AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680034461.01

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MsG0680034461.01.T01 AT1G12700 29.844 449 280 2 5 418 102 550 1.03e-68 233
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MsG0680034461.01.T01 AT5G12100 27.962 422 303 1 5 426 247 667 5.38e-56 201
MsG0680034461.01.T01 AT5G12100 31.842 380 258 1 4 383 281 659 6.17e-55 198
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MsG0680034461.01.T01 AT5G46680 27.143 350 251 4 84 430 20 368 1.43e-40 153
MsG0680034461.01.T01 AT5G46680 30.961 281 190 3 145 422 9 288 2.19e-36 141
MsG0680034461.01.T01 AT5G46680 28.710 310 218 3 116 423 17 325 2.19e-33 133
MsG0680034461.01.T01 AT5G46680 24.455 413 270 6 1 376 42 449 2.03e-32 130
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MsG0680034461.01.T01 AT5G39980 25.356 351 227 1 75 390 153 503 7.05e-33 134
MsG0680034461.01.T01 AT5G39980 19.906 427 295 6 2 424 290 673 6.49e-20 94.0
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MsG0680034461.01.T01 AT1G07740 26.972 393 287 0 22 414 61 453 5.30e-41 154
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MsG0680034461.01.T01 AT1G07740 28.137 263 189 0 1 263 180 442 1.77e-31 127
MsG0680034461.01.T01 AT1G07740 26.852 324 237 0 10 333 119 442 1.66e-30 124
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MsG0680034461.01.T01 AT1G71060 25.796 314 223 5 114 424 130 436 1.91e-27 116
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MsG0680034461.01.T01 AT2G35030 21.343 417 273 10 6 387 170 566 1.62e-22 102
MsG0680034461.01.T01 AT2G35030 23.548 310 166 7 168 422 32 325 4.20e-21 97.8
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MsG0680034461.01.T01 AT5G43820 25.000 248 185 1 177 424 146 392 2.04e-21 98.2
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MsG0680034461.01.T01 AT5G43820 19.685 254 204 0 2 255 285 538 2.02e-15 79.7
MsG0680034461.01.T01 AT5G14820 25.071 351 261 2 37 387 189 537 1.97e-37 146
MsG0680034461.01.T01 AT5G14820 23.256 344 262 2 80 423 197 538 9.48e-33 132
MsG0680034461.01.T01 AT5G14820 25.283 265 198 0 3 267 293 557 3.12e-29 122
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MsG0680034461.01.T01 AT1G19720 21.368 351 263 5 1 349 381 720 1.33e-18 90.1
MsG0680034461.01.T01 AT1G19720 21.296 324 208 4 135 424 39 349 1.24e-14 77.8
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MsG0680034461.01.T01 AT5G15010 29.969 327 205 9 6 321 196 509 2.55e-35 140
MsG0680034461.01.T01 AT5G15010 26.611 357 243 8 76 423 160 506 8.11e-28 117
MsG0680034461.01.T01 AT5G15010 22.789 294 200 7 149 418 144 434 2.86e-15 79.3
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MsG0680034461.01.T01 AT5G50280 25.429 350 259 2 76 423 272 621 1.18e-32 133
MsG0680034461.01.T01 AT5G50280 24.419 344 255 3 4 345 305 645 4.23e-31 128
MsG0680034461.01.T01 AT5G50280 24.722 360 269 2 45 402 276 635 4.55e-31 128
MsG0680034461.01.T01 AT5G50280 23.962 313 234 2 2 310 374 686 2.91e-26 114
MsG0680034461.01.T01 AT5G50280 22.430 214 163 1 1 214 479 689 3.33e-12 69.7
MsG0680034461.01.T01 AT1G74750 26.280 293 216 0 37 329 354 646 3.10e-34 138
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MsG0680034461.01.T01 AT1G74750 23.699 346 251 2 36 370 320 663 1.78e-29 124
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MsG0680034461.01.T01 AT3G15200 22.183 284 183 4 171 416 131 414 3.20e-16 82.0
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MsG0680034461.01.T01 AT4G01570 22.312 493 333 7 9 469 250 724 1.07e-27 118
MsG0680034461.01.T01 AT4G01570 24.113 423 295 5 2 398 354 776 3.06e-26 114
MsG0680034461.01.T01 AT4G01570 22.653 490 339 6 2 462 319 797 5.47e-26 113
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MsG0680034461.01.T01 AT4G20740 23.188 414 284 2 26 405 142 555 1.25e-29 124
MsG0680034461.01.T01 AT4G20740 25.185 270 200 1 156 423 165 434 8.10e-24 106
MsG0680034461.01.T01 AT4G20740 28.667 150 107 0 276 425 217 366 9.76e-16 80.9
MsG0680034461.01.T01 AT5G14080 24.888 446 279 8 4 399 151 590 4.18e-31 128
MsG0680034461.01.T01 AT5G14080 21.616 458 318 4 2 421 77 531 1.29e-28 120
MsG0680034461.01.T01 AT1G66345 24.138 348 264 0 2 349 194 541 4.82e-31 127
MsG0680034461.01.T01 AT1G66345 23.768 345 263 0 76 420 198 542 1.78e-28 119
MsG0680034461.01.T01 AT1G66345 20.544 331 263 0 37 367 194 524 4.55e-25 109
MsG0680034461.01.T01 AT1G66345 25.410 244 178 2 183 424 165 406 9.79e-21 96.3
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MsG0680034461.01.T01 AT1G66345 22.010 209 163 0 2 210 334 542 2.06e-14 76.3
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MsG0680034461.01.T01 AT3G23020 21.760 409 301 7 2 399 217 617 2.65e-21 98.6
MsG0680034461.01.T01 AT3G23020 21.616 458 314 6 5 419 147 602 2.85e-21 98.6
MsG0680034461.01.T01 AT3G23020 24.080 299 223 2 2 297 535 832 5.43e-20 94.7
MsG0680034461.01.T01 AT2G15980 25.428 409 256 12 2 367 68 470 5.79e-31 126
MsG0680034461.01.T01 AT2G15980 27.638 199 140 2 1 195 275 473 7.60e-19 90.1
MsG0680034461.01.T01 AT2G15980 23.552 259 180 5 159 402 141 396 8.29e-17 83.6
MsG0680034461.01.T01 AT2G03880 24.703 421 294 8 2 420 56 455 6.05e-31 127
MsG0680034461.01.T01 AT1G77405 30.258 271 167 6 123 372 135 404 6.74e-31 125
MsG0680034461.01.T01 AT1G77405 28.814 295 188 6 23 297 107 399 4.46e-29 120
MsG0680034461.01.T01 AT1G77405 27.451 255 165 4 190 424 132 386 4.42e-21 96.7
MsG0680034461.01.T01 AT1G77405 26.341 205 135 4 3 191 194 398 5.03e-17 84.3
MsG0680034461.01.T01 AT3G13150 26.038 265 191 3 92 353 137 399 6.89e-31 127
MsG0680034461.01.T01 AT3G13150 25.000 220 164 1 161 379 136 355 1.59e-23 104
MsG0680034461.01.T01 AT3G13150 26.471 238 172 2 188 424 130 365 2.55e-23 104
MsG0680034461.01.T01 AT3G13150 29.775 178 125 0 1 178 187 364 2.46e-21 98.2
MsG0680034461.01.T01 AT3G13150 22.845 232 178 1 9 239 159 390 7.76e-20 93.6
MsG0680034461.01.T01 AT3G17370 29.717 212 136 2 99 310 1 199 1.59e-30 119
MsG0680034461.01.T01 AT3G17370 30.392 204 129 2 204 407 1 191 1.05e-24 102
MsG0680034461.01.T01 AT3G17370 27.041 196 130 3 80 275 17 199 1.63e-23 99.4
MsG0680034461.01.T01 AT3G17370 29.353 201 129 2 40 240 12 199 2.58e-23 98.6
MsG0680034461.01.T01 AT3G17370 28.108 185 114 5 2 186 44 209 8.99e-16 77.0
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MsG0680034461.01.T01 AT1G55890 24.561 171 129 0 2 172 210 380 8.71e-11 64.3
MsG0680034461.01.T01 AT3G08820 21.586 454 301 7 5 420 74 510 4.64e-27 116
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MsG0680034461.01.T01 AT4G16390 23.585 318 242 1 77 393 175 492 2.46e-26 114
MsG0680034461.01.T01 AT4G16390 22.857 315 242 1 8 321 176 490 4.02e-25 110
MsG0680034461.01.T01 AT4G16390 24.825 286 212 3 107 390 170 454 2.17e-24 108
MsG0680034461.01.T01 AT4G16390 23.746 299 209 4 118 399 132 428 9.18e-22 99.8
MsG0680034461.01.T01 AT4G16390 25.943 212 156 1 6 216 279 490 1.14e-18 90.1
MsG0680034461.01.T01 AT2G13600 24.427 393 274 6 9 394 119 495 1.60e-26 114
MsG0680034461.01.T01 AT2G13600 22.879 389 269 9 18 399 29 393 7.56e-19 90.9
MsG0680034461.01.T01 AT5G15280 22.118 425 285 6 4 391 253 668 1.77e-26 115
MsG0680034461.01.T01 AT5G15280 24.093 386 283 5 40 423 737 1114 2.48e-21 99.0
MsG0680034461.01.T01 AT5G15280 22.101 457 306 7 3 419 629 1075 7.21e-20 94.4
MsG0680034461.01.T01 AT5G15280 23.315 356 228 5 66 382 517 866 2.36e-18 89.7
MsG0680034461.01.T01 AT5G15280 23.741 278 206 3 150 424 186 460 3.26e-18 89.4
MsG0680034461.01.T01 AT5G15280 22.910 323 245 3 44 364 875 1195 3.37e-18 89.4
MsG0680034461.01.T01 AT5G15280 20.844 403 305 6 12 407 808 1203 5.29e-16 82.0
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MsG0680034461.01.T01 AT1G61870 24.684 316 232 3 74 385 77 390 2.92e-22 99.8
