AlfalfaGEDB | MsG0180004769.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180004769.01

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MsG0180004769.01.T01	AT5G03560	29.605	152	103	3	187	335	187	337	1.27e-11	66.6
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Find 129 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 153 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

CRISPR-Local
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TCAGAACTTGACGCAGAAAA+TGG	0.301339	1:-82474882	MsG0180004769.01.T01:CDS
GTCTCTTCTGACTCTTCCTT+TGG	0.301514	1:+82474755	None:intergenic
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AACATACAAGATTGCGTATA+CGG	0.317040	1:+82475157	None:intergenic
AAGAAGATTGTGCCTGATTA+TGG	0.328507	1:-82475793	MsG0180004769.01.T01:CDS
TACTAGTGTTATTGGTGGAT+TGG	0.341537	1:-82475455	MsG0180004769.01.T01:CDS
AAAACAACCATAACAGTTCT+TGG	0.349284	1:+82475874	None:intergenic
CGCAGAAAATGGCAATATTT+GGG	0.361146	1:-82474871	MsG0180004769.01.T01:CDS
AAGAATTCAAGGGTTTGATT+AGG	0.361248	1:+82476042	None:intergenic
GGAAATTGAGAAAGCGTATA+AGG	0.362012	1:-82475527	MsG0180004769.01.T01:CDS
ACTTTGTGAACGTCGTCGTT+TGG	0.372484	1:+82476192	None:intergenic
TGGAGATGGCATTGCAGTTA+TGG	0.373977	1:-82475102	MsG0180004769.01.T01:CDS
GATGGAGGTGAATGGTGATT+TGG	0.378271	1:+82476239	None:intergenic
ACAACTTTCAAATGTTTCTT+CGG	0.382241	1:-82476272	None:intergenic
CGAATGATTTACAGAGTTCA+TGG	0.382846	1:-82475216	MsG0180004769.01.T01:CDS
ATTGGTGGATTGGGGTTGGT+TGG	0.386426	1:-82475445	MsG0180004769.01.T01:CDS
TGTTGTAACGTATAATAGTT+TGG	0.391242	1:-82475572	MsG0180004769.01.T01:CDS
CAACTCCTCCATTTCTTCTA+CGG	0.391517	1:+82474814	None:intergenic
ATGGAGGAGTTGGACAATAG+AGG	0.391663	1:-82474803	MsG0180004769.01.T01:CDS
TGGTGTTTACGCTGATGTTC+CGG	0.392350	1:-82475377	MsG0180004769.01.T01:CDS
GGAGGCGGAGAAATGTTTCT+TGG	0.393946	1:-82474993	MsG0180004769.01.T01:CDS
ATATTAAAAGTCTGCAAATT+CGG	0.396725	1:+82475673	None:intergenic
TACTTACAATTTGTTCTTCA+GGG	0.399140	1:-82475251	MsG0180004769.01.T01:CDS
TGTTATTGGTGGATTGGGGT+TGG	0.402154	1:-82475449	MsG0180004769.01.T01:CDS
TTCGTTGGAGAGGAAAATTT+GGG	0.402394	1:+82476110	None:intergenic
TTGAAGGAAATGAAGGAGTA+TGG	0.404691	1:-82475397	MsG0180004769.01.T01:CDS
CGTTAACGAGATGAAGGAAA+TGG	0.407683	1:-82475608	MsG0180004769.01.T01:CDS
AAACAATTCACACCATAATC+AGG	0.415841	1:+82475781	None:intergenic
TACTACACCCGTAGAAGAAA+TGG	0.417864	1:-82474822	MsG0180004769.01.T01:CDS
GTCCTCAAACGTGTTCGCTT+TGG	0.421225	1:-82476075	MsG0180004769.01.T01:CDS
GACACAATGCTCTACATTCT+CGG	0.424027	1:-82475970	MsG0180004769.01.T01:CDS
CGTTACACTGGCAGAAGAAA+AGG	0.424917	1:-82476018	MsG0180004769.01.T01:CDS
TGAAGGTGGAGAGGCGGCGG+AGG	0.425838	1:+82476217	None:intergenic
CTCTTAAACGAAACATTGCT+TGG	0.428793	1:+82474947	None:intergenic
TGGTAGTGCTTATGAATTGA+TGG	0.429109	1:-82475311	MsG0180004769.01.T01:CDS
AATCAATTAGTATTCAGTTA+AGG	0.430691	1:+82474718	None:intergenic
GACTTGATCGATTAATTCGT+TGG	0.437123	1:+82476095	None:intergenic
