AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880047720.01


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MsG0880047720.01.T01 AT1G33720 30.029 343 198 12 82 391 4 337 1.81e-34 132
MsG0880047720.01.T01 AT1G28430 32.420 219 131 4 178 391 240 446 3.69e-34 133
MsG0880047720.01.T01 AT3G44250 33.951 324 186 10 82 391 125 434 3.80e-34 133
MsG0880047720.01.T01 AT5G10600 30.247 324 191 10 82 391 144 446 5.74e-34 132
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MsG0880047720.01.T01 AT3G20080 29.956 227 146 3 168 391 96 312 8.86e-34 130
MsG0880047720.01.T01 AT3G20080 29.956 227 146 3 168 391 96 312 8.86e-34 130
MsG0880047720.01.T01 AT4G15380 26.220 328 213 7 67 391 143 444 1.65e-33 131
MsG0880047720.01.T01 AT3G20080 25.402 311 213 5 68 371 128 426 2.62e-33 130
MsG0880047720.01.T01 AT3G20080 25.402 311 213 5 68 371 128 426 2.62e-33 130
MsG0880047720.01.T01 AT1G74540 26.682 431 228 9 37 403 27 433 3.31e-33 130
MsG0880047720.01.T01 AT3G20935 33.668 199 120 4 185 371 53 251 1.40e-32 126
MsG0880047720.01.T01 AT2G45580 28.657 335 208 8 73 391 126 445 9.04e-32 126
MsG0880047720.01.T01 AT1G66540 29.020 255 160 7 122 371 5 243 9.77e-32 123
MsG0880047720.01.T01 AT4G31970 24.839 467 254 15 5 391 7 456 1.00e-31 126
MsG0880047720.01.T01 AT2G45580 36.723 177 99 3 215 391 128 291 4.45e-31 122
MsG0880047720.01.T01 AT2G25160 34.404 218 127 7 180 391 245 452 8.81e-31 124
MsG0880047720.01.T01 AT3G25180 28.882 322 206 8 81 391 137 446 9.59e-31 123
MsG0880047720.01.T01 AT3G53280 31.288 326 191 12 82 391 125 433 1.83e-30 122
MsG0880047720.01.T01 AT2G23190 26.769 325 203 10 68 378 163 466 8.42e-30 121
MsG0880047720.01.T01 AT5G09970 28.013 307 194 6 81 373 165 458 3.27e-29 119
MsG0880047720.01.T01 AT1G74110 26.923 338 201 10 81 391 160 478 1.31e-26 112
MsG0880047720.01.T01 AT3G61040 27.957 279 177 7 73 342 121 384 5.96e-26 108
MsG0880047720.01.T01 AT2G46660 26.748 329 197 11 81 391 166 468 7.09e-26 109
MsG0880047720.01.T01 AT5G04630 26.113 337 220 12 68 391 127 447 1.41e-24 105
MsG0880047720.01.T01 AT3G10570 25.074 339 220 12 68 391 132 451 3.89e-23 101
MsG0880047720.01.T01 AT1G01190 32.240 183 103 4 191 371 290 453 5.43e-23 101
MsG0880047720.01.T01 AT1G01190 31.053 190 110 4 184 371 278 448 6.36e-23 101
MsG0880047720.01.T01 AT1G11600 25.522 431 229 16 37 391 35 449 6.78e-23 100
MsG0880047720.01.T01 AT2G22330 22.851 442 254 13 3 369 22 451 9.49e-23 100
MsG0880047720.01.T01 AT2G22330 22.851 442 254 13 3 369 45 474 1.45e-22 100
MsG0880047720.01.T01 AT3G10560 25.074 339 217 12 68 391 135 451 2.70e-22 99.4
MsG0880047720.01.T01 AT3G61880 28.899 218 132 6 180 391 268 468 2.78e-22 99.4
MsG0880047720.01.T01 AT3G61880 29.897 194 119 4 180 371 268 446 6.05e-22 98.2
MsG0880047720.01.T01 AT1G13710 25.076 327 212 10 81 391 144 453 6.13e-22 98.2
