AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580027140.01

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MsG0580027140.01.T01 AT5G16640 32.906 468 298 3 127 579 34 500 7.11e-86 277
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MsG0580027140.01.T01 AT5G16640 32.660 297 191 1 325 612 62 358 1.31e-44 166
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MsG0580027140.01.T01 AT3G16710 25.854 205 143 1 414 609 48 252 1.64e-14 77.0
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MsG0580027140.01.T01 AT1G09900 26.386 451 291 6 3 445 168 585 7.11e-45 169
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MsG0580027140.01.T01 AT5G64320 30.635 457 301 4 165 611 215 665 1.03e-70 243
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MsG0580027140.01.T01 AT4G26800 28.775 351 239 3 267 606 114 464 3.27e-43 162
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MsG0580027140.01.T01 AT3G16710 24.920 313 214 3 84 395 157 449 8.65e-28 117
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MsG0580027140.01.T01 AT3G48810 24.148 352 217 3 304 610 71 417 1.28e-21 99.8
MsG0580027140.01.T01 AT3G48810 21.192 302 211 5 33 325 368 651 1.82e-14 77.0
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MsG0580027140.01.T01 AT1G05670 27.500 520 348 4 22 534 219 716 7.24e-67 232
MsG0580027140.01.T01 AT1G05670 32.905 389 252 1 232 611 239 627 8.01e-67 232
MsG0580027140.01.T01 AT1G05670 30.047 426 289 1 195 611 272 697 5.06e-66 230
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MsG0580027140.01.T01 AT5G65560 31.027 448 299 2 172 610 186 632 7.18e-65 229
MsG0580027140.01.T01 AT5G65560 32.374 417 272 2 204 611 183 598 3.92e-61 219
MsG0580027140.01.T01 AT5G65560 26.904 591 383 8 11 592 222 772 4.96e-60 216
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MsG0580027140.01.T01 AT1G13630 21.845 618 351 13 11 502 82 693 7.38e-34 137
MsG0580027140.01.T01 AT1G13630 30.000 300 193 4 323 612 47 339 5.98e-33 135
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MsG0580027140.01.T01 AT3G54980 26.825 589 391 8 33 602 284 851 3.57e-52 192
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MsG0580027140.01.T01 AT3G09060 26.655 559 366 9 35 590 167 684 4.67e-53 193
MsG0580027140.01.T01 AT3G09060 29.221 308 206 4 314 610 83 389 8.56e-36 143
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MsG0580027140.01.T01 AT1G19290 25.077 646 385 11 35 612 243 857 7.45e-49 183
MsG0580027140.01.T01 AT1G19290 28.889 405 254 6 214 612 127 503 5.48e-37 148
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MsG0580027140.01.T01 AT1G11710 25.893 448 291 5 172 611 221 635 1.55e-45 171
MsG0580027140.01.T01 AT1G11710 24.935 385 275 3 234 606 145 527 5.46e-37 147
MsG0580027140.01.T01 AT1G11710 24.498 249 172 4 376 611 147 392 1.69e-16 83.6
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MsG0580027140.01.T01 AT1G53330 28.417 278 156 3 342 610 46 289 1.02e-27 115
MsG0580027140.01.T01 AT1G53330 30.114 176 113 3 446 611 45 220 9.98e-18 85.9
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MsG0580027140.01.T01 AT5G40400 21.806 454 301 8 22 448 232 658 1.76e-14 77.4
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MsG0580027140.01.T01 AT1G13800 22.957 514 302 7 35 482 379 864 1.09e-36 147
MsG0580027140.01.T01 AT1G13800 23.077 637 353 15 83 611 255 862 1.61e-36 146
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MsG0580027140.01.T01 AT1G07740 24.791 359 270 0 172 530 84 442 1.89e-32 130
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MsG0580027140.01.T01 AT5G18950 22.884 319 217 5 39 351 170 465 1.23e-17 86.7
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MsG0580027140.01.T01 AT2G18940 21.899 516 359 10 32 531 296 783 2.11e-27 118
MsG0580027140.01.T01 AT2G18940 19.417 515 383 6 4 510 307 797 1.04e-26 116
