AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680032793.01

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MsG0680032793.01.T01 AT1G09900 28.959 442 287 4 8 449 135 549 5.15e-68 228
MsG0680032793.01.T01 AT1G09900 30.607 428 264 3 23 450 86 480 3.95e-67 225
MsG0680032793.01.T01 AT1G09900 30.992 242 154 2 1 242 335 563 4.51e-34 135
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MsG0680032793.01.T01 AT5G11310 21.944 319 220 5 8 323 248 540 2.18e-19 91.3
MsG0680032793.01.T01 AT5G11310 22.260 292 205 2 45 336 248 517 1.82e-18 88.6
MsG0680032793.01.T01 AT3G49240 22.646 446 313 9 8 444 128 550 4.34e-34 135
MsG0680032793.01.T01 AT5G25630 23.503 451 305 8 8 453 78 493 1.08e-33 134
MsG0680032793.01.T01 AT5G25630 24.103 195 140 3 263 453 64 254 7.42e-17 83.6
MsG0680032793.01.T01 AT5G08310 26.862 376 241 4 80 449 437 784 1.79e-33 134
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MsG0680032793.01.T01 AT1G10270 27.600 250 168 4 179 425 161 400 1.35e-19 92.4
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MsG0680032793.01.T01 AT1G02420 24.789 355 236 8 100 450 90 417 1.19e-22 100
MsG0680032793.01.T01 AT1G02420 25.402 311 206 4 115 425 178 462 8.28e-22 98.2
MsG0680032793.01.T01 AT1G02420 24.731 186 129 1 43 228 242 416 7.88e-14 73.9
MsG0680032793.01.T01 AT1G56570 24.235 425 265 10 31 445 64 441 1.50e-22 100
MsG0680032793.01.T01 AT1G56570 24.235 425 265 10 31 445 64 441 1.50e-22 100
MsG0680032793.01.T01 AT2G27800 30.328 244 144 7 166 396 210 440 1.53e-22 100
MsG0680032793.01.T01 AT2G27800 25.311 241 154 6 13 241 210 436 3.46e-16 80.9
MsG0680032793.01.T01 AT2G27800 24.352 193 134 3 270 453 239 428 1.84e-12 69.3
MsG0680032793.01.T01 AT1G80550 23.691 363 232 8 13 347 84 429 2.26e-22 99.8
MsG0680032793.01.T01 AT1G80550 21.320 394 252 7 93 450 56 427 4.22e-22 99.0
MsG0680032793.01.T01 AT1G80550 23.451 226 157 2 7 232 221 430 2.71e-16 81.3
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MsG0680032793.01.T01 AT1G06143 23.631 347 196 8 155 446 83 415 2.64e-14 75.5
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MsG0680032793.01.T01 AT2G44880 21.640 439 285 11 51 446 46 468 1.22e-19 92.0
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MsG0680032793.01.T01 AT2G44880 21.640 439 285 11 51 446 87 509 1.91e-19 91.7
MsG0680032793.01.T01 AT4G21170 21.461 438 297 13 1 426 179 581 2.32e-19 91.3
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MsG0680032793.01.T01 AT4G33990 21.591 352 238 9 10 358 313 629 5.03e-11 65.5
MsG0680032793.01.T01 AT4G33990 20.297 404 278 7 46 445 208 571 2.67e-19 91.3
MsG0680032793.01.T01 AT4G33990 21.591 352 238 9 10 358 306 622 4.71e-11 65.5
MsG0680032793.01.T01 AT2G20540 23.467 375 232 11 31 378 61 407 3.00e-19 90.9
MsG0680032793.01.T01 AT4G14820 21.719 442 298 10 8 445 74 471 3.81e-19 90.9
MsG0680032793.01.T01 AT4G18750 22.047 381 260 8 50 428 163 508 4.03e-19 90.9
MsG0680032793.01.T01 AT4G18750 20.954 482 308 10 13 442 163 623 1.06e-17 86.7
MsG0680032793.01.T01 AT4G18750 20.403 397 269 10 47 418 362 736 4.56e-12 68.9
MsG0680032793.01.T01 AT3G53170 24.290 317 217 5 142 447 158 462 4.42e-19 89.7
MsG0680032793.01.T01 AT3G53170 27.374 179 121 3 250 426 122 293 8.16e-13 70.5
MsG0680032793.01.T01 AT3G53170 23.048 269 178 5 45 305 213 460 1.12e-11 67.0
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MsG0680032793.01.T01 AT1G74630 20.264 454 284 14 31 445 69 483 2.42e-14 75.9
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MsG0680032793.01.T01 AT1G05750 21.229 358 244 7 25 378 49 372 1.91e-13 72.8
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MsG0680032793.01.T07 AT3G22470 34.419 215 141 0 346 560 100 314 8.56e-37 145
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MsG0680032793.01.T07 AT1G63080 27.412 456 329 1 46 501 147 600 5.59e-68 231
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MsG0680032793.01.T07 AT1G31840 27.579 504 287 7 131 557 206 708 8.09e-56 201
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MsG0680032793.01.T07 AT1G30290 23.773 387 293 2 172 556 203 589 1.34e-39 154
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MsG0680032793.01.T07 AT5G57250 27.853 517 342 8 48 553 361 857 2.05e-54 199
MsG0680032793.01.T07 AT5G57250 28.311 438 303 5 67 501 132 561 1.04e-52 194
MsG0680032793.01.T07 AT5G57250 32.203 295 192 4 244 535 132 421 7.13e-40 155
MsG0680032793.01.T07 AT5G57250 27.438 441 262 8 57 447 470 902 7.44e-39 152
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MsG0680032793.01.T07 AT1G53330 30.857 175 120 1 384 557 46 220 6.28e-20 92.0
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MsG0680032793.01.T07 AT1G71060 27.273 187 134 2 370 555 111 296 1.41e-13 73.9
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MsG0680032793.01.T07 AT1G18900 27.891 294 211 1 265 557 347 640 1.45e-32 133
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MsG0680032793.01.T07 AT5G27270 19.424 417 335 1 133 549 180 595 1.14e-21 100
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MsG0680032793.01.T07 AT5G37570 22.172 442 266 15 65 442 70 497 4.60e-16 81.6
MsG0680032793.01.T07 AT5G37570 25.610 328 206 11 243 558 71 372 5.56e-15 78.2
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MsG0680032793.01.T03 AT5G65560 27.843 255 183 1 2 256 465 718 3.60e-31 122
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MsG0680032793.01.T03 AT3G48810 22.826 276 171 3 1 276 113 346 1.90e-20 91.3
MsG0680032793.01.T03 AT3G48810 22.321 224 132 4 71 276 78 277 1.12e-11 65.5
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MsG0680032793.01.T03 AT3G54980 28.571 308 182 5 1 272 270 575 4.87e-23 99.0
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MsG0680032793.01.T03 AT2G41720 23.105 277 175 3 2 276 251 491 2.21e-22 97.1
