AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680034621.01

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MsG0680034621.01.T01 AT5G41170 31.325 415 280 2 119 530 13 425 4.53e-70 232
MsG0680034621.01.T01 AT5G41170 33.520 358 234 2 1 355 71 427 4.40e-52 184
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MsG0680034621.01.T01 AT5G28370 26.667 435 309 4 133 559 244 676 5.80e-48 178
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MsG0680034621.01.T01 AT5G28370 28.198 344 243 3 9 351 372 712 3.60e-34 138
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MsG0680034621.01.T01 AT5G28370 26.357 258 188 2 5 261 439 695 3.47e-23 104
MsG0680034621.01.T01 AT5G28370 25.161 310 213 6 249 545 148 451 3.34e-21 98.2
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MsG0680034621.01.T01 AT5G24830 26.098 387 281 3 1 383 185 570 8.95e-40 153
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MsG0680034621.01.T01 AT1G53330 29.474 190 128 4 376 561 29 216 3.12e-16 80.9
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MsG0680034621.01.T01 AT2G19280 24.390 410 307 1 35 444 263 669 1.90e-41 159
MsG0680034621.01.T01 AT2G19280 24.096 415 312 1 59 473 252 663 1.77e-40 156
MsG0680034621.01.T01 AT2G19280 26.837 313 222 1 39 351 369 674 1.62e-38 150
MsG0680034621.01.T01 AT2G19280 25.850 441 322 3 46 485 204 640 1.13e-47 177
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MsG0680034621.01.T01 AT1G74900 26.667 315 227 3 204 517 112 423 3.18e-37 144
MsG0680034621.01.T01 AT1G74900 28.082 292 207 2 255 546 128 416 1.03e-36 142
MsG0680034621.01.T01 AT1G74900 25.172 290 214 2 275 564 113 399 2.21e-29 121
MsG0680034621.01.T01 AT1G74900 26.217 267 195 1 7 273 161 425 3.43e-27 115
MsG0680034621.01.T01 AT1G74900 26.693 251 174 2 10 251 198 447 5.74e-23 102
MsG0680034621.01.T01 AT1G74900 27.189 217 154 3 351 566 84 297 4.44e-18 87.4
MsG0680034621.01.T01 AT1G20300 26.879 346 251 2 115 459 188 532 6.43e-43 161
MsG0680034621.01.T01 AT1G20300 26.211 351 257 2 38 387 181 530 4.75e-39 150
MsG0680034621.01.T01 AT1G20300 24.058 345 259 2 146 490 151 492 9.66e-39 149
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MsG0680034621.01.T01 AT1G20300 24.042 287 211 3 35 317 247 530 1.71e-23 104
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MsG0680034621.01.T01 AT4G20740 21.788 358 275 4 205 561 215 568 2.17e-24 108
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MsG0680034621.01.T01 AT5G11310 25.521 384 268 6 108 477 130 509 4.92e-34 137
MsG0680034621.01.T01 AT5G11310 21.549 297 233 0 55 351 227 523 8.99e-25 108
MsG0680034621.01.T01 AT5G11310 21.287 202 158 1 10 211 323 523 5.82e-13 72.0
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MsG0680034621.01.T01 AT1G71060 24.629 337 221 2 186 490 131 466 1.04e-29 123
MsG0680034621.01.T01 AT1G71060 22.333 403 308 3 20 422 105 502 9.57e-27 114
MsG0680034621.01.T01 AT1G71060 21.719 221 169 3 345 564 114 331 9.90e-11 64.7
MsG0680034621.01.T01 AT2G35030 25.551 454 290 13 119 559 52 470 2.10e-37 147
MsG0680034621.01.T01 AT2G35030 25.344 363 237 9 204 565 32 361 5.28e-34 137
MsG0680034621.01.T01 AT2G35030 22.511 462 293 13 63 490 31 461 2.37e-28 120
MsG0680034621.01.T01 AT4G01400 31.679 262 177 2 4 264 151 411 7.02e-37 143
MsG0680034621.01.T01 AT4G01400 30.204 245 169 1 267 511 169 411 4.24e-35 138
MsG0680034621.01.T01 AT4G01400 27.273 319 221 2 46 358 122 435 2.15e-30 124
MsG0680034621.01.T01 AT4G01400 23.636 330 251 1 65 393 106 435 3.06e-30 124
MsG0680034621.01.T01 AT4G01400 25.767 326 237 3 168 488 100 425 2.28e-28 118