MsG0580027140.01.T01 AT2G18940 23.670 376 254 5 242 611 139 487 1.57e-21 99.8
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MsG0580027140.01.T01 AT5G46680 27.922 308 208 6 316 611 20 325 1.25e-29 122
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MsG0580027140.01.T01 AT1G74850 20.881 613 384 12 50 612 139 700 9.43e-27 116
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MsG0580027140.01.T01 AT4G01400 32.461 191 120 1 430 611 171 361 1.79e-27 116
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MsG0580027140.01.T01 AT3G60050 29.932 294 200 2 245 535 155 445 3.62e-32 130
MsG0580027140.01.T01 AT3G60050 30.672 238 165 0 172 409 222 459 7.20e-28 117
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MsG0580027140.01.T01 AT3G60050 26.259 278 161 4 344 612 149 391 7.94e-15 77.8
MsG0580027140.01.T01 AT4G01030 23.888 427 300 5 156 571 147 559 8.01e-32 132
MsG0580027140.01.T01 AT4G01030 22.896 297 199 2 294 590 140 406 2.14e-24 108
MsG0580027140.01.T01 AT4G01030 22.189 338 210 5 323 611 24 357 2.98e-15 79.7
MsG0580027140.01.T01 AT4G01030 19.957 466 303 12 51 492 154 573 5.15e-15 79.0
MsG0580027140.01.T01 AT5G39980 23.198 444 325 4 170 603 191 628 9.21e-32 131
MsG0580027140.01.T01 AT5G39980 21.005 557 375 9 107 610 57 601 7.30e-28 119
MsG0580027140.01.T01 AT5G39980 22.086 489 336 8 35 490 137 613 4.40e-23 104
MsG0580027140.01.T01 AT5G39980 23.885 314 230 1 307 611 153 466 7.62e-23 103
MsG0580027140.01.T01 AT2G17670 30.169 295 199 4 134 423 52 344 1.40e-31 126
MsG0580027140.01.T01 AT2G17670 25.084 299 206 6 237 531 63 347 2.69e-26 110
MsG0580027140.01.T01 AT2G17670 25.000 232 171 2 270 498 118 349 8.95e-20 91.7
MsG0580027140.01.T01 AT2G17670 22.442 303 189 5 321 610 61 330 4.00e-16 80.9
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MsG0580027140.01.T01 AT1G18900 27.211 294 205 1 269 553 359 652 2.22e-27 118
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MsG0580027140.01.T01 AT3G22670 26.433 314 221 3 173 480 243 552 8.60e-23 103
MsG0580027140.01.T01 AT3G22670 20.811 370 259 5 54 392 168 534 5.32e-13 72.4
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MsG0580027140.01.T01 AT3G13150 25.743 202 149 1 309 509 157 358 5.79e-19 91.3
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MsG0580027140.01.T01 AT2G15980 21.811 243 167 4 382 601 165 407 1.53e-12 70.9
MsG0580027140.01.T01 AT3G13160 24.400 250 188 1 286 534 118 367 2.71e-24 105
MsG0580027140.01.T01 AT3G13160 24.062 320 222 8 306 612 38 349 1.71e-19 91.7
MsG0580027140.01.T01 AT3G13160 22.124 226 175 1 174 398 111 336 3.73e-16 81.3
MsG0580027140.01.T01 AT3G13160 21.250 240 188 1 164 402 136 375 4.03e-14 75.1
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MsG0580027140.01.T01 AT5G18390 24.051 316 230 2 307 612 109 424 2.57e-22 100
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MsG0580027140.01.T01 AT5G14080 21.475 461 326 4 156 611 69 498 5.04e-24 107
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MsG0580027140.01.T01 AT1G08070 23.009 452 312 10 170 606 66 496 5.19e-22 101
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MsG0580027140.01.T01 AT1G77405 24.727 275 153 5 358 611 179 420 9.98e-18 86.7
MsG0580027140.01.T01 AT1G77405 27.778 198 126 5 167 348 197 393 5.68e-16 81.3
MsG0580027140.01.T01 AT1G77405 23.404 235 166 3 194 414 190 424 2.78e-14 75.9
MsG0580027140.01.T01 AT1G77405 25.641 234 113 4 440 612 153 386 6.86e-13 71.6
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MsG0580027140.01.T01 AT5G52850 21.429 364 230 12 169 527 427 739 8.79e-12 68.9
MsG0580027140.01.T01 AT2G21090 20.811 370 277 7 165 533 140 494 1.79e-21 99.4
MsG0580027140.01.T01 AT3G62890 23.596 356 217 6 157 503 12 321 2.34e-21 98.6
MsG0580027140.01.T01 AT3G14580 27.094 203 148 0 269 471 197 399 2.72e-21 97.1
MsG0580027140.01.T01 AT3G14580 25.551 227 169 0 288 514 146 372 2.83e-20 94.0
