AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0080048602.01


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MsG0080048602.01.T01 MTR_7g090940 79.896 577 44 5 379 924 484 1019 0.0 903
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MsG0080048602.01.T01 AT5G12430 43.629 463 202 8 463 924 561 965 1.57e-104 352
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MsG0080048602.01.T01 AT3G14950 24.362 431 231 12 481 897 216 565 4.23e-11 67.4

Find 223 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 530 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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TTGCACAATGGCTTCTTCTT+TGG 0.224034 contig369end:-9319 MsG0080048602.01.T01:CDS
GAAGAAATTTAGGAGGAAAA+TGG 0.235820 contig369end:-9824 MsG0080048602.01.T01:intron
AGTATTGGAGTCTACGTTTC+TGG 0.252745 contig369end:-8647 MsG0080048602.01.T01:CDS
GCTAAACCGAATCCGGTTTC+TGG 0.265800 contig369end:-11219 MsG0080048602.01.T01:CDS
ATCTTAGGCAAGACTGTATC+AGG 0.266228 contig369end:+10039 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TCTGGTGTTTCAGCAGATGC+TGG 0.283032 contig369end:-9988 MsG0080048602.01.T01:CDS
ATCTAAGTGTTACTTTCGTT+TGG 0.303602 contig369end:-7724 MsG0080048602.01.T01:CDS
GAAGGCGGAGGCTCTGTATT+TGG 0.308261 contig369end:-8030 MsG0080048602.01.T01:intron
TGCTTTAGAACTACTTATAA+AGG 0.313822 contig369end:-8093 MsG0080048602.01.T01:CDS
AATAATTGCACTAGATTTGC+AGG 0.323899 contig369end:-6573 MsG0080048602.01.T01:CDS
CATCCTAATCTTTCGCTAGA+AGG 0.326375 contig369end:+9426 MsG0080048602.01.T01:intergenic
AATCAGCTGGTTCCCATAAC+TGG 0.328522 contig369end:-8740 MsG0080048602.01.T01:intron
AAGGGAATAATTTGTATCAT+TGG 0.329418 contig369end:+5233 MsG0080048602.01.T01:intergenic
AACTGCGGTGGCCGTGGTTC+TGG 0.332619 contig369end:+11413 MsG0080048602.01.T01:intergenic
AAGAAATTTAGGAGGAAAAT+GGG 0.333248 contig369end:-9823 MsG0080048602.01.T01:intron
GAAAATGAAGGTTCTGGTTC+CGG 0.336332 contig369end:-11390 MsG0080048602.01.T01:CDS
AAGTTGATTCTGATTCTGTT+AGG 0.339925 contig369end:-11311 MsG0080048602.01.T01:CDS
AATTCATGGTTTGCTGATTA+CGG 0.343666 contig369end:-11060 MsG0080048602.01.T01:CDS
GGAAATTCTATGGCAGCTAT+TGG 0.344511 contig369end:-8679 MsG0080048602.01.T01:CDS
GCTGCTGCTCATCAAGCTTC+AGG 0.355265 contig369end:-6816 MsG0080048602.01.T01:CDS
TGCAGCAACACGTATGAGTC+TGG 0.360806 contig369end:-9367 MsG0080048602.01.T01:CDS
ATTCATGGTTTGCTGATTAC+GGG 0.363056 contig369end:-11059 MsG0080048602.01.T01:CDS
ACCATTTGTTCCGCAAGCTT+TGG 0.367294 contig369end:+10619 MsG0080048602.01.T01:intergenic
GTAGGCGATGTTCATTTCTC+TGG 0.368252 contig369end:-10063 MsG0080048602.01.T01:CDS
AAATTATTCCCTTGCCGACT+TGG 0.369405 contig369end:-5223 MsG0080048602.01.T01:CDS
TGTTGACAGCAAGAGGAATT+CGG 0.372815 contig369end:-10992 MsG0080048602.01.T01:CDS
ACAGAGCCTCCGCCTTCATT+TGG 0.378270 contig369end:+8036 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TGGTGTTAATAGTTAGTAAA+GGG 0.381811 contig369end:-8924 MsG0080048602.01.T01:CDS
TTCATGGGTAGGAAATTCTA+TGG 0.382797 contig369end:-8689 MsG0080048602.01.T01:CDS
GGAACAAATGGTGTCCAAAA+TGG 0.384881 contig369end:-10608 MsG0080048602.01.T01:CDS
CTGGTGTTTCAGCAGATGCT+GGG 0.386382 contig369end:-9987 MsG0080048602.01.T01:CDS
ACCATCACTTTCTTTCTGTT+CGG 0.386387 contig369end:+11278 MsG0080048602.01.T01:intergenic
GTGTACCTAAGTGGAATTCA+TGG 0.390734 contig369end:-11074 MsG0080048602.01.T01:CDS
CCGACTTGGGGCTTTGACTC+CGG 0.390853 contig369end:-5209 MsG0080048602.01.T01:CDS
TAGTAGCAATGGTTTGTGTT+TGG 0.390988 contig369end:-10725 MsG0080048602.01.T01:CDS
ACGGGCTTTCCATTCACATT+TGG 0.391861 contig369end:+9780 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TTTGAATCTAGAAAATTTCA+TGG 0.400358 contig369end:-8705 MsG0080048602.01.T01:CDS
GATATGGGCCTCAGGCTTGT+TGG 0.401880 contig369end:-8944 MsG0080048602.01.T01:intron
CGACCTTCCACGTGCGGTTG+CGG 0.402153 contig369end:+11494 MsG0080048602.01.T01:intergenic
AATTGCTCCGATACCAGTTA+TGG 0.407541 contig369end:+8727 MsG0080048602.01.T01:intergenic
AGGGAATAATTTGTATCATT+GGG 0.414407 contig369end:+5234 MsG0080048602.01.T01:intergenic
GGAAATGATAACTTTAAATT+GGG 0.415396 contig369end:-6930 MsG0080048602.01.T01:CDS
GTTAAGTCGAAGAGTGGAAA+TGG 0.416270 contig369end:-10880 MsG0080048602.01.T01:CDS
CGTGCGGTTGCGGCGGTAGG+AGG 0.419021 contig369end:+11504 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TCTAAGTGTTACTTTCGTTT+GGG 0.420110 contig369end:-7723 MsG0080048602.01.T01:CDS
TGCGGATTGCAGCATGGCTA+TGG 0.423201 contig369end:-6775 MsG0080048602.01.T01:CDS
GTATTGGAGTCTACGTTTCT+GGG 0.423613 contig369end:-8646 MsG0080048602.01.T01:CDS
AATTATTCCCTTGCCGACTT+GGG 0.423914 contig369end:-5222 MsG0080048602.01.T01:CDS
ACAAATGGTGATGTTGATAA+AGG 0.426583 contig369end:-10934 MsG0080048602.01.T01:CDS
TTACTTTCGTTTGGGAAGGC+TGG 0.429269 contig369end:-7715 MsG0080048602.01.T01:CDS
GAAGAGCCACCTTGCATGAA+TGG 0.433899 contig369end:-6541 MsG0080048602.01.T01:CDS
TGATGATGCTAAACCGAATC+CGG 0.434958 contig369end:-11226 MsG0080048602.01.T01:CDS
ATTTATTAAGAACTTAAAGA+TGG 0.435112 contig369end:-6603 MsG0080048602.01.T01:intron
TACAGGTGAAGATGAATTGC+CGG 0.435574 contig369end:+5190 MsG0080048602.01.T01:intergenic
GATAATGGCAAGTCCTGTTA+TGG 0.437842 contig369end:-10096 MsG0080048602.01.T01:CDS
GCAGTTGAAAATGAAGGTTC+TGG 0.438840 contig369end:-11396 MsG0080048602.01.T01:CDS
GTTGACAGCAAGAGGAATTC+GGG 0.439659 contig369end:-10991 MsG0080048602.01.T01:CDS
TGAATTTGTGTTCGGAAAGC+AGG 0.439660 contig369end:-11019 MsG0080048602.01.T01:CDS
AACACTTCGGACTGCATCTT+AGG 0.441438 contig369end:+10024 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TTGTTATCTCCAAATGTGAA+TGG 0.442518 contig369end:-9789 MsG0080048602.01.T01:CDS
TGAAAATTGTACGGAAGATA+CGG 0.442948 contig369end:+9761 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TTGGTGTTAATAGTTAGTAA+AGG 0.444374 contig369end:-8925 MsG0080048602.01.T01:CDS
TTCCTGAGTTTGACAAGTCT+CGG 0.447394 contig369end:+11468 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TTACTTACATCACCAGAAAC+CGG 0.452212 contig369end:+11207 MsG0080048602.01.T01:intergenic
AGAGGTGGAGATCTTGATAA+TGG 0.453683 contig369end:-10111 MsG0080048602.01.T01:CDS
AGTGGAAATGGAAGTGCTAA+TGG 0.456088 contig369end:-10868 MsG0080048602.01.T01:CDS
AGTTGATTCTGATTCTGTTA+GGG 0.460732 contig369end:-11310 MsG0080048602.01.T01:CDS
TTCACCTGTACCCTCACAAT+AGG 0.463079 contig369end:-5177 None:intergenic
TAGCAATGGTTTGTGTTTGG+AGG 0.464972 contig369end:-10722 MsG0080048602.01.T01:CDS
TCGGCGTTGAAAGGAGCAAA+GGG 0.466937 contig369end:+11537 MsG0080048602.01.T01:intergenic
AATAATTTGTATCATTGGGC+TGG 0.472076 contig369end:+5238 MsG0080048602.01.T01:intergenic
ATTGCTCCGATACCAGTTAT+GGG 0.474027 contig369end:+8728 MsG0080048602.01.T01:intergenic
AGCAAGAGGAATTCGGGTAA+TGG 0.474649 contig369end:-10985 MsG0080048602.01.T01:CDS
TTAATAGTTAGTAAAGGGGT+AGG 0.477095 contig369end:-8919 MsG0080048602.01.T01:CDS
ATCTCTGATCCCATCCTGAC+TGG 0.480310 contig369end:+10529 MsG0080048602.01.T01:intergenic
GCCAAAGCTTGCGGAACAAA+TGG 0.480609 contig369end:-10620 MsG0080048602.01.T01:CDS
GTGCGGTTGCGGCGGTAGGA+GGG 0.481002 contig369end:+11505 MsG0080048602.01.T01:intergenic
CCAAAACAAATTGCTGCAAA+AGG 0.481821 contig369end:+6846 MsG0080048602.01.T01:intergenic
CCACGTGCGGTTGCGGCGGT+AGG 0.482328 contig369end:+11501 MsG0080048602.01.T01:intergenic
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GGTAGGAGGGTTGACGGCGT+CGG 0.490607 contig369end:+11518 MsG0080048602.01.T01:intergenic
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TAATAGTTAGTAAAGGGGTA+GGG 0.492877 contig369end:-8918 MsG0080048602.01.T01:CDS
TTTCTACATCCCCTAGCAAA+AGG 0.495223 contig369end:+9170 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TTACACTTGAGTAACTATCA+TGG 0.498377 contig369end:+7769 MsG0080048602.01.T01:intergenic
GTCCCTTCTAGCGAAAGATT+AGG 0.498776 contig369end:-9429 MsG0080048602.01.T01:CDS
GGTATTGATCAGGATGCTAC+AGG 0.500541 contig369end:-10575 MsG0080048602.01.T01:CDS
TTCTAAGACAACCACCAGTC+AGG 0.501464 contig369end:-10543 MsG0080048602.01.T01:CDS
TATTGGATTACAAACAGTAT+TGG 0.503246 contig369end:-8662 MsG0080048602.01.T01:CDS
CATGCTGAGACGGAAACAAA+TGG 0.503939 contig369end:-10949 MsG0080048602.01.T01:CDS
AACTGCTCAAGGTATTGATC+AGG 0.505403 contig369end:-10585 MsG0080048602.01.T01:CDS
TTAAACTCGGAAGAGGAGAA+AGG 0.506147 contig369end:-11180 MsG0080048602.01.T01:CDS
GGAGCGAAAAGGATTGAAAC+CGG 0.506544 contig369end:+11371 MsG0080048602.01.T01:intergenic
GAGAGGACTTTGGATGCAGC+TGG 0.506593 contig369end:-8119 MsG0080048602.01.T01:CDS
CTTACCTGATCGGAGCGAAA+AGG 0.506894 contig369end:+11360 MsG0080048602.01.T01:intergenic
CGCTCCGATCAGGTAAGTGA+GGG 0.508810 contig369end:-11354 MsG0080048602.01.T01:CDS
AATAGTTAGTAAAGGGGTAG+GGG 0.510095 contig369end:-8917 MsG0080048602.01.T01:intron
AGAAAGATTGCTCCAAATGA+AGG 0.512898 contig369end:-8048 MsG0080048602.01.T01:CDS
TGATGTGATGGACAAGTCTC+AGG 0.514273 contig369end:-9706 MsG0080048602.01.T01:CDS
