AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180003682.01


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MsG0180003682.01.T01 AT1G32600 26.754 228 131 9 45 267 1 197 2.25e-15 76.3
MsG0180003682.01.T01 AT4G10190 24.351 308 198 13 1 292 6 294 1.36e-14 74.7
MsG0180003682.01.T01 AT4G04690 27.200 250 148 11 4 242 11 237 1.79e-14 74.7
MsG0180003682.01.T01 AT1G12870 24.367 316 195 15 2 292 31 327 1.63e-12 68.9
MsG0180003682.01.T01 AT1G33530 24.172 302 180 8 2 286 95 364 2.17e-11 65.5
MsG0180003682.01.T01 AT3G17710 25.086 291 180 13 4 278 6 274 2.53e-11 65.1
MsG0180003682.01.T01 AT3G10430 25.703 249 149 10 2 236 3 229 3.47e-11 64.7
MsG0180003682.01.T01 AT1G11620 23.279 305 201 9 3 292 5 291 3.72e-11 64.3
MsG0180003682.01.T01 AT3G23260 23.301 309 192 13 4 292 6 289 9.18e-11 63.2

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CCAATGCTGGAATCGCTTTC+TGG 0.152390 1:-66559433 MsG0180003682.01.T01:CDS
TTAACTTCTTCACCTATTTC+AGG 0.202881 1:+66559020 None:intergenic
GCTTGTTTGATTCTCCTTCC+TGG 0.221392 1:+66558656 None:intergenic
ATCAACCGCATGTCTCTTCT+TGG 0.235421 1:-66559485 MsG0180003682.01.T01:CDS
ATCAGAATCTATTGCTTCTC+TGG 0.277430 1:-66559272 MsG0180003682.01.T01:CDS
TCAAATTGGTGTTTCGGTTC+TGG 0.295575 1:-66558985 MsG0180003682.01.T01:CDS
CTTGTTTGATTCTCCTTCCT+GGG 0.306996 1:+66558657 None:intergenic
TAGTGTTGAGGAGTAGGAAT+AGG 0.312366 1:+66559371 None:intergenic
TGAAGTTGTGGGAATCGATT+AGG 0.330860 1:+66559636 None:intergenic
CGTTGAAAATCTCGAGTGTT+AGG 0.333891 1:+66559054 None:intergenic
CCTTCCAATGGCGGATCTTC+CGG 0.340771 1:-66559741 None:intergenic
GTCTGGGTGATGAAAGAATA+TGG 0.362923 1:-66558915 MsG0180003682.01.T01:CDS
ATGCGATGTTTACGGAGGTT+AGG 0.365833 1:+66559407 None:intergenic
GAAAGAGTGTAAGGCATAGT+AGG 0.371098 1:+66559179 None:intergenic
AAACTGCTAAAATTGATGTC+TGG 0.375761 1:-66558932 MsG0180003682.01.T01:CDS
TAGATCGTGAGAAGCTGTTT+TGG 0.380196 1:-66558776 MsG0180003682.01.T01:CDS
TCCTATGCTCGAAGAACAAT+GGG 0.383999 1:-66559158 MsG0180003682.01.T01:CDS
GGAGTTTAACGCCGGTGGTT+AGG 0.391223 1:+66559528 None:intergenic
AGTGTTGAGGAGTAGGAATA+GGG 0.395006 1:+66559372 None:intergenic
GGTTAGAGAGATCATTGATT+TGG 0.395959 1:+66559549 None:intergenic
GAAGTTGTGGGAATCGATTA+GGG 0.396457 1:+66559637 None:intergenic
TGCGATGTTTACGGAGGTTA+GGG 0.397678 1:+66559408 None:intergenic
CTCTGCATTTCCTCCAATGC+TGG 0.397740 1:-66559446 MsG0180003682.01.T01:CDS
TTATTCGAGCGATAGAAGTA+TGG 0.402294 1:-66558811 MsG0180003682.01.T01:CDS
AAGGGATAATGCGATGTTTA+CGG 0.404504 1:+66559399 None:intergenic
