AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380015692.01

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MsG0380015692.01.T01 AT1G06580 33.333 291 159 1 177 432 3 293 7.00e-44 160
MsG0380015692.01.T01 AT1G06580 33.590 390 255 2 40 425 3 392 3.04e-74 241
MsG0380015692.01.T01 AT1G06580 30.334 389 266 2 1 386 1 387 1.22e-59 202
MsG0380015692.01.T01 AT1G06580 33.333 291 159 1 177 432 3 293 7.00e-44 160
MsG0380015692.01.T01 AT5G64320 31.555 431 293 2 1 430 208 637 1.14e-73 248
MsG0380015692.01.T01 AT5G64320 30.575 435 284 6 1 426 278 703 9.38e-66 227
MsG0380015692.01.T01 AT5G64320 26.488 336 244 1 8 340 387 722 6.60e-42 160
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MsG0380015692.01.T01 AT1G05670 27.055 292 211 2 140 430 169 459 4.43e-33 134
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MsG0380015692.01.T01 AT3G04760 29.023 348 245 1 91 436 100 447 2.01e-52 188
MsG0380015692.01.T01 AT3G04760 22.822 241 183 1 8 245 331 571 1.78e-21 98.6
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MsG0380015692.01.T01 AT4G28010 29.717 424 293 2 9 427 211 634 3.53e-61 214
MsG0380015692.01.T01 AT4G28010 27.624 362 257 1 1 357 273 634 8.56e-48 177
MsG0380015692.01.T01 AT4G28010 28.777 278 195 2 151 426 40 316 8.15e-35 139
MsG0380015692.01.T01 AT1G63230 33.333 324 208 3 71 390 1 320 1.10e-63 211
MsG0380015692.01.T01 AT1G63230 29.618 314 220 1 106 419 1 313 2.43e-47 167
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MsG0380015692.01.T01 AT1G13630 27.804 428 293 2 8 419 92 519 3.22e-49 180
MsG0380015692.01.T01 AT1G13630 26.087 437 307 4 1 421 120 556 7.81e-47 174
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MsG0380015692.01.T01 AT2G31400 29.915 351 242 2 84 430 237 587 1.98e-46 174
MsG0380015692.01.T01 AT2G31400 30.000 340 228 6 9 341 267 603 8.11e-46 172
MsG0380015692.01.T01 AT2G31400 25.833 360 263 1 49 404 237 596 9.27e-39 152
MsG0380015692.01.T01 AT2G31400 26.016 369 243 4 8 349 337 702 2.43e-37 147
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MsG0380015692.01.T01 AT3G18020 22.563 359 267 6 13 363 310 665 4.43e-25 110
MsG0380015692.01.T01 AT3G18020 25.791 411 257 9 65 428 75 484 5.71e-24 106
MsG0380015692.01.T01 AT3G18020 22.393 326 248 2 8 328 340 665 8.79e-23 102
MsG0380015692.01.T01 AT3G18020 27.746 173 123 1 234 404 72 244 8.18e-11 65.1
MsG0380015692.01.T01 AT5G28460 25.819 519 346 7 7 497 256 763 2.70e-47 176
MsG0380015692.01.T01 AT5G28460 24.750 400 256 5 64 418 243 642 4.23e-36 143
MsG0380015692.01.T01 AT5G28460 27.273 330 222 8 116 430 153 479 1.39e-28 120
MsG0380015692.01.T01 AT5G28460 22.511 231 171 3 1 225 502 730 8.15e-17 84.3
MsG0380015692.01.T01 AT2G31400 27.374 358 256 2 16 369 239 596 2.81e-47 177
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MsG0380015692.01.T01 AT2G41720 24.606 317 202 1 149 428 13 329 4.15e-29 122
MsG0380015692.01.T01 AT2G41720 24.249 433 323 3 1 428 204 636 7.06e-41 158
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MsG0380015692.01.T01 AT1G07740 24.232 293 219 1 9 298 150 442 3.15e-24 106
MsG0380015692.01.T01 AT5G39980 23.349 424 318 2 7 427 152 571 7.18e-35 139
MsG0380015692.01.T01 AT5G39980 20.283 424 331 2 1 421 216 635 1.36e-26 114
MsG0380015692.01.T01 AT5G39980 23.810 294 224 0 138 431 181 474 3.01e-22 101
MsG0380015692.01.T01 AT5G39980 22.177 248 192 1 184 430 121 368 2.00e-20 95.5
MsG0380015692.01.T01 AT5G40400 23.641 423 314 4 13 428 169 589 9.15e-35 138
MsG0380015692.01.T01 AT5G40400 28.214 280 200 1 144 422 163 442 2.77e-32 131
MsG0380015692.01.T01 AT5G40400 22.955 440 280 7 29 427 96 517 1.43e-29 123
MsG0380015692.01.T01 AT5G40400 21.390 374 257 4 1 371 227 566 4.36e-23 103
MsG0380015692.01.T01 AT2G35130 24.242 396 296 2 36 427 146 541 1.36e-34 138
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MsG0380015692.01.T01 AT2G35130 23.352 364 275 2 71 430 146 509 2.24e-30 125
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MsG0380015692.01.T01 AT3G22670 31.174 247 165 3 184 426 205 450 8.54e-33 132
MsG0380015692.01.T01 AT3G22670 28.674 279 192 3 112 384 270 547 1.15e-24 108
MsG0380015692.01.T01 AT3G22670 28.000 250 174 4 183 428 167 414 3.00e-22 100
MsG0380015692.01.T01 AT3G22670 25.305 328 202 5 14 299 207 533 1.21e-21 99.0
MsG0380015692.01.T01 AT3G22670 29.444 180 121 4 255 430 169 346 6.61e-14 74.7
MsG0380015692.01.T01 AT5G11310 25.598 418 291 8 31 432 87 500 6.78e-34 136
MsG0380015692.01.T01 AT5G11310 24.742 388 257 10 7 371 134 509 3.35e-28 119
MsG0380015692.01.T01 AT5G11310 23.926 326 237 4 50 366 217 540 6.39e-25 109
MsG0380015692.01.T01 AT5G11310 23.871 310 219 6 138 434 92 397 1.96e-18 89.4
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MsG0380015692.01.T01 AT2G35130 23.161 367 275 2 71 430 146 512 2.23e-29 122
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MsG0380015692.01.T01 AT2G35130 22.109 294 225 2 137 426 167 460 4.48e-23 103
MsG0380015692.01.T01 AT2G35130 24.348 230 170 2 207 432 167 396 1.99e-19 92.4
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MsG0380015692.01.T01 AT3G18110 19.807 414 300 1 13 426 755 1136 4.35e-29 123
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MsG0380015692.01.T01 AT5G50280 24.691 324 207 3 146 432 272 595 2.07e-30 126
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MsG0380015692.01.T01 AT5G50280 22.835 254 190 3 8 256 412 664 2.59e-20 95.5
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MsG0380015692.01.T01 AT5G62370 23.218 435 301 4 29 430 256 690 9.69e-31 127
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MsG0380015692.01.T01 AT5G62370 21.315 441 304 5 31 431 463 900 1.61e-24 108
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MsG0380015692.01.T01 AT5G25630 23.469 294 219 3 8 296 135 427 3.12e-29 121
MsG0380015692.01.T01 AT5G25630 21.393 402 232 7 130 453 12 407 1.16e-27 117
MsG0380015692.01.T01 AT5G25630 25.263 285 190 5 29 305 228 497 1.00e-17 86.7
