AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780038157.01


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MsG0780038157.01.T01 AT1G60410 36.041 197 106 7 41 231 10 192 2.43e-16 79.7
MsG0780038157.01.T01 AT4G00315 35.354 198 108 6 41 231 2 186 2.44e-16 80.1
MsG0780038157.01.T01 AT3G58930 31.950 241 135 9 41 268 2 226 2.55e-16 80.1
MsG0780038157.01.T01 AT3G58930 31.950 241 135 9 41 268 2 226 2.55e-16 80.1
MsG0780038157.01.T01 AT3G58930 31.950 241 135 9 41 268 2 226 2.55e-16 80.1
MsG0780038157.01.T01 AT5G38392 31.364 220 131 8 41 250 2 211 2.91e-16 77.0
MsG0780038157.01.T01 AT1G55660 34.804 204 101 8 41 231 53 237 3.02e-16 79.7
MsG0780038157.01.T01 AT1G55660 34.328 201 106 7 41 231 53 237 3.20e-16 79.0
MsG0780038157.01.T01 AT4G26350 33.168 202 104 6 41 232 2 182 3.72e-16 79.3
MsG0780038157.01.T01 AT5G38390 36.538 208 103 8 41 242 2 186 3.78e-16 79.3
MsG0780038157.01.T01 AT5G62970 28.492 358 174 13 48 334 10 356 4.10e-16 79.3
MsG0780038157.01.T01 AT2G26860 27.247 356 166 11 41 330 2 330 4.84e-16 79.0
MsG0780038157.01.T01 AT2G26860 27.247 356 166 11 41 330 2 330 4.84e-16 79.0
MsG0780038157.01.T01 AT1G66300 29.493 217 127 7 22 231 9 206 4.90e-16 79.0
MsG0780038157.01.T01 AT5G22660 30.732 205 108 6 37 231 9 189 6.10e-16 77.8
MsG0780038157.01.T01 AT5G53840 30.804 224 119 7 43 257 20 216 8.31e-16 78.6
MsG0780038157.01.T01 AT5G22660 30.732 205 108 6 37 231 9 189 1.05e-15 78.2
MsG0780038157.01.T01 AT5G56440 27.985 268 159 9 41 295 2 248 1.11e-15 77.8
MsG0780038157.01.T01 AT3G49150 32.020 203 119 7 41 236 16 206 1.43e-15 77.8
MsG0780038157.01.T01 AT3G26922 32.850 207 123 5 41 245 14 206 1.97e-15 76.3
MsG0780038157.01.T01 AT3G26922 32.850 207 123 5 41 245 14 206 1.97e-15 76.3
MsG0780038157.01.T01 AT5G41630 35.149 202 112 8 41 231 12 205 2.55e-15 77.0
MsG0780038157.01.T01 AT5G56410 33.990 203 104 8 48 231 10 201 3.20e-15 76.6
MsG0780038157.01.T01 AT5G27750 28.745 247 142 7 39 268 3 232 3.80e-15 76.6
MsG0780038157.01.T01 AT5G27750 28.745 247 142 7 39 268 3 232 3.88e-15 75.9
MsG0780038157.01.T01 AT3G58960 28.986 207 121 6 41 238 2 191 6.37e-15 75.9
MsG0780038157.01.T01 AT1G55030 32.161 199 104 7 41 231 19 194 8.94e-15 75.1
MsG0780038157.01.T01 AT1G55030 32.161 199 104 7 41 231 9 184 9.48e-15 75.1
MsG0780038157.01.T01 AT1G32375 26.239 343 184 13 41 330 2 328 9.57e-15 75.1
MsG0780038157.01.T01 AT1G32375 26.239 343 184 13 41 330 2 328 9.57e-15 75.1