CCTGAGTCTCCATTGGTGAC+AGG 0.517072 contig369end:+9629 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TCTTCTTAAAACCAGCATGC+AGG 0.517281 contig369end:-6951 MsG0080048602.01.T01:intron
TAAACTCGGAAGAGGAGAAA+GGG 0.517645 contig369end:-11179 MsG0080048602.01.T01:CDS
GAAGGGAAGTGCATCGGCGC+CGG 0.519334 contig369end:+11600 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TCTCTGACTGTCTTTACAAT+CGG 0.522319 contig369end:+10131 MsG0080048602.01.T01:intergenic
ACATCCTATTGTGAGGGTAC+AGG 0.522752 contig369end:+5173 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TCTGTACTTTCAGAAAGGTC+GGG 0.524726 contig369end:+9295 MsG0080048602.01.T01:intergenic
AGTGTTACTTTCGTTTGGGA+AGG 0.526344 contig369end:-7719 MsG0080048602.01.T01:CDS
ATCCTAATCTTTCGCTAGAA+GGG 0.527501 contig369end:+9427 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TATAACAAGTGCTTGGAGTC+CGG 0.529113 contig369end:-9133 MsG0080048602.01.T01:intron
TCTGAAGATGCTCAAGTGAA+TGG 0.532480 contig369end:-10497 MsG0080048602.01.T01:CDS
CAAGTGTAAAATTGTGGAGA+TGG 0.532769 contig369end:-7755 MsG0080048602.01.T01:CDS
TGGAATTGAAGAGTCTTGTA+CGG 0.533452 contig369end:-10477 MsG0080048602.01.T01:CDS
CTGGTTCCCATAACTGGTAT+CGG 0.534470 contig369end:-8734 MsG0080048602.01.T01:CDS
ACTTGAGTAACTATCATGGA+TGG 0.535580 contig369end:+7773 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TCTCATCTGTACTTTCAGAA+AGG 0.535948 contig369end:+9290 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TAAGAAATTAAACTCGGAAG+AGG 0.536672 contig369end:-11187 MsG0080048602.01.T01:CDS
TTGACGGCGTCGGCGTTGAA+AGG 0.537641 contig369end:+11528 MsG0080048602.01.T01:intergenic
ATTCCTTAGCTTTATGAGCA+CGG 0.542261 contig369end:+9493 MsG0080048602.01.T01:intergenic
CAAAAGTTCTTGTATTGTAG+CGG 0.543496 contig369end:+7494 MsG0080048602.01.T01:intergenic
GTTACTCAAGTGTAAAATTG+TGG 0.544184 contig369end:-7761 MsG0080048602.01.T01:CDS
CCTGTCACCAATGGAGACTC+AGG 0.544866 contig369end:-9629 MsG0080048602.01.T01:intron
GGGCTTTAAACCTCCGGCAT+GGG 0.545080 contig369end:-10456 MsG0080048602.01.T01:CDS
TGTCAAACTCAGGAAGCAAT+CGG 0.546387 contig369end:-11460 MsG0080048602.01.T01:CDS
GTCAAAGCCCCAAGTCGGCA+AGG 0.548065 contig369end:+5214 MsG0080048602.01.T01:intergenic
GGAATTGAAGAGTCTTGTAC+GGG 0.553282 contig369end:-10476 MsG0080048602.01.T01:CDS
ATTATTCCCTTGCCGACTTG+GGG 0.553943 contig369end:-5221 MsG0080048602.01.T01:CDS
GGCGTTGAAAGGAGCAAAGG+GGG 0.554389 contig369end:+11539 MsG0080048602.01.T01:intergenic
AAGTTGTCTTTAAAACAAGA+AGG 0.557340 contig369end:+10431 MsG0080048602.01.T01:intergenic
CGGGCTTTAAACCTCCGGCA+TGG 0.558729 contig369end:-10457 MsG0080048602.01.T01:CDS
TCGCTCCGATCAGGTAAGTG+AGG 0.561591 contig369end:-11355 MsG0080048602.01.T01:CDS
CCTACCGCCGCAACCGCACG+TGG 0.563173 contig369end:-11501 MsG0080048602.01.T01:CDS
GACTCATACGTGTTGCTGCA+CGG 0.563705 contig369end:+9370 MsG0080048602.01.T01:intergenic
AGGAATCTGTTGACAGCAAG+AGG 0.564401 contig369end:-10999 MsG0080048602.01.T01:CDS
CATCCCAAATTCAATGTCAC+CGG 0.565284 contig369end:-11619 None:intergenic
TTGAATCTAGAAAATTTCAT+GGG 0.565406 contig369end:-8704 MsG0080048602.01.T01:CDS
GTCATCACATTCTGATGTGA+TGG 0.565578 contig369end:-9718 MsG0080048602.01.T01:CDS
AAGACAACCACCAGTCAGGA+TGG 0.565848 contig369end:-10539 MsG0080048602.01.T01:CDS
AAGGATTAGAGAAGCTCTAG+AGG 0.567222 contig369end:-9343 MsG0080048602.01.T01:CDS
ATCTAGAAAATTTCATGGGT+AGG 0.567239 contig369end:-8700 MsG0080048602.01.T01:CDS
GCGATGTTATAACAAGTGCT+TGG 0.567499 contig369end:-9140 MsG0080048602.01.T01:CDS
GTTTGCTGATTACGGGGAGA+GGG 0.567524 contig369end:-11052 MsG0080048602.01.T01:CDS
CGGCTTCGACCTTCCACGTG+CGG 0.567733 contig369end:+11488 MsG0080048602.01.T01:intergenic
GACAGAACCTGAGTCTCCAT+TGG 0.570339 contig369end:+9622 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TACTCTTAACCATTCATGCA+AGG 0.570399 contig369end:+6532 MsG0080048602.01.T01:intergenic
GGTTTGCTGATTACGGGGAG+AGG 0.571612 contig369end:-11053 MsG0080048602.01.T01:CDS
GAAAATTGTACGGAAGATAC+GGG 0.572076 contig369end:+9762 MsG0080048602.01.T01:intergenic
AGCCGAGACTTGTCAAACTC+AGG 0.574180 contig369end:-11470 MsG0080048602.01.T01:CDS
GGTGTTAATAGTTAGTAAAG+GGG 0.574416 contig369end:-8923 MsG0080048602.01.T01:CDS
TAATCTTTCGCTAGAAGGGA+CGG 0.575166 contig369end:+9431 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TTGAAGCAGCCTGTCACCAA+TGG 0.575547 contig369end:-9638 MsG0080048602.01.T01:CDS
CTGGTGGTTGTCTTAGAACA+AGG 0.576000 contig369end:+10548 MsG0080048602.01.T01:intergenic
AAACAAGAAGGATCCCATGC+CGG 0.578489 contig369end:+10443 MsG0080048602.01.T01:intergenic
AGAATGTGGAGTTGTGTCAT+CGG 0.578611 contig369end:+11566 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TCTGACAGCGCCAAAGCTTG+CGG 0.580297 contig369end:-10629 MsG0080048602.01.T01:intron
CTTAGAAACATCCTATTGTG+AGG 0.580316 contig369end:+5166 MsG0080048602.01.T01:intergenic
CCGCCGCAACCGCACGTGGA+AGG 0.581540 contig369end:-11497 MsG0080048602.01.T01:CDS
GGTTCTGGTCTTAGACCTTG+CGG 0.587306 contig369end:+11428 MsG0080048602.01.T01:intergenic
AGAAATTTAGGAGGAAAATG+GGG 0.587523 contig369end:-9822 MsG0080048602.01.T01:intron
GGTAAGTGGTGAAAATTGTA+CGG 0.588702 contig369end:+9752 MsG0080048602.01.T01:intergenic
GAACCGTGCTCATAAAGCTA+AGG 0.590318 contig369end:-9496 MsG0080048602.01.T01:CDS
AAGATGCAGTCCGAAGTGTT+CGG 0.593687 contig369end:-10021 MsG0080048602.01.T01:CDS
GAAGATGTTAAGTCGAAGAG+TGG 0.594496 contig369end:-10886 MsG0080048602.01.T01:CDS
ATCGGAGAAGGGAAGTGCAT+CGG 0.596046 contig369end:+11594 MsG0080048602.01.T01:intergenic
AAAACCCTCACTTACCTGAT+CGG 0.596206 contig369end:+11350 MsG0080048602.01.T01:intergenic
GTCGGCGTTGAAAGGAGCAA+AGG 0.597053 contig369end:+11536 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TGTAAAGACAGTCAGAGAGG+TGG 0.597397 contig369end:-10126 MsG0080048602.01.T01:CDS
GCAGCAACACGTATGAGTCT+GGG 0.598784 contig369end:-9366 MsG0080048602.01.T01:CDS
GTCCAAAATGGAACTGCTCA+AGG 0.599107 contig369end:-10596 MsG0080048602.01.T01:CDS
CCTTCCACGTGCGGTTGCGG+CGG 0.600483 contig369end:+11497 MsG0080048602.01.T01:intergenic
CCTTGATGAAAATTATGCAA+AGG 0.602678 contig369end:-6751 MsG0080048602.01.T01:intron
GCCACCGCAGTTGAAAATGA+AGG 0.602808 contig369end:-11402 MsG0080048602.01.T01:CDS
ACTGAACATCAACGATCATG+AGG 0.604078 contig369end:-10788 MsG0080048602.01.T01:CDS
TCAAAGCCCCAAGTCGGCAA+GGG 0.606684 contig369end:+5215 MsG0080048602.01.T01:intergenic
CTTGAGTAACTATCATGGAT+GGG 0.607164 contig369end:+7774 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TTCATGGTTTGCTGATTACG+GGG 0.607216 contig369end:-11058 MsG0080048602.01.T01:CDS
ATTGCTCCAAATGAAGGCGG+AGG 0.607908 contig369end:-8042 MsG0080048602.01.T01:CDS
GACATGTTCGCAGTGGTAAG+TGG 0.609310 contig369end:+9738 MsG0080048602.01.T01:intergenic
GCAAACCATGAATTCCACTT+AGG 0.609553 contig369end:+11069 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TATCTAGTAATATCAAATCA+CGG 0.610379 contig369end:-6869 MsG0080048602.01.T01:CDS
AGACAACCACCAGTCAGGAT+GGG 0.610723 contig369end:-10538 MsG0080048602.01.T01:CDS
TCTCTTCAGAGTTTGAGGTG+AGG 0.610966 contig369end:+9959 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TCACATGTAAGTAGTAGCAA+TGG 0.612024 contig369end:-10736 MsG0080048602.01.T01:CDS
AATGGTGATGTTGATAAAGG+TGG 0.612830 contig369end:-10931 MsG0080048602.01.T01:CDS
GTTGTGTCATCGGAGTTGAT+CGG 0.613425 contig369end:+11576 MsG0080048602.01.T01:intergenic
CATCGGAGTTGATCGGAGAA+GGG 0.614036 contig369end:+11583 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TATTGGAGTCTACGTTTCTG+GGG 0.614378 contig369end:-8645 MsG0080048602.01.T01:intron
TTAGAAACATCCTATTGTGA+GGG 0.615023 contig369end:+5167 MsG0080048602.01.T01:intergenic
AGGAATTCGGGTAATGGACC+CGG 0.616549 contig369end:-10979 MsG0080048602.01.T01:CDS
AGCCATGCTGCAATCCGCAA+TGG 0.619597 contig369end:+6779 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TCAAATTGCTGATGCCATTG+CGG 0.621776 contig369end:-6793 MsG0080048602.01.T01:CDS
TGCCATTGCGGATTGCAGCA+TGG 0.622816 contig369end:-6781 MsG0080048602.01.T01:CDS
TCTGATCCCATCCTGACTGG+TGG 0.623309 contig369end:+10532 MsG0080048602.01.T01:intergenic
AAAGCTACTACCGAACACTT+CGG 0.624764 contig369end:+10011 MsG0080048602.01.T01:intergenic
CTGAACATCAACGATCATGA+GGG 0.625359 contig369end:-10787 MsG0080048602.01.T01:CDS
TCCGAACAGAAAGAAAGTGA+TGG 0.634127 contig369end:-11279 MsG0080048602.01.T01:CDS
TGTGTTTGGAGGAAGTCACA+AGG 0.636581 contig369end:-10711 MsG0080048602.01.T01:intron
CCGGAGTCAAAGCCCCAAGT+CGG 0.638477 contig369end:+5209 MsG0080048602.01.T01:intergenic
GGGAAACTATACAGAAGCAG+TGG 0.640234 contig369end:-6910 MsG0080048602.01.T01:CDS
GCGTTGAAAGGAGCAAAGGG+GGG 0.654914 contig369end:+11540 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TGCAGAAAAGAATTTCCGCA+CGG 0.655824 contig369end:-7823 MsG0080048602.01.T01:CDS
AGCTCTAGAGGATTGCACAA+TGG 0.656021 contig369end:-9331 MsG0080048602.01.T01:CDS
AAGCTTGATGAGCAGCAGCA+CGG 0.659642 contig369end:+6820 MsG0080048602.01.T01:intergenic
AATCGGCGTCACAAACCGCA+AGG 0.659869 contig369end:-11443 MsG0080048602.01.T01:CDS