MsG0580027140.01.T01 AT3G14580 24.519 208 157 0 202 409 165 372 9.89e-20 92.4
MsG0580027140.01.T01 AT3G14580 22.508 311 228 4 306 604 92 401 3.02e-17 84.7
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MsG0580027140.01.T01 AT1G74630 20.721 444 297 14 188 609 54 464 8.44e-14 75.1
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MsG0580027140.01.T01 AT1G74630 24.642 349 243 8 165 510 81 412 6.80e-19 91.3
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MsG0580027140.01.T01 AT1G74630 20.721 444 297 14 188 609 69 479 7.49e-14 75.1
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MsG0580027140.01.T01 AT1G31430 22.149 456 284 12 166 571 8 442 1.35e-15 80.5
MsG0580027140.01.T01 AT3G25970 19.614 622 437 16 3 606 31 607 1.35e-15 80.9
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MsG0580027140.01.T01 AT3G53360 19.112 518 359 12 46 513 96 603 2.65e-14 77.0
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MsG0580027140.01.T01 AT3G50420 21.212 495 287 11 165 570 159 639 3.90e-15 79.3
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MsG0580027140.01.T01 AT2G37310 21.528 432 277 10 228 612 223 639 4.47e-15 79.0
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Find 106 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 252 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
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CTTCCTTAACTTTACCATTA+AGG 0.292079 5:-54280468 None:intergenic
TTGATGGACTTCGCAAATTA+GGG 0.292976 5:+54278494 MsG0580027140.01.T01:CDS
CAACTTAATCAGGTTAGTTA+TGG 0.294919 5:+54280529 MsG0580027140.01.T01:CDS
CTTGGTCAAAGAAGTGAATA+AGG 0.296395 5:+54280993 MsG0580027140.01.T01:CDS
TCGATGATGAAGAATGAAAT+TGG 0.307968 5:-54280098 None:intergenic
GTATTAAAAGTTACAACATT+TGG 0.313905 5:-54280847 None:intergenic
ATAAGAATTTCGAAAGTTAC+AGG 0.315677 5:-54281550 None:intergenic
AAAGGGGTTTCAACTTAATC+AGG 0.324235 5:+54280519 MsG0580027140.01.T01:CDS
CACATATGTACTCACATTCT+TGG 0.326978 5:+54278396 MsG0580027140.01.T01:CDS
GTAGTCAATGTTACGGTATT+AGG 0.327415 5:-54280427 None:intergenic
TATTAAAAGTTACAACATTT+GGG 0.332477 5:-54280846 None:intergenic
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GAATTGTATGTTACAATATC+AGG 0.338599 5:-54281162 None:intergenic
TGGACTATGTAAGAATAAAA+TGG 0.349513 5:+54281089 MsG0580027140.01.T01:CDS
AACTTAATCAGGTTAGTTAT+GGG 0.362992 5:+54280530 MsG0580027140.01.T01:CDS
TTTGCACAAAGCATCCAATA+AGG 0.363798 5:-54281289 None:intergenic
CACATTTGTGTTCAACACTA+TGG 0.364220 5:+54281017 MsG0580027140.01.T01:CDS
AAGAAATAGCAGTGTGGAAA+TGG 0.375603 5:-54280267 None:intergenic
ACAGTATAGCTATGAACATT+AGG 0.379605 5:-54281057 None:intergenic
AGGGAAAATCTACGATGTTT+GGG 0.385126 5:+54278513 MsG0580027140.01.T01:CDS
CATTTCTTTGAAGAGATTAA+CGG 0.386450 5:-54281121 None:intergenic
ATCGACGGGTTATGTAAAAT+AGG 0.390003 5:+54280559 MsG0580027140.01.T01:CDS
GGACACTAAACATACATATC+TGG 0.401914 5:-54278655 None:intergenic
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TGTGACCTCTATTATACATC+TGG 0.458876 5:-54278546 None:intergenic
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TGAAACAACAGCTGCCCTGC+AGG 0.497888 5:+54280582 MsG0580027140.01.T01:CDS
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ATCTTGTTAAATTCAAAGAT+GGG 0.503884 5:-54280220 None:intergenic
AAAACCCAGCTTGACAATCA+TGG 0.504564 5:-54280401 None:intergenic
ATTCAAAGATGGGTTTGGTA+GGG 0.514884 5:-54280210 None:intergenic
TGAAAACGACATGAATGATA+AGG 0.515376 5:+54281585 MsG0580027140.01.T01:CDS
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CACATTAGGAAATATTCCCA+TGG 0.612204 5:-54280728 None:intergenic
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CATAGTGTTGAACACAAATG+TGG 0.651850 5:-54281016 None:intergenic
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CRISPR-GE

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!! ACTTACAATACTTTAATATA+TGG + Chr5:54280754-54280773 MsG0580027140.01.T01:CDS 15.0%