MsG0880047720.01.T01 AT5G04660 25.000 340 220 11 68 391 130 450 8.09e-22 97.8
MsG0880047720.01.T01 AT2G30490 31.250 176 107 3 217 391 279 441 1.37e-21 97.1
MsG0880047720.01.T01 AT1G64940 26.006 323 212 10 85 391 137 448 2.41e-21 96.3
MsG0880047720.01.T01 AT1G16400 24.169 331 233 8 52 369 116 441 2.52e-21 96.3
MsG0880047720.01.T01 AT2G12190 26.543 324 211 10 85 391 136 449 3.08e-21 95.9
MsG0880047720.01.T01 AT2G25160 36.242 149 82 5 180 325 245 383 3.56e-21 95.1
MsG0880047720.01.T01 AT1G64930 33.149 181 108 6 214 391 278 448 3.87e-21 95.9
MsG0880047720.01.T01 AT4G39950 23.907 343 226 9 51 369 158 489 9.12e-21 94.7
MsG0880047720.01.T01 AT4G39950 23.907 343 226 9 51 369 118 449 1.01e-20 94.7
MsG0880047720.01.T01 AT1G16410 24.834 302 211 7 81 369 144 442 1.10e-20 94.4
MsG0880047720.01.T01 AT2G45580 27.018 285 179 7 73 341 126 397 1.23e-20 93.6
MsG0880047720.01.T01 AT1G58260 25.291 344 213 13 54 371 110 435 6.97e-20 92.0
MsG0880047720.01.T01 AT1G64950 25.697 323 213 10 85 391 136 447 9.74e-20 91.7
MsG0880047720.01.T01 AT3G53290 29.231 325 180 11 81 391 54 342 5.21e-19 88.6
MsG0880047720.01.T01 AT1G79370 24.765 319 203 9 81 369 139 450 1.55e-18 87.8
MsG0880047720.01.T01 AT5G61320 26.488 336 207 13 68 391 120 427 4.08e-18 86.7
MsG0880047720.01.T01 AT5G05260 24.051 316 197 10 81 369 140 439 1.28e-17 85.1
MsG0880047720.01.T01 AT3G03470 28.968 252 158 8 163 403 219 460 2.23e-17 84.3
MsG0880047720.01.T01 AT1G31800 35.000 140 86 3 254 391 374 510 3.09e-17 84.0
MsG0880047720.01.T01 AT5G05260 32.075 159 95 4 214 369 259 407 3.42e-17 83.6
MsG0880047720.01.T01 AT3G53130 30.822 146 98 3 254 397 344 488 1.98e-16 81.6
MsG0880047720.01.T01 AT1G16410 24.088 274 192 7 81 341 144 414 2.57e-16 80.9
MsG0880047720.01.T01 AT5G25900 27.016 248 160 10 146 391 220 448 8.73e-16 79.3
MsG0880047720.01.T01 AT3G25180 24.727 275 186 6 81 344 137 401 6.32e-15 76.3
MsG0880047720.01.T01 AT5G38450 25.256 293 207 6 89 376 163 448 3.45e-14 74.7
MsG0880047720.01.T01 AT1G64900 25.072 347 216 12 68 391 118 443 3.89e-14 74.3
MsG0880047720.01.T01 AT5G24910 24.809 262 184 9 134 391 222 474 4.08e-14 74.3
MsG0880047720.01.T01 AT3G14680 22.015 268 189 8 128 391 203 454 5.53e-14 73.9
MsG0880047720.01.T01 AT3G14630 24.490 294 196 11 104 391 177 450 7.25e-14 73.6
MsG0880047720.01.T01 AT3G14630 24.490 294 196 11 104 391 232 505 1.23e-13 72.8
MsG0880047720.01.T01 AT3G14640 22.945 292 205 8 104 391 181 456 8.08e-13 70.5
MsG0880047720.01.T01 AT3G14640 22.945 292 205 8 104 391 203 478 1.06e-12 70.1
MsG0880047720.01.T01 AT3G14610 21.147 279 199 7 118 391 192 454 4.43e-12 68.2
MsG0880047720.01.T01 AT2G26170 25.926 216 139 7 178 391 182 378 5.04e-12 67.8
MsG0880047720.01.T01 AT2G26170 25.926 216 139 7 178 391 265 461 5.68e-12 67.8
MsG0880047720.01.T01 AT5G24900 31.507 146 96 3 247 391 210 352 7.52e-12 67.0
MsG0880047720.01.T01 AT5G24900 31.507 146 96 3 247 391 327 469 1.44e-11 66.6
