCTAATTGA+TGG 0.378731 6:+73353469 MsG0680033779.01.T01:CDS
TATATACCTTTCTCATCAAT+TGG 0.394128 6:+73359984 MsG0680033779.01.T01:CDS
AATAATGCTTAACACATGTT+TGG 0.395178 6:-73353311 None:intergenic
CACTTGAACCAAGTTAGTTA+TGG 0.396341 6:+73352824 MsG0680033779.01.T01:CDS
GTCAAAGGCATGTGTCTTAA+CGG 0.396747 6:+73352749 MsG0680033779.01.T01:CDS
GCCTTTGACAAGTGTATTGA+AGG 0.397408 6:-73352735 None:intergenic
CCTTATACACTTCATTAACT+AGG 0.398610 6:-73353288 None:intergenic
CCTCATTCCATCGAATGCTT+CGG 0.399509 6:+73352471 None:intergenic
GATTGAAGGATTAAATGAAT+TGG 0.401116 6:+73354689 MsG0680033779.01.T01:CDS
GGTATATAGCAGTGGGGTAA+TGG 0.405305 6:-73359969 None:intergenic
GAATTGTAGGTAACAACATT+TGG 0.407429 6:-73353247 None:intergenic
ATGGCTTGAGCTTTCTGATA+AGG 0.408403 6:-73354570 None:intergenic
TTACTGCCATCTTGGTGAAA+TGG 0.408464 6:+73360059 MsG0680033779.01.T01:CDS
ATACTATAGCTATAAACATT+AGG 0.410544 6:-73353352 None:intergenic
ATGTATAGCACAATCATTGA+TGG 0.411767 6:+73352944 MsG0680033779.01.T01:CDS
CAAATGTTGAGAAAGATTGA+TGG 0.413710 6:+73360303 MsG0680033779.01.T01:CDS
ATAACCCATCTTTAGCATCT+TGG 0.414225 6:-73360103 None:intergenic
GCAAATAAGGAGTTGATTGA+AGG 0.415558 6:+73354675 MsG0680033779.01.T01:CDS
GTATTAAAGGTAATGGTATC+CGG 0.417892 6:-73360129 None:intergenic
AAAGAGAGATGAGATTGAAT+TGG 0.418834 6:+73354653 MsG0680033779.01.T01:CDS
ATGCTAAAAGTATAAACATC+CGG 0.424043 6:-73353142 None:intergenic
TCCATCCATTAATGAATTGT+AGG 0.430371 6:-73353260 None:intergenic
AGTTATGGTACTTTGATCAA+TGG 0.430803 6:+73352839 MsG0680033779.01.T01:CDS
GATAAGAGTATTAAAGGTAA+TGG 0.430997 6:-73360136 None:intergenic
AATGTGTCACCACCAAAATA+AGG 0.433956 6:-73354732 None:intergenic
ATTAATTGTTACTGCCATCT+TGG 0.434496 6:+73360051 MsG0680033779.01.T01:CDS
ATCAATGGCTTGTGTAAAAT+GGG 0.438367 6:+73352854 MsG0680033779.01.T01:CDS
ATGTTGAAAGTAGCAATATC+AGG 0.438708 6:-73352617 None:intergenic
TTAAGCATTATTTCTCGAAT+GGG 0.438940 6:+73353322 MsG0680033779.01.T01:CDS
CAAGACCATGTGATTGCACT+AGG 0.440757 6:+73352797 MsG0680033779.01.T01:CDS
ATTGGTTGATGCTCTATGTA+AGG 0.445756 6:+73353165 MsG0680033779.01.T01:CDS
GATAATAGTTTCATAAGTTA+CGG 0.451848 6:-73353778 None:intergenic
TTGTTAAATTCAACAATGGA+TGG 0.453316 6:-73352506 None:intergenic
AACAAGAAGGTTGGTGATGT+TGG 0.455281 6:+73354612 MsG0680033779.01.T01:CDS
GCTTGCACTTGGATTTCACT+TGG 0.461636 6:+73360215 MsG0680033779.01.T01:CDS
TTCATTCTCATCTTTATGAA+AGG 0.462541 6:-73353808 None:intergenic
TGATGTTGGAGGGAGGATAT+GGG 0.462736 6:+73354626 MsG0680033779.01.T01:CDS
ATTAATGGACTTTGTAAAGA+GGG 0.473939 6:+73353693 MsG0680033779.01.T01:CDS
TCATTCTCATCTTTATGAAA+GGG 0.474204 6:-73353807 None:intergenic
ACTTATGGGACCTTAATCAA+TGG 0.476873 6:+73360246 MsG0680033779.01.T01:CDS
ACCTTTAATACTCTTATCAA+AGG 0.480157 6:+73360141 MsG0680033779.01.T01:CDS
TAATCATAATAGTATACGTT+CGG 0.484618 6:-73353674 None:intergenic
GTTAAGCATTATTTCTCGAA+TGG 0.487007 6:+73353321 MsG0680033779.01.T01:CDS
ATTAATTGTCACTCTCACTT+GGG 0.502092 6:+73352644 MsG0680033779.01.T01:CDS
AATGAATTGGAGAATGTGCT+TGG 0.505341 6:+73354702 MsG0680033779.01.T01:CDS
TGTATTGAAGGTTAAAGTTG+TGG 0.507314 6:-73352723 None:intergenic
TGTTAAATTCAACAATGGAT+GGG 0.508940 6:-73352505 None:intergenic
TGAGTTCCAATTGATGAGAA+AGG 0.511182 6:-73359990 None:intergenic
AGGTTTGTGTCTTAATGGTA+AGG 0.517066 6:+73360161 MsG0680033779.01.T01:CDS
GGTGGCCAAGATGCTAAAGA+TGG 0.517979 6:+73360098 MsG0680033779.01.T01:CDS
GTTAAATTCAACAATGGATG+GGG 0.518377 6:-73352504 None:intergenic
TCAAAGTACCATAACTAACT+TGG 0.521662 6:-73352832 None:intergenic
TTGTTAAATTCAATGATGGA+TGG 0.521666 6:-73359910 None:intergenic
GGCTGATTTCGTCAACAAGA+AGG 0.522914 6:+73354599 MsG0680033779.01.T01:CDS
TGCTATACATTACTATATCA+GGG 0.533417 6:-73352931 None:intergenic
CAAGTGTTAAGACAAATTGA+AGG 0.536038 6:+73352896 MsG0680033779.01.T01:CDS
GGTTGTTGTTAGACTTAACA+AGG 0.538799 6:-73352541 None:intergenic
TCATAAAGATGAGAATGAAA+AGG 0.539340 6:+73353812 MsG0680033779.01.T01:CDS
CATTTCATTAAAGAGACTCA+TGG 0.543869 6:-73353416 None:intergenic
TGCTAAAAGTATAAACATCC+GGG 0.544842 6:-73353141 None:intergenic
ATAGCTGTGATGATGATAGA+AGG 0.545263 6:+73353217 MsG0680033779.01.T01:CDS
AAGAAGGTTGGTGATGTTGG+AGG 0.548883 6:+73354615 MsG0680033779.01.T01:CDS
TGAGAAAGGTATATAGCAGT+GGG 0.549828 6:-73359976 None:intergenic
AATCTTTCTCAACATTTGCA+AGG 0.550191 6:-73360298 None:intergenic
AGAAGGTTGGTGATGTTGGA+GGG 0.550723 6:+73354616 MsG0680033779.01.T01:CDS
ACCTACAATTCATTAATGGA+TGG 0.551321 6:+73353259 MsG0680033779.01.T01:CDS
TTTAATGAAATGCACTGCAT+AGG 0.552376 6:+73353427 MsG0680033779.01.T01:CDS
GTGTCTTAATGGTAAGGTCA+AGG 0.555980 6:+73360167 MsG0680033779.01.T01:CDS
AATTCAACAATGGATGGGGT+AGG 0.560627 6:-73352500 None:intergenic
TTAATTGTCACTCTCACTTG+GGG 0.561130 6:+73352645 MsG0680033779.01.T01:CDS
