AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280007709.01

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CRISPR-Local

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AAACTCCTAAAATTGATGTT+TGG 0.287986 2:+19508626 MsG0280007709.01.T01:CDS
GAGGATGAGGTTGAAATTTC+GGG 0.288904 2:-19507960 None:intergenic
AACTCCTAAAATTGATGTTT+GGG 0.308118 2:+19508627 MsG0280007709.01.T01:CDS
TAAATCTCGGGAAGCTGTTT+TGG 0.313966 2:+19508782 MsG0280007709.01.T01:CDS
AAATTCTCTTCACTGGATAA+TGG 0.331045 2:+19508453 MsG0280007709.01.T01:CDS
ATCCGATGTTTATGCGTGTT+AGG 0.333054 2:-19508175 None:intergenic
AACATAGCTTCATCCAAATT+AGG 0.339979 2:-19508847 None:intergenic
GTGATAGGAATAGGTAGAAA+AGG 0.347690 2:-19508202 None:intergenic
GTGGAATCATCGATTTGGTT+AGG 0.351784 2:-19508021 None:intergenic
GTTGTAGAATGTAATTTCAT+TGG 0.351960 2:-19508152 None:intergenic
TCCTTCCTATAATTATCAAC+GGG 0.352045 2:-19508901 None:intergenic
TACAAACTCCTCAGAATCTC+TGG 0.358214 2:+19508298 MsG0280007709.01.T01:CDS
GAACGAGGAGTGATAGGAAT+AGG 0.360015 2:-19508211 None:intergenic
AACTGCTGTTTATGCGTTCA+CGG 0.361065 2:+19508247 MsG0280007709.01.T01:CDS
GTTTGGGTGATGAAAGAATA+TGG 0.362113 2:+19508643 MsG0280007709.01.T01:CDS
TGTTTATGCGTTCACGGCTT+TGG 0.364434 2:+19508253 MsG0280007709.01.T01:CDS
CCTCAGAATCTCTGGGTTAA+CGG 0.378899 2:+19508306 MsG0280007709.01.T01:CDS
TTGTAGAATGTAATTTCATT+GGG 0.380317 2:-19508151 None:intergenic
GGATTTAAACTGACATTGTA+AGG 0.382503 2:+19509606 MsG0280007709.01.T01:CDS
AGTTTGTAATCGGCAGATAA+TGG 0.382925 2:-19508283 None:intergenic
AAGGATGCGCGAAAGCGATT+TGG 0.394178 2:-19508123 None:intergenic
ATTGAGTGGAATCATCGATT+TGG 0.397977 2:-19508026 None:intergenic
AGCCCCAACATCACTCTTAT+CGG 0.405815 2:+19508067 MsG0280007709.01.T01:CDS
TAGAGAGCGTAAGGCATACT+AGG 0.422738 2:-19508400 None:intergenic
CCATCACTTGAATAAGCTAA+AGG 0.429010 2:-19508739 None:intergenic
TTGTTGAAAATTCTCTTCAC+TGG 0.430675 2:+19508446 MsG0280007709.01.T01:CDS
GATTCTGAGGAGTTTGTAAT+CGG 0.432252 2:-19508293 None:intergenic
ATTTCACCTCCTACTTCATC+AGG 0.432316 2:-19508556 None:intergenic
TCCACTCAATCATCCTTTCA+AGG 0.436444 2:+19508039 MsG0280007709.01.T01:CDS
TCCGATGTTTATGCGTGTTA+GGG 0.443177 2:-19508174 None:intergenic
ATAATGGCAAAGAAACTTGA+TGG 0.448423 2:+19508469 MsG0280007709.01.T01:CDS
CACTGAAAATCTCAAGTGTT+AGG 0.450765 2:-19508522 None:intergenic
ACTTCGAGGTTGATCGGAAT+CGG 0.454210 2:-19507883 None:intergenic
GAACCGATAAGAGTGATGTT+GGG 0.454749 2:-19508070 None:intergenic
CTCTACTATGCTCAAACCAT+GGG 0.461336 2:+19508418 MsG0280007709.01.T01:CDS
GATTGAGAACGAGGAGTGAT+AGG 0.462668 2:-19508217 None:intergenic
GAACTAGTTAGTCATGTTGA+AGG 0.463572 2:+19508820 MsG0280007709.01.T01:CDS