GGAAGAGGTGGTGGTGAGAA+TGG	0.441284	1:+82476164	None:intergenic
TTTGACATGCTTTGTGATAT+GGG	0.442672	1:-82475025	MsG0180004769.01.T01:CDS
AACTCCTCCATTTCTTCTAC+GGG	0.444795	1:+82474815	None:intergenic
GGTGGAGAGGCGGCGGAGGA+TGG	0.448400	1:+82476221	None:intergenic
ATGGGATGACATGGTGGAGA+AGG	0.451909	1:-82475083	MsG0180004769.01.T01:CDS
TGGTGGATGTTTATTGCAAA+GGG	0.455866	1:-82475552	MsG0180004769.01.T01:CDS
CTATTATACGTTACAACATC+CGG	0.460757	1:+82475577	None:intergenic
CAGTGTAACGGAAGAATTCA+AGG	0.467034	1:+82476031	None:intergenic
GGAGATGGCATTGCAGTTAT+GGG	0.470139	1:-82475101	MsG0180004769.01.T01:CDS
GTTAACGAGATGAAGGAAAT+GGG	0.474611	1:-82475607	MsG0180004769.01.T01:CDS
GAGTGAAGGTGGAGAGGCGG+CGG	0.477309	1:+82476214	None:intergenic
GTTCATGGAACTTATACAAA+AGG	0.480455	1:-82475201	MsG0180004769.01.T01:CDS
AACGTCGTCGTTTGGAGTGA+AGG	0.483407	1:+82476200	None:intergenic
TGGAGGAGTTGGACAATAGA+GGG	0.485626	1:-82474802	MsG0180004769.01.T01:CDS
CGGCGGAGGATGGAGGTGAA+TGG	0.486503	1:+82476231	None:intergenic
GATTACGCCAAGAACTGTTA+TGG	0.495548	1:-82475881	MsG0180004769.01.T01:CDS
GGTTTGTTCTGTTAGACAAA+CGG	0.498070	1:-82475836	MsG0180004769.01.T01:CDS
GTTTGATGAAATGCGCGAAA+AGG	0.502146	1:-82475503	MsG0180004769.01.T01:CDS
TTTCTGCGTCAAGTTCTGAA+TGG	0.505101	1:+82474886	None:intergenic
AAACAGCACATCAGAAACTA+AGG	0.506256	1:+82475045	None:intergenic
TTGGTGGATGTTTATTGCAA+AGG	0.510434	1:-82475553	MsG0180004769.01.T01:CDS
CGTAGAAGAAATGGAGGAGT+TGG	0.510539	1:-82474813	MsG0180004769.01.T01:CDS
GTTGTTCGTTAACGAGATGA+AGG	0.513587	1:-82475614	MsG0180004769.01.T01:CDS
TGGGATGACATGGTGGAGAA+GGG	0.513828	1:-82475082	MsG0180004769.01.T01:CDS
GTTGAAGAGGCATGAAAAGA+TGG	0.514867	1:-82475122	MsG0180004769.01.T01:CDS
GGCCAAAGCGAACACGTTTG+AGG	0.517976	1:+82476073	None:intergenic
AAATTGTAAGTAGTTGCATT+CGG	0.520936	1:+82475262	None:intergenic
ATACAAAAGGATGATGGATG+AGG	0.528740	1:-82475188	MsG0180004769.01.T01:CDS
GAACTTATACAAAAGGATGA+TGG	0.530966	1:-82475194	MsG0180004769.01.T01:CDS
AGATGATTGAGAAGGGGCAG+AGG	0.534638	1:-82474970	MsG0180004769.01.T01:CDS
ACTTATACTAGTGTTATTGG+TGG	0.535813	1:-82475460	MsG0180004769.01.T01:CDS
AATGTAGAGCATTGTGTCAA+GGG	0.537516	1:+82475975	None:intergenic
GGAGAGGCGGCGGAGGATGG+AGG	0.537605	1:+82476224	None:intergenic
TGTTTCGTTTAAGAGAATCA+AGG	0.541643	1:-82474939	MsG0180004769.01.T01:CDS
CTGATAGCAGCATTGTATGC+CGG	0.542604	1:+82475358	None:intergenic
TTGTGATATGGGGAAATTGT+CGG	0.544276	1:-82475014	MsG0180004769.01.T01:CDS
TTCTTGGAGATGATTGAGAA+GGG	0.545819	1:-82474977	MsG0180004769.01.T01:CDS
CTAGTATAAGTAATCACATC+CGG	0.546357	1:+82475472	None:intergenic
GAATGTAGAGCATTGTGTCA+AGG	0.553835	1:+82475974	None:intergenic
CTTGAATTCTTCCGTTACAC+TGG	0.564486	1:-82476030	MsG0180004769.01.T01:CDS
GGGTTTGATTAGGATTTGCA+TGG	0.569334	1:+82476052	None:intergenic
TGGATGTTTATTGCAAAGGG+AGG	0.576644	1:-82475549	MsG0180004769.01.T01:CDS
TTTCTTGGAGATGATTGAGA+AGG	0.576921	1:-82474978	MsG0180004769.01.T01:CDS
TTAATATACTTCTTTCGGGG+TGG	0.579230	1:-82475657	MsG0180004769.01.T01:CDS
