AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880044486.01


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MsG0880044486.01.T01 AT3G13690 35.422 367 178 5 70 435 397 705 1.80e-60 211
MsG0880044486.01.T01 AT1G61500 37.394 353 169 7 80 431 492 793 1.82e-60 212
MsG0880044486.01.T01 AT1G61500 37.394 353 169 7 80 431 469 770 1.85e-60 211
MsG0880044486.01.T01 AT1G61500 37.394 353 169 7 80 431 487 788 1.87e-60 212
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MsG0880044486.01.T01 AT4G23220 34.586 399 199 11 37 424 281 628 4.98e-59 206
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MsG0880044486.01.T01 AT1G61490 37.176 347 166 6 65 409 471 767 1.13e-58 207
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MsG0880044486.01.T01 AT1G61360 35.264 397 198 8 35 427 371 712 2.79e-58 205
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MsG0880044486.01.T01 AT1G61420 33.501 397 199 8 14 409 441 773 1.31e-57 204
MsG0880044486.01.T01 AT4G23280 37.725 334 157 7 72 403 330 614 1.35e-57 202
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MsG0880044486.01.T01 AT4G03230 37.176 347 166 5 59 403 593 889 1.65e-57 205
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MsG0880044486.01.T01 AT4G03230 37.176 347 166 5 59 403 565 861 1.71e-57 205
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MsG0880044486.01.T01 AT1G67520 35.569 343 169 6 67 406 271 564 2.03e-57 200
MsG0880044486.01.T01 AT1G61420 36.826 334 161 6 77 409 487 771 2.15e-57 203
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MsG0880044486.01.T01 AT3G59110 36.919 344 165 5 62 403 168 461 2.89e-57 198
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MsG0880044486.01.T01 AT4G21410 36.826 334 158 8 74 403 222 506 3.58e-57 199
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MsG0880044486.01.T01 AT4G35600 33.702 362 183 7 52 403 51 365 4.27e-57 195
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MsG0880044486.01.T01 AT1G69790 36.152 343 162 6 69 403 58 351 7.40e-57 193
MsG0880044486.01.T01 AT1G61370 34.384 349 169 7 67 409 333 627 7.41e-57 200
MsG0880044486.01.T01 AT3G15890 33.144 353 185 5 56 406 11 314 7.57e-57 192
MsG0880044486.01.T01 AT1G01540 40.824 267 124 3 62 326 132 366 7.82e-57 193
MsG0880044486.01.T01 AT1G69790 35.652 345 161 6 69 403 69 362 8.45e-57 193
MsG0880044486.01.T01 AT2G07180 35.328 351 171 6 68 411 74 375 8.77e-57 195
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MsG0880044486.01.T01 AT4G04540 38.209 335 144 9 80 409 349 625 9.68e-57 199
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MsG0880044486.01.T01 AT1G68690 36.119 335 163 5 71 403 364 649 2.65e-56 199
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MsG0880044486.01.T01 AT1G07570 34.435 363 181 7 51 403 35 350 3.56e-55 190
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MsG0880044486.01.T01 AT1G29750 54.891 184 77 2 72 253 669 848 1.35e-54 196
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MsG0880044486.01.T01 AT1G09440 35.174 344 159 8 72 407 145 432 1.88e-54 189
MsG0880044486.01.T01 AT5G02800 35.965 342 160 7 69 403 58 347 1.99e-54 187
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MsG0880044486.01.T01 AT1G77280 33.913 345 172 7 70 409 390 683 2.82e-50 183
MsG0880044486.01.T01 AT1G24030 40.161 249 111 5 71 313 49 265 2.86e-50 173
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MsG0880044486.01.T01 AT4G17660 33.528 343 174 7 67 403 74 368 3.82e-50 176
MsG0880044486.01.T01 AT1G74360 34.682 346 152 7 72 404 802 1086 4.44e-50 184
MsG0880044486.01.T01 AT5G24010 35.799 338 165 6 64 400 470 756 4.83e-50 183
MsG0880044486.01.T01 AT2G30730 34.125 337 163 7 76 403 39 325 5.90e-50 174
MsG0880044486.01.T01 AT1G72300 33.429 350 178 5 67 411 786 1085 7.83e-50 183
MsG0880044486.01.T01 AT1G55610 36.982 338 155 9 73 403 848 1134 8.01e-50 183
MsG0880044486.01.T01 AT1G55610 36.982 338 155 9 73 403 848 1134 8.01e-50 183
MsG0880044486.01.T01 AT2G30730 34.125 337 163 7 76 403 49 335 8.25e-50 174
MsG0880044486.01.T01 AT4G39400 35.277 343 159 9 69 403 868 1155 9.64e-50 183
MsG0880044486.01.T01 AT4G04570 41.494 241 107 4 79 317 179 387 1.05e-49 175
MsG0880044486.01.T01 AT5G48740 34.511 368 168 10 51 403 568 877 1.11e-49 182
MsG0880044486.01.T01 AT4G00970 39.431 246 113 4 74 315 334 547 1.24e-49 178
MsG0880044486.01.T01 AT4G35030 33.613 357 181 6 59 409 77 383 1.28e-49 176
MsG0880044486.01.T01 AT4G35030 33.613 357 181 6 59 409 77 383 1.28e-49 176
MsG0880044486.01.T01 AT4G35030 33.613 357 181 6 59 409 77 383 1.28e-49 176
MsG0880044486.01.T01 AT4G35030 33.613 357 181 6 59 409 77 383 1.28e-49 176
