AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680033732.01

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MsG0680033732.01.T01 AT1G64583 28.571 455 310 4 442 892 45 488 3.71e-54 197
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MsG0680033732.01.T01 AT2G32630 29.330 433 285 7 410 835 201 619 1.26e-51 192
MsG0680033732.01.T01 AT2G32630 27.737 411 297 0 173 583 209 619 1.26e-50 189
MsG0680033732.01.T01 AT2G32630 29.167 384 255 4 515 893 201 572 3.54e-43 167
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MsG0680033732.01.T01 AT5G16420 25.140 179 133 1 717 894 152 330 1.28e-16 84.7
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MsG0680033732.01.T01 AT1G77340 32.364 275 182 2 624 895 126 399 1.16e-37 146
MsG0680033732.01.T01 AT1G77340 27.622 286 196 2 366 651 123 397 2.18e-34 137
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MsG0680033732.01.T01 AT1G32415 23.292 322 195 8 149 429 396 706 2.06e-12 71.6
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MsG0680033732.01.T01 AT2G35030 23.282 524 344 15 159 675 52 524 2.84e-32 134
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MsG0680033732.01.T01 AT1G53330 30.798 263 181 1 291 552 46 308 1.74e-32 130
MsG0680033732.01.T01 AT1G53330 31.359 287 179 6 571 851 46 320 9.24e-31 125
MsG0680033732.01.T01 AT1G53330 24.671 304 217 4 362 664 47 339 5.09e-28 117
MsG0680033732.01.T01 AT1G53330 28.169 284 193 6 620 896 50 329 1.12e-26 113
MsG0680033732.01.T01 AT1G53330 23.203 306 198 3 152 421 47 351 2.52e-23 103
MsG0680033732.01.T01 AT1G53330 18.662 284 194 3 100 347 65 347 1.83e-12 70.5
MsG0680033732.01.T01 AT1G71210 23.099 710 465 17 228 889 187 863 7.34e-39 156
MsG0680033732.01.T01 AT1G71210 22.102 647 452 10 154 796 252 850 5.47e-31 131
MsG0680033732.01.T01 AT1G71210 21.333 600 416 7 298 890 187 737 2.96e-29 125
MsG0680033732.01.T01 AT1G71210 20.857 537 377 10 117 618 356 879 1.37e-22 104
MsG0680033732.01.T01 AT1G71210 21.461 438 259 7 464 895 139 497 1.14e-14 79.0
MsG0680033732.01.T01 AT1G16830 24.444 495 349 7 121 604 75 555 7.90e-39 154
MsG0680033732.01.T01 AT1G16830 23.026 456 297 6 475 891 115 555 1.08e-28 122
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MsG0680033732.01.T01 AT4G30825 22.695 564 355 6 144 637 340 892 3.73e-34 141
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MsG0680033732.01.T01 AT5G27270 20.260 691 506 11 105 763 210 887 2.82e-27 119
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MsG0680033732.01.T01 AT2G37230 21.670 503 340 6 106 560 243 739 4.35e-24 109
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MsG0680033732.01.T01 AT3G59040 23.297 279 205 3 619 891 175 450 4.52e-21 99.0
MsG0680033732.01.T01 AT3G59040 22.059 340 250 4 534 869 135 463 5.31e-20 95.5
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MsG0680033732.01.T01 AT5G43820 20.918 392 309 1 115 506 148 538 1.60e-23 106
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MsG0680033732.01.T01 AT5G43820 26.887 212 151 2 684 892 182 392 1.23e-15 81.6
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MsG0680033732.01.T01 AT1G14470 21.521 539 342 14 318 816 28 525 4.41e-25 111
MsG0680033732.01.T01 AT1G14470 22.256 328 212 4 152 447 197 513 6.31e-20 95.1
MsG0680033732.01.T01 AT1G14470 21.755 547 353 13 240 783 53 527 2.72e-19 93.2
MsG0680033732.01.T01 AT3G49240 23.128 454 318 11 309 745 111 550 1.24e-28 122
MsG0680033732.01.T01 AT3G49240 20.423 568 367 11 99 661 111 598 1.93e-27 119
MsG0680033732.01.T01 AT3G49240 23.690 439 262 10 469 887 131 516 2.70e-23 106
MsG0680033732.01.T01 AT3G49240 19.529 425 306 9 116 528 199 599 2.40e-17 87.4
MsG0680033732.01.T01 AT3G49240 21.575 292 181 5 648 891 160 451 1.01e-13 75.5
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MsG0680033732.01.T01 AT5G52850 23.256 559 358 12 106 660 213 704 1.03e-27 121
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MsG0680033732.01.T01 AT1G55890 20.536 224 139 3 93 280 157 377 1.07e-11 68.2
MsG0680033732.01.T01 AT4G33170 20.296 744 482 19 152 817 104 814 8.32e-25 112
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MsG0680033732.01.T01 AT1G26500 25.070 359 222 9 434 763 113 453 9.62e-17 84.7
MsG0680033732.01.T01 AT1G26500 22.667 375 223 8 184 496 104 473 1.09e-14 78.2
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MsG0680033732.01.T01 AT3G22150 20.392 765 522 22 164 894 50 761 5.23e-23 105
MsG0680033732.01.T01 AT3G22150 23.844 411 281 11 151 551 351 739 4.21e-22 102
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MsG0680033732.01.T01 AT1G05750 22.296 453 302 14 458 894 26 444 6.72e-15 79.0
MsG0680033732.01.T01 AT1G05750 25.490 408 252 10 154 523 37 430 6.02e-23 103
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MsG0680033732.01.T01 AT5G48910 22.408 299 213 4 172 459 111 401 1.19e-18 91.7
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MsG0680033732.01.T01 AT5G48910 23.103 290 212 5 153 441 239 518 1.89e-11 68.6
MsG0680033732.01.T01 AT5G48910 18.605 387 278 10 449 819 75 440 8.30e-11 66.2
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MsG0680033732.01.T01 AT5G56310 22.353 255 188 5 152 405 181 426 7.64e-12 69.3
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MsG0680033732.01.T01 AT5G46460 22.016 486 299 17 375 819 47 493 3.67e-18 90.1
