AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180005655.01


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MsG0180005655.01.T01 AT4G08470 44.030 268 133 8 55 318 303 557 2.10e-60 211
MsG0180005655.01.T01 AT4G12020 44.280 271 125 9 55 318 1626 1877 1.42e-57 211
MsG0180005655.01.T01 AT4G12020 44.280 271 125 9 55 318 1551 1802 1.67e-57 210
MsG0180005655.01.T01 AT4G12020 44.280 271 125 9 55 318 1618 1869 1.68e-57 210
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MsG0180005655.01.T01 AT1G69220 37.931 261 141 6 64 318 231 476 7.35e-49 183
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MsG0180005655.01.T01 AT1G53165 37.847 288 164 6 54 339 14 288 1.73e-48 181
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MsG0180005655.01.T01 AT1G07150 34.074 270 161 5 55 319 23 280 2.51e-44 166
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MsG0180005655.01.T01 AT1G50240 33.229 319 190 10 59 368 10 314 1.50e-40 159
MsG0180005655.01.T01 AT3G53930 30.031 323 199 5 55 372 20 320 1.61e-39 155
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MsG0180005655.01.T01 AT4G08470 43.784 185 93 5 55 238 303 477 2.33e-38 148
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MsG0180005655.01.T01 AT4G29810 31.955 266 166 6 59 318 83 339 6.68e-38 144
MsG0180005655.01.T01 AT4G36950 33.333 282 157 8 53 319 1 266 1.33e-36 140
MsG0180005655.01.T01 AT3G17850 30.216 278 159 6 61 309 888 1159 1.45e-36 147
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MsG0180005655.01.T01 AT1G48490 30.515 272 160 5 61 309 834 1099 2.41e-36 146
MsG0180005655.01.T01 AT1G48490 30.515 272 160 5 61 309 834 1099 2.41e-36 146
MsG0180005655.01.T01 AT1G48490 30.515 272 160 5 61 309 835 1100 2.46e-36 146
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MsG0180005655.01.T01 AT4G26070 29.841 315 195 9 43 341 46 350 3.55e-35 136
MsG0180005655.01.T01 AT5G49470 31.429 280 172 7 58 329 468 735 3.74e-35 142
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MsG0180005655.01.T01 AT1G51660 31.461 267 165 5 57 318 81 334 3.81e-34 134
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MsG0180005655.01.T01 AT1G79640 31.250 288 174 8 49 327 7 279 5.66e-34 138
MsG0180005655.01.T01 AT1G79640 31.250 288 174 8 49 327 10 282 5.96e-34 138
MsG0180005655.01.T01 AT3G06640 32.270 282 167 8 58 329 449 716 6.11e-34 138
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MsG0180005655.01.T01 AT2G25880 31.439 264 165 5 58 319 28 277 9.08e-34 130
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MsG0180005655.01.T01 AT3G08720 30.938 320 179 10 59 368 144 431 1.32e-33 134
MsG0180005655.01.T01 AT3G08720 30.938 320 179 10 59 368 144 431 1.32e-33 134
MsG0180005655.01.T01 AT3G08720 30.938 320 179 10 59 368 144 431 1.32e-33 134
MsG0180005655.01.T01 AT3G08720 30.938 320 179 10 59 368 144 431 1.32e-33 134
MsG0180005655.01.T01 AT5G03730 34.082 267 157 8 59 318 555 809 2.31e-33 137
MsG0180005655.01.T01 AT5G03730 34.082 267 157 8 59 318 555 809 2.31e-33 137
MsG0180005655.01.T01 AT4G12020 42.857 182 85 6 55 233 1626 1791 2.45e-33 137
MsG0180005655.01.T01 AT4G12020 42.857 182 85 6 55 233 1626 1791 2.45e-33 137
MsG0180005655.01.T01 AT4G12020 42.857 182 85 6 55 233 1618 1783 2.54e-33 137
MsG0180005655.01.T01 AT4G10730 30.435 276 172 6 52 318 24 288 3.74e-33 135
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MsG0180005655.01.T01 AT4G10730 30.435 276 172 6 52 318 44 308 4.21e-33 135
MsG0180005655.01.T01 AT4G35780 31.923 260 151 10 61 313 298 538 4.36e-33 134
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MsG0180005655.01.T01 AT3G08730 29.653 317 187 10 59 368 138 425 1.13e-32 131
MsG0180005655.01.T01 AT3G08730 29.653 317 187 10 59 368 138 425 1.13e-32 131
MsG0180005655.01.T01 AT2G25090 27.465 284 190 6 54 329 14 289 1.29e-32 131
MsG0180005655.01.T01 AT3G06630 34.940 249 143 7 58 301 437 671 2.18e-32 133
MsG0180005655.01.T01 AT5G55560 34.909 275 148 11 56 317 32 288 2.32e-32 127
MsG0180005655.01.T01 AT5G11850 30.337 267 168 7 53 313 604 858 2.63e-32 133
MsG0180005655.01.T01 AT5G14720 30.483 269 167 6 59 318 20 277 4.65e-32 132
MsG0180005655.01.T01 AT5G14720 30.483 269 167 6 59 318 20 277 4.65e-32 132
MsG0180005655.01.T01 AT1G62400 31.923 260 162 8 58 313 89 337 4.69e-32 128
MsG0180005655.01.T01 AT1G29230 27.969 261 177 5 54 313 73 323 5.80e-32 130
MsG0180005655.01.T01 AT5G56580 32.090 268 164 8 59 318 74 331 7.13e-32 127
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MsG0180005655.01.T01 AT5G57630 27.063 303 206 7 54 354 11 300 9.53e-32 128
MsG0180005655.01.T01 AT4G31170 31.008 258 167 6 58 313 134 382 1.01e-31 128
MsG0180005655.01.T01 AT4G31170 31.008 258 167 6 58 313 134 382 1.01e-31 128
MsG0180005655.01.T01 AT4G31170 31.008 258 167 6 58 313 134 382 1.01e-31 128
MsG0180005655.01.T01 AT4G31170 31.008 258 167 6 58 313 134 382 1.01e-31 128
MsG0180005655.01.T01 AT4G31170 31.008 258 167 6 58 313 134 382 1.01e-31 128
MsG0180005655.01.T01 AT4G31170 31.008 258 167 6 58 313 134 382 1.01e-31 128
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MsG0180005655.01.T01 AT3G63280 28.920 287 185 7 54 333 3 277 1.59e-30 126
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MsG0180005655.01.T01 AT3G04810 29.278 263 171 5 59 318 8 258 1.54e-28 121
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MsG0180005655.01.T01 AT1G01140 27.599 279 183 8 42 313 3 269 3.44e-28 118
MsG0180005655.01.T01 AT4G18710 28.614 339 183 15 17 318 8 324 3.57e-28 117
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MsG0180005655.01.T01 AT5G50860 33.628 226 126 7 43 258 102 313 4.59e-28 118
MsG0180005655.01.T01 AT5G25110 27.612 268 179 6 54 318 42 297 4.62e-28 118
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MsG0180005655.01.T01 AT4G13020 29.217 332 181 12 54 349 11 324 4.73e-28 117
MsG0180005655.01.T01 AT5G27510 31.154 260 162 6 105 350 45 301 4.82e-28 115
MsG0180005655.01.T01 AT1G08650 31.599 269 161 6 54 313 14 268 5.49e-28 114
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MsG0180005655.01.T01 AT4G13020 28.012 332 194 12 54 349 3 325 8.14e-28 116
