AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480018621.01


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MsG0480018621.01.T02 AT3G62750 38.655 119 71 2 19 135 212 330 3.54e-19 87.0
MsG0480018621.01.T02 AT3G62750 38.983 118 70 2 20 135 239 356 6.59e-19 87.0
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MsG0480018621.01.T03 AT2G44470 38.163 283 157 7 20 295 234 505 5.04e-54 185
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MsG0480018621.01.T03 AT2G32860 35.017 297 166 8 16 301 296 576 1.14e-53 185
MsG0480018621.01.T03 AT3G21370 39.929 283 153 8 20 296 241 512 2.00e-53 182
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MsG0480018621.01.T03 AT1G52400 39.007 282 157 8 19 296 246 516 2.22e-53 182
MsG0480018621.01.T03 AT1G66270 40.972 288 141 9 19 295 239 508 3.97e-53 181
MsG0480018621.01.T03 AT1G66270 40.972 288 141 9 19 295 241 510 4.52e-53 181
MsG0480018621.01.T03 AT3G09260 38.516 283 161 5 19 297 239 512 4.92e-53 181
MsG0480018621.01.T03 AT5G28510 38.298 282 159 6 19 295 248 519 6.28e-53 181
MsG0480018621.01.T03 AT1G61810 40.449 267 146 6 13 275 231 488 8.03e-53 181
MsG0480018621.01.T03 AT1G66280 39.858 281 154 7 19 295 241 510 3.98e-52 179
MsG0480018621.01.T03 AT4G27830 37.500 288 157 8 11 295 129 396 6.21e-49 168
MsG0480018621.01.T03 AT4G27830 37.500 288 157 8 11 295 217 484 4.02e-48 168
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MsG0480018621.01.T03 AT3G62750 38.983 118 70 2 20 135 239 356 6.59e-19 87.0
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MsG0480018621.01.T01 AT1G52400 39.007 282 157 8 19 296 246 516 2.22e-53 182
MsG0480018621.01.T01 AT1G66270 40.972 288 141 9 19 295 239 508 3.97e-53 181
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MsG0480018621.01.T01 AT3G09260 38.516 283 161 5 19 297 239 512 4.92e-53 181
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MsG0480018621.01.T01 AT1G61810 40.449 267 146 6 13 275 231 488 8.03e-53 181
MsG0480018621.01.T01 AT1G66280 39.858 281 154 7 19 295 241 510 3.98e-52 179
MsG0480018621.01.T01 AT4G27830 37.500 288 157 8 11 295 129 396 6.21e-49 168
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MsG0480018621.01.T01 AT5G54570 38.865 229 123 5 20 242 234 451 2.69e-46 162
MsG0480018621.01.T01 AT1G02850 35.231 281 157 6 20 296 227 486 3.91e-45 160
MsG0480018621.01.T01 AT3G62750 33.571 280 165 6 19 295 127 388 7.51e-45 157
MsG0480018621.01.T01 AT3G62750 33.571 280 165 6 19 295 127 388 7.51e-45 157
MsG0480018621.01.T01 AT4G27820 35.842 279 158 7 20 295 137 397 1.67e-44 157
MsG0480018621.01.T01 AT4G27820 35.842 279 158 7 20 295 137 397 1.67e-44 157
MsG0480018621.01.T01 AT3G62750 33.571 280 165 6 19 295 212 473 4.84e-44 157
MsG0480018621.01.T01 AT3G62750 33.214 280 166 6 19 295 238 499 9.74e-44 156
MsG0480018621.01.T01 AT4G27820 35.842 279 158 7 20 295 222 482 1.10e-43 156
MsG0480018621.01.T01 AT4G22100 36.986 292 164 9 10 298 211 485 1.21e-43 156
MsG0480018621.01.T01 AT1G02850 32.566 304 157 6 20 296 227 509 7.41e-42 151
MsG0480018621.01.T01 AT3G62740 33.106 293 167 9 9 295 209 478 4.54e-41 149
MsG0480018621.01.T01 AT1G02850 32.459 305 157 7 20 296 227 510 3.89e-40 147
MsG0480018621.01.T01 AT5G25980 39.556 225 123 7 20 242 254 467 1.26e-39 144
MsG0480018621.01.T01 AT5G25980 39.556 225 123 7 20 242 254 467 1.26e-39 144
MsG0480018621.01.T01 AT1G02850 33.571 280 136 6 20 296 227 459 8.82e-39 142
MsG0480018621.01.T01 AT1G45191 34.495 287 162 7 13 296 221 484 2.15e-38 142
MsG0480018621.01.T01 AT5G26000 38.222 225 127 4 20 242 242 456 3.15e-38 140
MsG0480018621.01.T01 AT5G48375 38.367 245 104 8 20 260 210 411 8.68e-38 139
MsG0480018621.01.T01 AT1G45191 34.146 287 174 7 13 296 221 495 8.37e-37 137
MsG0480018621.01.T01 AT1G45191 34.146 287 174 7 13 296 233 507 9.64e-37 137
MsG0480018621.01.T01 AT1G45191 34.146 287 169 8 13 296 221 490 1.08e-36 137
MsG0480018621.01.T01 AT1G60090 32.857 280 167 7 20 296 222 483 1.46e-35 134
MsG0480018621.01.T01 AT3G18070 39.487 195 100 6 20 208 41 223 1.27e-34 126
MsG0480018621.01.T01 AT5G24540 37.915 211 122 4 33 241 251 454 2.16e-34 130
MsG0480018621.01.T01 AT3G18070 39.487 195 100 6 20 208 153 335 1.84e-33 125