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Find 158 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 276 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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AGCTATAATACTGTGATTAA+TGG 0.240503 6:-72367319 MsG0680033732.01.T01:CDS
GAATTGGGTAAAACCGTAAT+TGG 0.244080 6:-72368507 MsG0680033732.01.T01:CDS
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GAATTGTAAGTTACCTTATC+AGG 0.253352 6:+72367226 None:intergenic
CCTAGTTAATGAAGTTAATA+AGG 0.258508 6:-72367395 MsG0680033732.01.T01:CDS
ATTGATGGGCTGTGCAAATC+TGG 0.268227 6:-72364507 MsG0680033732.01.T01:CDS
TGTTACATATAATACATTAA+TGG 0.268547 6:-72364727 MsG0680033732.01.T01:CDS
GTAGAATTTAGCAAAATATT+AGG 0.269575 6:-72368162 MsG0680033732.01.T01:CDS
ACATATAATATTATGATTAA+TGG 0.269828 6:-72366899 MsG0680033732.01.T01:CDS
TTTACATAAAGCATGTAATA+AGG 0.276866 6:+72364407 None:intergenic
ATATTGTATGTGTTAATATT+TGG 0.292728 6:+72364324 None:intergenic
CCTGGTTAATGAAGTGAATA+AGG 0.296645 6:-72364694 MsG0680033732.01.T01:CDS
ATTGATGGTTTGTGCAAATC+AGG 0.297027 6:-72367199 MsG0680033732.01.T01:CDS
GAGAAAGATTGATGGGAAAT+TGG 0.304084 6:-72367779 MsG0680033732.01.T01:CDS
GATCAATGGTCTTTGTTTAG+AGG 0.306712 6:-72364193 MsG0680033732.01.T01:CDS
CTTCAACACTTCTCCAATTA+CGG 0.312489 6:+72368494 None:intergenic
GAGTTGTAAGTTACTGTATT+GGG 0.319149 6:+72364534 None:intergenic
ATGCTAAAAGTATAAACATT+TGG 0.324161 6:+72367541 None:intergenic
GTTTGAAAAGTCACAACATT+AGG 0.326879 6:+72364114 None:intergenic
TATGATTAATGGCCTTTGTT+TGG 0.332300 6:-72366888 MsG0680033732.01.T01:CDS
AACATCAACATGATTGGAAT+TGG 0.339381 6:+72368245 None:intergenic
TGGATTATGTAAGATGAAAA+TGG 0.341531 6:-72364598 MsG0680033732.01.T01:CDS
TCACACATACAATATACTTA+TGG 0.344460 6:-72367008 MsG0680033732.01.T01:CDS
CAATTGCCTTGTCAACTTGA+TGG 0.353343 6:+72367074 None:intergenic
GTCAAAGGTTTGTGTCTTAA+CGG 0.354733 6:-72367934 MsG0680033732.01.T01:CDS
GTATTATAGCTCAGGGCATT+AGG 0.356496 6:+72367331 None:intergenic
GCACTAAAAGTGACAACATT+TGG 0.359297 6:+72367646 None:intergenic
GATCAAAGGCTATAATTTAA+CGG 0.366664 6:-72366927 MsG0680033732.01.T01:CDS
CACGACCATGTGCTTGCACT+TGG 0.369532 6:-72367886 MsG0680033732.01.T01:CDS
AATTGAATGAAGTTACTTAT+GGG 0.370388 6:-72367858 MsG0680033732.01.T01:CDS
GTTTCAGCCACCAACTTGAT+TGG 0.376193 6:-72368440 MsG0680033732.01.T01:CDS
ACTTACAATTCTCTCATTGA+TGG 0.378731 6:-72367214 MsG0680033732.01.T01:CDS
GACAAGTGTATTTAAGGTAA+TGG 0.382854 6:+72367954 None:intergenic
TGCTAAAAGTATAAACATTT+GGG 0.383385 6:+72367542 None:intergenic
AGAGTTGTAAGTTACTGTAT+TGG 0.386121 6:+72364533 None:intergenic
CCTTATTAACTTCATTAACT+AGG 0.386191 6:+72367395 None:intergenic
TGTTTGTCAATACCATTTGA+TGG 0.389666 6:+72367569 None:intergenic
ATTTGGTTTGTTCCATCAAA+TGG 0.391410 6:-72367581 MsG0680033732.01.T01:CDS
TCTCACCGATTGGAATTTAA+CGG 0.394378 6:-72368096 MsG0680033732.01.T01:CDS
ACTTACAACTCTCTTATTGA+TGG 0.397999 6:-72364522 MsG0680033732.01.T01:CDS
ATTAGGTTCCCTTGTTAAGC+TGG 0.400963 6:-72368145 MsG0680033732.01.T01:CDS
GTATTTAAGGTAATGGTATC+AGG 0.401282 6:+72367961 None:intergenic
CACATCACAGCTGCTTTCAA+TGG 0.402375 6:-72368391 MsG0680033732.01.T01:CDS
TTGCTAAATTCTACAATGGA+TGG 0.411147 6:+72368171 None:intergenic
CTGGGAGAGTTTCTCATGCT+TGG 0.413177 6:-72364488 MsG0680033732.01.T01:CDS
CATTTCTGTGAAGAGATTCA+AGG 0.413995 6:+72364566 None:intergenic
GGTCAATTGAAAGAAGCATT+TGG 0.418578 6:-72367598 MsG0680033732.01.T01:CDS
AATAGTGCTTAAAACGTGTT+TGG 0.420903 6:+72367372 None:intergenic
ATGTATAGCACAATCATTGA+TGG 0.422198 6:-72367739 MsG0680033732.01.T01:CDS
TCCATCCATTAATGAATTGT+AGG 0.430371 6:+72367423 None:intergenic
ATCAATGGTCTTTGTTTAGA+GGG 0.441288 6:-72364192 MsG0680033732.01.T01:CDS
ATCAACAACATCAACATGAT+TGG 0.442025 6:+72368239 None:intergenic
ATTGGTTGATGCTCTTTGTA+AGG 0.444010 6:-72364817 MsG0680033732.01.T01:CDS
TAATCACAGTATTATAGCTC+AGG 0.445117 6:+72367323 None:intergenic
TATTTCCCTTTCTCACCGAT+TGG 0.445851 6:-72368106 MsG0680033732.01.T01:CDS
TCAATGGCTTGTGTAAAATT+GGG 0.447283 6:-72367828 MsG0680033732.01.T01:CDS
TTTCGCCAAAATTCTCAAGA+TGG 0.447359 6:-72367992 MsG0680033732.01.T01:CDS
GTTTCATAAGTTACAACATC+AGG 0.454066 6:+72366806 None:intergenic
TAATATTTGGTTGAATGCCT+TGG 0.461639 6:+72364337 None:intergenic
TAAATTCCAATCGGTGAGAA+AGG 0.463581 6:+72368100 None:intergenic
AAGCATGTATTCAACATCAT+AGG 0.465205 6:-72364669 MsG0680033732.01.T01:CDS
TTGCCAGATTTAAAGTTACC+TGG 0.465681 6:-72365844 MsG0680033732.01.T01:intron
TTTACATAAAGCATGTAAGA+AGG 0.467261 6:+72367099 None:intergenic
AAGGCTATAATTTAACGGTC+TGG 0.467830 6:-72366922 MsG0680033732.01.T01:CDS
TTTACACAAGCCATTGATCA+AGG 0.471807 6:+72367834 None:intergenic
CAGGGAAAATTTCTCATGCA+TGG 0.477292 6:-72367180 MsG0680033732.01.T01:CDS
TTCGCCAAAATTCTCAAGAT+GGG 0.478786 6:-72367991 MsG0680033732.01.T01:CDS
TTAAGCACTATTGCTCGAAT+GGG 0.478839 6:-72367361 MsG0680033732.01.T01:CDS
CAAAGGAATTGATCCTGATA+AGG 0.480888 6:-72367239 MsG0680033732.01.T01:CDS
ACTTATGGGACCTTGATCAA+TGG 0.481530 6:-72367844 MsG0680033732.01.T01:CDS
TGCTAAATTCTACAATGGAT+GGG 0.482277 6:+72368172 None:intergenic
ATTAATGGCCTTTGTTTGGA+GGG 0.483631 6:-72366884 MsG0680033732.01.T01:CDS
CTTGATCAGATGCGTGATAG+AGG 0.484425 6:-72364459 MsG0680033732.01.T01:CDS
ACAATTGATCAACATATTCA+AGG 0.485003 6:+72368053 None:intergenic
CCTTATTCACTTCATTAACC+AGG 0.487833 6:+72364694 None:intergenic
GAATTGTAAGTGATTACATT+GGG 0.488039 6:+72364429 None:intergenic
GTTGATGCTCTTTGTAAGGA+AGG 0.489370 6:-72364813 MsG0680033732.01.T01:CDS