MsG0680034621.01.T01 AT4G01400 26.354 277 191 3 291 561 122 391 9.00e-27 114
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MsG0680034621.01.T01 AT3G59040 22.159 352 268 3 44 392 140 488 3.90e-31 128
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MsG0680034621.01.T01 AT3G59040 25.208 361 259 4 200 557 166 518 4.35e-34 137
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MsG0680034621.01.T01 AT3G59040 25.926 270 192 3 291 557 149 413 3.60e-26 113
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MsG0680034621.01.T01 AT3G59040 20.886 316 245 2 3 316 212 524 2.70e-20 95.1
MsG0680034621.01.T01 AT4G16390 26.183 317 233 1 147 462 174 490 4.87e-34 137
MsG0680034621.01.T01 AT4G16390 23.795 332 249 3 1 330 169 498 4.52e-25 110
MsG0680034621.01.T01 AT4G16390 20.415 289 229 1 254 542 176 463 3.09e-18 89.0
MsG0680034621.01.T01 AT4G16390 23.228 254 186 4 305 554 156 404 4.84e-17 85.1
MsG0680034621.01.T01 AT5G18950 25.806 341 246 4 38 377 140 474 4.98e-34 135
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MsG0680034621.01.T01 AT3G02650 28.750 320 218 3 152 465 235 550 1.44e-30 126
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MsG0680034621.01.T01 AT3G02650 25.773 291 199 5 270 557 223 499 1.64e-16 83.2
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MsG0680034621.01.T01 AT3G12770 21.591 528 354 12 73 566 17 518 1.73e-27 117
MsG0680034621.01.T01 AT1G80550 27.042 355 240 8 10 355 84 428 7.30e-31 125
MsG0680034621.01.T01 AT1G80550 23.691 401 297 6 31 427 35 430 2.15e-28 118
MsG0680034621.01.T01 AT1G80550 23.529 374 269 7 194 559 56 420 3.07e-28 118
MsG0680034621.01.T01 AT1G80550 21.404 285 213 4 8 287 152 430 3.62e-17 84.7
MsG0680034621.01.T01 AT3G04130 26.005 423 257 11 150 562 53 429 8.56e-31 126
MsG0680034621.01.T01 AT3G04130 23.474 426 312 8 29 450 79 494 2.95e-28 119
MsG0680034621.01.T01 AT3G04130 22.981 322 241 6 12 330 160 477 1.27e-19 92.8
MsG0680034621.01.T01 AT3G04130 24.731 279 203 5 290 566 123 396 4.99e-17 84.7
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MsG0680034621.01.T01 AT1G53600 21.896 443 285 11 77 482 176 594 2.37e-24 108
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MsG0680034621.01.T01 AT1G68930 21.277 517 359 13 58 563 21 500 6.16e-22 100
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MsG0680034621.01.T01 AT3G04750 23.743 358 250 9 3 352 193 535 1.09e-19 93.6
MsG0680034621.01.T01 AT3G04750 20.747 482 267 17 146 544 98 547 1.47e-13 73.9
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MsG0680034621.01.T01 AT5G18390 22.767 347 263 3 216 560 109 452 5.41e-27 114
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MsG0680034621.01.T01 AT5G18390 25.735 272 201 1 84 354 152 423 4.60e-19 90.5
MsG0680034621.01.T01 AT5G18390 22.712 295 228 0 13 307 152 446 2.20e-18 88.6
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MsG0680034621.01.T01 AT1G79490 21.918 365 282 2 45 407 245 608 1.17e-19 93.6
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MsG0680034621.01.T01 AT2G15980 24.454 229 166 5 319 542 241 467 2.98e-21 97.8
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MsG0680034621.01.T01 AT2G13600 22.656 256 181 5 291 544 22 262 7.50e-15 78.2
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MsG0680034621.01.T01 AT3G22690 20.611 524 349 13 10 489 102 602 2.92e-19 92.4
MsG0680034621.01.T01 AT3G22690 24.201 219 154 3 339 551 45 257 1.75e-13 73.9
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MsG0680034621.01.T01 AT2G33680 21.569 306 192 8 293 561 109 403 4.08e-11 66.2