CAATGGCTTGTGTAAAATAG+GGG 0.564701 6:+73360263 MsG0680033779.01.T01:CDS
ACCTTCAATACACTTGTCAA+AGG 0.565082 6:+73352734 MsG0680033779.01.T01:CDS
GATTTCGTCAACAAGAAGGT+TGG 0.568652 6:+73354603 MsG0680033779.01.T01:CDS
TATTAAAGGTAATGGTATCC+GGG 0.569051 6:-73360128 None:intergenic
GATTAATGGACTTTGTAAAG+AGG 0.571488 6:+73353692 MsG0680033779.01.T01:CDS
AATGTTGTTAAATTCAACAA+TGG 0.575268 6:-73352510 None:intergenic
GTTGTTGTTAGTCTTAACAA+TGG 0.576971 6:-73359944 None:intergenic
TTGGTTGATGCTCTATGTAA+GGG 0.581673 6:+73353166 MsG0680033779.01.T01:CDS
TCTCATCAATTGGAACTCAA+CGG 0.583523 6:+73359994 MsG0680033779.01.T01:CDS
AAGTGTTAAGACAAATTGAA+GGG 0.590042 6:+73352897 MsG0680033779.01.T01:CDS
AATTCAATGATGGATGGAGA+AGG 0.590537 6:-73359904 None:intergenic
GTTGGAGGGAGGATATGGGC+TGG 0.592056 6:+73354630 MsG0680033779.01.T01:CDS
GAATTGAAAGTGACAACGGT+AGG 0.592206 6:-73353037 None:intergenic
GACGAAATCAGCCCGAAACA+TGG 0.592857 6:-73354589 None:intergenic
TATTGAGAACAAATCTAGAG+TGG 0.597014 6:-73359828 None:intergenic
ATGAGAAAGGTATATAGCAG+TGG 0.598583 6:-73359977 None:intergenic
GTGTCTTAACGGTAAAGTCA+AGG 0.602781 6:+73352760 MsG0680033779.01.T01:CDS
GAAATCCAAGTGCAAGCACA+TGG 0.610248 6:-73360209 None:intergenic
CTTCGTGAAATGATCGCTAG+AGG 0.613965 6:+73353846 MsG0680033779.01.T01:CDS
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CRISPR-GE

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!!! AATGTGCTTTTCTTTTTTGA+TGG - Chr6:73354302-73354321 None:intergenic 25.0%
!!! ACCTTTGATAAGAGTATTAA+AGG - Chr6:73360145-73360164 None:intergenic 25.0%
!!! AGTCACGTTTTTTATAACAA+TGG + Chr6:73357389-73357408 MsG0680033779.01.T01:intron 25.0%
!!! ATTAATGGACTTTGTAAAGA+GGG + Chr6:73353693-73353712 MsG0680033779.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTTTTGGTAAGTTTATCGA+TGG - Chr6:73357974-73357993 None:intergenic 25.0%
!!! CATAACCTTTCATTTGATTT+TGG + Chr6:73355620-73355639 MsG0680033779.01.T01:intron 25.0%
!!! CATAGGAATTGCTTTTAATA+TGG + Chr6:73353444-73353463 MsG0680033779.01.T01:CDS 25.0%
!!! GACAAACATATATTTGGTTT+TGG - Chr6:73359357-73359376 None:intergenic 25.0%
!!! GATAAGAGTATTAAAGGTAA+TGG - Chr6:73360139-73360158 None:intergenic 25.0%
!!! GTCAACATTTTTTGATTATG+TGG + Chr6:73358484-73358503 MsG0680033779.01.T01:intron 25.0%
!!! TAGCTGATTTTATACTTATG+AGG + Chr6:73354788-73354807 MsG0680033779.01.T01:intron 25.0%
!!! TCCATTTTTTGTTATTACCA+AGG + Chr6:73356769-73356788 MsG0680033779.01.T01:intron 25.0%
!!! TTCCAGAATCTTTTGATTAA+GGG + Chr6:73353636-73353655 MsG0680033779.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTCCAGAATCTTTTGATTA+AGG + Chr6:73353635-73353654 MsG0680033779.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTGCAACATTATTTTAGAC+AGG - Chr6:73355337-73355356 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTAGATAGATAAGAGCAT+AGG - Chr6:73356634-73356653 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTTTAACTATGGTCCAAA+CGG - Chr6:73359548-73359567 None:intergenic 25.0%
AAAAATCCATTTCACCAAGA+TGG - Chr6:73360068-73360087 None:intergenic 30.0%
AAAGAATCAAGATCTCATCA+AGG - Chr6:73355908-73355927 None:intergenic 30.0%
AAAGACGACAATCACAATTA+GGG - Chr6:73359676-73359695 None:intergenic 30.0%
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AAAGATTGAGACAAAAATCG+GGG - Chr6:73355784-73355803 None:intergenic 30.0%
AACCCTTAATCAAAAGATTC+TGG - Chr6:73353641-73353660 None:intergenic 30.0%
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ACTTTGTGGTTATGAACTTA+AGG + Chr6:73354138-73354157 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
AGTACAATCAACTATCTTGA+TGG - Chr6:73358441-73358460 None:intergenic 30.0%
AGTCAAGAAATTAAAGACCA+AGG + Chr6:73353531-73353550 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
AGTTATGGTACTTTGATCAA+TGG + Chr6:73352839-73352858 MsG0680033779.01.T01:CDS 30.0%
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ATCATAACTGAATCAACCAT+TGG - Chr6:73354073-73354092 None:intergenic 30.0%
ATGAACAAATGAATACACAG+TGG - Chr6:73356033-73356052 None:intergenic 30.0%
ATGAAGACAAGGAAAATGTA+TGG + Chr6:73357680-73357699 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
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ATGTTGAAAGTAGCAATATC+AGG - Chr6:73352620-73352639 None:intergenic 30.0%
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ATTAATTGTTACTGCCATCT+TGG + Chr6:73360051-73360070 MsG0680033779.01.T01:CDS 30.0%
ATTATGCAACTTCAAAGTTG+AGG + Chr6:73354812-73354831 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
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CAAATGTTGAGAAAGATTGA+TGG + Chr6:73360303-73360322 MsG0680033779.01.T01:CDS 30.0%
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CAATCCCAAAATCAAATGAA+AGG - Chr6:73355628-73355647 None:intergenic 30.0%