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!! TTCTTCTATAGATTATTATT+TGG + Chr5:54277996-54278015 MsG0580027140.01.T01:intron 15.0%
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!!! CGTTGAAAATAATTTTTTTA+AGG + Chr5:54279771-54279790 MsG0580027140.01.T01:intron 15.0%
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!!! CAAACTTTATTTTTTTGTTG+AGG - Chr5:54278862-54278881 None:intergenic 20.0%
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!!! TTTTTCACTATTTTAGGAAA+TGG - Chr5:54279123-54279142 None:intergenic 20.0%
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AATGAGAGAAAGAATGAAGT+TGG - Chr5:54280001-54280020 None:intergenic 30.0%
AATTCTTGACTTCCGTATTT+CGG - Chr5:54279618-54279637 None:intergenic 30.0%
ACAGTATAGCTATGAACATT+AGG - Chr5:54281060-54281079 None:intergenic 30.0%
ACATATCTGGTTGAATTCTT+TGG - Chr5:54278645-54278664 None:intergenic 30.0%
ACTTATAGTTCTTTGATGGA+TGG + Chr5:54280964-54280983 MsG0580027140.01.T01:CDS 30.0%
AGCTATACTGTCATGATTAA+TGG + Chr5:54281069-54281088 MsG0580027140.01.T01:CDS 30.0%
AGGAAAATGGTTGAATATCT+TGG + Chr5:54279056-54279075 MsG0580027140.01.T01:intron 30.0%
ATAATCATACATGTGTACCA+GGG - Chr5:54278155-54278174 None:intergenic 30.0%
ATAGACCAGATGTATAATAG+AGG + Chr5:54278541-54278560 MsG0580027140.01.T01:CDS 30.0%
ATCAATGGTCTTCTCAAATA+TGG + Chr5:54281189-54281208 MsG0580027140.01.T01:CDS 30.0%
ATGAATGATGCTATTGAATG+AGG - Chr5:54280182-54280201 None:intergenic 30.0%
ATTGCTTTCACTTTGATGAA+TGG + Chr5:54279889-54279908 MsG0580027140.01.T01:intron 30.0%
ATTGTCCTTACTGTCAAAAA+TGG + Chr5:54281504-54281523 MsG0580027140.01.T01:CDS 30.0%
ATTTCGAAAGTTACAGGATT+AGG - Chr5:54281547-54281566 None:intergenic 30.0%
CAACATCATCATGAAAGTAA+AGG - Chr5:54280495-54280514 None:intergenic 30.0%
CATAAGTGTAGTCAATGTTA+CGG - Chr5:54280437-54280456 None:intergenic 30.0%
CATTGTTTAGTACACTATCA+AGG + Chr5:54278724-54278743 MsG0580027140.01.T01:intron 30.0%
CTTATCATTCAAGTAATCTG+AGG - Chr5:54278064-54278083 None:intergenic 30.0%
CTTCCTTAACTTTACCATTA+AGG - Chr5:54280471-54280490 None:intergenic 30.0%
GATCACTTACAATTCCTTAT+TGG + Chr5:54281275-54281294 MsG0580027140.01.T01:CDS 30.0%
GCATTATTAACGAAGATCAA+AGG + Chr5:54278619-54278638 MsG0580027140.01.T01:CDS 30.0%
GGAAAATGGTTGAATATCTT+GGG + Chr5:54279057-54279076 MsG0580027140.01.T01:intron 30.0%
GTAAATGAGATGCATAATAG+AGG + Chr5:54281237-54281256 MsG0580027140.01.T01:CDS 30.0%
GTATTGTAAGTAACCACATT+AGG - Chr5:54280745-54280764 None:intergenic 30.0%
TAGAATTCTATCTGCATTCT+TGG - Chr5:54279094-54279113 None:intergenic 30.0%
TATTAATTTCTGACAAACGC+AGG + Chr5:54278097-54278116 MsG0580027140.01.T01:intron 30.0%
TCAATGGTCTTCTCAAATAT+GGG + Chr5:54281190-54281209 MsG0580027140.01.T01:CDS 30.0%
TCGATGATGAAGAATGAAAT+TGG - Chr5:54280101-54280120 None:intergenic 30.0%
TGAAAACGACATGAATGATA+AGG + Chr5:54281585-54281604 MsG0580027140.01.T01:CDS 30.0%
TTTCGAAAGTTACAGGATTA+GGG - Chr5:54281546-54281565 None:intergenic 30.0%
! ACATACACAATACTTGTTGA+TGG + Chr5:54281384-54281403 MsG0580027140.01.T01:intron 30.0%
! ACATTGACTACACTTATGAA+AGG + Chr5:54280439-54280458 MsG0580027140.01.T01:CDS 30.0%
! CAACTTAATCAGGTTAGTTA+TGG + Chr5:54280529-54280548 MsG0580027140.01.T01:CDS 30.0%
! CTTATAGTTCTTTGATGGAT+GGG + Chr5:54280965-54280984 MsG0580027140.01.T01:CDS 30.0%
! GTTAAATTCAAAGATGGGTT+TGG - Chr5:54280218-54280237 None:intergenic 30.0%
! TAAACTGATTTCACCAAATC+CGG + Chr5:54279923-54279942 MsG0580027140.01.T01:intron 30.0%
! TAACAAAAGAGATGCACTTT+TGG + Chr5:54279032-54279051 MsG0580027140.01.T01:intron 30.0%
! TTTGATGAATGGTTCTATAG+TGG + Chr5:54279900-54279919 MsG0580027140.01.T01:intron 30.0%
!! AAAGCACTCTTTTTATCTTG+AGG - Chr5:54277593-54277612 None:intergenic 30.0%
!! AAGATAGCTTTTATTTGGTG+TGG + Chr5:54278323-54278342 MsG0580027140.01.T01:intron 30.0%
!! AATTAGCTCTAAAAGAATGC+CGG - Chr5:54279945-54279964 None:intergenic 30.0%