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MsG0680034621.01.T01 AT3G14580 24.906 265 195 3 285 547 92 354 5.38e-20 92.8
MsG0680034621.01.T01 AT3G14580 22.358 246 185 1 116 361 141 380 2.65e-18 87.8
MsG0680034621.01.T01 AT3G14580 25.000 176 132 0 291 466 205 380 1.19e-14 76.6
MsG0680034621.01.T01 AT2G33680 21.176 595 366 14 1 549 76 613 1.81e-22 102
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MsG0680034621.01.T01 AT1G56570 20.155 516 371 13 14 512 3 494 1.58e-18 89.7
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MsG0680034621.01.T01 AT2G17210 19.288 534 366 14 33 529 108 613 1.21e-12 71.2
MsG0680034621.01.T01 AT2G17210 21.222 311 214 8 42 344 414 701 1.63e-12 70.9
MsG0680034621.01.T01 AT5G13270 21.505 465 284 8 152 549 52 502 1.14e-19 93.6
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MsG0680034621.01.T01 AT3G18840 25.281 356 246 7 108 459 18 357 1.63e-18 89.7
MsG0680034621.01.T01 AT1G06140 24.427 393 239 12 33 388 140 511 1.80e-18 89.4
MsG0680034621.01.T01 AT1G06140 22.018 327 238 5 232 556 123 434 3.21e-17 85.5
MsG0680034621.01.T01 AT1G06140 22.559 297 212 6 196 490 228 508 8.52e-16 80.9
MsG0680034621.01.T01 AT1G06140 19.309 492 324 9 49 491 10 477 6.98e-14 74.7
MsG0680034621.01.T01 AT4G21300 21.000 400 256 8 135 490 50 433 2.09e-18 89.7
MsG0680034621.01.T01 AT4G21300 19.373 542 351 13 39 512 200 723 2.53e-18 89.4
MsG0680034621.01.T01 AT4G21300 19.153 590 419 11 7 560 103 670 8.99e-18 87.8
MsG0680034621.01.T01 AT4G21300 20.769 520 323 15 11 460 278 778 3.44e-14 76.3
MsG0680034621.01.T01 AT3G22150 20.663 513 365 11 61 559 162 646 2.17e-18 89.7
MsG0680034621.01.T01 AT3G22150 22.165 388 255 8 43 429 353 694 8.72e-18 87.8
MsG0680034621.01.T01 AT3G22150 17.739 575 389 13 40 562 176 718 2.10e-12 70.5
MsG0680034621.01.T01 AT3G22150 18.835 515 324 11 120 557 46 543 1.25e-11 68.2
MsG0680034621.01.T01 AT3G22150 20.663 513 365 11 61 559 162 646 2.17e-18 89.7
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MsG0680034621.01.T01 AT1G13410 24.365 394 265 12 142 528 53 420 2.36e-18 88.6
MsG0680034621.01.T01 AT1G13410 23.958 288 160 7 294 544 34 299 1.86e-16 82.8
MsG0680034621.01.T01 AT1G13410 22.368 304 210 8 193 492 38 319 3.88e-12 68.9
MsG0680034621.01.T01 AT1G30610 22.609 345 242 7 12 353 474 796 2.49e-18 89.7
MsG0680034621.01.T01 AT1G30610 23.466 277 195 5 5 268 591 863 1.98e-14 77.0
MsG0680034621.01.T01 AT1G30610 21.579 380 257 10 207 552 458 830 1.58e-11 67.8
MsG0680034621.01.T01 AT2G40720 21.212 396 289 8 166 557 426 802 3.30e-18 89.0
MsG0680034621.01.T01 AT2G40720 21.642 536 353 11 33 561 229 704 1.69e-16 83.6
MsG0680034621.01.T01 AT2G40720 21.294 479 328 15 79 535 25 476 4.83e-14 75.9
MsG0680034621.01.T01 AT3G21470 23.944 355 242 8 195 549 63 389 3.67e-18 88.2
MsG0680034621.01.T01 AT3G21470 19.155 355 270 5 137 491 101 438 1.85e-15 79.7
MsG0680034621.01.T01 AT3G21470 24.082 245 163 7 319 561 77 300 7.45e-14 74.7
MsG0680034621.01.T01 AT3G21470 20.639 407 296 9 70 475 73 453 4.09e-13 72.4
MsG0680034621.01.T01 AT3G21470 23.980 196 145 1 42 237 238 429 2.30e-11 67.0
MsG0680034621.01.T01 AT5G13230 23.150 419 293 10 49 460 288 684 3.68e-18 89.0
MsG0680034621.01.T01 AT5G13230 21.390 561 384 14 33 559 37 574 5.81e-17 85.1
MsG0680034621.01.T01 AT5G13230 19.065 535 393 14 37 561 140 644 8.29e-16 81.6

Find 88 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 111 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATAAATGGATATTGTCTTAA+AGG 0.159261 6:+91382022 MsG0680034621.01.T01:CDS