MsG0780038157.01.T01 AT3G58920 28.502 207 132 5 41 238 2 201 1.01e-14 75.1
MsG0780038157.01.T01 AT4G15060 31.224 237 138 8 38 266 169 388 1.11e-14 75.1
MsG0780038157.01.T01 AT3G44810 36.269 193 108 6 46 231 12 196 1.13e-14 75.1
MsG0780038157.01.T01 AT1G48400 33.184 223 132 7 41 257 10 221 1.24e-14 75.1
MsG0780038157.01.T01 AT4G15060 30.315 254 148 9 25 266 6 242 1.28e-14 74.7
MsG0780038157.01.T01 AT1G48400 33.184 223 132 7 41 257 10 221 1.35e-14 75.1
MsG0780038157.01.T01 AT3G62440 29.756 205 136 4 41 238 2 205 1.48e-14 74.7
MsG0780038157.01.T01 AT2G29910 30.653 199 112 7 39 231 27 205 4.43e-14 72.8
MsG0780038157.01.T01 AT2G29910 30.808 198 111 7 39 230 3 180 4.82e-14 72.4
MsG0780038157.01.T01 AT2G29910 30.808 198 111 7 39 230 3 180 4.82e-14 72.4
MsG0780038157.01.T01 AT2G29910 30.653 199 112 7 39 231 3 181 4.95e-14 72.4
MsG0780038157.01.T01 AT2G29910 30.653 199 112 7 39 231 3 181 4.95e-14 72.4
MsG0780038157.01.T01 AT2G29910 30.653 199 112 7 39 231 3 181 4.95e-14 72.4
MsG0780038157.01.T01 AT2G29910 30.653 199 112 7 39 231 3 181 4.95e-14 72.4
MsG0780038157.01.T01 AT3G58900 36.548 197 109 8 41 231 2 188 6.14e-14 72.0
MsG0780038157.01.T01 AT3G58900 36.548 197 109 8 41 231 2 188 6.23e-14 72.8
MsG0780038157.01.T01 AT3G58900 36.548 197 109 8 41 231 2 188 6.81e-14 72.0
MsG0780038157.01.T01 AT3G58900 36.548 197 109 8 41 231 2 188 6.81e-14 72.0
MsG0780038157.01.T01 AT3G51530 29.023 348 165 16 39 330 28 349 7.11e-14 72.8
MsG0780038157.01.T01 AT5G44960 27.353 340 183 13 41 331 5 329 7.47e-14 72.4
MsG0780038157.01.T01 AT5G02920 29.464 224 128 8 37 257 24 220 1.03e-13 70.5
MsG0780038157.01.T01 AT5G56820 26.377 345 191 13 30 332 4 327 1.27e-13 71.6
MsG0780038157.01.T01 AT5G25860 24.798 371 185 14 39 330 10 365 1.83e-13 71.2
MsG0780038157.01.T01 AT4G13960 32.057 209 122 9 41 242 2 197 2.40e-13 70.9
MsG0780038157.01.T01 AT4G13960 32.057 209 122 9 41 242 2 197 2.40e-13 70.9
MsG0780038157.01.T01 AT1G66300 24.405 336 203 13 22 328 9 322 2.83e-13 70.5
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MsG0780038157.01.T01 AT5G35995 33.659 205 100 9 39 231 3 183 3.93e-13 70.5
MsG0780038157.01.T01 AT5G35995 33.659 205 100 9 39 231 3 183 3.93e-13 70.5
MsG0780038157.01.T01 AT4G27050 30.769 208 117 7 41 231 4 201 4.10e-13 70.5
MsG0780038157.01.T01 AT4G27050 30.769 208 117 7 41 231 4 201 4.10e-13 70.5
MsG0780038157.01.T01 AT4G27050 30.769 208 117 7 41 231 4 201 4.10e-13 70.5