CGGCGTTGAAAGGAGCAAAG+GGG 0.662783 contig369end:+11538 MsG0080048602.01.T01:intergenic
TGTAAGTAAGAAATTAAACT+CGG 0.665065 contig369end:-11193 MsG0080048602.01.T01:CDS
TCTTAGGCAAGACTGTATCA+GGG 0.671094 contig369end:+10040 MsG0080048602.01.T01:intergenic
GCTGAGGAACTCTACACACA+AGG 0.671125 contig369end:-9462 MsG0080048602.01.T01:CDS
CAAGAAGGATCCCATGCCGG+AGG 0.678592 contig369end:+10446 MsG0080048602.01.T01:intergenic
AAGATTGCTCCAAATGAAGG+CGG 0.679324 contig369end:-8045 MsG0080048602.01.T01:CDS
GATAAAGGTGGTGATAAGTG+TGG 0.681944 contig369end:-10919 MsG0080048602.01.T01:CDS
AAGAACTTAAAGATGGACTG+TGG 0.684658 contig369end:-6596 MsG0080048602.01.T01:CDS
CAACACGTATGAGTCTGGGA+AGG 0.697473 contig369end:-9362 MsG0080048602.01.T01:CDS
TCTTAACCATTCATGCAAGG+TGG 0.722475 contig369end:+6535 MsG0080048602.01.T01:intergenic
AAGGTCTAAGACCAGAACCA+CGG 0.726437 contig369end:-11424 MsG0080048602.01.T01:CDS
GATTGTAAAGACAGTCAGAG+AGG 0.740620 contig369end:-10129 MsG0080048602.01.T01:CDS
TGTCTGCACTATTTGCCGTG+CGG 0.744073 contig369end:+7808 MsG0080048601.01.T01:intergenic
ATGTGATGACATGTTCGCAG+TGG 0.759657 contig369end:+9731 MsG0080048601.01.T01:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! AATTTTACAAAATTTGTTTT+TGG - contig369end:5634-5653 MsG0080048602.01.T01:intron 10.0%
!!! TTTTAAGAAGAATAATAATA+AGG + contig369end:9824-9843 MsG0080048602.01.T01:intergenic 10.0%
!! AAAAGTGATAATATTTCATA+AGG + contig369end:9464-9483 MsG0080048602.01.T01:intergenic 15.0%
!! AAATCTTGACTTATAAAATT+AGG - contig369end:10087-10106 MsG0080048602.01.T01:CDS 15.0%
!! AATAAACAATATTCAACTTA+AGG + contig369end:11019-11038 MsG0080048602.01.T01:intergenic 15.0%
!! ATTATGAAATAACTAATTTG+AGG + contig369end:10713-10732 MsG0080048602.01.T01:intergenic 15.0%
!! ATTTATTAAGAACTTAAAGA+TGG - contig369end:10181-10200 MsG0080048602.01.T01:intron 15.0%
!! GTTATACATTAATTCATAAA+TGG + contig369end:9496-9515 MsG0080048602.01.T01:intergenic 15.0%
!! TAGTTATTAAAATGTCTTAA+CGG - contig369end:9376-9395 MsG0080048602.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTAGTTATTTCATAATTGTA+TGG - contig369end:10717-10736 MsG0080048602.01.T01:CDS 15.0%
!! AAAAAAATGCTAGATTGAAA+TGG + contig369end:9191-9210 MsG0080048602.01.T01:intergenic 20.0%
!! AACTGCAAACATAATTATAA+GGG + contig369end:11521-11540 MsG0080048602.01.T01:intergenic 20.0%
!! AGAGTCAATATACAAATAAT+AGG + contig369end:9798-9817 MsG0080048602.01.T01:intergenic 20.0%
!! AGGAAATGATAACTTTAAAT+TGG - contig369end:9853-9872 MsG0080048602.01.T01:intron 20.0%
!! AGTTATTAAAATGTCTTAAC+GGG - contig369end:9377-9396 MsG0080048602.01.T01:CDS 20.0%
!! ATAAAAAATTTCCACTTCTT+TGG + contig369end:9621-9640 MsG0080048602.01.T01:intergenic 20.0%
!! ATCTGTTATTATGTTAGATA+TGG - contig369end:7824-7843 MsG0080048602.01.T01:CDS 20.0%
!! ATTATCTCCCTTATAATATA+TGG - contig369end:11283-11302 MsG0080048602.01.T01:CDS 20.0%
!! GGAAATGATAACTTTAAATT+GGG - contig369end:9854-9873 MsG0080048602.01.T01:intron 20.0%
!! TAACTGCAAACATAATTATA+AGG + contig369end:11522-11541 MsG0080048602.01.T01:intergenic 20.0%
!! TACCTTACCATATATTATAA+GGG + contig369end:11293-11312 MsG0080048602.01.T01:intergenic 20.0%
!! TATCTAGTAATATCAAATCA+CGG - contig369end:9915-9934 MsG0080048602.01.T01:intron 20.0%
!! TCTGTTATTATGTTAGATAT+GGG - contig369end:7825-7844 MsG0080048602.01.T01:CDS 20.0%
!! TGTAAGTAAGAAATTAAACT+CGG - contig369end:5591-5610 MsG0080048602.01.T01:intron 20.0%
!! TGTAAGTTCTTTATTCAATT+GGG - contig369end:10454-10473 MsG0080048602.01.T01:CDS 20.0%
!! TTACCTTACCATATATTATA+AGG + contig369end:11294-11313 MsG0080048602.01.T01:intergenic 20.0%
!! TTGAATCTAGAAAATTTCAT+GGG - contig369end:8080-8099 MsG0080048602.01.T01:CDS 20.0%
!! TTGTAAGTTCTTTATTCAAT+TGG - contig369end:10453-10472 MsG0080048602.01.T01:CDS 20.0%
!! TTTGAATCTAGAAAATTTCA+TGG - contig369end:8079-8098 MsG0080048602.01.T01:CDS 20.0%
!!! AACATACTTATTCTTTTGTT+TGG + contig369end:9713-9732 MsG0080048602.01.T01:intergenic 20.0%
!!! AATTTTCATTTGATGTTTCA+TGG - contig369end:10133-10152 MsG0080048602.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATAAAGTTGCTGTTTATTTA+TGG - contig369end:8875-8894 MsG0080048602.01.T01:intron 20.0%
!!! ATAAGACATTTAGTATTGAA+AGG + contig369end:9216-9235 MsG0080048602.01.T01:intergenic 20.0%
!!! ATGGAATCTGATAATTTTTA+TGG - contig369end:10152-10171 MsG0080048602.01.T01:intron 20.0%
!!! GATATCAAATGTTTAAAACA+GGG - contig369end:10739-10758 MsG0080048602.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATATCTTTATTTAGATACC+TGG - contig369end:10495-10514 MsG0080048602.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTGAAGATTTGTATCATTTT+AGG - contig369end:9756-9775 MsG0080048602.01.T01:CDS 20.0%
! AAGAAATTTAGGAGGAAAAT+GGG - contig369end:6961-6980 MsG0080048602.01.T01:intron 25.0%
! AATATCAGCAATGATATAGA+TGG - contig369end:11350-11369 MsG0080048602.01.T01:CDS 25.0%
! ACAAAATGAGATAAAAGTCA+GGG + contig369end:10437-10456 MsG0080048602.01.T01:intergenic 25.0%
! ACAAATCTCTATATAAGAAG+AGG - contig369end:9520-9539 MsG0080048602.01.T01:intron 25.0%
! AGTAAATCTTCCAAAGAAAA+AGG - contig369end:6416-6435 MsG0080048602.01.T01:intron 25.0%
! ATCTAACATAATAACAGATC+AGG + contig369end:7823-7842 MsG0080048602.01.T01:intergenic 25.0%
! ATTCAGCTCTTTAATTAGTT+TGG - contig369end:7194-7213 MsG0080048602.01.T01:intron 25.0%
! CAGATAAACTAACTACAATA+TGG + contig369end:9581-9600 MsG0080048602.01.T01:intergenic 25.0%
! GTAAACAGAAGAAGAAATTT+AGG - contig369end:6950-6969 MsG0080048602.01.T01:intron 25.0%
! GTAGAAAGATGAGAAAAAAT+AGG - contig369end:10869-10888 MsG0080048602.01.T01:CDS 25.0%
! TAAAGAGCTGAATTTATTCA+TGG + contig369end:7187-7206 MsG0080048602.01.T01:intergenic 25.0%
! TACAAAATGAGATAAAAGTC+AGG + contig369end:10438-10457 MsG0080048602.01.T01:intergenic 25.0%
! TATTGGATTACAAACAGTAT+TGG - contig369end:8122-8141 MsG0080048602.01.T01:CDS 25.0%
! TGTGTAAATGAATTTGTGTT+CGG - contig369end:5757-5776 MsG0080048602.01.T01:intron 25.0%
! TTAGAAAGATGAGGAAAAAT+AGG - contig369end:10667-10686 MsG0080048602.01.T01:intron 25.0%
! TTCTGTTACTGTTAGTTAAA+AGG - contig369end:8225-8244 MsG0080048602.01.T01:intron 25.0%
! TTTGCAAATATCCTAATTTC+AGG + contig369end:10916-10935 MsG0080048602.01.T01:intergenic 25.0%
!! AAGGGAATAATTTGTATCAT+TGG + contig369end:11554-11573 MsG0080048602.01.T01:intergenic 25.0%
!! AGGGAATAATTTGTATCATT+GGG + contig369end:11553-11572 MsG0080048602.01.T01:intergenic 25.0%
!! ATTCAATCTTTTATCAAGCA+AGG - contig369end:9150-9169 MsG0080048602.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTGTAGTTAGTTTATCTGT+TGG - contig369end:9582-9601 MsG0080048602.01.T01:intron 25.0%
!! CTTTGCATAATTTTCATCAA+GGG + contig369end:10035-10054 MsG0080048602.01.T01:intergenic 25.0%
!! GGATATCAAATGTTTAAAAC+AGG - contig369end:10738-10757 MsG0080048602.01.T01:CDS 25.0%
!! TGGTGTTAATAGTTAGTAAA+GGG - contig369end:7860-7879 MsG0080048602.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAAGTTGCTTTTTGTTTGAA+TGG - contig369end:10521-10540 MsG0080048602.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAGTTGTCTTTAAAACAAGA+AGG + contig369end:6356-6375 MsG0080048602.01.T01:intergenic 25.0%
!!! GACATTTTAATAACTACCAT+TGG + contig369end:9372-9391 MsG0080048602.01.T01:intergenic 25.0%
!!! GTATTTTGATCCTTTTTCTT+TGG + contig369end:6429-6448 MsG0080048602.01.T01:intergenic 25.0%
!!! GTTAGTTTGTTAATTAGACT+GGG - contig369end:8272-8291 MsG0080048602.01.T01:intron 25.0%
!!! TGCTTTAGAACTACTTATAA+AGG - contig369end:8691-8710 MsG0080048602.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTCTTTTTTGCAATGTGATA+TGG - contig369end:9644-9663 MsG0080048602.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTGGTGTTAATAGTTAGTAA+AGG - contig369end:7859-7878 MsG0080048602.01.T01:CDS 25.0%
AAAAATCTAGTGTACCTAAG+TGG - contig369end:5701-5720 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
AAAATGAGATAAAAGTCAGG+GGG + contig369end:10435-10454 MsG0080048602.01.T01:intergenic 30.0%
AACAGAAGAAGAAATTTAGG+AGG - contig369end:6953-6972 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
AACTACGATTTAGAAAGATG+AGG - contig369end:10658-10677 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
AATAATTGCACTAGATTTGC+AGG - contig369end:10211-10230 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
AATTAGTGTTACCAAAGAAG+TGG - contig369end:9607-9626 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
AATTATGAGTTACTCGCTAA+CGG + contig369end:7931-7950 MsG0080048602.01.T01:intergenic 30.0%
AGAAATTTAGGAGGAAAATG+GGG - contig369end:6962-6981 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
AGAGCAGAAAAGAGAATTAT+TGG + contig369end:7745-7764 MsG0080048602.01.T01:intergenic 30.0%
ATCTAGAAAATTTCATGGGT+AGG - contig369end:8084-8103 MsG0080048602.01.T01:CDS 30.0%
CAAAAGTTCTTGTATTGTAG+CGG + contig369end:9293-9312 MsG0080048602.01.T01:intergenic 30.0%
CAAAATGAGATAAAAGTCAG+GGG + contig369end:10436-10455 MsG0080048602.01.T01:intergenic 30.0%
CCTTGATGAAAATTATGCAA+AGG - contig369end:10033-10052 MsG0080048602.01.T01:CDS 30.0%
