AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180004705.01


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MsG0180004705.01.T01 AT5G12870 76.147 109 26 0 10 118 16 124 4.42e-58 190
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MsG0180004705.01.T01 AT4G17785 64.341 129 45 1 1 128 1 129 8.45e-58 192
MsG0180004705.01.T01 AT5G60890 61.240 129 50 0 1 129 1 129 1.27e-57 189
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MsG0180004705.01.T01 AT1G74430 65.625 128 44 0 1 128 1 128 1.18e-56 186
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MsG0180004705.01.T01 AT3G23250 43.318 217 101 3 1 199 1 213 1.25e-54 181
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MsG0180004705.01.T01 AT3G28910 54.264 129 57 1 1 129 1 127 8.70e-44 154
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MsG0180004705.01.T01 AT3G11440 61.321 106 41 0 12 117 41 146 3.53e-42 155
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MsG0180004705.01.T01 AT2G47190 37.811 201 111 1 12 198 20 220 1.23e-40 144
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MsG0180004705.01.T01 AT2G26950 48.696 115 56 1 6 120 10 121 2.72e-35 133
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MsG0180004705.01.T01 AT5G14750 68.116 69 22 0 48 116 18 86 5.94e-30 113
MsG0180004705.01.T01 AT5G40350 50.000 106 43 1 45 140 5 110 1.58e-29 112
MsG0180004705.01.T01 AT3G47600 53.684 95 40 1 24 118 22 112 1.27e-28 114
MsG0180004705.01.T01 AT3G46130 62.667 75 28 0 44 118 9 83 1.62e-28 111
MsG0180004705.01.T01 AT1G22640 62.162 74 28 0 58 131 1 74 1.87e-28 110
MsG0180004705.01.T01 AT3G46130 63.514 74 27 0 45 118 20 93 3.98e-28 110
MsG0180004705.01.T01 AT5G59780 63.514 74 27 0 45 118 20 93 4.27e-28 109
MsG0180004705.01.T01 AT3G53200 64.789 71 25 0 45 115 9 79 1.20e-27 108
MsG0180004705.01.T01 AT5G58850 37.725 167 85 6 12 163 103 265 4.22e-27 111
MsG0180004705.01.T01 AT1G18960 43.802 121 61 4 14 132 10 125 4.98e-27 109
MsG0180004705.01.T01 AT4G37260 53.398 103 45 2 14 115 13 113 6.87e-27 109
MsG0180004705.01.T01 AT3G27785 45.370 108 56 2 9 115 184 289 7.20e-27 110
MsG0180004705.01.T01 AT5G40360 43.519 108 59 2 9 116 153 258 2.13e-26 108
MsG0180004705.01.T01 AT5G11050 44.660 103 54 2 14 115 105 205 4.61e-26 108
MsG0180004705.01.T01 AT4G18770 44.954 109 57 2 9 116 212 318 5.45e-26 108
MsG0180004705.01.T01 AT5G02320 47.664 107 53 2 11 116 124 228 1.61e-25 108
MsG0180004705.01.T01 AT5G02320 47.664 107 53 2 11 116 124 228 1.61e-25 108
MsG0180004705.01.T01 AT5G02320 47.664 107 53 2 11 116 64 168 1.72e-25 107
