AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680033724.01

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MsG0680033724.01.T01 AT1G64583 35.484 155 99 1 41 195 54 207 2.47e-21 99.4
MsG0680033724.01.T01 AT1G64583 29.480 173 121 1 19 191 102 273 6.47e-21 97.8
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MsG0680033724.01.T01 AT5G65560 28.037 214 134 4 2 196 616 828 1.78e-15 81.6
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MsG0680033724.01.T01 AT2G17140 28.571 154 106 2 26 175 150 303 1.16e-16 85.5
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MsG0680033724.01.T01 AT2G17525 24.378 201 139 4 2 196 402 595 5.02e-11 67.0
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MsG0680033724.01.T01 AT1G11710 28.571 224 143 5 22 228 223 446 1.31e-15 81.6
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MsG0680033724.01.T01 AT5G16420 26.238 202 148 1 3 204 206 406 1.50e-17 87.4
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MsG0680033724.01.T01 AT2G35130 25.939 293 208 4 591 874 143 435 1.87e-28 122
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MsG0680033724.01.T01 AT1G73710 28.846 156 106 1 26 181 308 458 2.37e-12 71.6
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MsG0680033724.01.T01 AT3G53170 20.147 273 212 3 608 874 115 387 6.46e-12 69.3
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MsG0680033724.01.T01 AT3G46610 21.041 461 327 8 387 815 185 640 4.07e-23 105
MsG0680033724.01.T01 AT3G46610 21.149 383 267 7 524 874 180 559 2.30e-11 68.2
MsG0680033724.01.T01 AT1G11290 20.231 519 393 8 337 852 48 548 9.87e-23 104
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MsG0680033724.01.T01 AT1G11290 21.569 408 299 8 452 855 60 450 3.27e-14 77.4
MsG0680033724.01.T01 AT1G11290 23.256 387 241 13 374 729 302 663 4.23e-13 73.9
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MsG0680033724.01.T01 AT1G56570 21.108 379 250 10 532 874 46 411 1.23e-15 81.6
MsG0680033724.01.T01 AT5G27110 20.000 405 285 6 426 797 173 571 4.34e-21 99.4
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MsG0680033724.01.T01 AT3G02010 24.183 306 208 10 520 812 33 327 9.14e-12 69.7
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MsG0680033724.01.T01 AT1G16480 19.333 450 332 13 412 850 312 741 1.63e-13 75.5
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MsG0680033724.01.T01 AT1G17630 19.672 488 336 7 394 872 124 564 3.62e-17 87.0
MsG0680033724.01.T01 AT1G17630 20.968 372 274 7 367 729 237 597 2.17e-16 84.3
MsG0680033724.01.T01 AT1G34160 23.922 255 185 3 542 795 119 365 3.76e-17 86.3
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MsG0680033724.01.T01 AT2G33680 21.914 324 225 7 402 715 373 678 5.16e-12 70.5
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MsG0680033724.01.T01 AT3G48250 25.751 233 128 7 674 866 373 600 4.20e-11 67.0
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MsG0680033724.01.T01 AT3G49142 20.412 583 389 15 339 866 49 611 1.63e-16 84.7
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MsG0680033724.01.T01 AT2G33680 19.074 540 365 12 385 874 3 520 1.18e-16 85.1
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MsG0680033724.01.T01 AT2G33680 21.914 324 225 7 402 715 298 603 9.02e-12 69.3
MsG0680033724.01.T01 AT2G33680 19.074 540 365 12 385 874 3 520 1.18e-16 85.1
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MsG0680033724.01.T01 AT2G33680 21.914 324 225 7 402 715 298 603 9.02e-12 69.3
MsG0680033724.01.T01 AT3G58590 23.706 367 232 8 446 811 401 720 1.19e-16 85.1
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MsG0680033724.01.T01 AT3G58590 22.200 491 313 16 421 869 245 708 6.33e-11 66.6

Find 165 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 640 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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ATTTGGTTTGTTCCATAAAA+TGG 0.207077 6:-72299281 MsG0680033724.01.T01:CDS
AAACTAACCTGCTTGATTTC+AGG 0.208605 6:+72295489 None:intergenic
ACTTTCAATTCTCTAATATA+TGG 0.213341 6:-72299334 MsG0680033724.01.T01:CDS
ACTTTCAGTTCTCTAATCTA+TGG 0.232675 6:-72289728 MsG0680033724.01.T01:CDS
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TGTTACATACAATTCATTAA+TGG 0.244485 6:-72289522 MsG0680033724.01.T01:CDS
GATCGATGGCTTGTGTAAAA+TGG 0.257574 6:-72289924 MsG0680033724.01.T01:CDS
ATTGATAGTTTGTGCAAATC+TGG 0.265271 6:-72289302 MsG0680033724.01.T01:CDS
GAGACAAATTGAAGGGAAAT+TGG 0.268216 6:-72299479 MsG0680033724.01.T01:CDS
AATGCATTGTGAACCTAATA+TGG 0.282583 6:-72289342 MsG0680033724.01.T01:CDS
CCTAGTTAATGAAGTGAATA+AGG 0.285527 6:-72289489 MsG0680033724.01.T01:CDS
CACTTGAACCAAGTTACTTA+TGG 0.288028 6:-72289953 MsG0680033724.01.T01:CDS
TGGTTTATGTAGGATTAAAA+TGG 0.290326 6:-72289393 MsG0680033724.01.T01:CDS
CCTAGTTAATGAAGTGAATA+AGG 0.296320 6:-72299095 MsG0680033724.01.T01:CDS
TATTAAAAGTATAAACATTT+GGG 0.303352 6:+72289636 None:intergenic
GATCAATGGTCTTTGTTTAG+AGG 0.306712 6:-72288988 MsG0680033724.01.T01:CDS
TCAGGAGGAGCGGGGACTTT+GGG 0.309005 6:+72295507 None:intergenic
ATCAATTGTTACTGTCATCT+TGG 0.334460 6:-72290133 MsG0680033724.01.T01:CDS
TCTCCACCGCTCAAATGTTC+AGG 0.338717 6:-72290450 MsG0680033724.01.T01:CDS
ATATTAAAAGTATAAACATT+TGG 0.339247 6:+72289635 None:intergenic
TATTCAACATCATAGGAAAA+AGG 0.339426 6:-72289457 MsG0680033724.01.T01:CDS
ACTATCCCTATACAAGATTT+GGG 0.340396 6:+72294781 None:intergenic
TGTTACCTACACTTCAATAA+TGG 0.346383 6:-72299128 MsG0680033724.01.T01:CDS
TCCCGAGGAAAGGGAAGATT+TGG 0.349421 6:-72295532 MsG0680033724.01.T01:CDS
TTCAAATAGAGCGTGAATAA+TGG 0.350326 6:+72288887 None:intergenic
TGCAGAAAGTTCTGCAGATA+TGG 0.352509 6:-72295690 MsG0680033724.01.T01:intron
CAATTGCCTTGTCAACTTGA+TGG 0.353343 6:+72289177 None:intergenic
ATGTTATAGCTCTGAGCATT+AGG 0.355064 6:+72299031 None:intergenic
GTATTATATGTGTGCATATC+TGG 0.356431 6:+72289119 None:intergenic
AATCTTTCTCAACACTTGTA+AGG 0.360133 6:+72289886 None:intergenic
ATTTCGTTTGTTCCATGAAA+TGG 0.364276 6:-72289675 MsG0680033724.01.T01:CDS
GCAGAAGAAGCTTCTGCATC+TGG 0.367037 6:+72295597 None:intergenic
TTGTTAAATTCAATGATTGA+TGG 0.375277 6:+72290271 None:intergenic
TAGTTTGTGTAAAGAGAAAT+TGG 0.382685 6:-72289813 MsG0680033724.01.T01:CDS
GTATTCAAGGTGACGGTATT+CGG 0.385175 6:+72290055 None:intergenic
ACATATAATACACTTGTTGA+TGG 0.387447 6:-72289107 MsG0680033724.01.T01:CDS