TTGTTGAGAATTCTCTTCAC+TGG 0.405175 1:-66559130 MsG0180003682.01.T01:CDS
AAAGTTGTGTCGAAGGATTA+AGG 0.412173 1:+66559580 None:intergenic
TCTTCACCTATTTCAGGAAA+AGG 0.414896 1:+66559026 None:intergenic
GTTTACCTTTGAGAGCTTTG+AGG 0.431826 1:-66558842 MsG0180003682.01.T01:CDS
GATTCATAGTGTTGAGGAGT+AGG 0.442331 1:+66559365 None:intergenic
TCTGATAAGTTTGTAATCGT+TGG 0.452516 1:+66559289 None:intergenic
CCAGAAAGCGATTCCAGCAT+TGG 0.461498 1:+66559433 None:intergenic
AACTGCTAAAATTGATGTCT+GGG 0.462285 1:-66558931 MsG0180003682.01.T01:CDS
AGTTTGTAATCGTTGGTCAA+TGG 0.463465 1:+66559296 None:intergenic
TTCTCCTTCCTGGGGAAGGA+AGG 0.464219 1:+66558666 None:intergenic
AAGAAGAGACATGCGGTTGA+TGG 0.465176 1:+66559487 None:intergenic
ATGTTGAGGTTGAACGGAAT+CGG 0.475816 1:+66559669 None:intergenic
AAGGATTAAGGAACGATTGA+GGG 0.494899 1:+66559592 None:intergenic
TGGCAGCATAGAGAGGATTC+CGG 0.495481 1:+66559706 None:intergenic
TTGATTCTCCTTCCTGGGGA+AGG 0.495730 1:+66558662 None:intergenic
TCTCTTCTTGGTTCATGTAA+CGG 0.497158 1:-66559473 MsG0180003682.01.T01:CDS
CGAGCATAGGAAAGAGTGTA+AGG 0.501820 1:+66559170 None:intergenic
TCAGAATCTATTGCTTCTCT+GGG 0.508575 1:-66559271 MsG0180003682.01.T01:CDS
CTCTTCACTGGGTAATGACT+CGG 0.509525 1:-66559118 MsG0180003682.01.T01:CDS
GAATGTGTTAGTTATGTTGA+AGG 0.512815 1:-66558738 MsG0180003682.01.T01:CDS
AAACTCCGTCTTCCTTTCAC+AGG 0.515778 1:-66559512 MsG0180003682.01.T01:CDS
ATTGGTGTTTCGGTTCTGGA+AGG 0.517496 1:-66558981 MsG0180003682.01.T01:CDS
AAGACTTCCAACACAAATGA+TGG 0.519578 1:+66558695 None:intergenic
GGTTAAACGCGACGATTGCA+CGG 0.526323 1:+66559075 None:intergenic
GTTATGTTGAAGGAATTCCT+AGG 0.527071 1:-66558728 MsG0180003682.01.T01:CDS
AGAAGAGACATGCGGTTGAT+GGG 0.527119 1:+66559488 None:intergenic
GTGTTGAGGAGTAGGAATAG+GGG 0.532814 1:+66559373 None:intergenic
GAAGGATTAAGGAACGATTG+AGG 0.535662 1:+66559591 None:intergenic
CCCCATTGTTCTTCGAGCAT+AGG 0.537653 1:+66559157 None:intergenic
TTGTACAACCTTCCTTCCCC+AGG 0.542112 1:-66558674 MsG0180003682.01.T01:CDS
AGGTTGAACGGAATCGGAGA+AGG 0.542380 1:+66559675 None:intergenic
GTTAAACGCGACGATTGCAC+GGG 0.543453 1:+66559076 None:intergenic
TGTTGAGAATTCTCTTCACT+GGG 0.544727 1:-66559129 MsG0180003682.01.T01:CDS
TTCCTATGCTCGAAGAACAA+TGG 0.549241 1:-66559159 MsG0180003682.01.T01:CDS
TGTTGAGGAGTAGGAATAGG+GGG 0.550910 1:+66559374 None:intergenic
GATGAAGTTTGATGAAGTTG+TGG 0.553423 1:+66559624 None:intergenic
TTATGTTGAAGGAATTCCTA+GGG 0.554663 1:-66558727 MsG0180003682.01.T01:CDS
TTGTTAGATTCATAGTGTTG+AGG 0.556029 1:+66559359 None:intergenic