MsG0780038157.01.T01 AT4G27050 30.769 208 117 7 41 231 4 201 4.10e-13 70.5
MsG0780038157.01.T01 AT4G27050 30.769 208 117 7 41 231 4 201 4.10e-13 70.5
MsG0780038157.01.T01 AT5G38386 28.165 316 184 11 41 331 2 299 4.25e-13 70.1
MsG0780038157.01.T01 AT5G38386 28.165 316 184 11 41 331 2 299 4.25e-13 70.1
MsG0780038157.01.T01 AT1G60400 32.323 198 111 7 41 231 14 195 1.05e-12 68.9
MsG0780038157.01.T01 AT5G44980 36.923 195 109 8 41 232 4 187 1.18e-12 68.2
MsG0780038157.01.T01 AT5G44980 36.923 195 109 8 41 232 4 187 1.18e-12 68.2
MsG0780038157.01.T01 AT3G26930 26.050 357 189 10 28 331 8 342 1.25e-12 68.9
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MsG0780038157.01.T01 AT2G42720 32.365 241 138 11 41 274 2 224 1.40e-12 68.6
MsG0780038157.01.T01 AT5G44980 36.923 195 109 8 41 232 4 187 1.87e-12 68.2
MsG0780038157.01.T01 AT5G44980 36.923 195 109 8 41 232 4 187 1.87e-12 68.2
MsG0780038157.01.T01 AT3G44080 27.273 308 182 8 46 333 12 297 3.74e-12 67.0
MsG0780038157.01.T01 AT1G21990 32.178 202 119 5 37 234 5 192 4.44e-12 67.0
MsG0780038157.01.T01 AT3G59000 33.516 182 102 8 41 212 2 174 4.51e-12 67.4
MsG0780038157.01.T01 AT1G49610 30.000 220 88 9 41 260 26 179 5.41e-12 66.6
MsG0780038157.01.T01 AT3G50710 31.658 199 113 6 41 231 2 185 5.53e-12 66.6
MsG0780038157.01.T01 AT3G49040 33.005 203 103 7 41 231 17 198 6.15e-12 65.9
MsG0780038157.01.T01 AT3G49030 29.730 222 108 8 32 234 12 204 9.39e-12 66.2
MsG0780038157.01.T01 AT3G14710 30.392 204 108 8 41 233 26 206 9.87e-12 66.2
MsG0780038157.01.T01 AT3G58980 28.365 208 122 6 41 238 2 192 1.34e-11 65.9
MsG0780038157.01.T01 AT3G49030 29.730 222 108 8 32 234 12 204 1.70e-11 65.5
MsG0780038157.01.T01 AT1G64540 31.472 197 102 9 41 231 5 174 2.71e-11 64.7
MsG0780038157.01.T01 AT1G64540 31.472 197 102 9 41 231 5 174 2.71e-11 64.7
MsG0780038157.01.T01 AT5G38396 28.856 201 125 6 41 231 2 194 3.65e-11 64.3
MsG0780038157.01.T01 AT3G58950 44.444 90 40 4 41 128 2 83 6.87e-11 63.5
MsG0780038157.01.T01 AT1G19070 55.102 49 22 0 41 89 2 50 8.09e-11 58.2
MsG0780038157.01.T01 AT3G59000 34.783 138 76 6 41 174 2 129 9.19e-11 62.8

Find 61 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 74 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTCACTCTATTGAATATAAT+TGG 0.097690 7:-41323795 MsG0780038157.01.T01:CDS
GATGAGGTTTGTTTAGTTTA+GGG 0.238025 7:-41323718 None:intergenic