MsG0480018621.01.T01 AT1G60090 32.168 286 168 8 20 296 222 490 2.99e-33 128
MsG0480018621.01.T01 AT2G44470 34.211 228 133 6 20 241 234 450 2.51e-30 119
MsG0480018621.01.T01 AT3G60140 40.816 196 97 7 20 208 231 414 6.47e-30 118
MsG0480018621.01.T01 AT5G16580 35.021 237 131 9 20 252 82 299 5.86e-29 112
MsG0480018621.01.T01 AT1G52400 35.398 226 132 7 19 241 246 460 1.44e-28 114
MsG0480018621.01.T01 AT1G61810 35.859 198 114 6 13 206 231 419 1.68e-27 111
MsG0480018621.01.T01 AT3G62750 30.263 228 139 5 19 244 238 447 4.46e-27 110
MsG0480018621.01.T01 AT3G62740 33.186 226 123 8 9 229 209 411 2.32e-26 107
MsG0480018621.01.T01 AT3G18070 42.982 114 63 2 20 131 230 343 3.13e-22 95.9
MsG0480018621.01.T01 AT3G62750 38.655 119 71 2 19 135 212 330 3.54e-19 87.0
MsG0480018621.01.T01 AT3G62750 38.655 119 71 2 19 135 212 330 3.54e-19 87.0
MsG0480018621.01.T01 AT3G62750 38.983 118 70 2 20 135 239 356 6.59e-19 87.0
MsG0480018621.01.T01 AT1G02850 29.577 213 109 4 20 206 227 424 2.04e-18 85.5
MsG0480018621.01.T01 AT2G44470 40.000 115 66 3 20 131 234 348 2.69e-18 84.7
MsG0480018621.01.T01 AT3G06510 24.834 302 171 7 10 300 292 548 3.12e-17 82.4
MsG0480018621.01.T01 AT1G60270 37.500 144 79 5 20 160 136 271 6.46e-17 79.7
MsG0480018621.01.T01 AT1G60270 37.500 144 79 5 20 160 223 358 1.55e-16 79.7
MsG0480018621.01.T01 AT2G44480 41.935 93 52 2 20 110 271 363 9.14e-16 77.4
MsG0480018621.01.T01 AT1G45191 38.843 121 71 3 13 131 221 340 9.65e-16 77.4
MsG0480018621.01.T01 AT1G45191 38.843 121 71 3 13 131 221 340 1.15e-15 77.4
MsG0480018621.01.T01 AT3G06510 24.915 293 148 8 10 300 292 514 5.57e-15 75.5
MsG0480018621.01.T01 AT1G51490 36.620 142 85 3 20 159 218 356 2.69e-14 73.2

Find 26 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 301 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTTGAACATAATAGAATTAT+TGG 0.142938 4:-7644679 MsG0480018621.01.T02:CDS
CAAAGCTCACACAGTATTAT+TGG 0.283801 4:+7644634 None:intergenic
ATACTTTGCATGGTCCCTTT+TGG 0.290939 4:-7644815 MsG0480018621.01.T02:CDS
AGCTCTCTGCCCGGTGGTTT+AGG 0.309537 4:-7644708 MsG0480018621.01.T02:CDS
CAATAAAGAGGGGTGATTTA+AGG 0.315275 4:-7644475 MsG0480018621.01.T02:three_prime_UTR
TTCTTGTTTCGCTCAGGTCT+TGG 0.348865 4:-7644289 MsG0480018621.01.T02:three_prime_UTR
GATGGATACACTGTGCGTTT+TGG 0.361928 4:-7644775 MsG0480018621.01.T02:CDS
AGGCAAGGTGTGAATGTAAA+AGG 0.387936 4:-7644838 MsG0480018621.01.T02:CDS
TCCATTCAAAGTTGTCCAAA+AGG 0.405927 4:+7644800 None:intergenic
AACCACCGGGCAGAGAGCTT+AGG 0.450563 4:+7644712 None:intergenic
TTGCCTTTCTTGTTTCGCTC+AGG 0.451091 4:-7644295 MsG0480018621.01.T02:three_prime_UTR
GACAACTTTGAATGGAATGA+TGG 0.454965 4:-7644793 MsG0480018621.01.T02:CDS
CTTCTTCTTCATCAATAAAG+AGG 0.457465 4:-7644487 MsG0480018621.01.T02:three_prime_UTR
TTCATTGACTGAATCTGCAT+TGG 0.473903 4:+7644236 None:intergenic
ACCACCGGGCAGAGAGCTTA+GGG 0.475465 4:+7644713 None:intergenic
CCATTCAAAGTTGTCCAAAA+GGG 0.499789 4:+7644801 None:intergenic
TTCTTCTTCATCAATAAAGA+GGG 0.501801 4:-7644486 MsG0480018621.01.T02:three_prime_UTR
AGACCTGAGCGAAACAAGAA+AGG 0.536233 4:+7644292 None:intergenic
CAAGAAACTTCCTAAACCAC+CGG 0.545200 4:+7644698 None:intergenic
GACACCCTAAGCTCTCTGCC+CGG 0.573913 4:-7644717 MsG0480018621.01.T02:CDS
GTGTGTTTGTCGCATTTGTG+TGG 0.592863 4:-7644324 MsG0480018621.01.T02:three_prime_UTR
AGCTCACACAGTATTATTGG+TGG 0.605868 4:+7644637 None:intergenic
ATGTAAAAGGATACTTTGCA+TGG 0.622027 4:-7644825 MsG0480018621.01.T02:CDS
TCTTCTTCATCAATAAAGAG+GGG 0.629116 4:-7644485 MsG0480018621.01.T02:three_prime_UTR
AAGAAACTTCCTAAACCACC+GGG 0.661886 4:+7644699 None:intergenic
ACCCTAAGCTCTCTGCCCGG+TGG 0.683098 4:-7644714 MsG0480018621.01.T02:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! GATAAAAATATATTTCAATA+CGG + Chr4:7641859-7641878 None:intergenic 10.0%
!! TTAAACTGTTATATATATAA+AGG - Chr4:7645535-7645554 MsG0480018621.01.T02:intron 10.0%
!! TTAATTAACAATTATCTATA+TGG - Chr4:7646232-7646251 MsG0480018621.01.T02:CDS 10.0%
!! TTCTAATAAATTTAAATCAT+AGG - Chr4:7642650-7642669 MsG0480018621.01.T02:intron 10.0%
!! AAAATACATTTAAGTCTTTA+AGG + Chr4:7645579-7645598 None:intergenic 15.0%