AATTAGTTTGTTTAAGAAAA+TGG 0.195761 6:+91382375 MsG0680034621.01.T01:CDS
ACCTTCAATACACTTATAAA+TGG 0.229760 6:+91382007 MsG0680034621.01.T01:CDS
ATCAGTTCTCTTCTTGATAA+AGG 0.265812 6:+91383393 MsG0680034621.01.T01:CDS
ATTTACTTACAGTTCTATAT+TGG 0.269908 6:+91383053 MsG0680034621.01.T01:CDS
TTTGTTTAATAAAATGATAT+TGG 0.285944 6:+91382591 MsG0680034621.01.T01:CDS
TGTGTATACATTTAATATAT+TGG 0.308336 6:+91382420 MsG0680034621.01.T01:CDS
GAACTGTAAGTAAATATATT+TGG 0.311510 6:-91383045 None:intergenic
TTGTTTAATAAAATGATATT+GGG 0.320727 6:+91382592 MsG0680034621.01.T01:CDS
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ACATTTAATATATTGGTTGA+TGG 0.347546 6:+91382427 MsG0680034621.01.T01:CDS
ATATTGAAAGTGACTAAGTT+AGG 0.354814 6:-91381890 None:intergenic
CACATCAGGAAATATTTGTT+TGG 0.357083 6:-91382926 None:intergenic
TCGACAAGCTTCAAAGCATT+AGG 0.357529 6:-91382997 None:intergenic
ACTTATAGCTGTTTAATGTA+TGG 0.369081 6:+91382742 MsG0680034621.01.T01:CDS
GAGAAACAACGGTGGGATAA+TGG 0.369526 6:-91381832 None:intergenic
TTATGATAAGGTGGTAGGTT+TGG 0.373111 6:+91382069 MsG0680034621.01.T01:CDS
ACTTACAATACTCTACTTCA+TGG 0.380605 6:+91382322 MsG0680034621.01.T01:CDS
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CGACAAGCTTCAAAGCATTA+GGG 0.382737 6:-91382996 None:intergenic
GGTGGGATAATGGTTGGATT+TGG 0.385708 6:-91381822 None:intergenic
GTTTGATAAGTTACAGTGTC+TGG 0.386551 6:-91383366 None:intergenic
ACTTACAGTTCCCTTGTTGA+TGG 0.387522 6:+91382952 MsG0680034621.01.T01:CDS
CAGTTGAACCACGTTAGTTA+TGG 0.389742 6:+91382097 MsG0680034621.01.T01:CDS
CAGCTATAAGTGATAACATT+AGG 0.392789 6:-91382730 None:intergenic
TCCATTTATAAGTGTATTGA+AGG 0.393702 6:-91382008 None:intergenic
TAGTAAAAGTATACACATTC+GGG 0.412059 6:-91382624 None:intergenic
ATAGTAAAAGTATACACATT+CGG 0.419690 6:-91382625 None:intergenic
TTAAAATGGTGGATGAAGTC+AGG 0.431933 6:+91382881 MsG0680034621.01.T01:CDS
TTGGCGAAGATTATCAAGAT+TGG 0.440851 6:+91381965 MsG0680034621.01.T01:CDS
AACTCCTGCTTTCATCATCA+AGG 0.441695 6:-91382494 None:intergenic
TCTTCTTGATAAAGGTGAAA+AGG 0.450841 6:+91383401 MsG0680034621.01.T01:CDS
GTGTAAAGATAAACTTGTTA+AGG 0.452313 6:+91382243 MsG0680034621.01.T01:CDS
AACTGAGAGATGGGTGGGGC+GGG 0.452639 6:-91381776 None:intergenic
TATTAAATGTATACACAGTT+GGG 0.455474 6:-91382414 None:intergenic
GTATTGTAAGTGATAACATT+AGG 0.459832 6:-91382310 None:intergenic
TTGAATTGTTACAGCCACTT+AGG 0.460058 6:+91381917 MsG0680034621.01.T01:CDS
CTATGTGCTCAATGTGATGA+TGG 0.465117 6:+91382693 MsG0680034621.01.T01:CDS
ATTCAAAAGTATGACTCAAA+GGG 0.472224 6:+91382804 MsG0680034621.01.T01:CDS
ATAGTGTATGTGTACACATT+TGG 0.476377 6:-91383150 None:intergenic
TAATAAAATGATATTGGGAA+AGG 0.476511 6:+91382597 MsG0680034621.01.T01:CDS
GTATTGAAGGTAACAACATC+TGG 0.480108 6:-91381995 None:intergenic
ACTTATAGTACTTTAATTCG+TGG 0.482942 6:+91382532 MsG0680034621.01.T01:CDS
GAACTGTAAGTTACCACATC+AGG 0.489738 6:-91382940 None:intergenic
CTTCATGGCCTTTGCATCGT+GGG 0.492117 6:+91382337 MsG0680034621.01.T01:CDS
TGTTGATGGTTTGTGCAAAT+CGG 0.495809 6:+91382966 MsG0680034621.01.T01:CDS
ATATTAAATGTATACACAGT+TGG 0.499236 6:-91382415 None:intergenic
TTGATTAACAAATTATGTAA+AGG 0.500704 6:+91382124 MsG0680034621.01.T01:CDS
TGATAAAGGTGAAAAGGATA+AGG 0.502245 6:+91383407 MsG0680034621.01.T01:CDS
TTTAAAGAATTTAAAGACAA+GGG 0.508450 6:+91383120 MsG0680034621.01.T01:CDS
ATGGAAGACTAGAGGATGCA+TGG 0.508585 6:+91383196 MsG0680034621.01.T01:CDS
TTTGTTTAAGAAAATGGTAT+CGG 0.514447 6:+91382381 MsG0680034621.01.T01:CDS
AATCTTGTTAAACTGAGAGA+TGG 0.515664 6:-91381786 None:intergenic
ACTTGGACCGTTATGATCCA+TGG 0.518102 6:+91383273 MsG0680034621.01.T01:CDS