CTCCCTTATAATATATGGTA+AGG - contig369end:11288-11307 MsG0080048602.01.T01:CDS 30.0%
GAAAATGTGTAATGACTAAG+TGG - contig369end:10964-10983 MsG0080048602.01.T01:CDS 30.0%
GAAGAAATTTAGGAGGAAAA+TGG - contig369end:6960-6979 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
GAAGATTTACTCTTATGTGT+GGG + contig369end:6407-6426 MsG0080048602.01.T01:intergenic 30.0%
GCAACAAAAAAAGAAACAAC+AGG + contig369end:8822-8841 MsG0080048602.01.T01:intergenic 30.0%
GGTGTTAATAGTTAGTAAAG+GGG - contig369end:7861-7880 MsG0080048602.01.T01:CDS 30.0%
GTTACTCAAGTGTAAAATTG+TGG - contig369end:9023-9042 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
TAAGAAATTAAACTCGGAAG+AGG - contig369end:5597-5616 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
TAATAGTTAGTAAAGGGGTA+GGG - contig369end:7866-7885 MsG0080048602.01.T01:CDS 30.0%
TACAGAAAAACTTCCATAAC+AGG + contig369end:6704-6723 MsG0080048602.01.T01:intergenic 30.0%
TATTTCCCTTTGTTGATGTT+TGG - contig369end:11035-11054 MsG0080048602.01.T01:CDS 30.0%
TCTATAAATAGGAACGAAGA+AGG - contig369end:7895-7914 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
TGAAAATTGTACGGAAGATA+CGG + contig369end:7026-7045 MsG0080048602.01.T01:intergenic 30.0%
TGATATTAAACTGACATCAG+TGG + contig369end:11337-11356 MsG0080048602.01.T01:intergenic 30.0%
TGTTTGGATCAAACTTAATC+AGG + contig369end:9697-9716 MsG0080048602.01.T01:intergenic 30.0%
TTAATAGTTAGTAAAGGGGT+AGG - contig369end:7865-7884 MsG0080048602.01.T01:CDS 30.0%
TTACACTTGAGTAACTATCA+TGG + contig369end:9018-9037 MsG0080048602.01.T01:intergenic 30.0%
TTGCTATAGCACAGTAAAAA+AGG + contig369end:7394-7413 MsG0080048602.01.T01:intergenic 30.0%
TTGTTATCTCCAAATGTGAA+TGG - contig369end:6995-7014 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
! AAAGATTTTGCATTTTCTGC+AGG - contig369end:6895-6914 MsG0080048602.01.T01:CDS 30.0%
! AAGTTGATTCTGATTCTGTT+AGG - contig369end:5473-5492 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
! AATAATTTGTATCATTGGGC+TGG + contig369end:11549-11568 MsG0080048602.01.T01:intergenic 30.0%
! ACAAATGGTGATGTTGATAA+AGG - contig369end:5850-5869 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
! ACGATCTACCTATTTTATCT+AGG - contig369end:7263-7282 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
! AGTTGATTCTGATTCTGTTA+GGG - contig369end:5474-5493 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
! ATCTACCTATTTTATCTAGG+GGG - contig369end:7266-7285 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
! ATTTTTAATGACCGACTAAG+TGG - contig369end:10763-10782 MsG0080048602.01.T01:CDS 30.0%
! CCTTTGCATAATTTTCATCA+AGG + contig369end:10036-10055 MsG0080048602.01.T01:intergenic 30.0%
! CGATCTACCTATTTTATCTA+GGG - contig369end:7264-7283 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
! GATATAGATGGATTCACAAT+GGG - contig369end:11362-11381 MsG0080048602.01.T01:CDS 30.0%
! GATCTACCTATTTTATCTAG+GGG - contig369end:7265-7284 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
! TAATTTGAGGTTACGAAACA+TGG + contig369end:10700-10719 MsG0080048602.01.T01:intergenic 30.0%
! TCAAGTGAACTGTTTTCTTT+TGG + contig369end:6512-6531 MsG0080048602.01.T01:intergenic 30.0%
! TCAATTTTCCAAAAATCAGC+TGG - contig369end:8031-8050 MsG0080048602.01.T01:CDS 30.0%
! TGATAGAAACTGATTTCTCA+TGG + contig369end:8468-8487 MsG0080048602.01.T01:intergenic 30.0%
! TGATATAGATGGATTCACAA+TGG - contig369end:11361-11380 MsG0080048602.01.T01:CDS 30.0%
! TGTTATGGAAGTTTTTCTGT+AGG - contig369end:6703-6722 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
!! AATTCATGGTTTGCTGATTA+CGG - contig369end:5724-5743 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
!! AGTTGATGAAACCTGAAATT+AGG - contig369end:10902-10921 MsG0080048602.01.T01:CDS 30.0%
!! ATCTAAGTGTTACTTTCGTT+TGG - contig369end:9060-9079 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
!! CGAGTAACTCATAATTTGTT+CGG - contig369end:7935-7954 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
!! GCTGATTTTTGGAAAATTGA+AGG + contig369end:8031-8050 MsG0080048602.01.T01:intergenic 30.0%
!! GGTTAGTTTGTTAATTAGAC+TGG - contig369end:8271-8290 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
!! TCTAAGTGTTACTTTCGTTT+GGG - contig369end:9061-9080 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
!!! GCTGATGTATTTTTTGTTGA+TGG - contig369end:6853-6872 MsG0080048602.01.T01:CDS 30.0%
!!! GTATTTTTTGTTGATGGTCT+GGG - contig369end:6859-6878 MsG0080048602.01.T01:CDS 30.0%
!!! TAAGGAATTTTCTAAAGCTG+AGG - contig369end:7306-7325 MsG0080048602.01.T01:intron 30.0%
!!! TGTATTTTTTGTTGATGGTC+TGG - contig369end:6858-6877 MsG0080048602.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTTTCTCTTCAGAGTTTG+AGG + contig369end:6833-6852 MsG0080048602.01.T01:intergenic 30.0%
AAACGTTAGTTGGACTTAAG+AGG - contig369end:11393-11412 MsG0080048602.01.T01:CDS 35.0%
AAATGAGATAAAAGTCAGGG+GGG + contig369end:10434-10453 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
AAGACATGTTACCTGCAAAT+AGG - contig369end:8314-8333 MsG0080048602.01.T01:intron 35.0%
AATAGTTAGTAAAGGGGTAG+GGG - contig369end:7867-7886 MsG0080048602.01.T01:CDS 35.0%
ACAAAAAGCAACTTTGTTCC+AGG + contig369end:10516-10535 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
ACAAAGGTGAATGTTTGTGT+GGG - contig369end:8186-8205 MsG0080048602.01.T01:intron 35.0%
ACACCTAACAGAAATTAGCA+AGG + contig369end:7220-7239 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
ACCATCACTTTCTTTCTGTT+CGG + contig369end:5509-5528 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
ACTTGAGTAACTATCATGGA+TGG + contig369end:9014-9033 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
AGAAAGATTGCTCCAAATGA+AGG - contig369end:8736-8755 MsG0080048602.01.T01:CDS 35.0%
AGACATGTTACCTGCAAATA+GGG - contig369end:8315-8334 MsG0080048602.01.T01:intron 35.0%
AGATGAGAACTGCTAAGTAA+GGG - contig369end:7509-7528 MsG0080048602.01.T01:CDS 35.0%
AGATTACCTATCAGCAATGA+AGG - contig369end:11126-11145 MsG0080048602.01.T01:CDS 35.0%
AGCAGATGATGAAGATCTAA+AGG - contig369end:6591-6610 MsG0080048602.01.T01:CDS 35.0%
ATCCTAATCTTTCGCTAGAA+GGG + contig369end:7360-7379 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
ATCTGTACTTTCAGAAAGGT+CGG + contig369end:7493-7512 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
ATGGTATAGATAGAGAGATC+AGG + contig369end:11422-11441 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
CAAGATTTCACCTGATTGAA+AGG + contig369end:10075-10094 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
CAAGTGTAAAATTGTGGAGA+TGG - contig369end:9029-9048 MsG0080048602.01.T01:intron 35.0%
CACATGTCATTATAAGTGAG+AGG + contig369end:7574-7593 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
CACTAAAGTTCTCAACCTAA+GGG + contig369end:10820-10839 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
CCAAAACAAATTGCTGCAAA+AGG + contig369end:9941-9960 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
CCATAAAGATAACCCTAAAG+TGG + contig369end:10598-10617 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
CTCTCACTTATAATGACATG+TGG - contig369end:7572-7591 MsG0080048602.01.T01:intron 35.0%
CTTGAGTAACTATCATGGAT+GGG + contig369end:9013-9032 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
GAAAATTGTACGGAAGATAC+GGG + contig369end:7025-7044 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
GATCCAAACAACAACTTTAC+CGG + contig369end:7673-7692 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
GATTACCTATCAGCAATGAA+GGG - contig369end:11127-11146 MsG0080048602.01.T01:CDS 35.0%
GCATTCATGAATGCCATATA+GGG + contig369end:9350-9369 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
GGAAGATTTACTCTTATGTG+TGG + contig369end:6408-6427 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
GGTAAGTGGTGAAAATTGTA+CGG + contig369end:7035-7054 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
TAACATGAACTTTCACCTTG+AGG - contig369end:8163-8182 MsG0080048602.01.T01:CDS 35.0%
TAAGGACATGCAAGAAATCT+AGG + contig369end:9446-9465 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
TACTCTTAACCATTCATGCA+AGG + contig369end:10255-10274 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
TATGCTCATTTCAACTGTGT+AGG - contig369end:9233-9252 MsG0080048602.01.T01:intron 35.0%
TCACATGTAAGTAGTAGCAA+TGG - contig369end:6048-6067 MsG0080048602.01.T01:intron 35.0%
TCTCATCTGTACTTTCAGAA+AGG + contig369end:7497-7516 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
TCTCTGACTGTCTTTACAAT+CGG + contig369end:6656-6675 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
TGAGTGTTATCCTCATTAAC+AGG - contig369end:8601-8620 MsG0080048602.01.T01:intron 35.0%
TGATTGAAAGGACTTCAGAA+AGG + contig369end:10063-10082 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
TGGATCTCAATCCAATGAAA+AGG - contig369end:10317-10336 MsG0080048602.01.T01:intron 35.0%
TGGTATAGATAGAGAGATCA+GGG + contig369end:11421-11440 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
TTAACCACTTCCTGTTAATG+AGG + contig369end:8614-8633 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
