AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene052802


Find 167 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 366 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-GE



Chromosome Type Strat End Strand Name
chr4.1 gene 81720018 81726487 81720018 ID=MS.gene052802
chr4.1 mRNA 81720018 81726487 81720018 ID=MS.gene052802.t1;Parent=MS.gene052802
chr4.1 exon 81720018 81720059 81720018 ID=MS.gene052802.t1.exon1;Parent=MS.gene052802.t1
chr4.1 CDS 81720018 81720059 81720018 ID=cds.MS.gene052802.t1;Parent=MS.gene052802.t1
chr4.1 exon 81720830 81720919 81720830 ID=MS.gene052802.t1.exon2;Parent=MS.gene052802.t1
chr4.1 CDS 81720830 81720919 81720830 ID=cds.MS.gene052802.t1;Parent=MS.gene052802.t1
chr4.1 exon 81721178 81721267 81721178 ID=MS.gene052802.t1.exon3;Parent=MS.gene052802.t1
chr4.1 CDS 81721178 81721267 81721178 ID=cds.MS.gene052802.t1;Parent=MS.gene052802.t1
chr4.1 exon 81722809 81722876 81722809 ID=MS.gene052802.t1.exon4;Parent=MS.gene052802.t1
chr4.1 CDS 81722809 81722876 81722809 ID=cds.MS.gene052802.t1;Parent=MS.gene052802.t1
chr4.1 exon 81723369 81724476 81723369 ID=MS.gene052802.t1.exon5;Parent=MS.gene052802.t1
chr4.1 CDS 81723369 81724476 81723369 ID=cds.MS.gene052802.t1;Parent=MS.gene052802.t1
chr4.1 exon 81724570 81724866 81724570 ID=MS.gene052802.t1.exon6;Parent=MS.gene052802.t1
chr4.1 CDS 81724570 81724866 81724570 ID=cds.MS.gene052802.t1;Parent=MS.gene052802.t1
chr4.1 exon 81724976 81726133 81724976 ID=MS.gene052802.t1.exon7;Parent=MS.gene052802.t1
chr4.1 CDS 81724976 81726133 81724976 ID=cds.MS.gene052802.t1;Parent=MS.gene052802.t1
chr4.1 exon 81726419 81726487 81726419 ID=MS.gene052802.t1.exon8;Parent=MS.gene052802.t1
chr4.1 CDS 81726419 81726487 81726419 ID=cds.MS.gene052802.t1;Parent=MS.gene052802.t1
Gene Sequence