GATTAATGGCCTTTGTTTGG+AGG 0.489494 6:-72366885 MsG0680033732.01.T01:CDS
CAATTGCCTTGTCAACAAGA+TGG 0.490316 6:+72364382 None:intergenic
TTGAAAATGATAAGAATGAA+AGG 0.494002 6:-72364074 MsG0680033732.01.T01:CDS
ATTAATGGACGGGTATTGCC+TGG 0.494771 6:-72364712 MsG0680033732.01.T01:CDS
ACATATAATATTATGATCAA+TGG 0.498176 6:-72364207 MsG0680033732.01.T01:CDS
TTTAAGCACTATTGCTCGAA+TGG 0.499266 6:-72367362 MsG0680033732.01.T01:CDS
CTTACAACTCTCTTATTGAT+GGG 0.504268 6:-72364521 MsG0680033732.01.T01:CDS
ATTGGTTGATGCTCTATGTA+AGG 0.504718 6:-72367518 MsG0680033732.01.T01:CDS
TAAAATGTTCTTTCTAGGAA+AGG 0.505667 6:+72368291 None:intergenic
CAAATGTTGAGAAAGATTGA+TGG 0.506629 6:-72367787 MsG0680033732.01.T01:CDS
GGAATTGTAAGTGATTACAT+TGG 0.507611 6:+72364428 None:intergenic
CACTATTGCTCGAATGGGAG+TGG 0.509512 6:-72367356 MsG0680033732.01.T01:CDS
TTTGATGAAATGCGGTTCAA+AGG 0.515033 6:-72367256 MsG0680033732.01.T01:CDS
CAACATGATTGGAATTGGAA+TGG 0.515107 6:+72368250 None:intergenic
ATGGATGGACTGTGCAAAGA+AGG 0.517167 6:-72366989 MsG0680033732.01.T01:CDS
ATCGATGGACTATGCAAAGA+AGG 0.523361 6:-72364297 MsG0680033732.01.T01:CDS
ATCAATTGTTACTGTCACCT+TGG 0.524528 6:-72368039 MsG0680033732.01.T01:CDS
AGGTTTGTGTCTTAACGGTA+AGG 0.529261 6:-72367929 MsG0680033732.01.T01:CDS
TGATCAAGCTATGATCCTGC+TGG 0.532133 6:-72366855 MsG0680033732.01.T01:CDS
TGAAAATGATAAGAATGAAA+GGG 0.538513 6:-72364073 MsG0680033732.01.T01:CDS
GCTAAATTCTACAATGGATG+GGG 0.538648 6:+72368173 None:intergenic
AAGTGATTACATTGGGAGGT+TGG 0.543128 6:+72364436 None:intergenic
AGTTGACAAGGCAATTGCAT+TGG 0.546091 6:-72367068 MsG0680033732.01.T01:CDS
CATATAATACATTAATGGAC+GGG 0.549942 6:-72364722 MsG0680033732.01.T01:CDS
AATCTTTCTCAACATTTGCA+AGG 0.550191 6:+72367792 None:intergenic
ACCTTAAATACACTTGTCAA+AGG 0.550200 6:-72367949 MsG0680033732.01.T01:CDS
ACCTACAATTCATTAATGGA+TGG 0.551321 6:-72367424 MsG0680033732.01.T01:CDS
AAATTCCAATCGGTGAGAAA+GGG 0.552004 6:+72368101 None:intergenic
TGTTGACAAGGCAATTGCAC+TGG 0.552283 6:-72364376 MsG0680033732.01.T01:CDS
TAGTTCCGTTAAATTCCAAT+CGG 0.554261 6:+72368091 None:intergenic
GAAGAGGCCAATCAAGTTGG+TGG 0.556748 6:+72368433 None:intergenic
GGTAATGCTCCAGCTTAACA+AGG 0.557718 6:+72368136 None:intergenic
ACATACAATATACTTATGGA+TGG 0.559282 6:-72367004 MsG0680033732.01.T01:CDS
ACATATAATACATTAATGGA+CGG 0.559804 6:-72364723 MsG0680033732.01.T01:CDS
TGCCAGATTTAAAGTTACCT+GGG 0.560358 6:-72365843 MsG0680033732.01.T01:intron
TGAGAAAGGGAAATAACAGT+TGG 0.562002 6:+72368114 None:intergenic
TTGATGGTTTGTGCAAATCA+GGG 0.562612 6:-72367198 MsG0680033732.01.T01:CDS
TTGTAAGGAAGGAAAGATCA+AGG 0.563106 6:-72364802 MsG0680033732.01.T01:CDS
CTTGATCAGATGCATGATAG+AGG 0.566685 6:-72367151 MsG0680033732.01.T01:CDS
GTGAAGACTCGTGTGGAAGA+AGG 0.568891 6:+72368411 None:intergenic
AGGGAAAATTTCTCATGCAT+GGG 0.569634 6:-72367179 MsG0680033732.01.T01:CDS
TGAGTCTCTTTGATGAAATG+CGG 0.570782 6:-72367264 MsG0680033732.01.T01:CDS
TTGATGGGCTGTGCAAATCT+GGG 0.573417 6:-72364506 MsG0680033732.01.T01:CDS
GTTGATGCTCTATGTAAGGA+AGG 0.575458 6:-72367514 MsG0680033732.01.T01:CDS
ACATACAATATACTTATCGA+TGG 0.576873 6:-72364312 MsG0680033732.01.T01:CDS
ACTCGTGTGGAAGAAGGAAG+AGG 0.579533 6:+72368417 None:intergenic
AAATGTTGAGAAAGATTGAT+GGG 0.583920 6:-72367786 MsG0680033732.01.T01:CDS
TTGTAAGTGATTACATTGGG+AGG 0.587737 6:+72364432 None:intergenic
GAGAAAGGGAAATAACAGTT+GGG 0.588148 6:+72368115 None:intergenic
AATTCTACAATGGATGGGGT+AGG 0.597764 6:+72368177 None:intergenic
GTATTATATGTAACAACAGT+AGG 0.601050 6:+72364735 None:intergenic
TTGTAAGTGAATGCATCTGC+AGG 0.608426 6:+72367124 None:intergenic
GAATATTTAGTTGAATGCAT+TGG 0.609074 6:+72367029 None:intergenic
GAAATCCAAGTGCAAGCACA+TGG 0.610248 6:+72367881 None:intergenic
AAGGAAGAGGCCAATCAAGT+TGG 0.611395 6:+72368430 None:intergenic
AATCACAGTATTATAGCTCA+GGG 0.612193 6:+72367324 None:intergenic
CAAACAATCCCTCCAAACAA+AGG 0.612764 6:+72366876 None:intergenic
GACAGAGCTACAACAGCACA+AGG 0.613804 6:+72368467 None:intergenic
CATTTCATCAAAGAGACTCA+AGG 0.619790 6:+72367267 None:intergenic
CTGCATCAGATAAAACTCCC+AGG 0.622680 6:+72365826 None:intergenic
CAATGGCTTGTGTAAAATTG+GGG 0.623224 6:-72367827 MsG0680033732.01.T01:CDS
ATATTGTAGCTATTAACAGT+AGG 0.644120 6:+72364630 None:intergenic
CTACGTGAAATGATTGCTAG+AGG 0.645793 6:-72366731 MsG0680033732.01.T01:CDS
GGGCTTGCTTGATGAAGCCG+AGG 0.649955 6:-72364172 MsG0680033732.01.T01:CDS
TAAAAGTATAAACATTTGGG+AGG 0.652180 6:+72367545 None:intergenic
CTGCGTGAAATGATTGCTAG+AGG 0.654129 6:-72364039 MsG0680033732.01.T01:CDS
TGCAGTTGAAAGTGACGCAG+AGG 0.668079 6:-72365808 MsG0680033732.01.T01:intron
ATAGCTGTGATGTTGAAAGA+TGG 0.669189 6:-72364765 MsG0680033732.01.T01:CDS
AGGCAAATCTCATTTGACCA+AGG 0.672760 6:+72368022 None:intergenic
GAAATTGGTCAACATCAATG+TGG 0.704660 6:-72367764 MsG0680033732.01.T01:CDS
ATAGCTGTGATGATGAGAGA+AGG 0.712175 6:-72367466 MsG0680033732.01.T01:CDS
GTAATGCTCCAGCTTAACAA+GGG 0.714199 6:+72368137 None:intergenic
TGTGATGTTGAAAGATGGCG+TGG 0.719795 6:-72364760 MsG0680033732.01.T01:CDS
CTGTGATGTGAAGACTCGTG+TGG 0.727648 6:+72368404 None:intergenic
ACAGAGCTACAACAGCACAA+GGG 0.760105 6:+72368468 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ACATATAATATTATGATTAA+TGG - Chr6:72365634-72365653 MsG0680033732.01.T01:intron 10.0%
!! ACATATAATATTATGATCAA+TGG - Chr6:72368326-72368345 MsG0680033732.01.T01:CDS 15.0%
!! ATATTGTATGTGTTAATATT+TGG + Chr6:72368212-72368231 None:intergenic 15.0%