!! ATTGATGAAATAATAAATAG+TGG - Chr4:7645887-7645906 MsG0480018621.01.T02:intron 15.0%
!! TATAAAACACAATTAAGAAT+AGG + Chr4:7645039-7645058 None:intergenic 15.0%
!! TATTGTGAAAATTTAACAAA+AGG + Chr4:7643643-7643662 None:intergenic 15.0%
!! TTATGTTAAGAATTTAGTAT+AGG - Chr4:7645845-7645864 MsG0480018621.01.T02:CDS 15.0%
!! TTTCTAATTACCAAAAATAA+GGG + Chr4:7644096-7644115 None:intergenic 15.0%
!!! AAATTTGCTAAAAACAAAAA+AGG + Chr4:7646103-7646122 None:intergenic 15.0%
!!! AATTTTAGAAGTAATTTTGA+AGG - Chr4:7645796-7645815 MsG0480018621.01.T02:CDS 15.0%
!!! ATATATTTTTATCTGTTTAC+AGG - Chr4:7641866-7641885 MsG0480018621.01.T02:intron 15.0%
!!! ATATTTTAAATGTTCAAAAG+TGG - Chr4:7643823-7643842 MsG0480018621.01.T02:intron 15.0%
!!! CATGCATATATTTTATTTTA+CGG - Chr4:7643748-7643767 MsG0480018621.01.T02:intron 15.0%
!!! GCAAAAAAAACAATATTTTT+GGG + Chr4:7643850-7643869 None:intergenic 15.0%
!!! GTTGTTTTTTAATAAAAATC+TGG - Chr4:7646198-7646217 MsG0480018621.01.T02:intron 15.0%
!!! TAATTTATTTTATGTGTAAG+AGG - Chr4:7643596-7643615 MsG0480018621.01.T02:intron 15.0%
!!! TGCAAAAAAAACAATATTTT+TGG + Chr4:7643851-7643870 None:intergenic 15.0%
!! AAAACAATTTATGTCAAACA+AGG + Chr4:7642209-7642228 None:intergenic 20.0%
!! AATTGATAAGGAACATTAAT+TGG + Chr4:7644280-7644299 None:intergenic 20.0%
!! AGAATAAATTGCCTAAAAAT+AGG + Chr4:7643946-7643965 None:intergenic 20.0%
!! ATCAAATTGTAATTGAACAA+AGG + Chr4:7644317-7644336 None:intergenic 20.0%
!! ATTCTGATTTAAGTAAATAG+AGG + Chr4:7642791-7642810 None:intergenic 20.0%
!! CGTAAAATAAAATATATGCA+TGG + Chr4:7643750-7643769 None:intergenic 20.0%
!! CTTGAACATAATAGAATTAT+TGG - Chr4:7643054-7643073 MsG0480018621.01.T02:intron 20.0%
!! GAATAAATTGCCTAAAAATA+GGG + Chr4:7643945-7643964 None:intergenic 20.0%
!! GTTAATATCATATTTCTTAG+TGG - Chr4:7645263-7645282 MsG0480018621.01.T02:intron 20.0%
!! GTTTCTAATTACCAAAAATA+AGG + Chr4:7644097-7644116 None:intergenic 20.0%
!! TCAGAAAAAGAAAATGATTT+AGG - Chr4:7645916-7645935 MsG0480018621.01.T02:intron 20.0%
!! TTATCTATTTCACATTGTTT+CGG - Chr4:7645633-7645652 MsG0480018621.01.T02:CDS 20.0%
!! TTCTGATTTAAGTAAATAGA+GGG + Chr4:7642790-7642809 None:intergenic 20.0%
!! TTTAATATAGTCATATGTGT+AGG - Chr4:7646015-7646034 MsG0480018621.01.T02:CDS 20.0%
!!! ATAATTTGAGACATGATTTT+GGG + Chr4:7644247-7644266 None:intergenic 20.0%
!!! TATAATTTGAGACATGATTT+TGG + Chr4:7644248-7644267 None:intergenic 20.0%
!!! TTGACTATATTGTTGTTTTT+TGG - Chr4:7642860-7642879 MsG0480018621.01.T02:intron 20.0%
!!! TTTTTGTCAAAAAAAAGTCT+TGG - Chr4:7646171-7646190 MsG0480018621.01.T02:intron 20.0%
! AATAACTAAACAATATGTGC+AGG - Chr4:7642331-7642350 MsG0480018621.01.T02:intron 25.0%
! AATTGCAATTATATTATGCG+TGG - Chr4:7645364-7645383 MsG0480018621.01.T02:CDS 25.0%
! AATTGCAATTATATTCTGTG+TGG - Chr4:7645403-7645422 MsG0480018621.01.T02:intron 25.0%
! ACGATTATCATAACAGAAAA+TGG - Chr4:7642431-7642450 MsG0480018621.01.T02:intron 25.0%
! ATGACAGATAAGAATAAAGA+TGG - Chr4:7642241-7642260 MsG0480018621.01.T02:intron 25.0%
! ATTGTATAAAACCACATATC+AGG - Chr4:7641662-7641681 MsG0480018621.01.T02:three_prime_UTR 25.0%
! GTTTATTAGACACTGAAAAA+AGG + Chr4:7642617-7642636 None:intergenic 25.0%
! TACCTAAAATGTTAGTGTAA+GGG + Chr4:7645697-7645716 None:intergenic 25.0%
! TATCTATTTCACATTGTTTC+GGG - Chr4:7645634-7645653 MsG0480018621.01.T02:CDS 25.0%
! TGACAGATAAGAATAAAGAT+GGG - Chr4:7642242-7642261 MsG0480018621.01.T02:intron 25.0%
! TGCTATTCAAATTCAGTTTA+CGG + Chr4:7644158-7644177 None:intergenic 25.0%
! TGTGAAAATTTAACAAAAGG+AGG + Chr4:7643640-7643659 None:intergenic 25.0%
! TTACCTAAAATGTTAGTGTA+AGG + Chr4:7645698-7645717 None:intergenic 25.0%
! TTCTTCTTCATCAATAAAGA+GGG - Chr4:7643247-7643266 MsG0480018621.01.T02:intron 25.0%
!! ATTATCTTTTATCTGCAATG+AGG - Chr4:7642759-7642778 MsG0480018621.01.T02:intron 25.0%
!! ATTATGCTGTATATGTTTTG+TGG - Chr4:7645106-7645125 MsG0480018621.01.T02:intron 25.0%
!! ATTGGGTCATATGATTTTAT+TGG - Chr4:7641985-7642004 MsG0480018621.01.T02:intron 25.0%
!! GTTTGACATAAATTGTTTTC+TGG - Chr4:7642210-7642229 MsG0480018621.01.T02:intron 25.0%
!! TTTTCTGTTATGATAATCGT+AGG + Chr4:7642431-7642450 None:intergenic 25.0%