MsG0880044486.01.T01 AT5G59260 35.693 339 166 7 72 409 343 630 1.47e-49 180
MsG0880044486.01.T01 AT2G28590 38.321 274 135 5 66 336 80 322 1.68e-49 172
MsG0880044486.01.T01 AT2G01950 33.422 377 205 7 33 403 790 1126 1.85e-49 182
MsG0880044486.01.T01 AT2G18890 33.626 342 167 8 70 406 54 340 1.85e-49 174
MsG0880044486.01.T01 AT3G17410 35.714 336 157 7 76 403 61 345 2.06e-49 173
MsG0880044486.01.T01 AT3G17410 35.714 336 157 7 76 403 61 345 2.06e-49 173
MsG0880044486.01.T01 AT3G13380 35.511 352 168 8 69 413 843 1142 2.60e-49 182
MsG0880044486.01.T01 AT1G06700 33.531 337 165 6 76 403 60 346 2.94e-49 172
MsG0880044486.01.T01 AT1G06700 33.531 337 165 6 76 403 60 346 2.94e-49 172
MsG0880044486.01.T01 AT1G06700 33.531 337 165 6 76 403 60 346 2.94e-49 172
MsG0880044486.01.T01 AT5G42440 35.417 336 153 10 76 403 73 352 3.38e-49 172
MsG0880044486.01.T01 AT4G02420 33.728 338 176 5 74 411 340 629 3.57e-49 179
MsG0880044486.01.T01 AT2G47060 39.051 274 126 5 69 334 58 298 3.86e-49 171
MsG0880044486.01.T01 AT1G07560 35.905 337 155 8 70 403 558 836 4.24e-49 181
MsG0880044486.01.T01 AT5G16500 34.911 338 170 7 69 403 59 349 4.65e-49 178
MsG0880044486.01.T01 AT2G16750 32.955 352 180 5 59 410 257 552 5.42e-49 177
MsG0880044486.01.T01 AT2G16750 32.955 352 180 5 59 410 257 552 5.42e-49 177
MsG0880044486.01.T01 AT5G01950 32.653 343 165 7 69 403 526 810 5.53e-49 180
MsG0880044486.01.T01 AT5G49770 33.623 345 178 5 60 403 610 904 5.85e-49 181
MsG0880044486.01.T01 AT2G23950 38.077 260 126 4 54 312 269 494 6.81e-49 176
MsG0880044486.01.T01 AT1G67720 34.385 317 157 5 85 400 607 873 7.29e-49 180
MsG0880044486.01.T01 AT3G62220 36.202 337 154 9 76 403 61 345 7.66e-49 171
MsG0880044486.01.T01 AT3G62220 36.202 337 154 9 76 403 61 345 7.66e-49 171
MsG0880044486.01.T01 AT1G78530 33.851 322 157 8 86 403 75 344 1.06e-48 171
MsG0880044486.01.T01 AT5G01950 32.653 343 165 7 69 403 611 895 1.17e-48 179
MsG0880044486.01.T01 AT5G01950 32.653 343 165 7 69 403 611 895 1.17e-48 179
MsG0880044486.01.T01 AT5G01950 32.653 343 165 7 69 403 611 895 1.17e-48 179
MsG0880044486.01.T01 AT5G01950 32.653 343 165 7 69 403 611 895 1.17e-48 179
MsG0880044486.01.T01 AT1G24030 33.837 331 163 7 80 403 4 285 1.48e-48 169
MsG0880044486.01.T01 AT5G47070 33.426 359 180 8 67 414 69 379 1.51e-48 172
MsG0880044486.01.T01 AT3G59700 32.749 342 180 4 72 412 326 618 1.64e-48 177
MsG0880044486.01.T01 AT4G35030 36.538 312 155 8 59 362 77 353 1.96e-48 171
MsG0880044486.01.T01 AT2G19230 33.923 339 170 6 66 403 553 838 2.28e-48 178
MsG0880044486.01.T01 AT4G35030 37.857 280 136 5 59 332 77 324 2.64e-48 169
MsG0880044486.01.T01 AT2G19230 33.923 339 170 6 66 403 554 839 2.66e-48 179

Find 118 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 278 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AAGGCCAAAATCTGAAATTT+TGG 0.105194 8:-43028582 None:intergenic
CAACCCAAAATTTCAGATTT+TGG 0.115189 8:+43028578 MsG0880044486.01.T01:CDS
AACACCCAATTCAAATTAAT+TGG 0.177230 8:-43030642 None:intergenic
TTAAATTTGAGAAAATATTT+TGG 0.219868 8:+43028758 MsG0880044486.01.T01:CDS
ACTTAACTTAATTAGCTAAT+AGG 0.242181 8:-43030674 None:intergenic
AAGATAGGGCAAGGAGGTTT+TGG 0.252839 8:+43027755 MsG0880044486.01.T01:CDS
TGTCAAAATTTACACTTATA+AGG 0.257448 8:+43027694 MsG0880044486.01.T01:CDS
GGAAGACAATCATAGAATTT+TGG 0.268415 8:+43028037 MsG0880044486.01.T01:CDS
GCTAATTAAGTTAAGTTGAT+TGG 0.271508 8:+43030681 MsG0880044486.01.T01:three_prime_UTR
ACTTCTTTGTTGGCAGGTTC+AGG 0.272007 8:+43030542 MsG0880044486.01.T01:CDS
TCGAACCAATTAATTTGAAT+TGG 0.283740 8:+43030637 MsG0880044486.01.T01:exon
CTTAACTTAATTAGCTAATA+GGG 0.292424 8:-43030673 None:intergenic
TTTAATCTTGCAAACAAGAT+AGG 0.306496 8:+43027740 MsG0880044486.01.T01:CDS
AAATCAGACATCTATAGTTT+TGG 0.311402 8:+43028875 MsG0880044486.01.T01:CDS
CAAAAGAGGCAAGGCTGAAA+TGG 0.324254 8:+43030508 MsG0880044486.01.T01:CDS
CGAGGGCTTGCATTCCTTCA+TGG 0.335981 8:+43028488 MsG0880044486.01.T01:CDS
AACTGAATTTAATGCTACTA+TGG 0.338916 8:-43028430 None:intergenic
TCTTCCTACCATACCCTGTT+TGG 0.354591 8:+43028798 MsG0880044486.01.T01:CDS
ACTGTGCTTAAAATGCTTAT+TGG 0.355275 8:+43030407 MsG0880044486.01.T01:CDS
CGAACCAATTAATTTGAATT+GGG 0.359155 8:+43030638 MsG0880044486.01.T01:exon
AGAACACGCTTTCTCATGTT+TGG 0.362813 8:-43027176 None:intergenic
AGCCTAGCACAAACACTTCT+TGG 0.364657 8:+43028083 MsG0880044486.01.T01:CDS
GAATTGCGAATTGCCACTTC+AGG 0.364968 8:+43027716 MsG0880044486.01.T01:CDS
TTAAATTCAGTTGGCTTGTA+AGG 0.367629 8:+43028441 MsG0880044486.01.T01:CDS
AGAAGATATTGTTCTTTAAC+GGG 0.372316 8:-43028950 None:intergenic