MsG0180004705.01.T01 AT2G23290 51.456 103 47 2 14 115 13 113 1.76e-25 105
MsG0180004705.01.T01 AT1G71030 55.844 77 34 0 51 127 5 81 2.09e-25 101
MsG0180004705.01.T01 AT1G71030 55.844 77 34 0 51 127 19 95 2.63e-25 101
MsG0180004705.01.T01 AT3G09230 50.000 104 49 2 14 116 55 156 2.86e-25 105
MsG0180004705.01.T01 AT5G67300 49.515 103 49 2 14 115 6 106 2.97e-25 104
MsG0180004705.01.T01 AT2G39880 52.427 103 46 2 14 115 50 150 3.97e-25 105
MsG0180004705.01.T01 AT3G09370 48.571 105 51 2 12 115 128 230 4.80e-25 106
MsG0180004705.01.T01 AT3G09370 48.571 105 51 2 12 115 133 235 5.42e-25 106
MsG0180004705.01.T01 AT3G09370 48.571 105 51 2 12 115 141 243 8.68e-25 105
MsG0180004705.01.T01 AT5G11510 46.729 107 54 2 11 116 78 182 9.50e-25 106
MsG0180004705.01.T01 AT5G11510 46.729 107 54 2 11 116 78 182 9.50e-25 106
MsG0180004705.01.T01 AT5G11510 46.729 107 54 2 11 116 78 182 9.50e-25 106
MsG0180004705.01.T01 AT3G55730 52.427 103 46 2 14 115 56 156 1.01e-24 104
MsG0180004705.01.T01 AT1G17950 45.283 106 55 2 14 118 5 108 1.42e-24 101
MsG0180004705.01.T01 AT1G73410 45.794 107 55 2 14 119 6 110 1.57e-24 100
MsG0180004705.01.T01 AT5G11510 46.729 107 54 2 11 116 78 182 1.58e-24 105
MsG0180004705.01.T01 AT3G50060 43.651 126 64 4 14 138 6 125 1.60e-24 102
MsG0180004705.01.T01 AT5G11510 46.729 107 54 2 11 116 78 182 1.69e-24 105
MsG0180004705.01.T01 AT3G23250 68.333 60 19 0 58 117 1 60 2.82e-24 99.8
MsG0180004705.01.T01 AT1G69560 41.441 111 62 2 9 118 102 210 3.07e-24 102
MsG0180004705.01.T01 AT1G69560 41.441 111 62 2 9 118 118 226 4.07e-24 102
MsG0180004705.01.T01 AT1G73410 45.794 107 55 2 14 119 6 110 6.84e-24 98.2
MsG0180004705.01.T01 AT1G26780 42.593 108 59 2 12 118 96 201 1.74e-23 99.0
MsG0180004705.01.T01 AT1G26780 42.593 108 59 2 12 118 96 201 2.61e-23 100
MsG0180004705.01.T01 AT4G32730 44.860 107 56 2 11 116 84 188 2.87e-23 102
MsG0180004705.01.T01 AT4G32730 44.860 107 56 2 11 116 84 188 2.98e-23 102
MsG0180004705.01.T01 AT4G32730 44.860 107 56 2 11 116 84 188 2.98e-23 102
MsG0180004705.01.T01 AT4G32730 44.860 107 56 2 11 116 84 188 2.98e-23 102
MsG0180004705.01.T01 AT4G32730 44.860 107 56 2 11 116 84 188 2.98e-23 102
MsG0180004705.01.T01 AT1G66380 58.442 77 32 0 39 115 2 78 2.93e-22 90.9
MsG0180004705.01.T01 AT2G25230 41.593 113 63 2 9 120 21 131 4.10e-22 94.0
MsG0180004705.01.T01 AT4G33450 38.739 111 65 2 9 118 14 122 1.31e-21 93.2
MsG0180004705.01.T01 AT5G17800 40.566 106 62 1 14 119 93 197 1.40e-21 94.4
MsG0180004705.01.T01 AT5G14750 62.712 59 22 0 58 116 1 59 4.31e-21 88.6
MsG0180004705.01.T01 AT5G14750 62.712 59 22 0 58 116 1 59 4.31e-21 88.6