CCTTATTCACTTCATTAACT+AGG 0.387761 6:+72299095 None:intergenic
ATTTGGCAATATTCTTAAGA+TGG 0.388481 6:-72290086 MsG0680033724.01.T01:CDS
ATCCAAATCTTCCCTTTCCT+CGG 0.397240 6:+72295530 None:intergenic
TGATCATAATATTATATGTC+CGG 0.398961 6:+72289006 None:intergenic
ATGTATAACACAATCATTGA+TGG 0.405411 6:-72299439 MsG0680033724.01.T01:CDS
GTCAAAGGTATGTGTCTTAA+CGG 0.405981 6:-72290028 MsG0680033724.01.T01:CDS
TTCAGGAGGAGCGGGGACTT+TGG 0.412108 6:+72295506 None:intergenic
AATAGTGCTTAAAACATGTT+TGG 0.414336 6:+72299072 None:intergenic
TCATTATTAATGGTTTATGT+AGG 0.418712 6:-72289403 MsG0680033724.01.T01:CDS
ACCTTTGACAAGTGTATTCA+AGG 0.419326 6:+72290042 None:intergenic
ACATAGAGCATCAACCAATA+TGG 0.419685 6:+72299222 None:intergenic
GGTCAATTGAAAGATGCATT+TGG 0.427379 6:-72299298 MsG0680033724.01.T01:CDS
TTTCAGCAATTAGTATTCAA+TGG 0.427388 6:-72290190 MsG0680033724.01.T01:CDS
CATTTCTTTAAAGAGATTCA+AGG 0.427876 6:+72289361 None:intergenic
CCTTATTCACTTCATTAACT+AGG 0.433141 6:+72289489 None:intergenic
TATTCACGCTCTATTTGAAA+AGG 0.437532 6:-72288883 MsG0680033724.01.T01:CDS
ATCAATGGTCTTTGTTTAGA+GGG 0.441288 6:-72288987 MsG0680033724.01.T01:CDS
ATTGGTTGATGCTCTTTGTA+AGG 0.444010 6:-72289612 MsG0680033724.01.T01:CDS
GGGATCATTGCCATCATCAT+TGG 0.446430 6:+72295551 None:intergenic
ATAGTGTAGCTGCGAACATT+AGG 0.446701 6:+72289425 None:intergenic
TTCCAAAATACACATCTTCA+AGG 0.449722 6:+72295625 None:intergenic
ATCGATGGCTTGTGTAAAAT+GGG 0.456406 6:-72289923 MsG0680033724.01.T01:CDS
TTATAAAGATTACAATGAAA+AGG 0.456657 6:-72298886 MsG0680033724.01.T01:intron
GAACTGAAAGTGACAACATC+AGG 0.458723 6:+72289740 None:intergenic
GAATTGAAAGTGACAACATC+AGG 0.461532 6:+72299346 None:intergenic
GAATTGTATGTAACAACATC+AGG 0.462078 6:+72289530 None:intergenic
TCCAAATCTTCCCTTTCCTC+GGG 0.462459 6:+72295531 None:intergenic
GAGAAATAGCAGTTGGGTAA+TGG 0.462865 6:+72290215 None:intergenic
CATGACCGTGTGATTGCACT+TGG 0.463728 6:-72289980 MsG0680033724.01.T01:CDS
GAGAAAGATTGATGGGAAAT+CGG 0.463779 6:-72289873 MsG0680033724.01.T01:CDS
AAGCATGTATTCAACATCAT+AGG 0.465205 6:-72289464 MsG0680033724.01.T01:CDS
TGCTTGATTTCAGGAGGAGC+GGG 0.471514 6:+72295498 None:intergenic
GTATAGTCTTCTACTTAGAA+AGG 0.474723 6:+72290384 None:intergenic
TTAAGCACTATTGCTCGAAT+GGG 0.476400 6:-72299061 MsG0680033724.01.T01:CDS
TTTGGCAATATTCTTAAGAT+GGG 0.479005 6:-72290085 MsG0680033724.01.T01:CDS
ACATATAATATTATGATCAA+TGG 0.484603 6:-72289002 MsG0680033724.01.T01:CDS
GTTCGATAAGTTACAACATC+AGG 0.485572 6:+72288909 None:intergenic
GATGCAGAAGCTTCTTCTGC+AGG 0.485651 6:-72295594 MsG0680033724.01.T01:CDS
TTTACATAAAGCATGTAAGA+AGG 0.486452 6:+72289202 None:intergenic
GCTTCTTCTGCAGGAGCAGT+AGG 0.488357 6:-72295585 MsG0680033724.01.T01:CDS
GTTGATGCTCTTTGTAAGGA+AGG 0.489370 6:-72289608 MsG0680033724.01.T01:CDS
CATTTCAGAATATAACTCAT+AGG 0.490638 6:+72299387 None:intergenic
TGAATTGAATAGACAAGTAA+TGG 0.491092 6:-72294847 MsG0680033724.01.T01:CDS
TTGATAGTTTGTGCAAATCT+GGG 0.491289 6:-72289301 MsG0680033724.01.T01:CDS
CAAGTGTTGAGAAAGATTGA+TGG 0.492130 6:-72289881 MsG0680033724.01.T01:CDS
AATATTGCCAAATATAGAAA+AGG 0.495452 6:+72290096 None:intergenic
CTGGGAGAGTTTCTCATGCA+TGG 0.496621 6:-72289283 MsG0680033724.01.T01:CDS
AAAGGGAACAGTAAGAAAAG+TGG 0.496871 6:+72290402 None:intergenic
ATACAAGATTTGGGGAAGAA+AGG 0.497353 6:+72294790 None:intergenic
GCATATCTGGTTGAATGCCT+TGG 0.498235 6:+72289132 None:intergenic
AATTCAATGATTGATGGAGT+TGG 0.499593 6:+72290277 None:intergenic
TGGAGAGAAGGAACGACAAT+GGG 0.500398 6:+72290467 None:intergenic
TTTAAGCACTATTGCTCGAA+TGG 0.502039 6:-72299062 MsG0680033724.01.T01:CDS
ATTGGTTGATGCTCTATGTA+AGG 0.504718 6:-72299218 MsG0680033724.01.T01:CDS
CACTATTGCTCGAATGGGAG+TGG 0.505877 6:-72299056 MsG0680033724.01.T01:CDS
AAGATTTGGGGAAGAAAGGA+AGG 0.506654 6:+72294794 None:intergenic
GATCAATGGACTTTGTAAAG+AGG 0.508158 6:-72299005 MsG0680033724.01.T01:CDS
GAAGTGTAGGTAACAACATT+CGG 0.515204 6:+72299136 None:intergenic
AGGAGCAGTAGGAATGATCT+TGG 0.521627 6:-72295574 MsG0680033724.01.T01:CDS
TGGCAATGATCCCGAGGAAA+GGG 0.525085 6:-72295541 MsG0680033724.01.T01:CDS
AAGTGTTGAGAAAGATTGAT+GGG 0.526693 6:-72289880 MsG0680033724.01.T01:CDS
TGGAACACTTGATGTTGAAA+AGG 0.529614 6:-72295670 MsG0680033724.01.T01:CDS
ATGGTAAAAGTATACACGCT+AGG 0.529713 6:+72299241 None:intergenic
CGCTCCTCCTGAAATCAAGC+AGG 0.530063 6:-72295496 MsG0680033724.01.T01:intron
CTTGATCAAATGCATGATAG+AGG 0.531631 6:-72289254 MsG0680033724.01.T01:CDS
TATAGTCTTCTACTTAGAAA+GGG 0.531711 6:+72290385 None:intergenic
ACATACAATTCATTAATGGA+TGG 0.536495 6:-72289518 MsG0680033724.01.T01:CDS
GATCATAATATTATATGTCC+GGG 0.537851 6:+72289007 None:intergenic
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ATACTCAAAGTAACAATACT+TGG 0.541929 6:+72290160 None:intergenic
AGTTGACAAGGCAATTGCAT+TGG 0.546091 6:-72289171 MsG0680033724.01.T01:CDS
CACTTGATGTTGAAAAGGTG+AGG 0.551012 6:-72295665 MsG0680033724.01.T01:CDS
AATGGATGCAATATTAGCTA+TGG 0.551599 6:-72294829 MsG0680033724.01.T01:CDS
ACATTTGAGCGGTGGAGAGA+AGG 0.554953 6:+72290455 None:intergenic
ATGGCAATGATCCCGAGGAA+AGG 0.555528 6:-72295542 MsG0680033724.01.T01:CDS
ACGGAGCATGCGATTGAATG+AGG 0.557870 6:+72290306 None:intergenic
GGTTGTTGTTAGTCTTAACA+AGG 0.559371 6:+72290236 None:intergenic
TGGTAAAAGTATACACGCTA+GGG 0.560423 6:+72299242 None:intergenic
TCAAAGTACCATAAGTAACT+TGG 0.562512 6:+72289945 None:intergenic
ACTTATGGTACTTTGATCGA+TGG 0.565500 6:-72289938 MsG0680033724.01.T01:CDS
TGGGAGAGTTTCTCATGCAT+GGG 0.567418 6:-72289282 MsG0680033724.01.T01:CDS
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GGATGCAATATTAGCTATGG+TGG 0.573899 6:-72294826 MsG0680033724.01.T01:CDS
AAGGGAACAGTAAGAAAAGT+GGG 0.574577 6:+72290403 None:intergenic
GTTGATGCTCTATGTAAGGA+AGG 0.575458 6:-72299214 MsG0680033724.01.T01:CDS
AAGTTGTTGAGACAAATTGA+AGG 0.577190 6:-72299487 MsG0680033724.01.T01:CDS
TACCTACACTTCAATAATGG+AGG 0.577704 6:-72299125 MsG0680033724.01.T01:CDS
ATAATATTATATGTCCGGGT+TGG 0.581449 6:+72289011 None:intergenic
AAGTGGCTTGTGAATTGTGA+TGG 0.583589 6:-72293238 MsG0680033724.01.T01:CDS
TCCCTCCATTATTGAAGTGT+AGG 0.588421 6:+72299123 None:intergenic
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GACAAGTGTATTCAAGGTGA+CGG 0.591394 6:+72290048 None:intergenic
CTGCTTGATTTCAGGAGGAG+CGG 0.591513 6:+72295497 None:intergenic
GTGGAGAGAAGGAACGACAA+TGG 0.592034 6:+72290466 None:intergenic
AGTTGTTGAGACAAATTGAA+GGG 0.594405 6:-72299486 MsG0680033724.01.T01:CDS