TGATAGGAATAGGTAGAAAA+GGG 0.469958 2:-19508201 None:intergenic
AGCGATTTGGCCATTAGAAA+AGG 0.471360 2:-19508110 None:intergenic
CAATGTCAGTTTAAATCCTC+GGG 0.475395 2:-19509601 None:intergenic
TGGAATCATCGATTTGGTTA+GGG 0.478327 2:-19508020 None:intergenic
CTCCTTCCTATAATTATCAA+CGG 0.486710 2:-19508902 None:intergenic
ACAATGTCAGTTTAAATCCT+CGG 0.491910 2:-19509602 None:intergenic
GGTGAAGGTTGATGAATTTG+TGG 0.491921 2:-19507928 None:intergenic
TGGTAAGCGAGAGAAGATTT+CGG 0.492087 2:-19507846 None:intergenic
TCATCGATTTGGTTAGGGTA+GGG 0.495127 2:-19508015 None:intergenic
TGAACCGATAAGAGTGATGT+TGG 0.495326 2:-19508071 None:intergenic
CCTTTAGCTTATTCAAGTGA+TGG 0.497547 2:+19508739 MsG0280007709.01.T01:CDS
GAATTGACTTCGAGGTTGAT+CGG 0.497631 2:-19507889 None:intergenic
TGACATGTGGATCATAATAA+GGG 0.502802 2:-19508339 None:intergenic
TCTCTACTATGCTCAAACCA+TGG 0.524201 2:+19508417 MsG0280007709.01.T01:CDS
CAGTGTTATAGCGGAGGATG+AGG 0.525123 2:-19507973 None:intergenic
GTGAAGGTTGATGAATTTGT+GGG 0.534406 2:-19507927 None:intergenic
TAAGGTTCGAATTGACTTCG+AGG 0.540443 2:-19507897 None:intergenic
TGAGCATAGTAGAGAGCGTA+AGG 0.540937 2:-19508409 None:intergenic
ACTCTTATCGGTTCATGTAA+CGG 0.552247 2:+19508079 MsG0280007709.01.T01:CDS
CCCCGTTGATAATTATAGGA+AGG 0.555806 2:+19508900 MsG0280007709.01.T01:CDS
CCGTTAACCCAGAGATTCTG+AGG 0.556465 2:-19508306 None:intergenic
CCTCCTACTTCATCAGGAAG+AGG 0.563141 2:-19508550 None:intergenic
TTGGGGCTGTTACCCTTGAA+AGG 0.568156 2:-19508052 None:intergenic
CCACTCAATCATCCTTTCAA+GGG 0.570124 2:+19508040 MsG0280007709.01.T01:CDS
CCTATAATTATCAACGGGGA+AGG 0.572424 2:-19508896 None:intergenic
GTTCCTCTTCCTGATGAAGT+AGG 0.573216 2:+19508547 MsG0280007709.01.T01:CDS
CCCTTGAAAGGATGATTGAG+TGG 0.575591 2:-19508040 None:intergenic
TAATTATCAACGGGGAAGGA+AGG 0.583502 2:-19508892 None:intergenic
AATATGGATCTAGAGATAGT+TGG 0.584921 2:+19508659 MsG0280007709.01.T01:CDS
GATGGCTGCTGATCTTCCGC+CGG 0.595228 2:+19507814 None:intergenic
ACAAACTCCTCAGAATCTCT+GGG 0.596070 2:+19508299 MsG0280007709.01.T01:CDS
TAATGGCAAAGAAACTTGAT+GGG 0.597517 2:+19508470 MsG0280007709.01.T01:CDS
GGCGGAAGATCAGCAGCCAT+CGG 0.598851 2:-19507812 None:intergenic
TCAGCTTGAAAACAAACTCG+TGG 0.600644 2:+19508368 MsG0280007709.01.T01:CDS
TGTAGAATGTAATTTCATTG+GGG 0.606865 2:-19508150 None:intergenic
TTAGGGTAGGGAAATCGAGT+TGG 0.606868 2:-19508003 None:intergenic
AATCGGAGGAGTGATTGTAC+TGG 0.607476 2:-19507866 None:intergenic
AGGGATGACTTCTTGTCCCG+AGG 0.607904 2:+19509585 MsG0280007709.01.T01:CDS
GATTTAAACTGACATTGTAA+GGG 0.608735 2:+19509607 MsG0280007709.01.T01:CDS
AAAGGCCTCAACGAATTCAA+AGG 0.610665 2:-19508721 None:intergenic