TTACTTACATCACCAGAAAC+CGG + contig369end:5580-5599 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
TTATCCTCATTAACAGGAAG+TGG - contig369end:8607-8626 MsG0080048602.01.T01:intron 35.0%
TTCATGGGTAGGAAATTCTA+TGG - contig369end:8095-8114 MsG0080048602.01.T01:CDS 35.0%
! AAATGTGTCAGAATCCCTTT+TGG - contig369end:10569-10588 MsG0080048602.01.T01:CDS 35.0%
! AATGGTGATGTTGATAAAGG+TGG - contig369end:5853-5872 MsG0080048602.01.T01:intron 35.0%
! ACAAGAACTTTTGAACCACA+GGG - contig369end:9300-9319 MsG0080048602.01.T01:CDS 35.0%
! AGAACCTTCATTTTCAACTG+CGG + contig369end:5389-5408 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
! TACAAGAACTTTTGAACCAC+AGG - contig369end:9299-9318 MsG0080048602.01.T01:CDS 35.0%
! TAGTAGCAATGGTTTGTGTT+TGG - contig369end:6059-6078 MsG0080048602.01.T01:intron 35.0%
! TATAGAGATTCATGCCCTTT+TGG + contig369end:9549-9568 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
! TGGAATTGAAGAGTCTTGTA+CGG - contig369end:6307-6326 MsG0080048602.01.T01:intron 35.0%
!! AACTCATAATTTGTTCGGAG+AGG - contig369end:7940-7959 MsG0080048602.01.T01:intron 35.0%
!! AAGAACTTAAAGATGGACTG+TGG - contig369end:10188-10207 MsG0080048602.01.T01:intron 35.0%
!! AAGGTTTCTAGTGTTAGTTC+GGG - contig369end:6092-6111 MsG0080048602.01.T01:intron 35.0%
!! AGGAGACTTATTTCTGTTCT+TGG - contig369end:10297-10316 MsG0080048602.01.T01:intron 35.0%
!! ATTCATGGTTTGCTGATTAC+GGG - contig369end:5725-5744 MsG0080048602.01.T01:intron 35.0%
!! ATTCCTTAGCTTTATGAGCA+CGG + contig369end:7294-7313 MsG0080048602.01.T01:intergenic 35.0%
!! CAAGGTTTCTAGTGTTAGTT+CGG - contig369end:6091-6110 MsG0080048602.01.T01:intron 35.0%
!! CCACTTTAGGGTTATCTTTA+TGG - contig369end:10595-10614 MsG0080048602.01.T01:CDS 35.0%
!! CCTTTTGCAGCAATTTGTTT+TGG - contig369end:9938-9957 MsG0080048602.01.T01:CDS 35.0%
!! GGTAAAGTTGTTGTTTGGAT+CGG - contig369end:7672-7691 MsG0080048602.01.T01:CDS 35.0%
!! TGAACGATCTTTTCAAGGAA+GGG - contig369end:7101-7120 MsG0080048602.01.T01:intron 35.0%
!! TTATTTTGTTCGCTCTCACA+AGG - contig369end:8554-8573 MsG0080048602.01.T01:intron 35.0%
!! TTTCTGAAGTCCTTTCAATC+AGG - contig369end:10062-10081 MsG0080048602.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTTGTTTGAATGGCTACC+TGG - contig369end:10529-10548 MsG0080048602.01.T01:CDS 35.0%
AAAACCCTCACTTACCTGAT+CGG + contig369end:5437-5456 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
AAAAGCCACCAGAAGATTCA+GGG + contig369end:6537-6556 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
AAAGCTACTACCGAACACTT+CGG + contig369end:6776-6795 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
AAAGGTGAATGTTTGTGTGG+GGG - contig369end:8188-8207 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
AAATGCCCTTCATTGCTGAT+AGG + contig369end:11135-11154 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
AACATTCACCTTTGTCCTCA+AGG + contig369end:8181-8200 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
AACTTTCACCTTGAGGACAA+AGG - contig369end:8170-8189 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
AAGATTGCTCCAAATGAAGG+CGG - contig369end:8739-8758 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
AATCGCAAATGGATCAAGTG+TGG - contig369end:10351-10370 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
AATTGCTCCGATACCAGTTA+TGG + contig369end:8060-8079 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
ACCCTCCAAACATCAACAAA+GGG + contig369end:11043-11062 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
ACTCATTCACATGCAACTCT+AGG + contig369end:7984-8003 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
ACTGAACATCAACGATCATG+AGG - contig369end:5996-6015 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
ACTTGAAACCCTGAATCTTC+TGG - contig369end:6526-6545 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
AGAATGTGGAGTTGTGTCAT+CGG + contig369end:5221-5240 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
AGAGGTGGAGATCTTGATAA+TGG - contig369end:6673-6692 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
AGCATGTGCATGATAGAAAC+TGG - contig369end:11228-11247 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
AGGTTGAGAACTTTAGTGGA+TGG - contig369end:10822-10841 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
AGTTATCATTTCCTGCATGC+TGG + contig369end:9847-9866 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
ATAGATGAAACCTCAGTCGA+TGG - contig369end:10623-10642 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
ATCAAACTATGCCATGGTCT+TGG + contig369end:11170-11189 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
ATCAAGTGTGGGAAAGAATC+AGG - contig369end:10363-10382 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
ATCGCAAATGGATCAAGTGT+GGG - contig369end:10352-10371 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
ATCTTAGGCAAGACTGTATC+AGG + contig369end:6748-6767 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
ATGGCATTCATGAATGCCAA+TGG - contig369end:9353-9372 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
ATTGCTCCGATACCAGTTAT+GGG + contig369end:8059-8078 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
ATTTCTCATGGCTGGAATCT+GGG + contig369end:8456-8475 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
CAAAGGTGAATGTTTGTGTG+GGG - contig369end:8187-8206 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
CAGATGAGAACTGCTAAGTA+AGG - contig369end:7508-7527 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
CAGGAACACATTAAGATGAG+TGG + contig369end:8803-8822 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
CATCCTAATCTTTCGCTAGA+AGG + contig369end:7361-7380 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
CCAAACATCTGAATCGCAAA+TGG - contig369end:10340-10359 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
CCACTAAAGTTCTCAACCTA+AGG + contig369end:10821-10840 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
CCATTTGCGATTCAGATGTT+TGG + contig369end:10343-10362 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
CTAAGCTGAGAATAGAGTAG+AGG + contig369end:11467-11486 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
CTACCTGGAACAAAGTTGTA+TGG - contig369end:10544-10563 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
CTGAACATCAACGATCATGA+GGG - contig369end:5997-6016 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
GAACAGAAATAAGTCTCCTG+AGG + contig369end:10296-10315 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
GAAGATGTTAAGTCGAAGAG+TGG - contig369end:5898-5917 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
GACAAAGGTGAATGTTTGTG+TGG - contig369end:8185-8204 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
GACATCTAGAAATTACCCTG+TGG + contig369end:9318-9337 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
GATAAAGGTGGTGATAAGTG+TGG - contig369end:5865-5884 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
GATTGTAAAGACAGTCAGAG+AGG - contig369end:6655-6674 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
GCAAACCATGAATTCCACTT+AGG + contig369end:5718-5737 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
GCAGTTGAAAATGAAGGTTC+TGG - contig369end:5388-5407 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
GCGACTGTTCTGCAATAAAA+GGG - contig369end:8422-8441 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
GCGATGTTATAACAAGTGCT+TGG - contig369end:7644-7663 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
GGAAATTCTATGGCAGCTAT+TGG - contig369end:8105-8124 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
GGAACAAATGGTGTCCAAAA+TGG - contig369end:6176-6195 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
GGAACGAAGAAGGAATCAAT+AGG - contig369end:7905-7924 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
GGCATTCATGAATGCCATAT+AGG + contig369end:9351-9370 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
GTATTGGAGTCTACGTTTCT+GGG - contig369end:8138-8157 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
GTCATCACATTCTGATGTGA+TGG - contig369end:7066-7085 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
GTGTACCTAAGTGGAATTCA+TGG - contig369end:5710-5729 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
GTTAAGTCGAAGAGTGGAAA+TGG - contig369end:5904-5923 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
GTTAGTTCGGGAACTAATAC+TGG - contig369end:6104-6123 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
TAAACTCGGAAGAGGAGAAA+GGG - contig369end:5605-5624 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
TAATCTTTCGCTAGAAGGGA+CGG + contig369end:7356-7375 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
TACAGGTGAAGATGAATTGC+CGG + contig369end:11597-11616 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
TACCTGGAAATCAGCCAAAA+GGG - contig369end:10406-10425 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
TAGGGGTGAGCTCTATAAAT+AGG - contig369end:7884-7903 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
TATAACAAGTGCTTGGAGTC+CGG - contig369end:7651-7670 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
TATTAACACCAACAAGCCTG+AGG + contig369end:7851-7870 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
