AlfalfaGEDB | MsG0380017200.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380017200.01

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Trembl:

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MsG0380017200.01.T03	AT4G30020	34.290	627	347	23	3	579	198	809	8.11e-83	276
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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence	on_target_score	Position	Region
CACATTCCCTTTCCAGCTTT+TGG	0.086592	3:+93235137	None:intergenic
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CCTGCTACACCGTTTGATTA+TGG	0.232758	3:-93233834	MsG0380017200.01.T05:CDS
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GCATTTGGCGGTACCCAGTT+AGG	0.320273	3:-93234197	MsG0380017200.01.T05:CDS
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GAGCTGAAAGCTGCCACCAC+TGG	0.355342	3:+93234161	None:intergenic
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GGGTTAGCTGCTCTTCTTAA+GGG	0.363224	3:-93233963	MsG0380017200.01.T05:CDS
GTCTATTGGTGGAGGTTTAA+CGG	0.371521	3:-93234771	MsG0380017200.01.T05:CDS
CCAACTGCTAAAATTGCATT+TGG	0.376803	3:-93234212	MsG0380017200.01.T05:CDS
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GTGCCATTTGACACAGCTTC+AGG	0.384639	3:-93233618	MsG0380017200.01.T05:intron
CATTTGGCGGTACCCAGTTA+GGG	0.385535	3:-93234196	MsG0380017200.01.T05:CDS
ATAGCTGAAGGACTCCATTC+AGG	0.386949	3:+93233933	None:intergenic
TCCTAGAGCTGAAAAGAGTT+TGG	0.393572	3:-93234387	MsG0380017200.01.T05:CDS
TGGGTTAGCTGCTCTTCTTA+AGG	0.394301	3:-93233964	MsG0380017200.01.T05:CDS
TGAAGCTCGTATCTAACTTC+AGG	0.394820	3:+93235312	None:intergenic
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TCCACCGTTTCCTGCTGAAC+TGG	0.403739	3:+93234685	None:intergenic
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CTAGCTCTTCTCCATAATCT+TGG	0.409204	3:+93234321	None:intergenic
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TTCCCTGCCTATATTACCCT+TGG	0.411237	3:-93234590	MsG0380017200.01.T05:CDS
GCAGCAGGTTCTGCAGTTGC+AGG	0.411728	3:-93234953	MsG0380017200.01.T02:CDS
CCAGTAGCTGCTCTTGATCC+TGG	0.412169	3:-93233795	MsG0380017200.01.T05:CDS
TGGACCTAGTAAAGCAAGTT+TGG	0.413710	3:-93234666	MsG0380017200.01.T05:CDS
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ACTCGAACACCAGAGTTTCT+CGG	0.417904	3:-93235285	MsG0380017200.01.T02:CDS
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AGACTTACTCACAAAGCAAC+CGG	0.430014	3:-93235352	MsG0380017200.01.T02:CDS
GAAATCGCGGTCTATAGTTC+CGG	0.436744	3:+93234610	None:intergenic
ACATCTCATTCAATGCCTTC+TGG	0.438916	3:-93233414	MsG0380017200.01.T05:CDS
GAGTAATTGACACGGGTGTA+TGG	0.443093	3:-93235203	MsG0380017200.01.T02:CDS
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AGCTGAAAGCTGCCACCACT+GGG	0.447684	3:+93234162	None:intergenic
CTAGTCCCATTGCTTTCAGC+TGG	0.447957	3:-93233341	MsG0380017200.01.T05:CDS
CCTATATTACCCTTGGAAAT+GGG	0.452105	3:-93234583	MsG0380017200.01.T05:CDS
CATTTGACACAGCTTCAGGC+AGG	0.455325	3:-93233614	MsG0380017200.01.T05:intron