MsG0380015692.01.T01 AT5G25630 25.143 175 128 1 259 430 1 175 9.74e-15 77.4
MsG0380015692.01.T01 AT5G14080 25.455 440 300 11 14 432 156 588 1.21e-31 129
MsG0380015692.01.T01 AT2G37230 27.365 296 211 2 146 437 184 479 1.50e-31 130
MsG0380015692.01.T01 AT2G37230 22.052 458 279 8 16 430 159 581 3.55e-27 116
MsG0380015692.01.T01 AT2G37230 26.299 308 221 3 115 418 81 386 1.65e-24 108
MsG0380015692.01.T01 AT2G37230 21.983 464 310 9 7 422 287 746 1.05e-20 96.7
MsG0380015692.01.T01 AT1G71060 24.932 369 258 4 13 372 131 489 1.62e-31 128
MsG0380015692.01.T01 AT1G71060 24.367 316 233 2 113 425 160 472 4.70e-30 124
MsG0380015692.01.T01 AT1G71060 23.548 310 231 2 13 319 200 506 1.18e-24 107
MsG0380015692.01.T01 AT1G71060 25.159 314 190 6 150 425 131 437 4.66e-24 105
MsG0380015692.01.T01 AT1G71060 21.635 208 163 0 8 215 265 472 3.26e-13 72.4
MsG0380015692.01.T01 AT1G71060 24.084 191 143 2 236 425 111 300 4.17e-13 72.0
MsG0380015692.01.T01 AT5G18950 22.740 365 272 5 7 367 110 468 1.87e-31 127
MsG0380015692.01.T01 AT5G18950 22.662 278 183 1 32 309 235 480 9.64e-26 110
MsG0380015692.01.T01 AT5G18950 23.333 330 250 2 75 402 140 468 2.06e-24 107
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MsG0380015692.01.T01 AT3G62540 24.268 239 173 5 210 444 188 422 1.30e-14 77.0
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MsG0380015692.01.T01 AT3G04130 28.696 230 161 3 199 426 172 400 1.94e-25 110
MsG0380015692.01.T01 AT3G04130 25.161 310 227 4 82 386 157 466 4.04e-23 103
MsG0380015692.01.T01 AT3G04130 24.585 301 186 6 164 425 172 470 1.16e-22 101
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MsG0380015692.01.T01 AT5G18390 22.321 336 255 3 76 406 107 441 3.08e-23 103
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MsG0380015692.01.T01 AT3G09650 20.650 431 292 9 42 424 233 661 4.11e-24 107
MsG0380015692.01.T01 AT3G09650 22.545 275 189 4 8 258 450 724 8.84e-17 84.3
MsG0380015692.01.T01 AT3G02650 24.156 385 239 11 51 427 237 576 8.03e-26 112
MsG0380015692.01.T01 AT1G77405 28.571 238 156 3 184 407 167 404 8.24e-26 110
MsG0380015692.01.T01 AT1G77405 24.671 304 199 6 20 315 137 418 2.44e-21 97.4
MsG0380015692.01.T01 AT1G77405 23.214 224 155 3 8 214 198 421 3.54e-14 75.5
MsG0380015692.01.T01 AT1G77405 25.974 231 154 4 217 430 91 321 2.17e-12 69.7
MsG0380015692.01.T01 AT3G14580 25.246 305 221 5 129 431 47 346 9.26e-26 109
MsG0380015692.01.T01 AT3G14580 27.511 229 166 0 200 428 150 378 2.87e-25 108
MsG0380015692.01.T01 AT3G14580 21.860 215 168 0 150 364 170 384 1.94e-17 85.1
MsG0380015692.01.T01 AT3G14580 22.689 238 181 1 40 274 162 399 1.27e-16 82.4
MsG0380015692.01.T01 AT1G66345 24.093 386 284 4 5 385 161 542 1.41e-25 110
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MsG0380015692.01.T01 AT1G66345 21.661 277 214 1 43 316 267 543 2.68e-16 82.4
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MsG0380015692.01.T01 AT1G79490 27.132 258 185 1 110 364 273 530 6.87e-23 103
MsG0380015692.01.T01 AT1G79490 24.422 303 222 2 130 425 184 486 4.00e-21 98.2
MsG0380015692.01.T01 AT1G79490 21.039 385 264 3 1 345 231 615 7.91e-17 84.3
MsG0380015692.01.T01 AT4G39620 25.407 307 220 5 137 436 123 427 7.39e-23 102
MsG0380015692.01.T01 AT4G39620 21.788 358 254 5 76 422 129 471 7.66e-21 96.7
MsG0380015692.01.T01 AT4G39620 24.701 251 183 3 187 431 102 352 3.75e-16 82.0
MsG0380015692.01.T01 AT4G39620 28.261 184 123 5 254 430 100 281 2.33e-14 76.3
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MsG0380015692.01.T01 AT5G60960 23.938 259 186 5 184 432 177 434 9.03e-13 71.2
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MsG0380015692.01.T01 AT3G46610 25.726 241 172 1 166 399 400 640 4.45e-19 91.3
MsG0380015692.01.T01 AT3G46610 24.454 229 173 0 147 375 423 651 1.11e-18 90.1
MsG0380015692.01.T01 AT3G46610 20.365 329 227 5 8 331 344 642 2.97e-15 79.3
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MsG0380015692.01.T01 AT1G80880 21.021 333 220 6 24 317 167 495 6.36e-16 81.3
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MsG0380015692.01.T01 AT1G80880 21.021 333 220 6 24 317 167 495 6.36e-16 81.3
MsG0380015692.01.T01 AT2G18520 27.922 308 184 10 151 449 106 384 8.76e-20 92.4
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MsG0380015692.01.T01 AT2G22410 19.084 393 266 7 5 393 217 561 1.23e-13 74.3
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MsG0380015692.01.T01 AT2G28050 24.583 240 174 5 17 250 181 419 1.25e-12 70.5
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MsG0380015692.01.T01 AT1G68930 21.165 515 312 14 6 447 68 561 6.41e-18 87.8
MsG0380015692.01.T01 AT3G06430 23.000 300 221 5 137 430 113 408 7.28e-18 87.0
MsG0380015692.01.T01 AT3G06430 21.598 338 258 4 76 407 120 456 2.05e-17 85.5
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MsG0380015692.01.T01 AT3G60040 32.500 120 81 0 271 390 708 827 1.92e-14 77.0
MsG0380015692.01.T01 AT3G60040 45.556 90 49 0 341 430 708 797 4.32e-14 75.9
MsG0380015692.01.T01 AT3G60040 33.898 118 78 0 231 348 703 820 1.75e-12 70.9
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MsG0380015692.01.T01 AT5G03560 26.316 152 107 2 136 286 190 337 1.80e-12 69.3
MsG0380015692.01.T01 AT5G03560 27.742 155 104 4 101 251 187 337 3.28e-12 68.6
MsG0380015692.01.T01 AT5G03560 29.771 131 91 1 188 317 203 333 1.14e-16 82.0
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MsG0380015692.01.T01 AT1G31430 19.700 467 315 10 2 425 3 452 1.85e-16 82.8
MsG0380015692.01.T01 AT1G31430 23.077 286 196 8 147 426 11 278 2.36e-14 76.3
MsG0380015692.01.T01 AT1G32415 22.993 274 200 4 113 383 366 631 2.36e-16 82.8
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MsG0380015692.01.T01 AT3G12770 18.009 422 300 6 6 425 80 457 4.59e-16 82.0
MsG0380015692.01.T01 AT1G69350 23.580 352 232 10 81 418 168 496 5.36e-16 81.6
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MsG0380015692.01.T01 AT1G34160 24.806 258 179 4 126 379 72 318 5.48e-16 81.3