GCATGTAAATCTTCTATAAT+TGG 0.241225 7:+41324178 None:intergenic
CCTCAAAATCCTTCATTTAG+AGG 0.252137 7:-41324251 MsG0780038157.01.T01:CDS
CGGCTCAAGGTTGGATATAA+TGG 0.263733 7:-41324478 MsG0780038157.01.T01:CDS
TAGATTCCATCAAGAGTTTC+CGG 0.269386 7:-41324498 MsG0780038157.01.T01:CDS
TGATGAGGTTTGTTTAGTTT+AGG 0.277254 7:-41323719 None:intergenic
TTGTGTAGAATTTCAATCTT+TGG 0.298484 7:-41324794 MsG0780038157.01.T01:CDS
GGATATAATGGTTCTGATCT+TGG 0.299116 7:-41324466 MsG0780038157.01.T01:CDS
CAAACTCGTTAAATCGATAA+AGG 0.299243 7:+41324542 None:intergenic
GATGCTTCCATCTCTTTGAT+AGG 0.362866 7:+41324650 None:intergenic
TAAAGATTTAGTATTGCTTC+TGG 0.365707 7:-41324209 MsG0780038157.01.T01:CDS
TTGGGAGAAAAGAAAGAATA+TGG 0.368420 7:+41324698 None:intergenic
TAAGCTTTCACACTCTGTAT+AGG 0.372771 7:+41324120 None:intergenic
TCACTCTATTGAATATAATT+GGG 0.397531 7:-41323794 MsG0780038157.01.T01:CDS
AGTCCCAGCCATTTGTGCTT+TGG 0.402657 7:+41324081 None:intergenic
GGGAACCGATGCCATTGAAT+TGG 0.407359 7:-41324578 MsG0780038157.01.T01:CDS
CTTGAGCCGGAAACTCTTGA+TGG 0.410637 7:+41324492 None:intergenic
ATAGAAGATTTACATGCATA+TGG 0.414753 7:-41324172 MsG0780038157.01.T01:CDS
GGTTCTGATCTTGGATACCT+TGG 0.433421 7:-41324457 MsG0780038157.01.T01:CDS
GCTAGTTGCAACAACCTGTT+TGG 0.441030 7:+41324675 None:intergenic
CAAGCTGACCAAAGCACAAA+TGG 0.445462 7:-41324089 MsG0780038157.01.T01:CDS
TTGCAACAACCTGTTTGGTT+GGG 0.447480 7:+41324680 None:intergenic
AATTTGATCATCCAATTCAA+TGG 0.449175 7:+41324567 None:intergenic
CATCGGTTCCCTGTACATCT+TGG 0.450502 7:+41324590 None:intergenic
GCTTTACTAGAGTAGCTGAT+TGG 0.460999 7:-41324435 MsG0780038157.01.T01:CDS
AAACTCGTTAAATCGATAAA+GGG 0.472087 7:+41324543 None:intergenic
AACTGACGACCAAGATGTAC+AGG 0.473218 7:-41324599 MsG0780038157.01.T01:CDS
GATTTAGTATTGCTTCTGGC+TGG 0.474719 7:-41324205 MsG0780038157.01.T01:CDS
CATCAAGAGTTTCCGGCTCA+AGG 0.477717 7:-41324491 MsG0780038157.01.T01:CDS
CAAAGAGATGGAAGCATCAC+TGG 0.477775 7:-41324645 MsG0780038157.01.T01:CDS
ACTGCAGATAGCAATAAATC+AGG 0.478776 7:-41324017 MsG0780038157.01.T01:intron
GTCGTCAGTTAAGTCGATAT+CGG 0.482952 7:+41324612 None:intergenic
ATCATCCAATTCAATGGCAT+CGG 0.486975 7:+41324573 None:intergenic
CTGACCAAAGCACAAATGGC+TGG 0.487407 7:-41324085 MsG0780038157.01.T01:CDS
GTTGCAACAACCTGTTTGGT+TGG 0.503865 7:+41324679 None:intergenic
TTGCAGTTCAAAATGCTAAC+GGG 0.505297 7:+41324340 None:intergenic
AAGAGTTTCCGGCTCAAGGT+TGG 0.512571 7:-41324487 MsG0780038157.01.T01:CDS