GGTAGAGATCAGTGTTATAG+CGG 0.619529 2:-19507982 None:intergenic
CCTCTTCCTGATGAAGTAGG+AGG 0.620683 2:+19508550 MsG0280007709.01.T01:CDS
TCGAGGTTGATCGGAATCGG+AGG 0.626817 2:-19507880 None:intergenic
ATCATCGATTTGGTTAGGGT+AGG 0.627815 2:-19508016 None:intergenic
ACCCTAACACGCATAAACAT+CGG 0.628118 2:+19508173 MsG0280007709.01.T01:CDS
GTAGAATGTAATTTCATTGG+GGG 0.628917 2:-19508149 None:intergenic
ATTTACCTTTGAATTCGTTG+AGG 0.629713 2:+19508716 MsG0280007709.01.T01:CDS
GGACAAGAAGTCATCCCTGT+GGG 0.635272 2:-19509580 None:intergenic
TTTGGCCATTAGAAAAGGCG+AGG 0.637140 2:-19508105 None:intergenic
TTATCAACGGGGAAGGAAGG+TGG 0.645573 2:-19508889 None:intergenic
AGAGATCAGTGTTATAGCGG+AGG 0.646918 2:-19507979 None:intergenic
TTCATGTCAGATTGAGAACG+AGG 0.654694 2:-19508226 None:intergenic
GTACAAGCAAGAGCAAGAGA+AGG 0.658263 2:+19508929 MsG0280007709.01.T01:intron
TCTACTATGCTCAAACCATG+GGG 0.662795 2:+19508419 MsG0280007709.01.T01:CDS
GGCCATTAGAAAAGGCGAGG+AGG 0.663994 2:-19508102 None:intergenic
AACCGATAAGAGTGATGTTG+GGG 0.668832 2:-19508069 None:intergenic
AAGCTGAAGAGTCTGACATG+TGG 0.676232 2:-19508352 None:intergenic
CCTTCCTATAATTATCAACG+GGG 0.702936 2:-19508900 None:intergenic
GGGACAAGAAGTCATCCCTG+TGG 0.733995 2:-19509581 None:intergenic
ATTTCGGCAAGTATTTCCGG+CGG 0.741653 2:-19507830 None:intergenic
CTACTATGCTCAAACCATGG+GGG 0.755948 2:+19508420 MsG0280007709.01.T01:CDS
TTAAATGCGACAATCAACAG+CGG 0.771267 2:-19508499 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAATACAAATACATAAACAA+AGG - Chr2:19509107-19509126 None:intergenic 15.0%
!! TCAAATTGAATTCTTATTAT+AGG + Chr2:19509049-19509068 MsG0280007709.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTTTTTTTTTTTTCATCCA+TGG + Chr2:19509284-19509303 MsG0280007709.01.T01:intron 15.0%
!! TAACTACAAATACATACTAT+GGG - Chr2:19509013-19509032 None:intergenic 20.0%
!! TTAATCTAACTTCAAAGAAA+AGG - Chr2:19509238-19509257 None:intergenic 20.0%
!! TTGTAGAATGTAATTTCATT+GGG - Chr2:19508154-19508173 None:intergenic 20.0%
!!! AAAAAAACATGCTTTTTTTG+AGG - Chr2:19509500-19509519 None:intergenic 20.0%
!!! AAAAAACATGCTTTTTTTGA+GGG - Chr2:19509499-19509518 None:intergenic 20.0%
!!! AAAAATTTGGAACAATTTCA+TGG - Chr2:19509423-19509442 None:intergenic 20.0%
! AAACTCCTAAAATTGATGTT+TGG + Chr2:19508626-19508645 MsG0280007709.01.T01:CDS 25.0%
! AACTCCTAAAATTGATGTTT+GGG + Chr2:19508627-19508646 MsG0280007709.01.T01:CDS 25.0%
! ATTCAATTTGACCTTTAACA+TGG - Chr2:19509040-19509059 None:intergenic 25.0%
! CTAACTACAAATACATACTA+TGG - Chr2:19509014-19509033 None:intergenic 25.0%
! GCTAGTCAAAATAATTACTT+AGG - Chr2:19509325-19509344 None:intergenic 25.0%