GTACGTGAAATGATTGCTAG+AGG 0.595151 6:-72288834 MsG0680033724.01.T01:CDS
GTGTCTTAACGGTAAAGTCA+AGG 0.602781 6:-72290017 MsG0680033724.01.T01:CDS
ATTTGGGGAAGAAAGGAAGG+AGG 0.603147 6:+72294797 None:intergenic
CTTCGTGAAATGATTGCTAG+AGG 0.611526 6:-72298852 MsG0680033724.01.T01:CDS
TGTGTTATACATTACTACAT+CGG 0.611662 6:+72299450 None:intergenic
AAGTGATTACATCGGTAGGT+TGG 0.615648 6:+72289231 None:intergenic
ACCTACACTTCAATAATGGA+GGG 0.616350 6:-72299124 MsG0680033724.01.T01:CDS
CTAACCTGCTTGATTTCAGG+AGG 0.619687 6:+72295492 None:intergenic
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GCTTGATTTCAGGAGGAGCG+GGG 0.624057 6:+72295499 None:intergenic
ACCTTGAATACACTTGTCAA+AGG 0.625076 6:-72290043 MsG0680033724.01.T01:CDS
TTGATGGAGTTGGTTTCGCA+CGG 0.626332 6:+72290287 None:intergenic
GTTGTTGTTAGTCTTAACAA+GGG 0.631551 6:+72290237 None:intergenic
GGTATCTATAGTTCCTTCAG+TGG 0.635202 6:-72293217 MsG0680033724.01.T01:intron
AAACCTGAACATTTGAGCGG+TGG 0.636726 6:+72290447 None:intergenic
TAAAGATTACAATGAAAAGG+CGG 0.640619 6:-72298883 MsG0680033724.01.T01:intron
GTTGATGGACTATGCAAACA+AGG 0.640999 6:-72289092 MsG0680033724.01.T01:CDS
GAAATCCAAGTGCAATCACA+CGG 0.654146 6:+72289975 None:intergenic
CTATCCCTATACAAGATTTG+GGG 0.661248 6:+72294782 None:intergenic
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AGCAGACGGGAAGCTTCAAG+TGG 0.672711 6:-72293255 MsG0680033724.01.T01:intron
ATAGCTGTGATGATGAAAGA+AGG 0.673676 6:-72289560 MsG0680033724.01.T01:CDS
CTTGATGTTGAAAAGGTGAG+GGG 0.676401 6:-72295663 MsG0680033724.01.T01:CDS
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GGGAAGCTTGAACACACACA+CGG 0.681275 6:+72290487 None:intergenic
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TGTGATGATGAAAGAAGGCG+TGG 0.716506 6:-72289555 MsG0680033724.01.T01:CDS
GGAGTTGTAAGTGATTACAT+CGG 0.716812 6:+72289223 None:intergenic
TTGTCTCAACAACTTCAGTG+CGG 0.729506 6:+72299495 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TTAATTAATAAAATTAAATT+AGG + Chr6:72291646-72291665 None:intergenic 0.0%
!! ATATTTGCATATTAAAAAAA+TGG + Chr6:72295992-72296011 None:intergenic 10.0%
!! GATATTTCTTATTATATAAT+TGG - Chr6:72289516-72289535 MsG0680033724.01.T01:CDS 10.0%
!!! AAAAATCTGATATTTTAAAT+CGG + Chr6:72293834-72293853 None:intergenic 10.0%
!!! AAATTTAATCTAAAATCATT+CGG + Chr6:72297058-72297077 None:intergenic 10.0%
!!! AGATATTTGTTATTTAAATT+CGG - Chr6:72294595-72294614 MsG0680033724.01.T01:intron 10.0%
!!! ATATTAAAAGTATAAACATT+TGG + Chr6:72298703-72298722 None:intergenic 10.0%
!!! ATCAATATATTTTATTTTAG+AGG - Chr6:72296777-72296796 MsG0680033724.01.T01:intron 10.0%
!!! ATTTTATTTTCTCTATTTTT+TGG - Chr6:72291464-72291483 MsG0680033724.01.T01:intron 10.0%
!!! TAAAATCGTTTAATTTAAAT+CGG + Chr6:72293923-72293942 None:intergenic 10.0%
!!! TAAAATCTTTTAATTTACAT+CGG + Chr6:72293889-72293908 None:intergenic 10.0%
!!! TAAATTAAAAGATTTTAGAT+GGG - Chr6:72293892-72293911 MsG0680033724.01.T01:intron 10.0%
!!! TAAATTAAACGATTTTAAAT+CGG - Chr6:72293926-72293945 MsG0680033724.01.T01:intron 10.0%
!!! TATTAAAAGTATAAACATTT+GGG + Chr6:72298702-72298721 None:intergenic 10.0%
!!! TGTTTATACTTTTAATATAT+TGG - Chr6:72298705-72298724 MsG0680033724.01.T01:intron 10.0%
!!! TTTATTTTTTAAGTAAAATG+TGG - Chr6:72289588-72289607 MsG0680033724.01.T01:CDS 10.0%
!! AATTACTAAATTGGTATAAT+GGG - Chr6:72294907-72294926 MsG0680033724.01.T01:intron 15.0%
!! ACAAAAAATAAAAAGTTCAA+AGG + Chr6:72290423-72290442 None:intergenic 15.0%
!! ACATATAATATTATGATCAA+TGG - Chr6:72299333-72299352 MsG0680033724.01.T01:CDS 15.0%
!! ATTACACATGAATTTATTTA+TGG - Chr6:72297159-72297178 MsG0680033724.01.T01:intron 15.0%
!! ATTAGGTATGAATTTATTTA+TGG - Chr6:72292966-72292985 MsG0680033724.01.T01:intron 15.0%
!! ATTTAAATTGTTAAAATTGC+AGG + Chr6:72290056-72290075 None:intergenic 15.0%
!! CAAAAAATAAAAAGTTCAAA+GGG + Chr6:72290422-72290441 None:intergenic 15.0%
!! GAGTTTAATAATAAATTTGA+GGG + Chr6:72296536-72296555 None:intergenic 15.0%
!! GATGTTAATATTAACTATAA+TGG - Chr6:72296580-72296599 MsG0680033724.01.T01:intron 15.0%
!! TAAATATTTACAAAGGAAAT+TGG + Chr6:72296325-72296344 None:intergenic 15.0%
!! TAATTACTAAATTGGTATAA+TGG - Chr6:72294906-72294925 MsG0680033724.01.T01:intron 15.0%
!! TAATTCTATATAAAAAGTTG+TGG + Chr6:72295243-72295262 None:intergenic 15.0%
!! TAGTAAAAATTTGGAAATAA+AGG + Chr6:72296861-72296880 None:intergenic 15.0%
!! TATATACAAGTAAAATTCTT+AGG - Chr6:72292340-72292359 MsG0680033724.01.T01:intron 15.0%
!! TATATGATATTTCATATTAG+TGG - Chr6:72293715-72293734 MsG0680033724.01.T01:intron 15.0%
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!! TTACACATGAATTTATTTAT+GGG - Chr6:72297160-72297179 MsG0680033724.01.T01:intron 15.0%
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! TTTGGCAATATTCTTAAGAT+GGG - Chr6:72298250-72298269 MsG0680033724.01.T01:intron 25.0%
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!!! AACAATGTTTAGCTTTTGTT+TGG - Chr6:72293625-72293644 MsG0680033724.01.T01:intron 25.0%
!!! AATCATTTTTAATTCGGAGA+AGG - Chr6:72292292-72292311 MsG0680033724.01.T01:intron 25.0%
!!! AGCTATAACATTTTGATCAA+TGG - Chr6:72289316-72289335 MsG0680033724.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATCATTTTTAATTCGGAGAA+GGG - Chr6:72292293-72292312 MsG0680033724.01.T01:intron 25.0%
!!! ATTTGGGTTTTTTGAGAATT+TGG - Chr6:72294819-72294838 MsG0680033724.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATTTGGTTTGTTCCATAAAA+TGG - Chr6:72289054-72289073 MsG0680033724.01.T01:CDS 25.0%
!!! CAGAAAACACTTTTTAAATC+GGG + Chr6:72294040-72294059 None:intergenic 25.0%
!!! GCAGAAAACACTTTTTAAAT+CGG + Chr6:72294041-72294060 None:intergenic 25.0%
!!! GCATCCAATCATTTTTAATT+CGG - Chr6:72292286-72292305 MsG0680033724.01.T01:intron 25.0%
!!! TCTGTTTTATTCTGTATTTC+AGG - Chr6:72294300-72294319 MsG0680033724.01.T01:intron 25.0%
!!! TGAAGAAGGAAAATTTTTAG+GGG + Chr6:72297265-72297284 None:intergenic 25.0%
!!! TGGTAAGGTTTTTATTTAGA+AGG - Chr6:72290792-72290811 MsG0680033724.01.T01:intron 25.0%
!!! TGGTTGGTTTAGTAAAAATT+TGG + Chr6:72296870-72296889 None:intergenic 25.0%
!!! TGTTTTTCAATACCATTTCA+TGG + Chr6:72298675-72298694 None:intergenic 25.0%
!!! TTCATCCTTCATGTATTTTT+TGG - Chr6:72297680-72297699 MsG0680033724.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTTAAGTAAAATGTGGAC+TGG - Chr6:72289593-72289612 MsG0680033724.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTTGTTTGTTATGATGAC+TGG - Chr6:72294212-72294231 MsG0680033724.01.T01:intron 25.0%