MsG0680034461.01.T01 AT1G61870 27.234 235 170 1 157 390 126 360 3.92e-22 99.4
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MsG0680034461.01.T01 AT2G27800 27.778 216 144 4 219 422 174 389 1.16e-13 73.6
MsG0680034461.01.T01 AT2G27800 25.472 212 140 4 203 399 193 401 2.45e-13 72.8
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MsG0680034461.01.T01 AT1G30610 21.994 341 238 7 65 390 582 909 4.81e-14 75.9
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MsG0680034461.01.T01 AT3G22150 22.422 446 278 14 1 401 208 630 9.34e-18 87.4
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MsG0680034461.01.T01 AT3G46610 20.976 410 300 4 2 402 214 608 9.07e-19 90.5
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MsG0680034461.01.T01 AT4G33990 25.000 348 216 7 76 390 184 519 1.67e-20 96.3
MsG0680034461.01.T01 AT4G33990 20.655 397 289 9 6 395 246 623 3.96e-16 82.4
MsG0680034461.01.T01 AT3G06430 20.811 370 284 5 9 372 90 456 1.75e-20 95.1
MsG0680034461.01.T01 AT3G06430 22.340 282 217 2 2 281 154 435 1.08e-18 89.7
MsG0680034461.01.T01 AT3G06430 19.294 425 292 8 55 432 64 484 7.86e-18 87.0
MsG0680034461.01.T01 AT3G49142 23.691 401 245 8 38 395 31 413 1.84e-20 95.9
MsG0680034461.01.T01 AT3G49142 19.450 473 286 10 4 394 137 596 1.07e-15 80.9
MsG0680034461.01.T01 AT2G34400 23.632 402 247 9 5 401 94 440 2.40e-20 95.1
MsG0680034461.01.T01 AT2G34400 22.013 318 230 6 2 315 228 531 1.43e-14 77.0
MsG0680034461.01.T01 AT3G48250 25.000 276 169 2 181 418 262 537 2.97e-20 95.1
MsG0680034461.01.T01 AT3G48250 24.000 350 249 7 3 344 259 599 2.12e-18 89.4
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MsG0680034461.01.T01 AT2G17210 22.872 188 139 3 5 191 445 627 7.27e-12 68.6
MsG0680034461.01.T01 AT4G25270 21.574 343 221 7 72 380 122 450 4.99e-19 90.9
MsG0680034461.01.T01 AT4G25270 21.927 301 218 6 43 341 161 446 5.36e-15 78.2
MsG0680034461.01.T01 AT4G04790 25.140 358 253 7 51 404 139 485 5.08e-19 91.3
MsG0680034461.01.T01 AT2G33680 22.170 424 244 8 49 399 196 606 5.12e-19 91.3
MsG0680034461.01.T01 AT2G33680 20.588 408 299 7 1 399 251 642 4.44e-18 88.6
MsG0680034461.01.T01 AT2G33680 21.111 450 253 11 30 394 68 500 3.54e-15 79.3
MsG0680034461.01.T01 AT2G33680 22.170 424 244 8 49 399 185 595 5.38e-19 91.3
MsG0680034461.01.T01 AT2G33680 20.588 408 299 7 1 399 240 631 5.06e-18 88.2
MsG0680034461.01.T01 AT2G33680 21.111 450 253 11 30 394 57 489 4.33e-15 79.0
MsG0680034461.01.T01 AT2G33680 22.170 424 244 8 49 399 185 595 5.38e-19 91.3
MsG0680034461.01.T01 AT2G33680 20.588 408 299 7 1 399 240 631 5.06e-18 88.2
MsG0680034461.01.T01 AT2G33680 21.111 450 253 11 30 394 57 489 4.33e-15 79.0
MsG0680034461.01.T01 AT2G33680 22.170 424 244 8 49 399 185 595 5.38e-19 91.3
MsG0680034461.01.T01 AT2G33680 20.588 408 299 7 1 399 240 631 5.06e-18 88.2
MsG0680034461.01.T01 AT2G33680 21.111 450 253 11 30 394 57 489 4.33e-15 79.0
MsG0680034461.01.T01 AT2G33680 22.170 424 244 8 49 399 176 586 6.65e-19 90.9
MsG0680034461.01.T01 AT2G33680 20.588 408 299 7 1 399 231 622 5.67e-18 88.2
MsG0680034461.01.T01 AT2G33680 21.111 450 253 11 30 394 48 480 5.53e-15 78.6
MsG0680034461.01.T01 AT1G11900 28.962 183 129 1 99 280 164 346 6.91e-19 89.0
MsG0680034461.01.T01 AT1G11900 21.782 303 212 7 55 348 58 344 9.59e-18 85.5
MsG0680034461.01.T01 AT1G11900 24.092 303 205 7 100 389 60 350 9.13e-17 82.4
MsG0680034461.01.T01 AT1G11900 20.472 254 197 3 150 399 73 325 2.84e-12 68.9
MsG0680034461.01.T01 AT5G36300 21.290 310 226 5 45 339 14 320 7.51e-19 88.2
MsG0680034461.01.T01 AT5G36300 20.984 305 223 5 10 299 14 315 4.60e-18 85.9
MsG0680034461.01.T01 AT5G36300 21.944 319 225 6 74 374 8 320 5.09e-18 85.9
MsG0680034461.01.T01 AT5G36300 23.846 260 181 5 154 399 18 274 2.67e-16 80.9
MsG0680034461.01.T01 AT4G21300 22.016 377 245 7 2 341 335 699 7.69e-19 90.9
MsG0680034461.01.T01 AT4G21300 21.515 330 244 5 81 408 39 355 2.20e-18 89.4
MsG0680034461.01.T01 AT4G21300 21.466 382 249 5 72 418 98 463 2.44e-16 83.2
MsG0680034461.01.T01 AT4G21300 19.200 500 292 11 1 401 167 653 9.76e-14 74.7
MsG0680034461.01.T01 AT5G42450 26.389 288 197 7 111 394 57 333 7.85e-19 90.1
MsG0680034461.01.T01 AT5G42450 22.646 393 284 9 1 387 87 465 2.32e-15 79.3
MsG0680034461.01.T01 AT5G42450 21.703 364 241 9 40 383 56 395 3.54e-15 78.6
MsG0680034461.01.T01 AT5G19020 21.326 347 225 6 80 394 110 440 8.41e-19 90.5
MsG0680034461.01.T01 AT5G19020 20.166 362 273 7 8 366 271 619 4.18e-17 85.1
MsG0680034461.01.T01 AT5G19020 18.637 499 327 10 6 437 137 623 9.15e-16 80.9
MsG0680034461.01.T01 AT2G20540 21.970 396 290 7 5 397 77 456 9.24e-19 89.7
MsG0680034461.01.T01 AT2G02980 19.035 373 255 5 78 414 60 421 9.55e-19 90.1
MsG0680034461.01.T01 AT2G02980 23.510 302 218 4 2 302 124 413 4.00e-18 88.2
MsG0680034461.01.T01 AT2G02980 19.437 355 242 4 32 350 49 395 5.91e-16 81.3
MsG0680034461.01.T01 AT4G04790 25.140 358 253 7 51 404 276 622 1.14e-18 90.5
MsG0680034461.01.T01 AT1G74630 22.460 374 248 7 5 348 104 465 1.25e-18 90.1
MsG0680034461.01.T01 AT1G74630 20.112 358 236 7 93 412 51 396 5.30e-17 84.7
MsG0680034461.01.T01 AT3G16610 22.689 476 267 11 4 399 63 517 1.26e-18 90.1
MsG0680034461.01.T01 AT3G16610 24.167 240 137 4 76 278 342 573 6.31e-11 65.5
MsG0680034461.01.T01 AT1G13410 23.973 292 168 9 137 395 23 293 1.26e-18 89.4
MsG0680034461.01.T01 AT1G13410 22.821 390 278 9 6 392 58 427 2.20e-17 85.5
MsG0680034461.01.T01 AT1G74630 22.460 374 248 7 5 348 119 480 1.33e-18 89.7
MsG0680034461.01.T01 AT1G74630 20.112 358 236 7 93 412 66 411 5.15e-17 84.7
MsG0680034461.01.T01 AT4G04790 25.140 358 253 7 51 404 272 618 1.38e-18 90.1
MsG0680034461.01.T01 AT5G46460 24.629 337 185 12 66 395 55 329 1.56e-18 89.7
MsG0680034461.01.T01 AT5G46460 28.788 198 117 6 188 383 41 216 2.17e-15 79.7
MsG0680034461.01.T01 AT5G46460 20.290 414 271 9 5 383 64 453 6.94e-14 75.1
MsG0680034461.01.T01 AT3G53360 21.709 433 286 12 8 418 235 636 1.64e-18 89.7
MsG0680034461.01.T01 AT3G53360 19.947 376 241 9 47 375 69 431 1.06e-13 74.7
MsG0680034461.01.T01 AT3G53360 21.709 433 286 12 8 418 235 636 1.64e-18 89.7
MsG0680034461.01.T01 AT3G53360 19.947 376 241 9 47 375 69 431 1.06e-13 74.7
MsG0680034461.01.T01 AT2G01390 26.141 241 170 2 254 494 124 356 1.71e-18 89.4
MsG0680034461.01.T01 AT2G01390 21.560 436 316 6 2 417 117 546 3.23e-17 85.5
MsG0680034461.01.T01 AT2G01390 26.000 200 145 1 219 418 124 320 1.12e-15 80.5
MsG0680034461.01.T01 AT2G01390 26.708 161 118 0 176 336 116 276 2.60e-13 73.2

Find 120 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 438 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTCAAGGATACCATCCTTTA+TGG 0.148305 6:-87981447 MsG0680034461.01.T01:CDS
TATTGATGGTTTGTGTAAAT+TGG 0.179802 6:-87985910 MsG0680034461.01.T01:CDS
TGTTACTTATAACTCTTTAA+TGG 0.217600 6:-87986138 MsG0680034461.01.T01:CDS
TTTACATAATCCGTTGATTA+AGG 0.250061 6:+87986544 None:intergenic
AGCTATACTACCATGATTAA+TGG 0.274508 6:-87986029 MsG0680034461.01.T01:CDS
TGGATTATGTAAGATTAAAA+TGG 0.289867 6:-87986009 MsG0680034461.01.T01:CDS
ATTTACACAAACCATCAATA+AGG 0.295585 6:+87985913 None:intergenic
AATAACTTACAGTTCTATAT+TGG 0.299820 6:-87985823 MsG0680034461.01.T01:CDS
CATTTCTTCAAAGAGATTTA+CGG 0.308614 6:+87985977 None:intergenic
TGTGTATACCTTTACTATAT+TGG 0.314345 6:-87986246 MsG0680034461.01.T01:CDS
GTAGAGAATGTTATGGCATT+TGG 0.321820 6:+87986671 None:intergenic
ACTTATAATGCTTTAATTAG+TGG 0.322120 6:-87986344 MsG0680034461.01.T01:CDS
CAAAGATATATTCGATAGTA+TGG 0.332678 6:-87986081 MsG0680034461.01.T01:CDS
TTAAGGTACCGTAGCTAAAT+TGG 0.337032 6:+87986561 None:intergenic
GAACTGTAAGTTATTACATT+AGG 0.346198 6:+87985831 None:intergenic
ATTGATGGTTTGTGTAAATT+GGG 0.359430 6:-87985909 MsG0680034461.01.T01:CDS
CTTGAACTGGGTCAATTCCT+TGG 0.362530 6:+87981377 None:intergenic
