AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480021273.01

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MsG0480021273.01.T01 AT3G21410 29.052 327 177 13 5 315 38 325 7.42e-18 85.1
MsG0480021273.01.T01 AT3G23880 24.416 385 236 11 5 371 14 361 5.08e-17 82.4
MsG0480021273.01.T01 AT4G10190 23.548 310 210 12 2 305 6 294 4.39e-16 79.3
MsG0480021273.01.T01 AT1G13200 25.836 329 203 15 3 305 41 354 7.33e-16 79.3
MsG0480021273.01.T01 AT3G10430 32.184 261 132 15 1 248 1 229 2.91e-15 77.0
MsG0480021273.01.T01 AT2G27520 24.863 366 221 13 4 358 5 327 5.48e-15 75.9
MsG0480021273.01.T01 AT3G20690 25.000 320 200 13 1 305 2 296 1.77e-14 74.7
MsG0480021273.01.T01 AT1G12870 24.204 314 210 12 3 305 31 327 2.42e-14 74.7
MsG0480021273.01.T01 AT4G04690 25.660 265 145 11 5 255 11 237 8.04e-14 72.8
MsG0480021273.01.T01 AT1G11270 27.037 270 129 11 5 246 35 264 9.37e-14 72.0
MsG0480021273.01.T01 AT1G11270 27.037 270 129 11 5 246 35 264 9.37e-14 72.0
MsG0480021273.01.T01 AT3G08750 26.772 254 149 9 1 248 8 230 1.19e-13 72.0
MsG0480021273.01.T01 AT3G17490 24.127 315 204 10 1 305 2 291 4.12e-13 70.9
MsG0480021273.01.T01 AT3G17530 23.755 261 167 10 1 251 2 240 1.32e-12 69.3
MsG0480021273.01.T01 AT1G33530 25.982 331 191 11 1 317 93 383 2.76e-12 68.6
MsG0480021273.01.T01 AT2G17830 25.912 274 156 13 1 251 3 252 8.76e-12 66.6
MsG0480021273.01.T01 AT1G51320 34.615 130 77 5 3 130 4 127 2.15e-11 65.5
MsG0480021273.01.T01 AT3G23260 24.183 306 205 11 5 305 6 289 2.62e-11 65.1
MsG0480021273.01.T01 AT3G17540 22.925 253 177 7 1 251 6 242 3.57e-11 64.7
MsG0480021273.01.T01 AT2G40910 23.560 382 245 17 2 360 59 416 3.66e-11 65.1
MsG0480021273.01.T01 AT3G21120 22.989 261 174 10 4 254 2 245 3.88e-11 64.7
MsG0480021273.01.T01 AT2G40910 23.560 382 245 17 2 360 66 423 5.27e-11 64.3
MsG0480021273.01.T01 AT3G17620 24.812 266 159 10 1 246 1 245 5.73e-11 64.3
MsG0480021273.01.T01 AT3G22870 22.571 319 214 14 2 309 5 301 9.23e-11 63.5

Find 90 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 103 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTTCAACATTTATACGATTT+GGG 0.223285 4:-56175107 MsG0480021273.01.T01:CDS
AAAATTTCGGTGAGAATTTC+CGG 0.224626 4:+56175698 None:intergenic
CTGACATGTGGATCATAAAA+AGG 0.230095 4:+56175185 None:intergenic