!! TGTTACATATAATACATTAA+TGG - Chr6:72367806-72367825 MsG0680033732.01.T01:CDS 15.0%
!!! ACTTTTTTTATTTAGTATCT+CGG + Chr6:72366853-72366872 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTATTTTTATTTTTGCAC+AGG + Chr6:72367222-72367241 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTTTTTTTTGACATAGTT+GGG - Chr6:72366497-72366516 MsG0680033732.01.T01:intron 15.0%
!! AATTGAATGAAGTTACTTAT+GGG - Chr6:72364675-72364694 MsG0680033732.01.T01:CDS 20.0%
!! ACATATAATACATTAATGGA+CGG - Chr6:72367810-72367829 MsG0680033732.01.T01:CDS 20.0%
!! AGCTACAATATCATTATTAA+TGG - Chr6:72367915-72367934 MsG0680033732.01.T01:CDS 20.0%
!! CAACTATGTCAAAAAAAAAA+AGG + Chr6:72366498-72366517 None:intergenic 20.0%
!! GAATGAAGAAAACATATATT+AGG - Chr6:72366374-72366393 MsG0680033732.01.T01:intron 20.0%
!! GAGATACTAAATAAAAAAAG+TGG - Chr6:72366852-72366871 MsG0680033732.01.T01:CDS 20.0%
!! GTAGAATTTAGCAAAATATT+AGG - Chr6:72364371-72364390 MsG0680033732.01.T01:CDS 20.0%
!! TAAAAATGATGAGAATGATA+GGG - Chr6:72365768-72365787 MsG0680033732.01.T01:intron 20.0%
!! TGAAAAATATAACAGTATGA+AGG - Chr6:72367482-72367501 MsG0680033732.01.T01:CDS 20.0%
!! TGAAAATGATAAGAATGAAA+GGG - Chr6:72368460-72368479 MsG0680033732.01.T01:CDS 20.0%
!! TGTTATTATAATGATCGAAA+TGG - Chr6:72365950-72365969 MsG0680033732.01.T01:intron 20.0%
!! TTAAAAATGATGAGAATGAT+AGG - Chr6:72365767-72365786 MsG0680033732.01.T01:intron 20.0%
!! TTGAAAATGATAAGAATGAA+AGG - Chr6:72368459-72368478 MsG0680033732.01.T01:CDS 20.0%
!! TTTACATAAAGCATGTAATA+AGG + Chr6:72368129-72368148 None:intergenic 20.0%
!!! AACTCTTTTTAATTGAGATT+TGG - Chr6:72366622-72366641 MsG0680033732.01.T01:intron 20.0%
!!! ATGCTAAAAGTATAAACATT+TGG + Chr6:72364995-72365014 None:intergenic 20.0%
!!! CTTTTTTTTGTATTGGAATT+GGG - Chr6:72367423-72367442 MsG0680033732.01.T01:CDS 20.0%
!!! CTTTTTTTTTTTGACATAGT+TGG - Chr6:72366496-72366515 MsG0680033732.01.T01:intron 20.0%
!!! GTGAATTCTTTTTTTTGTAT+TGG - Chr6:72367416-72367435 MsG0680033732.01.T01:CDS 20.0%
!!! TACCATATAATTTTTGCATA+AGG - Chr6:72366229-72366248 MsG0680033732.01.T01:intron 20.0%
!!! TATTTTGCTAAATTCTACAA+TGG + Chr6:72364369-72364388 None:intergenic 20.0%
!!! TCATTTAGACAAATCATTTT+TGG - Chr6:72366404-72366423 MsG0680033732.01.T01:intron 20.0%
!!! TCTTTTTTTTGTATTGGAAT+TGG - Chr6:72367422-72367441 MsG0680033732.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGCTAAAAGTATAAACATTT+GGG + Chr6:72364994-72365013 None:intergenic 20.0%
!!! TGGATTTTGTAAGAATAAAA+TGG - Chr6:72365234-72365253 MsG0680033732.01.T01:intron 20.0%
!!! TGTTTATACTTTTAGCATAT+TGG - Chr6:72364997-72365016 MsG0680033732.01.T01:intron 20.0%
!!! TGTTTGTACTTTTAGTATAT+TGG - Chr6:72367698-72367717 MsG0680033732.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTCAAGATCTTTTCATTAA+AGG - Chr6:72368284-72368303 MsG0680033732.01.T01:CDS 20.0%
! AAATGTTGAGAAAGATTGAT+GGG - Chr6:72364747-72364766 MsG0680033732.01.T01:CDS 25.0%
! ACAATTGATCAACATATTCA+AGG + Chr6:72364483-72364502 None:intergenic 25.0%
! ACATACAATATACTTATCGA+TGG - Chr6:72368221-72368240 MsG0680033732.01.T01:CDS 25.0%
! ACATACAATATACTTATGGA+TGG - Chr6:72365529-72365548 MsG0680033732.01.T01:intron 25.0%
! ACTATACTTATTGTCAGTTT+CGG - Chr6:72366440-72366459 MsG0680033732.01.T01:intron 25.0%
! AGCTATAATACTGTGATTAA+TGG - Chr6:72365214-72365233 MsG0680033732.01.T01:intron 25.0%
! AGTAGTAAAATGTTCTTTCT+AGG + Chr6:72364250-72364269 None:intergenic 25.0%
! ATATTGTAGCTATTAACAGT+AGG + Chr6:72367906-72367925 None:intergenic 25.0%
! CAAATACTCCAAGAAAAATA+AGG + Chr6:72367397-72367416 None:intergenic 25.0%
! CAATTGAATGAAGTTACTTA+TGG - Chr6:72364674-72364693 MsG0680033732.01.T01:CDS 25.0%
! CCTAGTTAATGAAGTTAATA+AGG - Chr6:72365138-72365157 MsG0680033732.01.T01:intron 25.0%
! CCTTATTAACTTCATTAACT+AGG + Chr6:72365141-72365160 None:intergenic 25.0%
! GAATATTTAGTTGAATGCAT+TGG + Chr6:72365507-72365526 None:intergenic 25.0%
! GAATTGTAAGTGATTACATT+GGG + Chr6:72368107-72368126 None:intergenic 25.0%
! GATCAAAGGCTATAATTTAA+CGG - Chr6:72365606-72365625 MsG0680033732.01.T01:intron 25.0%
! GTATTATATGTAACAACAGT+AGG + Chr6:72367801-72367820 None:intergenic 25.0%
! TAGTCAAAAAATATTCAGCT+GGG - Chr6:72367063-72367082 MsG0680033732.01.T01:CDS 25.0%
! TCACACATACAATATACTTA+TGG - Chr6:72365525-72365544 MsG0680033732.01.T01:intron 25.0%
! TGGATTATGTAAGATGAAAA+TGG - Chr6:72367935-72367954 MsG0680033732.01.T01:CDS 25.0%
! TGTTACCTACAATTCATTAA+TGG - Chr6:72365105-72365124 MsG0680033732.01.T01:intron 25.0%
! TTATATGGTACAAACACAAA+AGG + Chr6:72366219-72366238 None:intergenic 25.0%
! TTCAAAAAGCTCCAATTATT+TGG + Chr6:72366292-72366311 None:intergenic 25.0%
! TTTAAATCTGGCAACAAAAA+GGG + Chr6:72366683-72366702 None:intergenic 25.0%
! TTTACATAAAGCATGTAAGA+AGG + Chr6:72365437-72365456 None:intergenic 25.0%
!! AAATAATTGGAGCTTTTTGA+AGG - Chr6:72366291-72366310 MsG0680033732.01.T01:intron 25.0%
!! AATAATTGGAGCTTTTTGAA+GGG - Chr6:72366292-72366311 MsG0680033732.01.T01:intron 25.0%
!! AGCCTTATGCAAAAATTATA+TGG + Chr6:72366234-72366253 None:intergenic 25.0%
!! ATTTTCGTCATATTGTTGTA+TGG - Chr6:72366025-72366044 MsG0680033732.01.T01:intron 25.0%
!! CATATAATACATTAATGGAC+GGG - Chr6:72367811-72367830 MsG0680033732.01.T01:CDS 25.0%
!! CTATGATATCAGTTTGAAAT+TGG - Chr6:72366827-72366846 MsG0680033732.01.T01:CDS 25.0%
!! CTTCTGTAAAAGTATATTCA+AGG + Chr6:72366355-72366374 None:intergenic 25.0%