CATACTATCGAATATATCTT+TGG 0.365013 6:+87986082 None:intergenic
ACTTACAATTCCCTTATTGA+TGG 0.380904 6:-87985924 MsG0680034461.01.T01:CDS
ATAGTGTATGTGTACATATT+TGG 0.384139 6:+87985726 None:intergenic
GAATTGTAAGTTACCACATT+AGG 0.392884 6:+87985936 None:intergenic
AGCATTGCACTTTCATGATA+AGG 0.402201 6:-87986609 MsG0680034461.01.T01:CDS
CATGAAAGTGCAATGCTTGA+TGG 0.403594 6:+87986615 None:intergenic
CATGATAAGGTGGTAGCGTT+GGG 0.409418 6:-87986596 MsG0680034461.01.T01:CDS
CAACCTTCAAGTCCTTGAAC+TGG 0.420060 6:+87981364 None:intergenic
GTGGTGTACATTACCACATT+AGG 0.420100 6:+87986461 None:intergenic
TACTTTGGAGGAGGTCCAAT+CGG 0.422673 6:-87981409 MsG0680034461.01.T01:CDS
TAGAGAATGTTATGGCATTT+GGG 0.426914 6:+87986672 None:intergenic
TTGAAATGCTCAAAAGACTT+TGG 0.430017 6:+87981465 None:intergenic
GACCCAGTTCAAGGACTTGA+AGG 0.445072 6:-87981367 MsG0680034461.01.T01:CDS
GAGAAGAGTTGGGTTGGACT+CGG 0.447856 6:-87981081 MsG0680034461.01.T01:CDS
CACATACACTATTCTTATCA+AGG 0.450654 6:-87985715 MsG0680034461.01.T01:CDS
GAGACTTTGGCTCTAAAAGA+AGG 0.451461 6:-87981021 MsG0680034461.01.T01:CDS
ATAGTAAAGGTATACACATC+GGG 0.454127 6:+87986251 None:intergenic
ACTTGATTTATATTCTGAAA+TGG 0.454380 6:-87986396 MsG0680034461.01.T01:CDS
TTTACACAAACCATCAATAA+GGG 0.457291 6:+87985914 None:intergenic
GTCTCAAAATATTCCTTCCT+AGG 0.464192 6:+87981039 None:intergenic
GACCTCTTGCGATCATTTCA+CGG 0.465262 6:+87985439 None:intergenic
GGTAAATTGAATGATGCAAT+TGG 0.468418 6:-87986308 MsG0680034461.01.T01:CDS
GCATTATAAGTGACAACATC+AGG 0.474334 6:+87986356 None:intergenic
CATCTTCTAGCCTTCCACTT+TGG 0.477509 6:+87985685 None:intergenic
CCTTGGTTCTCAAAGCCGAT+TGG 0.478137 6:+87981394 None:intergenic
TAAGGAGGGCACCACTACTT+TGG 0.478260 6:-87981424 MsG0680034461.01.T01:CDS
AGTGGTCACAAGTTGGGAAC+CGG 0.480222 6:-87981103 MsG0680034461.01.T01:CDS
AACATTCTCTACACTCATCA+AGG 0.480737 6:-87986660 MsG0680034461.01.T01:CDS
TGCACTAGTGGTCACAAGTT+GGG 0.482910 6:-87981109 MsG0680034461.01.T01:CDS
TTGGGAACCGGAGAAGAGTT+GGG 0.493607 6:-87981091 MsG0680034461.01.T01:CDS
AAGTTGATGGGAAATTAGTT+CGG 0.496592 6:-87986484 MsG0680034461.01.T01:CDS
ACTTATAACTCTTTAATGGA+TGG 0.499169 6:-87986134 MsG0680034461.01.T01:CDS
TTGTGACAAGGGCTTGTTTG+AGG 0.501955 6:-87985583 MsG0680034461.01.T01:CDS
TGGTGCCCTCCTTACCATAA+AGG 0.502043 6:+87981433 None:intergenic
TCATGATAAGGTGGTAGCGT+TGG 0.503933 6:-87986597 MsG0680034461.01.T01:CDS
GTTGGGAACCGGAGAAGAGT+TGG 0.509328 6:-87981092 MsG0680034461.01.T01:CDS
CAAGGAATTGACCCAGTTCA+AGG 0.510475 6:-87981376 MsG0680034461.01.T01:CDS
CTTACATAATCCATTAATCA+TGG 0.518154 6:+87986019 None:intergenic
AGCATCAACCAATATAGTAA+AGG 0.523226 6:+87986238 None:intergenic
GTCGATGAGATGCGTGATAG+AGG 0.525286 6:-87985861 MsG0680034461.01.T01:CDS
AGTCCAACCCAACTCTTCTC+CGG 0.525403 6:+87981084 None:intergenic
AGCCCTTGTCACAAAACCCT+TGG 0.529690 6:+87985592 None:intergenic
CTGTAAGTTATTACATTAGG+TGG 0.532140 6:+87985834 None:intergenic
GGAGGGCACCACTACTTTGG+AGG 0.534393 6:-87981421 MsG0680034461.01.T01:CDS
GGATACCATCCTTTATGGTA+AGG 0.535900 6:-87981442 MsG0680034461.01.T01:CDS
ATTCGATAGTATGGCCTCAA+GGG 0.542082 6:-87986072 MsG0680034461.01.T01:CDS
AAGGACTTGAAGGTTGATGA+TGG 0.543254 6:-87981357 MsG0680034461.01.T01:intron
AGAAGAGTTGGGTTGGACTC+GGG 0.544557 6:-87981080 MsG0680034461.01.T01:CDS
AAGCGTGCAAAGTCAAGGCA+TGG 0.545826 6:-87980972 MsG0680034461.01.T01:CDS
GTGCACTAGTGGTCACAAGT+TGG 0.546050 6:-87981110 MsG0680034461.01.T01:CDS
CTTATCACATGTGCCTAGGA+AGG 0.546157 6:-87981052 MsG0680034461.01.T01:CDS
ACATATACCGTTATGATCCA+AGG 0.549893 6:-87985609 MsG0680034461.01.T01:CDS
GATGAGTGTAGAGAATGTTA+TGG 0.552306 6:+87986664 None:intergenic
GGGCTTGTTTGAGGAAGCGT+TGG 0.556395 6:-87985574 MsG0680034461.01.T01:CDS
AGCTACGGTACCTTAATCAA+CGG 0.556433 6:-87986554 MsG0680034461.01.T01:CDS
TATTCGATAGTATGGCCTCA+AGG 0.556767 6:-87986073 MsG0680034461.01.T01:CDS
ATCAAGGGTCTCTGTCTCAA+AGG 0.556847 6:-87986644 MsG0680034461.01.T01:CDS
CATTTGGACCAATTTAGCTA+CGG 0.557795 6:-87986569 MsG0680034461.01.T01:CDS
CATATACCGTTATGATCCAA+GGG 0.563708 6:-87985608 MsG0680034461.01.T01:CDS
AACCTTCAAGTCCTTGAACT+GGG 0.569364 6:+87981365 None:intergenic
AATTGCTGAGAAAAGTTGAT+GGG 0.570327 6:-87986496 MsG0680034461.01.T01:CDS
TGAGAGTGCGGGTGCACTAG+TGG 0.572989 6:-87981121 MsG0680034461.01.T01:CDS
GCATAAACTATCTATAATTG+TGG 0.574426 6:+87986442 None:intergenic
GAACCGGAGAAGAGTTGGGT+TGG 0.574535 6:-87981087 MsG0680034461.01.T01:CDS
CTCCGTGAAATGATCGCAAG+AGG 0.574948 6:-87985441 MsG0680034461.01.T01:CDS
TACCATCCTTTATGGTAAGG+AGG 0.579529 6:-87981439 MsG0680034461.01.T01:CDS
TATAGTAAAGGTATACACAT+CGG 0.580461 6:+87986250 None:intergenic
TTTGTTCAATAAAATGACAT+CGG 0.582238 6:-87986285 MsG0680034461.01.T01:CDS
ACAAAACCCTTGGATCATAA+CGG 0.583900 6:+87985602 None:intergenic
GAGTTATAAGTAACAACACT+AGG 0.588918 6:+87986146 None:intergenic
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GCCCTCCTTACCATAAAGGA+TGG 0.610523 6:+87981437 None:intergenic
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GTTCTTCGTTCAAGTTGCGG+TGG 0.630159 6:-87981163 MsG0680034461.01.T01:intron
AGCGTGCAAAGTCAAGGCAT+GGG 0.631707 6:-87980971 MsG0680034461.01.T01:CDS
TTGGACCTCCTCCAAAGTAG+TGG 0.632340 6:+87981413 None:intergenic
TTCGATAGTATGGCCTCAAG+GGG 0.637246 6:-87986071 MsG0680034461.01.T01:CDS
ACATACACTATTCTTATCAA+GGG 0.638818 6:-87985714 MsG0680034461.01.T01:CDS
GAAGATGGTTATGAGAGTGC+GGG 0.655805 6:-87981132 MsG0680034461.01.T01:CDS
ATTAGCAATGACTCCCCTTG+AGG 0.656628 6:+87986058 None:intergenic
TGAAGATGGTTATGAGAGTG+CGG 0.673366 6:-87981133 MsG0680034461.01.T01:CDS
ACTTTGGCTCTAAAAGAAGG+AGG 0.677598 6:-87981018 MsG0680034461.01.T01:CDS
ACATATTTGGTCGAATACCG+TGG 0.694933 6:+87985739 None:intergenic
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GAAAGTGCAATGCTTGATGG+AGG 0.719266 6:+87986618 None:intergenic
TAGTAAAGGTATACACATCG+GGG 0.725621 6:+87986252 None:intergenic
TTATCTATGATGATGAAACA+AGG 0.730179 6:-87986176 MsG0680034461.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! AATATAATTTGTTTCTAATT+AGG + Chr6:87982379-87982398 None:intergenic 10.0%
!! AAAAATATATGGTATAAAGA+TGG - Chr6:87984840-87984859 MsG0680034461.01.T01:intron 15.0%
!! AAGATATTGGAAAAAATATA+TGG - Chr6:87984829-87984848 MsG0680034461.01.T01:intron 15.0%
!! ATATAGTGAATATATAGATT+AGG - Chr6:87983415-87983434 MsG0680034461.01.T01:intron 15.0%
!! TATAGAACAGATTATAAAAA+AGG - Chr6:87982586-87982605 MsG0680034461.01.T01:intron 15.0%
!! TATTTCCATTAATACAATAT+TGG - Chr6:87982774-87982793 MsG0680034461.01.T01:intron 15.0%
!! TCAATAGTTAATCTATATTT+AGG + Chr6:87983821-87983840 None:intergenic 15.0%
!!! AATGATGATTTTTATTTTTC+TGG - Chr6:87984777-87984796 MsG0680034461.01.T01:intron 15.0%
!!! ATAACTTTTGTTTATTGTTT+TGG - Chr6:87984062-87984081 MsG0680034461.01.T01:intron 15.0%
!!! CATAGAAAAGTTTATTTTTA+CGG - Chr6:87984171-87984190 MsG0680034461.01.T01:intron 15.0%
!!! TTCTGGTATTTTTTTAATTT+AGG - Chr6:87984571-87984590 MsG0680034461.01.T01:intron 15.0%
!! AAACAACAATCTATTCATTT+AGG - Chr6:87986033-87986052 MsG0680034461.01.T01:CDS 20.0%
!! AAGTAATAAGATGAAAAATC+TGG - Chr6:87983925-87983944 MsG0680034461.01.T01:intron 20.0%
!! AATAACTTACAGTTCTATAT+TGG - Chr6:87981817-87981836 MsG0680034461.01.T01:intron 20.0%
!! AATCTATATTTAGGCTAATT+TGG + Chr6:87983812-87983831 None:intergenic 20.0%
!! AATTTCCATGAAAAAATTAC+TGG + Chr6:87984728-87984747 None:intergenic 20.0%
!! ACATTGGAATAACTATAATT+TGG + Chr6:87983597-87983616 None:intergenic 20.0%
!! ACTTATAATGCTTTAATTAG+TGG - Chr6:87981296-87981315 MsG0680034461.01.T01:intron 20.0%
!! AGAATTAGAATGTAATTGTT+AGG - Chr6:87982477-87982496 MsG0680034461.01.T01:intron 20.0%
!! ATCTATATTTAGGCTAATTT+GGG + Chr6:87983811-87983830 None:intergenic 20.0%
!! ATTATGTAAGATTAAAATGG+TGG - Chr6:87981634-87981653 MsG0680034461.01.T01:intron 20.0%