MsG0180004705.01.T01 AT1G66380 54.217 83 38 0 10 92 6 88 8.14e-21 87.0
MsG0180004705.01.T01 AT3G29020 38.679 106 62 2 14 118 65 168 1.15e-20 90.1
MsG0180004705.01.T01 AT3G29020 38.679 106 62 2 14 118 67 170 1.25e-20 91.7
MsG0180004705.01.T01 AT2G02820 37.815 119 72 2 4 121 19 136 5.41e-19 88.6
MsG0180004705.01.T01 AT2G02820 37.815 119 72 2 4 121 19 136 5.45e-19 87.4
MsG0180004705.01.T01 AT4G00540 42.342 111 58 3 12 118 101 209 5.74e-19 88.2
MsG0180004705.01.T01 AT2G02820 37.815 119 72 2 4 121 19 136 8.78e-19 87.8
MsG0180004705.01.T01 AT4G00540 42.342 111 58 3 12 118 99 207 1.14e-18 87.4
MsG0180004705.01.T01 AT5G40430 38.053 113 66 3 9 120 49 158 3.16e-18 84.0
MsG0180004705.01.T01 AT1G14350 40.000 105 62 1 17 121 28 131 3.68e-18 85.9
MsG0180004705.01.T01 AT1G14350 40.000 105 62 1 17 121 28 131 3.68e-18 85.9
MsG0180004705.01.T01 AT5G61420 66.667 54 18 0 81 134 2 55 1.06e-16 80.1
MsG0180004705.01.T01 AT2G37630 35.246 122 77 1 17 136 7 128 1.16e-16 80.9
MsG0180004705.01.T01 AT5G39700 34.545 110 71 1 9 118 51 159 1.27e-14 72.0
MsG0180004705.01.T01 AT1G74430 70.732 41 12 0 88 128 19 59 1.72e-14 72.0
MsG0180004705.01.T01 AT4G28110 73.171 41 11 0 88 128 4 44 3.98e-14 70.9
MsG0180004705.01.T01 AT5G59780 60.870 46 18 0 73 118 4 49 1.71e-13 68.6
MsG0180004705.01.T01 AT3G46130 60.870 46 18 0 73 118 4 49 1.87e-13 68.9
MsG0180004705.01.T01 AT5G15310 53.731 67 25 1 88 154 9 69 2.29e-13 69.7
MsG0180004705.01.T01 AT1G14350 43.939 66 37 0 56 121 23 88 2.08e-12 68.2
MsG0180004705.01.T01 AT1G14350 43.939 66 37 0 56 121 23 88 2.08e-12 68.2
MsG0180004705.01.T01 AT1G22640 61.364 44 17 0 88 131 16 59 2.31e-12 65.5
MsG0180004705.01.T01 AT5G14340 55.556 45 20 0 88 132 10 54 2.47e-12 65.5
MsG0180004705.01.T01 AT4G25560 61.224 49 19 0 71 119 3 51 3.01e-12 65.9
MsG0180004705.01.T01 AT3G18100 35.417 96 61 1 13 108 545 639 5.49e-11 64.7
MsG0180004705.01.T01 AT3G18100 35.417 96 61 1 13 108 497 591 7.21e-11 64.3
MsG0180004705.01.T01 AT3G18100 35.417 96 61 1 13 108 384 478 7.54e-11 63.9
MsG0180004705.01.T01 AT3G28910 50.943 53 24 1 77 129 1 51 8.43e-11 62.0
MsG0180004705.01.T01 AT3G18100 35.417 96 61 1 13 108 332 426 9.56e-11 63.5

Find 66 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 79 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TCTGTTATGAAACCTGTTTC+TGG 0.187715 1:-81599149 None:intergenic
TCTTTCCAGAACTTGAACTA+TGG 0.254408 1:+81598789 MsG0180004705.01.T01:CDS
ATCTCATTGTCTGTTCTTCC+TGG 0.281887 1:-81598465 None:intergenic
CCTCGGACGGAGTTCATAAC+TGG 0.293507 1:+81598985 MsG0180004705.01.T01:CDS
