AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480022886.01


Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
MsG0480022886.01.T01 MTR_0009s0050 49.128 344 173 2 13 355 6 348 3.78e-120 351
MsG0480022886.01.T01 MTR_0009s0050 49.128 344 173 2 13 355 6 348 6.61e-120 350
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g055680 47.384 344 179 2 13 355 6 348 6.71e-119 348
MsG0480022886.01.T01 MTR_0328s0030 49.387 326 163 2 31 355 22 346 4.37e-118 346
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g048570 47.965 344 175 3 13 355 6 346 3.54e-117 343
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g055900 47.774 337 174 2 20 355 13 348 1.54e-116 342
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g048740 48.930 327 164 3 31 355 22 347 1.96e-116 342
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g055800 49.387 326 162 3 31 355 24 347 1.05e-115 340
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g064200 45.797 345 184 3 13 355 16 359 9.08e-115 338
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g064200 45.797 345 184 3 13 355 11 354 1.12e-114 337
MsG0480022886.01.T01 MTR_0009s0480 48.466 326 166 2 31 355 23 347 1.20e-114 337
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g048470 46.154 338 180 2 20 355 18 355 6.95e-114 335
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g072890 50.915 328 157 3 31 355 29 355 2.89e-113 333
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g072910 49.695 328 161 3 31 355 28 354 1.38e-111 329
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g055820 45.266 338 182 3 20 355 13 349 6.98e-111 327
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g048850 44.957 347 189 2 10 355 3 348 1.78e-110 326
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g048550 45.930 344 184 2 13 355 6 348 4.60e-109 323
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g055690 45.402 348 187 3 10 355 3 349 7.35e-109 322
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g033810 45.342 322 171 4 31 348 23 343 2.31e-96 290
MsG0480022886.01.T01 MTR_0009s0480 50.607 247 120 2 31 276 23 268 1.43e-88 268
MsG0480022886.01.T01 MTR_0009s0050 51.822 247 118 1 110 355 4 250 1.08e-87 265
MsG0480022886.01.T01 MTR_0009s0050 51.822 247 118 1 110 355 4 250 1.33e-87 265
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g063730 38.872 337 205 1 20 355 29 365 6.61e-87 267
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g048850 45.185 270 146 2 10 278 3 271 3.19e-84 257
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g055690 45.725 269 143 3 10 276 3 270 2.33e-83 254
MsG0480022886.01.T01 MTR_0056s0160 48.276 232 119 1 125 355 2 233 7.26e-83 252
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g062570 37.714 350 216 2 7 355 8 356 9.96e-83 256
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g072910 50.000 252 122 3 31 279 28 278 6.64e-82 251
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g437380 39.024 328 190 5 31 351 28 352 6.03e-80 249
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g062600 37.278 338 210 2 20 355 16 353 1.14e-79 248
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g026150 39.359 343 201 5 7 345 12 351 2.32e-79 247
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g062580 36.000 350 222 2 7 355 8 356 3.41e-78 244
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g062550 37.685 337 209 1 20 355 25 361 8.03e-77 241
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g068650 38.806 335 193 4 31 353 26 360 1.06e-76 240
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g015790 37.209 344 195 5 31 353 25 368 1.23e-72 230
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g117420 40.836 311 166 6 55 355 52 354 9.20e-72 227
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g082750 35.542 332 207 3 30 354 24 355 1.28e-71 227
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g062560 34.226 336 212 2 20 355 27 353 1.33e-70 224
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g070860 35.650 331 206 3 31 354 26 356 2.09e-70 224
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g045650 41.026 273 158 3 20 290 25 296 1.75e-68 218
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g074050 39.482 309 173 5 55 355 52 354 9.16e-68 217
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g437380 40.323 248 146 2 106 351 11 258 1.35e-64 206
MsG0480022886.01.T01 MTR_0009s0050 54.762 168 76 0 188 355 1 168 4.19e-63 199
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g074070 36.893 309 181 5 55 355 52 354 4.76e-62 202
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g092890 34.985 323 204 5 31 351 15 333 1.48e-61 201
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g026150 40.408 245 145 1 102 345 4 248 7.02e-61 196
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g059130 37.097 310 187 5 31 335 20 326 5.95e-60 196
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g116010 35.693 339 199 7 30 355 16 348 7.53e-60 196
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g026150 39.051 274 160 5 7 276 12 282 4.75e-59 192
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g069300 34.195 348 203 6 23 355 22 358 8.19e-59 194
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g063180 33.333 333 209 6 31 353 21 350 2.63e-58 192
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g074070 36.513 304 170 5 55 355 52 335 2.06e-56 187
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g059140 35.099 302 186 6 31 325 18 316 3.15e-55 184
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g009110 32.964 361 208 10 11 355 23 365 4.74e-55 184
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g087120 34.591 318 165 8 55 342 26 330 2.73e-54 182
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g102820 34.118 340 195 7 37 355 49 380 3.42e-54 182
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g069190 32.869 359 212 8 11 355 28 371 4.47e-54 182
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g062110 34.561 353 211 10 18 355 26 373 8.96e-54 181
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g069210 32.591 359 213 8 11 355 24 367 1.93e-53 180
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g065010 34.557 327 186 9 43 355 30 342 2.25e-53 179
MsG0480022886.01.T01 MTR_0009s0400 53.472 144 67 0 212 355 1 144 2.67e-53 173
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g009170 33.427 356 214 10 11 355 23 366 4.08e-53 179
