AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680033665.01

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MsG0680033665.01.T01 AT1G74580 25.964 389 243 5 49 400 371 751 2.42e-36 142
MsG0680033665.01.T01 AT1G74580 23.569 297 223 3 125 418 23 318 1.50e-21 98.2
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MsG0680033665.01.T01 AT2G17140 25.366 205 150 2 216 417 44 248 3.65e-20 94.0
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MsG0680033665.01.T01 AT3G06920 23.711 291 214 3 126 413 99 384 2.07e-19 91.7
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MsG0680033665.01.T01 AT2G35130 25.000 396 253 6 30 421 84 439 4.38e-34 134
MsG0680033665.01.T01 AT2G35130 18.571 350 283 2 62 410 220 568 8.64e-19 89.4
MsG0680033665.01.T01 AT2G35130 21.333 300 230 2 120 416 243 539 4.03e-18 87.4
MsG0680033665.01.T01 AT2G35130 18.966 348 274 3 49 396 244 583 7.97e-15 77.0
MsG0680033665.01.T01 AT2G35130 27.682 289 208 1 134 421 148 436 5.89e-34 134
MsG0680033665.01.T01 AT2G35130 23.592 373 265 6 30 394 84 444 2.79e-30 123
MsG0680033665.01.T01 AT2G35130 18.551 345 280 1 66 410 222 565 6.54e-20 92.8
MsG0680033665.01.T01 AT2G35130 20.923 325 250 3 96 416 215 536 1.62e-19 91.7
MsG0680033665.01.T01 AT2G35130 19.048 378 296 4 19 396 213 580 4.77e-15 77.8
MsG0680033665.01.T01 AT5G08310 25.625 320 232 2 102 418 435 751 6.46e-34 135
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MsG0680033665.01.T01 AT5G62370 25.159 314 200 2 104 416 164 443 2.33e-20 94.7
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MsG0680033665.01.T01 AT5G62370 22.507 351 232 6 102 417 338 683 4.14e-15 78.2
MsG0680033665.01.T01 AT5G62370 21.384 318 206 7 132 408 50 364 2.97e-11 66.2
MsG0680033665.01.T01 AT4G20740 24.460 278 209 1 82 358 169 446 3.32e-29 121
MsG0680033665.01.T01 AT4G20740 22.137 393 262 6 57 411 216 602 3.07e-26 112
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MsG0680033665.01.T01 AT5G55740 24.375 320 228 5 103 418 234 543 2.56e-22 100
MsG0680033665.01.T01 AT5G55740 19.174 339 262 5 102 435 437 768 3.24e-11 65.9
MsG0680033665.01.T01 AT3G62540 25.097 259 192 2 133 390 290 547 2.59e-22 100
MsG0680033665.01.T01 AT3G62540 22.152 316 239 3 106 418 229 540 3.91e-20 93.6
MsG0680033665.01.T01 AT3G62540 21.538 260 202 1 61 320 290 547 9.50e-20 92.4
MsG0680033665.01.T01 AT3G62540 20.144 278 221 1 140 417 228 504 3.69e-17 84.3
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MsG0680033665.01.T01 AT3G13150 26.531 245 175 3 178 419 159 401 1.66e-21 97.4
MsG0680033665.01.T01 AT3G13150 23.721 215 159 2 230 439 141 355 9.82e-21 95.1
MsG0680033665.01.T01 AT3G13150 23.322 283 209 4 97 373 110 390 3.24e-19 90.5
MsG0680033665.01.T01 AT1G08070 25.517 290 204 4 104 393 97 374 1.35e-21 98.2
MsG0680033665.01.T01 AT1G08070 21.118 322 209 6 105 393 168 477 1.15e-11 67.4
MsG0680033665.01.T01 AT3G23020 22.616 367 271 6 50 412 314 671 1.86e-21 97.8