GAAATTGATTCGATGGATTA+AGG 0.231483 4:+56175559 None:intergenic
TCTTCAACATTTATACGATT+TGG 0.232639 4:-56175108 MsG0480021273.01.T01:CDS
TAACCCACCAAGTTTCTTCT+TGG 0.278198 4:+56175049 None:intergenic
AATCATCATCAATTTCAATT+TGG 0.293716 4:+56175528 None:intergenic
AAGATACTAAAATTGATGTT+TGG 0.297039 4:-56174875 MsG0480021273.01.T01:CDS
TTGTCAGGTTGGAGAATGTT+AGG 0.308993 4:+56175308 None:intergenic
TTCTTACTACGATTATCAAC+AGG 0.333646 4:+56174597 None:intergenic
AGATACTAAAATTGATGTTT+GGG 0.337841 4:-56174874 MsG0480021273.01.T01:CDS
AACAGAGCCATTACTCTTAT+CGG 0.347165 4:-56175440 MsG0480021273.01.T01:CDS
TGCTTATGTGTTCACGGCTT+CGG 0.351364 4:-56175272 MsG0480021273.01.T01:CDS
GTTTGGGTGATGAAAGAATA+TGG 0.362113 4:-56174858 MsG0480021273.01.T01:CDS
CATTGAAAGTCTCAAGTGTT+AGG 0.365530 4:+56175000 None:intergenic
GAAATAGGTGAAGAAGTTAA+TGG 0.373645 4:-56174960 MsG0480021273.01.T01:CDS
GTTCCTCTTCCTGATGAAAT+AGG 0.374911 4:-56174975 MsG0480021273.01.T01:CDS
CCACCCTTTCACCGGCTTCA+AGG 0.377753 4:-56175465 MsG0480021273.01.T01:CDS
AAAAGCATCATCGATGTGTT+TGG 0.395576 4:+56175497 None:intergenic
GAGGGATAATCCGATGTTTA+CGG 0.407961 4:+56175348 None:intergenic
AGGGATAATCCGATGTTTAC+GGG 0.409718 4:+56175349 None:intergenic
ATCCGATGTTTACGGGTGTA+AGG 0.410005 4:+56175356 None:intergenic
ACACATAAGCAGCGACGGTT+AGG 0.417747 4:+56175284 None:intergenic
AGGTAAGCGGGAGAAAATTT+CGG 0.419755 4:+56175685 None:intergenic
GTGTTTCGATGATTTACCTT+TGG 0.429039 4:-56174793 MsG0480021273.01.T01:CDS
TTCGGTTTCGATCAATTAAC+CGG 0.430312 4:-56175254 MsG0480021273.01.T01:CDS
ATTTACCTTTGGAATCTTTG+AGG 0.430908 4:-56174782 MsG0480021273.01.T01:CDS
CGTCGCTGCTTATGTGTTCA+CGG 0.432690 4:-56175278 MsG0480021273.01.T01:CDS
GGATTGGAAGAGGGAGAAGA+GGG 0.433564 4:+56175330 None:intergenic
GTTCATTACGCCGTGGTACA+TGG 0.436924 4:+56175397 None:intergenic
CAGCGACGGTTAGGGTTGTC+AGG 0.445384 4:+56175293 None:intergenic
GGGATTGGAAGAGGGAGAAG+AGG 0.446924 4:+56175329 None:intergenic
TTGTTGAGAATTCTATTCAC+TGG 0.447743 4:-56175079 MsG0480021273.01.T01:CDS
ACTTCTTCACCTATTTCATC+AGG 0.451165 4:+56174966 None:intergenic
TAGATGCTGAGAATCTGTTT+TGG 0.456955 4:-56174716 MsG0480021273.01.T01:CDS
CCACTCAACCACCCTTTCAC+CGG 0.460766 4:-56175473 MsG0480021273.01.T01:CDS
GGTTGGAGAATGTTAGGGAT+TGG 0.463117 4:+56175314 None:intergenic