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g009160 31.389 360 214 9 11 355 23 364 4.32e-53 179
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g117485 36.770 291 161 5 55 330 49 331 5.88e-53 179
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g069090 32.312 359 215 6 11 355 28 372 9.94e-53 179
MsG0480022886.01.T01 MTR_0032s0040 33.240 358 209 11 11 350 23 368 1.28e-52 178
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g034140 32.710 321 192 9 52 355 24 337 1.55e-52 177
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g072820 35.256 312 192 7 31 336 18 325 1.82e-52 177
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g028435 31.667 360 213 9 11 355 23 364 2.33e-52 177
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g009090 31.638 354 221 8 11 355 23 364 2.54e-52 177
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g072810 35.379 277 173 4 71 342 53 328 5.43e-52 176
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g088565 34.354 294 174 5 54 340 2 283 9.35e-52 174
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g024120 31.402 328 220 5 31 355 18 343 1.03e-51 175
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g087140 32.515 326 190 10 55 355 26 346 2.85e-51 174
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g009080 30.707 368 224 9 3 355 46 397 3.46e-51 175
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g087110 34.915 295 169 8 76 355 54 340 5.20e-51 174
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g093110 29.204 339 219 8 31 355 43 374 6.02e-51 174
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g102570 33.851 322 192 10 31 339 28 341 7.38e-51 174
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g093140 29.738 343 216 7 31 355 43 378 1.45e-50 173
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g093120 30.874 366 229 10 3 355 16 370 2.12e-50 172
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g034120 32.000 300 182 8 73 355 53 347 2.91e-50 172
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g011250 35.144 313 185 8 31 327 19 329 4.00e-50 171
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g034060 32.000 300 182 8 73 355 53 347 5.97e-50 171
MsG0480022886.01.T01 MTR_6g015950 33.754 317 199 6 31 342 16 326 2.33e-49 169
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g048940 30.769 351 217 12 19 355 12 350 2.90e-49 169
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g093840 32.927 328 204 8 38 355 45 366 2.98e-49 169
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g117485 35.878 262 149 4 80 330 6 259 8.06e-49 166
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g069010 33.333 321 183 7 47 348 61 369 1.14e-48 168
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g102720 35.350 314 179 11 53 355 35 335 1.28e-48 167
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g041620 32.791 369 202 13 11 355 28 374 1.76e-48 167
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g105070 29.494 356 228 9 11 355 19 362 1.79e-48 167
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g068960 32.955 352 206 9 4 338 15 353 3.27e-48 167
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g008930 31.268 355 222 8 11 355 23 365 3.34e-48 166
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g032870 32.298 322 201 7 32 342 17 332 8.58e-48 165
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g024660 30.707 368 226 12 3 355 20 373 9.44e-48 166
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g087090 29.641 334 214 9 38 355 16 344 2.71e-47 164
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g070085 32.131 305 185 9 53 345 35 329 4.28e-47 163
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g070085 32.131 305 185 9 53 345 35 329 4.28e-47 163
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g041600 31.405 363 215 11 11 355 28 374 4.94e-47 164
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g068950 31.519 349 215 8 4 338 15 353 5.74e-47 163
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g056347 28.962 366 233 8 4 355 21 373 1.02e-46 163
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g033380 33.546 313 185 7 30 327 32 336 2.22e-46 162
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g096500 30.938 320 205 5 13 320 27 342 5.06e-46 161
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g070135 31.399 293 194 6 54 342 37 326 7.44e-46 160
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g069020 31.476 359 211 10 4 344 19 360 8.86e-46 160
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g025120 29.568 301 201 5 52 347 1 295 1.09e-45 159
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g043900 35.714 308 185 9 53 355 54 353 1.09e-45 159
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g081710 28.212 358 241 8 5 355 3 351 1.33e-45 159
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g062600 30.137 365 216 12 11 355 28 373 1.44e-45 160
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g069020 31.476 359 211 10 4 344 19 360 1.55e-45 160
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g029655 30.495 364 218 10 11 355 23 370 2.68e-45 159
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g091350 32.268 313 190 9 54 354 58 360 3.34e-45 159
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g045230 33.758 314 184 10 53 355 54 354 3.45e-45 158
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g087100 33.224 304 177 8 71 355 49 345 4.15e-45 158
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g117880 32.551 341 202 12 11 338 23 348 8.17e-45 157
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g032140 31.395 344 220 8 11 348 25 358 9.35e-45 157
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g069060 32.817 323 191 10 46 355 40 349 9.68e-45 157
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g070080 32.831 332 201 10 27 350 15 332 2.48e-44 155
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g043810 29.745 353 230 7 11 355 15 357 2.84e-44 156
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g102070 30.267 337 215 7 19 339 26 358 3.37e-44 156
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g016090 31.661 319 202 8 31 342 18 327 5.88e-44 155
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g016090 31.661 319 202 8 31 342 16 325 7.07e-44 154
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g075890 31.776 321 205 8 28 337 13 330 1.69e-43 154
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g043770 31.921 354 219 9 11 355 15 355 2.10e-43 154