TTGGTGTTTCGGTTCTGGAA+GGG 0.557227 1:-66558980 MsG0180003682.01.T01:CDS
GATCATGCCATCATTTGTGT+TGG 0.572304 1:-66558702 MsG0180003682.01.T01:CDS
CATTGGAGGAAATGCAGAGA+AGG 0.574708 1:+66559450 None:intergenic
AGAAATCAAAGTTGTGTCGA+AGG 0.578576 1:+66559573 None:intergenic
ATGAAGTTTGATGAAGTTGT+GGG 0.579907 1:+66559625 None:intergenic
TCCGCCGGAAGATCCGCCAT+TGG 0.582476 1:+66559737 None:intergenic
GATCTCTCTAACCTAACCAC+CGG 0.584870 1:-66559539 MsG0180003682.01.T01:CDS
AATCGGAGAAGGGATTGTAC+TGG 0.586900 1:+66559686 None:intergenic
AAAATCCTCAAAGCTCTCAA+AGG 0.587974 1:+66558837 None:intergenic
AGAATCAAACAAGCAAGAGA+AGG 0.589438 1:-66558647 MsG0180003682.01.T01:CDS
TAGGGATTGAAGTGATGTTG+AGG 0.591531 1:+66559655 None:intergenic
GGTTGAACGGAATCGGAGAA+GGG 0.592132 1:+66559676 None:intergenic
GAAAGCGATTCCAGCATTGG+AGG 0.593337 1:+66559436 None:intergenic
TTGTTTGATTCTCCTTCCTG+GGG 0.594685 1:+66558658 None:intergenic
AATATGGATGTAGAGATAGC+TGG 0.599739 1:-66558899 MsG0180003682.01.T01:CDS
TCAGCTTCAAAACAAACTCG+TGG 0.600644 1:-66559211 MsG0180003682.01.T01:CDS
TCCAATGGCGGATCTTCCGG+CGG 0.602631 1:-66559738 None:intergenic
CTTCCGGCGGAGATACTCAC+CGG 0.605434 1:-66559725 MsG0180003682.01.T01:CDS
GAAGTGATGTTGAGGTTGAA+CGG 0.605534 1:+66559663 None:intergenic
GAAGCCGTGAATGCAAAAGC+CGG 0.606357 1:+66559328 None:intergenic
ACAACCTTCCTTCCCCAGGA+AGG 0.611686 1:-66558670 MsG0180003682.01.T01:CDS
ATTGTACTGGCAGCATAGAG+AGG 0.615863 1:+66559699 None:intergenic
CGGTTGATGGGACCTGTGAA+AGG 0.619030 1:+66559500 None:intergenic
ATGATGGCATGATCCACCCT+AGG 0.630491 1:+66558711 None:intergenic
AAGACGGAGTTTAACGCCGG+TGG 0.638536 1:+66559523 None:intergenic
TGTTGAAGGAATTCCTAGGG+TGG 0.649730 1:-66558724 MsG0180003682.01.T01:CDS
TGGGACCTGTGAAAGGAAGA+CGG 0.650437 1:+66559507 None:intergenic
ATTCCGGTGAGTATCTCCGC+CGG 0.655323 1:+66559722 None:intergenic
AGGAAGACGGAGTTTAACGC+CGG 0.675654 1:+66559520 None:intergenic
CTATGCTCGAAGAACAATGG+GGG 0.681906 1:-66559156 MsG0180003682.01.T01:CDS
GAATCTAACAACATTCACGC+CGG 0.691202 1:-66559347 MsG0180003682.01.T01:CDS
GGATAATGCGATGTTTACGG+AGG 0.693289 1:+66559402 None:intergenic
TTAAACGCGACGATTGCACG+GGG 0.719624 1:+66559077 None:intergenic
CCTATGCTCGAAGAACAATG+GGG 0.750154 1:-66559157 MsG0180003682.01.T01:CDS
ATGAACCAAGAAGAGACATG+CGG 0.753037 1:+66559480 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AATAGTGAGAGTTTTCAAAT+TGG - Chr1:66559361-66559380 MsG0180003682.01.T01:CDS 25.0%
AAACTGCTAAAATTGATGTC+TGG - Chr1:66559428-66559447 MsG0180003682.01.T01:CDS 30.0%
AACTGCTAAAATTGATGTCT+GGG - Chr1:66559429-66559448 MsG0180003682.01.T01:CDS 30.0%