MsG0880047720.01.T01 AT2G26710 22.348 264 191 6 129 391 207 457 1.46e-11 66.6
MsG0880047720.01.T01 AT1G19630 26.442 208 128 7 189 391 230 417 2.74e-11 65.5
MsG0880047720.01.T01 AT1G19630 26.442 208 128 7 189 391 230 417 3.34e-11 65.1
MsG0880047720.01.T01 AT1G19630 26.596 188 120 5 189 371 230 404 3.47e-11 65.1
MsG0880047720.01.T01 AT3G14660 20.275 291 212 8 104 391 35 308 5.75e-11 63.9
MsG0880047720.01.T01 AT2G45510 26.778 239 145 7 154 371 202 431 6.74e-11 64.3
MsG0880047720.01.T01 AT1G67110 24.621 264 183 5 129 391 204 452 7.51e-11 64.3

Find 72 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 120 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CACAGCTTCTTAGTGCTAAA+AGG 0.160458 8:-90005779 MsG0880047720.01.T01:CDS
TTTATACCTGAGAGCTTTAA+TGG 0.166558 8:-90004413 MsG0880047720.01.T01:CDS
ACTATCACACTAATCTTTAT+AGG 0.179334 8:+90004488 None:intergenic
TGATGCAAATTTCCTATTAA+AGG 0.192099 8:+90006065 None:intergenic
CCATGGAAGCTTCCTTTAAT+AGG 0.242856 8:-90006077 MsG0880047720.01.T01:CDS
AGCTTTGATTACATGCCTTT+TGG 0.264674 8:-90004359 MsG0880047720.01.T01:CDS
GAGATAAGAGAAACCTTTAA+AGG 0.276333 8:-90004653 MsG0880047720.01.T01:CDS
CTCTGCATCATACCAATGTT+TGG 0.279059 8:+90004439 None:intergenic
TTCCACCTCTTCTTCTCTAA+TGG 0.302695 8:+90005740 None:intergenic
CGAGATCTATCCAACAAATA+TGG 0.319428 8:-90006005 MsG0880047720.01.T01:CDS
TTGACATTGTCGTCTGTGAT+AGG 0.340353 8:+90005342 None:intergenic
TACTAAAATAGCTTTCTCTT+TGG 0.341397 8:-90005670 MsG0880047720.01.T01:CDS
CACGCTTCCCTGCATTCTCT+TGG 0.345565 8:+90004533 None:intergenic
CCTCTTATGCATCTTCAGTT+TGG 0.354383 8:-90005981 MsG0880047720.01.T01:intron
TCTCTTGGAAGCAAAGTAAA+AGG 0.371338 8:+90004548 None:intergenic
GTGCTTTCTTCATCACTGTT+GGG 0.373167 8:+90004681 None:intergenic
GTTCGAGTGATAAGATGAAT+AGG 0.379521 8:+90005516 None:intergenic
TGTGCTTTCTTCATCACTGT+TGG 0.387666 8:+90004680 None:intergenic
TCTGCATCATACCAATGTTT+GGG 0.390685 8:+90004440 None:intergenic
AAATTCAATCCATGGCCAAC+AGG 0.391714 8:-90005421 MsG0880047720.01.T01:CDS
GGCCATGGATTGAATTTGAT+TGG 0.400953 8:+90005427 None:intergenic
GCTCAAGCAAACAGTGGAAA+TGG 0.433727 8:-90005580 MsG0880047720.01.T01:CDS
CATAAGAGGTCCATATTTGT+TGG 0.438869 8:+90005995 None:intergenic
TTTGTTTCAAGAGCAGCATT+TGG 0.443322 8:-90005639 MsG0880047720.01.T01:CDS
GCTAAGCCAAGCAAAATTCC+CGG 0.456022 8:+90004318 None:intergenic
ACAGCTTCTTAGTGCTAAAA+GGG 0.462335 8:-90005778 MsG0880047720.01.T01:CDS
CATTCTTCTTCCTCCCCAAA+AGG 0.465304 8:+90004344 None:intergenic
GAGCAGGATATGTTCGCTGC+TGG 0.465779 8:-90004758 MsG0880047720.01.T01:CDS
GGGAGGAAGAAGAATGTGTC+CGG 0.469010 8:-90004337 MsG0880047720.01.T01:CDS
AGATGAATAGGTTTAAATGA+AGG 0.481205 8:+90005528 None:intergenic
CCTATTAAAGGAAGCTTCCA+TGG 0.489263 8:+90006077 None:intergenic
CTTTGCTTCCAAGAGAATGC+AGG 0.491418 8:-90004541 MsG0880047720.01.T01:CDS