TTAGCCAAACTTGCTTTACT+AGG	0.455847	3:+93234662	None:intergenic
CAAGCATTGTCCAGTACAAA+AGG	0.460516	3:-93233575	MsG0380017200.01.T05:CDS
ACTCCTGGAGCTATAAAGTC+TGG	0.462419	3:+93234101	None:intergenic
CCATAATCAAACGGTGTAGC+AGG	0.465695	3:+93233834	None:intergenic
TCAAACGTGCAGGAGGAATT+GGG	0.467708	3:-93234361	MsG0380017200.01.T05:CDS
AACACCAGAGTTTCTCGGAT+TGG	0.470196	3:-93235280	MsG0380017200.01.T02:CDS
TACAAAGACACTGTTGCAAT+GGG	0.473717	3:-93234743	MsG0380017200.01.T05:CDS
TTCTCCAATCCGAGAAACTC+TGG	0.474431	3:+93235276	None:intergenic
GAGCAGCTAACCCACTTACA+TGG	0.478406	3:+93233973	None:intergenic
GTGAGCTTCAACATCATCTC+TGG	0.483488	3:-93234014	MsG0380017200.01.T05:CDS
AGCTTCGATGACACTGGACT+TGG	0.483930	3:-93235168	MsG0380017200.01.T02:CDS
ACAGATTATCACTGGAATCC+TGG	0.484037	3:+93234477	None:intergenic
CTCTCTATGTCTATTGGTGG+AGG	0.485551	3:-93234779	MsG0380017200.01.T05:CDS
TTTCCAAGGGTAATATAGGC+AGG	0.489312	3:+93234587	None:intergenic
CCAGGAGTCAATATTCTAGC+TGG	0.491600	3:-93234086	MsG0380017200.01.T05:CDS
GCGATAAAAGGATTAAGTAC+AGG	0.491673	3:-93233671	MsG0380017200.01.T05:CDS
CCAGGATCAAGAGCAGCTAC+TGG	0.492323	3:+93233795	None:intergenic
GTCCTCTCTATGTCTATTGG+TGG	0.497053	3:-93234782	MsG0380017200.01.T05:CDS
TTAAGGGAGCCCATCCTGAA+TGG	0.497147	3:-93233947	MsG0380017200.01.T05:CDS
TGTATCTCTTCCCATTTCCA+AGG	0.499750	3:+93234573	None:intergenic
CAAGTCCAGCTGAAAGCAAT+GGG	0.502405	3:+93233336	None:intergenic
CCAGCTAGAATATTGACTCC+TGG	0.502572	3:+93234086	None:intergenic
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TACAAAGTGTGTTGGCTTGG+TGG	0.507949	3:-93234863	MsG0380017200.01.T05:CDS
GCTCATCTGGAATGGTCGGA+TGG	0.509951	3:-93233378	MsG0380017200.01.T05:CDS
CTGCCTGAAGCTGTGTCAAA+TGG	0.512310	3:+93233615	None:intergenic
ACTGAAACTTTATATGTCGA+TGG	0.513316	3:+93233531	None:intergenic
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CTACAAAGACACTGTTGCAA+TGG	0.518092	3:-93234744	MsG0380017200.01.T05:CDS
CCAGTACCCAAAAGCTGGAA+AGG	0.520233	3:-93235144	MsG0380017200.01.T02:CDS
CTGAAACTTTATATGTCGAT+GGG	0.522219	3:+93233532	None:intergenic
AGTTTGGTGGTCAAACGTGC+AGG	0.522689	3:-93234371	MsG0380017200.01.T05:CDS
GCTGGATGGAGTGGGAAAGT+TGG	0.523441	3:-93234068	MsG0380017200.01.T05:CDS
TTTGACACAGCTTCAGGCAG+GGG	0.526043	3:-93233612	MsG0380017200.01.T05:intron
CCATAAAAGATGTCGCTACT+GGG	0.526230	3:-93233860	MsG0380017200.01.T05:CDS
GGGATAACCGAGAGAATCCC+CGG	0.526461	3:+93235333	None:intergenic
ACAAGAAACTTGTTGGTGCA+AGG	0.528369	3:-93235081	MsG0380017200.01.T02:CDS
CCATGCCCGTCATCATCCCT+TGG	0.528418	3:+93234995	None:intergenic
AAACAAAGTGAGGTGATTGT+TGG	0.531482	3:-93235225	MsG0380017200.01.T02:CDS
TGATTATGGTTCCGGGCATG+TGG	0.532684	3:-93233820	MsG0380017200.01.T05:CDS
TGGATAACCACTGTCGGTGC+CGG	0.532742	3:-93234629	MsG0380017200.01.T05:CDS
TGTGCTGCACAGATTATCAC+TGG	0.533799	3:+93234469	None:intergenic
GCTTACAAAGTGTGTTGGCT+TGG	0.537753	3:-93234866	MsG0380017200.01.T05:CDS