MsG0680033665.01.T01 AT3G23020 23.768 345 225 4 108 417 300 641 2.85e-18 88.2
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MsG0680033665.01.T01 AT1G53600 22.930 314 208 10 106 412 81 367 3.16e-12 68.9
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MsG0680033665.01.T01 AT1G14470 21.765 340 240 10 59 393 188 506 1.73e-12 69.7
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MsG0680033665.01.T01 AT1G68930 22.467 227 163 6 177 400 311 527 1.71e-11 66.6
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MsG0680033665.01.T01 AT5G15280 21.515 330 251 3 90 417 723 1046 5.23e-13 72.0
MsG0680033665.01.T01 AT5G15280 21.654 254 193 2 90 340 202 452 1.00e-12 70.9
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MsG0680033665.01.T01 AT3G29290 23.944 213 156 3 104 315 317 524 2.11e-12 69.3
MsG0680033665.01.T01 AT3G29290 23.944 213 156 3 104 315 317 524 2.11e-12 69.3
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MsG0680033665.01.T01 AT5G43790 23.077 351 226 15 86 412 49 379 6.85e-12 67.8
MsG0680033665.01.T01 AT3G57430 23.058 399 252 13 34 408 24 391 3.65e-12 68.9
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MsG0680033665.01.T01 AT2G36980 23.676 321 224 8 103 418 30 334 3.76e-12 68.9
MsG0680033665.01.T01 AT2G01390 22.826 276 205 4 104 378 53 321 4.24e-12 68.6
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MsG0680033665.01.T01 AT2G37310 24.057 212 153 2 194 405 283 486 5.24e-12 68.6
MsG0680033665.01.T01 AT2G37310 19.870 307 222 7 97 395 254 544 8.67e-11 64.7
MsG0680033665.01.T01 AT1G74630 21.676 346 214 10 90 393 48 378 7.10e-12 67.8
MsG0680033665.01.T01 AT5G61800 23.659 317 219 8 104 413 77 377 7.74e-12 67.4
MsG0680033665.01.T01 AT4G21065 26.404 178 123 2 233 410 10 179 8.08e-12 67.4
MsG0680033665.01.T01 AT1G74630 21.676 346 214 10 90 393 63 393 8.22e-12 67.8
MsG0680033665.01.T01 AT2G46050 20.144 278 201 7 142 414 209 470 8.43e-12 67.8
MsG0680033665.01.T01 AT2G40720 20.118 338 254 5 82 416 349 673 8.97e-12 67.8
MsG0680033665.01.T01 AT4G25270 25.000 172 123 2 230 401 146 311 1.01e-11 67.4
MsG0680033665.01.T01 AT2G20540 19.955 441 316 14 16 438 10 431 1.06e-11 67.0
MsG0680033665.01.T01 AT4G15720 31.373 153 98 3 223 374 76 222 1.12e-11 67.4
MsG0680033665.01.T01 AT1G13410 23.958 288 194 8 117 402 39 303 1.12e-11 67.0
MsG0680033665.01.T01 AT1G22830 22.807 342 213 11 105 405 249 580 1.13e-11 67.4
MsG0680033665.01.T01 AT1G22830 22.807 342 213 11 105 405 249 580 1.13e-11 67.4
MsG0680033665.01.T01 AT4G18840 24.215 223 159 5 87 304 247 464 1.26e-11 67.0
MsG0680033665.01.T01 AT4G18840 24.215 223 159 5 87 304 247 464 1.26e-11 67.0
MsG0680033665.01.T01 AT4G18840 24.215 223 159 5 87 304 247 464 1.26e-11 67.0
MsG0680033665.01.T01 AT1G25360 20.846 331 244 7 103 432 110 423 1.32e-11 67.4
MsG0680033665.01.T01 AT1G25360 24.281 313 224 5 82 393 124 424 1.40e-11 67.0
MsG0680033665.01.T01 AT5G27270 18.947 285 231 0 133 417 180 464 1.34e-11 67.4