!! ATTTCCATGAAAAAATTACT+GGG + Chr6:87984727-87984746 None:intergenic 20.0%
!! CTTAGTTAAAGAAATAAACA+AGG - Chr6:87981535-87981554 MsG0680034461.01.T01:intron 20.0%
!! TAGAAAAATTATTCCTAATG+TGG - Chr6:87981691-87981710 MsG0680034461.01.T01:intron 20.0%
!! TGGATTATGTAAGATTAAAA+TGG - Chr6:87981631-87981650 MsG0680034461.01.T01:intron 20.0%
!! TTCATTCAAATTGAATACTT+AGG + Chr6:87983455-87983474 None:intergenic 20.0%
!! TTTGTTCAATAAAATGACAT+CGG - Chr6:87981355-87981374 MsG0680034461.01.T01:intron 20.0%
!!! AAAAATAAACTTTTCTATGG+TGG + Chr6:87984170-87984189 None:intergenic 20.0%
!!! AAAATAAACTTTTCTATGGT+GGG + Chr6:87984169-87984188 None:intergenic 20.0%
!!! ACTTGATTTATATTCTGAAA+TGG - Chr6:87981244-87981263 MsG0680034461.01.T01:intron 20.0%
!!! AGCTATTTAGAATAAGAAAT+TGG + Chr6:87982562-87982581 None:intergenic 20.0%
!!! ATTAAAGAAGTAACTTGTTA+TGG - Chr6:87983011-87983030 MsG0680034461.01.T01:intron 20.0%
!!! CAATTTTCGTTTTTAGTTTT+TGG - Chr6:87982674-87982693 MsG0680034461.01.T01:intron 20.0%
!!! CGTAAAAATAAACTTTTCTA+TGG + Chr6:87984173-87984192 None:intergenic 20.0%
!!! GATTCCTTTTTTTTCTTTTT+CGG + Chr6:87984679-87984698 None:intergenic 20.0%
!!! GGTTTGATTTTAAAGATTAT+TGG + Chr6:87984706-87984725 None:intergenic 20.0%
!!! TAAAATCAATTATGCTTTTC+TGG - Chr6:87984533-87984552 MsG0680034461.01.T01:intron 20.0%
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!!! TGTTACTTATAACTCTTTAA+TGG - Chr6:87981502-87981521 MsG0680034461.01.T01:intron 20.0%
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!!! TTGTTTCTAAATTATCAAGT+AGG + Chr6:87983743-87983762 None:intergenic 20.0%
!!! TTTAAAAGTGTGTTGAAAAA+TGG - Chr6:87982913-87982932 MsG0680034461.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTTTTTGTGTATACACTA+AGG - Chr6:87984100-87984119 MsG0680034461.01.T01:intron 20.0%
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! AACAAGTTACTTCTTTAATG+AGG + Chr6:87983010-87983029 None:intergenic 25.0%
! AACAATCTATTCATTTAGGA+TGG - Chr6:87986037-87986056 MsG0680034461.01.T01:CDS 25.0%
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! ACTTATAACTCTTTAATGGA+TGG - Chr6:87981506-87981525 MsG0680034461.01.T01:intron 25.0%
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! ATACACAAAAAAAACAACCA+GGG + Chr6:87984094-87984113 None:intergenic 25.0%
! ATACACTAAGGATCTAATTA+TGG - Chr6:87984112-87984131 MsG0680034461.01.T01:intron 25.0%
! ATAGTGTATGTGTACATATT+TGG + Chr6:87981917-87981936 None:intergenic 25.0%
! ATATATGGTATAAAGATGGA+TGG - Chr6:87984844-87984863 MsG0680034461.01.T01:intron 25.0%
! ATATTGCTACATTCCTAATA+AGG - Chr6:87983866-87983885 MsG0680034461.01.T01:intron 25.0%
! ATCCACCAATATTGTATTAA+TGG + Chr6:87982782-87982801 None:intergenic 25.0%
! ATTTACACAAACCATCAATA+AGG + Chr6:87981730-87981749 None:intergenic 25.0%
! CAAAGATATATTCGATAGTA+TGG - Chr6:87981559-87981578 MsG0680034461.01.T01:intron 25.0%
! CAAATATATCCTCAAAGTAA+AGG - Chr6:87983699-87983718 MsG0680034461.01.T01:intron 25.0%
! CATACTATCGAATATATCTT+TGG + Chr6:87981561-87981580 None:intergenic 25.0%
! CATTTCTTCAAAGAGATTTA+CGG + Chr6:87981666-87981685 None:intergenic 25.0%
! CGAAAAAGATGAGAATTATA+TGG - Chr6:87982165-87982184 MsG0680034461.01.T01:intron 25.0%
! CTTACATAATCCATTAATCA+TGG + Chr6:87981624-87981643 None:intergenic 25.0%
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! TATGCTTGACATGTTTATAA+AGG - Chr6:87983568-87983587 MsG0680034461.01.T01:intron 25.0%
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!! AATGAAATATAGTTTGCGTT+GGG + Chr6:87984372-87984391 None:intergenic 25.0%
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!! ATTGATGGTTTGTGTAAATT+GGG - Chr6:87981731-87981750 MsG0680034461.01.T01:intron 25.0%
!! CAATTTTACAATCAAGTTTC+TGG + Chr6:87982813-87982832 None:intergenic 25.0%
!! TATAGTAAAGGTATACACAT+CGG + Chr6:87981393-87981412 None:intergenic 25.0%
!! TATTGATGGTTTGTGTAAAT+TGG - Chr6:87981730-87981749 MsG0680034461.01.T01:intron 25.0%
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!! TTACAAAGGAGGTAATTTTA+GGG - Chr6:87985200-87985219 MsG0680034461.01.T01:intron 25.0%
!! TTACTTTGAGGATATATTTG+TGG + Chr6:87983699-87983718 None:intergenic 25.0%
!! TTATCTATGATGATGAAACA+AGG - Chr6:87981464-87981483 MsG0680034461.01.T01:CDS 25.0%
!! TTATGTTTCTACAGCATAAT+TGG - Chr6:87983336-87983355 MsG0680034461.01.T01:intron 25.0%
!! TTTACATAATCCGTTGATTA+AGG + Chr6:87981099-87981118 None:intergenic 25.0%
!!! AATTTGTTTCTAATTAGGAG+AGG + Chr6:87982374-87982393 None:intergenic 25.0%
!!! ACTTTTGTTTATTGTTTTGG+TGG - Chr6:87984065-87984084 MsG0680034461.01.T01:intron 25.0%
!!! ATTTCATAAGTTTTAGCATC+TGG + Chr6:87982127-87982146 None:intergenic 25.0%
!!! GATGATTTTTATTTTTCTGG+TGG - Chr6:87984780-87984799 MsG0680034461.01.T01:intron 25.0%
!!! TTAGATTAGATCTGTTTTTG+TGG - Chr6:87985573-87985592 MsG0680034461.01.T01:CDS 25.0%
AATTTGCAGCATATCATTCT+TGG - Chr6:87984510-87984529 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
ACAATGATAACAAAGATGTG+TGG + Chr6:87985644-87985663 None:intergenic 30.0%
ACTTACAATTCCCTTATTGA+TGG - Chr6:87981716-87981735 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
AGAAAAATAAGTACTTGAGG+AGG + Chr6:87984280-87984299 None:intergenic 30.0%
AGCATCAACCAATATAGTAA+AGG + Chr6:87981405-87981424 None:intergenic 30.0%
AGCTATACTACCATGATTAA+TGG - Chr6:87981611-87981630 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
ATATCCTCAAAGTAAAGGTT+TGG - Chr6:87983704-87983723 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
ATCCTAAGAGAAAACACAAA+AGG + Chr6:87985318-87985337 None:intergenic 30.0%
ATCTAATTATGGTGGCATTT+AGG - Chr6:87984123-87984142 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
ATGGAACCTATATTGAGTAA+AGG - Chr6:87983890-87983909 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
ATGTCAAAAATGGAAGACAA+TGG - Chr6:87982094-87982113 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
ATTTGAAAAATGAGTCCAAG+TGG - Chr6:87983769-87983788 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
CAACGCAAACTATATTTCAT+TGG - Chr6:87984371-87984390 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
CACATACACTATTCTTATCA+AGG - Chr6:87981925-87981944 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
CATGAAAATGGGTAGAAATT+AGG - Chr6:87985357-87985376 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
CCTTCCGAAAAAGAAAAAAA+AGG - Chr6:87984672-87984691 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
CTGTAAGTTATTACATTAGG+TGG + Chr6:87981809-87981828 None:intergenic 30.0%
GAATTGTAAGTTACCACATT+AGG + Chr6:87981707-87981726 None:intergenic 30.0%
GAGTTATAAGTAACAACACT+AGG + Chr6:87981497-87981516 None:intergenic 30.0%
GGTAAATTGAATGATGCAAT+TGG - Chr6:87981332-87981351 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
GTAGAAACATAATTCATGCT+TGG + Chr6:87983328-87983347 None:intergenic 30.0%
TAATATGGAAGATGAGGATA+AGG - Chr6:87986131-87986150 MsG0680034461.01.T01:CDS 30.0%
TAGAGAATGTTATGGCATTT+GGG + Chr6:87980971-87980990 None:intergenic 30.0%
TAGGATTGTCTTGGAAATAT+TGG - Chr6:87982496-87982515 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
TATAGGTTCCATACCTTATT+AGG + Chr6:87983882-87983901 None:intergenic 30.0%
TATTGCTTTGATTATGCTTG+TGG - Chr6:87985537-87985556 MsG0680034461.01.T01:CDS 30.0%
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TCTAATTATGGTGGCATTTA+GGG - Chr6:87984124-87984143 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
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TGTAATTGTTAGGATTGTCT+TGG - Chr6:87982487-87982506 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
TTCCAATGTTAGTGTTAAGA+AGG - Chr6:87983608-87983627 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
TTGAAATGCTCAAAAGACTT+TGG + Chr6:87986178-87986197 None:intergenic 30.0%