AGAAAGAATATGGCAGAGAA+TGG 0.524043 7:+41324708 None:intergenic
TCGTCAGTTAAGTCGATATC+GGG 0.532841 7:+41324613 None:intergenic
ATATGGCAGAGAATGGCATC+TGG 0.538490 7:+41324715 None:intergenic
ATGTACACTCCTCTAAATGA+AGG 0.538691 7:+41324242 None:intergenic
CATTATATCCAACCTTGAGC+CGG 0.539268 7:+41324479 None:intergenic
TTGATCATATTATGAAAGGT+AGG 0.556020 7:+41323826 None:intergenic
TCACATTAAATGAAAACAAG+TGG 0.556058 7:+41324302 None:intergenic
CTTGCAGTTCAAAATGCTAA+CGG 0.556212 7:+41324339 None:intergenic
CAACTTGATCATATTATGAA+AGG 0.557972 7:+41323822 None:intergenic
CTAGCGTCCTATCAAAGAGA+TGG 0.564675 7:-41324657 MsG0780038157.01.T01:CDS
GTTGAAAGCACTTCATAATG+TGG 0.565738 7:-41324044 MsG0780038157.01.T01:CDS
TGACCAAAGCACAAATGGCT+GGG 0.568186 7:-41324084 MsG0780038157.01.T01:CDS
TCAAAATCTTGAGCTTGATG+AGG 0.568869 7:-41323734 MsG0780038157.01.T01:CDS
CAGCTACTCTAGTAAAGCCA+AGG 0.597994 7:+41324440 None:intergenic
TTTGAACTGCAAGACCCTTG+TGG 0.603147 7:-41324329 MsG0780038157.01.T01:CDS
ACATTATGAAGTGCTTTCAA+CGG 0.609482 7:+41324046 None:intergenic
AAATGTCATCAAGAACAAGA+AGG 0.612253 7:-41324762 MsG0780038157.01.T01:CDS
CAACACCGCGTTGTACAACA+TGG 0.614275 7:+41324407 None:intergenic
AAAACAAGTGGAGCTCCACA+AGG 0.619768 7:+41324314 None:intergenic
AGGTTAGAGAGTCTTGAGAG+AGG 0.641818 7:+41324140 None:intergenic
CTCGACCATGTTGTACAACG+CGG 0.692449 7:-41324412 MsG0780038157.01.T01:CDS
ACTGACGACCAAGATGTACA+GGG 0.694193 7:-41324598 MsG0780038157.01.T01:CDS
AAACAAGTGGAGCTCCACAA+GGG 0.715533 7:+41324315 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ACGATATAGTATAAAAAATA+AGG + Chr7:41324680-41324699 None:intergenic 15.0%
!! TCACTCTATTGAATATAATT+GGG - Chr7:41324779-41324798 MsG0780038157.01.T01:CDS 20.0%
!! TTCACTCTATTGAATATAAT+TGG - Chr7:41324778-41324797 MsG0780038157.01.T01:CDS 20.0%
!!! CTATGTTGTTTACATTTTTT+AGG - Chr7:41324701-41324720 MsG0780038157.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTGTTTTCATTTAATGTGAA+GGG - Chr7:41324275-41324294 MsG0780038157.01.T01:CDS 20.0%
! AAACTCGTTAAATCGATAAA+GGG + Chr7:41324033-41324052 None:intergenic 25.0%
! AATTTGATCATCCAATTCAA+TGG + Chr7:41324009-41324028 None:intergenic 25.0%
! ATAGAAGATTTACATGCATA+TGG - Chr7:41324401-41324420 MsG0780038157.01.T01:CDS 25.0%
! CAACTTGATCATATTATGAA+AGG + Chr7:41324754-41324773 None:intergenic 25.0%
! GCATGTAAATCTTCTATAAT+TGG + Chr7:41324398-41324417 None:intergenic 25.0%