AAGAAGATATTGTTCTTTAA+CGG 0.380416 8:-43028951 None:intergenic
GGTGGGTGGTCAAGGGGATG+GGG 0.381660 8:+43029599 MsG0880044486.01.T01:CDS
TTGGAAATTTCAAGTTTGTC+AGG 0.392120 8:+43028731 MsG0880044486.01.T01:intron
CATATTAGTACAAGGGTTGC+TGG 0.405087 8:+43028632 MsG0880044486.01.T01:CDS
TAACCACTACAAAACCAAAC+AGG 0.406508 8:-43028812 None:intergenic
TGTGTCAAGTAATATATTGC+TGG 0.414862 8:-43028549 None:intergenic
ACACTTAAGGTGGGTGGTCA+AGG 0.418732 8:+43029591 MsG0880044486.01.T01:CDS
GGTATGGTAGGAAGAAAATC+AGG 0.420074 8:-43028790 None:intergenic
AGGTGGGTGGTCAAGGGGAT+GGG 0.425407 8:+43029598 MsG0880044486.01.T01:CDS
CTTCTTTGTTGGCAGGTTCA+GGG 0.426080 8:+43030543 MsG0880044486.01.T01:CDS
AAGGTGGGTGGTCAAGGGGA+TGG 0.432162 8:+43029597 MsG0880044486.01.T01:CDS
GATTCATCTTCATCAGGAAC+CGG 0.435350 8:+43030575 MsG0880044486.01.T01:CDS
TTAAGCACAGTGGACATAGA+AGG 0.441468 8:-43030395 None:intergenic
GTACTAATATGAGTCAGGTT+TGG 0.447428 8:-43028620 None:intergenic
TGTCTCAAATATCCCATTTG+TGG 0.450368 8:-43029571 None:intergenic
TGGGATATTTGAGACACTTA+AGG 0.455035 8:+43029578 MsG0880044486.01.T01:CDS
CCCTTGTACTAATATGAGTC+AGG 0.459949 8:-43028625 None:intergenic
CCGAAATTGTCAAAAGCAAA+TGG 0.461071 8:-43027220 None:intergenic
AATTAATTTGAATTGGGTGT+TGG 0.461472 8:+43030644 MsG0880044486.01.T01:exon
CAAGATGATTCATCTTCATC+AGG 0.461496 8:+43030569 MsG0880044486.01.T01:CDS
ACATGTACTTCTTTGTTGGC+AGG 0.463892 8:+43030536 MsG0880044486.01.T01:CDS
GGTAAGCGTCTGTTTGTGTT+GGG 0.466703 8:-43028929 None:intergenic
ATAGTAGCATTAAATTCAGT+TGG 0.469754 8:+43028432 MsG0880044486.01.T01:CDS
ACAAATTCAAATATCATGCC+TGG 0.481116 8:-43030464 None:intergenic
TTAATCTTGCAAACAAGATA+GGG 0.485651 8:+43027741 MsG0880044486.01.T01:CDS
AAGAACAATATCTTCTTACA+AGG 0.489049 8:+43028957 MsG0880044486.01.T01:CDS
GGGTAAGCGTCTGTTTGTGT+TGG 0.497450 8:-43028930 None:intergenic
ATATCTCTGTGAATTATATG+TGG 0.497493 8:-43028521 None:intergenic
CTACTATTAGAAATTGTTAG+TGG 0.498853 8:+43028902 MsG0880044486.01.T01:CDS
AAGTACATGTACTTCTTTGT+TGG 0.500212 8:+43030532 MsG0880044486.01.T01:CDS
TTTATCAGATGTCCACAAAT+GGG 0.501588 8:+43029559 MsG0880044486.01.T01:intron
GACATAGAAGGCCGGAGCTG+AGG 0.501962 8:-43030383 None:intergenic
CTAATATGAGTCAGGTTTGG+AGG 0.505550 8:-43028617 None:intergenic
CTACAAAACCAAACAGGGTA+TGG 0.510597 8:-43028806 None:intergenic
CACTTAAGGTGGGTGGTCAA+GGG 0.511431 8:+43029592 MsG0880044486.01.T01:CDS
AATTGCGAATTGCCACTTCA+GGG 0.518032 8:+43027717 MsG0880044486.01.T01:CDS
CGCAGGACTCTCCTCAGCTC+CGG 0.522605 8:+43030372 MsG0880044486.01.T01:CDS
AATGTTGTGTTCACGAGGAT+TGG 0.524488 8:+43027316 MsG0880044486.01.T01:CDS
GGTCAATAGCCTCTGATGCT+AGG 0.526116 8:-43027246 None:intergenic
ATGGGATTTGTATGAGGAAG+GGG 0.539117 8:+43030262 MsG0880044486.01.T01:CDS
GCTTGCATTCCTTCATGGAG+AGG 0.540808 8:+43028493 MsG0880044486.01.T01:CDS
GAAAGTCATGGTAGCAAAAG+AGG 0.541120 8:-43030600 None:intergenic
TGATTTCGTATTGCATACTC+AGG 0.545918 8:-43028842 None:intergenic
ACCTGACTCATATTAGTACA+AGG 0.548123 8:+43028624 MsG0880044486.01.T01:CDS
TGCAAGATTAAACCCTGAAG+TGG 0.553435 8:-43027729 None:intergenic
AAAACCAAACAGGGTATGGT+AGG 0.558767 8:-43028802 None:intergenic
GCAGGCATGGGATTTGTATG+AGG 0.561818 8:+43030256 MsG0880044486.01.T01:intron
CATGGTAGCAAAAGAGGTCC+CGG 0.561862 8:-43030594 None:intergenic
GCATGGGATTTGTATGAGGA+AGG 0.565430 8:+43030260 MsG0880044486.01.T01:CDS
AATGACCTGGGGAACAAAAG+AGG 0.566874 8:+43030494 MsG0880044486.01.T01:CDS
ATTTGTAGATGCCAATGACC+TGG 0.576610 8:+43030481 MsG0880044486.01.T01:CDS
GATATTTGAGACACTTAAGG+TGG 0.576914 8:+43029581 MsG0880044486.01.T01:CDS
TTGGAGGGATAAGCTTTGCA+AGG 0.577468 8:-43028601 None:intergenic
TTTCGGTTTCCTAGCATCAG+AGG 0.578221 8:+43027237 MsG0880044486.01.T01:CDS
TACCAAGAAGTGTTTGTGCT+AGG 0.578221 8:-43028085 None:intergenic
ACTTAAGGTGGGTGGTCAAG+GGG 0.578691 8:+43029593 MsG0880044486.01.T01:CDS
GTGGTCGAACCTCTCCATGA+AGG 0.583772 8:-43028502 None:intergenic
GTAAGGCGCAACATTTGCAT+AGG 0.585227 8:+43028458 MsG0880044486.01.T01:CDS
TAATATGAGTCAGGTTTGGA+GGG 0.586008 8:-43028616 None:intergenic
TACTATTAGAAATTGTTAGT+GGG 0.587440 8:+43028903 MsG0880044486.01.T01:CDS
AGAAGGGGACTTCAATGTTG+AGG 0.588262 8:+43030313 MsG0880044486.01.T01:CDS
TAGGAAGAAAATCAGGGGAG+TGG 0.589366 8:-43028783 None:intergenic
TTATCAGCTGAATCAAAACA+AGG 0.590918 8:+43027933 MsG0880044486.01.T01:CDS
ATCAGCTGAATCAAAACAAG+GGG 0.594532 8:+43027935 MsG0880044486.01.T01:CDS
GTACAGGGAAAGTTGAGAGA+TGG 0.595212 8:+43027888 MsG0880044486.01.T01:intron
GAAGTTGAATGGTTGTTGTG+TGG 0.596140 8:+43028016 MsG0880044486.01.T01:CDS
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GAGAATCTAGTGAAGTTGAA+TGG 0.597697 8:+43028005 MsG0880044486.01.T01:CDS