AAAGCTGCCACCACTGGGGA+TGG	0.537769	3:+93234167	None:intergenic
ATACTAGTATCCAGTTCAGC+AGG	0.539480	3:-93234695	MsG0380017200.01.T05:CDS
CAAGCTTTGCTCATCTGGAA+TGG	0.539673	3:-93233386	MsG0380017200.01.T05:CDS
AAACCAGACTTTATAGCTCC+AGG	0.540594	3:-93234104	MsG0380017200.01.T05:CDS
CTTTGCTCATCTGGAATGGT+CGG	0.540746	3:-93233382	MsG0380017200.01.T05:CDS
TTATGCTGCTAACGTCAGCC+AGG	0.541079	3:-93234495	MsG0380017200.01.T05:CDS
CACACCTCAACTACAGCAGC+AGG	0.541534	3:-93234968	MsG0380017200.01.T02:CDS
TGCCCGGAACCATAATCAAA+CGG	0.542022	3:+93233825	None:intergenic
TTGGACCAGTACCCAAAAGC+TGG	0.542660	3:-93235149	MsG0380017200.01.T02:CDS
ACTGCTAAAATTGCATTTGG+CGG	0.547552	3:-93234209	MsG0380017200.01.T05:CDS
AGCAGCTAACCCACTTACAT+GGG	0.549151	3:+93233974	None:intergenic
GCAGCATAAACAAGTGGCAG+TGG	0.550151	3:+93234509	None:intergenic
GACTTACTCACAAAGCAACC+GGG	0.554244	3:-93235351	MsG0380017200.01.T02:CDS
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CRISPR-GE

badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content
!	TTGAAATGAATTGTAGTTCA+AGG	+	Chr3:93235027-93235046	None:intergenic	25.0%
!!	TAGTTAAAATCCTTTTGTAC+TGG	+	Chr3:93235187-93235206	None:intergenic	25.0%
!!!	AAAAGGATTTTAACTAACGT+AGG	-	Chr3:93235191-93235210	MsG0380017200.01.T02:CDS	25.0%
!!!	AAAGGATTTTAACTAACGTA+GGG	-	Chr3:93235192-93235211	MsG0380017200.01.T02:CDS	25.0%
!!!	ATTTTTGGTGTGAGTATATT+TGG	+	Chr3:93234621-93234640	None:intergenic	25.0%
	AACTGTAACAAGAAACTTGT+TGG	-	Chr3:93233661-93233680	MsG0380017200.01.T05:CDS	30.0%
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	CTGAAACTTTATATGTCGAT+GGG	+	Chr3:93235220-93235239	None:intergenic	30.0%
	TACTAGTATTCCATGTTCTA+TGG	+	Chr3:93234043-93234062	None:intergenic	30.0%
	TGAAACTTTATATGTCGATG+GGG	+	Chr3:93235219-93235238	None:intergenic	30.0%
	TTAGCAAACAACCAAGATTA+TGG	-	Chr3:93234417-93234436	MsG0380017200.01.T05:CDS	30.0%
!	ATTTTTCCTGAAACTTTGCT+AGG	+	Chr3:93234318-93234337	None:intergenic	30.0%
!!	AAGTCTGGTTTGAGTATTTT+TGG	+	Chr3:93234636-93234655	None:intergenic	30.0%
	AAAATAGTGATATGTGACCG+AGG	-	Chr3:93234333-93234352	MsG0380017200.01.T05:CDS	35.0%
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	CAAATGGCACAGAAAAAGAT+GGG	+	Chr3:93235121-93235140	None:intergenic	35.0%
	CCAACTGCTAAAATTGCATT+TGG	-	Chr3:93234537-93234556	MsG0380017200.01.T05:CDS	35.0%
	CCTATATTACCCTTGGAAAT+GGG	-	Chr3:93234166-93234185	MsG0380017200.01.T05:CDS	35.0%
	CTTATGGTGCGTACAAAAAT+GGG	-	Chr3:93234862-93234881	MsG0380017200.01.T05:CDS	35.0%
	GAGGAAATTCAAATAGTCGT+CGG	+	Chr3:93235000-93235019	None:intergenic	35.0%
	GATTGTTGGAGTAATTGACA+CGG	-	Chr3:93233538-93233557	MsG0380017200.01.T05:CDS	35.0%
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	TCAAATGGCACAGAAAAAGA+TGG	+	Chr3:93235122-93235141	None:intergenic	35.0%
	TCAACGACTATCTTATCCAA+AGG	+	Chr3:93235257-93235276	None:intergenic	35.0%
	TCTTATGGTGCGTACAAAAA+TGG	-	Chr3:93234861-93234880	MsG0380017200.01.T05:CDS	35.0%