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MsG0680032793.01.T03 AT4G18840 23.214 280 182 8 5 271 172 431 6.38e-11 62.8
MsG0680032793.01.T03 AT4G18840 22.267 247 153 5 22 254 92 313 1.08e-12 68.2
MsG0680032793.01.T03 AT4G18840 23.214 280 182 8 5 271 172 431 6.38e-11 62.8
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MsG0680032793.01.T04 AT1G62590 28.992 238 164 2 8 245 398 630 3.58e-23 103
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MsG0680032793.01.T04 AT2G35130 22.829 403 296 3 75 473 170 561 1.25e-34 137
MsG0680032793.01.T04 AT2G35130 26.774 310 212 4 170 474 158 457 1.29e-29 122
MsG0680032793.01.T04 AT2G35130 20.057 349 266 4 16 364 257 592 4.70e-19 90.5
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MsG0680032793.01.T04 AT5G65820 25.770 357 252 3 120 475 150 494 6.49e-33 132
MsG0680032793.01.T04 AT5G65820 23.896 385 268 6 8 385 216 582 2.94e-24 106
MsG0680032793.01.T04 AT5G25630 23.261 417 303 4 66 477 13 417 2.87e-36 140
MsG0680032793.01.T04 AT5G25630 23.557 433 312 6 8 435 27 445 4.69e-36 140
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MsG0680032793.01.T04 AT5G62370 25.000 456 301 5 31 456 256 700 8.82e-35 139
MsG0680032793.01.T04 AT5G62370 22.844 429 319 2 45 473 545 961 1.55e-33 135
MsG0680032793.01.T04 AT5G62370 25.000 412 269 6 8 406 580 964 2.28e-31 128
MsG0680032793.01.T04 AT5G62370 24.384 365 256 7 95 453 73 423 2.96e-20 94.7
MsG0680032793.01.T04 AT5G25630 23.261 417 303 4 66 477 64 468 3.96e-36 141
MsG0680032793.01.T04 AT5G25630 23.557 433 312 6 8 435 78 496 7.65e-36 140
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MsG0680032793.01.T04 AT3G18110 25.779 353 241 6 127 473 201 538 3.03e-29 122
MsG0680032793.01.T04 AT3G18110 22.470 494 349 8 8 473 295 782 1.80e-28 120
MsG0680032793.01.T04 AT3G18110 23.851 348 253 4 128 474 727 1063 5.77e-26 112
MsG0680032793.01.T04 AT3G18110 19.759 415 322 2 25 439 765 1168 1.21e-20 96.3
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MsG0680032793.01.T04 AT1G18900 25.625 320 192 3 155 474 367 640 5.26e-26 112
MsG0680032793.01.T04 AT1G18900 22.195 401 297 5 46 444 363 750 7.05e-21 96.7
MsG0680032793.01.T04 AT5G14820 22.525 404 298 5 53 456 166 554 1.36e-30 125
MsG0680032793.01.T04 AT5G14820 24.540 326 229 4 151 474 193 503 3.58e-25 109
MsG0680032793.01.T04 AT5G14820 22.253 364 270 4 111 474 188 538 5.22e-25 108
MsG0680032793.01.T04 AT5G14820 22.308 260 200 1 2 261 289 546 2.99e-20 94.4
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MsG0680032793.01.T04 AT2G37310 23.851 457 309 11 46 476 197 640 6.66e-25 108
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MsG0680032793.01.T04 AT1G79490 24.055 291 203 4 187 474 209 484 7.74e-16 80.9
MsG0680032793.01.T04 AT1G79490 23.022 278 205 3 199 475 181 450 8.13e-15 77.8
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MsG0680032793.01.T04 AT4G16390 23.653 334 206 6 5 302 170 490 1.12e-19 92.8
MsG0680032793.01.T04 AT4G16390 22.093 344 221 2 135 442 158 490 2.08e-17 85.5
MsG0680032793.01.T04 AT4G16390 23.311 296 215 2 180 474 168 452 8.51e-17 84.0
MsG0680032793.01.T04 AT4G16390 20.543 258 192 3 214 469 165 411 1.31e-16 83.2
MsG0680032793.01.T04 AT1G06143 22.128 470 311 14 7 458 40 472 4.54e-24 105
MsG0680032793.01.T04 AT1G06143 23.876 356 205 11 151 470 90 415 9.45e-15 77.0
MsG0680032793.01.T04 AT1G02420 24.925 333 232 5 117 449 148 462 7.68e-24 104
MsG0680032793.01.T04 AT1G02420 24.688 320 210 6 164 474 120 417 3.26e-22 99.8
MsG0680032793.01.T04 AT1G02420 23.396 265 186 4 12 276 123 370 2.82e-18 87.8
MsG0680032793.01.T04 AT1G02420 23.750 240 177 3 13 252 183 416 6.41e-13 71.2
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MsG0680032793.01.T04 AT1G56570 24.153 443 267 12 31 469 64 441 1.27e-22 101
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MsG0680032793.01.T04 AT2G44880 22.197 446 298 12 51 470 87 509 2.39e-21 97.8
MsG0680032793.01.T04 AT2G44880 22.197 446 298 12 51 470 86 508 2.41e-21 97.8
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MsG0680032793.01.T04 AT2G21090 21.366 454 301 13 8 450 80 488 3.76e-21 97.1
MsG0680032793.01.T04 AT2G21090 22.782 417 279 11 61 470 25 405 4.40e-17 84.3
MsG0680032793.01.T04 AT2G21090 19.948 381 276 9 6 385 140 492 1.30e-15 79.7
MsG0680032793.01.T04 AT5G19020 22.388 402 280 10 6 403 235 608 4.52e-21 97.1
MsG0680032793.01.T04 AT5G19020 19.444 504 333 11 6 469 134 604 2.78e-15 79.0
MsG0680032793.01.T04 AT1G20230 20.690 435 310 6 32 442 202 625 6.19e-21 96.7
MsG0680032793.01.T04 AT1G20230 19.648 341 243 5 160 474 49 384 9.45e-11 64.7
MsG0680032793.01.T04 AT5G59200 22.759 435 298 12 8 439 90 489 6.28e-21 96.3
MsG0680032793.01.T04 AT5G59200 22.508 311 205 6 168 458 77 371 5.76e-12 68.2
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MsG0680032793.01.T04 AT5G08490 23.789 454 268 14 31 458 282 683 1.30e-15 80.1
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MsG0680032793.01.T02 AT1G62680 28.438 320 221 2 42 354 73 391 8.57e-43 156
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MsG0680032793.01.T02 AT3G22470 23.565 331 246 1 35 358 50 380 4.14e-36 138
MsG0680032793.01.T02 AT1G63070 36.074 377 215 2 1 360 161 528 1.65e-74 241
MsG0680032793.01.T02 AT1G63070 25.753 365 261 3 4 359 59 422 6.68e-41 152
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MsG0680032793.01.T02 AT1G63070 27.240 279 189 4 2 267 302 579 3.82e-30 121
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MsG0680032793.01.T02 AT5G39710 31.169 231 156 2 130 359 148 376 1.62e-32 129
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MsG0680032793.01.T02 AT2G31400 28.756 386 235 8 5 354 320 701 9.03e-39 147
MsG0680032793.01.T02 AT2G31400 29.474 190 133 1 171 359 286 475 3.85e-22 98.6