! TAAAGATTTAGTATTGCTTC+TGG - Chr7:41324364-41324383 MsG0780038157.01.T01:CDS 25.0%
! TCACATTAAATGAAAACAAG+TGG + Chr7:41324274-41324293 None:intergenic 25.0%
! TTGATCATATTATGAAAGGT+AGG + Chr7:41324750-41324769 None:intergenic 25.0%
! TTGTGTAGAATTTCAATCTT+TGG - Chr7:41323779-41323798 MsG0780038157.01.T01:CDS 25.0%
!!! CTTGTTTTCATTTAATGTGA+AGG - Chr7:41324274-41324293 MsG0780038157.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTGTTCTTGATGACATTTTA+GGG + Chr7:41323809-41323828 None:intergenic 25.0%
AAATGTCATCAAGAACAAGA+AGG - Chr7:41323811-41323830 MsG0780038157.01.T01:CDS 30.0%
AGATAGCAATAAATCAGGTT+TGG - Chr7:41324561-41324580 MsG0780038157.01.T01:CDS 30.0%
CAAACTCGTTAAATCGATAA+AGG + Chr7:41324034-41324053 None:intergenic 30.0%
TTGGGAGAAAAGAAAGAATA+TGG + Chr7:41323878-41323897 None:intergenic 30.0%
! ACATTATGAAGTGCTTTCAA+CGG + Chr7:41324530-41324549 None:intergenic 30.0%
! CTCTAAATGAAGGATTTTGA+GGG + Chr7:41324324-41324343 None:intergenic 30.0%
!! CTTGTTCTTGATGACATTTT+AGG + Chr7:41323810-41323829 None:intergenic 30.0%
ACTGCAGATAGCAATAAATC+AGG - Chr7:41324556-41324575 MsG0780038157.01.T01:CDS 35.0%
AGAAAGAATATGGCAGAGAA+TGG + Chr7:41323868-41323887 None:intergenic 35.0%
ATCATCCAATTCAATGGCAT+CGG + Chr7:41324003-41324022 None:intergenic 35.0%
ATGTACACTCCTCTAAATGA+AGG + Chr7:41324334-41324353 None:intergenic 35.0%
CCTCAAAATCCTTCATTTAG+AGG - Chr7:41324322-41324341 MsG0780038157.01.T01:CDS 35.0%
CTTGCAGTTCAAAATGCTAA+CGG + Chr7:41324237-41324256 None:intergenic 35.0%
TAAGCTTTCACACTCTGTAT+AGG + Chr7:41324456-41324475 None:intergenic 35.0%
TAGATTCCATCAAGAGTTTC+CGG - Chr7:41324075-41324094 MsG0780038157.01.T01:CDS 35.0%
TCAAAATCTTGAGCTTGATG+AGG - Chr7:41324839-41324858 MsG0780038157.01.T01:CDS 35.0%
TTGCAGTTCAAAATGCTAAC+GGG + Chr7:41324236-41324255 None:intergenic 35.0%
! CCTCTAAATGAAGGATTTTG+AGG + Chr7:41324325-41324344 None:intergenic 35.0%
!! AAATGAAGGATTTTGAGGGA+GGG + Chr7:41324320-41324339 None:intergenic 35.0%
!! GGATATAATGGTTCTGATCT+TGG - Chr7:41324107-41324126 MsG0780038157.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTGAAAGCACTTCATAATG+TGG - Chr7:41324529-41324548 MsG0780038157.01.T01:CDS 35.0%
!! TAAATGAAGGATTTTGAGGG+AGG + Chr7:41324321-41324340 None:intergenic 35.0%
!!! AGCTCAAGATTTTGAAGCTT+AGG + Chr7:41324834-41324853 None:intergenic 35.0%
!!! GCTCAAGATTTTGAAGCTTA+GGG + Chr7:41324833-41324852 None:intergenic 35.0%