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MsG0180005655.01.T01 AT2G31010 29.740 269 167 8 58 322 522 772 9.28e-28 119
MsG0180005655.01.T01 AT1G30270 25.830 271 191 4 54 323 30 291 1.08e-27 117
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MsG0180005655.01.T01 AT3G44200 28.315 279 184 6 59 333 12 278 1.16e-27 119
MsG0180005655.01.T01 AT1G30270 25.830 271 191 4 54 323 30 291 1.27e-27 117
MsG0180005655.01.T01 AT3G23000 28.897 263 173 8 54 313 24 275 1.34e-27 116
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MsG0180005655.01.T01 AT4G13020 28.012 332 194 12 54 349 3 325 1.47e-27 116
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MsG0180005655.01.T01 AT1G03740 34.742 213 113 8 57 258 215 412 2.30e-27 117
MsG0180005655.01.T01 AT1G12580 27.138 269 183 5 54 318 43 302 2.30e-27 117
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MsG0180005655.01.T01 AT3G45790 30.970 268 157 6 55 303 96 354 3.18e-27 114
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MsG0180005655.01.T01 AT1G53050 32.338 201 126 4 61 258 140 333 4.22e-27 117
MsG0180005655.01.T01 AT5G64960 33.617 235 121 10 50 258 14 239 4.33e-27 115
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MsG0180005655.01.T01 AT5G66880 30.566 265 157 8 61 315 28 275 7.44e-27 112
MsG0180005655.01.T01 AT3G05840 27.941 340 164 15 49 343 67 370 7.56e-27 114
MsG0180005655.01.T01 AT3G05840 27.941 340 164 15 49 343 67 370 7.56e-27 114
MsG0180005655.01.T01 AT5G26751 27.941 340 164 15 49 343 63 366 7.72e-27 113
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MsG0180005655.01.T01 AT3G01090 23.204 362 231 9 55 399 19 350 3.26e-26 113
MsG0180005655.01.T01 AT5G60550 30.000 270 171 6 61 321 113 373 3.34e-26 111
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MsG0180005655.01.T01 AT3G06630 40.000 180 91 6 58 232 437 604 5.06e-26 113
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MsG0180005655.01.T01 AT1G54610 32.857 210 113 8 61 258 124 317 1.53e-25 111
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MsG0180005655.01.T01 AT5G01810 27.376 263 178 5 53 313 10 261 1.55e-25 110
MsG0180005655.01.T01 AT1G71530 31.707 205 122 7 61 258 153 346 1.57e-25 110
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MsG0180005655.01.T01 AT3G51630 31.022 274 166 10 56 320 26 285 1.63e-25 111
MsG0180005655.01.T01 AT3G45240 30.797 276 169 7 53 321 109 369 1.65e-25 109
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MsG0180005655.01.T01 AT1G71530 32.178 202 125 6 61 258 153 346 2.18e-25 109
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MsG0180005655.01.T01 AT5G01820 27.331 311 206 7 54 356 21 319 3.17e-25 109
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MsG0180005655.01.T01 AT2G26980 29.327 208 141 2 54 260 23 225 3.20e-25 109
MsG0180005655.01.T01 AT1G74330 32.127 221 123 6 52 258 115 322 3.32e-25 111
MsG0180005655.01.T01 AT3G48260 27.597 308 196 10 56 356 23 310 3.95e-25 110
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MsG0180005655.01.T01 AT4G19110 27.609 297 176 9 54 322 3 288 5.38e-25 108
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MsG0180005655.01.T01 AT4G33080 26.644 289 156 5 60 299 99 380 6.11e-25 109
MsG0180005655.01.T01 AT1G03920 25.449 334 193 8 60 349 29 350 7.13e-25 108
MsG0180005655.01.T01 AT1G12680 26.718 262 175 4 58 318 110 355 7.48e-25 108
MsG0180005655.01.T01 AT5G12480 27.526 287 188 9 40 318 43 317 7.77e-25 109
MsG0180005655.01.T01 AT1G03920 25.449 334 193 8 60 349 142 463 8.04e-25 109
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MsG0180005655.01.T01 AT3G61160 27.660 329 171 13 53 343 100 399 1.01e-24 107
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MsG0180005655.01.T01 AT3G61160 27.660 329 171 13 53 343 100 399 1.22e-24 107
MsG0180005655.01.T01 AT1G33770 33.168 202 123 6 61 258 147 340 1.34e-24 108
MsG0180005655.01.T01 AT3G61160 27.660 329 171 13 53 343 107 406 1.47e-24 107
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MsG0180005655.01.T01 AT3G08870 28.269 283 168 8 54 315 388 656 3.32e-24 108
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MsG0180005655.01.T01 AT3G08870 28.269 283 168 8 54 315 367 635 3.63e-24 107
MsG0180005655.01.T01 AT5G03140 32.710 214 124 6 60 266 379 579 3.77e-24 107
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MsG0180005655.01.T01 AT1G30640 25.442 283 163 3 60 299 125 402 4.19e-24 107
MsG0180005655.01.T01 AT3G05050 30.097 206 122 5 61 257 144 336 4.31e-24 107
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MsG0180005655.01.T01 AT3G05050 30.097 206 122 5 61 257 144 336 4.31e-24 107
MsG0180005655.01.T01 AT1G10940 30.556 252 142 8 61 299 10 241 4.40e-24 104
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MsG0180005655.01.T01 AT5G06740 30.216 278 159 9 61 313 348 615 7.86e-24 107
MsG0180005655.01.T01 AT3G57530 27.239 268 176 8 58 318 66 321 8.22e-24 106
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MsG0180005655.01.T01 AT5G58350 27.660 282 167 10 56 321 20 280 1.01e-23 106
MsG0180005655.01.T01 AT4G04500 34.483 203 118 4 61 257 351 544 1.10e-23 106
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MsG0180005655.01.T01 AT4G00720 27.928 333 173 15 49 343 132 435 2.86e-23 103
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MsG0180005655.01.T01 AT2G42640 29.643 280 156 12 54 321 489 739 3.23e-23 105
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MsG0180005655.01.T01 AT1G23700 28.676 272 160 7 59 318 20 269 3.45e-23 102
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MsG0180005655.01.T01 AT5G44290 30.986 213 121 7 57 258 139 336 5.20e-23 103
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MsG0180005655.01.T01 AT5G44290 30.435 207 130 6 57 258 139 336 5.70e-23 103
MsG0180005655.01.T01 AT5G44290 30.435 207 130 6 57 258 139 336 5.70e-23 103
MsG0180005655.01.T01 AT5G44290 30.435 207 130 6 57 258 139 336 5.70e-23 103
MsG0180005655.01.T01 AT5G44290 30.435 207 130 6 57 258 139 336 5.70e-23 103
MsG0180005655.01.T01 AT4G11460 33.005 203 121 4 61 257 277 470 6.01e-23 103