GTTGGAGAGGAAAATTTGGG+TGG	0.584074	1:+82476113	None:intergenic
GGTGAATGGTGATTTGGAAG+TGG	0.591325	1:+82476245	None:intergenic
GGATGTTTATTGCAAAGGGA+GGG	0.591393	1:-82475548	MsG0180004769.01.T01:CDS
GAGGCATGAAAAGATGGAGA+TGG	0.599282	1:-82475116	MsG0180004769.01.T01:CDS
CTAGTGTTATTGGTGGATTG+GGG	0.602167	1:-82475453	MsG0180004769.01.T01:CDS
CCCAAACATGTTCAAACATG+CGG	0.603190	1:+82475941	None:intergenic
TACAAAAGGATGATGGATGA+GGG	0.604168	1:-82475187	MsG0180004769.01.T01:CDS
ATGTGCGACAGAGGGACAAG+TGG	0.605198	1:-82474778	MsG0180004769.01.T01:CDS
TACAAGATTGCGTATACGGA+AGG	0.606962	1:+82475161	None:intergenic
ACTCTTTCATGAACTTGCAG+TGG	0.607668	1:+82474845	None:intergenic
GTCGTCGTTTGGAGTGAAGG+TGG	0.608668	1:+82476203	None:intergenic
GCGCGAAAAGGATTTGTCGC+CGG	0.610538	1:-82475491	MsG0180004769.01.T01:CDS
TATGGGGAAATTGTCGGAGG+CGG	0.612005	1:-82475008	MsG0180004769.01.T01:CDS
CGTTTGGAGTGAAGGTGGAG+AGG	0.615531	1:+82476208	None:intergenic
GATCGATTAATTCGTTGGAG+AGG	0.623234	1:+82476100	None:intergenic
CATTGTGTCAAGGGAATAAG+CGG	0.623426	1:+82475984	None:intergenic
TTATGAATTGATGGATGAGA+TGG	0.623699	1:-82475302	MsG0180004769.01.T01:CDS
TTGGAGTGAAGGTGGAGAGG+CGG	0.628787	1:+82476211	None:intergenic
TTAACGAGATGAAGGAAATG+GGG	0.629272	1:-82475606	MsG0180004769.01.T01:CDS
ACAGAGGGACAAGTGGCCAA+AGG	0.632623	1:-82474771	MsG0180004769.01.T01:CDS
TTGACATGCTTTGTGATATG+GGG	0.633850	1:-82475024	MsG0180004769.01.T01:CDS
TGTAACGTATAATAGTTTGG+TGG	0.635292	1:-82475569	MsG0180004769.01.T01:CDS
TAGAGGGAATGTGCGACAGA+GGG	0.636907	1:-82474786	MsG0180004769.01.T01:CDS
ATGGATGAGATGGTGAGCAA+AGG	0.639548	1:-82475292	MsG0180004769.01.T01:CDS
GGGAGCTTCTTATCGAAGCG+CGG	0.641119	1:-82475921	MsG0180004769.01.T01:CDS
GGAACTAGCAAATAAACATG+AGG	0.644129	1:-82474909	MsG0180004769.01.T01:CDS
AGTGTAACGGAAGAATTCAA+GGG	0.647355	1:+82476032	None:intergenic
ATAGAGGGAATGTGCGACAG+AGG	0.648237	1:-82474787	MsG0180004769.01.T01:CDS
TCTTGGAGATGATTGAGAAG+GGG	0.648899	1:-82474976	MsG0180004769.01.T01:CDS
TGATATGGGGAAATTGTCGG+AGG	0.665224	1:-82475011	MsG0180004769.01.T01:CDS
TACACCCGTAGAAGAAATGG+AGG	0.674227	1:-82474819	MsG0180004769.01.T01:CDS
ATTGCAGTTATGGGATGACA+TGG	0.681720	1:-82475092	MsG0180004769.01.T01:CDS
GAAGAGTCAGAAGAGACACA+AGG	0.688303	1:-82474749	MsG0180004769.01.T01:CDS
TAACGAGATGAAGGAAATGG+GGG	0.698117	1:-82475605	MsG0180004769.01.T01:CDS
GCAGTTATGGGATGACATGG+TGG	0.717911	1:-82475089	MsG0180004769.01.T01:CDS
TGTCAAGGGAATAAGCGGTG+TGG	0.737364	1:+82475989	None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content
!!	ATATTAAAAGTCTGCAAATT+CGG	+	Chr1:82475315-82475334	None:intergenic	20.0%
!!	ATTACTTATACTAGTGTTAT+TGG	-	Chr1:82475522-82475541	MsG0180004769.01.T01:CDS	20.0%
!!!	AATCTTGTATGTTTTTGATA+AGG	-	Chr1:82475838-82475857	MsG0180004769.01.T01:CDS	20.0%
!!!	ACTTTTAATATACTTCTTTC+GGG	-	Chr1:82475324-82475343	MsG0180004769.01.T01:CDS	20.0%
!!!	GACTTTTAATATACTTCTTT+CGG	-	Chr1:82475323-82475342	MsG0180004769.01.T01:CDS	20.0%
!	AAATTGTAAGTAGTTGCATT+CGG	+	Chr1:82475726-82475745	None:intergenic	25.0%