CATTATATCCAACCTTGAGC+CGG + Chr7:41324097-41324116 None:intergenic 40.0%
GATGCTTCCATCTCTTTGAT+AGG + Chr7:41323926-41323945 None:intergenic 40.0%
GATTTAGTATTGCTTCTGGC+TGG - Chr7:41324368-41324387 MsG0780038157.01.T01:CDS 40.0%
GCTTTACTAGAGTAGCTGAT+TGG - Chr7:41324138-41324157 MsG0780038157.01.T01:CDS 40.0%
GTCGTCAGTTAAGTCGATAT+CGG + Chr7:41323964-41323983 None:intergenic 40.0%
TATGAACACACTGACAGTGA+TGG - Chr7:41324599-41324618 MsG0780038157.01.T01:CDS 40.0%
TCGTCAGTTAAGTCGATATC+GGG + Chr7:41323963-41323982 None:intergenic 40.0%
TTGCAACAACCTGTTTGGTT+GGG + Chr7:41323896-41323915 None:intergenic 40.0%
! TTCTTTTCTCCCAACCAAAC+AGG - Chr7:41323884-41323903 MsG0780038157.01.T01:intron 40.0%
AAAACAAGTGGAGCTCCACA+AGG + Chr7:41324262-41324281 None:intergenic 45.0%
AAACAAGTGGAGCTCCACAA+GGG + Chr7:41324261-41324280 None:intergenic 45.0%
AACTGACGACCAAGATGTAC+AGG - Chr7:41323974-41323993 MsG0780038157.01.T01:intron 45.0%
ACTGACGACCAAGATGTACA+GGG - Chr7:41323975-41323994 MsG0780038157.01.T01:intron 45.0%
AGGTTAGAGAGTCTTGAGAG+AGG + Chr7:41324436-41324455 None:intergenic 45.0%
ATATGGCAGAGAATGGCATC+TGG + Chr7:41323861-41323880 None:intergenic 45.0%
CAAGCTGACCAAAGCACAAA+TGG - Chr7:41324484-41324503 MsG0780038157.01.T01:CDS 45.0%
CAGCTACTCTAGTAAAGCCA+AGG + Chr7:41324136-41324155 None:intergenic 45.0%
CGGCTCAAGGTTGGATATAA+TGG - Chr7:41324095-41324114 MsG0780038157.01.T01:CDS 45.0%
CTAGCGTCCTATCAAAGAGA+TGG - Chr7:41323916-41323935 MsG0780038157.01.T01:intron 45.0%
GCTAGTTGCAACAACCTGTT+TGG + Chr7:41323901-41323920 None:intergenic 45.0%
GTTGCAACAACCTGTTTGGT+TGG + Chr7:41323897-41323916 None:intergenic 45.0%
TGACCAAAGCACAAATGGCT+GGG - Chr7:41324489-41324508 MsG0780038157.01.T01:CDS 45.0%
TTTGAACTGCAAGACCCTTG+TGG - Chr7:41324244-41324263 MsG0780038157.01.T01:CDS 45.0%
! GGTTCTGATCTTGGATACCT+TGG - Chr7:41324116-41324135 MsG0780038157.01.T01:CDS 45.0%
!! CAAAGAGATGGAAGCATCAC+TGG - Chr7:41323928-41323947 MsG0780038157.01.T01:intron 45.0%
AAGAGTTTCCGGCTCAAGGT+TGG - Chr7:41324086-41324105 MsG0780038157.01.T01:CDS 50.0%
AGTCCCAGCCATTTGTGCTT+TGG + Chr7:41324495-41324514 None:intergenic 50.0%
CAACACCGCGTTGTACAACA+TGG + Chr7:41324169-41324188 None:intergenic 50.0%
CATCAAGAGTTTCCGGCTCA+AGG - Chr7:41324082-41324101 MsG0780038157.01.T01:CDS 50.0%
CTCGACCATGTTGTACAACG+CGG - Chr7:41324161-41324180 MsG0780038157.01.T01:CDS 50.0%
CTGACCAAAGCACAAATGGC+TGG - Chr7:41324488-41324507 MsG0780038157.01.T01:CDS 50.0%