!!! AACATAACTTCCCTTATTTT+TGG - Chr4:7644083-7644102 MsG0480018621.01.T02:intron 25.0%
!!! AACATTTTAGGTAACAAAGA+AGG - Chr4:7645704-7645723 MsG0480018621.01.T02:CDS 25.0%
!!! TTTAGTTCATCCCTATTTTT+AGG - Chr4:7643932-7643951 MsG0480018621.01.T02:intron 25.0%
!!! TTTTTTGGTTTTTTGTGTGA+AGG - Chr4:7642875-7642894 MsG0480018621.01.T02:intron 25.0%
AAAGAGAAAAACGAGATACA+GGG + Chr4:7643307-7643326 None:intergenic 30.0%
AATAAAGATGGGACATACAT+TGG - Chr4:7642253-7642272 MsG0480018621.01.T02:intron 30.0%
AATACTTGTAATTGCCTTAG+TGG - Chr4:7645237-7645256 MsG0480018621.01.T02:intron 30.0%
ACACTTTGAATACATCAGAT+TGG - Chr4:7641590-7641609 MsG0480018621.01.T02:three_prime_UTR 30.0%
ACTGTTAATGTGACTTTAAC+AGG - Chr4:7642108-7642127 MsG0480018621.01.T02:intron 30.0%
AGGTTTACTATTAGAACACA+AGG + Chr4:7644547-7644566 None:intergenic 30.0%
AGTATGAACCAATTTGGATA+AGG - Chr4:7645664-7645683 MsG0480018621.01.T02:CDS 30.0%
ATAAGTAAACAACAACAACG+TGG + Chr4:7644028-7644047 None:intergenic 30.0%
ATGTAAAAGGATACTTTGCA+TGG - Chr4:7642908-7642927 MsG0480018621.01.T02:intron 30.0%
CAAAATGGTATAATAGGCAT+TGG - Chr4:7641687-7641706 MsG0480018621.01.T02:three_prime_UTR 30.0%
CAAACACTTCATGTTTCTTT+AGG + Chr4:7644647-7644666 None:intergenic 30.0%
CTAACTCATATATCAGCTAA+AGG + Chr4:7643803-7643822 None:intergenic 30.0%
CTATTATAATCACCTCAAGT+AGG + Chr4:7643685-7643704 None:intergenic 30.0%
CTTCTTCTTCATCAATAAAG+AGG - Chr4:7643246-7643265 MsG0480018621.01.T02:intron 30.0%
GATATATGCTTCAAGGAATT+TGG - Chr4:7641523-7641542 MsG0480018621.01.T03:intron 30.0%
GCTCTTATAACTATATGATC+CGG + Chr4:7645453-7645472 None:intergenic 30.0%
GGTTTACTATTAGAACACAA+GGG + Chr4:7644546-7644565 None:intergenic 30.0%
GTATTCAAAGTGTAAGAGAA+TGG + Chr4:7641583-7641602 None:intergenic 30.0%
GTCAATTTCCTTATCCAAAT+TGG + Chr4:7645675-7645694 None:intergenic 30.0%
GTTTACTATTAGAACACAAG+GGG + Chr4:7644545-7644564 None:intergenic 30.0%
TAATTGAACAAAGGAAGACT+TGG + Chr4:7644308-7644327 None:intergenic 30.0%
TAGATATTCTTCGAACAAAG+AGG + Chr4:7644567-7644586 None:intergenic 30.0%
TCTTCTTCATCAATAAAGAG+GGG - Chr4:7643248-7643267 MsG0480018621.01.T02:intron 30.0%
! AGAGTATTTGAACCTATAAG+TGG + Chr4:7644441-7644460 None:intergenic 30.0%
! GAAAGTTGTGTATGATAATG+TGG - Chr4:7645060-7645079 MsG0480018621.01.T02:CDS 30.0%
!! AGCAATCTAAGAGTCTTATT+GGG - Chr4:7641968-7641987 MsG0480018621.01.T02:intron 30.0%
!! ATAGTGGATTCCTTATCTTT+AGG + Chr4:7644062-7644081 None:intergenic 30.0%
!! CTAAAAGCACTAAGTTGAAA+GGG - Chr4:7644692-7644711 MsG0480018621.01.T02:CDS 30.0%
!! GTCGTTTTATGCTATTAACA+TGG - Chr4:7646050-7646069 MsG0480018621.01.T02:CDS 30.0%
!! TAAAAGCACTAAGTTGAAAG+GGG - Chr4:7644693-7644712 MsG0480018621.01.T02:CDS 30.0%
!! TAGTGCTTTTAGAGAATCTA+CGG + Chr4:7644684-7644703 None:intergenic 30.0%
!! TCTAAAAGCACTAAGTTGAA+AGG - Chr4:7644691-7644710 MsG0480018621.01.T02:CDS 30.0%
!! TTTGTGAAACGATTGACTTT+TGG - Chr4:7645192-7645211 MsG0480018621.01.T02:intron 30.0%
!!! TTTATTTTACGGTGCTCTTT+TGG - Chr4:7643759-7643778 MsG0480018621.01.T02:intron 30.0%
AAAATATCGGGATGTTACAG+AGG + Chr4:7643531-7643550 None:intergenic 35.0%
AAACCAATTCCTATACAGTC+TGG - Chr4:7642048-7642067 MsG0480018621.01.T02:intron 35.0%
AAATTGAGTATGCTGCAGAT+GGG + Chr4:7644616-7644635 None:intergenic 35.0%
AAGAGAAAAACGAGATACAG+GGG + Chr4:7643306-7643325 None:intergenic 35.0%
ACCATCCAAACATGAAATCA+AGG + Chr4:7641779-7641798 None:intergenic 35.0%
AGTATGCCTTCCTAAAGATA+AGG - Chr4:7644049-7644068 MsG0480018621.01.T02:intron 35.0%
ATACATCAGATTGGTATACC+AGG - Chr4:7641599-7641618 MsG0480018621.01.T02:three_prime_UTR 35.0%
ATCCATGGTTGTTGTAGAAA+CGG + Chr4:7641820-7641839 None:intergenic 35.0%
ATCGTGTGGTATATGATTTG+AGG + Chr4:7644207-7644226 None:intergenic 35.0%
ATGATTTAGGCGTAATGTCT+TGG - Chr4:7645929-7645948 MsG0480018621.01.T02:intron 35.0%
CAAAGCTCACACAGTATTAT+TGG + Chr4:7643102-7643121 None:intergenic 35.0%
CAATAAAGAGGGGTGATTTA+AGG - Chr4:7643258-7643277 MsG0480018621.01.T02:intron 35.0%
CAGGCTCAAAATGGTATAAT+AGG - Chr4:7641681-7641700 MsG0480018621.01.T02:three_prime_UTR 35.0%
CCATCCAAACATGAAATCAA+GGG + Chr4:7641778-7641797 None:intergenic 35.0%
CCATTCAAAGTTGTCCAAAA+GGG + Chr4:7642935-7642954 None:intergenic 35.0%