!! GATCATACTTATCAGTTTTT+GGG - Chr6:72366944-72366963 MsG0680033732.01.T01:CDS 25.0%
!! TAAAAGTATAAACATTTGGG+AGG + Chr6:72364991-72365010 None:intergenic 25.0%
!! TAAAATGTTCTTTCTAGGAA+AGG + Chr6:72364245-72364264 None:intergenic 25.0%
!! TATTCATTTTGTGATGAGTA+TGG - Chr6:72365887-72365906 MsG0680033732.01.T01:intron 25.0%
!! TGATCATACTTATCAGTTTT+TGG - Chr6:72366943-72366962 MsG0680033732.01.T01:CDS 25.0%
!!! AATTTTGGCGAAAATAGAAA+AGG + Chr6:72364534-72364553 None:intergenic 25.0%
!!! AGCTAGTTTTTATATGTTGT+TGG + Chr6:72366599-72366618 None:intergenic 25.0%
!!! ATATTCTTTGAAGTCATTGT+TGG - Chr6:72366266-72366285 MsG0680033732.01.T01:intron 25.0%
!!! GATTGATACCTTATTTTTCT+TGG - Chr6:72367386-72367405 MsG0680033732.01.T01:CDS 25.0%
!!! GTATGGATTTTTTCATTCAT+TGG - Chr6:72366042-72366061 MsG0680033732.01.T01:intron 25.0%
!!! TCTTTTTAATTGAGATTTGG+AGG - Chr6:72366625-72366644 MsG0680033732.01.T01:intron 25.0%
AAATGCCCTTCGATAAAAAT+GGG + Chr6:72367297-72367316 None:intergenic 30.0%
AAATGCTTCTTCCATATGAA+TGG + Chr6:72366136-72366155 None:intergenic 30.0%
AACATCAACATGATTGGAAT+TGG + Chr6:72364291-72364310 None:intergenic 30.0%
AACTGACAATAAGTATAGTG+AGG + Chr6:72366439-72366458 None:intergenic 30.0%
AAGCATGTATTCAACATCAT+AGG - Chr6:72367864-72367883 MsG0680033732.01.T01:CDS 30.0%
AATAGTGCTTAAAACGTGTT+TGG + Chr6:72365164-72365183 None:intergenic 30.0%
AATCACAGTATTATAGCTCA+GGG + Chr6:72365212-72365231 None:intergenic 30.0%
AATCTTTCTCAACATTTGCA+AGG + Chr6:72364744-72364763 None:intergenic 30.0%
AATGCTTCTTCCATATGAAT+GGG + Chr6:72366135-72366154 None:intergenic 30.0%
ACCTACAATTCATTAATGGA+TGG - Chr6:72365109-72365128 MsG0680033732.01.T01:intron 30.0%
ACCTTAAATACACTTGTCAA+AGG - Chr6:72364584-72364603 MsG0680033732.01.T01:CDS 30.0%
ACCTTTGACAAGTGTATTTA+AGG + Chr6:72364588-72364607 None:intergenic 30.0%
ACTTACAATTCTCTCATTGA+TGG - Chr6:72365319-72365338 MsG0680033732.01.T01:intron 30.0%
AGATGATTAACAATGCTGAT+AGG + Chr6:72366475-72366494 None:intergenic 30.0%
ATCAACAACATCAACATGAT+TGG + Chr6:72364297-72364316 None:intergenic 30.0%
ATGTATAGCACAATCATTGA+TGG - Chr6:72364794-72364813 MsG0680033732.01.T01:CDS 30.0%
CAAACATCAATACCATTTCA+TGG + Chr6:72367684-72367703 None:intergenic 30.0%
CAAATGTTGAGAAAGATTGA+TGG - Chr6:72364746-72364765 MsG0680033732.01.T01:CDS 30.0%
CAAATTGCATCAAGTTTCTA+TGG + Chr6:72367043-72367062 None:intergenic 30.0%
CTGGAAAAAATGGAAGAAAA+TGG - Chr6:72365697-72365716 MsG0680033732.01.T01:intron 30.0%
CTTACTGCAAAATTGAAAGT+AGG - Chr6:72366972-72366991 MsG0680033732.01.T01:CDS 30.0%
CTTTAAATCTGGCAACAAAA+AGG + Chr6:72366684-72366703 None:intergenic 30.0%
GAATTGTAAGTTACCTTATC+AGG + Chr6:72365310-72365329 None:intergenic 30.0%
GCACTAAAAGTGAAAACATT+TGG + Chr6:72367607-72367626 None:intergenic 30.0%
GCATTTGGAAGGAAAATATA+AGG - Chr6:72367311-72367330 MsG0680033732.01.T01:CDS 30.0%
GGAATTGTAAGTGATTACAT+TGG + Chr6:72368108-72368127 None:intergenic 30.0%
GTAGTCAAAAAATATTCAGC+TGG - Chr6:72367062-72367081 MsG0680033732.01.T01:CDS 30.0%
GTTTCATAAGTTACAACATC+AGG + Chr6:72365730-72365749 None:intergenic 30.0%
GTTTGAAAAGTCACAACATT+AGG + Chr6:72368422-72368441 None:intergenic 30.0%
TAAAAACCATCTTGTTGACA+AGG - Chr6:72368145-72368164 MsG0680033732.01.T01:CDS 30.0%
TAATATTTGGTTGAATGCCT+TGG + Chr6:72368199-72368218 None:intergenic 30.0%
TAATCACAGTATTATAGCTC+AGG + Chr6:72365213-72365232 None:intergenic 30.0%
TACATGAACCATTTAAACTC+AGG + Chr6:72366106-72366125 None:intergenic 30.0%
TAGGGATTTCAATTAGTAAG+AGG - Chr6:72367188-72367207 MsG0680033732.01.T01:CDS 30.0%
TAGTTCCGTTAAATTCCAAT+CGG + Chr6:72364445-72364464 None:intergenic 30.0%
TATGATTAATGGCCTTTGTT+TGG - Chr6:72365645-72365664 MsG0680033732.01.T01:intron 30.0%
TCAATTCTGATAGTTAACAG+AGG - Chr6:72367250-72367269 MsG0680033732.01.T01:CDS 30.0%
TCCATCCATTAATGAATTGT+AGG + Chr6:72365113-72365132 None:intergenic 30.0%
TGCTAAATTCTACAATGGAT+GGG + Chr6:72364364-72364383 None:intergenic 30.0%
TGTTTGTCAATACCATTTGA+TGG + Chr6:72364967-72364986 None:intergenic 30.0%
TTGCTAAATTCTACAATGGA+TGG + Chr6:72364365-72364384 None:intergenic 30.0%
TTGTCAAAAATGGAAGACTA+TGG - Chr6:72368389-72368408 MsG0680033732.01.T01:CDS 30.0%
! ACTTTTAGTGCTCTTATCTA+CGG - Chr6:72364899-72364918 MsG0680033732.01.T01:intron 30.0%
! ATAACCCATCTTGAGAATTT+TGG + Chr6:72364549-72364568 None:intergenic 30.0%
! ATATTTTTCATCAGCAAGCT+AGG + Chr6:72367472-72367491 None:intergenic 30.0%
! ATCAATGGCTTGTGTAAAAT+TGG - Chr6:72364704-72364723 MsG0680033732.01.T01:CDS 30.0%
! ATCAATGGTCTTTGTTTAGA+GGG - Chr6:72368341-72368360 MsG0680033732.01.T01:CDS 30.0%
! ATTGGAATTGGGAGTATATT+AGG - Chr6:72367434-72367453 MsG0680033732.01.T01:CDS 30.0%
! GACAAGTGTATTTAAGGTAA+TGG + Chr6:72364582-72364601 None:intergenic 30.0%
! GTATTTAAGGTAATGGTATC+AGG + Chr6:72364575-72364594 None:intergenic 30.0%
! TCAATGGCTTGTGTAAAATT+GGG - Chr6:72364705-72364724 MsG0680033732.01.T01:CDS 30.0%
! TTGGAATTGGGAGTATATTA+GGG - Chr6:72367435-72367454 MsG0680033732.01.T01:CDS 30.0%
! TTTCAGGATCTTTTGATCAA+AGG - Chr6:72365592-72365611 MsG0680033732.01.T01:intron 30.0%
!! ATTTGGTTTGTTCCATCAAA+TGG - Chr6:72364952-72364971 MsG0680033732.01.T01:intron 30.0%
!! GGAAAGTTTGATTGATTTTG+TGG - Chr6:72366993-72367012 MsG0680033732.01.T01:CDS 30.0%
!! GTCAAGAATTTTAAAGACCA+AGG - Chr6:72368179-72368198 MsG0680033732.01.T01:CDS 30.0%
!! GTTTAGTTTGTTCCATGAAA+TGG - Chr6:72367669-72367688 MsG0680033732.01.T01:CDS 30.0%