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g469400 31.492 362 202 14 11 355 28 360 3.19e-43 153
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g085330 30.742 283 184 4 71 347 22 298 3.75e-43 152
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g091360 31.385 325 204 9 41 354 37 353 3.88e-43 153
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g083370 28.239 301 203 6 52 347 1 293 4.28e-43 152
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g083000 31.469 286 178 5 55 335 33 305 4.32e-43 152
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g088745 33.537 328 191 10 31 339 16 335 5.75e-43 152
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g022020 32.063 315 196 9 35 336 20 329 6.62e-43 152
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g043760 31.250 352 211 11 11 348 15 349 7.65e-43 152
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g115990 33.446 296 172 5 39 330 30 304 8.94e-43 151
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g043775 30.791 354 225 8 11 355 15 357 1.11e-42 152
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g070120 30.034 293 198 6 54 342 37 326 1.32e-42 151
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g058610 31.699 306 197 7 55 354 39 338 1.45e-42 151
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g087130 36.299 281 160 6 76 342 54 329 1.55e-42 151
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g009150 29.752 363 197 11 11 355 23 345 1.92e-42 151
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g081840 32.362 309 192 7 26 322 28 331 3.85e-42 151
MsG0480022886.01.T01 MTR_6g464620 30.267 337 215 8 19 339 31 363 4.45e-42 151
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g451860 33.208 265 160 5 77 337 67 318 7.03e-42 149
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g047670 33.208 265 160 5 77 337 67 318 7.03e-42 149
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g075830 32.234 273 177 4 72 337 59 330 1.02e-41 149
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g032880 29.358 327 214 7 32 351 17 333 1.10e-41 154
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g032880 30.462 325 210 7 29 342 351 670 2.68e-41 153
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g068840 30.278 360 225 12 9 355 15 361 1.30e-41 149
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g119410 29.712 313 204 6 54 355 66 373 1.75e-41 149
MsG0480022886.01.T01 MTR_6g092620 34.629 283 159 8 54 323 2 271 2.95e-41 147
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g032250 30.702 342 223 8 11 347 32 364 3.94e-41 148
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g063070 27.479 353 233 8 11 351 28 369 1.12e-40 147
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g056393 28.767 365 235 10 4 355 21 373 1.64e-40 146
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g006930 29.301 372 224 13 4 355 21 373 3.74e-40 145
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g083030 33.670 297 166 10 53 337 35 312 4.74e-40 144
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g016080 29.573 328 209 8 31 351 16 328 2.24e-39 142
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g078010 30.352 369 224 11 4 355 21 373 3.71e-39 143
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g032220 29.738 343 227 8 11 348 32 365 4.34e-39 142
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g009120 30.220 364 202 12 11 355 23 353 8.41e-39 141
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g005570 32.302 291 173 7 55 337 37 311 2.48e-38 140
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g070185 27.701 361 239 8 3 355 21 367 2.82e-38 140
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g062110 34.228 298 175 11 18 299 26 318 6.33e-38 138
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g019370 30.225 311 192 8 49 344 22 322 9.75e-38 138
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g070085 32.589 224 140 5 127 345 34 251 1.12e-37 136
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g070100 33.333 222 137 5 127 343 30 245 2.11e-37 135
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g011580 30.293 307 200 8 47 350 55 350 7.91e-37 136
MsG0480022886.01.T01 MTR_0009s0410 44.928 138 74 2 31 167 23 159 2.18e-35 127
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g464530 31.365 271 164 6 41 303 23 279 3.70e-35 131
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g074130 27.726 321 211 9 25 335 5 314 1.27e-34 130
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g093930 26.377 345 236 6 6 338 1 339 1.47e-34 130
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g072930 49.593 123 59 2 44 163 40 162 2.34e-33 122
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g056353 33.096 281 160 9 89 354 79 346 4.96e-33 129
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g123020 28.746 327 206 12 42 354 6 319 1.12e-32 124
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g009170 32.517 286 172 9 11 287 23 296 1.34e-32 124
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g086550 28.395 324 198 12 55 355 20 332 2.09e-32 124
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g461330 29.730 296 185 8 77 354 44 334 4.17e-32 123
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g009180 32.051 234 141 4 138 355 63 294 1.23e-31 121
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g025120 29.694 229 151 4 52 276 1 223 2.60e-31 118
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g033270 30.526 285 172 10 74 344 35 307 2.93e-31 120
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g009080 30.508 295 173 11 3 283 46 322 9.31e-31 119
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g041600 30.797 276 169 9 11 276 28 291 8.85e-30 116
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g093980 30.545 275 171 7 77 337 84 352 9.52e-30 117
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g009080 30.389 283 167 9 3 272 46 311 1.13e-29 117
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g070135 31.278 227 149 6 54 276 37 260 1.74e-29 115
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g070870 28.966 290 190 7 74 353 42 325 2.43e-29 115
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g043810 29.630 270 175 6 11 275 15 274 1.58e-28 113
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g096840 27.208 283 191 7 74 344 43 322 4.81e-28 112
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g083370 26.522 230 157 5 52 276 1 223 6.83e-28 109