GAAAGAGAAAAACGAGATAC+AGG + Chr4:7643308-7643327 None:intergenic 35.0%
GACAACTTTGAATGGAATGA+TGG - Chr4:7642940-7642959 MsG0480018621.01.T02:intron 35.0%
GGAAAAAGAGGAGGAAATTA+AGG + Chr4:7644385-7644404 None:intergenic 35.0%
TAATGTCTTGGACCAAAATC+CGG - Chr4:7645941-7645960 MsG0480018621.01.T02:intron 35.0%
TATTCCAAATGACCTACTTG+AGG - Chr4:7643670-7643689 MsG0480018621.01.T02:intron 35.0%
TCCATTCAAAGTTGTCCAAA+AGG + Chr4:7642936-7642955 None:intergenic 35.0%
TCGAAGAATATCTATCACCT+TGG - Chr4:7644573-7644592 MsG0480018621.01.T02:three_prime_UTR 35.0%
TCGTGTGGTATATGATTTGA+GGG + Chr4:7644206-7644225 None:intergenic 35.0%
TGATGTATGCCATCTTCATT+AGG + Chr4:7642156-7642175 None:intergenic 35.0%
TGGCTATATGTTTGTCCAAA+GGG - Chr4:7642362-7642381 MsG0480018621.01.T02:intron 35.0%
TTCATTAGGAGTGGTAAGAA+AGG + Chr4:7642142-7642161 None:intergenic 35.0%
TTGGCTATATGTTTGTCCAA+AGG - Chr4:7642361-7642380 MsG0480018621.01.T02:intron 35.0%
TTTAGGTAACAAAGAAGGCA+TGG - Chr4:7645709-7645728 MsG0480018621.01.T02:CDS 35.0%
TTTCCTTTGTGTACAACAGT+AGG + Chr4:7642397-7642416 None:intergenic 35.0%
! AAGGGAAGTTATGTTGATAG+TGG + Chr4:7644078-7644097 None:intergenic 35.0%
! AGAAACTAGAGTTTTGCTGA+CGG + Chr4:7643228-7643247 None:intergenic 35.0%
! ATCTCTTCTTTTAGTACGTG+TGG - Chr4:7643899-7643918 MsG0480018621.01.T02:intron 35.0%
! CTGTATATGTTTTGTGGTCT+TGG - Chr4:7645112-7645131 MsG0480018621.01.T02:intron 35.0%
! GAAACGGTCAAAAAGTATAG+TGG + Chr4:7641804-7641823 None:intergenic 35.0%
! GACCCTTACACTAACATTTT+AGG - Chr4:7645692-7645711 MsG0480018621.01.T02:CDS 35.0%
! GACTTGGTAGAGAATTGATA+AGG + Chr4:7644292-7644311 None:intergenic 35.0%
! GAGCAATCTAAGAGTCTTAT+TGG - Chr4:7641967-7641986 MsG0480018621.01.T02:intron 35.0%
! GCTTTGAGTATGAACCAATT+TGG - Chr4:7645658-7645677 MsG0480018621.01.T02:CDS 35.0%
! GTATGATAATGTGGTGTGAA+TGG - Chr4:7645069-7645088 MsG0480018621.01.T02:intron 35.0%
! TAAGTTGAAAGGGGAGAAAA+GGG - Chr4:7644702-7644721 MsG0480018621.01.T02:CDS 35.0%
! TCTCTTCTTTTAGTACGTGT+GGG - Chr4:7643900-7643919 MsG0480018621.01.T02:intron 35.0%
! TGGATTCCTTATCTTTAGGA+AGG + Chr4:7644058-7644077 None:intergenic 35.0%
! TTCATTGACTGAATCTGCAT+TGG + Chr4:7643500-7643519 None:intergenic 35.0%
!!! AAGAGAGTAGTGTTTTGACT+CGG + Chr4:7644000-7644019 None:intergenic 35.0%
AAAGAGCTTGCAAGAGAGAA+AGG + Chr4:7644742-7644761 None:intergenic 40.0%
AAGAAACTTCCTAAACCACC+GGG + Chr4:7643037-7643056 None:intergenic 40.0%
AAGCTTCCAAGTCAAGTCTA+TGG - Chr4:7644818-7644837 MsG0480018621.01.T02:CDS 40.0%
AATGTCTTGGACCAAAATCC+GGG - Chr4:7645942-7645961 MsG0480018621.01.T02:intron 40.0%
ACACATCCTAACAAGGTTTC+AGG + Chr4:7644772-7644791 None:intergenic 40.0%
ACCACATATCAGGCTCAAAA+TGG - Chr4:7641672-7641691 MsG0480018621.01.T02:three_prime_UTR 40.0%
ACCATGGATCACGACAAAAT+TGG - Chr4:7641831-7641850 MsG0480018621.01.T02:intron 40.0%
ACTATTAGAACACAAGGGGT+TGG + Chr4:7644541-7644560 None:intergenic 40.0%
ACTTGTAATTGCCTTAGTGG+CGG - Chr4:7645240-7645259 MsG0480018621.01.T02:intron 40.0%
AGAGAAAAACGAGATACAGG+GGG + Chr4:7643305-7643324 None:intergenic 40.0%
AGAGATAGCTACAAGCATGA+TGG + Chr4:7643885-7643904 None:intergenic 40.0%
AGCTCACACAGTATTATTGG+TGG + Chr4:7643099-7643118 None:intergenic 40.0%
AGCTTCCAAGTCAAGTCTAT+GGG - Chr4:7644819-7644838 MsG0480018621.01.T02:CDS 40.0%
AGGCAAGGTGTGAATGTAAA+AGG - Chr4:7642895-7642914 MsG0480018621.01.T02:intron 40.0%
ATCACCTCAAGTAGGTCATT+TGG + Chr4:7643677-7643696 None:intergenic 40.0%
ATGATATTAACCCGCCACTA+AGG + Chr4:7645254-7645273 None:intergenic 40.0%
ATTCCTATACAGTCTGGATC+AGG - Chr4:7642054-7642073 MsG0480018621.01.T02:intron 40.0%
ATTTCTTAGTGGTGCCTAAG+TGG - Chr4:7645274-7645293 MsG0480018621.01.T02:intron 40.0%
CAAGAAACTTCCTAAACCAC+CGG + Chr4:7643038-7643057 None:intergenic 40.0%
CCATGGATCACGACAAAATT+GGG - Chr4:7641832-7641851 MsG0480018621.01.T02:intron 40.0%
CCCTTGATTTCATGTTTGGA+TGG - Chr4:7641775-7641794 MsG0480018621.01.T02:intron 40.0%
CGTGTGGTATATGATTTGAG+GGG + Chr4:7644205-7644224 None:intergenic 40.0%
CTTACCACTCCTAATGAAGA+TGG - Chr4:7642144-7642163 MsG0480018621.01.T02:intron 40.0%
CTTCGTGGATATATGCTTCA+AGG - Chr4:7641516-7641535 MsG0480018621.01.T03:three_prime_UTR 40.0%