TTGTATCACTTTCATCTTAG+TGG - Chr6:87985424-87985443 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
TTTCATTTACTGCATTCTCT+CGG - Chr6:87983518-87983537 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
TTTGAAAAATGAGTCCAAGT+GGG - Chr6:87983770-87983789 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
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! AATCTATTCATTTAGGATGG+TGG - Chr6:87986040-87986059 MsG0680034461.01.T01:CDS 30.0%
! AATTGCTGAGAAAAGTTGAT+GGG - Chr6:87981144-87981163 MsG0680034461.01.T01:CDS 30.0%
! ATAGTAAAGGTATACACATC+GGG + Chr6:87981392-87981411 None:intergenic 30.0%
! ATTAGTGGTTTTTGCATTGT+TGG - Chr6:87981311-87981330 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
! ATTTTATTAATGATCGCGAG+AGG - Chr6:87982322-87982341 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
! CAATGAAATATAGTTTGCGT+TGG + Chr6:87984373-87984392 None:intergenic 30.0%
! GGTATTCAATTATGCTTTTC+TGG - Chr6:87984554-87984573 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
! TATGGCTTGGCTTATATTAT+GGG - Chr6:87983029-87983048 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
! TGTTTCTTTGCAGATTTTGA+AGG - Chr6:87985151-87985170 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
! TTATGGCTTGGCTTATATTA+TGG - Chr6:87983028-87983047 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
! TTCCTTTTGTGTTTTCTCTT+AGG - Chr6:87985313-87985332 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
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! TTTGAAGATCTTTTGGTCAA+AGG - Chr6:87981989-87982008 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
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!! AAGTTGATGGGAAATTAGTT+CGG - Chr6:87981156-87981175 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
!! AATTGGTAAAGTTGGTATCA+TGG - Chr6:87985716-87985735 MsG0680034461.01.T01:CDS 30.0%
!! ACACGTTTTTGAAGATCTTT+TGG - Chr6:87981982-87982001 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
!! ATTGGTAAAGTTGGTATCAT+GGG - Chr6:87985717-87985736 MsG0680034461.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTGGTTGATGCTTTTTGTA+AGG - Chr6:87981412-87981431 MsG0680034461.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTTTTCTGGTGGTAAAGAA+GGG - Chr6:87984790-87984809 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
!! TATTCTTCTTCTTGTTGTTG+TGG - Chr6:87984444-87984463 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
!! TATTTTTCTGGTGGTAAAGA+AGG - Chr6:87984789-87984808 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
!! TTGGAAATATTGGTAGTGTT+AGG - Chr6:87982506-87982525 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
!!! CAAACCCAGTAATTTTTTCA+TGG - Chr6:87984720-87984739 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
!!! CCTTTTTTTTCTTTTTCGGA+AGG + Chr6:87984675-87984694 None:intergenic 30.0%
!!! GAAGGAATATTTTGAGACTT+TGG - Chr6:87986606-87986625 MsG0680034461.01.T01:CDS 30.0%
!!! TCGTTTTTAGTTTTTGGAGT+TGG - Chr6:87982680-87982699 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
!!! TGGATGATAGATGTTGTTTT+TGG - Chr6:87984874-87984893 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
!!! TGTTTTTGGCTTCAAATTTG+TGG - Chr6:87984888-87984907 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTCTGAGATTTTGAACTCA+TGG - Chr6:87984747-87984766 MsG0680034461.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTTTTCTTTTTCGGAAGGA+CGG + Chr6:87984671-87984690 None:intergenic 30.0%
AAAATAAGTACTTGAGGAGG+TGG + Chr6:87984277-87984296 None:intergenic 35.0%
AACATTCTCTACACTCATCA+AGG - Chr6:87980980-87980999 MsG0680034461.01.T01:CDS 35.0%
AAGACTCTTGATGCCAAATT+AGG - Chr6:87983666-87983685 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
AAGGCTTGAATGTTACAAGA+GGG - Chr6:87986312-87986331 MsG0680034461.01.T01:CDS 35.0%
ACAAAACCCTTGGATCATAA+CGG + Chr6:87982041-87982060 None:intergenic 35.0%
ACAAGTAGGATTCATCGAAT+TGG - Chr6:87983479-87983498 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
ACATATACCGTTATGATCCA+AGG - Chr6:87982031-87982050 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
ACATTCTCTACACTCATCAA+GGG - Chr6:87980981-87981000 MsG0680034461.01.T01:CDS 35.0%
ACTCTCATAACCATCTTCAT+CGG + Chr6:87986506-87986525 None:intergenic 35.0%
AGAAAAGATACATGCTAGCT+AGG - Chr6:87983230-87983249 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
AGAAACTTGGATTACAAAGG+AGG - Chr6:87985189-87985208 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
AGAAGACAAATAAGTCCTTG+TGG + Chr6:87983189-87983208 None:intergenic 35.0%
AGAATGGGGATTGAAGATAT+TGG - Chr6:87984816-87984835 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
AGATAAAAGTAAGCACCACA+AGG - Chr6:87983171-87983190 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
AGATGAAAAATCTGGATCCT+TGG - Chr6:87983933-87983952 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
AGCAAGACTCGTAATAGTTA+AGG - Chr6:87982615-87982634 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
AGCATTGCACTTTCATGATA+AGG - Chr6:87981031-87981050 MsG0680034461.01.T01:CDS 35.0%
ATCACTTTCATCTTAGTGGA+TGG - Chr6:87985428-87985447 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
ATCTCCGAGACATAAAACAA+TGG + Chr6:87985913-87985932 None:intergenic 35.0%
ATGCTTCTTTGTCATAAGCA+AGG - Chr6:87986413-87986432 MsG0680034461.01.T01:CDS 35.0%
ATTGCACTTTCATGATAAGG+TGG - Chr6:87981034-87981053 MsG0680034461.01.T01:CDS 35.0%
ATTGTACATGACGAAATCGT+TGG - Chr6:87985993-87986012 MsG0680034461.01.T01:CDS 35.0%
ATTTATCTTTCTCAGCAGCA+TGG - Chr6:87982850-87982869 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
CAAAAACCTAGAAATCAGTG+AGG - Chr6:87982433-87982452 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
CAAAAATCATCATGTTGACG+AGG - Chr6:87981850-87981869 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
CAATTGCTGAGAAAAGTTGA+TGG - Chr6:87981143-87981162 MsG0680034461.01.T01:CDS 35.0%
CACTAAGGATCTAATTATGG+TGG - Chr6:87984115-87984134 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
CATATACCGTTATGATCCAA+GGG - Chr6:87982032-87982051 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
CATTTGGACCAATTTAGCTA+CGG - Chr6:87981071-87981090 MsG0680034461.01.T01:CDS 35.0%
GAAAAGATACATGCTAGCTA+GGG - Chr6:87983231-87983250 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
GAGAGAAACTTGGATTACAA+AGG - Chr6:87985186-87985205 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
GATGAGTGTAGAGAATGTTA+TGG + Chr6:87980979-87980998 None:intergenic 35.0%
GCATTATAAGTGACAACATC+AGG + Chr6:87981287-87981306 None:intergenic 35.0%
GCTACATTCCTAATAAGGTA+TGG - Chr6:87983871-87983890 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
GGAAACATTGTAAACACCTT+GGG - Chr6:87985257-87985276 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
GGCCAACATTGAAGTTAATA+TGG - Chr6:87986116-87986135 MsG0680034461.01.T01:CDS 35.0%
GTAGAGAATGTTATGGCATT+TGG + Chr6:87980972-87980991 None:intergenic 35.0%
GTCTCAAAATATTCCTTCCT+AGG + Chr6:87986604-87986623 None:intergenic 35.0%
TAAAACAATCTCGGAGCAAT+TGG - Chr6:87986067-87986086 MsG0680034461.01.T01:CDS 35.0%
TAAAGATGGATGGTAGAAGA+TGG - Chr6:87984854-87984873 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
TCATTGGTATCCAGATCTAT+AGG - Chr6:87984387-87984406 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
TCTACTGTAAGACTGAAACT+AGG - Chr6:87982222-87982241 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
TGCCTTCTTAACACTAACAT+TGG + Chr6:87983613-87983632 None:intergenic 35.0%
TTAGGATTCATTGTGAGTGT+GGG - Chr6:87985331-87985350 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
TTAGGCTAATTTGGGTATGA+AGG + Chr6:87983803-87983822 None:intergenic 35.0%
TTCAAGGATACCATCCTTTA+TGG - Chr6:87986193-87986212 MsG0680034461.01.T01:CDS 35.0%
TTCATTTACTGCATTCTCTC+GGG - Chr6:87983519-87983538 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