TGTCAGGTTGGAGAATGTTA+GGG 0.463902 4:+56175309 None:intergenic
GTGAAGATTGATGAATTTGT+AGG 0.468952 4:+56175604 None:intergenic
CACCCTTTCACCGGCTTCAA+GGG 0.475823 4:-56175464 MsG0480021273.01.T01:CDS
AGAATGTTAGGGATTGGAAG+AGG 0.484341 4:+56175320 None:intergenic
ATGGATTAAGGATCGATTGA+GGG 0.485054 4:+56175571 None:intergenic
TGAAGATCGTACGGCATAGC+AGG 0.487119 4:+56175125 None:intergenic
AGATTTCGAAATTGATTCGA+TGG 0.492921 4:+56175552 None:intergenic
TCTAAGTAGTTTGTAATCAC+CGG 0.494354 4:+56175235 None:intergenic
CGATTATCAACAGGGAAGTA+AGG 0.495910 4:+56174606 None:intergenic
TAATGAACGAAATCACAATC+TGG 0.498912 4:-56175382 MsG0480021273.01.T01:CDS
GATGGATTAAGGATCGATTG+AGG 0.507488 4:+56175570 None:intergenic
TTACCCTTGAAGCCGGTGAA+AGG 0.508831 4:+56175461 None:intergenic
CACATAAGCAGCGACGGTTA+GGG 0.514031 4:+56175285 None:intergenic
TCAGCTTGAAAACAAACTCA+TGG 0.515734 4:-56175157 MsG0480021273.01.T01:CDS
GGCTCTGTTACCCTTGAAGC+CGG 0.521515 4:+56175454 None:intergenic
TCACCTATTTCATCAGGAAG+AGG 0.521517 4:+56174972 None:intergenic
ACTCTTATCGGTTCATGTAA+CGG 0.521685 4:-56175428 MsG0480021273.01.T01:CDS
GACGGTTAGGGTTGTCAGGT+TGG 0.521846 4:+56175297 None:intergenic
TACCCTTGAAGCCGGTGAAA+GGG 0.526278 4:+56175462 None:intergenic
GAATGTTAGGGATTGGAAGA+GGG 0.532406 4:+56175321 None:intergenic
TCCGATGTTTACGGGTGTAA+GGG 0.535892 4:+56175357 None:intergenic
AGAATCCTACAAGCGAGAAA+AGG 0.540089 4:-56174572 MsG0480021273.01.T01:CDS
AAGTGATTCTACAGGTAAGC+GGG 0.544848 4:+56175673 None:intergenic
TTCAACATTTATACGATTTG+GGG 0.546261 4:-56175106 MsG0480021273.01.T01:CDS
CGTGACGCTATGATTTGTGT+TGG 0.547324 4:-56174642 MsG0480021273.01.T01:CDS
AATATGGATGTAGAGATAGT+TGG 0.550990 4:-56174842 MsG0480021273.01.T01:CDS
TGTTGATAATCGTAGTAAGA+AGG 0.569589 4:-56174595 MsG0480021273.01.T01:CDS
ATTATGACCAAGAAGAAACT+TGG 0.569795 4:-56175056 MsG0480021273.01.T01:CDS
TATAAATGTTGAAGATCGTA+CGG 0.573781 4:+56175116 None:intergenic
AATCGGAGAAGTGATTCTAC+AGG 0.574128 4:+56175665 None:intergenic
ATGACCAAGAAGAAACTTGG+TGG 0.584801 4:-56175053 MsG0480021273.01.T01:CDS
ATCGATTGAGGGAATTTCTG+AGG 0.585693 4:+56175582 None:intergenic
AACACTTGAGACTTTCAATG+AGG 0.585762 4:-56174997 MsG0480021273.01.T01:CDS
AATGGTGGCTGAACTTCCAC+CGG 0.590286 4:-56175717 MsG0480021273.01.T01:CDS
GGCCTCCTCGCCATGTACCA+CGG 0.595023 4:-56175407 MsG0480021273.01.T01:CDS