ATGAAGTTTGATGAAGTTGT+GGG + Chr1:66558738-66558757 None:intergenic 30.0%
GAATGTGTTAGTTATGTTGA+AGG - Chr1:66559622-66559641 MsG0180003682.01.T01:CDS 30.0%
TCTGATAAGTTTGTAATCGT+TGG + Chr1:66559074-66559093 None:intergenic 30.0%
TTAACTTCTTCACCTATTTC+AGG + Chr1:66559343-66559362 None:intergenic 30.0%
TTATGTTGAAGGAATTCCTA+GGG - Chr1:66559633-66559652 MsG0180003682.01.T01:CDS 30.0%
TTGTTAGATTCATAGTGTTG+AGG + Chr1:66559004-66559023 None:intergenic 30.0%
!! GAGTTTTCAAATTGGTGTTT+CGG - Chr1:66559369-66559388 MsG0180003682.01.T01:CDS 30.0%
AAAATCCTCAAAGCTCTCAA+AGG + Chr1:66559526-66559545 None:intergenic 35.0%
AAAGTTGTGTCGAAGGATTA+AGG + Chr1:66558783-66558802 None:intergenic 35.0%
AAGACTTCCAACACAAATGA+TGG + Chr1:66559668-66559687 None:intergenic 35.0%
AAGGATTAAGGAACGATTGA+GGG + Chr1:66558771-66558790 None:intergenic 35.0%
AAGGGATAATGCGATGTTTA+CGG + Chr1:66558964-66558983 None:intergenic 35.0%
AATATGGATGTAGAGATAGC+TGG - Chr1:66559461-66559480 MsG0180003682.01.T01:CDS 35.0%
AGAAATCAAAGTTGTGTCGA+AGG + Chr1:66558790-66558809 None:intergenic 35.0%
AGAATCAAACAAGCAAGAGA+AGG - Chr1:66559713-66559732 MsG0180003682.01.T01:CDS 35.0%
AGTTTGTAATCGTTGGTCAA+TGG + Chr1:66559067-66559086 None:intergenic 35.0%
ATCAGAATCTATTGCTTCTC+TGG - Chr1:66559088-66559107 MsG0180003682.01.T01:CDS 35.0%
GATGAAGTTTGATGAAGTTG+TGG + Chr1:66558739-66558758 None:intergenic 35.0%
GTTATGTTGAAGGAATTCCT+AGG - Chr1:66559632-66559651 MsG0180003682.01.T01:CDS 35.0%
TCAGAATCTATTGCTTCTCT+GGG - Chr1:66559089-66559108 MsG0180003682.01.T01:CDS 35.0%
TCTCTTCTTGGTTCATGTAA+CGG - Chr1:66558887-66558906 MsG0180003682.01.T01:CDS 35.0%
TCTTCACCTATTTCAGGAAA+AGG + Chr1:66559337-66559356 None:intergenic 35.0%
TGTTGAGAATTCTCTTCACT+GGG - Chr1:66559231-66559250 MsG0180003682.01.T01:CDS 35.0%
TTATTCGAGCGATAGAAGTA+TGG - Chr1:66559549-66559568 MsG0180003682.01.T01:CDS 35.0%
TTGTTGAGAATTCTCTTCAC+TGG - Chr1:66559230-66559249 MsG0180003682.01.T01:CDS 35.0%
! CTGGTGTAAACTTTTTACTG+TGG - Chr1:66559480-66559499 MsG0180003682.01.T01:CDS 35.0%
! GGTTAGAGAGATCATTGATT+TGG + Chr1:66558814-66558833 None:intergenic 35.0%
! GTGTAAACTTTTTACTGTGG+CGG - Chr1:66559483-66559502 MsG0180003682.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTGAGAGCTTTGAGGATTTT+AGG - Chr1:66559526-66559545 MsG0180003682.01.T01:CDS 35.0%
ATGAACCAAGAAGAGACATG+CGG + Chr1:66558883-66558902 None:intergenic 40.0%
ATGTTGAGGTTGAACGGAAT+CGG + Chr1:66558694-66558713 None:intergenic 40.0%
CGTTGAAAATCTCGAGTGTT+AGG + Chr1:66559309-66559328 None:intergenic 40.0%