AAAGGATAGAACTTATGTGT+TGG + Chr6:72292493-72292512 None:intergenic 30.0%
AACATTTCTATGCTCTATCT+AGG - Chr6:72292533-72292552 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
AACGAAAAAGATTGGAGTTA+TGG + Chr6:72291868-72291887 None:intergenic 30.0%
AACTATCCCTATACAAGATT+TGG + Chr6:72293558-72293577 None:intergenic 30.0%
AAGCATGTATTCAACATCAT+AGG - Chr6:72298871-72298890 MsG0680033724.01.T01:CDS 30.0%
AAGTCGAAGAAAATTTGTAG+AGG + Chr6:72297237-72297256 None:intergenic 30.0%
AAGTTCTATCCTTTGATTAG+TGG - Chr6:72292499-72292518 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
AAGTTGTTGAGACAAATTGA+AGG - Chr6:72288848-72288867 MsG0680033724.01.T01:CDS 30.0%
AATCACAAAGCAACCATATT+CGG - Chr6:72294161-72294180 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
AATCTTTCTCAACACTTGTA+AGG + Chr6:72298452-72298471 None:intergenic 30.0%
AATGCATTGTGAACCTAATA+TGG - Chr6:72298993-72299012 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
AATGGATGCAATATTAGCTA+TGG - Chr6:72293506-72293525 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
AATTCAATGATTGATGGAGT+TGG + Chr6:72298061-72298080 None:intergenic 30.0%
ACAAACTAATATGAGAAGGT+AGG - Chr6:72289819-72289838 MsG0680033724.01.T01:CDS 30.0%
ACAGATTTCACATATTCCAT+TGG - Chr6:72295694-72295713 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
ACATTTCTATGCTCTATCTA+GGG - Chr6:72292534-72292553 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
ACTATCCCTATACAAGATTT+GGG + Chr6:72293557-72293576 None:intergenic 30.0%
ACTTTCAGTTCTCTAATCTA+TGG - Chr6:72298607-72298626 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
AGACATAACTCTGATTGAAA+GGG - Chr6:72292402-72292421 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
AGCATTTATGGAATGAATCA+AGG - Chr6:72292038-72292057 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
AGTCGAAGAAAATTTGTAGA+GGG + Chr6:72297236-72297255 None:intergenic 30.0%
AGTTATCTGTTATCTTTGCA+AGG - Chr6:72289728-72289747 MsG0680033724.01.T01:CDS 30.0%
AGTTGTTGAGACAAATTGAA+GGG - Chr6:72288849-72288868 MsG0680033724.01.T01:CDS 30.0%
ATAATATTATATGTCCGGGT+TGG + Chr6:72299327-72299346 None:intergenic 30.0%
ATCAATTGTTACTGTCATCT+TGG - Chr6:72298202-72298221 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
ATCTTGTATAGGGATAGTTT+AGG - Chr6:72293559-72293578 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
ATTAACAAACACAGGAAATC+AGG - Chr6:72296012-72296031 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
ATTTAAATTCGGTTCTCTCT+AGG - Chr6:72294606-72294625 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
ATTTAGACAATAAAGGAAGG+AGG + Chr6:72294248-72294267 None:intergenic 30.0%
ATTTCGTTTGTTCCATGAAA+TGG - Chr6:72298660-72298679 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
CAAATAAAAACTGAGTAGGT+TGG - Chr6:72295279-72295298 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
CAAGTTATCAAGATAATCGA+GGG + Chr6:72293146-72293165 None:intergenic 30.0%
CAATGATAACACTAAGACAA+GGG + Chr6:72289940-72289959 None:intergenic 30.0%
CACATTATGGTTGAACTATA+AGG + Chr6:72295204-72295223 None:intergenic 30.0%
CCAAAAATCAAGATACGATA+CGG - Chr6:72295913-72295932 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
CCTAGTTAATGAAGTGAATA+AGG - Chr6:72289240-72289259 MsG0680033724.01.T01:CDS 30.0%
CCTTATTCACTTCATTAACT+AGG + Chr6:72289243-72289262 None:intergenic 30.0%
CTAGTAAGTTAGCAATAAAC+TGG + Chr6:72290596-72290615 None:intergenic 30.0%
CTTACTACTATTACTTCGAT+AGG - Chr6:72296097-72296116 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
GAAAAAGAGAAATAGCAGTT+GGG + Chr6:72298129-72298148 None:intergenic 30.0%
GAAAGAAGCTAAAAATGTGT+TGG - Chr6:72289150-72289169 MsG0680033724.01.T01:CDS 30.0%
GAATTGTATGTAACAACATC+AGG + Chr6:72298808-72298827 None:intergenic 30.0%
GGGCATAATTTAGACAATAA+AGG + Chr6:72294255-72294274 None:intergenic 30.0%
GTATAGTCTTCTACTTAGAA+AGG + Chr6:72297954-72297973 None:intergenic 30.0%
GTATTATATGTGTGCATATC+TGG + Chr6:72299219-72299238 None:intergenic 30.0%
GTTTGAGCTAAAATTTCTAC+TGG - Chr6:72295667-72295686 MsG0680033724.01.T01:CDS 30.0%
TAACTTGAAGAACAAATGAG+CGG - Chr6:72293159-72293178 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
TAATCAAAGGCGATTAACTT+TGG + Chr6:72296426-72296445 None:intergenic 30.0%
TAATCATTCATAAGTCTCTC+TGG + Chr6:72297143-72297162 None:intergenic 30.0%
TAATGATGGTTGACACATTA+TGG + Chr6:72295217-72295236 None:intergenic 30.0%
TAATTGTTCAACTTCTGTTG+TGG + Chr6:72290470-72290489 None:intergenic 30.0%
TACTAGAAGCTTACTGTTAT+AGG - Chr6:72290610-72290629 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
TAGACATAACTCTGATTGAA+AGG - Chr6:72292401-72292420 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
TATTCACGCTCTATTTGAAA+AGG - Chr6:72299452-72299471 MsG0680033724.01.T01:CDS 30.0%
TCAAGTTATCAAGATAATCG+AGG + Chr6:72293147-72293166 None:intergenic 30.0%
TCAATGATAACACTAAGACA+AGG + Chr6:72289941-72289960 None:intergenic 30.0%
TCACTAACCAAAGTAATAGA+AGG + Chr6:72293344-72293363 None:intergenic 30.0%
TCATTGGATCCTAAAAACAT+AGG + Chr6:72294444-72294463 None:intergenic 30.0%
TCTGCTATATTTGTATTCCT+TGG - Chr6:72289908-72289927 MsG0680033724.01.T01:CDS 30.0%
TGAAAAAGAGAAATAGCAGT+TGG + Chr6:72298130-72298149 None:intergenic 30.0%
TGAGTTTAAGAAACAATACG+GGG + Chr6:72294797-72294816 None:intergenic 30.0%
TGTTACCTACACTTCAATAA+TGG - Chr6:72289207-72289226 MsG0680033724.01.T01:CDS 30.0%
TTCAAATAGAGCGTGAATAA+TGG + Chr6:72299451-72299470 None:intergenic 30.0%
TTCAGACTCATAATCAAGAA+TGG - Chr6:72295753-72295772 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
TTCCAAAATACACATCTTCA+AGG + Chr6:72292713-72292732 None:intergenic 30.0%
TTCGAAACAGTTCCAAAATA+AGG + Chr6:72292120-72292139 None:intergenic 30.0%
TTGTTAAAATTGCAGGTGTT+TGG + Chr6:72290049-72290068 None:intergenic 30.0%
TTTAGTAATTACGTCTTCAC+GGG + Chr6:72294897-72294916 None:intergenic 30.0%
TTTGAATCAGAAGTAAGTCT+GGG - Chr6:72293209-72293228 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
! AACGATTTTAAATCGGGTAA+AGG - Chr6:72293933-72293952 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
! ACGATTTTAAATCGGGTAAA+GGG - Chr6:72293934-72293953 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
! ATCAATGGTCTTTGTTTAGA+GGG - Chr6:72299348-72299367 MsG0680033724.01.T01:CDS 30.0%
! ATTGATAGTTTGTGCAAATC+TGG - Chr6:72299033-72299052 MsG0680033724.01.T01:CDS 30.0%