!! CTTGATAGTGTACTAAACAA+TGG - Chr5:54278726-54278745 None:intergenic 30.0%
!!! AATTTTTTTAAGGGTAGACG+TGG + Chr5:54279781-54279800 MsG0580027140.01.T01:intron 30.0%
!!! AGTTTTGGATGGGTATTTAT+TGG + Chr5:54278354-54278373 MsG0580027140.01.T01:CDS 30.0%
!!! CAATGCCATTTTTAAGGTTA+AGG + Chr5:54280047-54280066 MsG0580027140.01.T01:intron 30.0%
AAACGACATGAATGATAAGG+CGG + Chr5:54281588-54281607 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
AAAGGGGTTTCAACTTAATC+AGG + Chr5:54280519-54280538 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
AAGAAAAATTGAGGTGACGA+AGG - Chr5:54280369-54280388 None:intergenic 35.0%
AAGAAATAGCAGTGTGGAAA+TGG - Chr5:54280270-54280289 None:intergenic 35.0%
ACATATTTGGCTGAATTCCT+TGG - Chr5:54281362-54281381 None:intergenic 35.0%
AGGGAAAATCTACGATGTTT+GGG + Chr5:54278513-54278532 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
ATATCCAATTGGTAAGTGAG+TGG + Chr5:54279471-54279490 MsG0580027140.01.T01:intron 35.0%
ATCTAGGGAATATTGATGTG+AGG + Chr5:54277828-54277847 MsG0580027140.01.T01:intron 35.0%
ATGATGCTATTCATCCTGAA+AGG - Chr5:54279684-54279703 None:intergenic 35.0%
ATGGAAGCTATTCATGATTG+TGG + Chr5:54277549-54277568 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
CAAACAAGCTCTCTTTACAA+AGG - Chr5:54281477-54281496 None:intergenic 35.0%
CAATTACTTTGTCAACCTGT+TGG - Chr5:54278600-54278619 None:intergenic 35.0%
CACATATGTACTCACATTCT+TGG + Chr5:54278396-54278415 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
CACATTAGGAAATATTCCCA+TGG - Chr5:54280731-54280750 None:intergenic 35.0%
CACATTTGTGTTCAACACTA+TGG + Chr5:54281017-54281036 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
CATGGGAATATTTCCTAATG+TGG + Chr5:54280729-54280748 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
CTGCCTTAATGGTAAAGTTA+AGG + Chr5:54280465-54280484 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
CTGTCAAAAATGGAAGACAA+TGG + Chr5:54281514-54281533 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
CTTGGTCAAAGAAGTGAATA+AGG + Chr5:54280993-54281012 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
GAAACATCATCGTCAACATT+GGG - Chr5:54280160-54280179 None:intergenic 35.0%
GATAATCATACATGTGTACC+AGG - Chr5:54278156-54278175 None:intergenic 35.0%
GCATGTTAAGAAGTCATCTA+GGG + Chr5:54277813-54277832 MsG0580027140.01.T01:intron 35.0%
GGACACTAAACATACATATC+TGG - Chr5:54278658-54278677 None:intergenic 35.0%
GTAGTCAATGTTACGGTATT+AGG - Chr5:54280430-54280449 None:intergenic 35.0%
GTCAAAGGGCTAAAATTAGA+TGG + Chr5:54277707-54277726 MsG0580027140.01.T01:intron 35.0%
GTCTACCATGTATATTGTAG+AGG + Chr5:54278771-54278790 MsG0580027140.01.T01:intron 35.0%
GTTGAATATCTTGGGTTCAA+TGG + Chr5:54279065-54279084 MsG0580027140.01.T01:intron 35.0%
TAGAGGTCACACTTCTTTAT+TGG + Chr5:54278558-54278577 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
TAGGGAAAATCTACGATGTT+TGG + Chr5:54278512-54278531 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
TCATGCCTCTACAATATACA+TGG - Chr5:54278779-54278798 None:intergenic 35.0%
TCGAAAAAGAAATAGCAGTG+TGG - Chr5:54280276-54280295 None:intergenic 35.0%
TGAAGAGATTACAAGACTAG+AGG + Chr5:54277672-54277691 MsG0580027140.01.T01:intron 35.0%
TGCATGTTAAGAAGTCATCT+AGG + Chr5:54277812-54277831 MsG0580027140.01.T01:intron 35.0%
TGTGACCTCTATTATACATC+TGG - Chr5:54278549-54278568 None:intergenic 35.0%
TGTGAGTACACTTATTGATC+AGG - Chr5:54278679-54278698 None:intergenic 35.0%
TGTTATGTTAAAACAAGGCG+TGG + Chr5:54280927-54280946 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
TTCGAAAGTTACAGGATTAG+GGG - Chr5:54281545-54281564 None:intergenic 35.0%
TTGCTATATTCTGTCCTTGA+AGG - Chr5:54279201-54279220 None:intergenic 35.0%
! AAAAGAGATGCACTTTTGGT+AGG + Chr5:54279036-54279055 MsG0580027140.01.T01:intron 35.0%
! AAAATGGCGGAAGGATTATT+AGG + Chr5:54279142-54279161 MsG0580027140.01.T01:intron 35.0%
! AATATATGGCTTTTGCATCG+TGG + Chr5:54280768-54280787 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