MsG0680033665.01.T01 AT3G56550 22.472 356 255 9 62 412 64 403 1.39e-11 67.0
MsG0680033665.01.T01 AT3G56550 22.472 356 255 9 62 412 64 403 1.39e-11 67.0
MsG0680033665.01.T01 AT2G37320 21.603 287 212 6 103 385 181 458 1.42e-11 66.6
MsG0680033665.01.T01 AT3G47840 27.670 206 140 5 105 307 375 574 1.42e-11 67.0
MsG0680033665.01.T01 AT1G30610 21.212 297 203 7 125 416 526 796 1.47e-11 67.0
MsG0680033665.01.T01 AT1G30610 22.581 248 176 4 64 299 588 831 1.55e-11 67.0
MsG0680033665.01.T01 AT3G14330 23.744 219 155 3 197 415 261 467 1.52e-11 67.0
MsG0680033665.01.T01 AT4G38010 22.874 341 220 8 105 412 140 470 1.54e-11 66.6
MsG0680033665.01.T01 AT3G28640 23.502 217 157 5 200 412 172 383 1.59e-11 66.6
MsG0680033665.01.T01 AT5G39680 19.088 351 233 6 105 419 201 536 1.81e-11 66.6
MsG0680033665.01.T01 AT3G51320 22.121 330 229 6 94 415 71 380 1.84e-11 66.6
MsG0680033665.01.T01 AT2G27610 23.546 361 228 11 50 394 174 502 2.26e-11 66.6
MsG0680033665.01.T01 AT1G10330 20.712 309 228 6 109 412 54 350 2.27e-11 65.9
MsG0680033665.01.T01 AT4G08210 23.113 212 149 5 207 417 36 234 2.36e-11 66.2
MsG0680033665.01.T01 AT3G26630 21.222 311 226 7 100 408 46 339 2.68e-11 65.9
MsG0680033665.01.T01 AT5G27300 25.287 174 114 3 255 417 151 319 3.09e-11 65.9
MsG0680033665.01.T01 AT5G27300 25.444 169 110 3 260 417 156 319 3.11e-11 65.5
MsG0680033665.01.T01 AT5G27300 25.287 174 114 3 255 417 176 344 3.16e-11 65.9
MsG0680033665.01.T01 AT1G19520 22.041 245 188 3 176 418 349 592 3.83e-11 65.9
MsG0680033665.01.T01 AT4G16470 22.807 285 196 7 141 418 76 343 4.48e-11 65.1
MsG0680033665.01.T01 AT3G49142 21.069 318 231 5 105 417 104 406 5.01e-11 65.5
MsG0680033665.01.T01 AT3G13880 22.340 282 204 6 105 382 423 693 6.18e-11 65.1
MsG0680033665.01.T01 AT3G13880 18.644 354 239 8 105 418 213 557 6.87e-11 65.1
MsG0680033665.01.T01 AT1G05750 24.516 310 205 12 140 437 35 327 6.72e-11 64.7
MsG0680033665.01.T01 AT1G05750 24.516 310 205 12 140 437 35 327 6.72e-11 64.7
MsG0680033665.01.T01 AT3G09040 22.148 447 268 12 41 426 138 565 6.89e-11 65.1
MsG0680033665.01.T01 AT3G09040 22.148 447 268 12 41 426 138 565 6.89e-11 65.1
MsG0680033665.01.T01 AT1G56570 21.229 358 261 8 65 418 72 412 7.61e-11 64.7
MsG0680033665.01.T01 AT1G56570 21.229 358 261 8 65 418 72 412 7.61e-11 64.7
MsG0680033665.01.T01 AT1G60770 22.886 201 154 1 214 413 126 326 9.17e-11 64.3
MsG0680033665.01.T01 AT3G09040 22.148 447 268 12 41 426 113 540 9.29e-11 64.7
MsG0680033665.01.T01 AT3G09040 22.148 447 268 12 41 426 113 540 9.29e-11 64.7
MsG0680033665.01.T01 AT3G61170 22.623 305 213 7 103 400 54 342 9.61e-11 64.3

Find 79 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 89 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GAATTGTAAGTTACCATATT+AGG 0.223059 6:-70690305 None:intergenic
GATCAATGGCTTGTGTAAAA+TGG 0.237086 6:+70689701 MsG0680033665.01.T01:CDS
ACTTTCAATTCTCTAATCTA+TGG 0.237445 6:+70689897 MsG0680033665.01.T01:CDS