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MsG0180005655.01.T01 AT5G54590 30.000 270 159 8 60 313 118 373 6.86e-23 102
MsG0180005655.01.T01 AT5G54590 30.000 270 159 8 60 313 118 373 6.86e-23 102
MsG0180005655.01.T01 AT2G28970 31.878 229 137 7 60 279 484 702 6.95e-23 104
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MsG0180005655.01.T01 AT2G02800 27.622 286 172 6 55 313 83 360 7.32e-23 102
MsG0180005655.01.T01 AT4G11460 33.005 203 121 4 61 257 352 545 7.76e-23 103
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MsG0180005655.01.T01 AT4G23250 32.020 203 123 4 61 257 360 553 9.15e-23 103
MsG0180005655.01.T01 AT1G16260 32.773 238 134 9 54 279 389 612 1.10e-22 103
MsG0180005655.01.T01 AT1G16260 32.773 238 134 9 54 279 389 612 1.10e-22 103
MsG0180005655.01.T01 AT5G50000 26.087 276 173 8 60 313 87 353 1.39e-22 100
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MsG0180005655.01.T01 AT5G01850 27.941 272 164 12 58 313 21 276 1.67e-22 99.4
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MsG0180005655.01.T01 AT4G11480 32.547 212 124 6 54 257 323 523 2.11e-22 102
MsG0180005655.01.T01 AT5G15730 32.414 290 153 13 60 330 119 384 2.21e-22 100
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MsG0180005655.01.T01 AT1G15530 28.369 282 166 10 59 316 365 634 2.42e-22 102
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MsG0180005655.01.T01 AT2G19230 30.876 217 127 6 60 267 574 776 2.82e-22 102
MsG0180005655.01.T01 AT1G64630 29.897 291 170 12 56 332 17 287 2.91e-22 101
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MsG0180005655.01.T01 AT5G15730 32.765 293 150 15 60 330 119 386 2.95e-22 100
MsG0180005655.01.T01 AT5G15730 32.765 293 150 15 60 330 119 386 2.95e-22 100
MsG0180005655.01.T01 AT4G10010 37.342 158 93 5 105 258 20 175 2.96e-22 100
MsG0180005655.01.T01 AT4G29050 32.857 210 127 4 55 259 358 558 3.31e-22 101
MsG0180005655.01.T01 AT4G29050 32.857 210 127 4 55 259 344 544 3.57e-22 101
MsG0180005655.01.T01 AT1G78290 28.090 267 165 8 61 317 10 259 3.94e-22 98.6
MsG0180005655.01.T01 AT1G78290 28.090 267 165 8 61 317 10 259 3.94e-22 98.6
MsG0180005655.01.T01 AT5G35960 30.198 202 128 5 60 257 139 331 4.76e-22 99.4
MsG0180005655.01.T01 AT1G18890 26.493 268 178 8 58 318 66 321 4.96e-22 100
MsG0180005655.01.T01 AT3G61160 28.136 295 157 12 53 309 100 377 5.16e-22 99.0
MsG0180005655.01.T01 AT1G49160 33.937 221 130 9 105 318 121 332 5.42e-22 100
MsG0180005655.01.T01 AT5G58940 32.710 214 129 7 61 267 153 358 5.67e-22 99.8
MsG0180005655.01.T01 AT5G58940 32.710 214 129 7 61 267 153 358 5.67e-22 99.8
MsG0180005655.01.T01 AT5G58940 32.710 214 129 7 61 267 153 358 5.67e-22 99.8
MsG0180005655.01.T01 AT5G58940 32.710 214 129 7 61 267 153 358 5.67e-22 99.8
MsG0180005655.01.T01 AT1G01560 27.326 344 186 16 19 324 17 334 5.77e-22 98.6
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MsG0180005655.01.T01 AT5G59270 27.798 277 172 8 55 313 352 618 6.19e-22 100
MsG0180005655.01.T01 AT1G18390 29.245 212 135 5 61 267 350 551 6.57e-22 100
MsG0180005655.01.T01 AT5G41990 29.348 276 165 11 56 319 30 287 6.64e-22 100
MsG0180005655.01.T01 AT5G35960 30.198 202 128 5 60 257 139 331 6.97e-22 99.4
MsG0180005655.01.T01 AT5G59270 28.159 277 171 8 55 313 368 634 7.18e-22 100
MsG0180005655.01.T01 AT1G76040 26.894 264 178 7 61 319 118 371 7.25e-22 99.8
MsG0180005655.01.T01 AT1G76040 27.273 264 177 7 61 319 118 371 7.39e-22 100
MsG0180005655.01.T01 AT3G51850 26.996 263 177 7 61 318 60 312 7.80e-22 99.0
MsG0180005655.01.T01 AT3G51850 27.027 296 192 9 37 318 27 312 7.86e-22 99.8
MsG0180005655.01.T01 AT5G59260 28.571 280 166 9 55 313 355 621 9.26e-22 100
MsG0180005655.01.T01 AT1G06840 26.990 289 185 8 61 332 631 910 9.36e-22 100
MsG0180005655.01.T01 AT5G12180 26.115 314 198 8 29 318 28 331 9.42e-22 99.8
MsG0180005655.01.T01 AT1G10940 29.615 260 142 9 61 299 10 249 1.01e-21 97.8
MsG0180005655.01.T01 AT5G01020 26.354 277 184 5 55 313 69 343 1.03e-21 98.6
MsG0180005655.01.T01 AT3G24240 29.670 273 168 9 60 312 791 1059 1.11e-21 100
MsG0180005655.01.T01 AT1G09600 32.524 206 127 6 57 258 165 362 1.15e-21 100
MsG0180005655.01.T01 AT4G04510 33.654 208 113 6 61 257 347 540 1.15e-21 100
MsG0180005655.01.T01 AT4G04510 33.654 208 113 6 61 257 345 538 1.25e-21 99.8
MsG0180005655.01.T01 AT1G18390 29.245 212 135 5 61 267 344 545 1.25e-21 99.8
MsG0180005655.01.T01 AT3G58760 29.515 227 141 7 94 308 197 416 1.28e-21 99.0
MsG0180005655.01.T01 AT3G51850 27.027 296 192 9 37 318 27 312 1.30e-21 99.4
MsG0180005655.01.T01 AT4G31170 34.857 175 105 5 58 230 134 301 1.30e-21 96.3
MsG0180005655.01.T01 AT4G31170 34.857 175 105 5 58 230 134 301 1.30e-21 96.3
MsG0180005655.01.T01 AT4G31170 34.857 175 105 5 58 230 134 301 1.30e-21 96.3
MsG0180005655.01.T01 AT1G25390 31.905 210 123 7 57 258 293 490 1.52e-21 99.8
MsG0180005655.01.T01 AT1G25390 31.905 210 123 7 57 258 293 490 1.52e-21 99.8
MsG0180005655.01.T01 AT3G61160 30.126 239 135 10 53 276 100 321 1.54e-21 97.1
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MsG0180005655.01.T01 AT3G18040 27.213 305 170 10 54 318 22 314 1.62e-21 99.0
MsG0180005655.01.T01 AT3G58760 29.515 227 141 7 94 308 260 479 1.73e-21 99.0
MsG0180005655.01.T01 AT3G58760 29.515 227 141 7 94 308 260 479 1.73e-21 99.0
MsG0180005655.01.T01 AT4G36450 28.082 292 163 8 61 318 38 316 1.77e-21 97.1
MsG0180005655.01.T01 AT2G46070 27.083 336 183 15 20 319 53 362 1.79e-21 97.8
MsG0180005655.01.T01 AT3G18040 27.213 305 170 10 54 318 17 309 1.93e-21 98.6
MsG0180005655.01.T01 AT3G17510 29.843 191 129 2 133 322 13 199 1.98e-21 97.1
MsG0180005655.01.T01 AT2G46070 27.083 336 183 15 20 319 19 328 2.05e-21 97.1
MsG0180005655.01.T01 AT5G63370 30.198 202 133 5 61 258 169 366 2.17e-21 97.4
MsG0180005655.01.T01 AT2G17290 27.985 268 173 9 61 321 91 345 2.19e-21 98.6
MsG0180005655.01.T01 AT2G17290 27.985 268 173 9 61 321 91 345 2.19e-21 98.6
MsG0180005655.01.T01 AT2G46070 30.204 245 142 10 20 258 19 240 2.24e-21 95.9
MsG0180005655.01.T01 AT1G67580 28.856 201 132 5 61 258 412 604 2.27e-21 99.4