CATTTCATTAAAGAGACTCA+TGG - Chr6:73353419-73353438 None:intergenic 30.0%
CCTAGTTAATGAAGTGTATA+AGG + Chr6:73353288-73353307 MsG0680033779.01.T01:CDS 30.0%
CCTTATACACTTCATTAACT+AGG - Chr6:73353291-73353310 None:intergenic 30.0%
CTCAACGTTAGTAGTAATAA+AGG + Chr6:73358956-73358975 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
CTTGCTAGAAAATAGAATGA+AGG - Chr6:73356490-73356509 None:intergenic 30.0%
GAAATGAACATATCAACACA+TGG - Chr6:73354032-73354051 None:intergenic 30.0%
GAACTATCTTCTTGTGAATT+TGG - Chr6:73354455-73354474 None:intergenic 30.0%
GAATTGTAGGTAACAACATT+TGG - Chr6:73353250-73353269 None:intergenic 30.0%
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GTGCTATACATTACTATATC+AGG - Chr6:73352935-73352954 None:intergenic 30.0%
GTTAAATTCAACAATGGATG+GGG - Chr6:73352507-73352526 None:intergenic 30.0%
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TAGAGAATTGAAAGTGACAA+CGG - Chr6:73353044-73353063 None:intergenic 30.0%
TAGCAGTACTTAATAACATG+AGG + Chr6:73357743-73357762 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
TATTGAGAACAAATCTAGAG+TGG - Chr6:73359831-73359850 None:intergenic 30.0%
TATTGTTGCGTATATTGATG+AGG + Chr6:73354512-73354531 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
TCAGATTTCGAAACAGAAAT+TGG + Chr6:73355941-73355960 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
TCAGCACTACTTCATTAAAA+TGG - Chr6:73357462-73357481 None:intergenic 30.0%
TCATAGATGAGTCTCAAATA+AGG - Chr6:73356283-73356302 None:intergenic 30.0%
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TCTCAGAAACTTACTTCTAA+TGG - Chr6:73356310-73356329 None:intergenic 30.0%
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TGTACTGTTATAGTGAGAAT+AGG + Chr6:73357567-73357586 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
TGTATTGAAGGTTAAAGTTG+TGG - Chr6:73352726-73352745 None:intergenic 30.0%
TTGCAATTTATCTGCATTCA+GGG + Chr6:73359222-73359241 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
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TTTGCAATTTATCTGCATTC+AGG + Chr6:73359221-73359240 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
! AAACTTGACTTGACCAATTA+TGG + Chr6:73355010-73355029 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
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! ACTTGGATCATGTTACTTAT+GGG + Chr6:73360232-73360251 MsG0680033779.01.T01:CDS 30.0%
! AGTAAGTTTGCTTCATTTCA+AGG - Chr6:73356607-73356626 None:intergenic 30.0%
! ATAAGGGTCAATTTTAAACC+CGG - Chr6:73357203-73357222 None:intergenic 30.0%
! ATCAATGGCTTGTGTAAAAT+AGG + Chr6:73352854-73352873 MsG0680033779.01.T01:CDS 30.0%
! ATCAATGGCTTGTGTAAAAT+GGG + Chr6:73352854-73352873 MsG0680033779.01.T01:CDS 30.0%
! ATCTGAAATGAGGAGTTATT+TGG + Chr6:73356329-73356348 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
! ATGAAAATGTTTGGCCTTTA+GGG + Chr6:73357131-73357150 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
! ATTGAGAACAAATCTAGAGT+GGG - Chr6:73359830-73359849 None:intergenic 30.0%
! ATTGCCACTTAACCATTATT+TGG - Chr6:73355587-73355606 None:intergenic 30.0%
! ATTGTACTTTTATGCTTAGG+TGG + Chr6:73358453-73358472 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
! CAAAATCCTGTGATTTTGAA+CGG + Chr6:73357254-73357273 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
! GGATTTTTCTTTTTCTATGG+TGG + Chr6:73360080-73360099 MsG0680033779.01.T01:CDS 30.0%
! GTATTAAAGGTAATGGTATC+CGG - Chr6:73360132-73360151 None:intergenic 30.0%
! GTTAAGCATTATTTCTCGAA+TGG + Chr6:73353321-73353340 MsG0680033779.01.T01:CDS 30.0%
! GTTGTTGTTAGACTTAACAA+GGG - Chr6:73352543-73352562 None:intergenic 30.0%
! TACATATGGTGATTTGTGAT+AGG + Chr6:73355304-73355323 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
! TATTAAAGGTAATGGTATCC+GGG - Chr6:73360131-73360150 None:intergenic 30.0%
! TCAAAATCACAGGATTTTGA+TGG - Chr6:73357253-73357272 None:intergenic 30.0%
! TCAAAGTACCATAACTAACT+TGG - Chr6:73352835-73352854 None:intergenic 30.0%
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! TGCTAAAAGTATAAACATCC+GGG - Chr6:73353144-73353163 None:intergenic 30.0%
! TTATCTAAAATGGAGGACAA+TGG + Chr6:73353741-73353760 MsG0680033779.01.T01:CDS 30.0%
! TTGTTGTTAACTATAGGAAG+AGG + Chr6:73354928-73354947 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
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! TTTAGGGTATTTATAGAACC+GGG + Chr6:73357147-73357166 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
!! AATCACAATTAGGGTATTGA+AGG - Chr6:73359667-73359686 None:intergenic 30.0%
!! AATGCTGTTTCTTCATTCTA+TGG + Chr6:73359865-73359884 MsG0680033779.01.T01:CDS 30.0%
!! ATAGGATTTTGCCTGTTTTT+GGG + Chr6:73357301-73357320 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