! CAAAACATGCCTATGTTTTT+AGG - Chr6:72294432-72294451 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
! CGTGTATACTTTTACCATAT+TGG - Chr6:72289099-72289118 MsG0680033724.01.T01:CDS 30.0%
! GAATCAAGGATGATGATTTT+GGG - Chr6:72292052-72292071 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
! GCAAAAAGGTAAGAACTTTT+TGG + Chr6:72291197-72291216 None:intergenic 30.0%
! TCAAAGTACCATAAGTAACT+TGG + Chr6:72298393-72298412 None:intergenic 30.0%
! TCTCTCAATACACAAGTTTT+TGG - Chr6:72294103-72294122 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
! TCTTTGTTGTGTTTATGGTA+TGG - Chr6:72295010-72295029 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
! TGAATCAAGGATGATGATTT+TGG - Chr6:72292051-72292070 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
! TGTATTTTCTGTAGAACTTC+CGG - Chr6:72294489-72294508 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
! TTATGTAAGCTTGTGGTTTT+TGG - Chr6:72294568-72294587 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
! TTGAAATTGATGGTATGACA+AGG + Chr6:72294415-72294434 None:intergenic 30.0%
! TTGATAGTTTGTGCAAATCT+GGG - Chr6:72299034-72299053 MsG0680033724.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTGAATCAGAAGTAAGTC+TGG - Chr6:72293208-72293227 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
!! AAGTGTTGAGAAAGATTGAT+GGG - Chr6:72298455-72298474 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
!! ACAATTAGGGTATTGAAAGA+GGG + Chr6:72297800-72297819 None:intergenic 30.0%
!! AGGTAAGAACTTTTTGGTAT+AGG + Chr6:72291191-72291210 None:intergenic 30.0%
!! GCTTTTGTGAATTTGAAATG+AGG - Chr6:72290337-72290356 MsG0680033724.01.T01:CDS 30.0%
!! GTCAACAATTTTAAAGACCA+AGG - Chr6:72299186-72299205 MsG0680033724.01.T01:CDS 30.0%
!! GTTGTTGTTAGTCTTAACAA+GGG + Chr6:72298101-72298120 None:intergenic 30.0%
!! TAAAAACCATCAAGTTGACA+AGG - Chr6:72299152-72299171 MsG0680033724.01.T01:CDS 30.0%
!! TAAGAACTTTTTGGTATAGG+AGG + Chr6:72291188-72291207 None:intergenic 30.0%
!! TCATTTTTAATTCGGAGAAG+GGG - Chr6:72292294-72292313 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
!!! CAAATCTTACCTTTTTTGAG+AGG - Chr6:72296642-72296661 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
!!! CCAATCATGATTTTGATTTG+CGG + Chr6:72291340-72291359 None:intergenic 30.0%
!!! TAGGCATGTTTTGAAATTGA+TGG + Chr6:72294425-72294444 None:intergenic 30.0%
!!! TCTTATTTTGACCTCTATTC+TGG - Chr6:72291783-72291802 MsG0680033724.01.T01:intron 30.0%
AAACTAACCTGCTTGATTTC+AGG + Chr6:72292849-72292868 None:intergenic 35.0%
AAAGGGAACAGTAAGAAAAG+TGG + Chr6:72297936-72297955 None:intergenic 35.0%
AAATAAGGACCAACTGATGT+TGG + Chr6:72292105-72292124 None:intergenic 35.0%
AAATGAGCGGTTTACTTAAC+AGG - Chr6:72293172-72293191 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
AACAACGACATAGCATTTAC+CGG + Chr6:72291409-72291428 None:intergenic 35.0%
AAGCATAGTTACTGACATAG+AGG + Chr6:72293602-72293621 None:intergenic 35.0%
AAGGGAACAGTAAGAAAAGT+GGG + Chr6:72297935-72297954 None:intergenic 35.0%
AATGAGCGGTTTACTTAACA+GGG - Chr6:72293173-72293192 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
AATTCACATATTGCAGCCAA+TGG + Chr6:72295713-72295732 None:intergenic 35.0%
ACCTTGAATACACTTGTCAA+AGG - Chr6:72298292-72298311 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
ACCTTTGACAAGTGTATTCA+AGG + Chr6:72298296-72298315 None:intergenic 35.0%
ACTTATGGTACTTTGATCGA+TGG - Chr6:72298397-72298416 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
ACTTGATGTTGAAAAGGTGA+GGG - Chr6:72292671-72292690 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
AGATATGTAGGCAAATTGTG+TGG + Chr6:72295157-72295176 None:intergenic 35.0%
AGCCTAAAGTCACAGAATAT+GGG + Chr6:72294084-72294103 None:intergenic 35.0%
AGGATGAAGGATAAACTTGA+AGG + Chr6:72291067-72291086 None:intergenic 35.0%
AGTAGACCAAGAGTTAAACA+AGG + Chr6:72293442-72293461 None:intergenic 35.0%
AGTAGAGAAACTATGTCTAG+TGG - Chr6:72291999-72292018 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
AGTGATGGTTCCTTGAAAAA+CGG + Chr6:72291283-72291302 None:intergenic 35.0%
AGTTAAACAAGGGGAAAAAG+AGG + Chr6:72293431-72293450 None:intergenic 35.0%
ATACAAGATTTGGGGAAGAA+AGG + Chr6:72293548-72293567 None:intergenic 35.0%
ATGCAAACAAGGAAGACTTA+AGG - Chr6:72299254-72299273 MsG0680033724.01.T01:CDS 35.0%
ATTAAGAAACCATCGACAAG+TGG + Chr6:72291586-72291605 None:intergenic 35.0%
ATTAAGCACTAGAACCCAAT+TGG + Chr6:72296890-72296909 None:intergenic 35.0%
CACTTGAACCAAGTTACTTA+TGG - Chr6:72298382-72298401 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
CATGATTGGAACAATTTCAC+CGG - Chr6:72291351-72291370 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
CCGCAAATCAAAATCATGAT+TGG - Chr6:72291337-72291356 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
CCTTCAGTGGTATAAACAAA+AGG - Chr6:72295131-72295150 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
CGGATGAACCCATTTAAAAA+AGG + Chr6:72293869-72293888 None:intergenic 35.0%
CTATCCCTATACAAGATTTG+GGG + Chr6:72293556-72293575 None:intergenic 35.0%
CTCATAATCAAGAATGGACA+TGG - Chr6:72295759-72295778 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
CTCTTTCAATACCCTAATTG+TGG - Chr6:72297799-72297818 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
CTGTCAAAAATGGAAGACAA+CGG - Chr6:72299396-72299415 MsG0680033724.01.T01:CDS 35.0%
CTTGATCAAATGCATGATAG+AGG - Chr6:72299081-72299100 MsG0680033724.01.T01:CDS 35.0%
GAAAAAGGCAACCACAATTA+GGG + Chr6:72297813-72297832 None:intergenic 35.0%
GAAGTGTAGGTAACAACATT+CGG + Chr6:72289202-72289221 None:intergenic 35.0%
GAATTGAAAGTGACAACATC+AGG + Chr6:72288992-72289011 None:intergenic 35.0%
GAGAAAGATTGATGGGAAAT+CGG - Chr6:72298462-72298481 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
GAGACAAATTGAAGGGAAAT+TGG - Chr6:72288856-72288875 MsG0680033724.01.T01:CDS 35.0%
GCCTACATATCTTAGTAAAC+AGG - Chr6:72295165-72295184 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
GCCTGTTTACTAAGATATGT+AGG + Chr6:72295169-72295188 None:intergenic 35.0%
GGACATGGATTCAGAATTAT+AGG - Chr6:72295774-72295793 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
GGAGTTGTAAGTGATTACAT+CGG + Chr6:72299115-72299134 None:intergenic 35.0%
GGTCAATTGAAAGATGCATT+TGG - Chr6:72289037-72289056 MsG0680033724.01.T01:CDS 35.0%
GTAAACTATAAGTCAAGGAG+TGG + Chr6:72295575-72295594 None:intergenic 35.0%
GTAGACCAAGAGTTAAACAA+GGG + Chr6:72293441-72293460 None:intergenic 35.0%