CTTGAAACTTCTCAATCGTG+TGG + Chr4:7644221-7644240 None:intergenic 40.0%
GAAATTGAGTATGCTGCAGA+TGG + Chr4:7644617-7644636 None:intergenic 40.0%
GAGAGAAAGGACTCAAAACT+TGG + Chr4:7644729-7644748 None:intergenic 40.0%
GATCCAGACTGTATAGGAAT+TGG + Chr4:7642054-7642073 None:intergenic 40.0%
GCATTGGATTAAACTCTCAC+TGG - Chr4:7641703-7641722 MsG0480018621.01.T02:three_prime_UTR 40.0%
GGATACTTTCCTGTTGTTAG+CGG + Chr4:7641901-7641920 None:intergenic 40.0%
GGCTATATGTTTGTCCAAAG+GGG - Chr4:7642363-7642382 MsG0480018621.01.T02:intron 40.0%
TAGTTCCACACATCCTAACA+AGG + Chr4:7644779-7644798 None:intergenic 40.0%
TATGCCATCTTCATTAGGAG+TGG + Chr4:7642151-7642170 None:intergenic 40.0%
TCTTACCCATAGACTTGACT+TGG + Chr4:7644827-7644846 None:intergenic 40.0%
TGAAACCTTGTTAGGATGTG+TGG - Chr4:7644771-7644790 MsG0480018621.01.T02:CDS 40.0%
TGAACCTATAAGTGGCATGT+GGG + Chr4:7644433-7644452 None:intergenic 40.0%
TGGGTCACCATGAGAAAATA+GGG + Chr4:7644414-7644433 None:intergenic 40.0%
TTGAACCTATAAGTGGCATG+TGG + Chr4:7644434-7644453 None:intergenic 40.0%
TTGGAGACAGAGTAAAGCAT+TGG - Chr4:7641542-7641561 MsG0480018621.01.T03:intron 40.0%
TTTATACAGCCGCTAACAAC+AGG - Chr4:7641889-7641908 MsG0480018621.01.T02:intron 40.0%
! AAAATCCGGCTTGTAGTTTG+AGG + Chr4:7644873-7644892 None:intergenic 40.0%
! AAATCCGGCTTGTAGTTTGA+GGG + Chr4:7644872-7644891 None:intergenic 40.0%
! ACCATTTTGAGCCTGATATG+TGG + Chr4:7641676-7641695 None:intergenic 40.0%
! AGGAATTGGTTTCGTTGCAT+TGG + Chr4:7642040-7642059 None:intergenic 40.0%
! AGGGCTGTGTTATTGAATAG+TGG - Chr4:7644918-7644937 MsG0480018621.01.T02:intron 40.0%
! ATACTTTGCATGGTCCCTTT+TGG - Chr4:7642918-7642937 MsG0480018621.01.T02:intron 40.0%
! CCCTTTTGGACAACTTTGAA+TGG - Chr4:7642932-7642951 MsG0480018621.01.T02:intron 40.0%
! CGGCAGCTTTTAGATCTAAT+GGG + Chr4:7641749-7641768 None:intergenic 40.0%
! CTAAGTTGAAAGGGGAGAAA+AGG - Chr4:7644701-7644720 MsG0480018621.01.T02:CDS 40.0%
! GTTTTTGCTTGAAGCGTGTA+CGG - Chr4:7645745-7645764 MsG0480018621.01.T02:CDS 40.0%
! TCGGCAGCTTTTAGATCTAA+TGG + Chr4:7641750-7641769 None:intergenic 40.0%
! TCTAATGGGTCAGTTGAGTA+TGG + Chr4:7641735-7641754 None:intergenic 40.0%
! TGGAGACAGAGTAAAGCATT+GGG - Chr4:7641543-7641562 MsG0480018621.01.T03:intron 40.0%
! TTAGTGGCGGGAATTATATC+CGG - Chr4:7645431-7645450 MsG0480018621.01.T02:intron 40.0%
! TTTTTGCTTGAAGCGTGTAC+GGG - Chr4:7645746-7645765 MsG0480018621.01.T02:CDS 40.0%
!!! GTTTTGACTCGGCAACAAAA+GGG + Chr4:7643989-7644008 None:intergenic 40.0%
!!! TGGTTTTTTGTGTGAAGGCA+AGG - Chr4:7642880-7642899 MsG0480018621.01.T02:intron 40.0%
!!! TGTTTTGACTCGGCAACAAA+AGG + Chr4:7643990-7644009 None:intergenic 40.0%
AAAACTCAATCCCGCCACTT+AGG + Chr4:7645291-7645310 None:intergenic 45.0%
AATATGTGCAGGCTGCAACT+TGG - Chr4:7642342-7642361 MsG0480018621.01.T02:intron 45.0%
ACATAAGACACCAAGCTTGC+TGG + Chr4:7641922-7641941 None:intergenic 45.0%
ACATTGCAGATCTGGAGACA+TGG - Chr4:7645979-7645998 MsG0480018621.01.T02:CDS 45.0%
AGACCTGAGCGAAACAAGAA+AGG + Chr4:7643444-7643463 None:intergenic 45.0%
AGCACTTAGCATGGACGTAT+GGG + Chr4:7644898-7644917 None:intergenic 45.0%
ATACGTCCATGCTAAGTGCT+AGG - Chr4:7644898-7644917 MsG0480018621.01.T02:intron 45.0%
ATCTGGAGACATGGGTATTC+GGG - Chr4:7645988-7646007 MsG0480018621.01.T02:CDS 45.0%
ATGCATGGCTGCTTGTGTAT+TGG + Chr4:7643735-7643754 None:intergenic 45.0%
ATGGGACATACATTGGAGCA+TGG - Chr4:7642260-7642279 MsG0480018621.01.T02:intron 45.0%
ATGTCTCCAGATCTGCAATG+TGG + Chr4:7645980-7645999 None:intergenic 45.0%
ATGTCTTGGACCAAAATCCG+GGG - Chr4:7645943-7645962 MsG0480018621.01.T02:intron 45.0%
ATTCTGTGTGGATGCCTTAG+TGG - Chr4:7645415-7645434 MsG0480018621.01.T02:intron 45.0%
CATGAGAAAATAGGGGTCGA+GGG + Chr4:7644406-7644425 None:intergenic 45.0%
CATTGCAGATCTGGAGACAT+GGG - Chr4:7645980-7645999 MsG0480018621.01.T02:CDS 45.0%
CTTGTAATTGCCTTAGTGGC+GGG - Chr4:7645241-7645260 MsG0480018621.01.T02:intron 45.0%
GACCGTTTCTACAACAACCA+TGG - Chr4:7641815-7641834 MsG0480018621.01.T02:intron 45.0%
GACGCCCTTGATTTCATGTT+TGG - Chr4:7641771-7641790 MsG0480018621.01.T02:intron 45.0%
GATCTGGAGACATGGGTATT+CGG - Chr4:7645987-7646006 MsG0480018621.01.T02:CDS 45.0%
GCATGTCATATGCATCTGTG+TGG - Chr4:7645326-7645345 MsG0480018621.01.T02:CDS 45.0%