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AAAGTTGAGAGATGGATGCA+TGG 0.609170 8:+43027896 MsG0880044486.01.T01:CDS
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GTATGGTAGGAAGAAAATCA+GGG 0.650201 8:-43028789 None:intergenic
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ATATTTGAGACACTTAAGGT+GGG 0.663976 8:+43029582 MsG0880044486.01.T01:CDS
GATGATAATATGATAAAACC+AGG 0.668421 8:+43030446 MsG0880044486.01.T01:CDS
TTGTAGATGCCAATGACCTG+GGG 0.671263 8:+43030483 MsG0880044486.01.T01:CDS
CTATGAATGTTGTGTTCACG+AGG 0.672188 8:+43027311 MsG0880044486.01.T01:CDS
CCTGACTCATATTAGTACAA+GGG 0.678732 8:+43028625 MsG0880044486.01.T01:CDS
TATGGTAGGAAGAAAATCAG+GGG 0.690558 8:-43028788 None:intergenic
GCAAACAAGATAGGGCAAGG+AGG 0.726125 8:+43027749 MsG0880044486.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
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!!! TTAAATTTGAGAAAATATTT+TGG + Chr8:43028758-43028777 MsG0880044486.01.T01:CDS 10.0%
!! CATATATTTCAAAATGATTA+TGG + Chr8:43027620-43027639 MsG0880044486.01.T01:intron 15.0%
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!!! AAAGTTTTGAATATATATGT+AGG - Chr8:43027600-43027619 None:intergenic 15.0%
!!! AAGTTTTGAATATATATGTA+GGG - Chr8:43027599-43027618 None:intergenic 15.0%
!! AAGAAGATATTGTTCTTTAA+CGG - Chr8:43028954-43028973 None:intergenic 20.0%
!! ACAAACTTATAAAAACATCT+CGG - Chr8:43027443-43027462 None:intergenic 20.0%
!! ACTTAACTTAATTAGCTAAT+AGG - Chr8:43030677-43030696 None:intergenic 20.0%
!! AGTCACTAAACAATAAATAT+TGG - Chr8:43027852-43027871 None:intergenic 20.0%
!! ATAAGTTAGTAGGATTAATT+TGG + Chr8:43028224-43028243 MsG0880044486.01.T01:intron 20.0%
!! ATATCAACGGTTAATAAAAA+GGG + Chr8:43030105-43030124 MsG0880044486.01.T01:intron 20.0%
!! ATTGTTTAAAAATGAATGAG+TGG - Chr8:43030085-43030104 None:intergenic 20.0%
!! CTTAACTTAATTAGCTAATA+GGG - Chr8:43030676-43030695 None:intergenic 20.0%
!! TAAGTTAGTAGGATTAATTT+GGG + Chr8:43028225-43028244 MsG0880044486.01.T01:intron 20.0%
!! TACTATTAGAAATTGTTAGT+GGG + Chr8:43028903-43028922 MsG0880044486.01.T01:CDS 20.0%
!! TATATCAACGGTTAATAAAA+AGG + Chr8:43030104-43030123 MsG0880044486.01.T01:intron 20.0%
!! TGAAAAGAGGTTTATATTTA+GGG + Chr8:43028284-43028303 MsG0880044486.01.T01:intron 20.0%
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!! TTCTTAATCCAGAATAAAAT+TGG - Chr8:43030796-43030815 None:intergenic 20.0%
!! TTGAAAAGAGGTTTATATTT+AGG + Chr8:43028283-43028302 MsG0880044486.01.T01:intron 20.0%
!! TTTAACAAGAAGATAACTTA+AGG + Chr8:43029100-43029119 MsG0880044486.01.T01:intron 20.0%
!!! AACATAGCTAATGTTTTTTT+TGG + Chr8:43029665-43029684 MsG0880044486.01.T01:intron 20.0%
!!! AATCATAGAATTTTGGTATA+TGG + Chr8:43028044-43028063 MsG0880044486.01.T01:CDS 20.0%
!!! AATTCAATTTTAAGAACCAT+TGG + Chr8:43029882-43029901 MsG0880044486.01.T01:intron 20.0%
!!! GGACAAATTTTTATTCAAAT+GGG + Chr8:43028305-43028324 MsG0880044486.01.T01:intron 20.0%
! AACACCCAATTCAAATTAAT+TGG - Chr8:43030645-43030664 None:intergenic 25.0%
! AACTGAATTTAATGCTACTA+TGG - Chr8:43028433-43028452 None:intergenic 25.0%
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! AAGTCGGAAAAAATAAAACT+TGG + Chr8:43029156-43029175 MsG0880044486.01.T01:intron 25.0%
! AGAACAATATCTTCTTACAA+GGG + Chr8:43028958-43028977 MsG0880044486.01.T01:CDS 25.0%
! AGAAGATATTGTTCTTTAAC+GGG - Chr8:43028953-43028972 None:intergenic 25.0%
! ATAGTAGCATTAAATTCAGT+TGG + Chr8:43028432-43028451 MsG0880044486.01.T01:CDS 25.0%
! ATATCTCTGTGAATTATATG+TGG - Chr8:43028524-43028543 None:intergenic 25.0%
! ATCAATATCAATGGAAAGAA+TGG + Chr8:43029638-43029657 MsG0880044486.01.T01:intron 25.0%
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! CAAGAATAAAGAAAGTGAAA+TGG - Chr8:43029067-43029086 None:intergenic 25.0%
! CATTTCACTTTCTTTATTCT+TGG + Chr8:43029065-43029084 MsG0880044486.01.T01:intron 25.0%
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! GATCAAAGAAATATATGAGA+TGG - Chr8:43029448-43029467 None:intergenic 25.0%
! GATGATAATATGATAAAACC+AGG + Chr8:43030446-43030465 MsG0880044486.01.T01:CDS 25.0%
! GTGCAAACAAAATATCATAA+AGG + Chr8:43029130-43029149 MsG0880044486.01.T01:intron 25.0%
! TAGATTTCTTTGTGAATTCT+AGG - Chr8:43027817-43027836 None:intergenic 25.0%
! TCCAGAATAAAATTGGAAAA+AGG - Chr8:43030789-43030808 None:intergenic 25.0%
! TTAATCTTGCAAACAAGATA+GGG + Chr8:43027741-43027760 MsG0880044486.01.T01:CDS 25.0%
! TTCTGTTCAAGTGTAAATAA+TGG + Chr8:43027387-43027406 MsG0880044486.01.T01:intron 25.0%
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!! AAAAAGGTCCTCTAAAAAAA+TGG - Chr8:43030773-43030792 None:intergenic 25.0%