	TGGACCTATTGATGAAAACA+CGG	-	Chr3:93233720-93233739	MsG0380017200.01.T05:CDS	35.0%
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!	GATTCCGTGTTTTCATCAAT+AGG	+	Chr3:93233727-93233746	None:intergenic	35.0%
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!	TTAGCCAAACTTGCTTTACT+AGG	+	Chr3:93234090-93234109	None:intergenic	35.0%
!!	CCAAATGCAATTTTAGCAGT+TGG	+	Chr3:93234540-93234559	None:intergenic	35.0%
!!	GCAATTTTAGCAGTTGGATT+GGG	+	Chr3:93234534-93234553	None:intergenic	35.0%
!!	TGCAATTTTAGCAGTTGGAT+TGG	+	Chr3:93234535-93234554	None:intergenic	35.0%
!!!	TCATCGAAGCTTTTTAGTTC+AGG	+	Chr3:93233572-93233591	None:intergenic	35.0%
	AAACCAGACTTTATAGCTCC+AGG	-	Chr3:93234645-93234664	MsG0380017200.01.T05:CDS	40.0%
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	AAGCCAACACACTTTGTAAG+CGG	+	Chr3:93233884-93233903	None:intergenic	40.0%
	AATTGTAGTTCAAGGCACAG+AGG	+	Chr3:93235019-93235038	None:intergenic	40.0%
	ACACCGTTTGATTATGGTTC+CGG	-	Chr3:93234921-93234940	MsG0380017200.01.T02:CDS	40.0%
	ACAGATTATCACTGGAATCC+TGG	+	Chr3:93234275-93234294	None:intergenic	40.0%
	ACATCTCATTCAATGCCTTC+TGG	-	Chr3:93235335-93235354	MsG0380017200.01.T02:CDS	40.0%
	ACCATAAAAGATGTCGCTAC+TGG	-	Chr3:93234888-93234907	MsG0380017200.01.T05:CDS	40.0%
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	ACGTTAGCAGCATAAACAAG+TGG	+	Chr3:93234249-93234268	None:intergenic	40.0%
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	ATACTAGTATCCAGTTCAGC+AGG	-	Chr3:93234054-93234073	MsG0380017200.01.T05:CDS	40.0%
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	CCCATTTCCAAGGGTAATAT+AGG	+	Chr3:93234169-93234188	None:intergenic	40.0%
	CTAAAAAGCTTCGATGACAC+TGG	-	Chr3:93233575-93233594	MsG0380017200.01.T05:CDS	40.0%
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	GAAATTCAAATAGTCGTCGG+TGG	+	Chr3:93234997-93235016	None:intergenic	40.0%
	GAAGCTCGTATCTAACTTCA+GGG	+	Chr3:93233439-93233458	None:intergenic	40.0%
	GAGAGTTTACGTGCGATAAA+AGG	-	Chr3:93235066-93235085	MsG0380017200.01.T02:CDS	40.0%
	GCCTATATTACCCTTGGAAA+TGG	-	Chr3:93234165-93234184	MsG0380017200.01.T05:CDS	40.0%
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	GTATCTCTTCCCATTTCCAA+GGG	+	Chr3:93234178-93234197	None:intergenic	40.0%
	GTCTATTGGTGGAGGTTTAA+CGG	-	Chr3:93233978-93233997	MsG0380017200.01.T05:CDS	40.0%
	TAATATAGGCAGGGAAATCG+CGG	+	Chr3:93234155-93234174	None:intergenic	40.0%
	TACAACAAGCTTTGCTCATC+TGG	-	Chr3:93235358-93235377	MsG0380017200.01.T02:CDS	40.0%
	TAGAGCTGAAAAGAGTTTGG+TGG	-	Chr3:93234365-93234384	MsG0380017200.01.T05:CDS	40.0%
	TCCTAGAGCTGAAAAGAGTT+TGG	-	Chr3:93234362-93234381	MsG0380017200.01.T05:CDS	40.0%
	TGAAGCTCGTATCTAACTTC+AGG	+	Chr3:93233440-93233459	None:intergenic	40.0%
	TGGACCTAGTAAAGCAAGTT+TGG	-	Chr3:93234083-93234102	MsG0380017200.01.T05:CDS	40.0%
	TGTATCTCTTCCCATTTCCA+AGG	+	Chr3:93234179-93234198	None:intergenic	40.0%
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!	AATATTCTAGCTGGATGGAG+TGG	-	Chr3:93234672-93234691	MsG0380017200.01.T05:CDS	40.0%