!	TGTTGTAACGTATAATAGTT+TGG	-	Chr1:82475413-82475432	MsG0180004769.01.T01:CDS	25.0%
!!	CTTTTAATATACTTCTTTCG+GGG	-	Chr1:82475325-82475344	MsG0180004769.01.T01:CDS	25.0%
!!	TACTTACAATTTGTTCTTCA+GGG	-	Chr1:82475734-82475753	MsG0180004769.01.T01:CDS	25.0%
	AAAACAACCATAACAGTTCT+TGG	+	Chr1:82475114-82475133	None:intergenic	30.0%
	AAACAATTCACACCATAATC+AGG	+	Chr1:82475207-82475226	None:intergenic	30.0%
	AACATACAAGATTGCGTATA+CGG	+	Chr1:82475831-82475850	None:intergenic	30.0%
	AAGAATTCAAGGGTTTGATT+AGG	+	Chr1:82474946-82474965	None:intergenic	30.0%
	CTAGTATAAGTAATCACATC+CGG	+	Chr1:82475516-82475535	None:intergenic	30.0%
	CTATTATACGTTACAACATC+CGG	+	Chr1:82475411-82475430	None:intergenic	30.0%
	GAACTTATACAAAAGGATGA+TGG	-	Chr1:82475791-82475810	MsG0180004769.01.T01:CDS	30.0%
	GTTCATGGAACTTATACAAA+AGG	-	Chr1:82475784-82475803	MsG0180004769.01.T01:CDS	30.0%
	TAAGAGAATCAAGGTTCTTA+TGG	-	Chr1:82476055-82476074	MsG0180004769.01.T01:CDS	30.0%
	TGTAACGTATAATAGTTTGG+TGG	-	Chr1:82475416-82475435	MsG0180004769.01.T01:CDS	30.0%
	TGTTTCGTTTAAGAGAATCA+AGG	-	Chr1:82476046-82476065	MsG0180004769.01.T01:CDS	30.0%
	TTTGACATGCTTTGTGATAT+GGG	-	Chr1:82475960-82475979	MsG0180004769.01.T01:CDS	30.0%
!	AAGAACTGTTATGGTTGTTT+TGG	-	Chr1:82475113-82475132	MsG0180004769.01.T01:CDS	30.0%
!	ACTTATACTAGTGTTATTGG+TGG	-	Chr1:82475525-82475544	MsG0180004769.01.T01:CDS	30.0%
!	CTACTTACAATTTGTTCTTC+AGG	-	Chr1:82475733-82475752	MsG0180004769.01.T01:CDS	30.0%
!	GAAACTTTTGTATTGCAAAG+AGG	-	Chr1:82475649-82475668	MsG0180004769.01.T01:CDS	30.0%
!	TTATGAATTGATGGATGAGA+TGG	-	Chr1:82475683-82475702	MsG0180004769.01.T01:CDS	30.0%
!	TTTTGATAAGGTTGTTGAAG+AGG	-	Chr1:82475850-82475869	MsG0180004769.01.T01:CDS	30.0%
!!	AAAACATCTCTAGCTTTATC+AGG	+	Chr1:82475570-82475589	None:intergenic	30.0%
!!	AGAACTGTTATGGTTGTTTT+GGG	-	Chr1:82475114-82475133	MsG0180004769.01.T01:CDS	30.0%
!!	GAAAATTTGGGTGGATTTTA+GGG	+	Chr1:82474866-82474885	None:intergenic	30.0%
!!	TAAAGCTAGAGATGTTTTGA+AGG	-	Chr1:82475572-82475591	MsG0180004769.01.T01:CDS	30.0%
!!!	AGATGTTTTGAAGGAAATGA+AGG	-	Chr1:82475581-82475600	MsG0180004769.01.T01:CDS	30.0%
!!!	GGATTTTAGGGTTTGTTTTA+GGG	+	Chr1:82474854-82474873	None:intergenic	30.0%
!!!	TGGATTTTAGGGTTTGTTTT+AGG	+	Chr1:82474855-82474874	None:intergenic	30.0%
!!!	TGTTCTTCAGGGTTTTTTAT+TGG	-	Chr1:82475745-82475764	MsG0180004769.01.T01:CDS	30.0%
	AAACAGCACATCAGAAACTA+AGG	+	Chr1:82475943-82475962	None:intergenic	35.0%
	AAGAAGATTGTGCCTGATTA+TGG	-	Chr1:82475192-82475211	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
	ACGCAGAAAATGGCAATATT+TGG	-	Chr1:82476113-82476132	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
	ATTCGTTGGAGAGGAAAATT+TGG	+	Chr1:82474879-82474898	None:intergenic	35.0%
	CGAATGATTTACAGAGTTCA+TGG	-	Chr1:82475769-82475788	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
	CGCAGAAAATGGCAATATTT+GGG	-	Chr1:82476114-82476133	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
	CTCTTAAACGAAACATTGCT+TGG	+	Chr1:82476041-82476060	None:intergenic	35.0%