TATTGGAGTCTACGTTTCTG+GGG - contig369end:8139-8158 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
TCAAATTGCTGATGCCATTG+CGG - contig369end:9991-10010 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
TCAAGTGTGGGAAAGAATCA+GGG - contig369end:10364-10383 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
TCATGAATGCCATATAGGGA+GGG + contig369end:9346-9365 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
TCCCTTTGTTGATGTTTGGA+GGG - contig369end:11039-11058 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
TCCGAACAGAAAGAAAGTGA+TGG - contig369end:5505-5524 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
TCTGAAGATGCTCAAGTGAA+TGG - contig369end:6287-6306 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
TCTGTACTTTCAGAAAGGTC+GGG + contig369end:7492-7511 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
TCTTAACCATTCATGCAAGG+TGG + contig369end:10252-10271 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
TCTTAGGCAAGACTGTATCA+GGG + contig369end:6747-6766 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
TCTTCTTAAAACCAGCATGC+AGG - contig369end:9833-9852 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
TGAAGGTTTACAGAAAGCTC+AGG - contig369end:7715-7734 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
TGAATTTGTGTTCGGAAAGC+AGG - contig369end:5765-5784 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
TGCAGAAAAGAATTTCCGCA+CGG - contig369end:8961-8980 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
TGGACTGACTAATGTAACTC+AGG + contig369end:8502-8521 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
TGTCAAACTCAGGAAGCAAT+CGG - contig369end:5324-5343 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
TGTCCATACAACTTTGTTCC+AGG + contig369end:10550-10569 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
TGTTGACAGCAAGAGGAATT+CGG - contig369end:5792-5811 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
TTAAACTCGGAAGAGGAGAA+AGG - contig369end:5604-5623 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
TTACCTGGAAATCAGCCAAA+AGG - contig369end:10405-10424 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
TTATGTTAGATATGGGCCTC+AGG - contig369end:7832-7851 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
TTCATGAATGCCATATAGGG+AGG + contig369end:9347-9366 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
TTCCCTTTGTTGATGTTTGG+AGG - contig369end:11038-11057 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
TTCCTGAGTTTGACAAGTCT+CGG + contig369end:5319-5338 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
TTGAAGGAAAACTCTCCCTT+AGG - contig369end:10802-10821 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
TTGCACAATGGCTTCTTCTT+TGG - contig369end:7465-7484 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
TTTCTACATCCCCTAGCAAA+AGG + contig369end:7617-7636 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
! AAATTATTCCCTTGCCGACT+TGG - contig369end:11561-11580 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
! AAGGATTAGAGAAGCTCTAG+AGG - contig369end:7441-7460 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
! AGAAACTGATTTCTCATGGC+TGG + contig369end:8464-8483 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
! AGTATTGGAGTCTACGTTTC+TGG - contig369end:8137-8156 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
! AGTCCGGTAAAGTTGTTGTT+TGG - contig369end:7667-7686 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
! CTTTTATTGCAGAACAGTCG+CGG + contig369end:8423-8442 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
! GAGAGTTTTCCTTCAACACT+AGG + contig369end:10798-10817 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
! GATAATGGCAAGTCCTGTTA+TGG - contig369end:6688-6707 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
! GGAATTGAAGAGTCTTGTAC+GGG - contig369end:6308-6327 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
! GGTTACTCCATTTTATGCCA+AGG - contig369end:11063-11082 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
! GTAAGGTAATTTTGCCTGTC+AGG - contig369end:11305-11324 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
! TACCTTGAGCAGTTCCATTT+TGG + contig369end:6193-6212 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
! TAGATGGATTCACAATGGGA+TGG - contig369end:11366-11385 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
! TAGCAATGGTTTGTGTTTGG+AGG - contig369end:6062-6081 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
! TCAGGTGAACGATCTTTTCA+AGG - contig369end:7096-7115 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
! TGATGATGCTAAACCGAATC+CGG - contig369end:5558-5577 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
! TGGCCTTGCTAATTTCTGTT+AGG - contig369end:7214-7233 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
!! AACGATCTTTTCAAGGAAGG+GGG - contig369end:7103-7122 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
!! AACTGCTCAAGGTATTGATC+AGG - contig369end:6199-6218 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
!! AATTATTCCCTTGCCGACTT+GGG - contig369end:11562-11581 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
!! AGTGGAAATGGAAGTGCTAA+TGG - contig369end:5916-5935 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
!! AGTGTTACTTTCGTTTGGGA+AGG - contig369end:9065-9084 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
!! ATAAGAAGAGGCGTCCAAAA+GGG - contig369end:9532-9551 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
!! ATCTGCTGTTGTTTCCTGAT+AGG + contig369end:6578-6597 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
!! ATGAAGGGCATTTACGTGAA+AGG - contig369end:11142-11161 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
!! CAGATGTTTGGCCTTTTCAT+TGG + contig369end:10331-10350 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
!! CATAATTTGTTCGGAGAGGT+AGG - contig369end:7944-7963 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
!! CCTTAGGTTGAGAACTTTAG+TGG - contig369end:10818-10837 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
!! CGTGTCATTTGAGAATAGCA+GGG - contig369end:8361-8380 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
!! GAAAATGAAGGTTCTGGTTC+CGG - contig369end:5394-5413 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
!! GAACGATCTTTTCAAGGAAG+GGG - contig369end:7102-7121 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
!! GCTTTTGAAAGAGAGGACTT+TGG - contig369end:8655-8674 MsG0080048602.01.T01:CDS 40.0%
!! GTGAACGATCTTTTCAAGGA+AGG - contig369end:7100-7119 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
!! TATAAGAAGAGGCGTCCAAA+AGG - contig369end:9531-9550 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
!! TATGGGAACCAGCTGATTTT+TGG + contig369end:8042-8061 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
!! TCGTGTCATTTGAGAATAGC+AGG - contig369end:8360-8379 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
!! TCTGCTGTTGTTTCCTGATA+GGG + contig369end:6577-6596 MsG0080048602.01.T01:intergenic 40.0%
!! TTCATGGTTTGCTGATTACG+GGG - contig369end:5726-5745 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
!!! GTTGTCTTTTGCTGTTAGCT+AGG - contig369end:8247-8266 MsG0080048602.01.T01:intron 40.0%
AAACAAGAAGGATCCCATGC+CGG + contig369end:6344-6363 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
AACACTTCGGACTGCATCTT+AGG + contig369end:6763-6782 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
AAGGTGAATGTTTGTGTGGG+GGG - contig369end:8189-8208 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
ACATCACCAGAAACCGGATT+CGG + contig369end:5574-5593 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
ACCACTGCAAGTCTTTGTTG+TGG + contig369end:11100-11119 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
ACCATTTGTTCCGCAAGCTT+TGG + contig369end:6168-6187 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
ACCTGGAAATCAGCCAAAAG+GGG - contig369end:10407-10426 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
ACGGGCTTTCCATTCACATT+TGG + contig369end:7007-7026 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
AGCAAGAGGAATTCGGGTAA+TGG - contig369end:5799-5818 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
AGCTGAGAATAGAGTAGAGG+AGG + contig369end:11464-11483 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
AGGAATCTGTTGACAGCAAG+AGG - contig369end:5785-5804 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
AGGAGAGTTCCTTCAATGCT+AGG + contig369end:10999-11018 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
AGTTCCTTCAATGCTAGGCA+TGG + contig369end:10994-11013 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
AGTTCGGGAACTAATACTGG+CGG - contig369end:6107-6126 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
ATCAAGCGTACTGCATACTC+TGG - contig369end:9418-9437 MsG0080048602.01.T01:CDS 45.0%
ATCAGTGGTTATAGCCTGAC+AGG + contig369end:11322-11341 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
ATGTGATGACATGTTCGCAG+TGG + contig369end:7056-7075 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