!	ACATTCCCTTTCCAGCTTTT+GGG	+	Chr3:93233614-93233633	None:intergenic	40.0%
!	ACCAAACTCTTTTCAGCTCT+AGG	+	Chr3:93234366-93234385	None:intergenic	40.0%
!	ACTTTTGCAGCCATAGAACA+TGG	-	Chr3:93234030-93234049	MsG0380017200.01.T05:CDS	40.0%
!	ATATTCTAGCTGGATGGAGT+GGG	-	Chr3:93234673-93234692	MsG0380017200.01.T05:CDS	40.0%
!	CAAGCATTGTCCAGTACAAA+AGG	-	Chr3:93235174-93235193	MsG0380017200.01.T02:CDS	40.0%
!	CTAGCTCTTCTCCATAATCT+TGG	+	Chr3:93234431-93234450	None:intergenic	40.0%
!	CTTTTGTACTGGACAATGCT+TGG	+	Chr3:93235176-93235195	None:intergenic	40.0%
!	GAGTCAATATTCTAGCTGGA+TGG	-	Chr3:93234667-93234686	MsG0380017200.01.T05:CDS	40.0%
!!	ACAAGAAACTTGTTGGTGCA+AGG	-	Chr3:93233668-93233687	MsG0380017200.01.T05:CDS	40.0%
!!	TCTTTGAAGCTAAGTGTCTG+TGG	+	Chr3:93235281-93235300	None:intergenic	40.0%
!!!	GGTGCAAGGTTTTTTGCTAA+AGG	-	Chr3:93233682-93233701	MsG0380017200.01.T05:CDS	40.0%
!!!	GTTTTTTGCTAAAGGCTACG+AGG	-	Chr3:93233690-93233709	MsG0380017200.01.T05:CDS	40.0%
!!!	TCACTTTGTTTTCCAGAGGA+CGG	+	Chr3:93233515-93233534	None:intergenic	40.0%
	AACACCAGAGTTTCTCGGAT+TGG	-	Chr3:93233469-93233488	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
	AACGGCGTGTCTCTTTACAA+TGG	-	Chr3:93234198-93234217	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
	AAGTCACCAAGGGATGATGA+CGG	-	Chr3:93233748-93233767	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
	ACACGGAATCAAAGTCACCA+AGG	-	Chr3:93233737-93233756	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
	ACTCCTGGAGCTATAAAGTC+TGG	+	Chr3:93234651-93234670	None:intergenic	45.0%
	ACTCGAACACCAGAGTTTCT+CGG	-	Chr3:93233464-93233483	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
	ACTTACTCACAAAGCAACCG+GGG	-	Chr3:93233399-93233418	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
	AGCAGCTAACCCACTTACAT+GGG	+	Chr3:93234778-93234797	None:intergenic	45.0%
	AGTGCGGATCTTATAGCTGA+AGG	+	Chr3:93234831-93234850	None:intergenic	45.0%
	AGTGTCATCACAGTCTCCTT+TGG	-	Chr3:93235238-93235257	MsG0380017200.01.T02:CDS	45.0%
	ATAAGACGTGGTCATGAGTG+CGG	+	Chr3:93234847-93234866	None:intergenic	45.0%
	ATAGCTGAAGGACTCCATTC+AGG	+	Chr3:93234819-93234838	None:intergenic	45.0%
	ATAGTGATATGTGACCGAGG+AGG	-	Chr3:93234336-93234355	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
	ATGGTCGGATGGGAAACATA+AGG	-	Chr3:93235382-93235401	MsG0380017200.01.T02:CDS	45.0%
	ATTGACAAGGCCATCGAAGA+CGG	-	Chr3:93233937-93233956	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
	ATTTGACACAGCTTCAGGCA+GGG	-	Chr3:93235136-93235155	MsG0380017200.01.T02:intron	45.0%
	CAAGCTTTGCTCATCTGGAA+TGG	-	Chr3:93235363-93235382	MsG0380017200.01.T02:CDS	45.0%
	CAAGTCCAGCTGAAAGCAAT+GGG	+	Chr3:93235416-93235435	None:intergenic	45.0%
	CACAAGGCTAACTACTCAAG+AGG	-	Chr3:93233373-93233392	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
	CACCGTTTGATTATGGTTCC+GGG	-	Chr3:93234922-93234941	MsG0380017200.01.T02:CDS	45.0%