!! ATCACAATTAGGGTATTGAA+GGG - Chr6:73359666-73359685 None:intergenic 30.0%
!! ATGGGTTTGTTGTTAACTAT+AGG + Chr6:73354922-73354941 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
!! CATTCTATTTTCTAGCAAGT+AGG + Chr6:73356491-73356510 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
!! CTTTAGGGTATTTATAGAAC+CGG + Chr6:73357146-73357165 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
!! GATTAATGGACTTTGTAAAG+AGG + Chr6:73353692-73353711 MsG0680033779.01.T01:CDS 30.0%
!! GCTTGGTAATGATTGTATTT+GGG + Chr6:73357928-73357947 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
!! GTGAGGAAAAAGTATTTGAT+TGG + Chr6:73355126-73355145 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
!! GTTGTTGTTAGTCTTAACAA+TGG - Chr6:73359947-73359966 None:intergenic 30.0%
!! TATAGTTTGCTACATAGTGA+TGG + Chr6:73357516-73357535 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
!! TGCTTGGTAATGATTGTATT+TGG + Chr6:73357927-73357946 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
!! TTTTAATGAAGTAGTGCTGA+TGG + Chr6:73357462-73357481 MsG0680033779.01.T01:intron 30.0%
!!! AGGATTTTGATGGATTTTGA+AGG - Chr6:73357243-73357262 None:intergenic 30.0%
AAAGATAGTACTCGCTAGAA+GGG - Chr6:73356131-73356150 None:intergenic 35.0%
AAGTAGGTTCAATGCTATAG+TGG + Chr6:73356507-73356526 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
AAGTTTATCGATGGAATGTC+AGG - Chr6:73357965-73357984 None:intergenic 35.0%
AATGAATTGGAGAATGTGCT+TGG + Chr6:73354702-73354721 MsG0680033779.01.T01:CDS 35.0%
AATGTGTCACCACCAAAATA+AGG - Chr6:73354735-73354754 None:intergenic 35.0%
ACACTTCCTCAATAGTTGTA+CGG - Chr6:73357096-73357115 None:intergenic 35.0%
ACATATTTGGTTGAATGCCT+TGG - Chr6:73353551-73353570 None:intergenic 35.0%
ACCAACAAAGTCAACATTCA+GGG - Chr6:73359089-73359108 None:intergenic 35.0%
ACCTTCAATACACTTGTCAA+AGG + Chr6:73352734-73352753 MsG0680033779.01.T01:CDS 35.0%
ACTTATGGGACCTTAATCAA+TGG + Chr6:73360246-73360265 MsG0680033779.01.T01:CDS 35.0%
AGCACCAAATAATGGTTAAG+TGG + Chr6:73355580-73355599 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
AGGTTTGTGTCTTAATGGTA+AGG + Chr6:73360161-73360180 MsG0680033779.01.T01:CDS 35.0%
AGTGTGAAAAACCTATTGCT+TGG + Chr6:73354838-73354857 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
AGTTTGAGAGGATATATCTC+AGG + Chr6:73356387-73356406 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
ATAACCCATCTTTAGCATCT+TGG - Chr6:73360106-73360125 None:intergenic 35.0%
ATTAACAGAGTCTGCATTCA+GGG + Chr6:73359161-73359180 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
ATTGAGTCAATTTACGAACC+GGG + Chr6:73357182-73357201 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
CAATATCAGGCATAATTCTG+TGG - Chr6:73352607-73352626 None:intergenic 35.0%
CACTTGAACCAAGTTAGTTA+TGG + Chr6:73352824-73352843 MsG0680033779.01.T01:CDS 35.0%
CATTAATTGTCACTCTCACT+TGG + Chr6:73352643-73352662 MsG0680033779.01.T01:CDS 35.0%
CATTCGCTTCTATCCATAAT+TGG - Chr6:73355026-73355045 None:intergenic 35.0%
CGATATACGATAGTAAAGTC+AGG + Chr6:73356897-73356916 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
CGGTTCTATAAATACCCTAA+AGG - Chr6:73357148-73357167 None:intergenic 35.0%
GAAAGACGACAATCACAATT+AGG - Chr6:73359677-73359696 None:intergenic 35.0%
GAATACTCATTTCCCATTCA+GGG - Chr6:73359029-73359048 None:intergenic 35.0%
GACTTTGTTGGTCAATTTCA+GGG + Chr6:73359097-73359116 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
GATTTCGAAACAGAAATTGG+TGG + Chr6:73355944-73355963 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
GCATATTATGTGAGTTTGAG+AGG + Chr6:73356375-73356394 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
GGGATTAAAGTATGAGTACA+AGG + Chr6:73354386-73354405 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
GGTACTTTACTTAAGTCGAA+GGG + Chr6:73356803-73356822 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
GGTCAATTGAAAAAAGCCTT+TGG + Chr6:73353085-73353104 MsG0680033779.01.T01:CDS 35.0%
GTACTTTACTTAAGTCGAAG+GGG + Chr6:73356804-73356823 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
GTGTGAAAAACCTATTGCTT+GGG + Chr6:73354839-73354858 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
GTTTCATAAGTTACGGCATT+AGG - Chr6:73353774-73353793 None:intergenic 35.0%
TAAAGATAGTACTCGCTAGA+AGG - Chr6:73356132-73356151 None:intergenic 35.0%
TAATTCTGTGGAATTGCAGA+TGG - Chr6:73352595-73352614 None:intergenic 35.0%
TATGAACTTAAGGTGGATGT+GGG + Chr6:73354148-73354167 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
TCAAAGGCTGGATTATTCAA+TGG + Chr6:73353977-73353996 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
TCATAGTTGATTGACAACCT+TGG - Chr6:73354238-73354257 None:intergenic 35.0%
TCTCATCAATTGGAACTCAA+CGG + Chr6:73359994-73360013 MsG0680033779.01.T01:CDS 35.0%
