AlfalfaGEDB | MS.gene35021

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene35021

KEGG: K17686
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Nr:

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Swissprot:

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Trembl:

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TFs/TRs:

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Gene ID	Type	Classification
No data available in table

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Protein Kinases:

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No data available in table

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Network:

Co-expression Network:

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Gene1	Gene2	correlation coefficient	p_value	FDR
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Showing 1 to 10 of 165 entries

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PPI:

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Gene1	Gene2	Type
No data available in table

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MS.gene35021.t1	MTR_4g094232	96.934	946	26	1	1	946	1	943	0.0	1863
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MS.gene35021.t1	MTR_3g105190	42.297	714	347	15	129	800	78	768	7.74e-164	498
MS.gene35021.t1	MTR_5g010420	38.846	641	353	8	290	911	347	967	1.67e-126	407
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MS.gene35021.t1	MTR_2g035840	36.364	715	392	17	218	895	272	960	1.68e-118	386
MS.gene35021.t1	MTR_8g012390	37.423	652	364	12	269	896	301	932	6.92e-116	378
MS.gene35021.t1	MTR_4g094695	38.043	644	343	12	287	895	339	961	3.60e-115	377
MS.gene35021.t1	MTR_8g079250	37.002	527	294	9	290	796	353	861	1.54e-87	299
MS.gene35021.t1	MTR_8g012390	35.466	547	309	12	269	791	301	827	7.49e-81	280

Showing 1 to 10 of 39 entries

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MS.gene35021.t1	AT4G33520	70.655	794	223	3	123	913	133	919	0.0	1137
MS.gene35021.t1	AT4G33520	70.529	794	224	3	123	913	133	919	0.0	1134
MS.gene35021.t1	AT5G21930	41.844	846	405	17	130	919	67	881	0.0	610
MS.gene35021.t1	AT5G21930	41.844	846	405	17	130	919	67	881	0.0	610
MS.gene35021.t1	AT5G21930	41.017	846	389	18	130	919	67	858	0.0	582
MS.gene35021.t1	AT5G21930	40.702	769	369	17	130	842	67	804	7.14e-176	531
MS.gene35021.t1	AT1G63440	39.626	641	347	9	290	910	354	974	5.95e-126	406
MS.gene35021.t1	AT5G44790	37.258	671	364	13	261	895	321	970	1.24e-110	365
MS.gene35021.t1	AT4G30110	32.768	531	324	8	332	860	152	651	1.12e-72	259
MS.gene35021.t1	AT4G30110	32.768	531	324	8	332	860	152	651	1.12e-72	259

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Find 232 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 0 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

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CRISPR-Local
sgRNA_sequence	on_target_score	Position	Region
AAAACAGGGACCCTCACGAT+TGG	0.587026	4.4:-20808848	MS.gene35021:CDS
AAACACGACAGTATTTACCA+TGG	0.731349	4.4:+20808874	None:intergenic
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AACAGGTTGGAACTTCTTTG+GGG	0.473835	4.4:-20808946	MS.gene35021:intron
AACCAATCATTTGTCTATGT+TGG	0.405719	4.4:-20806202	MS.gene35021:CDS
AACCTATGTTGAATCTGATC+TGG	0.462021	4.4:-20802021	MS.gene35021:CDS
AACGGCGTAGAAGTACAAGA+GGG	0.727611	4.4:+20818398	None:intergenic
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AAGAAGTCCTGTCATATCAC+TGG	0.537371	4.4:+20812659	None:intergenic

Showing 1 to 10 of 232 entries

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CRISPR-GE

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badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content
No data available in table

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chr4.4	gene	20801986	20818579	20801986	ID=MS.gene35021
chr4.4	mRNA	20801986	20818579	20801986	ID=MS.gene35021.t1;Parent=MS.gene35021
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Gene Sequence

>MS.gene35021

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