	CACGGAATCAAAGTCACCAA+GGG	-	Chr3:93233738-93233757	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
	CAGTACCCAAAAGCTGGAAA+GGG	-	Chr3:93233606-93233625	MsG0380017200.01.T05:intron	45.0%
	CATAGCTGCTGCAATTGACA+AGG	-	Chr3:93233924-93233943	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
	CCAGGAGTCAATATTCTAGC+TGG	-	Chr3:93234663-93234682	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
	CCATAATCAAACGGTGTAGC+AGG	+	Chr3:93234918-93234937	None:intergenic	45.0%
	CCTGCTACACCGTTTGATTA+TGG	-	Chr3:93234915-93234934	MsG0380017200.01.T02:CDS	45.0%
	CTCCACCAATAGACATAGAG+AGG	+	Chr3:93233972-93233991	None:intergenic	45.0%
	CTCTCTATGTCTATTGGTGG+AGG	-	Chr3:93233970-93233989	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
	GAAATCGCGGTCTATAGTTC+CGG	+	Chr3:93234142-93234161	None:intergenic	45.0%
	GACTTACTCACAAAGCAACC+GGG	-	Chr3:93233398-93233417	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
	GAGTAATTGACACGGGTGTA+TGG	-	Chr3:93233546-93233565	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
	GCCATGAGCTACATGTTTGT+AGG	+	Chr3:93233348-93233367	None:intergenic	45.0%
	GTAGCATCGTATACAAGACC+AGG	+	Chr3:93234975-93234994	None:intergenic	45.0%
	GTATCCAGTTCAGCAGGAAA+CGG	-	Chr3:93234060-93234079	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
	GTCCTCTCTATGTCTATTGG+TGG	-	Chr3:93233967-93233986	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
	GTGAGCTTCAACATCATCTC+TGG	-	Chr3:93234735-93234754	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
	GTTTGGCTAATGTTGCACCA+TGG	-	Chr3:93234100-93234119	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
	TCAAACGTGCAGGAGGAATT+GGG	-	Chr3:93234388-93234407	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
	TCAAGTCCAGCTGAAAGCAA+TGG	+	Chr3:93235417-93235436	None:intergenic	45.0%
	TCCCAGAAGCAAAACCAAAG+AGG	+	Chr3:93233828-93233847	None:intergenic	45.0%
	TGAAGGACTCCATTCAGGAT+GGG	+	Chr3:93234814-93234833	None:intergenic	45.0%
	TGCCCGGAACCATAATCAAA+CGG	+	Chr3:93234927-93234946	None:intergenic	45.0%
	TGTGCTGCACAGATTATCAC+TGG	+	Chr3:93234283-93234302	None:intergenic	45.0%
	TTCCCTGCCTATATTACCCT+TGG	-	Chr3:93234159-93234178	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
	TTCTCCAATCCGAGAAACTC+TGG	+	Chr3:93233476-93233495	None:intergenic	45.0%
	TTTGTACGCACCATAAGACG+TGG	+	Chr3:93234859-93234878	None:intergenic	45.0%
!	ATCACTCTTTTACCGTCCTC+TGG	-	Chr3:93233500-93233519	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
!	CACATTCCCTTTCCAGCTTT+TGG	+	Chr3:93233615-93233634	None:intergenic	45.0%
!	CCCAGTAGCGACATCTTTTA+TGG	+	Chr3:93234892-93234911	None:intergenic	45.0%
!	CTTTGCTCATCTGGAATGGT+CGG	-	Chr3:93235367-93235386	MsG0380017200.01.T02:CDS	45.0%
!	GTCCTCTGGAAAACAAAGTG+AGG	-	Chr3:93233514-93233533	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
!!	CCAGCTAGAATATTGACTCC+TGG	+	Chr3:93234666-93234685	None:intergenic	45.0%
!!	CTCTTGAGTAGTTAGCCTTG+TGG	+	Chr3:93233375-93233394	None:intergenic	45.0%