TCAAAACCATTAAAGCTCTC+AGG 0.495028 8:+90004407 None:intergenic
ATAGTAAATGCATGGGCAAT+CGG 0.498162 8:-90004470 MsG0880047720.01.T01:CDS
CCAAACTGAAGATGCATAAG+AGG 0.499981 8:+90005981 None:intergenic
TTGCATCAACTAGCATTAGC+AGG 0.501407 8:-90006050 MsG0880047720.01.T01:CDS
AATGAAGGGAACAAATCAGC+AGG 0.506687 8:+90005543 None:intergenic
AAAGGAAGCTTCCATGGTCC+TGG 0.512674 8:+90006083 None:intergenic
AGCAGGATATGTTCGCTGCT+GGG 0.514968 8:-90004757 MsG0880047720.01.T01:CDS
GATGAATAGGTTTAAATGAA+GGG 0.515862 8:+90005529 None:intergenic
TGACATTGTCGTCTGTGATA+GGG 0.517201 8:+90005343 None:intergenic
CATAGTATGTGGAAATGAGC+AGG 0.519831 8:-90004774 MsG0880047720.01.T01:CDS
GAATGAGGAAATGATGAGGA+AGG 0.531705 8:+90006181 None:intergenic
TTCTTCCATTAGAGAAGAAG+AGG 0.533162 8:-90005745 MsG0880047720.01.T01:CDS
GAAGGAAGATTTGAATTCCA+TGG 0.544795 8:+90006199 None:intergenic
TGCAGGGAAGCGTGCAACAT+AGG 0.555151 8:-90004524 MsG0880047720.01.T01:CDS
CACCAATCAAATTCAATCCA+TGG 0.557614 8:-90005429 MsG0880047720.01.T01:CDS
TTCCATTAGAGAAGAAGAGG+TGG 0.571680 8:-90005742 MsG0880047720.01.T01:CDS
CAGTGATCAAAGAAACTATG+AGG 0.572962 8:-90004580 MsG0880047720.01.T01:CDS
TAGTGAAAGTGAAACTTGAA+TGG 0.581087 8:+90005704 None:intergenic
CTTGGAAGCAAAGTAAAAGG+TGG 0.583825 8:+90004551 None:intergenic
TTAGTGTGATAGTAAATGCA+TGG 0.585212 8:-90004478 MsG0880047720.01.T01:CDS
CTTCAGCAACAGTAATAGAG+TGG 0.589125 8:-90004727 MsG0880047720.01.T01:CDS
TTTGCTTCCAAGAGAATGCA+GGG 0.591610 8:-90004540 MsG0880047720.01.T01:CDS
AAATGCTGCTCTTGAAACAA+AGG 0.601255 8:+90005641 None:intergenic
AGATGAATGAGGAAATGATG+AGG 0.602206 8:+90006177 None:intergenic
ATAAACTTCCACCAGGACCA+TGG 0.607741 8:-90006094 MsG0880047720.01.T01:CDS
GGAAGCTTCCATGGTCCTGG+TGG 0.607845 8:+90006086 None:intergenic
AATTCAATCCATGGCCAACA+GGG 0.611778 8:-90005420 MsG0880047720.01.T01:CDS
TAGTGTGATAGTAAATGCAT+GGG 0.616428 8:-90004477 MsG0880047720.01.T01:CDS
AAGTATCAAGAAGATGAATG+AGG 0.616564 8:+90006166 None:intergenic
TTCAGCAACAGTAATAGAGT+GGG 0.617822 8:-90004726 MsG0880047720.01.T01:CDS
TTGGAAGCAAAGTAAAAGGT+GGG 0.618980 8:+90004552 None:intergenic
GGAGGAAGAAGAATGTGTCC+GGG 0.621038 8:-90004336 MsG0880047720.01.T01:CDS
AGATCTCGAAGTGTATGATG+TGG 0.630459 8:+90006020 None:intergenic
GAGTTTGCTCAAGCAAACAG+TGG 0.636309 8:-90005586 MsG0880047720.01.T01:CDS
TCGGAAGAGATCCCAAACAT+TGG 0.648838 8:-90004451 MsG0880047720.01.T01:CDS
AGGGAAGCGTGCAACATAGG+TGG 0.659598 8:-90004521 MsG0880047720.01.T01:CDS
CAAACAGTGGAAATGGCAAG+TGG 0.666453 8:-90005573 MsG0880047720.01.T01:CDS
ATGAAGGGAACAAATCAGCA+GGG 0.685418 8:+90005544 None:intergenic
GAGGTTCATAAACTTCCACC+AGG 0.694137 8:-90006101 MsG0880047720.01.T01:CDS
GAAAATCAAAGTGAAGAACG+AGG 0.759074 8:-90006120 MsG0880047720.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