TTAAACGCGACAATTAAAGA+AGG 0.597351 4:+56175023 None:intergenic
CCGGTGAAAGGGTGGTTGAG+TGG 0.600430 4:+56175473 None:intergenic
CCTTGAAGCCGGTGAAAGGG+TGG 0.600984 4:+56175465 None:intergenic
ACATGAACCGATAAGAGTAA+TGG 0.604958 4:+56175433 None:intergenic
ACCCTTACACCCGTAAACAT+CGG 0.616792 4:-56175358 MsG0480021273.01.T01:CDS
AGGGTGTCTTTGTATGACTG+TGG 0.626073 4:-56174904 MsG0480021273.01.T01:CDS
TGACCAAGAAGAAACTTGGT+GGG 0.626228 4:-56175052 MsG0480021273.01.T01:CDS
TCAACATTTATACGATTTGG+GGG 0.642575 4:-56175105 MsG0480021273.01.T01:CDS
CGCCGTGGTACATGGCGAGG+AGG 0.642668 4:+56175405 None:intergenic
AAAAGCCTCAAAGATTCCAA+AGG 0.644484 4:+56174777 None:intergenic
CGTGAACACATAAGCAGCGA+CGG 0.653708 4:+56175279 None:intergenic
TTACGCCGTGGTACATGGCG+AGG 0.660547 4:+56175402 None:intergenic
GAAGTGATTCTACAGGTAAG+CGG 0.662071 4:+56175672 None:intergenic
TGATTTCGTTCATTACGCCG+TGG 0.685823 4:+56175390 None:intergenic
TCTTACTACGATTATCAACA+GGG 0.687246 4:+56174598 None:intergenic
AAGCTGAAGAGACTGACATG+TGG 0.701104 4:+56175173 None:intergenic
TTATCAACAGGGAAGTAAGG+TGG 0.703355 4:+56174609 None:intergenic
ATTTCGGTGAGAATTTCCGG+TGG 0.736050 4:+56175701 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAGATACTAAAATTGATGTT+TGG - Chr4:56175392-56175411 MsG0480021273.01.T01:CDS 20.0%
!! AATCATCATCAATTTCAATT+TGG + Chr4:56174742-56174761 None:intergenic 20.0%
!! AGATACTAAAATTGATGTTT+GGG - Chr4:56175393-56175412 MsG0480021273.01.T01:CDS 20.0%
! CTTCAACATTTATACGATTT+GGG - Chr4:56175160-56175179 MsG0480021273.01.T01:CDS 25.0%
! TATAAATGTTGAAGATCGTA+CGG + Chr4:56175154-56175173 None:intergenic 25.0%
! TCTTCAACATTTATACGATT+TGG - Chr4:56175159-56175178 MsG0480021273.01.T01:CDS 25.0%
! TTCAACATTTATACGATTTG+GGG - Chr4:56175161-56175180 MsG0480021273.01.T01:CDS 25.0%
!!! TAAGTGATTTTGAAGTTGAT+CGG + Chr4:56174628-56174647 None:intergenic 25.0%
AAAATTTCGGTGAGAATTTC+CGG + Chr4:56174572-56174591 None:intergenic 30.0%
AATATGGATGTAGAGATAGT+TGG - Chr4:56175425-56175444 MsG0480021273.01.T01:CDS 30.0%
ATTATGACCAAGAAGAAACT+TGG - Chr4:56175211-56175230 MsG0480021273.01.T01:CDS 30.0%
GAAATAGGTGAAGAAGTTAA+TGG - Chr4:56175307-56175326 MsG0480021273.01.T01:CDS 30.0%
GTGAAGATTGATGAATTTGT+AGG + Chr4:56174666-56174685 None:intergenic 30.0%