!! AAATCAGACATCTATAGTTT+TGG + Chr8:43028875-43028894 MsG0880044486.01.T01:CDS 25.0%
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!! AATTAATTTGAATTGGGTGT+TGG + Chr8:43030644-43030663 MsG0880044486.01.T01:exon 25.0%
!! ACCTTTTTCCAATTTTATTC+TGG + Chr8:43030785-43030804 MsG0880044486.01.T01:intron 25.0%
!! ACTTTTCTTTCTTTACTTGT+TGG + Chr8:43028669-43028688 MsG0880044486.01.T01:intron 25.0%
!! CGAACCAATTAATTTGAATT+GGG + Chr8:43030638-43030657 MsG0880044486.01.T01:exon 25.0%
!! GGGACAAATTTTTATTCAAA+TGG + Chr8:43028304-43028323 MsG0880044486.01.T01:intron 25.0%
!! GGTTAAACTTTATTTCAGAT+TGG - Chr8:43029182-43029201 None:intergenic 25.0%
!! TAATTTTTACTGTCGTACAA+GGG - Chr8:43030023-43030042 None:intergenic 25.0%
!! TACTAAAAGCTCATTCTTTT+AGG - Chr8:43029282-43029301 None:intergenic 25.0%
!! TCAAATGGGTCTTATATATA+GGG + Chr8:43028319-43028338 MsG0880044486.01.T01:intron 25.0%
!! TCGAACCAATTAATTTGAAT+TGG + Chr8:43030637-43030656 MsG0880044486.01.T01:exon 25.0%
!! TTAATTTTTACTGTCGTACA+AGG - Chr8:43030024-43030043 None:intergenic 25.0%
!! TTCAAATGGGTCTTATATAT+AGG + Chr8:43028318-43028337 MsG0880044486.01.T01:intron 25.0%
!! TTTCTTTAAGTTAAGTGTCA+AGG + Chr8:43029345-43029364 MsG0880044486.01.T01:intron 25.0%
!!! AAGTTTTATTTTTTCCGACT+TGG - Chr8:43029157-43029176 None:intergenic 25.0%
!!! ATAGCTAATGTTTTTTTTGG+TGG + Chr8:43029668-43029687 MsG0880044486.01.T01:intron 25.0%
!!! GCTAATTAAGTTAAGTTGAT+TGG + Chr8:43030681-43030700 MsG0880044486.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
AAACCTATTCCCTAAAACTT+TGG + Chr8:43029373-43029392 MsG0880044486.01.T01:intron 30.0%
AAGTACATGTACTTCTTTGT+TGG + Chr8:43030532-43030551 MsG0880044486.01.T01:CDS 30.0%
AATATCATAAAGGACCAAGT+CGG + Chr8:43029140-43029159 MsG0880044486.01.T01:intron 30.0%
AATATCTTCTTACAAGGGTA+AGG + Chr8:43028963-43028982 MsG0880044486.01.T01:intron 30.0%
ACAAATTCAAATATCATGCC+TGG - Chr8:43030467-43030486 None:intergenic 30.0%
ACTGTGCTTAAAATGCTTAT+TGG + Chr8:43030407-43030426 MsG0880044486.01.T01:CDS 30.0%
AGACATACTTTAGATGAGAA+CGG + Chr8:43029322-43029341 MsG0880044486.01.T01:intron 30.0%
AGGTGATTCATCAATATCAA+TGG + Chr8:43029629-43029648 MsG0880044486.01.T01:intron 30.0%
ATAAATAGCTGTGAAAGTCA+TGG - Chr8:43030615-43030634 None:intergenic 30.0%
CATACAAACAAAGGACAATT+TGG - Chr8:43028174-43028193 None:intergenic 30.0%
CTATGAGAAGGAAAAAAGAA+AGG + Chr8:43029948-43029967 MsG0880044486.01.T01:intron 30.0%
CTTCAAAGTTCATTCTCAAT+TGG + Chr8:43029209-43029228 MsG0880044486.01.T01:intron 30.0%
GACAATGCATAATATATGCA+AGG - Chr8:43029716-43029735 None:intergenic 30.0%
GCATCTAGTAATTTGAAAAG+AGG + Chr8:43028271-43028290 MsG0880044486.01.T01:intron 30.0%
GTATTGCAAGATAAGTTAGT+AGG + Chr8:43028214-43028233 MsG0880044486.01.T01:intron 30.0%
TAGGGAATGTATTAATCACA+TGG - Chr8:43027581-43027600 None:intergenic 30.0%
TATCAGCTGAATCAAAACAA+GGG + Chr8:43027934-43027953 MsG0880044486.01.T01:CDS 30.0%
TATTAGAAATTGTTAGTGGG+AGG + Chr8:43028906-43028925 MsG0880044486.01.T01:CDS 30.0%
TCTATACATTCATGGTTTCA+AGG + Chr8:43029398-43029417 MsG0880044486.01.T01:intron 30.0%
TGATTTCTGTCAAAAACTCT+TGG - Chr8:43027962-43027981 None:intergenic 30.0%
TGTGTCAAGTAATATATTGC+TGG - Chr8:43028552-43028571 None:intergenic 30.0%
TGTTATATTTGAGAGATGAG+AGG + Chr8:43027499-43027518 MsG0880044486.01.T01:intron 30.0%
TTATCAGCTGAATCAAAACA+AGG + Chr8:43027933-43027952 MsG0880044486.01.T01:CDS 30.0%
TTTAACACGCATACAAACAA+AGG - Chr8:43028183-43028202 None:intergenic 30.0%
TTTATCAGATGTCCACAAAT+GGG + Chr8:43029559-43029578 MsG0880044486.01.T01:intron 30.0%
! AATAAGCATTTTAAGCACAG+TGG - Chr8:43030408-43030427 None:intergenic 30.0%
! AGAGTTTTTGACAGAAATCA+AGG + Chr8:43027962-43027981 MsG0880044486.01.T01:CDS 30.0%
! ATATTTGAGACACTTAAGGT+GGG + Chr8:43029582-43029601 MsG0880044486.01.T01:CDS 30.0%
! ATTAATTTGGGGTATGTTCA+AGG + Chr8:43028237-43028256 MsG0880044486.01.T01:intron 30.0%
! CAAATGGTATAAAAGCATGT+TGG - Chr8:43027207-43027226 None:intergenic 30.0%
! CAACCCAAAATTTCAGATTT+TGG + Chr8:43028578-43028597 MsG0880044486.01.T01:CDS 30.0%
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! CCTTTTGAACTCTATGTAAA+AGG - Chr8:43027270-43027289 None:intergenic 30.0%
! GGAAGACAATCATAGAATTT+TGG + Chr8:43028037-43028056 MsG0880044486.01.T01:CDS 30.0%
! GTATAGACTCCAAAGTTTTA+GGG - Chr8:43029385-43029404 None:intergenic 30.0%
! TACCAGTAAATGACAGATTT+TGG + Chr8:43028712-43028731 MsG0880044486.01.T01:intron 30.0%
! TCCTCTAAAAAAATGGCAAA+GGG - Chr8:43030766-43030785 None:intergenic 30.0%
! TGTATAGACTCCAAAGTTTT+AGG - Chr8:43029386-43029405 None:intergenic 30.0%
! TTCCAAAATCTGTCATTTAC+TGG - Chr8:43028717-43028736 None:intergenic 30.0%