! AATTCAAAGATGGGTTTGGT+AGG - Chr5:54280214-54280233 None:intergenic 35.0%
! ATATATGGCTTTTGCATCGT+GGG + Chr5:54280769-54280788 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
! ATGATGATGTTGTAGCAAAG+GGG + Chr5:54280503-54280522 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
! ATGCACTTTTGGTAGGAAAA+TGG + Chr5:54279043-54279062 MsG0580027140.01.T01:intron 35.0%
! ATTCAAAGATGGGTTTGGTA+GGG - Chr5:54280213-54280232 None:intergenic 35.0%
! CATAGTGTTGAACACAAATG+TGG - Chr5:54281019-54281038 None:intergenic 35.0%
! CATGATGATGTTGTAGCAAA+GGG + Chr5:54280502-54280521 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
! TAGTGAAAAAAAATGGCGGA+AGG + Chr5:54279133-54279152 MsG0580027140.01.T01:intron 35.0%
! TCATGATGATGTTGTAGCAA+AGG + Chr5:54280501-54280520 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
! TTTGATGGATGGGTATTTCT+TGG + Chr5:54280975-54280994 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
! TTTGCACAAAGCATCCAATA+AGG - Chr5:54281292-54281311 None:intergenic 35.0%
!! ACCAGTGTTGATAAACTCAA+GGG - Chr5:54279265-54279284 None:intergenic 35.0%
!! ATATTCTGAAATGGTTGCCA+TGG + Chr5:54280711-54280730 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
!! ATCGACGGGTTATGTAAAAT+AGG + Chr5:54280559-54280578 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTGATGGACTTCGCAAATT+AGG + Chr5:54278493-54278512 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
!! GTCTTCCATTTTTGACAGTA+AGG - Chr5:54281512-54281531 None:intergenic 35.0%
!! TACCAGTGTTGATAAACTCA+AGG - Chr5:54279266-54279285 None:intergenic 35.0%
!! TATTCTGAAATGGTTGCCAT+GGG + Chr5:54280712-54280731 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
!! TTGATGGACTTCGCAAATTA+GGG + Chr5:54278494-54278513 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
!!! CTTTTTGGTTAAGCCTAATG+TGG + Chr5:54280624-54280643 MsG0580027140.01.T01:CDS 35.0%
!!! TGTCGTTTTCAAACAAAGCA+CGG - Chr5:54281576-54281595 None:intergenic 35.0%
AAAACCCAGCTTGACAATCA+TGG - Chr5:54280404-54280423 None:intergenic 40.0%
AAGGCTATCATTTAGACGTG+AGG + Chr5:54281428-54281447 MsG0580027140.01.T01:CDS 40.0%
ACCCTTGAGTTTATCAACAC+TGG + Chr5:54279261-54279280 MsG0580027140.01.T01:intron 40.0%
ATGAAAGGTCTCTGCCTTAA+TGG + Chr5:54280454-54280473 MsG0580027140.01.T01:CDS 40.0%
CAAGACTAGAGGAATTGTGA+TGG + Chr5:54277683-54277702 MsG0580027140.01.T01:intron 40.0%
CTGCAGGTTCTTAGAAAGAT+GGG + Chr5:54280598-54280617 MsG0580027140.01.T01:CDS 40.0%
CTTACGAAGATCAAAGACCA+AGG + Chr5:54281342-54281361 MsG0580027140.01.T01:intron 40.0%
GGAAACATCATCGTCAACAT+TGG - Chr5:54280161-54280180 None:intergenic 40.0%
GGAGAGAGTAGTTCAATGAA+TGG - Chr5:54279980-54279999 None:intergenic 40.0%
GTACTGTACATGACCACATT+AGG - Chr5:54280640-54280659 None:intergenic 40.0%
GTATCGTGAAACTACCTTTC+AGG + Chr5:54279667-54279686 MsG0580027140.01.T01:intron 40.0%
GTTCAACACTATGGCTAGAA+GGG + Chr5:54281026-54281045 MsG0580027140.01.T01:CDS 40.0%
TAGGGAATATTGATGTGAGG+TGG + Chr5:54277831-54277850 MsG0580027140.01.T01:intron 40.0%
TGAAGAGAAGCTGCTTAAGA+TGG + Chr5:54277869-54277888 MsG0580027140.01.T01:intron 40.0%
TGCTCTTTGCATAAACCAAC+AGG + Chr5:54278582-54278601 MsG0580027140.01.T01:CDS 40.0%
TGCTTTGTGCAAAAACCATC+AGG + Chr5:54281299-54281318 MsG0580027140.01.T01:CDS 40.0%
TGTTCAACACTATGGCTAGA+AGG + Chr5:54281025-54281044 MsG0580027140.01.T01:CDS 40.0%
TTCAACACTATGGCTAGAAG+GGG + Chr5:54281027-54281046 MsG0580027140.01.T01:CDS 40.0%
TTGGGAATGAACGAAGTAAG+AGG - Chr5:54280142-54280161 None:intergenic 40.0%
TTGTAAGTGATCACATCAGC+AGG - Chr5:54281267-54281286 None:intergenic 40.0%
TTTACATAACCCGTCGATCA+AGG - Chr5:54280557-54280576 None:intergenic 40.0%
! ACATCGCGACATGTGTATTT+TGG - Chr5:54279649-54279668 None:intergenic 40.0%
! AGGAATTGTGATGGAGTCAA+AGG + Chr5:54277692-54277711 MsG0580027140.01.T01:intron 40.0%
! AGTTTGAAGGTGTACAGTAC+AGG + Chr5:54278876-54278895 MsG0580027140.01.T01:intron 40.0%