GGACCTACTGTTGTACACAA+AGG - Chr4:7642391-7642410 MsG0480018621.01.T02:intron 45.0%
GGATATAATTCCCGCCACTA+AGG + Chr4:7645432-7645451 None:intergenic 45.0%
GGCAACAAAAGGGACATTCA+TGG + Chr4:7643979-7643998 None:intergenic 45.0%
GGGTCACCATGAGAAAATAG+GGG + Chr4:7644413-7644432 None:intergenic 45.0%
GTGGAACCTGAAACCTTGTT+AGG - Chr4:7644763-7644782 MsG0480018621.01.T02:CDS 45.0%
GTGGGTCACCATGAGAAAAT+AGG + Chr4:7644415-7644434 None:intergenic 45.0%
GTGTGTTTGTCGCATTTGTG+TGG - Chr4:7643409-7643428 MsG0480018621.01.T02:intron 45.0%
TACGTCCATGCTAAGTGCTA+GGG - Chr4:7644899-7644918 MsG0480018621.01.T02:intron 45.0%
TAGCACTTAGCATGGACGTA+TGG + Chr4:7644899-7644918 None:intergenic 45.0%
TCCAACACTATCACTCGAAG+AGG - Chr4:7642691-7642710 MsG0480018621.01.T02:intron 45.0%
TGGACGTATGGGGAAAAATC+CGG + Chr4:7644887-7644906 None:intergenic 45.0%
TGGGACATACATTGGAGCAT+GGG - Chr4:7642261-7642280 MsG0480018621.01.T02:intron 45.0%
TGTTTGTCCAAAGGGGATTC+AGG - Chr4:7642370-7642389 MsG0480018621.01.T02:intron 45.0%
TTGGTATGAATGTGAGGGAG+TGG + Chr4:7644522-7644541 None:intergenic 45.0%
! AATCCGGCTTGTAGTTTGAG+GGG + Chr4:7644871-7644890 None:intergenic 45.0%
! AGAAGGCATGGTGTATGCTT+TGG - Chr4:7645721-7645740 MsG0480018621.01.T02:CDS 45.0%
! AGCAAGAAGTTGGTTGTGTG+TGG + Chr4:7641625-7641644 None:intergenic 45.0%
! CCCAATTTTGTCGTGATCCA+TGG + Chr4:7641835-7641854 None:intergenic 45.0%
! CTCTCTTGCAAGCTCTTTTG+TGG - Chr4:7644744-7644763 MsG0480018621.01.T02:CDS 45.0%
! GAAGTGTTTGTTCGTGCGTT+TGG - Chr4:7644657-7644676 MsG0480018621.01.T02:exon 45.0%
! GATGGATACACTGTGCGTTT+TGG - Chr4:7642958-7642977 MsG0480018621.01.T02:intron 45.0%
! GCAGTGAACGTTGGTAAATC+TGG + Chr4:7641946-7641965 None:intergenic 45.0%
! TTCTTGTTTCGCTCAGGTCT+TGG - Chr4:7643444-7643463 MsG0480018621.01.T02:intron 45.0%
! TTGCCTTTCTTGTTTCGCTC+AGG - Chr4:7643438-7643457 MsG0480018621.01.T02:intron 45.0%
! TTTTGCTTGAAGCGTGTACG+GGG - Chr4:7645747-7645766 MsG0480018621.01.T02:CDS 45.0%
!! AAGGGGTTGGTATGAATGTG+AGG + Chr4:7644528-7644547 None:intergenic 45.0%
!! AGGAAAGTATCCAGCAAGCT+TGG - Chr4:7641909-7641928 MsG0480018621.01.T02:intron 45.0%
!! AGGGGTTGGTATGAATGTGA+GGG + Chr4:7644527-7644546 None:intergenic 45.0%
!! CAGATGGGTGGTTTTGCTTA+CGG + Chr4:7644601-7644620 None:intergenic 45.0%
!! CATGAAATCAAGGGCGTCTT+CGG + Chr4:7641769-7641788 None:intergenic 45.0%
!! TGGTTTTGCTTACGGTTCCA+AGG + Chr4:7644593-7644612 None:intergenic 45.0%
!! AATTAAATATATAAAATATC+GGG + Chr4:7643543-7643562 None:intergenic 5.0%
!! GAATTAAATATATAAAATAT+CGG + Chr4:7643544-7643563 None:intergenic 5.0%
!!! AATAATTAAAATGTATTTTA+CGG - Chr4:7644968-7644987 MsG0480018621.01.T02:intron 5.0%
!!! ACTTATTTTAATAAAAAAAA+AGG + Chr4:7643330-7643349 None:intergenic 5.0%
AATTGCAATTCCCGCCACAC+AGG + Chr4:7645354-7645373 None:intergenic 50.0%
AGTAGGTCCTGAATCCCCTT+TGG + Chr4:7642380-7642399 None:intergenic 50.0%
ATAGGGGTCGAGGGAAAAAG+AGG + Chr4:7644397-7644416 None:intergenic 50.0%
ATCCCCCTCAAACTACAAGC+CGG - Chr4:7644865-7644884 MsG0480018621.01.T02:intron 50.0%
ATTATGCGTGGATGCCTGTG+TGG - Chr4:7645376-7645395 MsG0480018621.01.T02:CDS 50.0%
CAGCTGCATGAGCAAGAAGT+TGG + Chr4:7641635-7641654 None:intergenic 50.0%
CATCCTCCACATTGCAGATC+TGG - Chr4:7645971-7645990 MsG0480018621.01.T02:CDS 50.0%
CCATGAGAAAATAGGGGTCG+AGG + Chr4:7644407-7644426 None:intergenic 50.0%
CCTATACAGTCTGGATCAGG+CGG - Chr4:7642057-7642076 MsG0480018621.01.T02:intron 50.0%
GATTGCTCTGCAGTGAACGT+TGG + Chr4:7641955-7641974 None:intergenic 50.0%
GCACTTAGCATGGACGTATG+GGG + Chr4:7644897-7644916 None:intergenic 50.0%
TCTCCAGATCTGCAATGTGG+AGG + Chr4:7645977-7645996 None:intergenic 50.0%
TCTTAGTGGTGCCTAAGTGG+CGG - Chr4:7645277-7645296 MsG0480018621.01.T02:intron 50.0%
TGTAGTTTGAGGGGGATACC+CGG + Chr4:7644862-7644881 None:intergenic 50.0%
TTGAGTATGCTGCAGATGGG+TGG + Chr4:7644613-7644632 None:intergenic 50.0%
! ATCCGGCTTGTAGTTTGAGG+GGG + Chr4:7644870-7644889 None:intergenic 50.0%
! CCTCGACCCCTATTTTCTCA+TGG - Chr4:7644404-7644423 MsG0480018621.01.T02:three_prime_UTR 50.0%
! CGAGATACAGGGGGTGATTT+TGG + Chr4:7643296-7643315 None:intergenic 50.0%
! GCCTCTTCGAGTGATAGTGT+TGG + Chr4:7642695-7642714 None:intergenic 50.0%
