AlfalfaGEDB | MsG0780041100.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780041100.01

KEGG: -
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PFAM: PF00657

Nr:

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Swissprot:

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Trembl:

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TFs/TRs:

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Protein Kinases:

Gene ID	Type	Classification

Network:

Co-expression Network

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MsG0780041100.01.T01	AT1G58725	28.739	341	211	13	22	342	12	340	6.29e-29	115
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MsG0780041100.01.T01	AT2G03980	27.796	313	193	14	41	332	44	344	5.98e-26	107
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MsG0780041100.01.T01	AT1G53990	24.615	325	191	14	39	332	34	335	9.03e-11	63.2

Find 54 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 251 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence	on_target_score	Position	Region
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GAATAATGTTAAGAAATATT+TGG	0.268269	7:-86585167	MsG0780041100.01.T02:intron
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ATCAATTTCCTCAGGCTGTA+TGG	0.326225	7:+86586852	None:intergenic
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TTGATCTGGGTTGTCATGTT+TGG	0.334896	7:+86586756	None:intergenic
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TATGGAATGAACTTTGCTTT+TGG	0.362848	7:-86586813	MsG0780041100.01.T02:CDS
GTATCAAAATTGTTTGTGTT+TGG	0.368114	7:-86589441	MsG0780041100.01.T02:CDS
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TGGGTTGTCATGTTTGGGCC+TGG	0.398569	7:+86586762	None:intergenic
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CRISPR-GE

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!	GGATTTGGTTCATCCTACGG+AGG	-	Chr7:86589690-86589709	MsG0780041100.01.T02:five_prime_UTR	50.0%
!	GGTCACAAATGGCTCTGTTG+AGG	-	Chr7:86588172-86588191	MsG0780041100.01.T02:intron	50.0%
	CGTGGAGTGCACTGAAACAC+TGG	-	Chr7:86588273-86588292	MsG0780041100.01.T02:intron	55.0%
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	GTTGCTCTTGTCTCTGTCGC+TGG	-	Chr7:86588128-86588147	MsG0780041100.01.T02:intron	55.0%
	TGGGTTGTCATGTTTGGGCC+TGG	+	Chr7:86588044-86588063	None:intergenic	55.0%
	TGGTTCATCCTACGGAGGCA+GGG	-	Chr7:86589695-86589714	MsG0780041100.01.T02:five_prime_UTR	55.0%
	TTCCTCAGGCTGTATGGGAC+TGG	+	Chr7:86587948-86587967	None:intergenic	55.0%
	TTGGTTCATCCTACGGAGGC+AGG	-	Chr7:86589694-86589713	MsG0780041100.01.T02:five_prime_UTR	55.0%
!	CGGACCTTTTATGGTGCGAC+AGG	+	Chr7:86587556-86587575	None:intergenic	55.0%
!	GCTGCGTCGTCATGCCTTTT+TGG	-	Chr7:86587319-86587338	MsG0780041100.01.T02:intron	55.0%
	ACCTTTCCCGGCAAACCTGC+CGG	-	Chr7:86585455-86585474	MsG0780041100.01.T02:intron	60.0%
	CACCAGTCCCATACAGCCTG+AGG	-	Chr7:86587943-86587962	MsG0780041100.01.T02:intron	60.0%
	GTCGGTGAGGACTCTTCCGT+CGG	+	Chr7:86585489-86585508	None:intergenic	60.0%
	TCTTCCGTCGGAGAAACGGC+CGG	+	Chr7:86585477-86585496	None:intergenic	60.0%
	TTCATCCTACGGAGGCAGGG+TGG	-	Chr7:86589698-86589717	MsG0780041100.01.T02:five_prime_UTR	60.0%
	AAACGGCCGGCAGGTTTGCC+GGG	+	Chr7:86585464-86585483	None:intergenic	65.0%
	GAAACGGCCGGCAGGTTTGC+CGG	+	Chr7:86585465-86585484	None:intergenic	65.0%
	CCTGCCGGCCGTTTCTCCGA+CGG	-	Chr7:86585470-86585489	MsG0780041100.01.T02:intron	70.0%
	GCATGCCACCCTGCCTCCGT+AGG	+	Chr7:86589706-86589725	None:intergenic	70.0%
	GCCGGCAGGTTTGCCGGGAA+AGG	+	Chr7:86585459-86585478	None:intergenic	70.0%
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