CTTGTTTGATTCTCCTTCCT+GGG + Chr1:66559706-66559725 None:intergenic 40.0%
GAAGGATTAAGGAACGATTG+AGG + Chr1:66558772-66558791 None:intergenic 40.0%
GAAGTGATGTTGAGGTTGAA+CGG + Chr1:66558700-66558719 None:intergenic 40.0%
GAAGTTGTGGGAATCGATTA+GGG + Chr1:66558726-66558745 None:intergenic 40.0%
GAATCTAACAACATTCACGC+CGG - Chr1:66559013-66559032 MsG0180003682.01.T01:CDS 40.0%
GATCATGCCATCATTTGTGT+TGG - Chr1:66559658-66559677 MsG0180003682.01.T01:CDS 40.0%
GTCTGGGTGATGAAAGAATA+TGG - Chr1:66559445-66559464 MsG0180003682.01.T01:CDS 40.0%
TAGGGATTGAAGTGATGTTG+AGG + Chr1:66558708-66558727 None:intergenic 40.0%
TCAGCTTCAAAACAAACTCG+TGG - Chr1:66559149-66559168 MsG0180003682.01.T01:CDS 40.0%
TCCTATGCTCGAAGAACAAT+GGG - Chr1:66559202-66559221 MsG0180003682.01.T01:CDS 40.0%
TGAAGTTGTGGGAATCGATT+AGG + Chr1:66558727-66558746 None:intergenic 40.0%
TTCCTATGCTCGAAGAACAA+TGG - Chr1:66559201-66559220 MsG0180003682.01.T01:CDS 40.0%
TTGTTTGATTCTCCTTCCTG+GGG + Chr1:66559705-66559724 None:intergenic 40.0%
! AACACTCGAGATTTTCAACG+AGG - Chr1:66559309-66559328 MsG0180003682.01.T01:CDS 40.0%
! AGTGTTGAGGAGTAGGAATA+GGG + Chr1:66558991-66559010 None:intergenic 40.0%
! GAAAGAGTGTAAGGCATAGT+AGG + Chr1:66559184-66559203 None:intergenic 40.0%
! GAGGTTCCTTTTCCTGAAAT+AGG - Chr1:66559328-66559347 MsG0180003682.01.T01:CDS 40.0%
! GATTCATAGTGTTGAGGAGT+AGG + Chr1:66558998-66559017 None:intergenic 40.0%
! GTTTACCTTTGAGAGCTTTG+AGG - Chr1:66559518-66559537 MsG0180003682.01.T01:CDS 40.0%
! TAGATCGTGAGAAGCTGTTT+TGG - Chr1:66559584-66559603 MsG0180003682.01.T01:CDS 40.0%
! TAGTGTTGAGGAGTAGGAAT+AGG + Chr1:66558992-66559011 None:intergenic 40.0%
! TCAAATTGGTGTTTCGGTTC+TGG - Chr1:66559375-66559394 MsG0180003682.01.T01:CDS 40.0%
AAACTCCGTCTTCCTTTCAC+AGG - Chr1:66558848-66558867 MsG0180003682.01.T01:CDS 45.0%
AAGAAGAGACATGCGGTTGA+TGG + Chr1:66558876-66558895 None:intergenic 45.0%
AATCGGAGAAGGGATTGTAC+TGG + Chr1:66558677-66558696 None:intergenic 45.0%
AGAAGAGACATGCGGTTGAT+GGG + Chr1:66558875-66558894 None:intergenic 45.0%
ATCAACCGCATGTCTCTTCT+TGG - Chr1:66558875-66558894 MsG0180003682.01.T01:CDS 45.0%
ATGCGATGTTTACGGAGGTT+AGG + Chr1:66558956-66558975 None:intergenic 45.0%
CATTGGAGGAAATGCAGAGA+AGG + Chr1:66558913-66558932 None:intergenic 45.0%
CCTATGCTCGAAGAACAATG+GGG - Chr1:66559203-66559222 MsG0180003682.01.T01:CDS 45.0%
CTATGCTCGAAGAACAATGG+GGG - Chr1:66559204-66559223 MsG0180003682.01.T01:CDS 45.0%
CTCTTCACTGGGTAATGACT+CGG - Chr1:66559242-66559261 MsG0180003682.01.T01:CDS 45.0%