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g043775 31.502 273 166 9 11 275 15 274 8.30e-28 111
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g068800 29.333 300 165 12 9 294 15 281 1.27e-27 110
MsG0480022886.01.T01 MTR_2g069060 32.922 243 139 8 46 276 18 248 4.63e-27 107
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g464530 29.918 244 149 6 41 276 23 252 5.66e-27 107
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g132770 34.752 141 90 1 205 343 22 162 7.96e-27 104
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g090520 30.159 315 198 8 53 355 8 312 1.46e-26 108
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g100600 30.216 278 174 9 74 335 26 299 1.75e-26 107
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g043770 31.734 271 166 8 11 275 15 272 8.37e-26 105
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g040410 28.938 273 178 9 71 337 27 289 1.87e-25 104
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g070110 29.339 242 134 5 101 341 15 220 6.19e-25 101
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g078010 29.225 284 174 9 4 276 21 288 8.39e-25 102
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g027290 26.398 322 208 10 53 355 27 338 1.90e-24 102
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g102600 29.180 305 166 14 71 342 26 313 1.47e-23 99.8
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g025090 23.856 306 219 6 53 355 3 297 2.35e-23 98.6
MsG0480022886.01.T01 MTR_6g088665 29.720 286 174 9 74 335 38 320 3.17e-23 99.0
MsG0480022886.01.T01 MTR_6g088665 28.920 287 176 8 74 335 38 321 5.76e-23 98.6
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g100590 30.605 281 158 12 77 335 29 294 1.61e-22 96.7
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g030880 26.667 315 206 10 51 353 6 307 4.00e-22 95.9
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g027310 26.367 311 180 9 53 355 47 316 1.46e-20 91.3
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g011720 27.759 299 201 7 53 342 7 299 4.33e-20 89.7
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g043840 30.052 193 121 4 156 335 32 223 2.81e-19 87.8
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g077670 27.036 307 199 10 45 338 1 295 1.09e-18 85.9
MsG0480022886.01.T01 MTR_3g108520 28.674 279 181 9 73 341 33 303 1.19e-18 85.9
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g027230 24.055 291 197 8 53 335 4 278 1.28e-18 85.5
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g025050 26.059 307 199 9 55 351 5 293 1.35e-18 85.5
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g021360 25.166 302 202 10 55 340 7 300 2.86e-17 82.0
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g011690 26.756 299 199 9 55 341 9 299 5.33e-17 80.9
MsG0480022886.01.T01 MTR_5g024940 24.324 296 187 7 53 343 4 267 5.14e-16 77.8
MsG0480022886.01.T01 MTR_6g035160 33.333 165 104 5 180 341 4 165 1.01e-15 74.7
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g100590 30.556 252 138 12 106 335 11 247 3.00e-15 75.1
MsG0480022886.01.T01 MTR_8g102600 28.519 270 143 14 106 342 11 263 7.64e-15 74.3
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g021380 26.087 299 184 10 73 353 33 312 3.83e-14 72.8
MsG0480022886.01.T01 MTR_4g100600 27.014 211 138 8 54 253 8 213 1.32e-12 67.0
MsG0480022886.01.T01 MTR_7g056370 28.276 145 95 3 56 195 47 187 1.02e-11 64.3
MsG0480022886.01.T01 MTR_1g032240 39.785 93 45 3 214 305 63 145 2.24e-11 62.4
Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
MsG0480022886.01.T01 AT1G78550 50.294 340 166 2 19 355 17 356 9.24e-114 335
MsG0480022886.01.T01 AT1G17020 48.256 344 171 4 18 355 16 358 2.16e-113 334
MsG0480022886.01.T01 AT4G25310 54.861 288 125 3 70 355 69 353 1.70e-106 316
MsG0480022886.01.T01 AT4G25300 47.273 330 168 4 31 355 28 356 7.15e-105 312
MsG0480022886.01.T01 AT1G17010 46.512 344 177 5 18 355 16 358 4.24e-104 310
MsG0480022886.01.T01 AT1G78550 53.285 274 127 1 83 355 5 278 1.99e-99 295
MsG0480022886.01.T01 AT4G25310 50.174 287 112 4 70 355 69 325 1.08e-86 265
MsG0480022886.01.T01 AT3G21420 40.751 346 195 6 20 355 17 362 8.65e-84 259
MsG0480022886.01.T01 AT3G11180 37.500 328 198 4 31 351 67 394 1.82e-75 238
MsG0480022886.01.T01 AT3G11180 38.462 312 185 4 31 335 67 378 4.46e-73 232
MsG0480022886.01.T01 AT5G05600 35.976 328 203 3 31 351 38 365 5.34e-73 231
MsG0480022886.01.T01 AT2G38240 35.366 328 206 4 31 353 23 349 2.90e-72 229
MsG0480022886.01.T01 AT3G55970 36.795 337 201 7 30 354 24 360 7.93e-71 225
MsG0480022886.01.T01 AT1G49390 36.637 333 202 6 30 355 18 348 5.37e-67 215
MsG0480022886.01.T01 AT5G20400 35.942 345 209 7 19 355 8 348 8.07e-67 214
MsG0480022886.01.T01 AT5G54000 36.888 347 208 6 17 355 6 349 5.68e-66 212
MsG0480022886.01.T01 AT5G20550 37.168 339 188 9 20 341 9 339 6.12e-63 204
MsG0480022886.01.T01 AT5G54000 38.376 271 163 3 87 355 1 269 2.86e-59 192
MsG0480022886.01.T01 AT4G25300 50.526 190 93 1 167 355 73 262 3.31e-59 192
MsG0480022886.01.T01 AT1G49390 37.079 267 164 3 87 351 1 265 6.68e-59 191
MsG0480022886.01.T01 AT4G16330 34.967 306 184 6 54 353 66 362 3.65e-58 192
MsG0480022886.01.T01 AT3G19000 35.260 346 196 12 29 351 1 341 5.63e-55 184
MsG0480022886.01.T01 AT1G06640 32.533 375 213 12 3 355 13 369 9.75e-55 184
MsG0480022886.01.T01 AT3G13610 33.333 372 216 13 1 355 5 361 2.62e-54 182
MsG0480022886.01.T01 AT5G24530 32.515 326 211 6 31 351 15 336 5.51e-54 181
MsG0480022886.01.T01 AT5G59540 32.597 362 212 11 11 355 20 366 6.88e-54 181
MsG0480022886.01.T01 AT3G19010 33.542 319 190 7 50 351 23 336 2.53e-53 179
MsG0480022886.01.T01 AT3G19010 33.542 319 190 7 50 351 23 336 2.53e-53 179
MsG0480022886.01.T01 AT1G06650 31.452 372 221 13 3 355 13 369 8.25e-53 179
MsG0480022886.01.T01 AT5G08640 34.505 313 195 6 30 336 18 326 1.33e-52 177
MsG0480022886.01.T01 AT5G08640 34.505 313 195 6 30 336 18 326 1.33e-52 177
MsG0480022886.01.T01 AT1G55290 35.119 336 196 13 31 355 37 361 1.87e-52 177
MsG0480022886.01.T01 AT1G06620 31.319 364 211 8 11 355 22 365 3.91e-52 177
MsG0480022886.01.T01 AT5G59530 33.058 363 198 12 16 355 24 364 2.12e-51 175
MsG0480022886.01.T01 AT1G04380 32.268 313 190 5 54 355 44 345 3.79e-51 174
MsG0480022886.01.T01 AT1G77330 36.462 277 148 7 54 315 2 265 5.02e-51 172
MsG0480022886.01.T01 AT2G36690 32.440 336 212 8 31 355 32 363 3.28e-50 172
MsG0480022886.01.T01 AT2G36690 32.440 336 212 8 31 355 32 363 3.28e-50 172