TTGTCCGAATTCACAACAAT+TGG - Chr6:87985669-87985688 MsG0680034461.01.T01:CDS 35.0%
TTGTGGTTTCTCTCCTAATT+TGG + Chr6:87983682-87983701 None:intergenic 35.0%
TTGTTATGCCATTACTCTAG+TGG + Chr6:87984329-87984348 None:intergenic 35.0%
! AAAAGTGTGTAGAAGCATGA+AGG - Chr6:87985820-87985839 MsG0680034461.01.T01:CDS 35.0%
! AAAGTGTGTAGAAGCATGAA+GGG - Chr6:87985821-87985840 MsG0680034461.01.T01:CDS 35.0%
! AACATGTGTTTAGAAGTGTG+TGG - Chr6:87983267-87983286 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
! GATTGTAAAATTGACTCTGC+TGG - Chr6:87982820-87982839 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
! TAGTAAAGGTATACACATCG+GGG + Chr6:87981391-87981410 None:intergenic 35.0%
! TATAATCGTGGCACGATTTT+GGG - Chr6:87984992-87985011 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
! TGTTTTATGTCTCGGAGATA+AGG - Chr6:87985914-87985933 MsG0680034461.01.T01:CDS 35.0%
!! AGAAGTAACTTGTTATGGCT+TGG - Chr6:87983016-87983035 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
!! AGTGCCATTGTTTTATGTCT+CGG - Chr6:87985906-87985925 MsG0680034461.01.T01:CDS 35.0%
!! CTATTACGAGTCTTGCTTTT+AGG + Chr6:87982612-87982631 None:intergenic 35.0%
!! GTCTTCCATTTTTGACATCA+AGG + Chr6:87982092-87982111 None:intergenic 35.0%
!! GTTGATGCTTTTTGTAAGGA+TGG - Chr6:87981416-87981435 MsG0680034461.01.T01:CDS 35.0%
!! TGCTTTTTGTAAGGATGGTA+TGG - Chr6:87981421-87981440 MsG0680034461.01.T01:CDS 35.0%
!! TTAAGGTACCGTAGCTAAAT+TGG + Chr6:87981082-87981101 None:intergenic 35.0%
!! TTGTGGTGTTGATTTGAAGT+TGG - Chr6:87984461-87984480 MsG0680034461.01.T01:intron 35.0%
!!! CATCTTTTTCGAACAGAGAA+AGG + Chr6:87982156-87982175 None:intergenic 35.0%
!!! GATTAGATCTGTTTTTGTGG+TGG - Chr6:87985576-87985595 MsG0680034461.01.T01:CDS 35.0%
AACCTTCAAGTCCTTGAACT+GGG + Chr6:87986278-87986297 None:intergenic 40.0%
AATTATGGTGGCATTTAGGG+TGG - Chr6:87984127-87984146 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
ACACCAGCAAAACATGCTTT+CGG + Chr6:87984973-87984992 None:intergenic 40.0%
ACATATTTGGTCGAATACCG+TGG + Chr6:87981904-87981923 None:intergenic 40.0%
ACCATCCTTTATGGTAAGGA+GGG - Chr6:87986202-87986221 MsG0680034461.01.T01:CDS 40.0%
AGAAGTGAGCAAAGAGGAAA+AGG - Chr6:87986335-87986354 MsG0680034461.01.T01:CDS 40.0%
AGAGAGAAACCAGTTAAGTG+TGG + Chr6:87984018-87984037 None:intergenic 40.0%
AGCTACGGTACCTTAATCAA+CGG - Chr6:87981086-87981105 MsG0680034461.01.T01:CDS 40.0%
AGCTTGAAGAGAGAGAAACT+TGG - Chr6:87985176-87985195 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
AGTGAGATTTCACCATTGGA+AGG - Chr6:87985281-87985300 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
AGTGTGGGTGACATGAAAAT+GGG - Chr6:87985346-87985365 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
ATCAAAGGAAACAAGTGTGG+TGG - Chr6:87983105-87983124 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
ATTCGATAGTATGGCCTCAA+GGG - Chr6:87981568-87981587 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
CTTAGGATTCATTGTGAGTG+TGG - Chr6:87985330-87985349 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
CTTTGTAGTGAGGATCTCTT+GGG - Chr6:87985231-87985250 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
GAAAAATCTGGATCCTTGGT+TGG - Chr6:87983937-87983956 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
GAAATTAGTTCGGCCTAATG+TGG - Chr6:87981166-87981185 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
GAAGACAGAGTGATAGAGAA+TGG + Chr6:87984252-87984271 None:intergenic 40.0%
GAAGGAACAAACACACAAGA+TGG + Chr6:87985501-87985520 None:intergenic 40.0%
GAAGGCTTGAATGTTACAAG+AGG - Chr6:87986311-87986330 MsG0680034461.01.T01:CDS 40.0%
GGAGATTGATTGCATTTCAG+AGG - Chr6:87983050-87983069 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
GGATACCATCCTTTATGGTA+AGG - Chr6:87986198-87986217 MsG0680034461.01.T01:CDS 40.0%
GGGAAACATTGTAAACACCT+TGG - Chr6:87985256-87985275 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
GGTAAAGAAGGGAAGAGAAT+GGG - Chr6:87984801-87984820 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
GTAAAGAAGGGAAGAGAATG+GGG - Chr6:87984802-87984821 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
GTGGTGTACATTACCACATT+AGG + Chr6:87981182-87981201 None:intergenic 40.0%
GTGGTGTACGTCAATGATAT+CGG - Chr6:87983286-87983305 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
GTGTCCAAACCTTTACTTTG+AGG + Chr6:87983711-87983730 None:intergenic 40.0%
GTTTGATTAGAGAGGAACAC+TGG - Chr6:87984193-87984212 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
TAACAAAGCGTGCAAAGTCA+AGG - Chr6:87986663-87986682 MsG0680034461.01.T01:CDS 40.0%
TAAGCAAGGTCACTACAAGA+AGG - Chr6:87986427-87986446 MsG0680034461.01.T01:CDS 40.0%
TAATTCTTCAACTTCCCCTC+AGG + Chr6:87982464-87982483 None:intergenic 40.0%
TACCATCCTTTATGGTAAGG+AGG - Chr6:87986201-87986220 MsG0680034461.01.T01:CDS 40.0%
TAGGCGTGAATTGGTAAAGT+TGG - Chr6:87985708-87985727 MsG0680034461.01.T01:CDS 40.0%
TAGTCATATTGGACCGAACT+GGG - Chr6:87985472-87985491 MsG0680034461.01.T01:CDS 40.0%
TATTCGATAGTATGGCCTCA+AGG - Chr6:87981567-87981586 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
TCAAAGGAAACAAGTGTGGT+GGG - Chr6:87983106-87983125 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
TCTTTGTAGTGAGGATCTCT+TGG - Chr6:87985230-87985249 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
TGAAGATGGTTATGAGAGTG+CGG - Chr6:87986507-87986526 MsG0680034461.01.T01:CDS 40.0%
TGCATCAAAGGAAACAAGTG+TGG - Chr6:87983102-87983121 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
TGGTAAAGAAGGGAAGAGAA+TGG - Chr6:87984800-87984819 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
TTATGCCATTACTCTAGTGG+AGG + Chr6:87984326-87984345 None:intergenic 40.0%
TTGGTATCATGGGTTCAAGT+GGG - Chr6:87985727-87985746 MsG0680034461.01.T01:CDS 40.0%
TTTGATGCTCCACACTTAAC+TGG - Chr6:87984006-87984025 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
! AAATGAGTCCAAGTGGGTTT+CGG - Chr6:87983776-87983795 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
! ACTTTCATCTTAGTGGATGG+AGG - Chr6:87985431-87985450 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
! ATTATGGTGGCATTTAGGGT+GGG - Chr6:87984128-87984147 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
! CATGAAAGTGCAATGCTTGA+TGG + Chr6:87981028-87981047 None:intergenic 40.0%
! CTTTCATCTTAGTGGATGGA+GGG - Chr6:87985432-87985451 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
! GAAGCTTTTGATCCTTCCAA+TGG + Chr6:87985296-87985315 None:intergenic 40.0%
! GGAAAACGTGACACGATTTT+CGG - Chr6:87985013-87985032 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
! GGTGGAGTCTAAAACAATCT+CGG - Chr6:87986058-87986077 MsG0680034461.01.T01:CDS 40.0%
! GTATAATCGTGGCACGATTT+TGG - Chr6:87984991-87985010 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
! GTATCAAACGTGTCACGTTT+TGG - Chr6:87985085-87985104 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
! GTCTCGGAGATAAGGTTTTA+GGG - Chr6:87985922-87985941 MsG0680034461.01.T01:CDS 40.0%
! GTTTTGCTGGTGTATAATCG+TGG - Chr6:87984980-87984999 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
! TGTCTCGGAGATAAGGTTTT+AGG - Chr6:87985921-87985940 MsG0680034461.01.T01:CDS 40.0%
!! AAGGACTTGAAGGTTGATGA+TGG - Chr6:87986283-87986302 MsG0680034461.01.T01:CDS 40.0%
!! ACTTGAAGGTTGATGATGGT+TGG - Chr6:87986287-87986306 MsG0680034461.01.T01:CDS 40.0%
!! ACTTTGGCTCTAAAAGAAGG+AGG - Chr6:87986622-87986641 MsG0680034461.01.T01:CDS 40.0%
!! ATCCAAGGGTTTTGTGACAA+GGG - Chr6:87982046-87982065 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
!! CTTTGATTTGTCAAAGCCCT+TGG + Chr6:87986390-87986409 None:intergenic 40.0%
!! GAGACTTTGGCTCTAAAAGA+AGG - Chr6:87986619-87986638 MsG0680034461.01.T01:CDS 40.0%
!! GTAGTTCTTCGTTCAAGTTG+CGG - Chr6:87986474-87986493 MsG0680034461.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTGGCCTTGATGTCAAAAA+TGG - Chr6:87982084-87982103 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