MsG0180005655.01.T01 AT1G67580 28.856 201 132 5 61 258 412 604 2.27e-21 99.4
MsG0180005655.01.T01 AT3G61160 30.126 239 135 10 53 276 107 328 2.46e-21 96.7
MsG0180005655.01.T01 AT2G46700 28.000 275 177 10 54 318 142 405 2.47e-21 99.0
MsG0180005655.01.T01 AT3G18040 27.213 305 170 10 54 318 131 423 2.82e-21 99.0
MsG0180005655.01.T01 AT5G21222 23.636 275 192 7 54 323 12 273 2.83e-21 99.4

Find 159 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 339 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATCCAGGAATGCTCTAATTT+TGG 0.136550 1:+94553824 None:intergenic
AAACTCCAGCAGAATATTTA+AGG 0.202348 1:+94557219 None:intergenic
AGATTTGAGGCTGCCGATTC+TGG 0.205521 1:+94557982 None:intergenic
CTAACACTCACAACAATATT+TGG 0.220898 1:+94557347 None:intergenic
CCTCTTTATGAAGAATTCTT+TGG 0.263581 1:-94553614 MsG0180005655.01.T01:CDS
TTGATATAGGCTACCATAAA+TGG 0.265707 1:-94556723 MsG0180005655.01.T01:intron
GATGCAGAAGGTCTTAAATT+TGG 0.266178 1:+94554808 None:intergenic
TTATTAGCTCTGCTGATATA+TGG 0.276524 1:-94555315 MsG0180005655.01.T01:intron
TGGATCTATCTCATCACTAT+TGG 0.304378 1:-94557188 MsG0180005655.01.T01:CDS
TTCTCATTGTAGACCTTTGC+AGG 0.306252 1:-94553399 MsG0180005655.01.T01:CDS
GTTGAATCAGGCTAATATTC+TGG 0.309256 1:-94557411 MsG0180005655.01.T01:intron
ATTCATCACCTGCGAGTATC+AGG 0.323067 1:-94554633 MsG0180005655.01.T01:CDS
TGTGTCAGACAGATAGTTTA+AGG 0.339485 1:-94554308 MsG0180005655.01.T01:CDS
TTGATTGGTTCCGGTGCCTT+TGG 0.342902 1:-94557920 MsG0180005655.01.T01:CDS
ATTCTTCATAAAGAGGTGTT+TGG 0.345380 1:+94553621 None:intergenic
ATCCAAAATTAGAGCATTCC+TGG 0.352328 1:-94553826 MsG0180005655.01.T01:CDS
TGATTGGTTCCGGTGCCTTT+GGG 0.358284 1:-94557919 MsG0180005655.01.T01:CDS
TACCTTTGTATTCTCTTTGA+AGG 0.361827 1:+94557740 None:intergenic
GCCTCAGTAGACAGATGTTC+AGG 0.365999 1:+94555032 None:intergenic
CTCCTCCTCCTCCGCCAATT+CGG 0.366827 1:-94557958 MsG0180005655.01.T01:CDS
TTCTGCATCAGACTTGTTAC+TGG 0.367053 1:-94554794 MsG0180005655.01.T01:intron
GCCGATCTTGTTGGCAAAAC+CGG 0.367886 1:+94558021 None:intergenic
ATTACATCAGGCCTTTGAAT+TGG 0.368563 1:-94553651 MsG0180005655.01.T01:intron
TGCCTTTGGGAGGGTCTACA+TGG 0.373023 1:-94557906 MsG0180005655.01.T01:CDS
AAGGGTGAGTTGATTGGTTC+CGG 0.380035 1:-94557929 MsG0180005655.01.T01:CDS
CAATATCACGCAGTTCAATC+AGG 0.382429 1:-94554601 MsG0180005655.01.T01:CDS
CCAAAGAATTCTTCATAAAG+AGG 0.391659 1:+94553614 None:intergenic
GACTCTTCATGATGCTGAGC+TGG 0.395785 1:-94553342 MsG0180005655.01.T01:CDS
TGGCGTAAGGGTGAGTTGAT+TGG 0.399709 1:-94557935 MsG0180005655.01.T01:CDS
CTCCTTTGATTCATTGAGCT+CGG 0.400864 1:+94553364 None:intergenic
TTTCTAGTGTTCAGCCCATT+TGG 0.401219 1:+94554464 None:intergenic
CTGTCTGACACACATCCTTT+AGG 0.401862 1:+94554319 None:intergenic
GGATCTATCTCATCACTATT+GGG 0.403211 1:-94557187 MsG0180005655.01.T01:CDS
CGCCACCGAATTGGCGGAGG+AGG 0.405337 1:+94557953 None:intergenic
CATGCAATGCAAGACTTCTT+CGG 0.405712 1:-94558103 None:intergenic
TAGAGCATTCCTGGATGATA+AGG 0.405807 1:-94553817 MsG0180005655.01.T01:intron
TGATATCCCTGTGAATAATT+CGG 0.407442 1:+94556999 None:intergenic
TCATCACTATTGGGAAAATT+CGG 0.411761 1:-94557178 MsG0180005655.01.T01:CDS
CAATCCAATGTCCGAGCCTC+TGG 0.412412 1:-94554027 MsG0180005655.01.T01:CDS
ATCCAGAAAAGTAGTGGAAT+TGG 0.412728 1:-94556835 MsG0180005655.01.T01:intron
TCACCCTTACGCCACCGAAT+TGG 0.416518 1:+94557944 None:intergenic
AGAGCTTATTGCTGTTAAAC+AGG 0.417026 1:-94557864 MsG0180005655.01.T01:intron
ACTCGCTGCTGACGACATAA+AGG 0.417129 1:-94554142 MsG0180005655.01.T01:intron
GCCATCGTCGGTGGAGGGTG+GGG 0.421722 1:+94558051 None:intergenic
GGCCTGTGCAAGTTGATCCT+TGG 0.426661 1:+94554340 None:intergenic
CGGCCATCGTCGGTGGAGGG+TGG 0.427159 1:+94558049 None:intergenic
GAGAACTCATTCTCTGCATT+AGG 0.432384 1:+94553897 None:intergenic
TCATTTATTATAGAGATACT+TGG 0.436912 1:-94557263 MsG0180005655.01.T01:intron
TCCGCCAATTCGGTGGCGTA+AGG 0.437462 1:-94557948 MsG0180005655.01.T01:CDS
TCCTCCAGAGGCTCGGACAT+TGG 0.440362 1:+94554023 None:intergenic
ACCGACGATGGCCGCTTCAC+CGG 0.440577 1:-94558040 MsG0180005655.01.T01:CDS
GGCCATCGTCGGTGGAGGGT+GGG 0.443023 1:+94558050 None:intergenic
TTACTTTGAGCAACAGCAAA+AGG 0.445362 1:+94553563 None:intergenic
CACCGAATTGGCGGAGGAGG+AGG 0.446575 1:+94557956 None:intergenic
ACTCTCCTGGCTTGTTACAT+TGG 0.446621 1:+94553457 None:intergenic
TGTATTAAACTCGCAGACTT+TGG 0.449430 1:-94556861 MsG0180005655.01.T01:CDS
AAATATCTTACGAAACTTAG+TGG 0.451413 1:-94553428 MsG0180005655.01.T01:CDS
CGAATTGGCGGAGGAGGAGG+AGG 0.452325 1:+94557959 None:intergenic
GAAGCGGCCATCGTCGGTGG+AGG 0.452700 1:+94558045 None:intergenic
TCTTATCAGATGATACCAAA+TGG 0.459100 1:-94554479 MsG0180005655.01.T01:CDS
CCGAGCCTCTGGAGGATGAC+TGG 0.459257 1:-94554016 MsG0180005655.01.T01:CDS
CCCTTACGCCACCGAATTGG+CGG 0.464275 1:+94557947 None:intergenic
TGGGGATACTGTTGACTCCA+TGG 0.464416 1:+94555250 None:intergenic
CCTGTCTGTAAAATAACTTC+AGG 0.464591 1:+94556663 None:intergenic
TGCAGTTTGGATTCTATCCA+AGG 0.485395 1:-94554357 MsG0180005655.01.T01:intron
AGATTCCTTAAATATTCTGC+TGG 0.486582 1:-94557224 MsG0180005655.01.T01:CDS
TTTGATTCATTGAGCTCGGA+TGG 0.487095 1:+94553368 None:intergenic
AAATGGAGCAAAATCTATGA+AGG 0.488456 1:-94556706 MsG0180005655.01.T01:CDS
TAAAATCCACTCACCGACTC+AGG 0.490280 1:+94557148 None:intergenic
CAATAAGCTCTCCGGAATCA+AGG 0.496630 1:+94557876 None:intergenic
ACAATAACCGAATTATTCAC+AGG 0.498039 1:-94557006 MsG0180005655.01.T01:CDS
AGTAGACAGATGTTCAGGTA+TGG 0.503520 1:+94555037 None:intergenic
CTTATCAGATGATACCAAAT+GGG 0.505210 1:-94554478 MsG0180005655.01.T01:CDS
GCCGATTCTGGATTTGCGAA+TGG 0.506571 1:+94557994 None:intergenic
ATCAACTTGCACAGGCCTAA+AGG 0.508879 1:-94554334 MsG0180005655.01.T01:CDS
TATGTCGTCAGCAGCGAGTA+GGG 0.515785 1:+94554146 None:intergenic
TGGTTCCGGTGCCTTTGGGA+GGG 0.517624 1:-94557915 MsG0180005655.01.T01:CDS
GCCATTCGCAAATCCAGAAT+CGG 0.518772 1:-94557995 MsG0180005655.01.T01:CDS
ATGGGCATGAACCTTGATTC+CGG 0.521040 1:-94557887 MsG0180005655.01.T01:CDS
TTTAAAAGCAGGTTCCTACC+AGG 0.524607 1:-94554247 MsG0180005655.01.T01:CDS
AATGGCGGAGCCGATCTTGT+TGG 0.529845 1:+94558012 None:intergenic