TTTGCTAAGATTCTCAAATT+AGG 0.238560 6:+70689540 MsG0680033665.01.T01:CDS
TGTTACCTACAATTCATTAA+TGG 0.245388 6:+70690103 MsG0680033665.01.T01:CDS
TGGATTCTGTAAGATTAAAA+TGG 0.249286 6:+70690232 MsG0680033665.01.T01:CDS
TTGTTAAATTCAACAATAGA+TGG 0.258673 6:-70689354 None:intergenic
AGCTATAGTATCATGATTAA+TGG 0.277695 6:+70690212 MsG0680033665.01.T01:CDS
AAGACGAATTGAAGGAAAAT+TGG 0.288085 6:+70689752 MsG0680033665.01.T01:CDS
AATTCTCTTTGTAATCATTT+CGG 0.306806 6:-70689859 None:intergenic
ACACTCATCTTCGATGATTA+GGG 0.317839 6:+70689227 MsG0680033665.01.T01:CDS
CCTAGTTAATGAAGTGTATA+AGG 0.319105 6:+70690136 MsG0680033665.01.T01:CDS
CAGAGGAATTGCTCCTAATA+TGG 0.321951 6:+70690292 MsG0680033665.01.T01:CDS
CACACTCATCTTCGATGATT+AGG 0.323486 6:+70689226 MsG0680033665.01.T01:CDS
TATTTCCCTTTCTCACCATT+TGG 0.331394 6:+70689425 MsG0680033665.01.T01:CDS
GGGAAATAGCAGTGAGATAA+TGG 0.362463 6:-70689410 None:intergenic
CATTTCGGAATATAATTCAT+AGG 0.366981 6:-70689844 None:intergenic
ATACTATAGCTATGAACATT+AGG 0.377122 6:-70690200 None:intergenic
ACTTACAATTCTCTAATTGA+TGG 0.378731 6:+70690317 MsG0680033665.01.T01:CDS
ATCAATGGCTTGTGTAAAAT+GGG 0.380915 6:+70689702 MsG0680033665.01.T01:CDS
GTTAAGCATTATTTCTAGAA+TGG 0.387332 6:+70690169 MsG0680033665.01.T01:CDS
AATAATGCTTAACACATGTT+TGG 0.395178 6:-70690159 None:intergenic
TCCTTTGACAAGTGTATTGA+AGG 0.397408 6:-70689583 None:intergenic
ATTAATTGTTACTGTCACTT+AGG 0.398083 6:+70689492 MsG0680033665.01.T01:CDS
CCTTATACACTTCATTAACT+AGG 0.398610 6:-70690136 None:intergenic
CACTTGAAACAAGTTAGTTA+TGG 0.399010 6:+70689672 MsG0680033665.01.T01:CDS
GTCAAAGGAATGTGTCTTAA+CGG 0.401830 6:+70689597 MsG0680033665.01.T01:CDS
CAAGACCATGTGATTGCACT+TGG 0.404275 6:+70689645 MsG0680033665.01.T01:CDS
GAATTGTAGGTAACAACATT+TGG 0.407429 6:-70690095 None:intergenic
TTAATTGTTACTGTCACTTA+GGG 0.408943 6:+70689493 MsG0680033665.01.T01:CDS
GTGCTATACATTACTACATC+AGG 0.409480 6:-70689780 None:intergenic
TTTGAGAATCTTAGCAAATA+CGG 0.419779 6:-70689535 None:intergenic
TTAAGCATTATTTCTAGAAT+GGG 0.421954 6:+70690170 MsG0680033665.01.T01:CDS
ATGCTAAAAGTATAAACATC+CGG 0.424043 6:-70689990 None:intergenic
TCCATCCATTAATGAATTGT+AGG 0.430371 6:-70690108 None:intergenic
AGTTATGGTACTTTGATCAA+TGG 0.430803 6:+70689687 MsG0680033665.01.T01:CDS
TCGTCCTCCTTTGAATGCCT+TGG 0.434426 6:-70690397 None:intergenic
ATGTTGAAAGTAGCAATATC+AGG 0.438708 6:-70689465 None:intergenic
TGTTAAATTCAACAATAGAT+GGG 0.472002 6:-70689353 None:intergenic
GGAATTCCAAATGGTGAGAA+AGG 0.474042 6:-70689431 None:intergenic
GAAGATGAGTGTGATTGAAA+TGG 0.477528 6:-70689216 None:intergenic
TGTATTGAAGGTTATAGTTG+TGG 0.487755 6:-70689571 None:intergenic
CAAATGTTAAGACGAATTGA+AGG 0.495525 6:+70689744 MsG0680033665.01.T01:CDS
AACCCTTCATCAAAAGATCC+TGG 0.502176 6:-70690443 None:intergenic
ATTGGTTGATGCTCTATGTA+AGG 0.504718 6:+70690013 MsG0680033665.01.T01:CDS
CTTTGGTATGTTCCATGAGA+TGG 0.511021 6:+70689950 MsG0680033665.01.T01:CDS