TCTGATATGACACAGACATA+TGG + Chr6:73355386-73355405 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
TCTGTGATTGTCTTTGACAA+TGG + Chr6:73354356-73354375 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
TCTTTGACAATGGCAGAAAA+GGG + Chr6:73354366-73354385 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
TGAAATCCGTTCAAAATCAC+AGG - Chr6:73357263-73357282 None:intergenic 35.0%
TGAATACTCATTTCCCATTC+AGG - Chr6:73359030-73359049 None:intergenic 35.0%
TGACTTAAGTCTCAAAATCC+TGG - Chr6:73357374-73357393 None:intergenic 35.0%
TGACTTTGTTGGTCAATTTC+AGG + Chr6:73359096-73359115 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
TGAGTTCCAATTGATGAGAA+AGG - Chr6:73359993-73360012 None:intergenic 35.0%
TGTTTCCAAATCTGTTGATG+AGG + Chr6:73354887-73354906 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
TTAATTGTCACTCTCACTTG+GGG + Chr6:73352645-73352664 MsG0680033779.01.T01:CDS 35.0%
TTATGAACTTAAGGTGGATG+TGG + Chr6:73354147-73354166 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
TTCAAGGTAACAATACAGAC+AGG - Chr6:73356591-73356610 None:intergenic 35.0%
TTGATTGAAGGAAAGGATGA+TGG + Chr6:73357005-73357024 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
TTGCAATTTCTCTGCATTCA+TGG - Chr6:73359060-73359079 None:intergenic 35.0%
TTGCAGATCAAGCAACTATT+AGG + Chr6:73356204-73356223 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
TTGTGGTTATGAACTTAAGG+TGG + Chr6:73354141-73354160 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
TTTATGCAGTGTGTGTATGA+TGG + Chr6:73357777-73357796 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
TTTCTCCTCATCAACAGATT+TGG - Chr6:73354895-73354914 None:intergenic 35.0%
! AGAAATTGGTGGCTGTTATT+TGG + Chr6:73355955-73355974 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
! AGTCACTTTAGTCACTGAAT+AGG - Chr6:73359267-73359286 None:intergenic 35.0%
! ATAGCTGTGATGATGATAGA+AGG + Chr6:73353217-73353236 MsG0680033779.01.T01:CDS 35.0%
! ATGAGAAAGGTATATAGCAG+TGG - Chr6:73359980-73359999 None:intergenic 35.0%
! ATGGTTTGAGGTGAAATTGT+TGG + Chr6:73357535-73357554 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
! ATTGGTTGATGCTCTATGTA+AGG + Chr6:73353165-73353184 MsG0680033779.01.T01:CDS 35.0%
! CAATGGCTTGTGTAAAATAG+GGG + Chr6:73360263-73360282 MsG0680033779.01.T01:CDS 35.0%
! CACTTGGATCATGTTACTTA+TGG + Chr6:73360231-73360250 MsG0680033779.01.T01:CDS 35.0%
! GATAGGATTTTGCCTGTTTT+TGG + Chr6:73357300-73357319 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
! GATCAATGGCTTGTGTAAAA+TGG + Chr6:73352853-73352872 MsG0680033779.01.T01:CDS 35.0%
! GCAAATAAGGAGTTGATTGA+AGG + Chr6:73354675-73354694 MsG0680033779.01.T01:CDS 35.0%
! GGTTGTTGTTAGACTTAACA+AGG - Chr6:73352544-73352563 None:intergenic 35.0%
! GTCCTCCATTTTAGATAACA+AGG - Chr6:73353739-73353758 None:intergenic 35.0%
! TACAACTATTGAGGAAGTGT+GGG + Chr6:73357096-73357115 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
! TGAGAAAGGTATATAGCAGT+GGG - Chr6:73359979-73359998 None:intergenic 35.0%
! TTGGTTGATGCTCTATGTAA+GGG + Chr6:73353166-73353185 MsG0680033779.01.T01:CDS 35.0%
!! AATTCAATGATGGATGGAGA+AGG - Chr6:73359907-73359926 None:intergenic 35.0%
!! AGAGGCCTTGTTATCTAAAA+TGG + Chr6:73353731-73353750 MsG0680033779.01.T01:CDS 35.0%
!! AGTTTCTGAGATCTGAAATG+AGG + Chr6:73356319-73356338 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
!! ATAAAGAGCATTACCTTCCA+TGG - Chr6:73355652-73355671 None:intergenic 35.0%
!! ATTGATGGACTATGCAAAAG+AGG + Chr6:73353588-73353607 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
!! CAAACGTTATTTTCCAAACG+CGG - Chr6:73356187-73356206 None:intergenic 35.0%
!! GGTTCATTTGCAAAAGCATT+TGG - Chr6:73354434-73354453 None:intergenic 35.0%
!! TCACAATTAGGGTATTGAAG+GGG - Chr6:73359665-73359684 None:intergenic 35.0%
!!! ACTTTTAATTAGGGGGTGTT+TGG + Chr6:73359462-73359481 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
!!! AGTACCGATTTTGATAACCT+TGG - Chr6:73356789-73356808 None:intergenic 35.0%
!!! ATTTTGGTGGTGACACATTT+GGG + Chr6:73354736-73354755 MsG0680033779.01.T01:CDS 35.0%
!!! TATTTTGGTGGTGACACATT+TGG + Chr6:73354735-73354754 MsG0680033779.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTTGATTTTGGGATTGACCA+TGG + Chr6:73355632-73355651 MsG0680033779.01.T01:intron 35.0%
AAGCAACTATTAGGAGAGTC+TGG + Chr6:73356213-73356232 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
AATCACAGAGCTGAGAGAAT+TGG - Chr6:73354345-73354364 None:intergenic 40.0%
AATTCAACAATGGATGGGGT+AGG - Chr6:73352503-73352522 None:intergenic 40.0%
ACAATCCCGTACAACTATTG+AGG + Chr6:73357087-73357106 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
AGAAAGCTCAAGCCATGTTT+CGG + Chr6:73354577-73354596 MsG0680033779.01.T01:CDS 40.0%
AGCAACTATTAGGAGAGTCT+GGG + Chr6:73356214-73356233 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