!!	GCAAAGCTTGTTGTACCAGA+AGG	+	Chr3:93235353-93235372	None:intergenic	45.0%
!!	GCTTACAAAGTGTGTTGGCT+TGG	-	Chr3:93233883-93233902	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
!!	GGGTTAGCTGCTCTTCTTAA+GGG	-	Chr3:93234786-93234805	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
!!	TACAAAGTGTGTTGGCTTGG+TGG	-	Chr3:93233886-93233905	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
!!	TGGGTTAGCTGCTCTTCTTA+AGG	-	Chr3:93234785-93234804	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
!!	TTTGCTTCTGGGACAGCAAA+AGG	-	Chr3:93233835-93233854	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
!!!	AGCCTCTTTGGTTTTGCTTC+TGG	-	Chr3:93233823-93233842	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
!!!	CACCTCACTTTGTTTTCCAG+AGG	+	Chr3:93233519-93233538	None:intergenic	45.0%
!!!	GCCTCTTTGGTTTTGCTTCT+GGG	-	Chr3:93233824-93233843	MsG0380017200.01.T05:CDS	45.0%
	AAAGCAACCGGGGATTCTCT+CGG	-	Chr3:93233409-93233428	MsG0380017200.01.T05:CDS	50.0%
	ACAAGTGGCAGTGGAGAGTT+AGG	+	Chr3:93234234-93234253	None:intergenic	50.0%
	AGAACCTGCTGCTGTAGTTG+AGG	+	Chr3:93233788-93233807	None:intergenic	50.0%
	AGCTTCGATGACACTGGACT+TGG	-	Chr3:93233581-93233600	MsG0380017200.01.T05:intron	50.0%
	AGTCACCAAGGGATGATGAC+GGG	-	Chr3:93233749-93233768	MsG0380017200.01.T05:CDS	50.0%
	AGTGGGAAAGTTGGACCAAC+TGG	-	Chr3:93234690-93234709	MsG0380017200.01.T05:CDS	50.0%
	ATGTCATGCCCCCATGTAAG+TGG	-	Chr3:93234765-93234784	MsG0380017200.01.T05:CDS	50.0%
	ATTTGGCGGTACCCAGTTAG+GGG	-	Chr3:93234554-93234573	MsG0380017200.01.T05:CDS	50.0%
	CAGCTAACCCACTTACATGG+GGG	+	Chr3:93234776-93234795	None:intergenic	50.0%
	CATTTGACACAGCTTCAGGC+AGG	-	Chr3:93235135-93235154	MsG0380017200.01.T02:intron	50.0%
	CATTTGGCGGTACCCAGTTA+GGG	-	Chr3:93234553-93234572	MsG0380017200.01.T05:CDS	50.0%
	CCAGTACCCAAAAGCTGGAA+AGG	-	Chr3:93233605-93233624	MsG0380017200.01.T05:intron	50.0%
	CTAGTCCCATTGCTTTCAGC+TGG	-	Chr3:93235408-93235427	MsG0380017200.01.T02:CDS	50.0%
	CTGAAGGACTCCATTCAGGA+TGG	+	Chr3:93234815-93234834	None:intergenic	50.0%
	CTGCCTGAAGCTGTGTCAAA+TGG	+	Chr3:93235137-93235156	None:intergenic	50.0%
	CTGGAAAGGGAATGTGAGAC+AGG	-	Chr3:93233619-93233638	MsG0380017200.01.T05:intron	50.0%
	GACGTTAACACCGTCTTCGA+TGG	+	Chr3:93233950-93233969	None:intergenic	50.0%
	GAGCAGCTAACCCACTTACA+TGG	+	Chr3:93234779-93234798	None:intergenic	50.0%
	GCACCATGGATAACCACTGT+CGG	-	Chr3:93234114-93234133	MsG0380017200.01.T05:CDS	50.0%
	GCACTCATGACCACGTCTTA+TGG	-	Chr3:93234846-93234865	MsG0380017200.01.T05:CDS	50.0%
	GCAGCATAAACAAGTGGCAG+TGG	+	Chr3:93234243-93234262	None:intergenic	50.0%
	GCAGCTAACCCACTTACATG+GGG	+	Chr3:93234777-93234796	None:intergenic	50.0%
	GGATGGTTGAACCCCTAACT+GGG	+	Chr3:93234568-93234587	None:intergenic	50.0%
	GTCAAACGTGCAGGAGGAAT+TGG	-	Chr3:93234387-93234406	MsG0380017200.01.T05:CDS	50.0%
	GTGTCAACTGACAAGCCAGT+TGG	+	Chr3:93234708-93234727	None:intergenic	50.0%
	TAGCTCATGGCTTCTCCACA+AGG	-	Chr3:93233357-93233376	MsG0380017200.01.T05:CDS	50.0%