	GACTTGATCGATTAATTCGT+TGG	+	Chr1:82474893-82474912	None:intergenic	35.0%
	GGAACTAGCAAATAAACATG+AGG	-	Chr1:82476076-82476095	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
	GTTAACGAGATGAAGGAAAT+GGG	-	Chr1:82475378-82475397	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
	GTTTGACATGCTTTGTGATA+TGG	-	Chr1:82475959-82475978	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
	TTAACGAGATGAAGGAAATG+GGG	-	Chr1:82475379-82475398	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
	TTAATATACTTCTTTCGGGG+TGG	-	Chr1:82475328-82475347	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
	TTCGTTGGAGAGGAAAATTT+GGG	+	Chr1:82474878-82474897	None:intergenic	35.0%
	TTCTTGGAGATGATTGAGAA+GGG	-	Chr1:82476008-82476027	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
	TTGAAGGAAATGAAGGAGTA+TGG	-	Chr1:82475588-82475607	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
	TTGACATGCTTTGTGATATG+GGG	-	Chr1:82475961-82475980	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
	TTGTGATATGGGGAAATTGT+CGG	-	Chr1:82475971-82475990	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
	TTTCTTGGAGATGATTGAGA+AGG	-	Chr1:82476007-82476026	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
!	AGTGTAACGGAAGAATTCAA+GGG	+	Chr1:82474956-82474975	None:intergenic	35.0%
!	GGAAATTGAGAAAGCGTATA+AGG	-	Chr1:82475458-82475477	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
!	GGTTTGTTCTGTTAGACAAA+CGG	-	Chr1:82475149-82475168	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
!	TACTAGTGTTATTGGTGGAT+TGG	-	Chr1:82475530-82475549	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
!	TGGTAGTGCTTATGAATTGA+TGG	-	Chr1:82475674-82475693	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
!	TGGTGGATGTTTATTGCAAA+GGG	-	Chr1:82475433-82475452	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
!	TTGGTGGATGTTTATTGCAA+AGG	-	Chr1:82475432-82475451	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
!	TTTTGTATTGCAAAGAGGCT+TGG	-	Chr1:82475654-82475673	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
!!	AATGTAGAGCATTGTGTCAA+GGG	+	Chr1:82475013-82475032	None:intergenic	35.0%
!!	ACTAGTGTTATTGGTGGATT+GGG	-	Chr1:82475531-82475550	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
!!	ATACAAAAGGATGATGGATG+AGG	-	Chr1:82475797-82475816	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
!!	GGAAAATTTGGGTGGATTTT+AGG	+	Chr1:82474867-82474886	None:intergenic	35.0%
!!	TACAAAAGGATGATGGATGA+GGG	-	Chr1:82475798-82475817	MsG0180004769.01.T01:CDS	35.0%
!!!	TAGGGTTTGTTTTAGGGTTT+CGG	+	Chr1:82474848-82474867	None:intergenic	35.0%
	AACTCCTCCATTTCTTCTAC+GGG	+	Chr1:82476173-82476192	None:intergenic	40.0%
	ACTCTTTCATGAACTTGCAG+TGG	+	Chr1:82476143-82476162	None:intergenic	40.0%
	ATTGCAGTTATGGGATGACA+TGG	-	Chr1:82475893-82475912	MsG0180004769.01.T01:CDS	40.0%
	CAACTCCTCCATTTCTTCTA+CGG	+	Chr1:82476174-82476193	None:intergenic	40.0%
	CATTGTGTCAAGGGAATAAG+CGG	+	Chr1:82475004-82475023	None:intergenic	40.0%
	CCCAAACATGTTCAAACATG+CGG	+	Chr1:82475047-82475066	None:intergenic	40.0%