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!! AGATTAAGGTTCTTAAAAAA+AGG + Chr8:90005426-90005445 None:intergenic 20.0%
!! TTAAATCTTTCAATTGTGTT+AGG - Chr8:90005266-90005285 MsG0880047720.01.T01:intron 20.0%
!!! ACCTTTTTATAAACTCATTT+CGG - Chr8:90005509-90005528 MsG0880047720.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATTCTCTTTTTACCTTTAA+AGG + Chr8:90005879-90005898 None:intergenic 20.0%
! ACTATCACACTAATCTTTAT+AGG + Chr8:90006031-90006050 None:intergenic 25.0%
! AGAATAGATATAAGACTTGA+AGG + Chr8:90005648-90005667 None:intergenic 25.0%
! AGATGAATAGGTTTAAATGA+AGG + Chr8:90004991-90005010 None:intergenic 25.0%
! GATGAATAGGTTTAAATGAA+GGG + Chr8:90004990-90005009 None:intergenic 25.0%
! TACTAAAATAGCTTTCTCTT+TGG - Chr8:90004846-90004865 MsG0880047720.01.T01:intron 25.0%
! TCCGAAATGAGTTTATAAAA+AGG + Chr8:90005513-90005532 None:intergenic 25.0%
! TGATGCAAATTTCCTATTAA+AGG + Chr8:90004454-90004473 None:intergenic 25.0%
!!! AGTTGTTTTAACATAGTATG+TGG - Chr8:90005731-90005750 MsG0880047720.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATGATAATATTTTAGGAGCT+AGG + Chr8:90004649-90004668 None:intergenic 25.0%
!!! GCTATTTTAGTAACATTAAG+TGG + Chr8:90004838-90004857 None:intergenic 25.0%
AAGTATCAAGAAGATGAATG+AGG + Chr8:90004353-90004372 None:intergenic 30.0%
ATGATATGATTGCAACATCA+TGG + Chr8:90005388-90005407 None:intergenic 30.0%
ATGTGTCTTCATTATCTCTT+TGG + Chr8:90004599-90004618 None:intergenic 30.0%
GAATCACCCATAATTTATCT+AGG + Chr8:90005543-90005562 None:intergenic 30.0%
GAGATAAGAGAAACCTTTAA+AGG - Chr8:90005863-90005882 MsG0880047720.01.T01:intron 30.0%
GATATTGTTTATGCTCCATA+CGG - Chr8:90004680-90004699 MsG0880047720.01.T01:CDS 30.0%
GCAGAATATGCAAAAAAAGT+TGG - Chr8:90005035-90005054 MsG0880047720.01.T01:intron 30.0%
GGAGACAGTAATAAAGATTA+AGG + Chr8:90005440-90005459 None:intergenic 30.0%
TAGTGAAAGTGAAACTTGAA+TGG + Chr8:90004815-90004834 None:intergenic 30.0%
TAGTGTGATAGTAAATGCAT+GGG - Chr8:90006039-90006058 MsG0880047720.01.T01:CDS 30.0%
TTAGTGTGATAGTAAATGCA+TGG - Chr8:90006038-90006057 MsG0880047720.01.T01:CDS 30.0%
TTATAAACTCATTTCGGACT+CGG - Chr8:90005515-90005534 MsG0880047720.01.T01:CDS 30.0%
! ATGATCTTTCTTTTGTTCAG+AGG - Chr8:90004617-90004636 MsG0880047720.01.T01:CDS 30.0%
! TTTATACCTGAGAGCTTTAA+TGG - Chr8:90006103-90006122 MsG0880047720.01.T01:CDS 30.0%
!!! CTTATGAGTCGGTTTTTTTA+AGG + Chr8:90005599-90005618 None:intergenic 30.0%
!!! TCAGGAATTTTGATTAGTGA+AGG - Chr8:90005318-90005337 MsG0880047720.01.T01:intron 30.0%
AAATGCTGCTCTTGAAACAA+AGG + Chr8:90004878-90004897 None:intergenic 35.0%
ACACATGTCATCTTATGAGT+CGG + Chr8:90005610-90005629 None:intergenic 35.0%
ACAGCTTCTTAGTGCTAAAA+GGG - Chr8:90004738-90004757 MsG0880047720.01.T01:CDS 35.0%
ACCAATGCAAACATCATATC+GGG - Chr8:90005460-90005479 MsG0880047720.01.T01:CDS 35.0%
AGATGAATGAGGAAATGATG+AGG + Chr8:90004342-90004361 None:intergenic 35.0%