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MsG0380015692.01.T01 AT4G32430 25.342 292 170 9 29 280 356 639 3.58e-12 69.7
MsG0380015692.01.T01 AT2G34400 19.617 418 277 8 1 376 87 487 5.85e-16 81.3
MsG0380015692.01.T01 AT2G34400 21.875 352 259 5 71 418 87 426 2.56e-15 79.3
MsG0380015692.01.T01 AT5G59600 23.148 324 204 8 101 386 138 454 8.84e-16 80.5
MsG0380015692.01.T01 AT5G59600 22.601 323 233 7 101 417 37 348 2.71e-15 79.0
MsG0380015692.01.T01 AT5G59600 21.101 327 213 8 13 336 186 470 6.50e-15 77.8
MsG0380015692.01.T01 AT5G59600 23.077 377 230 10 89 419 90 452 5.82e-14 75.1
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MsG0380015692.01.T01 AT4G21065 22.306 399 256 10 29 387 72 456 5.43e-14 75.1
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MsG0380015692.01.T01 AT1G56570 22.673 419 271 11 15 430 50 418 1.88e-12 70.5
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MsG0380015692.01.T01 AT5G40405 23.396 265 181 7 38 294 166 416 4.28e-14 75.5
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MsG0380015692.01.T01 AT5G37570 23.600 250 170 7 180 426 72 303 1.53e-11 67.4
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MsG0380015692.01.T01 AT3G23330 19.677 310 203 5 146 418 206 506 1.41e-13 73.9
MsG0380015692.01.T01 AT3G03580 19.574 470 315 10 3 430 64 512 1.47e-13 74.3
MsG0380015692.01.T01 AT2G33680 20.054 369 279 5 13 377 279 635 1.51e-13 73.9
MsG0380015692.01.T01 AT2G33680 19.865 443 299 8 28 430 156 582 1.20e-11 68.2
MsG0380015692.01.T01 AT2G33680 20.948 401 291 9 35 426 94 477 2.20e-11 67.0
MsG0380015692.01.T01 AT3G22690 21.131 336 216 6 98 428 47 338 1.69e-13 73.9
MsG0380015692.01.T01 AT3G22690 20.844 379 274 9 48 419 102 461 1.64e-11 67.8
MsG0380015692.01.T01 AT4G04790 22.680 291 220 3 150 440 372 657 1.74e-13 73.9
MsG0380015692.01.T01 AT4G04790 22.680 291 220 3 150 440 376 661 1.75e-13 73.9
MsG0380015692.01.T01 AT3G22690 21.131 336 216 6 98 428 47 338 1.80e-13 73.9
MsG0380015692.01.T01 AT3G22690 21.372 379 272 10 48 419 102 461 1.49e-11 67.8
MsG0380015692.01.T01 AT3G22690 21.131 336 216 6 98 428 47 338 1.81e-13 73.9
MsG0380015692.01.T01 AT1G64310 19.715 421 294 4 1 421 62 438 2.01e-13 73.2
MsG0380015692.01.T01 AT2G17210 23.841 302 214 6 138 438 274 560 2.47e-13 73.2
MsG0380015692.01.T01 AT2G17210 22.112 303 196 4 10 278 314 610 2.99e-13 73.2
MsG0380015692.01.T01 AT2G17210 20.000 375 265 8 77 421 244 613 1.06e-11 68.2
MsG0380015692.01.T01 AT3G49740 21.078 408 298 11 26 423 339 732 2.52e-13 73.2
MsG0380015692.01.T01 AT3G05340 20.506 395 282 8 1 390 161 528 2.75e-13 73.2

Find 127 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 279 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATTGATGGTTTGTGCAAATT+AGG 0.114885 3:+73805007 MsG0380015692.01.T01:CDS
GTTGGGTTTATAAAGCTTTA+TGG 0.158716 3:+73807950 MsG0380015692.01.T01:CDS
ACGTATAATGTTATGATAAA+TGG 0.184532 3:+73805307 MsG0380015692.01.T01:CDS
TGCTACAATATCATTATTAA+TGG 0.192096 3:+73804887 MsG0380015692.01.T01:CDS
AGGCTAAAATGTTGTTAAAT+TGG 0.217307 3:-73804160 None:intergenic
AGGGAAAATCTCTCCTTCTT+TGG 0.233118 3:+73805027 MsG0380015692.01.T01:CDS
CATCTCTTTGAAGAGATTCA+TGG 0.249944 3:-73804939 None:intergenic
CTTTGTAAGCGATGCTTATA+AGG 0.250946 3:+73804610 MsG0380015692.01.T01:CDS
TGGATGGGGTTGGAGAAATT+TGG 0.251899 3:-73804133 None:intergenic
TGTTACTTATGGTGCTTTAA+TGG 0.252550 3:+73804778 MsG0380015692.01.T01:CDS
TTTAAATATATTCAATGTTA+TGG 0.295002 3:+73804835 MsG0380015692.01.T01:CDS
GATGGATGGGTTCTGTAAAA+TGG 0.307701 3:+73804490 MsG0380015692.01.T01:CDS
GGTAGTGAATGTTATGGAAT+TGG 0.322702 3:-73804360 None:intergenic
AAACCGAATGTTGTTACTTA+TGG 0.326906 3:+73804767 MsG0380015692.01.T01:CDS
TTGATGGTTTGTGCAAATTA+GGG 0.328376 3:+73805008 MsG0380015692.01.T01:CDS
ATGGAGAGAGTGGATATTAC+AGG 0.345076 3:+73806629 MsG0380015692.01.T01:CDS
GAGTCCTTATAGTTTGTATA+AGG 0.346828 3:+73807877 MsG0380015692.01.T01:CDS
ATTTGCACAAACCATCAATA+AGG 0.362828 3:-73805003 None:intergenic
TCTTCCTTATACAAACTATA+AGG 0.367538 3:-73807881 None:intergenic
TAACCTATCTTGAGAATCTT+GGG 0.371955 3:-73804332 None:intergenic
TGTTGATGAGATGCGTAGTA+TGG 0.374754 3:+73805054 MsG0380015692.01.T01:CDS
ACTTACAATATCCTTATTGA+TGG 0.380904 3:+73804992 MsG0380015692.01.T01:CDS
ATGCAAAGGTGGAAGACTTA+TGG 0.384365 3:+73805228 MsG0380015692.01.T01:CDS
CCAGGCAATTACATTAGTTA+AGG 0.389563 3:+73805144 MsG0380015692.01.T01:CDS
GTGAGTTTGAAACTGTATAA+AGG 0.393785 3:+73807830 MsG0380015692.01.T01:CDS
ATCAAAGGCATGTGTCTTAA+CGG 0.405725 3:+73804386 MsG0380015692.01.T01:CDS
CGTATAATGTTATGATAAAT+GGG 0.406461 3:+73805308 MsG0380015692.01.T01:CDS
AAGACACATGCCTTTGATAA+GGG 0.409674 3:-73804381 None:intergenic
GTAACCTATCTTGAGAATCT+TGG 0.416092 3:-73804333 None:intergenic
GATAAGGGTAGTGAATGTTA+TGG 0.416165 3:-73804366 None:intergenic
ACTTGCCTTGTTATCAAGAA+TGG 0.419203 3:+73805360 MsG0380015692.01.T01:CDS
AGTTAGTTACGCGATCTTGA+TGG 0.419550 3:+73804472 MsG0380015692.01.T01:CDS
GTTTCATAACTTACAGCATC+AGG 0.420938 3:-73805400 None:intergenic
GATAAATGGGCTTTGTAAGA+AGG 0.422593 3:+73805321 MsG0380015692.01.T01:CDS
ATACTAAAAGTATAAACATT+TGG 0.423116 3:-73804665 None:intergenic
GTGAGTCAATGATGCATTCA+TGG 0.424048 3:+73807778 MsG0380015692.01.T01:intron
TAAGACACATGCCTTTGATA+AGG 0.425084 3:-73804382 None:intergenic
ACAACATTTAACTTGGGATT+CGG 0.426223 3:-73806600 None:intergenic
AGGGAGTGGAGCCGAATGTT+TGG 0.426428 3:+73804864 MsG0380015692.01.T01:CDS
TTTCGTCAATTAGAATTCAA+TGG 0.430840 3:+73804224 MsG0380015692.01.T01:CDS
CACGACCATGTGGTTGCACA+TGG 0.440544 3:+73804434 MsG0380015692.01.T01:CDS
ATAAATGGGCTTTGTAAGAA+GGG 0.440708 3:+73805322 MsG0380015692.01.T01:CDS
TGGAGCCACAACATTTAACT+TGG 0.448067 3:-73806607 None:intergenic
ACATATACTACACTAATTGA+TGG 0.452315 3:+73805202 MsG0380015692.01.T01:CDS
GTAGTGAATGTTATGGAATT+GGG 0.452324 3:-73804359 None:intergenic
GCACCATAAGTAACAACATT+CGG 0.460879 3:-73804770 None:intergenic
AAGGCTGTCATATAACTGTT+TGG 0.462692 3:+73805284 MsG0380015692.01.T01:CDS