GTCATAGCTAATTCTACGAT+TGG - Chr6:72292929-72292948 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
GTTCGATAAGTTACAACATC+AGG + Chr6:72299429-72299448 None:intergenic 35.0%
GTTTCATAAGTTACAGCATC+AGG + Chr6:72289411-72289430 None:intergenic 35.0%
TAAATCGGCCACCTATAAAT+CGG - Chr6:72293984-72294003 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
TACCTACACTTCAATAATGG+AGG - Chr6:72289210-72289229 MsG0680033724.01.T01:CDS 35.0%
TAGACCAAGAGTTAAACAAG+GGG + Chr6:72293440-72293459 None:intergenic 35.0%
TCGTAGAATTAGCTATGACA+TGG + Chr6:72292928-72292947 None:intergenic 35.0%
TCTATCCGAAAATCGAATAC+AGG + Chr6:72296945-72296964 None:intergenic 35.0%
TCTTCCCCAAATCTTGTATA+GGG - Chr6:72293549-72293568 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
TGAAGGATAAACTTGAAGGA+TGG + Chr6:72291063-72291082 None:intergenic 35.0%
TGAGTTTCAGAGATGAACAA+AGG + Chr6:72290897-72290916 None:intergenic 35.0%
TGCATGATTTCAGTGAAGTT+CGG - Chr6:72293104-72293123 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
TGGAACACTTGATGTTGAAA+AGG - Chr6:72292665-72292684 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
TGGATAGCAATAGGAAAATG+TGG + Chr6:72290029-72290048 None:intergenic 35.0%
TGTGTTTATGGTATGGTGAA+AGG - Chr6:72295017-72295036 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
TTAAGCACTATTGCTCGAAT+GGG - Chr6:72289274-72289293 MsG0680033724.01.T01:CDS 35.0%
TTAGGATCCAATGAACTGTT+TGG - Chr6:72294450-72294469 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
TTCCCATATTCTGTGACTTT+AGG - Chr6:72294079-72294098 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
TTCTTCCCCAAATCTTGTAT+AGG - Chr6:72293548-72293567 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
TTGTAAGTGATTACATCGGT+AGG + Chr6:72299111-72299130 None:intergenic 35.0%
TTTAAGCACTATTGCTCGAA+TGG - Chr6:72289273-72289292 MsG0680033724.01.T01:CDS 35.0%
! AAGAGGCTTGTTTGATAAAG+CGG - Chr6:72289347-72289366 MsG0680033724.01.T01:CDS 35.0%
! ACATAGAGCATCAACCAATA+TGG + Chr6:72289116-72289135 None:intergenic 35.0%
! ACCTACACTTCAATAATGGA+GGG - Chr6:72289211-72289230 MsG0680033724.01.T01:CDS 35.0%
! ACTTTTATCCTCCAAAAGGA+GGG - Chr6:72293005-72293024 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
! AGACAAAGGCTACGAATTTT+AGG + Chr6:72296497-72296516 None:intergenic 35.0%
! ATAGCTGTGATGATGAAAGA+AGG - Chr6:72298775-72298794 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
! ATCGATGGCTTGTGTAAAAT+GGG - Chr6:72298412-72298431 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
! ATGGTAAAAGTATACACGCT+AGG + Chr6:72289097-72289116 None:intergenic 35.0%
! ATTGGTTGATGCTCTATGTA+AGG - Chr6:72289117-72289136 MsG0680033724.01.T01:CDS 35.0%
! ATTGGTTGATGCTCTTTGTA+AGG - Chr6:72298723-72298742 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
! CCGTATCGTATCTTGATTTT+TGG + Chr6:72295916-72295935 None:intergenic 35.0%
! CGATTTTAAATCGGGTAAAG+GGG - Chr6:72293935-72293954 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
! CTTGATTTTTCATCTCGACA+AGG - Chr6:72296448-72296467 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
! GAAGATAATGGCAGCATTTA+TGG - Chr6:72292026-72292045 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
! GATCAATGGACTTTGTAAAG+AGG - Chr6:72289330-72289349 MsG0680033724.01.T01:CDS 35.0%
! GATCAATGGTCTTTGTTTAG+AGG - Chr6:72299347-72299366 MsG0680033724.01.T01:CDS 35.0%
! GATCTGTGATTTTCGCAAAA+AGG + Chr6:72291211-72291230 None:intergenic 35.0%
! GATTTTAAATCGGGTAAAGG+GGG - Chr6:72293936-72293955 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
! GGTCTCTTTTTGGATTGTTA+GGG - Chr6:72292442-72292461 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
! GTCAAAGGTATGTGTCTTAA+CGG - Chr6:72298307-72298326 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
! GTGTTGATCGTTTGATTTAC+CGG + Chr6:72296988-72297007 None:intergenic 35.0%
! TAAAGAGAAATTGGTGACTG+AGG - Chr6:72298531-72298550 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
! TCTAGTGGTGATGAAGATAA+TGG - Chr6:72292014-72292033 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
! TGCCTTGAAGATGTGTATTT+TGG - Chr6:72292708-72292727 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
! TGGTAAAAGTATACACGCTA+GGG + Chr6:72289096-72289115 None:intergenic 35.0%
! TGGTCTCTTTTTGGATTGTT+AGG - Chr6:72292441-72292460 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
! TGTTGATCGTTTGATTTACC+GGG + Chr6:72296987-72297006 None:intergenic 35.0%
! TTGGACTTTTATCCTCCAAA+AGG - Chr6:72293001-72293020 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
! TTGGCTATGATGATGAAAGA+AGG - Chr6:72289169-72289188 MsG0680033724.01.T01:CDS 35.0%
!! ACATCAGTTGGTCCTTATTT+TGG - Chr6:72292105-72292124 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
!! ATCCTCCATTTTTGACAACA+AGG + Chr6:72289376-72289395 None:intergenic 35.0%
!! ATGTTATAGCTCTGAGCATT+AGG + Chr6:72289307-72289326 None:intergenic 35.0%
!! CAAGTGTTGAGAAAGATTGA+TGG - Chr6:72298454-72298473 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
!! CACAATTAGGGTATTGAAAG+AGG + Chr6:72297801-72297820 None:intergenic 35.0%
!! CCTTTTGTTTATACCACTGA+AGG + Chr6:72295134-72295153 None:intergenic 35.0%
!! GGGAACTAGTCTTTCATTTA+AGG - Chr6:72292462-72292481 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
!! GGTTGTTGTTAGTCTTAACA+AGG + Chr6:72298102-72298121 None:intergenic 35.0%
!! TGTTATGATGACTGGTTTAC+TGG - Chr6:72294220-72294239 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
!! TTCAGTTGAGAGTGTTGAAA+AGG - Chr6:72290304-72290323 MsG0680033724.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTCCCCTTGTTTAACTCT+TGG - Chr6:72293433-72293452 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
!! TTTTTGGTATAGGAGGATGA+GGG + Chr6:72291181-72291200 None:intergenic 35.0%
!!! CGTCATCCATTTTGAAGTAT+CGG - Chr6:72296184-72296203 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
!!! GAGATGCTGGTTTTATACAT+AGG - Chr6:72293260-72293279 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
!!! GGATGAGGGTATTTTAATAG+TGG + Chr6:72291167-72291186 None:intergenic 35.0%
!!! GTCATCCATTTTGAAGTATC+GGG - Chr6:72296185-72296204 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
!!! TCATCCATTTTGAAGTATCG+GGG - Chr6:72296186-72296205 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
!!! TTGATTTGCGGATTTTGTAG+AGG + Chr6:72291328-72291347 None:intergenic 35.0%
!!! TTGTTTTGATGTGTAGCAGA+CGG - Chr6:72295066-72295085 MsG0680033724.01.T01:intron 35.0%