TTGGAGCTTCTCCAATTCAA+AGG 0.530210 1:+94553640 None:intergenic
ATCCAAGGATCAACTTGCAC+AGG 0.530507 1:-94554342 MsG0180005655.01.T01:CDS
TGATACTCGCAGGTGATGAA+TGG 0.530851 1:+94554635 None:intergenic
CCGCCAATTCGGTGGCGTAA+GGG 0.531327 1:-94557947 MsG0180005655.01.T01:CDS
ACTCTTCATGATGCTGAGCT+GGG 0.532029 1:-94553341 MsG0180005655.01.T01:CDS
AAGCGGCCATCGTCGGTGGA+GGG 0.533899 1:+94558046 None:intergenic
AGCAAAAGGCGCAGGAGGAA+TGG 0.534877 1:+94553577 None:intergenic
TTCTCTTTGAAGGCAATACC+AGG 0.534946 1:+94557750 None:intergenic
AAGATATAACCTTATCATCC+AGG 0.535396 1:+94553808 None:intergenic
CATCATCGTTGTCTGCTCCC+TGG 0.537869 1:+94554229 None:intergenic
GGTGAAGCGGCCATCGTCGG+TGG 0.539433 1:+94558042 None:intergenic
AATTATTCACAGGGATATCA+AGG 0.540305 1:-94556996 MsG0180005655.01.T01:intron
CTCCTCCTCCGCCAATTCGG+TGG 0.543568 1:-94557955 MsG0180005655.01.T01:CDS
TTGGTTCCGGTGCCTTTGGG+AGG 0.544027 1:-94557916 MsG0180005655.01.T01:CDS
AACTAGACGACGATTCTCAA+TGG 0.545671 1:-94553489 MsG0180005655.01.T01:CDS
CCAGTCATCCTCCAGAGGCT+CGG 0.546188 1:+94554016 None:intergenic
TGGCTACAGGAAAGCCTCCA+TGG 0.546708 1:-94555267 MsG0180005655.01.T01:CDS
CATTTATTATAGAGATACTT+GGG 0.547248 1:-94557262 MsG0180005655.01.T01:intron
AACATTCTAGTTGATAACAA+AGG 0.552076 1:-94556885 MsG0180005655.01.T01:CDS
ACATTCTAGTTGATAACAAA+GGG 0.552824 1:-94556884 MsG0180005655.01.T01:CDS
TCATCATCTTCAACCGCAAG+AGG 0.553581 1:+94553861 None:intergenic
AATCGTCGTCTAGTTTGACT+TGG 0.557247 1:+94553497 None:intergenic
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CRISPR-GE

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TTGATATAGGCTACCATAAA+TGG - Chr1:94554684-94554703 MsG0180005655.01.T01:intron 30.0%
TTTCATAGTAGTTTGATCTG+GGG + Chr1:94557469-94557488 None:intergenic 30.0%
! ATATTTGGTAGTTGTGTTGT+TGG - Chr1:94554487-94554506 MsG0180005655.01.T01:intron 30.0%
! ATCTTTTTCCCTTCAATTCT+AGG - Chr1:94555133-94555152 MsG0180005655.01.T01:intron 30.0%
! ATTAGTGTTTGTTGAACACT+TGG - Chr1:94557324-94557343 MsG0180005655.01.T01:intron 30.0%
! CATAGATTTTGCTCCATTTA+TGG + Chr1:94554700-94554719 None:intergenic 30.0%
! GTTTTCATAGTAGTTTGATC+TGG + Chr1:94557471-94557490 None:intergenic 30.0%
! TAGAAATATAGACTTTTGGG+TGG - Chr1:94555068-94555087 MsG0180005655.01.T01:CDS 30.0%
! TAGTTGTGTTGTTGGATATA+GGG - Chr1:94554495-94554514 MsG0180005655.01.T01:intron 30.0%
! TATGATTTTATATCAGCTGG+GGG - Chr1:94553925-94553944 MsG0180005655.01.T01:CDS 30.0%
! TCTTTTTCCCTTCAATTCTA+GGG - Chr1:94555134-94555153 MsG0180005655.01.T01:intron 30.0%
! TTCTTGTGTAACTTTGTTTG+TGG - Chr1:94554638-94554657 MsG0180005655.01.T01:CDS 30.0%
!! ACGTAAGTGGACTAAATATT+TGG - Chr1:94554774-94554793 MsG0180005655.01.T01:intron 30.0%
!! AGGTAGAAGTTCTTTTGTTT+TGG - Chr1:94555563-94555582 MsG0180005655.01.T01:intron 30.0%
!! ATTCTTCATAAAGAGGTGTT+TGG + Chr1:94557789-94557808 None:intergenic 30.0%
!! TTATTAGCTCTGCTGATATA+TGG - Chr1:94556092-94556111 MsG0180005655.01.T01:intron 30.0%
!!! AGAAGTTCTTTTGTTTTGGT+CGG - Chr1:94555567-94555586 MsG0180005655.01.T01:intron 30.0%
!!! GCTACTGCTTTTTTTCTTAT+TGG + Chr1:94553887-94553906 None:intergenic 30.0%
!!! GGGAAAATTGAGTTTTGAAT+TGG - Chr1:94555606-94555625 MsG0180005655.01.T01:intron 30.0%
!!! TGCTTCTTGTTGTTTTCTTT+AGG - Chr1:94553623-94553642 MsG0180005655.01.T01:CDS 30.0%
AAAAGTTGCCCTAGAATTGA+AGG + Chr1:94555145-94555164 None:intergenic 35.0%
AAAGTTGCCCTAGAATTGAA+GGG + Chr1:94555144-94555163 None:intergenic 35.0%
AATATCACGCAGTTCAATCA+GGG - Chr1:94556807-94556826 MsG0180005655.01.T01:intron 35.0%
AATCACTACCCATCAATTTG+TGG - Chr1:94556566-94556585 MsG0180005655.01.T01:intron 35.0%
ACACAACTACCAAATATGAG+AGG + Chr1:94554484-94554503 None:intergenic 35.0%
AGAGTTTCATCAAACTTGCA+AGG + Chr1:94557417-94557436 None:intergenic 35.0%
ATAACTTTCAGATGCAGAAC+TGG + Chr1:94554828-94554847 None:intergenic 35.0%
ATTACAAACTGTAACCTCAC+AGG + Chr1:94555368-94555387 None:intergenic 35.0%
ATTACATCAGGCCTTTGAAT+TGG - Chr1:94557756-94557775 MsG0180005655.01.T01:CDS 35.0%
ATTTAGGGGTTATGATACGA+GGG + Chr1:94555495-94555514 None:intergenic 35.0%
CAAGTTCATGGAGATATGAT+GGG - Chr1:94554288-94554307 MsG0180005655.01.T01:CDS 35.0%
CACAACTACCAAATATGAGA+GGG + Chr1:94554483-94554502 None:intergenic 35.0%
CATTGTATAAACTCACACTG+GGG + Chr1:94556840-94556859 None:intergenic 35.0%
CCTGTCTGTAAAATAACTTC+AGG + Chr1:94554747-94554766 None:intergenic 35.0%
CTATTGTTAGGAACCAAAGT+TGG + Chr1:94555051-94555070 None:intergenic 35.0%
CTGATAAGAGTCCTAGATAT+TGG + Chr1:94556917-94556936 None:intergenic 35.0%
CTTATTGGAAACTCAGTATC+TGG + Chr1:94553872-94553891 None:intergenic 35.0%
GATGCAGAAGGTCTTAAATT+TGG + Chr1:94556602-94556621 None:intergenic 35.0%
GATTGATCCTCTAGATTAGT+CGG - Chr1:94553838-94553857 MsG0180005655.01.T01:CDS 35.0%
GCAATCACCATAATGAATTC+CGG - Chr1:94555193-94555212 MsG0180005655.01.T01:intron 35.0%
GGATCTATCTCATCACTATT+GGG - Chr1:94554220-94554239 MsG0180005655.01.T01:CDS 35.0%
GTAAATGCAGACTAGACTAT+GGG - Chr1:94555824-94555843 MsG0180005655.01.T01:intron 35.0%
GTTGAATCAGGCTAATATTC+TGG - Chr1:94553996-94554015 MsG0180005655.01.T01:CDS 35.0%
TAGGAAATACAACCCCTATA+TGG + Chr1:94555445-94555464 None:intergenic 35.0%
TATTCTGTTGTTCTGCAGTT+TGG - Chr1:94557037-94557056 MsG0180005655.01.T01:CDS 35.0%
TATTTAGGGGTTATGATACG+AGG + Chr1:94555496-94555515 None:intergenic 35.0%
TCAAGTTCATGGAGATATGA+TGG - Chr1:94554287-94554306 MsG0180005655.01.T01:CDS 35.0%
TGAGGTTACAGTTTGTAATC+CGG - Chr1:94555369-94555388 MsG0180005655.01.T01:intron 35.0%
TGCCTTCAAAGAGAATACAA+AGG - Chr1:94553665-94553684 MsG0180005655.01.T01:intron 35.0%
TGGATCTATCTCATCACTAT+TGG - Chr1:94554219-94554238 MsG0180005655.01.T01:CDS 35.0%
TGTAAATGCAGACTAGACTA+TGG - Chr1:94555823-94555842 MsG0180005655.01.T01:intron 35.0%
TGTATTAAACTCGCAGACTT+TGG - Chr1:94554546-94554565 MsG0180005655.01.T01:intron 35.0%
TGTGTCAGACAGATAGTTTA+AGG - Chr1:94557099-94557118 MsG0180005655.01.T01:intron 35.0%
TTACTTTGAGCAACAGCAAA+AGG + Chr1:94557847-94557866 None:intergenic 35.0%
TTCGTATGTCATGGAATGAA+AGG - Chr1:94554875-94554894 MsG0180005655.01.T01:intron 35.0%