AGCTTTCTGATAAGGATCTG+AGG - Chr6:73354565-73354584 None:intergenic 40.0%
AGTGAACACTTTGATGAGTG+AGG + Chr6:73355109-73355128 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
ATGCAACTTCAAAGTTGAGG+AGG + Chr6:73354815-73354834 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
ATGGCTTGAGCTTTCTGATA+AGG - Chr6:73354573-73354592 None:intergenic 40.0%
CAAAAATCGTCACGTTGACA+AGG + Chr6:73353498-73353517 MsG0680033779.01.T01:CDS 40.0%
CAATGACGCAGGTATGTATA+GGG + Chr6:73358059-73358078 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
CACTTCCTCAATAGTTGTAC+GGG - Chr6:73357095-73357114 None:intergenic 40.0%
CATAGCAAAGTCCCAAAAAC+AGG - Chr6:73357315-73357334 None:intergenic 40.0%
CATCTCATGGAACAAACCAA+AGG - Chr6:73353104-73353123 None:intergenic 40.0%
CGGTACTTTACTTAAGTCGA+AGG + Chr6:73356802-73356821 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
CTATAGGAAGAGGTTTGAGT+TGG + Chr6:73354938-73354957 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
CTCAATTTGAATCCATGACC+CGG - Chr6:73357168-73357187 None:intergenic 40.0%
GAAACCTGAACATTTGACAG+TGG - Chr6:73359750-73359769 None:intergenic 40.0%
GAAATCCTAGTGCAATCACA+TGG - Chr6:73352805-73352824 None:intergenic 40.0%
GAATTGAAAGTGACAACGGT+AGG - Chr6:73353040-73353059 None:intergenic 40.0%
GACCAACAAAGTCAACATTC+AGG - Chr6:73359090-73359109 None:intergenic 40.0%
GATCCAGCACTCAATCAAAT+GGG + Chr6:73356417-73356436 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
GATTAACAGAGTCTGCATTC+AGG + Chr6:73359160-73359179 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
GATTTCGTCAACAAGAAGGT+TGG + Chr6:73354603-73354622 MsG0680033779.01.T01:CDS 40.0%
GCCTTTGACAAGTGTATTGA+AGG - Chr6:73352738-73352757 None:intergenic 40.0%
GCTTTCTGATAAGGATCTGA+GGG - Chr6:73354564-73354583 None:intergenic 40.0%
GTACAACTATTGAGGAAGTG+TGG + Chr6:73357095-73357114 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
GTATTTATAGAACCGGGTCA+TGG + Chr6:73357153-73357172 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
GTCTTTGACAATGGCAGAAA+AGG + Chr6:73354365-73354384 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
GTGGCAAAAAAGTGGGATAT+TGG - Chr6:73359526-73359545 None:intergenic 40.0%
GTGTCTTAACGGTAAAGTCA+AGG + Chr6:73352760-73352779 MsG0680033779.01.T01:CDS 40.0%
GTGTCTTAATGGTAAGGTCA+AGG + Chr6:73360167-73360186 MsG0680033779.01.T01:CDS 40.0%
TAATTGTCACTCTCACTTGG+GGG + Chr6:73352646-73352665 MsG0680033779.01.T01:CDS 40.0%
TACATGTTCTCTTTCCTGCA+TGG + Chr6:73355530-73355549 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
TCAATGACGCAGGTATGTAT+AGG + Chr6:73358058-73358077 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
TCAGGGACTAAAGTGACTAA+TGG + Chr6:73359114-73359133 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
TCTCATCAAGGATAGATTGC+AGG - Chr6:73355896-73355915 None:intergenic 40.0%
TGATCCAGCACTCAATCAAA+TGG + Chr6:73356416-73356435 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
TGATGGCAGACAATGAAGAT+CGG + Chr6:73357479-73357498 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
TGCTACATAGTGATGGTTTG+AGG + Chr6:73357523-73357542 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
TTACTGCCATCTTGGTGAAA+TGG + Chr6:73360059-73360078 MsG0680033779.01.T01:CDS 40.0%
TTGAACAAATTGTCCGCGTT+TGG + Chr6:73356171-73356190 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
TTGAGCATCCATGTTTGTGT+CGG + Chr6:73355474-73355493 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
TTTAACTATGGTCCAAACGG+TGG - Chr6:73359545-73359564 None:intergenic 40.0%
! AATCTCACTTGACTTGACCA+AGG + Chr6:73354218-73354237 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
! ACAACTATTGAGGAAGTGTG+GGG + Chr6:73357097-73357116 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
! ACAAGAGAGGAGCACATATT+AGG + Chr6:73355870-73355889 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
! ACGCGGACAATTTGTTCAAA+AGG - Chr6:73356170-73356189 None:intergenic 40.0%
! AGTCACTTTACTCCCTGAAT+GGG + Chr6:73359014-73359033 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
! ATCTGTTGATGAGGAGAAAG+AGG + Chr6:73354896-73354915 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
! ATGAGGAGAAAGAGGTGTAT+GGG + Chr6:73354904-73354923 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
! GAGAAAGGTATATAGCAGTG+GGG - Chr6:73359978-73359997 None:intergenic 40.0%
! GTATTGTGTCTAGAGTCATG+TGG + Chr6:73357832-73357851 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
! GTCAAAGGCATGTGTCTTAA+CGG + Chr6:73352749-73352768 MsG0680033779.01.T01:CDS 40.0%
! TAGTCACTTTACTCCCTGAA+TGG + Chr6:73359013-73359032 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
! TGATACTATGATGGTGCCAA+TGG + Chr6:73354054-73354073 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