!! TAAAAACCATCAAGTTGACA+AGG - Chr6:72365453-72365472 MsG0680033732.01.T01:intron 30.0%
AAACCATCAATGATTGTGCT+AGG + Chr6:72364800-72364819 None:intergenic 35.0%
AAATTCCAATCGGTGAGAAA+GGG + Chr6:72364435-72364454 None:intergenic 35.0%
AAGGCTATAATTTAACGGTC+TGG - Chr6:72365611-72365630 MsG0680033732.01.T01:intron 35.0%
AGGGAAAATTTCTCATGCAT+GGG - Chr6:72365354-72365373 MsG0680033732.01.T01:intron 35.0%
ATAGCTGTGATGTTGAAAGA+TGG - Chr6:72367768-72367787 MsG0680033732.01.T01:CDS 35.0%
ATCAATTGTTACTGTCACCT+TGG - Chr6:72364494-72364513 MsG0680033732.01.T01:CDS 35.0%
ATGCTTCTTCCATATGAATG+GGG + Chr6:72366134-72366153 None:intergenic 35.0%
ATTCTGATAGTTAACAGAGG+AGG - Chr6:72367253-72367272 MsG0680033732.01.T01:CDS 35.0%
CAAAGGAATTGATCCTGATA+AGG - Chr6:72365294-72365313 MsG0680033732.01.T01:intron 35.0%
CAAATGCCCTTCGATAAAAA+TGG + Chr6:72367298-72367317 None:intergenic 35.0%
CAACATGATTGGAATTGGAA+TGG + Chr6:72364286-72364305 None:intergenic 35.0%
CATTTCATCAAAGAGACTCA+AGG + Chr6:72365269-72365288 None:intergenic 35.0%
CATTTCTGTGAAGAGATTCA+AGG + Chr6:72367970-72367989 None:intergenic 35.0%
CCTGGTTAATGAAGTGAATA+AGG - Chr6:72367839-72367858 MsG0680033732.01.T01:CDS 35.0%
CCTTATTCACTTCATTAACC+AGG + Chr6:72367842-72367861 None:intergenic 35.0%
CTTCAACACTTCTCCAATTA+CGG + Chr6:72364042-72364061 None:intergenic 35.0%
GAAATTGGTCAACATCAATG+TGG - Chr6:72364769-72364788 MsG0680033732.01.T01:CDS 35.0%
GAATTGGGTAAAACCGTAAT+TGG - Chr6:72364026-72364045 MsG0680033732.01.T01:CDS 35.0%
GAGAAAGATTGATGGGAAAT+TGG - Chr6:72364754-72364773 MsG0680033732.01.T01:CDS 35.0%
GAGAAAGGGAAATAACAGTT+GGG + Chr6:72364421-72364440 None:intergenic 35.0%
GCACTAAAAGTGACAACATT+TGG + Chr6:72364890-72364909 None:intergenic 35.0%
GCTAAATTCTACAATGGATG+GGG + Chr6:72364363-72364382 None:intergenic 35.0%
GTCAAAGGTTTGTGTCTTAA+CGG - Chr6:72364599-72364618 MsG0680033732.01.T01:CDS 35.0%
GTCATTGTTGGCCAAATAAT+TGG - Chr6:72366278-72366297 MsG0680033732.01.T01:intron 35.0%
TAAATTCCAATCGGTGAGAA+AGG + Chr6:72364436-72364455 None:intergenic 35.0%
TACTAATTGAAATCCCTAGC+AGG + Chr6:72367186-72367205 None:intergenic 35.0%
TATGATCCTGCTGGAAAAAA+TGG - Chr6:72365687-72365706 MsG0680033732.01.T01:intron 35.0%
TGAGAAAGGGAAATAACAGT+TGG + Chr6:72364422-72364441 None:intergenic 35.0%
TGAGTCTCTTTGATGAAATG+CGG - Chr6:72365269-72365288 MsG0680033732.01.T01:intron 35.0%
TTAAGCACTATTGCTCGAAT+GGG - Chr6:72365172-72365191 MsG0680033732.01.T01:intron 35.0%
TTCGCCAAAATTCTCAAGAT+GGG - Chr6:72364542-72364561 MsG0680033732.01.T01:CDS 35.0%
TTGTAAGGAAGGAAAGATCA+AGG - Chr6:72367731-72367750 MsG0680033732.01.T01:CDS 35.0%
TTGTAAGTGATTACATTGGG+AGG + Chr6:72368104-72368123 None:intergenic 35.0%
TTTAAGCACTATTGCTCGAA+TGG - Chr6:72365171-72365190 MsG0680033732.01.T01:intron 35.0%
TTTACACAAGCCATTGATCA+AGG + Chr6:72364702-72364721 None:intergenic 35.0%
TTTCGCCAAAATTCTCAAGA+TGG - Chr6:72364541-72364560 MsG0680033732.01.T01:CDS 35.0%
TTTGATGAAATGCGGTTCAA+AGG - Chr6:72365277-72365296 MsG0680033732.01.T01:intron 35.0%
! ATCCTTACATTTTCTCTTCG+TGG + Chr6:72366192-72366211 None:intergenic 35.0%
! ATCTACGGATTTTGCATTGT+TGG - Chr6:72364914-72364933 MsG0680033732.01.T01:intron 35.0%
! ATTAATGGCCTTTGTTTGGA+GGG - Chr6:72365649-72365668 MsG0680033732.01.T01:intron 35.0%
! ATTGATGGTTTGTGCAAATC+AGG - Chr6:72365334-72365353 MsG0680033732.01.T01:intron 35.0%
! ATTGGTTGATGCTCTATGTA+AGG - Chr6:72365015-72365034 MsG0680033732.01.T01:intron 35.0%
! ATTGGTTGATGCTCTTTGTA+AGG - Chr6:72367716-72367735 MsG0680033732.01.T01:CDS 35.0%
! CAATGGCTTGTGTAAAATTG+GGG - Chr6:72364706-72364725 MsG0680033732.01.T01:CDS 35.0%
! GAATGCACAAGTGATTTTTC+AGG - Chr6:72365576-72365595 MsG0680033732.01.T01:intron 35.0%
! GATCAATGGTCTTTGTTTAG+AGG - Chr6:72368340-72368359 MsG0680033732.01.T01:CDS 35.0%
! TCCTTACATTTTCTCTTCGT+GGG + Chr6:72366191-72366210 None:intergenic 35.0%
! TCTCACCGATTGGAATTTAA+CGG - Chr6:72364437-72364456 MsG0680033732.01.T01:CDS 35.0%
! TGCCAGATTTAAAGTTACCT+GGG - Chr6:72366690-72366709 MsG0680033732.01.T01:intron 35.0%
! TTGATGGTTTGTGCAAATCA+GGG - Chr6:72365335-72365354 MsG0680033732.01.T01:intron 35.0%
! TTGCCAGATTTAAAGTTACC+TGG - Chr6:72366689-72366708 MsG0680033732.01.T01:intron 35.0%
!! AGTCTTCCATTTTTGACAAC+AGG + Chr6:72368388-72368407 None:intergenic 35.0%
!! ATGGACCCATTTTTATCGAA+GGG - Chr6:72367289-72367308 MsG0680033732.01.T01:CDS 35.0%
!! GGTCAATTGAAAGAAGCATT+TGG - Chr6:72364935-72364954 MsG0680033732.01.T01:intron 35.0%
!! GTCTTCCATTTTTGACAACA+GGG + Chr6:72368387-72368406 None:intergenic 35.0%
!!! CATTTTTATCGAAGGGCATT+TGG - Chr6:72367296-72367315 MsG0680033732.01.T01:CDS 35.0%
!!! TACTTATCAGTTTTTGGGAC+TGG - Chr6:72366949-72366968 MsG0680033732.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTTCTTCCATTTTTTCCAGC+AGG + Chr6:72365696-72365715 None:intergenic 35.0%
AAGTGATTACATTGGGAGGT+TGG + Chr6:72368100-72368119 None:intergenic 40.0%
AATTCTACAATGGATGGGGT+AGG + Chr6:72364359-72364378 None:intergenic 40.0%
ACGCAAGTCCTGAGTTTAAA+TGG - Chr6:72366095-72366114 MsG0680033732.01.T01:intron 40.0%
ACTTATGGGACCTTGATCAA+TGG - Chr6:72364689-72364708 MsG0680033732.01.T01:CDS 40.0%
AGGCAAATCTCATTTGACCA+AGG + Chr6:72364514-72364533 None:intergenic 40.0%
AGGTTTGTGTCTTAACGGTA+AGG - Chr6:72364604-72364623 MsG0680033732.01.T01:CDS 40.0%
AGTCAGAACTTGGAAATGGA+TGG - Chr6:72367107-72367126 MsG0680033732.01.T01:CDS 40.0%