GTATTGAAGGTTATAGTTGT+GGG 0.516429 6:-70689570 None:intergenic
TAATTCTGTGGAATTCCAAA+TGG 0.527361 6:-70689440 None:intergenic
GAATTCCAAATGGTGAGAAA+GGG 0.538693 6:-70689430 None:intergenic
TTACTTCAATGTTGAACAAG+AGG 0.540842 6:+70689163 MsG0680033665.01.T01:CDS
TCAGTGGATTTAGAAATGAA+TGG 0.542298 6:-70689273 None:intergenic
CATTTCATTAAAGAGACTCA+TGG 0.543458 6:-70690264 None:intergenic
TGCTAAAAGTATAAACATCC+GGG 0.544842 6:-70689989 None:intergenic
ATAGCTGTGATGATGATAGA+AGG 0.545263 6:+70690065 MsG0680033665.01.T01:CDS
ACCTACAATTCATTAATGGA+TGG 0.551321 6:+70690107 MsG0680033665.01.T01:CDS
AAATTCAACAATAGATGGGG+TGG 0.570808 6:-70689349 None:intergenic
ATCGTTAACATCAAAATCAG+TGG 0.571086 6:-70689289 None:intergenic
TTAAAGACCAAGGCATTCAA+AGG 0.574207 6:+70690390 MsG0680033665.01.T01:CDS
GTTGATGCTCTATGTAAGGA+AGG 0.575458 6:+70690017 MsG0680033665.01.T01:CDS
AATTCGTCTTAACATTTGCA+AGG 0.577969 6:-70689739 None:intergenic
GTTAAATTCAACAATAGATG+GGG 0.585711 6:-70689352 None:intergenic
GTCAAGAAAATTAAAGACCA+AGG 0.588775 6:+70690380 MsG0680033665.01.T01:CDS
GAATTGAAAGTGACAACGGT+AGG 0.592206 6:-70689885 None:intergenic
TTTAATGAAATGCATTGCAG+AGG 0.597546 6:+70690275 MsG0680033665.01.T01:CDS
TGCTATACATTACTACATCA+GGG 0.599536 6:-70689779 None:intergenic
GTTGTTGTTAGACTTAACAA+TGG 0.600441 6:-70689388 None:intergenic
GTGTCTTAACGGTAAAGTCA+AGG 0.602781 6:+70689608 MsG0680033665.01.T01:CDS
GACGCATATGAAGCATTCGA+TGG 0.610052 6:-70689326 None:intergenic
AATTCAACAATAGATGGGGT+GGG 0.610409 6:-70689348 None:intergenic
ACCTTCAATACACTTGTCAA+AGG 0.614105 6:+70689582 MsG0680033665.01.T01:CDS
TATTGAAGGTTATAGTTGTG+GGG 0.629028 6:-70689569 None:intergenic
CAATATCAGGCATAATTCTG+TGG 0.640047 6:-70689452 None:intergenic
GAAATCCAAGTGCAATCACA+TGG 0.645395 6:-70689650 None:intergenic
AAGACCAAGGCATTCAAAGG+AGG 0.651455 6:+70690393 MsG0680033665.01.T01:CDS
TAATTGTTACTGTCACTTAG+GGG 0.662026 6:+70689494 MsG0680033665.01.T01:CDS
ATGTATAGCACAATCATCGA+CGG 0.662328 6:+70689792 MsG0680033665.01.T01:CDS
CATCTCATGGAACATACCAA+AGG 0.667290 6:-70689949 None:intergenic
TAGAGAATTGAAAGTGACAA+CGG 0.669177 6:-70689889 None:intergenic
TCAATGGCTTGTGTAAAATG+GGG 0.746418 6:+70689703 MsG0680033665.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AATTCTCTTTGTAATCATTT+CGG - Chr6:70689862-70689881 None:intergenic 20.0%
!! TGTTAAATTCAACAATAGAT+GGG - Chr6:70689356-70689375 None:intergenic 20.0%
!! TTGTTAAATTCAACAATAGA+TGG - Chr6:70689357-70689376 None:intergenic 20.0%
!!! GTTGAATTTAACAAGATTTT+AGG + Chr6:70689363-70689382 MsG0680033665.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGTTTATACTTTTAGCATAT+TGG + Chr6:70689995-70690014 MsG0680033665.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTAAGCATTATTTCTAGAAT+GGG + Chr6:70690170-70690189 MsG0680033665.01.T01:CDS 20.0%
! AATAATGCTTAACACATGTT+TGG - Chr6:70690162-70690181 None:intergenic 25.0%