ATAGTAAATGCATGGGCAAT+CGG - Chr8:90006046-90006065 MsG0880047720.01.T01:CDS 35.0%
ATATCGGGGAAAATGCAATA+AGG - Chr8:90005475-90005494 MsG0880047720.01.T01:CDS 35.0%
ATTATCTCTTTGGCCAAATC+AGG + Chr8:90004589-90004608 None:intergenic 35.0%
ATTGCTTCACAAACGAATTC+AGG - Chr8:90005300-90005319 MsG0880047720.01.T01:intron 35.0%
CACCAATCAAATTCAATCCA+TGG - Chr8:90005087-90005106 MsG0880047720.01.T01:intron 35.0%
CACCAATGCAAACATCATAT+CGG - Chr8:90005459-90005478 MsG0880047720.01.T01:CDS 35.0%
CAGTGATCAAAGAAACTATG+AGG - Chr8:90005936-90005955 MsG0880047720.01.T01:intron 35.0%
CATAAGAGGTCCATATTTGT+TGG + Chr8:90004524-90004543 None:intergenic 35.0%
CGAGATCTATCCAACAAATA+TGG - Chr8:90004511-90004530 MsG0880047720.01.T01:CDS 35.0%
GAAAATCAAAGTGAAGAACG+AGG - Chr8:90004396-90004415 MsG0880047720.01.T01:CDS 35.0%
GTTCGAGTGATAAGATGAAT+AGG + Chr8:90005003-90005022 None:intergenic 35.0%
TATGGGTGATTCTGAATAGA+CGG - Chr8:90005551-90005570 MsG0880047720.01.T01:CDS 35.0%
TCAAAACCATTAAAGCTCTC+AGG + Chr8:90006112-90006131 None:intergenic 35.0%
TCTCTTGGAAGCAAAGTAAA+AGG + Chr8:90005971-90005990 None:intergenic 35.0%
TCTGCATCATACCAATGTTT+GGG + Chr8:90006079-90006098 None:intergenic 35.0%
TGTTTCCAATAATCACCGTA+TGG + Chr8:90004698-90004717 None:intergenic 35.0%
TTCAGCAACAGTAATAGAGT+GGG - Chr8:90005790-90005809 MsG0880047720.01.T01:CDS 35.0%
TTCTTCCATTAGAGAAGAAG+AGG - Chr8:90004771-90004790 MsG0880047720.01.T01:CDS 35.0%
TTGGAAGCAAAGTAAAAGGT+GGG + Chr8:90005967-90005986 None:intergenic 35.0%
TTTGTTTCAAGAGCAGCATT+TGG - Chr8:90004877-90004896 MsG0880047720.01.T01:intron 35.0%
! CTTTGATTACATGCCTTTTG+GGG - Chr8:90006159-90006178 MsG0880047720.01.T01:CDS 35.0%
! GCTTTGATTACATGCCTTTT+GGG - Chr8:90006158-90006177 MsG0880047720.01.T01:CDS 35.0%
! TCGGTGCCTAGATAAATTAT+GGG - Chr8:90005534-90005553 MsG0880047720.01.T01:CDS 35.0%
!! AGCTTTGATTACATGCCTTT+TGG - Chr8:90006157-90006176 MsG0880047720.01.T01:CDS 35.0%
!! ATATTTTAGGAGCTAGGTTC+TGG + Chr8:90004643-90004662 None:intergenic 35.0%
!! TAGTCGTGTTTAAGTTGTAG+AGG - Chr8:90005351-90005370 MsG0880047720.01.T01:CDS 35.0%
!!! GAGTCGGTTTTTTTAAGGAT+GGG + Chr8:90005594-90005613 None:intergenic 35.0%
!!! TGAGTCGGTTTTTTTAAGGA+TGG + Chr8:90005595-90005614 None:intergenic 35.0%
AAATTCAATCCATGGCCAAC+AGG - Chr8:90005095-90005114 MsG0880047720.01.T01:intron 40.0%
AATGAAGGGAACAAATCAGC+AGG + Chr8:90004976-90004995 None:intergenic 40.0%
AATTCAATCCATGGCCAACA+GGG - Chr8:90005096-90005115 MsG0880047720.01.T01:intron 40.0%
AGATCTCGAAGTGTATGATG+TGG + Chr8:90004499-90004518 None:intergenic 40.0%
ATGAAGGGAACAAATCAGCA+GGG + Chr8:90004975-90004994 None:intergenic 40.0%
ATGCTCCATACGGTGATTAT+TGG - Chr8:90004690-90004709 MsG0880047720.01.T01:CDS 40.0%
CACAGCTTCTTAGTGCTAAA+AGG - Chr8:90004737-90004756 MsG0880047720.01.T01:CDS 40.0%
CATAGTATGTGGAAATGAGC+AGG - Chr8:90005742-90005761 MsG0880047720.01.T01:CDS 40.0%