TTGCGTAATCATCTTAGACA+TGG - Chr1:94555768-94555787 MsG0180005655.01.T01:intron 35.0%
TTGTTCGTGGAACTTCTTAT+AGG - Chr1:94556997-94557016 MsG0180005655.01.T01:CDS 35.0%
TTTAACAGCAATAAGCTCTC+CGG + Chr1:94553542-94553561 None:intergenic 35.0%
! AACTAAAAGTATGTACCTCC+TGG + Chr1:94556180-94556199 None:intergenic 35.0%
! ACTAAAAGTATGTACCTCCT+GGG + Chr1:94556179-94556198 None:intergenic 35.0%
! AGAGCTTATTGCTGTTAAAC+AGG - Chr1:94553543-94553562 MsG0180005655.01.T01:CDS 35.0%
! ATATTACGTAAGTTGGCTGA+AGG + Chr1:94556659-94556678 None:intergenic 35.0%
! ATCCAAAATTAGAGCATTCC+TGG - Chr1:94557581-94557600 MsG0180005655.01.T01:intron 35.0%
! ATCCAGAAAAGTAGTGGAAT+TGG - Chr1:94554572-94554591 MsG0180005655.01.T01:intron 35.0%
! ATCCAGGAATGCTCTAATTT+TGG + Chr1:94557586-94557605 None:intergenic 35.0%
! ATTACATAAAGCTTTGGCGA+TGG + Chr1:94555710-94555729 None:intergenic 35.0%
! ATTGATCCTCTAGATTAGTC+GGG - Chr1:94553839-94553858 MsG0180005655.01.T01:CDS 35.0%
! GATATTTTCTTTGACTCTCC+TGG + Chr1:94557966-94557985 None:intergenic 35.0%
! GTAGTTGTGTTGTTGGATAT+AGG - Chr1:94554494-94554513 MsG0180005655.01.T01:intron 35.0%
! TATTACGTAAGTTGGCTGAA+GGG + Chr1:94556658-94556677 None:intergenic 35.0%
!! ACAGTTTGACATTTAGGTTG+AGG - Chr1:94556514-94556533 MsG0180005655.01.T01:intron 35.0%
!! CAGTTTGACATTTAGGTTGA+GGG - Chr1:94556515-94556534 MsG0180005655.01.T01:intron 35.0%
!! CCTGAAGTTATTTTACAGAC+AGG - Chr1:94554744-94554763 MsG0180005655.01.T01:intron 35.0%
!! TACCAATTCCACTACTTTTC+TGG + Chr1:94554577-94554596 None:intergenic 35.0%
!! TTTTCAGGACAGAACGAAAT+AGG + Chr1:94555464-94555483 None:intergenic 35.0%
!!! ATTTTCAAGTGAACCTCTTG+CGG - Chr1:94557533-94557552 MsG0180005655.01.T01:intron 35.0%
!!! TCGGCATGTTTACTTTTTTG+AGG + Chr1:94555673-94555692 None:intergenic 35.0%
!!! TCTTTTGTTTTGGTCGGAAA+TGG - Chr1:94555573-94555592 MsG0180005655.01.T01:intron 35.0%
!!! TTTCCTTGTTTTGAGCTTCA+TGG - Chr1:94553744-94553763 MsG0180005655.01.T01:intron 35.0%
AACTAGACGACGATTCTCAA+TGG - Chr1:94557918-94557937 MsG0180005655.01.T01:CDS 40.0%
AAGAACCAAATTGCAGAGAG+AGG + Chr1:94556275-94556294 None:intergenic 40.0%
AGAACCAAATTGCAGAGAGA+GGG + Chr1:94556274-94556293 None:intergenic 40.0%
AGTAACAAGTCTGATGCAGA+AGG + Chr1:94556614-94556633 None:intergenic 40.0%
AGTAGACAGATGTTCAGGTA+TGG + Chr1:94556373-94556392 None:intergenic 40.0%
ATCCGAGCTCAATGAATCAA+AGG - Chr1:94558041-94558060 MsG0180005655.01.T01:CDS 40.0%
CAATATCACGCAGTTCAATC+AGG - Chr1:94556806-94556825 MsG0180005655.01.T01:intron 40.0%
CTCCTTTGATTCATTGAGCT+CGG + Chr1:94558046-94558065 None:intergenic 40.0%
CTTCCATGAAGCTCAAAACA+AGG + Chr1:94553750-94553769 None:intergenic 40.0%
GACAGGATATACAACGTAAG+TGG - Chr1:94554761-94554780 MsG0180005655.01.T01:intron 40.0%
GAGAACTCATTCTCTGCATT+AGG + Chr1:94557513-94557532 None:intergenic 40.0%
GATGGACCAATGGTTGAAAT+CGG + Chr1:94555692-94555711 None:intergenic 40.0%
GTAGACAGATGTTCAGGTAT+GGG + Chr1:94556372-94556391 None:intergenic 40.0%
TCATTCTCTGCATTAGGAGA+TGG + Chr1:94557507-94557526 None:intergenic 40.0%
TCTGTCTATCTCGTTGAATC+AGG - Chr1:94553984-94554003 MsG0180005655.01.T01:CDS 40.0%
TGCAGTTTGGATTCTATCCA+AGG - Chr1:94557050-94557069 MsG0180005655.01.T01:CDS 40.0%
TGGTGATTGCTTAACTATCC+TGG + Chr1:94555183-94555202 None:intergenic 40.0%
TGTTCTGTCCCTCTCATATT+TGG - Chr1:94554472-94554491 MsG0180005655.01.T01:CDS 40.0%
TTAAAAGCAGGTTCCTACCA+GGG - Chr1:94557161-94557180 MsG0180005655.01.T01:intron 40.0%
TTCTCATTGTAGACCTTTGC+AGG - Chr1:94558008-94558027 MsG0180005655.01.T01:CDS 40.0%
TTGGAGCTTCTCCAATTCAA+AGG + Chr1:94557770-94557789 None:intergenic 40.0%
TTGTTGAACACTTGGCTGAA+TGG - Chr1:94557332-94557351 MsG0180005655.01.T01:intron 40.0%
TTTAAAAGCAGGTTCCTACC+AGG - Chr1:94557160-94557179 MsG0180005655.01.T01:intron 40.0%
TTTGATTCATTGAGCTCGGA+TGG + Chr1:94558042-94558061 None:intergenic 40.0%
! AATCGTCGTCTAGTTTGACT+TGG + Chr1:94557913-94557932 None:intergenic 40.0%
! ATTACGTAAGTTGGCTGAAG+GGG + Chr1:94556657-94556676 None:intergenic 40.0%
! CTAAAAGTATGTACCTCCTG+GGG + Chr1:94556178-94556197 None:intergenic 40.0%
! GTCATGACATCTGAAGTTTG+TGG - Chr1:94554660-94554679 MsG0180005655.01.T01:intron 40.0%
! GTTTCGGCTCTTTTCTACAT+TGG - Chr1:94556327-94556346 MsG0180005655.01.T01:intron 40.0%
! TAGAGCATTCCTGGATGATA+AGG - Chr1:94557590-94557609 MsG0180005655.01.T01:intron 40.0%
! TTCTCTTTGAAGGCAATACC+AGG + Chr1:94553660-94553679 None:intergenic 40.0%
! TTTCTAGTGTTCAGCCCATT+TGG + Chr1:94556946-94556965 None:intergenic 40.0%
!! AACATGCCGATTTCAACCAT+TGG - Chr1:94555683-94555702 MsG0180005655.01.T01:intron 40.0%
!! TTCTGCATCAGACTTGTTAC+TGG - Chr1:94556613-94556632 MsG0180005655.01.T01:intron 40.0%
!!! CTTTAGGTTTTGATTGAGCC+TGG - Chr1:94553639-94553658 MsG0180005655.01.T01:CDS 40.0%
AAATTGCAGAGAGAGGGAGA+GGG + Chr1:94556268-94556287 None:intergenic 45.0%
ACATCTGTCTACTGAGGCAA+AGG - Chr1:94556380-94556399 MsG0180005655.01.T01:intron 45.0%
ACCTGAACATCTGTCTACTG+AGG - Chr1:94556374-94556393 MsG0180005655.01.T01:intron 45.0%
ACTCTTCATGATGCTGAGCT+GGG - Chr1:94558066-94558085 MsG0180005655.01.T01:CDS 45.0%
ACTGTGATAGAGATGGCTAC+AGG - Chr1:94556127-94556146 MsG0180005655.01.T01:intron 45.0%
AGATGCAGAACTGGTTGACT+TGG + Chr1:94554819-94554838 None:intergenic 45.0%
AGTGATGAGATAGATCCACC+AGG + Chr1:94554217-94554236 None:intergenic 45.0%
ATACTTGGGAACTGCAAGAG+AGG - Chr1:94554159-94554178 MsG0180005655.01.T01:CDS 45.0%
ATCAACTTGCACAGGCCTAA+AGG - Chr1:94557073-94557092 MsG0180005655.01.T01:intron 45.0%
ATCCAAGGATCAACTTGCAC+AGG - Chr1:94557065-94557084 MsG0180005655.01.T01:intron 45.0%
ATGGGCATGAACCTTGATTC+CGG - Chr1:94553520-94553539 MsG0180005655.01.T01:CDS 45.0%
ATTCATCACCTGCGAGTATC+AGG - Chr1:94556774-94556793 MsG0180005655.01.T01:intron 45.0%
ATTCTGCTGGAGTTTGTACC+TGG - Chr1:94554196-94554215 MsG0180005655.01.T01:CDS 45.0%
CAATAAGCTCTCCGGAATCA+AGG + Chr1:94553534-94553553 None:intergenic 45.0%
CACTACCCATCAATTTGTGG+TGG - Chr1:94556569-94556588 MsG0180005655.01.T01:intron 45.0%
CATTGCCAATGTAACAAGCC+AGG - Chr1:94557945-94557964 MsG0180005655.01.T01:CDS 45.0%
CGTGGAACTTCTTATAGGCA+TGG - Chr1:94557002-94557021 MsG0180005655.01.T01:CDS 45.0%