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MsG0680032793.01.T02 AT2G02150 29.097 299 184 1 61 359 233 503 6.18e-40 150
MsG0680032793.01.T02 AT2G02150 27.778 360 231 2 1 359 383 714 9.09e-40 150
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MsG0680032793.01.T02 AT4G31850 27.907 344 238 4 1 334 765 1108 2.23e-37 143
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MsG0680032793.01.T02 AT4G31850 26.087 345 248 1 22 359 120 464 1.92e-35 138
MsG0680032793.01.T02 AT4G31850 27.966 354 244 5 17 359 710 1063 2.71e-32 128
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MsG0680032793.01.T02 AT5G40400 24.650 357 259 4 4 351 256 611 5.17e-31 124
MsG0680032793.01.T02 AT5G40400 26.222 225 159 1 124 341 236 460 1.37e-28 117
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MsG0680032793.01.T02 AT5G24830 26.769 325 227 2 24 337 125 449 2.19e-34 134
MsG0680032793.01.T02 AT5G24830 29.310 290 194 2 19 299 264 551 1.84e-33 131
MsG0680032793.01.T02 AT5G24830 28.148 270 180 4 92 348 123 391 2.17e-31 125
MsG0680032793.01.T02 AT5G24830 27.556 225 156 1 1 218 316 540 3.08e-24 104
MsG0680032793.01.T02 AT5G57250 26.361 349 244 3 14 354 165 508 4.95e-39 148
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MsG0680032793.01.T02 AT1G52640 28.054 221 148 4 143 354 156 374 1.93e-20 92.8
MsG0680032793.01.T02 AT1G52640 23.000 200 154 0 159 358 144 343 6.10e-13 70.5
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MsG0680032793.01.T02 AT5G27270 23.301 309 229 2 4 305 518 825 1.14e-18 88.2
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MsG0680032793.01.T02 AT5G08310 22.857 280 200 5 23 288 71 348 5.67e-11 64.7
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MsG0680032793.01.T02 AT3G62540 24.042 287 186 4 12 296 290 546 2.35e-21 95.9
MsG0680032793.01.T02 AT3G62540 22.112 303 207 3 57 359 231 504 7.77e-21 94.4
MsG0680032793.01.T02 AT5G14820 23.242 327 242 3 22 341 230 554 1.36e-26 111
MsG0680032793.01.T02 AT5G14820 23.585 318 234 3 49 359 188 503 8.70e-22 97.1
MsG0680032793.01.T02 AT5G14820 24.042 287 186 4 12 296 289 545 2.31e-21 95.9
MsG0680032793.01.T02 AT4G20740 24.351 308 220 5 17 316 295 597 1.59e-26 111
MsG0680032793.01.T02 AT4G20740 22.581 372 224 4 5 341 213 555 5.60e-26 109
MsG0680032793.01.T02 AT4G20740 21.186 354 234 2 6 359 126 434 1.43e-20 93.6
MsG0680032793.01.T02 AT4G20740 20.386 363 245 4 17 335 330 692 5.16e-19 89.0
MsG0680032793.01.T02 AT4G20740 25.926 189 140 0 172 360 177 365 1.23e-16 82.0
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MsG0680032793.01.T02 AT3G59040 19.608 357 264 4 18 359 102 450 7.50e-20 91.3
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MsG0680032793.01.T02 AT3G17370 23.265 245 145 4 86 330 10 211 1.03e-15 75.5
MsG0680032793.01.T02 AT3G17370 29.530 149 92 3 4 152 33 168 1.44e-15 75.1
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MsG0680032793.01.T02 AT2G42920 23.864 352 236 10 17 354 123 456 2.30e-21 95.9
MsG0680032793.01.T02 AT2G42920 20.681 382 246 10 22 361 26 392 8.71e-14 72.8
MsG0680032793.01.T02 AT1G80880 25.564 266 187 4 96 354 195 456 2.58e-21 95.5
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MsG0680032793.01.T02 AT1G80880 25.564 266 187 4 96 354 195 456 2.58e-21 95.5
MsG0680032793.01.T02 AT1G80550 22.252 373 245 6 31 359 56 427 4.73e-21 94.4
MsG0680032793.01.T02 AT1G80550 24.670 227 164 3 34 256 206 429 3.13e-20 92.0
MsG0680032793.01.T02 AT1G80550 23.721 215 154 2 15 222 219 430 2.46e-17 83.6
MsG0680032793.01.T02 AT5G61370 26.016 246 168 3 54 285 172 417 4.90e-21 94.7
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MsG0680032793.01.T02 AT3G60040 32.283 127 86 0 167 293 704 830 1.30e-15 79.0
MsG0680032793.01.T02 AT3G60040 31.034 116 80 0 4 119 709 824 9.96e-11 63.9
MsG0680032793.01.T02 AT3G25210 24.632 272 184 6 49 301 102 371 6.22e-18 84.7
MsG0680032793.01.T02 AT3G25210 26.351 148 109 0 210 357 210 357 9.04e-14 72.4
MsG0680032793.01.T02 AT3G25210 25.949 158 114 2 4 160 206 361 5.24e-11 63.9
MsG0680032793.01.T02 AT3G06430 21.148 331 251 4 22 342 90 420 8.02e-18 85.1
MsG0680032793.01.T02 AT3G06430 22.460 187 143 2 170 354 141 327 1.89e-12 68.6
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MsG0680032793.01.T02 AT5G37570 23.962 313 211 8 17 319 173 468 1.05e-14 75.9
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MsG0680032793.01.T02 AT5G03560 23.602 161 110 3 194 341 203 363 6.82e-12 66.6
MsG0680032793.01.T02 AT5G03560 28.571 133 94 1 229 360 203 335 1.23e-14 74.7
MsG0680032793.01.T02 AT5G03560 23.602 161 110 3 194 341 203 363 6.82e-12 66.6
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MsG0680032793.01.T02 AT3G13880 24.138 290 187 10 66 337 93 367 4.89e-11 64.7
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MsG0680032793.01.T02 AT1G06140 20.461 347 250 7 19 354 108 439 7.21e-11 63.9
MsG0680032793.01.T02 AT1G34160 22.517 302 201 10 71 359 78 359 2.22e-13 71.6
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MsG0680032793.01.T02 AT4G18840 21.368 234 163 6 113 337 92 313 4.35e-13 70.9
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MsG0680032793.01.T05 AT3G22470 28.836 378 229 3 57 399 233 605 2.74e-53 189
MsG0680032793.01.T05 AT3G22470 29.177 401 246 2 90 455 54 451 4.21e-50 180
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MsG0680032793.01.T05 AT1G12620 30.685 365 248 2 70 434 248 607 3.59e-56 197
MsG0680032793.01.T05 AT1G12620 32.616 279 185 1 177 455 73 348 5.70e-44 163
MsG0680032793.01.T05 AT1G12620 27.654 358 224 4 48 373 261 615 4.77e-42 158
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MsG0680032793.01.T05 AT5G21222 24.543 383 281 6 51 430 371 748 1.02e-35 141
MsG0680032793.01.T05 AT5G21222 23.913 322 232 3 140 455 318 632 1.90e-28 119
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MsG0680032793.01.T05 AT1G74850 29.114 316 220 2 138 452 138 450 4.85e-35 139