GAGAAATAGCGGTAGGGTAG+TGG 0.463279 3:-73804199 None:intergenic
ATATTGTAAGTTACCACATC+AGG 0.465075 3:-73804980 None:intergenic
ATCATGGCTCTGATCCTCAT+TGG 0.465937 3:-73807977 None:intergenic
TTGTTTCCCCTTACGATCCT+TGG 0.465991 3:-73804705 None:intergenic
TTAAATGCCTTGTTCCATCA+TGG 0.476647 3:-73807993 None:intergenic
CTCCCCAAGATTCTCAAGAT+AGG 0.480731 3:+73804329 MsG0380015692.01.T01:CDS
AATGTTGTTAAATTGGAGAA+TGG 0.481370 3:-73804153 None:intergenic
AATTGGAGAATGGATGGGGT+TGG 0.485364 3:-73804143 None:intergenic
CTTATGGTGCTTTAATGGAT+GGG 0.486960 3:+73804783 MsG0380015692.01.T01:CDS
CCTTAACTAATGTAATTGCC+TGG 0.490729 3:-73805144 None:intergenic
AAAGGTAGTGCTTCTGTGAC+GGG 0.492018 3:+73807848 MsG0380015692.01.T01:CDS
GTAGTATATGTGCAAACATT+TGG 0.492187 3:-73805190 None:intergenic
CTCAGAGGCTACAACAGGTT+CGG 0.495308 3:+73807808 MsG0380015692.01.T01:CDS
CATTCGGCTCCACTCCCTCC+TGG 0.498965 3:-73804859 None:intergenic
TATATTCAATGTTATGGTCC+AGG 0.505575 3:+73804841 MsG0380015692.01.T01:CDS
GTTACGCGATCTTGATGGAT+GGG 0.505887 3:+73804477 MsG0380015692.01.T01:CDS
TGTTATGGTCCAGGAGGGAG+TGG 0.505994 3:+73804850 MsG0380015692.01.T01:CDS
TGTAATATCCACTCTCTCCA+TGG 0.508725 3:-73806627 None:intergenic
AGTTAAATGTTGTGGCTCCA+TGG 0.510694 3:+73806610 MsG0380015692.01.T01:CDS
CTTAGTTAATCAAGTGAACA+AGG 0.510870 3:+73804811 MsG0380015692.01.T01:CDS
ATGATCATGCTGATGATGTT+GGG 0.513141 3:+73807933 MsG0380015692.01.T01:CDS
ATATTGTAGCACCAAACATT+CGG 0.513575 3:-73804875 None:intergenic
GTCTTCCATTCTTGATAACA+AGG 0.514624 3:-73805365 None:intergenic
ATGGATGGGTTCTGTAAAAT+GGG 0.514943 3:+73804491 MsG0380015692.01.T01:CDS
AAGATCTCAGAGGCTACAAC+AGG 0.516063 3:+73807803 MsG0380015692.01.T01:CDS
ACTTATGGTGCTTTAATGGA+TGG 0.517387 3:+73804782 MsG0380015692.01.T01:CDS
TGCACTGTCCAAGGATCGTA+AGG 0.518822 3:+73804697 MsG0380015692.01.T01:CDS
GTTAAATTGGAGAATGGATG+GGG 0.521532 3:-73804147 None:intergenic
ATATTTCTTCGTTTGAGAGT+GGG 0.530764 3:+73807903 MsG0380015692.01.T01:CDS
TATGATCATGCTGATGATGT+TGG 0.531073 3:+73807932 MsG0380015692.01.T01:CDS
TTGTTAAATTGGAGAATGGA+TGG 0.531097 3:-73804149 None:intergenic
TCAAGATCGCGTAACTAACT+CGG 0.537099 3:-73804469 None:intergenic
TCATCAACAAGCTCCAAAGA+AGG 0.540404 3:-73805040 None:intergenic
CATGTGCAACCACATGGTCG+TGG 0.546313 3:-73804433 None:intergenic
ATCTCTTCAAAGAGATGCAA+GGG 0.547820 3:+73804945 MsG0380015692.01.T01:CDS
TAAAGGTAGTGCTTCTGTGA+CGG 0.549158 3:+73807847 MsG0380015692.01.T01:CDS
GATATTTCTTCGTTTGAGAG+TGG 0.549217 3:+73807902 MsG0380015692.01.T01:CDS
AGTTACGCGATCTTGATGGA+TGG 0.553849 3:+73804476 MsG0380015692.01.T01:CDS
GGTTGCACATGGATTTAAGC+TGG 0.561922 3:+73804445 MsG0380015692.01.T01:CDS
GTTGATGAGATGCGTAGTAT+GGG 0.563677 3:+73805055 MsG0380015692.01.T01:CDS
GATGCGTAGTATGGGGAAAA+CGG 0.564342 3:+73805063 MsG0380015692.01.T01:CDS
AAACATTTGGCTGAATACAT+TGG 0.566239 3:-73805177 None:intergenic
TATTTCTTCGTTTGAGAGTG+GGG 0.566497 3:+73807904 MsG0380015692.01.T01:CDS
ATAGTGAAAGTAACGATGGA+GGG 0.570973 3:-73804254 None:intergenic
AATGAGGATCAGAGCCATGA+TGG 0.575339 3:+73807979 MsG0380015692.01.T01:CDS
AGCTTTATGGTCTTCCAATG+AGG 0.578462 3:+73807963 MsG0380015692.01.T01:CDS
GAAACAAGCTATGAATGTGT+TGG 0.578813 3:+73804721 MsG0380015692.01.T01:CDS
GGAGCCACAACATTTAACTT+GGG 0.583839 3:-73806606 None:intergenic
TGTTAAATTGGAGAATGGAT+GGG 0.583859 3:-73804148 None:intergenic
AATCTCTTCAAAGAGATGCA+AGG 0.584480 3:+73804944 MsG0380015692.01.T01:CDS
ATTTCTTCGTTTGAGAGTGG+GGG 0.587207 3:+73807905 MsG0380015692.01.T01:CDS
ACTAGTTGATGCACTGTCCA+AGG 0.587561 3:+73804688 MsG0380015692.01.T01:CDS
TATTCTGAGATGATTGCGAA+GGG 0.597831 3:+73804635 MsG0380015692.01.T01:CDS
AATTGTTACTGCCACGTCGG+TGG 0.600920 3:+73804284 MsG0380015692.01.T01:CDS
ATCAGAGCCATGATGGAACA+AGG 0.603309 3:+73807986 MsG0380015692.01.T01:CDS
TTTCTTCGTTTGAGAGTGGG+GGG 0.603320 3:+73807906 MsG0380015692.01.T01:CDS
GAATCCCAAGTTAAATGTTG+TGG 0.604523 3:+73806602 MsG0380015692.01.T01:CDS
TTCAATGTTATGGTCCAGGA+GGG 0.606433 3:+73804845 MsG0380015692.01.T01:CDS
AATAGTGAAAGTAACGATGG+AGG 0.608276 3:-73804255 None:intergenic
TAAATCCATGTGCAACCACA+TGG 0.610522 3:-73804439 None:intergenic
ACATTCACTACCCTTATCAA+AGG 0.611462 3:+73804371 MsG0380015692.01.T01:CDS
AACATGGGTTAACGCTGATG+TGG 0.612539 3:+73804547 MsG0380015692.01.T01:CDS
TTGTGGCTCCATGGAGAGAG+TGG 0.614412 3:+73806619 MsG0380015692.01.T01:CDS
ATTGATGGACTATGCAAAGG+TGG 0.616181 3:+73805217 MsG0380015692.01.T01:CDS
CTAATTGATGGACTATGCAA+AGG 0.617266 3:+73805214 MsG0380015692.01.T01:CDS
GTAGTGCTTCTGTGACGGGT+CGG 0.618058 3:+73807852 MsG0380015692.01.T01:CDS
CAAAATAGTGAAAGTAACGA+TGG 0.623400 3:-73804258 None:intergenic
TCTTAACGGTCAAGCTTACG+AGG 0.623551 3:+73804400 MsG0380015692.01.T01:CDS
TTATCAAGAATGGAAGACAA+TGG 0.626505 3:+73805370 MsG0380015692.01.T01:CDS
ATATTCTGAGATGATTGCGA+AGG 0.633116 3:+73804634 MsG0380015692.01.T01:CDS
CACTGTCCAAGGATCGTAAG+GGG 0.634780 3:+73804699 MsG0380015692.01.T01:CDS
AACCTATCTTGAGAATCTTG+GGG 0.636121 3:-73804331 None:intergenic
ATTCAATGTTATGGTCCAGG+AGG 0.647104 3:+73804844 MsG0380015692.01.T01:CDS
TGGAGAGAGTGGATATTACA+GGG 0.648531 3:+73806630 MsG0380015692.01.T01:CDS
GCACTGTCCAAGGATCGTAA+GGG 0.682356 3:+73804698 MsG0380015692.01.T01:CDS
ATTCTGAGATGATTGCGAAG+GGG 0.697795 3:+73804636 MsG0380015692.01.T01:CDS
ATGAATTGTTACTGCCACGT+CGG 0.715111 3:+73804281 MsG0380015692.01.T01:CDS
GAAGAGTTATTCCACCGACG+TGG 0.722774 3:-73804295 None:intergenic
TTGATGAGATGCGTAGTATG+GGG 0.746024 3:+73805056 MsG0380015692.01.T01:CDS
ATTCATGGAGAAGATCTCAG+AGG 0.777411 3:+73807793 MsG0380015692.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TTAAAATACATGATAAATAA+AGG - Chr3:73807053-73807072 None:intergenic 10.0%
!! TTAGTTATTTATAATTGTTA+AGG + Chr3:73806551-73806570 MsG0380015692.01.T01:intron 10.0%
!! TTTAAATATATTCAATGTTA+TGG + Chr3:73804835-73804854 MsG0380015692.01.T01:CDS 10.0%
!!! TTAATTTTGGTTATTAATAA+GGG + Chr3:73806454-73806473 MsG0380015692.01.T01:intron 10.0%
!!! TTTAATTTTGGTTATTAATA+AGG + Chr3:73806453-73806472 MsG0380015692.01.T01:intron 10.0%