	CCGCATGTTTGAACATGTTT+GGG	-	Chr1:82475044-82475063	MsG0180004769.01.T01:CDS	40.0%
	CGTTAACGAGATGAAGGAAA+TGG	-	Chr1:82475377-82475396	MsG0180004769.01.T01:CDS	40.0%
	CTTGAATTCTTCCGTTACAC+TGG	-	Chr1:82474955-82474974	MsG0180004769.01.T01:CDS	40.0%
	GACACAATGCTCTACATTCT+CGG	-	Chr1:82475015-82475034	MsG0180004769.01.T01:CDS	40.0%
	GATCGATTAATTCGTTGGAG+AGG	+	Chr1:82474888-82474907	None:intergenic	40.0%
	GATTACGCCAAGAACTGTTA+TGG	-	Chr1:82475104-82475123	MsG0180004769.01.T01:CDS	40.0%
	GGATGTTTATTGCAAAGGGA+GGG	-	Chr1:82475437-82475456	MsG0180004769.01.T01:CDS	40.0%
	GGGTTTGATTAGGATTTGCA+TGG	+	Chr1:82474936-82474955	None:intergenic	40.0%
	GTTGTTCGTTAACGAGATGA+AGG	-	Chr1:82475371-82475390	MsG0180004769.01.T01:CDS	40.0%
	GTTTGATGAAATGCGCGAAA+AGG	-	Chr1:82475482-82475501	MsG0180004769.01.T01:CDS	40.0%
	TAACGAGATGAAGGAAATGG+GGG	-	Chr1:82475380-82475399	MsG0180004769.01.T01:CDS	40.0%
	TACAAGATTGCGTATACGGA+AGG	+	Chr1:82475827-82475846	None:intergenic	40.0%
	TACTACACCCGTAGAAGAAA+TGG	-	Chr1:82476163-82476182	MsG0180004769.01.T01:CDS	40.0%
	TCAGAACTTGACGCAGAAAA+TGG	-	Chr1:82476103-82476122	MsG0180004769.01.T01:CDS	40.0%
	TCTTGGAGATGATTGAGAAG+GGG	-	Chr1:82476009-82476028	MsG0180004769.01.T01:CDS	40.0%
	TGGATGTTTATTGCAAAGGG+AGG	-	Chr1:82475436-82475455	MsG0180004769.01.T01:CDS	40.0%
!	CAGTGTAACGGAAGAATTCA+AGG	+	Chr1:82474957-82474976	None:intergenic	40.0%
!	CTTTTCTTCTGCCAGTGTAA+CGG	+	Chr1:82474969-82474988	None:intergenic	40.0%
!	GTTGAAGAGGCATGAAAAGA+TGG	-	Chr1:82475863-82475882	MsG0180004769.01.T01:CDS	40.0%
!!	CTAGTGTTATTGGTGGATTG+GGG	-	Chr1:82475532-82475551	MsG0180004769.01.T01:CDS	40.0%
!!	GAATGTAGAGCATTGTGTCA+AGG	+	Chr1:82475014-82475033	None:intergenic	40.0%
!!	TGTTTTGGGTAGAGTTGCTA+AGG	-	Chr1:82475128-82475147	MsG0180004769.01.T01:CDS	40.0%
!!	TTTCTGCGTCAAGTTCTGAA+TGG	+	Chr1:82476102-82476121	None:intergenic	40.0%
!!!	AGGGTTTGTTTTAGGGTTTC+GGG	+	Chr1:82474847-82474866	None:intergenic	40.0%
	ACTTTGTGAACGTCGTCGTT+TGG	+	Chr1:82474796-82474815	None:intergenic	45.0%
	ATGGAGGAGTTGGACAATAG+AGG	-	Chr1:82476182-82476201	MsG0180004769.01.T01:CDS	45.0%
	ATGGATGAGATGGTGAGCAA+AGG	-	Chr1:82475693-82475712	MsG0180004769.01.T01:CDS	45.0%
	CGTAGAAGAAATGGAGGAGT+TGG	-	Chr1:82476172-82476191	MsG0180004769.01.T01:CDS	45.0%
	CGTTACACTGGCAGAAGAAA+AGG	-	Chr1:82474967-82474986	MsG0180004769.01.T01:CDS	45.0%
	CTGATAGCAGCATTGTATGC+CGG	+	Chr1:82475630-82475649	None:intergenic	45.0%
	GAAGAGTCAGAAGAGACACA+AGG	-	Chr1:82476236-82476255	MsG0180004769.01.T01:CDS	45.0%
	GAGGCATGAAAAGATGGAGA+TGG	-	Chr1:82475869-82475888	MsG0180004769.01.T01:CDS	45.0%
	GATGGAGGTGAATGGTGATT+TGG	+	Chr1:82474749-82474768	None:intergenic	45.0%
	GCCGCATGTTTGAACATGTT+TGG	-	Chr1:82475043-82475062	MsG0180004769.01.T01:CDS	45.0%
	GGAGATGGCATTGCAGTTAT+GGG	-	Chr1:82475884-82475903	MsG0180004769.01.T01:CDS	45.0%
	GTCTCTTCTGACTCTTCCTT+TGG	+	Chr1:82476233-82476252	None:intergenic	45.0%
	GTTGGAGAGGAAAATTTGGG+TGG	+	Chr1:82474875-82474894	None:intergenic	45.0%