ATGTTTGTACCTGCTAGTTT+GGG 0.316790 1:-81598068 None:intergenic
TATGTTTGTACCTGCTAGTT+TGG 0.322284 1:-81598069 None:intergenic
TTGATCCATAGTTCAAGTTC+TGG 0.343300 1:-81598794 None:intergenic
AAAGGTGTGGGAAGAGTTGC+AGG 0.345434 1:+81598187 MsG0180004705.01.T01:CDS
GAGAGTGGTTTGTGAGTGTT+TGG 0.356009 1:-81598543 None:intergenic
GCTACTATTGTTGATCTTTG+AGG 0.360896 1:-81598709 None:intergenic
CATCAAACTCATAACTTCAT+TGG 0.369991 1:-81598634 None:intergenic
CCAACATCCATGACCATGTT+TGG 0.389930 1:-81598036 None:intergenic
CCTACAAAAGCTTCTATAGA+AGG 0.393701 1:+81598663 MsG0180004705.01.T01:CDS
ACATGTTAAGCCAACTGTTT+CGG 0.398547 1:+81598959 MsG0180004705.01.T01:CDS
TGCTACCAAACCTGGTATCT+AGG 0.408405 1:-81598752 None:intergenic
GTGAAACAAATAGATGCATT+TGG 0.408858 1:-81598837 None:intergenic
TTCATGCAGTACTTGGTAAC+AGG 0.409516 1:+81598289 MsG0180004705.01.T01:CDS
AGAAGTTTCTCATCTTCCTC+TGG 0.426768 1:-81598002 None:intergenic
ATTGAACTTCATGCAGTACT+TGG 0.433082 1:+81598282 MsG0180004705.01.T01:CDS
TTATTCCTAGATACCAGGTT+TGG 0.454673 1:+81598747 MsG0180004705.01.T01:CDS
GCCAACTGTTTCGGTTTCCT+CGG 0.459910 1:+81598968 MsG0180004705.01.T01:CDS
TTAGCCTCAGTGTACATTGA+TGG 0.461448 1:-81599125 None:intergenic
TGATACAGAATGGAGCATAT+TGG 0.462241 1:-81598913 None:intergenic
TTGAGGCCTGATTTGAAAAG+AGG 0.464473 1:+81598228 MsG0180004705.01.T01:CDS
TAGCCTCAGTGTACATTGAT+GGG 0.467430 1:-81599124 None:intergenic
AGAAGTTAAGGAAAGGACTT+TGG 0.475806 1:+81597976 MsG0180004705.01.T01:CDS
GGAAGAGTTGCAGGTTAAGA+TGG 0.476199 1:+81598196 MsG0180004705.01.T01:CDS
CGTTACAAGAAGAAATGAAA+TGG 0.480075 1:+81599057 MsG0180004705.01.T01:CDS
GGTTGATTCTGCATAAGAAA+TGG 0.480248 1:-81599098 None:intergenic
ACTTGAACTGCTACCAAACC+TGG 0.483346 1:-81598760 None:intergenic
ACTGAGGCTAAACCAGAAAC+AGG 0.484680 1:+81599137 MsG0180004705.01.T01:CDS
TGGTATCTAGGAATAATTCA+TGG 0.486504 1:-81598740 None:intergenic
TTGAACTATGGATCAAACAT+AGG 0.491185 1:+81598801 MsG0180004705.01.T01:CDS
GCTGCTACAAGCAGAAGTTA+AGG 0.502078 1:+81597964 MsG0180004705.01.T01:CDS
CTGAATTACATTACCAAACA+TGG 0.502718 1:+81598023 MsG0180004705.01.T01:CDS
ATTTGTGAAGAAGTTGAAGT+TGG 0.511516 1:-81598861 None:intergenic
CCAAACATGGTCATGGATGT+TGG 0.521644 1:+81598036 MsG0180004705.01.T01:CDS
CAGATGAATCATGCACTAGT+TGG 0.523015 1:+81599168 MsG0180004705.01.T01:CDS
CATTTCATTTCTTCTTGTAA+CGG 0.527153 1:-81599056 None:intergenic
TTTACAGGTTTGCAAAGGTG+TGG 0.532239 1:+81598174 MsG0180004705.01.T01:intron
GTTGAAGTTGAGAAAATTGA+GGG 0.536490 1:-81598936 None:intergenic
ACTGTTTCGGTTTCCTCGGA+CGG 0.541892 1:+81598972 MsG0180004705.01.T01:CDS