GGTAAATTGAAAGAAGCAGT+TGG 0.525382 6:+91382568 MsG0680034621.01.T01:CDS
ATTAACAAATTATGTAAAGG+TGG 0.527063 6:+91382127 MsG0680034621.01.T01:CDS
CAACTGTTGAGACAGGTTGA+TGG 0.527410 6:+91382169 MsG0680034621.01.T01:CDS
AACAACGGTGGGATAATGGT+TGG 0.532860 6:-91381828 None:intergenic
TATTCAAAAGTATGACTCAA+AGG 0.533229 6:+91382803 MsG0680034621.01.T01:CDS
AGCTCTTTCTACAAAATCCA+TGG 0.533362 6:-91383290 None:intergenic
CAAAACTCATTTGACCTAAG+TGG 0.536737 6:-91381931 None:intergenic
TGTTAAACTGAGAGATGGGT+GGG 0.555070 6:-91381781 None:intergenic
CAAACAAATATTTCCTGATG+TGG 0.555128 6:+91382927 MsG0680034621.01.T01:CDS
ATAATCGTAACAAATATACT+TGG 0.556071 6:+91383256 MsG0680034621.01.T01:CDS
GTCGATGAGATGCATGATAG+AGG 0.558821 6:+91383015 MsG0680034621.01.T01:CDS
ATCTTGTTAAACTGAGAGAT+GGG 0.560886 6:-91381785 None:intergenic
TCAATTGTCCCACGATGCAA+AGG 0.570380 6:-91382345 None:intergenic
AACCTGTCTCAACAGTTGTA+GGG 0.570658 6:-91382164 None:intergenic
CTGTAAGTAAATATATTTGG+TGG 0.570777 6:-91383042 None:intergenic
ATTTAAAGAATTTAAAGACA+AGG 0.575558 6:+91383119 MsG0680034621.01.T01:CDS
AGCCCTACAACTGTTGAGAC+AGG 0.575650 6:+91382162 MsG0680034621.01.T01:CDS
TGGAAGACTAGAGGATGCAT+GGG 0.577417 6:+91383197 MsG0680034621.01.T01:CDS
ACTTCATGGCCTTTGCATCG+TGG 0.597544 6:+91382336 MsG0680034621.01.T01:CDS
ACAAAATCCATGGATCATAA+CGG 0.600039 6:-91383280 None:intergenic
TTAGCCTTGATGATGAAAGC+AGG 0.607698 6:+91382490 MsG0680034621.01.T01:CDS
AAACTGAGAGATGGGTGGGG+CGG 0.612702 6:-91381777 None:intergenic
CGACAAAGAGAAACAACGGT+GGG 0.625902 6:-91381839 None:intergenic
TTGTTAAACTGAGAGATGGG+TGG 0.627127 6:-91381782 None:intergenic
AAGGTGAAAAGGATAAGGCA+AGG 0.634964 6:+91383412 MsG0680034621.01.T01:CDS
GTTAAACTGAGAGATGGGTG+GGG 0.651239 6:-91381780 None:intergenic
TTCAAAAGTATGACTCAAAG+GGG 0.653737 6:+91382805 MsG0680034621.01.T01:CDS
ATTTGCACAAACCATCAACA+AGG 0.653779 6:-91382963 None:intergenic
ACGTTGTACATTACTACATG+AGG 0.660558 6:-91382205 None:intergenic
TCTAGTTAATGAAGTGAACG+AGG 0.706493 6:+91382771 MsG0680034621.01.T01:CDS
TTTGCACAAACCATCAACAA+GGG 0.706778 6:-91382962 None:intergenic
TCAATGTACCATAACTAACG+TGG 0.720098 6:-91382105 None:intergenic
TCGACAAAGAGAAACAACGG+TGG 0.722960 6:-91381840 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TTGTTTAATAAAATGATATT+GGG + Chr6:91382592-91382611 MsG0680034621.01.T01:CDS 10.0%
!! TTTGTTTAATAAAATGATAT+TGG + Chr6:91382591-91382610 MsG0680034621.01.T01:CDS 10.0%
!! ATTTAAAGAATTTAAAGACA+AGG + Chr6:91383119-91383138 MsG0680034621.01.T01:CDS 15.0%
!! TGTGTATACATTTAATATAT+TGG + Chr6:91382420-91382439 MsG0680034621.01.T01:CDS 15.0%
!! TTGATTAACAAATTATGTAA+AGG + Chr6:91382124-91382143 MsG0680034621.01.T01:CDS 15.0%
!! TTTAAAGAATTTAAAGACAA+GGG + Chr6:91383120-91383139 MsG0680034621.01.T01:CDS 15.0%
!!! AATTAGTTTGTTTAAGAAAA+TGG + Chr6:91382375-91382394 MsG0680034621.01.T01:CDS 15.0%
!!! TAAATTTTGCAAGATTAAAA+TGG + Chr6:91382867-91382886 MsG0680034621.01.T01:CDS 15.0%
!! ATAAATGGATATTGTCTTAA+AGG + Chr6:91382022-91382041 MsG0680034621.01.T01:CDS 20.0%
!! ATAATCGTAACAAATATACT+TGG + Chr6:91383256-91383275 MsG0680034621.01.T01:CDS 20.0%
!! ATATTAAATGTATACACAGT+TGG - Chr6:91382418-91382437 None:intergenic 20.0%
!! ATTAACAAATTATGTAAAGG+TGG + Chr6:91382127-91382146 MsG0680034621.01.T01:CDS 20.0%
!! ATTTACTTACAGTTCTATAT+TGG + Chr6:91383053-91383072 MsG0680034621.01.T01:CDS 20.0%
!! GAACTGTAAGTAAATATATT+TGG - Chr6:91383048-91383067 None:intergenic 20.0%
!! TAATAAAATGATATTGGGAA+AGG + Chr6:91382597-91382616 MsG0680034621.01.T01:CDS 20.0%
!! TATTAAATGTATACACAGTT+GGG - Chr6:91382417-91382436 None:intergenic 20.0%