	TACACCCGTAGAAGAAATGG+AGG	-	Chr1:82476166-82476185	MsG0180004769.01.T01:CDS	45.0%
	TCTTTCGGGGTGGAAAAATG+TGG	-	Chr1:82475338-82475357	MsG0180004769.01.T01:CDS	45.0%
	TGATATGGGGAAATTGTCGG+AGG	-	Chr1:82475974-82475993	MsG0180004769.01.T01:CDS	45.0%
	TGGAGATGGCATTGCAGTTA+TGG	-	Chr1:82475883-82475902	MsG0180004769.01.T01:CDS	45.0%
	TGGAGGAGTTGGACAATAGA+GGG	-	Chr1:82476183-82476202	MsG0180004769.01.T01:CDS	45.0%
	TGGTGTTTACGCTGATGTTC+CGG	-	Chr1:82475608-82475627	MsG0180004769.01.T01:CDS	45.0%
!	GGTGAATGGTGATTTGGAAG+TGG	+	Chr1:82474743-82474762	None:intergenic	45.0%
!!	TGTTATTGGTGGATTGGGGT+TGG	-	Chr1:82475536-82475555	MsG0180004769.01.T01:CDS	45.0%
!!!	GGGTTTGTTTTAGGGTTTCG+GGG	+	Chr1:82474846-82474865	None:intergenic	45.0%
!!!	GGTTTGTTTTAGGGTTTCGG+GGG	+	Chr1:82474845-82474864	None:intergenic	45.0%
	AGATGATTGAGAAGGGGCAG+AGG	-	Chr1:82476015-82476034	MsG0180004769.01.T01:CDS	50.0%
	ATAGAGGGAATGTGCGACAG+AGG	-	Chr1:82476198-82476217	MsG0180004769.01.T01:CDS	50.0%
	GAAGGAAATGGGGGTTGAAC+CGG	-	Chr1:82475389-82475408	MsG0180004769.01.T01:CDS	50.0%
	GCAGTTATGGGATGACATGG+TGG	-	Chr1:82475896-82475915	MsG0180004769.01.T01:CDS	50.0%
	GGAGGCGGAGAAATGTTTCT+TGG	-	Chr1:82475992-82476011	MsG0180004769.01.T01:CDS	50.0%
	GTCCTCAAACGTGTTCGCTT+TGG	-	Chr1:82474910-82474929	MsG0180004769.01.T01:CDS	50.0%
	TAGAGGGAATGTGCGACAGA+GGG	-	Chr1:82476199-82476218	MsG0180004769.01.T01:CDS	50.0%
	TATGGGGAAATTGTCGGAGG+CGG	-	Chr1:82475977-82475996	MsG0180004769.01.T01:CDS	50.0%
	TGTCAAGGGAATAAGCGGTG+TGG	+	Chr1:82474999-82475018	None:intergenic	50.0%
!	AACGTCGTCGTTTGGAGTGA+AGG	+	Chr1:82474788-82474807	None:intergenic	50.0%
!	ACATGGTGGAGAAGGGTTTC+GGG	-	Chr1:82475910-82475929	MsG0180004769.01.T01:CDS	50.0%
!	ATGGGATGACATGGTGGAGA+AGG	-	Chr1:82475902-82475921	MsG0180004769.01.T01:CDS	50.0%
!	GACATGGTGGAGAAGGGTTT+CGG	-	Chr1:82475909-82475928	MsG0180004769.01.T01:CDS	50.0%
!	TGGGATGACATGGTGGAGAA+GGG	-	Chr1:82475903-82475922	MsG0180004769.01.T01:CDS	50.0%
!!	ATTGGTGGATTGGGGTTGGT+TGG	-	Chr1:82475540-82475559	MsG0180004769.01.T01:CDS	50.0%
!!!	TTTTAGGGTTTCGGGGGAAG+AGG	+	Chr1:82474839-82474858	None:intergenic	50.0%
	ACAGAGGGACAAGTGGCCAA+AGG	-	Chr1:82476214-82476233	MsG0180004769.01.T01:CDS	55.0%
	ATGTGCGACAGAGGGACAAG+TGG	-	Chr1:82476207-82476226	MsG0180004769.01.T01:CDS	55.0%
	GCGCGAAAAGGATTTGTCGC+CGG	-	Chr1:82475494-82475513	MsG0180004769.01.T01:CDS	55.0%
	GGCCAAAGCGAACACGTTTG+AGG	+	Chr1:82474915-82474934	None:intergenic	55.0%
	GGGAGCTTCTTATCGAAGCG+CGG	-	Chr1:82475064-82475083	MsG0180004769.01.T01:CDS	55.0%
	TTGGAGTGAAGGTGGAGAGG+CGG	+	Chr1:82474777-82474796	None:intergenic	55.0%
!	CGTTTGGAGTGAAGGTGGAG+AGG	+	Chr1:82474780-82474799	None:intergenic	55.0%
!	GGAAGAGGTGGTGGTGAGAA+TGG	+	Chr1:82474824-82474843	None:intergenic	55.0%
!	GTCGTCGTTTGGAGTGAAGG+TGG	+	Chr1:82474785-82474804	None:intergenic	55.0%
	TAGGGTTTCGGGGGAAGAGG+TGG	+	Chr1:82474836-82474855	None:intergenic	60.0%
	CGGCGGAGGATGGAGGTGAA+TGG	+	Chr1:82474757-82474776	None:intergenic	65.0%
	GAGTGAAGGTGGAGAGGCGG+CGG	+	Chr1:82474774-82474793	None:intergenic	65.0%