AAAGGTGAGGGGAAAAATAG+TGG - Chr6:72292683-72292702 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
AAGATTTGGGGAAGAAAGGA+AGG + Chr6:72293544-72293563 None:intergenic 40.0%
AAGGACGTCTTACAGCAAAT+GGG + Chr6:72290523-72290542 None:intergenic 40.0%
AAGTGATTACATCGGTAGGT+TGG + Chr6:72299107-72299126 None:intergenic 40.0%
AATCAAAACAGCCACCTTCA+TGG - Chr6:72291236-72291255 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
AATCAAGATACGATACGGCT+AGG - Chr6:72295918-72295937 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
ACAACTGAAGCATATGCACA+TGG + Chr6:72295502-72295521 None:intergenic 40.0%
ACGAAACCTGAACATTTGAG+CGG + Chr6:72297894-72297913 None:intergenic 40.0%
ACTAAAACGAAACACGACGA+TGG - Chr6:72290871-72290890 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
ACTGATGCATGAGAGCTAAT+TGG + Chr6:72294141-72294160 None:intergenic 40.0%
AGCTTCTGCACAATGGAAAA+AGG + Chr6:72297828-72297847 None:intergenic 40.0%
AGGTGACAACAAGCACTTTA+AGG - Chr6:72292209-72292228 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
AGTTGACAAGGCAATTGCAT+TGG - Chr6:72299164-72299183 MsG0680033724.01.T01:CDS 40.0%
ATAGTGTAGCTGCGAACATT+AGG + Chr6:72298913-72298932 None:intergenic 40.0%
ATCCAAATCTTCCCTTTCCT+CGG + Chr6:72292808-72292827 None:intergenic 40.0%
ATCCAATGAACTGTTTGGCT+TGG - Chr6:72294455-72294474 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
ATCTGGACAGTAGCAGATAT+CGG - Chr6:72294655-72294674 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
ATGATCTTGGCCAATGATGA+TGG - Chr6:72292774-72292793 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
ATTTGACCATCATAGAAGGC+CGG + Chr6:72290660-72290679 None:intergenic 40.0%
CAACGGAACAGTTATTGAGA+GGG + Chr6:72291520-72291539 None:intergenic 40.0%
CAATTGCCTTGTCAACTTGA+TGG + Chr6:72299161-72299180 None:intergenic 40.0%
CACTTGATGTTGAAAAGGTG+AGG - Chr6:72292670-72292689 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
CCAAAACAGAAAAGCAACAC+AGG + Chr6:72294721-72294740 None:intergenic 40.0%
CCTTCTTCACCACTAATCAA+AGG + Chr6:72292511-72292530 None:intergenic 40.0%
CCTTTGATTAGTGGTGAAGA+AGG - Chr6:72292508-72292527 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
CGATGTGAATGTGATGATAG+AGG + Chr6:72291098-72291117 None:intergenic 40.0%
CTTCGTGAAATGATTGCTAG+AGG - Chr6:72289483-72289502 MsG0680033724.01.T01:CDS 40.0%
CTTGATGTTGAAAAGGTGAG+GGG - Chr6:72292672-72292691 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
GAAACTAAACTCGCCGAATA+TGG + Chr6:72294177-72294196 None:intergenic 40.0%
GAAATCCAAGTGCAATCACA+CGG + Chr6:72298363-72298382 None:intergenic 40.0%
GAACTGAAAGTGACAACATC+AGG + Chr6:72298598-72298617 None:intergenic 40.0%
GAAGAGTCTTTCTACAGTGA+TGG + Chr6:72291298-72291317 None:intergenic 40.0%
GACAAGTGTATTCAAGGTGA+CGG + Chr6:72298290-72298309 None:intergenic 40.0%
GAGAAATAGCAGTTGGGTAA+TGG + Chr6:72298123-72298142 None:intergenic 40.0%
GAGCCTAAAGTCACAGAATA+TGG + Chr6:72294085-72294104 None:intergenic 40.0%
GAGGGACTAAAACGAAATGT+TGG + Chr6:72297218-72297237 None:intergenic 40.0%
GCAATCTGTTAAAGTCCACT+CGG + Chr6:72294875-72294894 None:intergenic 40.0%
GGAAAAAGGCAACCACAATT+AGG + Chr6:72297814-72297833 None:intergenic 40.0%
GGATGCAATATTAGCTATGG+TGG - Chr6:72293509-72293528 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
GGTATCTATAGTTCCTTCAG+TGG - Chr6:72295118-72295137 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
GGTATGACAAGGACAATTAG+TGG + Chr6:72294404-72294423 None:intergenic 40.0%
GGTTGACCTAACATGTTTAG+TGG - Chr6:72296469-72296488 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
GTACGTGAAATGATTGCTAG+AGG - Chr6:72299501-72299520 MsG0680033724.01.T01:CDS 40.0%
GTCACCTAGTGTAACATAAC+TGG + Chr6:72292196-72292215 None:intergenic 40.0%
GTGAACATCCGATTTATAGG+TGG + Chr6:72293995-72294014 None:intergenic 40.0%
GTGTCTTAACGGTAAAGTCA+AGG - Chr6:72298318-72298337 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
GTTGATGCTCTATGTAAGGA+AGG - Chr6:72289121-72289140 MsG0680033724.01.T01:CDS 40.0%
GTTGATGCTCTTTGTAAGGA+AGG - Chr6:72298727-72298746 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
TAAATTCGGTTCTCTCTAGG+TGG - Chr6:72294609-72294628 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
TAAGACAAGGGAAAGAACCA+AGG + Chr6:72289928-72289947 None:intergenic 40.0%
TAAGGACGTCTTACAGCAAA+TGG + Chr6:72290524-72290543 None:intergenic 40.0%
TAGGCACCACTAAACATGTT+AGG + Chr6:72296478-72296497 None:intergenic 40.0%
TATAGGCTATAGCTTACCAC+AGG - Chr6:72290627-72290646 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
TCAACGGAACAGTTATTGAG+AGG + Chr6:72291521-72291540 None:intergenic 40.0%
TCCCTCCATTATTGAAGTGT+AGG + Chr6:72289215-72289234 None:intergenic 40.0%
TGATCGAGATCTAACCATGA+AGG + Chr6:72291253-72291272 None:intergenic 40.0%
TGATGATAGAGGAGAAGAGA+AGG + Chr6:72291087-72291106 None:intergenic 40.0%
TGATTCTGGATGAAGACATG+CGG + Chr6:72291001-72291020 None:intergenic 40.0%
TGCAGAAAGTTCTGCAGATA+TGG - Chr6:72292645-72292664 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
TTAAGAAACAATACGGGGAC+TGG + Chr6:72294792-72294811 None:intergenic 40.0%
TTCAGTGAAGTTCGGATAGA+GGG - Chr6:72293112-72293131 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
TTCGCCAGTTATGTTACACT+AGG - Chr6:72292189-72292208 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
TTGTCTCAACAACTTCAGTG+CGG + Chr6:72288843-72288862 None:intergenic 40.0%
TTTCAGTGAAGTTCGGATAG+AGG - Chr6:72293111-72293130 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
! AAGTGGCTTGTGAATTGTGA+TGG - Chr6:72295097-72295116 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
! ATGTGCTGAGACTTTTGTGT+TGG - Chr6:72294344-72294363 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
! CACTTGTTAGGGTTTCAGAT+AGG + Chr6:72290952-72290971 None:intergenic 40.0%
! GACTTTTATCCTCCAAAAGG+AGG - Chr6:72293004-72293023 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
! GATCGATGGCTTGTGTAAAA+TGG - Chr6:72298411-72298430 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
! GGTATAGGCTTAGGTTTTTC+TGG - Chr6:72294543-72294562 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
! GTATTCAAGGTGACGGTATT+CGG + Chr6:72298283-72298302 None:intergenic 40.0%
! GTTGATCGTTTGATTTACCG+GGG + Chr6:72296986-72297005 None:intergenic 40.0%
! TAGGTGGCCGATTTAAAAAG+TGG + Chr6:72293979-72293998 None:intergenic 40.0%
! TGAGACCTTGCTGTCAAAAA+TGG - Chr6:72299386-72299405 MsG0680033724.01.T01:CDS 40.0%