MsG0680032793.01.T05 AT1G74850 26.829 205 145 3 256 458 115 316 4.85e-19 90.9
MsG0680032793.01.T05 AT1G53330 28.464 267 188 2 188 454 26 289 3.65e-35 134
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MsG0680032793.01.T05 AT3G60050 30.328 244 165 2 72 315 222 460 1.05e-27 115
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MsG0680032793.01.T05 AT3G60050 24.342 152 113 1 54 205 309 458 1.88e-12 69.7
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MsG0680032793.01.T05 AT1G10910 21.257 334 224 3 48 346 180 509 4.99e-18 87.4
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MsG0680032793.01.T05 AT3G59040 22.727 330 246 3 107 433 147 470 1.15e-23 104
MsG0680032793.01.T05 AT3G59040 23.050 282 208 3 177 455 182 457 1.26e-22 101
MsG0680032793.01.T05 AT3G59040 21.118 322 241 3 139 455 109 422 4.09e-22 99.8
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MsG0680032793.01.T05 AT1G04840 24.503 302 213 3 132 433 117 403 8.37e-21 95.9
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MsG0680032793.01.T05 AT2G33760 23.123 333 241 6 90 419 56 376 2.11e-20 94.4
MsG0680032793.01.T05 AT2G33760 21.450 331 209 7 156 450 21 336 9.41e-14 73.9
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MsG0680032793.01.T05 AT4G30825 21.895 306 234 3 109 414 213 513 3.57e-16 82.0
MsG0680032793.01.T05 AT4G30825 18.703 401 252 8 103 433 346 742 5.87e-14 74.7
MsG0680032793.01.T05 AT4G30825 19.598 398 274 7 72 432 213 601 3.52e-13 72.4
MsG0680032793.01.T05 AT1G03540 24.194 310 195 7 138 416 226 526 3.09e-20 94.0
MsG0680032793.01.T05 AT1G03540 20.728 357 263 7 100 455 122 459 4.35e-19 90.5
MsG0680032793.01.T05 AT1G71210 22.821 390 290 7 68 454 356 737 3.30e-20 94.4
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MsG0680032793.01.T05 AT3G60040 36.937 111 70 0 279 389 500 610 8.45e-17 83.6
MsG0680032793.01.T05 AT3G60040 36.066 122 75 1 194 315 488 606 3.84e-16 81.3
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MsG0680032793.01.T05 AT4G16835 22.704 392 237 12 48 439 75 400 1.96e-16 82.4
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MsG0680032793.01.T06 AT3G16710 27.564 156 113 0 95 250 63 218 3.12e-13 69.3
MsG0680032793.01.T06 AT3G22470 38.912 239 136 1 1 229 306 544 1.08e-51 177
MsG0680032793.01.T06 AT3G22470 37.308 260 153 1 1 250 271 530 9.54e-50 172
MsG0680032793.01.T06 AT3G22470 33.071 254 170 0 1 254 61 314 5.62e-43 154
MsG0680032793.01.T06 AT3G22470 33.984 256 159 1 1 246 201 456 1.46e-42 152
MsG0680032793.01.T06 AT3G22470 30.864 243 168 0 8 250 138 380 9.23e-41 148
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MsG0680032793.01.T06 AT5G39710 31.301 246 166 2 8 251 167 411 1.01e-39 146
MsG0680032793.01.T06 AT5G39710 30.000 240 167 1 13 251 137 376 4.03e-38 141
MsG0680032793.01.T06 AT5G39710 30.804 224 138 2 1 208 476 698 1.40e-31 123
MsG0680032793.01.T06 AT4G11690 34.263 251 165 0 1 251 267 517 1.19e-47 166
MsG0680032793.01.T06 AT4G11690 33.884 242 160 0 11 252 172 413 1.85e-43 154
MsG0680032793.01.T06 AT4G11690 32.353 238 161 0 12 249 208 445 1.99e-43 154
MsG0680032793.01.T06 AT4G11690 30.488 246 171 0 6 251 237 482 2.15e-40 146
MsG0680032793.01.T06 AT4G11690 32.751 229 154 0 1 229 302 530 1.50e-35 133
MsG0680032793.01.T06 AT4G11690 28.049 246 135 1 48 251 97 342 8.25e-28 111
MsG0680032793.01.T06 AT1G62914 33.068 251 168 0 1 251 209 459 1.69e-47 165
MsG0680032793.01.T06 AT1G62914 34.127 252 166 0 1 252 174 425 1.83e-44 157
MsG0680032793.01.T06 AT1G62914 38.191 199 123 0 1 199 314 512 3.80e-41 148
MsG0680032793.01.T06 AT1G62914 33.478 230 153 0 1 230 279 508 4.78e-40 145
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MsG0680032793.01.T06 AT1G64583 31.707 287 161 1 1 252 177 463 1.69e-45 159
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MsG0680032793.01.T06 AT1G64583 27.679 224 158 1 24 247 29 248 2.36e-25 104
MsG0680032793.01.T06 AT1G64583 26.115 157 116 0 95 251 61 217 2.39e-16 78.6
MsG0680032793.01.T06 AT1G64583 31.707 287 161 1 1 252 202 488 2.99e-45 159
MsG0680032793.01.T06 AT1G64583 35.586 222 143 0 8 229 139 360 1.35e-44 157
MsG0680032793.01.T06 AT1G64583 32.400 250 169 0 1 250 62 311 1.18e-40 146
MsG0680032793.01.T06 AT1G64583 32.114 246 167 0 6 251 102 347 1.75e-39 143
MsG0680032793.01.T06 AT1G64583 29.258 229 162 0 19 247 45 273 6.98e-31 120
MsG0680032793.01.T06 AT1G64583 25.789 190 141 0 62 251 53 242 4.34e-20 89.4
MsG0680032793.01.T06 AT1G64583 29.518 166 117 0 86 251 42 207 4.02e-15 74.7
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MsG0680032793.01.T06 AT1G13630 32.540 252 169 1 1 251 352 603 1.60e-37 140
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MsG0680032793.01.T06 AT2G16880 26.506 166 109 2 2 167 583 735 7.99e-13 68.2
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MsG0680032793.01.T06 AT2G32630 26.364 220 162 0 32 251 211 430 1.64e-25 105
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MsG0680032793.01.T06 AT4G31850 29.293 198 138 2 56 251 760 957 1.01e-19 88.6
MsG0680032793.01.T06 AT4G31850 27.273 231 167 1 1 230 73 303 1.62e-18 85.1
MsG0680032793.01.T06 AT4G31850 26.389 216 159 0 12 227 120 335 3.66e-18 84.3
MsG0680032793.01.T06 AT4G31850 23.502 217 165 1 35 250 72 288 1.15e-11 65.1
MsG0680032793.01.T06 AT2G39230 32.937 252 167 2 4 254 584 834 1.13e-38 143
MsG0680032793.01.T06 AT2G39230 27.931 290 173 1 1 254 475 764 2.44e-34 130
MsG0680032793.01.T06 AT2G39230 31.278 227 156 0 7 233 622 848 4.52e-31 121
MsG0680032793.01.T06 AT2G39230 30.000 240 167 1 14 252 453 692 1.91e-29 117
MsG0680032793.01.T06 AT2G39230 27.711 249 175 3 1 247 336 581 1.37e-25 105
MsG0680032793.01.T06 AT2G39230 25.000 256 182 4 1 251 265 515 3.73e-20 90.1
MsG0680032793.01.T06 AT2G39230 23.346 257 192 2 1 252 195 451 5.30e-20 89.4