	GGTTTCGGGGGAAGAGGTGG+TGG	+	Chr1:82474833-82474852	None:intergenic	65.0%
	TGAAGGTGGAGAGGCGGCGG+AGG	+	Chr1:82474771-82474790	None:intergenic	70.0%
	GGAGAGGCGGCGGAGGATGG+AGG	+	Chr1:82474764-82474783	None:intergenic	75.0%
	GGTGGAGAGGCGGCGGAGGA+TGG	+	Chr1:82474767-82474786	None:intergenic	75.0%

Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
Chr1	gene	82474724	82476283	82474724	ID=MsG0180004769.01;Name=MsG0180004769.01
Chr1	mRNA	82474724	82476283	82474724	ID=MsG0180004769.01.T01;Parent=MsG0180004769.01;Name=MsG0180004769.01.T01;_AED=0.21;_eAED=0.21;_QI=0\|-1\|0\|1\|-1\|1\|1\|0\|519
Chr1	exon	82474724	82476283	82474724	ID=MsG0180004769.01.T01:exon:27303;Parent=MsG0180004769.01.T01
Chr1	CDS	82474724	82476283	82474724	ID=MsG0180004769.01.T01:cds;Parent=MsG0180004769.01.T01

Gene Sequence

>MsG0180004769.01.T01

ATGTTTCTTCGGCATTCCACTTCCAAATCACCATTCACCTCCATCCTCCGCCGCCTCTCCACCTTCACTCCAAACGACGACGTTCACAAAGTCTACACCATTCTCACCACCACCTCTTCCCCCGAAACCCTAAAACAAACCCTAAAATCCACCCAAATTTTCCTCTCCAACGAATTAATCGATCAAGTCCTCAAACGTGTTCGCTTTGGCCATGCAAATCCTAATCAAACCCTTGAATTCTTCCGTTACACTGGCAGAAGAAAAGGCTTTTACCACACCGCTTATTCCCTTGACACAATGCTCTACATTCTCGGTAGAAGCCGCATGTTTGAACATGTTTGGGAGCTTCTTATCGAAGCGCGGCGAAAAGATCAAAATGTGATTACGCCAAGAACTGTTATGGTTGTTTTGGGTAGAGTTGCTAAGGTTTGTTCTGTTAGACAAACGGTTGAAACTTTTAAGAAGTTTAAGAAGATTGTGCCTGATTATGGTGTGAATTGTTTTAATGCGTTGTTGAGAACGCTTTGTCAAGAGAAAAGTATGACTGATGCTAGAAATGTTTATCATAGTTTGAAGCATAATTTTCGTCCGAATTTGCAGACTTTTAATATACTTCTTTCGGGGTGGAAAAATGTGGAAGATGCTGAGTTGTTCGTTAACGAGATGAAGGAAATGGGGGTTGAACCGGATGTTGTAACGTATAATAGTTTGGTGGATGTTTATTGCAAAGGGAGGGAAATTGAGAAAGCGTATAAGGTGTTTGATGAAATGCGCGAAAAGGATTTGTCGCCGGATGTGATTACTTATACTAGTGTTATTGGTGGATTGGGGTTGGTTGGTCAGCCTGATAAAGCTAGAGATGTTTTGAAGGAAATGAAGGAGTATGGTGTTTACGCTGATGTTCCGGCATACAATGCTGCTATCAGAAACTTTTGTATTGCAAAGAGGCTTGGTAGTGCTTATGAATTGATGGATGAGATGGTGAGCAAAGGTTTGAGTCCGAATGCAACTACTTACAATTTGTTCTTCAGGGTTTTTTATTGGTCGAATGATTTACAGAGTTCATGGAACTTATACAAAAGGATGATGGATGAGGGATGCCTTCCGTATACGCAATCTTGTATGTTTTTGATAAGGTTGTTGAAGAGGCATGAAAAGATGGAGATGGCATTGCAGTTATGGGATGACATGGTGGAGAAGGGTTTCGGGTCATATACCTTAGTTTCTGATGTGCTGTTTGACATGCTTTGTGATATGGGGAAATTGTCGGAGGCGGAGAAATGTTTCTTGGAGATGATTGAGAAGGGGCAGAGGCCAAGCAATGTTTCGTTTAAGAGAATCAAGGTTCTTATGGAACTAGCAAATAAACATGAGGCCATTCAGAACTTGACGCAGAAAATGGCAATATTTGGGCGACCACTGCAAGTTCATGAAAGAGTTACTACACCCGTAGAAGAAATGGAGGAGTTGGACAATAGAGGGAATGTGCGACAGAGGGACAAGTGGCCAAAGGAAGAGTCAGAAGAGACACAAGGAATAAGTTCCTTAACTGAATACTAA

Protein sequence

>MsG0180004769.01.T01

MFLRHSTSKSPFTSILRRLSTFTPNDDVHKVYTILTTTSSPETLKQTLKSTQIFLSNELIDQVLKRVRFGHANPNQTLEFFRYTGRRKGFYHTAYSLDTMLYILGRSRMFEHVWELLIEARRKDQNVITPRTVMVVLGRVAKVCSVRQTVETFKKFKKIVPDYGVNCFNALLRTLCQEKSMTDARNVYHSLKHNFRPNLQTFNILLSGWKNVEDAELFVNEMKEMGVEPDVVTYNSLVDVYCKGREIEKAYKVFDEMREKDLSPDVITYTSVIGGLGLVGQPDKARDVLKEMKEYGVYADVPAYNAAIRNFCIAKRLGSAYELMDEMVSKGLSPNATTYNLFFRVFYWSNDLQSSWNLYKRMMDEGCLPYTQSCMFLIRLLKRHEKMEMALQLWDDMVEKGFGSYTLVSDVLFDMLCDMGKLSEAEKCFLEMIEKGQRPSNVSFKRIKVLMELANKHEAIQNLTQKMAIFGRPLQVHERVTTPVEEMEELDNRGNVRQRDKWPKEESEETQGISSLTEY*