!! CAAAATTAAAACAAATGAAA+AGG - Chr3:73806443-73806462 None:intergenic 15.0%
!! TATAAAAGAAATATAAGTTG+AGG + Chr3:73805574-73805593 MsG0380015692.01.T01:intron 15.0%
!! TATTTATAATTGTTAAGGTT+CGG + Chr3:73806556-73806575 MsG0380015692.01.T01:intron 15.0%
!!! ATAAAAGAAATATAAGTTGA+GGG + Chr3:73805575-73805594 MsG0380015692.01.T01:intron 15.0%
!!! ATACTAAAAGTATAAACATT+TGG - Chr3:73804668-73804687 None:intergenic 15.0%
!!! CTTTTCATTTGTTTTAATTT+TGG + Chr3:73806441-73806460 MsG0380015692.01.T01:intron 15.0%
!!! TAATTTTGGTTATTAATAAG+GGG + Chr3:73806455-73806474 MsG0380015692.01.T01:intron 15.0%
!! AAATAATTGGCATGATTAAT+TGG - Chr3:73806513-73806532 None:intergenic 20.0%
!! AAATACATGATAAATAAAGG+AGG - Chr3:73807050-73807069 None:intergenic 20.0%
!! ACACATTAGAAGAAAATAAT+TGG - Chr3:73806526-73806545 None:intergenic 20.0%
!! ACGTATAATGTTATGATAAA+TGG + Chr3:73805307-73805326 MsG0380015692.01.T01:CDS 20.0%
!! CATATATTGTTAGATGAAAT+CGG + Chr3:73805870-73805889 MsG0380015692.01.T01:intron 20.0%
!! CGTATAATGTTATGATAAAT+GGG + Chr3:73805308-73805327 MsG0380015692.01.T01:CDS 20.0%
!! GTATTTGAACATGATTATTA+AGG + Chr3:73807220-73807239 MsG0380015692.01.T01:intron 20.0%
!! TAAGCAACATTAAGAAAATT+GGG - Chr3:73806383-73806402 None:intergenic 20.0%
!! TGCTACAATATCATTATTAA+TGG + Chr3:73804887-73804906 MsG0380015692.01.T01:CDS 20.0%
!! TTAAGCAACATTAAGAAAAT+TGG - Chr3:73806384-73806403 None:intergenic 20.0%
!!! AATGTTTTAAATTGCAGTAA+TGG - Chr3:73807416-73807435 None:intergenic 20.0%
!!! ATTGCTATTTTCAATGAATT+TGG + Chr3:73805813-73805832 MsG0380015692.01.T01:intron 20.0%
!!! TTGCTATTTTCAATGAATTT+GGG + Chr3:73805814-73805833 MsG0380015692.01.T01:intron 20.0%
! AAATCTGTATTGTAATGACA+AGG - Chr3:73806207-73806226 None:intergenic 25.0%
! AAGTTATCTTAATTGTAGAC+TGG + Chr3:73806775-73806794 MsG0380015692.01.T01:intron 25.0%
! AATGTTGTTAAATTGGAGAA+TGG - Chr3:73804156-73804175 None:intergenic 25.0%
! ACATATACTACACTAATTGA+TGG + Chr3:73805202-73805221 MsG0380015692.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTACAATATCCTTATTGA+TGG + Chr3:73804992-73805011 MsG0380015692.01.T01:CDS 25.0%
! AGGCTAAAATGTTGTTAAAT+TGG - Chr3:73804163-73804182 None:intergenic 25.0%
! ATTATTAAGGATACCAACAT+GGG + Chr3:73807233-73807252 MsG0380015692.01.T01:intron 25.0%
! TCATTATGATTGAATAACAG+AGG + Chr3:73806087-73806106 MsG0380015692.01.T01:intron 25.0%
! TCTTCCTTATACAAACTATA+AGG - Chr3:73807884-73807903 None:intergenic 25.0%
! TTAAATGTTTAGCAAGCAAT+CGG + Chr3:73806400-73806419 MsG0380015692.01.T01:intron 25.0%
! TTTCGTCAATTAGAATTCAA+TGG + Chr3:73804224-73804243 MsG0380015692.01.T01:CDS 25.0%
!! ACATATAATTTAAGACACCT+TGG - Chr3:73805604-73805623 None:intergenic 25.0%
!!! TGATTTATGATTTGTTGTCA+CGG + Chr3:73806832-73806851 MsG0380015692.01.T01:intron 25.0%
AAACATTTGGCTGAATACAT+TGG - Chr3:73805180-73805199 None:intergenic 30.0%
AACAAATCATTTCTGCTGTT+AGG + Chr3:73806479-73806498 MsG0380015692.01.T01:intron 30.0%
ATATGCCACTACATATCATT+TGG - Chr3:73805855-73805874 None:intergenic 30.0%
ATATTGTAAGTTACCACATC+AGG - Chr3:73804983-73805002 None:intergenic 30.0%
ATATTGTAGCACCAAACATT+CGG - Chr3:73804878-73804897 None:intergenic 30.0%
ATATTTCTTCGTTTGAGAGT+GGG + Chr3:73807903-73807922 MsG0380015692.01.T01:CDS 30.0%
ATGCTGCAATCTTATAATTC+TGG - Chr3:73805948-73805967 None:intergenic 30.0%
ATTTGCACAAACCATCAATA+AGG - Chr3:73805006-73805025 None:intergenic 30.0%
CAAAATAGTGAAAGTAACGA+TGG - Chr3:73804261-73804280 None:intergenic 30.0%
CAAGAAATCCCTATATAGTA+GGG + Chr3:73806706-73806725 MsG0380015692.01.T01:intron 30.0%
CAGAGGATACAAGTATTTAT+AGG + Chr3:73806104-73806123 MsG0380015692.01.T01:intron 30.0%
CTTAGTTAATCAAGTGAACA+AGG + Chr3:73804811-73804830 MsG0380015692.01.T01:CDS 30.0%
GATTATTAAGGATACCAACA+TGG + Chr3:73807232-73807251 MsG0380015692.01.T01:intron 30.0%
GCTACTAATAAGTAATAACG+TGG - Chr3:73807137-73807156 None:intergenic 30.0%
GTAGTATATGTGCAAACATT+TGG - Chr3:73805193-73805212 None:intergenic 30.0%
GTAGTGAATGTTATGGAATT+GGG - Chr3:73804362-73804381 None:intergenic 30.0%
GTTGGGTTTATAAAGCTTTA+TGG + Chr3:73807950-73807969 MsG0380015692.01.T01:CDS 30.0%
GTTTACTTTCACTACTTACT+TGG + Chr3:73807459-73807478 MsG0380015692.01.T01:intron 30.0%
TAAATGTTTAGCAAGCAATC+GGG + Chr3:73806401-73806420 MsG0380015692.01.T01:intron 30.0%
TAACCTATCTTGAGAATCTT+GGG - Chr3:73804335-73804354 None:intergenic 30.0%
TATATTCAATGTTATGGTCC+AGG + Chr3:73804841-73804860 MsG0380015692.01.T01:CDS 30.0%
TATGTCCAAATGATATGTAG+TGG + Chr3:73805847-73805866 MsG0380015692.01.T01:intron 30.0%
TGGATTGTGCAAGAAAAAAA+GGG + Chr3:73804907-73804926 MsG0380015692.01.T01:CDS 30.0%
TGTTAAATTGGAGAATGGAT+GGG - Chr3:73804151-73804170 None:intergenic 30.0%
TTAAATTGCAGTAATGGTTG+TGG - Chr3:73807410-73807429 None:intergenic 30.0%
TTATAACCAACAATTTCGAC+AGG - Chr3:73806253-73806272 None:intergenic 30.0%
TTATCAAGAATGGAAGACAA+TGG + Chr3:73805370-73805389 MsG0380015692.01.T01:CDS 30.0%
TTGACGAAAAAGAGAAATAG+CGG - Chr3:73804213-73804232 None:intergenic 30.0%
TTGTTAAATTGGAGAATGGA+TGG - Chr3:73804152-73804171 None:intergenic 30.0%
TTTAAAAAGGTCTGTGATCT+AGG + Chr3:73807268-73807287 MsG0380015692.01.T01:intron 30.0%
! AAACCGAATGTTGTTACTTA+TGG + Chr3:73804767-73804786 MsG0380015692.01.T01:CDS 30.0%
! ATAAATGGGCTTTGTAAGAA+GGG + Chr3:73805322-73805341 MsG0380015692.01.T01:CDS 30.0%
! ATGGATTGTGCAAGAAAAAA+AGG + Chr3:73804906-73804925 MsG0380015692.01.T01:CDS 30.0%
! ATTGATGGTTTGTGCAAATT+AGG + Chr3:73805007-73805026 MsG0380015692.01.T01:CDS 30.0%
! ATTTATGCTCTCTCTGAAAA+AGG + Chr3:73805427-73805446 MsG0380015692.01.T01:intron 30.0%
! GAGTCCTTATAGTTTGTATA+AGG + Chr3:73807877-73807896 MsG0380015692.01.T01:CDS 30.0%
! GTGAGTTTGAAACTGTATAA+AGG + Chr3:73807830-73807849 MsG0380015692.01.T01:CDS 30.0%
! GTGCTTTTCATAAAAACACA+AGG + Chr3:73805914-73805933 MsG0380015692.01.T01:intron 30.0%
! TGTTACTTATGGTGCTTTAA+TGG + Chr3:73804778-73804797 MsG0380015692.01.T01:CDS 30.0%
! TTGATGGTTTGTGCAAATTA+GGG + Chr3:73805008-73805027 MsG0380015692.01.T01:CDS 30.0%