TAATGAACGAAATCACAATC+TGG - Chr4:56174885-56174904 MsG0480021273.01.T01:CDS 30.0%
TCTTACTACGATTATCAACA+GGG + Chr4:56175672-56175691 None:intergenic 30.0%
TGACATGTGGATCATAAAAA+GGG + Chr4:56175084-56175103 None:intergenic 30.0%
TTAAACGCGACAATTAAAGA+AGG + Chr4:56175247-56175266 None:intergenic 30.0%
TTCTTACTACGATTATCAAC+AGG + Chr4:56175673-56175692 None:intergenic 30.0%
TTGTTGAGAATTCTATTCAC+TGG - Chr4:56175188-56175207 MsG0480021273.01.T01:CDS 30.0%
! TCAACATTTATACGATTTGG+GGG - Chr4:56175162-56175181 MsG0480021273.01.T01:CDS 30.0%
! TCTAAGTAGTTTGTAATCAC+CGG + Chr4:56175035-56175054 None:intergenic 30.0%
! TTATTCGAGTGATGGAAAAA+AGG - Chr4:56175516-56175535 MsG0480021273.01.T01:CDS 30.0%
! TTGGTGTAAACTTTTTACTG+TGG - Chr4:56175444-56175463 MsG0480021273.01.T01:CDS 30.0%
!! AGATTTCGAAATTGATTCGA+TGG + Chr4:56174718-56174737 None:intergenic 30.0%
!! ATTTACCTTTGGAATCTTTG+AGG - Chr4:56175485-56175504 MsG0480021273.01.T01:CDS 30.0%
!! GAAATTGATTCGATGGATTA+AGG + Chr4:56174711-56174730 None:intergenic 30.0%
!! TGTTGATAATCGTAGTAAGA+AGG - Chr4:56175672-56175691 MsG0480021273.01.T01:CDS 30.0%
!!! ATGGAAAAAAGGTTTTGTTG+AGG - Chr4:56175527-56175546 MsG0480021273.01.T01:CDS 30.0%
!!! ATTTTGAAGTTGATCGGAAT+CGG + Chr4:56174622-56174641 None:intergenic 30.0%
!!! GAATCTGTTTTGGTATGATT+TGG - Chr4:56175561-56175580 MsG0480021273.01.T01:CDS 30.0%
!!! TGGAAAAAAGGTTTTGTTGA+GGG - Chr4:56175528-56175547 MsG0480021273.01.T01:CDS 30.0%
AAAAGCCTCAAAGATTCCAA+AGG + Chr4:56175493-56175512 None:intergenic 35.0%
AACACTTGAGACTTTCAATG+AGG - Chr4:56175270-56175289 MsG0480021273.01.T01:CDS 35.0%
AACAGAGCCATTACTCTTAT+CGG - Chr4:56174827-56174846 MsG0480021273.01.T01:CDS 35.0%
ACATGAACCGATAAGAGTAA+TGG + Chr4:56174837-56174856 None:intergenic 35.0%
ACTTCTTCACCTATTTCATC+AGG + Chr4:56175304-56175323 None:intergenic 35.0%
CATTGAAAGTCTCAAGTGTT+AGG + Chr4:56175270-56175289 None:intergenic 35.0%
CTGACATGTGGATCATAAAA+AGG + Chr4:56175085-56175104 None:intergenic 35.0%
GTGTTTCGATGATTTACCTT+TGG - Chr4:56175474-56175493 MsG0480021273.01.T01:CDS 35.0%
GTTTGGGTGATGAAAGAATA+TGG - Chr4:56175409-56175428 MsG0480021273.01.T01:CDS 35.0%
TCAGCTTGAAAACAAACTCA+TGG - Chr4:56175110-56175129 MsG0480021273.01.T01:CDS 35.0%
TTCGGTTTCGATCAATTAAC+CGG - Chr4:56175013-56175032 MsG0480021273.01.T01:CDS 35.0%