!!! TATTGTTTTGGTGGATACCC+TGG - Chr6:87984074-87984093 MsG0680034461.01.T01:intron 40.0%
AAAGCCCTTGGACTTAGACT+TGG + Chr6:87986378-87986397 None:intergenic 45.0%
AACAATCTCGGAGCAATTGG+CGG - Chr6:87986070-87986089 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
AAGGATTGCCCGGATAAAAG+GGG - Chr6:87986446-87986465 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
AATCTCATCGCCATTGGTGT+GGG - Chr6:87982703-87982722 MsG0680034461.01.T01:intron 45.0%
ACAAAGATGTGTGGCAGCAA+AGG + Chr6:87985635-87985654 None:intergenic 45.0%
ACAACCCGAAATCATGCTTC+CGG + Chr6:87985768-87985787 None:intergenic 45.0%
AGAAGGATTGCCCGGATAAA+AGG - Chr6:87986444-87986463 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
AGCAAAGAGGAAAAGGCAAG+GGG - Chr6:87986342-87986361 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
AGGTCCAAGTCTAAGTCCAA+GGG - Chr6:87986371-87986390 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
AGTTGGAATCTCATCGCCAT+TGG - Chr6:87982697-87982716 MsG0680034461.01.T01:intron 45.0%
ATCAAGGGTCTCTGTCTCAA+AGG - Chr6:87980996-87981015 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
ATCTTTCTCAGCAGCATGGT+TGG - Chr6:87982854-87982873 MsG0680034461.01.T01:intron 45.0%
ATGCTAGCTAGGGAAGAGAA+AGG - Chr6:87983241-87983260 MsG0680034461.01.T01:intron 45.0%
ATTAGCAATGACTCCCCTTG+AGG + Chr6:87981585-87981604 None:intergenic 45.0%
CAACCTTCAAGTCCTTGAAC+TGG + Chr6:87986279-87986298 None:intergenic 45.0%
CAAGGAATTGACCCAGTTCA+AGG - Chr6:87986264-87986283 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
CACAAGATGGTAACCCAGTT+CGG + Chr6:87985488-87985507 None:intergenic 45.0%
CGGTCCAATATGACTACCTA+GGG + Chr6:87985468-87985487 None:intergenic 45.0%
CTTATCACATGTGCCTAGGA+AGG - Chr6:87986588-87986607 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
CTTGAACTGGGTCAATTCCT+TGG + Chr6:87986266-87986285 None:intergenic 45.0%
GAAGCGTGAGATGATAGACA+AGG - Chr6:87985878-87985897 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
GAAGGATTGCCCGGATAAAA+GGG - Chr6:87986445-87986464 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
GACCTCTTGCGATCATTTCA+CGG + Chr6:87982204-87982223 None:intergenic 45.0%
GAGCAAAGAGGAAAAGGCAA+GGG - Chr6:87986341-87986360 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
GAGTGTGGGTGACATGAAAA+TGG - Chr6:87985345-87985364 MsG0680034461.01.T01:intron 45.0%
GCACTACAATCATCCAACCA+AGG + Chr6:87983953-87983972 None:intergenic 45.0%
GGCGCCAATTGTTGTGAATT+CGG + Chr6:87985676-87985695 None:intergenic 45.0%
GGGTAGTGAGATTTCACCAT+TGG - Chr6:87985277-87985296 MsG0680034461.01.T01:intron 45.0%
GGTTGAGTGTCTTTGTAGTG+AGG - Chr6:87985221-87985240 MsG0680034461.01.T01:intron 45.0%
GTAGTCATATTGGACCGAAC+TGG - Chr6:87985471-87985490 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
GTTGGTATCATGGGTTCAAG+TGG - Chr6:87985726-87985745 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
TAGTGAGGATCTCTTGGGTT+GGG - Chr6:87985236-87985255 MsG0680034461.01.T01:intron 45.0%
TCACACCTCCACTAGAGTAA+TGG - Chr6:87984318-87984337 MsG0680034461.01.T01:intron 45.0%
TCACTACAAGAAGGATTGCC+CGG - Chr6:87986436-87986455 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
TCCAATATGACTACCTAGGG+AGG + Chr6:87985465-87985484 None:intergenic 45.0%
TCCTCCCTAGGTAGTCATAT+TGG - Chr6:87985461-87985480 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
TCGGTCCAATATGACTACCT+AGG + Chr6:87985469-87985488 None:intergenic 45.0%
TGAGCAAAGAGGAAAAGGCA+AGG - Chr6:87986340-87986359 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
TGCACTAGTGGTCACAAGTT+GGG - Chr6:87986531-87986550 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
TGCTCTTATCACATGTGCCT+AGG - Chr6:87986584-87986603 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
TGGTGAAATCTCACTACCCA+AGG + Chr6:87985276-87985295 None:intergenic 45.0%
TTCGATAGTATGGCCTCAAG+GGG - Chr6:87981569-87981588 MsG0680034461.01.T01:intron 45.0%
! CATCTTCTAGCCTTCCACTT+TGG + Chr6:87981958-87981977 None:intergenic 45.0%
! CATGATAAGGTGGTAGCGTT+GGG - Chr6:87981044-87981063 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
! CGTTGGGCATCACATTTTCA+TGG + Chr6:87984356-87984375 None:intergenic 45.0%
! CTACCATTGCCCCTTTTATC+CGG + Chr6:87986458-87986477 None:intergenic 45.0%
! GAAAGTGCAATGCTTGATGG+AGG + Chr6:87981025-87981044 None:intergenic 45.0%
! GAAGATGGTTATGAGAGTGC+GGG - Chr6:87986508-87986527 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
! GATAAGGTTGGTCGTACCTT+GGG - Chr6:87985056-87985075 MsG0680034461.01.T01:intron 45.0%
! GTTCACCGGAAGCATGATTT+CGG - Chr6:87985760-87985779 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
! TACCATTGCCCCTTTTATCC+GGG + Chr6:87986457-87986476 None:intergenic 45.0%
! TACTTTGGAGGAGGTCCAAT+CGG - Chr6:87986231-87986250 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
! TCATGATAAGGTGGTAGCGT+TGG - Chr6:87981043-87981062 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
! TGGCATTTAGGGTGGGTAAA+AGG - Chr6:87984135-87984154 MsG0680034461.01.T01:intron 45.0%
! TTCACCGGAAGCATGATTTC+GGG - Chr6:87985761-87985780 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
! TTGTGACAAGGGCTTGTTTG+AGG - Chr6:87982057-87982076 MsG0680034461.01.T01:intron 45.0%
!! AGGTTGATGATGGTTGGTGA+AGG - Chr6:87986293-87986312 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
!! ATGCCGAAAGCATGTTTTGC+TGG - Chr6:87984967-87984986 MsG0680034461.01.T01:intron 45.0%
!! GATCCAAGGGTTTTGTGACA+AGG - Chr6:87982045-87982064 MsG0680034461.01.T01:intron 45.0%
!! GCACGTTTTCAGGATAAGGT+TGG - Chr6:87985044-87985063 MsG0680034461.01.T01:intron 45.0%
!! GGTAGCGTTGGGTTTTCATT+TGG - Chr6:87981055-87981074 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
!! GTGGAACCTCACTGATTTCT+AGG + Chr6:87982442-87982461 None:intergenic 45.0%
!! TGACGAAATCGTTGGCTCAT+AGG - Chr6:87986001-87986020 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
!!! TCTGTTTTTGTGGTGGTGCT+TGG - Chr6:87985583-87985602 MsG0680034461.01.T01:CDS 45.0%
AAGCGTGCAAAGTCAAGGCA+TGG - Chr6:87986668-87986687 MsG0680034461.01.T01:CDS 50.0%
AATCAGTGAGGTTCCACCTG+AGG - Chr6:87982445-87982464 MsG0680034461.01.T01:intron 50.0%
AGAGGGAGAAGTGAGCAAAG+AGG - Chr6:87986329-87986348 MsG0680034461.01.T01:CDS 50.0%
AGCCCTTGTCACAAAACCCT+TGG + Chr6:87982051-87982070 None:intergenic 50.0%
AGCCTAATAAACAGCCCAGG+CGG + Chr6:87983140-87983159 None:intergenic 50.0%
AGCGTGCAAAGTCAAGGCAT+GGG - Chr6:87986669-87986688 MsG0680034461.01.T01:CDS 50.0%
AGTCCAACCCAACTCTTCTC+CGG + Chr6:87986559-87986578 None:intergenic 50.0%
ATCAAGGGACTGTGCCAAAG+TGG - Chr6:87981941-87981960 MsG0680034461.01.T01:intron 50.0%
ATCAGTGAGGTTCCACCTGA+GGG - Chr6:87982446-87982465 MsG0680034461.01.T01:intron 50.0%
ATGAAGGTCCGAAACCCACT+TGG + Chr6:87983787-87983806 None:intergenic 50.0%
ATGTGTGGCAGCAAAGGAAG+TGG + Chr6:87985629-87985648 None:intergenic 50.0%
CAACACCACGCCTATAGATC+TGG + Chr6:87984400-87984419 None:intergenic 50.0%
CGTTTGATACGTACGACCCA+AGG + Chr6:87985075-87985094 None:intergenic 50.0%
CTCCGTGAAATGATCGCAAG+AGG - Chr6:87982199-87982218 MsG0680034461.01.T01:intron 50.0%
CTGAGCCTAATAAACAGCCC+AGG + Chr6:87983143-87983162 None:intergenic 50.0%
GAAGGAGGAGTTGTTCGACT+CGG - Chr6:87986637-87986656 MsG0680034461.01.T01:CDS 50.0%
GAATCTCATCGCCATTGGTG+TGG - Chr6:87982702-87982721 MsG0680034461.01.T01:intron 50.0%
GACCCAGTTCAAGGACTTGA+AGG - Chr6:87986273-87986292 MsG0680034461.01.T01:CDS 50.0%
GAGGTCCAAGTCTAAGTCCA+AGG - Chr6:87986370-87986389 MsG0680034461.01.T01:CDS 50.0%
GCCCTCCTTACCATAAAGGA+TGG + Chr6:87986206-87986225 None:intergenic 50.0%
GGTATCCAGATCTATAGGCG+TGG - Chr6:87984392-87984411 MsG0680034461.01.T01:intron 50.0%
GTAGTGAGGATCTCTTGGGT+TGG - Chr6:87985235-87985254 MsG0680034461.01.T01:intron 50.0%
GTCGATGAGATGCGTGATAG+AGG - Chr6:87981779-87981798 MsG0680034461.01.T01:intron 50.0%