! TTGGCTATGATGATGAAAAA+AGG + Chr3:73804740-73804759 MsG0380015692.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTGTTACAACCTCTATCA+AGG - Chr3:73806001-73806020 None:intergenic 30.0%
!! ACAACATTTAACTTGGGATT+CGG - Chr3:73806603-73806622 None:intergenic 30.0%
!! TGTTATCATCAACTAGCTTT+AGG - Chr3:73806805-73806824 None:intergenic 30.0%
!!! AACAGGTAGATATCCTTTTT+TGG - Chr3:73806967-73806986 None:intergenic 30.0%
!!! GTAGTGGTTGATTTTAACTA+GGG - Chr3:73804186-73804205 None:intergenic 30.0%
AAATGTTTAGCAAGCAATCG+GGG + Chr3:73806402-73806421 MsG0380015692.01.T01:intron 35.0%
AACCTATCTTGAGAATCTTG+GGG - Chr3:73804334-73804353 None:intergenic 35.0%
AAGACACATGCCTTTGATAA+GGG - Chr3:73804384-73804403 None:intergenic 35.0%
AAGGCTGTCATATAACTGTT+TGG + Chr3:73805284-73805303 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
AATAGTGAAAGTAACGATGG+AGG - Chr3:73804258-73804277 None:intergenic 35.0%
AATCTCTTCAAAGAGATGCA+AGG + Chr3:73804944-73804963 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
ACATTCACTACCCTTATCAA+AGG + Chr3:73804371-73804390 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
ACCTATGGAGCTAAAAAAGT+AGG - Chr3:73805696-73805715 None:intergenic 35.0%
ACTTATGGTGCTTTAATGGA+TGG + Chr3:73804782-73804801 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
ACTTATTAGTAGCAGCAACA+TGG + Chr3:73807144-73807163 MsG0380015692.01.T01:intron 35.0%
ATAGTGAAAGTAACGATGGA+GGG - Chr3:73804257-73804276 None:intergenic 35.0%
ATAGTTGAAAACCGTATCGT+AGG + Chr3:73807620-73807639 MsG0380015692.01.T01:intron 35.0%
ATCTCTTCAAAGAGATGCAA+GGG + Chr3:73804945-73804964 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
ATTGTGCAAGAAAAAAAGGG+TGG + Chr3:73804910-73804929 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
CAACACTTCACTATAGAAAG+AGG - Chr3:73805732-73805751 None:intergenic 35.0%
CACCTTTCATTGTCACAAAT+CGG - Chr3:73806918-73806937 None:intergenic 35.0%
CCAAGAAATCCCTATATAGT+AGG + Chr3:73806705-73806724 MsG0380015692.01.T01:intron 35.0%
CCAGGCAATTACATTAGTTA+AGG + Chr3:73805144-73805163 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
CCATTGTTAAACCTTGATAG+AGG + Chr3:73805987-73806006 MsG0380015692.01.T01:intron 35.0%
CCTACTATATAGGGATTTCT+TGG - Chr3:73806708-73806727 None:intergenic 35.0%
CCTCTATCAAGGTTTAACAA+TGG - Chr3:73805990-73806009 None:intergenic 35.0%
CCTTAACTAATGTAATTGCC+TGG - Chr3:73805147-73805166 None:intergenic 35.0%
CTAAGAATCACAGTCAAATG+CGG - Chr3:73807358-73807377 None:intergenic 35.0%
CTATCAAGGTTTAACAATGG+CGG - Chr3:73805987-73806006 None:intergenic 35.0%
CTCTTTCTATAGTGAAGTGT+TGG + Chr3:73805730-73805749 MsG0380015692.01.T01:intron 35.0%
CTTTGTAAGCGATGCTTATA+AGG + Chr3:73804610-73804629 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
GAAAAAGAGAAATAGCGGTA+GGG - Chr3:73804208-73804227 None:intergenic 35.0%
GAAAAAGATTGATCCTGATG+TGG + Chr3:73804967-73804986 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
GAAAATCTGTTGCTGATATG+TGG + Chr3:73807481-73807500 MsG0380015692.01.T01:intron 35.0%
GAAACAAGCTATGAATGTGT+TGG + Chr3:73804721-73804740 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
GAATCCCAAGTTAAATGTTG+TGG + Chr3:73806602-73806621 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
GATAAGGGTAGTGAATGTTA+TGG - Chr3:73804369-73804388 None:intergenic 35.0%
GATATTTCTTCGTTTGAGAG+TGG + Chr3:73807902-73807921 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
GATTTCTTGGTTACAGGAAT+CGG - Chr3:73806695-73806714 None:intergenic 35.0%
GCAAATGCTGAGAAAAACAT+GGG + Chr3:73804532-73804551 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
GCACCATAAGTAACAACATT+CGG - Chr3:73804773-73804792 None:intergenic 35.0%
GGTAGTGAATGTTATGGAAT+TGG - Chr3:73804363-73804382 None:intergenic 35.0%
GTAACCTATCTTGAGAATCT+TGG - Chr3:73804336-73804355 None:intergenic 35.0%
GTTAAATTGGAGAATGGATG+GGG - Chr3:73804150-73804169 None:intergenic 35.0%
GTTCTTGTCCCTACTATATA+GGG - Chr3:73806717-73806736 None:intergenic 35.0%
GTTTCATAACTTACAGCATC+AGG - Chr3:73805403-73805422 None:intergenic 35.0%
TAAGACACATGCCTTTGATA+AGG - Chr3:73804385-73804404 None:intergenic 35.0%
TAAGCACACAAAATACACAG+AGG + Chr3:73805773-73805792 MsG0380015692.01.T01:intron 35.0%
TATAGGGATTTCTTGGTTAC+AGG - Chr3:73806701-73806720 None:intergenic 35.0%
TATTTCTTCGTTTGAGAGTG+GGG + Chr3:73807904-73807923 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
TGCAAATGCTGAGAAAAACA+TGG + Chr3:73804531-73804550 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
TGTCTATTACGACCACAATA+CGG + Chr3:73807174-73807193 MsG0380015692.01.T01:intron 35.0%
TGTTAACAACATGCTTACTC+TGG - Chr3:73807021-73807040 None:intergenic 35.0%
! ACTTGCCTTGTTATCAAGAA+TGG + Chr3:73805360-73805379 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
! ATCAAAGGCATGTGTCTTAA+CGG + Chr3:73804386-73804405 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
! ATGATCATGCTGATGATGTT+GGG + Chr3:73807933-73807952 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
! ATGGATGGGTTCTGTAAAAT+GGG + Chr3:73804491-73804510 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
! CATCTCTTTGAAGAGATTCA+TGG - Chr3:73804942-73804961 None:intergenic 35.0%
! CTTATGGTGCTTTAATGGAT+GGG + Chr3:73804783-73804802 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
! GACAATGAAAGGTGATGTTT+TGG + Chr3:73806924-73806943 MsG0380015692.01.T01:intron 35.0%
! GATAAATGGGCTTTGTAAGA+AGG + Chr3:73805321-73805340 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
! GGATGCAAAAGTGATTTTTC+AGG + Chr3:73805249-73805268 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
! GGTTTTCAACTATATCGACA+CGG - Chr3:73807613-73807632 None:intergenic 35.0%
! GTCTTCCATTCTTGATAACA+AGG - Chr3:73805368-73805387 None:intergenic 35.0%
! TATGATCATGCTGATGATGT+TGG + Chr3:73807932-73807951 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
! TTAAATGCCTTGTTCCATCA+TGG - Chr3:73807996-73808015 None:intergenic 35.0%
! TTCCGATTTGTGACAATGAA+AGG + Chr3:73806913-73806932 MsG0380015692.01.T01:intron 35.0%