AGTTGACAAGGCAATTGCAT+TGG - Chr6:72365465-72365484 MsG0680033732.01.T01:intron 40.0%
ATGTTCGTCCTTATTGTTGC+TGG - Chr6:72367346-72367365 MsG0680033732.01.T01:CDS 40.0%
ATTAGGTTCCCTTGTTAAGC+TGG - Chr6:72364388-72364407 MsG0680033732.01.T01:CDS 40.0%
CAAACAATCCCTCCAAACAA+AGG + Chr6:72365660-72365679 None:intergenic 40.0%
CAATTGCCTTGTCAACAAGA+TGG + Chr6:72368154-72368173 None:intergenic 40.0%
CAATTGCCTTGTCAACTTGA+TGG + Chr6:72365462-72365481 None:intergenic 40.0%
CAGGGAAAATTTCTCATGCA+TGG - Chr6:72365353-72365372 MsG0680033732.01.T01:intron 40.0%
CTACGTGAAATGATTGCTAG+AGG - Chr6:72365802-72365821 MsG0680033732.01.T01:intron 40.0%
CTCCCAGGTAACTTTAAATC+TGG + Chr6:72366695-72366714 None:intergenic 40.0%
CTTGATCAGATGCATGATAG+AGG - Chr6:72365382-72365401 MsG0680033732.01.T01:intron 40.0%
GACAATGTGATTAAGTTCCC+AGG + Chr6:72366653-72366672 None:intergenic 40.0%
GATCCTAGCACAATCATTGA+TGG - Chr6:72367511-72367530 MsG0680033732.01.T01:CDS 40.0%
GTAATGCTCCAGCTTAACAA+GGG + Chr6:72364399-72364418 None:intergenic 40.0%
GTTGATGCTCTATGTAAGGA+AGG - Chr6:72365019-72365038 MsG0680033732.01.T01:intron 40.0%
GTTGATGCTCTTTGTAAGGA+AGG - Chr6:72367720-72367739 MsG0680033732.01.T01:CDS 40.0%
TAGCACAACCAGCAACAATA+AGG + Chr6:72367357-72367376 None:intergenic 40.0%
TATTTCCCTTTCTCACCGAT+TGG - Chr6:72364427-72364446 MsG0680033732.01.T01:CDS 40.0%
TCCCACGAAGAGAAAATGTA+AGG - Chr6:72366187-72366206 MsG0680033732.01.T01:intron 40.0%
TGTAGTTGTCCCCATTCATA+TGG - Chr6:72366122-72366141 MsG0680033732.01.T01:intron 40.0%
TTAAACTCAGGACTTGCGTT+TGG + Chr6:72366094-72366113 None:intergenic 40.0%
TTGGAAATGGATGGTTGTTG+AGG - Chr6:72367116-72367135 MsG0680033732.01.T01:CDS 40.0%
TTGTAAGTGAATGCATCTGC+AGG + Chr6:72365412-72365431 None:intergenic 40.0%
! ATAGCTGTGATGATGAGAGA+AGG - Chr6:72365067-72365086 MsG0680033732.01.T01:intron 40.0%
! CCATTTCCAAGTTCTGACTT+CGG + Chr6:72367106-72367125 None:intergenic 40.0%
! CTCTGTTTTCATCATGCTTC+AGG - Chr6:72364177-72364196 MsG0680033732.01.T01:CDS 40.0%
! GATTAATGGCCTTTGTTTGG+AGG - Chr6:72365648-72365667 MsG0680033732.01.T01:intron 40.0%
! GTATTATAGCTCAGGGCATT+AGG + Chr6:72365205-72365224 None:intergenic 40.0%
! GTTGCTGGTTGTGCTATAAT+AGG - Chr6:72367361-72367380 MsG0680033732.01.T01:CDS 40.0%
!! AATTGAGATTTGGAGGTACC+TGG - Chr6:72366632-72366651 MsG0680033732.01.T01:intron 40.0%
!! AGGTTTGACAGTTCTGAATG+AGG - Chr6:72366756-72366775 MsG0680033732.01.T01:CDS 40.0%
!! ATCGATGGACTATGCAAAGA+AGG - Chr6:72368236-72368255 MsG0680033732.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTGAGATTTGGAGGTACCT+GGG - Chr6:72366633-72366652 MsG0680033732.01.T01:intron 40.0%
!! GATGGACCCATTTTTATCGA+AGG - Chr6:72367288-72367307 MsG0680033732.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTATCGAAGGGCATTTGGA+AGG - Chr6:72367300-72367319 MsG0680033732.01.T01:CDS 40.0%
AAGAAGCCGAAGTCAGAACT+TGG - Chr6:72367097-72367116 MsG0680033732.01.T01:CDS 45.0%
AAGGAAGAGGCCAATCAAGT+TGG + Chr6:72364106-72364125 None:intergenic 45.0%
ACAGAGCTACAACAGCACAA+GGG + Chr6:72364068-72364087 None:intergenic 45.0%
AGGCAGAGTTAGAACTCTGA+GGG - Chr6:72366776-72366795 MsG0680033732.01.T01:CDS 45.0%
CCGAAGTCAGAACTTGGAAA+TGG - Chr6:72367103-72367122 MsG0680033732.01.T01:CDS 45.0%
CCTAGCAGGATTCAAAGCTA+GGG + Chr6:72367172-72367191 None:intergenic 45.0%
CTGCATCAGATAAAACTCCC+AGG + Chr6:72366710-72366729 None:intergenic 45.0%
CTGCGTGAAATGATTGCTAG+AGG - Chr6:72368494-72368513 MsG0680033732.01.T01:CDS 45.0%
CTTGATCAGATGCGTGATAG+AGG - Chr6:72368074-72368093 MsG0680033732.01.T01:CDS 45.0%
GAAATCCAAGTGCAAGCACA+TGG + Chr6:72364655-72364674 None:intergenic 45.0%
GGTAATGCTCCAGCTTAACA+AGG + Chr6:72364400-72364419 None:intergenic 45.0%
GTTTCAGCCACCAACTTGAT+TGG - Chr6:72364093-72364112 MsG0680033732.01.T01:CDS 45.0%
TGATCAAGCTATGATCCTGC+TGG - Chr6:72365678-72365697 MsG0680033732.01.T01:intron 45.0%
TGGATGGTTGTTGAGGTTCT+AGG - Chr6:72367123-72367142 MsG0680033732.01.T01:CDS 45.0%
TGTGATGTTGAAAGATGGCG+TGG - Chr6:72367773-72367792 MsG0680033732.01.T01:CDS 45.0%
TGTTGACAAGGCAATTGCAC+TGG - Chr6:72368157-72368176 MsG0680033732.01.T01:CDS 45.0%
! ATTAATGGACGGGTATTGCC+TGG - Chr6:72367821-72367840 MsG0680033732.01.T01:CDS 45.0%
! CACATCACAGCTGCTTTCAA+TGG - Chr6:72364142-72364161 MsG0680033732.01.T01:CDS 45.0%
! CATTTTTGACAACAGGGCCT+CGG + Chr6:72368381-72368400 None:intergenic 45.0%
! GTGACGCAGAGGTATAATGA+AGG - Chr6:72366736-72366755 MsG0680033732.01.T01:CDS 45.0%
!! ATGGATGGACTGTGCAAAGA+AGG - Chr6:72365544-72365563 MsG0680033732.01.T01:intron 45.0%
!! ATTGATGGGCTGTGCAAATC+TGG - Chr6:72368026-72368045 MsG0680033732.01.T01:CDS 45.0%
!! ATTGGAGCTTTTTGAAGGGC+TGG - Chr6:72366296-72366315 MsG0680033732.01.T01:intron 45.0%
!! CCTAGCTTTGAATCCTGCTA+GGG - Chr6:72367170-72367189 MsG0680033732.01.T01:CDS 45.0%
!! TTGATGGGCTGTGCAAATCT+GGG - Chr6:72368027-72368046 MsG0680033732.01.T01:CDS 45.0%
ACTCGTGTGGAAGAAGGAAG+AGG + Chr6:72364119-72364138 None:intergenic 50.0%
AGGAGGTAACAAGCGACAGA+TGG - Chr6:72367270-72367289 MsG0680033732.01.T01:CDS 50.0%
CACTATTGCTCGAATGGGAG+TGG - Chr6:72365177-72365196 MsG0680033732.01.T01:intron 50.0%
CCCTAGCAGGATTCAAAGCT+AGG + Chr6:72367173-72367192 None:intergenic 50.0%
CGAGGCCCTGTTGTCAAAAA+TGG - Chr6:72368379-72368398 MsG0680033732.01.T01:CDS 50.0%
CTGGGAGAGTTTCTCATGCT+TGG - Chr6:72368045-72368064 MsG0680033732.01.T01:CDS 50.0%
CTGTGATGTGAAGACTCGTG+TGG + Chr6:72364132-72364151 None:intergenic 50.0%