	TGATTATGGTTCCGGGCATG+TGG	-	Chr3:93234929-93234948	MsG0380017200.01.T02:CDS	50.0%
	TGGCCGCTTACAAAGTGTGT+TGG	-	Chr3:93233878-93233897	MsG0380017200.01.T05:CDS	50.0%
	TGTCATGCCCCCATGTAAGT+GGG	-	Chr3:93234766-93234785	MsG0380017200.01.T05:CDS	50.0%
	TTAAGGGAGCCCATCCTGAA+TGG	-	Chr3:93234802-93234821	MsG0380017200.01.T05:CDS	50.0%
	TTATGCTGCTAACGTCAGCC+AGG	-	Chr3:93234254-93234273	MsG0380017200.01.T05:CDS	50.0%
	TTGGACCAGTACCCAAAAGC+TGG	-	Chr3:93233600-93233619	MsG0380017200.01.T05:intron	50.0%
	TTTGACACAGCTTCAGGCAG+GGG	-	Chr3:93235137-93235156	MsG0380017200.01.T02:intron	50.0%
!	AAAGGCTACGAGGCAGCTTT+TGG	-	Chr3:93233700-93233719	MsG0380017200.01.T05:CDS	50.0%
!	ACTTACATGGGGGCATGACA+TGG	+	Chr3:93234766-93234785	None:intergenic	50.0%
!	AGTTTGGTGGTCAAACGTGC+AGG	-	Chr3:93234378-93234397	MsG0380017200.01.T05:CDS	50.0%
!	CTCATCTGGAATGGTCGGAT+GGG	-	Chr3:93235372-93235391	MsG0380017200.01.T02:CDS	50.0%
!	CTGGCTTGTCAGTTGACACA+AGG	-	Chr3:93234709-93234728	MsG0380017200.01.T05:CDS	50.0%
!!	CAGCTCTAGGATTTCCTCCT+CGG	+	Chr3:93234353-93234372	None:intergenic	50.0%
!!	CCTTTCCAGCTTTTGGGTAC+TGG	+	Chr3:93233608-93233627	None:intergenic	50.0%
!!	GTGCCATTTGACACAGCTTC+AGG	-	Chr3:93235131-93235150	MsG0380017200.01.T02:intron	50.0%
!!	TTCTGGGACAGCAAAAGGCA+TGG	-	Chr3:93233840-93233859	MsG0380017200.01.T05:CDS	50.0%
	AGCTACTGGATCCACATGCC+CGG	+	Chr3:93234943-93234962	None:intergenic	55.0%
	AGCTGAAAGCTGCCACCACT+GGG	+	Chr3:93234590-93234609	None:intergenic	55.0%
	AGTGGCAGTGGAGAGTTAGG+TGG	+	Chr3:93234231-93234250	None:intergenic	55.0%
	CACACCTCAACTACAGCAGC+AGG	-	Chr3:93233781-93233800	MsG0380017200.01.T05:CDS	55.0%
	CATGGCTACACAAGCTCGAG+TGG	-	Chr3:93233858-93233877	MsG0380017200.01.T05:CDS	55.0%
	CCAGGATCAAGAGCAGCTAC+TGG	+	Chr3:93234957-93234976	None:intergenic	55.0%
	CCAGTAGCTGCTCTTGATCC+TGG	-	Chr3:93234954-93234973	MsG0380017200.01.T02:CDS	55.0%
	GCATTTGGCGGTACCCAGTT+AGG	-	Chr3:93234552-93234571	MsG0380017200.01.T05:CDS	55.0%
	GCTGGATGGAGTGGGAAAGT+TGG	-	Chr3:93234681-93234700	MsG0380017200.01.T05:CDS	55.0%
	GGGATAACCGAGAGAATCCC+CGG	+	Chr3:93233419-93233438	None:intergenic	55.0%
	GGGATGGTTGAACCCCTAAC+TGG	+	Chr3:93234569-93234588	None:intergenic	55.0%
	GTTGCAGGAGCAAGCCTCTT+TGG	-	Chr3:93233811-93233830	MsG0380017200.01.T05:CDS	55.0%
	TCCACCGTTTCCTGCTGAAC+TGG	+	Chr3:93234067-93234086	None:intergenic	55.0%
	TCCAGTTCAGCAGGAAACGG+TGG	-	Chr3:93234063-93234082	MsG0380017200.01.T05:CDS	55.0%
	TCTCTCCCAAAGCTGCTGCA+GGG	+	Chr3:93234473-93234492	None:intergenic	55.0%
	TGGATAACCACTGTCGGTGC+CGG	-	Chr3:93234120-93234139	MsG0380017200.01.T05:CDS	55.0%
	TTCTCTCCCAAAGCTGCTGC+AGG	+	Chr3:93234474-93234493	None:intergenic	55.0%
!	GCACCGACAGTGGTTATCCA+TGG	+	Chr3:93234120-93234139	None:intergenic	55.0%
!	GCTCATCTGGAATGGTCGGA+TGG	-	Chr3:93235371-93235390	MsG0380017200.01.T02:CDS	55.0%
!	GTGGCAGCTTTCAGCTCTAG+AGG	-	Chr3:93234594-93234613	MsG0380017200.01.T05:CDS	55.0%
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