MsG0480022886.01.T01 AT1G04350 31.215 362 214 9 11 355 17 360 6.62e-50 171
MsG0480022886.01.T01 AT5G43440 33.439 314 188 8 54 355 61 365 1.91e-49 170
MsG0480022886.01.T01 AT4G22880 33.648 318 188 9 29 327 16 329 3.75e-49 169
MsG0480022886.01.T01 AT4G22880 33.648 318 188 9 29 327 16 329 3.75e-49 169
MsG0480022886.01.T01 AT4G22880 33.648 318 188 9 29 327 16 329 3.75e-49 169
MsG0480022886.01.T01 AT4G10500 30.000 330 225 6 29 354 18 345 1.32e-48 167
MsG0480022886.01.T01 AT3G55970 37.066 259 151 7 30 276 24 282 1.92e-48 166
MsG0480022886.01.T01 AT1G06645 29.508 366 233 9 3 355 26 379 2.10e-48 167
MsG0480022886.01.T01 AT1G03410 32.329 365 225 10 3 355 7 361 2.83e-48 167
MsG0480022886.01.T01 AT1G03410 32.329 365 225 10 3 355 44 398 5.57e-48 167
MsG0480022886.01.T01 AT1G03400 32.203 354 213 9 3 346 7 343 9.19e-48 165
MsG0480022886.01.T01 AT4G10490 29.179 329 226 6 31 354 18 344 2.82e-47 164
MsG0480022886.01.T01 AT4G16330 36.078 255 152 5 105 353 7 256 2.98e-47 161
MsG0480022886.01.T01 AT5G43450 30.726 358 211 11 16 355 24 362 4.90e-47 163
MsG0480022886.01.T01 AT3G61400 31.903 373 218 14 4 355 13 370 7.28e-47 163
MsG0480022886.01.T01 AT5G05600 33.202 253 162 3 31 276 38 290 9.40e-47 160
MsG0480022886.01.T01 AT2G30830 31.302 361 204 12 16 355 21 358 1.24e-46 162
MsG0480022886.01.T01 AT5G07200 30.564 337 211 8 22 339 28 360 1.15e-45 160
MsG0480022886.01.T01 AT4G25420 32.432 333 205 10 28 345 37 364 1.23e-45 160
MsG0480022886.01.T01 AT3G19010 31.975 319 165 8 50 351 23 306 2.83e-45 157
MsG0480022886.01.T01 AT1G12010 28.716 296 199 5 56 347 8 295 1.22e-44 156
MsG0480022886.01.T01 AT2G30840 29.679 374 223 12 3 355 8 362 1.63e-44 157
MsG0480022886.01.T01 AT1G05010 30.844 308 192 7 52 347 1 299 2.96e-44 155
MsG0480022886.01.T01 AT1G15550 32.990 291 179 9 53 335 55 337 4.26e-44 155
MsG0480022886.01.T01 AT3G60290 29.787 329 207 9 37 354 38 353 6.68e-44 155
MsG0480022886.01.T01 AT2G44800 29.012 324 218 7 30 344 23 343 3.81e-43 153
MsG0480022886.01.T01 AT2G19590 35.531 273 157 7 55 319 11 272 3.96e-43 152
MsG0480022886.01.T01 AT4G21200 32.997 297 184 6 55 344 42 330 6.72e-43 152
MsG0480022886.01.T01 AT1G60980 30.312 353 216 9 9 345 23 361 9.24e-43 152
MsG0480022886.01.T01 AT1G62380 29.514 288 191 5 56 339 8 287 1.17e-42 151
MsG0480022886.01.T01 AT1G03400 29.843 382 213 10 3 346 7 371 6.38e-42 150
MsG0480022886.01.T01 AT3G51240 32.000 275 182 4 73 344 59 331 3.90e-41 148
MsG0480022886.01.T01 AT2G30840 29.412 374 218 13 3 355 8 356 5.44e-41 147
MsG0480022886.01.T01 AT5G51810 31.269 323 201 9 31 339 42 357 2.25e-40 146
MsG0480022886.01.T01 AT1G80340 29.532 342 219 12 3 335 2 330 4.50e-40 145
MsG0480022886.01.T01 AT3G12900 30.699 329 217 7 31 354 33 355 7.39e-40 144
MsG0480022886.01.T01 AT1G78440 31.475 305 185 9 55 345 18 312 1.11e-39 143
MsG0480022886.01.T01 AT5G63590 33.448 290 178 8 55 335 14 297 1.24e-39 142
MsG0480022886.01.T01 AT5G07480 29.651 344 210 13 31 355 24 354 6.45e-39 142
MsG0480022886.01.T01 AT1G50960 31.752 274 171 5 49 312 30 297 1.70e-38 140
MsG0480022886.01.T01 AT1G80330 29.712 313 200 8 33 335 31 333 5.72e-38 139
MsG0480022886.01.T01 AT4G21690 31.636 275 172 6 74 335 61 332 1.06e-37 138
MsG0480022886.01.T01 AT3G19000 32.472 271 158 11 29 276 1 269 3.34e-37 135
MsG0480022886.01.T01 AT2G19590 35.000 240 144 5 84 319 26 257 3.65e-37 135
MsG0480022886.01.T01 AT5G63600 29.329 283 192 5 55 335 33 309 2.66e-36 134
MsG0480022886.01.T01 AT3G49620 34.848 264 140 7 73 314 63 316 8.33e-36 134
MsG0480022886.01.T01 AT2G25450 28.108 370 231 12 3 355 8 359 8.75e-36 134
MsG0480022886.01.T01 AT5G63600 29.577 284 191 6 55 335 33 310 8.88e-36 133
MsG0480022886.01.T01 AT3G19010 32.389 247 144 7 50 277 23 265 8.86e-35 129
MsG0480022886.01.T01 AT1G44090 32.573 307 183 9 31 322 43 340 9.29e-35 131
MsG0480022886.01.T01 AT1G06640 31.959 291 162 10 3 275 13 285 1.72e-34 129
MsG0480022886.01.T01 AT1G06640 31.849 292 163 10 3 276 13 286 1.82e-34 128
MsG0480022886.01.T01 AT2G34555 29.310 290 187 8 55 335 27 307 1.92e-34 129
MsG0480022886.01.T01 AT1G47990 28.571 308 192 11 53 344 13 308 1.15e-33 127
MsG0480022886.01.T01 AT4G25420 32.184 261 160 9 28 276 37 292 2.36e-33 125
MsG0480022886.01.T01 AT1G02400 29.487 312 195 12 49 345 18 319 5.14e-33 125
MsG0480022886.01.T01 AT1G30040 27.063 303 200 10 53 344 29 321 1.79e-32 124
MsG0480022886.01.T01 AT1G06650 29.592 294 177 11 3 281 13 291 2.69e-32 123
MsG0480022886.01.T01 AT3G49630 30.769 299 164 9 49 314 3 291 4.44e-32 123
MsG0480022886.01.T01 AT3G50210 30.976 297 165 9 52 314 5 295 1.45e-31 122
MsG0480022886.01.T01 AT3G50210 30.976 297 165 9 52 314 5 295 1.45e-31 122
MsG0480022886.01.T01 AT3G50210 30.976 297 165 9 52 314 5 295 1.45e-31 122
MsG0480022886.01.T01 AT3G51240 33.023 215 140 3 105 316 7 220 1.85e-31 120
MsG0480022886.01.T01 AT3G49630 31.579 266 150 7 71 314 32 287 3.66e-31 120
MsG0480022886.01.T01 AT1G06620 30.249 281 160 7 11 275 22 282 6.40e-31 119
MsG0480022886.01.T01 AT5G43440 33.761 234 137 7 54 278 61 285 2.40e-30 117
MsG0480022886.01.T01 AT1G04380 31.330 233 141 4 54 278 44 265 4.01e-30 116
MsG0480022886.01.T01 AT5G51810 31.274 259 161 8 31 279 42 293 6.07e-30 116
MsG0480022886.01.T01 AT5G12270 29.932 294 189 8 73 355 72 359 6.54e-30 117
MsG0480022886.01.T01 AT5G59540 30.357 280 166 10 11 276 20 284 3.48e-29 114
MsG0480022886.01.T01 AT3G61400 30.690 290 170 11 4 276 13 288 7.97e-29 113
MsG0480022886.01.T01 AT5G07480 30.332 211 137 4 153 355 37 245 2.31e-28 111
MsG0480022886.01.T01 AT5G43450 29.670 273 158 10 18 275 26 279 8.15e-28 110
MsG0480022886.01.T01 AT5G63595 28.253 269 169 6 43 309 13 259 1.28e-27 110
MsG0480022886.01.T01 AT5G43935 28.667 300 179 9 42 335 12 282 1.71e-27 110
MsG0480022886.01.T01 AT4G23340 33.103 290 158 11 77 347 30 302 2.61e-26 107
MsG0480022886.01.T01 AT2G30840 27.835 291 173 10 3 275 8 279 5.11e-26 106
MsG0480022886.01.T01 AT3G46500 29.856 278 176 9 74 335 34 308 2.38e-25 104
MsG0480022886.01.T01 AT3G47190 29.242 277 145 9 55 303 32 285 6.38e-25 103
MsG0480022886.01.T01 AT5G63580 29.018 224 151 6 53 272 17 236 4.88e-23 96.7
MsG0480022886.01.T01 AT5G63580 29.018 224 151 6 53 272 17 236 5.29e-23 96.7
MsG0480022886.01.T01 AT3G46500 31.301 246 150 9 74 303 34 276 3.99e-22 95.5
MsG0480022886.01.T01 AT1G52820 29.139 302 194 10 51 341 9 301 5.26e-22 95.5
MsG0480022886.01.T01 AT1G30040 27.660 235 149 9 53 276 29 253 2.89e-21 92.4
MsG0480022886.01.T01 AT1G14130 25.753 299 200 9 55 345 9 293 6.07e-20 89.4
MsG0480022886.01.T01 AT3G50210 33.939 165 103 3 156 314 49 213 6.92e-20 88.2