MsG0680032793.01.T06 AT2G39230 20.183 218 173 1 12 228 171 388 7.28e-14 71.2
MsG0680032793.01.T06 AT2G15630 33.607 244 162 0 8 251 325 568 1.17e-38 142
MsG0680032793.01.T06 AT2G15630 33.333 231 154 0 4 234 391 621 7.78e-37 137
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MsG0680032793.01.T06 AT1G53330 29.437 231 162 1 1 230 74 304 2.16e-33 124
MsG0680032793.01.T06 AT1G53330 30.857 175 120 1 78 251 46 220 5.75e-22 93.6
MsG0680032793.01.T06 AT1G53330 26.712 146 105 2 1 145 215 359 5.04e-14 71.2
MsG0680032793.01.T06 AT1G07740 33.628 226 150 0 5 230 181 406 2.65e-36 134
MsG0680032793.01.T06 AT1G07740 28.992 238 169 0 13 250 119 356 1.10e-27 110
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MsG0680032793.01.T06 AT1G07740 26.407 231 135 2 55 250 56 286 6.22e-14 71.2
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MsG0680032793.01.T06 AT4G26680 28.745 247 176 0 5 251 233 479 1.69e-30 119
MsG0680032793.01.T06 AT4G26680 28.333 240 172 0 13 252 171 410 5.42e-27 109
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MsG0680032793.01.T06 AT4G26680 29.918 244 171 0 11 254 274 517 3.49e-36 134
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MsG0680032793.01.T06 AT2G26790 27.857 280 174 2 1 252 344 623 4.48e-31 121
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MsG0680032793.01.T06 AT5G08310 29.577 213 148 2 8 218 612 824 3.68e-22 95.9
MsG0680032793.01.T06 AT5G08310 33.793 145 96 0 32 176 601 745 8.48e-22 94.7
MsG0680032793.01.T06 AT5G08310 26.871 294 163 4 9 251 213 505 1.96e-20 90.9
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MsG0680032793.01.T06 AT5G08310 22.749 211 159 3 44 251 105 314 4.09e-11 63.2
MsG0680032793.01.T06 AT5G08310 28.700 223 159 0 8 230 472 694 2.07e-26 108
MsG0680032793.01.T06 AT5G08310 31.156 199 137 0 52 250 586 784 6.81e-26 106
MsG0680032793.01.T06 AT5G08310 29.577 213 150 0 39 251 433 645 2.38e-24 102
MsG0680032793.01.T06 AT5G08310 29.577 213 148 2 8 218 612 824 3.68e-22 95.9
MsG0680032793.01.T06 AT5G08310 33.793 145 96 0 32 176 601 745 8.48e-22 94.7
MsG0680032793.01.T06 AT5G08310 26.871 294 163 4 9 251 213 505 1.96e-20 90.9
MsG0680032793.01.T06 AT5G08310 29.730 148 104 0 1 148 640 787 5.33e-15 74.7
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MsG0680032793.01.T06 AT1G61870 26.339 224 161 2 8 227 111 334 8.15e-18 82.4
MsG0680032793.01.T06 AT1G61870 25.000 212 155 2 43 250 111 322 6.46e-17 79.7
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MsG0680032793.01.T06 AT4G34830 25.692 253 186 1 1 251 528 780 8.63e-21 92.0
MsG0680032793.01.T06 AT4G34830 26.577 222 157 3 3 221 602 820 4.89e-20 89.7
MsG0680032793.01.T06 AT3G25210 31.902 163 111 0 31 193 209 371 2.29e-23 97.8
MsG0680032793.01.T06 AT3G25210 29.747 158 111 0 1 158 214 371 1.08e-18 84.7
MsG0680032793.01.T06 AT3G25210 26.351 148 109 0 102 249 210 357 1.44e-14 72.8
MsG0680032793.01.T06 AT3G25210 21.596 213 158 2 28 231 162 374 7.61e-12 65.1
MsG0680032793.01.T06 AT1G10910 26.471 238 174 1 9 245 165 402 2.73e-23 99.0
MsG0680032793.01.T06 AT1G10910 30.882 204 138 2 6 207 197 399 6.32e-23 97.8
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MsG0680032793.01.T06 AT5G27270 25.381 197 134 3 4 191 247 439 3.82e-13 69.3
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MsG0680032793.01.T06 AT1G34160 23.361 244 175 6 9 251 127 359 3.87e-14 72.0
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MsG0680032793.01.T06 AT5G37570 25.926 243 162 7 1 242 101 326 8.98e-13 68.2
MsG0680032793.01.T06 AT5G37570 26.923 208 140 5 9 211 268 468 1.66e-12 67.0
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MsG0680032793.01.T06 AT1G31430 23.729 236 168 3 14 249 186 409 1.66e-12 67.4
MsG0680032793.01.T06 AT1G56690 28.962 183 110 5 12 194 50 212 2.05e-12 67.0
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MsG0680032793.01.T06 AT3G22150 24.028 283 172 7 9 254 485 761 2.86e-12 66.6
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MsG0680032793.01.T06 AT5G47460 22.381 210 150 4 8 216 119 316 8.49e-12 65.1
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MsG0680032793.01.T06 AT1G05750 30.061 163 106 5 10 169 272 429 3.63e-11 63.2
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MsG0680032793.01.T06 AT1G17630 22.951 244 176 3 14 253 333 568 2.53e-11 63.9
MsG0680032793.01.T06 AT1G17630 22.951 244 176 3 14 253 333 568 2.53e-11 63.9
MsG0680032793.01.T06 AT1G74600 22.907 227 157 7 9 229 616 830 2.57e-11 63.9
MsG0680032793.01.T06 AT1G19520 20.642 218 164 3 6 218 415 628 2.72e-11 63.5
MsG0680032793.01.T06 AT1G80150 28.105 153 109 1 9 160 140 292 2.96e-11 62.8
MsG0680032793.01.T06 AT1G80150 23.618 199 149 2 57 254 118 314 4.94e-11 62.4
MsG0680032793.01.T06 AT3G02010 22.768 224 161 4 8 228 145 359 3.33e-11 63.5
MsG0680032793.01.T06 AT3G58590 26.016 246 144 5 1 246 501 708 4.20e-11 63.2
MsG0680032793.01.T06 AT1G26900 23.695 249 175 8 5 247 219 458 4.30e-11 63.2
MsG0680032793.01.T06 AT4G21170 27.564 156 110 2 74 227 427 581 4.38e-11 63.2
MsG0680032793.01.T06 AT1G71490 22.768 224 156 5 12 229 348 560 4.70e-11 63.2
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MsG0680032793.01.T06 AT2G33680 21.162 241 182 2 11 251 352 584 4.86e-11 63.2
MsG0680032793.01.T06 AT2G33680 21.162 241 182 2 11 251 352 584 4.86e-11 63.2
MsG0680032793.01.T06 AT2G33680 21.162 241 182 2 11 251 352 584 4.86e-11 63.2
MsG0680032793.01.T06 AT5G13230 21.399 243 181 4 6 247 344 577 4.95e-11 63.2
MsG0680032793.01.T06 AT2G33680 21.162 241 182 2 11 251 363 595 4.97e-11 62.8
MsG0680032793.01.T06 AT2G33680 21.162 241 182 2 11 251 288 520 5.31e-11 62.8
MsG0680032793.01.T06 AT2G33680 21.162 241 182 2 11 251 288 520 5.31e-11 62.8
MsG0680032793.01.T06 AT2G33680 21.162 241 182 2 11 251 288 520 5.31e-11 62.8