! ACTTACAATTCTCTAATTGA+TGG + Chr6:70690317-70690336 MsG0680033665.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTTCAATTCTCTAATCTA+TGG + Chr6:70689897-70689916 MsG0680033665.01.T01:CDS 25.0%
! AGCTATAGTATCATGATTAA+TGG + Chr6:70690212-70690231 MsG0680033665.01.T01:CDS 25.0%
! ATACTATAGCTATGAACATT+AGG - Chr6:70690203-70690222 None:intergenic 25.0%
! CATTTCGGAATATAATTCAT+AGG - Chr6:70689847-70689866 None:intergenic 25.0%
! GAATTGTAAGTTACCATATT+AGG - Chr6:70690308-70690327 None:intergenic 25.0%
! GTTAAATTCAACAATAGATG+GGG - Chr6:70689355-70689374 None:intergenic 25.0%
! TGGATTCTGTAAGATTAAAA+TGG + Chr6:70690232-70690251 MsG0680033665.01.T01:CDS 25.0%
! TGTTACCTACAATTCATTAA+TGG + Chr6:70690103-70690122 MsG0680033665.01.T01:CDS 25.0%
! TTTGAGAATCTTAGCAAATA+CGG - Chr6:70689538-70689557 None:intergenic 25.0%
! TTTGCTAAGATTCTCAAATT+AGG + Chr6:70689540-70689559 MsG0680033665.01.T01:CDS 25.0%
!! ATCTATGGATTTTGCATTAT+TGG + Chr6:70689912-70689931 MsG0680033665.01.T01:CDS 25.0%
!! ATGCTAAAAGTATAAACATC+CGG - Chr6:70689993-70690012 None:intergenic 25.0%
!! ATTAATTGTTACTGTCACTT+AGG + Chr6:70689492-70689511 MsG0680033665.01.T01:CDS 25.0%
!! TTAATTGTTACTGTCACTTA+GGG + Chr6:70689493-70689512 MsG0680033665.01.T01:CDS 25.0%
!!! GTTAAGCATTATTTCTAGAA+TGG + Chr6:70690169-70690188 MsG0680033665.01.T01:CDS 25.0%
!!! TATTTTTGAATACCATCTCA+TGG - Chr6:70689965-70689984 None:intergenic 25.0%
AAGACGAATTGAAGGAAAAT+TGG + Chr6:70689752-70689771 MsG0680033665.01.T01:CDS 30.0%
AATTCGTCTTAACATTTGCA+AGG - Chr6:70689742-70689761 None:intergenic 30.0%
ACCTACAATTCATTAATGGA+TGG + Chr6:70690107-70690126 MsG0680033665.01.T01:CDS 30.0%
AGTTATGGTACTTTGATCAA+TGG + Chr6:70689687-70689706 MsG0680033665.01.T01:CDS 30.0%
ATCGTTAACATCAAAATCAG+TGG - Chr6:70689292-70689311 None:intergenic 30.0%
ATGTTGAAAGTAGCAATATC+AGG - Chr6:70689468-70689487 None:intergenic 30.0%
CAAATGTTAAGACGAATTGA+AGG + Chr6:70689744-70689763 MsG0680033665.01.T01:CDS 30.0%
CACTTGAAACAAGTTAGTTA+TGG + Chr6:70689672-70689691 MsG0680033665.01.T01:CDS 30.0%
CATTTCATTAAAGAGACTCA+TGG - Chr6:70690267-70690286 None:intergenic 30.0%
CCTAGTTAATGAAGTGTATA+AGG + Chr6:70690136-70690155 MsG0680033665.01.T01:CDS 30.0%
CCTTATACACTTCATTAACT+AGG - Chr6:70690139-70690158 None:intergenic 30.0%
GAATTGTAGGTAACAACATT+TGG - Chr6:70690098-70690117 None:intergenic 30.0%
GGTATTCAAAAATAACAACC+CGG + Chr6:70689971-70689990 MsG0680033665.01.T01:CDS 30.0%
GTATTGAAGGTTATAGTTGT+GGG - Chr6:70689573-70689592 None:intergenic 30.0%
GTCAAGAAAATTAAAGACCA+AGG + Chr6:70690380-70690399 MsG0680033665.01.T01:CDS 30.0%
TAATTCTGTGGAATTCCAAA+TGG - Chr6:70689443-70689462 None:intergenic 30.0%
TAGAGAATTGAAAGTGACAA+CGG - Chr6:70689892-70689911 None:intergenic 30.0%
TATTGAAGGTTATAGTTGTG+GGG - Chr6:70689572-70689591 None:intergenic 30.0%
TCCATCCATTAATGAATTGT+AGG - Chr6:70690111-70690130 None:intergenic 30.0%
TGCTATACATTACTACATCA+GGG - Chr6:70689782-70689801 None:intergenic 30.0%
TGTATTGAAGGTTATAGTTG+TGG - Chr6:70689574-70689593 None:intergenic 30.0%