GAAGGGCTGGAAATCATCTC+AGG - Chr6:72366309-72366328 MsG0680033732.01.T01:intron 50.0%
GACAGAGCTACAACAGCACA+AGG + Chr6:72364069-72364088 None:intergenic 50.0%
GAGGCAGAGTTAGAACTCTG+AGG - Chr6:72366775-72366794 MsG0680033732.01.T01:CDS 50.0%
GTGAAGACTCGTGTGGAAGA+AGG + Chr6:72364125-72364144 None:intergenic 50.0%
TCAAAGCTAGGGTGAGAGAG+AGG + Chr6:72367161-72367180 None:intergenic 50.0%
TGCAGTTGAAAGTGACGCAG+AGG - Chr6:72366725-72366744 MsG0680033732.01.T01:CDS 50.0%
!! CCCTAGCTTTGAATCCTGCT+AGG - Chr6:72367169-72367188 MsG0680033732.01.T01:CDS 50.0%
!! GAAGAGGCCAATCAAGTTGG+TGG + Chr6:72364103-72364122 None:intergenic 50.0%
CACGACCATGTGCTTGCACT+TGG - Chr6:72364647-72364666 MsG0680033732.01.T01:CDS 55.0%
! GGGCTTGCTTGATGAAGCCG+AGG - Chr6:72368361-72368380 MsG0680033732.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 72364017 72368538 72364017 ID=MsG0680033732.01;Name=MsG0680033732.01
Chr6 mRNA 72364017 72368538 72364017 ID=MsG0680033732.01.T01;Parent=MsG0680033732.01;Name=MsG0680033732.01.T01;_AED=0.13;_eAED=0.14;_QI=0|0|0|0.66|1|1|3|0|896
Chr6 exon 72366725 72368538 72366725 ID=MsG0680033732.01.T01:exon:4182;Parent=MsG0680033732.01.T01
Chr6 exon 72365809 72365859 72365809 ID=MsG0680033732.01.T01:exon:4183;Parent=MsG0680033732.01.T01
Chr6 exon 72364017 72364842 72364017 ID=MsG0680033732.01.T01:exon:4184;Parent=MsG0680033732.01.T01
Chr6 CDS 72366725 72368538 72366725 ID=MsG0680033732.01.T01:cds;Parent=MsG0680033732.01.T01
Chr6 CDS 72365809 72365859 72365809 ID=MsG0680033732.01.T01:cds;Parent=MsG0680033732.01.T01
Chr6 CDS 72364017 72364842 72364017 ID=MsG0680033732.01.T01:cds;Parent=MsG0680033732.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680033732.01.T01

ATGCAAATTGAATTGGGTAAAACCGTAATTGGAGAAGTGTTGAAGAAACCCTTGTGCTGTTGTAGCTCTGTCGTTTGTTTCAGCCACCAACTTGATTGGCCTCTTCCTTCTTCCACACGAGTCTTCACATCACAGCTGCTTTCAATGGCTCAAATGTCTTCTCTGTTTTCATCATGCTTCAGGTTTTGTAATTCTTCTTCTTCTATTAATTGCAATTTTCTTATTCCTTTCCTAGAAAGAACATTTTACTACTCTCACTCTAGATTCCATTCCAATTCCAATCATGTTGATGTTGTTGATAATGTTATTTTGTCATTCAATCACATGATTCGTATGAATCCTACCCCATCCATTGTAGAATTTAGCAAAATATTAGGTTCCCTTGTTAAGCTGGAGCATTACCCAACTGTTATTTCCCTTTCTCACCGATTGGAATTTAACGGAACTATGCTAGATATTGTTTCCTTGAATATGTTGATCAATTGTTACTGTCACCTTGGTCAAATGAGATTTGCCTTTTCTATTTTCGCCAAAATTCTCAAGATGGGTTATCAGCCTGATACCATTACCTTAAATACACTTGTCAAAGGTTTGTGTCTTAACGGTAAGGTAAAAGAAGCTCTACACTTTCACGACCATGTGCTTGCACTTGGATTTCAATTGAATGAAGTTACTTATGGGACCTTGATCAATGGCTTGTGTAAAATTGGGGAAACAAGAGCTGCCTTGCAAATGTTGAGAAAGATTGATGGGAAATTGGTCAACATCAATGTGGTAATGTATAGCACAATCATTGATGGTTTGTGTAAAGATAAACTTGTAAATGATGCATATGAGTTATATTCTGAAATGATTACAAAGAGAATTTCTCCAAATGTTGTCACTTTTAGTGCTCTTATCTACGGATTTTGCATTGTTGGTCAATTGAAAGAAGCATTTGGTTTGTTCCATCAAATGGTATTGACAAACATCCTCCCAAATGTTTATACTTTTAGCATATTGGTTGATGCTCTATGTAAGGAAGGAAATGTGAAAGAAGCTAAAAGTGTGATAGCTGTGATGATGAGAGAAGGTGTGATGACAAATGTTGTTACCTACAATTCATTAATGGATGGATATTGCCTAGTTAATGAAGTTAATAAGGCCAAACACGTTTTAAGCACTATTGCTCGAATGGGAGTGGCACCTAATGCCCTGAGCTATAATACTGTGATTAATGGATTTTGTAAGAATAAAATGGTCAATGAAGCCTTGAGTCTCTTTGATGAAATGCGGTTCAAAGGAATTGATCCTGATAAGGTAACTTACAATTCTCTCATTGATGGTTTGTGCAAATCAGGGAAAATTTCTCATGCATGGGAGCTTCTTGATCAGATGCATGATAGAGGTCAACCTGCAGATGCATTCACTTACAATTCCTTCTTACATGCTTTATGTAAAAACCATCAAGTTGACAAGGCAATTGCATTGGTCAAGAAAATTAAAGACCAATGCATTCAACTAAATATTCACACATACAATATACTTATGGATGGACTGTGCAAAGAAGGAAGACTTGAGAATGCACAAGTGATTTTTCAGGATCTTTTGATCAAAGGCTATAATTTAACGGTCTGGACATATAATATTATGATTAATGGCCTTTGTTTGGAGGGATTGTTTGATCAAGCTATGATCCTGCTGGAAAAAATGGAAGAAAATGGTTGCATTCCTGATGTTGTAACTTATGAAACTATTATTCGCGCTCTTTTTAAAAATGATGAGAATGATAGGGCAGAGAAACTTCTACGTGAAATGATTGCTAGAGGTCTACTATTTAAAGTTACCTGGGAGTTTTATCTGATGCAGTTGAAAGTGACGCAGAGTATATTGGTTGATGCTCTTTGTAAGGAAGGAAAGATCAAGGAAGCTAAAAATGTGATAGCTGTGATGTTGAAAGATGGCGTGGAACCTACTGTTGTTACATATAATACATTAATGGACGGGTATTGCCTGGTTAATGAAGTGAATAAGGCAAAGCATGTATTCAACATCATAGGAAAAATGAAAGTGATACCTACTGTTAATAGCTACAATATCATTATTAATGGATTATGTAAGATGAAAATGGTTGATGAAGCCTTGAATCTCTTCACAGAAATGCATTGCAAACCCAATACAGTAACTTACAACTCTCTTATTGATGGGCTGTGCAAATCTGGGAGAGTTTCTCATGCTTGGAAGCTTCTTGATCAGATGCGTGATAGAGGCCAACCTCCCAATGTAATCACTTACAATTCCTTATTACATGCTTTATGTAAAAACCATCTTGTTGACAAGGCAATTGCACTGGTCAAGAATTTTAAAGACCAAGGCATTCAACCAAATATTAACACATACAATATACTTATCGATGGACTATGCAAAGAAGGAAGACTTAAGAACGCACAAGTTATTTTTCAAGATCTTTTCATTAAAGGCTATAATTTAACAGTTTGTACATATAATATTATGATCAATGGTCTTTGTTTAGAGGGCTTGCTTGATGAAGCCGAGGCCCTGTTGTCAAAAATGGAAGACTATGGATGCATTCCTAATGTTGTGACTTTTCAAACAATTGTCTGCGCTCTCTTTGAAAATGATAAGAATGAAAGGGCAGAGAAACTACTGCGTGAAATGATTGCTAGAGGTCTTTTGCAAGAGAAAGACTAG
Protein sequence

>MsG0680033732.01.T01

MQIELGKTVIGEVLKKPLCCCSSVVCFSHQLDWPLPSSTRVFTSQLLSMAQMSSLFSSCFRFCNSSSSINCNFLIPFLERTFYYSHSRFHSNSNHVDVVDNVILSFNHMIRMNPTPSIVEFSKILGSLVKLEHYPTVISLSHRLEFNGTMLDIVSLNMLINCYCHLGQMRFAFSIFAKILKMGYQPDTITLNTLVKGLCLNGKVKEALHFHDHVLALGFQLNEVTYGTLINGLCKIGETRAALQMLRKIDGKLVNINVVMYSTIIDGLCKDKLVNDAYELYSEMITKRISPNVVTFSALIYGFCIVGQLKEAFGLFHQMVLTNILPNVYTFSILVDALCKEGNVKEAKSVIAVMMREGVMTNVVTYNSLMDGYCLVNEVNKAKHVLSTIARMGVAPNALSYNTVINGFCKNKMVNEALSLFDEMRFKGIDPDKVTYNSLIDGLCKSGKISHAWELLDQMHDRGQPADAFTYNSFLHALCKNHQVDKAIALVKKIKDQCIQLNIHTYNILMDGLCKEGRLENAQVIFQDLLIKGYNLTVWTYNIMINGLCLEGLFDQAMILLEKMEENGCIPDVVTYETIIRALFKNDENDRAEKLLREMIARGLLFKVTWEFYLMQLKVTQSILVDALCKEGKIKEAKNVIAVMLKDGVEPTVVTYNTLMDGYCLVNEVNKAKHVFNIIGKMKVIPTVNSYNIIINGLCKMKMVDEALNLFTEMHCKPNTVTYNSLIDGLCKSGRVSHAWKLLDQMRDRGQPPNVITYNSLLHALCKNHLVDKAIALVKNFKDQGIQPNINTYNILIDGLCKEGRLKNAQVIFQDLFIKGYNLTVCTYNIMINGLCLEGLLDEAEALLSKMEDYGCIPNVVTFQTIVCALFENDKNERAEKLLREMIARGLLQEKD*