MsG0680032793.01.T06 AT2G33680 21.162 241 182 2 11 251 343 575 5.89e-11 62.8
MsG0680032793.01.T06 AT3G22690 27.103 214 148 5 32 242 50 258 7.02e-11 62.4
MsG0680032793.01.T06 AT3G22690 27.103 214 148 5 32 242 50 258 7.70e-11 62.4
MsG0680032793.01.T06 AT3G22690 27.103 214 148 5 32 242 50 258 7.74e-11 62.4

Find 108 sgRNAs with CRISPR-Local

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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AATAATAAAATTGGAATTAA+TGG 0.183723 6:-49818872 None:intergenic
GATCAATGGTTTGTGTAAAA+TGG 0.209071 6:+49819362 MsG0680032793.01.T04:CDS
ACTTTCAATTCTCTAATATA+TGG 0.213341 6:+49819558 MsG0680032793.01.T04:CDS
TGAGTATCAATTGATTAAAA+AGG 0.214296 6:-49819092 None:intergenic
TAGGAAAGGAATAATAAAAT+TGG 0.225616 6:-49818881 None:intergenic
AGCTATAGTATCATGATTAA+TGG 0.282448 6:+49819873 MsG0680032793.01.T04:intron
ATATTAAAAGTATAAATATC+TGG 0.287759 6:-49819651 None:intergenic
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ATTGATGGTTTGTGCAAATC+TGG 0.293062 6:+49819993 MsG0680032793.01.T04:CDS
GGAATTGTAAGTGAATATAT+TGG 0.303373 6:-49820072 None:intergenic
GTTTCATAAGTTACAGCATT+AGG 0.305642 6:-49820386 None:intergenic
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GAACTGTAAGTTACCGTATT+AGG 0.327942 6:-49819966 None:intergenic
ATATTATACGTCCACATATC+TGG 0.335680 6:-49820176 None:intergenic
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AATAATGCTTAGAACATGTT+TGG 0.379396 6:-49819820 None:intergenic
GTGGACGTATAATATACTTA+TGG 0.394181 6:+49820184 MsG0680032793.01.T04:CDS
ATTAAAGGTATGTGTCTTAA+CGG 0.399446 6:+49819258 MsG0680032793.01.T04:CDS
TGGGAGATTCTCTTGTGCTT+GGG 0.399527 6:+49820013 MsG0680032793.01.T04:CDS
CCTTGTTGATTTCATTAACT+AGG 0.407437 6:-49819797 None:intergenic
TGGGTTCTGTAAGATTAAAA+TGG 0.410714 6:+49819893 MsG0680032793.01.T04:intron
ACTTACAGTTCGCTCATTGA+TGG 0.411369 6:+49819978 MsG0680032793.01.T04:CDS
ATGTATAGCACAATCATTGA+TGG 0.411767 6:+49819453 MsG0680032793.01.T04:CDS
GCTATAGTATCATGATTAAT+GGG 0.413254 6:+49819874 MsG0680032793.01.T04:intron
GGTCAATTGAAAGAAGCATT+TGG 0.418578 6:+49819594 MsG0680032793.01.T04:CDS
GTTAATAAAATCAAAGATCA+AGG 0.423933 6:+49820146 MsG0680032793.01.T04:CDS
AGTCTTTATGAAAGAGAGCC+TGG 0.429848 6:-49820415 None:intergenic
CTGGGAGATTCTCTTGTGCT+TGG 0.437274 6:+49820012 MsG0680032793.01.T04:CDS
ATCAATGGTTTGTGTAAAAT+GGG 0.441186 6:+49819363 MsG0680032793.01.T04:CDS
AATCTTGTTAAATTCAATGA+TGG 0.442748 6:-49819019 None:intergenic
ATTGGTTGATGCTCTTTGTA+AGG 0.444010 6:+49819674 MsG0680032793.01.T04:CDS
ATACTATAGCTATGAGCATC+AGG 0.444666 6:-49819861 None:intergenic
AAAAGGCAGAGAAACTTCTT+CGG 0.445637 6:+49820444 MsG0680032793.01.T04:CDS
ATGAACATCACCAACATGAT+TGG 0.448508 6:-49818947 None:intergenic
TATGTTGGCCAAGATTCTTA+AGG 0.449548 6:+49819197 MsG0680032793.01.T04:CDS
TCAAGGTCCCGTAGCTAACT+TGG 0.452204 6:-49819341 None:intergenic
AAACCCCACCTTAAGAATCT+TGG 0.453787 6:-49819205 None:intergenic
GAATTGTAGGTAACAACATT+CGG 0.455207 6:-49819756 None:intergenic
ACGTATACTATTATGATCAA+TGG 0.459999 6:+49820293 MsG0680032793.01.T04:CDS
GAATTGAAAGTGACAACATC+AGG 0.461532 6:-49819546 None:intergenic
GTGTTGAAAGTAACAATATC+AGG 0.462376 6:-49819126 None:intergenic
TTTACACAAACCATTGATCA+AGG 0.462731 6:-49819358 None:intergenic
CACGATCATGTGCTTGCACA+TGG 0.463469 6:+49819306 MsG0680032793.01.T04:CDS
CAGAGGAATTGCTCCTAATA+CGG 0.470704 6:+49819953 MsG0680032793.01.T04:CDS
GAATTGTAAGTGAATATATT+GGG 0.471233 6:-49820071 None:intergenic
TCATAAAGACTTGAATGAAA+AGG 0.472801 6:+49820427 MsG0680032793.01.T04:CDS
AAAGGCAGAGAAACTTCTTC+GGG 0.474353 6:+49820445 MsG0680032793.01.T04:CDS
TATTAAAAGTATAAATATCT+GGG 0.475630 6:-49819650 None:intergenic
AATGGGTTTATTTGATGAAG+TGG 0.476715 6:+49820325 MsG0680032793.01.T04:CDS
TGATCATAATAGTATACGTT+CGG 0.484618 6:-49820289 None:intergenic
TCTTAAGGTGGGGTTTCAGC+CGG 0.486903 6:+49819212 MsG0680032793.01.T04:CDS
TGTGTCTTAACGGTAAGGTC+AGG 0.488101 6:+49819268 MsG0680032793.01.T04:CDS
GTTGATGAGATGCATCATAA+TGG 0.489519 6:+49820041 MsG0680032793.01.T04:CDS
CATTTCAGAATATAACTCAT+AGG 0.490638 6:-49819505 None:intergenic
GTTGATGCTCTTTGTAAGGA+AGG 0.498428 6:+49819678 MsG0680032793.01.T04:CDS
GTTGTGAGGGTTACAATATC+CGG 0.501611 6:-49819231 None:intergenic
TTATGGATGGACTATGCAAA+GGG 0.501921 6:+49820201 MsG0680032793.01.T04:CDS
CATTCCAATTCCAATCATGT+TGG 0.502492 6:+49818937 MsG0680032793.01.T07:CDS
AACTTATGAAACTATTATCC+AGG 0.502973 6:+49820397 MsG0680032793.01.T04:CDS
AGCTACGGGACCTTGATCAA+TGG 0.510563 6:+49819348 MsG0680032793.01.T04:CDS
AATCTTGGCCAACATAGAAA+AGG 0.511130 6:-49819190 None:intergenic
CAACATGATTGGAATTGGAA+TGG 0.515107 6:-49818936 None:intergenic
CACTTGGACCAAGTTAGCTA+CGG 0.515626 6:+49819333 MsG0680032793.01.T04:CDS
ACCTTTAATAAGTGTTGTGA+GGG 0.516554 6:-49819244 None:intergenic
CAAAACTCATTTCAGCAAGA+TGG 0.521488 6:-49819167 None:intergenic
GTTTGTTGCCAGACTTAACA+AGG 0.529045 6:-49819050 None:intergenic
TTGTTAAATTCAATGATGGA+TGG 0.538459 6:-49819015 None:intergenic
CAATAGCCTTGTCAATCTGA+TGG 0.538577 6:-49820118 None:intergenic
AGGTATGTGTCTTAACGGTA+AGG 0.541753 6:+49819263 MsG0680032793.01.T04:CDS
AAGGGATTCAACCAGATATG+TGG 0.551794 6:+49820165 MsG0680032793.01.T04:CDS
TACCTTTAATAAGTGTTGTG+AGG 0.552297 6:-49819245 None:intergenic
GAATTACGAAACCTGAAGAA+TGG 0.555851 6:-49818844 None:intergenic
ACTTGGACCAAGTTAGCTAC+GGG 0.556597 6:+49819334 MsG0680032793.01.T04:CDS
GTTGGCCAAGATTCTTAAGG+TGG 0.556750 6:+49819200 MsG0680032793.01.T04:CDS
ACCTACAATTCAATAATGGA+TGG 0.564781 6:+49819768 MsG0680032793.01.T04:CDS
TTGGCCAAGATTCTTAAGGT+GGG 0.565777 6:+49819201 MsG0680032793.01.T04:CDS
TGCTATACATTACTGCATTG+AGG 0.567015 6:-49819440 None:intergenic
CTTATGGATGGACTATGCAA+AGG 0.567303 6:+49820200 MsG0680032793.01.T04:CDS
ACGAAGCATGTGATTGAATG+AGG 0.569962 6:-49818980 None:intergenic
ACGTATAATATACTTATGGA+TGG 0.571641 6:+49820188 MsG0680032793.01.T04:CDS