GAGTAGGAATAGGGGGATAA+GGG + Chr1:66558982-66559001 None:intergenic 45.0%
GATCTCTCTAACCTAACCAC+CGG - Chr1:66558821-66558840 MsG0180003682.01.T01:CDS 45.0%
GCTTGTTTGATTCTCCTTCC+TGG + Chr1:66559707-66559726 None:intergenic 45.0%
GGATAATGCGATGTTTACGG+AGG + Chr1:66558961-66558980 None:intergenic 45.0%
GTGTTGAGGAGTAGGAATAG+GGG + Chr1:66558990-66559009 None:intergenic 45.0%
TGCGATGTTTACGGAGGTTA+GGG + Chr1:66558955-66558974 None:intergenic 45.0%
TGTTGAAGGAATTCCTAGGG+TGG - Chr1:66559636-66559655 MsG0180003682.01.T01:CDS 45.0%
TGTTGAGGAGTAGGAATAGG+GGG + Chr1:66558989-66559008 None:intergenic 45.0%
! ATTGTACTGGCAGCATAGAG+AGG + Chr1:66558664-66558683 None:intergenic 45.0%
! CGAGCATAGGAAAGAGTGTA+AGG + Chr1:66559193-66559212 None:intergenic 45.0%
!! ATTGGTGTTTCGGTTCTGGA+AGG - Chr1:66559379-66559398 MsG0180003682.01.T01:CDS 45.0%
!! TTGGTGTTTCGGTTCTGGAA+GGG - Chr1:66559380-66559399 MsG0180003682.01.T01:CDS 45.0%
AGGAAGACGGAGTTTAACGC+CGG + Chr1:66558843-66558862 None:intergenic 50.0%
AGGTTGAACGGAATCGGAGA+AGG + Chr1:66558688-66558707 None:intergenic 50.0%
ATGATGGCATGATCCACCCT+AGG + Chr1:66559652-66559671 None:intergenic 50.0%
CCAATGCTGGAATCGCTTTC+TGG - Chr1:66558927-66558946 MsG0180003682.01.T01:CDS 50.0%
CCAGAAAGCGATTCCAGCAT+TGG + Chr1:66558930-66558949 None:intergenic 50.0%
CCCCATTGTTCTTCGAGCAT+AGG + Chr1:66559206-66559225 None:intergenic 50.0%
CTCTGCATTTCCTCCAATGC+TGG - Chr1:66558914-66558933 MsG0180003682.01.T01:CDS 50.0%
GAAGCCGTGAATGCAAAAGC+CGG + Chr1:66559035-66559054 None:intergenic 50.0%
GGAGTAGGAATAGGGGGATA+AGG + Chr1:66558983-66559002 None:intergenic 50.0%
GGTTAAACGCGACGATTGCA+CGG + Chr1:66559288-66559307 None:intergenic 50.0%
GGTTGAACGGAATCGGAGAA+GGG + Chr1:66558687-66558706 None:intergenic 50.0%
GTTAAACGCGACGATTGCAC+GGG + Chr1:66559287-66559306 None:intergenic 50.0%
TGGCAGCATAGAGAGGATTC+CGG + Chr1:66558657-66558676 None:intergenic 50.0%
TGGGACCTGTGAAAGGAAGA+CGG + Chr1:66558856-66558875 None:intergenic 50.0%
TTAAACGCGACGATTGCACG+GGG + Chr1:66559286-66559305 None:intergenic 50.0%
TTGATTCTCCTTCCTGGGGA+AGG + Chr1:66559701-66559720 None:intergenic 50.0%
TTGTACAACCTTCCTTCCCC+AGG - Chr1:66559686-66559705 MsG0180003682.01.T01:CDS 50.0%
! GAAAGCGATTCCAGCATTGG+AGG + Chr1:66558927-66558946 None:intergenic 50.0%
! GGCTTTTGCATTCACGGCTT+CGG - Chr1:66559034-66559053 MsG0180003682.01.T01:CDS 50.0%
AAGACGGAGTTTAACGCCGG+TGG + Chr1:66558840-66558859 None:intergenic 55.0%
ACAACCTTCCTTCCCCAGGA+AGG - Chr1:66559690-66559709 MsG0180003682.01.T01:CDS 55.0%
ATTCCGGTGAGTATCTCCGC+CGG + Chr1:66558641-66558660 None:intergenic 55.0%