MsG0480022886.01.T01 AT3G49630 33.544 158 102 3 159 314 62 218 1.19e-19 87.8
MsG0480022886.01.T01 AT1G02400 27.344 256 166 10 49 292 18 265 5.26e-19 85.9
MsG0480022886.01.T01 AT5G58660 26.490 302 166 10 45 303 14 302 7.93e-19 87.0
MsG0480022886.01.T01 AT3G46490 26.498 317 201 8 48 335 2 315 8.41e-19 86.7
MsG0480022886.01.T01 AT4G16765 32.178 202 122 7 151 340 42 240 3.32e-18 83.6
MsG0480022886.01.T01 AT4G16765 32.178 202 122 7 151 340 42 240 3.32e-18 83.6
MsG0480022886.01.T01 AT4G16765 32.178 202 122 7 151 340 42 240 3.32e-18 83.6
MsG0480022886.01.T01 AT3G46490 27.336 289 178 8 48 307 2 287 4.53e-18 84.0
MsG0480022886.01.T01 AT1G14120 26.452 310 206 9 54 355 7 302 7.29e-18 83.6
MsG0480022886.01.T01 AT1G14120 26.452 310 206 9 54 355 7 302 7.29e-18 83.6
MsG0480022886.01.T01 AT1G14120 26.452 310 206 9 54 355 7 302 7.29e-18 83.6
MsG0480022886.01.T01 AT4G23340 35.838 173 98 5 180 347 20 184 1.12e-17 80.9
MsG0480022886.01.T01 AT1G35190 30.980 255 123 12 74 303 29 255 5.95e-17 80.9
MsG0480022886.01.T01 AT4G16765 31.884 207 114 9 151 345 42 233 2.25e-16 77.8
MsG0480022886.01.T01 AT1G35190 30.739 257 144 11 74 303 29 278 5.71e-16 78.2
MsG0480022886.01.T01 AT1G52800 25.869 259 174 9 77 328 38 285 7.80e-16 77.8
MsG0480022886.01.T01 AT1G28030 27.703 296 197 11 45 328 3 293 3.09e-15 76.3
MsG0480022886.01.T01 AT4G16770 28.216 241 150 10 47 269 14 249 1.07e-13 70.9
MsG0480022886.01.T01 AT5G58660 25.357 280 152 10 45 282 14 278 1.49e-13 70.5
MsG0480022886.01.T01 AT4G03070 26.797 306 188 12 55 339 14 304 1.80e-13 70.9
MsG0480022886.01.T01 AT4G22870 42.857 84 47 1 245 327 2 85 2.76e-13 66.2
MsG0480022886.01.T01 AT4G16765 35.833 120 70 3 226 340 77 194 7.17e-13 67.4
MsG0480022886.01.T01 AT3G46500 26.842 190 126 6 170 351 1 185 1.49e-12 66.2
MsG0480022886.01.T01 AT4G22870 40.230 87 48 2 245 327 40 126 9.52e-12 62.8

Find 71 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 123 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTCCTTCATATCTATCTTTA+TGG 0.119474 4:+78085646 None:intergenic
TCCAATTTCTGCTTCAAATT+TGG 0.136100 4:+78084829 None:intergenic
ACCAAATTTGAAGCAGAAAT+TGG 0.176209 4:-78084830 MsG0480022886.01.T01:CDS
GAGAGCACTCATTCAATTCT+TGG 0.207479 4:-78086605 MsG0480022886.01.T01:CDS
AGAATTGAGGGTTCTTTATC+TGG 0.219371 4:+78086524 None:intergenic
CATTTCTGGTATTCCCATTT+CGG 0.225004 4:+78086556 None:intergenic
ACCATCCTTAATCAGCTTAA+TGG 0.230605 4:-78085509 MsG0480022886.01.T01:CDS
TCTGGGCGAAGAAACATTTC+TGG 0.234498 4:+78086542 None:intergenic
CAACTCCATTAAGCTGATTA+AGG 0.246921 4:+78085504 None:intergenic
TCATTCAATTCTTGGTGTTA+TGG 0.254788 4:-78086597 MsG0480022886.01.T01:CDS
AGATTAAGAAAGATGGAGTT+TGG 0.278559 4:-78085472 MsG0480022886.01.T01:CDS
CAAAGATTGGGGTTTCTTCC+AGG 0.305283 4:-78086402 MsG0480022886.01.T01:intron
ATTTCTGGTATTCCCATTTC+GGG 0.313699 4:+78086557 None:intergenic
TTTGTTCAAAAGCATGTTGA+TGG 0.327425 4:-78084771 MsG0480022886.01.T01:CDS
TGTGGCTTTCTTCTTGCAAT+AGG 0.330734 4:+78085947 None:intergenic
GAACTTATCAAACTCTTTGC+TGG 0.345699 4:+78084806 None:intergenic
CATCGACAAGCTCCGGTTGC+GGG 0.347018 4:+78085564 None:intergenic
AGTGATTAATAAACCCGAAA+TGG 0.356205 4:-78086570 MsG0480022886.01.T01:CDS
TATTCTCAGCATGCAAAGAT+TGG 0.378321 4:-78086415 MsG0480022886.01.T01:CDS
ATGATGGCAATCAATCAATA+AGG 0.380789 4:-78085607 MsG0480022886.01.T01:CDS
ATTCTCAGCATGCAAAGATT+GGG 0.402514 4:-78086414 MsG0480022886.01.T01:CDS
GTTTCATTTGTTAGAATTGA+GGG 0.407447 4:+78086512 None:intergenic
ACAAGCTCCGGTTGCGGGCA+TGG 0.426562 4:+78085569 None:intergenic
GGACTAGAGATTAAGAAAGA+TGG 0.432535 4:-78085479 MsG0480022886.01.T01:CDS
TGGAATTGTTTGCAAGGGAT+TGG 0.432753 4:+78086490 None:intergenic
CTATCCGCCATGCCCGCAAC+CGG 0.448538 4:-78085576 MsG0480022886.01.T01:CDS
GGTTTCATTTGTTAGAATTG+AGG 0.451727 4:+78086511 None:intergenic
AATCAGCTTAATGGAGTTGA+AGG 0.457519 4:-78085500 MsG0480022886.01.T01:CDS
GATAAGCACCTTAGTGATGA+TGG 0.459040 4:+78085908 None:intergenic
GTGATTAATAAACCCGAAAT+GGG 0.460139 4:-78086569 MsG0480022886.01.T01:CDS
ATATTAACTACAAAAGCATC+TGG 0.461880 4:+78085431 None:intergenic
AGTAGTGTCACCACATATCA+AGG 0.464874 4:+78086451 None:intergenic
ATCTTAGAATTGAAGAAACT+TGG 0.471265 4:-78085698 MsG0480022886.01.T01:CDS
GAATTGAGGGTTCTTTATCT+GGG 0.475454 4:+78086525 None:intergenic
TACAAAAGCATCTGGAAGAA+AGG 0.481736 4:+78085439 None:intergenic
ATGCCGGAGCCGTCGGAGTG+AGG 0.487266 4:+78085533 None:intergenic
TCTAAATGGGAAGACAAACT+TGG 0.498065 4:-78084717 MsG0480022886.01.T01:CDS
AATCAACATGGCATCATCTC+AGG 0.499386 4:-78086642 None:intergenic
AGCCATAAAGATAGATATGA+AGG 0.506134 4:-78085648 MsG0480022886.01.T01:CDS
AACCCTCACTCCGACGGCTC+CGG 0.507522 4:-78085536 MsG0480022886.01.T01:CDS
AGTTAATATTGGAGACATCA+TGG 0.510828 4:-78085417 MsG0480022886.01.T01:CDS
TGCCGGAGCCGTCGGAGTGA+GGG 0.514870 4:+78085534 None:intergenic
GACTTTCAAACCTTGATATG+TGG 0.523264 4:-78086461 MsG0480022886.01.T01:CDS
CCATCGACAAGCTCCGGTTG+CGG 0.523575 4:+78085563 None:intergenic
CTGATTAAGGATGGTTATGC+CGG 0.526310 4:+78085517 None:intergenic
GTAGAGAATATGTTTGATGA+TGG 0.535170 4:-78085623 MsG0480022886.01.T01:CDS
AGACAAACTTGGAGAGGATG+AGG 0.539827 4:-78084706 MsG0480022886.01.T01:CDS
GGTTTCAGTAAACAAAGAAA+AGG 0.544690 4:-78084882 MsG0480022886.01.T01:CDS
GATGGTTATGCCGGAGCCGT+CGG 0.550223 4:+78085526 None:intergenic
AAAACTGGAATTGTTTGCAA+GGG 0.550609 4:+78086485 None:intergenic
TTGATGCCATCGACAAGCTC+CGG 0.550885 4:+78085557 None:intergenic
TCCATTAAGCTGATTAAGGA+TGG 0.551241 4:+78085508 None:intergenic
CTCAACTCCCATCATCACTA+AGG 0.551331 4:-78085916 MsG0480022886.01.T01:intron
TCTACTCTAGCATAGAGCAC+AGG 0.552312 4:-78084904 MsG0480022886.01.T01:CDS
GCATATGTGAAGGGATACCT+TGG 0.558232 4:-78085729 MsG0480022886.01.T01:intron
TTCTCAGCATGCAAAGATTG+GGG 0.568244 4:-78086413 MsG0480022886.01.T01:CDS
CTTAGTGATGATGGGAGTTG+AGG 0.569423 4:+78085917 None:intergenic
CCGCAACCGGAGCTTGTCGA+TGG 0.579043 4:-78085563 MsG0480022886.01.T01:CDS
GGAGCTGTCATTAGATGTGA+AGG 0.581827 4:-78086013 MsG0480022886.01.T01:CDS
TTCTAAGATATATGACTCCA+AGG 0.586022 4:+78085712 None:intergenic
ATAAGCACCTTAGTGATGAT+GGG 0.587837 4:+78085909 None:intergenic
TATATGCAGGTGGTGAATCA+CGG 0.608081 4:-78086148 MsG0480022886.01.T01:intron
GCATCTGGAAGAAAGGTCAC+AGG 0.608787 4:+78085446 None:intergenic
CTACTCTAGCATAGAGCACA+GGG 0.608995 4:-78084903 MsG0480022886.01.T01:CDS
ATGGGAAGACAAACTTGGAG+AGG 0.618024 4:-78084712 MsG0480022886.01.T01:CDS
GGCATCAACCCTCACTCCGA+CGG 0.622191 4:-78085542 MsG0480022886.01.T01:CDS
AGCTCCGGTTGCGGGCATGG+CGG 0.640748 4:+78085572 None:intergenic
