AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar zhongmu-4 / Msa0620790


Find 309 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 632 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE

Chromosome Type Strat End Strand Name
chr4_2 gene 72560677 72571392 72560677 ID=Msa0620790;Name=Msa0620790
chr4_2 mRNA 72560677 72571392 72560677 ID=Msa0620790-mRNA-1;Parent=Msa0620790;Name=Msa0620790-mRNA-1;_AED=0.31;_eAED=0.31;_QI=126|0.88|0.80|0.96|1|1|26|0|1495
chr4_2 exon 72560677 72560817 72560677 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21673;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72561923 72561990 72561923 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21672;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72562084 72562309 72562084 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21671;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72562886 72563140 72562886 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21670;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72563499 72563670 72563499 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21669;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72563752 72563979 72563752 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21668;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72564093 72564226 72564093 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21667;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72564308 72564391 72564308 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21666;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72564489 72564779 72564489 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21665;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72565074 72565406 72565074 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21664;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72565568 72565728 72565568 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21663;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72565825 72565929 72565825 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21662;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72566015 72566171 72566015 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21661;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72566274 72566377 72566274 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21660;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72566707 72566827 72566707 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21659;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72567107 72567430 72567107 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21658;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72567507 72567788 72567507 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21657;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72567888 72568189 72567888 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21656;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72568478 72568568 72568478 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21655;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72568670 72568723 72568670 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21654;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72568819 72568895 72568819 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21653;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72569030 72569189 72569030 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21652;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72569830 72569914 72569830 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21651;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72570014 72570102 72570014 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21650;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72570184 72570304 72570184 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21649;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 exon 72570944 72571392 72570944 ID=Msa0620790-mRNA-1:exon:21648;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 five_prime_UTR 72571267 72571392 72571267 ID=Msa0620790-mRNA-1:five_prime_utr;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72570944 72571266 72570944 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72570184 72570304 72570184 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72570014 72570102 72570014 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72569830 72569914 72569830 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72569030 72569189 72569030 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72568819 72568895 72568819 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72568670 72568723 72568670 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72568478 72568568 72568478 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72567888 72568189 72567888 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72567507 72567788 72567507 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72567107 72567430 72567107 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72566707 72566827 72566707 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72566274 72566377 72566274 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72566015 72566171 72566015 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72565825 72565929 72565825 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72565568 72565728 72565568 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72565074 72565406 72565074 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72564489 72564779 72564489 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72564308 72564391 72564308 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72564093 72564226 72564093 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72563752 72563979 72563752 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72563499 72563670 72563499 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72562886 72563140 72562886 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72562084 72562309 72562084 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72561923 72561990 72561923 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
chr4_2 CDS 72560677 72560817 72560677 ID=Msa0620790-mRNA-1:cds;Parent=Msa0620790-mRNA-1
Gene Sequence