! TTTTATCAGATGTCCACAAA+TGG + Chr8:43029558-43029577 MsG0880044486.01.T01:intron 30.0%
!! AAGGCCAAAATCTGAAATTT+TGG - Chr8:43028585-43028604 None:intergenic 30.0%
!! AATGAACTTTGAAGTTCAGA+AGG - Chr8:43029203-43029222 None:intergenic 30.0%
!! AGGCCAAAATCTGAAATTTT+GGG - Chr8:43028584-43028603 None:intergenic 30.0%
!! CAAAATCTGAAATTTTGGGT+TGG - Chr8:43028580-43028599 None:intergenic 30.0%
!! CAATTTTAAGAACCATTGGT+TGG + Chr8:43029886-43029905 MsG0880044486.01.T01:intron 30.0%
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!!! TTTTAGGATATCTACATAGC+AGG - Chr8:43029266-43029285 None:intergenic 30.0%
AACCACTACAAAACCAAACA+GGG - Chr8:43028814-43028833 None:intergenic 35.0%
AATCAACCGTATATCCTAAC+AGG - Chr8:43029497-43029516 None:intergenic 35.0%
ACCTGACTCATATTAGTACA+AGG + Chr8:43028624-43028643 MsG0880044486.01.T01:CDS 35.0%
ATCAGCTGAATCAAAACAAG+GGG + Chr8:43027935-43027954 MsG0880044486.01.T01:CDS 35.0%
ATGAATTTACGGTTCCTGTT+AGG + Chr8:43029480-43029499 MsG0880044486.01.T01:intron 35.0%
ATGTTGTATGCAGCATTCAA+AGG + Chr8:43029839-43029858 MsG0880044486.01.T01:intron 35.0%
ATTAGTCCTCGTGAGTTTAT+AGG + Chr8:43028401-43028420 MsG0880044486.01.T01:intron 35.0%
CAAAGTTCATTCTCAATTGG+AGG + Chr8:43029212-43029231 MsG0880044486.01.T01:intron 35.0%
CAAGATGATTCATCTTCATC+AGG + Chr8:43030569-43030588 MsG0880044486.01.T01:CDS 35.0%
CATAATATATGCAAGGTCTG+GGG - Chr8:43029709-43029728 None:intergenic 35.0%
CCGAAATTGTCAAAAGCAAA+TGG - Chr8:43027223-43027242 None:intergenic 35.0%
CCTGACTCATATTAGTACAA+GGG + Chr8:43028625-43028644 MsG0880044486.01.T01:CDS 35.0%
GAGAATCTAGTGAAGTTGAA+TGG + Chr8:43028005-43028024 MsG0880044486.01.T01:CDS 35.0%
GCATAATATATGCAAGGTCT+GGG - Chr8:43029710-43029729 None:intergenic 35.0%
GGTTAATAAAAAGGGATCAC+TGG + Chr8:43030113-43030132 MsG0880044486.01.T01:intron 35.0%
GTACTAATATGAGTCAGGTT+TGG - Chr8:43028623-43028642 None:intergenic 35.0%
GTATGGTAGGAAGAAAATCA+GGG - Chr8:43028792-43028811 None:intergenic 35.0%
TAACCACTACAAAACCAAAC+AGG - Chr8:43028815-43028834 None:intergenic 35.0%
TAAGAGATGTATCAAGTGAG+AGG + Chr8:43027468-43027487 MsG0880044486.01.T01:intron 35.0%
TAATATGAGTCAGGTTTGGA+GGG - Chr8:43028619-43028638 None:intergenic 35.0%
TAATGTGAGTGAACAACCTT+TGG + Chr8:43027417-43027436 MsG0880044486.01.T01:intron 35.0%
TATAAAAACATCTCGGCCAA+AGG - Chr8:43027436-43027455 None:intergenic 35.0%
TATGGTAGGAAGAAAATCAG+GGG - Chr8:43028791-43028810 None:intergenic 35.0%
TGATTTCGTATTGCATACTC+AGG - Chr8:43028845-43028864 None:intergenic 35.0%
TGCATAATATATGCAAGGTC+TGG - Chr8:43029711-43029730 None:intergenic 35.0%
TGGAGGTTGCAAAACATATT+AGG + Chr8:43029229-43029248 MsG0880044486.01.T01:intron 35.0%
TGTCTCAAATATCCCATTTG+TGG - Chr8:43029574-43029593 None:intergenic 35.0%
TGTTGTATGCAGCATTCAAA+GGG + Chr8:43029840-43029859 MsG0880044486.01.T01:intron 35.0%
TTGAATGCTGCATACAACAT+GGG - Chr8:43029839-43029858 None:intergenic 35.0%
TTTGAATGCTGCATACAACA+TGG - Chr8:43029840-43029859 None:intergenic 35.0%
! ATACGGTTGATTCTTGTACA+GGG + Chr8:43029505-43029524 MsG0880044486.01.T01:intron 35.0%
! ATCACTGGTGTATCTTTTGA+TGG + Chr8:43030128-43030147 MsG0880044486.01.T01:intron 35.0%
! GATATTTGAGACACTTAAGG+TGG + Chr8:43029581-43029600 MsG0880044486.01.T01:CDS 35.0%
! GGTCTTATATATAGGGATAG+AGG + Chr8:43028326-43028345 MsG0880044486.01.T01:intron 35.0%
! GTCCTCTAAAAAAATGGCAA+AGG - Chr8:43030767-43030786 None:intergenic 35.0%
! TATACGGTTGATTCTTGTAC+AGG + Chr8:43029504-43029523 MsG0880044486.01.T01:intron 35.0%
! TCACTGGTGTATCTTTTGAT+GGG + Chr8:43030129-43030148 MsG0880044486.01.T01:intron 35.0%
! TGACATTTTGTCCTATGAGA+AGG + Chr8:43029936-43029955 MsG0880044486.01.T01:intron 35.0%
! TGGGATATTTGAGACACTTA+AGG + Chr8:43029578-43029597 MsG0880044486.01.T01:CDS 35.0%
! TTTCAAGGTTTAGAGCGAAT+TGG + Chr8:43029413-43029432 MsG0880044486.01.T01:intron 35.0%
!! ATGTTTGGTGTCTATCTAGA+TGG + Chr8:43029775-43029794 MsG0880044486.01.T01:intron 35.0%
!! CTTTGGAGTCTATACATTCA+TGG + Chr8:43029390-43029409 MsG0880044486.01.T01:intron 35.0%
!! TGGTGGATGTTTTTCTAGAA+GGG + Chr8:43030297-43030316 MsG0880044486.01.T01:CDS 35.0%
!! TTGGTGGATGTTTTTCTAGA+AGG + Chr8:43030296-43030315 MsG0880044486.01.T01:CDS 35.0%
!!! ACTCCAAAGTTTTAGGGAAT+AGG - Chr8:43029379-43029398 None:intergenic 35.0%
!!! AGGTTTTGGATCAGTCTATA+AGG + Chr8:43027769-43027788 MsG0880044486.01.T01:CDS 35.0%
!!! ATGTTTTTTTTGGTGGTGTC+TGG + Chr8:43029675-43029694 MsG0880044486.01.T01:intron 35.0%
!!! ATTGGTTTTGCCATCCAAAA+AGG + Chr8:43027334-43027353 MsG0880044486.01.T01:CDS 35.0%
!!! TCCCTTTGCCATTTTTTTAG+AGG + Chr8:43030762-43030781 MsG0880044486.01.T01:intron 35.0%
!!! TGTTTTTTTTGGTGGTGTCT+GGG + Chr8:43029676-43029695 MsG0880044486.01.T01:intron 35.0%
AAAACCAAACAGGGTATGGT+AGG - Chr8:43028805-43028824 None:intergenic 40.0%
AAAGTTGAGAGATGGATGCA+TGG + Chr8:43027896-43027915 MsG0880044486.01.T01:CDS 40.0%
AATGTTGTGTTCACGAGGAT+TGG + Chr8:43027316-43027335 MsG0880044486.01.T01:CDS 40.0%
ACACTTGAACAGAAGACAAG+CGG - Chr8:43027381-43027400 None:intergenic 40.0%
ACATGTACTTCTTTGTTGGC+AGG + Chr8:43030536-43030555 MsG0880044486.01.T01:CDS 40.0%
ACGGTTCCTGTTAGGATATA+CGG + Chr8:43029488-43029507 MsG0880044486.01.T01:intron 40.0%
AGAACACGCTTTCTCATGTT+TGG - Chr8:43027179-43027198 None:intergenic 40.0%
AGATGTATCAAGTGAGAGGA+GGG + Chr8:43027472-43027491 MsG0880044486.01.T01:intron 40.0%
AGGGGAGCTAAAAAATTTGG+TGG + Chr8:43030280-43030299 MsG0880044486.01.T01:CDS 40.0%
ATGGGATTTGTATGAGGAAG+GGG + Chr8:43030262-43030281 MsG0880044486.01.T01:CDS 40.0%
ATTCATCTTCATCAGGAACC+GGG + Chr8:43030576-43030595 MsG0880044486.01.T01:CDS 40.0%
ATTTGTAGATGCCAATGACC+TGG + Chr8:43030481-43030500 MsG0880044486.01.T01:CDS 40.0%
CATATTAGTACAAGGGTTGC+TGG + Chr8:43028632-43028651 MsG0880044486.01.T01:CDS 40.0%
CATGGGATTTGTATGAGGAA+GGG + Chr8:43030261-43030280 MsG0880044486.01.T01:CDS 40.0%
CCCTTGTACTAATATGAGTC+AGG - Chr8:43028628-43028647 None:intergenic 40.0%
CTAATATGAGTCAGGTTTGG+AGG - Chr8:43028620-43028639 None:intergenic 40.0%
CTACAAAACCAAACAGGGTA+TGG - Chr8:43028809-43028828 None:intergenic 40.0%
CTATGAATGTTGTGTTCACG+AGG + Chr8:43027311-43027330 MsG0880044486.01.T01:CDS 40.0%
CTCTTTCAAAATTGCTGCAC+TGG + Chr8:43029993-43030012 MsG0880044486.01.T01:intron 40.0%
GAAAGTCATGGTAGCAAAAG+AGG - Chr8:43030603-43030622 None:intergenic 40.0%
GAAGTTGAATGGTTGTTGTG+TGG + Chr8:43028016-43028035 MsG0880044486.01.T01:CDS 40.0%
GACATACTAATGTGTCATGC+AGG + Chr8:43030238-43030257 MsG0880044486.01.T01:intron 40.0%
GATTCATCTTCATCAGGAAC+CGG + Chr8:43030575-43030594 MsG0880044486.01.T01:CDS 40.0%
GCTGAAAACATCTTAACCGT+TGG - Chr8:43027551-43027570 None:intergenic 40.0%
GGAAGGGGAGCTAAAAAATT+TGG + Chr8:43030277-43030296 MsG0880044486.01.T01:CDS 40.0%
GGGACAACATAGCTAATGTT+TGG + Chr8:43029760-43029779 MsG0880044486.01.T01:intron 40.0%
GGTATGGTAGGAAGAAAATC+AGG - Chr8:43028793-43028812 None:intergenic 40.0%
GTTGTATGCAGCATTCAAAG+GGG + Chr8:43029841-43029860 MsG0880044486.01.T01:intron 40.0%
TACCAACTGAGCTAAGCTTA+CGG + Chr8:43029738-43029757 MsG0880044486.01.T01:intron 40.0%
TGCAAGATTAAACCCTGAAG+TGG - Chr8:43027732-43027751 None:intergenic 40.0%
TTAAGCACAGTGGACATAGA+AGG - Chr8:43030398-43030417 None:intergenic 40.0%
TTTGTAGATGCCAATGACCT+GGG + Chr8:43030482-43030501 MsG0880044486.01.T01:CDS 40.0%
! AATTGCGAATTGCCACTTCA+GGG + Chr8:43027717-43027736 MsG0880044486.01.T01:CDS 40.0%
! CACTGGTGTATCTTTTGATG+GGG + Chr8:43030130-43030149 MsG0880044486.01.T01:intron 40.0%
! GCAGTCAAATTTTGCAAGGT+TGG + Chr8:43030338-43030357 MsG0880044486.01.T01:CDS 40.0%
! TAAGCTTAGCTCAGTTGGTA+AGG - Chr8:43029738-43029757 None:intergenic 40.0%
! TACGGTTGATTCTTGTACAG+GGG + Chr8:43029506-43029525 MsG0880044486.01.T01:intron 40.0%
!! GGTGGATGTTTTTCTAGAAG+GGG + Chr8:43030298-43030317 MsG0880044486.01.T01:CDS 40.0%
!! TACCAAGAAGTGTTTGTGCT+AGG - Chr8:43028088-43028107 None:intergenic 40.0%
!!! GTTTTTTTTGGTGGTGTCTG+GGG + Chr8:43029677-43029696 MsG0880044486.01.T01:intron 40.0%
!!! TACCCTGTTTGGTTTTGTAG+TGG + Chr8:43028809-43028828 MsG0880044486.01.T01:CDS 40.0%
AATGACCTGGGGAACAAAAG+AGG + Chr8:43030494-43030513 MsG0880044486.01.T01:CDS 45.0%
ACCAACTGAGCTAAGCTTAC+GGG + Chr8:43029739-43029758 MsG0880044486.01.T01:intron 45.0%
ACTAATGTGTCATGCAGGCA+TGG + Chr8:43030243-43030262 MsG0880044486.01.T01:intron 45.0%
ACTTCTTTGTTGGCAGGTTC+AGG + Chr8:43030542-43030561 MsG0880044486.01.T01:CDS 45.0%
AGAAGGGGACTTCAATGTTG+AGG + Chr8:43030313-43030332 MsG0880044486.01.T01:CDS 45.0%
AGCCTAGCACAAACACTTCT+TGG + Chr8:43028083-43028102 MsG0880044486.01.T01:CDS 45.0%
ATAGCATCCTCCACTGTACA+GGG + Chr8:43027873-43027892 MsG0880044486.01.T01:intron 45.0%
CAAAAGAGGCAAGGCTGAAA+TGG + Chr8:43030508-43030527 MsG0880044486.01.T01:CDS 45.0%
CACTTGAACAGAAGACAAGC+GGG - Chr8:43027380-43027399 None:intergenic 45.0%
CCTCGTGAGTTTATAGGTTC+AGG + Chr8:43028407-43028426 MsG0880044486.01.T01:intron 45.0%
CCTGAACCTATAAACTCACG+AGG - Chr8:43028410-43028429 None:intergenic 45.0%
CTAATGTGTCATGCAGGCAT+GGG + Chr8:43030244-43030263 MsG0880044486.01.T01:intron 45.0%
CTTCTTTGTTGGCAGGTTCA+GGG + Chr8:43030543-43030562 MsG0880044486.01.T01:CDS 45.0%
CTTGCAAACAAGATAGGGCA+AGG + Chr8:43027746-43027765 MsG0880044486.01.T01:CDS 45.0%
GAGATGTATCAAGTGAGAGG+AGG + Chr8:43027471-43027490 MsG0880044486.01.T01:intron 45.0%