! GTTGTAGAATGTAATTTCAT+TGG - Chr2:19508155-19508174 None:intergenic 25.0%
! TACAAATACATAAACAAAGG+TGG - Chr2:19509104-19509123 None:intergenic 25.0%
! TGTAGAATGTAATTTCATTG+GGG - Chr2:19508153-19508172 None:intergenic 25.0%
!! AAGTTTAACATGCTTTTGAA+AGG - Chr2:19509454-19509473 None:intergenic 25.0%
!! TTATTCAAGTGATGGAAAAA+AGG + Chr2:19508747-19508766 MsG0280007709.01.T01:CDS 25.0%
!! TTGGTGTAAACTTTTTACTT+TGG + Chr2:19508678-19508697 MsG0280007709.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAAGGTACTATGCAAAAATT+TGG - Chr2:19509436-19509455 None:intergenic 25.0%
!!! CAATTTTTTTTTTTCCCACA+GGG + Chr2:19509566-19509585 MsG0280007709.01.T01:CDS 25.0%
!!! GAAATTCATATTGCTGTTTT+GGG + Chr2:19508574-19508593 MsG0280007709.01.T01:CDS 25.0%
!!! TCAATTTTTTTTTTTCCCAC+AGG + Chr2:19509565-19509584 MsG0280007709.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGAAATTCATATTGCTGTTT+TGG + Chr2:19508573-19508592 MsG0280007709.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGAAATTTCGGGAATTTTTT+AGG - Chr2:19507952-19507971 None:intergenic 25.0%
AAATTCTCTTCACTGGATAA+TGG + Chr2:19508453-19508472 MsG0280007709.01.T01:CDS 30.0%
AACATAGCTTCATCCAAATT+AGG - Chr2:19508850-19508869 None:intergenic 30.0%
AATATGGATCTAGAGATAGT+TGG + Chr2:19508659-19508678 MsG0280007709.01.T01:CDS 30.0%
ACAATGTCAGTTTAAATCCT+CGG - Chr2:19509605-19509624 None:intergenic 30.0%
ATAATGGCAAAGAAACTTGA+TGG + Chr2:19508469-19508488 MsG0280007709.01.T01:CDS 30.0%
ATTTACCTTTGAATTCGTTG+AGG + Chr2:19508716-19508735 MsG0280007709.01.T01:CDS 30.0%
CTCCTTCCTATAATTATCAA+CGG - Chr2:19508905-19508924 None:intergenic 30.0%
GAATTTGTGGGAATCAATTA+AGG - Chr2:19507918-19507937 None:intergenic 30.0%
GCAGAAAGTTGTTTAGAAAT+TGG + Chr2:19509393-19509412 MsG0280007709.01.T01:intron 30.0%
GTAGAATGTAATTTCATTGG+GGG - Chr2:19508152-19508171 None:intergenic 30.0%
TAATGGCAAAGAAACTTGAT+GGG + Chr2:19508470-19508489 MsG0280007709.01.T01:CDS 30.0%
TCCTTCCTATAATTATCAAC+GGG - Chr2:19508904-19508923 None:intergenic 30.0%
TGACATGTGGATCATAATAA+GGG - Chr2:19508342-19508361 None:intergenic 30.0%
TGATAGGAATAGGTAGAAAA+GGG - Chr2:19508204-19508223 None:intergenic 30.0%
TGTTGAAGGATTTCCTAATT+TGG + Chr2:19508834-19508853 MsG0280007709.01.T01:CDS 30.0%
TTGTTGAAAATTCTCTTCAC+TGG + Chr2:19508446-19508465 MsG0280007709.01.T01:CDS 30.0%
! ATCACCCAAACATCAATTTT+AGG - Chr2:19508634-19508653 None:intergenic 30.0%
!! AAGTGATGGAAAAAAGGTTT+TGG + Chr2:19508753-19508772 MsG0280007709.01.T01:CDS 30.0%
AAGATTTCGGCAAGTATTTC+CGG - Chr2:19507836-19507855 None:intergenic 35.0%
AGATTCTTTAGCTACTCACA+AGG - Chr2:19509207-19509226 None:intergenic 35.0%