>Msa0620790

ATGGAGAGCAATGAAGTATCAAGAGTTGATAGCTTAAGAAGAGCAAGTAGTTCTAACATATGGAGGAACAATAGCATGAATGTTTTCTCGACTTCTGAACGTGAAGACGATGAAGAAGCTCTTAAATGGGCTGCTATTGAGAGACTTCCTACATATCTAAGGATTAGAAGAAGTATAATCAATAATGAAGAAGGTGAAGGGAGAGAGATTGATATAAAAAAGCTTGGATTAACTGAGAGAAAGGTTTTACTAGAGAGACTTGTGAAAATTGCTGAAGAAGATAACGAAAAGTTCTTGTTGAAACTTAAGGAAAGAATTGAAAGAGTTGGACTTGATATTCCAACAGTTGAAGTGAGATTTGAGCATATAAATGTTGAAGCACAAGTTTATGTTGGAGGCAGAGCTTTACCTTCATTGCTCAACTTCTTTGTTAATGTGTTAGAGGGATTCTTAAATTATCTTCATATCATTCCAAGTCCAAAGAAACCATTACATATCCTTCAAAATGTTAGTGGAATCATAAAGCCTCAAAGAATGACATTACTTTTGGGGCCACCAGGCTCTGGAAAGACCACTTTGCTTTTGGCTTTGGCAGGAAAACTTGCTAAAGATTTAAAGAAATCTGGGAGAGTAACATACAATGGGAAAGGACTAGAAGAGTTTGTTCCACAAAGAACATCAGCTTATATAAGTCAATATGATAATCACATTGGAGAAATGACAGTGAGAGAGACACTAGCTTTCTCTGCAAGATGTCAAGGGGTTGGACACAATTACGATATGTTGACTGAACTACTAAGAAGAGAGAAGGAAGCAAAGATTAAACCAGATCCTGATGTTGATGCCTATATGAAGGCAGCAGCACTAGAAGGACAGGAGGCAAGTGTGGTAACCGACTATATTCTCAAGATTTTGGGACTGGAAATATGTGCTGACATTATGGTAGGAGATGGAATGATAAGAGGTATTTCAGGAGGGCAGAAAAAGAGAGTCACAACAGGGGAGATGCTGGTTGGACCTATAAGGGTATTGTTCATGGACGAGATATCGACTGGTTTGGACAGTTCAACAACTTTCCAAATAATCAGCTCAATCAGACAATCAATCCATATTCTGAATGGAACTGCACTTGTGTCTTTGCTACAACCAGCACCAGAAACTTATGAATTATTTGATGATATCATATTGCTCACAGATGGGCAAATTGTGTATCAAGGTCCAAGAGAAAATGTACTCGAGTTTTTTGAATCAATGGGATTCAAGTGTCCTGAAAGAAAAGGAGTTGCCGATTTCTTACAAGAAGTGACATCAAGGAAAGATCAATGGCAATATTGGGCAAATAAAGATGAACCTTATAGTTTTGTTACTGTTAAGGATTTTGCAGAAGCCTTTCAGATATTTCACATAGGTCAAAAACTTGGAGATGAGTTAGCCAATCCTTTTGACAAGTCAAAATGCCATCCTAGTGTCTTGACCACAAAGAAATACGGTGTTAACAAGAAGGAGCTTCTGAAGGCTTGTGCTAGCAGAGAATTTTTGCTTATGAAGCGAAATTCGTTTGTCCATATTTTCAAAGTCACTCAACTTATTTATTTAGCTATCATGACAACAACATTGTTTCTAAGAACTAAGATGCATAAGGATACTGTAGAGGATGGAGGAGCTTACATGGGAGCACTATTTTTCACAGTCACGGTAGCAATGTTCAATGGAATATCAGAACTAAATATGACACTTATGAAACTTCCTGTCTTTCACAAGCAAAGAGATCTTCTCTTCTATCCTTCATGGGCTTATTCTCTTCCACCATGGATTCTAAAAATACCAATAACTATCATAGAAGCTGTCATATGGGAAGCCATCACTTACTATGCTATTGGCTATGATACAAGTTTTCTAAGGCAAGAAATGGCTTCTTCACTATTTCGGTTGATGGCAGCATTAGGAAGGGATGTTATAGTTGCAAGCACTGTTGGGTCATTTGCATTACTAGTAGTTTTGGTTTTGGGAGGATTTGTGATTTCAAGAGAGGACGTGCACAAATGGTTTCTGTGGGGTTATTGGTCGTCACCGTTGATGTATGGACAGAATGCTATAGCTGTGAATGAATTTCTTGGACATAGTTGGAGAAAGGTTACCCATAATTCCAATGAAACATTGGGAGTTTTGGTAATGAAAACTCGCGGTTTTTTCCCACAAGCTTATTGGTATTGGATTGGTGTAGGAGCATTGATTGGTTATGTTTTTCTATTCAACTTTTTGTTCACATTGGCCTTACAATATCTCAACCCATTCAGAAAGGATCAAGCAGGTCTATCTGAGGAGGAACTGCTTGAGAGAGATGCTTCAACAGCTGTAGAATTTACTCAGTTACCGACTCGAAAGAAAATCTCTGAAACAAAGATAGCAGAAGAAGGACTTATGCCATCGAGATCGTTTTCTGCAAGAGTTGGTAAGGATAAAGCTAGCATAAGTGGAAGGAGGGGAATGGTTCTTCCTTTTCAACCTCTATCCCTCACTTTTGATGAAATCAGATACGCTGTAGACATGCCTCAGGAAATGAAAAACCAAGGAGTTTCCGAGGATCGTCTCGAACTTTTGAAGGGTATCAATGGCGCCTTTAGGCCTGGAGTACTGACTGCTTTGATGGGTGTAAGTGGTGCCGGAAAGACTACTCTAATGGATGTTTTAGCTGGAAGGAAAACTGGCGGATATATTGATGGAAACATCACAATTTCCGGCTATCCAAAGAATCAAAAAACATTTGCTCGCATATCGGGATATTGCGAGCAATTTGATATCCATTCACCTAATGTTACAGTTTATGAATCTTTGCTATATTCGGCATGGCTTCGTTTACCACCTGAAGTTGATCAAGCTACTAGAAAGATGTTTATTGAGGAAGTTATGGAGCTTGTAGAGCTTAATTCATTAAGAGAAGCACTTGTTGGATTGCCAGGCGAGACTGGACTTTCAACCGAACAACGCAAGAGACTAACGATTGCAGTTGAACTTGTAGCAAACCCATCGATAATATTCATGGATGAGCCAACCTCTGGCCTTGATGCTAGAGCAGCTGCAATTGTAATGAGAACAGTGAGGAACACCGTTGACACAGGACGAACTGTGGTTTGCACGATCCATCAGCCAAGTATTGACATATTTGATGCCTTTGATGAGCTTCTACTTATGAAATTGGGAGGTGAGCAAATATATTCTGGTCCATTAGGCCGCCATTGCGCTCATTTGATTCATTACTTTGAGGCTATTGAAGGAGTTCCTAAGATCAAAGATGGTTATAATCCTGCAACATGGATGTTGGAAGTTACATCAGCAGGATCAGAAGCAAATCTTAAGGTCAACTTCACTAATGTATACAGAAACTCGGAACTATACCGGAGAAACAAACAATTGATCCAGGAATTAAGTATACCTCCTCAAGATTCAAAGGAGTTATACTTTGATTCTCAATATACACAAACTATGCTGTCACAATGTAAAGCTTGCTTATGGAAACAGCATTTATCATATTGGCGAAACACGTCATATACAGCAGTTAGACTGTTATTTACAACACTAATAGCTTTCTTGTTTGGAATCATATTTTGGAACATCGGCTTGAAAAGGGGAAAGGAGCAAGATCTTTTCAATGCAATGGGATCAATGTATGCTTCTGTTATATTTATTGGAGTACAAAATGGTGCCTCAGTGCAGCCTGTAATAGCAGTCGAGAGAACAGTCTTTTACCGAGAAAGAGCTGCTGGAATGTATTCTGCTTTGCCTTATGCAGCAGCACAGGTTATTATAGAGCTACCCCACATCTTGGTTCAGACCCTGGTATTTGGGATCATTGTATATGCCATGATGGGATTTGAGTGGACAGCATCAAAATTCTTTTGGTATATTTTCTTCAATTACTTCACTTTCTTGTACTACACCTTCTATGGTATGATGACCATGGCCATCACTCCCAACCCACATGTTGCTGCCATACTGTCCTCCTCATTCTATGCAATATGGAATCTTTTCTCAGGCTTTATCATTCCCTTATCTAAAATACCAATATGGTGGAAGTGGTTCTATTGGGTTTGTCCTGTTGCATGGACATTGTATGGATTGGTGACTTCTCAATATGGAGACAACATGCACAAACTTGAGAATGGTCAAAGGGTTGAAGAATTTGTGAGGAATTACTTTGGTTTTAAACATGACTTCCTAGGAGTGGTTGCAATTGTTGTGGCTAGTTTTTCAGTGTTCTTTGCACTTATTTTCACCTTTGGTTGTAATGTCCTTGGTATCAAAGTTAGCAAGTCCTTCCTATTCCTAGCATATGAGGAAGTGCAAAGTGAATCTGGTTTTGAAGAAGATGCCACACAAAAAATTGTAAGAAGCCCTTTCATCTCATACGGCTCCTCCTTCATGTGTGTAATGATAAACATCCACCGAATCAAAGCCAAAAAGGTTGCACTATCCTCATTATCAACTTAG