! CATCTTTCTAAGAACCTGCA+GGG - Chr5:54280599-54280618 None:intergenic 40.0%
! CTCTAAAAGAATGCCGGATT+TGG - Chr5:54279939-54279958 None:intergenic 40.0%
! GAAGAAGGACAAACCCTTTT+AGG + Chr5:54278958-54278977 MsG0580027140.01.T01:intron 40.0%
! GGAATTGTGATGGAGTCAAA+GGG + Chr5:54277693-54277712 MsG0580027140.01.T01:intron 40.0%
! TAGAAAGATGGGTGGCTTTT+TGG + Chr5:54280609-54280628 MsG0580027140.01.T01:CDS 40.0%
! TGATTGGTGGATGGTTGTTT+CGG - Chr5:54279558-54279577 None:intergenic 40.0%
!! ACTCGAGTTCGAGTTTTTCA+TGG - Chr5:54279719-54279738 None:intergenic 40.0%
!! CAAAAACCATCAGGTTGACA+AGG + Chr5:54281308-54281327 MsG0580027140.01.T01:intron 40.0%
!! GGGTGCTTTTTACCGAAATA+CGG + Chr5:54279603-54279622 MsG0580027140.01.T01:intron 40.0%
!! TCAGCTTTTTGATTGGTGGA+TGG - Chr5:54279567-54279586 None:intergenic 40.0%
AAGCTCCATCTCTTTCCAGA+GGG - Chr5:54277653-54277672 None:intergenic 45.0%
AAGTGATCACATCAGCAGGT+TGG - Chr5:54281263-54281282 None:intergenic 45.0%
ACGGTTGTTTGCAACAAGTC+AGG + Chr5:54278265-54278284 MsG0580027140.01.T01:intron 45.0%
AGCAGTGACTCTGTTGAAGA+AGG + Chr5:54278943-54278962 MsG0580027140.01.T01:intron 45.0%
AGCTGATGCTGCTGTCAAAT+AGG + Chr5:54278296-54278315 MsG0580027140.01.T01:intron 45.0%
AGTTATGGGACCTTGATCGA+CGG + Chr5:54280544-54280563 MsG0580027140.01.T01:CDS 45.0%
ATGGGAGAATCTCTGATGCT+TGG + Chr5:54281208-54281227 MsG0580027140.01.T01:CDS 45.0%
ATTGGCCATGATTGTCAAGC+TGG + Chr5:54280396-54280415 MsG0580027140.01.T01:CDS 45.0%
CAATCAAAAAGCTGACCCAG+CGG + Chr5:54279572-54279591 MsG0580027140.01.T01:intron 45.0%
CAGGTTCTTAGAAAGATGGG+TGG + Chr5:54280601-54280620 MsG0580027140.01.T01:CDS 45.0%
CCTGCAGGTTCTTAGAAAGA+TGG + Chr5:54280597-54280616 MsG0580027140.01.T01:CDS 45.0%
CTTCGCGAAATGATTGCTAG+AGG + Chr5:54281619-54281638 MsG0580027140.01.T01:CDS 45.0%
CTTGCAGATCAAGACCTTCA+AGG + Chr5:54279184-54279203 MsG0580027140.01.T01:intron 45.0%
GACTCCACTCACTTACCAAT+TGG - Chr5:54279478-54279497 None:intergenic 45.0%
GGCATGACTAACAACATGCT+TGG + Chr5:54278792-54278811 MsG0580027140.01.T01:intron 45.0%
TGAAGGTCTTGATCTGCAAG+AGG - Chr5:54279184-54279203 None:intergenic 45.0%
TGATTGCCTTGTCAACCTGA+TGG - Chr5:54281317-54281336 None:intergenic 45.0%
TGGGAGAATCTCTGATGCTT+GGG + Chr5:54281209-54281228 MsG0580027140.01.T01:CDS 45.0%
TTGGCCATGATTGTCAAGCT+GGG + Chr5:54280397-54280416 MsG0580027140.01.T01:CDS 45.0%
! CCATCTTTCTAAGAACCTGC+AGG - Chr5:54280600-54280619 None:intergenic 45.0%
! GATTGGTGGATGGTTGTTTC+GGG - Chr5:54279557-54279576 None:intergenic 45.0%
! TGGTTGTTTCGGGATGCATT+CGG - Chr5:54279547-54279566 None:intergenic 45.0%
!! TAAATTGGTGTTAGCAGCCC+TGG + Chr5:54278135-54278154 MsG0580027140.01.T01:intron 45.0%
!! TGGGTCAGCTTTTTGATTGG+TGG - Chr5:54279571-54279590 None:intergenic 45.0%
!!! GGTGCAGTCAAGTTTTGGAT+GGG + Chr5:54278344-54278363 MsG0580027140.01.T01:intron 45.0%
!!! TGGTGCAGTCAAGTTTTGGA+TGG + Chr5:54278343-54278362 MsG0580027140.01.T01:intron 45.0%
AGCTCCATCTCTTTCCAGAG+GGG - Chr5:54277652-54277671 None:intergenic 50.0%
ATTGATGTGAGGTGGTGCGA+TGG + Chr5:54277839-54277858 MsG0580027140.01.T01:intron 50.0%
CAAGCTCCATCTCTTTCCAG+AGG - Chr5:54277654-54277673 None:intergenic 50.0%
CGACATGAATGATAAGGCGG+TGG + Chr5:54281591-54281610 MsG0580027140.01.T01:CDS 50.0%
GTTATGGGACCTTGATCGAC+GGG + Chr5:54280545-54280564 MsG0580027140.01.T01:CDS 50.0%
! CGCTGGGTCAGCTTTTTGAT+TGG - Chr5:54279574-54279593 None:intergenic 50.0%
! GGTGTGGTGCAGTCAAGTTT+TGG + Chr5:54278339-54278358 MsG0580027140.01.T01:intron 50.0%
! GGTTGTTTCGGGATGCATTC+GGG - Chr5:54279546-54279565 None:intergenic 50.0%
AGATCCATCATTCCCCCCTC+TGG + Chr5:54277635-54277654 MsG0580027140.01.T01:intron 55.0%
AGCTGACCCAGCGGAATTCA+CGG + Chr5:54279581-54279600 MsG0580027140.01.T01:intron 55.0%
CTCCATCTCTTTCCAGAGGG+GGG - Chr5:54277650-54277669 None:intergenic 55.0%
CTTTCCAGAGGGGGGAATGA+TGG - Chr5:54277642-54277661 None:intergenic 55.0%