!! AACAAGAAGGTTGGTGATGT+TGG + Chr6:73354612-73354631 MsG0680033779.01.T01:CDS 40.0%
!! AAGGATGATGGATTGAAGGA+AGG + Chr6:73357017-73357036 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
!! AGGAAAGGATGATGGATTGA+AGG + Chr6:73357013-73357032 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
!! CGACTTTGTGCGATTTTGAT+AGG + Chr6:73357283-73357302 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
!! GGCCTTGTTATCTAAAATGG+AGG + Chr6:73353734-73353753 MsG0680033779.01.T01:CDS 40.0%
!! TCCCTGAATGTTGACTTTGT+TGG + Chr6:73359085-73359104 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
!!! ATTTTGGGATTGACCATGGA+AGG + Chr6:73355636-73355655 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
!!! CTGTTTTTGGGACTTTGCTA+TGG + Chr6:73357313-73357332 MsG0680033779.01.T01:intron 40.0%
!!! CTTGGAGACAAGCCTTATTT+TGG + Chr6:73354720-73354739 MsG0680033779.01.T01:CDS 40.0%
AACATTTGACAGTGGAGAGG+AGG - Chr6:73359742-73359761 None:intergenic 45.0%
AACGGAGCTTGAAGAAGAAG+TGG - Chr6:73359713-73359732 None:intergenic 45.0%
ACATTTGACAGTGGAGAGGA+GGG - Chr6:73359741-73359760 None:intergenic 45.0%
ACGGAGCTTGAAGAAGAAGT+GGG - Chr6:73359712-73359731 None:intergenic 45.0%
ATGGCAGACAATGAAGATCG+GGG + Chr6:73357481-73357500 MsG0680033779.01.T01:intron 45.0%
CAAGACCATGTGATTGCACT+AGG + Chr6:73352797-73352816 MsG0680033779.01.T01:CDS 45.0%
CAATGGGAATGAATCCATGC+AGG - Chr6:73355547-73355566 None:intergenic 45.0%
CATCTCTTTGCCCAAGCAAT+AGG - Chr6:73354852-73354871 None:intergenic 45.0%
CATCTTTATGAAAGGGAGCG+CGG - Chr6:73353803-73353822 None:intergenic 45.0%
CCAAACGGTGGCAAAAAAGT+GGG - Chr6:73359533-73359552 None:intergenic 45.0%
CCTCATTCTTTGGACAAGAG+AGG + Chr6:73355857-73355876 MsG0680033779.01.T01:intron 45.0%
CCTCTCTTGTCCAAAGAATG+AGG - Chr6:73355860-73355879 None:intergenic 45.0%
CGATGGAATGTCAGGTCAAA+TGG - Chr6:73357957-73357976 None:intergenic 45.0%
CTCTCCACTGTCAAATGTTC+AGG + Chr6:73359743-73359762 MsG0680033779.01.T01:intron 45.0%
CTGAACATTTGACAGTGGAG+AGG - Chr6:73359745-73359764 None:intergenic 45.0%
CTTCGTGAAATGATCGCTAG+AGG + Chr6:73353846-73353865 MsG0680033779.01.T01:CDS 45.0%
GAAAGCTCAAGCCATGTTTC+GGG + Chr6:73354578-73354597 MsG0680033779.01.T01:CDS 45.0%
GAAATCCAAGTGCAAGCACA+TGG - Chr6:73360212-73360231 None:intergenic 45.0%
GAAATTGGTCAAGACCGATG+TGG + Chr6:73360325-73360344 MsG0680033779.01.T01:CDS 45.0%
GAGTCATGTGGTGATAACTG+AGG + Chr6:73357844-73357863 MsG0680033779.01.T01:intron 45.0%
GATGGCAGACAATGAAGATC+GGG + Chr6:73357480-73357499 MsG0680033779.01.T01:intron 45.0%
GCAGTTGAGATCTGACTTTG+TGG + Chr6:73354124-73354143 MsG0680033779.01.T01:intron 45.0%
GCTTGCACTTGGATTTCACT+TGG + Chr6:73360215-73360234 MsG0680033779.01.T01:CDS 45.0%
GGTATATAGCAGTGGGGTAA+TGG - Chr6:73359972-73359991 None:intergenic 45.0%
GTGGCCAAGATGCTAAAGAT+GGG + Chr6:73360099-73360118 MsG0680033779.01.T01:CDS 45.0%
GTTGATGCTCTATGTAAGGG+AGG + Chr6:73353169-73353188 MsG0680033779.01.T01:CDS 45.0%
GTTGGACTGAGAAGTCACTT+TGG + Chr6:73354956-73354975 MsG0680033779.01.T01:intron 45.0%
TACGCAAAGTCGCAAAAACC+AGG + Chr6:73357353-73357372 MsG0680033779.01.T01:intron 45.0%
TAGCCCATTTGATTGAGTGC+TGG - Chr6:73356423-73356442 None:intergenic 45.0%
TCCAAACGGTGGCAAAAAAG+TGG - Chr6:73359534-73359553 None:intergenic 45.0%
TCGAAGGGGAGTAGCAAAAT+CGG + Chr6:73356818-73356837 MsG0680033779.01.T01:intron 45.0%
TGATGTTGGAGGGAGGATAT+GGG + Chr6:73354626-73354645 MsG0680033779.01.T01:CDS 45.0%
! CAACTATTGAGGAAGTGTGG+GGG + Chr6:73357098-73357117 MsG0680033779.01.T01:intron 45.0%
! GATGAGGAGAAAGAGGTGTA+TGG + Chr6:73354903-73354922 MsG0680033779.01.T01:intron 45.0%
! GGCTGATTTCGTCAACAAGA+AGG + Chr6:73354599-73354618 MsG0680033779.01.T01:CDS 45.0%
! TGAGGTGTGTTTGAGAGTGT+TGG + Chr6:73357862-73357881 MsG0680033779.01.T01:intron 45.0%
! TTGTGTCGGTGCTTTGCTAA+GGG + Chr6:73355488-73355507 MsG0680033779.01.T01:intron 45.0%
! TTTGTGTCGGTGCTTTGCTA+AGG + Chr6:73355487-73355506 MsG0680033779.01.T01:intron 45.0%
!! AAGAAGGTTGGTGATGTTGG+AGG + Chr6:73354615-73354634 MsG0680033779.01.T01:CDS 45.0%
!! AGAAGGTTGGTGATGTTGGA+GGG + Chr6:73354616-73354635 MsG0680033779.01.T01:CDS 45.0%
!! GATGATGGATTGAAGGAAGG+AGG + Chr6:73357020-73357039 MsG0680033779.01.T01:intron 45.0%
!! GCTAAAGATGGGTTATCACC+CGG + Chr6:73360110-73360129 MsG0680033779.01.T01:CDS 45.0%
!! GTTTGAGAGTGTTGGAGTTG+TGG + Chr6:73357870-73357889 MsG0680033779.01.T01:intron 45.0%
!!! GGAGACAAGCCTTATTTTGG+TGG + Chr6:73354723-73354742 MsG0680033779.01.T01:CDS 45.0%
!! GTTTATTAAAAAAAAAAAAT+TGG + Chr6:73358253-73358272 MsG0680033779.01.T01:intron 5.0%
ACTCGCTAGAAGGGAAGCTA+TGG - Chr6:73356122-73356141 None:intergenic 50.0%
CATTTGACAGTGGAGAGGAG+GGG - Chr6:73359740-73359759 None:intergenic 50.0%