TTACTTCAATGTTGAACAAG+AGG + Chr6:70689163-70689182 MsG0680033665.01.T01:CDS 30.0%
TTTAATGAAATGCATTGCAG+AGG + Chr6:70690275-70690294 MsG0680033665.01.T01:CDS 30.0%
! ATCAATGGCTTGTGTAAAAT+GGG + Chr6:70689702-70689721 MsG0680033665.01.T01:CDS 30.0%
! GTTGTTGTTAGACTTAACAA+TGG - Chr6:70689391-70689410 None:intergenic 30.0%
! TAATTGTTACTGTCACTTAG+GGG + Chr6:70689494-70689513 MsG0680033665.01.T01:CDS 30.0%
! TCAGTGGATTTAGAAATGAA+TGG - Chr6:70689276-70689295 None:intergenic 30.0%
! TGCTAAAAGTATAAACATCC+GGG - Chr6:70689992-70690011 None:intergenic 30.0%
AAATTCAACAATAGATGGGG+TGG - Chr6:70689352-70689371 None:intergenic 35.0%
AATTCAACAATAGATGGGGT+GGG - Chr6:70689351-70689370 None:intergenic 35.0%
ACACTCATCTTCGATGATTA+GGG + Chr6:70689227-70689246 MsG0680033665.01.T01:CDS 35.0%
ACCTTCAATACACTTGTCAA+AGG + Chr6:70689582-70689601 MsG0680033665.01.T01:CDS 35.0%
ATGTATAGCACAATCATCGA+CGG + Chr6:70689792-70689811 MsG0680033665.01.T01:CDS 35.0%
CAAAAATCGTCATGTTGACA+AGG + Chr6:70690346-70690365 MsG0680033665.01.T01:CDS 35.0%
CAATATCAGGCATAATTCTG+TGG - Chr6:70689455-70689474 None:intergenic 35.0%
GAAGATGAGTGTGATTGAAA+TGG - Chr6:70689219-70689238 None:intergenic 35.0%
GAATTCCAAATGGTGAGAAA+GGG - Chr6:70689433-70689452 None:intergenic 35.0%
GGTCAATTGAAAAAAGCCTT+TGG + Chr6:70689933-70689952 MsG0680033665.01.T01:CDS 35.0%
GTCAAAGGAATGTGTCTTAA+CGG + Chr6:70689597-70689616 MsG0680033665.01.T01:CDS 35.0%
GTGCTATACATTACTACATC+AGG - Chr6:70689783-70689802 None:intergenic 35.0%
TATTTCCCTTTCTCACCATT+TGG + Chr6:70689425-70689444 MsG0680033665.01.T01:CDS 35.0%
TCCTTTGACAAGTGTATTGA+AGG - Chr6:70689586-70689605 None:intergenic 35.0%
! ATAGCTGTGATGATGATAGA+AGG + Chr6:70690065-70690084 MsG0680033665.01.T01:CDS 35.0%
! ATTGGTTGATGCTCTATGTA+AGG + Chr6:70690013-70690032 MsG0680033665.01.T01:CDS 35.0%
! GATCAATGGCTTGTGTAAAA+TGG + Chr6:70689701-70689720 MsG0680033665.01.T01:CDS 35.0%
! TCAATGGCTTGTGTAAAATG+GGG + Chr6:70689703-70689722 MsG0680033665.01.T01:CDS 35.0%
! TTAAAGACCAAGGCATTCAA+AGG + Chr6:70690390-70690409 MsG0680033665.01.T01:CDS 35.0%
! TTCCAGGATCTTTTGATGAA+GGG + Chr6:70690441-70690460 MsG0680033665.01.T01:CDS 35.0%
! TTTCCAGGATCTTTTGATGA+AGG + Chr6:70690440-70690459 MsG0680033665.01.T01:CDS 35.0%
AACCCTTCATCAAAAGATCC+TGG - Chr6:70690446-70690465 None:intergenic 40.0%
CACACTCATCTTCGATGATT+AGG + Chr6:70689226-70689245 MsG0680033665.01.T01:CDS 40.0%
CAGAGGAATTGCTCCTAATA+TGG + Chr6:70690292-70690311 MsG0680033665.01.T01:CDS 40.0%
CATCTCATGGAACATACCAA+AGG - Chr6:70689952-70689971 None:intergenic 40.0%
CTTTGGTATGTTCCATGAGA+TGG + Chr6:70689950-70689969 MsG0680033665.01.T01:CDS 40.0%
GAAATCCAAGTGCAATCACA+TGG - Chr6:70689653-70689672 None:intergenic 40.0%
GAATTGAAAGTGACAACGGT+AGG - Chr6:70689888-70689907 None:intergenic 40.0%
GGAATTCCAAATGGTGAGAA+AGG - Chr6:70689434-70689453 None:intergenic 40.0%
GGGAAATAGCAGTGAGATAA+TGG - Chr6:70689413-70689432 None:intergenic 40.0%