!! TTTGTTTAAGAAAATGGTAT+CGG + Chr6:91382381-91382400 MsG0680034621.01.T01:CDS 20.0%
!!! ACATACACTATTTTTATTGA+CGG + Chr6:91383162-91383181 MsG0680034621.01.T01:CDS 20.0%
!!! ACATTTAATATATTGGTTGA+TGG + Chr6:91382427-91382446 MsG0680034621.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATAGTAAAAGTATACACATT+CGG - Chr6:91382628-91382647 None:intergenic 20.0%
!!! TGTGTATACTTTTACTATAT+TGG + Chr6:91382630-91382649 MsG0680034621.01.T01:CDS 20.0%
! ACCTTCAATACACTTATAAA+TGG + Chr6:91382007-91382026 MsG0680034621.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTATAGCTGTTTAATGTA+TGG + Chr6:91382742-91382761 MsG0680034621.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTATAGTACTTTAATTCG+TGG + Chr6:91382532-91382551 MsG0680034621.01.T01:CDS 25.0%
! ATATTGAAAGTGACTAAGTT+AGG - Chr6:91381893-91381912 None:intergenic 25.0%
! CGAAAAATGGAATTAAATGA+CGG + Chr6:91381860-91381879 MsG0680034621.01.T01:CDS 25.0%
! CTGTAAGTAAATATATTTGG+TGG - Chr6:91383045-91383064 None:intergenic 25.0%
! GTATTGTAAGTGATAACATT+AGG - Chr6:91382313-91382332 None:intergenic 25.0%
! TCCATTTATAAGTGTATTGA+AGG - Chr6:91382011-91382030 None:intergenic 25.0%
!! ATTCAAAAGTATGACTCAAA+GGG + Chr6:91382804-91382823 MsG0680034621.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTTTGCAAGATTAAAATGG+TGG + Chr6:91382870-91382889 MsG0680034621.01.T01:CDS 25.0%
!! CATACTTTTGAATATTCTCT+TGG - Chr6:91382797-91382816 None:intergenic 25.0%
!! TAGTAAAAGTATACACATTC+GGG - Chr6:91382627-91382646 None:intergenic 25.0%
!! TATTCAAAAGTATGACTCAA+AGG + Chr6:91382803-91382822 MsG0680034621.01.T01:CDS 25.0%
!! TGCTTTATTGAAAAAACATC+AGG + Chr6:91383077-91383096 MsG0680034621.01.T01:CDS 25.0%
!!! GTGTAAAGATAAACTTGTTA+AGG + Chr6:91382243-91382262 MsG0680034621.01.T01:CDS 25.0%
AATCTTGTTAAACTGAGAGA+TGG - Chr6:91381789-91381808 None:intergenic 30.0%
ACAAAATCCATGGATCATAA+CGG - Chr6:91383283-91383302 None:intergenic 30.0%
ACTTACAATACTCTACTTCA+TGG + Chr6:91382322-91382341 MsG0680034621.01.T01:CDS 30.0%
ATAGTGTATGTGTACACATT+TGG - Chr6:91383153-91383172 None:intergenic 30.0%
ATCAGTTCTCTTCTTGATAA+AGG + Chr6:91383393-91383412 MsG0680034621.01.T01:CDS 30.0%
ATCTTGTTAAACTGAGAGAT+GGG - Chr6:91381788-91381807 None:intergenic 30.0%
CAAACAAATATTTCCTGATG+TGG + Chr6:91382927-91382946 MsG0680034621.01.T01:CDS 30.0%
CACATCAGGAAATATTTGTT+TGG - Chr6:91382929-91382948 None:intergenic 30.0%
CAGCTATAAGTGATAACATT+AGG - Chr6:91382733-91382752 None:intergenic 30.0%
TCTTCTTGATAAAGGTGAAA+AGG + Chr6:91383401-91383420 MsG0680034621.01.T01:CDS 30.0%
TGATAAAGGTGAAAAGGATA+AGG + Chr6:91383407-91383426 MsG0680034621.01.T01:CDS 30.0%
TGTTTCTCTTTGTCGAAAAA+TGG + Chr6:91381847-91381866 MsG0680034621.01.T01:CDS 30.0%
! TTCAAAAGTATGACTCAAAG+GGG + Chr6:91382805-91382824 MsG0680034621.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTCGACAAAGAGAAACAA+CGG - Chr6:91381846-91381865 None:intergenic 30.0%
!! ATTGACGGATTGTGTAAAAA+TGG + Chr6:91383177-91383196 MsG0680034621.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTGGTTGATGCTTTTTGTA+AGG + Chr6:91382648-91382667 MsG0680034621.01.T01:CDS 30.0%
!! GGAAGTTTTTGAAGATCTTT+TGG + Chr6:91383218-91383237 MsG0680034621.01.T01:CDS 30.0%
!! TTGATGCTTTTTGTAAGGAA+GGG + Chr6:91382653-91382672 MsG0680034621.01.T01:CDS 30.0%
!!! ATTGGTTGATGGATTTTGTA+AGG + Chr6:91382438-91382457 MsG0680034621.01.T01:CDS 30.0%
!!! GAGTTTTGCTTTTTCAGTAT+TGG + Chr6:91381946-91381965 MsG0680034621.01.T01:CDS 30.0%
ACGTTGTACATTACTACATG+AGG - Chr6:91382208-91382227 None:intergenic 35.0%
AGCTCTTTCTACAAAATCCA+TGG - Chr6:91383293-91383312 None:intergenic 35.0%