GGAGTTTAACGCCGGTGGTT+AGG + Chr1:66558835-66558854 None:intergenic 55.0%
TTCTCCTTCCTGGGGAAGGA+AGG + Chr1:66559697-66559716 None:intergenic 55.0%
!! CGGTTGATGGGACCTGTGAA+AGG + Chr1:66558863-66558882 None:intergenic 55.0%
!!! CACGCCGGCTTTTGCATTCA+CGG - Chr1:66559028-66559047 MsG0180003682.01.T01:CDS 55.0%
CTTCCGGCGGAGATACTCAC+CGG - Chr1:66558635-66558654 MsG0180003682.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 66558626 66559756 66558626 ID=MsG0180003682.01;Name=MsG0180003682.01
Chr1 mRNA 66558626 66559756 66558626 ID=MsG0180003682.01.T01;Parent=MsG0180003682.01;Name=MsG0180003682.01.T01;_AED=0.44;_eAED=0.44;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|376
Chr1 exon 66558626 66559756 66558626 ID=MsG0180003682.01.T01:exon:3598;Parent=MsG0180003682.01.T01
Chr1 CDS 66558626 66559756 66558626 ID=MsG0180003682.01.T01:cds;Parent=MsG0180003682.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180003682.01.T01

ATGGCGGATCTTCCGGCGGAGATACTCACCGGAATCCTCTCTATGCTGCCAGTACAATCCCTTCTCCGATTCCGTTCAACCTCAACATCACTTCAATCCCTAATCGATTCCCACAACTTCATCAAACTTCATCTCAAAAATTCCCTCAATCGTTCCTTAATCCTTCGACACAACTTTGATTTCTACCAAATCAATGATCTCTCTAACCTAACCACCGGCGTTAAACTCCGTCTTCCTTTCACAGGTCCCATCAACCGCATGTCTCTTCTTGGTTCATGTAACGGCCTTCTCTGCATTTCCTCCAATGCTGGAATCGCTTTCTGGAACCCTAACCTCCGTAAACATCGCATTATCCCTTATCCCCCTATTCCTACTCCTCAACACTATGAATCTAACAACATTCACGCCGGCTTTTGCATTCACGGCTTCGGTTTTGATCCATTGACCAACGATTACAAACTTATCAGAATCTATTGCTTCTCTGGGTTACAAAACTCTACTTTTGAATCACATGTGAGACTCTTCAGCTTCAAAACAAACTCGTGGAAAGAACTTCCTACTATGCCTTACACTCTTTCCTATGCTCGAAGAACAATGGGGGATTTTGTTGAGAATTCTCTTCACTGGGTAATGACTCGGAAACTTGATCTGTTGCAACCCCGTGCAATCGTCGCGTTTAACCTAACACTCGAGATTTTCAACGAGGTTCCTTTTCCTGAAATAGGTGAAGAAGTTAATAGTGAGAGTTTTCAAATTGGTGTTTCGGTTCTGGAAGGGTGTCTTTGTATGATTGTGAATTATCAAACTGCTAAAATTGATGTCTGGGTGATGAAAGAATATGGATGTAGAGATAGCTGGTGTAAACTTTTTACTGTGGCGGAATCGTGTTTCAGTTTACCTTTGAGAGCTTTGAGGATTTTAGGTTATTCGAGCGATAGAAGTATGGTTCTGTTGCAAGTAGATCGTGAGAAGCTGTTTTGGTATGATCTCAAGAGTGAATGTGTTAGTTATGTTGAAGGAATTCCTAGGGTGGATCATGCCATCATTTGTGTTGGAAGTCTTGTACAACCTTCCTTCCCCAGGAAGGAGAATCAAACAAGCAAGAGAAGGTACTTCTTGTTGATTACCTGA

Protein sequence

>MsG0180003682.01.T01

MADLPAEILTGILSMLPVQSLLRFRSTSTSLQSLIDSHNFIKLHLKNSLNRSLILRHNFDFYQINDLSNLTTGVKLRLPFTGPINRMSLLGSCNGLLCISSNAGIAFWNPNLRKHRIIPYPPIPTPQHYESNNIHAGFCIHGFGFDPLTNDYKLIRIYCFSGLQNSTFESHVRLFSFKTNSWKELPTMPYTLSYARRTMGDFVENSLHWVMTRKLDLLQPRAIVAFNLTLEIFNEVPFPEIGEEVNSESFQIGVSVLEGCLCMIVNYQTAKIDVWVMKEYGCRDSWCKLFTVAESCFSLPLRALRILGYSSDRSMVLLQVDREKLFWYDLKSECVSYVEGIPRVDHAIICVGSLVQPSFPRKENQTSKRRYFLLIT*