CTATCTTCCTTGGCCAACTT+TGG - Chr1:94555035-94555054 MsG0180005655.01.T01:CDS 45.0%
CTGTCTGACACACATCCTTT+AGG + Chr1:94557091-94557110 None:intergenic 45.0%
GATTCTGGATTTGCGAATGG+CGG + Chr1:94553413-94553432 None:intergenic 45.0%
GCAGACTAGACTATGGGAAT+GGG - Chr1:94555830-94555849 MsG0180005655.01.T01:intron 45.0%
GCAGTGTCCGGAATTCATTA+TGG + Chr1:94555203-94555222 None:intergenic 45.0%
GCCATTCGCAAATCCAGAAT+CGG - Chr1:94553412-94553431 MsG0180005655.01.T01:CDS 45.0%
GGGTTGAGAAGACAATGGAT+CGG + Chr1:94553339-94553358 None:intergenic 45.0%
TAGATGTGAACTGCAGTGTC+CGG + Chr1:94555215-94555234 None:intergenic 45.0%
TCATCATCTTCAACCGCAAG+AGG + Chr1:94557549-94557568 None:intergenic 45.0%
TGATACTCGCAGGTGATGAA+TGG + Chr1:94556775-94556794 None:intergenic 45.0%
TGCAGACTAGACTATGGGAA+TGG - Chr1:94555829-94555848 MsG0180005655.01.T01:intron 45.0%
TGCATGCACTGTGATAGAGA+TGG - Chr1:94556120-94556139 MsG0180005655.01.T01:intron 45.0%
TGGTGCATCCAGAAAAGTAG+TGG - Chr1:94554566-94554585 MsG0180005655.01.T01:intron 45.0%
TTAGGAACCAAAGTTGGCCA+AGG + Chr1:94555045-94555064 None:intergenic 45.0%
! GGTCGGAAATGGATTTCTGA+GGG - Chr1:94555584-94555603 MsG0180005655.01.T01:intron 45.0%
! GTCGGAAATGGATTTCTGAG+GGG - Chr1:94555585-94555604 MsG0180005655.01.T01:intron 45.0%
! TCGGAAATGGATTTCTGAGG+GGG - Chr1:94555586-94555605 MsG0180005655.01.T01:intron 45.0%
! TGAGGTTTTTGCTACCTGTG+AGG - Chr1:94555351-94555370 MsG0180005655.01.T01:intron 45.0%
! TGGTCGGAAATGGATTTCTG+AGG - Chr1:94555583-94555602 MsG0180005655.01.T01:intron 45.0%
!! AAAATCCACTCACCGACTCA+GGG + Chr1:94554261-94554280 None:intergenic 45.0%
!! AAGGGTGAGTTGATTGGTTC+CGG - Chr1:94553478-94553497 MsG0180005655.01.T01:CDS 45.0%
!! ACCGGTTTTGCCAACAAGAT+CGG - Chr1:94553385-94553404 MsG0180005655.01.T01:CDS 45.0%
!! ACGAGGGCATATGCATTTTC+AGG + Chr1:94555479-94555498 None:intergenic 45.0%
!! ACTCTCCTGGCTTGTTACAT+TGG + Chr1:94557953-94557972 None:intergenic 45.0%
!! TAAAATCCACTCACCGACTC+AGG + Chr1:94554262-94554281 None:intergenic 45.0%
!!! AAATAATTTTAAAATAAGTT+AGG + Chr1:94556074-94556093 None:intergenic 5.0%
ACCCATCAATTTGTGGTGGC+AGG - Chr1:94556573-94556592 MsG0180005655.01.T01:intron 50.0%
ACGAGATTCCTGATACTCGC+AGG + Chr1:94556785-94556804 None:intergenic 50.0%
ACTCGCTGCTGACGACATAA+AGG - Chr1:94557265-94557284 MsG0180005655.01.T01:intron 50.0%
ACTTCAGGTGACATCCAGTG+TGG + Chr1:94554732-94554751 None:intergenic 50.0%
ATGGAGTCAACAGTATCCCC+AGG - Chr1:94556159-94556178 MsG0180005655.01.T01:intron 50.0%
ATTCGGATCCTTCCCTGAGT+CGG - Chr1:94554246-94554265 MsG0180005655.01.T01:CDS 50.0%
CAAATTGCAGAGAGAGGGAG+AGG + Chr1:94556269-94556288 None:intergenic 50.0%
CCAAGTCCCGACTAATCTAG+AGG + Chr1:94553848-94553867 None:intergenic 50.0%
CCCATCAATTTGTGGTGGCA+GGG - Chr1:94556574-94556593 MsG0180005655.01.T01:intron 50.0%
CCCTGCCACCACAAATTGAT+GGG + Chr1:94556577-94556596 None:intergenic 50.0%
CTCTCCCTCTCTCTGCAATT+TGG - Chr1:94556267-94556286 MsG0180005655.01.T01:intron 50.0%
CTCTGCATTAGGAGATGGTG+CGG + Chr1:94557502-94557521 None:intergenic 50.0%
CTTCAGGTGACATCCAGTGT+GGG + Chr1:94554731-94554750 None:intergenic 50.0%
GACAGATGTTCAGGTATGGG+TGG + Chr1:94556369-94556388 None:intergenic 50.0%
GACTCTTCATGATGCTGAGC+TGG - Chr1:94558065-94558084 MsG0180005655.01.T01:CDS 50.0%
GATGGCTGAACTTCCTGCAA+AGG + Chr1:94558024-94558043 None:intergenic 50.0%
GCCGATCTTGTTGGCAAAAC+CGG + Chr1:94553389-94553408 None:intergenic 50.0%
GCCTCAGTAGACAGATGTTC+AGG + Chr1:94556378-94556397 None:intergenic 50.0%
TATGTCGTCAGCAGCGAGTA+GGG + Chr1:94557264-94557283 None:intergenic 50.0%
TCCCTGCCACCACAAATTGA+TGG + Chr1:94556578-94556597 None:intergenic 50.0%
TCTGCATTAGGAGATGGTGC+GGG + Chr1:94557501-94557520 None:intergenic 50.0%
TGTTGGCAAAACCGGTGAAG+CGG + Chr1:94553381-94553400 None:intergenic 50.0%
TTATGTCGTCAGCAGCGAGT+AGG + Chr1:94557265-94557284 None:intergenic 50.0%
TTCAGGTGACATCCAGTGTG+GGG + Chr1:94554730-94554749 None:intergenic 50.0%
! AAGCTTTGGCGATGGACCAA+TGG + Chr1:94555702-94555721 None:intergenic 50.0%
! CCTCTAGATTAGTCGGGACT+TGG - Chr1:94553845-94553864 MsG0180005655.01.T01:CDS 50.0%
! GCCGATTCTGGATTTGCGAA+TGG + Chr1:94553416-94553435 None:intergenic 50.0%
! TGATTGGTTCCGGTGCCTTT+GGG - Chr1:94553488-94553507 MsG0180005655.01.T01:CDS 50.0%
! TTGATTGGTTCCGGTGCCTT+TGG - Chr1:94553487-94553506 MsG0180005655.01.T01:CDS 50.0%
!! AGATTTGAGGCTGCCGATTC+TGG + Chr1:94553428-94553447 None:intergenic 50.0%
!! GGATACTGTTGACTCCATGG+AGG + Chr1:94556157-94556176 None:intergenic 50.0%
!! TGGCGTAAGGGTGAGTTGAT+TGG - Chr1:94553472-94553491 MsG0180005655.01.T01:CDS 50.0%
!! TGGGGATACTGTTGACTCCA+TGG + Chr1:94556160-94556179 None:intergenic 50.0%
AAGTTGGCTGAAGGGGAGGA+AGG + Chr1:94556650-94556669 None:intergenic 55.0%
ATCGTTGTCTGCTCCCTGGT+AGG + Chr1:94557177-94557196 None:intergenic 55.0%
CAATCCAATGTCCGAGCCTC+TGG - Chr1:94557380-94557399 MsG0180005655.01.T01:CDS 55.0%
CATCATCGTTGTCTGCTCCC+TGG + Chr1:94557181-94557200 None:intergenic 55.0%
CTGCTGGAGTTTGTACCTGG+TGG - Chr1:94554199-94554218 MsG0180005655.01.T01:CDS 55.0%
GAGGAGGAGGAGGAGATTTG+AGG + Chr1:94553441-94553460 None:intergenic 55.0%
GAGTCAACAGTATCCCCAGG+AGG - Chr1:94556162-94556181 MsG0180005655.01.T01:intron 55.0%
GGGTGGGGTTGAGAAGACAA+TGG + Chr1:94553344-94553363 None:intergenic 55.0%
TCACCCTTACGCCACCGAAT+TGG + Chr1:94553466-94553485 None:intergenic 55.0%
TGGCTACAGGAAAGCCTCCA+TGG - Chr1:94556140-94556159 MsG0180005655.01.T01:intron 55.0%
! AATGGCGGAGCCGATCTTGT+TGG + Chr1:94553398-94553417 None:intergenic 55.0%
! ACGTAAGTTGGCTGAAGGGG+AGG + Chr1:94556654-94556673 None:intergenic 55.0%
! AGCAAAAGGCGCAGGAGGAA+TGG + Chr1:94557833-94557852 None:intergenic 55.0%
! GCCTTTGGGAGGGTCTACAT+GGG - Chr1:94553502-94553521 MsG0180005655.01.T01:CDS 55.0%
! GGGTGGTTGCTGAAGAGTGT+AGG - Chr1:94555085-94555104 MsG0180005655.01.T01:intron 55.0%
! TGAGCAACAGCAAAAGGCGC+AGG + Chr1:94557841-94557860 None:intergenic 55.0%
! TGCCTTTGGGAGGGTCTACA+TGG - Chr1:94553501-94553520 MsG0180005655.01.T01:CDS 55.0%
!! CTATGAAGGGTACCCCACAC+TGG - Chr1:94554715-94554734 MsG0180005655.01.T01:intron 55.0%