CAACATGGCATCATCTCAGG+TGG 0.641861 4:-78086639 None:intergenic
TTTACAGATTCTAAGCAATG+GGG 0.672405 4:-78084927 MsG0480022886.01.T01:intron
ACAAAATACAAAATAAGACA+AGG 0.680547 4:-78086052 MsG0480022886.01.T01:CDS
TAATATTGGAGACATCATGG+AGG 0.754731 4:-78085414 MsG0480022886.01.T01:intron

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATAATATATAGTATCTAATT+AGG + Chr4:78085563-78085582 None:intergenic 10.0%
!! AGTTGAATAAAAATTACATA+TGG + Chr4:78085512-78085531 None:intergenic 15.0%
!! ATTTATATAATAGGTATAGT+AGG + Chr4:78086035-78086054 None:intergenic 15.0%
!!! ATTTCTTGAAAAAAAGTATT+TGG + Chr4:78086599-78086618 None:intergenic 15.0%
!!! GTTTTTGCATTTTTTTTTTA+TGG - Chr4:78085133-78085152 MsG0480022886.01.T01:intron 15.0%
!!! TTATCTTTTTGATACAATAA+TGG + Chr4:78086131-78086150 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTTTCAAGAAATCTAAAT+GGG - Chr4:78086605-78086624 MsG0480022886.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTTTTTTCAAGAAATCTAAA+TGG - Chr4:78086604-78086623 MsG0480022886.01.T01:CDS 15.0%
!! ACAAAATACAAAATAAGACA+AGG - Chr4:78085283-78085302 MsG0480022886.01.T01:intron 20.0%
!!! ATATCTTTAACTCATGTTTT+GGG - Chr4:78086381-78086400 MsG0480022886.01.T01:intron 20.0%
!!! ATGACACTTTTTGAATTATT+GGG - Chr4:78085661-78085680 MsG0480022886.01.T01:CDS 20.0%
!!! CAATAAAAAATGTGCTATTT+AGG + Chr4:78086216-78086235 None:intergenic 20.0%
!!! CTAAATAGCACATTTTTTAT+TGG - Chr4:78086214-78086233 MsG0480022886.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTAATAACTCTCTTCTTA+GGG - Chr4:78086280-78086299 MsG0480022886.01.T01:intron 20.0%
! AAATTGATGCAATTATATGC+AGG - Chr4:78085174-78085193 MsG0480022886.01.T01:intron 25.0%
! ATCTTAGAATTGAAGAAACT+TGG - Chr4:78085637-78085656 MsG0480022886.01.T01:CDS 25.0%
! CTAAGAAGAGAGTTATTAAA+AGG + Chr4:78086281-78086300 None:intergenic 25.0%
! CTTAGGGTTTCATTAAAAAA+TGG - Chr4:78086296-78086315 MsG0480022886.01.T01:intron 25.0%
! TGAACTCTAATTTATAAACC+TGG + Chr4:78084954-78084973 None:intergenic 25.0%
! TGTAATAATGGCATTATTTG+TGG - Chr4:78086174-78086193 MsG0480022886.01.T01:intron 25.0%
! TTCCTTCATATCTATCTTTA+TGG + Chr4:78085692-78085711 None:intergenic 25.0%
!! ATTTTACAGATTCTAAGCAA+TGG - Chr4:78086406-78086425 MsG0480022886.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTTTTGTATGCATATGTGA+AGG - Chr4:78085596-78085615 MsG0480022886.01.T01:CDS 25.0%
!! CATATCTTTAACTCATGTTT+TGG - Chr4:78086380-78086399 MsG0480022886.01.T01:intron 25.0%
!! CTTTTAATAACTCTCTTCTT+AGG - Chr4:78086279-78086298 MsG0480022886.01.T01:intron 25.0%
!! GATGCTTTTGTAGTTAATAT+TGG - Chr4:78085907-78085926 MsG0480022886.01.T01:intron 25.0%
!! GTTTCATTTGTTAGAATTGA+GGG + Chr4:78084826-78084845 None:intergenic 25.0%
!! TTTTACAGATTCTAAGCAAT+GGG - Chr4:78086407-78086426 MsG0480022886.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTTTGTATGCATATGTGAA+GGG - Chr4:78085597-78085616 MsG0480022886.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATATTAACTACAAAAGCATC+TGG + Chr4:78085907-78085926 None:intergenic 25.0%
!!! CATGACACTTTTTGAATTAT+TGG - Chr4:78085660-78085679 MsG0480022886.01.T01:CDS 25.0%
!!! TATTTTGTTTTCTCTTCAAC+AGG + Chr4:78085271-78085290 None:intergenic 25.0%
AAAAACTGGAATTGTTTGCA+AGG + Chr4:78084854-78084873 None:intergenic 30.0%
AAAACTGGAATTGTTTGCAA+GGG + Chr4:78084853-78084872 None:intergenic 30.0%
AAGGTTTGAAAGTCAAAAAC+TGG + Chr4:78084868-78084887 None:intergenic 30.0%
ACAGGAAGCTTGAAAAAATT+TGG + Chr4:78085253-78085272 None:intergenic 30.0%
AGATTAAGAAAGATGGAGTT+TGG - Chr4:78085863-78085882 MsG0480022886.01.T01:intron 30.0%
AGCCATAAAGATAGATATGA+AGG - Chr4:78085687-78085706 MsG0480022886.01.T01:CDS 30.0%
AGTGATTAATAAACCCGAAA+TGG - Chr4:78084765-78084784 MsG0480022886.01.T01:CDS 30.0%
AGTTAATATTGGAGACATCA+TGG - Chr4:78085918-78085937 MsG0480022886.01.T01:CDS 30.0%
ATGATGGCAATCAATCAATA+AGG - Chr4:78085728-78085747 MsG0480022886.01.T01:intron 30.0%
CATGTGTTATGGTGTAATAA+TGG - Chr4:78086162-78086181 MsG0480022886.01.T01:intron 30.0%
GAGTTATTAAAAGGAAGATG+AGG + Chr4:78086272-78086291 None:intergenic 30.0%
GGTTTCAGTAAACAAAGAAA+AGG - Chr4:78086453-78086472 MsG0480022886.01.T01:CDS 30.0%
GTAGAGAATATGTTTGATGA+TGG - Chr4:78085712-78085731 MsG0480022886.01.T01:CDS 30.0%
GTGATTAATAAACCCGAAAT+GGG - Chr4:78084766-78084785 MsG0480022886.01.T01:CDS 30.0%
TCCAATTTCTGCTTCAAATT+TGG + Chr4:78086509-78086528 None:intergenic 30.0%
TGAAGGTCAAAAACTTGATT+GGG - Chr4:78085339-78085358 MsG0480022886.01.T01:intron 30.0%
TGTGTACAAATTAAGTTCTC+TGG - Chr4:78085097-78085116 MsG0480022886.01.T01:intron 30.0%
TTATTACACCATAACACATG+TGG + Chr4:78086162-78086181 None:intergenic 30.0%
TTTACAGATTCTAAGCAATG+GGG - Chr4:78086408-78086427 MsG0480022886.01.T01:CDS 30.0%
! ACCAAATTTGAAGCAGAAAT+TGG - Chr4:78086505-78086524 MsG0480022886.01.T01:CDS 30.0%
! ATAAGACAAGGAGATTTTCA+AGG - Chr4:78085295-78085314 MsG0480022886.01.T01:intron 30.0%
! ATCAACATGCTTTTGAACAA+AGG + Chr4:78086565-78086584 None:intergenic 30.0%
! CTATTTAGGAGCATATTGAA+TGG + Chr4:78086202-78086221 None:intergenic 30.0%
! GGTTTCATTTGTTAGAATTG+AGG + Chr4:78084827-78084846 None:intergenic 30.0%
! TAGTATTTTCAATGAGTCGT+GGG - Chr4:78086092-78086111 MsG0480022886.01.T01:CDS 30.0%
! TTTGTTCAAAAGCATGTTGA+TGG - Chr4:78086564-78086583 MsG0480022886.01.T01:CDS 30.0%
!! TCATTCAATTCTTGGTGTTA+TGG - Chr4:78084738-78084757 MsG0480022886.01.T01:CDS 30.0%
!! TTCTAAGATATATGACTCCA+AGG + Chr4:78085626-78085645 None:intergenic 30.0%
AATCAGCTTAATGGAGTTGA+AGG - Chr4:78085835-78085854 MsG0480022886.01.T01:intron 35.0%
ACCATCCTTAATCAGCTTAA+TGG - Chr4:78085826-78085845 MsG0480022886.01.T01:intron 35.0%
AGAATTGAGGGTTCTTTATC+TGG + Chr4:78084814-78084833 None:intergenic 35.0%
ATAAGCACCTTAGTGATGAT+GGG + Chr4:78085429-78085448 None:intergenic 35.0%
ATAATAGGTATAGTAGGACC+TGG + Chr4:78086029-78086048 None:intergenic 35.0%
ATTAAAAGGAAGATGAGGCA+TGG + Chr4:78086267-78086286 None:intergenic 35.0%
ATTCTCAGCATGCAAAGATT+GGG - Chr4:78084921-78084940 MsG0480022886.01.T01:CDS 35.0%
CAACTCCATTAAGCTGATTA+AGG + Chr4:78085834-78085853 None:intergenic 35.0%
GAACTTATCAAACTCTTTGC+TGG + Chr4:78086532-78086551 None:intergenic 35.0%
GAAGGTCAAAAACTTGATTG+GGG - Chr4:78085340-78085359 MsG0480022886.01.T01:intron 35.0%
GAATTGAGGGTTCTTTATCT+GGG + Chr4:78084813-78084832 None:intergenic 35.0%
GACTTTCAAACCTTGATATG+TGG - Chr4:78084874-78084893 MsG0480022886.01.T01:CDS 35.0%
GGACTAGAGATTAAGAAAGA+TGG - Chr4:78085856-78085875 MsG0480022886.01.T01:intron 35.0%
GTGAAGGTCAAAAACTTGAT+TGG - Chr4:78085338-78085357 MsG0480022886.01.T01:intron 35.0%