>MS.gene052802

ATGGCGTATTTGTCTTCCGGAGCTTCTCCAATAATATATGCTGTAATCTCTGCTTATTGATTTTGAATTTCGTTTCGAATTAATGTTAAAACTTTAAGATTTATCAATGTACACATGTTATTAATTTACAAAGCGTTATCCAACTAAATGGGGTCGGATGTTATTAACTACAAATAAATAAATAAATAATAATTAAGACATATTATGAATCACATTCTTAAAATAAGACGAACTATGTAATTTTTGATTTTAGTTCTATATTGGCAGATATTGTAATTTGTATGAGCTTTAAAGTAAGACAAAAACTTTTTTGTGAACTTTCATATATTCTATGTCTTGCACACTTTAATGTAGGAAATCATTGTATAATAGTTCTAAAGATTTACTTTGCAGAAATCGAAGTAAATATTCATTTTGGTATTTAAATGTGCGATATGTTGTCAATATAGTCTATGAATGAATCAAAATTACCAAATAGTATCTAAATACGTCTTTCATTAGTCAGTATTGTGCAAGTTAGTATGGTCCTTGAATCTACCCTCTATTAGTTAATTTTGTCTATTTTGGAAATTTTGATACATTCAAGACTATTGTGACAACATCGTCTTACACATTTAGAGACCAAAATTACCGTTTATTTACATAAATCATATTTATATTTATGTTTGGTTGGAGTTCAAAGTCAACCATTGGGACTAGAAAAAAAACCCTCCAACTTTTAGCTCAAAGGGATTATGAATAATAAACTTTTATGAGTCTTAACAGCTTAGAATTGCATCTGATTCTGTTTCTATTAATTTGCATTTCCTCAGAGACAATACAGGCATTCTGGAAGTAAGGCATTTCCAGCTGTAACATCTAACTTTGAAATGCTGCCATTATGGGACTCTGGCATAAATCACGTATGTGAGATATGTGCTGCTACTCATCCATTTATACTAATAAAAATTTAGTGAAGTGGTAGAAATGTGCTGCTACTTATTCATTGATCTTAGAATATGTTCATTTCTATAAGATCAACTGCTAATATGAAATCAAAGGAACATATATTTGTTCAAACCTGCTAATTTTTTAATTTGATGATCTGACATCTACATCATTAATTTTATTTTTATGCTTCACTTTTCTTGTTTCAATTAATGCTGTTTTTGCATTTCCAGTTTCATCAGAGAATTTCAAAGCACCGGTTAAACATGTGGACTGTTGCAGGAGTTAAGAAGAAAGAAAGTGTCAATAATACTGTCACAAAGGTGAGTGTTGATTTACTTATACAATTCGACTCTAGTCAAATGATCATATTATATCTGCTAACTCATATTGAATATTTTGTGCTTTTTTTGTCTTTCCATGATGATGGTGATATAAACTGATTAAATATTTGTGTTTGGCGCAACCATTTATCTGCTATCAATGCTTTGTATTCTATTTTTTCCCCTATATTCTATGTTATTACACTTTATTGTACATGAAACTGACTTGATAGAACCTATATTCTAAAAAAGTGTTCTCTGTTTGTTTTCCTGAATTCTATCTATGTTAATCAATAAAGGGAACTAAAACAATAAAAAAAAAAATTATTAGCAAAAGAGAAAGAATTAACTAGTTGAGTACAAGAAATACTGAACTCGAAAGAGTTCCTTATAAATGCAATCAGATGAAACTAGGAAACTAAAAAATCACAAAAACTAAATAAATTATTCTGAATACTATTTCGAAAAGATGAGTAGAATTAATGTTAAATGTACTTGGATCCCACTCTCATAAACTAGCTCATAACATGAGAGTTAACACATAAATACATTACATAACCCAAAAACCATGGCATATGAGACTGAAATACAACTTCAATATAGAATCACAAACACTAACTTAGACCCCCAACTTTTTCTTGGAACCATGGCCAGTATCTATAATCTCAATAAGATCCATCAACTAAAAAAAACACAAGCACCAAAACAATATTATTTATTTCTTAATCAACATCATTTCCATGTAAAGTAACATTTTTTAAAATATAAATTATAACACCTTTACTCGCTTCCTTTGCTTCAAAAAAAAAATTATAACACCTTTATAATATTATACAAAATTAAACTAGAAATAAATGTTAGTATTTTTCTCCTTAACTCCTTTACTCCCTTAGTTCAAATCAATTGAGCTACCCAAACCCCTCCACTATTTTAAGATCTATAATTTTTAATTTTTAAGATGTCAGTGTCATATAAACTTAAATGTGATTTATTACATGGCCAAAAGAATAGCATTACATTTTGTTAATCCAGTAATATTTTTCATTGTTGTTATATTTTGTTTATGTTATAGCCCTAACTCGTATTTATGAAGATTTTACTACATTTTTTTTGTTAATAAGTTGAAGGGTGTACGTGAAAAGAAAATGTCAAACGATGCTCCCCAATCAAAATACGATGTTTTTGTGAACTTTAGGGGTGAAGACATCCGCCACAGCTTTCTTGGGCATTTGGTTAAGGATTTTTCGCGAAAGAAAGTAAATGCCTTTGTAGACAACAAAATTAAGAGGGGAGATGAAATACTACATTCACTTGTTGAAGCAATTAAAGGATCATCCATTTCATTGATCATATTCTCAGAAAACTATGCTTCTTCACATTGGTGTTTAGAGGAGCTTGTGAAAATAATCGAGTGCAAAGAGAAATATGGACAGATTGTAATACCCGTTTTCTATAGGGTGCGTTCTACAGTTGTACGACATCAAAAGGGGAGTTATGAAACTGCACTTAATGAACTTAAAGAAAAGTATACCTCGTCCAAGGTTCAGAATTGGAAACATACTTTGAAGAAATCTACTTATGCGGCAGGAATTAAGTCATCAGAATTTCGGTTAGTTCGTTTCCCCCTATAAATTTTCTGGTAGCAATTTACTTGTCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGTGCATATGCTTATTAATTATATTTCACTTCTTTGTATGGTAGTTAATGCTACAACTCTTTTGTACCGGGATTAATATGAATCTCAGTACTTTGAGGGATTAGTCTCTGAATCTCATTTGGAGATACCATGAGTTCACCAGAACAAAAATTGTTCAGTTGTGATTATTGTTGTTTTAATTTAGGCCAATGTGGTCTGTAATATTGGTTTGTTGGCAGATTATATAGCCGAAACATGTAGGTCACATCACATTCTTAAACCCTTGGTTTGTCCAGCATGGGTGTTGAAAATCTCAATACTAATTTTCAACCATATAAAGTGATAGTAGTGCCATTCATTTTTCTTTCTTTGATTTGATGTATAGGAATGATGCTGAGCTGCTTGAAGAAATCACCAATGTTGTGTTGATGAGTCTGAGTAAGTACCCAGTTAACCCAAAAGGACTTATTGGAATTGACAAACCAATTGCACATTTGAATTCATTGTTAATAAAAGAGTCAGAAAAGGTCCGTGTTATTGGAATTTGGGGTATGGGCGGTATTGGCAAGTCAACTATTGCCGAAGAATTATTAAGCCAAATTCGTTCTGAATATGATGGTTGTTGTTTTTTGGAAAAGGTAAGTAAAAAGTTAAAAAAACATGGAAGGAAACATTTAAAGGAAAACCTTTTTTCTGATCTATTAGCAGAAGAAGTGAAAATTGATACACCAAATAGGTTGTCTAGTGATATTGTGAGACGGGTTGGCCGCATGAAGGTTCTTATTGTTCTTGATGATGTCAAGAATACAAATCTGCTAGAGATGTTATTTGGAACTCTTGATTGGTTTCGATCAGATAGTAGAATAATTGTAACAACTAGAGATAAGCAAGTACTAATTGCCAATGAAGTTGATGATATATACAAGGTTGGGGTATTGAGTTCTAATGAAGCTCTAGAGCTTTTTAATTTAAAGGCCTTCAAACAGAATAATCAACTTCAAATGGAGGAGTACCATAAGCTATCAAAGAGATTTGTCAAATATGCAGGATGCATTCCGCTAGTTCTTGAAATTTTGGGTAGTCATCTTCGTGGAAAAGATAAGGAAGTTTGGGAAAGTCAGTTAGACAAACTTAGTAGGCTGCCAAGTAAAGAAGTTTATCATGTAATGAGGCTCAGTTATGATGATCTTGATCGTTTAGAGAAAAAGTATTTTTTAGATATTGCATGTTTCTTCAATGGGTTGAATTTGAAAGTGGATTACATGAAACTTTTATTGAAAGATCGTGAAGGTGATAATTCAGTGGCTGTTGGGTTAGAAAGGTTGGAAGACAAAGCTCTTATAACTATTTCTGAAGATAATGTTATATCTATGCATGACATTCTACAAGAAATGGGTCGGGAGGTTGTTCGCCAAGAATCTAGTGAAGACCCTAAAAAACGCAGAAGATTATGGGATCCTGATGAAGTTTGTGATGTATTGAAAAATGACAAGGTAAAAAAAAAAGCATTTTTACATAAAATTTGCCATTTTGATTAAAATTGTGGCTTTCAATGATTTTAAATTTCTCTTTTTCATTCGTGATAGGGTACTGATGCTATTAGAAGCATCAGTGTAGACTTGTCATTAGTTAGGGACCTGAAGTTAAGCCCTCATGTATTTACTAAGATGACCAACCTGAAATTTTTGGATTTTCATTGCGGAAACGATCAAGACTGTTTGGATCTTCTTCCTCAAGGGCTTCAATCTTTTCCAACTAATCTAAGATATCTTCATTGGATACATTACCCTCTAAAATCATTGCCAGAGAAGTTTTCTGCTGAGAATCTTGTTATACTGGACTTGTCATATAGCCTAGTAGAAAAGCTTTGGTGTGGAGTGCAGGTAATTAAATACACCCTTCCTTTTCAAATTTCTCTTAATTACTGGATTGAGAAATACTTAATAACTTGAGGTTATGTTTAAGGTCATCAATTTTTTTATTTTGTTTCAGAGTCTGGTTAATTTAAAAGAAGTTATACTCTATAGATCCAAATTACTAAAAGAGCTACCTGACTTTTCAAAAGCTACAAATCTTGAAGTTTTGGATTGCAGTCGTTGTTATCGTTTGAAAAGCATCCACCCATCTATCTTCTCACTTGAGAAGCTTATCATATTGAATCTCGATTTTTGTTCTTCCCTCACCAAATTCATAAGTGATACACGTTTAAGCTCCCTTCATTATCTCAATCTTGGATATTGCAAAAGACTAAGGACATTCTCGGTGACAACAGATAGTTTAATAGAGTTAGATCTAACTGGCATTACCATCAATGCACTGCCATCATCTTTTGGATGTCTTAGCAAGCTAGAAATGTTGGCTTTAGCAGACAGTAAAATTGAGAGCATACCTTCAAGCATAAAAAATCTTGCAAGACTAAGAAAACTAGACTTGAGATTTTGCTCTAAGGTTCTGGTTCTACCTGAACTTCCATCATCGCTAGAATCTGTAATAGCTGAAGGTGAATCGCTGAAGACTGTATTGTTCCCTTCAACAGCTGCAGAACAGTTCAAGGAAAACAAGAAAGGGGTTGAGTTCTGGAATTGCTCGAACTTGGATAAAGGTTCTCTCATAAATATTGGGTTGAATGTTCAAATCAATTTGATCAAGTTTGCATATCAACATTTATCAACATGGGAACACGATGATTATGTTGAAAGCAATGTTGATTACAACTATAACTTTGATTCTAATCAAGCAGTGTATGTGTATCCTGGAAGTAGTGTTCCAGAGTGGTTGGAATACAAGACTACAAAGGATGACATGATTGTTGAAATTTCTCCACCTCATCTCTCCCCTTTGTTGGGATTTGTTTTTTGCTTCATTCTTGCTGAGGACTCCCAATATTGCGACATTATGGAATTTAACATCACTCCATTTGATGGTGAGGGTGACGATGAAAAGGATGGTGTCAATATCTACATCTATAGGACATGTTGCTATACTGAATTAGATCATGTGTGCTTGATATATGACCAACCATGTTCTCACTACCTAACCAGCATAGCAAAAAATCAGACAGAGCTTAAAATCAAGGTCACAGCAAGGACAGTAGCTAATAAATTTAGAGAAAGAACAAAGGTGAAGCTAAAGGGGTTTGGCATCAGCCCCGTAAGTCACACAATATATCGCAATTTCGTTCGGAAAATGGAATTGTTTGATTATATTAACAAATCGAAGAGTACTGTGCTGCTTAGTATCATCCTATGTATTTCCTTACTGCTGCTGAAGATGAAGTTCATTTAGGCACAATATAGTCTGATGTAAGTAACCACGATTAACATTCGAGTTATCAACATTACTTCTTATGCTTAAAATTATAATACACACATATCAAGTGCTTTAAAACACAACTATAAGCAGTCCATTAAAATATATTAGTTTTTTGTTCTGCAGTTTCATGTAGTGGTTGCAGCATTTCCAATATTCGAGGAAGCGTATCAGAAGGGGATTGCAGAAGTATAG