! GTGACCCACATGCCACTTAT+AGG - Chr4:7644426-7644445 MsG0480018621.01.T02:three_prime_UTR 50.0%
! TGCATTGGCAGCATACATGC+TGG + Chr4:7642025-7642044 None:intergenic 50.0%
ATGTGGAGGATGTAACGCCC+CGG + Chr4:7645963-7645982 None:intergenic 55.0%
CACAGCCCTAGCACTTAGCA+TGG + Chr4:7644907-7644926 None:intergenic 55.0%
CCGCCTGATCCAGACTGTAT+AGG + Chr4:7642060-7642079 None:intergenic 55.0%
CTGTGTGGATGCCTTAGTGG+CGG - Chr4:7645418-7645437 MsG0480018621.01.T02:intron 55.0%
CTTAGTGGTGCCTAAGTGGC+GGG - Chr4:7645278-7645297 MsG0480018621.01.T02:intron 55.0%
GCGTGTACGGGGACGAAATT+TGG - Chr4:7645758-7645777 MsG0480018621.01.T02:CDS 55.0%
TGTGTGGATGCCTTAGTGGC+GGG - Chr4:7645419-7645438 MsG0480018621.01.T02:intron 55.0%
! GAAGTTGGTTGTGTGTGGCC+TGG + Chr4:7641620-7641639 None:intergenic 55.0%
! GGATGTAACGCCCCGGATTT+TGG + Chr4:7645956-7645975 None:intergenic 55.0%
!! ATCACTCGAAGAGGCGCTCA+TGG - Chr4:7642700-7642719 MsG0480018621.01.T02:intron 55.0%
AACCACCGGGCAGAGAGCTT+AGG + Chr4:7643024-7643043 None:intergenic 60.0%
ACCACCGGGCAGAGAGCTTA+GGG + Chr4:7643023-7643042 None:intergenic 60.0%
AGCTCTCTGCCCGGTGGTTT+AGG - Chr4:7643025-7643044 MsG0480018621.01.T02:intron 60.0%
ATGCGTGGATGCCTGTGTGG+CGG - Chr4:7645379-7645398 MsG0480018621.01.T02:CDS 60.0%
GACACCCTAAGCTCTCTGCC+CGG - Chr4:7643016-7643035 MsG0480018621.01.T02:intron 60.0%
GCATCTGTGTGGTGCCTGTG+TGG - Chr4:7645337-7645356 MsG0480018621.01.T02:CDS 60.0%
GGGGTCGAGGGAAAAAGAGG+AGG + Chr4:7644394-7644413 None:intergenic 60.0%
TCTGTGTGGTGCCTGTGTGG+CGG - Chr4:7645340-7645359 MsG0480018621.01.T02:CDS 60.0%
ACCCTAAGCTCTCTGCCCGG+TGG - Chr4:7643019-7643038 MsG0480018621.01.T02:intron 65.0%
CTGTGTGGTGCCTGTGTGGC+GGG - Chr4:7645341-7645360 MsG0480018621.01.T02:CDS 65.0%
GGTAAGAGACCCCCACCAGC+CGG - Chr4:7644840-7644859 MsG0480018621.01.T02:intron 65.0%
GTAAGAGACCCCCACCAGCC+GGG - Chr4:7644841-7644860 MsG0480018621.01.T02:intron 65.0%
GTTTGAGGGGGATACCCGGC+TGG + Chr4:7644858-7644877 None:intergenic 65.0%
TGCGTGGATGCCTGTGTGGC+GGG - Chr4:7645380-7645399 MsG0480018621.01.T02:CDS 65.0%
! TCTGGATCAGGCGGCGCTGA+CGG - Chr4:7642066-7642085 MsG0480018621.01.T02:intron 65.0%
AGGGGGATACCCGGCTGGTG+GGG + Chr4:7644853-7644872 None:intergenic 70.0%
GAGGGGGATACCCGGCTGGT+GGG + Chr4:7644854-7644873 None:intergenic 70.0%
TGAGGGGGATACCCGGCTGG+TGG + Chr4:7644855-7644874 None:intergenic 70.0%
GGGGGATACCCGGCTGGTGG+GGG + Chr4:7644852-7644871 None:intergenic 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 7641503 7646252 7641503 ID=MsG0480018621.01;Name=MsG0480018621.01
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Chr4 exon 7641503 7641535 7641503 ID=MsG0480018621.01.T03:exon:1894;Parent=MsG0480018621.01.T03
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Chr4 three_prime_UTR 7644607 7644674 7644607 ID=MsG0480018621.01.T03:three_prime_utr;Parent=MsG0480018621.01.T03
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Gene Sequence

>MsG0480018621.01.T02

ATGATTTTAAGGACTTCGTGGATATATGCTTCAAGGAATTTGGAGACAGAATTGGTATACCAGGCCACACACAACCAACTTCTTGCTCATGCAGCTGTTTTCGAATTGTATAAAACCACATATCAGGCTCAAAATGGTATAATAGGCATTGGATTAAACTCTCACTGGTTTAAACCATACTCAACTGACCCATTAGATCTAAAAGCTGCCGAAGACGCCCTTGATTTCATGTTTGGATGGTTTATACAGCCGCTAACAACAGGAAAGTATCCAGCAAGCTTGGTGTCTTATGTGCCAGATTTACCAACGTTCACTGCAGAGCAATCTAAGAGTCTTATTGGGTCATATGATTTTATTGGAATCAATTACTACACCAGCATGTATGCTGCCAATGCAACGAAACCAATTCCTATACAGTCTGGATCAGGCGGCGCTGACGGTGTCAATAGTGTTTTCAATACTGTTAATGTGACTTTAACAGATAAGAATAAAGATGGGACATACATTGGAGCATGGGCTGCAACTTGGCTATATGTTTGTCCAAAGGGGATTCAGGACCTACTGTTGTACACAAAGGAAAAGTATAACAATCCTACGATTATCATAACAGAAAATGGTATGAATGAAGTCAATGATCCAACACTATCACTCGAAGAGGCGCTCATGGATACTAACAGAATTGATTACTTTTATCGTCATCTATATTATCTTTTATCTGCAATGAGGCAAGGTGTGAATGTAAAAGGATACTTTGCATGGTCCCTTTTGGACAACTTTGAATGGAATGATGGATACACTGTGCGTTTTGGAATTAACTTTGTTGATTATGACAATGATCTTAGAAGACACCCTAAGCTCTCTGCCCGGTGGTTTAGGAAGTTTCTTGAACATAATAGAATTATTGGTTGA

>MsG0480018621.01.T03

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>MsG0480018621.01.T01

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Protein sequence

>MsG0480018621.01.T02

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