TAATATTGGAGACATCATGG+AGG - Chr4:78085921-78085940 MsG0480022886.01.T01:CDS 35.0%
TATTCTCAGCATGCAAAGAT+TGG - Chr4:78084920-78084939 MsG0480022886.01.T01:CDS 35.0%
TCCATTAAGCTGATTAAGGA+TGG + Chr4:78085830-78085849 None:intergenic 35.0%
TCTAAATGGGAAGACAAACT+TGG - Chr4:78086618-78086637 MsG0480022886.01.T01:CDS 35.0%
TGACAATGAAATAAAGCACG+TGG - Chr4:78085994-78086013 MsG0480022886.01.T01:CDS 35.0%
TGCTAAATCCACATGTGTTA+TGG - Chr4:78086151-78086170 MsG0480022886.01.T01:intron 35.0%
TTAAAAGGAAGATGAGGCAT+GGG + Chr4:78086266-78086285 None:intergenic 35.0%
TTGATGCAATTATATGCAGG+TGG - Chr4:78085177-78085196 MsG0480022886.01.T01:intron 35.0%
! AACATGCTTTTGAACAAAGG+TGG + Chr4:78086562-78086581 None:intergenic 35.0%
! GTAGTATTTTCAATGAGTCG+TGG - Chr4:78086091-78086110 MsG0480022886.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTTCTGGTATTCCCATTTC+GGG + Chr4:78084781-78084800 None:intergenic 35.0%
!! CAAGGAGATTTTCAAGGTTA+TGG - Chr4:78085301-78085320 MsG0480022886.01.T01:intron 35.0%
!! CATTTCTGGTATTCCCATTT+CGG + Chr4:78084782-78084801 None:intergenic 35.0%
!! TACAAAAGCATCTGGAAGAA+AGG + Chr4:78085899-78085918 None:intergenic 35.0%
AGTAGTGTCACCACATATCA+AGG + Chr4:78084887-78084906 None:intergenic 40.0%
CTGATTAAGGATGGTTATGC+CGG + Chr4:78085821-78085840 None:intergenic 40.0%
GATAAGCACCTTAGTGATGA+TGG + Chr4:78085430-78085449 None:intergenic 40.0%
TATATGCAGGTGGTGAATCA+CGG - Chr4:78085187-78085206 MsG0480022886.01.T01:intron 40.0%
TGGAATTGTTTGCAAGGGAT+TGG + Chr4:78084848-78084867 None:intergenic 40.0%
TGTGGCTTTCTTCTTGCAAT+AGG + Chr4:78085391-78085410 None:intergenic 40.0%
TTCTCAGCATGCAAAGATTG+GGG - Chr4:78084922-78084941 MsG0480022886.01.T01:CDS 40.0%
!! GAGAGCACTCATTCAATTCT+TGG - Chr4:78084730-78084749 MsG0480022886.01.T01:CDS 40.0%
AGACAAACTTGGAGAGGATG+AGG - Chr4:78086629-78086648 MsG0480022886.01.T01:CDS 45.0%
ATGGGAAGACAAACTTGGAG+AGG - Chr4:78086623-78086642 MsG0480022886.01.T01:CDS 45.0%
CAAAGATTGGGGTTTCTTCC+AGG - Chr4:78084933-78084952 MsG0480022886.01.T01:intron 45.0%
CTACTCTAGCATAGAGCACA+GGG - Chr4:78086432-78086451 MsG0480022886.01.T01:CDS 45.0%
CTCAACTCCCATCATCACTA+AGG - Chr4:78085419-78085438 MsG0480022886.01.T01:CDS 45.0%
GCATATGTGAAGGGATACCT+TGG - Chr4:78085606-78085625 MsG0480022886.01.T01:CDS 45.0%
GGAGCTGTCATTAGATGTGA+AGG - Chr4:78085322-78085341 MsG0480022886.01.T01:intron 45.0%
GGGAGTTGAGGAAAAAGATG+TGG + Chr4:78085409-78085428 None:intergenic 45.0%
TCTACTCTAGCATAGAGCAC+AGG - Chr4:78086431-78086450 MsG0480022886.01.T01:CDS 45.0%
TCTGGGCGAAGAAACATTTC+TGG + Chr4:78084796-78084815 None:intergenic 45.0%
!! CTTAGTGATGATGGGAGTTG+AGG + Chr4:78085421-78085440 None:intergenic 45.0%
!! AATATATATATCTTAAAAAT+TGG - Chr4:78085044-78085063 MsG0480022886.01.T01:intron 5.0%
!! ATCAAATTAATTTATATAAT+AGG + Chr4:78086044-78086063 None:intergenic 5.0%
AGCACGTGGTGTATTGAACC+AGG - Chr4:78086008-78086027 MsG0480022886.01.T01:CDS 50.0%
GCATCTGGAAGAAAGGTCAC+AGG + Chr4:78085892-78085911 None:intergenic 50.0%
TTGATGCCATCGACAAGCTC+CGG + Chr4:78085781-78085800 None:intergenic 50.0%
CATCGACAAGCTCCGGTTGC+GGG + Chr4:78085774-78085793 None:intergenic 60.0%
CCATCGACAAGCTCCGGTTG+CGG + Chr4:78085775-78085794 None:intergenic 60.0%
GATGGTTATGCCGGAGCCGT+CGG + Chr4:78085812-78085831 None:intergenic 60.0%
GGCATCAACCCTCACTCCGA+CGG - Chr4:78085793-78085812 MsG0480022886.01.T01:intron 60.0%
AACCCTCACTCCGACGGCTC+CGG - Chr4:78085799-78085818 MsG0480022886.01.T01:intron 65.0%
ACAAGCTCCGGTTGCGGGCA+TGG + Chr4:78085769-78085788 None:intergenic 65.0%
CCGCAACCGGAGCTTGTCGA+TGG - Chr4:78085772-78085791 MsG0480022886.01.T01:intron 65.0%
CTATCCGCCATGCCCGCAAC+CGG - Chr4:78085759-78085778 MsG0480022886.01.T01:intron 65.0%
AGCTCCGGTTGCGGGCATGG+CGG + Chr4:78085766-78085785 None:intergenic 70.0%
ATGCCGGAGCCGTCGGAGTG+AGG + Chr4:78085805-78085824 None:intergenic 70.0%
TGCCGGAGCCGTCGGAGTGA+GGG + Chr4:78085804-78085823 None:intergenic 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 78084700 78086657 78084700 ID=MsG0480022886.01;Name=MsG0480022886.01
Chr4 mRNA 78084700 78086657 78084700 ID=MsG0480022886.01.T01;Parent=MsG0480022886.01;Name=MsG0480022886.01.T01;_AED=0.10;_eAED=0.10;_QI=0|0|0|1|1|1|4|0|355
Chr4 exon 78086403 78086657 78086403 ID=MsG0480022886.01.T01:exon:8696;Parent=MsG0480022886.01.T01
Chr4 exon 78085917 78086161 78085917 ID=MsG0480022886.01.T01:exon:8695;Parent=MsG0480022886.01.T01
Chr4 exon 78085415 78085739 78085415 ID=MsG0480022886.01.T01:exon:8694;Parent=MsG0480022886.01.T01
Chr4 exon 78084700 78084942 78084700 ID=MsG0480022886.01.T01:exon:8693;Parent=MsG0480022886.01.T01
Chr4 CDS 78086403 78086657 78086403 ID=MsG0480022886.01.T01:cds;Parent=MsG0480022886.01.T01
Chr4 CDS 78085917 78086161 78085917 ID=MsG0480022886.01.T01:cds;Parent=MsG0480022886.01.T01
Chr4 CDS 78085415 78085739 78085415 ID=MsG0480022886.01.T01:cds;Parent=MsG0480022886.01.T01
Chr4 CDS 78084700 78084942 78084700 ID=MsG0480022886.01.T01:cds;Parent=MsG0480022886.01.T01
Gene Sequence

>MsG0480022886.01.T01

ATGGCATCATCTCAGGTGGCTAATATCTTTGAGAGCACTCATTCAATTCTTGGTGTTATGGATGAAGTGATTAATAAACCCGAAATGGGAATACCAGAAATGTTTCTTCGCCCAGATAAAGAACCCTCAATTCTAACAAATGAAACCAATCCCTTGCAAACAATTCCAGTTTTTGACTTTCAAACCTTGATATGTGGTGACACTACTGAACTTGACAAGTTATTCTCAGCATGCAAAGATTGGGGTTTCTTCCAGGTGGTGAATCACGGTATTAGCTCTGAATTGCTTGAGAAGCTGAAATTTGAGATTCCAAATTTTTTCAAGCTTCCTGTTGAAGAGAAAACAAAATACAAAATAAGACAAGGAGATTTTCAAGGTTATGGAGCTGTCATTAGATGTGAAGGTCAAAAACTTGATTGGGGTGACAGATTCTTCATGATTACAAATCCTATTGCAAGAAGAAAGCCACATCTTTTTCCTCAACTCCCATCATCACTAAGGGATACCTTGGAGTCATATATCTTAGAATTGAAGAAACTTGGCATGACACTTTTTGAATTATTGGGAAAAGCCATAAAGATAGATATGAAGGAAGTAGAGAATATGTTTGATGATGGCAATCAATCAATAAGGATGACATACTATCCGCCATGCCCGCAACCGGAGCTTGTCGATGGCATCAACCCTCACTCCGACGGCTCCGGCATAACCATCCTTAATCAGCTTAATGGAGTTGAAGGACTAGAGATTAAGAAAGATGGAGTTTGGATTCCTGTGACCTTTCTTCCAGATGCTTTTGTAGTTAATATTGGAGACATCATGGAGATTCTAAGCAATGGGGTCTACTCTAGCATAGAGCACAGGGTTTCAGTAAACAAAGAAAAGGAGAGAGTTTCTGTTGCTATGTTCTTCAACACCAAATTTGAAGCAGAAATTGGACCAGCAAAGAGTTTGATAAGTTCTGAAAATCCACCTTTGTTCAAAAGCATGTTGATGGAAGAATACTCCAAATACTTTTTTTCAAGAAATCTAAATGGGAAGACAAACTTGGAGAGGATGAGGATTTAA

Protein sequence

>MsG0480022886.01.T01

MASSQVANIFESTHSILGVMDEVINKPEMGIPEMFLRPDKEPSILTNETNPLQTIPVFDFQTLICGDTTELDKLFSACKDWGFFQVVNHGISSELLEKLKFEIPNFFKLPVEEKTKYKIRQGDFQGYGAVIRCEGQKLDWGDRFFMITNPIARRKPHLFPQLPSSLRDTLESYILELKKLGMTLFELLGKAIKIDMKEVENMFDDGNQSIRMTYYPPCPQPELVDGINPHSDGSGITILNQLNGVEGLEIKKDGVWIPVTFLPDAFVVNIGDIMEILSNGVYSSIEHRVSVNKEKERVSVAMFFNTKFEAEIGPAKSLISSENPPLFKSMLMEEYSKYFFSRNLNGKTNLERMRI*