! ATGGATTAAGGATCGATTGA+GGG + Chr4:56174699-56174718 None:intergenic 35.0%
! TAGATGCTGAGAATCTGTTT+TGG - Chr4:56175551-56175570 MsG0480021273.01.T01:CDS 35.0%
!! AAAAGCATCATCGATGTGTT+TGG + Chr4:56174773-56174792 None:intergenic 35.0%
!! ACTCTTATCGGTTCATGTAA+CGG - Chr4:56174839-56174858 MsG0480021273.01.T01:CDS 35.0%
!!! CTTTTAGGTTATTCGAGTGA+TGG - Chr4:56175508-56175527 MsG0480021273.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTGGAATCTTTGAGGCTTTT+AGG - Chr4:56175493-56175512 MsG0480021273.01.T01:CDS 35.0%
AAGTGATTCTACAGGTAAGC+GGG + Chr4:56174597-56174616 None:intergenic 40.0%
AATCGGAGAAGTGATTCTAC+AGG + Chr4:56174605-56174624 None:intergenic 40.0%
AGAATCCTACAAGCGAGAAA+AGG - Chr4:56175695-56175714 MsG0480021273.01.T01:CDS 40.0%
AGAATGTTAGGGATTGGAAG+AGG + Chr4:56174950-56174969 None:intergenic 40.0%
AGGGATAATCCGATGTTTAC+GGG + Chr4:56174921-56174940 None:intergenic 40.0%
AGGTAAGCGGGAGAAAATTT+CGG + Chr4:56174585-56174604 None:intergenic 40.0%
ATCGATTGAGGGAATTTCTG+AGG + Chr4:56174688-56174707 None:intergenic 40.0%
ATGACCAAGAAGAAACTTGG+TGG - Chr4:56175214-56175233 MsG0480021273.01.T01:CDS 40.0%
CGATTATCAACAGGGAAGTA+AGG + Chr4:56175664-56175683 None:intergenic 40.0%
GAAGTGATTCTACAGGTAAG+CGG + Chr4:56174598-56174617 None:intergenic 40.0%
GAATGTTAGGGATTGGAAGA+GGG + Chr4:56174949-56174968 None:intergenic 40.0%
GAGGGATAATCCGATGTTTA+CGG + Chr4:56174922-56174941 None:intergenic 40.0%
GTTCCTCTTCCTGATGAAAT+AGG - Chr4:56175292-56175311 MsG0480021273.01.T01:CDS 40.0%
TAACCCACCAAGTTTCTTCT+TGG + Chr4:56175221-56175240 None:intergenic 40.0%
TCACCTATTTCATCAGGAAG+AGG + Chr4:56175298-56175317 None:intergenic 40.0%
TGACCAAGAAGAAACTTGGT+GGG - Chr4:56175215-56175234 MsG0480021273.01.T01:CDS 40.0%
TTATCAACAGGGAAGTAAGG+TGG + Chr4:56175661-56175680 None:intergenic 40.0%
!! GATGGATTAAGGATCGATTG+AGG + Chr4:56174700-56174719 None:intergenic 40.0%
!! TGTCAGGTTGGAGAATGTTA+GGG + Chr4:56174961-56174980 None:intergenic 40.0%
!! TTGTCAGGTTGGAGAATGTT+AGG + Chr4:56174962-56174981 None:intergenic 40.0%
!!! GAAGTTCGTGTTGCTGTTTT+AGG - Chr4:56175340-56175359 MsG0480021273.01.T01:CDS 40.0%
!!! TTCGTGTTGCTGTTTTAGGA+GGG - Chr4:56175344-56175363 MsG0480021273.01.T01:CDS 40.0%
AAGCTGAAGAGACTGACATG+TGG + Chr4:56175097-56175116 None:intergenic 45.0%
ACCCTTACACCCGTAAACAT+CGG - Chr4:56174909-56174928 MsG0480021273.01.T01:CDS 45.0%