CAGATTGCAGCACAATTACC+AGG 0.546616 1:+81598447 MsG0180004705.01.T01:CDS
ATGAATTATTCCTAGATACC+AGG 0.549894 1:+81598742 MsG0180004705.01.T01:CDS
TACATTACCAAACATGGTCA+TGG 0.551080 1:+81598029 MsG0180004705.01.T01:CDS
AAGAAAAGATTGAGACAAAG+TGG 0.551516 1:+81598513 MsG0180004705.01.T01:CDS
AGTTCTGTCCCCAAACTAGC+AGG 0.555346 1:+81598059 MsG0180004705.01.T01:CDS
AAATTGAGGGTGATACAGAA+TGG 0.566456 1:-81598923 None:intergenic
TGTTGAAGTTGAGAAAATTG+AGG 0.567398 1:-81598937 None:intergenic
TTACAGGTTTGCAAAGGTGT+GGG 0.568173 1:+81598175 MsG0180004705.01.T01:intron
AACATTAACAACACAAACAA+CGG 0.580018 1:+81599026 MsG0180004705.01.T01:CDS
TGAACTATGGATCAAACATA+GGG 0.580769 1:+81598802 MsG0180004705.01.T01:CDS
ACTTTCTGATATATATAGCA+AGG 0.584658 1:+81599217 MsG0180004705.01.T01:CDS
TCCGAGGAAACCGAAACAGT+TGG 0.603461 1:-81598969 None:intergenic
CTCGGACGGAGTTCATAACT+GGG 0.605268 1:+81598986 MsG0180004705.01.T01:CDS
TAAGATGGATAAATTACTTG+AGG 0.605702 1:+81598211 MsG0180004705.01.T01:CDS
AGCCTCAGTGTACATTGATG+GGG 0.607267 1:-81599123 None:intergenic
GAGGTAGTAGAAACTTCTAG+AGG 0.610829 1:-81598690 None:intergenic
CACTCACAAACCACTCTCTG+AGG 0.631167 1:+81598548 MsG0180004705.01.T01:CDS
AGGTAGTAGAAACTTCTAGA+GGG 0.636573 1:-81598689 None:intergenic
TACAAGCAGAAGTTAAGGAA+AGG 0.639660 1:+81597969 MsG0180004705.01.T01:CDS
CCAGTTATGAACTCCGTCCG+AGG 0.643154 1:-81598985 None:intergenic
TGTTTGTACCTGCTAGTTTG+GGG 0.646582 1:-81598067 None:intergenic
GAAAGGACTTTGGTCTCCAG+AGG 0.652425 1:+81597986 MsG0180004705.01.T01:CDS
TCAGTGTACATTGATGGGGA+AGG 0.652779 1:-81599119 None:intergenic
TTCCCCATCAATGTACACTG+AGG 0.775584 1:+81599121 MsG0180004705.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! ATATAAATTTAATCTTTTAC+AGG + Chr1:81598159-81598178 MsG0180004705.01.T01:intron 10.0%
!!! TTTTTTTTATACTATAGTTT+TGG + Chr1:81598375-81598394 MsG0180004705.01.T01:intron 10.0%
!! ACAATGAGATTAAAAATCTA+TGG + Chr1:81598478-81598497 MsG0180004705.01.T01:CDS 20.0%
! AACATTAACAACACAAACAA+CGG + Chr1:81599026-81599045 MsG0180004705.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTTCTGATATATATAGCA+AGG + Chr1:81599217-81599236 MsG0180004705.01.T01:CDS 25.0%
! CATTTCATTTCTTCTTGTAA+CGG - Chr1:81599059-81599078 None:intergenic 25.0%
! TAAGATGGATAAATTACTTG+AGG + Chr1:81598211-81598230 MsG0180004705.01.T01:CDS 25.0%
!!! GTTTTGGTTTAATTATGTGA+TGG + Chr1:81598391-81598410 MsG0180004705.01.T01:intron 25.0%
AAGAAAAGATTGAGACAAAG+TGG + Chr1:81598513-81598532 MsG0180004705.01.T01:CDS 30.0%
ATGAATTATTCCTAGATACC+AGG + Chr1:81598742-81598761 MsG0180004705.01.T01:CDS 30.0%