!! ATATTCTGAGATGATTGCGA+AGG + Chr3:73804634-73804653 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
!! CTAATTGATGGACTATGCAA+AGG + Chr3:73805214-73805233 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
!! TATTCTGAGATGATTGCGAA+GGG + Chr3:73804635-73804654 MsG0380015692.01.T01:CDS 35.0%
!!! CACAGACCTTTTTAAAACCT+TGG - Chr3:73807264-73807283 None:intergenic 35.0%
!!! GGTAGTGGTTGATTTTAACT+AGG - Chr3:73804187-73804206 None:intergenic 35.0%
!!! GTGCAACCAAGGTTTTAAAA+AGG + Chr3:73807255-73807274 MsG0380015692.01.T01:intron 35.0%
ACCAACAATTTCGACAGGAA+CGG - Chr3:73806248-73806267 None:intergenic 40.0%
AGACATGAGTTATGTGCTAC+AGG - Chr3:73806739-73806758 None:intergenic 40.0%
AGCCCACTTGTCATTAAGAT+CGG - Chr3:73806328-73806347 None:intergenic 40.0%
AGCTCAGCAACCAAATTTCA+TGG - Chr3:73807560-73807579 None:intergenic 40.0%
AGGGAAAATCTCTCCTTCTT+TGG + Chr3:73805027-73805046 MsG0380015692.01.T01:CDS 40.0%
AGTTAAATGTTGTGGCTCCA+TGG + Chr3:73806610-73806629 MsG0380015692.01.T01:CDS 40.0%
AGTTAGTGTATGCTGAAAGG+TGG + Chr3:73807742-73807761 MsG0380015692.01.T01:intron 40.0%
AGTTAGTTACGCGATCTTGA+TGG + Chr3:73804472-73804491 MsG0380015692.01.T01:CDS 40.0%
ATGAATTGTTACTGCCACGT+CGG + Chr3:73804281-73804300 MsG0380015692.01.T01:CDS 40.0%
ATGCAAAGGTGGAAGACTTA+TGG + Chr3:73805228-73805247 MsG0380015692.01.T01:CDS 40.0%
ATGGAGAGAGTGGATATTAC+AGG + Chr3:73806629-73806648 MsG0380015692.01.T01:CDS 40.0%
ATTCAATGTTATGGTCCAGG+AGG + Chr3:73804844-73804863 MsG0380015692.01.T01:CDS 40.0%
ATTCATGGAGAAGATCTCAG+AGG + Chr3:73807793-73807812 MsG0380015692.01.T01:CDS 40.0%
ATTTCTTCGTTTGAGAGTGG+GGG + Chr3:73807905-73807924 MsG0380015692.01.T01:CDS 40.0%
CAAAAATCATCATCTCGACC+AGG + Chr3:73805126-73805145 MsG0380015692.01.T01:CDS 40.0%
CACAAAATACACAGAGGAGA+TGG + Chr3:73805779-73805798 MsG0380015692.01.T01:intron 40.0%
CACATAACTCATGTCTCATG+AGG + Chr3:73806743-73806762 MsG0380015692.01.T01:intron 40.0%
CAGAGTTAGTGTATGCTGAA+AGG + Chr3:73807739-73807758 MsG0380015692.01.T01:intron 40.0%
CATGCTTACTCTGGTTGATT+TGG - Chr3:73807012-73807031 None:intergenic 40.0%
CATGTATCTGTAGTTGTCTC+TGG - Chr3:73806160-73806179 None:intergenic 40.0%
CGAAAAAGAGAAATAGCGGT+AGG - Chr3:73804209-73804228 None:intergenic 40.0%
CTATGTGCAATGATTGTGAG+AGG + Chr3:73805475-73805494 MsG0380015692.01.T01:intron 40.0%
CTCAGCAACCAAATTTCATG+GGG - Chr3:73807558-73807577 None:intergenic 40.0%
CTTCACTATAGAAAGAGGTG+AGG - Chr3:73805727-73805746 None:intergenic 40.0%
GCTCAGCAACCAAATTTCAT+GGG - Chr3:73807559-73807578 None:intergenic 40.0%
GGTTCTTGTCCCTACTATAT+AGG - Chr3:73806718-73806737 None:intergenic 40.0%
GTGAGTCAATGATGCATTCA+TGG + Chr3:73807778-73807797 MsG0380015692.01.T01:intron 40.0%
TAAAGGTAGTGCTTCTGTGA+CGG + Chr3:73807847-73807866 MsG0380015692.01.T01:CDS 40.0%
TAAATCCATGTGCAACCACA+TGG - Chr3:73804442-73804461 None:intergenic 40.0%
TCAAGATCGCGTAACTAACT+CGG - Chr3:73804472-73804491 None:intergenic 40.0%
TCATCAACAAGCTCCAAAGA+AGG - Chr3:73805043-73805062 None:intergenic 40.0%
TCCAGCAAGTGAACCAAAAA+AGG + Chr3:73806951-73806970 MsG0380015692.01.T01:intron 40.0%
TGCCGATCTTAATGACAAGT+GGG + Chr3:73806323-73806342 MsG0380015692.01.T01:intron 40.0%
TGGAGAGAGTGGATATTACA+GGG + Chr3:73806630-73806649 MsG0380015692.01.T01:CDS 40.0%
TGGAGCCACAACATTTAACT+TGG - Chr3:73806610-73806629 None:intergenic 40.0%
TGTAATATCCACTCTCTCCA+TGG - Chr3:73806630-73806649 None:intergenic 40.0%
TGTGATTCTTAGCGATACCA+AGG + Chr3:73807366-73807385 MsG0380015692.01.T01:intron 40.0%
TGTTGCTGATATGTGGAGAT+AGG + Chr3:73807488-73807507 MsG0380015692.01.T01:intron 40.0%
TTCAATGTTATGGTCCAGGA+GGG + Chr3:73804845-73804864 MsG0380015692.01.T01:CDS 40.0%
TTGATGAGATGCGTAGTATG+GGG + Chr3:73805056-73805075 MsG0380015692.01.T01:CDS 40.0%
TTGCCGATCTTAATGACAAG+TGG + Chr3:73806322-73806341 MsG0380015692.01.T01:intron 40.0%
! AGCTTTATGGTCTTCCAATG+AGG + Chr3:73807963-73807982 MsG0380015692.01.T01:CDS 40.0%
! ATATAAGTTGAGGGACTCCA+AGG + Chr3:73805584-73805603 MsG0380015692.01.T01:intron 40.0%
! GATGGATGGGTTCTGTAAAA+TGG + Chr3:73804490-73804509 MsG0380015692.01.T01:CDS 40.0%
! GGAGCCACAACATTTAACTT+GGG - Chr3:73806609-73806628 None:intergenic 40.0%
! GTGGAGATAGGATTTGAGTT+AGG + Chr3:73807500-73807519 MsG0380015692.01.T01:intron 40.0%
! GTTGATGAGATGCGTAGTAT+GGG + Chr3:73805055-73805074 MsG0380015692.01.T01:CDS 40.0%
! TGTTGATGAGATGCGTAGTA+TGG + Chr3:73805054-73805073 MsG0380015692.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTCTGAGATGATTGCGAAG+GGG + Chr3:73804636-73804655 MsG0380015692.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTGATGGACTATGCAAAGG+TGG + Chr3:73805217-73805236 MsG0380015692.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTCAGGAGCTTTTGACTGA+AGG + Chr3:73805265-73805284 MsG0380015692.01.T01:CDS 40.0%
!!! GCCTACTTTTTTAGCTCCAT+AGG + Chr3:73805692-73805711 MsG0380015692.01.T01:intron 40.0%
!!! GTGGTTGATTTTAACTAGGG+AGG - Chr3:73804183-73804202 None:intergenic 40.0%
!!! TCCTTTTTTGGTTCACTTGC+TGG - Chr3:73806955-73806974 None:intergenic 40.0%
AAAGGTAGTGCTTCTGTGAC+GGG + Chr3:73807848-73807867 MsG0380015692.01.T01:CDS 45.0%
AAGATCTCAGAGGCTACAAC+AGG + Chr3:73807803-73807822 MsG0380015692.01.T01:CDS 45.0%
AATGAGGATCAGAGCCATGA+TGG + Chr3:73807979-73807998 MsG0380015692.01.T01:CDS 45.0%
AATTGGAGAATGGATGGGGT+TGG - Chr3:73804146-73804165 None:intergenic 45.0%
ACTCTCTAAGTCTCTTGCTG+CGG - Chr3:73807696-73807715 None:intergenic 45.0%
AGTTACGCGATCTTGATGGA+TGG + Chr3:73804476-73804495 MsG0380015692.01.T01:CDS 45.0%
CACAGAGGAGATGGAAACTT+TGG + Chr3:73805788-73805807 MsG0380015692.01.T01:intron 45.0%
CTCCCCAAGATTCTCAAGAT+AGG + Chr3:73804329-73804348 MsG0380015692.01.T01:CDS 45.0%
CTGGAGTTTCATAAACTCCC+CGG - Chr3:73807655-73807674 None:intergenic 45.0%
GAGGCTATCCCCATGAAATT+TGG + Chr3:73807547-73807566 MsG0380015692.01.T01:intron 45.0%
GATACCAAGGATCACATTCG+CGG + Chr3:73807379-73807398 MsG0380015692.01.T01:intron 45.0%
GATGCGTAGTATGGGGAAAA+CGG + Chr3:73805063-73805082 MsG0380015692.01.T01:CDS 45.0%