AATTCAATGATGGATGGAGT+GGG 0.573078 6:-49819009 None:intergenic
TTAATAAAATCAAAGATCAA+GGG 0.573178 6:+49820147 MsG0680032793.01.T04:CDS
TTGATGGTTTGTGCAAATCT+GGG 0.578200 6:+49819994 MsG0680032793.01.T04:CDS
TTAGTCGTGATGATGAAAGA+AGG 0.579129 6:+49819726 MsG0680032793.01.T04:CDS
CGTAGCTAACTTGGTCCAAG+TGG 0.600712 6:-49819332 None:intergenic
GCTTGCACATGGATTCCACT+TGG 0.601418 6:+49819317 MsG0680032793.01.T04:CDS
GTGTCTTAACGGTAAGGTCA+GGG 0.602235 6:+49819269 MsG0680032793.01.T04:CDS
TGTAAGGAAGGAGATGTGAA+AGG 0.617358 6:+49819690 MsG0680032793.01.T04:CDS
TTTCATGAAATGCATTGCAG+AGG 0.617544 6:+49819936 MsG0680032793.01.T04:CDS
CATTATTTCTCGAATAGGAG+TGG 0.618095 6:+49819836 MsG0680032793.01.T04:intron
TGGCCAAGATTCTTAAGGTG+GGG 0.620464 6:+49819202 MsG0680032793.01.T04:CDS
AAGTGAATATATTGGGTGGT+TGG 0.624331 6:-49820064 None:intergenic
AAATTCAATGATGGATGGAG+TGG 0.625391 6:-49819010 None:intergenic
CTTCGGGAAATGATTGCTAG+AGG 0.627446 6:+49820461 MsG0680032793.01.T04:CDS
CATTTCATGAAAGAGACTCA+AGG 0.639978 6:-49819925 None:intergenic
CCTAGTTAATGAAATCAACA+AGG 0.649451 6:+49819797 MsG0680032793.01.T04:CDS
TTTGTTGCCAGACTTAACAA+GGG 0.673548 6:-49819049 None:intergenic
ATGGATGGACTATGCAAAGG+GGG 0.686643 6:+49820203 MsG0680032793.01.T04:CDS
TTGTAAGTGAATATATTGGG+TGG 0.694972 6:-49820068 None:intergenic
TATGGATGGACTATGCAAAG+GGG 0.738466 6:+49820202 MsG0680032793.01.T04:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AATAATAAAATTGGAATTAA+TGG - Chr6:49818875-49818894 None:intergenic 10.0%
!!! ATATTAAAAGTATAAATATC+TGG - Chr6:49819654-49819673 None:intergenic 10.0%
!!! TATTAAAAGTATAAATATCT+GGG - Chr6:49819653-49819672 None:intergenic 10.0%
!! TTAATAAAATCAAAGATCAA+GGG + Chr6:49820147-49820166 MsG0680032793.01.T04:CDS 15.0%
!!! ATTGAATTTAACAAGATTTT+AGG + Chr6:49819024-49819043 MsG0680032793.01.T04:CDS 15.0%
!! AATCTTGTTAAATTCAATGA+TGG - Chr6:49819022-49819041 None:intergenic 20.0%
!! ACTTTCAATTCTCTAATATA+TGG + Chr6:49819558-49819577 MsG0680032793.01.T04:CDS 20.0%
!! GAATTGTAAGTGAATATATT+GGG - Chr6:49820074-49820093 None:intergenic 20.0%
!! GAGTATCAATTGATTAAAAA+GGG - Chr6:49819094-49819113 None:intergenic 20.0%
!! GTTAATAAAATCAAAGATCA+AGG + Chr6:49820146-49820165 MsG0680032793.01.T04:CDS 20.0%
!! TAGGAAAGGAATAATAAAAT+TGG - Chr6:49818884-49818903 None:intergenic 20.0%
!! TGAGTATCAATTGATTAAAA+AGG - Chr6:49819095-49819114 None:intergenic 20.0%
!! TTTCAAGATCTTATGATTAA+GGG + Chr6:49820251-49820270 MsG0680032793.01.T04:CDS 20.0%
!!! TTTTCAAGATCTTATGATTA+AGG + Chr6:49820250-49820269 MsG0680032793.01.T04:CDS 20.0%
! AACTTATGAAACTATTATCC+AGG + Chr6:49820397-49820416 MsG0680032793.01.T04:CDS 25.0%
! AATAATGCTTAGAACATGTT+TGG - Chr6:49819823-49819842 None:intergenic 25.0%
! ACGTATAATATACTTATGGA+TGG + Chr6:49820188-49820207 MsG0680032793.01.T04:CDS 25.0%
! ACGTATACTATTATGATCAA+TGG + Chr6:49820293-49820312 MsG0680032793.01.T04:CDS 25.0%
! AGCTATAGTATCATGATTAA+TGG + Chr6:49819873-49819892 MsG0680032793.01.T04:intron 25.0%
! CATTTCAGAATATAACTCAT+AGG - Chr6:49819508-49819527 None:intergenic 25.0%
! GCTATAGTATCATGATTAAT+GGG + Chr6:49819874-49819893 MsG0680032793.01.T04:intron 25.0%
! GGAATTGTAAGTGAATATAT+TGG - Chr6:49820075-49820094 None:intergenic 25.0%
! TCATAAAGACTTGAATGAAA+AGG + Chr6:49820427-49820446 MsG0680032793.01.T04:CDS 25.0%
! TGATCATAATAGTATACGTT+CGG - Chr6:49820292-49820311 None:intergenic 25.0%
! TGTTACCTACAATTCAATAA+TGG + Chr6:49819764-49819783 MsG0680032793.01.T04:CDS 25.0%
! TTTGCATAAAGAGTCTATTA+AGG - Chr6:49820096-49820115 None:intergenic 25.0%
!! ATATATGGATTTTGCATTGT+TGG + Chr6:49819573-49819592 MsG0680032793.01.T04:CDS 25.0%
!! ATCAATGGACTTTGTAAAAT+GGG + Chr6:49820308-49820327 MsG0680032793.01.T04:CDS 25.0%
!! ATCAATGGTTTGTGTAAAAT+GGG + Chr6:49819363-49819382 MsG0680032793.01.T04:CDS 25.0%
!! ATTAAAGGTATGTGTCTTAA+CGG + Chr6:49819258-49819277 MsG0680032793.01.T04:CDS 25.0%
!! TTGTTAAATTCAATGATGGA+TGG - Chr6:49819018-49819037 None:intergenic 25.0%
!!! AGTAGTAAAGTGTTCTTTTT+AGG - Chr6:49818903-49818922 None:intergenic 25.0%
!!! TAAAGTGTTCTTTTTAGGAA+AGG - Chr6:49818898-49818917 None:intergenic 25.0%
!!! TGTTTTTCAATAGCATTTCA+TGG - Chr6:49819626-49819645 None:intergenic 25.0%
ATATTATACGTCCACATATC+TGG - Chr6:49820179-49820198 None:intergenic 30.0%
ATGTATAGCACAATCATTGA+TGG + Chr6:49819453-49819472 MsG0680032793.01.T04:CDS 30.0%
CCTAGTTAATGAAATCAACA+AGG + Chr6:49819797-49819816 MsG0680032793.01.T04:CDS 30.0%
GAATTGTAGGTAACAACATT+CGG - Chr6:49819759-49819778 None:intergenic 30.0%
GTGGACGTATAATATACTTA+TGG + Chr6:49820184-49820203 MsG0680032793.01.T04:CDS 30.0%
GTGTTGAAAGTAACAATATC+AGG - Chr6:49819129-49819148 None:intergenic 30.0%
GTTTCATAAGTTACAGCATT+AGG - Chr6:49820389-49820408 None:intergenic 30.0%
TAAAAAGGGAAATAGCAGTT+GGG - Chr6:49819080-49819099 None:intergenic 30.0%
TCCATCCATTATTGAATTGT+AGG - Chr6:49819772-49819791 None:intergenic 30.0%
TGGGTTCTGTAAGATTAAAA+TGG + Chr6:49819893-49819912 MsG0680032793.01.T04:intron 30.0%
TTAAAAAGGGAAATAGCAGT+TGG - Chr6:49819081-49819100 None:intergenic 30.0%
TTGTAAGTGAATATATTGGG+TGG - Chr6:49820071-49820090 None:intergenic 30.0%
TTTACACAAACCATTGATCA+AGG - Chr6:49819361-49819380 None:intergenic 30.0%
! AATGGGTTTATTTGATGAAG+TGG + Chr6:49820325-49820344 MsG0680032793.01.T04:CDS 30.0%
! ACCTACAATTCAATAATGGA+TGG + Chr6:49819768-49819787 MsG0680032793.01.T04:CDS 30.0%
! ACCTTTAATAAGTGTTGTGA+GGG - Chr6:49819247-49819266 None:intergenic 30.0%
! CTAAGCATTATTTCTCGAAT+AGG + Chr6:49819831-49819850 MsG0680032793.01.T04:CDS 30.0%
! GATCAATGGACTTTGTAAAA+TGG + Chr6:49820307-49820326 MsG0680032793.01.T04:CDS 30.0%
! GATCAATGGTTTGTGTAAAA+TGG + Chr6:49819362-49819381 MsG0680032793.01.T04:CDS 30.0%
! TACCTTTAATAAGTGTTGTG+AGG - Chr6:49819248-49819267 None:intergenic 30.0%
!! CCTTGTTGATTTCATTAACT+AGG - Chr6:49819800-49819819 None:intergenic 30.0%