ATTTGTGAAGAAGTTGAAGT+TGG - Chr1:81598864-81598883 None:intergenic 30.0%
CATCAAACTCATAACTTCAT+TGG - Chr1:81598637-81598656 None:intergenic 30.0%
CGTTACAAGAAGAAATGAAA+TGG + Chr1:81599057-81599076 MsG0180004705.01.T01:CDS 30.0%
CTGAATTACATTACCAAACA+TGG + Chr1:81598023-81598042 MsG0180004705.01.T01:CDS 30.0%
GTGAAACAAATAGATGCATT+TGG - Chr1:81598840-81598859 None:intergenic 30.0%
GTTGAAGTTGAGAAAATTGA+GGG - Chr1:81598939-81598958 None:intergenic 30.0%
TGAACTATGGATCAAACATA+GGG + Chr1:81598802-81598821 MsG0180004705.01.T01:CDS 30.0%
TGGTATCTAGGAATAATTCA+TGG - Chr1:81598743-81598762 None:intergenic 30.0%
TGTTGAAGTTGAGAAAATTG+AGG - Chr1:81598940-81598959 None:intergenic 30.0%
TTGAACTATGGATCAAACAT+AGG + Chr1:81598801-81598820 MsG0180004705.01.T01:CDS 30.0%
! AATCTTTTACAGGTTTGCAA+AGG + Chr1:81598169-81598188 MsG0180004705.01.T01:intron 30.0%
! TGAAACTGAAGCTTTTTGAT+TGG - Chr1:81598613-81598632 None:intergenic 30.0%
!! TGTTGTTGCTTTATATCAGA+TGG + Chr1:81598421-81598440 MsG0180004705.01.T01:intron 30.0%
!!! AGCTTTTTGATTGGTTTTGT+TGG - Chr1:81598604-81598623 None:intergenic 30.0%
AAATTGAGGGTGATACAGAA+TGG - Chr1:81598926-81598945 None:intergenic 35.0%
ACATGTTAAGCCAACTGTTT+CGG + Chr1:81598959-81598978 MsG0180004705.01.T01:CDS 35.0%
AGAAGTTAAGGAAAGGACTT+TGG + Chr1:81597976-81597995 MsG0180004705.01.T01:CDS 35.0%
AGGTAGTAGAAACTTCTAGA+GGG - Chr1:81598692-81598711 None:intergenic 35.0%
ATTGAACTTCATGCAGTACT+TGG + Chr1:81598282-81598301 MsG0180004705.01.T01:CDS 35.0%
CCTACAAAAGCTTCTATAGA+AGG + Chr1:81598663-81598682 MsG0180004705.01.T01:CDS 35.0%
GCTACTATTGTTGATCTTTG+AGG - Chr1:81598712-81598731 None:intergenic 35.0%
TACAAGCAGAAGTTAAGGAA+AGG + Chr1:81597969-81597988 MsG0180004705.01.T01:CDS 35.0%
TACATTACCAAACATGGTCA+TGG + Chr1:81598029-81598048 MsG0180004705.01.T01:CDS 35.0%
TATGTTTGTACCTGCTAGTT+TGG - Chr1:81598072-81598091 None:intergenic 35.0%
TCTGTTATGAAACCTGTTTC+TGG - Chr1:81599152-81599171 None:intergenic 35.0%
TCTTTCCAGAACTTGAACTA+TGG + Chr1:81598789-81598808 MsG0180004705.01.T01:CDS 35.0%
TGATACAGAATGGAGCATAT+TGG - Chr1:81598916-81598935 None:intergenic 35.0%
TTATTCCTAGATACCAGGTT+TGG + Chr1:81598747-81598766 MsG0180004705.01.T01:CDS 35.0%
! AATGCTCCTCTTTTCAAATC+AGG - Chr1:81598237-81598256 None:intergenic 35.0%
! ATGTTTGTACCTGCTAGTTT+GGG - Chr1:81598071-81598090 None:intergenic 35.0%
! CCTTCTATAGAAGCTTTTGT+AGG - Chr1:81598666-81598685 None:intergenic 35.0%
! GGTTGATTCTGCATAAGAAA+TGG - Chr1:81599101-81599120 None:intergenic 35.0%
! TTGATCCATAGTTCAAGTTC+TGG - Chr1:81598797-81598816 None:intergenic 35.0%
AGAAGTTTCTCATCTTCCTC+TGG - Chr1:81598005-81598024 None:intergenic 40.0%