GATGTTGCTGCAATCGTAAC+AGG + Chr3:73807310-73807329 MsG0380015692.01.T01:intron 45.0%
GGAGTTTATGAAACTCCAGG+TGG + Chr3:73807656-73807675 MsG0380015692.01.T01:intron 45.0%
GGTGAGGATCTACTAACCTA+TGG - Chr3:73805711-73805730 None:intergenic 45.0%
GGTTGCACATGGATTTAAGC+TGG + Chr3:73804445-73804464 MsG0380015692.01.T01:CDS 45.0%
TCTTAACGGTCAAGCTTACG+AGG + Chr3:73804400-73804419 MsG0380015692.01.T01:CDS 45.0%
TGGATGGGGTTGGAGAAATT+TGG - Chr3:73804136-73804155 None:intergenic 45.0%
TTGTTTCCCCTTACGATCCT+TGG - Chr3:73804708-73804727 None:intergenic 45.0%
TTTCAGTTGCTGCCGTATTG+TGG - Chr3:73807189-73807208 None:intergenic 45.0%
TTTCTTCGTTTGAGAGTGGG+GGG + Chr3:73807906-73807925 MsG0380015692.01.T01:CDS 45.0%
! AACATGGGTTAACGCTGATG+TGG + Chr3:73804547-73804566 MsG0380015692.01.T01:CDS 45.0%
! ACTAGTTGATGCACTGTCCA+AGG + Chr3:73804688-73804707 MsG0380015692.01.T01:CDS 45.0%
! ATCAGAGCCATGATGGAACA+AGG + Chr3:73807986-73808005 MsG0380015692.01.T01:CDS 45.0%
! GTTACGCGATCTTGATGGAT+GGG + Chr3:73804477-73804496 MsG0380015692.01.T01:CDS 45.0%
!! ATCATGGCTCTGATCCTCAT+TGG - Chr3:73807980-73807999 None:intergenic 45.0%
!! TAGTGAAGTGTTGGCTTGTC+AGG + Chr3:73805739-73805758 MsG0380015692.01.T01:intron 45.0%
!! TCTACTTTTCCACGACCATG+TGG + Chr3:73804424-73804443 MsG0380015692.01.T01:CDS 45.0%
!!! ACAAATTTTTTAATAAAATA+AGG - Chr3:73807112-73807131 None:intergenic 5.0%
AACCTTGGTTGCACCCATGT+TGG - Chr3:73807249-73807268 None:intergenic 50.0%
AAGGTCTGTGATCTAGGCTG+TGG + Chr3:73807274-73807293 MsG0380015692.01.T01:intron 50.0%
AATTGTTACTGCCACGTCGG+TGG + Chr3:73804284-73804303 MsG0380015692.01.T01:CDS 50.0%
CACTGTCCAAGGATCGTAAG+GGG + Chr3:73804699-73804718 MsG0380015692.01.T01:CDS 50.0%
CGGGGAGTTTATGAAACTCC+AGG + Chr3:73807653-73807672 MsG0380015692.01.T01:intron 50.0%
CTCAGAGGCTACAACAGGTT+CGG + Chr3:73807808-73807827 MsG0380015692.01.T01:CDS 50.0%
GAAGAGTTATTCCACCGACG+TGG - Chr3:73804298-73804317 None:intergenic 50.0%
GAGAAATAGCGGTAGGGTAG+TGG - Chr3:73804202-73804221 None:intergenic 50.0%
GCACTGTCCAAGGATCGTAA+GGG + Chr3:73804698-73804717 MsG0380015692.01.T01:CDS 50.0%
GCATTCCAGTGACAGTGAAC+GGG + Chr3:73807522-73807541 MsG0380015692.01.T01:intron 50.0%
GCCGTTCCTGTCGAAATTGT+TGG + Chr3:73806244-73806263 MsG0380015692.01.T01:intron 50.0%
GGCATTCCAGTGACAGTGAA+CGG + Chr3:73807521-73807540 MsG0380015692.01.T01:intron 50.0%
GTTGCTGAGCTGAACGAGAT+AGG + Chr3:73807569-73807588 MsG0380015692.01.T01:intron 50.0%
TACCAACATGGGTGCAACCA+AGG + Chr3:73807244-73807263 MsG0380015692.01.T01:intron 50.0%
TCTTGCTGCGGTGAAGAGAA+TGG - Chr3:73807684-73807703 None:intergenic 50.0%
TGCACTGTCCAAGGATCGTA+AGG + Chr3:73804697-73804716 MsG0380015692.01.T01:CDS 50.0%
! ATAGGCGGAAGGCATGGAAT+AGG + Chr3:73807587-73807606 MsG0380015692.01.T01:intron 50.0%
!! GTTGATTTGGAGCGTCCTCT+GGG - Chr3:73806999-73807018 None:intergenic 50.0%
AACGAGATAGGCGGAAGGCA+TGG + Chr3:73807581-73807600 MsG0380015692.01.T01:intron 55.0%
AGCTGAACGAGATAGGCGGA+AGG + Chr3:73807576-73807595 MsG0380015692.01.T01:intron 55.0%
AGGGAGTGGAGCCGAATGTT+TGG + Chr3:73804864-73804883 MsG0380015692.01.T01:CDS 55.0%
CACGACCATGTGGTTGCACA+TGG + Chr3:73804434-73804453 MsG0380015692.01.T01:CDS 55.0%
CAGTCAAATGCGGCTGATGC+AGG - Chr3:73807348-73807367 None:intergenic 55.0%
CAGTGACAGTGAACGGGAAG+AGG + Chr3:73807528-73807547 MsG0380015692.01.T01:intron 55.0%
CATAAACTCCCCGGCTCTTC+AGG - Chr3:73807646-73807665 None:intergenic 55.0%
CATGTGCAACCACATGGTCG+TGG - Chr3:73804436-73804455 None:intergenic 55.0%
CCTCTGGGTCTACAGTCAAC+AGG - Chr3:73806984-73807003 None:intergenic 55.0%
CTCTTCCCGTTCACTGTCAC+TGG - Chr3:73807530-73807549 None:intergenic 55.0%
GCATATGCGAGTCTGGAGGA+TGG + Chr3:73806348-73806367 MsG0380015692.01.T01:intron 55.0%
GCTGAGCTGAACGAGATAGG+CGG + Chr3:73807572-73807591 MsG0380015692.01.T01:intron 55.0%
GGCTCTTCAGGCCTACGATA+CGG - Chr3:73807634-73807653 None:intergenic 55.0%
GTATCGTAGGCCTGAAGAGC+CGG + Chr3:73807633-73807652 MsG0380015692.01.T01:intron 55.0%
TATCGTAGGCCTGAAGAGCC+GGG + Chr3:73807634-73807653 MsG0380015692.01.T01:intron 55.0%
TGTGCCGCGAATGTGATCCT+TGG - Chr3:73807386-73807405 None:intergenic 55.0%
TGTTATGGTCCAGGAGGGAG+TGG + Chr3:73804850-73804869 MsG0380015692.01.T01:CDS 55.0%
TTGTGGCTCCATGGAGAGAG+TGG + Chr3:73806619-73806638 MsG0380015692.01.T01:CDS 55.0%
! CCTGTTGACTGTAGACCCAG+AGG + Chr3:73806981-73807000 MsG0380015692.01.T01:intron 55.0%
!! GGTTGATTTGGAGCGTCCTC+TGG - Chr3:73807000-73807019 None:intergenic 55.0%
!! GTAGTGCTTCTGTGACGGGT+CGG + Chr3:73807852-73807871 MsG0380015692.01.T01:CDS 55.0%
!! GTGAAGAGAATGGTGCCACC+TGG - Chr3:73807674-73807693 None:intergenic 55.0%
ATCGTAGGCCTGAAGAGCCG+GGG + Chr3:73807635-73807654 MsG0380015692.01.T01:intron 60.0%
GGCTGCATATGCGAGTCTGG+AGG + Chr3:73806344-73806363 MsG0380015692.01.T01:intron 60.0%
! GTGGGCTGCATATGCGAGTC+TGG + Chr3:73806341-73806360 MsG0380015692.01.T01:intron 60.0%
CATTCGGCTCCACTCCCTCC+TGG - Chr3:73804862-73804881 None:intergenic 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 73804128 73808015 73804128 ID=MsG0380015692.01;Name=MsG0380015692.01
Chr3 mRNA 73804128 73808015 73804128 ID=MsG0380015692.01.T01;Parent=MsG0380015692.01;Name=MsG0380015692.01.T01;_AED=0.29;_eAED=0.29;_QI=0|0|0|1|1|1|3|0|536
Chr3 exon 73804128 73805408 73804128 ID=MsG0380015692.01.T01:exon:24333;Parent=MsG0380015692.01.T01
Chr3 exon 73806573 73806669 73806573 ID=MsG0380015692.01.T01:exon:24334;Parent=MsG0380015692.01.T01
Chr3 exon 73807783 73808015 73807783 ID=MsG0380015692.01.T01:exon:24335;Parent=MsG0380015692.01.T01
Chr3 CDS 73804128 73805408 73804128 ID=MsG0380015692.01.T01:cds;Parent=MsG0380015692.01.T01
Chr3 CDS 73806573 73806669 73806573 ID=MsG0380015692.01.T01:cds;Parent=MsG0380015692.01.T01
Chr3 CDS 73807783 73808015 73807783 ID=MsG0380015692.01.T01:cds;Parent=MsG0380015692.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380015692.01.T01

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Protein sequence

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