AAAAGGCAGAGAAACTTCTT+CGG + Chr6:49820444-49820463 MsG0680032793.01.T04:CDS 35.0%
AAGTGAATATATTGGGTGGT+TGG - Chr6:49820067-49820086 None:intergenic 35.0%
AATCTTGGCCAACATAGAAA+AGG - Chr6:49819193-49819212 None:intergenic 35.0%
ACCCTCACAACACTTATTAA+AGG + Chr6:49819243-49819262 MsG0680032793.01.T04:CDS 35.0%
ATACTATAGCTATGAGCATC+AGG - Chr6:49819864-49819883 None:intergenic 35.0%
ATCACCAACATGATTGGAAT+TGG - Chr6:49818944-49818963 None:intergenic 35.0%
ATGAACATCACCAACATGAT+TGG - Chr6:49818950-49818969 None:intergenic 35.0%
CAAAAACCATCAGATTGACA+AGG + Chr6:49820112-49820131 MsG0680032793.01.T04:CDS 35.0%
CAAAACTCATTTCAGCAAGA+TGG - Chr6:49819170-49819189 None:intergenic 35.0%
CAACATGATTGGAATTGGAA+TGG - Chr6:49818939-49818958 None:intergenic 35.0%
CATTCCAATTCCAATCATGT+TGG + Chr6:49818937-49818956 MsG0680032793.01.T07:CDS 35.0%
CATTTCATGAAAGAGACTCA+AGG - Chr6:49819928-49819947 None:intergenic 35.0%
GAACTGTAAGTTACCGTATT+AGG - Chr6:49819969-49819988 None:intergenic 35.0%
GAATTACGAAACCTGAAGAA+TGG - Chr6:49818847-49818866 None:intergenic 35.0%
GAATTGAAAGTGACAACATC+AGG - Chr6:49819549-49819568 None:intergenic 35.0%
GAGACGAATTGAAAGCAAAT+TGG + Chr6:49819413-49819432 MsG0680032793.01.T04:CDS 35.0%
TATGTTGGCCAAGATTCTTA+AGG + Chr6:49819197-49819216 MsG0680032793.01.T04:CDS 35.0%
TGCTATACATTACTGCATTG+AGG - Chr6:49819443-49819462 None:intergenic 35.0%
TTGTCAAAAATGGAGGACAA+TGG + Chr6:49820356-49820375 MsG0680032793.01.T04:CDS 35.0%
TTTCATGAAATGCATTGCAG+AGG + Chr6:49819936-49819955 MsG0680032793.01.T04:CDS 35.0%
TTTGTTGCCAGACTTAACAA+GGG - Chr6:49819052-49819071 None:intergenic 35.0%
! ATTGATGGTTTGTGCAAATC+TGG + Chr6:49819993-49820012 MsG0680032793.01.T04:CDS 35.0%
! ATTGGTTGATGCTCTTTGTA+AGG + Chr6:49819674-49819693 MsG0680032793.01.T04:CDS 35.0%
! CATTATTTCTCGAATAGGAG+TGG + Chr6:49819836-49819855 MsG0680032793.01.T04:intron 35.0%
! GAGTTTTGCCTTTTCTATGT+TGG + Chr6:49819182-49819201 MsG0680032793.01.T04:CDS 35.0%
! GTTGATGAGATGCATCATAA+TGG + Chr6:49820041-49820060 MsG0680032793.01.T04:CDS 35.0%
! TTAGTCGTGATGATGAAAGA+AGG + Chr6:49819726-49819745 MsG0680032793.01.T04:CDS 35.0%
! TTGATGGTTTGTGCAAATCT+GGG + Chr6:49819994-49820013 MsG0680032793.01.T04:CDS 35.0%
!! AAATTCAATGATGGATGGAG+TGG - Chr6:49819013-49819032 None:intergenic 35.0%
!! AATTCAATGATGGATGGAGT+GGG - Chr6:49819012-49819031 None:intergenic 35.0%
!! GGTCAATTGAAAGAAGCATT+TGG + Chr6:49819594-49819613 MsG0680032793.01.T04:CDS 35.0%
!! TTATGGATGGACTATGCAAA+GGG + Chr6:49820201-49820220 MsG0680032793.01.T04:CDS 35.0%
!!! CTTTGTTTTCACCATTCTTC+AGG + Chr6:49818833-49818852 MsG0680032793.01.T07:CDS 35.0%
AAACCCCACCTTAAGAATCT+TGG - Chr6:49819208-49819227 None:intergenic 40.0%
AAAGGCAGAGAAACTTCTTC+GGG + Chr6:49820445-49820464 MsG0680032793.01.T04:CDS 40.0%
AAGGGATTCAACCAGATATG+TGG + Chr6:49820165-49820184 MsG0680032793.01.T04:CDS 40.0%
ACGAAGCATGTGATTGAATG+AGG - Chr6:49818983-49819002 None:intergenic 40.0%
ACTTACAGTTCGCTCATTGA+TGG + Chr6:49819978-49819997 MsG0680032793.01.T04:CDS 40.0%
AGGTATGTGTCTTAACGGTA+AGG + Chr6:49819263-49819282 MsG0680032793.01.T04:CDS 40.0%
AGTCTTTATGAAAGAGAGCC+TGG - Chr6:49820418-49820437 None:intergenic 40.0%
CAGAGGAATTGCTCCTAATA+CGG + Chr6:49819953-49819972 MsG0680032793.01.T04:CDS 40.0%
GTTGATGCTCTTTGTAAGGA+AGG + Chr6:49819678-49819697 MsG0680032793.01.T04:CDS 40.0%
GTTGTGAGGGTTACAATATC+CGG - Chr6:49819234-49819253 None:intergenic 40.0%
TGTAAGGAAGGAGATGTGAA+AGG + Chr6:49819690-49819709 MsG0680032793.01.T04:CDS 40.0%
TTAGGTTCCCTTGTTAAGTC+TGG + Chr6:49819042-49819061 MsG0680032793.01.T04:CDS 40.0%
TTGGCCAAGATTCTTAAGGT+GGG + Chr6:49819201-49819220 MsG0680032793.01.T04:CDS 40.0%
! GGATGCCTTGTTGTCAAAAA+TGG + Chr6:49820346-49820365 MsG0680032793.01.T04:CDS 40.0%
! GTTTGTTGCCAGACTTAACA+AGG - Chr6:49819053-49819072 None:intergenic 40.0%
! TGCCTTGTTGTCAAAAATGG+AGG + Chr6:49820349-49820368 MsG0680032793.01.T04:CDS 40.0%
!! CAATAGCCTTGTCAATCTGA+TGG - Chr6:49820121-49820140 None:intergenic 40.0%
!! CTTATGGATGGACTATGCAA+AGG + Chr6:49820200-49820219 MsG0680032793.01.T04:CDS 40.0%
!! GTCCTCCATTTTTGACAACA+AGG - Chr6:49820354-49820373 None:intergenic 40.0%
!! TATGGATGGACTATGCAAAG+GGG + Chr6:49820202-49820221 MsG0680032793.01.T04:CDS 40.0%
ACTTGGACCAAGTTAGCTAC+GGG + Chr6:49819334-49819353 MsG0680032793.01.T04:CDS 45.0%
CACTTGGACCAAGTTAGCTA+CGG + Chr6:49819333-49819352 MsG0680032793.01.T04:CDS 45.0%
CTTCGGGAAATGATTGCTAG+AGG + Chr6:49820461-49820480 MsG0680032793.01.T04:CDS 45.0%
GTGTCTTAACGGTAAGGTCA+GGG + Chr6:49819269-49819288 MsG0680032793.01.T04:CDS 45.0%
GTTGGCCAAGATTCTTAAGG+TGG + Chr6:49819200-49819219 MsG0680032793.01.T04:CDS 45.0%
TGGCCAAGATTCTTAAGGTG+GGG + Chr6:49819202-49819221 MsG0680032793.01.T04:CDS 45.0%
TGGGAGATTCTCTTGTGCTT+GGG + Chr6:49820013-49820032 MsG0680032793.01.T04:CDS 45.0%
TGTGTCTTAACGGTAAGGTC+AGG + Chr6:49819268-49819287 MsG0680032793.01.T04:CDS 45.0%
!! ATGGATGGACTATGCAAAGG+GGG + Chr6:49820203-49820222 MsG0680032793.01.T04:CDS 45.0%
!!! TATTTATACTTTTAATATAT+TGG + Chr6:49819656-49819675 MsG0680032793.01.T04:CDS 5.0%
AGCTACGGGACCTTGATCAA+TGG + Chr6:49819348-49819367 MsG0680032793.01.T04:CDS 50.0%
CACGATCATGTGCTTGCACA+TGG + Chr6:49819306-49819325 MsG0680032793.01.T04:CDS 50.0%
CGTAGCTAACTTGGTCCAAG+TGG - Chr6:49819335-49819354 None:intergenic 50.0%
CTGGGAGATTCTCTTGTGCT+TGG + Chr6:49820012-49820031 MsG0680032793.01.T04:CDS 50.0%
GCTTGCACATGGATTCCACT+TGG + Chr6:49819317-49819336 MsG0680032793.01.T04:CDS 50.0%
TCAAGGTCCCGTAGCTAACT+TGG - Chr6:49819344-49819363 None:intergenic 50.0%
TCTTAAGGTGGGGTTTCAGC+CGG + Chr6:49819212-49819231 MsG0680032793.01.T04:CDS 50.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 49818817 49820499 49818817 ID=MsG0680032793.01;Name=MsG0680032793.01
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