AGTTTGTAATCGGCAGATAA+TGG - Chr2:19508286-19508305 None:intergenic 35.0%
CAATGTCAGTTTAAATCCTC+GGG - Chr2:19509604-19509623 None:intergenic 35.0%
CACTGAAAATCTCAAGTGTT+AGG - Chr2:19508525-19508544 None:intergenic 35.0%
CCATCACTTGAATAAGCTAA+AGG - Chr2:19508742-19508761 None:intergenic 35.0%
CCTTCCTATAATTATCAACG+GGG - Chr2:19508903-19508922 None:intergenic 35.0%
CTGACATGTGGATCATAATA+AGG - Chr2:19508343-19508362 None:intergenic 35.0%
GAACTAGTTAGTCATGTTGA+AGG + Chr2:19508820-19508839 MsG0280007709.01.T01:CDS 35.0%
GTAGTTAGACTCCATGTTAA+AGG + Chr2:19509026-19509045 MsG0280007709.01.T01:intron 35.0%
GTGATAGGAATAGGTAGAAA+AGG - Chr2:19508205-19508224 None:intergenic 35.0%
GTTTGGGTGATGAAAGAATA+TGG + Chr2:19508643-19508662 MsG0280007709.01.T01:CDS 35.0%
TGAGTAGCTAAAGAATCTGT+AGG + Chr2:19509209-19509228 MsG0280007709.01.T01:intron 35.0%
TTAAATGCGACAATCAACAG+CGG - Chr2:19508502-19508521 None:intergenic 35.0%
TTTCTGCTCTTTACATACCA+CGG - Chr2:19509380-19509399 None:intergenic 35.0%
! AACACTTGAGATTTTCAGTG+AGG + Chr2:19508525-19508544 MsG0280007709.01.T01:CDS 35.0%
! ATTGAGTGGAATCATCGATT+TGG - Chr2:19508029-19508048 None:intergenic 35.0%
! ATTTTCAACAAAAACCCCCA+TGG - Chr2:19508437-19508456 None:intergenic 35.0%
! CCTTTAGCTTATTCAAGTGA+TGG + Chr2:19508739-19508758 MsG0280007709.01.T01:CDS 35.0%
! GATGAAGCTATGTTTTGTGT+TGG + Chr2:19508856-19508875 MsG0280007709.01.T01:CDS 35.0%
! GATTCTGAGGAGTTTGTAAT+CGG - Chr2:19508296-19508315 None:intergenic 35.0%
!! ACTCTTATCGGTTCATGTAA+CGG + Chr2:19508079-19508098 MsG0280007709.01.T01:CDS 35.0%
!! GTGAAGGTTGATGAATTTGT+GGG - Chr2:19507930-19507949 None:intergenic 35.0%
!! TGATGGAAAAAAGGTTTTGG+TGG + Chr2:19508756-19508775 MsG0280007709.01.T01:CDS 35.0%
!! TGGAATCATCGATTTGGTTA+GGG - Chr2:19508023-19508042 None:intergenic 35.0%
!!! ATTCATATTGCTGTTTTGGG+TGG + Chr2:19508577-19508596 MsG0280007709.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTCATATTGCTGTTTTGGGT+GGG + Chr2:19508578-19508597 MsG0280007709.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTCGGGAATTTTTTAGGTGA+AGG - Chr2:19507946-19507965 None:intergenic 35.0%
AAAGGCCTCAACGAATTCAA+AGG - Chr2:19508724-19508743 None:intergenic 40.0%
AACCGATAAGAGTGATGTTG+GGG - Chr2:19508072-19508091 None:intergenic 40.0%
ACAAACTCCTCAGAATCTCT+GGG + Chr2:19508299-19508318 MsG0280007709.01.T01:CDS 40.0%
ACCCTAACACGCATAAACAT+CGG + Chr2:19508173-19508192 MsG0280007709.01.T01:CDS 40.0%
ATCCGATGTTTATGCGTGTT+AGG - Chr2:19508178-19508197 None:intergenic 40.0%
ATTTCACCTCCTACTTCATC+AGG - Chr2:19508559-19508578 None:intergenic 40.0%
CCACTCAATCATCCTTTCAA+GGG + Chr2:19508040-19508059 MsG0280007709.01.T01:CDS 40.0%