ATCTCATTGTCTGTTCTTCC+TGG - Chr1:81598468-81598487 None:intergenic 40.0%
CAGATGAATCATGCACTAGT+TGG + Chr1:81599168-81599187 MsG0180004705.01.T01:CDS 40.0%
GAGGTAGTAGAAACTTCTAG+AGG - Chr1:81598693-81598712 None:intergenic 40.0%
TAGCCTCAGTGTACATTGAT+GGG - Chr1:81599127-81599146 None:intergenic 40.0%
TTAGCCTCAGTGTACATTGA+TGG - Chr1:81599128-81599147 None:intergenic 40.0%
TTTACAGGTTTGCAAAGGTG+TGG + Chr1:81598174-81598193 MsG0180004705.01.T01:intron 40.0%
! CAGAGATTTTCAGTGGCTTT+TGG + Chr1:81599245-81599264 MsG0180004705.01.T01:CDS 40.0%
! TCATTTTCAACCTCAGAGAG+TGG - Chr1:81598561-81598580 None:intergenic 40.0%
! TGTTTGTACCTGCTAGTTTG+GGG - Chr1:81598070-81598089 None:intergenic 40.0%
! TTACAGGTTTGCAAAGGTGT+GGG + Chr1:81598175-81598194 MsG0180004705.01.T01:intron 40.0%
! TTCATGCAGTACTTGGTAAC+AGG + Chr1:81598289-81598308 MsG0180004705.01.T01:CDS 40.0%
! TTGAGGCCTGATTTGAAAAG+AGG + Chr1:81598228-81598247 MsG0180004705.01.T01:CDS 40.0%
ACTGAGGCTAAACCAGAAAC+AGG + Chr1:81599137-81599156 MsG0180004705.01.T01:CDS 45.0%
ACTTGAACTGCTACCAAACC+TGG - Chr1:81598763-81598782 None:intergenic 45.0%
AGCCTCAGTGTACATTGATG+GGG - Chr1:81599126-81599145 None:intergenic 45.0%
CAGATTGCAGCACAATTACC+AGG + Chr1:81598447-81598466 MsG0180004705.01.T01:CDS 45.0%
CCAAACATGGTCATGGATGT+TGG + Chr1:81598036-81598055 MsG0180004705.01.T01:CDS 45.0%
CCAACATCCATGACCATGTT+TGG - Chr1:81598039-81598058 None:intergenic 45.0%
GCTGCTACAAGCAGAAGTTA+AGG + Chr1:81597964-81597983 MsG0180004705.01.T01:CDS 45.0%
GGAAGAGTTGCAGGTTAAGA+TGG + Chr1:81598196-81598215 MsG0180004705.01.T01:CDS 45.0%
TCAGTGTACATTGATGGGGA+AGG - Chr1:81599122-81599141 None:intergenic 45.0%
TGCTACCAAACCTGGTATCT+AGG - Chr1:81598755-81598774 None:intergenic 45.0%
TTCCCCATCAATGTACACTG+AGG + Chr1:81599121-81599140 MsG0180004705.01.T01:CDS 45.0%
! GAGAGTGGTTTGTGAGTGTT+TGG - Chr1:81598546-81598565 None:intergenic 45.0%
! GGATCTGCAGAGATTTTCAG+TGG + Chr1:81599238-81599257 MsG0180004705.01.T01:CDS 45.0%
ACTGTTTCGGTTTCCTCGGA+CGG + Chr1:81598972-81598991 MsG0180004705.01.T01:CDS 50.0%
AGTTCTGTCCCCAAACTAGC+AGG + Chr1:81598059-81598078 MsG0180004705.01.T01:CDS 50.0%
CACTCACAAACCACTCTCTG+AGG + Chr1:81598548-81598567 MsG0180004705.01.T01:CDS 50.0%
CTCGGACGGAGTTCATAACT+GGG + Chr1:81598986-81599005 MsG0180004705.01.T01:CDS 50.0%
GAAAGGACTTTGGTCTCCAG+AGG + Chr1:81597986-81598005 MsG0180004705.01.T01:CDS 50.0%
GCCAACTGTTTCGGTTTCCT+CGG + Chr1:81598968-81598987 MsG0180004705.01.T01:CDS 50.0%
TCCGAGGAAACCGAAACAGT+TGG - Chr1:81598972-81598991 None:intergenic 50.0%