CGAAGGGGAGTAGCAAAATC+GGG + Chr6:73356819-73356838 MsG0680033779.01.T01:intron 50.0%
CTCGCTAGAAGGGAAGCTAT+GGG - Chr6:73356121-73356140 None:intergenic 50.0%
CTTTGACAGCTCAATGACGC+AGG + Chr6:73358048-73358067 MsG0680033779.01.T01:intron 50.0%
GACGAAATCAGCCCGAAACA+TGG - Chr6:73354592-73354611 None:intergenic 50.0%
GGTGGCCAAGATGCTAAAGA+TGG + Chr6:73360098-73360117 MsG0680033779.01.T01:CDS 50.0%
GTGATGTTGGAGGGAGGATA+TGG + Chr6:73354625-73354644 MsG0680033779.01.T01:CDS 50.0%
GTGGAGAGGAGGGGAAAAAA+CGG - Chr6:73359731-73359750 None:intergenic 50.0%
TGCTTTGCTAAGGGACTGCA+AGG + Chr6:73355497-73355516 MsG0680033779.01.T01:intron 50.0%
TGGCAGACAATGAAGATCGG+GGG + Chr6:73357482-73357501 MsG0680033779.01.T01:intron 50.0%
! GGGCTTGTTTGATGAAGCAG+AGG + Chr6:73353713-73353732 MsG0680033779.01.T01:CDS 50.0%
!! GCAAAGCACCGACACAAACA+TGG - Chr6:73355485-73355504 None:intergenic 50.0%
!!! CCCACTTTTTTGCCACCGTT+TGG + Chr6:73359530-73359549 MsG0680033779.01.T01:intron 50.0%
CACGACCATGTGCTTGCACT+TGG + Chr6:73360204-73360223 MsG0680033779.01.T01:CDS 55.0%
CAGACAATGAAGATCGGGGG+AGG + Chr6:73357485-73357504 MsG0680033779.01.T01:intron 55.0%
GTGGGTTCTGTAGTTGCCCT+TGG + Chr6:73354166-73354185 MsG0680033779.01.T01:intron 55.0%
!! AGGTTGGTGATGTTGGAGGG+AGG + Chr6:73354619-73354638 MsG0680033779.01.T01:CDS 55.0%
GTTGGAGGGAGGATATGGGC+TGG + Chr6:73354630-73354649 MsG0680033779.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 73352485 73360350 73352485 ID=MsG0680033779.01;Name=MsG0680033779.01
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Chr6 exon 73359813 73360350 73359813 ID=MsG0680033779.01.T01:exon:3777;Parent=MsG0680033779.01.T01
Chr6 CDS 73352485 73353527 73352485 ID=MsG0680033779.01.T01:cds;Parent=MsG0680033779.01.T01
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Chr6 CDS 73359813 73360350 73359813 ID=MsG0680033779.01.T01:cds;Parent=MsG0680033779.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680033779.01.T01

ATGCTTCGGATGAATCCTACCCCATCCATTGTTGAATTTAACAACATTTTAGGTTCCCTTGTTAAGTCTAACAACAACCATTATCTCACTGTTATTTCACTTTCTCACCATCTGCAATTCCACAGAATTATGCCTGATATTGCTACTTTCAACATTGTCATTAATTGTCACTCTCACTTGGGGGAAATGAATTTTGCTTTTTCCATATTTGCTAAGATTCTCAAATTAGGTCATCACTCCACAACTTTAACCTTCAATACACTTGTCAAAGGCATGTGTCTTAACGGTAAAGTCAAGGAAGCTCTACATTTTCAAGACCATGTGATTGCACTAGGATTTCACTTGAACCAAGTTAGTTATGGTACTTTGATCAATGGCTTGTGTAAAATGGGAAAAACAACTGAAGCCTTACAAGTGTTAAGACAAATTGAAGGGAAATTGGTCAACCCTGATATAGTAATGTATAGCACAATCATTGATGGTTTGTGTAAAGATAAACTTGTAAATGATGCCTATGTGTTATATTCTGAAATGATTACAAAGAGAATTTCTCCTACCGTTGTCACTTTCAATTCTCTAATCTATGGATTTTGCATTATTGGTCAATTGAAAAAAGCCTTTGGTTTGTTCCATGAGATGATATTGAAAAATAACAACCCGGATGTTTATACTTTTAGCATATTGGTTGATGCTCTATGTAAGGGAGGAAAGATGAAAAAAGCTAAAAGTGTGATAGCTGTGATGATGATAGAAGGTGTGATACCAAATGTTGTTACCTACAATTCATTAATGGATGGATATTGCCTAGTTAATGAAGTGTATAAGGCCAAACATGTGTTAAGCATTATTTCTCGAATGGGAATGACTCCTAATGTTTATAGCTATAGTATCATGATTAATGGATTCTGTAAGATTAAAATGGTTAATCAAGCCATGAGTCTCTTTAATGAAATGCACTGCATAGGAATTGCTTTTAATATGGTAACTTACAATTCTCTAATTGATGGTTTATGCAAAAATCGTCACGTTGACAAGGCTATTGCAGGACGACTAAAGAATGCACAAGATGTTTTCCAGAATCTTTTGATTAAGGGTTATAATCTAAATATCCGAACGTATACTATTATGATTAATGGACTTTGTAAAGAGGGCTTGTTTGATGAAGCAGAGGCCTTGTTATCTAAAATGGAGGACAATGGTATCATTCCTAATGCCGTAACTTATGAAACTATTATCCGCGCTCCCTTTCATAAAGATGAGAATGAAAAGGCGGAAAAATTTCTTCGTGAAATGATCGCTAGAGATCCTTATCAGAAAGCTCAAGCCATGTTTCGGGCTGATTTCGTCAACAAGAAGGTTGGTGATGTTGGAGGGAGGATATGGGCTGGAAAGAGAGATGAGATTGAATTGGCAAATAAGGAGTTGATTGAAGGATTAAATGAATTGGAGAATGTGCTTGGAGACAAGCCTTATTTTGGTGGTGACACATTTGGAAGAAAATTACACTCCCACTCTAGATTTGTTCTCAATACTGTTGATGTTGACAATGCTGTTTCTTCATTCTATGGCATGCTTCGTATGAATCCTTCTCCATCCATCATTGAATTTAACAAAATTTTAGGTTCCATTGTTAAGACTAACAACAACAACCATTACCCCACTGCTATATACCTTTCTCATCAATTGGAACTCAACGGAATTACGTCTGATATTGTTACTTTCAACACTGTCATTAATTGTTACTGCCATCTTGGTGAAATGGATTTTTCTTTTTCTATGGTGGCCAAGATGCTAAAGATGGGTTATCACCCGGATACCATTACCTTTAATACTCTTATCAAAGGTTTGTGTCTTAATGGTAAGGTCAAGGAAGCTTTACACTTTCACGACCATGTGCTTGCACTTGGATTTCACTTGGATCATGTTACTTATGGGACCTTAATCAATGGCTTGTGTAAAATAGGGGAAACAAGAGCTGCCTTGCAAATGTTGAGAAAGATTGATGGAAATTGGTCAAGACCGATGTGGTAA
Protein sequence

>MsG0680033779.01.T01

MLRMNPTPSIVEFNNILGSLVKSNNNHYLTVISLSHHLQFHRIMPDIATFNIVINCHSHLGEMNFAFSIFAKILKLGHHSTTLTFNTLVKGMCLNGKVKEALHFQDHVIALGFHLNQVSYGTLINGLCKMGKTTEALQVLRQIEGKLVNPDIVMYSTIIDGLCKDKLVNDAYVLYSEMITKRISPTVVTFNSLIYGFCIIGQLKKAFGLFHEMILKNNNPDVYTFSILVDALCKGGKMKKAKSVIAVMMIEGVIPNVVTYNSLMDGYCLVNEVYKAKHVLSIISRMGMTPNVYSYSIMINGFCKIKMVNQAMSLFNEMHCIGIAFNMVTYNSLIDGLCKNRHVDKAIAGRLKNAQDVFQNLLIKGYNLNIRTYTIMINGLCKEGLFDEAEALLSKMEDNGIIPNAVTYETIIRAPFHKDENEKAEKFLREMIARDPYQKAQAMFRADFVNKKVGDVGGRIWAGKRDEIELANKELIEGLNELENVLGDKPYFGGDTFGRKLHSHSRFVLNTVDVDNAVSSFYGMLRMNPSPSIIEFNKILGSIVKTNNNNHYPTAIYLSHQLELNGITSDIVTFNTVINCYCHLGEMDFSFSMVAKMLKMGYHPDTITFNTLIKGLCLNGKVKEALHFHDHVLALGFHLDHVTYGTLINGLCKIGETRAALQMLRKIDGNWSRPMW*