CACCCTCCAAACATCAACAA+AGG + contig369end:11044-11063 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
CATGCTGAGACGGAAACAAA+TGG - contig369end:5835-5854 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
CATGTTACCTGCAAATAGGG+AGG - contig369end:8318-8337 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
CCTTCAACACTAGGCATGAA+AGG + contig369end:10789-10808 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
CGCGACTGTTCTGCAATAAA+AGG - contig369end:8421-8440 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
CGGTTCCCCCTAGATAAAAT+AGG + contig369end:7274-7293 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
CGTCTCAGCATGAAAAACAC+CGG + contig369end:5827-5846 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
CTCAGTCGATGGAAGAACTT+TGG - contig369end:10634-10653 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
CTGGTGGTTGTCTTAGAACA+AGG + contig369end:6239-6258 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
CTGGTTCCCATAACTGGTAT+CGG - contig369end:8050-8069 MsG0080048602.01.T01:CDS 45.0%
CTTTGTTGATGTTTGGAGGG+TGG - contig369end:11042-11061 MsG0080048602.01.T01:CDS 45.0%
GAAAAGCCACCAGAAGATTC+AGG + contig369end:6538-6557 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
GAACCGTGCTCATAAAGCTA+AGG - contig369end:7288-7307 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
GATTTCTCATGGCTGGAATC+TGG + contig369end:8457-8476 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
GGAGCGAAAAGGATTGAAAC+CGG + contig369end:5416-5435 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
GGATGGAGCAAAACGTTAGT+TGG - contig369end:11383-11402 MsG0080048602.01.T01:CDS 45.0%
GGGAAACTATACAGAAGCAG+TGG - contig369end:9874-9893 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
GTAACAGTAGAAGCAGCTGA+AGG - contig369end:7698-7717 MsG0080048602.01.T01:CDS 45.0%
GTAGGCGATGTTCATTTCTC+TGG - contig369end:6721-6740 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
GTCCAAAATGGAACTGCTCA+AGG - contig369end:6188-6207 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
GTCCCTTCTAGCGAAAGATT+AGG - contig369end:7355-7374 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
GTCTCAGCATGAAAAACACC+GGG + contig369end:5826-5845 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
GTTGACAGCAAGAGGAATTC+GGG - contig369end:5793-5812 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
TACAATCGGTAGCAATCGCT+GGG + contig369end:6642-6661 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
TACCTACCTCCCAATGCAAA+AGG + contig369end:8387-8406 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
TGAAACCCTGAATCTTCTGG+TGG - contig369end:6529-6548 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
TGATAGGGAGACGAATCCAT+TGG + contig369end:6562-6581 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
TGGCATGCCTTGGCATAAAA+TGG + contig369end:11073-11092 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
TGTAAAGACAGTCAGAGAGG+TGG - contig369end:6658-6677 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
TGTCAATCTCCCTCCCTATA+TGG - contig369end:9334-9353 MsG0080048602.01.T01:CDS 45.0%
TGTGTTTGGAGGAAGTCACA+AGG - contig369end:6073-6092 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
TTACAATCGGTAGCAATCGC+TGG + contig369end:6643-6662 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
TTACCTGCAAATAGGGAGGA+GGG - contig369end:8322-8341 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
TTACTTTCGTTTGGGAAGGC+TGG - contig369end:9069-9088 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
TTGATGAGCCACTAAACCTG+AGG + contig369end:9403-9422 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
TTTCTCATGGCTGGAATCTG+GGG + contig369end:8455-8474 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
! AAAATGTCTTAACGGGCCTC+AGG - contig369end:9384-9403 MsG0080048602.01.T01:CDS 45.0%
! AAGATGCAGTCCGAAGTGTT+CGG - contig369end:6763-6782 MsG0080048602.01.T01:CDS 45.0%
! AAGGTCTAAGACCAGAACCA+CGG - contig369end:5360-5379 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
! AATAGCAGGGCCTTTTGCAT+TGG - contig369end:8374-8393 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
! AATCAGCTGGTTCCCATAAC+TGG - contig369end:8044-8063 MsG0080048602.01.T01:CDS 45.0%
! AATGGATTCGTCTCCCTATC+AGG - contig369end:6561-6580 MsG0080048602.01.T01:CDS 45.0%
! ACCTTCATTTTCAACTGCGG+TGG + contig369end:5386-5405 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
! ATAGCAGGGCCTTTTGCATT+GGG - contig369end:8375-8394 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
! CAAAGTTCTTCCATCGACTG+AGG + contig369end:10636-10655 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
! CAATGAAGTACCCTCTACAG+TGG + contig369end:6923-6942 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
! CCACTGCAAGTCTTTGTTGT+GGG + contig369end:11099-11118 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
! CCTTTCATGCCTAGTGTTGA+AGG - contig369end:10786-10805 MsG0080048602.01.T01:CDS 45.0%
! CGGTGTTTTTCATGCTGAGA+CGG - contig369end:5825-5844 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
! GTGTTCGGTAGTAGCTTTTC+TGG - contig369end:6778-6797 MsG0080048602.01.T01:CDS 45.0%
! GTTGTGTCATCGGAGTTGAT+CGG + contig369end:5211-5230 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
! TCAGCTGTCACCTTTTGCTA+GGG - contig369end:7604-7623 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
! TCTCTTCAGAGTTTGAGGTG+AGG + contig369end:6828-6847 MsG0080048602.01.T01:intergenic 45.0%
! TCTTCCATGCCTAGCATTGA+AGG - contig369end:10987-11006 MsG0080048602.01.T01:CDS 45.0%
! TTCTGGTGGCTTTTCTCCAA+TGG - contig369end:6543-6562 MsG0080048602.01.T01:CDS 45.0%
!! AGCTCTAGAGGATTGCACAA+TGG - contig369end:7453-7472 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
!! ATTATTCCCTTGCCGACTTG+GGG - contig369end:11563-11582 MsG0080048602.01.T01:CDS 45.0%
!! CTGCTGAGCTTTTGAAAGAG+AGG - contig369end:8648-8667 MsG0080048602.01.T01:CDS 45.0%
!! GGTATTGATCAGGATGCTAC+AGG - contig369end:6209-6228 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
!! TGATGTGATGGACAAGTCTC+AGG - contig369end:7078-7097 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
!! TTCTAAGACAACCACCAGTC+AGG - contig369end:6241-6260 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
!! TTGTACGGGCTTTAAACCTC+CGG - contig369end:6322-6341 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
!!! GTCTTTTGCTGTTAGCTAGG+AGG - contig369end:8250-8269 MsG0080048602.01.T01:intron 45.0%
AACAAGCAGCTTGTGACCTC+AGG - contig369end:10277-10296 MsG0080048602.01.T01:intron 50.0%
AAGACAACCACCAGTCAGGA+TGG - contig369end:6245-6264 MsG0080048602.01.T01:intron 50.0%
AAGCTTGATGAGCAGCAGCA+CGG + contig369end:9967-9986 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
AATCCCTCCTCCCTATTTGC+AGG + contig369end:8328-8347 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
ACCCTAAAGTGGCAGCCAAA+AGG + contig369end:10587-10606 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
AGACAACCACCAGTCAGGAT+GGG - contig369end:6246-6265 MsG0080048602.01.T01:intron 50.0%
AGCCGAGACTTGTCAAACTC+AGG - contig369end:5314-5333 MsG0080048602.01.T01:intron 50.0%
AGGTGAATGTTTGTGTGGGG+GGG - contig369end:8190-8209 MsG0080048602.01.T01:intron 50.0%
ATAGAGTAGAGGAGGACAGC+AGG + contig369end:11456-11475 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
ATCTCTGATCCCATCCTGAC+TGG + contig369end:6258-6277 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
ATTGCTCCAAATGAAGGCGG+AGG - contig369end:8742-8761 MsG0080048602.01.T01:intron 50.0%
CAACACGTATGAGTCTGGGA+AGG - contig369end:7422-7441 MsG0080048602.01.T01:intron 50.0%
CAATCGAGCCTACCCTCAAT+CGG - contig369end:11195-11214 MsG0080048602.01.T01:CDS 50.0%
CCCACAACAAAGACTTGCAG+TGG - contig369end:11096-11115 MsG0080048602.01.T01:CDS 50.0%
CCCTAAAGTGGCAGCCAAAA+GGG + contig369end:10586-10605 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
CGTGAAAGGAACCAAGACCA+TGG - contig369end:11156-11175 MsG0080048602.01.T01:CDS 50.0%
CTAGCAAAAGGTGACAGCTG+AGG + contig369end:7605-7624 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
CTAGCACCCAAACCGATTGA+GGG + contig369end:11210-11229 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
CTGGTGTTTCAGCAGATGCT+GGG - contig369end:6797-6816 MsG0080048602.01.T01:CDS 50.0%
CTTACCTGATCGGAGCGAAA+AGG + contig369end:5427-5446 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
GAAGAGCCACCTTGCATGAA+TGG - contig369end:10243-10262 MsG0080048602.01.T01:intron 50.0%
GACAGAACCTGAGTCTCCAT+TGG + contig369end:7165-7184 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
GACATGTTCGCAGTGGTAAG+TGG + contig369end:7049-7068 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
GATTGACGAGCAATTGCTGC+TGG + contig369end:8522-8541 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
GCAAACAACGTCTGCTTACC+TGG - contig369end:10390-10409 MsG0080048602.01.T01:intron 50.0%
GCAGCAACACGTATGAGTCT+GGG - contig369end:7418-7437 MsG0080048602.01.T01:intron 50.0%
GCCAAAGCTTGCGGAACAAA+TGG - contig369end:6164-6183 MsG0080048602.01.T01:intron 50.0%