Protein sequence

>MS.gene052802.t1

MAYLSSGASPIIYARQYRHSGSKAFPAVTSNFEMLPLWDSGINHFHQRISKHRLNMWTVAGVKKKESVNNTVTKVQNWKHTLKKSTYAAGIKSSEFRNDAELLEEITNVVLMSLSKYPVNPKGLIGIDKPIAHLNSLLIKESEKVRVIGIWGMGGIGKSTIAEELLSQIRSEYDGCCFLEKVSKKLKKHGRKHLKENLFSDLLAEEVKIDTPNRLSSDIVRRVGRMKVLIVLDDVKNTNLLEMLFGTLDWFRSDSRIIVTTRDKQVLIANEVDDIYKVGVLSSNEALELFNLKAFKQNNQLQMEEYHKLSKRFVKYAGCIPLVLEILGSHLRGKDKEVWESQLDKLSRLPSKEVYHVMRLSYDDLDRLEKKYFLDIACFFNGLNLKVDYMKLLLKDREGDNSVAVGLERLEDKALITISEDNVISMHDILQEMGREVVRQESSEDPKKRRRLWDPDEVCDVLKNDKGTDAIRSISVDLSLVRDLKLSPHVFTKMTNLKFLDFHCGNDQDCLDLLPQGLQSFPTNLRYLHWIHYPLKSLPEKFSAENLVILDLSYSLVEKLWCGVQSLVNLKEVILYRSKLLKELPDFSKATNLEVLDCSRCYRLKSIHPSIFSLEKLIILNLDFCSSLTKFISDTRLSSLHYLNLGYCKRLRTFSVTTDSLIELDLTGITINALPSSFGCLSKLEMLALADSKIESIPSSIKNLARLRKLDLRFCSKVLVLPELPSSLESVIAEGESLKTVLFPSTAAEQFKENKKGVEFWNCSNLDKGSLINIGLNVQINLIKFAYQHLSTWEHDDYVESNVDYNYNFDSNQAVYVYPGSSVPEWLEYKTTKDDMIVEISPPHLSPLLGFVFCFILAEDSQYCDIMEFNITPFDGEGDDEKDGVNIYIYRTCCYTELDHVCLIYDQPCSHYLTSIAKNQTELKIKVTARTVANKFRERTKVKLKGFGISPFHVVVAAFPIFEEAYQKGIAEV