GATGTATCAAGTGAGAGGAG+GGG + Chr8:43027473-43027492 MsG0880044486.01.T01:intron 45.0%
GCATGGGATTTGTATGAGGA+AGG + Chr8:43030260-43030279 MsG0880044486.01.T01:CDS 45.0%
GGTAAGCGTCTGTTTGTGTT+GGG - Chr8:43028932-43028951 None:intergenic 45.0%
GTAAGGCGCAACATTTGCAT+AGG + Chr8:43028458-43028477 MsG0880044486.01.T01:CDS 45.0%
GTACAGGGAAAGTTGAGAGA+TGG + Chr8:43027888-43027907 MsG0880044486.01.T01:intron 45.0%
TAGGAAGAAAATCAGGGGAG+TGG - Chr8:43028786-43028805 None:intergenic 45.0%
TCTCAACTTTCCCTGTACAG+TGG - Chr8:43027886-43027905 None:intergenic 45.0%
TCTTCCTACCATACCCTGTT+TGG + Chr8:43028798-43028817 MsG0880044486.01.T01:CDS 45.0%
TTGGAGGGATAAGCTTTGCA+AGG - Chr8:43028604-43028623 None:intergenic 45.0%
TTGTAGATGCCAATGACCTG+GGG + Chr8:43030483-43030502 MsG0880044486.01.T01:CDS 45.0%
TTTCGGTTTCCTAGCATCAG+AGG + Chr8:43027237-43027256 MsG0880044486.01.T01:CDS 45.0%
! AAGATAGGGCAAGGAGGTTT+TGG + Chr8:43027755-43027774 MsG0880044486.01.T01:CDS 45.0%
! GAATTGCGAATTGCCACTTC+AGG + Chr8:43027716-43027735 MsG0880044486.01.T01:CDS 45.0%
! GGAGGCAGTCAAATTTTGCA+AGG + Chr8:43030334-43030353 MsG0880044486.01.T01:CDS 45.0%
! TCTTTTGTTCCCCAGGTCAT+TGG - Chr8:43030495-43030514 None:intergenic 45.0%
! TTTGAGACACTTAAGGTGGG+TGG + Chr8:43029585-43029604 MsG0880044486.01.T01:CDS 45.0%
!! ATTTGCATAGGTGTTGCTCG+AGG + Chr8:43028470-43028489 MsG0880044486.01.T01:CDS 45.0%
!! TTTGCATAGGTGTTGCTCGA+GGG + Chr8:43028471-43028490 MsG0880044486.01.T01:CDS 45.0%
ACACTTAAGGTGGGTGGTCA+AGG + Chr8:43029591-43029610 MsG0880044486.01.T01:CDS 50.0%
ACGCAGCGGTAGGATGTTAA+AGG + Chr8:43030164-43030183 MsG0880044486.01.T01:intron 50.0%
ACTTAAGGTGGGTGGTCAAG+GGG + Chr8:43029593-43029612 MsG0880044486.01.T01:CDS 50.0%
AGGGGACTTCAATGTTGAGG+AGG + Chr8:43030316-43030335 MsG0880044486.01.T01:CDS 50.0%
ATACCTTAGAACGCAGCGGT+AGG + Chr8:43030154-43030173 MsG0880044486.01.T01:intron 50.0%
CAACTTTCCCTGTACAGTGG+AGG - Chr8:43027883-43027902 None:intergenic 50.0%
CACTTAAGGTGGGTGGTCAA+GGG + Chr8:43029592-43029611 MsG0880044486.01.T01:CDS 50.0%
CATGGTAGCAAAAGAGGTCC+CGG - Chr8:43030597-43030616 None:intergenic 50.0%
CCAACTGAGCTAAGCTTACG+GGG + Chr8:43029740-43029759 MsG0880044486.01.T01:intron 50.0%
GATAGCATCCTCCACTGTAC+AGG + Chr8:43027872-43027891 MsG0880044486.01.T01:intron 50.0%
GCAAACAAGATAGGGCAAGG+AGG + Chr8:43027749-43027768 MsG0880044486.01.T01:CDS 50.0%
GCACAAGTTGTGCCAACCAA+TGG - Chr8:43029901-43029920 None:intergenic 50.0%
GCAGGCATGGGATTTGTATG+AGG + Chr8:43030256-43030275 MsG0880044486.01.T01:intron 50.0%
GCTTGCATTCCTTCATGGAG+AGG + Chr8:43028493-43028512 MsG0880044486.01.T01:CDS 50.0%
GGGTAAGCGTCTGTTTGTGT+TGG - Chr8:43028933-43028952 None:intergenic 50.0%
GGGTATACCTTAGAACGCAG+CGG + Chr8:43030150-43030169 MsG0880044486.01.T01:intron 50.0%
GGTCAATAGCCTCTGATGCT+AGG - Chr8:43027249-43027268 None:intergenic 50.0%
TGGCACAACTTGTGCTTGAC+TGG + Chr8:43029906-43029925 MsG0880044486.01.T01:intron 50.0%
! CGCTGCTAGACCTTTTTGGA+TGG - Chr8:43027347-43027366 None:intergenic 50.0%
CATCCTACCGCTGCGTTCTA+AGG - Chr8:43030160-43030179 None:intergenic 55.0%
CCCCGTAAGCTTAGCTCAGT+TGG - Chr8:43029743-43029762 None:intergenic 55.0%
CCTGGGGAACAAAAGAGGCA+AGG + Chr8:43030499-43030518 MsG0880044486.01.T01:CDS 55.0%
CGAGGGCTTGCATTCCTTCA+TGG + Chr8:43028488-43028507 MsG0880044486.01.T01:CDS 55.0%
GCACAGTGGACATAGAAGGC+CGG - Chr8:43030394-43030413 None:intergenic 55.0%
GTGGTCGAACCTCTCCATGA+AGG - Chr8:43028505-43028524 None:intergenic 55.0%
! CCTTGCCTCTTTTGTTCCCC+AGG - Chr8:43030502-43030521 None:intergenic 55.0%
! GCTGCGCTGCTAGACCTTTT+TGG - Chr8:43027351-43027370 None:intergenic 55.0%
!! GGTTGGTCTTCTTTGCACGC+AGG + Chr8:43030355-43030374 MsG0880044486.01.T01:CDS 55.0%
AAGGTGGGTGGTCAAGGGGA+TGG + Chr8:43029597-43029616 MsG0880044486.01.T01:CDS 60.0%
AGGTGGGTGGTCAAGGGGAT+GGG + Chr8:43029598-43029617 MsG0880044486.01.T01:CDS 60.0%
GACATAGAAGGCCGGAGCTG+AGG - Chr8:43030386-43030405 None:intergenic 60.0%
CAAGGGGATGGGGTAGGCAC+AGG + Chr8:43029609-43029628 MsG0880044486.01.T01:intron 65.0%
CGCAGGACTCTCCTCAGCTC+CGG + Chr8:43030372-43030391 MsG0880044486.01.T01:CDS 65.0%
GGTGGGTGGTCAAGGGGATG+GGG + Chr8:43029599-43029618 MsG0880044486.01.T01:CDS 65.0%
GGTGGTCAAGGGGATGGGGT+AGG + Chr8:43029603-43029622 MsG0880044486.01.T01:intron 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 43027172 43030853 43027172 ID=MsG0880044486.01;Name=MsG0880044486.01
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Gene Sequence

>MsG0880044486.01.T01

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Protein sequence

>MsG0880044486.01.T01

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