ATTTGCACAAACCATCAACA+AGG - Chr6:91382966-91382985 None:intergenic 35.0%
CAAAACTCATTTGACCTAAG+TGG - Chr6:91381934-91381953 None:intergenic 35.0%
GGTAAATTGAAAGAAGCAGT+TGG + Chr6:91382568-91382587 MsG0680034621.01.T01:CDS 35.0%
GTATTGAAGGTAACAACATC+TGG - Chr6:91381998-91382017 None:intergenic 35.0%
GTGTAAAAATGGAAGACTAG+AGG + Chr6:91383188-91383207 MsG0680034621.01.T01:CDS 35.0%
GTTTGATAAGTTACAGTGTC+TGG - Chr6:91383369-91383388 None:intergenic 35.0%
TATGATAAGGTGGTAGGTTT+GGG + Chr6:91382070-91382089 MsG0680034621.01.T01:CDS 35.0%
TCAATGTACCATAACTAACG+TGG - Chr6:91382108-91382127 None:intergenic 35.0%
TCTAGTTAATGAAGTGAACG+AGG + Chr6:91382771-91382790 MsG0680034621.01.T01:CDS 35.0%
TTATGATAAGGTGGTAGGTT+TGG + Chr6:91382069-91382088 MsG0680034621.01.T01:CDS 35.0%
TTGAATTGTTACAGCCACTT+AGG + Chr6:91381917-91381936 MsG0680034621.01.T01:CDS 35.0%
TTGGCGAAGATTATCAAGAT+TGG + Chr6:91381965-91381984 MsG0680034621.01.T01:CDS 35.0%
TTTGCACAAACCATCAACAA+GGG - Chr6:91382965-91382984 None:intergenic 35.0%
! ATTGCGCTTTTATGATAAGG+TGG + Chr6:91382060-91382079 MsG0680034621.01.T01:CDS 35.0%
! GCTATTGCGCTTTTATGATA+AGG + Chr6:91382057-91382076 MsG0680034621.01.T01:CDS 35.0%
! TGGATTTTGTAAGGAAGGAA+AGG + Chr6:91382447-91382466 MsG0680034621.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTGATGCTTTTTGTAAGGA+AGG + Chr6:91382652-91382671 MsG0680034621.01.T01:CDS 35.0%
!! TGTTGATGGTTTGTGCAAAT+CGG + Chr6:91382966-91382985 MsG0680034621.01.T01:CDS 35.0%
!! TTAAAATGGTGGATGAAGTC+AGG + Chr6:91382881-91382900 MsG0680034621.01.T01:CDS 35.0%
!!! GTTGATGGATTTTGTAAGGA+AGG + Chr6:91382442-91382461 MsG0680034621.01.T01:CDS 35.0%
AACCTGTCTCAACAGTTGTA+GGG - Chr6:91382167-91382186 None:intergenic 40.0%
AACTCCTGCTTTCATCATCA+AGG - Chr6:91382497-91382516 None:intergenic 40.0%
AAGGTGAAAAGGATAAGGCA+AGG + Chr6:91383412-91383431 MsG0680034621.01.T01:CDS 40.0%
ACTTACAGTTCCCTTGTTGA+TGG + Chr6:91382952-91382971 MsG0680034621.01.T01:CDS 40.0%
CAGTTGAACCACGTTAGTTA+TGG + Chr6:91382097-91382116 MsG0680034621.01.T01:CDS 40.0%
CTATGTGCTCAATGTGATGA+TGG + Chr6:91382693-91382712 MsG0680034621.01.T01:CDS 40.0%
GAACTGTAAGTTACCACATC+AGG - Chr6:91382943-91382962 None:intergenic 40.0%
TGTTAAACTGAGAGATGGGT+GGG - Chr6:91381784-91381803 None:intergenic 40.0%
TTGTTAAACTGAGAGATGGG+TGG - Chr6:91381785-91381804 None:intergenic 40.0%
! ATTCGTGGCTTTTGCATTGT+TGG + Chr6:91382547-91382566 MsG0680034621.01.T01:CDS 40.0%
! CGACAAGCTTCAAAGCATTA+GGG - Chr6:91382999-91383018 None:intergenic 40.0%
! CGCTTTTATGATAAGGTGGT+AGG + Chr6:91382064-91382083 MsG0680034621.01.T01:CDS 40.0%
! TCGACAAGCTTCAAAGCATT+AGG - Chr6:91383000-91383019 None:intergenic 40.0%
!! GAGACAGGTTGATGGTAAAT+TGG + Chr6:91382177-91382196 MsG0680034621.01.T01:CDS 40.0%
!! TTAGCCTTGATGATGAAAGC+AGG + Chr6:91382490-91382509 MsG0680034621.01.T01:CDS 40.0%
ACTTGGACCGTTATGATCCA+TGG + Chr6:91383273-91383292 MsG0680034621.01.T01:CDS 45.0%
ATGGAAGACTAGAGGATGCA+TGG + Chr6:91383196-91383215 MsG0680034621.01.T01:CDS 45.0%
CAACCTGTCTCAACAGTTGT+AGG - Chr6:91382168-91382187 None:intergenic 45.0%
CGACAAAGAGAAACAACGGT+GGG - Chr6:91381842-91381861 None:intergenic 45.0%
GAGAAACAACGGTGGGATAA+TGG - Chr6:91381835-91381854 None:intergenic 45.0%
GTCGATGAGATGCATGATAG+AGG + Chr6:91383015-91383034 MsG0680034621.01.T01:CDS 45.0%
GTTAAACTGAGAGATGGGTG+GGG - Chr6:91381783-91381802 None:intergenic 45.0%
TCAATTGTCCCACGATGCAA+AGG - Chr6:91382348-91382367 None:intergenic 45.0%
TCGACAAAGAGAAACAACGG+TGG - Chr6:91381843-91381862 None:intergenic 45.0%
TGGAAGACTAGAGGATGCAT+GGG + Chr6:91383197-91383216 MsG0680034621.01.T01:CDS 45.0%