CCAAACTGAAGATGCATAAG+AGG + Chr8:90004538-90004557 None:intergenic 40.0%
CCAATGCAAACATCATATCG+GGG - Chr8:90005461-90005480 MsG0880047720.01.T01:CDS 40.0%
CCATGGAAGCTTCCTTTAAT+AGG - Chr8:90004439-90004458 MsG0880047720.01.T01:CDS 40.0%
CCTATTAAAGGAAGCTTCCA+TGG + Chr8:90004442-90004461 None:intergenic 40.0%
CCTCTTATGCATCTTCAGTT+TGG - Chr8:90004535-90004554 MsG0880047720.01.T01:CDS 40.0%
CGATATGATGTTTGCATTGG+TGG + Chr8:90005461-90005480 None:intergenic 40.0%
CTCTGCATCATACCAATGTT+TGG + Chr8:90006080-90006099 None:intergenic 40.0%
CTTCAGCAACAGTAATAGAG+TGG - Chr8:90005789-90005808 MsG0880047720.01.T01:CDS 40.0%
CTTGGAAGCAAAGTAAAAGG+TGG + Chr8:90005968-90005987 None:intergenic 40.0%
GAATGAGGAAATGATGAGGA+AGG + Chr8:90004338-90004357 None:intergenic 40.0%
GTGCTTTCTTCATCACTGTT+GGG + Chr8:90005838-90005857 None:intergenic 40.0%
TAGTTTAGCAACTAACCCAC+AGG + Chr8:90005206-90005225 None:intergenic 40.0%
TGACATTGTCGTCTGTGATA+GGG + Chr8:90005176-90005195 None:intergenic 40.0%
TGTGCTTTCTTCATCACTGT+TGG + Chr8:90005839-90005858 None:intergenic 40.0%
TTCCACCTCTTCTTCTCTAA+TGG + Chr8:90004779-90004798 None:intergenic 40.0%
TTCCATTAGAGAAGAAGAGG+TGG - Chr8:90004774-90004793 MsG0880047720.01.T01:CDS 40.0%
TTGACATTGTCGTCTGTGAT+AGG + Chr8:90005177-90005196 None:intergenic 40.0%
TTGCATCAACTAGCATTAGC+AGG - Chr8:90004466-90004485 MsG0880047720.01.T01:CDS 40.0%
TTTGCTTCCAAGAGAATGCA+GGG - Chr8:90005976-90005995 MsG0880047720.01.T01:intron 40.0%
! CAACTAGATTTTCACCCTGT+TGG + Chr8:90005113-90005132 None:intergenic 40.0%
! GGCCATGGATTGAATTTGAT+TGG + Chr8:90005092-90005111 None:intergenic 40.0%
! GGTTGTTTCATCTCCTGATT+TGG - Chr8:90004573-90004592 MsG0880047720.01.T01:CDS 40.0%
! GTTTGGTGAAATTTCTGCAG+TGG - Chr8:90004552-90004571 MsG0880047720.01.T01:CDS 40.0%
!! CTCGGTGCCTAGATAAATTA+TGG - Chr8:90005533-90005552 MsG0880047720.01.T01:CDS 40.0%
ATAAACTTCCACCAGGACCA+TGG - Chr8:90004422-90004441 MsG0880047720.01.T01:CDS 45.0%
CAAACAGTGGAAATGGCAAG+TGG - Chr8:90004943-90004962 MsG0880047720.01.T01:intron 45.0%
CATTCTTCTTCCTCCCCAAA+AGG + Chr8:90006175-90006194 None:intergenic 45.0%
CCCCGATATGATGTTTGCAT+TGG + Chr8:90005464-90005483 None:intergenic 45.0%
CTTTGCTTCCAAGAGAATGC+AGG - Chr8:90005975-90005994 MsG0880047720.01.T01:intron 45.0%
GAGGTTCATAAACTTCCACC+AGG - Chr8:90004415-90004434 MsG0880047720.01.T01:CDS 45.0%
GCTCAAGCAAACAGTGGAAA+TGG - Chr8:90004936-90004955 MsG0880047720.01.T01:intron 45.0%
TCGGAAGAGATCCCAAACAT+TGG - Chr8:90006065-90006084 MsG0880047720.01.T01:CDS 45.0%
TTAGCAACTAACCCACAGGA+CGG + Chr8:90005202-90005221 None:intergenic 45.0%
! ATGTGTCCGGGAATTTTGCT+TGG - Chr8:90006192-90006211 MsG0880047720.01.T01:CDS 45.0%
! GAGTTTGCTCAAGCAAACAG+TGG - Chr8:90004930-90004949 MsG0880047720.01.T01:intron 45.0%
!! TGATTACATGCCTTTTGGGG+AGG - Chr8:90006162-90006181 MsG0880047720.01.T01:CDS 45.0%