CTTGAGCCGGAAACTCTTGA+TGG + Chr7:41324084-41324103 None:intergenic 50.0%
GGGAACCGATGCCATTGAAT+TGG - Chr7:41323995-41324014 MsG0780038157.01.T01:intron 50.0%
!! CATCGGTTCCCTGTACATCT+TGG + Chr7:41323986-41324005 None:intergenic 50.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 41323720 41324875 41323720 ID=MsG0780038157.01;Name=MsG0780038157.01
Chr7 mRNA 41323720 41324875 41323720 ID=MsG0780038157.01.T01;Parent=MsG0780038157.01;Name=MsG0780038157.01.T01;_AED=0.32;_eAED=0.32;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|336
Chr7 exon 41324018 41324875 41324018 ID=MsG0780038157.01.T01:exon:15449;Parent=MsG0780038157.01.T01
Chr7 exon 41323720 41323872 41323720 ID=MsG0780038157.01.T01:exon:15448;Parent=MsG0780038157.01.T01
Chr7 CDS 41324018 41324875 41324018 ID=MsG0780038157.01.T01:cds;Parent=MsG0780038157.01.T01
Chr7 CDS 41323720 41323872 41323720 ID=MsG0780038157.01.T01:cds;Parent=MsG0780038157.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780038157.01.T01

ATGATTATGCATCAGCAGTCTTGTTTTTATTTTATTTTATTTGAAACTTTGCATTTTTGTTGTGTAGAATTTCAATCTTTGGTACACCCTAAAATGTCATCAAGAACAAGAAGGAGTTATGATGTCATCAGTAATTTACCAGATGCCATTCTCTGCCATATTCTTTCTTTTCTCCCAACCAAACAGGTTGTTGCAACTAGCGTCCTATCAAAGAGATGGAAGCATCACTGGCGCTCAGTTCCCGATATCGACTTAACTGACGACCAAGATGTACAGGGAACCGATGCCATTGAATTGGATGATCAAATTACCCTTTATCGATTTAACGAGTTTGTGTACTCTGTTTTGCTCAAGCTAGATTCCATCAAGAGTTTCCGGCTCAAGGTTGGATATAATGGTTCTGATCTTGGATACCTTGGCTTTACTAGAGTAGCTGATTGGCTCGACCATGTTGTACAACGCGGTGTTGAGAGAATTCTTCTCACTCTTTTCTTTAGCGTTGATATGAAATTGCCCGTTAGCATTTTGAACTGCAAGACCCTTGTGGAGCTCCACTTGTTTTCATTTAATGTGAAGGGTTTTTCTTCTGTTAGACTTCCCTCCCTCAAAATCCTTCATTTAGAGGAGTGTACATTTCTAAATGCTAAAGATTTAGTATTGCTTCTGGCTGGATGTCCAATTATAGAAGATTTACATGCATATGGTATAGAGTTCCTCTCTCAAGACTCTCTAACCTATACAGAGTGTGAAAGCTTAAGCTTAAGCAAGCTGACCAAAGCACAAATGGCTGGGACTTATTGTCATTTTCCGTTGAAAGCACTTCATAATGTGGAGAAACTGCAGATAGCAATAAATCAGGTGTATCGAAATTTTGATGAGATTCCTACCTTTCATAATATGATCAAGTTGAGACTTCACTCTATTGAATATAATTGGGATTTGTTAGTGCAAGTGCTCGATCATTGCCCTAAGCTTCAAAATCTTGAGCTTGATGAGGTTTGTTTAGTTTAG

Protein sequence

>MsG0780038157.01.T01

MIMHQQSCFYFILFETLHFCCVEFQSLVHPKMSSRTRRSYDVISNLPDAILCHILSFLPTKQVVATSVLSKRWKHHWRSVPDIDLTDDQDVQGTDAIELDDQITLYRFNEFVYSVLLKLDSIKSFRLKVGYNGSDLGYLGFTRVADWLDHVVQRGVERILLTLFFSVDMKLPVSILNCKTLVELHLFSFNVKGFSSVRLPSLKILHLEECTFLNAKDLVLLLAGCPIIEDLHAYGIEFLSQDSLTYTECESLSLSKLTKAQMAGTYCHFPLKALHNVEKLQIAINQVYRNFDEIPTFHNMIKLRLHSIEYNWDLLVQVLDHCPKLQNLELDEVCLV*