GCTCCATCTCTTTCCAGAGG+GGG - Chr5:54277651-54277670 None:intergenic 55.0%
TGAAACAACAGCTGCCCTGC+AGG + Chr5:54280582-54280601 MsG0580027140.01.T01:CDS 55.0%
! TTCCCCCCTCTGGAAAGAGA+TGG + Chr5:54277645-54277664 MsG0580027140.01.T01:intron 55.0%
AAGCACCCCGTGAATTCCGC+TGG - Chr5:54279591-54279610 None:intergenic 60.0%
AGCACCCCGTGAATTCCGCT+GGG - Chr5:54279590-54279609 None:intergenic 60.0%
CTGACCCAGCGGAATTCACG+GGG + Chr5:54279583-54279602 MsG0580027140.01.T01:intron 60.0%
GCTGACCCAGCGGAATTCAC+GGG + Chr5:54279582-54279601 MsG0580027140.01.T01:intron 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 54277549 54281651 54277549 ID=MsG0580027140.01;Name=MsG0580027140.01
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Chr5 exon 54278351 54278662 54278351 ID=MsG0580027140.01.T01:exon:40535;Parent=MsG0580027140.01.T01
Chr5 exon 54280063 54281320 54280063 ID=MsG0580027140.01.T01:exon:40534;Parent=MsG0580027140.01.T01
Chr5 exon 54281415 54281651 54281415 ID=MsG0580027140.01.T01:exon:40533;Parent=MsG0580027140.01.T01
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Chr5 CDS 54280063 54281320 54280063 ID=MsG0580027140.01.T01:cds;Parent=MsG0580027140.01.T01
Chr5 CDS 54281415 54281651 54281415 ID=MsG0580027140.01.T01:cds;Parent=MsG0580027140.01.T01
Gene Sequence

>MsG0580027140.01.T01

ATGGAAGCTATTCATGATTGTGGTTATAAAAATCAAGTTTTGGATGGGTATTTATTGGTTAAAGAAATGAACAAGGACACATATGTACTCACATTCTTGGTTAAAGCCGTGATTCTCTTAAAAGAAATGCATTTCAAAAACATGTCTCCAAATACTATAACGTACAATTTTCTTATTGATGGACTTCGCAAATTAGGGAAAATCTACGATGTTTGGGATCTTATAGACCAGATGTATAATAGAGGTCACACTTCTTTATTGGATGCTCTTTGCATAAACCAACAGGTTGACAAAGTAATTGCATTATTAACGAAGATCAAAGGCCAAAGAATTCAACCAGATATGTTAAGGTACAAAGCTCTTTCTGTTTCTTTTAATGCCAATTTCATTCTTCATCATCGATTATACTCGTTCATTAAGCCTCTTACTTCGTTCATTCCCAATGTTGACGATGATGTTTCCTCATTCAATAGCATCATTCATATGAACAACCCTACCAAACCCATCTTTGAATTTAACAAGATCTTATCTTCTCTTGTTAAGATGAACCATTTCCACACTGCTATTTCTTTTTCGAAACAAATGGAACTCAAACAAATTCAACCTAACATTTTTACTTTCAATATCTTGATTAATTGTTTCTGTCACCTTCGTCACCTCAATTTTTCTTTTTCTGTATTGGCCATGATTGTCAAGCTGGGTTTTGAGCCTAATACCGTAACATTGACTACACTTATGAAAGGTCTCTGCCTTAATGGTAAAGTTAAGGAAGCCCTTTACTTTCATGATGATGTTGTAGCAAAGGGGTTTCAACTTAATCAGGTTAGTTATGGGACCTTGATCGACGGGTTATGTAAAATAGGTGAAACAACAGCTGCCCTGCAGGTTCTTAGAAAGATGGGTGGCTTTTTGGTTAAGCCTAATGTGGTCATGTACAGTACAATTATCGATAGTTTATGCAAGGATAAACTTCTAACAGATGCTTTTGATTTATATTCTGAAATGGTTGCCATGGGAATATTTCCTAATGTGGTTACTTACAATACTTTAATATATGGCTTTTGCATCGTGGGTCAAATGAAACAAGCAGTTGATTTGTTAAATGAAATGTTGTTGAAAAACATCAGCCCAAATGTTGTAACTTTTAATACATTTATTCATAGTTTATGTAAGAAGGGAGATGTCAAAAAAGCTAGAAATGTGTTAGCTGTTATGTTAAAACAAGGCGTGGAACTTAATTTTGTTACTTATAGTTCTTTGATGGATGGGTATTTCTTGGTCAAAGAAGTGAATAAGGCCACATTTGTGTTCAACACTATGGCTAGAAGGGGAGTGAATCCTAATGTTCATAGCTATACTGTCATGATTAATGGACTATGTAAGAATAAAATGGTGGATGAAGCCGTTAATCTCTTCAAAGAAATGCATTTAAAAAACATGGCTCCTGATATTGTAACATACAATTCACTTATCAATGGTCTTCTCAAATATGGGAGAATCTCTGATGCTTGGGATCTTGTAAATGAGATGCATAATAGAGGCCAACCTGCTGATGTGATCACTTACAATTCCTTATTGGATGCTTTGTGCAAAAACCATCAGATTCTTTTGATTAAAGGCTATCATTTAGACGTGAGGATGTATACTGTTATGATTAATGGCCTTTGTAAAGAGAGCTTGTTTGATGAAGCATTGTCCTTACTGTCAAAAATGGAAGACAATGGTTGCACCCCTAATCCTGTAACTTTCGAAATTCTTATCCGTGCTTTGTTTGAAAACGACATGAATGATAAGGCGGTGGAACTTCTTCGCGAAATGATTGCTAGAGGTCTACTATAA
Protein sequence

>MsG0580027140.01.T01

MEAIHDCGYKNQVLDGYLLVKEMNKDTYVLTFLVKAVILLKEMHFKNMSPNTITYNFLIDGLRKLGKIYDVWDLIDQMYNRGHTSLLDALCINQQVDKVIALLTKIKGQRIQPDMLRYKALSVSFNANFILHHRLYSFIKPLTSFIPNVDDDVSSFNSIIHMNNPTKPIFEFNKILSSLVKMNHFHTAISFSKQMELKQIQPNIFTFNILINCFCHLRHLNFSFSVLAMIVKLGFEPNTVTLTTLMKGLCLNGKVKEALYFHDDVVAKGFQLNQVSYGTLIDGLCKIGETTAALQVLRKMGGFLVKPNVVMYSTIIDSLCKDKLLTDAFDLYSEMVAMGIFPNVVTYNTLIYGFCIVGQMKQAVDLLNEMLLKNISPNVVTFNTFIHSLCKKGDVKKARNVLAVMLKQGVELNFVTYSSLMDGYFLVKEVNKATFVFNTMARRGVNPNVHSYTVMINGLCKNKMVDEAVNLFKEMHLKNMAPDIVTYNSLINGLLKYGRISDAWDLVNEMHNRGQPADVITYNSLLDALCKNHQILLIKGYHLDVRMYTVMINGLCKESLFDEALSLLSKMEDNGCTPNPVTFEILIRALFENDMNDKAVELLREMIARGLL*