! TTAAAGTGATAGCGAGACCT+TGG + Chr6:72289625-72289644 None:intergenic 40.0%
! TTGGGTTCTAGTGCTTAATG+AGG - Chr6:72296891-72296910 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
!! AGCTTCAGTTTTGGTGGTAT+AGG - Chr6:72294528-72294547 MsG0680033724.01.T01:intron 40.0%
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CACCAAGCCAAACAGTTCAT+TGG + Chr6:72294460-72294479 None:intergenic 45.0%
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CGGGTGAACATCCGATTTAT+AGG + Chr6:72293998-72294017 None:intergenic 45.0%
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CTCAGCACATCAATACAGCA+TGG + Chr6:72294334-72294353 None:intergenic 45.0%
GAAGCCCCGATACTTCAAAA+TGG + Chr6:72296193-72296212 None:intergenic 45.0%
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GCTTACCACAGGTTGTATTC+CGG - Chr6:72290638-72290657 MsG0680033724.01.T01:intron 45.0%
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! TGTGATGATGAAAGAAGGCG+TGG - Chr6:72298780-72298799 MsG0680033724.01.T01:intron 45.0%
! TTGATGGAGTTGGTTTCGCA+CGG + Chr6:72298051-72298070 None:intergenic 45.0%
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!!! TGTTTTGGCGCTCTGTTGTA+AGG - Chr6:72294733-72294752 MsG0680033724.01.T01:intron 45.0%
!!! ATGAATTTTTATAATTTTTA+TGG - Chr6:72297418-72297437 MsG0680033724.01.T01:intron 5.0%
ACATTTGAGCGGTGGAGAGA+AGG + Chr6:72297883-72297902 None:intergenic 50.0%
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ACGCTCCAACCAACATCAGT+TGG - Chr6:72292093-72292112 MsG0680033724.01.T01:intron 50.0%
ACGGAGCATGCGATTGAATG+AGG + Chr6:72298032-72298051 None:intergenic 50.0%
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CCCGGATACGAGATACGATA+CGG - Chr6:72295853-72295872 MsG0680033724.01.T01:intron 50.0%
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TCCCGAGGAAAGGGAAGATT+TGG - Chr6:72292803-72292822 MsG0680033724.01.T01:intron 50.0%
TCTCCACCGCTCAAATGTTC+AGG - Chr6:72297885-72297904 MsG0680033724.01.T01:intron 50.0%
TGATCACATGTCACCCTCTC+CGG - Chr6:72291538-72291557 MsG0680033724.01.T01:intron 50.0%
TGCTTGATTTCAGGAGGAGC+GGG + Chr6:72292840-72292859 None:intergenic 50.0%
TGGCAATGATCCCGAGGAAA+GGG - Chr6:72292794-72292813 MsG0680033724.01.T01:intron 50.0%
TTCTGGATGAAGACATGCGG+TGG + Chr6:72290998-72291017 None:intergenic 50.0%
! AAACAATACGGGGACTGGCA+AGG + Chr6:72294787-72294806 None:intergenic 50.0%
! ACTGCACCGATACGTCGATA+CGG - Chr6:72295883-72295902 MsG0680033724.01.T01:intron 50.0%
! CTAGTCAACCCTCCTTTTGG+AGG + Chr6:72293016-72293035 None:intergenic 50.0%
! GCTGGTGTGAGCTTCAGTTT+TGG - Chr6:72294519-72294538 MsG0680033724.01.T01:intron 50.0%
! GTATCAAGAGCATGCAGCAG+TGG + Chr6:72295321-72295340 None:intergenic 50.0%
! GTATCGGTGCAGAATACGCA+GGG - Chr6:72296152-72296171 MsG0680033724.01.T01:intron 50.0%
! GTTTGATTTACCGGGGAAGG+TGG + Chr6:72296979-72296998 None:intergenic 50.0%
!! ATGTGGACTGGACTACTCCA+AGG - Chr6:72289605-72289624 MsG0680033724.01.T01:CDS 50.0%
!! GGTGGTGATGATTTCTGGCA+CGG + Chr6:72291383-72291402 None:intergenic 50.0%
!! GGTGTGAGCTTCAGTTTTGG+TGG - Chr6:72294522-72294541 MsG0680033724.01.T01:intron 50.0%
!! TGATGATGGCAATGATCCCG+AGG - Chr6:72292788-72292807 MsG0680033724.01.T01:intron 50.0%
!! TTGAAGTATCGGGGCTTCAC+AGG - Chr6:72296195-72296214 MsG0680033724.01.T01:intron 50.0%
AGAAATCATCACCACCCCGC+CGG - Chr6:72291387-72291406 MsG0680033724.01.T01:intron 55.0%
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ATGGTCATGCGCTGAGCTGA+AGG + Chr6:72291044-72291063 None:intergenic 55.0%
CAATTCTTCGCCACCTTCCC+CGG - Chr6:72296966-72296985 MsG0680033724.01.T01:intron 55.0%
CACACGGAGCTTCTGCACAA+TGG + Chr6:72297835-72297854 None:intergenic 55.0%
CGACATAGCATTTACCGGCG+GGG + Chr6:72291404-72291423 None:intergenic 55.0%
CGCTCCTCCTGAAATCAAGC+AGG - Chr6:72292839-72292858 MsG0680033724.01.T01:intron 55.0%
CTAGATCCCACTGCACTTGG+TGG - Chr6:72290187-72290206 MsG0680033724.01.T01:CDS 55.0%
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! CTGCACCGATACGTCGATAC+GGG - Chr6:72295884-72295903 MsG0680033724.01.T01:intron 55.0%
! GCACCGATACCTGCCTGATA+GGG + Chr6:72296142-72296161 None:intergenic 55.0%
! GCTCACACCAGCAAAGCATC+CGG + Chr6:72294511-72294530 None:intergenic 55.0%
! TGCACCGATACCTGCCTGAT+AGG + Chr6:72296143-72296162 None:intergenic 55.0%
!! ATTTCTGGCACGGTGGTTGC+CGG + Chr6:72291373-72291392 None:intergenic 55.0%
!! CCATCGACAAGTGGTGATGG+CGG + Chr6:72291577-72291596 None:intergenic 55.0%
!! GGTATCGGTGCAGAATACGC+AGG - Chr6:72296151-72296170 MsG0680033724.01.T01:intron 55.0%
!! GGTGATGATTTCTGGCACGG+TGG + Chr6:72291380-72291399 None:intergenic 55.0%
AGGGCCAAACCGCAAGTGCA+CGG + Chr6:72296123-72296142 None:intergenic 60.0%
AGGGGGAGGGGACACTTGTT+AGG + Chr6:72290964-72290983 None:intergenic 60.0%
AGTGCTCCCACCAAGTGCAG+TGG + Chr6:72290197-72290216 None:intergenic 60.0%
ATGCGGTGGTCGCAAGAGAG+AGG + Chr6:72290984-72291003 None:intergenic 60.0%
CATAGCATTTACCGGCGGGG+TGG + Chr6:72291401-72291420 None:intergenic 60.0%
CCGCCATCACCACTTGTCGA+TGG - Chr6:72291574-72291593 MsG0680033724.01.T01:intron 60.0%
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TCAGGAGGAGCGGGGACTTT+GGG + Chr6:72292831-72292850 None:intergenic 60.0%
TGCGGTGGTCGCAAGAGAGA+GGG + Chr6:72290983-72291002 None:intergenic 60.0%
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! GGCGGGGTGGTGATGATTTC+TGG + Chr6:72291388-72291407 None:intergenic 60.0%
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CAACCGTTGCTGGCCGGAGA+GGG + Chr6:72291554-72291573 None:intergenic 65.0%
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GGTCGCAAGAGAGAGGGGGA+GGG + Chr6:72290977-72290996 None:intergenic 65.0%
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TCACCCTCTCCGGCCAGCAA+CGG - Chr6:72291548-72291567 MsG0680033724.01.T01:intron 65.0%
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! GCGGTTTGGCCCTATCAGGC+AGG - Chr6:72296130-72296149 MsG0680033724.01.T01:intron 65.0%
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GCAACCGTTGCTGGCCGGAG+AGG + Chr6:72291555-72291574 None:intergenic 70.0%
TGGCGGCAACCGTTGCTGGC+CGG + Chr6:72291560-72291579 None:intergenic 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
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Gene Sequence

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Protein sequence

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