CCTATAATTATCAACGGGGA+AGG - Chr2:19508899-19508918 None:intergenic 40.0%
CTCTACTATGCTCAAACCAT+GGG + Chr2:19508418-19508437 MsG0280007709.01.T01:CDS 40.0%
GAACCGATAAGAGTGATGTT+GGG - Chr2:19508073-19508092 None:intergenic 40.0%
GAGGATGAGGTTGAAATTTC+GGG - Chr2:19507963-19507982 None:intergenic 40.0%
GGAGGATGAGGTTGAAATTT+CGG - Chr2:19507964-19507983 None:intergenic 40.0%
GGTAGAGATCAGTGTTATAG+CGG - Chr2:19507985-19508004 None:intergenic 40.0%
TAATTATCAACGGGGAAGGA+AGG - Chr2:19508895-19508914 None:intergenic 40.0%
TACAAACTCCTCAGAATCTC+TGG + Chr2:19508298-19508317 MsG0280007709.01.T01:CDS 40.0%
TACTCACAAGGTCAACTCTT+AGG - Chr2:19509195-19509214 None:intergenic 40.0%
TCAGCTTGAAAACAAACTCG+TGG + Chr2:19508368-19508387 MsG0280007709.01.T01:CDS 40.0%
TCCACTCAATCATCCTTTCA+AGG + Chr2:19508039-19508058 MsG0280007709.01.T01:CDS 40.0%
TCCGATGTTTATGCGTGTTA+GGG - Chr2:19508177-19508196 None:intergenic 40.0%
TCTACTATGCTCAAACCATG+GGG + Chr2:19508419-19508438 MsG0280007709.01.T01:CDS 40.0%
TCTCTACTATGCTCAAACCA+TGG + Chr2:19508417-19508436 MsG0280007709.01.T01:CDS 40.0%
TGAACCGATAAGAGTGATGT+TGG - Chr2:19508074-19508093 None:intergenic 40.0%
TGGTAAGCGAGAGAAGATTT+CGG - Chr2:19507849-19507868 None:intergenic 40.0%
TTCATGTCAGATTGAGAACG+AGG - Chr2:19508229-19508248 None:intergenic 40.0%
! AACTGCTGTTTATGCGTTCA+CGG + Chr2:19508247-19508266 MsG0280007709.01.T01:CDS 40.0%
! AGCGATTTGGCCATTAGAAA+AGG - Chr2:19508113-19508132 None:intergenic 40.0%
! GAATTGACTTCGAGGTTGAT+CGG - Chr2:19507892-19507911 None:intergenic 40.0%
! TAAATCTCGGGAAGCTGTTT+TGG + Chr2:19508782-19508801 MsG0280007709.01.T01:CDS 40.0%
! TAAGGTTCGAATTGACTTCG+AGG - Chr2:19507900-19507919 None:intergenic 40.0%
! TTTTGGTGGAGGTAAATCTC+GGG + Chr2:19508770-19508789 MsG0280007709.01.T01:CDS 40.0%
!! ATCATCGATTTGGTTAGGGT+AGG - Chr2:19508019-19508038 None:intergenic 40.0%
!! CCCCGTTGATAATTATAGGA+AGG + Chr2:19508900-19508919 MsG0280007709.01.T01:CDS 40.0%
!! CCTTCCCCGTTGATAATTAT+AGG + Chr2:19508896-19508915 MsG0280007709.01.T01:CDS 40.0%
!! GGTGAAGGTTGATGAATTTG+TGG - Chr2:19507931-19507950 None:intergenic 40.0%
!! GTGGAATCATCGATTTGGTT+AGG - Chr2:19508024-19508043 None:intergenic 40.0%
!! GTTTTGGTGGAGGTAAATCT+CGG + Chr2:19508769-19508788 MsG0280007709.01.T01:CDS 40.0%
!! TCATCGATTTGGTTAGGGTA+GGG - Chr2:19508018-19508037 None:intergenic 40.0%
!! TGGAAAAAAGGTTTTGGTGG+AGG + Chr2:19508759-19508778 MsG0280007709.01.T01:CDS 40.0%
AAGCTGAAGAGTCTGACATG+TGG - Chr2:19508355-19508374 None:intergenic 45.0%
AATCGGAGGAGTGATTGTAC+TGG - Chr2:19507869-19507888 None:intergenic 45.0%
AGAGATCAGTGTTATAGCGG+AGG - Chr2:19507982-19508001 None:intergenic 45.0%