!! GGCCTGTGCAAGTTGATCCT+TGG + Chr1:94557070-94557089 None:intergenic 55.0%
CAAGGCCAGTCATCCTCCAG+AGG + Chr1:94557399-94557418 None:intergenic 60.0%
CCAGTCATCCTCCAGAGGCT+CGG + Chr1:94557394-94557413 None:intergenic 60.0%
CCCTTACGCCACCGAATTGG+CGG + Chr1:94553463-94553482 None:intergenic 60.0%
CTCCTCCTCCTCCGCCAATT+CGG - Chr1:94553449-94553468 MsG0180005655.01.T01:CDS 60.0%
GCCCATGTAGACCCTCCCAA+AGG + Chr1:94553506-94553525 None:intergenic 60.0%
TCCAATGTCCGAGCCTCTGG+AGG - Chr1:94557383-94557402 MsG0180005655.01.T01:CDS 60.0%
TCCTCCAGAGGCTCGGACAT+TGG + Chr1:94557387-94557406 None:intergenic 60.0%
TCCTTCCCTGAGTCGGTGAG+TGG - Chr1:94554253-94554272 MsG0180005655.01.T01:CDS 60.0%
TTACGCCACCGAATTGGCGG+AGG + Chr1:94553460-94553479 None:intergenic 60.0%
TTGGTTCCGGTGCCTTTGGG+AGG - Chr1:94553491-94553510 MsG0180005655.01.T01:CDS 60.0%
! CCGCCAATTCGGTGGCGTAA+GGG - Chr1:94553460-94553479 MsG0180005655.01.T01:CDS 60.0%
! GCAACAGCAAAAGGCGCAGG+AGG + Chr1:94557838-94557857 None:intergenic 60.0%
! GTAGACCCTCCCAAAGGCAC+CGG + Chr1:94553500-94553519 None:intergenic 60.0%
! TCCGCCAATTCGGTGGCGTA+AGG - Chr1:94553459-94553478 MsG0180005655.01.T01:CDS 60.0%
! TGGTTCCGGTGCCTTTGGGA+GGG - Chr1:94553492-94553511 MsG0180005655.01.T01:CDS 60.0%
!! TCCACTCACCGACTCAGGGA+AGG + Chr1:94554257-94554276 None:intergenic 60.0%
AAGCGGCCATCGTCGGTGGA+GGG + Chr1:94553364-94553383 None:intergenic 65.0%
ACCGACGATGGCCGCTTCAC+CGG - Chr1:94553367-94553386 MsG0180005655.01.T01:CDS 65.0%
ACCGGTGAAGCGGCCATCGT+CGG + Chr1:94553371-94553390 None:intergenic 65.0%
CACCGAATTGGCGGAGGAGG+AGG + Chr1:94553454-94553473 None:intergenic 65.0%
CGAATTGGCGGAGGAGGAGG+AGG + Chr1:94553451-94553470 None:intergenic 65.0%
CTCCTCCTCCGCCAATTCGG+TGG - Chr1:94553452-94553471 MsG0180005655.01.T01:CDS 65.0%
! CCGAGCCTCTGGAGGATGAC+TGG - Chr1:94557391-94557410 MsG0180005655.01.T01:CDS 65.0%
ACCCCACCCTCCACCGACGA+TGG - Chr1:94553355-94553374 MsG0180005655.01.T01:CDS 70.0%
CGCCACCGAATTGGCGGAGG+AGG + Chr1:94553457-94553476 None:intergenic 70.0%
GAAGCGGCCATCGTCGGTGG+AGG + Chr1:94553365-94553384 None:intergenic 70.0%
GCCATCGTCGGTGGAGGGTG+GGG + Chr1:94553359-94553378 None:intergenic 70.0%
GGCCATCGTCGGTGGAGGGT+GGG + Chr1:94553360-94553379 None:intergenic 70.0%
GGTGAAGCGGCCATCGTCGG+TGG + Chr1:94553368-94553387 None:intergenic 70.0%
CGGCCATCGTCGGTGGAGGG+TGG + Chr1:94553361-94553380 None:intergenic 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 94553310 94558119 94553310 ID=MsG0180005655.01;Name=MsG0180005655.01
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Chr1 exon 94557865 94558119 94557865 ID=MsG0180005655.01.T01:exon:50134;Parent=MsG0180005655.01.T01
Chr1 exon 94557743 94557784 94557743 ID=MsG0180005655.01.T01:exon:50133;Parent=MsG0180005655.01.T01
Chr1 exon 94557358 94557423 94557358 ID=MsG0180005655.01.T01:exon:50132;Parent=MsG0180005655.01.T01
Chr1 exon 94557162 94557272 94557162 ID=MsG0180005655.01.T01:exon:50131;Parent=MsG0180005655.01.T01
Chr1 exon 94556997 94557077 94556997 ID=MsG0180005655.01.T01:exon:50130;Parent=MsG0180005655.01.T01
Chr1 exon 94556836 94556913 94556836 ID=MsG0180005655.01.T01:exon:50129;Parent=MsG0180005655.01.T01
Chr1 exon 94556654 94556736 94556654 ID=MsG0180005655.01.T01:exon:50128;Parent=MsG0180005655.01.T01
Chr1 exon 94555246 94555330 94555246 ID=MsG0180005655.01.T01:exon:50127;Parent=MsG0180005655.01.T01
Chr1 exon 94555002 94555102 94555002 ID=MsG0180005655.01.T01:exon:50126;Parent=MsG0180005655.01.T01
Chr1 exon 94554795 94554834 94554795 ID=MsG0180005655.01.T01:exon:50125;Parent=MsG0180005655.01.T01
Chr1 exon 94554601 94554660 94554601 ID=MsG0180005655.01.T01:exon:50124;Parent=MsG0180005655.01.T01
Chr1 exon 94554461 94554504 94554461 ID=MsG0180005655.01.T01:exon:50123;Parent=MsG0180005655.01.T01
Chr1 exon 94554143 94554374 94554143 ID=MsG0180005655.01.T01:exon:50122;Parent=MsG0180005655.01.T01
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Chr1 exon 94553310 94553663 94553310 ID=MsG0180005655.01.T01:exon:50120;Parent=MsG0180005655.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0180005655.01.T01

ATGCAAGACTTCTTCGGCTCAATTCGCCGATCCATTGTCTTCTCAACCCCACCCTCCACCGACGATGGCCGCTTCACCGGTTTTGCCAACAAGATCGGCTCCGCCATTCGCAAATCCAGAATCGGCAGCCTCAAATCTCCTCCTCCTCCTCCGCCAATTCGGTGGCGTAAGGGTGAGTTGATTGGTTCCGGTGCCTTTGGGAGGGTCTACATGGGCATGAACCTTGATTCCGGAGAGCTTATTGCTGTTAAACAGGTTTTGATTGAGCCTGGTATTGCCTTCAAAGAGAATACAAAGGCTAATATTCTGGAGCTCGAAGAAGAAGTGAAGCTTCTCAAGAATCTTAAGCATCCAAATATTGTTAGATACTTGGGAACTGCAAGAGAGGAAGATTCCTTAAATATTCTGCTGGAGTTTGTACCTGGTGGATCTATCTCATCACTATTGGGAAAATTCGGATCCTTCCCTGAGTCGGTTATCAGAACGTATACAAAACAGCTTTTAGATGGTCTTGAATACCTTCACAATAACCGAATTATTCACAGGGATATCAAGGGTGCAAACATTCTAGTTGATAACAAAGGGTGTATTAAACTCGCAGACTTTGGTGCATCCAGAAAAGTAGTGGAATTGGCTACCATAAATGGAGCAAAATCTATGAAGGGTACCCCACACTGGATGTCACCTGAAGTTATTTTACAGACAGGATATACAACCTCTGCTGATATATGGAGTGTTGCATGCACTGTGATAGAGATGGCTACAGGAAAGCCTCCATGGAGTCAACAGTATCCCCAGGAGGTTTCGGCTCTTTTCTACATTGGAACAACTAGAGATCATCCACCCATACCTGAACATCTGTCTACTGAGGCAAAGGACTTTTTGCTCAAATGCTTTCACAAGGAACCAAATTTAAGACCTTCTGCATCAGACTTGTTACTGCATCCATTCATCACCTGCGAGTATCAGGAATCTCGTTCAATATCACGCAGTTCAATCAGGGACTCTTATCAGATGATACCAAATGGGCTGAACACTAGAAACTTTTTGGATTCTATCCAAGGATCAACTTGCACAGGCCTAAAGGATGTGTGTCAGACAGATAGTTTAAGGTTCTCAACTGTATATCATTCAAATTCCAATTCAAATCTTTTAAAAGCAGGTTCCTACCAGGGAGCAGACAACGATGATGATATGTGTCAAATAGACGATAAAGATGATTTTTTGGTTGATTCATCAGTAAAATCTAAATCCCTACTCGCTGCTGACGACATAAAGAGTTTCAATCCAATGTCCGAGCCTCTGGAGGATGACTGGCCTTGCAAGTTTGATGAAACTCTGAATTTAAAGAAAAGCAGACTGAACTTGTCCCCAGATCAAACTACTATGAAAACTATGAGTCCCGCACCATCTCCTAATGCAGAGAATGAGTTCTCATTTTCAAGTGAACCTCTTGCGGTTGAAGATGATGATGAAGTCACAGAATCCAAAATTAGAGCATTCCTGGATGATAAGGCCTTTGAATTGGAGAAGCTCCAAACACCTCTTTATGAAGAATTCTTTGGCAAATCAAATGCAACCATTCCTCCTGCGCCTTTTGCTGTTGCTCAAAGTAAAGTTATTTCTGATGTCTCAAATGTAACATCAAAAAGCAGGTCTCCAAGTCAAACTAGACGACGATTCTCAATGGCTAGCATTGCCAATGTAACAAGCCAGGAGAGTCAAAGAAAATATCTTACGAAACTTAGTGGTGCGACTTCTCATTGTAGACCTTTGCAGGAAGTTCAGCCATCCGAGCTCAATGAATCAAAGGAGACTCTTCATGATGCTGAGCTGGGATCAAATGTTAAGTATGTATTTAATGCTTGA

Protein sequence

>MsG0180005655.01.T01

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