AAAGGAAGCTTCCATGGTCC+TGG + Chr8:90004436-90004455 None:intergenic 50.0%
ACAATGTCAAAGCCGTCCTG+TGG - Chr8:90005187-90005206 MsG0880047720.01.T01:intron 50.0%
AGCAGGATATGTTCGCTGCT+GGG - Chr8:90005759-90005778 MsG0880047720.01.T01:CDS 50.0%
CAATGTCAAAGCCGTCCTGT+GGG - Chr8:90005188-90005207 MsG0880047720.01.T01:intron 50.0%
GGAGGAAGAAGAATGTGTCC+GGG - Chr8:90006180-90006199 MsG0880047720.01.T01:CDS 50.0%
GGGAGGAAGAAGAATGTGTC+CGG - Chr8:90006179-90006198 MsG0880047720.01.T01:CDS 50.0%
! GATTTTCACCCTGTTGGCCA+TGG + Chr8:90005107-90005126 None:intergenic 50.0%
CACGCTTCCCTGCATTCTCT+TGG + Chr8:90005986-90006005 None:intergenic 55.0%
GAGCAGGATATGTTCGCTGC+TGG - Chr8:90005758-90005777 MsG0880047720.01.T01:CDS 55.0%
! AGGGAAGCGTGCAACATAGG+TGG - Chr8:90005995-90006014 MsG0880047720.01.T01:CDS 55.0%
! TGCAGGGAAGCGTGCAACAT+AGG - Chr8:90005992-90006011 MsG0880047720.01.T01:CDS 55.0%
GGAAGCTTCCATGGTCCTGG+TGG + Chr8:90004433-90004452 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 90004319 90006219 90004319 ID=MsG0880047720.01;Name=MsG0880047720.01
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Chr8 exon 90005982 90006219 90005982 ID=MsG0880047720.01.T01:exon:18230;Parent=MsG0880047720.01.T01
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Chr8 exon 90004319 90004805 90004319 ID=MsG0880047720.01.T01:exon:18228;Parent=MsG0880047720.01.T01
Chr8 CDS 90005982 90006219 90005982 ID=MsG0880047720.01.T01:cds;Parent=MsG0880047720.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0880047720.01.T01

ATGGAATTCAAATCTTCCTTCCTCATCATTTCCTCATTCATCTTCTTGATACTTTGTCTAGCAAAGATTTATAAGCAGAAAATCAAAGTGAAGAACGAGGTTCATAAACTTCCACCAGGACCATGGAAGCTTCCTTTAATAGGAAATTTGCATCAACTAGCATTAGCAGGATCACTTCCACATCATACACTTCGAGATCTATCCAACAAATATGGACCTCTTATGCATCTTCAGTTTGATGAAAAAATATGTACAACACAGCTTCTTAGTGCTAAAAGGGTTCGTTATTTTTCTTCCATTAGAGAAGAAGAGGTGGAAAAGCTCATACAATCCATTCAAGTTTCACTTTCACTACCACTTAATGTTACTAAAATAGCTTTCTCTTTGGTAAGTACCTTTGTTTCAAGAGCAGCATTTGGTAAAAAATCTAAACATGAAGATGAACTTTTGAGTTTGCTCAAGCAAACAGTGGAAATGGCAAGTGGCTTTGACCCTGCTGATTTGTTCCCTTCATTTAAACCTATTCATCTTATCACTCGAACGAAAGCTAAATTGCAGAATATGCAAAAAAAGTTGGATAAGATTTTAGAAAGCATTATCAAAGAGCACCAATCAAATTCAATCCATGGCCAACAGGGTGAAAATCTAGTTGATGTTCTTTTGCGCGTTCAGCAAAGTGACAGTTTCGATATCCCTATCACAGACGACAATGTCAAAGCCGTCCTTTGTTTTAACATAGTATGTGGAAATGAGCAGGATATGTTCGCTGCTGGGAGTGATACTTCAGCAACAGTAATAGAGTGGGCTATGTCAGAGTTGATGAAAAACCCAACAGTGATGAAGAAAGCACAATCTGAGATAAGAGAAACCTTTAAAGGTAAAAAGAGAATATATGAGAGTGATCTACATGATCTTAGTTACTTGAAGTCAGTGATCAAAGAAACTATGAGGTTACACCCACCTTTTACTTTGCTTCCAAGAGAATGCAGGGAAGCGTGCAACATAGGTGGATATGAAATACCTATAAAGATTAGTGTGATAGTAAATGCATGGGCAATCGGAAGAGATCCCAAACATTGGTATGATGCAGAGAAGTTTATACCTGAGAGCTTTAATGGTTTTGATTTTAATAAATTGAACAATAATAATAGCTTTGATTACATGCCTTTTGGGGAGGAAGAAGAATGTGTCCGGGAATTTTGCTTGGCTTAG

Protein sequence

>MsG0880047720.01.T01

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