Protein sequence

>Msa0620790

MESNEVSRVDSLRRASSSNIWRNNSMNVFSTSEREDDEEALKWAAIERLPTYLRIRRSIINNEEGEGREIDIKKLGLTERKVLLERLVKIAEEDNEKFLLKLKERIERVGLDIPTVEVRFEHINVEAQVYVGGRALPSLLNFFVNVLEGFLNYLHIIPSPKKPLHILQNVSGIIKPQRMTLLLGPPGSGKTTLLLALAGKLAKDLKKSGRVTYNGKGLEEFVPQRTSAYISQYDNHIGEMTVRETLAFSARCQGVGHNYDMLTELLRREKEAKIKPDPDVDAYMKAAALEGQEASVVTDYILKILGLEICADIMVGDGMIRGISGGQKKRVTTGEMLVGPIRVLFMDEISTGLDSSTTFQIISSIRQSIHILNGTALVSLLQPAPETYELFDDIILLTDGQIVYQGPRENVLEFFESMGFKCPERKGVADFLQEVTSRKDQWQYWANKDEPYSFVTVKDFAEAFQIFHIGQKLGDELANPFDKSKCHPSVLTTKKYGVNKKELLKACASREFLLMKRNSFVHIFKVTQLIYLAIMTTTLFLRTKMHKDTVEDGGAYMGALFFTVTVAMFNGISELNMTLMKLPVFHKQRDLLFYPSWAYSLPPWILKIPITIIEAVIWEAITYYAIGYDTSFLRQEMASSLFRLMAALGRDVIVASTVGSFALLVVLVLGGFVISREDVHKWFLWGYWSSPLMYGQNAIAVNEFLGHSWRKVTHNSNETLGVLVMKTRGFFPQAYWYWIGVGALIGYVFLFNFLFTLALQYLNPFRKDQAGLSEEELLERDASTAVEFTQLPTRKKISETKIAEEGLMPSRSFSARVGKDKASISGRRGMVLPFQPLSLTFDEIRYAVDMPQEMKNQGVSEDRLELLKGINGAFRPGVLTALMGVSGAGKTTLMDVLAGRKTGGYIDGNITISGYPKNQKTFARISGYCEQFDIHSPNVTVYESLLYSAWLRLPPEVDQATRKMFIEEVMELVELNSLREALVGLPGETGLSTEQRKRLTIAVELVANPSIIFMDEPTSGLDARAAAIVMRTVRNTVDTGRTVVCTIHQPSIDIFDAFDELLLMKLGGEQIYSGPLGRHCAHLIHYFEAIEGVPKIKDGYNPATWMLEVTSAGSEANLKVNFTNVYRNSELYRRNKQLIQELSIPPQDSKELYFDSQYTQTMLSQCKACLWKQHLSYWRNTSYTAVRLLFTTLIAFLFGIIFWNIGLKRGKEQDLFNAMGSMYASVIFIGVQNGASVQPVIAVERTVFYRERAAGMYSALPYAAAQVIIELPHILVQTLVFGIIVYAMMGFEWTASKFFWYIFFNYFTFLYYTFYGMMTMAITPNPHVAAILSSSFYAIWNLFSGFIIPLSKIPIWWKWFYWVCPVAWTLYGLVTSQYGDNMHKLENGQRVEEFVRNYFGFKHDFLGVVAIVVASFSVFFALIFTFGCNVLGIKVSKSFLFLAYEEVQSESGFEEDATQKIVRSPFISYGSSFMCVMINIHRIKAKKVALSSLST*