GTGCACTAGTGGTCACAAGT+TGG - Chr6:87986530-87986549 MsG0680034461.01.T01:CDS 50.0%
TGCGGCACATTTGACACAAG+CGG - Chr6:87985854-87985873 MsG0680034461.01.T01:CDS 50.0%
TGGGACATCGAGAAGTTCAC+CGG - Chr6:87985746-87985765 MsG0680034461.01.T01:CDS 50.0%
TGGTGCCCTCCTTACCATAA+AGG + Chr6:87986210-87986229 None:intergenic 50.0%
TTCTTCAACTTCCCCTCAGG+TGG + Chr6:87982461-87982480 None:intergenic 50.0%
TTGGACCTCCTCCAAAGTAG+TGG + Chr6:87986230-87986249 None:intergenic 50.0%
TTGGGAACCGGAGAAGAGTT+GGG - Chr6:87986549-87986568 MsG0680034461.01.T01:CDS 50.0%
! AGTGGTCACAAGTTGGGAAC+CGG - Chr6:87986537-87986556 MsG0680034461.01.T01:CDS 50.0%
! CCTTGGTTCTCAAAGCCGAT+TGG + Chr6:87986249-87986268 None:intergenic 50.0%
! GGATAAGGTTGGTCGTACCT+TGG - Chr6:87985055-87985074 MsG0680034461.01.T01:intron 50.0%
! GTAGAAGCATGAAGGGTGAG+CGG - Chr6:87985828-87985847 MsG0680034461.01.T01:CDS 50.0%
!! AGAAGAGTTGGGTTGGACTC+GGG - Chr6:87986560-87986579 MsG0680034461.01.T01:CDS 50.0%
!! CCAATCGGCTTTGAGAACCA+AGG - Chr6:87986246-87986265 MsG0680034461.01.T01:CDS 50.0%
!! CTGGGCACGTTTTCAGGATA+AGG - Chr6:87985040-87985059 MsG0680034461.01.T01:intron 50.0%
!! GAAACAAGTGTGGTGGGCAT+GGG - Chr6:87983112-87983131 MsG0680034461.01.T01:intron 50.0%
!! GACACGATTTTCGGCTTGCT+GGG - Chr6:87985022-87985041 MsG0680034461.01.T01:intron 50.0%
!! GAGAAGAGTTGGGTTGGACT+CGG - Chr6:87986559-87986578 MsG0680034461.01.T01:CDS 50.0%
!! GCATGATTTCGGGTTGTGGA+AGG - Chr6:87985771-87985790 MsG0680034461.01.T01:CDS 50.0%
!! GGAAGCATGATTTCGGGTTG+TGG - Chr6:87985767-87985786 MsG0680034461.01.T01:CDS 50.0%
!! GTTCTTCGTTCAAGTTGCGG+TGG - Chr6:87986477-87986496 MsG0680034461.01.T01:CDS 50.0%
!! TAAGGAGGGCACCACTACTT+TGG - Chr6:87986216-87986235 MsG0680034461.01.T01:CDS 50.0%
!! TGACACGATTTTCGGCTTGC+TGG - Chr6:87985021-87985040 MsG0680034461.01.T01:intron 50.0%
!!! AAGGTTTTAGGGATGTCGCG+AGG - Chr6:87985933-87985952 MsG0680034461.01.T01:CDS 50.0%
!!! AGGTTTTAGGGATGTCGCGA+GGG - Chr6:87985934-87985953 MsG0680034461.01.T01:CDS 50.0%
AACAACAGCGCCCACACCAA+TGG + Chr6:87982716-87982735 None:intergenic 55.0%
AGGGACTGTGCCAAAGTGGA+AGG - Chr6:87981945-87981964 MsG0680034461.01.T01:intron 55.0%
CAATTCACGCCTATGCCCCA+CGG + Chr6:87985701-87985720 None:intergenic 55.0%
GAAAAGGCAAGGGGAAGTCG+AGG - Chr6:87986351-87986370 MsG0680034461.01.T01:CDS 55.0%
GAACCGGAGAAGAGTTGGGT+TGG - Chr6:87986553-87986572 MsG0680034461.01.T01:CDS 55.0%
GTTGGGAACCGGAGAAGAGT+TGG - Chr6:87986548-87986567 MsG0680034461.01.T01:CDS 55.0%
TCAGTGAGGTTCCACCTGAG+GGG - Chr6:87982447-87982466 MsG0680034461.01.T01:intron 55.0%
TGCCCGGATAAAAGGGGCAA+TGG - Chr6:87986452-87986471 MsG0680034461.01.T01:CDS 55.0%
TGCCGCCTGGGCTGTTTATT+AGG - Chr6:87983135-87983154 MsG0680034461.01.T01:intron 55.0%
! GGAGTCGATGTGGGCTAAGT+TGG - Chr6:87985966-87985985 MsG0680034461.01.T01:CDS 55.0%
! GGGCTTGTTTGAGGAAGCGT+TGG - Chr6:87982066-87982085 MsG0680034461.01.T01:intron 55.0%
!! GGAAACAAGTGTGGTGGGCA+TGG - Chr6:87983111-87983130 MsG0680034461.01.T01:intron 55.0%
!! TTTTAGGGATGTCGCGAGGG+AGG - Chr6:87985937-87985956 MsG0680034461.01.T01:CDS 55.0%
AACAATTGGCGCCCACCGTG+GGG - Chr6:87985683-87985702 MsG0680034461.01.T01:CDS 60.0%
ACAACAATTGGCGCCCACCG+TGG - Chr6:87985681-87985700 MsG0680034461.01.T01:CDS 60.0%
AGGCTACGCGGAGTCGATGT+GGG - Chr6:87985957-87985976 MsG0680034461.01.T01:CDS 60.0%
ATGAAGGGTGAGCGGCGATG+CGG - Chr6:87985836-87985855 MsG0680034461.01.T01:CDS 60.0%
CAACAATTGGCGCCCACCGT+GGG - Chr6:87985682-87985701 MsG0680034461.01.T01:CDS 60.0%
CGTGGGGCATAGGCGTGAAT+TGG - Chr6:87985699-87985718 MsG0680034461.01.T01:CDS 60.0%
! GGGCACCACTACTTTGGAGG+AGG - Chr6:87986222-87986241 MsG0680034461.01.T01:CDS 60.0%
! TGAGAGTGCGGGTGCACTAG+TGG - Chr6:87986519-87986538 MsG0680034461.01.T01:CDS 60.0%
!! GGAGGGCACCACTACTTTGG+AGG - Chr6:87986219-87986238 MsG0680034461.01.T01:CDS 60.0%
!!! GGCTTGCTGGGCACGTTTTC+AGG - Chr6:87985034-87985053 MsG0680034461.01.T01:intron 60.0%
ATGTCGCGAGGGAGGCTACG+CGG - Chr6:87985945-87985964 MsG0680034461.01.T01:CDS 65.0%
GAGGCTACGCGGAGTCGATG+TGG - Chr6:87985956-87985975 MsG0680034461.01.T01:CDS 65.0%
GCGGTGGCGTCCGATGAAGA+TGG - Chr6:87986493-87986512 MsG0680034461.01.T01:CDS 65.0%
TCACGCCTATGCCCCACGGT+GGG + Chr6:87985697-87985716 None:intergenic 65.0%
TTCACGCCTATGCCCCACGG+TGG + Chr6:87985698-87985717 None:intergenic 65.0%
GGAGGGCTGCTCTCCTCCCT+AGG - Chr6:87985449-87985468 MsG0680034461.01.T01:CDS 70.0%
TGGCGCCCACCGTGGGGCAT+AGG - Chr6:87985689-87985708 MsG0680034461.01.T01:CDS 75.0%
! GGTGGGCATGGGTGCCGCCT+GGG - Chr6:87983123-87983142 MsG0680034461.01.T01:intron 75.0%
! TGGTGGGCATGGGTGCCGCC+TGG - Chr6:87983122-87983141 MsG0680034461.01.T01:intron 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 87980957 87986705 87980957 ID=MsG0680034461.01;Name=MsG0680034461.01
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Chr6 exon 87985435 87986705 87985435 ID=MsG0680034461.01.T01:exon:7528;Parent=MsG0680034461.01.T01
Chr6 exon 87981358 87981509 87981358 ID=MsG0680034461.01.T01:exon:7527;Parent=MsG0680034461.01.T01
Chr6 exon 87980957 87981171 87980957 ID=MsG0680034461.01.T01:exon:7526;Parent=MsG0680034461.01.T01
Chr6 CDS 87985435 87986705 87985435 ID=MsG0680034461.01.T01:cds;Parent=MsG0680034461.01.T01
Chr6 CDS 87981358 87981509 87981358 ID=MsG0680034461.01.T01:cds;Parent=MsG0680034461.01.T01
Chr6 CDS 87980957 87981171 87980957 ID=MsG0680034461.01.T01:cds;Parent=MsG0680034461.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680034461.01.T01

ATGGGTTATCACCCAAATGCCATAACATTCTCTACACTCATCAAGGGTCTCTGTCTCAAAGGTGACCTCCATCAAGCATTGCACTTTCATGATAAGGTGGTAGCGTTGGGTTTTCATTTGGACCAATTTAGCTACGGTACCTTAATCAACGGATTATGTAAAGTTGAACAAACAAGAGCTGCTGTACAATTGCTGAGAAAAGTTGATGGGAAATTAGTTCGGCCTAATGTGGTAATGTACACCACAATTATAGATAGTTTATGCAAAGATAAACTTGTTAATGATGCACTTGATTTATATTCTGAAATGGTTGCTAAGAGAATTTCTCCTGATGTTGTCACTTATAATGCTTTAATTAGTGGTTTTTGCATTGTTGGTAAATTGAATGATGCAATTGGTTTGTTCAATAAAATGACATCGGAAAACATCAACCCCGATGTGTATACCTTTACTATATTGGTTGATGCTTTTTGTAAGGATGGTATGGTGAAAGAAGCTAAAAATGTGTTATCTATGATGATGAAACAAGGCATCAAACCTAGTGTTGTTACTTATAACTCTTTAATGGATGGATATTGCTTAGTTAAAGAAATAAACAAGGCCAAAGATATATTCGATAGTATGGCCTCAAGGGGAGTCATTGCTAATGTTCAGAGCTATACTACCATGATTAATGGATTATGTAAGATTAAAATGGTGGATGAAGCCGTAAATCTCTTTGAAGAAATGCGTTGTAGAAAAATTATTCCTAATGTGGTAACTTACAATTCCCTTATTGATGGTTTGTGTAAATTGGGGAAAATCTCTTCTGCGTTGAAGCTAGTCGATGAGATGCGTGATAGAGGTCAACCACCTAATGTAATAACTTACAGTTCTATATTGGATGCTTTATGCAAAAATCATCATGTTGACGAGGCAATTGCATTATTAACAAATTTGAAAGACCACGGTATTCGACCAAATATGTACACATACACTATTCTTATCAAGGGACTGTGCCAAAGTGGAAGGCTAGAAGATGCGCAACACGTTTTTGAAGATCTTTTGGTCAAAGGCTATAATCTAGATGTCTATACATATACCGTTATGATCCAAGGGTTTTGTGACAAGGGCTTGTTTGAGGAAGCGTTGGCCTTGATGTCAAAAATGGAAGACAATGGCTGCATTCCAGATGCTAAAACTTATGAAATAATTATCCTTTCTCTGTTCGAAAAAGATGAGAATTATATGGCAGAGAAACTTCTCCGTGAAATGATCGCAAGAGGTCTACTGCTTGTTGTTACTTGTTCATTACCAAAGTCTTTTGAGCATTTCAAGGATACCATCCTTTATGGTAAGGAGGGCACCACTACTTTGGAGGAGGTCCAATCGGCTTTGAGAACCAAGGAATTGACCCAGTTCAAGGACTTGAAGGTTGATGATGTTGCGGTGGCGTCCGATGAAGATGGTTATGAGAGTGCGGGTGCACTAGTGGTCACAAGTTGGGAACCGGAGAAGAGTTGGGTTGGACTCGGGATGCTCTTATCACATGTGCCTAGGAAGGAATATTTTGAGACTTTGGCTCTAAAAGAAGGAGGAGTTGTTCGACTCGGAAATAACAAAGCGTGCAAAGTCAAGGCATGGGCACCGTTCGTCTAA
Protein sequence

>MsG0680034461.01.T01

MGYHPNAITFSTLIKGLCLKGDLHQALHFHDKVVALGFHLDQFSYGTLINGLCKVEQTRAAVQLLRKVDGKLVRPNVVMYTTIIDSLCKDKLVNDALDLYSEMVAKRISPDVVTYNALISGFCIVGKLNDAIGLFNKMTSENINPDVYTFTILVDAFCKDGMVKEAKNVLSMMMKQGIKPSVVTYNSLMDGYCLVKEINKAKDIFDSMASRGVIANVQSYTTMINGLCKIKMVDEAVNLFEEMRCRKIIPNVVTYNSLIDGLCKLGKISSALKLVDEMRDRGQPPNVITYSSILDALCKNHHVDEAIALLTNLKDHGIRPNMYTYTILIKGLCQSGRLEDAQHVFEDLLVKGYNLDVYTYTVMIQGFCDKGLFEEALALMSKMEDNGCIPDAKTYEIIILSLFEKDENYMAEKLLREMIARGLLLVVTCSLPKSFEHFKDTILYGKEGTTTLEEVQSALRTKELTQFKDLKVDDVAVASDEDGYESAGALVVTSWEPEKSWVGLGMLLSHVPRKEYFETLALKEGGVVRLGNNKACKVKAWAPFV*