AGCCCCAACATCACTCTTAT+CGG + Chr2:19508067-19508086 MsG0280007709.01.T01:CDS 45.0%
ATTTCGGCAAGTATTTCCGG+CGG - Chr2:19507833-19507852 None:intergenic 45.0%
CCCTTGAAAGGATGATTGAG+TGG - Chr2:19508043-19508062 None:intergenic 45.0%
CCTCAGAATCTCTGGGTTAA+CGG + Chr2:19508306-19508325 MsG0280007709.01.T01:CDS 45.0%
CTACTATGCTCAAACCATGG+GGG + Chr2:19508420-19508439 MsG0280007709.01.T01:CDS 45.0%
GAACGAGGAGTGATAGGAAT+AGG - Chr2:19508214-19508233 None:intergenic 45.0%
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GGAGTGAAGATCTCAAACCA+TGG - Chr2:19509304-19509323 None:intergenic 45.0%
GTACAAGCAAGAGCAAGAGA+AGG + Chr2:19508929-19508948 MsG0280007709.01.T01:intron 45.0%
GTTCCTCTTCCTGATGAAGT+AGG + Chr2:19508547-19508566 MsG0280007709.01.T01:CDS 45.0%
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TTAGGGTAGGGAAATCGAGT+TGG - Chr2:19508006-19508025 None:intergenic 45.0%
TTTGGCCATTAGAAAAGGCG+AGG - Chr2:19508108-19508127 None:intergenic 45.0%
! ACTTCGAGGTTGATCGGAAT+CGG - Chr2:19507886-19507905 None:intergenic 45.0%
! GTAATTTCATTGGGGGCGTA+AGG - Chr2:19508145-19508164 None:intergenic 45.0%
! TAGAGAGCGTAAGGCATACT+AGG - Chr2:19508403-19508422 None:intergenic 45.0%
! TGAGCATAGTAGAGAGCGTA+AGG - Chr2:19508412-19508431 None:intergenic 45.0%
AAGGATGCGCGAAAGCGATT+TGG - Chr2:19508126-19508145 None:intergenic 50.0%
CCGTTAACCCAGAGATTCTG+AGG - Chr2:19508309-19508328 None:intergenic 50.0%
CCTCCTACTTCATCAGGAAG+AGG - Chr2:19508553-19508572 None:intergenic 50.0%
CCTCTTCCTGATGAAGTAGG+AGG + Chr2:19508550-19508569 MsG0280007709.01.T01:CDS 50.0%
GCTCTTTACATACCACGGCA+GGG - Chr2:19509375-19509394 None:intergenic 50.0%
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TTATCAACGGGGAAGGAAGG+TGG - Chr2:19508892-19508911 None:intergenic 50.0%
TTGGGGCTGTTACCCTTGAA+AGG - Chr2:19508055-19508074 None:intergenic 50.0%
! CAGTGTTATAGCGGAGGATG+AGG - Chr2:19507976-19507995 None:intergenic 50.0%
AGGGATGACTTCTTGTCCCG+AGG + Chr2:19509585-19509604 MsG0280007709.01.T01:CDS 55.0%
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GGCCATTAGAAAAGGCGAGG+AGG - Chr2:19508105-19508124 None:intergenic 55.0%
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! GGCCTCCTCGCCTTTTCTAA+TGG + Chr2:19508100-19508119 MsG0280007709.01.T01:CDS 55.0%
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GAGACTATTCCACCCTGCCG+TGG + Chr2:19509360-19509379 MsG0280007709.01.T01:intron 60.0%
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Gene Sequence