! AAAGGTGTGGGAAGAGTTGC+AGG + Chr1:81598187-81598206 MsG0180004705.01.T01:CDS 50.0%
CCAGTTATGAACTCCGTCCG+AGG - Chr1:81598988-81599007 None:intergenic 55.0%
CCTCGGACGGAGTTCATAAC+TGG + Chr1:81598985-81599004 MsG0180004705.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 81597948 81599280 81597948 ID=MsG0180004705.01;Name=MsG0180004705.01
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Chr1 exon 81597948 81598080 81597948 ID=MsG0180004705.01.T01:exon:34437;Parent=MsG0180004705.01.T01
Chr1 exon 81598181 81598310 81598181 ID=MsG0180004705.01.T01:exon:34438;Parent=MsG0180004705.01.T01
Chr1 exon 81598440 81599280 81598440 ID=MsG0180004705.01.T01:exon:34439;Parent=MsG0180004705.01.T01
Chr1 CDS 81597948 81598080 81597948 ID=MsG0180004705.01.T01:cds;Parent=MsG0180004705.01.T01
Chr1 CDS 81598181 81598310 81598181 ID=MsG0180004705.01.T01:cds;Parent=MsG0180004705.01.T01
Chr1 CDS 81598440 81599280 81598440 ID=MsG0180004705.01.T01:cds;Parent=MsG0180004705.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180004705.01.T01

ATGGGAAGACATTCTTGCTGCTACAAGCAGAAGTTAAGGAAAGGACTTTGGTCTCCAGAGGAAGATGAGAAACTTCTGAATTACATTACCAAACATGGTCATGGATGTTGGAGTTCTGTCCCCAAACTAGCAGGTTTGCAAAGGTGTGGGAAGAGTTGCAGGTTAAGATGGATAAATTACTTGAGGCCTGATTTGAAAAGAGGAGCATTCTCACAACAAGAAGAGAATTTGATCATTGAACTTCATGCAGTACTTGGTAACAGATGGTCTCAGATTGCAGCACAATTACCAGGAAGAACAGACAATGAGATTAAAAATCTATGGAATTCATGTCTCAAGAAAAGATTGAGACAAAGTGGCATTGATCCAAACACTCACAAACCACTCTCTGAGGTTGAAAATGACAATGAAAAATCACTCACATCCAACAAAACCAATCAAAAAGCTTCAGTTTCATCCAATGAAGTTATGAGTTTGATGATTGAACCTACAAAAGCTTCTATAGAAGGATACCCTCTAGAAGTTTCTACTACCTCAAAGATCAACAATAGTAGCAGCAGCAGCCATGAATTATTCCTAGATACCAGGTTTGGTAGCAGTTCAAGTTATTTTTCTTTCCAGAACTTGAACTATGGATCAAACATAGGGATTTCTGAAAATCCAAATGCATCTATTTGTTTCACACCAACTTCAACTTCTTCACAAATTATGTCAGATACAAATTCTGTTATAACTTCCAATATGCTCCATTCTGTATCACCCTCAATTTTCTCAACTTCAACACATGTTAAGCCAACTGTTTCGGTTTCCTCGGACGGAGTTCATAACTGGGAAGCAAGTAACTACAACAACATTAACAACACAAACAACGGCGCTTTACCGTTACAAGAAGAAATGAAATGGTCTGAGTATCTTAACACACCATTTCTTATGCAGAATCAACCTTCCCCATCAATGTACACTGAGGCTAAACCAGAAACAGGTTTCATAACAGATGAATCATGCACTAGTTGGCAGCAGCAGCAACAACAAAATTTTCAACTTTCTGATATATATAGCAAGGATCTGCAGAGATTTTCAGTGGCTTTTGGACAAACTATGTAG

Protein sequence

>MsG0180004705.01.T01

MGRHSCCYKQKLRKGLWSPEEDEKLLNYITKHGHGCWSSVPKLAGLQRCGKSCRLRWINYLRPDLKRGAFSQQEENLIIELHAVLGNRWSQIAAQLPGRTDNEIKNLWNSCLKKRLRQSGIDPNTHKPLSEVENDNEKSLTSNKTNQKASVSSNEVMSLMIEPTKASIEGYPLEVSTTSKINNSSSSSHELFLDTRFGSSSSYFSFQNLNYGSNIGISENPNASICFTPTSTSSQIMSDTNSVITSNMLHSVSPSIFSTSTHVKPTVSVSSDGVHNWEASNYNNINNTNNGALPLQEEMKWSEYLNTPFLMQNQPSPSMYTEAKPETGFITDESCTSWQQQQQQNFQLSDIYSKDLQRFSVAFGQTM*