ATCCGATGTTTACGGGTGTA+AGG + Chr4:56174914-56174933 None:intergenic 45.0%
ATTTCGGTGAGAATTTCCGG+TGG + Chr4:56174569-56174588 None:intergenic 45.0%
GGTTGGAGAATGTTAGGGAT+TGG + Chr4:56174956-56174975 None:intergenic 45.0%
TCCGATGTTTACGGGTGTAA+GGG + Chr4:56174913-56174932 None:intergenic 45.0%
TGATTTCGTTCATTACGCCG+TGG + Chr4:56174880-56174899 None:intergenic 45.0%
TGCTTATGTGTTCACGGCTT+CGG - Chr4:56174995-56175014 MsG0480021273.01.T01:CDS 45.0%
! AGGGTGTCTTTGTATGACTG+TGG - Chr4:56175363-56175382 MsG0480021273.01.T01:CDS 45.0%
! CGTGACGCTATGATTTGTGT+TGG - Chr4:56175625-56175644 MsG0480021273.01.T01:CDS 45.0%
! GAGTACCTTTTCTCGCTTGT+AGG + Chr4:56175703-56175722 None:intergenic 45.0%
!!! GTTCGTGTTGCTGTTTTAGG+AGG - Chr4:56175343-56175362 MsG0480021273.01.T01:CDS 45.0%
ACACATAAGCAGCGACGGTT+AGG + Chr4:56174986-56175005 None:intergenic 50.0%
CACATAAGCAGCGACGGTTA+GGG + Chr4:56174985-56175004 None:intergenic 50.0%
CGTCGCTGCTTATGTGTTCA+CGG - Chr4:56174989-56175008 MsG0480021273.01.T01:CDS 50.0%
CGTGAACACATAAGCAGCGA+CGG + Chr4:56174991-56175010 None:intergenic 50.0%
GGATTGGAAGAGGGAGAAGA+GGG + Chr4:56174940-56174959 None:intergenic 50.0%
GTTCATTACGCCGTGGTACA+TGG + Chr4:56174873-56174892 None:intergenic 50.0%
TACCCTTGAAGCCGGTGAAA+GGG + Chr4:56174808-56174827 None:intergenic 50.0%
TGAAGATCGTACGGCATAGC+AGG + Chr4:56175145-56175164 None:intergenic 50.0%
TTACCCTTGAAGCCGGTGAA+AGG + Chr4:56174809-56174828 None:intergenic 50.0%
CCACTCAACCACCCTTTCAC+CGG - Chr4:56174794-56174813 MsG0480021273.01.T01:CDS 55.0%
GACGGTTAGGGTTGTCAGGT+TGG + Chr4:56174973-56174992 None:intergenic 55.0%
GGCTCTGTTACCCTTGAAGC+CGG + Chr4:56174816-56174835 None:intergenic 55.0%
GGGATTGGAAGAGGGAGAAG+AGG + Chr4:56174941-56174960 None:intergenic 55.0%
!! CACCCTTTCACCGGCTTCAA+GGG - Chr4:56174803-56174822 MsG0480021273.01.T01:CDS 55.0%
CAGCGACGGTTAGGGTTGTC+AGG + Chr4:56174977-56174996 None:intergenic 60.0%
CCGGTGAAAGGGTGGTTGAG+TGG + Chr4:56174797-56174816 None:intergenic 60.0%
CCTTGAAGCCGGTGAAAGGG+TGG + Chr4:56174805-56174824 None:intergenic 60.0%
TTACGCCGTGGTACATGGCG+AGG + Chr4:56174868-56174887 None:intergenic 60.0%
!! CCACCCTTTCACCGGCTTCA+AGG - Chr4:56174802-56174821 MsG0480021273.01.T01:CDS 60.0%
GGCCTCCTCGCCATGTACCA+CGG - Chr4:56174860-56174879 MsG0480021273.01.T01:CDS 65.0%