GTGTCTTAACGGTAAAGTCA+AGG + Chr6:70689608-70689627 MsG0680033665.01.T01:CDS 40.0%
GTTGATGCTCTATGTAAGGA+AGG + Chr6:70690017-70690036 MsG0680033665.01.T01:CDS 40.0%
! GAATGCACAAGATGTTTTCC+AGG + Chr6:70690425-70690444 MsG0680033665.01.T01:CDS 40.0%
CAAGACCATGTGATTGCACT+TGG + Chr6:70689645-70689664 MsG0680033665.01.T01:CDS 45.0%
! AAGACCAAGGCATTCAAAGG+AGG + Chr6:70690393-70690412 MsG0680033665.01.T01:CDS 45.0%
! GACGCATATGAAGCATTCGA+TGG - Chr6:70689329-70689348 None:intergenic 45.0%
TCGTCCTCCTTTGAATGCCT+TGG - Chr6:70690400-70690419 None:intergenic 50.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 70689156 70690475 70689156 ID=MsG0680033665.01;Name=MsG0680033665.01
Chr6 mRNA 70689156 70690475 70689156 ID=MsG0680033665.01.T01;Parent=MsG0680033665.01;Name=MsG0680033665.01.T01;_AED=0.23;_eAED=0.23;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|439
Chr6 exon 70689156 70690475 70689156 ID=MsG0680033665.01.T01:exon:10814;Parent=MsG0680033665.01.T01
Chr6 CDS 70689156 70690475 70689156 ID=MsG0680033665.01.T01:cds;Parent=MsG0680033665.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680033665.01.T01

ATGTTGTTTACTTCAATGTTGAACAAGAGGTTCGTTTCTTACTCTCACAATTTTCTCATTCCATTTCAATCACACTCATCTTCGATGATTAGGGCTTCTTTCTCTCAATCTCTTCATCCATTCATTTCTAAATCCACTGATTTTGATGTTAACGATGATGTTTCTTCATTCCATCGAATGCTTCATATGCGTCCCACCCCATCTATTGTTGAATTTAACAAGATTTTAGGTTCCATTGTTAAGTCTAACAACAACCATTATCTCACTGCTATTTCCCTTTCTCACCATTTGGAATTCCACAGAATTATGCCTGATATTGCTACTTTCAACATTGTGATTAATTGTTACTGTCACTTAGGGGAAACGACTTTTGCTTTTTCCGTATTTGCTAAGATTCTCAAATTAGGTCATCACCCCACAACTATAACCTTCAATACACTTGTCAAAGGAATGTGTCTTAACGGTAAAGTCAAGGAAGCTCTACATTTTCAAGACCATGTGATTGCACTTGGATTTCACTTGAAACAAGTTAGTTATGGTACTTTGATCAATGGCTTGTGTAAAATGGGGAAAACAAGAGCTGCCTTGCAAATGTTAAGACGAATTGAAGGAAAATTGGTCAACCCTGATGTAGTAATGTATAGCACAATCATCGACGGTTTGTGTAAAGATAAACTTGTAAATGATGCCTATGAATTATATTCCGAAATGATTACAAAGAGAATTTCTCCTACCGTTGTCACTTTCAATTCTCTAATCTATGGATTTTGCATTATTGGTCAATTGAAAAAAGCCTTTGGTATGTTCCATGAGATGGTATTCAAAAATAACAACCCGGATGTTTATACTTTTAGCATATTGGTTGATGCTCTATGTAAGGAAGGAAAGATGAAAGAAGCTAAAAGTGTGATAGCTGTGATGATGATAGAAGGTGTGATACCAAATGTTGTTACCTACAATTCATTAATGGATGGATATTGCCTAGTTAATGAAGTGTATAAGGCCAAACATGTGTTAAGCATTATTTCTAGAATGGGAATGACTCCTAATGTTCATAGCTATAGTATCATGATTAATGGATTCTGTAAGATTAAAATGGTTAATGAAGCCATGAGTCTCTTTAATGAAATGCATTGCAGAGGAATTGCTCCTAATATGGTAACTTACAATTCTCTAATTGATGGTTTGTGCAAAAATCGTCATGTTGACAAGGCTATTGCGTTAGTCAAGAAAATTAAAGACCAAGGCATTCAAAGGAGGACGACTAAAGAATGCACAAGATGTTTTCCAGGATCTTTTGATGAAGGGTTAATAATCTAA
Protein sequence

>MsG0680033665.01.T01

MLFTSMLNKRFVSYSHNFLIPFQSHSSSMIRASFSQSLHPFISKSTDFDVNDDVSSFHRMLHMRPTPSIVEFNKILGSIVKSNNNHYLTAISLSHHLEFHRIMPDIATFNIVINCYCHLGETTFAFSVFAKILKLGHHPTTITFNTLVKGMCLNGKVKEALHFQDHVIALGFHLKQVSYGTLINGLCKMGKTRAALQMLRRIEGKLVNPDVVMYSTIIDGLCKDKLVNDAYELYSEMITKRISPTVVTFNSLIYGFCIIGQLKKAFGMFHEMVFKNNNPDVYTFSILVDALCKEGKMKEAKSVIAVMMIEGVIPNVVTYNSLMDGYCLVNEVYKAKHVLSIISRMGMTPNVHSYSIMINGFCKIKMVNEAMSLFNEMHCRGIAPNMVTYNSLIDGLCKNRHVDKAIALVKKIKDQGIQRRTTKECTRCFPGSFDEGLII*