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ATGGCTGCTGATCTTCCGCCGGAAATACTTGCCGAAATCTTCTCTCGCTTACCAGTACAATCACTCCTCCGATTCCGATCAACCTCGAAGTCAATTCGAACCTTAATTGATTCCCACAAATTCATCAACCTTCACCTAAAAAATTCCCGAAATTTCAACCTCATCCTCCGCTATAACACTGATCTCTACCAACTCGATTTCCCTACCCTAACCAAATCGATGATTCCACTCAATCATCCTTTCAAGGGTAACAGCCCCAACATCACTCTTATCGGTTCATGTAACGGCCTCCTCGCCTTTTCTACCCCCAATGAAATTACATTCTACAACCCTAACACGCATAAACATCGGATTATCCCTTTTCTACCTATTCCTATCACTCCTCGTTCTCAATCTGACATGAACTGCTGTTTATGCGTTCACGGCTTTGGTTTTGATCCATTATCTGCCGATTACAAACTCCTCAGAATCTCTGGGTTAACGGCTCTACATAACCCTTATTATGATCCACATGTCAGACTCTTCAGCTTGAAAACAAACTCGTGGAAAATAATTCCTAGTATGCCTTACGCTCTCTACTATGCTCAAACCATGGGGGTTTTTGTTGAAAATTCTCTTCACTGGATAATGGCAAAGAAACTTGATGGGTTACATCCGCTGTTGATTGTCGCATTTAACCTAACACTTGAGATTTTCAGTGAGGTTCCTCTTCCTGATGAAGTAGGAGGTGAAATTCATATTGCTGTTTTGGGTGGGTGTCTTTGTATGAATGTGAATTATCAAACTCCTAAAATTGATGTTTGGGTGATGAAAGAATATGGATCTAGAGATAGTTGGTGTAAACTTTTTACTTTGGTTGAATCATGTTTCAATTTACCTTTGAATTCGTTGAGGCCTTTAGCTTATTCAAGTGATGGAAAAAAGGTTTTGGTGGAGGTAAATCTCGGGAAGCTGTTTTGGTATGATTTGAAGAATGAACTAGTTAGTCATGTTGAAGGATTTCCTAATTTGGATGAAGCTATGTTTTGTGTTGGAAGTCTTGTACCACCTTCCTTCCCCGTTGATAATTATAGGAAGGAGAATCGTACAAGCAAGAGCAAGAGAAGGTACTACTTATTAATTATCTGA

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ATGGCTGCTGATCTTCCGCCGGAAATACTTGCCGAAATCTTCTCTCGCTTACCAGTACAATCACTCCTCCGATTCCGATCAACCTCGAAGTCAATTCGAACCTTAATTGATTCCCACAAATTCATCAACCTTCACCTAAAAAATTCCCGAAATTTCAACCTCATCCTCCGCTATAACACTGATCTCTACCAACTCGATTTCCCTACCCTAACCAAATCGATGATTCCACTCAATCATCCTTTCAAGGGTAACAGCCCCAACATCACTCTTATCGGTTCATGTAACGGCCTCCTCGCCTTTTCTAATGGCCAAATCGCTTTCGCGCATCCTTACGCCCCCAATGAAATTACATTCTACAACCCTAACACGCATAAACATCGGATTATCCCTTTTCTACCTATTCCTATCACTCCTCGTTCTCAATCTGACATGAACTGCTGTTTATGCGTTCACGGCTTTGGTTTTGATCCATTATCTGCCGATTACAAACTCCTCAGAATCTCTGGGTTAACGGCTCTACATAACCCTTATTATGATCCACATGTCAGACTCTTCAGCTTGAAAACAAACTCGTGGAAAATAATTCCTAGTATGCCTTACGCTCTCTACTATGCTCAAACCATGGGGGTTTTTGTTGAAAATTCTCTTCACTGGATAATGGCAAAGAAACTTGATGGGTTACATCCGCTGTTGATTGTCGCATTTAACCTAACACTTGAGATTTTCAGTGAGGTTCCTCTTCCTGATGAAGTAGGAGGTGAAATTCATATTGCTGTTTTGGGTGGGTGTCTTTGTATGAATGTGAATTATCAAACTCCTAAAATTGATGTTTGGGTGATGAAAGAATATGGATCTAGAGATAGTTGGTGTAAACTTTTTACTTTGGTTGAATCATGTTTCAATTTACCTTTGAATTCGTTGAGGCCTTTAGCTTATTCAAGTGATGGAAAAAAGGTTTTGGTGGAGGTAAATCTCGGGAAGCTGTTTTGGTATGATTTGAAGAATGAACTAGTTAGTCATGTTGAAGGATTTCCTAATTTGGATGAAGCTATGTTTTGTGTTGGAAGTCTTGTACCACCTTCCTTCCCCGTTGATAATTATAGGAAGGAGAATCGTACAAGCAAGAGCAAGAGAAGGTACTACTTATTAATTATCTGA
Protein sequence

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MNCCLCVHGFGFDPLSADYKLLRISGLTALHNPYYDPHVRLFSLKTNSWKIIPSMPYALYYAQTMGVFVENSLHWIMAKKLDGLHPLLIVAFNLTLEIFSEVPLPDEVGGEIHIAVLGGCLCMNVNYQTPKIDVWVMKEYGSRDSWCKLFTLVESCFNLPLNSLRPLAYSSDGKKVLVEVNLGKLFWYDLKNELVSHVEGFPNLDEAMFCVGSLVPPSFPVDNYRKENRTSKSKDDFLSRGFKLTL*

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