CGCCGTGGTACATGGCGAGG+AGG + Chr4:56174865-56174884 None:intergenic 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 56174551 56175738 56174551 ID=MsG0480021273.01;Name=MsG0480021273.01
Chr4 mRNA 56174551 56175738 56174551 ID=MsG0480021273.01.T01;Parent=MsG0480021273.01;Name=MsG0480021273.01.T01;_AED=0.48;_eAED=0.48;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|395
Chr4 exon 56174551 56175738 56174551 ID=MsG0480021273.01.T01:exon:6865;Parent=MsG0480021273.01.T01
Chr4 CDS 56174551 56175738 56174551 ID=MsG0480021273.01.T01:cds;Parent=MsG0480021273.01.T01
Gene Sequence

>MsG0480021273.01.T01

ATGGTGGCTGAACTTCCACCGGAAATTCTCACCGAAATTTTCTCCCGCTTACCTGTAGAATCACTTCTCCGATTCCGATCAACTTCAAAATCACTTAAATTCTTAATCGATTCCTACAAATTCATCAATCTTCACCTCAGAAATTCCCTCAATCGATCCTTAATCCATCGAATCAATTTCGAAATCTACCAAATTGAAATTGATGATGATTTCTCTGATCCAAACACATCGATGATGCTTTTTCCACTCAACCACCCTTTCACCGGCTTCAAGGGTAACAGAGCCATTACTCTTATCGGTTCATGTAACGGCCTCCTCGCCATGTACCACGGCGTAATGAACGAAATCACAATCTGGAACCCTTACACCCGTAAACATCGGATTATCCCTCTTCTCCCTCTTCCAATCCCTAACATTCTCCAACCTGACAACCCTAACCGTCGCTGCTTATGTGTTCACGGCTTCGGTTTCGATCAATTAACCGGTGATTACAAACTACTTAGAATCTCTCACTTGCTCGATCTACAAAACCCTTTTTATGATCCACATGTCAGTCTCTTCAGCTTGAAAACAAACTCATGGAAGATAATTCCTGCTATGCCGTACGATCTTCAACATTTATACGATTTGGGGGTTTTTGTTGAGAATTCTATTCACTGGATTATGACCAAGAAGAAACTTGGTGGGTTACATCCTTCTTTAATTGTCGCGTTTAACCTAACACTTGAGACTTTCAATGAGGTTCCTCTTCCTGATGAAATAGGTGAAGAAGTTAATGGTAAGAGTTTTGAAGTTCGTGTTGCTGTTTTAGGAGGGTGTCTTTGTATGACTGTGGATTATAAAGATACTAAAATTGATGTTTGGGTGATGAAAGAATATGGATGTAGAGATAGTTGGTGTAAACTTTTTACTGTGGTTCAATCGTGTTTCGATGATTTACCTTTGGAATCTTTGAGGCTTTTAGGTTATTCGAGTGATGGAAAAAAGGTTTTGTTGAGGGTAGATGCTGAGAATCTGTTTTGGTATGATTTGGAGAGTAAACAAGTTAGTTATGTTCAAGAAATTCGTAATTTGCGTGACGCTATGATTTGTGTTGGAAGTCTTGTACCACCTTACTTCCCTGTTGATAATCGTAGTAAGAAGGAGAATCCTACAAGCGAGAAAAGGTACTCCTTATTGTTTAACTGA
Protein sequence

>MsG0480021273.01.T01

MVAELPPEILTEIFSRLPVESLLRFRSTSKSLKFLIDSYKFINLHLRNSLNRSLIHRINFEIYQIEIDDDFSDPNTSMMLFPLNHPFTGFKGNRAITLIGSCNGLLAMYHGVMNEITIWNPYTRKHRIIPLLPLPIPNILQPDNPNRRCLCVHGFGFDQLTGDYKLLRISHLLDLQNPFYDPHVSLFSLKTNSWKIIPAMPYDLQHLYDLGVFVENSIHWIMTKKKLGGLHPSLIVAFNLTLETFNEVPLPDEIGEEVNGKSFEVRVAVLGGCLCMTVDYKDTKIDVWVMKEYGCRDSWCKLFTVVQSCFDDLPLESLRLLGYSSDGKKVLLRVDAENLFWYDLESKQVSYVQEIRNLRDAMICVGSLVPPYFPVDNRSKKENPTSEKRYSLLFN*