GCCACCGCAGTTGAAAATGA+AGG - contig369end:5382-5401 MsG0080048602.01.T01:intron 50.0%
GCTAAACCGAATCCGGTTTC+TGG - contig369end:5565-5584 MsG0080048602.01.T01:intron 50.0%
GCTGAGGAACTCTACACACA+AGG - contig369end:7322-7341 MsG0080048602.01.T01:intron 50.0%
GGCATGAAAGGCCACTTAGT+CGG + contig369end:10777-10796 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
GGCGCTGTCAGAATCATCAT+TGG + contig369end:6147-6166 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
GGTGGGATCAAACTATGCCA+TGG + contig369end:11176-11195 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
GTTACCTGCAAATAGGGAGG+AGG - contig369end:8321-8340 MsG0080048602.01.T01:intron 50.0%
TCTGCAGGATCCACTGTAGA+GGG - contig369end:6910-6929 MsG0080048602.01.T01:CDS 50.0%
TCTGGTGTTTCAGCAGATGC+TGG - contig369end:6796-6815 MsG0080048602.01.T01:CDS 50.0%
TGCAGCAACACGTATGAGTC+TGG - contig369end:7417-7436 MsG0080048602.01.T01:intron 50.0%
TGTCTGCACTATTTGCCGTG+CGG + contig369end:8979-8998 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
TTCTGCAGGATCCACTGTAG+AGG - contig369end:6909-6928 MsG0080048602.01.T01:CDS 50.0%
TTGAAGCAGCCTGTCACCAA+TGG - contig369end:7146-7165 MsG0080048602.01.T01:intron 50.0%
! AGCCTACCCTCAATCGGTTT+GGG - contig369end:11201-11220 MsG0080048602.01.T01:CDS 50.0%
! ATCGGAGAAGGGAAGTGCAT+CGG + contig369end:5193-5212 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
! CAAGTCTTTGTTGTGGGCAG+TGG + contig369end:11093-11112 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
! CAATCCTTTTCGCTCCGATC+AGG - contig369end:5420-5439 MsG0080048602.01.T01:intron 50.0%
! CAGCTGTCACCTTTTGCTAG+GGG - contig369end:7605-7624 MsG0080048602.01.T01:intron 50.0%
! CATCGGAGTTGATCGGAGAA+GGG + contig369end:5204-5223 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
! CTCAGCTGTCACCTTTTGCT+AGG - contig369end:7603-7622 MsG0080048602.01.T01:intron 50.0%
! GACTCATACGTGTTGCTGCA+CGG + contig369end:7417-7436 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
! GTTTGCTGATTACGGGGAGA+GGG - contig369end:5732-5751 MsG0080048602.01.T01:intron 50.0%
! TCATCGGAGTTGATCGGAGA+AGG + contig369end:5205-5224 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
! TCGGCGTTGAAAGGAGCAAA+GGG + contig369end:5250-5269 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
! TTAACGGGCCTCAGGTTTAG+TGG - contig369end:9392-9411 MsG0080048602.01.T01:CDS 50.0%
!! AGGAATTCGGGTAATGGACC+CGG - contig369end:5805-5824 MsG0080048602.01.T01:intron 50.0%
!! GGTTCTGGTCTTAGACCTTG+CGG + contig369end:5359-5378 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
!! TCCCCTTTTGGCTGATTTCC+AGG + contig369end:10411-10430 MsG0080048602.01.T01:intergenic 50.0%
!!! CCCTTTTGGCTGCCACTTTA+GGG - contig369end:10583-10602 MsG0080048602.01.T01:CDS 50.0%
!!! TCCCTTTTGGCTGCCACTTT+AGG - contig369end:10582-10601 MsG0080048602.01.T01:CDS 50.0%
AATCGGCGTCACAAACCGCA+AGG - contig369end:5341-5360 MsG0080048602.01.T01:intron 55.0%
ACAGAGCCTCCGCCTTCATT+TGG + contig369end:8751-8770 MsG0080048602.01.T01:intergenic 55.0%
ACAGCAGGAGGCTGTGACTA+TGG + contig369end:11441-11460 MsG0080048602.01.T01:intergenic 55.0%
AGAACAGTCGCGGCACTTTG+AGG + contig369end:8413-8432 MsG0080048602.01.T01:intergenic 55.0%
AGCCATGCTGCAATCCGCAA+TGG + contig369end:10008-10027 MsG0080048602.01.T01:intergenic 55.0%
AGGGAGGAGGGATTAGAGAG+TGG - contig369end:8334-8353 MsG0080048602.01.T01:intron 55.0%
CACCCAAACCGATTGAGGGT+AGG + contig369end:11206-11225 MsG0080048602.01.T01:intergenic 55.0%
CCTGTCACCAATGGAGACTC+AGG - contig369end:7155-7174 MsG0080048602.01.T01:intron 55.0%
CGATTGAGGGTAGGCTCGAT+TGG + contig369end:11197-11216 MsG0080048602.01.T01:intergenic 55.0%
CGCTCCGATCAGGTAAGTGA+GGG - contig369end:5430-5449 MsG0080048602.01.T01:intron 55.0%
GAACAGTCGCGGCACTTTGA+GGG + contig369end:8412-8431 MsG0080048602.01.T01:intergenic 55.0%
GAAGGCGGAGGCTCTGTATT+TGG - contig369end:8754-8773 MsG0080048602.01.T01:intron 55.0%
GAGAGGACTTTGGATGCAGC+TGG - contig369end:8665-8684 MsG0080048602.01.T01:CDS 55.0%
GAGCCTACCCTCAATCGGTT+TGG - contig369end:11200-11219 MsG0080048602.01.T01:CDS 55.0%
GATATGGGCCTCAGGCTTGT+TGG - contig369end:7840-7859 MsG0080048602.01.T01:CDS 55.0%
GCAAAAGGTGACAGCTGAGG+AGG + contig369end:7602-7621 MsG0080048602.01.T01:intergenic 55.0%
GCGTTGAAAGGAGCAAAGGG+GGG + contig369end:5247-5266 MsG0080048602.01.T01:intergenic 55.0%
GCTAGCACCCAAACCGATTG+AGG + contig369end:11211-11230 MsG0080048602.01.T01:intergenic 55.0%
GCTGCTGCTCATCAAGCTTC+AGG - contig369end:9968-9987 MsG0080048602.01.T01:CDS 55.0%
GGGAGGAGGGATTAGAGAGT+GGG - contig369end:8335-8354 MsG0080048602.01.T01:intron 55.0%
GGTGAATGTTTGTGTGGGGG+GGG - contig369end:8191-8210 MsG0080048602.01.T01:intron 55.0%
GTGAATGTTTGTGTGGGGGG+GGG - contig369end:8192-8211 MsG0080048602.01.T01:intron 55.0%
TCAAAGCCCCAAGTCGGCAA+GGG + contig369end:11572-11591 MsG0080048602.01.T01:intergenic 55.0%
TCGCTCCGATCAGGTAAGTG+AGG - contig369end:5429-5448 MsG0080048602.01.T01:intron 55.0%
TCTGACAGCGCCAAAGCTTG+CGG - contig369end:6155-6174 MsG0080048602.01.T01:intron 55.0%
TCTGATCCCATCCTGACTGG+TGG + contig369end:6255-6274 MsG0080048602.01.T01:intergenic 55.0%
TGAGGGTAGGCTCGATTGGT+GGG + contig369end:11193-11212 MsG0080048602.01.T01:intergenic 55.0%
TTGAAAGGAGCAAAGGGGGG+AGG + contig369end:5244-5263 MsG0080048602.01.T01:intergenic 55.0%
TTGAGGGTAGGCTCGATTGG+TGG + contig369end:11194-11213 MsG0080048602.01.T01:intergenic 55.0%
! ATTTTCAACTGCGGTGGCCG+TGG + contig369end:5380-5399 MsG0080048602.01.T01:intergenic 55.0%
! CCTGAGTCTCCATTGGTGAC+AGG + contig369end:7158-7177 MsG0080048602.01.T01:intergenic 55.0%
! CGGCGTTGAAAGGAGCAAAG+GGG + contig369end:5249-5268 MsG0080048602.01.T01:intergenic 55.0%
! GGCCTTTTGCATTGGGAGGT+AGG - contig369end:8382-8401 MsG0080048602.01.T01:intron 55.0%
! GGCGTTGAAAGGAGCAAAGG+GGG + contig369end:5248-5267 MsG0080048602.01.T01:intergenic 55.0%
! GTCGGCGTTGAAAGGAGCAA+AGG + contig369end:5251-5270 MsG0080048602.01.T01:intergenic 55.0%
! TGCCATTGCGGATTGCAGCA+TGG - contig369end:10003-10022 MsG0080048602.01.T01:CDS 55.0%
! TGCGGATTGCAGCATGGCTA+TGG - contig369end:10009-10028 MsG0080048602.01.T01:CDS 55.0%
!! GGGCTTTAAACCTCCGGCAT+GGG - contig369end:6328-6347 MsG0080048602.01.T01:intron 55.0%
!! GGTTTGCTGATTACGGGGAG+AGG - contig369end:5731-5750 MsG0080048602.01.T01:intron 55.0%
AATGTTTGTGTGGGGGGGGG+TGG - contig369end:8195-8214 MsG0080048602.01.T01:intron 60.0%
ATGTTTGTGTGGGGGGGGGT+GGG - contig369end:8196-8215 MsG0080048602.01.T01:intron 60.0%
CAAGAAGGATCCCATGCCGG+AGG + contig369end:6341-6360 MsG0080048602.01.T01:intergenic 60.0%
CCGGAGTCAAAGCCCCAAGT+CGG + contig369end:11578-11597 MsG0080048602.01.T01:intergenic 60.0%
GAGTAGAGGAGGACAGCAGG+AGG + contig369end:11453-11472 MsG0080048602.01.T01:intergenic 60.0%
GCAAAGGGGGGAGGAGAATG+TGG + contig369end:5235-5254 MsG0080048602.01.T01:intergenic 60.0%
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TTGTGGGCAGTGGCATGCCT+TGG + contig369end:11083-11102 MsG0080048602.01.T01:intergenic 60.0%
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! GCAGGGCCTTTTGCATTGGG+AGG - contig369end:8378-8397 MsG0080048602.01.T01:intron 60.0%
!! CCGACTTGGGGCTTTGACTC+CGG - contig369end:11575-11594 MsG0080048602.01.T01:CDS 60.0%
!! CGGGCTTTAAACCTCCGGCA+TGG - contig369end:6327-6346 MsG0080048602.01.T01:intron 60.0%
!! TTGACGGCGTCGGCGTTGAA+AGG + contig369end:5259-5278 MsG0080048602.01.T01:intergenic 60.0%
AACTGCGGTGGCCGTGGTTC+TGG + contig369end:5374-5393 MsG0080048602.01.T01:intergenic 65.0%
CGACCTTCCACGTGCGGTTG+CGG + contig369end:5293-5312 MsG0080048602.01.T01:intergenic 65.0%
CGGCTTCGACCTTCCACGTG+CGG + contig369end:5299-5318 MsG0080048602.01.T01:intergenic 65.0%
GGTAGGAGGGTTGACGGCGT+CGG + contig369end:5269-5288 MsG0080048602.01.T01:intergenic 65.0%
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TGTTTGTGTGGGGGGGGGTG+GGG - contig369end:8197-8216 MsG0080048602.01.T01:intron 65.0%
! GAAGGGAAGTGCATCGGCGC+CGG + contig369end:5187-5206 MsG0080048602.01.T01:intergenic 65.0%
CCTTCCACGTGCGGTTGCGG+CGG + contig369end:5290-5309 MsG0080048602.01.T01:intergenic 70.0%
GTGCGGTTGCGGCGGTAGGA+GGG + contig369end:5282-5301 MsG0080048602.01.T01:intergenic 70.0%
CCACGTGCGGTTGCGGCGGT+AGG + contig369end:5286-5305 MsG0080048602.01.T01:intergenic 75.0%
CCGCCGCAACCGCACGTGGA+AGG - contig369end:5287-5306 MsG0080048602.01.T01:intron 75.0%
CCTACCGCCGCAACCGCACG+TGG - contig369end:5283-5302 MsG0080048602.01.T01:intron 75.0%
CGTGCGGTTGCGGCGGTAGG+AGG + contig369end:5283-5302 MsG0080048602.01.T01:intergenic 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
contig369end gene 5178 11628 5178 ID=MsG0080048602.01;Name=MsG0080048602.01
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contig369end exon 5178 5267 5178 ID=MsG0080048602.01.T01:exon:107;Parent=MsG0080048602.01.T01
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Gene Sequence

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Protein sequence

>MsG0080048602.01.T01

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