! AACAACGGTGGGATAATGGT+TGG - Chr6:91381831-91381850 None:intergenic 45.0%
! CAACTGTTGAGACAGGTTGA+TGG + Chr6:91382169-91382188 MsG0680034621.01.T01:CDS 45.0%
! GGTGGGATAATGGTTGGATT+TGG - Chr6:91381825-91381844 None:intergenic 45.0%
ACTTCATGGCCTTTGCATCG+TGG + Chr6:91382336-91382355 MsG0680034621.01.T01:CDS 50.0%
AGCCCTACAACTGTTGAGAC+AGG + Chr6:91382162-91382181 MsG0680034621.01.T01:CDS 50.0%
CTTCATGGCCTTTGCATCGT+GGG + Chr6:91382337-91382356 MsG0680034621.01.T01:CDS 50.0%
AAACTGAGAGATGGGTGGGG+CGG - Chr6:91381780-91381799 None:intergenic 55.0%
AACTGAGAGATGGGTGGGGC+GGG - Chr6:91381779-91381798 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 91381770 91383470 91381770 ID=MsG0680034621.01;Name=MsG0680034621.01
Chr6 mRNA 91381770 91383470 91381770 ID=MsG0680034621.01.T01;Parent=MsG0680034621.01;Name=MsG0680034621.01.T01;_AED=0.48;_eAED=0.48;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|566
Chr6 exon 91381770 91383470 91381770 ID=MsG0680034621.01.T01:exon:12685;Parent=MsG0680034621.01.T01
Chr6 CDS 91381770 91383470 91381770 ID=MsG0680034621.01.T01:cds;Parent=MsG0680034621.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680034621.01.T01

ATGCATCCCGCCCCACCCATCTCTCAGTTTAACAAGATTTTAGCTTCACTTGCCAAATCCAACCATTATCCCACCGTTGTTTCTCTTTGTCGAAAAATGGAATTAAATGACGGAGTTAAACCTAACTTAGTCACTTTCAATATCTTGTTGAATTGTTACAGCCACTTAGGTCAAATGAGTTTTGCTTTTTCAGTATTGGCGAAGATTATCAAGATTGGTTATCATCCAGATGTTGTTACCTTCAATACACTTATAAATGGATATTGTCTTAAAGGTGAGAATGATGAGCTATTGCGCTTTTATGATAAGGTGGTAGGTTTGGGATTTCAGTTGAACCACGTTAGTTATGGTACATTGATTAACAAATTATGTAAAGGTGGAGAGACAAGAGAAGCCCTACAACTGTTGAGACAGGTTGATGGTAAATTGGTTCAGCCTCATGTAGTAATGTACAACGTGCTTATTGATAGAATGTGTAAAGATAAACTTGTTAAGGATGCTTTTGATTTATATTCTGAAATGCTTGCTAAGAGAATTTCTCCTAATGTTATCACTTACAATACTCTACTTCATGGCCTTTGCATCGTGGGACAATTGAAACATGCAATTAGTTTGTTTAAGAAAATGGTATCGGAAGACATCAACCCAACTGTGTATACATTTAATATATTGGTTGATGGATTTTGTAAGGAAGGAAAGGTGAAAGATGCTAAAGTAGTGTTAGCCTTGATGATGAAAGCAGGAGTTAAACTTAACGCTGTCACTTATAGTACTTTAATTCGTGGCTTTTGCATTGTTGGTAAATTGAAAGAAGCAGTTGGTTTGTTTAATAAAATGATATTGGGAAAGGTTAACCCGAATGTGTATACTTTTACTATATTGGTTGATGCTTTTTGTAAGGAAGGGAAGATTGACAAAGCTAACTATGTGCTCAATGTGATGATGGAAAAAGACGTGACACCTAATGTTATCACTTATAGCTGTTTAATGTATGGATATTGTCTAGTTAATGAAGTGAACGAGGCCAAGAGAATATTCAAAAGTATGACTCAAAGGGGAGTCACTTTTGACGTTCTTAGCTACACTATCATGATTAGTAAATTTTGCAAGATTAAAATGGTGGATGAAGTCAGGAAACTTTTTGAAGAAATGCAGTCCAAACAAATATTTCCTGATGTGGTAACTTACAGTTCCCTTGTTGATGGTTTGTGCAAATCGGAGAGAATCCCTAATGCTTTGAAGCTTGTCGATGAGATGCATGATAGAGGTCAACCACCAAATATATTTACTTACAGTTCTATATTGGATGCTTTATTGAAAAAACATCAGGTTGAAGAAGCAATTAAATTATTTAAAGAATTTAAAGACAAGGGTATTCAACCAAATGTGTACACATACACTATTTTTATTGACGGATTGTGTAAAAATGGAAGACTAGAGGATGCATGGGAAGTTTTTGAAGATCTTTTGGTCAATAGCTACAATCATAATCGTAACAAATATACTTGGACCGTTATGATCCATGGATTTTGTAGAAAGAGCTTGTTTGATGAAGCTTTGACGTTGCTGTCAAATATGAGAGACAACAGTTGCATTCCAGACACTGTAACTTATCAAACAATTATCAGTTCTCTTCTTGATAAAGGTGAAAAGGATAAGGCAAGGAAACTTCGTGAAATGATTGCGAGCAGTGTACTATAA
Protein sequence

>MsG0680034621.01.T01

MHPAPPISQFNKILASLAKSNHYPTVVSLCRKMELNDGVKPNLVTFNILLNCYSHLGQMSFAFSVLAKIIKIGYHPDVVTFNTLINGYCLKGENDELLRFYDKVVGLGFQLNHVSYGTLINKLCKGGETREALQLLRQVDGKLVQPHVVMYNVLIDRMCKDKLVKDAFDLYSEMLAKRISPNVITYNTLLHGLCIVGQLKHAISLFKKMVSEDINPTVYTFNILVDGFCKEGKVKDAKVVLALMMKAGVKLNAVTYSTLIRGFCIVGKLKEAVGLFNKMILGKVNPNVYTFTILVDAFCKEGKIDKANYVLNVMMEKDVTPNVITYSCLMYGYCLVNEVNEAKRIFKSMTQRGVTFDVLSYTIMISKFCKIKMVDEVRKLFEEMQSKQIFPDVVTYSSLVDGLCKSERIPNALKLVDEMHDRGQPPNIFTYSSILDALLKKHQVEEAIKLFKEFKDKGIQPNVYTYTIFIDGLCKNGRLEDAWEVFEDLLVNSYNHNRNKYTWTVMIHGFCRKSLFDEALTLLSNMRDNSCIPDTVTYQTIISSLLDKGEKDKARKLREMIASSVL*